View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6828_low_5 (Length: 344)

Name: NF6828_low_5
Description: NF6828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6828_low_5
NF6828_low_5
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (5-331)||(44562923-44563249)
chr8 (5-331)||(9354444-9354770)
chr8 (5-331)||(19659106-19659432)
chr8 (9-326)||(22080949-22081263)
chr8 (5-307)||(16283292-16283597)
chr8 (5-169)||(33244649-33244813)
chr8 (26-307)||(16277397-16277681)
chr8 (26-307)||(14557470-14557751)
chr8 (26-307)||(2137347-2137631)
chr8 (26-325)||(19687923-19688225)
chr8 (26-265)||(27608993-27609235)
chr8 (5-325)||(18710411-18710734)
chr8 (26-325)||(31489838-31490140)
chr8 (5-265)||(19674323-19674589)
chr8 (5-262)||(31354412-31354672)
chr8 (26-151)||(19208448-19208573)
chr8 (5-325)||(19286290-19286610)
chr8 (26-151)||(28362043-28362168)
chr8 (26-147)||(3329595-3329716)
chr8 (25-85)||(29829390-29829450)
chr8 (26-147)||(12092812-12092933)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (5-331)||(34303400-34303726)
chr2 (5-331)||(34156829-34157155)
chr2 (26-330)||(31891446-31891750)
chr2 (5-331)||(3784472-3784798)
chr2 (5-331)||(16163417-16163743)
chr2 (5-331)||(27118506-27118832)
chr2 (5-322)||(19456518-19456835)
chr2 (5-322)||(21703261-21703578)
chr2 (9-326)||(27392813-27393109)
chr2 (5-307)||(27434541-27434846)
chr2 (26-307)||(23128684-23128968)
chr2 (26-307)||(28882053-28882337)
chr2 (26-307)||(12655381-12655665)
chr2 (26-305)||(20837759-20838041)
chr2 (5-259)||(11635283-11635543)
chr2 (26-265)||(21677300-21677542)
chr2 (5-259)||(11641472-11641732)
chr2 (5-265)||(34279330-34279593)
chr2 (5-265)||(34286235-34286498)
chr2 (5-265)||(34291295-34291558)
chr2 (26-262)||(37925377-37925616)
chr2 (48-265)||(13936684-13936904)
chr2 (5-151)||(22926125-22926271)
chr2 (26-259)||(32049685-32049921)
chr2 (26-151)||(34861678-34861803)
chr2 (26-151)||(37686027-37686152)
chr2 (26-151)||(37701292-37701417)
chr2 (5-145)||(40233515-40233655)
chr2 (48-169)||(12716742-12716863)
chr2 (5-307)||(37375000-37375305)
chr2 (26-307)||(16829456-16829740)
chr2 (26-307)||(16891741-16892025)
chr2 (48-169)||(27803687-27803808)
chr2 (48-145)||(27777226-27777323)
chr2 (48-145)||(27816984-27817081)
chr2 (26-151)||(31876279-31876404)
chr2 (48-145)||(39051962-39052059)
chr2 (26-73)||(39890150-39890197)
chr2 (149-262)||(261009-261122)
chr2 (48-145)||(9350122-9350219)
chr2 (48-145)||(12586814-12586911)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (5-331)||(31088458-31088784)
chr7 (5-331)||(45733283-45733609)
chr7 (5-322)||(16449992-16450309)
chr7 (5-322)||(16041155-16041472)
chr7 (5-169)||(26484679-26484843)
chr7 (5-169)||(2108999-2109163)
chr7 (5-169)||(39211017-39211181)
chr7 (5-169)||(2775344-2775508)
chr7 (6-169)||(18540784-18540947)
chr7 (26-307)||(16503395-16503679)
chr7 (26-307)||(16518431-16518715)
chr7 (26-280)||(10916883-10917137)
chr7 (5-325)||(5127818-5128141)
chr7 (26-265)||(11424791-11425033)
chr7 (5-283)||(5147334-5147615)
chr7 (26-307)||(2154417-2154701)
chr7 (6-325)||(5159348-5159667)
chr7 (26-259)||(45387235-45387471)
chr7 (5-265)||(16736454-16736717)
chr7 (5-265)||(16751508-16751771)
chr7 (5-265)||(17523418-17523681)
chr7 (5-265)||(17529534-17529797)
chr7 (5-283)||(26435125-26435406)
chr7 (26-262)||(4145138-4145377)
chr7 (26-262)||(26319884-26320123)
chr7 (26-151)||(9618654-9618779)
chr7 (26-151)||(26275109-26275234)
chr7 (26-151)||(26669929-26670054)
chr7 (26-147)||(31564405-31564526)
chr7 (26-145)||(26537885-26538004)
chr7 (26-85)||(3445375-3445434)
chr7 (26-85)||(11441641-11441700)
chr7 (26-73)||(31125001-31125048)
chr7 (198-262)||(11441449-11441513)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (5-331)||(13522124-13522450)
chr6 (5-331)||(33374307-33374633)
chr6 (5-331)||(8892361-8892687)
chr6 (5-331)||(8903596-8903922)
chr6 (5-330)||(28162477-28162802)
chr6 (5-322)||(22477324-22477644)
chr6 (5-263)||(20160588-20160846)
chr6 (5-263)||(22171985-22172243)
chr6 (5-181)||(27290421-27290597)
chr6 (5-169)||(14143336-14143500)
chr6 (5-169)||(26787925-26788089)
chr6 (5-169)||(27196298-27196462)
chr6 (5-169)||(27252778-27252942)
chr6 (5-169)||(22456985-22457149)
chr6 (5-307)||(22934931-22935233)
chr6 (5-307)||(23857376-23857678)
chr6 (26-325)||(24304690-24304992)
chr6 (26-307)||(13299023-13299307)
chr6 (5-325)||(26918202-26918525)
chr6 (26-307)||(15424389-15424673)
chr6 (26-307)||(26988841-26989125)
chr6 (26-307)||(26999913-27000197)
chr6 (5-306)||(16749695-16749999)
chr6 (26-307)||(24863557-24863841)
chr6 (5-325)||(29549300-29549620)
chr6 (26-262)||(4525174-4525410)
chr6 (5-145)||(27272631-27272771)
chr6 (5-262)||(27044275-27044532)
chr6 (26-147)||(4773009-4773130)
chr6 (26-151)||(29573012-29573137)
chr6 (26-145)||(3696086-3696205)
chr6 (26-136)||(4545847-4545957)
chr6 (26-136)||(4724206-4724316)
chr6 (26-262)||(4757646-4757888)
chr6 (26-136)||(28207468-28207578)
chr6 (5-145)||(34463397-34463537)
chr6 (26-326)||(30558088-30558391)
chr6 (26-160)||(26777687-26777821)
chr6 (192-325)||(29501228-29501361)
chr6 (26-147)||(29501418-29501539)
chr6 (5-85)||(16674204-16674284)
chr6 (5-85)||(27007792-27007872)
chr6 (26-73)||(27485206-27485253)
chr6 (26-67)||(26116482-26116523)
chr6 (149-250)||(27629907-27630008)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (5-331)||(13184653-13184979)
chr5 (5-331)||(33877078-33877404)
chr5 (5-331)||(13440499-13440825)
chr5 (5-331)||(11325625-11325951)
chr5 (5-322)||(22888310-22888627)
chr5 (5-307)||(25198884-25199186)
chr5 (5-307)||(23892058-23892363)
chr5 (13-181)||(29889095-29889263)
chr5 (26-307)||(24969876-24970154)
chr5 (26-307)||(30934488-30934769)
chr5 (26-265)||(11549248-11549490)
chr5 (5-307)||(23752455-23752760)
chr5 (26-307)||(23718014-23718298)
chr5 (26-307)||(24688183-24688467)
chr5 (5-325)||(33777321-33777644)
chr5 (5-307)||(22999119-22999424)
chr5 (5-265)||(9548548-9548811)
chr5 (26-326)||(30168302-30168605)
chr5 (26-265)||(8665501-8665743)
chr5 (26-262)||(34616418-34616654)
chr5 (6-325)||(33292362-33292681)
chr5 (5-250)||(15658765-15659013)
chr5 (26-151)||(2511062-2511187)
chr5 (26-151)||(15758883-15759008)
chr5 (5-265)||(41674603-41674866)
chr5 (5-262)||(6874199-6874462)
chr5 (26-262)||(12132052-12132291)
chr5 (26-151)||(26480403-26480528)
chr5 (5-262)||(32599477-32599734)
chr5 (5-147)||(37671488-37671630)
chr5 (26-151)||(5637921-5638046)
chr5 (26-151)||(9317462-9317587)
chr5 (26-151)||(30152029-30152154)
chr5 (5-147)||(18500735-18500877)
chr5 (5-147)||(28649250-28649392)
chr5 (26-136)||(31431466-31431576)
chr5 (26-326)||(18375438-18375741)
chr5 (5-147)||(37770992-37771134)
chr5 (26-160)||(28959812-28959946)
chr5 (26-326)||(33516189-33516492)
chr5 (26-147)||(37754995-37755116)
chr5 (26-85)||(31826433-31826492)
chr5 (26-169)||(37358669-37358812)
chr5 (48-145)||(24681457-24681554)
chr5 (48-145)||(24723984-24724081)
chr5 (48-145)||(40473597-40473694)
chr5 (198-262)||(31431325-31431389)
chr5 (5-262)||(43078146-43078409)
chr5 (198-325)||(3789360-3789487)
chr5 (26-85)||(3789618-3789677)
chr5 (198-262)||(18500949-18501013)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (5-331)||(24460713-24461039)
chr4 (5-322)||(15227716-15228033)
chr4 (5-322)||(15285036-15285353)
chr4 (5-322)||(1900103-1900420)
chr4 (5-322)||(14235633-14235953)
chr4 (9-326)||(15391450-15391764)
chr4 (5-307)||(17013858-17014163)
chr4 (26-325)||(24592443-24592742)
chr4 (26-325)||(14664858-14665160)
chr4 (5-307)||(14763412-14763717)
chr4 (6-325)||(34189069-34189388)
chr4 (6-324)||(24112506-24112824)
chr4 (26-259)||(27163446-27163682)
chr4 (5-259)||(5005776-5006036)
chr4 (5-307)||(36344623-36344925)
chr4 (5-265)||(6569753-6570016)
chr4 (26-325)||(14098381-14098683)
chr4 (5-325)||(54833230-54833550)
chr4 (26-147)||(18800742-18800863)
chr4 (26-325)||(31126647-31126949)
chr4 (5-145)||(33673906-33674046)
chr4 (26-151)||(40105767-40105892)
chr4 (26-85)||(30753837-30753896)
chr4 (48-145)||(39850661-39850758)
chr4 (195-253)||(21969613-21969671)
chr4 (224-325)||(19373101-19373202)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (5-331)||(17993933-17994259)
chr3 (5-331)||(4625727-4626053)
chr3 (5-331)||(5652170-5652496)
chr3 (5-322)||(16626655-16626972)
chr3 (5-322)||(18530186-18530497)
chr3 (5-169)||(32292697-32292861)
chr3 (5-169)||(31034266-31034430)
chr3 (26-331)||(5713007-5713315)
chr3 (26-331)||(5723917-5724225)
chr3 (26-331)||(5757252-5757560)
chr3 (26-331)||(5768143-5768451)
chr3 (26-325)||(15892876-15893178)
chr3 (26-325)||(8301437-8301736)
chr3 (26-307)||(18051066-18051350)
chr3 (26-307)||(8295779-8296060)
chr3 (5-325)||(22387727-22388047)
chr3 (26-307)||(4796823-4797107)
chr3 (26-325)||(35880552-35880854)
chr3 (5-265)||(4721477-4721740)
chr3 (26-325)||(18330460-18330757)
chr3 (5-325)||(6192102-6192425)
chr3 (5-307)||(29148904-29149209)
chr3 (5-307)||(18277201-18277506)
chr3 (5-307)||(18292502-18292807)
chr3 (5-307)||(18307803-18308108)
chr3 (6-325)||(4892999-4893318)
chr3 (26-259)||(7996414-7996650)
chr3 (26-259)||(10642922-10643158)
chr3 (5-259)||(28116103-28116363)
chr3 (26-262)||(47023302-47023541)
chr3 (6-324)||(32438944-32439262)
chr3 (5-265)||(7073058-7073321)
chr3 (26-307)||(15741264-15741536)
chr3 (26-326)||(17985126-17985429)
chr3 (5-151)||(5609471-5609617)
chr3 (5-151)||(28339265-28339411)
chr3 (5-151)||(31964622-31964768)
chr3 (5-151)||(50134220-50134366)
chr3 (26-147)||(6542632-6542753)
chr3 (5-325)||(8211527-8211847)
chr3 (5-265)||(10395982-10396242)
chr3 (5-151)||(4416882-4417028)
chr3 (5-262)||(4346836-4347093)
chr3 (48-307)||(20065850-20066109)
chr3 (26-262)||(5466834-5467073)
chr3 (5-262)||(28021127-28021384)
chr3 (5-325)||(21674479-21674802)
chr3 (26-325)||(18224977-18225279)
chr3 (26-145)||(36997247-36997366)
chr3 (5-85)||(11110498-11110578)
chr3 (26-85)||(51782052-51782111)
chr3 (26-147)||(5596527-5596648)
chr3 (192-325)||(5596705-5596838)
chr3 (48-145)||(20577039-20577136)
chr3 (48-145)||(29665162-29665259)
chr3 (198-283)||(29665330-29665415)
chr3 (5-85)||(48465956-48466036)
chr3 (26-85)||(5013741-5013800)
chr3 (26-73)||(18242780-18242827)
chr3 (34-85)||(51797141-51797192)
chr3 (198-262)||(11110706-11110770)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (5-331)||(2766-3092)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (5-331)||(20340443-20340769)
chr1 (5-322)||(16208139-16208453)
chr1 (5-157)||(20461076-20461228)
chr1 (5-169)||(28151845-28152009)
chr1 (178-322)||(20460935-20461079)
chr1 (5-259)||(41793416-41793673)
chr1 (26-325)||(28584805-28585107)
chr1 (26-151)||(10962671-10962796)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (5-322)||(20240-20536)
scaffold0124 (26-307)||(30296-30579)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (9-326)||(21391-21705)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (5-181)||(136-312)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (26-307)||(29606-29890)
scaffold0089 (26-307)||(40198-40482)
scaffold0089 (26-265)||(47114-47356)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (26-307)||(27135-27419)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (26-325)||(258-561)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (5-83)||(2025-2103)
scaffold0415 (5-117)||(6047-6160)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (26-262)||(7368-7607)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (26-151)||(9195-9320)
scaffold0159 (26-151)||(20017-20142)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (26-326)||(15059-15362)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (26-136)||(7966-8076)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (33-151)||(26338-26456)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (5-160)||(9559-9714)
scaffold0336 (195-262)||(8120-8187)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44563249 - 44562923
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44563249 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagc 44563150  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |   ||    
T  44563149 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcgg 44563050  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563049 cattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 44562950  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44562949 aggtagctgagcagcattgatgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9354770 - 9354444
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  9354770 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagt 9354671  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  9354670 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 9354571  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9354570 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 9354471  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9354470 aggtagctgagcagcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 19659106 - 19659432
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  19659106 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagt 19659205  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  | | ||    
T  19659206 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacgg 19659305  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659306 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 19659405  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19659406 aggtagctgagcagcattgatgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 22080949 - 22081263
Alignment:
Q  9 cacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||    
T  22080949 cacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagct 22081048  T
Q  109 cagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 208  Q
    | || || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22081049 cggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgct---gctgttgagccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcatt 22081145  T
Q  209 aacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| ||||    
T  22081146 gacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcgga 22081242  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22081243 ggtagctgagcagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16283597 - 16283292
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |||    
T  16283597 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagc 16283498  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  16283497 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 16283398  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16283397 ttgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacga 16283298  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  16283297 cggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33244813 - 33244649
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  33244813 atcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagt 33244714  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33244713 aattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16277681 - 16277397
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  16277681 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 16277582  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16277581 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 16277482  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16277481 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14557751 - 14557470
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  14557751 gaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 14557652  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  14557651 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 14557552  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  14557551 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 14557470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 2137347 - 2137631
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  2137347 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 2137446  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  2137447 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 2137546  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  2137547 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19688225 - 19687923
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  19688225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 19688126  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | |    |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19688125 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 19688026  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || | | |||| || ||  ||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  19688025 gttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 19687926  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  19687925 gat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 27608993 - 27609235
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  27608993 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 27609092  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  27609093 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27609192  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  27609193 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaa 27609235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18710734 - 18710411
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  18710734 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18710635  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| ||||||||  |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  18710634 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 18710535  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
      ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18710534 ctgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18710435  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  18710434 cggaggcatttgagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 31489838 - 31490140
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  31489838 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 31489937  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   ||| |||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  31489938 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 31490037  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  31490038 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 31490137  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  31490138 gat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19674589 - 19674323
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  19674589 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 19674490  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  19674489 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 19674390  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  19674389 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaa 19674323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31354672 - 31354412
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  31354672 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31354573  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || |||||    || ||||| |    
T  31354572 aactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcga 31354473  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  31354472 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 31354412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 19208448 - 19208573
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  19208448 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 19208547  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  19208548 atcggagggaaagtaggcctagcttg 19208573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19286610 - 19286290
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  19286610 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 19286511  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||||||||    
T  19286510 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 19286411  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  19286410 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 19286311  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgat 325  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  19286310 aggcatttgagctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 28362043 - 28362168
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  28362043 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28362142  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  28362143 atcggagggaaagtaggcctagcttg 28362168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 3329595 - 3329716
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  3329595 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3329694  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  3329695 ataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29829450 - 29829390
Alignment:
Q  25 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29829450 ggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 12092812 - 12092933
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  12092812 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 12092911  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  12092912 ataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 34303400 - 34303726
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  34303400 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 34303499  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |     
T  34303500 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacga 34303599  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 34303699  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34303700 aggtagctgagcagcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34157155 - 34156829
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  34157155 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 34157056  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  34157055 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 34156956  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34156955 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 34156856  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34156855 aggtagctgagcagcattgatgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 31891446 - 31891750
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31891446 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggt 31891545  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  31891546 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 31891645  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891646 gtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 31891745  T
Q  326 gtcca 330  Q
    |||||    
T  31891746 gtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3784798 - 3784472
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3784798 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 3784699  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  3784698 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 3784599  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3784598 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 3784499  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3784498 aggtagctgagcagcattgatgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16163743 - 16163417
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16163743 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 16163644  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  16163643 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 16163544  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16163543 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 16163444  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16163443 aggtagctgagcagcattgatgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27118832 - 27118506
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27118832 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 27118733  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  27118732 aattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacgg 27118633  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27118632 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacgg 27118533  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27118532 aggtagctgagcagcattgatgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 19456518 - 19456835
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19456518 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagt 19456617  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||    
T  19456618 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatgg 19456717  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19456718 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacgg 19456817  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  19456818 aggtaactgggcagcatt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 21703261 - 21703578
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21703261 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 21703360  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| | | ||    
T  21703361 aactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacgg 21703460  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21703461 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 21703560  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||  ||||||||    
T  21703561 aggtaactaggcagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27393109 - 27392813
Alignment:
Q  9 cacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||    
T  27393109 cacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagct 27393010  T
Q  109 cagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 208  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||                     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393009 cggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgct---------------------gttgttgcatttgctgagcaatggcatt 27392931  T
Q  209 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 308  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| ||||||  ||||||    
T  27392930 gacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggtggaggt 27392831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 27434541 - 27434846
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| |||    
T  27434541 atcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagc 27434640  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |   | ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  27434641 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 27434740  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27434741 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacga 27434840  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  27434841 cggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 23128684 - 23128968
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  23128684 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 23128783  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23128784 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23128883  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23128884 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28882337 - 28882053
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  28882337 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28882238  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  28882237 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 28882138  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  28882137 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 28882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12655665 - 12655381
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  12655665 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12655566  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12655565 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 12655466  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  12655465 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20838041 - 20837759
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  20838041 gaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20837942  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  20837941 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 20837842  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  20837841 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacgga 20837759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 11635283 - 11635543
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  11635283 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11635382  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  11635383 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11635482  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  11635483 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 11635543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 21677300 - 21677542
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  21677300 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 21677399  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  21677400 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 21677499  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21677500 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaa 21677542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 11641472 - 11641732
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  11641472 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11641571  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  11641572 aactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11641671  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  11641672 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 11641732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34279593 - 34279330
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  34279593 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34279494  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  34279493 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 34279394  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  34279393 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 34279330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34286498 - 34286235
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  34286498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34286399  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  34286398 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34286299  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
      ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  34286298 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 34286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34291558 - 34291295
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  34291558 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34291459  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  34291458 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34291359  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
      ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  34291358 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 34291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37925616 - 37925377
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  37925616 gaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 37925517  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  37925516 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37925417  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  37925416 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 37925377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 265
Target Start/End: Original strand, 13936684 - 13936904
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13936684 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgg 13936783  T
Q  148 cttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 244  Q
    |||| ||    |||||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  13936784 cttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggta 13936883  T
Q  245 ctgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  13936884 ctgatggtaaaatggcggaaa 13936904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 22926125 - 22926271
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  22926125 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 22926224  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  22926225 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 22926271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32049921 - 32049685
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  32049921 gaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 32049822  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  32049821 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 32049722  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32049721 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 32049685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 34861803 - 34861678
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  34861803 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 34861704  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  34861703 atcggagggaaagtaggcctagcttg 34861678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 37686027 - 37686152
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  37686027 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37686126  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  37686127 atcggagggaaagtaggcctagcttg 37686152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 37701292 - 37701417
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  37701292 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37701391  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  37701392 atcggagggaaagtaggcctagcttg 37701417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 40233655 - 40233515
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  40233655 atcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 40233556  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    | ||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233555 agctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 169
Target Start/End: Original strand, 12716742 - 12716863
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  12716742 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 12716841  T
Q  148 cttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
      | |||||||||| |||||||    
T  12716842 tatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37375305 - 37375000
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  37375305 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 37375206  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag---cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||    ||| ||||||||  | |||||| | || || || |||||    || ||||| |    
T  37375205 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcga 37375106  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    || |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || || || || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  37375105 tgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 37375006  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  37375005 cggagg 37375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 16829456 - 16829740
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||    
T  16829456 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16829555  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  16829556 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16829655  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16829656 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16829740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16892025 - 16891741
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||    
T  16892025 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16891926  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  16891925 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16891826  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16891825 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16891741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27803808 - 27803687
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||| |    
T  27803808 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 27803709  T
Q  148 cttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
      | |||||||||  |||||||    
T  27803708 tatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27777323 - 27777226
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27777323 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27817081 - 27816984
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27817081 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31876404 - 31876279
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | |||||||    
T  31876404 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggt 31876305  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  31876304 ataggaggaaaagtaggcctagcttg 31876279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 39051962 - 39052059
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39051962 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 39890197 - 39890150
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 73  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39890197 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 262
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261122
Alignment:
Q  149 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 248  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  249 tgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| || |||||    
T  261109 tgataaaacggtgg 261122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 9350122 - 9350219
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9350122 ggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12586911 - 12586814
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  12586911 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 31088458 - 31088784
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31088458 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 31088557  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  31088558 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 31088657  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31088658 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 31088757  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31088758 aggtagctgagcagcattgatgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45733609 - 45733283
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||     
T  45733609 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagt 45733510  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  45733509 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 45733410  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45733409 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 45733310  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45733309 aggtagctgagcagcattgatgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 16449992 - 16450309
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16449992 atcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 16450091  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||    
T  16450092 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacgg 16450191  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16450192 cattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacgg 16450291  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  16450292 aggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16041472 - 16041155
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16041472 atcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 16041373  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||    
T  16041372 aactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 16041273  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16041272 aattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 16041173  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  16041172 aggtaactgggcagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26484843 - 26484679
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484843 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 26484744  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484743 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 2108999 - 2109163
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108999 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 2109098  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109099 aactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 39211017 - 39211181
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211017 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 39211116  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39211117 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2775508 - 2775344
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775508 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 2775409  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2775408 tactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18540947 - 18540784
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540947 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 18540848  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540847 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 16503395 - 16503679
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  16503395 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16503494  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |   | ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16503495 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16503594  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16503595 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 16518431 - 16518715
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  16518431 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16518530  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |   | ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16518531 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16518630  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16518631 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 280
Target Start/End: Original strand, 10916883 - 10917137
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  10916883 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 10916982  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  10916983 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 10917082  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgaga 280  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||    
T  10917083 gacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5128141 - 5127818
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  5128141 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 5128042  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  5128041 aactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 5127942  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  5127941 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 5127842  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  5127841 cggaggcatttgagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 11424791 - 11425033
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  11424791 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 11424890  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11424891 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11424990  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  11424991 gttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 11425033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 5147334 - 5147615
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  5147334 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 5147433  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || || ||||    
T  5147434 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 5147533  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 283  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  5147534 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2154701 - 2154417
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  2154701 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 2154602  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||| ||    || ||| |||||||| |  |   ||||||||   | || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  2154601 atcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgag 2154502  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  2154501 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 2154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5159667 - 5159348
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  5159667 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 5159568  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  5159567 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 5159468  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  5159467 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 5159368  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgat 325  Q
    || | |||||||||||||||    
T  5159367 ggaaactgagcagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45387471 - 45387235
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  45387471 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 45387372  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  45387371 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 45387272  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45387271 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 45387235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 16736454 - 16736717
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  16736454 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16736553  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||    
T  16736554 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16736653  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  16736654 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaa 16736717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 16751508 - 16751771
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  16751508 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16751607  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||    
T  16751608 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16751707  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  16751708 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaa 16751771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17523681 - 17523418
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  17523681 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17523582  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||    
T  17523581 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17523482  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  17523481 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaa 17523418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 17529534 - 17529797
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  17529534 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17529633  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||    
T  17529634 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17529733  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  17529734 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaa 17529797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26435406 - 26435125
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  26435406 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 26435307  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||    
T  26435306 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 26435207  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 283  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  26435206 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 4145138 - 4145377
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  4145138 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 4145237  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || |||||    || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  4145238 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 4145337  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4145338 gttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 4145377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 26319884 - 26320123
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  26319884 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26319983  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  26319984 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26320083  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26320084 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 26320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9618779 - 9618654
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  9618779 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9618680  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  9618679 atcggagggaaagtaggcctagcttg 9618654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 26275109 - 26275234
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  26275109 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26275208  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  26275209 atcggagggaaagtaggcctagcttg 26275234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 26669929 - 26670054
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  26669929 gaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26670028  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  26670029 atcggagggaaagtaggcctagcttg 26670054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 31564405 - 31564526
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  31564405 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31564504  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  31564505 ataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 26537885 - 26538004
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  26537885 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26537984  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  26537985 ataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3445434 - 3445375
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3445434 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 3445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11441700 - 11441641
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11441700 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 31125048 - 31125001
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 73  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31125048 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11441513 - 11441449
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11441513 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 11441449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 13522124 - 13522450
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13522124 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 13522223  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  13522224 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 13522323  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13522324 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 13522423  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13522424 aggtagctgagcagcattgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 33374307 - 33374633
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33374307 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 33374406  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  33374407 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 33374506  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33374507 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 33374606  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33374607 aggtagctgagcagcattgatgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 8892361 - 8892687
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8892361 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 8892460  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  8892461 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacgg 8892560  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8892561 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 8892660  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8892661 aggtagctgagcagcattgatgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 8903596 - 8903922
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8903596 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 8903695  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  8903696 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacgg 8903795  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8903796 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 8903895  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8903896 aggtagctgagcagcattgatgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28162802 - 28162477
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28162802 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 28162703  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  28162702 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacgg 28162603  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28162602 cattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatgg 28162503  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtcca 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28162502 aggtagctgagcagcattgatgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 22477324 - 22477644
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  22477324 atcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagt 22477423  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | | || | |||||||||| |||| |||||||    
T  22477424 aactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaa 22477523  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22477524 ttgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacga 22477623  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | ||||||  || ||||||||    
T  22477624 cagaggtaattgggcagcatt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20160846 - 20160588
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||     
T  20160846 atcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagt 20160747  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20160746 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatgg 20160647  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  20160646 cattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtgga 20160588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 22171985 - 22172243
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||     
T  22171985 atcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagt 22172084  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22172085 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatgg 22172184  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  22172185 cattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtgga 22172243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 27290421 - 27290597
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290421 atcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 27290520  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27290521 aactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 14143336 - 14143500
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143336 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 14143435  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143436 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26788089 - 26787925
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788089 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 26787990  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26787989 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27196462 - 27196298
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196462 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 27196363  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196362 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 27252778 - 27252942
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252778 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 27252877  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252878 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 22456985 - 22457149
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  22456985 atcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagt 22457084  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22457085 aactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 22934931 - 22935233
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||    
T  22934931 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagc 22935030  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |    
T  22935031 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattg 22935130  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  22935131 cattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacgg 22935230  T
Q  305 agg 307  Q
    |||    
T  22935231 agg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 23857376 - 23857678
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||    
T  23857376 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagc 23857475  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |    
T  23857476 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattg 23857575  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  23857576 cattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacgg 23857675  T
Q  305 agg 307  Q
    |||    
T  23857676 agg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 24304690 - 24304992
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  24304690 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 24304789  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| |||||  |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24304790 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 24304889  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  24304890 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 24304989  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  24304990 gat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 13299023 - 13299307
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  13299023 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 13299122  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13299123 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 13299222  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13299223 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26918525 - 26918202
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||    
T  26918525 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 26918426  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| ||| || |||||||    
T  26918425 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaa 26918326  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  26918325 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 26918226  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  26918225 cggaggcatttgagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 15424389 - 15424673
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  15424389 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 15424488  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||| | ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15424489 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 15424588  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  15424589 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26989125 - 26988841
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  26989125 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 26989026  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||  |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  26989025 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 26988926  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26988925 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26988841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27000197 - 26999913
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  27000197 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 27000098  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27000097 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 26999998  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26999997 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26999913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16749999 - 16749695
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  16749999 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 16749900  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| |    
T  16749899 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 16749800  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  16749799 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 16749700  T
Q  302 cggag 306  Q
    |||||    
T  16749699 cggag 16749695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24863841 - 24863557
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  24863841 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24863742  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| || |    
T  24863741 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggg 24863642  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24863641 gttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29549620 - 29549300
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  29549620 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 29549521  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||| |||| || || ||||||   || ||||| ||||    
T  29549520 agctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 29549421  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  29549420 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 29549321  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgat 325  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  29549320 aggcatttgagctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4525410 - 4525174
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  4525410 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4525311  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  ||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  4525310 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 4525211  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4525210 ggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgg 4525174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 27272631 - 27272771
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||    
T  27272631 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagc 27272730  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  27272731 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27044532 - 27044275
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  27044532 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 27044433  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| ||||    
T  27044432 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 27044333  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27044332 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 27044275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4773130 - 4773009
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  4773130 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4773031  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  4773030 ataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29573137 - 29573012
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  29573137 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 29573038  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||    
T  29573037 ataggaggaaaagttggtctagcttg 29573012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3696205 - 3696086
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  3696205 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3696106  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3696105 ataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Original strand, 4545847 - 4545957
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  4545847 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4545946  T
Q  126 atcagaggaaa 136  Q
    ||  |||||||    
T  4545947 ataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Original strand, 4724206 - 4724316
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  4724206 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4724305  T
Q  126 atcagaggaaa 136  Q
    ||  |||||||    
T  4724306 ataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4757888 - 4757646
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  4757888 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4757789  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacct 219  Q
    ||  ||||||| || |||||||    ||  || ||||| ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || |    
T  4757788 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcactt 4757689  T
Q  220 gaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4757688 gaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 4757646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28207578 - 28207468
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  28207578 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 28207479  T
Q  126 atcagaggaaa 136  Q
    ||  |||||||    
T  28207478 ataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 34463397 - 34463537
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||    
T  34463397 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 34463496  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34463497 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 30558088 - 30558391
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||    
T  30558088 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30558187  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  30558188 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30558287  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  30558288 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30558387  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  30558388 gatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 26777687 - 26777821
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||    
T  26777687 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggt 26777786  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 160  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  26777787 ataggagggaaggttggtctagcatattgctgctg 26777821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29501361 - 29501228
Alignment:
Q  192 tgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcat 291  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||    
T  29501361 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 29501262  T
Q  292 acgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    | |||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29501261 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29501539 - 29501418
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  29501539 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 29501440  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  |||| ||||| |||||||    
T  29501439 ataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16674284 - 16674204
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16674284 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 16674204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27007872 - 27007792
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  27007872 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 27007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27485253 - 27485206
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 73  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485253 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 27485206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 67
Target Start/End: Original strand, 26116482 - 26116523
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 67  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26116482 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630008
Alignment:
Q  149 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 248  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||| || | || ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  249 tg 250  Q
    ||    
T  27630007 tg 27630008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 13184653 - 13184979
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13184653 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 13184752  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  13184753 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 13184852  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13184853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 13184952  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13184953 aggtagctgagcagcattgatgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33877404 - 33877078
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33877404 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 33877305  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  33877304 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 33877205  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33877204 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 33877105  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33877104 aggtagctgagcagcattgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 13440499 - 13440825
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13440499 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 13440598  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  13440599 aatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 13440698  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13440699 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 13440798  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13440799 aggtagctgagcagcattgatgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11325951 - 11325625
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11325951 atcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 11325852  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||    
T  11325851 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacgg 11325752  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11325751 cattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 11325652  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11325651 aggtagctgagcagcattgatgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22888627 - 22888310
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22888627 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagt 22888528  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||    
T  22888527 aactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 22888428  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22888427 cattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 22888328  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  22888327 aggtaactgggcagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25199186 - 25198884
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25199186 atcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 25199087  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||    
T  25199086 aactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 25198987  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  25198986 cgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacgg 25198887  T
Q  305 agg 307  Q
    |||    
T  25198886 agg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23892363 - 23892058
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892363 atcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagc 23892264  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||   | | || |||||||||||| |||||||| | |    
T  23892263 aactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacga 23892164  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  23892163 tggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacga 23892064  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  23892063 cggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 29889095 - 29889263
Alignment:
Q  13 tgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagc 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29889095 tgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagc 29889194  T
Q  113 atatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 181  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889195 atacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24970154 - 24969876
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  24970154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 24970055  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||| || |||   |||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24970054 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgt---tgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggtt 24969958  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24969957 gacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30934769 - 30934488
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  30934769 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 30934670  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  30934669 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 30934570  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  30934569 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 30934488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11549490 - 11549248
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  11549490 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 11549391  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11549390 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11549291  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11549290 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaa 11549248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 23752455 - 23752760
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||    
T  23752455 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 23752554  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| |    
T  23752555 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 23752654  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  23752655 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 23752754  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  23752755 cggagg 23752760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 23718014 - 23718298
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  23718014 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 23718113  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23718114 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23718213  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  23718214 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 23718298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 24688183 - 24688467
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| |  || |||    
T  24688183 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggt 24688282  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  24688283 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgag 24688382  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24688383 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33777644 - 33777321
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  33777644 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 33777545  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| |    
T  33777544 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 33777445  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  33777444 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 33777345  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  33777344 cggaggcatttgagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 22999119 - 22999424
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||    
T  22999119 atcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagc 22999218  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| |    
T  22999219 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 22999318  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  22999319 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 22999418  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  22999419 cggagg 22999424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 9548548 - 9548811
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  9548548 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 9548647  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    || |||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || |||||||    
T  9548648 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 9548747  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  9548748 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 9548811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30168605 - 30168302
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  30168605 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30168506  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  30168505 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30168406  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  30168405 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30168306  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  30168305 gatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 8665501 - 8665743
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  8665501 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 8665600  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  8665601 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 8665700  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8665701 gttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaa 8665743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34616654 - 34616418
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  34616654 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 34616555  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  34616554 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 34616455  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
      || | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  34616454 agccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 34616418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33292681 - 33292362
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  33292681 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 33292582  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  33292581 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 33292482  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  33292481 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 33292382  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgat 325  Q
    || | |||||||||||||||    
T  33292381 ggaaactgagcagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15658765 - 15659013
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  15658765 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 15658864  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  15658865 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 15658964  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatg 250  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15658965 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatg 15659013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2511187 - 2511062
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  2511187 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 2511088  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  2511087 atcggagggaaagtaggcctagcttg 2511062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 15758883 - 15759008
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  15758883 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15758982  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  15758983 atcggagggaaagtaggcctagcttg 15759008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41674866 - 41674603
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  41674866 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 41674767  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    || |||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||    
T  41674766 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaa 41674667  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  41674666 ttgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 41674603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6874462 - 6874199
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  6874462 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 6874363  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  6874362 agctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 6874263  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  6874262 caattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 6874199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12132291 - 12132052
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  12132291 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12132192  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  12132191 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 12132092  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12132091 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 12132052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26480528 - 26480403
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  26480528 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26480429  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  26480428 atcggagggaaagtaggcctagcttg 26480403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 32599477 - 32599734
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  32599477 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 32599576  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    |||||||| ||||    
T  32599577 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatgg 32599676  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  32599677 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 32599734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 37671488 - 37671630
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||    
T  37671488 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 37671587  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37671588 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5638046 - 5637921
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  5638046 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5637947  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  5637946 atcggagggaaagtaggcctagcttg 5637921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9317587 - 9317462
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  9317587 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9317488  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  9317487 atcggagggaaagtaggcctagcttg 9317462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30152154 - 30152029
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  30152154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30152055  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  30152054 atcggagggaaagtaggcctagcttg 30152029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 18500735 - 18500877
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  18500735 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18500834  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||||    
T  18500835 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28649392 - 28649250
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  28649392 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28649293  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  28649292 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31431576 - 31431466
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  31431576 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31431477  T
Q  126 atcagaggaaa 136  Q
    ||  |||||||    
T  31431476 ataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 18375438 - 18375741
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  18375438 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 18375537  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  18375538 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 18375637  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  18375638 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18375737  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  18375738 gatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 37770992 - 37771134
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || |||    
T  37770992 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagc 37771091  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37771092 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 28959812 - 28959946
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  28959812 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 28959911  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 160  Q
    ||  ||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  28959912 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctg 28959946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33516492 - 33516189
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||    
T  33516492 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 33516393  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  33516392 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 33516293  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  33516292 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcatt 33516193  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  33516192 gatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37755116 - 37754995
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  37755116 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 37755017  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  37755016 ataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 31826433 - 31826492
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31826433 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Original strand, 37358669 - 37358812
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  37358669 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 37358768  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    ||  ||||||| || |||||||  |  ||||||||| |||||||    
T  37358769 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24681554 - 24681457
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24681554 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24724081 - 24723984
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24724081 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 40473597 - 40473694
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  40473597 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31431389 - 31431325
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  31431389 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 31431325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43078409 - 43078146
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  43078409 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 43078310  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg------tcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||| |  | |||||||||      | |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  43078309 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 43078210  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  43078209 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 43078146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3789487 - 3789360
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggt 297  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  ||  ||| ||||    
T  3789487 gcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 3789388  T
Q  298 acgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  3789387 atgacggaggcatttgagctgcattgat 3789360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3789677 - 3789618
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3789677 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 3789618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Original strand, 18500949 - 18501013
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  18500949 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 18501013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 24460713 - 24461039
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24460713 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 24460812  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  24460813 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 24460912  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24460913 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 24461012  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24461013 aggtagctgagcagcattgatgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15228033 - 15227716
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15228033 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 15227934  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  |    
T  15227933 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacag 15227834  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227833 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 15227734  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  15227733 aggtaactgggcagcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 15285036 - 15285353
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15285036 atcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 15285135  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  15285136 aactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatgg 15285235  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  15285236 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatgg 15285335  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  15285336 aggtaactgggcagcatt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1900420 - 1900103
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1900420 atcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 1900321  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||    
T  1900320 aactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 1900221  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1900220 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 1900121  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  1900120 aggtaactgggcagcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 14235633 - 14235953
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  14235633 atcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagc 14235732  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14235733 agctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaa 14235832  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||  |||| ||||||     
T  14235833 tggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatactggtacgg 14235932  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  14235933 cagaggtaactgagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Original strand, 15391450 - 15391764
Alignment:
Q  9 cacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  15391450 cacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaact 15391549  T
Q  109 cagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 208  Q
    | || || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15391550 cggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgt---tgttgagccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcatt 15391646  T
Q  209 aacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
     | ||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| ||||    
T  15391647 gatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcgga 15391743  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgatg 326  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  15391744 ggtagctgagcaacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17014163 - 17013858
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||    
T  17014163 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagc 17014064  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||    
T  17014063 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 17013964  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||    
T  17013963 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatga 17013864  T
Q  302 cggagg 307  Q
     |||||    
T  17013863 aggagg 17013858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 24592443 - 24592742
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  24592443 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24592542  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24592543 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 24592642  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  24592643 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14665160 - 14664858
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  14665160 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 14665061  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14665060 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 14664961  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  14664960 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 14664861  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  14664860 gat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 14763412 - 14763717
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  14763412 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 14763511  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |    
T  14763512 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 14763611  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  14763612 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 14763711  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  14763712 cggagg 14763717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Original strand, 34189069 - 34189388
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  34189069 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 34189168  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  34189169 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 34189268  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  34189269 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 34189368  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgat 325  Q
    || | |||||||||||||||    
T  34189369 ggaaactgagcagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24112824 - 24112506
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  24112824 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 24112725  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  24112724 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 24112625  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  24112624 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 24112525  T
Q  306 ggtagctgagcagcattga 324  Q
    || | ||||||||||||||    
T  24112524 ggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Original strand, 27163446 - 27163682
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  27163446 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 27163545  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  27163546 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 27163645  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27163646 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 27163682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5006036 - 5005776
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  5006036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5005937  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  5005936 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 5005837  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5005836 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 5005776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 36344623 - 36344925
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  36344623 atcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 36344722  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| ||||    
T  36344723 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 36344822  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| | || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  36344823 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 36344922  T
Q  305 agg 307  Q
    |||    
T  36344923 agg 36344925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6570016 - 6569753
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  6570016 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 6569917  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    |  || ||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| | |||||| ||||   |||||||| | | || || ||||    
T  6569916 agttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 6569817  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  6569816 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 6569753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14098683 - 14098381
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  14098683 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 14098584  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  14098583 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 14098484  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  14098483 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 14098384  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  14098383 gat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54833550 - 54833230
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  54833550 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 54833451  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||||||||    
T  54833450 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 54833351  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  54833350 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 54833251  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgat 325  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  54833250 aggcatttgagctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 18800742 - 18800863
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  18800742 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 18800841  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  18800842 ataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 31126647 - 31126949
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||    
T  31126647 gaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 31126746  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  31126747 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 31126846  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  31126847 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 31126946  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  31126947 gat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 33673906 - 33674046
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||    
T  33673906 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 33674005  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  33674006 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 40105767 - 40105892
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  |||||||||| ||| |||    
T  40105767 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggt 40105866  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  40105867 atcggagggaaagtaggcctagcttg 40105892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30753896 - 30753837
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30753896 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 30753837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39850758 - 39850661
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39850758 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21969671 - 21969613
Alignment:
Q  195 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgata 253  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21969671 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgata 21969613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  224 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 323  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  324 at 325  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 17993933 - 17994259
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17993933 atcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 17994032  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  17994033 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 17994132  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17994133 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 17994232  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17994233 aggtagctgagcagcattgatgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4626053 - 4625727
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4626053 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagt 4625954  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |     
T  4625953 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacga 4625854  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 4625754  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4625753 aggtagctgagcagcattgatgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5652496 - 5652170
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  5652496 atcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagt 5652397  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||    
T  5652396 aattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgg 5652297  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5652296 cattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 5652197  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5652196 aggtagctgagcagcattgatgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 16626655 - 16626972
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  16626655 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagt 16626754  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16626755 aactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatgg 16626854  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16626855 cattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacgg 16626954  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  16626955 aggtaactgggcagcatt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18530497 - 18530186
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18530497 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagt 18530398  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | ||    
T  18530397 aactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacgg 18530304  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18530303 cattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatgg 18530204  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  18530203 aggtaactgggcagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32292861 - 32292697
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292861 atcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 32292762  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292761 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 31034266 - 31034430
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034266 atcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 31034365  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31034366 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5713315 - 5713007
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  5713315 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5713216  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| || |   | ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||    
T  5713215 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5713116  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5713115 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5713016  T
Q  323 gatgtccat 331  Q
    |||||||||    
T  5713015 gatgtccat 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5724225 - 5723917
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  5724225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5724126  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| || |   | ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||    
T  5724125 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5724026  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5724025 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5723926  T
Q  323 gatgtccat 331  Q
    |||||||||    
T  5723925 gatgtccat 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Original strand, 5757252 - 5757560
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  5757252 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5757351  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| || |   | ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||    
T  5757352 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5757451  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5757452 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5757551  T
Q  323 gatgtccat 331  Q
    |||||||||    
T  5757552 gatgtccat 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Original strand, 5768143 - 5768451
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  5768143 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5768242  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| || |   | ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||    
T  5768243 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5768342  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5768343 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5768442  T
Q  323 gatgtccat 331  Q
    |||||||||    
T  5768443 gatgtccat 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 15892876 - 15893178
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15892876 gaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggt 15892975  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15892976 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 15893075  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  15893076 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcatt 15893175  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  15893176 gat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 8301437 - 8301736
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  8301437 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8301536  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8301537 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggtt 8301636  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||    
T  8301637 gacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18051350 - 18051066
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  18051350 gaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 18051251  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18051250 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18051151  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  18051150 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8296060 - 8295779
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  8296060 gaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8295961  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 225  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |  ||| ||||||||  |||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  8295960 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 8295861  T
Q  226 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| || || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  8295860 gacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 22387727 - 22388047
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  22387727 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 22387826  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| ||||    
T  22387827 aactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 22387926  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || | ||| || || | | ||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  22387927 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgg 22388026  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgat 325  Q
     || | |||||||||||||||    
T  22388027 gggaaactgagcagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 4796823 - 4797107
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||    
T  4796823 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 4796922  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4796923 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 4797022  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  4797023 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 4797107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35880854 - 35880552
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  35880854 gaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 35880755  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  35880754 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 35880655  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  35880654 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 35880555  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  35880554 gat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4721740 - 4721477
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  4721740 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 4721641  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   ||||||||   | || |||||||    
T  4721640 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaa 4721541  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  4721540 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaa 4721477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18330757 - 18330460
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18330757 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggt 18330658  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18330657 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18330558  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||| ||||| |||     ||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  18330557 gttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18330463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6192425 - 6192102
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  6192425 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 6192326  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||    
T  6192325 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 6192226  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  6192225 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 6192126  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  6192125 cggaggcatttgagctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 29148904 - 29149209
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  29148904 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 29149003  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| |    
T  29149004 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 29149103  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  29149104 ttgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 29149203  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  29149204 cggagg 29149209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 18277201 - 18277506
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  18277201 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18277300  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |    
T  18277301 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18277400  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18277401 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18277500  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  18277501 cggagg 18277506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 18292502 - 18292807
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  18292502 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18292601  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |    
T  18292602 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18292701  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18292702 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18292801  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  18292802 cggagg 18292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 18307803 - 18308108
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  18307803 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18307902  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |    
T  18307903 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18308002  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18308003 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18308102  T
Q  302 cggagg 307  Q
    ||||||    
T  18308103 cggagg 18308108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4893318 - 4892999
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  4893318 tcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 4893219  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  4893218 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 4893119  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  4893118 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 4893019  T
Q  306 ggtagctgagcagcattgat 325  Q
    || | |||||||||||||||    
T  4893018 ggaaactgagcagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7996650 - 7996414
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  7996650 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7996551  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  7996550 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 7996451  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  7996450 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 7996414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10643158 - 10642922
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  10643158 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10643059  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  10643058 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 10642959  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10642958 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 10642922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 28116103 - 28116363
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  28116103 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28116202  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgag 198  Q
    || |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || |    
T  28116203 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 28116302  T
Q  199 caatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28116303 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 28116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47023541 - 47023302
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  47023541 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 47023442  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  47023441 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgag 47023342  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  47023341 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 47023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32439262 - 32438944
Alignment:
Q  6 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 105  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  32439262 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 32439163  T
Q  106 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggc 205  Q
      || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||    
T  32439162 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 32439063  T
Q  206 attaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 305  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  32439062 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 32438963  T
Q  306 ggtagctgagcagcattga 324  Q
    || | ||||||||||||||    
T  32438962 ggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7073321 - 7073058
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  7073321 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 7073222  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||    
T  7073221 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 7073122  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  7073121 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 7073058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 15741264 - 15741536
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  15741264 gaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15741363  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| || |   | ||| |||||||| ||||   ||||||            ||| || |||||||||||||| ||||    
T  15741364 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcgattgcattaacgggtacttgag 15741451  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  15741452 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 15741536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 17985126 - 17985429
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||    
T  17985126 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 17985225  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  17985226 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 17985325  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  17985326 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 17985425  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  17985426 gatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 5609471 - 5609617
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  5609471 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5609570  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  5609571 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 5609617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28339411 - 28339265
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  28339411 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28339312  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  28339311 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 28339265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 31964622 - 31964768
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  31964622 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31964721  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  31964722 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 31964768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 50134220 - 50134366
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  50134220 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 50134319  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  50134320 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 50134366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 6542632 - 6542753
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  6542632 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 6542731  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||    
T  6542732 ataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8211847 - 8211527
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  8211847 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 8211748  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||  ||||||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| ||||    
T  8211747 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 8211648  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  8211647 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacgg 8211548  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgat 325  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  8211547 aggcatttgagctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10396242 - 10395982
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  10396242 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 10396143  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    | ||| ||||| | ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||  |   || ||||| |    
T  10396142 agctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacc---tgttgagcga 10396046  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10396045 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaa 10395982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4417028 - 4416882
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  4417028 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 4416929  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  4416928 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 4416882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 4346836 - 4347093
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| ||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 4347035  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4347036 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 4347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20066109 - 20065850
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  20066109 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T
Q  148 cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactg 247  Q
      | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  20066009 tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactg 20065910  T
Q  248 atgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    |||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  20065909 atgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 20065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5467073 - 5466834
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||    
T  5467073 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggt 5466974  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    || |||||||| || |||||| |   ||| ||||||||  | |||||| |||| || ||  ||||    || ||||| |||||||| || || |||||||    
T  5466973 ataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 5466874  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5466873 gttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgg 5466834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28021384 - 28021127
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28021384 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaaga 28021285  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| ||||    
T  28021284 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 28021185  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28021184 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 28021127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21674802 - 21674479
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  21674802 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaaga 21674703  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||    
T  21674702 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 21674603  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacga 301  Q
    | || || | ||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||| || ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  21674602 ttgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 21674503  T
Q  302 cggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  21674502 cggaggcatttgagctgcattgat 21674479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18225279 - 18224977
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  18225279 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 18225180  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  |||| |||||||| |||||||||||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  18225179 ataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 18225080  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  18225079 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18224980  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  18224979 gat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 36997247 - 36997366
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||    
T  36997247 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 36997346  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  36997347 ataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 11110498 - 11110578
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11110498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 11110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51782111 - 51782052
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782111 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 5596527 - 5596648
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  5596527 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 5596626  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctag 147  Q
    ||  |||| ||||| |||||||    
T  5596627 ataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Original strand, 5596705 - 5596838
Alignment:
Q  192 tgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcat 291  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||    
T  5596705 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 5596804  T
Q  292 acgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 325  Q
    | |||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5596805 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 20577039 - 20577136
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  20577039 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 145
Target Start/End: Original strand, 29665162 - 29665259
Alignment:
Q  48 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 145  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  29665162 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 29665330 - 29665415
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 283  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  29665330 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 48466036 - 48465956
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  48466036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 48465956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5013800 - 5013741
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5013800 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5013741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18242827 - 18242780
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 73  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242827 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 18242780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51797192 - 51797141
Alignment:
Q  34 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 85  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797192 gaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Original strand, 11110706 - 11110770
Alignment:
Q  198 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11110706 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 11110770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 2766 - 3092
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2766 atcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagt 2865  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||    
T  2866 agctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacgg 2965  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2966 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacgg 3065  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3066 aggtagctgagcagcattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 20340443 - 20340769
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  20340443 atcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagt 20340542  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||    
T  20340543 agctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacgg 20340642  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20340643 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacgg 20340742  T
Q  305 aggtagctgagcagcattgatgtccat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20340743 aggtagctgagcagcattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 16208139 - 16208453
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16208139 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 16208238  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16208239 aactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgatgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatgg 16208335  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| |||    
T  16208336 cattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcgg 16208435  T
Q  305 aggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  16208436 aggtaactgggcagcatt 16208453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20461228 - 20461076
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20461228 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 20461129  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctg 157  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461128 aactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctg 20461076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28152009 - 28151845
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152009 atcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 28151910  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151909 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460935
Alignment:
Q  178 gctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctg 277  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  278 agagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcatt 20460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 41793416 - 41793673
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||    
T  41793416 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 41793515  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | ||  ||||||    
T  41793516 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaa 41793615  T
Q  202 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 259  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41793616 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 41793673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28585107 - 28584805
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  28585107 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28585008  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  28585007 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 28584908  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  28584907 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 28584808  T
Q  323 gat 325  Q
    |||    
T  28584807 gat 28584805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10962796 - 10962671
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  10962796 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10962697  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  10962696 atcggagggaaagtaggcctagcttg 10962671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20536 - 20240
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 20437  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| |||||||| | | ||    
T  20436 aactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgct---------------------gttgttgcatttgctgaacgacgg 20358  T
Q  205 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20357 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacgg 20258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30296
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||    
T  30579 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30480  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||| || |   | ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  30479 ataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 30381  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  30380 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21705 - 21391
Alignment:
Q  9 cacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||    
T  21705 cacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagct 21606  T
Q  109 cagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatt 208  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||   | |||| |||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21605 cggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgct---gctgttaagccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcatt 21509  T
Q  209 aacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggt 308  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| |||||| |||||||    
T  21508 gacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggt 21409  T
Q  309 agctgagcagcattgatg 326  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21408 agctgagaagcattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 136 - 312
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  136 atcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 235  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  236 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29890 - 29606
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  29890 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 29791  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  29790 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgag 29691  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  29690 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggagg 29606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 40198 - 40482
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  40198 gaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 40297  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40298 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgag 40397  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  40398 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggagg 40482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 47114 - 47356
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  47114 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 47213  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47214 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 47313  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 265  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  47314 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaa 47356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27419 - 27135
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  27419 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 27320  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  27319 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27220  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 307  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27219 gttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 258 - 561
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact-cagcatatagcattgg 124  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||  |||||||| ||| ||    
T  258 gaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcgg 357  T
Q  125 tatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctga 221  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  358 tatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttga 457  T
Q  222 ggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcat 321  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  458 ggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcat 557  T
Q  322 tgat 325  Q
    ||||    
T  558 tgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 2025 - 2103
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2025 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6047
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagt-agagtcgggag 103  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||| | ||| || ||    
T  6160 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaag 6061  T
Q  104 caactcagcatata 117  Q
    ||||||||||||||    
T  6060 caactcagcatata 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7607
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  7368 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7467  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  7468 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 7567  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  7568 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 7607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9320
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  9195 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9294  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  9295 atcggagggaaagtaggcctagcttg 9320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20142 - 20017
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  20142 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20043  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  20042 atcggagggaaagtaggcctagcttg 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 15059 - 15362
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||    
T  15059 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 15158  T
Q  126 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgag 222  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  15159 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 15258  T
Q  223 gttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 322  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  15259 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 15358  T
Q  323 gatg 326  Q
    ||||    
T  15359 gatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8076 - 7966
Alignment:
Q  26 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggt 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  8076 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 7977  T
Q  126 atcagaggaaa 136  Q
    ||  |||||||    
T  7976 ataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Original strand, 26338 - 26456
Alignment:
Q  33 ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagag 132  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  |||    
T  26338 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 26437  T
Q  133 gaaaggtaggtctagcttg 151  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  26438 gaaaagtaggcctagcttg 26456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9714 - 9559
Alignment:
Q  5 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 104  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  9714 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 9615  T
Q  105 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 160  Q
    |  || ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  9614 agttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctg 9559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 8120
Alignment:
Q  195 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 262  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8187 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgg 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University