View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6842_high_1 (Length: 674)

Name: NF6842_high_1
Description: NF6842
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6842_high_1
NF6842_high_1
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (1-674)||(19019351-19020019)
chr4 (1-674)||(8373392-8374050)
chr4 (4-516)||(5683458-5683970)
chr4 (1-516)||(18247235-18247749)
chr4 (1-496)||(22355159-22355651)
chr4 (4-498)||(14995157-14995651)
chr4 (4-486)||(19698075-19698549)
chr4 (4-486)||(19708660-19709134)
chr4 (4-516)||(55377288-55377801)
chr4 (138-496)||(18250785-18251142)
chr4 (141-516)||(18167839-18168214)
chr4 (1-252)||(17146379-17146630)
chr4 (4-257)||(18293758-18294011)
chr4 (4-218)||(16731469-16731683)
chr4 (4-227)||(14951053-14951277)
chr4 (292-496)||(18294009-18294212)
chr4 (4-227)||(43281788-43282012)
chr4 (1-167)||(47357027-47357193)
chr4 (233-486)||(16328854-16329106)
chr4 (310-486)||(10487645-10487820)
chr4 (312-496)||(26679105-26679288)
chr4 (1-167)||(10643590-10643756)
chr4 (310-486)||(9794315-9794490)
chr4 (369-518)||(54119342-54119491)
chr4 (371-516)||(45460028-45460173)
chr4 (586-674)||(34393981-34394069)
chr4 (231-516)||(9294572-9294857)
chr4 (581-674)||(18294300-18294393)
chr4 (231-385)||(13447995-13448149)
chr4 (230-444)||(34197110-34197326)
chr4 (1-94)||(18168210-18168303)
chr4 (588-674)||(47356257-47356343)
chr4 (586-674)||(5684039-5684128)
chr4 (369-516)||(15273722-15273869)
chr4 (369-516)||(16521730-16521877)
chr4 (371-516)||(44054863-44055009)
chr4 (4-90)||(25120137-25120223)
chr4 (303-389)||(40901660-40901746)
chr4 (231-404)||(7965645-7965818)
chr4 (230-394)||(41257282-41257443)
chr4 (233-389)||(50220861-50221017)
chr4 (364-518)||(21960633-21960787)
chr4 (230-399)||(34394259-34394429)
chr4 (236-399)||(41917667-41917830)
chr4 (230-315)||(820754-820839)
chr4 (369-498)||(12900839-12900967)
chr4 (236-389)||(42707864-42708017)
chr4 (4-124)||(15287961-15288083)
chr4 (4-124)||(15295071-15295193)
chr4 (233-389)||(47469245-47469401)
chr4 (236-389)||(12733264-12733417)
chr4 (363-495)||(23270990-23271119)
chr4 (230-326)||(14900625-14900721)
chr4 (369-516)||(33739206-33739353)
chr4 (411-516)||(821222-821329)
chr4 (236-399)||(13593643-13593806)
chr4 (233-327)||(43282341-43282435)
chr4 (241-496)||(13810560-13810812)
chr4 (598-674)||(18110001-18110078)
chr4 (230-394)||(38763887-38764049)
chr4 (230-326)||(12245188-12245284)
chr4 (310-389)||(19558536-19558615)
chr4 (586-633)||(33739090-33739137)
chr4 (586-636)||(110302-110352)
chr4 (586-636)||(8873780-8873830)
chr4 (586-636)||(18167612-18167662)
chr4 (19-128)||(22737671-22737781)
chr4 (586-636)||(53909056-53909106)
chr4 (432-516)||(7133473-7133558)
chr4 (586-635)||(15274046-15274095)
chr4 (586-635)||(18247009-18247058)
chr4 (236-325)||(19822657-19822746)
chr4 (586-635)||(19999348-19999397)
chr4 (369-516)||(30233612-30233759)
chr4 (230-326)||(15044074-15044170)
chr4 (230-326)||(15110254-15110350)
chr4 (586-634)||(16521612-16521660)
chr4 (405-516)||(53705915-53706027)
chr4 (519-586)||(55377963-55378031)
chr4 (586-629)||(7133735-7133778)
chr4 (413-496)||(18109813-18109896)
chr4 (405-500)||(44345786-44345881)
chr4 (589-636)||(53706079-53706126)
chr4 (586-636)||(44054744-44054794)
chr4 (586-635)||(821398-821447)
chr4 (437-498)||(19999487-19999548)
chr4 (4-124)||(26338425-26338548)
chr4 (523-593)||(8043951-8044018)
chr4 (230-298)||(16731066-16731134)
chr4 (371-498)||(8873619-8873745)
chr4 (586-629)||(14950847-14950890)
chr4 (230-285)||(15014209-15014264)
chr4 (586-629)||(15212171-15212214)
chr4 (586-636)||(13245272-13245322)
chr4 (586-628)||(15288296-15288338)
chr4 (586-636)||(26338304-26338354)
chr4 (586-635)||(9294346-9294395)
chr4 (586-627)||(15295406-15295447)
chr4 (586-635)||(22355850-22355899)
chr4 (431-496)||(25120253-25120318)
chr4 (588-629)||(30233831-30233872)
chr4 (245-326)||(41166895-41166976)
chr4 (588-629)||(45460244-45460285)
chr4 (589-629)||(18495695-18495735)
chr4 (586-629)||(5684188-5684231)
chr4 (303-410)||(7186916-7187023)
chr4 (586-625)||(8373186-8373225)
chr4 (586-629)||(10643016-10643059)
chr4 (586-629)||(14995024-14995067)
chr4 (586-629)||(34393883-34393926)
chr4 (586-629)||(44345657-44345700)
chr4 (586-636)||(25120408-25120458)
chr4 (586-635)||(12901058-12901107)
chr4 (519-576)||(14910977-14911034)
chr4 (586-635)||(26678856-26678905)
chr4 (586-622)||(21960854-21960890)
chr4 (461-516)||(53908963-53909019)
chr4 (586-625)||(23271210-23271249)
chr4 (586-629)||(47356155-47356198)
chr4 (644-674)||(14950950-14950980)
chr4 (644-674)||(15288204-15288234)
chr4 (644-674)||(22355760-22355790)
chr4 (526-587)||(22737477-22737539)
chr4 (526-568)||(23271432-23271474)
chr4 (644-674)||(26678966-26678996)
chr4 (586-635)||(10487492-10487541)
chr4 (587-628)||(13810907-13810948)
chr4 (522-567)||(14502868-14502913)
chr4 (586-635)||(16329210-16329259)
chr4 (369-478)||(18275834-18275943)
chr4 (586-623)||(18294453-18294490)
chr4 (231-324)||(37958056-37958149)
chr4 (499-527)||(14911092-14911120)
chr4 (644-672)||(15295314-15295342)
chr4 (310-382)||(49070950-49071022)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (7-674)||(20253207-20253862)
chr1 (1-516)||(15862140-15862656)
chr1 (4-516)||(22249665-22250177)
chr1 (1-218)||(22366321-22366537)
chr1 (310-486)||(51451586-51451761)
chr1 (311-498)||(41218414-41218600)
chr1 (313-496)||(22365718-22365901)
chr1 (1-128)||(18060674-18060801)
chr1 (1-128)||(7641659-7641787)
chr1 (231-389)||(18165268-18165426)
chr1 (230-516)||(2421916-2422193)
chr1 (4-128)||(17003792-17003916)
chr1 (236-492)||(8538883-8539140)
chr1 (236-492)||(8604122-8604379)
chr1 (4-93)||(21858510-21858599)
chr1 (586-674)||(22353058-22353146)
chr1 (371-498)||(35053802-35053928)
chr1 (369-516)||(20826192-20826339)
chr1 (230-444)||(27673867-27674079)
chr1 (4-128)||(21650972-21651098)
chr1 (230-389)||(5769107-5769267)
chr1 (371-498)||(21717163-21717288)
chr1 (230-472)||(22144313-22144554)
chr1 (371-516)||(22407272-22407418)
chr1 (231-442)||(5471320-5471531)
chr1 (371-516)||(18506296-18506441)
chr1 (4-100)||(44035921-44036018)
chr1 (230-399)||(49998243-49998412)
chr1 (374-516)||(5675681-5675823)
chr1 (371-498)||(35523496-35523622)
chr1 (236-389)||(40437197-40437351)
chr1 (238-322)||(22836181-22836265)
chr1 (230-492)||(17607932-17608194)
chr1 (230-324)||(13377702-13377796)
chr1 (303-389)||(33396504-33396590)
chr1 (369-516)||(27330847-27330994)
chr1 (230-326)||(20176385-20176481)
chr1 (581-636)||(20444567-20444622)
chr1 (581-636)||(20530332-20530387)
chr1 (586-636)||(18506177-18506227)
chr1 (586-636)||(20526939-20526989)
chr1 (586-636)||(22407487-22407537)
chr1 (586-635)||(15862725-15862774)
chr1 (586-635)||(20826516-20826565)
chr1 (231-496)||(20955910-20956172)
chr1 (4-124)||(22029700-22029822)
chr1 (586-629)||(21858384-21858427)
chr1 (521-576)||(32650491-32650546)
chr1 (586-629)||(37845758-37845801)
chr1 (431-498)||(51657447-51657514)
chr1 (586-636)||(7641887-7641937)
chr1 (304-386)||(20193214-20193296)
chr1 (586-636)||(41393271-41393321)
chr1 (586-636)||(44036192-44036242)
chr1 (4-124)||(22034851-22034974)
chr1 (448-516)||(44036055-44036124)
chr1 (230-326)||(36357329-36357425)
chr1 (586-630)||(51657606-51657650)
chr1 (243-326)||(16655658-16655741)
chr1 (586-629)||(17147608-17147651)
chr1 (586-629)||(18060901-18060944)
chr1 (307-370)||(21224404-21224467)
chr1 (442-516)||(22353215-22353290)
chr1 (585-636)||(35523712-35523763)
chr1 (230-325)||(37234903-37234998)
chr1 (586-636)||(22031008-22031058)
chr1 (586-636)||(22034666-22034716)
chr1 (590-636)||(41210867-41210913)
chr1 (374-500)||(41211003-41211128)
chr1 (586-636)||(45050503-45050553)
chr1 (586-636)||(49966470-49966520)
chr1 (586-635)||(2422263-2422312)
chr1 (586-630)||(22352955-22352999)
chr1 (230-326)||(38034608-38034704)
chr1 (586-629)||(5675893-5675936)
chr1 (437-496)||(17147743-17147802)
chr1 (231-326)||(19602259-19602354)
chr1 (586-629)||(22365583-22365626)
chr1 (586-629)||(35053668-35053711)
chr1 (586-636)||(21651229-21651279)
chr1 (421-486)||(49966619-49966684)
chr1 (592-636)||(20894991-20895035)
chr1 (586-629)||(17003649-17003691)
chr1 (262-325)||(17022718-17022781)
chr1 (586-629)||(22029522-22029565)
chr1 (586-620)||(22250245-22250279)
chr1 (586-628)||(22836530-22836572)
chr1 (586-635)||(51451433-51451482)
chr1 (586-636)||(21717027-21717074)
chr1 (499-527)||(32650606-32650634)
[»] chr8 (143 HSPs)
chr8 (1-674)||(17150715-17151374)
chr8 (4-514)||(22007188-22007700)
chr8 (4-496)||(13663191-13663682)
chr8 (4-422)||(22146567-22146984)
chr8 (4-486)||(18611485-18611959)
chr8 (1-326)||(18618515-18618840)
chr8 (6-310)||(39114116-39114420)
chr8 (218-496)||(13721940-13722217)
chr8 (191-496)||(28836665-28836968)
chr8 (233-498)||(24718350-24718613)
chr8 (4-210)||(24717813-24718019)
chr8 (310-494)||(24930014-24930197)
chr8 (1-167)||(223404-223570)
chr8 (1-167)||(699817-699983)
chr8 (1-167)||(737027-737193)
chr8 (1-167)||(860922-861088)
chr8 (519-674)||(18618099-18618253)
chr8 (233-486)||(5237170-5237422)
chr8 (233-486)||(24662176-24662428)
chr8 (310-486)||(43684629-43684804)
chr8 (310-498)||(22908387-22908572)
chr8 (1-137)||(688175-688311)
chr8 (4-128)||(15320091-15320215)
chr8 (4-128)||(15500460-15500584)
chr8 (4-128)||(22089475-22089599)
chr8 (4-128)||(272266-272390)
chr8 (4-128)||(829265-829389)
chr8 (231-389)||(18262425-18262582)
chr8 (231-389)||(45468232-45468390)
chr8 (4-128)||(643459-643583)
chr8 (588-674)||(224301-224387)
chr8 (588-674)||(700714-700800)
chr8 (588-674)||(737924-738010)
chr8 (588-674)||(861819-861905)
chr8 (233-389)||(18042438-18042595)
chr8 (586-674)||(13663774-13663862)
chr8 (586-674)||(13722309-13722397)
chr8 (586-674)||(13722457-13722545)
chr8 (586-674)||(13722605-13722693)
chr8 (586-674)||(13722753-13722841)
chr8 (586-674)||(13722901-13722989)
chr8 (586-674)||(13723049-13723137)
chr8 (230-389)||(29296992-29297151)
chr8 (236-389)||(7469366-7469519)
chr8 (230-399)||(38636587-38636756)
chr8 (371-498)||(20480634-20480760)
chr8 (230-472)||(37654562-37654804)
chr8 (231-441)||(24267066-24267276)
chr8 (230-389)||(33611986-33612145)
chr8 (303-428)||(20708832-20708955)
chr8 (310-399)||(16001195-16001284)
chr8 (405-516)||(22322538-22322651)
chr8 (230-399)||(23148966-23149135)
chr8 (369-498)||(37610330-37610457)
chr8 (374-498)||(20568339-20568462)
chr8 (374-498)||(20574532-20574655)
chr8 (231-326)||(24107443-24107538)
chr8 (234-389)||(33171374-33171530)
chr8 (374-516)||(19994225-19994367)
chr8 (4-90)||(29759350-29759436)
chr8 (369-496)||(16040321-16040446)
chr8 (374-516)||(25121485-25121628)
chr8 (411-498)||(21680167-21680254)
chr8 (310-389)||(25609309-25609388)
chr8 (411-496)||(16042144-16042229)
chr8 (261-472)||(15932347-15932558)
chr8 (303-399)||(24553569-24553665)
chr8 (519-586)||(41508288-41508356)
chr8 (586-633)||(41245490-41245537)
chr8 (414-516)||(41245606-41245709)
chr8 (230-325)||(41507891-41507986)
chr8 (369-498)||(3432647-3432773)
chr8 (374-500)||(16406140-16406265)
chr8 (431-516)||(29759234-29759320)
chr8 (87-156)||(3844641-3844710)
chr8 (230-399)||(21199162-21199330)
chr8 (586-635)||(24718702-24718751)
chr8 (586-635)||(28836416-28836465)
chr8 (310-399)||(45562106-45562195)
chr8 (431-498)||(16417224-16417291)
chr8 (586-629)||(22908770-22908813)
chr8 (586-629)||(24386994-24387037)
chr8 (586-629)||(43374868-43374911)
chr8 (586-628)||(3432861-3432903)
chr8 (586-628)||(6775517-6775559)
chr8 (241-399)||(21191756-21191913)
chr8 (230-408)||(23226942-23227120)
chr8 (244-326)||(23836355-23836437)
chr8 (236-326)||(26010606-26010696)
chr8 (413-498)||(20648548-20648633)
chr8 (586-635)||(24107872-24107921)
chr8 (586-629)||(16874224-16874267)
chr8 (586-629)||(17730749-17730792)
chr8 (586-629)||(19994436-19994479)
chr8 (586-629)||(21696393-21696436)
chr8 (303-382)||(22498266-22498345)
chr8 (586-629)||(24930399-24930442)
chr8 (231-326)||(31195276-31195371)
chr8 (586-629)||(38532490-38532533)
chr8 (586-636)||(16195022-16195072)
chr8 (586-636)||(20648724-20648774)
chr8 (416-498)||(20655136-20655218)
chr8 (586-636)||(20655309-20655359)
chr8 (371-498)||(21696527-21696651)
chr8 (586-636)||(24548042-24548092)
chr8 (586-636)||(29759115-29759165)
chr8 (438-496)||(38532627-38532685)
chr8 (437-498)||(24386842-24386903)
chr8 (586-629)||(16040645-16040688)
chr8 (586-629)||(16042321-16042364)
chr8 (437-496)||(16874073-16874132)
chr8 (586-629)||(20480500-20480543)
chr8 (588-627)||(20568553-20568592)
chr8 (588-627)||(20574746-20574785)
chr8 (586-629)||(21680034-21680077)
chr8 (310-385)||(22886974-22887049)
chr8 (586-629)||(37610198-37610241)
chr8 (586-636)||(272491-272540)
chr8 (586-636)||(643309-643358)
chr8 (586-636)||(829115-829164)
chr8 (451-516)||(24107629-24107695)
chr8 (586-635)||(25121367-25121416)
chr8 (241-326)||(38532792-38532877)
chr8 (230-298)||(17284423-17284491)
chr8 (586-629)||(22322720-22322764)
chr8 (586-629)||(224446-224489)
chr8 (586-629)||(700859-700902)
chr8 (586-629)||(738069-738112)
chr8 (586-629)||(861964-862007)
chr8 (624-674)||(23148839-23148890)
chr8 (451-498)||(28556952-28556998)
chr8 (586-636)||(15320346-15320396)
chr8 (586-636)||(15500715-15500765)
chr8 (644-674)||(16040555-16040585)
chr8 (586-636)||(22089730-22089780)
chr8 (416-486)||(22144185-22144255)
chr8 (644-674)||(24930309-24930339)
chr8 (586-635)||(5237017-5237066)
chr8 (586-623)||(13663921-13663958)
chr8 (586-623)||(13723196-13723233)
chr8 (586-635)||(24662532-24662581)
chr8 (586-635)||(43684476-43684525)
chr8 (460-496)||(16194917-16194953)
[»] chr5 (135 HSPs)
chr5 (4-516)||(10778894-10779408)
chr5 (1-516)||(11341685-11342200)
chr5 (1-516)||(11398-11913)
chr5 (1-498)||(18778705-18779200)
chr5 (1-496)||(22367194-22367690)
chr5 (4-516)||(22884006-22884518)
chr5 (1-496)||(25425693-25426187)
chr5 (1-476)||(21074308-21074782)
chr5 (4-496)||(1220446-1220937)
chr5 (1-496)||(35791824-35792314)
chr5 (148-516)||(29191481-29191849)
chr5 (204-496)||(23513870-23514160)
chr5 (4-227)||(1168894-1169118)
chr5 (4-218)||(23506296-23506510)
chr5 (4-227)||(27183271-27183495)
chr5 (4-201)||(11212796-11212993)
chr5 (310-516)||(16535249-16535455)
chr5 (310-516)||(17472750-17472956)
chr5 (310-498)||(1169524-1169711)
chr5 (310-496)||(27184735-27184920)
chr5 (1-167)||(19499272-19499438)
chr5 (1-167)||(43444108-43444274)
chr5 (233-486)||(21234455-21234707)
chr5 (233-496)||(25901269-25901531)
chr5 (310-496)||(4200986-4201171)
chr5 (310-486)||(23505705-23505880)
chr5 (310-486)||(37051961-37052136)
chr5 (310-486)||(20615589-20615764)
chr5 (586-674)||(1169799-1169887)
chr5 (586-674)||(17473026-17473114)
chr5 (4-128)||(36990741-36990865)
chr5 (371-498)||(20711100-20711226)
chr5 (236-428)||(6455753-6455944)
chr5 (4-128)||(35581224-35581347)
chr5 (230-408)||(29913149-29913327)
chr5 (230-408)||(24083193-24083370)
chr5 (588-674)||(43445013-43445099)
chr5 (231-516)||(11582926-11583210)
chr5 (4-128)||(21933345-21933468)
chr5 (4-128)||(21939515-21939638)
chr5 (231-495)||(109927-110189)
chr5 (237-399)||(23235380-23235542)
chr5 (369-516)||(9731748-9731895)
chr5 (371-498)||(24184283-24184408)
chr5 (234-381)||(21832612-21832759)
chr5 (406-516)||(28258545-28258656)
chr5 (4-90)||(23511048-23511134)
chr5 (236-389)||(19872978-19873131)
chr5 (21-90)||(32950134-32950203)
chr5 (230-389)||(11965153-11965313)
chr5 (380-498)||(21393151-21393268)
chr5 (370-498)||(19404546-19404672)
chr5 (230-487)||(21223649-21223903)
chr5 (231-444)||(23493069-23493284)
chr5 (236-324)||(37982582-37982670)
chr5 (598-674)||(35792419-35792496)
chr5 (519-586)||(2030708-2030776)
chr5 (4-124)||(7424763-7424884)
chr5 (4-124)||(23327960-23328082)
chr5 (585-636)||(24184498-24184549)
chr5 (586-636)||(10779585-10779635)
chr5 (586-636)||(11213008-11213058)
chr5 (586-635)||(11172-11221)
chr5 (586-635)||(1169947-1169996)
chr5 (586-635)||(1221137-1221186)
chr5 (586-635)||(9732072-9732121)
chr5 (586-635)||(11582700-11582749)
chr5 (586-635)||(16535131-16535180)
chr5 (586-635)||(22367890-22367939)
chr5 (236-325)||(22881618-22881706)
chr5 (586-635)||(25425443-25425492)
chr5 (586-635)||(29192026-29192075)
chr5 (519-576)||(34938329-34938386)
chr5 (230-326)||(3673140-3673236)
chr5 (230-326)||(5451735-5451831)
chr5 (236-392)||(5622363-5622518)
chr5 (247-326)||(19861366-19861445)
chr5 (374-516)||(21652474-21652618)
chr5 (236-399)||(26560720-26560882)
chr5 (586-628)||(7424508-7424550)
chr5 (363-496)||(23453920-23454052)
chr5 (363-496)||(23465425-23465557)
chr5 (586-635)||(11341460-11341509)
chr5 (586-635)||(21074895-21074944)
chr5 (586-635)||(21393014-21393063)
chr5 (437-498)||(21649795-21649856)
chr5 (519-576)||(25003755-25003812)
chr5 (586-635)||(25192402-25192451)
chr5 (519-576)||(29191413-29191470)
chr5 (421-516)||(23510932-23511028)
chr5 (586-629)||(4864099-4864142)
chr5 (236-295)||(16104759-16104818)
chr5 (310-393)||(16836310-16836393)
chr5 (586-629)||(19404413-19404456)
chr5 (586-629)||(21649661-21649704)
chr5 (588-635)||(21652690-21652737)
chr5 (230-325)||(25004072-25004167)
chr5 (243-326)||(28901211-28901294)
chr5 (243-326)||(28937606-28937689)
chr5 (588-630)||(11338154-11338196)
chr5 (586-636)||(20710962-20711011)
chr5 (586-636)||(23327774-23327824)
chr5 (586-635)||(4201371-4201420)
chr5 (629-674)||(19498832-19498877)
chr5 (230-326)||(7727642-7727738)
chr5 (5-124)||(24595507-24595629)
chr5 (368-427)||(431478-431536)
chr5 (586-629)||(27185119-27185162)
chr5 (597-635)||(19498621-19498659)
chr5 (586-636)||(24595322-24595372)
chr5 (586-636)||(37010572-37010621)
chr5 (586-635)||(110388-110437)
chr5 (230-323)||(21616162-21616255)
chr5 (374-495)||(24474543-24474663)
chr5 (458-498)||(11338021-11338061)
chr5 (586-622)||(18779399-18779435)
chr5 (461-500)||(4864229-4864268)
chr5 (586-629)||(22884586-22884629)
chr5 (644-674)||(4201280-4201310)
chr5 (644-674)||(7424612-7424642)
chr5 (644-674)||(18779307-18779337)
chr5 (586-636)||(21933568-21933617)
chr5 (586-636)||(21939738-21939787)
chr5 (519-576)||(23112296-23112354)
chr5 (586-620)||(23513637-23513671)
chr5 (644-674)||(27185029-27185059)
chr5 (237-326)||(32967173-32967263)
chr5 (586-636)||(35581075-35581124)
chr5 (588-625)||(17473177-17473214)
chr5 (586-635)||(21234811-21234860)
chr5 (595-635)||(20615436-20615476)
chr5 (499-527)||(23112210-23112238)
chr5 (499-527)||(23985523-23985551)
chr5 (499-527)||(29191327-29191355)
chr5 (499-527)||(34938444-34938472)
[»] scaffold0383 (5 HSPs)
scaffold0383 (4-516)||(1454-1966)
scaffold0383 (586-674)||(1297-1385)
scaffold0383 (371-498)||(6196-6322)
scaffold0383 (586-635)||(1189-1238)
scaffold0383 (586-629)||(6062-6105)
[»] scaffold0269 (5 HSPs)
scaffold0269 (4-496)||(15294-15785)
scaffold0269 (93-496)||(1038-1440)
scaffold0269 (310-492)||(12021-12201)
scaffold0269 (644-674)||(899-929)
scaffold0269 (644-674)||(15155-15185)
[»] chr6 (130 HSPs)
chr6 (1-496)||(16826467-16826962)
chr6 (1-516)||(25174607-25175122)
chr6 (1-516)||(27654696-27655211)
chr6 (4-510)||(25903975-25904481)
chr6 (11-516)||(19628381-19628883)
chr6 (4-516)||(33315178-33315692)
chr6 (1-326)||(1555212-1555537)
chr6 (148-498)||(14627347-14627699)
chr6 (4-227)||(23152819-23153042)
chr6 (4-227)||(35016106-35016330)
chr6 (4-210)||(22593684-22593890)
chr6 (310-498)||(35016692-35016879)
chr6 (1-167)||(21776195-21776361)
chr6 (4-167)||(16240140-16240303)
chr6 (310-498)||(23152226-23152413)
chr6 (519-674)||(1554778-1554950)
chr6 (4-128)||(16633603-16633727)
chr6 (4-128)||(16650277-16650401)
chr6 (4-128)||(22226672-22226796)
chr6 (4-128)||(16557047-16557171)
chr6 (231-516)||(18824482-18824766)
chr6 (230-492)||(22847120-22847382)
chr6 (236-389)||(17014592-17014745)
chr6 (236-389)||(18630562-18630715)
chr6 (4-128)||(10487854-10487978)
chr6 (4-128)||(16377350-16377473)
chr6 (4-128)||(16384674-16384797)
chr6 (245-385)||(19671494-19671634)
chr6 (244-493)||(18582257-18582504)
chr6 (230-389)||(19853292-19853450)
chr6 (231-389)||(14449531-14449691)
chr6 (372-516)||(25645900-25646044)
chr6 (371-498)||(18776177-18776303)
chr6 (231-516)||(4989950-4990234)
chr6 (369-516)||(16230635-16230782)
chr6 (406-498)||(22431215-22431307)
chr6 (229-442)||(16888671-16888882)
chr6 (406-498)||(18569555-18569647)
chr6 (4-124)||(19609465-19609587)
chr6 (231-516)||(18840337-18840621)
chr6 (4-90)||(19984221-19984306)
chr6 (371-483)||(16105540-16105650)
chr6 (237-496)||(25368284-25368540)
chr6 (371-516)||(32897670-32897816)
chr6 (235-389)||(11373671-11373825)
chr6 (371-518)||(16085026-16085170)
chr6 (231-389)||(33539323-33539481)
chr6 (230-355)||(29604636-29604761)
chr6 (406-498)||(13015910-13016001)
chr6 (405-497)||(18431599-18431691)
chr6 (20-124)||(29870520-29870626)
chr6 (432-516)||(18003996-18004081)
chr6 (230-325)||(25918822-25918917)
chr6 (310-389)||(26506128-26506207)
chr6 (310-389)||(31468561-31468640)
chr6 (586-636)||(14627896-14627946)
chr6 (237-498)||(18397894-18398152)
chr6 (519-576)||(222000-222057)
chr6 (369-516)||(15736141-15736289)
chr6 (586-635)||(15736467-15736516)
chr6 (586-635)||(16230409-16230458)
chr6 (586-635)||(18004259-18004308)
chr6 (437-498)||(18087845-18087906)
chr6 (432-516)||(19984337-19984422)
chr6 (586-635)||(23976396-23976445)
chr6 (586-635)||(25174381-25174430)
chr6 (437-498)||(26088833-26088894)
chr6 (586-635)||(27655373-27655422)
chr6 (230-326)||(18382614-18382710)
chr6 (236-315)||(17084324-17084403)
chr6 (310-389)||(22594316-22594395)
chr6 (586-629)||(25745618-25745661)
chr6 (23-90)||(29665295-29665362)
chr6 (369-494)||(13622075-13622197)
chr6 (586-636)||(18569414-18569464)
chr6 (432-498)||(23976535-23976601)
chr6 (311-389)||(29161334-29161412)
chr6 (519-576)||(14627279-14627336)
chr6 (586-635)||(16827162-16827211)
chr6 (586-635)||(18431462-18431511)
chr6 (519-576)||(27739890-27739947)
chr6 (307-399)||(22463107-22463199)
chr6 (374-498)||(25745406-25745529)
chr6 (310-389)||(15005869-15005948)
chr6 (586-629)||(23152094-23152137)
chr6 (586-629)||(31627273-31627316)
chr6 (586-629)||(35016967-35017010)
chr6 (586-636)||(1651237-1651287)
chr6 (586-636)||(19984491-19984541)
chr6 (586-636)||(32897551-32897601)
chr6 (231-325)||(33323914-33324008)
chr6 (586-635)||(4989724-4989773)
chr6 (591-628)||(18088003-18088040)
chr6 (586-635)||(18825047-18825096)
chr6 (629-674)||(21776769-21776814)
chr6 (586-635)||(25646113-25646162)
chr6 (519-576)||(35010543-35010600)
chr6 (231-320)||(35136923-35137012)
chr6 (586-622)||(16084923-16084959)
chr6 (586-622)||(16105401-16105437)
chr6 (236-392)||(32351192-32351347)
chr6 (586-629)||(18776043-18776086)
chr6 (586-636)||(10487704-10487753)
chr6 (586-636)||(16377574-16377623)
chr6 (586-636)||(16384898-16384947)
chr6 (586-636)||(26088662-26088712)
chr6 (453-498)||(22867124-22867169)
chr6 (241-326)||(28195717-28195802)
chr6 (586-635)||(33315868-33315917)
chr6 (277-325)||(17790405-17790453)
chr6 (230-326)||(21622283-21622379)
chr6 (586-629)||(1658997-1659040)
chr6 (586-629)||(22431083-22431126)
chr6 (451-486)||(28195924-28195959)
chr6 (586-629)||(29870761-29870804)
chr6 (631-674)||(35137174-35137217)
chr6 (586-636)||(16557302-16557352)
chr6 (586-636)||(16650532-16650582)
chr6 (644-674)||(19609314-19609344)
chr6 (590-628)||(28196068-28196106)
chr6 (644-674)||(33315777-33315807)
chr6 (313-389)||(34966025-34966103)
chr6 (588-629)||(18397762-18397803)
chr6 (586-635)||(18843107-18843156)
chr6 (498-527)||(35010456-35010485)
chr6 (499-527)||(222116-222144)
chr6 (262-298)||(940139-940175)
chr6 (646-674)||(16827073-16827101)
chr6 (588-628)||(25368636-25368676)
chr6 (627-671)||(31627320-31627364)
[»] chr7 (137 HSPs)
chr7 (6-496)||(32495155-32495644)
chr7 (1-516)||(15951693-15952208)
chr7 (1-516)||(16417516-16418028)
chr7 (1-326)||(15760838-15761163)
chr7 (1-235)||(10001084-10001318)
chr7 (4-227)||(11286760-11286983)
chr7 (310-496)||(13912017-13912202)
chr7 (233-486)||(15442492-15442744)
chr7 (233-486)||(30263057-30263309)
chr7 (310-498)||(7291926-7292111)
chr7 (1-147)||(15851840-15851986)
chr7 (312-496)||(11515302-11515484)
chr7 (336-516)||(15851270-15851450)
chr7 (519-674)||(15761425-15761597)
chr7 (371-516)||(12753826-12753970)
chr7 (231-399)||(4483919-4484087)
chr7 (4-128)||(27102614-27102738)
chr7 (4-128)||(27109962-27110086)
chr7 (4-128)||(27175588-27175712)
chr7 (4-128)||(38784706-38784830)
chr7 (4-128)||(7821896-7822020)
chr7 (4-128)||(7829207-7829331)
chr7 (371-498)||(3894059-3894185)
chr7 (371-498)||(12544787-12544913)
chr7 (231-389)||(28389456-28389614)
chr7 (4-93)||(1937889-1937978)
chr7 (231-493)||(10861777-10862036)
chr7 (230-498)||(11286177-11286445)
chr7 (369-516)||(369832-369979)
chr7 (236-477)||(9057575-9057815)
chr7 (230-492)||(16920850-16921112)
chr7 (236-389)||(31500324-31500477)
chr7 (87-218)||(17985310-17985441)
chr7 (371-498)||(112369-112495)
chr7 (230-492)||(48354345-48354606)
chr7 (4-90)||(125886-125972)
chr7 (230-399)||(14939878-14940047)
chr7 (230-399)||(15367471-15367640)
chr7 (403-498)||(44864206-44864301)
chr7 (368-498)||(2027628-2027757)
chr7 (231-389)||(4437968-4438126)
chr7 (231-389)||(4445369-4445527)
chr7 (369-498)||(142594-142722)
chr7 (236-493)||(7285147-7285403)
chr7 (369-516)||(14252263-14252411)
chr7 (231-383)||(34242157-34242309)
chr7 (230-492)||(9610246-9610508)
chr7 (236-399)||(9643440-9643603)
chr7 (230-492)||(9837818-9838080)
chr7 (310-389)||(13351127-13351206)
chr7 (409-516)||(26071375-26071485)
chr7 (409-516)||(26095162-26095272)
chr7 (598-674)||(2191847-2191924)
chr7 (233-389)||(9321960-9322117)
chr7 (230-399)||(14275869-14276037)
chr7 (371-496)||(45453332-45453454)
chr7 (371-500)||(13867146-13867275)
chr7 (371-498)||(15823479-15823607)
chr7 (522-593)||(14252568-14252638)
chr7 (586-636)||(16480225-16480275)
chr7 (586-635)||(15952385-15952434)
chr7 (586-635)||(16417290-16417339)
chr7 (241-496)||(13273722-13273973)
chr7 (230-326)||(13376800-13376896)
chr7 (404-500)||(39047797-39047893)
chr7 (586-629)||(11286045-11286088)
chr7 (586-629)||(11582131-11582174)
chr7 (586-629)||(12545001-12545044)
chr7 (236-399)||(33558799-33558961)
chr7 (586-629)||(47288607-47288650)
chr7 (374-516)||(47288719-47288861)
chr7 (586-636)||(112586-112636)
chr7 (586-628)||(7291686-7291728)
chr7 (586-636)||(13038395-13038445)
chr7 (586-636)||(26010480-26010530)
chr7 (586-636)||(39047980-39048030)
chr7 (415-496)||(2191661-2191742)
chr7 (437-498)||(3048691-3048752)
chr7 (369-495)||(15629750-15629874)
chr7 (437-498)||(18981043-18981104)
chr7 (586-635)||(45453545-45453594)
chr7 (451-496)||(49048942-49048987)
chr7 (519-593)||(7285695-7285766)
chr7 (230-326)||(13389047-13389143)
chr7 (431-498)||(125789-125856)
chr7 (586-629)||(1938060-1938103)
chr7 (586-629)||(12249401-12249444)
chr7 (586-629)||(13757410-13757453)
chr7 (586-629)||(15629613-15629656)
chr7 (586-629)||(16210611-16210654)
chr7 (586-629)||(32495843-32495886)
chr7 (586-629)||(36051495-36051538)
chr7 (586-636)||(125651-125701)
chr7 (586-636)||(3058872-3058922)
chr7 (586-624)||(15851163-15851201)
chr7 (522-576)||(47482171-47482225)
chr7 (586-635)||(369713-369762)
chr7 (586-635)||(2027383-2027432)
chr7 (586-623)||(15926202-15926239)
chr7 (591-628)||(18981201-18981238)
chr7 (374-491)||(35093783-35093899)
chr7 (588-636)||(26071557-26071604)
chr7 (588-636)||(26095344-26095391)
chr7 (337-385)||(45148750-45148798)
chr7 (586-629)||(3893925-3893968)
chr7 (586-629)||(12753713-12753756)
chr7 (437-496)||(13757545-13757604)
chr7 (310-385)||(17985681-17985756)
chr7 (312-358)||(15306516-15306562)
chr7 (588-626)||(16571380-16571418)
chr7 (588-626)||(16594244-16594282)
chr7 (586-636)||(27102839-27102888)
chr7 (586-636)||(27110187-27110236)
chr7 (586-636)||(27175438-27175487)
chr7 (586-636)||(38784931-38784980)
chr7 (586-636)||(44864068-44864118)
chr7 (244-326)||(49048739-49048821)
chr7 (586-635)||(13867363-13867412)
chr7 (241-326)||(15629914-15629999)
chr7 (368-496)||(16571160-16571286)
chr7 (368-496)||(16594376-16594502)
chr7 (241-298)||(16918748-16918805)
chr7 (586-626)||(13912402-13912442)
chr7 (586-629)||(142460-142503)
chr7 (451-498)||(12249263-12249310)
chr7 (586-625)||(13273589-13273628)
chr7 (369-476)||(15926352-15926458)
chr7 (586-636)||(7821746-7821795)
chr7 (586-636)||(7829057-7829106)
chr7 (430-496)||(11581996-11582062)
chr7 (644-674)||(13912311-13912341)
chr7 (586-620)||(15525772-15525806)
chr7 (586-624)||(15823695-15823733)
chr7 (644-674)||(32495753-32495783)
chr7 (588-625)||(2191987-2192024)
chr7 (586-635)||(15442848-15442897)
chr7 (241-326)||(17224876-17224961)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (4-516)||(20002-20514)
scaffold0039 (586-635)||(20583-20632)
[»] chr3 (156 HSPs)
chr3 (1-516)||(16819955-16820472)
chr3 (4-516)||(49231262-49231775)
chr3 (4-516)||(17956931-17957443)
chr3 (4-498)||(25057811-25058305)
chr3 (1-477)||(12808039-12808515)
chr3 (4-525)||(54039229-54039753)
chr3 (1-227)||(14528724-14528951)
chr3 (310-516)||(22274091-22274297)
chr3 (310-516)||(15469479-15469685)
chr3 (1-167)||(27840303-27840469)
chr3 (4-181)||(51158746-51158923)
chr3 (310-500)||(13837823-13838012)
chr3 (4-217)||(28557171-28557377)
chr3 (313-486)||(51159382-51159555)
chr3 (310-516)||(2450232-2450438)
chr3 (1-128)||(44228399-44228526)
chr3 (577-674)||(9303744-9303841)
chr3 (1-128)||(8276573-8276700)
chr3 (4-128)||(30152334-30152457)
chr3 (1-128)||(8269462-8269589)
chr3 (7-128)||(18897732-18897852)
chr3 (4-128)||(12265522-12265645)
chr3 (231-428)||(4163135-4163330)
chr3 (230-399)||(4146601-4146770)
chr3 (230-478)||(33369778-33370027)
chr3 (4-128)||(1468716-1468840)
chr3 (20-128)||(5227715-5227823)
chr3 (230-408)||(6229557-6229735)
chr3 (231-385)||(11637497-11637651)
chr3 (230-516)||(47785810-47786098)
chr3 (369-502)||(8630802-8630934)
chr3 (236-389)||(41660707-41660860)
chr3 (371-495)||(14297464-14297586)
chr3 (371-495)||(14303091-14303213)
chr3 (4-124)||(16934913-16935032)
chr3 (369-516)||(18909736-18909883)
chr3 (231-399)||(31413224-31413392)
chr3 (369-516)||(53769707-53769854)
chr3 (236-493)||(7852883-7853138)
chr3 (411-498)||(12350954-12351041)
chr3 (230-389)||(14816619-14816777)
chr3 (236-389)||(18969208-18969361)
chr3 (236-389)||(43428461-43428614)
chr3 (374-498)||(318686-318809)
chr3 (371-498)||(17523540-17523665)
chr3 (231-444)||(12489634-12489849)
chr3 (371-498)||(35122650-35122775)
chr3 (236-493)||(19945595-19945853)
chr3 (409-516)||(54423017-54423127)
chr3 (374-500)||(16183084-16183209)
chr3 (236-389)||(9591683-9591835)
chr3 (369-498)||(11198638-11198766)
chr3 (236-444)||(48420697-48420903)
chr3 (230-326)||(14060250-14060346)
chr3 (241-496)||(17138442-17138693)
chr3 (278-389)||(10912322-10912433)
chr3 (364-498)||(11062099-11062231)
chr3 (369-498)||(17099675-17099803)
chr3 (598-674)||(16259974-16260051)
chr3 (371-484)||(53899591-53899703)
chr3 (230-326)||(15875299-15875395)
chr3 (230-326)||(39655050-39655146)
chr3 (371-498)||(6147915-6148039)
chr3 (406-500)||(15860253-15860347)
chr3 (586-636)||(16819728-16819778)
chr3 (586-636)||(19572057-19572107)
chr3 (369-498)||(22145343-22145472)
chr3 (586-635)||(2450615-2450664)
chr3 (236-381)||(11401786-11401931)
chr3 (519-576)||(18892831-18892888)
chr3 (586-635)||(18909510-18909559)
chr3 (586-635)||(22273865-22273914)
chr3 (437-498)||(23491470-23491531)
chr3 (437-498)||(38167010-38167071)
chr3 (236-389)||(38376622-38376775)
chr3 (586-635)||(53769481-53769530)
chr3 (236-392)||(21167650-21167805)
chr3 (230-326)||(34559013-34559109)
chr3 (231-326)||(11987079-11987174)
chr3 (364-498)||(14294392-14294524)
chr3 (364-498)||(14300019-14300151)
chr3 (369-496)||(16260149-16260275)
chr3 (231-326)||(17203822-17203917)
chr3 (585-636)||(35122509-35122560)
chr3 (406-516)||(50113238-50113349)
chr3 (586-629)||(51159764-51159807)
chr3 (586-636)||(7852630-7852680)
chr3 (586-636)||(8269689-8269739)
chr3 (586-636)||(8276800-8276850)
chr3 (586-636)||(12031269-12031319)
chr3 (586-628)||(13816343-13816385)
chr3 (586-636)||(15860433-15860483)
chr3 (588-630)||(17099543-17099585)
chr3 (586-671)||(17937284-17937369)
chr3 (586-636)||(22145560-22145610)
chr3 (586-636)||(33340665-33340715)
chr3 (586-636)||(47786169-47786219)
chr3 (586-628)||(50113418-50113460)
chr3 (586-635)||(17957621-17957670)
chr3 (519-576)||(18889604-18889661)
chr3 (519-576)||(23174551-23174608)
chr3 (524-576)||(9303670-9303722)
chr3 (370-498)||(12562545-12562672)
chr3 (230-326)||(14522217-14522313)
chr3 (586-629)||(318899-318942)
chr3 (586-629)||(2048890-2048933)
chr3 (586-629)||(6148127-6148170)
chr3 (586-629)||(11062322-11062365)
chr3 (586-629)||(12562763-12562806)
chr3 (230-325)||(12952187-12952282)
chr3 (586-629)||(16183295-16183338)
chr3 (374-500)||(33340910-33341034)
chr3 (586-629)||(44228256-44228299)
chr3 (585-636)||(53899807-53899858)
chr3 (242-404)||(12021029-12021190)
chr3 (231-325)||(14079728-14079822)
chr3 (586-636)||(15469754-15469804)
chr3 (586-636)||(15574863-15574913)
chr3 (586-636)||(15613882-15613932)
chr3 (428-498)||(17937458-17937528)
chr3 (588-629)||(11198859-11198900)
chr3 (588-629)||(14294259-14294300)
chr3 (588-629)||(14522594-14522635)
chr3 (586-635)||(17913537-17913586)
chr3 (453-498)||(40938694-40938739)
chr3 (519-576)||(54039813-54039870)
chr3 (585-629)||(14297328-14297372)
chr3 (585-629)||(14302955-14302999)
chr3 (262-493)||(15516716-15516945)
chr3 (586-634)||(19230884-19230932)
chr3 (230-326)||(38812009-38812105)
chr3 (631-674)||(14079528-14079571)
chr3 (520-593)||(18738667-18738736)
chr3 (586-629)||(19945456-19945499)
chr3 (586-636)||(1468941-1468990)
chr3 (588-626)||(14299889-14299927)
chr3 (233-351)||(16745211-16745328)
chr3 (446-500)||(19571917-19571971)
chr3 (406-493)||(54652808-54652897)
chr3 (587-636)||(16935168-16935217)
chr3 (519-576)||(51962433-51962490)
chr3 (412-493)||(39654883-39654966)
chr3 (230-298)||(55441742-55441810)
chr3 (586-629)||(49231043-49231086)
chr3 (590-636)||(8630669-8630715)
chr3 (586-636)||(12265776-12265826)
chr3 (446-500)||(13816472-13816526)
chr3 (521-567)||(17937078-17937124)
chr3 (591-629)||(23491335-23491373)
chr3 (595-629)||(25057676-25057710)
chr3 (586-636)||(30152154-30152204)
chr3 (644-674)||(51159674-51159704)
chr3 (588-629)||(40938561-40938602)
chr3 (586-626)||(5227544-5227584)
chr3 (460-496)||(12031164-12031200)
chr3 (499-527)||(23174667-23174695)
[»] scaffold0034 (8 HSPs)
scaffold0034 (4-496)||(78519-79010)
scaffold0034 (4-218)||(39758-39972)
scaffold0034 (4-227)||(45231-45455)
scaffold0034 (374-498)||(39279-39401)
scaffold0034 (374-516)||(44742-44884)
scaffold0034 (586-634)||(78378-78426)
scaffold0034 (586-629)||(39043-39086)
scaffold0034 (586-629)||(44630-44673)
[»] chr2 (101 HSPs)
chr2 (4-516)||(12727206-12727718)
chr2 (1-516)||(19887374-19887889)
chr2 (4-516)||(34823245-34823757)
chr2 (1-516)||(21140923-21141437)
chr2 (4-498)||(16900327-16900822)
chr2 (4-498)||(16993718-16994213)
chr2 (4-218)||(27261125-27261339)
chr2 (4-227)||(67122-67346)
chr2 (233-486)||(14907368-14907620)
chr2 (233-486)||(23819154-23819406)
chr2 (310-486)||(20014094-20014269)
chr2 (1-128)||(5889354-5889482)
chr2 (4-128)||(24686700-24686824)
chr2 (4-128)||(11232315-11232439)
chr2 (233-472)||(25600951-25601191)
chr2 (230-428)||(24881681-24881879)
chr2 (4-128)||(22514162-22514286)
chr2 (4-128)||(28776764-28776887)
chr2 (231-389)||(16293698-16293856)
chr2 (236-516)||(27260503-27260784)
chr2 (231-516)||(25211922-25212206)
chr2 (230-389)||(24276981-24277140)
chr2 (236-389)||(24561682-24561835)
chr2 (369-516)||(12642987-12643134)
chr2 (369-516)||(21275489-21275636)
chr2 (236-399)||(9635881-9636044)
chr2 (229-442)||(19670066-19670275)
chr2 (371-498)||(36891782-36891908)
chr2 (236-389)||(25594209-25594362)
chr2 (371-498)||(270118-270243)
chr2 (230-326)||(721614-721710)
chr2 (371-498)||(4449300-4449426)
chr2 (262-444)||(24088328-24088508)
chr2 (369-516)||(42179328-42179475)
chr2 (411-498)||(8942609-8942696)
chr2 (233-348)||(66677-66792)
chr2 (411-498)||(12637274-12637361)
chr2 (4-90)||(22283176-22283262)
chr2 (432-516)||(3800030-3800115)
chr2 (431-518)||(22283058-22283146)
chr2 (230-326)||(25304694-25304790)
chr2 (585-636)||(4449516-4449567)
chr2 (262-389)||(6094035-6094162)
chr2 (371-486)||(28973016-28973130)
chr2 (586-636)||(8886963-8887013)
chr2 (4-90)||(22273943-22274029)
chr2 (586-636)||(25600784-25600834)
chr2 (586-635)||(5889583-5889632)
chr2 (405-482)||(6878423-6878500)
chr2 (586-635)||(12637451-12637500)
chr2 (586-635)||(12643311-12643360)
chr2 (586-635)||(19888066-19888115)
chr2 (586-635)||(21140697-21140746)
chr2 (586-635)||(21275813-21275862)
chr2 (230-326)||(32738808-32738904)
chr2 (233-383)||(25133301-25133452)
chr2 (307-370)||(45618618-45618681)
chr2 (431-516)||(22273827-22273913)
chr2 (363-492)||(22787088-22787215)
chr2 (586-636)||(43644262-43644312)
chr2 (586-635)||(12726875-12726924)
chr2 (4-124)||(23773540-23773663)
chr2 (586-635)||(34823020-34823069)
chr2 (230-326)||(24295576-24295672)
chr2 (522-593)||(42179632-42179706)
chr2 (586-629)||(461566-461609)
chr2 (586-629)||(7320319-7320362)
chr2 (370-498)||(22581002-22581128)
chr2 (586-636)||(22273708-22273758)
chr2 (586-636)||(22282941-22282991)
chr2 (586-634)||(25877236-25877285)
chr2 (587-636)||(36891998-36892046)
chr2 (303-382)||(18535037-18535116)
chr2 (586-629)||(22581219-22581262)
chr2 (586-629)||(24827855-24827898)
chr2 (586-629)||(28972870-28972913)
chr2 (437-495)||(9653982-9654040)
chr2 (586-636)||(11232540-11232589)
chr2 (230-284)||(19665771-19665825)
chr2 (586-636)||(22514387-22514436)
chr2 (586-636)||(22862310-22862360)
chr2 (586-636)||(23773356-23773406)
chr2 (586-636)||(28776988-28777037)
chr2 (586-635)||(3800399-3800448)
chr2 (586-622)||(20628684-20628720)
chr2 (456-492)||(24572544-24572580)
chr2 (523-586)||(32464812-32464876)
chr2 (586-629)||(6878273-6878316)
chr2 (586-629)||(8942476-8942519)
chr2 (239-326)||(22786967-22787054)
chr2 (586-628)||(721313-721355)
chr2 (586-628)||(22787313-22787355)
chr2 (376-478)||(22862465-22862566)
chr2 (587-629)||(24572678-24572720)
chr2 (586-636)||(24686955-24687005)
chr2 (586-635)||(14907724-14907773)
chr2 (586-635)||(20013944-20013993)
chr2 (405-454)||(22691124-22691173)
chr2 (405-454)||(22695771-22695820)
chr2 (586-635)||(23819001-23819050)
chr2 (233-273)||(20014306-20014346)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (4-516)||(27964-28476)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-516)||(6228-6740)
scaffold0003 (586-635)||(6002-6051)
scaffold0003 (586-636)||(217036-217086)
[»] scaffold0315 (3 HSPs)
scaffold0315 (4-496)||(17721-18212)
scaffold0315 (586-626)||(17481-17521)
scaffold0315 (644-674)||(17582-17612)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (4-516)||(154954-155466)
scaffold0023 (586-635)||(155643-155692)
scaffold0023 (586-636)||(733-783)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (4-408)||(1358-1763)
scaffold0342 (262-444)||(4858-5041)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-383)||(8182-8565)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (21-404)||(2343-2728)
[»] scaffold1753 (3 HSPs)
scaffold1753 (4-247)||(632-875)
scaffold1753 (291-496)||(428-632)
scaffold1753 (586-635)||(286-335)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (4-227)||(8350-8573)
scaffold0338 (230-498)||(7757-8025)
scaffold0338 (588-629)||(7625-7666)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (4-227)||(508-732)
scaffold0266 (310-408)||(5-103)
[»] scaffold1164 (2 HSPs)
scaffold1164 (4-227)||(693-917)
scaffold1164 (310-409)||(188-287)
[»] scaffold0396 (3 HSPs)
scaffold0396 (4-227)||(12583-12806)
scaffold0396 (369-498)||(13264-13392)
scaffold0396 (586-629)||(13481-13524)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (4-218)||(118668-118882)
scaffold0035 (4-93)||(110167-110256)
scaffold0035 (237-326)||(119210-119299)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (4-218)||(41050-41264)
scaffold0106 (590-636)||(40422-40468)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (310-498)||(28995-29182)
scaffold0116 (586-674)||(28818-28906)
scaffold0116 (586-635)||(28709-28758)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (233-498)||(95431-95695)
scaffold0044 (4-121)||(37750-37867)
scaffold0044 (586-672)||(95257-95343)
scaffold0044 (586-635)||(95146-95195)
[»] scaffold1734 (3 HSPs)
scaffold1734 (310-494)||(308-491)
scaffold1734 (586-674)||(125-213)
scaffold1734 (586-629)||(21-64)
[»] scaffold0066 (5 HSPs)
scaffold0066 (519-674)||(53240-53394)
scaffold0066 (374-527)||(53451-53602)
scaffold0066 (1-94)||(53862-53956)
scaffold0066 (230-326)||(53653-53748)
scaffold0066 (586-626)||(53139-53179)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (233-486)||(21623-21875)
scaffold0141 (233-486)||(25878-26130)
scaffold0141 (586-635)||(21470-21519)
scaffold0141 (586-635)||(25725-25774)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (4-180)||(1206-1382)
[»] scaffold0078 (5 HSPs)
scaffold0078 (310-496)||(38234-38419)
scaffold0078 (4-100)||(40539-40635)
scaffold0078 (586-635)||(38619-38668)
scaffold0078 (421-515)||(40434-40529)
scaffold0078 (586-636)||(40315-40365)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (312-486)||(2587-2760)
scaffold0124 (586-635)||(2864-2913)
scaffold0124 (519-576)||(36542-36599)
scaffold0124 (592-625)||(22997-23030)
scaffold0124 (499-527)||(36456-36484)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (310-496)||(14444-14629)
scaffold0032 (437-498)||(54593-54654)
scaffold0032 (586-635)||(109369-109418)
scaffold0032 (230-325)||(105549-105644)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (236-516)||(18277-18555)
scaffold0120 (231-435)||(30144-30345)
scaffold0120 (586-636)||(30011-30062)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (4-144)||(6298-6438)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (236-498)||(52215-52474)
scaffold0018 (236-498)||(56167-56426)
scaffold0018 (586-636)||(52562-52612)
scaffold0018 (586-636)||(56514-56564)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (4-128)||(30353-30477)
scaffold0107 (586-636)||(30172-30222)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (230-493)||(20679-20942)
scaffold0150 (230-493)||(27508-27771)
scaffold0150 (586-628)||(20541-20583)
scaffold0150 (586-628)||(27370-27412)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (230-492)||(84567-84829)
scaffold0025 (586-674)||(145463-145551)
scaffold0025 (371-496)||(145645-145769)
scaffold0025 (230-326)||(52447-52543)
scaffold0025 (586-635)||(145355-145404)
scaffold0025 (455-496)||(147733-147774)
[»] scaffold0138 (9 HSPs)
scaffold0138 (586-674)||(28433-28521)
scaffold0138 (581-674)||(40429-40522)
scaffold0138 (229-325)||(23350-23446)
scaffold0138 (523-576)||(28205-28258)
scaffold0138 (523-576)||(40201-40254)
scaffold0138 (586-629)||(28329-28372)
scaffold0138 (586-629)||(40325-40368)
scaffold0138 (599-636)||(14565-14602)
scaffold0138 (420-500)||(14386-14466)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (231-516)||(129434-129718)
scaffold0028 (586-636)||(90172-90222)
scaffold0028 (230-325)||(78826-78921)
scaffold0028 (586-635)||(129208-129257)
scaffold0028 (310-370)||(39023-39083)
scaffold0028 (625-674)||(78625-78674)
scaffold0028 (417-500)||(89894-89977)
[»] scaffold0037 (6 HSPs)
scaffold0037 (371-498)||(25797-25923)
scaffold0037 (417-516)||(70514-70614)
scaffold0037 (586-636)||(70684-70734)
scaffold0037 (416-498)||(93659-93743)
scaffold0037 (588-636)||(26014-26062)
scaffold0037 (586-629)||(93527-93570)
[»] scaffold0234 (3 HSPs)
scaffold0234 (586-674)||(18718-18806)
scaffold0234 (371-496)||(18498-18623)
scaffold0234 (586-629)||(18865-18908)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (234-399)||(968-1133)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (236-389)||(24487-24640)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (4-128)||(38258-38382)
scaffold0076 (586-636)||(38108-38157)
[»] scaffold0009 (7 HSPs)
scaffold0009 (310-390)||(271045-271125)
scaffold0009 (310-399)||(98030-98119)
scaffold0009 (369-498)||(237147-237275)
scaffold0009 (230-478)||(68509-68756)
scaffold0009 (310-389)||(255281-255359)
scaffold0009 (586-629)||(270953-270996)
scaffold0009 (586-629)||(237013-237056)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (230-389)||(1879-2038)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (231-389)||(106762-106920)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (230-409)||(2881-3061)
scaffold0327 (229-321)||(5179-5271)
[»] scaffold0158 (3 HSPs)
scaffold0158 (586-670)||(23863-23947)
scaffold0158 (405-512)||(24021-24128)
scaffold0158 (519-576)||(23746-23803)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (236-390)||(1696-1850)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (4-100)||(32209-32305)
scaffold0184 (421-515)||(32315-32410)
scaffold0184 (586-636)||(32479-32529)
[»] scaffold0359 (4 HSPs)
scaffold0359 (371-498)||(286-412)
scaffold0359 (369-516)||(12812-12959)
scaffold0359 (586-629)||(13028-13071)
scaffold0359 (586-624)||(161-199)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (230-444)||(90580-90796)
[»] scaffold0021 (7 HSPs)
scaffold0021 (371-516)||(137885-138030)
scaffold0021 (446-498)||(87402-87454)
scaffold0021 (586-636)||(138099-138149)
scaffold0021 (371-484)||(10645-10757)
scaffold0021 (588-636)||(87263-87311)
scaffold0021 (586-627)||(10499-10540)
scaffold0021 (371-435)||(87453-87516)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (89-218)||(113121-113251)
scaffold0014 (371-498)||(145890-146017)
scaffold0014 (592-625)||(145761-145794)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (369-516)||(14828-14975)
scaffold0251 (586-635)||(15152-15201)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (230-493)||(3682-3944)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (237-389)||(130979-131131)
scaffold0022 (405-516)||(113664-113776)
scaffold0022 (378-496)||(108628-108744)
scaffold0022 (586-628)||(113845-113887)
scaffold0022 (230-326)||(105915-106010)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (30-146)||(34854-34970)
scaffold0012 (586-636)||(248827-248877)
scaffold0012 (519-576)||(223320-223377)
scaffold0012 (499-527)||(223234-223262)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (405-516)||(256014-256126)
scaffold0011 (405-516)||(262620-262732)
scaffold0011 (586-637)||(75980-76031)
scaffold0011 (586-629)||(193443-193486)
scaffold0011 (590-636)||(256199-256246)
scaffold0011 (590-636)||(262805-262852)
scaffold0011 (586-636)||(124579-124629)
[»] scaffold0447 (3 HSPs)
scaffold0447 (371-498)||(3588-3714)
scaffold0447 (586-629)||(3454-3497)
scaffold0447 (371-449)||(8251-8328)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (231-476)||(1194-1437)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (230-389)||(503-662)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (234-381)||(34360-34507)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (231-389)||(21132-21290)
scaffold0165 (230-366)||(29154-29290)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (230-492)||(26548-26811)
scaffold0004 (230-494)||(330735-331001)
scaffold0004 (233-389)||(85501-85657)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (369-498)||(874-1001)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (11-128)||(11076-11192)
scaffold0467 (586-636)||(11323-11373)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (231-407)||(13593-13770)
scaffold0346 (432-498)||(2925-2991)
scaffold0346 (588-629)||(3082-3123)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (230-351)||(24569-24690)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (405-500)||(6466-6561)
scaffold0480 (586-629)||(6647-6690)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (230-327)||(1707-1804)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (231-444)||(3222-3437)
[»] scaffold0195 (6 HSPs)
scaffold0195 (369-516)||(7724-7871)
scaffold0195 (369-516)||(13113-13260)
scaffold0195 (586-634)||(7941-7989)
scaffold0195 (586-634)||(13330-13378)
scaffold0195 (586-629)||(18138-18181)
scaffold0195 (586-629)||(20222-20265)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (371-486)||(1762-1876)
scaffold0610 (589-634)||(1916-1961)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (230-326)||(5872-5968)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (242-326)||(117545-117629)
scaffold0016 (4-90)||(167191-167276)
scaffold0016 (519-576)||(167462-167519)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (20-143)||(5982-6107)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (230-325)||(6065-6160)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (375-498)||(47089-47211)
scaffold0068 (375-498)||(60537-60659)
scaffold0068 (586-629)||(46957-47000)
scaffold0068 (586-629)||(60405-60448)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (411-498)||(21601-21688)
scaffold0008 (586-636)||(21483-21533)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (374-500)||(1916-2041)
scaffold0673 (586-629)||(2127-2170)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (236-389)||(3735-3888)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (230-327)||(23393-23490)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (236-385)||(44508-44657)
[»] scaffold1849 (2 HSPs)
scaffold1849 (130-210)||(842-922)
scaffold1849 (230-325)||(405-500)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (230-326)||(7650-7746)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (230-325)||(13323-13418)
scaffold0456 (231-350)||(11869-11988)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (310-389)||(45116-45195)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (231-326)||(1027-1122)
[»] scaffold0833 (2 HSPs)
scaffold0833 (246-525)||(2163-2446)
scaffold0833 (519-593)||(2030-2103)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (377-498)||(13162-13281)
scaffold0083 (586-628)||(13031-13073)
[»] scaffold1752 (2 HSPs)
scaffold1752 (303-444)||(611-753)
scaffold1752 (586-628)||(425-467)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (231-327)||(2356-2452)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (437-516)||(1506-1586)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (413-516)||(6490-6594)
scaffold0240 (586-636)||(6371-6421)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (519-593)||(9323-9394)
scaffold0162 (586-636)||(27800-27850)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (369-492)||(30099-30221)
scaffold0010 (230-298)||(30254-30322)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (230-326)||(198286-198382)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (236-323)||(840-927)
scaffold0786 (236-323)||(5895-5982)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (411-498)||(524-611)
scaffold0692 (590-623)||(686-719)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (409-516)||(3603-3713)
scaffold0434 (586-636)||(3484-3534)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (236-323)||(4428-4515)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (260-399)||(6831-6970)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (520-593)||(12675-12745)
scaffold0132 (586-629)||(41538-41581)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (230-326)||(59840-59938)
[»] scaffold0808 (3 HSPs)
scaffold0808 (369-496)||(2526-2651)
scaffold0808 (586-629)||(2745-2788)
scaffold0808 (242-325)||(2401-2484)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (403-516)||(43062-43176)
scaffold0091 (586-628)||(43245-43287)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (586-635)||(8258-8307)
scaffold0622 (405-498)||(8396-8489)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (437-498)||(11061-11122)
scaffold0465 (586-629)||(11213-11256)
[»] scaffold0244 (5 HSPs)
scaffold0244 (405-498)||(17505-17598)
scaffold0244 (378-498)||(23898-24017)
scaffold0244 (523-593)||(24219-24286)
scaffold0244 (586-630)||(17687-17731)
scaffold0244 (523-593)||(17800-17867)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (230-398)||(34530-34698)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (230-326)||(98119-98215)
scaffold0031 (586-636)||(69590-69640)
scaffold0031 (627-671)||(69644-69688)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (371-486)||(5497-5611)
scaffold0750 (592-625)||(6634-6667)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (235-382)||(1815-1962)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (371-496)||(6861-6985)
scaffold0589 (586-629)||(6724-6767)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (586-636)||(32407-32457)
scaffold0103 (645-674)||(32518-32547)
[»] scaffold0597 (3 HSPs)
scaffold0597 (586-635)||(2419-2468)
scaffold0597 (437-496)||(2161-2220)
scaffold0597 (644-674)||(2329-2359)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (236-325)||(10749-10837)
[»] scaffold0253 (3 HSPs)
scaffold0253 (230-298)||(6644-6712)
scaffold0253 (230-298)||(16069-16137)
scaffold0253 (237-298)||(4145-4206)
[»] scaffold0125 (4 HSPs)
scaffold0125 (523-593)||(34264-34331)
scaffold0125 (588-630)||(34400-34442)
scaffold0125 (531-567)||(34220-34256)
scaffold0125 (499-527)||(34676-34704)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (230-325)||(892-987)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (586-629)||(2013-2056)
scaffold1140 (461-516)||(2096-2152)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (586-629)||(6437-6480)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (586-636)||(17378-17428)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (591-636)||(5902-5947)
scaffold0407 (446-500)||(5755-5809)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (310-383)||(4831-4904)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (406-498)||(71558-71651)
scaffold0001 (588-621)||(71741-71774)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (521-576)||(1399-1454)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (231-350)||(2443-2562)
scaffold0409 (231-350)||(10698-10817)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (586-636)||(14503-14554)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (586-629)||(2260-2303)
scaffold0092 (438-496)||(2397-2455)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (586-636)||(8903-8953)
scaffold0190 (627-665)||(8963-9001)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (519-576)||(7260-7316)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (348-389)||(36951-36992)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (525-572)||(2615-2662)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (586-620)||(4681-4715)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (522-567)||(16782-16827)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (499-527)||(24259-24287)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 19020019 - 19019351
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19020019 attaaattactacacacgagtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataactttttttatgagtcgtgagacttttccaaacttgatattggatttaat 19019920  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19019919 gaagtgcttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatt-gggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcagtgaa 19019821  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19019820 aacgggttttgagttaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagtc 19019721  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19019720 cttcactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctt-gaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 19019622  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19019621 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 19019522  T
Q  501 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgaca 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19019521 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtg---aatatatatatgatgttgaatgaca 19019425  T
Q  601 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19019424 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 19019351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 8374050 - 8373392
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8374050 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgagcttaat 8373951  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373950 gaagtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatt-gggaaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 8373852  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8373851 at-gggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagtc 8373753  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373752 cttgactacatgattgattaagattgaattgtatgatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 8373653  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||| |||||||| | |||||| || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | ||        ||||||||||||||    
T  8373652 tggat-ttttgtcgaagatgttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcggag--------ttgaatgattgttt 8373563  T
Q  501 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgaca 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  8373562 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtg---aatatatatattatgttgaatgaca 8373466  T
Q  601 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373465 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 8373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 5683458 - 5683970
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5683458 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctacgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtctaatgaa 5683557  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5683558 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 5683657  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5683658 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 5683757  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5683758 ggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 5683857  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 502  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  5683858 a-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 5683956  T
Q  503 atgtgatgtttatc 516  Q
    || |||||||||||    
T  5683957 atatgatgtttatc 5683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18247749 - 18247235
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247749 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 18247650  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18247649 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatt-gggaaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 18247551  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18247550 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctaccctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 18247451  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18247450 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 18247351  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18247350 tggat-ttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 18247252  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18247251 tgaatatgatgtttatc 18247235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 22355159 - 22355651
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22355159 attaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacctttccaaacttgatattgggtttaat 22355258  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22355259 gaagtacttagagtgaataattgagtattcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgtcgatggtttaagaaatattttgggcggatttgaatcggtgaa 22355358  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22355359 aacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagttatcctttgaactaatttctaata-tttgcaagtggcttaagtc 22355457  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355458 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcacacttgaataagttgcctagc-ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacaggatt 22355556  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22355557 tgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgccttgtgagttattgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 22355651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14995651 - 14995157
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14995651 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaaattttccaaacttgatattgggtttaataaa 14995552  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaa-tgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14995551 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaaatgtgaatgtgttcatggtttaggaaatattttgggcggagttgaattggtgaaaa 14995452  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14995451 cggattttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatatgaacttaagttatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcct 14995352  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  14995351 tggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttacctaactttgaaaattatcaatgttggtcgtttaccacatgattt- 14995253  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14995252 gaatttttgttggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 14995157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 486
Target Start/End: Original strand, 19698075 - 19698549
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698075 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 19698174  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698175 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 19698274  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19698275 gggttttgagctaaatgttgttttatcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaaataatttctaatagtttgcaagtggcttaagtcttt 19698374  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    |   | || |||   ||| | |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698375 g---aaataatt-tctaatagt---ttgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 19698467  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    | |||||||||||||||||| || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19698468 a-tttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgaatga 19698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 486
Target Start/End: Original strand, 19708660 - 19709134
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19708660 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 19708759  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19708760 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 19708859  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19708860 gggttttgagctaaatgttgttttatcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaaataatttctaatagtttgcaagtggcttaagtcttt 19708959  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    |   | || |||   ||| | |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19708960 g---aaataatt-tctaatagt---ttgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 19709052  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    | |||||||||||||||||| || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19709053 a-tttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgaatga 19709134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 55377288 - 55377801
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55377288 aaattattacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctaggagctgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 55377387  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55377388 gtgcttagagtaaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggcttgagaaatattttgggcgaagttgaatcggtgaaaac 55377487  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||   | ||| || | ||| ||| || |  |     
T  55377488 gggttttgtgctaaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaggctaatctttgagctaatgattgataattcgtaagtggcctatgctca 55377587  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55377588 tacttatatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttg 55377687  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  55377688 ga-tttttgtcggaaatgtttcttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaattgaatgattgtattg 55377786  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  55377787 aatatgatgtttatc 55377801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 138 - 496
Target Start/End: Original strand, 18250785 - 18251142
Alignment:
Q  138 tatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggatt 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18250785 tatttgagaatgtgaatgtgttgatgccttgagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttgggtt 18250884  T
Q  238 ttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggat 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18250885 ttcccatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtccttggctacatgattgattaagattgaattgtaggat 18250984  T
Q  338 ttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattat 437  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18250985 ttcaaacttaaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgt 18251083  T
Q  438 cttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18251084 cttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 18251142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 141 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18168214 - 18167839
Alignment:
Q  141 ttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18168214 ttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcaaagttgaatcggtgaaaacgggttttcagctaaatgttgttttgtcttggaatttc 18168115  T
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttc 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18168114 tcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttc 18168015  T
Q  341 aaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatctt 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18168014 aaacttaaataagttgcctagctttaaaaattatcaatgttggccgtttgccatatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtctt 18167916  T
Q  441 atgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     |||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||    
T  18167915 gtgagttattgagattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatc 18167839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 17146379 - 17146630
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146379 attaaattactacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 17146478  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146479 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 17146578  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaactt 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17146579 aacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaactt 17146630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 18293758 - 18294011
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293758 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 18293857  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293858 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 18293957  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagct 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293958 gggttttgagctaaaggtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagct 18294011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16731683 - 16731469
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16731683 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 16731584  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16731583 gtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgattgtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 16731484  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    |||||||||||||||    
T  16731483 gggttttgagctaaa 16731469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14951277 - 14951053
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951277 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgggaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 14951178  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14951177 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgagagtgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 14951078  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14951077 gggtttttagctaaaatgtcgtttt 14951053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 292 - 496
Target Start/End: Original strand, 18294009 - 18294212
Alignment:
Q  292 gcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgc 391  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18294009 gcttaagtcctcgactagatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgc 18294108  T
Q  392 cacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaa 491  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18294109 cacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgtatgaatgag 18294207  T
Q  492 tgatt 496  Q
    |||||    
T  18294208 tgatt 18294212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 43281788 - 43282012
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43281788 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatttatctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattggatttaatgaa 43281887  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  43281888 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaataggtgaaaac 43281987  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  43281988 gggttttaaactaaaatgtcgtttt 43282012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47357193 - 47357027
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47357193 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 47357094  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47357093 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcacttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 47357027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 16328854 - 16329106
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  16328854 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 16328953  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16328954 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 16329052  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16329053 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 16329106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10487820 - 10487645
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10487820 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttt 10487722  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10487721 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 10487645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26679288 - 26679105
Alignment:
Q  312 gattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttg 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26679288 gattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaatcatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttttg 26679190  T
Q  412 tcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26679189 tcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 26679105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10643756 - 10643590
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10643756 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 10643657  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10643656 gaagcacttagagtgaataattgagtatgcatttacgtattggggaatgtgaatgtgttgatggttt 10643590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 9794490 - 9794315
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||    
T  9794490 atgattgattaagattaaattttaggatttcaaactcgaataagttgtctcgctttgaaaattatcaatgttaaccgtttgccaattgatttggat-ttt 9794392  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9794391 tgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtaagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 9794315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 518
Target Start/End: Original strand, 54119342 - 54119491
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||    
T  54119342 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt-tgtcggaaatatttcttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatga 54119440  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatctt 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  54119441 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttatctt 54119491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Original strand, 45460028 - 45460173
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45460028 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgact 45460126  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  45460127 aagtgaagttgtatgattaaatgattgtattggatatgatgtttatc 45460173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 34394069 - 34393981
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34394069 tgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 34393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 9294857 - 9294572
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  9294857 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggtttaagctcatgactacataattgattaagattg--tt 9294760  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | || | |||| ||| ||  |||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||||||||      
T  9294759 tgagagctttc-aacatgtctaagttgctttgtcttggaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaaagtttcttttg 9294663  T
Q  428 agccaa-ttatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    | |||| || ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9294662 aaccaatttttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 9294572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 581 - 674
Target Start/End: Original strand, 18294300 - 18294393
Alignment:
Q  581 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18294300 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaattctagatgttgaatatgatatttatcttgagatgtt 18294393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Original strand, 13447995 - 13448149
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  13447995 ttgggttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcataagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatggagtt 13448094  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
     |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13448095 gtaggttttaaaacttgattaagttacctagctttgaaaattatcaatgttggcc 13448149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 444
Target Start/End: Original strand, 34197110 - 34197326
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34197110 cttgggttttctcatacggacttgagctatcctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagtccttgattacatgattgattaagattgttt 34197209  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
      ||   |||||||||| |    |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||     
T  34197210 ggtaacttttcaaacttcatattgttgccttactttgagaaattatcgatgttggccgtttgccacatggtatgga-taattgtcggaaatgattctttt 34197308  T
Q  428 -agccaattatcttatga 444  Q
     |||||||| ||||||||    
T  34197309 aagccaattgtcttatga 34197326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18168303 - 18168210
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 94  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18168303 attaaattactacacatgggtcatgtggagttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 18168210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356257
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgataaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 47356257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 5684039 - 5684128
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgata-tttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5684039 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatgaattgtagatgttgaatatgatattttatcatgagatgtt 5684128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 15273722 - 15273869
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  15273722 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 15273820  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15273821 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 15273869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16521877 - 16521730
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  16521877 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 16521779  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16521778 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 16521730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 44055009 - 44054863
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  44055009 ttatcaatgttggccggttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgac 44054911  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  44054910 taagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 44054863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 25120137 - 25120223
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25120137 aaattactacacatgggccatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatat 25120223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 389
Target Start/End: Original strand, 40901660 - 40901746
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40901660 tgactacatgatggattaagattgaattgtaggttttaaaacttgaataagttacctagctttaaaaattatcaatgttggccgttt 40901746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Original strand, 7965645 - 7965818
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  7965645 ttgggttttctcatacaaacttaaactatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagatcatgattacatgattgattaatattgagtt 7965744  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga 404  Q
     |  | ||||||||||||||| ||| | |   ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7965745 gtgagttttcaaacttgaataggttactttattttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga 7965818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 394
Target Start/End: Original strand, 41257282 - 41257443
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  ||    
T  41257282 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaccta-tgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgatggattaagatt--at 41257378  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccac 394  Q
    |||  | ||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41257379 tttgagttttcaaacttgaataagttactttactttgagaattatcaacgttgggcgtttgccac 41257443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Original strand, 50220861 - 50221017
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50220861 ggattttctcatacgaacttagcctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgt 50220960  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
      | |||| ||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  50220961 gagttttcgaacttaaataagttaccttattttgaaaattatcaatgttggccgttt 50221017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 364 - 518
Target Start/End: Original strand, 21960633 - 21960787
Alignment:
Q  364 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctta 463  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||  | |  |||||||| |||    
T  21960633 ttgagaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactattttta 21960731  T
Q  464 tatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatctt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  21960732 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatctt 21960787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34394429 - 34394259
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |    
T  34394429 cttgggttttcttatacgaacttaaactattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagtccttgattacatgattgattaagatcattt 34394330  T
Q  330 tttaggatttcaaacttga-ataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
      || | |||||||||| | || | ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34394329 ggtaagttttcaaacttcatatta-ttgccttactttgagaaattatcgatgttggccgtttgccacatgat 34394259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Original strand, 41917667 - 41917830
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| |||||||   | ||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  41917667 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaaactcatgattacatgattgattaaaattgatttgtgag 41917766  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41917767 ttttcaaacttgaataagttactttgctttgaaaattatcaacgttggccgtttgccacttgat 41917830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 315
Target Start/End: Original strand, 820754 - 820839
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgatt 315  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  820754 cttgggttttcttatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtgacttaagtccttgattacatgatt 820839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Original strand, 12900839 - 12900967
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  12900839 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggattttg-gtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatga 12900937  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  12900938 ctaattgaagttgtataaatgaatgattgt 12900967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 42708017 - 42707864
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || |  |    
T  42708017 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattaatttgtgag 42707918  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttg--aaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||||||||||||||   || |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42707917 ttttctaacttgaataagtt--ataactttggaaaaattatcaatgttggtcgttt 42707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 15287961 - 15288083
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  15287961 aaattaatacacatgagtcatgtggaattttgtgaaaacttatcataaatgttttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttggtaatggg-ttaat 15288059  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15288060 gaggtacttagagtgaataattga 15288083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 15295071 - 15295193
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| || |||| |||||    
T  15295071 aaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatgttttctttataaaccgtgaaagttttccaaacttggtaatggg-ttaat 15295169  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15295170 gaggtacttagagtgaataattga 15295193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Original strand, 47469245 - 47469401
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||   |||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| || |    
T  47469245 ggattttctcatacgaacttaggctaatttttgaactaatgcttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagtttgatttgt 47469344  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
      | |||  ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47469345 gagtttttcaacttgagtaagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 47469401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12733417 - 12733264
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||  | |  |    
T  12733417 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgattacatgattgattaagattgatctgtgag 12733318  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12733317 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgataattatcaatgttggccgttt 12733264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 495
Target Start/End: Original strand, 23270990 - 23271119
Alignment:
Q  363 tttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctt 462  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  23270990 tttggaaattatcaaagttggtcgtttgccacttgatatgg--ttttggtcggaaatgtt-cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattctt 23271086  T
Q  463 atatgactaagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  23271087 atatggctaagtgaagttgtatgaatggatgat 23271119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14900721 - 14900625
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  14900721 cttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagcggcttaagttcatgactacaagatcgattaagattg 14900625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 33739353 - 33739206
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| ||||||||| |||||| | |||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||| |    
T  33739353 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcggaaatatttcttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataa 33739255  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  33739254 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 33739206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 516
Target Start/End: Original strand, 821222 - 821329
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  821222 gtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatga 821321  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  821322 tgtttatc 821329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Original strand, 13593643 - 13593806
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||  || |    
T  13593643 ttttctcatacgtacttaggctaatctttgaactaatgtttagtagttcgtaagtggcttaagctcatgactacacgattgattaagattgaatggtaag 13593742  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||  ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  13593743 tttcgaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattatcaatgctggtcgtttgccacttgat 13593806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Original strand, 43282341 - 43282435
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43282341 ggattttctcatacgaacttaagctattctttgaactgatgtataatagtttgtaagtggcttaagctcatgactatatgattgattaagattga 43282435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 496
Target Start/End: Original strand, 13810560 - 13810812
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttc 340  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||||||  | ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  ||| || | ||     
T  13810560 tcatacgaacttaagctattctttggaataatgtctaatagtccgtaagtggcttaagctcatgattacatgattgattaagattg--tttgagaacttt 13810657  T
Q  341 aaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatc 438  Q
     ||||||  || ||||  | |  |||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||   | |||||||||||| ||||||  || ||||| ||    
T  13810658 caacttgtctatgttgttttgtcttggggattatcaatgttggtcgtttgtcacttgatacgg---tattgtcggaaatggttcttttaagtcaattgtc 13810754  T
Q  439 ttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13810755 ttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatgaatgatt 13810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 674
Target Start/End: Original strand, 18110001 - 18110078
Alignment:
Q  598 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcg-tagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  18110001 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatggttatatgttggatatgataattgtcatgagatgtt 18110078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38764049 - 38763887
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||  ||| ||| | ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  38764049 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactctgaactaatgtctaata--ttgtaagtgacttaagctcttgattacataattgattaagattgagt 38763952  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccac 394  Q
    | |  |  |||||||||||||||||| | |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  38763951 tgtgagtcttcaaacttgaataagttactttattttgggaattatcaatgttggctgtttgccac 38763887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 12245188 - 12245284
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12245188 cttggttttttttatacgaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 12245284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19558615 - 19558536
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19558615 atgattgattaagatggaattgtatgttttcaaacttgagtaagttacatagctttgaaaattattaatgttggccgttt 19558536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 33739137 - 33739090
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33739137 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 33739090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 110352 - 110302
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  110352 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 110302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 8873780 - 8873830
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8873780 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8873830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 18167662 - 18167612
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18167662 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 18167612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22737781 - 22737671
Alignment:
Q  19 ggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaactt-gatattgggtttaatgaagtacttagagtgaa 117  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22737781 ggtcatgtgaacttttgttaaaacttaacataactttttctatgagtcgtgaaacctttacaaactttgttattgggtttaataaagtatttagagtgaa 22737682  T
Q  118 taattgagtat 128  Q
    | |||||||||    
T  22737681 tgattgagtat 22737671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 53909056 - 53909106
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53909056 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 53909106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 7133473 - 7133558
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  7133473 aattgtcttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 7133558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15274046 - 15274095
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15274046 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 15274095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18247058 - 18247009
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18247058 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 18247009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Original strand, 19822657 - 19822746
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  19822657 ttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatggttgattaagatt 19822746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19999397 - 19999348
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19999397 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 19999348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 30233612 - 30233759
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  30233612 aattatcaacgtcggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatat 30233708  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  30233709 gactaagtaaatttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 30233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15044170 - 15044074
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15044170 cttgggttttatgatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtgacttaagctcttgattacatgattgattaagattg 15044074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 15110254 - 15110350
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15110254 cttgggttttatgatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtgacttaagctcttgattacatgattgattaagattg 15110350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 16521660 - 16521612
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16521660 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 16521612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 53705915 - 53706027
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaa 503  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  53705915 tttttagtcggaaatgtttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgga 53706014  T
Q  504 tgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||||||||    
T  53706015 tatgatgtttatc 53706027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 519 - 586
Target Start/End: Original strand, 55377963 - 55378031
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-atatatatat 586  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55377963 aaggtgatgatattggtggatccatatacattatttattatgatatggtgggtgaatatatatatatat 55378031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 7133735 - 7133778
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133735 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 7133778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 496
Target Start/End: Original strand, 18109813 - 18109896
Alignment:
Q  413 cggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18109813 cggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 18109896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 44345881 - 44345786
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44345881 tttttggtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 44345786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 636
Target Start/End: Original strand, 53706079 - 53706126
Alignment:
Q  589 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53706079 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 53706126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 44054794 - 44054744
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44054794 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatga 44054744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 821398 - 821447
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  821398 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 821447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19999548 - 19999487
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19999548 tcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgt 19999487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26338548 - 26338425
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatt-tttgtgaaaacttatcataact-ttttcttta--agccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaa 99  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||  ||||||||||||||  || |||||| ||    
T  26338548 aaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatgggtt-aa 26338450  T
Q  100 tgaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  26338449 tgaggtacttagagtgaataattga 26338425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8044018 - 8043951
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8044018 tgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatgtggtgggtg---aatatatatatgatgttg 8043951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16731134 - 16731066
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  16731134 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaag 16731066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 8873619 - 8873745
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||| |   || ||||||||  |||||| |||    
T  8873619 ttatcaatgttggccggtggccagttgatatgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataact 8873717  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8873718 aagtgaagttatatgaatgaatgattgt 8873745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14950890 - 14950847
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14950890 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 14950847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 285
Target Start/End: Original strand, 15014209 - 15014264
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  15014209 cttggattttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgcctaatagtttg 15014264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 15212214 - 15212171
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15212214 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 15212171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13245322 - 13245272
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13245322 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatga 13245272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 15288296 - 15288338
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15288296 tgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatg 15288338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26338354 - 26338304
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26338354 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 26338304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9294395 - 9294346
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9294395 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatg 9294346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 627
Target Start/End: Original strand, 15295406 - 15295447
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgat 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295406 tgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgat 15295447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 22355850 - 22355899
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  22355850 tgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatg 22355899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 25120253 - 25120318
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25120253 caattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaatgatt 25120318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Original strand, 30233831 - 30233872
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30233831 atgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgt 30233872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 41166895 - 41166976
Alignment:
Q  245 acgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  41166895 acgaacttaagttattctttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagctcttaattacatgattgattaagattg 41166976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Original strand, 45460244 - 45460285
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45460244 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 45460285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 629
Target Start/End: Original strand, 18495695 - 18495735
Alignment:
Q  589 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18495695 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 18495735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 5684188 - 5684231
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5684188 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 5684231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 410
Target Start/End: Original strand, 7186916 - 7187023
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |  | ||||||||||||||||| | | |  |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7186916 tgactacatgattgattaagattattttgtgagttttcaaacttgaataagctactttactttaagaattgtcaatgttggccgtttgccacttgatatg 7187015  T
Q  403 gatttttt 410  Q
    || |||||    
T  7187016 gacttttt 7187023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 8373225 - 8373186
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8373225 tgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttg 8373186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 10643059 - 10643016
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10643059 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 10643016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14995067 - 14995024
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14995067 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 14995024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 34393926 - 34393883
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34393926 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 34393883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 44345700 - 44345657
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44345700 tgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgt 44345657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 25120408 - 25120458
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25120408 tgatgttgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatga 25120458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 12901058 - 12901107
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12901058 tgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 12901107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 14911034 - 14910977
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14911034 aaggtgatgatattggtgtatcgatatacattgtttattatgatttggtgggtgaata 14910977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 26678905 - 26678856
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  26678905 tgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatg 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Original strand, 21960854 - 21960890
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 622  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21960854 tgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatg 21960890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 516
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909019
Alignment:
Q  461 ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattg-tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatc 53909019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 625
Target Start/End: Original strand, 23271210 - 23271249
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23271210 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttg 23271249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 47356198 - 47356155
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47356198 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 47356155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 14950980 - 14950950
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950980 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 14950950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 15288204 - 15288234
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15288204 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 15288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 22355760 - 22355790
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355760 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 22355790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 22737539 - 22737477
Alignment:
Q  526 tgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-atatatatatg 587  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22737539 tgatattgatgaaaccatatacgttgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatatg 22737477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 568
Target Start/End: Original strand, 23271432 - 23271474
Alignment:
Q  526 tgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtg 568  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23271432 tgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtg 23271474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26678996 - 26678966
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678996 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 26678966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10487541 - 10487492
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  10487541 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 10487492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 628
Target Start/End: Original strand, 13810907 - 13810948
Alignment:
Q  587 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13810907 gatgttgaatgacgttgttgattgttgatgatcatgttgatg 13810948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 567
Target Start/End: Original strand, 14502868 - 14502913
Alignment:
Q  522 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggt 567  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14502868 gtgatgatattggtgagtccatatacattgtttattatgatatggt 14502913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 16329210 - 16329259
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  16329210 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 16329259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18275943 - 18275834
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||| |  || ||||| ||||||  |||||||||||||||||  | | |||||||  |||||||    
T  18275943 aattatcaatgttcgtcgtttgccacttaatatggattttat--cgaaaatgattcttttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagccttatat 18275846  T
Q  467 gactaagtgaag 478  Q
    |||||| |||||    
T  18275845 gactaaatgaag 18275834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 623
Target Start/End: Original strand, 18294453 - 18294490
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 623  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18294453 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgt 18294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Original strand, 37958056 - 37958149
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagat 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || | ||||||  |||||||| || ||| ||||||||  | ||||||||| | ||||||||||    
T  37958056 ttgggttttctcataagaacttaagctattcttcggactaatgcctaatagtctgtaagtggcttaagctcatgactacataaatgattaagat 37958149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14911120 - 14911092
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14911120 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 14911092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 644 - 672
Target Start/End: Original strand, 15295314 - 15295342
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295314 atgttgaatatgatatttatcatgagatg 15295342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49071022 - 49070950
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttg 382  Q
    |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||  | | |||||||||| |||||||||||    
T  49071022 atgattaattaagatcgagttgtaggttttcaaacttgaacaagtaactttgctttgaaaaatatcaatgttg 49070950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 20253862 - 20253207
Alignment:
Q  7 ttattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagta 106  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20253862 ttattacacatgggacatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagta 20253763  T
Q  107 cttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacggg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20253762 cttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttaagggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggttaaaacggg 20253663  T
Q  207 ttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgac 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20253662 ttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctcatagtttgcgagtggcttaagtccttgac 20253563  T
Q  307 tacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20253562 tacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat- 20253464  T
Q  407 ttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtttgaatgt 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||    
T  20253463 ttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagctatggtgactattcttatatgactaagcgaag--------ttgaatgattgtttgaatgt 20253372  T
Q  507 gatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgacattgttg 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20253371 gatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtg---aatatatatatgatgttgaatgacattgttg 20253275  T
Q  607 attattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20253274 attattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 20253207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 15862140 - 15862656
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15862140 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaat 15862239  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacattt-atgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15862240 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcattttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcgaagttgaatcggtga 15862339  T
Q  200 aaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15862340 aaacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttagaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggctgaagt 15862439  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15862440 ccttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctaactttgaaaaggatcaatgttggccgtttgccacatgat 15862539  T
Q  400 ttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt- 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15862540 ttgga-tttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta 15862638  T
Q  499 ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  15862639 ttgaatatgatttttatc 15862656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 22249665 - 22250177
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249665 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 22249764  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249765 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtctaagatatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 22249864  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22249865 gggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttggattatctcttataaacttaaactaacctttgaattattttctaatagtttgtaagtggcttaagtcct 22249964  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22249965 tgattacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagttttaaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttg 22250064  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22250065 ga-tttttgtcggaaatg-ttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 22250162  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  22250163 aatatgatgtttatc 22250177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22366537 - 22366321
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22366537 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaataatgggtt-aat 22366439  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22366438 gaagtacttagagttaataatttagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatgggttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaa 22366339  T
Q  201 aacgggttttgagctaaa 218  Q
    |||||||||| |||||||    
T  22366338 aacgggtttttagctaaa 22366321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 51451761 - 51451586
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51451761 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttt 51451663  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51451662 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatga 51451586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 311 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41218600 - 41218414
Alignment:
Q  311 tgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41218600 tgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-tttt 41218502  T
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| || || ||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41218501 gtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtcaccatacttgtatggataagtgaagttgtatgtatgaatgattgt 41218414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 313 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22365901 - 22365718
Alignment:
Q  313 attgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaa-ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttg 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22365901 attgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttttctagctttgaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgaattttt-g 22365803  T
Q  412 tcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22365802 tcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 22365718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 18060674 - 18060801
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18060674 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattggacttaat 18060773  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18060774 gaagtatttagagtgaataattgagtat 18060801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 7641659 - 7641787
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatatt-gggtttaa 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  7641659 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgattttggggcttaa 7641758  T
Q  100 tgaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641759 tgaagtatttagagtgaataattgagtat 7641787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18165426 - 18165268
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18165426 ttgggttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagat-gaatt 18165328  T
Q  331 t-taggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18165327 tgtaggttttaaaacttgattaagttacctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 18165268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 516
Target Start/End: Original strand, 2421916 - 2422193
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||  | |||||||||||||||||||| |||  |    
T  2421916 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtagcttaagctcatgactacatgattgattaaggttg--t 2422013  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag 429  Q
    || || | ||||| ||||  || ||||      ||||  || | ||||| |||| |||||||||| |||   || | ||| |||| ||||||||||| ||    
T  2422014 ttgagaacttcaa-cttgtctatgttg------tttgggaaatgtcaatattggtcgtttgccacttgacacgg-tctttggtcgcaaatgtttcttgag 2422105  T
Q  430 ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  2422106 ccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgactgaatgattgtattgaatatgatgtgtatc 2422193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17003916 - 17003792
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17003916 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 17003817  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17003816 gtatttagagggaataattgagtat 17003792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 492
Target Start/End: Original strand, 8538883 - 8539140
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||  |    
T  8538883 ttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagcttttgattacatgattgtttaagatt--attttgcg 8538980  T
Q  336 a--tttcaaacttgaataagttgcctagcttt-gaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agc 430  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| |||| ||||||  |||    
T  8538981 agttttcaaacttgaatatgttaccttgttttggggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga--ttttatcgggaatggttcttttaagc 8539078  T
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  8539079 caattatcttatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 8539140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 492
Target Start/End: Original strand, 8604122 - 8604379
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||  |    
T  8604122 ttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagcttttgattacatgattgtttaagatt--attttgcg 8604219  T
Q  336 a--tttcaaacttgaataagttgcctagcttt-gaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agc 430  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| |||| ||||||  |||    
T  8604220 agttttcaaacttgaatatgttaccttgttttggggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga--ttttatcgggaatggttcttttaagc 8604317  T
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  8604318 caattatcttatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 8604379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21858599 - 21858510
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 93  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858599 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 21858510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 22353146 - 22353058
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22353146 tgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 22353058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 35053928 - 35053802
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| ||||||| || | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  35053928 ttatccatgttggtcgatggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 35053830  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35053829 aagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 35053802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 20826192 - 20826339
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  20826192 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 20826290  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20826291 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 20826339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27674079 - 27673867
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||      
T  27674079 cttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatg 27673980  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  | |||||||||||| || ||| |||  | |||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||   |||| ||||||||| ||||||      
T  27673979 tattagttttcaaacttgattacgttaccttac-ttgagagttatcaaagttggtcgtttgccacttgatacgg---ttttatcggaaatggttctttta 27673884  T
Q  428 agccaattatcttatga 444  Q
    |||||||||||||||||    
T  27673883 agccaattatcttatga 27673867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 21650972 - 21651098
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcata---actttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  21650972 aaattactacacatgggtcatgcggatttttgtgaaaacttatcataaatattttttttataagccgtgaaacttttccaaacttaacaatggg-ttaat 21651070  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  21651071 gaggtacttagagtgaataattgagtat 21651098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Original strand, 5769107 - 5769267
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | | |||||| | |||  | |||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5769107 cttggattttctcatacgaacttaagctaatttttgaactaatgtttgatagttcgtaagtagtttaagctcatgattacatgattgattaagattgatt 5769206  T
Q  330 ttt-aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | | ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5769207 tgtgagcttttcaaacttaaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 5769267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21717288 - 21717163
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||     
T  21717288 ttatcaatgttggttgtttgccacttgatatgg--ttttggtcggaaatgttttttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacg 21717191  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21717190 aagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 21717163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 472
Target Start/End: Original strand, 22144313 - 22144554
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |    
T  22144313 cttgggttttctcgtacgaacttaagctatgctttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattattt 22144412  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc-ttta 428  Q
    | |  |  |||||||||||| |||||  ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |   ||| ||||||||| ||| |||     
T  22144413 tgtgagtcttcaaacttgaacaagttatcttactttggaaattatcaatgttgaccgtttgtcacttgatatgaa--ctttatcggaaatgattcttttt 22144510  T
Q  429 gccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaa 472  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||  ||||| |||||||    
T  22144511 gccaattatcttataaccttttgtgactagccttatgtgactaa 22144554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Original strand, 22407272 - 22407418
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  22407272 ttatcaatgttggtcggttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgac 22407370  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22407371 taagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 22407418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 442
Target Start/End: Original strand, 5471320 - 5471531
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||   | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5471320 ttgggttttctcatacgaacttaatctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggtttaaactcgtgactacatgattgattaagattggttt 5471419  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataa-gttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-a 428  Q
     || | |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||   ||| ||||||||| |||||| |    
T  5471420 ataagctttcaaactttaataatgttaccttgttttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacgga--ctttatcggaaatggttctttaa 5471517  T
Q  429 gccaattatcttat 442  Q
    | ||||||||||||    
T  5471518 gacaattatcttat 5471531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18506441 - 18506296
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||  | | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  18506441 ttatcaatgttggttggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgact 18506343  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18506342 aagttaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 18506296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 44035921 - 44036018
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttt-tgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  44035921 aaattactacacatgggtcatgtgaattttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 44036018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 49998243 - 49998412
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||      
T  49998243 cttggattttctcgtacgaacttaaattatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgattacatgattgattaagattgaga 49998342  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |  | |||| | ||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49998343 tgtgagttttccatcttgaataaattactttattttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgat 49998412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Original strand, 5675681 - 5675823
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  5675681 tcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaag 5675779  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  5675780 tgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatc 5675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 35523496 - 35523622
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  35523496 ttatcagtgttggccgtttgccacttgatatgg-ttttggatcggaaatgtttcttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 35523594  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  35523595 aagtgaagttgtataaatgaatgcttgt 35523622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 40437197 - 40437351
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||| |||||| || |   ||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  40437197 ttttctcatacaaacttaggcaaatctttgaactaatgtttaatagtttataagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtggg 40437296  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttg-aaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40437297 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaaattatcaatgttgaccgttt 40437351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 322
Target Start/End: Original strand, 22836181 - 22836265
Alignment:
Q  238 ttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22836181 ttctcatacgaacttaagctattctttggactaatgtctaatagtttgcaagtggcttaagatcatgactacatgattgattaag 22836265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17608194 - 17607932
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  17608194 cttgggttttctcatacgaacttgagttattctttgaactaatatttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg-tt 17608096  T
Q  330 tttagga-tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||| ||  || |||||||||     
T  17608095 ttgagaattttcaaactttatgttgttaccttgttttgggaattatcaatgttggccggttgccacttgatatgaa--ttttatcaaaattgtttctttt 17607998  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
     ||||||||||||| |||    | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17607997 aagccaattatcttgtgatcattcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtatgagtgaat 17607932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 324
Target Start/End: Original strand, 13377702 - 13377796
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagat 324  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13377702 cttgggttttatcatacgaacttaacctattctttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgactacatgattgattaagat 13377796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33396590 - 33396504
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33396590 tgactacatgattgattaagattgatttgtgagttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaatcatcaatgttggccgttt 33396504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 27330847 - 27330994
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| ||||||  || ||||||  |||| | ||||||||| || ||||||||    
T  27330847 aattatcaacgtcggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatat 27330943  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27330944 gactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 27330994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20176481 - 20176385
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20176481 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgcctaatagtttgtaagtagcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 20176385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 581 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20444622 - 20444567
Alignment:
Q  581 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20444622 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 20444567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 581 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20530387 - 20530332
Alignment:
Q  581 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20530387 atatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 20530332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 18506227 - 18506177
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18506227 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 18506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20526989 - 20526939
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20526989 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 20526939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 22407487 - 22407537
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407487 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatga 22407537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15862725 - 15862774
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15862725 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 15862774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 20826516 - 20826565
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20826516 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 20826565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 496
Target Start/End: Original strand, 20955910 - 20956172
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||| |||||||||  | ||| || |||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  20955910 ttgggttttctcatacgaatttaagttattctttggaccaatgtctaatagtccgtaagtgggttaagatcatgactacataattgattaagattg--tt 20956007  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-ag 429  Q
    | ||  |||  |||||| |||  |||| | |  |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||||||||||||| |||| ||    
T  20956008 tgagagttttcaacttgtatatattgctttgtcttgggaattatcgatgttggccgtttgccacttgatacgg--tatttgtcggaaatgttcctttgag 20956105  T
Q  430 ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
     ||||  | |||||   | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20956106 tcaatcgttttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgatt 20956172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22029822 - 22029700
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| | |||  ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  22029822 aaattaatacacatgagtcatgaggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaactgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaat 22029724  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22029723 gaggtacttagagtgaataattga 22029700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21858427 - 21858384
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858427 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 21858384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 32650546 - 32650491
Alignment:
Q  521 ggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32650546 ggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 32650491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 37845758 - 37845801
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37845758 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 37845801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Original strand, 51657447 - 51657514
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51657447 caattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 51657514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 7641887 - 7641937
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7641887 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 7641937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20193296 - 20193214
Alignment:
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20193296 gactacatgattgattaagattgatttgtgagttttcaaacttgaataagttactttgctttgaaaaatatctatgttggccg 20193214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 41393321 - 41393271
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41393321 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatga 41393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 44036192 - 44036242
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44036192 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatga 44036242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22034974 - 22034851
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatt-tttgtgaaaacttatcataact-ttttcttta--agccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaa 99  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||  ||||||||||||||  || |||||| ||    
T  22034974 aaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatgggtt-aa 22034876  T
Q  100 tgaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  22034875 tgaggtacttagagtgaataattga 22034851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 516
Target Start/End: Original strand, 44036055 - 44036124
Alignment:
Q  448 gttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  44036055 gttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 44036124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 36357329 - 36357425
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||   || | ||||||||||||||||||||    
T  36357329 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaattttcaatggtttgtaagtggcttaagctattaattacatgattgattaagattg 36357425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 630
Target Start/End: Original strand, 51657606 - 51657650
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51657606 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgta 51657650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16655741 - 16655658
Alignment:
Q  243 atacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  16655741 atacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaattgtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaatattg 16655658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 17147651 - 17147608
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17147651 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgt 17147608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 18060901 - 18060944
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18060901 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgt 18060944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21224467 - 21224404
Alignment:
Q  307 tacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaa 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21224467 tacatgattgattaagtttgaattgtaggttttcaaacttgaataagtcgctttgctttgaaaa 21224404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22353290 - 22353215
Alignment:
Q  442 tgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22353290 tgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatc 22353215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 636
Target Start/End: Original strand, 35523712 - 35523763
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35523712 atgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 35523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 37234903 - 37234998
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  37234903 cttgggttttcttatgtgaacttaagctattatttgaactaaagtctaatagtttgtaagtggattacgttcatgaccacatgattgattaagatt 37234998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 22031008 - 22031058
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22031008 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 22031058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22034716 - 22034666
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22034716 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 22034666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 41210913 - 41210867
Alignment:
Q  590 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41210913 gttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatga 41210867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 41211128 - 41211003
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| || | |||||| || || || |||| |||| |||  |||||| ||||||    
T  41211128 tcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcgaaaatgttttttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaag 41211030  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  41211029 tgaagttgtatgaaggaatgattgttt 41211003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 45050553 - 45050503
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45050553 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 45050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 49966520 - 49966470
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  49966520 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatga 49966470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 2422263 - 2422312
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2422263 tgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 2422312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 22352999 - 22352955
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22352999 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgta 22352955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 38034608 - 38034704
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || | |||||||||||||||    
T  38034608 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatattcaatggtttgtaagtggcttaagctcttgattatacgattgattaagattg 38034704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 5675893 - 5675936
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5675893 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 5675936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17147802 - 17147743
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17147802 tcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 17147743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19602354 - 19602259
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||  | ||||||| | |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  19602354 ttgggttttctcatacgaacttaagttattctttggactaaggtttaatagtctacaagtggcttaagctcatgactgcatgattgattaagattg 19602259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22365626 - 22365583
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22365626 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 22365583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 35053711 - 35053668
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35053711 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 35053668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 21651229 - 21651279
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21651229 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 21651279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 49966684 - 49966619
Alignment:
Q  421 tttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    |||||| || |||||| ||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966684 tttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatga 49966619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 592 - 636
Target Start/End: Original strand, 20894991 - 20895035
Alignment:
Q  592 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20894991 tgaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatga 20895035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 17003691 - 17003649
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17003691 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgt 17003649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17022781 - 17022718
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17022781 tttgaactaatgtgtaatagtttgtaagtagcttaagctcttgattacatgattgattaagatt 17022718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22029565 - 22029522
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  22029565 tgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgt 22029522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 620
Target Start/End: Original strand, 22250245 - 22250279
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatca 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22250245 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatca 22250279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 22836530 - 22836572
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  22836530 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgttgatg 22836572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 51451482 - 51451433
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  51451482 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 51451433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 21717074 - 21717027
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21717074 tgatgttgaatgacattgttg---attgataatcatgttgatatgtgatga 21717027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32650634 - 32650606
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650634 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 32650606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 463; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 674
Target Start/End: Original strand, 17150715 - 17151374
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150715 attaaattactacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgatccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaat 17150814  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150815 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatatatgtatt-gggaaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 17150913  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  17150914 aacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaagtc 17151013  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151014 cttgtctacatgattgattaagattgaattttatgattttaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 17151113  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||| ||||||||| | |||||| || || || || ||||| || || | ||||||||||||||||||||||  ||||        ||||||||||||||    
T  17151114 tgga-tttttgtcgaagatgttt-ttgagtcatttgtcttacgatttatggtgactattcttatatgactaatcgaag--------ttgaatgattgttt 17151203  T
Q  501 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgaca 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  17151204 gaatgtgatgtttatcttaaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatattgtggttg---aatatatatattatgttgaatgaca 17151300  T
Q  601 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151301 ttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 17151374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 514
Target Start/End: Original strand, 22007188 - 22007700
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22007188 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaacgaa 22007287  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtattt-gggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007288 gtacttagaggggataattgagtatgcatttatgtattttgggaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 22007387  T
Q  203 cgggttttgagctaaa-tgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  22007388 cgggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggctcaagtcc 22007487  T
Q  302 ttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22007488 ttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgattt 22007587  T
Q  402 ggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-tt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22007588 gga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 22007686  T
Q  501 gaatgtgatgttta 514  Q
    |||| |||||||||    
T  22007687 gaatatgatgttta 22007700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 496
Target Start/End: Original strand, 13663191 - 13663682
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663191 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 13663290  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663291 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 13663390  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13663391 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttagtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 13663490  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13663491 gactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaacaagttacctaactttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccgcatgatttgg 13663590  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13663591 a-tttttgttggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 13663682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22146984 - 22146567
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146984 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttaccataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 22146885  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22146884 gtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgtgcggagttgaatcggtgaaaac 22146785  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22146784 gggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatatgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagtcctt 22146685  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146684 gactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 22146585  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtt 422  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22146584 at-ttttgtcggaaatgtt 22146567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18611959 - 18611485
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611959 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 18611860  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611859 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 18611760  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18611759 gggttttgagctaaatgttgttttatcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaaataatttctaatagtttgcaagtggcttaagtcttt 18611660  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    |   | || |||   ||| | |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611659 g---aaataatt-tctaatagt---ttgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 18611567  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    | |||||||||||||||||| || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18611566 a-tttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgaatga 18611485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18618840 - 18618515
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618840 attaaattactacacatggatcatgtggatttttgtaaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 18618741  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618740 gaagtacttagagtgaataattgaatatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 18618641  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18618640 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttcacatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 18618541  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  18618540 cttgactatatgattgattaagattg 18618515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39114420 - 39114116
Alignment:
Q  6 attattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagt 105  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39114420 attactacacatgagtcatgtagatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtttaatgaagt 39114321  T
Q  106 acttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39114320 acttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgg 39114221  T
Q  206 gttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  39114220 gttttgagctaaatgtcgttttgtcttaggttttcttataaaaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgtaagtaacttaagtccttga 39114121  T
Q  306 ctaca 310  Q
    |||||    
T  39114120 ctaca 39114116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 218 - 496
Target Start/End: Original strand, 13721940 - 13722217
Alignment:
Q  218 atgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattga 317  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13721940 atgttgttttgtcttggaacttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaaattctaatagtttgtaagtggcttgagtccttgactacatgattga 13722039  T
Q  318 ttaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaa 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13722040 ttaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga-tttttgtcggaa 13722138  T
Q  418 atgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13722139 atgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 13722217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 28836968 - 28836665
Alignment:
Q  191 aatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaagg 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28836968 aatcggtggaaacgggttttgagctaaatgttgatttgtcttgggttt-ctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtgagt 28836870  T
Q  291 ggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 390  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836869 ggcttatgtccttgactacgtgattgattaagattgatttgtaggttttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttg 28836770  T
Q  391 ccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattga 490  Q
    | | ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28836769 ctatatgatttaga-tttttgtcaaaaatgtttctttagccaaatgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 28836671  T
Q  491 atgatt 496  Q
     |||||    
T  28836670 gtgatt 28836665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 233 - 498
Target Start/End: Original strand, 24718350 - 24718613
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  24718350 ggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaacttatttataatagtatgtaagtggcttaagtccttggctacattattgattaagattgaattgt 24718449  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||| ||| |    
T  24718450 aggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttcgatttttgtt--gaaatgtttcttgagcaa 24718547  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24718548 attatcttgtgagttattgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 24718613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 24717813 - 24718019
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24717813 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttcttttagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 24717912  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24717913 gtacttagagtgaataattgtgtattcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatatttttggcggagttgaatcggtgaaaac 24718012  T
Q  204 gggtttt 210  Q
    |||||||    
T  24718013 gggtttt 24718019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 310 - 494
Target Start/End: Original strand, 24930014 - 24930197
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930014 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 24930113  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatga 494  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24930114 t-tcgaaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatga 24930197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 223404 - 223570
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  223404 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 223503  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  223504 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 223570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 699817 - 699983
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  699817 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 699916  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  699917 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 699983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 737027 - 737193
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  737027 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 737126  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  737127 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 737193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 860922 - 861088
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  860922 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 861021  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  861022 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 861088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 519 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 18618253 - 18618099
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataat 618  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618253 aaggtgatgatttttgtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata-tatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataat 18618155  T
Q  619 catgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618154 catgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 18618099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5237422 - 5237170
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  5237422 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 5237323  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5237322 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttagcaa 5237224  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5237223 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 5237170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 24662176 - 24662428
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  24662176 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 24662275  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24662276 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 24662374  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24662375 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 24662428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 43684804 - 43684629
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  43684804 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttt 43684706  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  43684705 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatga 43684629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Original strand, 22908387 - 22908572
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22908387 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccatttgccacatgatttgga-tttt 22908485  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||| |||||| | |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22908486 tgtcggaaatgtt--ttgagccaattgtcttgtgagttatggtgaccgttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgt 22908572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 688175 - 688311
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  688175 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 688274  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  688275 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatg 688311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 15320091 - 15320215
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15320091 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgattttgggtttaatgag 15320190  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15320191 gtacttagagtgaataattgagtat 15320215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 15500460 - 15500584
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15500460 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgattttgggtttaatgag 15500559  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15500560 gtacttagagtgaataattgagtat 15500584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 22089475 - 22089599
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  22089475 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgag 22089574  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22089575 gtacttagagtgaataattgagtat 22089599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 272266 - 272390
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  272266 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 272365  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  272366 gtatttagagggaataattgagtat 272390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 829389 - 829265
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  829389 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 829290  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  829289 gtatttagagggaataattgagtat 829265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Original strand, 18262425 - 18262582
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18262425 ttgggttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacacgattgattaagatggaatt 18262524  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18262525 gtaggttttaaaacttgaataag-tacctagctttgaaaattatcaatattggccgttt 18262582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Original strand, 45468232 - 45468390
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| | |||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  45468232 ttgggttttctcacacgaacttaagctaatctttgaattaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagttcatgactacatgattgattaagatggagtt 45468331  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45468332 gtaggttttaaaacttgaataagttacctagctttaaaaattatcaatgttggccgttt 45468390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 643583 - 643459
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  643583 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 643484  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  643483 gtatttagagggaataattgagtat 643459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224387
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 224387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700800
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 700800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 737924 - 738010
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 738010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861905
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 861905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Original strand, 18042438 - 18042595
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt-t 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18042438 ggattttctcatacgaacttaggctagtctttgaactaatgtttaatagttggtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgt 18042537  T
Q  332 taggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18042538 gagtttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 18042595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13663774 - 13663862
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663774 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13663862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13722309 - 13722397
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722309 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13722397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13722457 - 13722545
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722457 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13722545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13722605 - 13722693
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722605 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13722693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13722753 - 13722841
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722753 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13722841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13722901 - 13722989
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13722901 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13722989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 13723049 - 13723137
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723049 tgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatgaattgtggatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13723137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29297151 - 29296992
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29297151 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 29297052  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | ||| ||||||||||||||||  |   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29297051 tatgagtttttaaacttgaataagttgttttattttggaaattatcaatgttggccgttt 29296992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7469519 - 7469366
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  7469519 ttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaaattcatgactacatgattgattaaaattgatttgtaag 7469420  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7469419 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 7469366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 38636587 - 38636756
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | | | ||||||||||||||||||||| |    
T  38636587 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgagctaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctcataattacatgattgattaagattgagt 38636686  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38636687 tgtgagttttcaaacttgaataagttactttattttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgat 38636756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20480760 - 20480634
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  20480760 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 20480662  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20480661 aagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 20480634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 472
Target Start/End: Original strand, 37654562 - 37654804
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||   |    
T  37654562 cttgaattttctcatacaaacttgagttatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgtataagattattt 37654661  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  | ||||||||||||||| ||| ||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| |||||||||||      
T  37654662 tgtgagttttcaaacttgaatatgttaccttgttttgggaattatcaatgttgcccgtttgccacttgatatgga--ttttatcgggaatgtttctttta 37654759  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaa 472  Q
    |||||| ||||||||||  | | |||||||  |||||||||||||    
T  37654760 agccaaatatcttatgatctttcgtgactagccttatatgactaa 37654804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24267276 - 24267066
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||    
T  24267276 ttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaataatttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatgggatt 24267177  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccg-tttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
     |||| ||| ||| || |||||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| ||| ||      
T  24267176 gtagg-ttttaaaatttaataagttaccttattttggaaattatcaatattggccgttttgccacttgatacgga--ttttgtcgaaaatgattccttaa 24267080  T
Q  428 agccaattatctta 441  Q
    ||||||||||||||    
T  24267079 agccaattatctta 24267066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Original strand, 33611986 - 33612145
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |    
T  33611986 cttgggttttctcatacgaactcaagttatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattattt 33612085  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | ||||||||||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33612086 tgtgagttttcaaacttgaacaagttactttactttggaaattatcaatgttggccgttt 33612145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20708955 - 20708832
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  20708955 tgactacatgattgattaagattgaatggtaggttgccaaacttgaataagttactttgctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacg 20708856  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttcttta 428  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||    
T  20708855 ga--ctttgtcggaaatgattcttta 20708832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16001284 - 16001195
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16001284 atgattgattaagattgaattgtaggtttccaaacttgaacaagttaccttgctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgat 16001195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 22322538 - 22322651
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 502  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  22322538 tttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 22322637  T
Q  503 atgtgatgtttatc 516  Q
    || |||||||||||    
T  22322638 atatgatgtttatc 22322651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23149135 - 23148966
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||        
T  23149135 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagcggctttagctcgtgactacatgattgattaagattactc 23149036  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |   |||||||||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  23149035 tgtgaaatttcaaacttgaacaagttactttactttggaaattatcaatgttgggcttttgccacttgat 23148966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37610457 - 37610330
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  37610457 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcgtatatga 37610360  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37610359 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattgt 37610330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Original strand, 20568339 - 20568462
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||||||||||||||| |||| |||   || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  20568339 tcaatgttggccgtttaccacttgacacgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaag 20568437  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20568438 tgaagttgtatgaatgaataattgt 20568462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Original strand, 20574532 - 20574655
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||||||||||||||| |||| |||   || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  20574532 tcaatgttggccgtttaccacttgacacgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaag 20574630  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20574631 tgaagttgtatgaatgaataattgt 20574655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 24107443 - 24107538
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  24107443 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 24107538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33171530 - 33171374
Alignment:
Q  234 gattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt-tt 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||  | |||||||| | |||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  33171530 gattttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaaagtttaatagttcgtaagtagcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtg 33171431  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  33171430 agtttttcaaacttgaataagttaccttgtgttgagaattatcaatgttggccgttt 33171374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Original strand, 19994225 - 19994367
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  19994225 tcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaag 19994323  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattg-tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  19994324 tgaagttgtatgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatc 19994367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29759436 - 29759350
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29759436 aaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgaaccgtgaaacttttacaaacttgatat 29759350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 496
Target Start/End: Original strand, 16040321 - 16040446
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||  | || |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16040321 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg--tcttggtcggaaatgtttcttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatga 16040418  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16040419 ctaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 16040446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25121628 - 25121485
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaa 472  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||  |||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  25121628 tcaatgttggtcgtttgccacttgatacgg-tttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaa 25121530  T
Q  473 gtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25121529 gtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 25121485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21680254 - 21680167
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21680254 gtcggaaatgtttcttaaaccgattgtcttatgaattatcgagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 21680167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25609388 - 25609309
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609388 atgatttattaagatggaattgtaggttttcaaacttgaataagttacgttgctttgaaaattatcaatgttggccgttt 25609309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 496
Target Start/End: Original strand, 16042144 - 16042229
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16042144 gtcggaaatgtttcttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 16042229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15932558 - 15932347
Alignment:
Q  261 atttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-gatttcaaacttgaataagttgcct 359  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||||||||| |    ||| |||    
T  15932558 atttgaactaatgtttaatagtttgtaggtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgt-tttgagagttttcaaactttatattgttacct 15932460  T
Q  360 agctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgacta 457  Q
     |  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  | | |||||||    
T  15932459 tgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga--ttttatcggaaatgattcttttaagccaattatcttatgatatttcgtgacta 15932362  T
Q  458 ttcttatatgactaa 472  Q
      |||||||||||||    
T  15932361 gccttatatgactaa 15932347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 24553569 - 24553665
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24553569 tgactacataattgattaagattgatttgtgagttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaactatcaatgttggtcgtttgccacttgat 24553665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 519 - 586
Target Start/End: Original strand, 41508288 - 41508356
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-atatatatat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41508288 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatat 41508356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 41245537 - 41245490
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245537 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 41245490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 41245709 - 41245606
Alignment:
Q  414 ggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtt 512  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  41245709 ggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt 41245610  T
Q  513 tatc 516  Q
    ||||    
T  41245609 tatc 41245606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 41507891 - 41507986
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  41507891 cttgggttttctcatacagacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcacgactacatgattgattaagatt 41507986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Original strand, 3432647 - 3432773
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   |  | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  3432647 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgt-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 3432745  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  3432746 ctaagtgaa--tgtatgaatgaatgattgt 3432773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Original strand, 16406140 - 16406265
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| | |||||| || || || |||  ||||||||  || ||||||||||    
T  16406140 tcaatgttggccggtggccacatgatatgg-tttttggtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaag 16406238  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16406239 tgaagttgtatgaatgaatgattgttt 16406265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 29759320 - 29759234
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  29759320 caattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 29759234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Original strand, 3844641 - 3844710
Alignment:
Q  87 atattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgt 156  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3844641 atattgggttaaatgaagtatttatagtgaataattgagtatgtatttatggatttgggaatgtgaatgt 3844710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 21199162 - 21199330
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  21199162 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaaggcctaatagtttgtaagtggcttaaactcttgattacatgattgattaagattgttt 21199261  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
      |  | ||||||||||  ||  ||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21199262 ggtgagttttcaaacttatat-tgttaccttactttgagagttatcaatgttggccgtttgccacttgat 21199330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 24718702 - 24718751
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24718702 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 24718751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 28836465 - 28836416
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28836465 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 28836416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 399
Target Start/End: Original strand, 45562106 - 45562195
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45562106 atgattgattaagattgaatggtaggtttccaaacttgaacaagttactttgcattgaaaattatcaatgttggacgtttgccacttgat 45562195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16417291 - 16417224
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16417291 caattgtcttatgaattatggagactattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgt 16417224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 22908770 - 22908813
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908770 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 22908813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 24386994 - 24387037
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24386994 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 24387037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 43374868 - 43374911
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374868 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 43374911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 3432861 - 3432903
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3432861 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 3432903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 6775517 - 6775559
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6775517 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 6775559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 399
Target Start/End: Original strand, 21191756 - 21191913
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttc 340  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||   |  |  | ||||    
T  21191756 tcatacgaacttaagctattctttgaactaatgcctaatagtttttaagtggcttaagctcttgattacatgattggttaagattttttggtgagttttc 21191855  T
Q  341 aaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||  ||  |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21191856 aaacttatat-tgttgccttactttgagagttatcaatgttggccgtttgccacttgat 21191913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 408
Target Start/End: Original strand, 23226942 - 23227120
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||    |||||| |||||||||||||||||  |    
T  23226942 cttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttgagcttatgactaaatgattgattaagattgtct 23227041  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    | |  | |||||||||| || |||||   |    ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  23227042 tgtgagctttcaaacttaaacaagttattttatcttggaaattatcaatgttagccgtttgctacttgatatggatttt 23227120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23836437 - 23836355
Alignment:
Q  244 tacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23836437 tacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaggctcttgattacatgattgattaagattg 23836355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26010696 - 26010606
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | | |||||||||||||||| |||||    
T  26010696 ttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcataactacatgattgattatgattg 26010606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 20648548 - 20648633
Alignment:
Q  413 cggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20648548 cggaaatgtttcttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgt 20648633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 24107872 - 24107921
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24107872 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatg 24107921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 16874224 - 16874267
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16874224 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgt 16874267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 17730749 - 17730792
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17730749 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 17730792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 19994436 - 19994479
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19994436 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 19994479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21696436 - 21696393
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21696436 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 21696393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 382
Target Start/End: Original strand, 22498266 - 22498345
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |  | || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22498266 tgacttcatgattgattaagattgatttgtgagtttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttg 22498345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 24930399 - 24930442
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24930399 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 24930442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 31195276 - 31195371
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||| | ||||||| | |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  31195276 ttgggttttcttatacgaacttaagttattctttggactaatctttaatagtatacaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 31195371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 38532533 - 38532490
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38532533 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 38532490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16195022 - 16195072
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16195022 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatga 16195072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 20648724 - 20648774
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20648724 tgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatga 20648774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 498
Target Start/End: Original strand, 20655136 - 20655218
Alignment:
Q  416 aaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20655136 aaatgtttcttaagccgattgtcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgt 20655218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 20655309 - 20655359
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20655309 tgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatga 20655359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21696651 - 21696527
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttta-gccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||  |  | ||||||||||||| ||| |    
T  21696651 ttatcaaggttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggc 21696556  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21696555 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 21696527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24548092 - 24548042
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24548092 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 24548042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 29759165 - 29759115
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29759165 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 29759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532627
Alignment:
Q  438 cttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgatt 38532627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Original strand, 24386842 - 24386903
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24386842 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgt 24386903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 16040645 - 16040688
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16040645 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 16040688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 16042321 - 16042364
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16042321 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 16042364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 496
Target Start/End: Original strand, 16874073 - 16874132
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16874073 tcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 16874132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 20480543 - 20480500
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20480543 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 20480500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 627
Target Start/End: Original strand, 20568553 - 20568592
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20568553 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgat 20568592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 627
Target Start/End: Original strand, 20574746 - 20574785
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20574746 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgat 20574785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21680077 - 21680034
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21680077 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgt 21680034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22887049 - 22886974
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
    |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  22887049 atgattaattaagatcgagttgtaggttttcaaacttgaacaagttactttgctttgaaaagtatcaatgttggcc 22886974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 37610241 - 37610198
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37610241 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 37610198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 272491 - 272540
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  272491 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 272540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 643358 - 643309
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  643358 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 643309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 829164 - 829115
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  829164 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 829115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 516
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107695
Alignment:
Q  451 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 24107695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25121416 - 25121367
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  25121416 tgatgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatg 25121367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38532877 - 38532792
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38532877 tcatacgaacttaagctattctttagactaatgtctaatagtccgtaagtgacttaagttcatgactacatgattgattaaaattg 38532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17284491 - 17284423
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  17284491 cttgggttttatcatacgaacttaagctagtctttgaactaatgtctaatagtttgtaatcggcttaag 17284423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 22322720 - 22322764
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgtt-gattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22322720 tgatgttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgt 22322764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 224446 - 224489
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  224446 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 224489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 700859 - 700902
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  700859 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 700902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 738069 - 738112
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  738069 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 738112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 861964 - 862007
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  861964 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 862007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 23148890 - 23148839
Alignment:
Q  624 tgatgtatgatgaatcgt-agatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23148890 tgatgtgtgatgaattgttagatgttgtatatgatatttatcatgagatgtt 23148839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556952
Alignment:
Q  451 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgt 28556952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 15320346 - 15320396
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  15320346 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 15320396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 15500715 - 15500765
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  15500715 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 15500765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 16040555 - 16040585
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040555 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 16040585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 22089730 - 22089780
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  22089730 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 22089780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 416 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22144255 - 22144185
Alignment:
Q  416 aaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22144255 aaatgtttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttgaatga 22144185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 24930309 - 24930339
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930309 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 24930339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 5237066 - 5237017
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  5237066 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 5237017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 623
Target Start/End: Original strand, 13663921 - 13663958
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 623  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13663921 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgt 13663958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 623
Target Start/End: Original strand, 13723196 - 13723233
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 623  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13723196 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgt 13723233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 24662532 - 24662581
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  24662532 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 24662581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 43684525 - 43684476
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  43684525 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 43684476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 496
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194953
Alignment:
Q  460 cttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 16194953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 10778894 - 10779408
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778894 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 10778993  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtattt-gggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778994 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgggaatgtgaatgtgttgataatttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 10779093  T
Q  203 cgggttttgagctaaa-tgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcc 301  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10779094 cgagttttgagctaaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcc 10779193  T
Q  302 ttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10779194 ttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcagtttgccacatgattt 10779293  T
Q  402 ggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-tt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10779294 gga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 10779392  T
Q  501 gaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| |||||||||||    
T  10779393 gaatatgatgtttatc 10779408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11342200 - 11341685
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342200 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 11342101  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11342100 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatgttttaagaaaatattttgggcggagtagaatcggtga 11342001  T
Q  200 aaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11342000 aaacgagttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagt 11341901  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341900 ccttggctacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaatttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 11341801  T
Q  400 ttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt- 498  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11341800 ttgga--ttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta 11341703  T
Q  499 ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| |||||||||||    
T  11341702 ttgaatatgatgtttatc 11341685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11913 - 11398
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11913 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 11814  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 11714  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11713 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 11614  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11613 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 11514  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11513 tggat-ttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 11415  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  11414 tgaatatgatgtttatc 11398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 18778705 - 18779200
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778705 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtagaacttttccaaacttgatattgggtttaat 18778804  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778805 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatt-gggaaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 18778903  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18778904 aacggattttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagtc 18779003  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779004 cttgactacatgattgattaagattgaattgtatgatttcaaatttgaataagttgactaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 18779103  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18779104 tgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 18779200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 22367194 - 22367690
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22367194 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataacttttcctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattggatttaat 22367293  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22367294 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcagtgaa 22367393  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  22367394 aacgggttttgagttaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagttatcctttgaactaatgtctaatagtttgtaggtggcttaagtc 22367493  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367494 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcacacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 22367593  T
Q  401 tgga-ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||  |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22367594 tggatttttttgtcagaaatgtttctttagcaaattgcctggtgagttattgcgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 22367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 22884006 - 22884518
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22884006 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaa 22884105  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  22884106 gtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagttgagtagaatcggtgaaaa 22884205  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  22884206 cgagttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaagtcct 22884305  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884306 tacctacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaatttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 22884405  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22884406 ga--ctttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 22884503  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  22884504 aatatgatgtttatc 22884518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25426187 - 25425693
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25426187 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 25426088  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426087 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 25425988  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  25425987 aacgggttttgagctaaatgtcgatttgtcttgg-gtttctcatacgaacttaagctatccttttaactaatttctaatagtttgtgagtggcttatgtc 25425889  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25425888 cttgactacgtgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctagctttaaaaattatcaatgttggccgtttgctatatgatt 25425789  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25425788 tggattttttgtcgaaaatgtttctttagccaaatgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 25425693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 21074308 - 21074782
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21074308 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 21074407  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21074408 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 21074507  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  21074508 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttgagtc 21074607  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21074608 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgatt 21074707  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtga 476  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  21074708 taga-tttttctcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactatgtga 21074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 496
Target Start/End: Original strand, 1220446 - 1220937
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220446 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 1220545  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  1220546 gtactcagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtggagtataatcggt-aaaa 1220644  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1220645 cgagttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctatcctttgaaataatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcct 1220744  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220745 tggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagatttaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 1220844  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1220845 ga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattttcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 1220937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 35791824 - 35792314
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35791824 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggatcttttccaaactt-atattgggtttaat 35791922  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35791923 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttcgaaaatattttgggcggagtcgaatcggtgaa 35792022  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  35792023 aacggattttgagctaaatgtcgctttgtcttggattttctcataagaacttaagctatcccttgaaataatttctaatagtttgtaagtgacttaagtc 35792122  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  35792123 cttggctacgtgattgattaagattgaattgtaggatttcatacttgaataagttgactaactttgaaaattatcaatgttggtc-attgccacatgatt 35792221  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35792222 tgga--ttttgtcggaaatatttc-ttagccaattgtcttgtgagttattctgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 35792314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 148 - 516
Target Start/End: Original strand, 29191481 - 29191849
Alignment:
Q  148 tgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||     
T  29191481 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggagaaaacgggtattgagctaaatgtggttttgtcttaggttttctcataca 29191580  T
Q  248 aacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttg 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  29191581 aacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttatgttcttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaactta 29191680  T
Q  348 aataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagtt 447  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  29191681 aataagttgtctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttgga-tttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagtt 29191779  T
Q  448 gttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29191780 attgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatc 29191849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 204 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23514160 - 23513870
Alignment:
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||    
T  23514160 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttgg-ttttctcatatgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatattttgtatgtggcttaagtcctt 23514062  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23514061 gactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttgg 23513962  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23513961 at-ttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 23513870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 1168894 - 1169118
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168894 aaattactacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagctgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 1168993  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1168994 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 1169093  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1169094 gggtttttagctaaaatgtcgtttt 1169118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23506510 - 23506296
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23506510 aaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 23506411  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23506410 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 23506311  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  23506310 gggttttgagttaaa 23506296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 27183271 - 27183495
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27183271 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagttgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 27183370  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27183371 ttacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagataaattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 27183470  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27183471 gggttttgagctaaaatgtcgtttt 27183495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 11212796 - 11212993
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11212796 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaaggaa 11212895  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11212896 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgaggatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaattggtgaaa 11212993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 310 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16535455 - 16535249
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16535455 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-ttt 16535357  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  16535356 tgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatga 16535257  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  16535256 tgtttatc 16535249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 310 - 516
Target Start/End: Original strand, 17472750 - 17472956
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17472750 atgattaattaagattgaattgtaggattttaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga-tttt 17472848  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  17472849 tgtcggaagtgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatga 17472948  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  17472949 tgtttatc 17472956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Original strand, 1169524 - 1169711
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1169524 atgatttattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttgga-tttt 1169622  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1169623 tgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 1169711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 310 - 496
Target Start/End: Original strand, 27184735 - 27184920
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27184735 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt-gaatttt 27184833  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27184834 tgtcggaaatgtttctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 27184920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19499438 - 19499272
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19499438 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 19499339  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19499338 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgcattggggaatgtgaatgtgttgatggttt 19499272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 43444108 - 43444274
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43444108 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 43444207  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43444208 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatttgttgatggttt 43444274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 21234455 - 21234707
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  21234455 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 21234554  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21234555 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 21234653  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21234654 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 21234707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 496
Target Start/End: Original strand, 25901269 - 25901531
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||||| ||| ||| || |  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  25901269 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagtttgtaagtggcctatgctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 25901368  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  25901369 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga-tttttggcggaaatgtttctttagcaa 25901467  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||| | || |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25901468 attgttttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 25901531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 310 - 496
Target Start/End: Original strand, 4200986 - 4201171
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4200986 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttgga-tttt 4201084  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4201085 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 4201171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23505880 - 23505705
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23505880 atgatttattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggacgtttgccacatgatttggat-ttt 23505782  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23505781 tgtcggaaatgtttcttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 23505705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37052136 - 37051961
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37052136 atgattgattaagattgaattgtgggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttt 37052038  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37052037 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 37051961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20615764 - 20615589
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| |||    
T  20615764 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgtgggccgtttactatatgatttggat-ttt 20615666  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20615665 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 20615589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 1169799 - 1169887
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169799 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 1169887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 17473026 - 17473114
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17473026 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttgtcatgagatgtt 17473114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 36990741 - 36990865
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36990741 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 36990840  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  36990841 gtatttagagggaataattgagtat 36990865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20711226 - 20711100
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20711226 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgact 20711128  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20711127 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 20711100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6455944 - 6455753
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  6455944 ttttctcacacgaacttaagctatactttgaactaatgtctagtagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtgag 6455845  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccg-tttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttta 428  Q
     ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  6455844 ttttcaaacttgaataagttaccttattttgaaaattatcaatgttggccgttttgccacttgatacgga--ttttgtcgaaaatgattcttta 6455753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35581347 - 35581224
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35581347 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 35581248  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  35581247 gta-ttagagggaataattgagtat 35581224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29913327 - 29913149
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29913327 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 29913228  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    | |    ||||||||||||||||| |   |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  29913227 tgtgaattttcaaacttgaataaggtattttattttggaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggatttt 29913149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24083370 - 24083193
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24083370 cttgggttttctcatacgaacttaagctat-acttgaactaatatttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 24083272  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    | |  | ||||||| |||||||||||  ||   |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  24083271 tgtgagttttcaaagttgaataagttatcttattttggaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggatttt 24083193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445099
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgtgatgtt 43445099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11583210 - 11582926
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11583210 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctctaaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tt 11583113  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--ttt 427  Q
    | || | |||| ||||||  |||||||| | |   ||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||  ||||||| |||||||||||  ||     
T  11583112 tgagagctttc-aacttgtctaagttgctttgtcgtgggaattatcaatattggtcgtttgccacttgatacgg--tttttgttggaaatgtttcctttg 11583016  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  11583015 aaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 11582926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 21933345 - 21933468
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21933345 aaattactacacaggggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 21933444  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||    
T  21933445 gta-ttagaggaaataattgagtat 21933468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 21939515 - 21939638
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21939515 aaattactacacaggggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 21939614  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||    
T  21939615 gta-ttagaggaaataattgagtat 21939638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 495
Target Start/End: Original strand, 109927 - 110189
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  109927 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactgatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tt 110024  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--ttt 427  Q
    | || | |||| || |||  |||||||| | |  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||||  ||     
T  110025 tgagagctttc-aatttgtctaagttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccatttgccacttgatacgg--cttttgtcggaaatgtttcatttg 110121  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    | |||||| |||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  110122 aaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgat 110189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 399
Target Start/End: Original strand, 23235380 - 23235542
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagga 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |     
T  23235380 tttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtgagt 23235479  T
Q  337 tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    || |||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23235480 ttccaaacttgaacaagatactttgctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgat 23235542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 9731748 - 9731895
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  9731748 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 9731846  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9731847 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 9731895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 24184283 - 24184408
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  24184283 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--ttttggtcggaaatgcttcttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 24184380  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24184381 aagtgaagttgtataaatgaatgcttgt 24184408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21832759 - 21832612
Alignment:
Q  234 gattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttta 333  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21832759 gattttctcatacgaacttattctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtg 21832660  T
Q  334 ggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgtt 381  Q
     | ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  21832659 agttttcaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattatcaatgtt 21832612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 406 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 28258656 - 28258545
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaat 504  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  28258656 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggat 28258557  T
Q  505 gtgatgtttatc 516  Q
     |||||||||||    
T  28258556 atgatgtttatc 28258545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23511134 - 23511048
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23511134 aaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttaatat 23511048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19873131 - 19872978
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  19873131 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtaag 19873032  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  19873031 ttttcaaacttgaataagttactttgctttgaaaaatatatatgttgaccgttt 19872978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32950203 - 32950134
Alignment:
Q  21 tcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32950203 tcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaactttttcaaacttgatat 32950134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11965313 - 11965153
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| |  |||| |    
T  11965313 cttgggttttgtcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttgagctcatgactacaagattgatttaatttgact 11965214  T
Q  330 ttt-aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11965213 tgtgagcttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 11965153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21393268 - 21393151
Alignment:
Q  380 ttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagt 479  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21393268 ttggccgtttgccacttggtatgg-tttttggtcggaattgtttcttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgt 21393170  T
Q  480 tgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  21393169 tgtatgaaagaatgattgt 21393151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 370 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19404672 - 19404546
Alignment:
Q  370 attatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |  |||  ||| |||||||||||| | || ||| |||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  19404672 attatcaatgtgggccgtttgccacttgatatag--tttgggtcagaaatgtttcttaaaccgattgtcttatgaattatcgagactattcttatatgac 19404575  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19404574 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 19404546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 487
Target Start/End: Original strand, 21223649 - 21223903
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||  |    
T  21223649 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattatatgattgattaagattg-tt 21223747  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatg-tttcttt 427  Q
    || || | ||| |||||| |    | | ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||   |||| ||||||||| || |||     
T  21223748 ttgagagtttttaaactttatattgctaccttgttttggaaattatcaatgttggccgcttgccacttgatatgg---ttttatcggaaatgattcctta 21223844  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 487  Q
    || ||||||||||||||  | |||||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  21223845 agtcaattatcttatgacct-ttgtgactagcttcatatgactaaatgaagatgtatgat 21223903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23493284 - 23493069
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23493284 ttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatatctaatagttttcaagtcgcttaagctcatgactacttgattgattaagattgtttt 23493185  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
     |  | |||||||||| |    ||| |||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||      
T  23493184 gtgagttttcaaactttatattgtttccttactttgagaaattatcgatgttggtcgtttgccacatggtatgga-taattgtcggaaatgattctttta 23493086  T
Q  428 agccaattatcttatga 444  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23493085 agccaattgtcttatga 23493069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37982670 - 37982582
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagat 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  37982670 ttttcttatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagat 37982582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 674
Target Start/End: Original strand, 35792419 - 35792496
Alignment:
Q  598 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcg-tagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35792419 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatggttatatgttggatatgataattgtcatgagatgtt 35792496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 519 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2030776 - 2030708
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-atatatatat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2030776 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatat 2030708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7424884 - 7424763
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  7424884 aaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatgttttctttataaaccgtgaaac-tttccaaacttggtaatggg-ttaat 7424787  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  7424786 gaggtaattagagtgaataattga 7424763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23328082 - 23327960
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  23328082 aaattaatacacatgagttatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaat 23327984  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  23327983 gaggtacttagagtgaataattga 23327960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 636
Target Start/End: Original strand, 24184498 - 24184549
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24184498 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 24184549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 10779585 - 10779635
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10779585 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 10779635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 11213008 - 11213058
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213008 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 11213058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11221 - 11172
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11221 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 1169947 - 1169996
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1169947 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 1169996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 1221137 - 1221186
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1221137 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 1221186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 9732072 - 9732121
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9732072 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 9732121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11582749 - 11582700
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11582749 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 11582700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16535180 - 16535131
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16535180 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 16535131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 22367890 - 22367939
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22367890 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 22367939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22881706 - 22881618
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22881706 ttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtttaatagtttg-tagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagatt 22881618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25425492 - 25425443
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25425492 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 25425443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 29192026 - 29192075
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29192026 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 29192075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 34938386 - 34938329
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34938386 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 34938329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673140
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3673236 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatggttagtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 3673140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 5451735 - 5451831
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5451735 cttgggttttatcatacgaacttaagcaattctttgaactaatgtttaatggtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 5451831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 5622363 - 5622518
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| | ||   || |||||||| | | ||||||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || |  |    
T  5622363 ttttctcatacgaacttaggataatcttcgaactaatgtttcatagttcttaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatttatttgtgag 5622462  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgcc 392  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5622463 ttttcaaacttgaataagttaccttgttttg-aaactatcaatgttggccgtttgcc 5622518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19861445 - 19861366
Alignment:
Q  247 gaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||    
T  19861445 gaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttacgttcatgaccacatgattgattaagattg 19861366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Original strand, 21652474 - 21652618
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||| |||||     
T  21652474 tcaatgttggtcggtggccacttgatatgg-tttttggtcgaaaatgttccttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaa 21652572  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgatt---gtttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     |||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  21652573 agaagttgtatgaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatc 21652618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Original strand, 26560720 - 26560882
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || |||||||| | | |||||| | ||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| || |  |    
T  26560720 ttttctcatacgaacttaggctaatcttcgaactaatgtttgatagttagtaagtgacttaagctcatgattacatgattgattaagattgacttgtgag 26560819  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26560820 ttttcaaacttgaataagtcaccttgttttg-aaactatcaatgttggtcgtttgccacttgat 26560882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 7424550 - 7424508
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7424550 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 7424508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23454052 - 23453920
Alignment:
Q  363 tttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattc 460  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| |||||   || ||||   ||||||| || ||| || |||||    
T  23454052 tttggaaattatcaaggttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattc 23453956  T
Q  461 ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23453955 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 23453920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23465557 - 23465425
Alignment:
Q  363 tttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattc 460  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| |||||   || ||||   ||||||| || ||| || |||||    
T  23465557 tttggaaattatcaaggttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattc 23465461  T
Q  461 ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23465460 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 23465425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11341509 - 11341460
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11341509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 11341460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 21074895 - 21074944
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21074895 tgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 21074944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21393063 - 21393014
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21393063 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 21393014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21649856 - 21649795
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21649856 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgt 21649795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 25003812 - 25003755
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25003812 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttgttatgatatggtgggtgaata 25003755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 25192402 - 25192451
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25192402 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatg 25192451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 29191413 - 29191470
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29191413 aaggtgatgatattggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaata 29191470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 421 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 23511028 - 23510932
Alignment:
Q  421 tttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  23511028 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattggatatgatgtttatc 23510932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 4864142 - 4864099
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4864142 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 4864099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16104818 - 16104759
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggctt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  16104818 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggctt 16104759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 393
Target Start/End: Original strand, 16836310 - 16836393
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgcca 393  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16836310 atgatcgattaagattgaatggtaggtttccaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattatcaatgttgatcgtttgcca 16836393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 19404456 - 19404413
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19404456 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 19404413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21649704 - 21649661
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21649704 tgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgt 21649661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 635
Target Start/End: Original strand, 21652690 - 21652737
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21652690 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 21652737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25004167 - 25004072
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||  || | ||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25004167 cttgggttttctcatatgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgttagtgacttaagattatgactacatgattgattaagatt 25004072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28901294 - 28901211
Alignment:
Q  243 atacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28901294 atacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaattgtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaatattg 28901211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28937689 - 28937606
Alignment:
Q  243 atacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28937689 atacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaattgtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaatattg 28937606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 630
Target Start/End: Original strand, 11338154 - 11338196
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11338154 atgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgta 11338196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 20711011 - 20710962
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20711011 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatga 20710962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 23327824 - 23327774
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23327824 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 23327774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 4201371 - 4201420
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4201371 tgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 4201420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 629 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 19498877 - 19498832
Alignment:
Q  629 tatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498877 tatgatgaattgtagatgttgaatatgatgtttatcatgagatgtt 19498832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7727738 - 7727642
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||    
T  7727738 cttgggttttatcatacgatcttaagctattctttgaattaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcttggttacatggttgattaagattg 7727642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24595629 - 24595507
Alignment:
Q  5 aattattacacattggtcatgtggatt-tttgtgaaaacttatcataact-ttttcttta--agccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||  | |||||  ||||||||||||||  || |||||| |||    
T  24595629 aattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttgtcataaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatgggtt-aat 24595531  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24595530 gaggtacttagagtgaataattga 24595507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 431536 - 431478
Alignment:
Q  368 aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt 427  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  431536 aaattatcgatgttggccgtttgccacatgattt-gaatttttgtcgaaaatgattcttt 431478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 27185119 - 27185162
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27185119 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 27185162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19498659 - 19498621
Alignment:
Q  597 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19498659 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 19498621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24595372 - 24595322
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24595372 tgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 24595322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 37010572 - 37010621
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37010572 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 37010621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 110388 - 110437
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  110388 tgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatg 110437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21616255 - 21616162
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaaga 323  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || | |||  ||||||||||||||||    
T  21616255 cttgggttttcttatgtgaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttacgttcatgatcacatgattgattaaga 21616162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24474663 - 24474543
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||  ||| ||||||| | |||||| | ||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  24474663 tcaaggttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaag 24474565  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  24474564 tgaagttgtatgaatgaatgat 24474543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 498
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338061
Alignment:
Q  458 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgt 11338061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Original strand, 18779399 - 18779435
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18779399 tgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatg 18779435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4864268 - 4864229
Alignment:
Q  461 ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4864268 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 4864229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 22884586 - 22884629
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22884586 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 22884629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 4201280 - 4201310
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201280 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 4201310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 7424642 - 7424612
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7424642 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 7424612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 18779307 - 18779337
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18779307 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 18779337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 21933568 - 21933617
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21933568 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 21933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 21939738 - 21939787
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21939738 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 21939787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 23112296 - 23112354
Alignment:
Q  519 aaggtgatgatt-ttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23112296 aaggtgatgataattggtgaatacatctacattgtttattatgatatggtgggtgaata 23112354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 23513671 - 23513637
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatca 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23513671 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatca 23513637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 27185029 - 27185059
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185029 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 27185059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Original strand, 32967173 - 32967263
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatt-tctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| | ||||||||| | |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  32967173 tttctcatacgaacttaagttattctttggactaaatgtctaatagtctacaagtggcttaagctcatgactgcatgattgattaaaattg 32967263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 35581124 - 35581075
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  35581124 tgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 35581075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 625
Target Start/End: Original strand, 17473177 - 17473214
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17473177 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttg 17473214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 21234811 - 21234860
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  21234811 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 21234860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 595 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20615476 - 20615436
Alignment:
Q  595 atgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  20615476 atgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatg 20615436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 23112210 - 23112238
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23112210 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 23112238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 23985523 - 23985551
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23985523 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 23985551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 29191327 - 29191355
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191327 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 29191355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 34938472 - 34938444
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34938472 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 34938444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 1966 - 1454
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1966 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaa 1867  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1866 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 1767  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1766 gggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaacttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 1667  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1666 gactacatgattgattaatattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggctgtttgccacatgatttgg 1567  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 502  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1566 at-ttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattga 1468  T
Q  503 atgtgatgtttatc 516  Q
    || |||||||||||    
T  1467 atatgatgtttatc 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1297
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatgaattgtagatgttgaatataatatttatcatgagatgtt 1297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6322 - 6196
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||| | | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  6322 ttatccatgttggctggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 6224  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  6223 aagtgaagttgtatgaataaatgattgt 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 1189
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1238 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 6105 - 6062
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6105 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15785 - 15294
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15785 aaattaatacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 15686  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15685 gtacttagaatgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 15586  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||     
T  15585 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtgagtggcttaagtccta 15486  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15485 gactacatgattgattaaggttgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgaattgg 15386  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15385 a-tttttgtcggaaatgtttcttttgccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 15294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 93 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1038
Alignment:
Q  93 ggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaa 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1440 ggtttaatgaagtacttagaatgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaa 1341  T
Q  193 tcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaagggg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  1340 tcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtgagtgg 1241  T
Q  293 cttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgcc 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1240 cttaagtcctagactacatgattgattaaggttgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgcc 1141  T
Q  393 acatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1140 acatgaattgga-tttttgtcggaaatgtttcttttgccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagt 1042  T
Q  493 gatt 496  Q
    ||||    
T  1041 gatt 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 310 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12201 - 12021
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12201 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaa-cttgaatgagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-ttt 12104  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12103 tgtcggaaatgtttcttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 929 - 899
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  929 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 15185 - 15155
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 15155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 130)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 16826467 - 16826962
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16826467 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaaattgtgtttaat 16826566  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16826567 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaatgtgaatgtattgatggtttaagaaatattttgggcggagtttaatcggtgaa 16826666  T
Q  201 aacgggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16826667 aacgggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttttaatagtttgcaagtggcttaagt 16826766  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16826767 acttgactacatgattgattaagattgaattataagacttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttttcacatgat 16826866  T
Q  400 ttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16826867 ttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 16826962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25175122 - 25174607
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25175122 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 25175023  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175022 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 25174923  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25174922 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttcttatacgaacttgagctaccctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 25174823  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25174822 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 25174723  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25174722 tggat-ttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 25174624  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25174623 tgaatatgatgtttatc 25174607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 27654696 - 27655211
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27654696 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 27654795  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27654796 gaagtacttagagtgaataatttagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 27654895  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27654896 aatgggttttgagctaaatgttgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctaccctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 27654995  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27654996 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 27655095  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27655096 tgga-tttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 27655194  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27655195 tgaatatgatgtttatc 27655211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25904481 - 25903975
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25904481 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataattttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttagtgaa 25904382  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25904381 gaacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggaggagttgaatcggtgaaaac 25904282  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25904281 gggttttgagttaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 25904182  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25904181 gactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttacctaagtttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt-g 25904083  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 502  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25904082 aatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattga 25903983  T
Q  503 atgtgatg 510  Q
    || |||||    
T  25903982 atatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19628883 - 19628381
Alignment:
Q  11 tacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtactta 110  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19628883 tacacatgggtcatgttgatttttgggaaaacttaacataactttttctatgagccgtgagacttttccaaacttggtattgggtttaatgaagtactta 19628784  T
Q  111 gagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggtttt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628783 gagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggtttt 19628684  T
Q  211 gagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactaca 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19628683 gagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaacttctaatagtttgcaagtggcttaagtccttgactaca 19628584  T
Q  311 tgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19628583 tgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatga-ttgga-ttttt 19628486  T
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtttgaatgtgatg 510  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||  ||||||| |||||    
T  19628485 gtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttgaatgagtg-attatattttgaatatgatg 19628387  T
Q  511 tttatc 516  Q
    ||||||    
T  19628386 tttatc 19628381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 33315178 - 33315692
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  33315178 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgataatgggtt-aatgag 33315276  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgg-gaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33315277 gtacttaaagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgagaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggcggggttgaatcggtgaaaa 33315376  T
Q  203 cgggttttgagctaaa-tgtcgttttgtcttggatttt-ctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33315377 cgggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttggatttttctcatatgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 33315476  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33315477 cttgactacatgattgattaaggttgaattgtaggatttcaaacttaaataagttacctagctttaaaaattatcaatgttagccgtttgccacatgatt 33315576  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33315577 tgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 33315675  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  33315676 tgaatatgatgtttatc 33315692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1555537 - 1555212
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1555537 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaat 1555438  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1555437 gaattacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 1555338  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1555337 aacgggttttgagctaaatgtcattttgtcttgtattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaagtc 1555238  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  1555237 cttgactatatgattgattaagattg 1555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 148 - 498
Target Start/End: Original strand, 14627347 - 14627699
Alignment:
Q  148 tgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14627347 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagtttaatcggtgaaaacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttgggttt-ctcatacg 14627445  T
Q  248 aacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttg 347  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14627446 aacttaagctatccttcgaattaatttctaatagtttgtaagtggcttatgtccttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttg 14627545  T
Q  348 aataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaa----ttatcttatg 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||    
T  14627546 aataagttgtctagctttgaaaattatcaatgttggccatttgccacgtgatttgga-tttttgacggaaatgtttctttagccaaatatttgtcttgtg 14627644  T
Q  444 agttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14627645 agttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt 14627699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23153042 - 23152819
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23153042 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtttaatgaa 23152943  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23152942 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtg-aaac 23152844  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  23152843 gggttttgagctaaaatgtcgtttt 23152819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 35016106 - 35016330
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35016106 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttctaaacttgatattgagtttaatgaa 35016205  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35016206 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaattggtgaaaac 35016305  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  35016306 gggttttcagctaaaatgtcgtttt 35016330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 22593684 - 22593890
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593684 aaattactacacatgggtcatgtgaaattttgtgaaaaattatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 22593783  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  || |||||||||||||||     
T  22593784 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatgttttgggtagaattgaatcggtgaaaat 22593883  T
Q  204 gggtttt 210  Q
    |||||||    
T  22593884 gggtttt 22593890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Original strand, 35016692 - 35016879
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35016692 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccatttgccacatgatttgga-tttt 35016790  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35016791 tgttggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 35016879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 21776195 - 21776361
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21776195 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 21776294  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776295 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgcattggggaatgtgaatgtgttgatggttt 21776361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16240303 - 16240140
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16240303 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttatctatgagccgtgaaacatttccaaacttgatattgagtttaatgaa 16240204  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240203 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 16240140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23152413 - 23152226
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23152413 atgattgattaagattgaattgtaggatttaaaacttgaataagttgactagctttaaaaataatcaatgatggccgtttgccacatgatttaga-tttt 23152315  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23152314 tgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgt 23152226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 519 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 1554950 - 1554778
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-----------------atatatatatgatgttgaatgacat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||    
T  1554950 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatatatatatatatatatatgatgttgaatgacat 1554851  T
Q  602 tgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554850 tgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 1554778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 16633603 - 16633727
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  16633603 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgag 16633702  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16633703 gtacttagagtgaataattgagtat 16633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 16650277 - 16650401
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  16650277 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgag 16650376  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16650377 gtacttagagtgaataattgagtat 16650401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 22226672 - 22226796
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |     
T  22226672 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaacaag 22226771  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22226772 gtacttagagtgaataattgagtat 22226796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 16557047 - 16557171
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16557047 aaattactacacatgggtcatgtgaanttttgtgaaaacttattatacttttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaa 16557146  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16557147 gtacttagagtgaataattgagtat 16557171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Original strand, 18824482 - 18824766
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  18824482 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagctcaagactacatgattgattaagattg--tt 18824579  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag- 429  Q
    | ||   ||  ||| ||  |||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||| || |     
T  18824580 tgagagcttttaacatgtctaagttgctttgtcttggaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttga 18824677  T
Q  430 -ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     |||||| |||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18824678 accaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 18824766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22847382 - 22847120
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  22847382 cttgggttttctcatacgaacttaagctataatttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgtttaagatt--at 22847285  T
Q  330 tttagga--tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatg--tttct 425  Q
    |||  ||  |||||| |||||||| ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||| |||| ||||  | |||    
T  22847284 tttgtgaattttcaaccttgaatatgttaccttgttttgggaattattaatgttggccgtttgccacttgatataga--ttttatcgggaatggttctct 22847187  T
Q  426 ttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    | |||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  22847186 taagccaattatcttatgatctttcgtgactaaacttatatgactaaatgaagatgtttgaatgaat 22847120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 17014592 - 17014745
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||| | | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17014592 ttttctcagacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaaaagttcgtaggtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatggaattgtagg 17014691  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014692 gtttaaaacttgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 17014745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 18630562 - 18630715
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  18630562 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttctgag 18630661  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18630662 ttttcaaactcgaataagttgtcttattttggaaattatcaatgttggccgttt 18630715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10487978 - 10487854
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10487978 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 10487879  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  10487878 gtatttagagggaataattgagtat 10487854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 16377350 - 16377473
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16377350 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 16377449  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  16377450 gta-ttaaagggaataattgagtat 16377473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 16384674 - 16384797
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16384674 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 16384773  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||    
T  16384774 gta-ttaaagggaataattgagtat 16384797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19671634 - 19671494
Alignment:
Q  245 acgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaac 344  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  19671634 acgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatggagttgtaggttttaaaac 19671535  T
Q  345 ttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19671534 ttgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgttggcc 19671494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18582504 - 18582257
Alignment:
Q  244 tacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-gatttcaa 342  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||| || | ||||||    
T  18582504 tacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaataatttgtaagtggcttaagctcatgactacaagattgattaagattg--tttgagagctttcaa 18582407  T
Q  343 acttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag--ccaattatctt 440  Q
     ||||  |||||||| | |  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||    
T  18582406 -cttgtctaagttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg--tttttgtcggaaaagtttcttttgaaccaattttctt 18582310  T
Q  441 atgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  18582309 atgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 18582257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19853450 - 19853292
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||   |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19853450 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttggactaatgcttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 19853351  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19853350 tgttagttttcaaacttgaataagtt-ccttgttttgaaaagtatcaatgttggccgttt 19853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14449691 - 14449531
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14449691 ttgggttttctcatacgaacttaagctaacctttgaactaatgtttagtagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgcttgattaagatggaatt 14449592  T
Q  331 ttaggattt--caaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14449591 gtaggttttaaaaaacttgaataagttacctagctttgaaaactatctatgttggccgttt 14449531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 372 - 516
Target Start/End: Original strand, 25645900 - 25646044
Alignment:
Q  372 tatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgacta 471  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||    
T  25645900 tatcaatgttggccagtggccacttgatatgg-tgtttggtcggaaatgtttctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttacta 25645998  T
Q  472 agtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25645999 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 25646044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18776303 - 18776177
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  18776303 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggttggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgact 18776205  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18776204 aagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 18776177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4990234 - 4989950
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||   ||    
T  4990234 ttgggttttctcatacgaacttaagttattctttgaactgatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacattattgattaagattt--tt 4990137  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag 429  Q
    | || | ||||||  |||  |||||||| | |  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||| || |    
T  4990136 tgagagctttcaat-ttgtctaagttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccttttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttg 4990040  T
Q  430 --ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
      |||||| |||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4990039 aaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 4989950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16230782 - 16230635
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  16230782 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 16230684  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16230683 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 16230635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22431307 - 22431215
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22431307 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 22431215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 442
Target Start/End: Original strand, 16888671 - 16888882
Alignment:
Q  229 tcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaa 328  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  16888671 tcttgggttttctcatacagacttaagctaatctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttattgactacatgattgattaagattg-- 16888768  T
Q  329 ttttagga--tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgt-ttct 425  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||  ||||  |||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| ||||  || ||||||| | ||    
T  16888769 ttttaggagttttcaaacttggataagttgttta-ttttgggaattatcaatgttgaccgtttatcacttgaattggactttt--tcagaaatgtctcct 16888865  T
Q  426 ttagccaattatcttat 442  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16888866 ttaaccaattatcttat 16888882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 406 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18569647 - 18569555
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569647 ttttggtcggaaatctttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 18569555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19609587 - 19609465
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  19609587 aaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatgttttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttggtaatggg-ttaat 19609489  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  19609488 gaggtacttagagtgaataattga 19609465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Original strand, 18840337 - 18840621
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18840337 ttgggttttctcataagaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tt 18840434  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatg-tttcttt-a 428  Q
    | ||   ||  ||| ||  |||||||| | |  ||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  18840435 tgagagcttttaacatgtctaagttgctttgtcttggaatttatcaatgttggtcgtttgccacttgatacgg--tttttgtcgaaaatgttttctttga 18840532  T
Q  429 gccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     | |||| |||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18840533 actaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 18840621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 19984221 - 19984306
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19984221 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaagttatcataactttttctatgagccgt-gaacttttccaaacttgatat 19984306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16105650 - 16105540
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  16105650 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatatggatttg--gtcgaaaatgtttcttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgact 16105553  T
Q  471 aagtgaagttgta 483  Q
    |||||||||||||    
T  16105552 aagtgaagttgta 16105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 496
Target Start/End: Original strand, 25368284 - 25368540
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-g 335  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||  | ||  ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||  | | || |    
T  25368284 tttctcatacgaacttaagctattctttggactaatgtctaatagtccgtaattggcttaagctcatgactacataattgattaagattg--tctgagag 25368381  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaat 434  Q
     | |||| ||||  || | ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | ||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  25368382 ctatcaa-cttgtctatgctgctttgtcttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tatttatcggaaatgttcctttgagtcaat 25368478  T
Q  435 tatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
       ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25368479 cgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 25368540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 32897816 - 32897670
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  32897816 ttatcaatgttggtcggttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgac 32897718  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  32897717 taagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 32897670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 389
Target Start/End: Original strand, 11373671 - 11373825
Alignment:
Q  235 attttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag 334  Q
    ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| || |      
T  11373671 attttctcatacgaacttaggttaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgatatattaagattgatttgtga 11373770  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11373771 gtttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 11373825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16085170 - 16085026
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  16085170 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatatgga--tttggtcgaaaatgtttcttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgact 16085073  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatctt 518  Q
    ||||  |||||||||| |  | |||||| ||| || |||||||||||||    
T  16085072 aagt--agttgtatgaatagaagattgtattggatatgatgtttatctt 16085026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Original strand, 33539323 - 33539481
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  33539323 ttgggttttctaatatgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaaatggcttaagctcatgactacatgattgattagtattgattt 33539422  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |  | |||||||||||||||||||| ||   |||  ||||||||||||||||||||||    
T  33539423 atgagttttcaaacttgaataagttgtcttattttagaaattatcaatgttggccgttt 33539481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29604761 - 29604636
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||| | |    
T  29604761 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtgacttaagctcatgattacatgattgattaagatttatt 29604662  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagtt 355  Q
    |    | |||||||||||||||||||    
T  29604661 tgcgagttttcaaacttgaataagtt 29604636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 406 - 498
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016001
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13015910 ttttggtcggaaatgtttcttaaaccaattgtcttatgaattgttatga-tattcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 13016001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18431691 - 18431599
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattg 497  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18431691 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatgaaagaatgattg 18431599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Original strand, 29870520 - 29870626
Alignment:
Q  20 gtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29870520 gtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtga 29870618  T
Q  117 ataattga 124  Q
    ||||||||    
T  29870619 ataattga 29870626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 18003996 - 18004081
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18003996 aattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 18004081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25918917 - 25918822
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  25918917 cttgggttttcttatacggacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatt 25918822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26506207 - 26506128
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26506207 atgattgattaagattgaattgtaggttttcaaacttggataagttacttggctttgaaaagtgtcaatgttggccgttt 26506128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 31468561 - 31468640
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468561 atgattaattaagatcgagttgtaggttttcaaacttgaacaagttacttagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 31468640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 14627896 - 14627946
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14627896 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 14627946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18398152 - 18397894
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-g 335  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||| |||||||||   |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| || |    
T  18398152 tttctcatacgaacttaaattattctttggactaatgtctaatagtccacaagtggtttaagttcatgactacatgattgattaagattg--tttgagag 18398055  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaat-gtttcttt-agccaa 433  Q
     |||| ||||||  || |||| || | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||   | |   ||| |||||||| |||||||| || |||    
T  18398054 ctttc-aacttgtctatgttg-cttgttttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgaa--ctttatcggaaatggtttctttaagtcaa 18397959  T
Q  434 ttatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    || ||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18397958 ttgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt 18397894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 222057 - 222000
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  222057 aaggtgatgatgttggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 222000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 15736141 - 15736289
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || |||| ||| ||||  ||||||     
T  15736141 aattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggctttta-gtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatata 15736239  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15736240 actaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 15736289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15736467 - 15736516
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15736467 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 15736516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16230458 - 16230409
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16230458 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 16230409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 18004259 - 18004308
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18004259 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 18004308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Original strand, 18087845 - 18087906
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18087845 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 18087906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 19984337 - 19984422
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19984337 aattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 19984422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23976445 - 23976396
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23976445 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 23976396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25174430 - 25174381
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25174430 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 25174381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26088894 - 26088833
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26088894 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 26088833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 27655373 - 27655422
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27655373 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 27655422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 18382614 - 18382710
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  18382614 cttgggttttatcatacgaacttaagttatgctttgaactaatgtctaacagtttgtaagtggcttaagctctcgattacatgattgattaagattg 18382710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 17084324 - 17084403
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  17084324 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgacttcatgatt 17084403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 22594316 - 22594395
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22594316 atgattgattaagattgaattgtaggttttcatacttggataagttactgtgctttgaaaagtatcaatgttggccgttt 22594395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 25745618 - 25745661
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25745618 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 25745661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29665362 - 29665295
Alignment:
Q  23 atgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29665362 atgtggattttcgtgaaaacttaccgtaactttttctttgagccgtgaaacctttccaaacttgatat 29665295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 494
Target Start/End: Original strand, 13622075 - 13622197
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||  | || ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||   ||||| |||||| |||||    
T  13622075 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg--tcttggtcggaaatgttt-ttgagccaattgtcttgtgagttacggtgaccattcttgtatga 13622171  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatga 494  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  13622172 ctaagtgaagttgtatgaatgaatga 13622197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 18569464 - 18569414
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18569464 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 18569414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23976601 - 23976535
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23976601 aattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgt 23976535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 389
Target Start/End: Original strand, 29161334 - 29161412
Alignment:
Q  311 tgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29161334 tgattgattaagattgatttgtgagttttaaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 29161412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 14627279 - 14627336
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14627279 aaggtgatgatattggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaata 14627336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 16827162 - 16827211
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16827162 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 16827211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18431511 - 18431462
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18431511 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 18431462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 27739947 - 27739890
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27739947 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattataatatggtgggtgaata 27739890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 399
Target Start/End: Original strand, 22463107 - 22463199
Alignment:
Q  307 tacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22463107 tacatgattgattaaaattgaatggtaggtttcgaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattattaatgttggtcgtttgccacttgat 22463199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Original strand, 25745406 - 25745529
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||| | | || |||||||   |||||| ||||||    
T  25745406 tcaatgttggccgatggccacttgatatgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaag 25745504  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  25745505 tgaagttgtatgaacgaatgattgt 25745529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 15005869 - 15005948
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15005869 atgattgattaagatggaattgtaagttttgaaattcgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgctgaccgttt 15005948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23152137 - 23152094
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23152137 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 23152094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 31627316 - 31627273
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31627316 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 31627273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 35016967 - 35017010
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35016967 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 35017010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 1651237 - 1651287
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1651237 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 1651287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 19984491 - 19984541
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19984491 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 19984541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 32897601 - 32897551
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  32897601 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatga 32897551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33324008 - 33323914
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||    ||| |||||||||||||| ||||    
T  33324008 ttgggttttctcatacggacttaagctatactttgaaccaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagcttatgattacatgattgattaggatt 33323914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4989773 - 4989724
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4989773 tgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatg 4989724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 18088003 - 18088040
Alignment:
Q  591 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18088003 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 18088040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 18825047 - 18825096
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18825047 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatg 18825096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 629 - 674
Target Start/End: Original strand, 21776769 - 21776814
Alignment:
Q  629 tatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21776769 tatgatgaattgtagatgttgaatatgatgtttatcatgagatgtt 21776814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 25646113 - 25646162
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25646113 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 25646162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 35010543 - 35010600
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  35010543 aaggtaatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgagtgaata 35010600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Original strand, 35136923 - 35137012
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgatta 320  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    ||| ||||||||||||||    
T  35136923 ttgggttttctcacacggacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagcttatgattacatgattgatta 35137012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16084959 - 16084923
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16084959 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 16084923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16105437 - 16105401
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105437 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 16105401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32351347 - 32351192
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || |||||||| | | |||||| | ||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  32351347 ttttctcatacgaacttaggctaatcttcgaactaatgtttgatagttcgtaagtggctcaagctcatgactacatgattgattaagattgacttgtgag 32351248  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgcc 392  Q
      | |||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  32351247 tctccaaacttgaataagttaccttgttttg-aaactatcaatgttggtcgtctgcc 32351192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 18776086 - 18776043
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18776086 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 18776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10487753 - 10487704
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10487753 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 10487704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16377574 - 16377623
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16377574 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 16377623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16384898 - 16384947
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16384898 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 16384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26088712 - 26088662
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26088712 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 26088662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22867169 - 22867124
Alignment:
Q  453 gactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22867169 gactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgt 22867124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Original strand, 28195717 - 28195802
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||| |  | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  28195717 tcatacgaacttaagctattctttggattaatgtctaatattccgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 28195802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 33315868 - 33315917
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33315868 tgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatg 33315917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 325
Target Start/End: Original strand, 17790405 - 17790453
Alignment:
Q  277 aatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17790405 aatagtttgtaagtggcttaagttattgactacatgattgattaagatt 17790453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21622379 - 21622283
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| | ||||| |||| |||   ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21622379 cttgggttttatcattcgaacttaagctagtctttgaactaatgtttaatattttgtaagcatcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 21622283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 1658997 - 1659040
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1658997 tgatgttgaataacattgttgattattgatgaccatgttgatgt 1659040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22431126 - 22431083
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22431126 tgatgtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 22431083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 486
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28195959
Alignment:
Q  451 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatga 28195959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 29870761 - 29870804
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29870761 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgt 29870804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 674
Target Start/End: Original strand, 35137174 - 35137217
Alignment:
Q  631 tgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35137174 tgatgaattgtagatgttgaatatgatacttatcctgagatgtt 35137217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16557302 - 16557352
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  16557302 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 16557352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16650532 - 16650582
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  16650532 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 16650582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 19609344 - 19609314
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609344 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 19609314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 628
Target Start/End: Original strand, 28196068 - 28196106
Alignment:
Q  590 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196068 gttgaataatattgttgattattgataatcatgttgatg 28196106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 33315777 - 33315807
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33315777 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 33315807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34966103 - 34966025
Alignment:
Q  313 attgattaagattgaatttt-aggatttcaaacttgaataagttgcc-tagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  34966103 attgattaagattgatttgtgagtttttcaaacttgaataagttaccttttttttgaaaattatcaatgttggccgttt 34966025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 18397803 - 18397762
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18397803 atgttgaatgacattgttgagtattgatgatcatattgatgt 18397762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 18843107 - 18843156
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18843107 tgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatg 18843156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 527
Target Start/End: Original strand, 35010456 - 35010485
Alignment:
Q  498 tttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35010456 tttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 35010485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 222144 - 222116
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  222144 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 222116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 940139 - 940175
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  940139 tttgaactaatgtctaatagtttgcaagtggcttaag 940175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 646 - 674
Target Start/End: Original strand, 16827073 - 16827101
Alignment:
Q  646 gttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827073 gttgaatatgatatttatcatgagatgtt 16827101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 588 - 628
Target Start/End: Original strand, 25368636 - 25368676
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25368636 atgttgaatgatattgttgattattaatgatcatgttgatg 25368676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 627 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 31627364 - 31627320
Alignment:
Q  627 tgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagat 671  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  31627364 tgtatgatgaaccgtagatattgaatatgatatttgtcattagat 31627320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 137)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 32495155 - 32495644
Alignment:
Q  6 attattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagt 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32495155 attactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaatttgatattaggtttaatgaagt 32495254  T
Q  106 acttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495255 acttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgg 32495354  T
Q  206 gttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32495355 gttttgagctaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtccttga 32495454  T
Q  306 ctacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32495455 ctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataatttacctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga- 32495553  T
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32495554 tttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 32495644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 15951693 - 15952208
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951693 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 15951792  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951793 gaggtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatgggttgagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 15951892  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15951893 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaaattaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 15951992  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15951993 cttggctacatgattgatcaaaattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatt 15952092  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |    
T  15952093 tgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtat 15952191  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15952192 tgaatatgatgtttatc 15952208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16418028 - 16417516
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16418028 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 16417929  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16417928 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 16417829  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  16417828 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttgagtc 16417729  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16417728 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaagcttaaataagttg---tgctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 16417632  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16417631 tgga-tttttgttggaaatgtttcttaagcaagttgtcttgtgggttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 16417533  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16417532 tgaatatgatgtttatc 16417516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 15760838 - 15761163
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15760838 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaat 15760937  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760938 gaattacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 15761037  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15761038 aacgggttttgagctaaatgtcattttgtcttgtattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaagtc 15761137  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  15761138 cttgactatatgattgattaagattg 15761163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10001084 - 10001318
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10001084 attaagttactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 10001183  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10001184 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 10001283  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttgga 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10001284 aacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttgga 10001318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11286983 - 11286760
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11286983 aaattactacacatggatcatgtagatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccatggaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaa 11286884  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  11286883 gtacttagagtgtataatttagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtgaaattgaat-ggtgaaaac 11286785  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  11286784 gggttttgagctaaaatgtcgtttt 11286760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 310 - 496
Target Start/End: Original strand, 13912017 - 13912202
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13912017 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttt 13912115  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13912116 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 13912202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 15442492 - 15442744
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  15442492 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 15442591  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15442592 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 15442690  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15442691 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 15442744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 30263057 - 30263309
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  30263057 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 30263156  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30263157 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 30263255  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30263256 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 30263309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 7292111 - 7291926
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7292111 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-ttt 7292013  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||| |||||| | |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7292012 tgtcggaaatgtt--ttgagccaattgtcttgtgagttatggtgaccgttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgt 7291926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15851986 - 15851840
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15851986 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaat 15851887  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15851886 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 15851840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 312 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11515484 - 11515302
Alignment:
Q  312 gattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttg 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11515484 gattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttgaaa-ttatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggattttt-g 11515387  T
Q  412 tcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11515386 tcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 11515302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 336 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15851450 - 15851270
Alignment:
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaatt 435  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15851450 atttcaaactgaaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggctgtttgccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttaacaaatt 15851352  T
Q  436 atcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15851351 gtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatc 15851270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 519 - 674
Target Start/End: Original strand, 15761425 - 15761597
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-----------------atatatatatgatgttgaatgacat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||    
T  15761425 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatatatatatatatatatatgatgttgaatgacat 15761524  T
Q  602 tgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15761525 tgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 15761597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 12753970 - 12753826
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12753970 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatatga--ttttggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgact 12753873  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12753872 aagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttatc 12753826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4484087 - 4483919
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4484087 ttggattttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtgggttaagctcatgactacatgattgattaagattgattt 4483988  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     || | |||||||||| |||||||| |||   ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  4483987 gtaagctttcaaactttaataagttaccttattttgagaattataaatgttggcagtttgccacttgat 4483919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 27102614 - 27102738
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27102614 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 27102713  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  27102714 gtatttagagggaataattgagtat 27102738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 27109962 - 27110086
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27109962 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 27110061  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  27110062 gtatttagagggaataattgagtat 27110086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27175712 - 27175588
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27175712 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 27175613  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  27175612 gtatttagagggaataattgagtat 27175588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 38784706 - 38784830
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38784706 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 38784805  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  38784806 gtatttagagggaataattgagtat 38784830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7822020 - 7821896
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  7822020 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatacttggcttaatgaa 7821921  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  7821920 gtatttagagggaataattgagtat 7821896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7829331 - 7829207
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  7829331 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatacttggcttaatgaa 7829232  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  7829231 gtatttagagggaataattgagtat 7829207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3894185 - 3894059
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  3894185 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 3894087  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3894086 aagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 3894059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 12544787 - 12544913
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12544787 ttatcaatgttggtcggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgact 12544885  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12544886 aggtgaagttgtattattgaatgattgt 12544913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28389614 - 28389456
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||   |||||| | | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28389614 ttgggttttctcacacgaacttaagctaatctttgaactaatgcttaatagctcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatgtagtt 28389515  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389514 gtaggttttaaaacttgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 28389456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 1937889 - 1937978
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 93  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937889 aaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 1937978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 493
Target Start/End: Original strand, 10861777 - 10862036
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||   || | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10861777 ttgggttttcttatacgaacttaagctaatcttcggactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tt 10861874  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-ag 429  Q
    | |||  ||| ||||||  || ||||| | |  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |  |||||||||||||| |||| ||    
T  10861875 tgagggcttccaacttgtctatgttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tacttgtcggaaatgttcctttgag 10861972  T
Q  430 ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
     ||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  10861973 tcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 10862036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11286445 - 11286177
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  11286445 cttgggttttgtcatacgaacttaagttattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgt-t 11286347  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||| ||||| |    ||| ||| | ||||  |||| |||||||||| || ||||||| |||   ||| ||| |  | |||||| ||||||     
T  11286346 ttgagagttttcgaactttatattgttaccttgttttgggaattgtcaatgttggtcggttgccacttgacacggactttat--cagaaatggttctttc 11286249  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
     || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11286248 aagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgt 11286177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 369979 - 369832
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  369979 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 369881  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  369880 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 369832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 477
Target Start/End: Original strand, 9057575 - 9057815
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag- 334  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  9057575 ttttctcatacgaacttgaactattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttgaga 9057672  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--tttagcca 432  Q
    | |||||||||| |    ||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||| |||  || |||||    
T  9057673 gttttcaaactttatattgttaccttgttttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga--ttttatcggaaatgattctgttaagcca 9057770  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaa 477  Q
    ||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  9057771 attatcttatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaa 9057815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Original strand, 16920850 - 16921112
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16920850 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg-tt 16920948  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| |||| ||||||     
T  16920949 ttgagagttttcaaactttatattgttaccttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgga--ttttatcggtaatgattctttt 16921046  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
     |||||||||||||||||  | | ||||||   ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  16921047 aagccaattatcttatgatctttcgtgactggccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 16921112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31500477 - 31500324
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| || |  |    
T  31500477 ttttctcatacgaacttaagatataccttgaactaatgtctaatagcttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaggattgatttgtgag 31500378  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||| |||||    
T  31500377 ttttcaaacttgaataagttaccttattttggaaattatcaatgttggtcgttt 31500324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Original strand, 17985310 - 17985441
Alignment:
Q  87 atattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcgga 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||| || |||    
T  17985310 atattgggtttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatgtaattatggatttgagaatatgaatgtgttgatggcttgagaaata-tttaggtgga 17985408  T
Q  187 gttgaatcggtgaaaacggg-ttttgagctaaa 218  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17985409 attgaatcggagaaaacgggtttttgagctaaa 17985441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 112369 - 112495
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  112369 ttatccatgttggccggtggccacttgatatggtttttgt-tcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 112467  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  112468 aagtgaagttgtacgaatgaatggttgt 112495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 48354606 - 48354345
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  48354606 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg-tt 48354508  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| | ||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||     
T  48354507 ttgagagttttcaaactttatattgttaccttgttttgggaattatcaatgttggtcg-ttgccacttgatatgga--ttttatcgaaaatgattctttt 48354411  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
     |||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  48354410 aagccaattatcttatgatctttcgtgactaggcttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 48354345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 125972 - 125886
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  125972 aaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaaattgatat 125886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14940047 - 14939878
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14940047 cttgggttttctcatacgaacttaagctacactttggactaatatctaatagtttgtaaatggcttaagctcatgattacatgattgattaagattgatt 14939948  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14939947 tgtgagttttcaaacttgaataagttactttcttttgggaattatgaatgttggccgtttaccacttgat 14939878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15367640 - 15367471
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15367640 cttgggttttctcatacgaacttaagctacactttggactaatatctaatagtttgtaaatggcttaagctcatgattacatgattgattaagattgatt 15367541  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15367540 tgtgagttttcaaacttgaataagttactttcttttgggaattatgaatgttggccgtttaccacttgat 15367471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44864301 - 44864206
Alignment:
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  44864301 gatttttggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatgaaagaatgattgt 44864206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2027757 - 2027628
Alignment:
Q  368 aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||  ||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2027757 aaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcaaaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatg 2027659  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2027658 gctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 2027628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4438126 - 4437968
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||  | | |||||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||   ||    
T  4438126 ttgggttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaacgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacaagattgattaagattttttt 4438027  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4438026 gtgagttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 4437968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4445527 - 4445369
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | | |||||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||   ||    
T  4445527 ttgggttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaacgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacaagattgattaagattttttt 4445428  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4445427 gtgagttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggctgttt 4445369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 142722 - 142594
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||  || ||||||||| |||||    
T  142722 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcagaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatga 142624  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  142623 ctaagtgaagttgtatgaatggatgattgt 142594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 493
Target Start/End: Original strand, 7285147 - 7285403
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  7285147 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttatgagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttgaga 7285244  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt---agcc 431  Q
    |  ||| ||||||  | |||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  |  | |||||||| |||||||||| ||   | |     
T  7285245 gccttc-aacttgcctgagttgctttgtcttggaaattatcaatgttggtcgtttgccacttga--tacagtttttgtcagaaatgtttcctttgaacca 7285341  T
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    |||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7285342 aattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 7285403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 14252263 - 14252411
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||| ||||| || |||| ||| ||||  ||||||     
T  14252263 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg-tttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatata 14252361  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgattg-tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  14252362 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatc 14252411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 383
Target Start/End: Original strand, 34242157 - 34242309
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34242157 ttgggttttctcatacgaatttgagttattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactatatgattgattaagattgattt 34242256  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttgg 383  Q
     |  | |||||||||||||||||||| ||   |||  ||||||||||||||||    
T  34242257 atgagttttcaaacttgaataagttgtcttattttagaaattatcaatgttgg 34242309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9610508 - 9610246
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  |    
T  9610508 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatggttgattaagattg-tt 9610410  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| |  |||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||     
T  9610409 ttgagagttttcaaactttatattgttaccttgtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccaattgatatgga--ttttatcggaaatgattctttt 9610312  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
     |||||||| ||||||||  | |  ||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  9610311 aagccaattgtcttatgatctttcttgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 9610246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9643603 - 9643440
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||  || |    
T  9643603 ttttctcatacgtacttaggctaatctttgaactaatgtttagtagttcgtaagtggcttaagctcatgactacacgattgattaagattgaatggtaag 9643504  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||  ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9643503 tttcgaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattatcaatgctggtcgtttgccacttgat 9643440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9838080 - 9837818
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  |    
T  9838080 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgtttgattaagattg-tt 9837982  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| |  |||  ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||| ||||||     
T  9837981 ttgagagttttcaaactttatattgttaccttgtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccaattgatatgga--ttttatcggaaatgattctttt 9837884  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
     |||||||| ||||||||  | |  ||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  9837883 aagccaattgtcttatgatctttcttgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 9837818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13351206 - 13351127
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13351206 atgattgattaagatagaattgtaggttttaaaacttgaataagttaccttgctttgaaaattatcaatgttgaccgttt 13351127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Original strand, 26071375 - 26071485
Alignment:
Q  409 ttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatg 505  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  26071375 ttgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggata 26071474  T
Q  506 tgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||    
T  26071475 tgatgtttatc 26071485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Original strand, 26095162 - 26095272
Alignment:
Q  409 ttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatg 505  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  26095162 ttgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggata 26095261  T
Q  506 tgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||    
T  26095262 tgatgtttatc 26095272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 674
Target Start/End: Original strand, 2191847 - 2191924
Alignment:
Q  598 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcg-tagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  2191847 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatggttatatgttggatatgataattgtcatgagatgtt 2191924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Original strand, 9321960 - 9322117
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| | ||  |||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  9321960 ggattttctcatacaaacttaggctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaaatggctcaagctcatgattacatgattgattaagattgatttgt 9322059  T
Q  333 -aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||  |||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9322060 gagcttttcaaacttaaatcagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 9322117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 14275869 - 14276037
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  14275869 cttgggttttatcatacgaacttgatctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg-tt 14275967  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |||| |||||||||| |    ||| |||  | |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14275968 tgtaggttttcaaactttatattgttaccttaccttgagagttatcaatgttggtcgtttgccacttgat 14276037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 496
Target Start/End: Original strand, 45453332 - 45453454
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  45453332 ttatcaatgttggtcggttgccacttgatacgg-tttttggtcggaa-tgtt-cttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgact 45453428  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45453429 aagtaaagttgtatgaatgagtgatt 45453454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 500
Target Start/End: Original strand, 13867146 - 13867275
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||| | |||||||| ||||||  |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  13867146 ttatcaatgttggtcgtttgccgcttgatatg-atttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatga 13867244  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13867245 ccaa-tgaagttgtatgaatgaatgattgttt 13867275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 15823479 - 15823607
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || | ||   |||| ||||||||||||| ||| ||| |||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15823479 ttattaatgttggccgttttccacttggtatgttgttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgac 15823578  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15823579 taagtgaagtcgtatgagtgaatgattgt 15823607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 522 - 593
Target Start/End: Original strand, 14252568 - 14252638
Alignment:
Q  522 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14252568 gtgatgatattgatgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaat-atatatatatgatgttg 14252638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 16480225 - 16480275
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16480225 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 16480275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15952385 - 15952434
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15952385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 15952434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16417339 - 16417290
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16417339 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 16417290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13273973 - 13273722
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-gattt 339  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||    
T  13273973 tcatacgaacttaagctattctttagactaatgtctaatagtccgtaagtgacttaagttcatgactacatgattgattaagattg--tttgagagcttt 13273876  T
Q  340 caaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttta-gccaattatc 438  Q
    ||| ||||  || |||   |  | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | |||||| ||||||| ||||  | ||||   |    
T  13273875 caa-cttgtctatgttattttacattgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgc 13273780  T
Q  439 ttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13273779 ttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgatt 13273722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13376896 - 13376800
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13376896 cttgggttttatcatacgaactgaagctattctttgaactaatgtttaatggtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 13376800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Original strand, 39047797 - 39047893
Alignment:
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39047797 atttttagtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 39047893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 11286088 - 11286045
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11286088 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 11286045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 11582131 - 11582174
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582131 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 11582174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 12545001 - 12545044
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545001 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 12545044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33558961 - 33558799
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||   || |||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  33558961 ttttctcatacgaactcaggctaatcttcgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaaaattgatttgtgag 33558862  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||||||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33558861 ttttcaaacttgaataagttactttgttttg-aaactatcaatgttagccgtttgccacttgat 33558799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 47288650 - 47288607
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47288650 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 47288607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 47288861 - 47288719
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||||| || | |||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||| | ||||    
T  47288861 tcaatgtttgccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcggaaatgttttttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataag 47288763  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  47288762 tgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 47288719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 112586 - 112636
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  112586 tgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 112636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 7291728 - 7291686
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291728 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 7291686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 13038395 - 13038445
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13038395 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatga 13038445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 26010480 - 26010530
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26010480 tgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatga 26010530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 39047980 - 39048030
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39047980 tgatgttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 39048030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 496
Target Start/End: Original strand, 2191661 - 2191742
Alignment:
Q  415 gaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2191661 gaaatgtttcttgatctaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 2191742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3048752 - 3048691
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3048752 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgt 3048691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15629874 - 15629750
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | | |||||||||||| |||| || |||    ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15629874 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg---tatggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatg 15629778  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15629777 actaagtgaagtggtatgaatgaatgat 15629750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Original strand, 18981043 - 18981104
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18981043 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgt 18981104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 45453545 - 45453594
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45453545 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 45453594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 496
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49048987
Alignment:
Q  451 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 49048987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 519 - 593
Target Start/End: Original strand, 7285695 - 7285766
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  7285695 aaggtgatgatattggtggattcatatacattgtttattatgatatggtgggtg---aatatatatatgatgttg 7285766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13389143 - 13389047
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||| || |||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13389143 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaacgcctaatagtttgtaagtggattaagctcttaattacatgattgattaagattg 13389047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 125856 - 125789
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||| || |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  125856 caattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 125789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 1938060 - 1938103
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1938060 tgatgttgaatgacattgttgattattgataataatgttgatgt 1938103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 12249401 - 12249444
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12249401 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 12249444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 13757453 - 13757410
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13757453 tgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgt 13757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 15629656 - 15629613
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15629656 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 15629613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 16210654 - 16210611
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16210654 tgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgt 16210611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 32495843 - 32495886
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32495843 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 32495886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 36051538 - 36051495
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36051538 tgatgttgaatgacattgttgattattgaaaatcatgttgatgt 36051495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 125701 - 125651
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  125701 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 125651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 3058922 - 3058872
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3058922 tgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 3058872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 15851201 - 15851163
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851201 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 576
Target Start/End: Original strand, 47482171 - 47482225
Alignment:
Q  522 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47482171 gtgatgatattggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaata 47482225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 369762 - 369713
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  369762 tgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 369713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2027432 - 2027383
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2027432 tgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatg 2027383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 15926239 - 15926202
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15926239 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 15926202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 18981201 - 18981238
Alignment:
Q  591 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18981201 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 18981238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 35093899 - 35093783
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||  ||| ||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  35093899 tcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaag 35093801  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaa 491  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  35093800 tgaagttgtatgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 636
Target Start/End: Original strand, 26071557 - 26071604
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26071557 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatga 26071604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 636
Target Start/End: Original strand, 26095344 - 26095391
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26095344 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatga 26095391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45148798 - 45148750
Alignment:
Q  337 tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45148798 tttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggcc 45148750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 3893968 - 3893925
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3893968 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 3893925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 12753756 - 12753713
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12753756 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgt 12753713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13757604 - 13757545
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13757604 tcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 13757545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Original strand, 17985681 - 17985756
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| | | ||||| |||| | ||||||||||||    
T  17985681 atgattgattaagattgaattgtaggtttttaaacttggataagttactttgctttaaaaagtgtcaatgttggcc 17985756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15306562 - 15306516
Alignment:
Q  312 gattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcc 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  15306562 gattgattaagattgaattgtaggatttcatacttgaatgagttgcc 15306516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 626
Target Start/End: Original strand, 16571380 - 16571418
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16571380 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 16571418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16594282 - 16594244
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16594282 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 16594244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 27102839 - 27102888
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27102839 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27102888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 27110187 - 27110236
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27110187 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27110236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27175487 - 27175438
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27175487 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27175438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 38784931 - 38784980
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38784931 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 38784980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 44864118 - 44864068
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  44864118 tgatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatga 44864068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 326
Target Start/End: Original strand, 49048739 - 49048821
Alignment:
Q  244 tacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  49048739 tacgaacttaagctattctttagactaatgtctaatagtccgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 49048821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 13867363 - 13867412
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13867363 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 13867412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15629999 - 15629914
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||    ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  15629999 tcatacgaacttaagctattctttaaactaatgtccaatagtccttaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 15629914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 496
Target Start/End: Original strand, 16571160 - 16571286
Alignment:
Q  368 aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||  |||| ||||| |||||| |||||| ||||| | | |||   | | || | |||||||||||     
T  16571160 aaattatcaatgttggcagtttgccacttgatacgg--ttttggtcgggaatgttcctttagtcaattgtttcatgttctatagtaaatattcttatatc 16571257  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16571258 actaagtgaagttgtatgaaagaatgatt 16571286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16594502 - 16594376
Alignment:
Q  368 aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||  |||| ||||| |||||| |||||| ||||| | | |||   | | || | |||||||||||     
T  16594502 aaattatcaatgttggcagtttgccacttgatacgg--ttttggtcgggaatgttcctttagtcaattgtttcatgttctatagtaaatattcttatatc 16594405  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16594404 actaagtgaagttgtatgaaagaatgatt 16594376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16918805 - 16918748
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16918805 tcatacgaagttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaag 16918748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 626
Target Start/End: Original strand, 13912402 - 13912442
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13912402 tgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttga 13912442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 142503 - 142460
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  142503 tgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgt 142460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 498
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249310
Alignment:
Q  451 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgt 12249310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 13273628 - 13273589
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13273628 tgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgttg 13273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15926458 - 15926352
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||  | |||| |||||||||||||||||     
T  15926458 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacatgg-tctttggtcgaaaatgtttcttgaactaattgtcttacaatttgtggtgactattcttatatgg 15926360  T
Q  469 ctaagtga 476  Q
    ||| ||||    
T  15926359 ctatgtga 15926352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7821795 - 7821746
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7821795 tgatgttgagtgacattgttgattattgat-attatgttgatgtgtgatga 7821746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7829106 - 7829057
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7829106 tgatgttgagtgacattgttgattattgat-attatgttgatgtgtgatga 7829057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 430 - 496
Target Start/End: Original strand, 11581996 - 11582062
Alignment:
Q  430 ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||| ||||| || |||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11581996 ccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 11582062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 13912311 - 13912341
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13912311 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 13912341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 620
Target Start/End: Original strand, 15525772 - 15525806
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatca 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15525772 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatca 15525806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 624
Target Start/End: Original strand, 15823695 - 15823733
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 624  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15823695 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgtt 15823733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 32495753 - 32495783
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495753 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 32495783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 625
Target Start/End: Original strand, 2191987 - 2192024
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2191987 atgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttg 2192024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15442848 - 15442897
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  15442848 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 15442897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Original strand, 17224876 - 17224961
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||| ||||  ||||||||||| ||| || |||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  17224876 tcatacgaacttgagctattcttcgaattaatgcctaatagtttgtaagtggtttaaattcttcattacatgattgattaagattg 17224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 20002 - 20514
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 20101  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20102 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 20201  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  20202 ggggtttgagctagatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcttttgaactaatttctaatagttggtaagtggcttaagtcctt 20301  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20302 ggctacatgatttattaagattgaattgtaagatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgttttccatatgatttgg 20401  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 502  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20402 a-tttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 20500  T
Q  503 atgtgatgtttatc 516  Q
    || |||||||||||    
T  20501 atatgatgtttatc 20514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 20583 - 20632
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20583 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 20632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16820472 - 16819955
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16820472 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaat 16820373  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16820372 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaatcggtgaa 16820273  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16820272 aatgagttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatattttgcaagtggcttaagtc 16820173  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctt--tgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16820172 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctagcttaaaaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatga 16820073  T
Q  399 tttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16820072 tttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 16819974  T
Q  499 -ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
     ||| || |||||||||||    
T  16819973 attggatatgatgtttatc 16819955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 49231775 - 49231262
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49231775 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaacgaa 49231676  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  49231675 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtggagtagaatcggtgaaaa 49231576  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49231575 cgagttttgagctaaatgtcgttttgtcttggttcttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcct 49231476  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49231475 tgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttacctaagtttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt- 49231377  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49231376 gaatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 49231277  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  49231276 aatatgatgtttatc 49231262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 17956931 - 17957443
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17956931 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataacattttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaa 17957030  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957031 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgaggatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 17957130  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  17957131 gggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtctt 17957230  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957231 tggttacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctaactttgaaaa-tatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 17957329  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    || ||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  17957330 ga-tttttgtcggaaatgtttcttgaacaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattg 17957428  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
     || |||||||||||    
T  17957429 gatatgatgtttatc 17957443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25058305 - 25057811
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25058305 aaattactacacataggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaataaa 25058206  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtattt-gggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25058205 gtacttagagtgaatgattgagtatgcatttatgtattttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaataagtgaaaa 25058106  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25058105 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatatgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaagtcct 25058006  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25058005 tggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttacctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttg 25057906  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25057905 gat-ttttgttggaaatgtttctttagtaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgt 25057811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12808515 - 12808039
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12808515 attaaattactacatatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattttgtttaat 12808416  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12808415 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaatgtgaatgggttgatgatttaagaaatattttgggcagagtttaatcggtgaa 12808316  T
Q  201 aacgggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12808315 aacgggttttgagctaaaatgtcgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttttaatagtttgcaagtggcttaagt 12808216  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12808215 ccttggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcttagctttaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 12808116  T
Q  400 ttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaa 477  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  12808115 ttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaatttgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaa 12808039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 54039229 - 54039753
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54039229 aaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 54039328  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54039329 gtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttggacggagttgaatcggtgaaaac 54039428  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtctt-ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||   | |||||| | ||| ||| || |  |     
T  54039429 gagttttgagctaaatgtcgttttgtcttgggattttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgattgatagttcgtaagtggcctatgctca 54039528  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54039529 tacttaaatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgtctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgaattg 54039628  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt---t 499  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |   |    
T  54039629 ga-tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgt 54039727  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatcttaaggtga 525  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  54039728 tggatgtgatgtttatcttaaggtga 54039753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 14528724 - 14528951
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14528724 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctataagccgtgaaacttttccaaacatgatattgggtttaat 14528823  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14528824 gaagtacttagagtgaataattgagtatccatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaa 14528923  T
Q  201 aacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14528924 aacgagtttttagctaaaatgtcgtttt 14528951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 310 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22274297 - 22274091
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22274297 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgactagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-ttt 22274199  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22274198 tgtcagaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatga 22274099  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  22274098 tgtttatc 22274091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 310 - 516
Target Start/End: Original strand, 15469479 - 15469685
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15469479 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgactagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga-tttt 15469577  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||    
T  15469578 tgtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattggatatga 15469677  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  15469678 tgtttatc 15469685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27840469 - 27840303
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27840469 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 27840370  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggttt 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27840369 gaagtacttagagtgaacaattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggttt 27840303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 51158746 - 51158923
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51158746 aaattactacacatggttcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggttcaatgaa 51158845  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  51158846 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatatgaatgtgttgatggtttgagatatattttgg 51158923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 310 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13838012 - 13837823
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttg-aaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13838012 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgatttgga-ttt 13837914  T
Q  409 ttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13837913 ttgtcggaaatg-ttcttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgttt 13837823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28557377 - 28557171
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||    
T  28557377 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattaaatataatgaa 28557278  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28557277 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa------tgtgttgatggtttaag-aatattttgggcagagttgaatcggtgaaaac 28557185  T
Q  204 gggttttgagctaa 217  Q
    || |||||||||||    
T  28557184 ggattttgagctaa 28557171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 313 - 486
Target Start/End: Original strand, 51159382 - 51159555
Alignment:
Q  313 attgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaa-ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttg 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51159382 attgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagtttcctagctttgaaaaattatcaatgttgaccgtttgacacatgatttggatttt-tg 51159480  T
Q  412 tcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51159481 tcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatga 51159555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 310 - 516
Target Start/End: Original strand, 2450232 - 2450438
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2450232 atgatagattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctaactttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttgga-tttt 2450330  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtga 508  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  2450331 tgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatga 2450430  T
Q  509 tgtttatc 516  Q
    ||||||||    
T  2450431 tgtttatc 2450438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44228526 - 44228399
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44228526 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctataagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaat 44228427  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44228426 gaagtatttagagtgaataattgagtat 44228399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 577 - 674
Target Start/End: Original strand, 9303744 - 9303841
Alignment:
Q  577 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303744 atatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 9303841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8276573 - 8276700
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  8276573 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatttcgggcttaat 8276672  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8276673 gaagtatttagagtgaataactgagtat 8276700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30152457 - 30152334
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||     
T  30152457 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttaataatggg-ttaatgag 30152359  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30152358 gtacttagagtgaataattgagtat 30152334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8269462 - 8269589
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  8269462 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatttcgggcttaat 8269561  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8269562 gaagtatttagagtgaataactgagtat 8269589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 18897732 - 18897852
Alignment:
Q  7 ttattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagta 106  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  18897732 ttattacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttataataactttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaataatggg-ttaatgaggta 18897830  T
Q  107 cttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18897831 cttagagtgaataattgagtat 18897852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 12265522 - 12265645
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||     
T  12265522 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttgtcataactttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaatgatggg-ttaatgag 12265620  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12265621 gtacttagagtgaataattgagtat 12265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Original strand, 4163135 - 4163330
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    ||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  4163135 ttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagcttgtgactacatgattaattaaggttgattt 4163234  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttta 428  Q
     |  | |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  4163235 gtgagttttcaaacttgaataagttatcttattttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgga--ttttgtcgaaaatgattcttta 4163330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 399
Target Start/End: Original strand, 4146601 - 4146770
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||||||| |||| |    
T  4146601 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagcttatgactacatgattgattaaggttgatt 4146700  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    | |  | |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4146701 tgtgagttttcaaacttgaataagttatcttattttgaaaattatcaatgttggccttttgccacttgat 4146770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 478
Target Start/End: Original strand, 33369778 - 33370027
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  33369778 cttgggttttctcatacgaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 33369877  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataa-gttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    |||| | |||||||||| | ||| ||| ||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||  || |   ||| ||| ||||| ||||||     
T  33369878 tttaagctttcaaactttagtaatgttaccttgttttgggaattatcaacgttggccgtttgccacttga--tgcagactttatcgaaaatggttctttt 33369975  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaag 478  Q
     |||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33369976 aagccaattatcttatgatctttagtgactagccttatatgactaaatgaag 33370027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 1468716 - 1468840
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1468716 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 1468815  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1468816 gtatttagagggaataattgagtat 1468840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5227823 - 5227715
Alignment:
Q  20 gtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttcc-aaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaat 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5227823 gtcatgtggatttttgttaaaaattatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaaacttaataatggg-ttaatgaagtacttagagtgaat 5227725  T
Q  119 aattgagtat 128  Q
    ||||||||||    
T  5227724 aattgagtat 5227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 408
Target Start/End: Original strand, 6229557 - 6229735
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6229557 cttgggttttctcatacgaacttaagttatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagcttatgactacatgattgattaagattgatt 6229656  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    | |  | |||||||||| ||||||||  ||   ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||    
T  6229657 tgtgagttttcaaacttaaataagttatcttattttgaaaattatcaatgttgatcgtttgccacttgatacggatttt 6229735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11637651 - 11637497
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||| || ||    
T  11637651 ttgggttttctcacacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactgcatgattgattaagatggagtt 11637552  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
     |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11637551 gtaggttttaaaacttgaataagttatctagctttgaaaattatcaatgttggcc 11637497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 516
Target Start/End: Original strand, 47785810 - 47786098
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |    
T  47785810 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattattt 47785909  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  |  |||||||||||| |||||   | |||||| ||| || |||||||  ||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||| || |||      
T  47785910 tgtgagccttcaaacttgaacaagttattttgctttggaaactagcaatgttaaccggttgtcacttgatataga-cttttgtcggaaatgattatttta 47786008  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||| || |||  | |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  47786009 agccaattattttgtgatctttcatgactagccttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 47786098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8630934 - 8630802
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| || | ||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8630934 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggttgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatga 8630836  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgtttga 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8630835 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtttga 8630802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41660860 - 41660707
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |  || ||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || |  |    
T  41660860 ttttctcatacaaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagttcgtgagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatcgatttgttag 41660761  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41660760 ttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaagtatcaatgttggccgttt 41660707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14297586 - 14297464
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||    
T  14297586 ttatcaatgttggccgtttgccacttggtatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgact 14297488  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  14297487 aa-tgaagttgtatgaatgaatgat 14297464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14303213 - 14303091
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||    
T  14303213 ttatcaatgttggccgtttgccacttggtatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgact 14303115  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  14303114 aa-tgaagttgtatgaatgaatgat 14303091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 16934913 - 16935032
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||     
T  16934913 aaattactacacatgggtcatgcggatttttgtgaaaacttatcataaatatttttataagccgtgaaacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgag 16935011  T
Q  104 gtacttagagtgaataattga 124  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16935012 gtacttagagtgaataattga 16935032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18909883 - 18909736
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  18909883 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 18909785  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18909784 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 18909736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 399
Target Start/End: Original strand, 31413224 - 31413392
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||     
T  31413224 ttgggttttcttatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaaactcatgactacatgattgattaagattgaatg 31413323  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     |||| || |||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31413324 ataggtttccaaacttgaacaaattactttgctttgaaaattatcaatgttggccgtttgacacttgat 31413392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 53769854 - 53769707
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  53769854 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 53769756  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53769755 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 53769707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7853138 - 7852883
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  7853138 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttataagtgtcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttgaga 7853041  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--tttagcca 432  Q
    | |||| |||||   ||| |||| | |  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||  || | |||    
T  7853040 gctttc-aacttttctaacttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttgaacca 7852944  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||| ||||||||  | | | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7852943 attttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 7852883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Original strand, 12350954 - 12351041
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12350954 gtcggatatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 12351041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Original strand, 14816619 - 14816777
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  14816619 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctagtagtttgtaagtggcttaagctcacgacgacatgattgattaagattgatt 14816718  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14816719 tgtgagttttcaaacttgaataagttatcta-ttttggaaattatcaatgttgaccgttt 14816777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18969361 - 18969208
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| || |  |    
T  18969361 ttttctcatacgaacttaagcgatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatcattgattaagattgatttgtgag 18969262  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||||||||||||| | |   ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18969261 ttttcaaacttgaataagttactttattttggtaatcatcaatgttggccgttt 18969208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 43428461 - 43428614
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  43428461 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttatgag 43428560  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43428561 ttttcaaacttgagtaagttaccttgttttgaaaatgatcaatgttggccgttt 43428614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Original strand, 318686 - 318809
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||  ||||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  318686 tcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcaaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaag 318784  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  318785 tgaagttgtatgaatgaatgattgt 318809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 17523540 - 17523665
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  17523540 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgcttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgact 17523638  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||    
T  17523639 aa-tgacgttgcatgaatgaatgattgt 17523665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Original strand, 12489634 - 12489849
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | | |||||||||| |||||||| ||  ||    
T  12489634 ttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcataactacatgatagattaagaatgtttt 12489733  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
     || | |||||||||| |    |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||| ||||||      
T  12489734 gtaagttttcaaactttatattgttgccttactttgagaaattatcgatgttggccgtttgccacatagtatgga-taattgtcggaaatgattctttta 12489832  T
Q  428 agccaattatcttatga 444  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12489833 agccaattgtcttatga 12489849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 35122775 - 35122650
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  35122775 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--ttttggtcggaaatgtttcttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 35122678  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  35122677 aagtgaaattgtataaatgaatgcttgt 35122650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 19945853 - 19945595
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatt---tctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  19945853 ttttctcatacgaatttaagctattctttgaactaataatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttg 19945756  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag--c 430  Q
    ||   ||  ||| ||  |||||||  | |  |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||| || |  |    
T  19945755 agagcttttaacatgtctaagttgttttgtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttgaac 19945658  T
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  19945657 caattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 19945595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 54423127 - 54423017
Alignment:
Q  409 ttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatg 505  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  54423127 ttgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggata 54423028  T
Q  506 tgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||    
T  54423027 tgatgtttatc 54423017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Original strand, 16183084 - 16183209
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  16183084 tcaatgttgtccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaag 16183182  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16183183 tgaagttgtatgaatgaatgattgttt 16183209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 9591683 - 9591835
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   || |  |    
T  9591683 ttttctcaaacgaacttaagctatactttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattatcttgtgag 9591782  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||||||||||||||| ||   ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9591783 ttttcaaacttgaataaattattta-ttttggaaattatcaatgttggccgttt 9591835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Original strand, 11198638 - 11198766
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  || ||||| ||| |||||||| ||| || ||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  11198638 aattatcaatgttgaccggttgccacttgatacgg-tttttagtcagaaatgttccttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatga 11198736  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11198737 ctaagtgaggttgtatgaatgaatgattgt 11198766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48420903 - 48420697
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  48420903 ttttttcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaaatgacttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttattag 48420804  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaa 433  Q
     |||||||||||| || ||| |||  | |||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||  ||   |||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  48420803 ttttcaaacttgattatgttaccttac-ttgagagttatcaaagttggccatttgccacttgatacgg---ttttatcggaaatggttcttttaagccaa 48420708  T
Q  434 ttatcttatga 444  Q
    |||||||||||    
T  48420707 ttatcttatga 48420697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 14060250 - 14060346
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14060250 cttggattttatcatacgatcttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagttcttgattacatggttgattaagattg 14060346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17138693 - 17138442
Alignment:
Q  241 tcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-gattt 339  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||    
T  17138693 tcatacgaacttaagctattttttagactaatatctaatagtccgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttgagagcttt 17138596  T
Q  340 caaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatc 438  Q
    ||| ||||  || ||||  | |  |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||   | ||||||||||||||  ||| ||||||||  |    
T  17138595 caa-cttgtctatgttgtttcgtcttgggaattatcaaagttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatgttcttttgagccaattgac 17138500  T
Q  439 ttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17138499 ttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttatatgaatgaatgatt 17138442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10912433 - 10912322
Alignment:
Q  278 atagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaa 377  Q
    |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |    
T  10912433 atagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtaagttttcaaacttgaataagttactttgctttgaaaaatatcta 10912334  T
Q  378 tgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||    
T  10912333 tgttggccgttt 10912322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 498
Target Start/End: Original strand, 11062099 - 11062231
Alignment:
Q  364 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctta 463  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |  |||||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||   |   ||||||||||| |    
T  11062099 ttgagaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacg--ttttttgttggaaatgttccttgagccaattgttttatgttctaacgtgactattctca 11062196  T
Q  464 tatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11062197 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 11062231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17099803 - 17099675
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  17099803 aattatcaacgtcggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatat 17099707  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17099706 gactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 17099675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16260051 - 16259974
Alignment:
Q  598 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcg-tagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  16260051 acattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatggttatatgttggatatgataattgtcatgagatgtt 16259974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 484
Target Start/End: Original strand, 53899591 - 53899703
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||   || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  53899591 ttatcaatgttggtcggttgccacttgatatgg-ttttggatcagaaatgtttcttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 53899689  T
Q  471 aagtgaagttgtat 484  Q
    ||||||||||||||    
T  53899690 aagtgaagttgtat 53899703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15875395 - 15875299
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15875395 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatggtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 15875299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39655146 - 39655050
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39655146 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaaggtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactgcatgattgattaagattg 39655050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 6147915 - 6148039
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtt-tctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||     
T  6147915 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaa 6148010  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6148011 taagtgaagtggtatgatttaatgattgt 6148039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 500
Target Start/End: Original strand, 15860253 - 15860347
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| || || || |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15860253 ttttagtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatctttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 15860347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 16819778 - 16819728
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16819778 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 16819728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 19572057 - 19572107
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19572057 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 19572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Original strand, 22145343 - 22145472
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctt-atatg 467  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||  | | || || |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  22145343 aattgtcaatgttggctgtttgccacttgacatag-ttcttggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatg 22145441  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22145442 actaagttaagttgtatgaatgaatgattgt 22145472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 2450615 - 2450664
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2450615 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 2450664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11401931 - 11401786
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | |||  || |||   | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11401931 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtagcctaaactcatgattacatgattgattaagattgaattgtagg 11401832  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgtt 381  Q
     ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| | ||||||||    
T  11401831 ttttcaaacttgaacaagttactttgctttgaaaaatgtcaatgtt 11401786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 18892888 - 18892831
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18892888 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 18892831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18909559 - 18909510
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18909559 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 18909510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22273914 - 22273865
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22273914 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 22273865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23491531 - 23491470
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23491531 tcttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 23491470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 38167071 - 38167010
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38167071 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 38167010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 38376622 - 38376775
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| | | ||||||   ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| || |  |    
T  38376622 ttttctcatacgaacttaggctaatttttgaattaatgtttgatagttcataagtggcttaagctcatgagtacatgattgattaaaattgatttgtgag 38376721  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38376722 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattataaatgttggccgttt 38376775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 53769530 - 53769481
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53769530 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 53769481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 21167650 - 21167805
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| | ||   || |||||||| | | ||||||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || |  |    
T  21167650 ttttctcatacgaacttaggataatcttcgaactaatgtttcatagttcttaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatttatttgtgag 21167749  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgcc 392  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21167750 ttttcaaacttgaataagttaccttgttttg-aaactatcaatgttggccgtttgcc 21167805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34559109 - 34559013
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  34559109 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttaaattaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 34559013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 11987079 - 11987174
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11987079 ttgggttttatcgtacgatcttaagttattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtgacttaagttcttgactacatgattgattaagattg 11987174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14294524 - 14294392
Alignment:
Q  364 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||| | |||||| || | | ||||| || ||||   | | || ||||||||||    
T  14294524 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--ttttggtctggaatgttcctctcgtcaattgtcctatgttctatagtaactattctta 14294427  T
Q  464 tatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14294426 tatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgt 14294392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14300151 - 14300019
Alignment:
Q  364 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctta 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||| | |||||| || | | ||||| || ||||   | | || ||||||||||    
T  14300151 ttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--ttttggtctggaatgttcctctcgtcaattgtcctatgttctatagtaactattctta 14300054  T
Q  464 tatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14300053 tatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgt 14300019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16260275 - 16260149
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||   || | ||| |||| ||||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  16260275 aattgtcaatgttggccgtttgccaattgacacgg-tctttggtcgaaaatgtttcttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatga 16260177  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16260176 ctaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 16260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17203917 - 17203822
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||   |||| || ||||| |||||||||||    
T  17203917 ttgggttttatcatacgaacttaagctattttttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctattgattatatgatcgattaagattg 17203822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 35122560 - 35122509
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35122560 atgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatga 35122509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 516
Target Start/End: Original strand, 50113238 - 50113349
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaat 504  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||    
T  50113238 ttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggat 50113337  T
Q  505 gtgatgtttatc 516  Q
     |||||||||||    
T  50113338 atgatgtttatc 50113349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 51159764 - 51159807
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159764 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 51159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7852680 - 7852630
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7852680 tgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatga 7852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 8269689 - 8269739
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8269689 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8269739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 8276800 - 8276850
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8276800 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8276850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 12031269 - 12031319
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12031269 tgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 12031319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 13816385 - 13816343
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816385 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 13816343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 15860433 - 15860483
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15860433 tgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 15860483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 17099585 - 17099543
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17099585 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 17099543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 17937369 - 17937284
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcg-tagatgttgaatatgatatttatcatgagat 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17937369 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgaagacgtgtgatgaattgttaaatgttggatatgata-ttatcatgagat 17937284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 22145560 - 22145610
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22145560 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 22145610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 33340715 - 33340665
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33340715 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatga 33340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 47786169 - 47786219
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47786169 tgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 47786219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 50113418 - 50113460
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113418 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 50113460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 17957621 - 17957670
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17957621 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 17957670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 18889661 - 18889604
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18889661 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatacggtgggtgaata 18889604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 23174608 - 23174551
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23174608 aaggtgatgatattggtgaatccatatactttgtttattatgatatggtgggtgaata 23174551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 576
Target Start/End: Original strand, 9303670 - 9303722
Alignment:
Q  524 gatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9303670 gatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 9303722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 498
Target Start/End: Original strand, 12562545 - 12562672
Alignment:
Q  370 attatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgac 469  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || |  || ||||| | |||||||||| ||| || ||||| ||||| |   | | ||||| |||||||||||||    
T  12562545 attatcaacgttggccatttgccacttggtacgg-tttttgggcggaaatgttccttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgac 12562643  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12562644 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 12562672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 14522217 - 14522313
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  14522217 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatggtttgtaagtggcttaagctcataactatatgattgattaagattg 14522313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 318899 - 318942
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  318899 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 318942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2048933 - 2048890
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2048933 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 2048890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 6148127 - 6148170
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148127 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 6148170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 11062322 - 11062365
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11062322 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 11062365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 12562763 - 12562806
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12562763 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 12562806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12952282 - 12952187
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||| ||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  12952282 cttgggttttatcatacgaacttaagatattctttgaactaatgtttaatggtttgtaagtggcataagctcttgattacatgattgattaagatt 12952187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 16183295 - 16183338
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16183295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 16183338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33341034 - 33340910
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    |||||||||| || || |||| |||| |||  |||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||  || |||| ||| ||||  |||||| ||||||    
T  33341034 tcaatgttggtcggttaccacttgatatgg--ttttagtcgggaatgtttcttgaaccaattgtcttgagaattgtggtggctatgtttatataactaag 33340937  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33340936 tgaagttgtatgaatgaatgattgttt 33340910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 44228299 - 44228256
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44228299 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgt 44228256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 636
Target Start/End: Original strand, 53899807 - 53899858
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53899807 atgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatga 53899858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12021190 - 12021029
Alignment:
Q  242 catacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttca 341  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||  ||||| || |||||||||||||||||  ||||||  ||| |    
T  12021190 catacgaacttaaactattctttgaactaatgtctaatagtttttaagtggattaagctcttgattatatgattgattaagattg-tttttagagtttta 12021092  T
Q  342 aacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga 404  Q
    ||||| |    ||| ||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  12021091 aactttatattgttaccttgttttgggaattatcaatgttgaccgtttgccacttgatatgga 12021029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14079822 - 14079728
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    ||| |||||||||||||| ||||    
T  14079822 ttgggttttctcatacggacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtgacttaagcttatgattacatgattgattaggatt 14079728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 15469754 - 15469804
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15469754 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 15469804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 15574913 - 15574863
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15574913 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 15574863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 15613932 - 15613882
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15613932 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 15613882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17937528 - 17937458
Alignment:
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17937528 agccaattgtcttgtgagttattgtgaccatttttgtatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgt 17937458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Original strand, 11198859 - 11198900
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11198859 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 11198900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14294300 - 14294259
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14294300 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 14294259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Original strand, 14522594 - 14522635
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14522594 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 14522635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 17913537 - 17913586
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17913537 tgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatg 17913586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40938739 - 40938694
Alignment:
Q  453 gactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40938739 gactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgt 40938694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 54039813 - 54039870
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  54039813 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatagggtgtgtgaata 54039870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14297372 - 14297328
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14297372 atgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgt 14297328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14302999 - 14302955
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14302999 atgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgt 14302955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15516945 - 15516716
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctag 361  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||||||| || || |  | |||||||||||| || ||| |||      
T  15516945 tttgatctaatgtctaatagtttgtaagtggcttaaactcatgactacatgattgattaagatcgatttattagttttcaaacttgattatgttacctta 15516846  T
Q  362 ctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactatt 459  Q
    | |||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||   |||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||  | | |||||||      
T  15516845 c-ttgagagttatcaaagttggtcgtttgccacttgatacgg---ttttattggaaatggttcttttaagccaattatcttatgatctttagtgactagc 15516750  T
Q  460 cttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||    
T  15516749 cttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaatg 15516716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 19230932 - 19230884
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19230932 tgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgat 19230884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 38812009 - 38812105
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38812009 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgttcaatggtttgtaagtggcttaatctcttgattacatgattgattaaaattg 38812105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 631 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 14079571 - 14079528
Alignment:
Q  631 tgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14079571 tgatgaattgtagatgttggatatgatatttatcatgagatgtt 14079528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 520 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18738736 - 18738667
Alignment:
Q  520 aggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18738736 aggtgatgatattggtgaatccatatac-tttgttattataatatggtgggtg---aatatatatatgatgttg 18738667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 19945499 - 19945456
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19945499 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 19945456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 1468941 - 1468990
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1468941 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 1468990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 14299927 - 14299889
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14299927 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 14299889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 351
Target Start/End: Original strand, 16745211 - 16745328
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    ||||||| | ||| ||| || |  | ||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  16745211 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcaatagttcgtaagtggcctatgctcgtgcttatatgattgattaagattgaattgt 16745310  T
Q  333 aggatttcaaacttgaata 351  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16745311 aggatttc-aacttgaata 16745328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Original strand, 19571917 - 19571971
Alignment:
Q  446 ttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19571917 ttgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 19571971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 493
Target Start/End: Original strand, 54652808 - 54652897
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgtttctttag--ccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  54652808 tttttgtcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 54652897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 636
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935217
Alignment:
Q  587 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 16935217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 51962433 - 51962490
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||    
T  51962433 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgataaggcgggtaaata 51962490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 39654966 - 39654883
Alignment:
Q  412 tcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  39654966 tcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatg 39654883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Original strand, 55441742 - 55441810
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  55441742 cttgggttttctcatacggacttaagctaaactttgaactaatgtctaatagtttataagtggcttaag 55441810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 49231086 - 49231043
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49231086 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 49231043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 8630715 - 8630669
Alignment:
Q  590 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  8630715 gttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatga 8630669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 12265776 - 12265826
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12265776 tgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 12265826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13816526 - 13816472
Alignment:
Q  446 ttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13816526 ttgtggtgactatgtttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 13816472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 521 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 17937124 - 17937078
Alignment:
Q  521 ggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggt 567  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17937124 ggtgatgatattggtgagtccatatacattgtttattatgatatggt 17937078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23491373 - 23491335
Alignment:
Q  591 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23491373 ttgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgt 23491335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 595 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 25057710 - 25057676
Alignment:
Q  595 atgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25057710 atgacattgttgattattgataatcatattgatgt 25057676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 30152204 - 30152154
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  30152204 tgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatga 30152154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 51159674 - 51159704
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159674 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 51159704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 40938602 - 40938561
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40938602 atgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgt 40938561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 5227584 - 5227544
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5227584 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttga 5227544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 496
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031200
Alignment:
Q  460 cttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 12031200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 23174695 - 23174667
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174695 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 23174667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 79010 - 78519
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79010 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaaattatcgtaactttttctatgagccatgaaacttttccaaacttgatattgggtataatgaa 78911  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78910 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 78811  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  78810 gggttgtgagctaaatgtcgctttgtcttggattttctcatgcgaacttaaactatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 78711  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78710 gactacatgattgattaagtttgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 78611  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  78610 at-ttttgtcggaaatgtttctttagccaattttcttgtgggttattgtgaccattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgatt 78519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39972 - 39758
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39972 aaattactacacatgggtcatgtggattttcgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 39873  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39872 gtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtaattgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 39773  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    |||||||||||||||    
T  39772 gggttttgagctaaa 39758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45455 - 45231
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455 aaattactacacatgggtcatgtggattttcgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 45356  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45355 gtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtaattgggaatgtgaatgtgttgattgtttaagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 45256  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  45255 gggttttgagctaaaatgtcgtttt 45231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 39401 - 39279
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||  |||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  39401 tcaatgttggccgtttgccacttgacatgg--ttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaag 39304  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  39303 tgaagttgtatgaatgaatgattgt 39279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 44884 - 44742
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||  |||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  44884 tcaatgttggccgtttgccacttgacatgg--ttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaag 44787  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattg--tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  44786 tgaagttgtatgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatc 44742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 78426 - 78378
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78426 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 78378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 39086 - 39043
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39086 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 39043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 44673 - 44630
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44673 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgt 44630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 12727718 - 12727206
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggattttt-gtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatga 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727718 aaattactacacatgggtcatgcggattttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatga 12727619  T
Q  103 agtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12727618 agtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggctgagttgaatcggtgaaaa 12727519  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  12727518 cgggtttttagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaaatggcttaagtcct 12727419  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727418 tggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 12727319  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12727318 ga--ctttgttggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattg 12727221  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  12727220 aatatgatgtttatc 12727206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 19887374 - 19887889
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19887374 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccatgaaatttttccaaacttgatattgtgtttaat 19887473  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19887474 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatctgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 19887573  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19887574 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttgagctaccctttgaattaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtc 19887673  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19887674 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgtctagctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 19887773  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19887774 tgga-tttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 19887872  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19887873 tgaatatgatgtttatc 19887889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 34823757 - 34823245
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34823757 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 34823658  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  34823657 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtggagtagaatcggtgaaaa 34823558  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |    
T  34823557 cgagttttgagctaaatgtcgttttgctttggtttttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaattcgt 34823458  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34823457 tggctacatgattgattaagatttaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 34823358  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    ||   |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34823357 ga--ctttgtcagaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 34823260  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  34823259 aatatgatgtttatc 34823245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21141437 - 21140923
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21141437 attaaaatactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaatttatcgtaactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaat 21141338  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatatttt-gggcggagttgaatcggtga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21141337 gaagtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttggggcggagttgcatcggtga 21141238  T
Q  200 aaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  21141237 aaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttagtttttctcatacgaacttgagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaa--ggcttaatt 21141140  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141139 ccttggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 21141040  T
Q  400 ttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt- 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21141039 ttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattttcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta 21140941  T
Q  499 ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21140940 ttgaatatgatgtttatc 21140923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16900822 - 16900327
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16900822 aaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtaaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaa 16900723  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16900722 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatttgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgggcggagttgactcggtgaaaa 16900623  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  16900622 tgggttttgagcaaaatgttgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaattcct 16900523  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16900522 tggctatatgattgattgagattgaattgtaagatttcaaacttgaataagttgtctagttttaaaaattatcaaagttggccgtttgccacatgattt- 16900424  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattc-ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16900423 gtttttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcgtttgagttattgtgattactctttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 16900327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16994213 - 16993718
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16994213 aaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtaaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaa 16994114  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaa-tattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16994113 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatttgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgggcggagttgactcggtgaaaa 16994014  T
Q  203 cgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  16994013 tgggttttgagcaaaatgttgttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttttaagtggcttaattcct 16993914  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16993913 tggctatatgattgattgagattgaattgtaagatttcaaacttgaataagttgtctagttttaaaaattatcaaagttggccgtttgccacatgattt- 16993815  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattc-ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||| || | |||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16993814 gtttttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcgtttgagttattgtgattactctttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 16993718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27261339 - 27261125
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27261339 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaattaa 27261240  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27261239 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 27261140  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    | |||||||||||||    
T  27261139 gagttttgagctaaa 27261125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 67346 - 67122
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67346 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaa 67247  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  67246 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 67147  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  67146 gggtttttaactaaaatgtcgtttt 67122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Original strand, 14907368 - 14907620
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  14907368 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 14907467  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14907468 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttgga-tttttgtcggaaatgtttctttagcaa 14907566  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14907567 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 14907620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23819406 - 23819154
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  23819406 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 23819307  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23819306 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttagcaa 23819208  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23819207 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 23819154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20014269 - 20014094
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20014269 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttt 20014171  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20014170 tgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttatgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatga 20014094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5889354 - 5889482
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttg-tgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaa 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5889354 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttggtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaa 5889453  T
Q  100 tgaagtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5889454 tgaagtatttagagtgaataattgagtat 5889482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 24686700 - 24686824
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  24686700 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgag 24686799  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24686800 atacttagagtgaataattgagtat 24686824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 11232315 - 11232439
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11232315 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 11232414  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11232415 gtatttagagggaataattgagtat 11232439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25601191 - 25600951
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||   | |||||| |||||||||||||||||| || |    
T  25601191 ggattttctcatacgaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaatctcatgactatatgattgattaagattgatttgt 25601092  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agcc 431  Q
      | || |||||||||||||||| | |  |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | | ||||| |||||| | ||    
T  25601091 tagtttccaaacttgaataagttactttactttgagagttatcaatgttggccgtttgccacttgatgtggatttttattggaaaatggttctttaaacc 25600992  T
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaa 472  Q
    |||| ||||||||  | | ||||||| |||| |||||||||    
T  25600991 aattgtcttatgatctttcgtgactagtcttgtatgactaa 25600951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24881879 - 24881681
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  24881879 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactattatctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatttatt 24881780  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagcttt-gaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttta 428  Q
      |  | |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  24881779 ggtgagttttcaaacttgaataagttatcttactttggaaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatatgga-tttttgtcgaaaatgattcttta 24881681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 22514162 - 22514286
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22514162 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 22514261  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22514262 gtatttagagggaataattgagtat 22514286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 28776764 - 28776887
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28776764 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaa 28776863  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  28776864 gta-ttagagggaataattgagtat 28776887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Original strand, 16293698 - 16293856
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||   | ||||||||||||||| |||||| || ||    
T  16293698 ttgggttttctcacacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaaactcatgactacatgattgaataagatggagtt 16293797  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16293798 gtaggttttaaaacttgaataagttacctaactttgaaaattatcaatgttggccgttt 16293856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27260784 - 27260503
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  27260784 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggattaagctcatgactacatgattgattaagattgt-tttgaga 27260686  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agcca 432  Q
    | |||| ||||| |    ||| ||| | ||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||    || ||| |  |||||||| ||||||  || ||    
T  27260685 gttttcgaactttatattgttaccttgttttgggaattgtcaatgttggccgattgccacttgacacagactttat--cggaaatggttctttcaagtca 27260588  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| || |||||||||||    
T  27260587 attaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatc 27260503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25212206 - 25211922
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||    
T  25212206 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactgatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatt--ttt 25212109  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--ttt 427  Q
    | || | |||| || |||  |||||||| | |  |||  |||||||||||||||||||||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||||  ||     
T  25212108 tgagagctttc-aatttgtctaagttgctttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgtcgcttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttg 25212012  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||| |||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25212011 aaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 25211922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24277140 - 24276981
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24277140 cttgggttttctcatacgaacttaagctattccttgaactaatggttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 24277041  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  24277040 tgttagttttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaagtaacaatgttggccgttt 24276981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 24561682 - 24561835
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  24561682 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtgag 24561781  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24561782 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 24561835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 12642987 - 12643134
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  12642987 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 12643085  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12643086 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 12643134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 21275489 - 21275636
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  21275489 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 21275587  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21275588 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 21275636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9636044 - 9635881
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  9636044 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtgag 9635945  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
     ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  9635944 ttttcaaacttgaataagttactttgatttgaaaattatcaatgttgatcgtttgccacttgat 9635881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 442
Target Start/End: Original strand, 19670066 - 19670275
Alignment:
Q  229 tcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaa 328  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |    
T  19670066 tcttgggttttctcatacggacttaagctaatctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttattgacttcatgattgattaagatt--a 19670163  T
Q  329 ttttagga--tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctt 426  Q
    ||||  ||  ||||||||||| |||||||   ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19670164 ttttgtgaattttcaaacttggataagttaatta--tttggaaagtatcaatgttgaccgtttgtcacttgaattggactttt--tcggaaatgtttctt 19670259  T
Q  427 tagccaattatcttat 442  Q
    |  ||||| |||||||    
T  19670260 tgaccaatcatcttat 19670275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 36891782 - 36891908
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  36891782 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgact 36891880  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36891881 aagtgaagttgtatgattgaaagattgt 36891908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25594362 - 25594209
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | | |||||| | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  25594362 ttttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgtttgatagttcgtaagtgacttaagttcatgactacatgattgattaagattgatttgtaag 25594263  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||||||||||| |||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25594262 ttttcaaacttgagtaagttactttgctttgaaaaatatctatgttggccgttt 25594209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 270243 - 270118
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  270243 ttatcaatgttggtcgtttgccacttgatatgg--ttttggtcggaaatgtttcttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 270146  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  270145 aagtgaagttgtataaatgaatgcttgt 270118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 721710 - 721614
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  721710 cttggattttctcatacgaacttaagctattctttggactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 721614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 4449300 - 4449426
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  4449300 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg-ttttggatcggaaatgtttcttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgact 4449398  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4449399 aagtgaagttgtataaatgaatgcttgt 4449426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 444
Target Start/End: Original strand, 24088328 - 24088508
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctag 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||| || ||| |||      
T  24088328 tttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttcatgactacatgattgattaagattgatttattagttttcaaacttgattatgttacctta 24088427  T
Q  362 ctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatga 444  Q
    | |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||   |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  24088428 c-ttgagagttatcaaagttggccgtttgccacttgatacgg---ttttatcggaaatggttcttttaagccaattatcttatga 24088508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 42179328 - 42179475
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||| || |||| ||| ||||  |||||| |    
T  42179328 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg-tttttagtcggaaatgttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataa 42179426  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattg-tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  42179427 ctaagtggagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatc 42179475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8942696 - 8942609
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8942696 gtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 8942609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 66792 - 66677
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||   | |||||  |||||||||||||||||| || |    
T  66792 ggattttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaaactcatgactgtatgattgattaagattgatttat 66693  T
Q  333 aggatttcaaacttga 348  Q
      | ||||||||||||    
T  66692 tagttttcaaacttga 66677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Original strand, 12637274 - 12637361
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12637274 gtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 12637361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22283262 - 22283176
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22283262 aaattactaaacatgggtcatatggatttttgagaaaacttatcataacttttcctttgagctgtgaaacttttccaaacttgatat 22283176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 3800030 - 3800115
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3800030 aattgtcttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatc 3800115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22283146 - 22283058
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatctt 518  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  22283146 caattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatctt 22283058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25304790 - 25304694
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  25304790 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaggaggcttaagcttttgattacatgattgattaagattg 25304694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 636
Target Start/End: Original strand, 4449516 - 4449567
Alignment:
Q  585 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4449516 atgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 4449567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6094162 - 6094035
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctag 361  Q
    ||||||||||| | | |||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |  | || |||||||||||||||| ||| |    
T  6094162 tttgaactaatgtttgatagttcgtaactggcttaagttcatgactacatgattgatcaagattgatttgtgagtttccaaacttgaataagttaccttg 6094063  T
Q  362 ctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6094062 ttttgaaaattatcaatgttggtcgttt 6094035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28973130 - 28973016
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |  || | ||||  ||| ||||||||||    
T  28973130 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgact 28973032  T
Q  471 aagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||    
T  28973031 aagtgaagttgtatga 28973016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 8887013 - 8886963
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8887013 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8886963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22274029 - 22273943
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22274029 aaattactaaacatgggtcatatggatttttgagaaaacttatcataacatttcctttgagcagtgaaacttttccaaacttgatat 22273943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 25600834 - 25600784
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25600834 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 25600784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 5889583 - 5889632
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5889583 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 5889632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6878500 - 6878423
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 482  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6878500 tttttggtcggaaatatttcttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgt 6878423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 12637451 - 12637500
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12637451 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 12637500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 12643311 - 12643360
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12643311 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 12643360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 19888066 - 19888115
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19888066 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 19888115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21140746 - 21140697
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21140746 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 21140697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 21275813 - 21275862
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21275813 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 21275862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32738904 - 32738808
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  32738904 cttgggttttcttatacgaacttaagctatactctgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagctcatgattacatgattgattaagattg 32738808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25133452 - 25133301
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | | | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25133452 ggattttctcatacgaacttaggctaatctttgaactactgtttgatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgt 25133353  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagc-tttgaaaattatcaatgttgg 383  Q
      | ||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||| | ||||||    
T  25133352 gagttttcaaacttgagcaagttaccttgcttttgaaaattatgagtgttgg 25133301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45618681 - 45618618
Alignment:
Q  307 tacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaa 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45618681 tacatgattgattatgattgaattgtcggatttcaaacttgaataagttgctttgctttgaaaa 45618618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22273913 - 22273827
Alignment:
Q  431 caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| || |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22273913 caattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 22273827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 492
Target Start/End: Original strand, 22787088 - 22787215
Alignment:
Q  363 tttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattctt 462  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |  |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  | | ||||||||||||    
T  22787088 tttggaaattatcaatgttggccgtttgccagttgatacgg--taattgtcggaaatgttccttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattctt 22787185  T
Q  463 atatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  22787186 atatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 22787215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 43644262 - 43644312
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43644262 tgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 43644312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12726924 - 12726875
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12726924 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 12726875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23773663 - 23773540
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatt-tttgtgaaaacttatcataact-ttttcttta--agccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaa 99  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||  ||||||||||||||  || |||||| ||    
T  23773663 aaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatgggtt-aa 23773565  T
Q  100 tgaagtacttagagtgaataattga 124  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  23773564 tgaggtacttagagtgaataattga 23773540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 34823069 - 34823020
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34823069 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 34823020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 24295576 - 24295672
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24295576 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgttcaatggtttgtaagcggcttaagctcttgattacatgattggttaagattg 24295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 522 - 593
Target Start/End: Original strand, 42179632 - 42179706
Alignment:
Q  522 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata---atatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42179632 gtgatgataatgatgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaatatatatatatatatgatgttg 42179706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 461609 - 461566
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461609 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgt 461566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 7320362 - 7320319
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7320362 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 7320319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 498
Target Start/End: Original strand, 22581002 - 22581128
Alignment:
Q  370 attatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagc-caattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | ||||||||||||  ||||||   ||||| |||||||  || |  |||||||| || |||||    
T  22581002 attatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggatctttaaatcaattgtcttatgttttatcctgactatttttctatga 22581098  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22581099 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 22581128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22273758 - 22273708
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22273758 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 22273708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22282991 - 22282941
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22282991 tgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatga 22282941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Original strand, 25877236 - 25877285
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25877236 tgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 25877285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 636
Target Start/End: Original strand, 36891998 - 36892046
Alignment:
Q  587 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36891998 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatga 36892046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18535116 - 18535037
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||| || || | | |||||||||| |||||||||||    
T  18535116 tgactacatgattgattaagattgatttgtgagttttcaaacttgaacaaattactttgctttgaaaaatatcaatgttg 18535037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 22581219 - 22581262
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22581219 tgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgt 22581262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 24827855 - 24827898
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24827855 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 24827898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28972913 - 28972870
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28972913 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgt 28972870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 495
Target Start/End: Original strand, 9653982 - 9654040
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgat 495  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9653982 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat 9654040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 11232540 - 11232589
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11232540 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 11232589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19665825 - 19665771
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagttt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  19665825 cttgaattttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagttt 19665771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 22514387 - 22514436
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22514387 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 22514436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22862360 - 22862310
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22862360 tgatattgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatga 22862310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 23773406 - 23773356
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  23773406 tgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatga 23773356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 28776988 - 28777037
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28776988 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 28777037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 3800399 - 3800448
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3800399 tgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 3800448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Original strand, 20628684 - 20628720
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 622  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20628684 tgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg 20628720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 492
Target Start/End: Original strand, 24572544 - 24572580
Alignment:
Q  456 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24572544 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 24572580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 523 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 32464876 - 32464812
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata-atatatatat 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32464876 tgatgatattggtgaatccatatatgttgtttattatgatatggtggatgaatatatatatatat 32464812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 6878316 - 6878273
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6878316 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgt 6878273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 8942519 - 8942476
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8942519 tgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgt 8942476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Original strand, 22786967 - 22787054
Alignment:
Q  239 tctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||| |  | | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22786967 tctcatacgaacttaagttattctttggactattgtctaatagtctataggtggcttaagtttatgactacatgattgattaagattg 22787054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 721355 - 721313
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  721355 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgttgatg 721313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 22787313 - 22787355
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22787313 tgatgttgaatgatattgtggattattgatgatcatgttgatg 22787355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22862566 - 22862465
Alignment:
Q  376 aatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtg 475  Q
    ||||||||||| | ||||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  22862566 aatgttggccggtagccacttgacatgg-tttttagtcgaaaatgtttcttgaaccaattatcctaggaattgtggtgactatgtttatataactaagtg 22862468  T
Q  476 aag 478  Q
    |||    
T  22862467 aag 22862465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 629
Target Start/End: Original strand, 24572678 - 24572720
Alignment:
Q  587 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24572678 gatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgt 24572720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 24686955 - 24687005
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  24686955 tgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatga 24687005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 14907724 - 14907773
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  14907724 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 14907773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20013993 - 20013944
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  20013993 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 20013944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 454
Target Start/End: Original strand, 22691124 - 22691173
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtga 454  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22691124 tttttggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttatgatttgtcgtga 22691173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 454
Target Start/End: Original strand, 22695771 - 22695820
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtga 454  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22695771 tttttggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttatgatttgtcgtga 22695820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23819050 - 23819001
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  23819050 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 23819001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20014346 - 20014306
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatt 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  20014346 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatt 20014306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 28476 - 27964
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28476 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaa 28377  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376 gtacttagagtgaaaaattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 28277  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  28276 gggttttgagctaaaatgtc-ttttgtcttggattttctcatattaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtact 28178  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28177 tggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaatttgaataagttacctaactttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttg 28078  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28077 ga-tttttgttggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 27979  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  27978 aatatgatgtttatc 27964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 6740 - 6228
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6740 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaat 6641  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6640 gaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaa 6541  T
Q  201 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  6540 aacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttgagtc 6441  T
Q  301 cttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6440 cttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaagcttaaataagttg---tgctttaaaaattgtcaatgttggccgtttgccacatgttt 6344  T
Q  401 tggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-t 499  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6343 tgga-tttttgttggaaatgtttcttaagcaagttgtcttgtgggttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat 6245  T
Q  500 tgaatgtgatgtttatc 516  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6244 tgaatatgatgtttatc 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6051 - 6002
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6051 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 6002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 217036 - 217086
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  217036 tgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatga 217086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18212 - 17721
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18212 aaattactacacatgggtcatttgtatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatatttggtttaatgaa 18113  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18112 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaacgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcagagttgaatcgatgaaaac 18013  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18012 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggtttttcttatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcctt 17913  T
Q  304 gactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgg 403  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  17912 gactatatgatggattaagattaaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcagtttaccacacgatttgg 17813  T
Q  404 attttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17812 at-ttttgtcggaaatgtttctttagaaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 17721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 17521 - 17481
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17521 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 17481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 17612 - 17582
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17612 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 17582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 516
Target Start/End: Original strand, 154954 - 155466
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctt-taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatga 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  154954 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataatttttttttataagccgtgaaacttttccaaacttaataatgggtt-aacga 155052  T
Q  103 agtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 202  Q
     |||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155053 ggtacttatggtgaatgattgagtttgcatttatgtattttggaatgtgaatgtgttgttggttaag-aaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 155151  T
Q  203 cgggttttgagct-aaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcc 301  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  155152 cggattttgagctcaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttataatagtttgtaagtggcttaaatcc 155251  T
Q  302 ttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt 401  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155252 ttggctatatgattgattaagatcgaattgtaggatttcaaatttgaataagttgcctagctttaaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgattt 155351  T
Q  402 ggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-tt 500  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  155352 gga-tttttgtcggaaatatttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 155450  T
Q  501 gaatgtgatgtttatc 516  Q
    | || |||||||||||    
T  155451 ggatatgatgtttatc 155466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 155643 - 155692
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  155643 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 155692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 733 - 783
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  733 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1763
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcgtaactttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 1457  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1458 gtacttagagtggataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtattgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 1557  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcg-ttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1558 gggttttgagctaaatgtcgtttttgtcttgggttttctcatacgaacttaagctatcctttggactaatttctaatagtttgtaagtggcttaagtcct 1657  T
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  1658 tgactacatgtttgattaagattgaattgtagggtttcaaacttgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgtcacttgatatg 1757  T
Q  403 gatttt 408  Q
    ||||||    
T  1758 gatttt 1763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5041 - 4858
Alignment:
Q  262 tttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctag 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| ||||| |  |  | |||| |||||||||||  | | |      
T  5041 tttgaactaatgtctaatagtttgtaaggggcttgagctcatgactacatgattaattaaaattgattggttagttttccaacttgaataaagtacttta 4942  T
Q  362 ctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatga 444  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  4941 ttttgagaattatcaatgttggccgtttgccacatgatatgga-tttttgtcggaaatgattcttttaagccaattgtcttatga 4858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8565
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8182 attaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataacttttactttgagccgtggaacttttccaaacttgatattggatttgat 8281  T
Q  101 gaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtattt-gggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8282 gaagtacttagagtgaataattgagtaagcatttatgtattttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaatcggtaa 8381  T
Q  200 aaacgggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8382 aaacgggttttgagctaaatgttgttttgtcttggaatttctcatatgaacttaagctatcctttgaactaatttctaatagtttgcaagtggcttaagt 8481  T
Q  300 ccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttgg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8482 ccttgactacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttaaataagttgcctagctttaaaaattatcaatgttgg 8565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 404
Target Start/End: Original strand, 2343 - 2728
Alignment:
Q  21 tcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataa 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2343 tcatgtagatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataa 2442  T
Q  121 ttgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttggg-cggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa- 218  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2443 ttgagtatgcatttatctatttgagaatgtgaatgtgttgatggtctaagaaatattttggggcggagttaaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaa 2542  T
Q  219 tgtcgttttgtcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgat 318  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2543 tgtcgttttgtcttgagttttctcatacgaacttaagctatcctttgaactaatttataatagtttttaagtggcttaagtccttggctacatgattgat 2642  T
Q  319 taagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga 404  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2643 taagattgaattgtaggatttgaaacttgagtaagttgcctaactttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgga 2728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 875 - 632
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  875 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 776  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  775 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaattggtgaaaac 676  T
Q  204 gggttttgagctaaatgtcgttttgtcttggattttctcatacg 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  675 gggttttgaactaaatgtcgttttgtcttaagttttctcatacg 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 291 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 632 - 428
Alignment:
Q  291 ggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  632 ggcttaagtccttggctacatgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 533  T
Q  391 ccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattga 490  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  532 ccacatgatttgta-tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattatgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 434  T
Q  491 atgatt 496  Q
     |||||    
T  433 gtgatt 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 286
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  335 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatg 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8573 - 8350
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8573 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttt-ccaaacttgatattgggtttaatgaa 8475  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8474 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 8375  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  8374 gagttttgagctaaaatgtcgtttt 8350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8025 - 7757
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  8025 cttgggttttctcatacgaacttaagccattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgt-t 7927  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||| ||||| |    ||| ||| | ||||  |||| |||||||||| || ||||||| |||    || ||| |  |||||||| ||||||     
T  7926 ttgagagttttcgaactttatattgttaccttgttttgggaattgtcaatgttggtcggttgccacttgacacagactttat--cggaaatggttctttc 7829  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
     || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7828 aagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 7757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7625
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7666 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 732 - 508
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  732 aaattactacacatgggtaatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 633  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  632 gtacttagattgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 533  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  532 gggttttgagctaaaatgtcgtttt 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 103 - 5
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103 atgattgattaagattgaattgtaggattttaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttt 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 693
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  917 aaattattacacatgggtcatgtgcatttttgtgaaaacttatcataacttcttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattggttttaatgaa 818  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  817 gtacttcgagtgaataattcagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatagtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 718  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  717 gggtttttagctaaaatgtcgtttt 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 310 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 287 - 188
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  287 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctatctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggattttt 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 12583 - 12806
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12583 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgttggacttttccaaacatgatattgggtttaatgaa 12682  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  12683 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggt-aaaac 12781  T
Q  204 gggttttgagct-aaatgtcgtttt 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  12782 gggtttttagctaaaatgtcgtttt 12806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Original strand, 13264 - 13392
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||  ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  13264 aattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacatgg-tgtttggtcggaaatgtttcttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatga 13362  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13363 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 13481 - 13524
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13481 tgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 118668 - 118882
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  118668 aaattactacacttgggtcatgtggctttttgtgataacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggcgtaattaa 118767  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  118768 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 118867  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    |||||||||||||||    
T  118868 gggttttgagctaaa 118882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 110167 - 110256
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 93  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110167 aaattactacacttgggtcatgtggctttttgtgataacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 110256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Original strand, 119210 - 119299
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  119210 tttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtttaatactttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg 119299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41264 - 41050
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41264 aaattaatacacatgggtcacgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgat 41165  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41164 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgggaatgtgttgagggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaac 41065  T
Q  204 gggttttgagctaaa 218  Q
    | |||||||||||||    
T  41064 gagttttgagctaaa 41050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 40468 - 40422
Alignment:
Q  590 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40468 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 40422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 310 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29182 - 28995
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29182 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggat-ttt 29084  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29083 tgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 28995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 28906 - 28818
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28906 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 28818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 28758 - 28709
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28758 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 28709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 95695 - 95431
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||   | |||||| | ||| |||||| |  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  95695 ggattttctcatacgaacttaggctaatctttgaactaatgattgatagttcgtaagtggcttatgctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 95596  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  95595 aggttttcaaatttgaataagttgcctagcttcgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttcttgagcca 95497  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  95496 attgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 95431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 37867 - 37750
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37867 aaattactacacataggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataaatttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaa 37768  T
Q  104 gtacttagagtgaataat 121  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37767 gtacttagagtgaataat 37750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 586 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 95343 - 95257
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatg 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95343 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatg 95257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 95195 - 95146
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  95195 tgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 95146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 310 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 491 - 308
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  491 atgattgattaagattgaattataggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgca-tttt 393  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatga 494  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  392 tgtcgaaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatga 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 125
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 21
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  64 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 519 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 53394 - 53240
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataat 618  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53394 aaggtgatgattttgattaatccatatacattctttattatgatatggtgggtgaata-tatatatatgatgttgaatgacattgttgattattgataat 53296  T
Q  619 catgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53295 catgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 53240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 53602 - 53451
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53602 tcaatgttggccgtttgccacttgacacgg--ttttggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaag 53505  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgtttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53504 tgaagttgtatgattgaatgattgtttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 53451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53956 - 53862
Alignment:
Q  1 attaaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaa-cttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 94  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53956 attaaattactacacatgggtcatgtggattattgtgaaaaacatagcataactttttctatgaaccgtggaacttttccaaactggatattggg 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 53748 - 53653
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||| |||  ||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53748 cttgggttttatcatatgatcttaagttattctttgaactaaagt-taatagtttgtaagtggcttaagttcttaactacatgattgattaagattg 53653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 53179 - 53139
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 626  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53179 tgatgttggataacattgttgattattgatgatcatgttga 53139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21875 - 21623
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  21875 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatgatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 21776  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21775 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttagcaa 21677  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21676 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 21623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26130 - 25878
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||     |||||| | ||| ||| ||||  | |   || ||||||||||||||||||||| |    
T  26130 ggattttctcatacgaacttaggctaacctttgaactaatcatcgatagttcgtaagtggcctaagctcatacttatatgattgattaagattgaattgt 26031  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagcca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26030 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttgaccgtttaccacatgatttggat-ttttgtcggaaatgtttctttagcaa 25932  T
Q  433 attatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25931 attgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 25878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21519 - 21470
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  21519 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 21470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25774 - 25725
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  25774 tgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatg 25725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1206
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1382 aaattactacacatgggtcatatgaatttttatgaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 1283  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1282 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtacttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttg 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 123; Significance: 8e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 310 - 496
Target Start/End: Original strand, 38234 - 38419
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38234 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcactgttggccgtttaccacatgatttgga-tttt 38332  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  38333 tgtcggaaatgtttttttagcaaattgccttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgatt 38419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 40635 - 40539
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  40635 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 40539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 38619 - 38668
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38619 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 38668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40529 - 40434
Alignment:
Q  421 tttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttat 515  Q
    |||||| || |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  40529 tttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattggatatgatgtttat 40434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 40365 - 40315
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40365 tgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatga 40315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 312 - 486
Target Start/End: Original strand, 2587 - 2760
Alignment:
Q  312 gattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttg 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2587 gattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgtccagctttgaaaattatcaatgttggccgtttaccatatgatttgga-tttttg 2685  T
Q  412 tcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2686 tcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatga 2760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 2864 - 2913
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2864 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 36542 - 36599
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  36542 aaggtgatgatattggtgtatcgatatacattgtttattatgatttggtgggtgaata 36599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 625
Target Start/End: Original strand, 22997 - 23030
Alignment:
Q  592 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22997 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 23030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 36456 - 36484
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36456 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 36484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 310 - 496
Target Start/End: Original strand, 14444 - 14629
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttt 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  14444 atgattgattaagattaaattttaggattacaaacttgaataagttgcctcgctttgaaaattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttgga-ttta 14542  T
Q  410 tgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14543 tgtcggaaatgtttctttcaccaattgtcttgtaagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 54654 - 54593
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54654 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 54593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 109369 - 109418
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  109369 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 109418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 105549 - 105644
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  105549 cttgggttttctcatacgaacgtaagctattctttgaactaatatccaatagtttgtaagtggtttaagctcatggctacatgattgattaagatt 105644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18555 - 18277
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||  ||| ||     
T  18555 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaaattcatgactacatgattggttaagattg--tttgaga 18458  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaat 434  Q
    | |||||| ||||  |||||||| | |   ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18457 gctttcaa-cttgtctaagttgctttgtcctgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggattttg-gtcggaaatgtttcttgagccaat 18360  T
Q  435 tatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattg-tttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  18359 tgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgtatgattgaatgattgatttggatatgatgtttatc 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30345 - 30144
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30345 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagcggcttaaattcatgactacatgattgattaagattg--tt 30248  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttag 429  Q
    | || | |||| ||||||  |||||||| | |    |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| || ||    
T  30247 tgagagctttc-aacttgtctaagttgctttgtccagggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg-tttttgttcggaaatgtttattgag 30150  T
Q  430 ccaatt 435  Q
    ||||||    
T  30149 ccaatt 30144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 30062 - 30011
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttg-attattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  30062 tgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatcatgttaatgtgtgatga 30011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Original strand, 6298 - 6438
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6298 aaattactacacatgggtaatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctaagagccgtggaacttttcaaaacttgatattgagtttaatgaa 6397  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6398 gtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgg 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 52215 - 52474
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || |  |    
T  52215 ttttctcatatgaacttaagctattccatgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactatatgattgattaagattgatttattag 52314  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaatt 435  Q
     |||||||||||| || ||| |||  ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  52315 ttttcaaacttgattatgttaccttactt-gagatttatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg--tttggatcggaaatgtttcttgagccaatt 52411  T
Q  436 atcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  52412 gtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttatatgattgaatgattgt 52474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 56167 - 56426
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || |  |    
T  56167 ttttctcatatgaacttaagctattccatgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactatatgattgattaagattgatttattag 56266  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaatt 435  Q
     |||||||||||| || ||| |||  ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  56267 ttttcaaacttgattatgttaccttactt-gagatttatcaatgttggccgtttgccacttgatatgg--tttggatcggaaatgtttcttgagccaatt 56363  T
Q  436 atcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  56364 gtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttatatgattgaatgattgt 56426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 52562 - 52612
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52562 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatga 52612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 56514 - 56564
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  56514 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatga 56564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30477 - 30353
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  30477 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgag 30378  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30377 gtacttagagtgaataattgagtat 30353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 30222 - 30172
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30222 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatga 30172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 230 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20942 - 20679
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  20942 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattaatt 20843  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||      
T  20842 tgtgcgttttcaaacttgaataagttactttattttgagaattatcaatgttggctgtttgccacatgatttgga-tatttgtcggaaatgattctttta 20744  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    || ||||| ||||||||  | | |||||||  | |||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  20743 agtcaattgtcttatgatctttcgtgacta-gcctatatgactaagtggagatttgtgattgaatg 20679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 230 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27771 - 27508
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  27771 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattaatt 27672  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||      
T  27671 tgtgcgttttcaaacttgaataagttactttattttgagaattatcaatgttggctgtttgccacatgatttgga-tatttgtcggaaatgattctttta 27573  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    || ||||| ||||||||  | | |||||||  | |||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  27572 agtcaattgtcttatgatctttcgtgacta-gcctatatgactaagtggagatttgtgattgaatg 27508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20541
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20583 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatg 20541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 27412 - 27370
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27412 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatg 27370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 84829 - 84567
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  84829 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattgagt 84730  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
    | |  | |||| | |||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||   ||| ||||||||| ||||||      
T  84729 tatgagttttcgaccttgaataagttactttactttgagaattatcaatgttggccggttgccacttgatacgga--ctttatcggaaatggttctttta 84632  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  84631 agccagttatcttatgatcttttgtgactagccttaaatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 84567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 145551 - 145463
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145551 tgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 145463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 145769 - 145645
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  145769 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttgatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgact 145671  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  145670 aagtgaagttgtatgaatgaatgatt 145645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52543 - 52447
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  52543 cttgggttttctcatatgaacttgagctattctttgaactcatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactatatgattgattaagattg 52447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 145404 - 145355
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145404 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 145355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 147774 - 147733
Alignment:
Q  455 ctattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  147774 ctatgcttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 147733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 9)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 28521 - 28433
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28521 tgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 28433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 581 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 40522 - 40429
Alignment:
Q  581 atatatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40522 atatttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 40429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Original strand, 23350 - 23446
Alignment:
Q  229 tcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23350 tcttgggttttctcatacggacttaagttatcctttgaagtaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttattgactacatgattgattaagatt 23446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 28258 - 28205
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28258 tgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 28205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 40254 - 40201
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40254 tgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 40201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28372 - 28329
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28372 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 28329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 40368 - 40325
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40368 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 40325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 636
Target Start/End: Original strand, 14565 - 14602
Alignment:
Q  599 cattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14565 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 14602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 500
Target Start/End: Original strand, 14386 - 14466
Alignment:
Q  420 gtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||| | |||||| || || || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14386 gtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggtatgaatggatgattgttt 14466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 129718 - 129434
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  129718 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagcgcatgactacatgattgattaagattg--tt 129621  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--ttt 427  Q
    | || | |||| ||||||  |||||||| | |  |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||  ||     
T  129620 tgagagctttc-aacttgtctaagttgctttgtcttgggaactatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaatgtttcctttg 129524  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||| |||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  129523 aaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 129434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 90172 - 90222
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  90172 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 90222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 78921 - 78826
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  || ||  ||||||||||||||||||    
T  78921 cttgggttttctcatacggacttaagctaatctttgaactaatgtctaatagtttgtaagaggcttaagctctcgatcacatgattgattaagatt 78826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 129257 - 129208
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  129257 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatg 129208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Original strand, 39023 - 39083
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  39023 atgattgattaagattgaattgttggatttcatacttgaataagttttcttgctttgaaaa 39083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 625 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 78674 - 78625
Alignment:
Q  625 gatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  78674 gatgtgtgatgaattgtagatgttggatatgataattatcatgagatgtt 78625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 500
Target Start/End: Original strand, 89894 - 89977
Alignment:
Q  417 aatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||||||||| | |||||| ||||  || |||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  89894 aatgtttcttgaaccaattgtcttgagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttt 89977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 6)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Original strand, 25797 - 25923
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25797 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgact 25895  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25896 aagtgatgttgtatgattgaatgattgt 25923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 516
Target Start/End: Original strand, 70514 - 70614
Alignment:
Q  417 aatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttat 515  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  70514 aatgtatcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttat 70613  T
Q  516 c 516  Q
    |    
T  70614 c 70614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 70684 - 70734
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  70684 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatga 70734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 93743 - 93659
Alignment:
Q  416 aaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactat--tcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||| | | |||||| |||| ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  93743 aaatgtttcctgaaccaattgtcttttgaattgtggtgactatattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 93659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 636
Target Start/End: Original strand, 26014 - 26062
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  26014 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatga 26062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 93570 - 93527
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  93570 tgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgt 93527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 18718 - 18806
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18718 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcatagatgttgaatatgatatttatcattagatgtt 18806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 496
Target Start/End: Original strand, 18498 - 18623
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtga-ctattcttatatgac 469  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||    
T  18498 ttatccatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttgatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgac 18596  T
Q  470 taagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18597 taagtgaagttgtatgaatgaatgatt 18623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 18865 - 18908
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18865 tgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgt 18908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 968
Alignment:
Q  234 gattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttta 333  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||   | |||||| | ||| ||| ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  1133 gattttctcatacgaccttaggctaatctttgaactaatgattgatagttcgtaagtggcctaagctcatgactgcaagattgattaagattgaattgta 1034  T
Q  334 ggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  1033 ggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggtcgttttccacttgat 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24640 - 24487
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||| | | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24640 ttttctcagacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaaaagttcgtaggtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatggaattgtagg 24541  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540 gtttaaaacttgaataagttacctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 24487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38258
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaa 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38382 aaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttagcataactttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaa 38283  T
Q  104 gtacttagagtgaataattgagtat 128  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  38282 gtatttagagggaataattgagtat 38258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 38157 - 38108
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38157 tgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 38108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 7)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 271125 - 271045
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271125 atgattgattaagattgaattgtaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 271045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 399
Target Start/End: Original strand, 98030 - 98119
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  98030 atgattgattaagattgaattgtaggtttccaaacttgaacaagttaccttgctttgaaaattatcaatgttggttgtttgccacttgat 98119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 237275 - 237147
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || | || ||||| ||| ||| || |    
T  237275 aattatcaatgttagccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcgtaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataa 237177  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  237176 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 237147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 68756 - 68509
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||| | ||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  68756 cttgggttttctcatgcgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtgacttaagctcatgactacatgattgattaagattg--t 68659  T
Q  330 tttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    || || | |||||||||| |    ||| ||| |  |||  ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||   ||| ||||||||||||||||     
T  68658 ttgagagttttcaaactttatattgttaccttgtcttgggaattatcaatgttggtcatttgctacttgatatgga--ctttatcggaaatgtttctttt 68561  T
Q  428 -agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaag 478  Q
     |||||||||||||||||  | | |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  68560 gagccaattatcttatgatatttcgtgactagccttgtatgactaaatgaag 68509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 255281 - 255359
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || | ||||||||   ||||||||||||||||    
T  255281 atgattgattaagattgaattgtaagttttcaaacttgaatatgttg-cttgttttgaaaagagtcaatgttggccgttt 255359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 270996 - 270953
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  270996 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 270953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 237056 - 237013
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  237056 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgt 237013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Original strand, 1879 - 2038
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1879 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttttaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 1978  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| |||   | || ||||||||||||||||||||||    
T  1979 tatgagttttcaaacttgaataagttaccttattgtggaaattatcaatgttggccgttt 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 106920 - 106762
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||| || ||    
T  106920 ttgggttttctcatacgaacttaagctaacctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacaagattgattaagatggattt 106821  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     |||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106820 gtaggttttaaaacttgattaagttacatagctttgaaaattatcaatgttgaccgttt 106762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Original strand, 2881 - 3061
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2881 cttgggttttcttatacgaacttaagctatactttgaacaaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatt 2980  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccg-tttgccacatgatttggattttt 409  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| |||   | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  2981 tgtgagttttcaaacttgaataagttaccttaatgtggaaattatcaatgttggccgttttgccacttgatacggattttt 3061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5271 - 5179
Alignment:
Q  229 tcttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaa 321  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5271 tcttgggttttctcatacggacttaagctatcgtttgaactaatgcctaatagtttgtaagtggcttaagttattgactacatgattgattaa 5179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 23947 - 23863
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgaga 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23947 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgaattgtagatgttgaatatgatattgatcatgaga 23863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 24021
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaa 503  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24128 tttttggtcggaaatgtt-cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattgaa 24030  T
Q  504 tgtgatgtt 512  Q
    | |||||||    
T  24029 tatgatgtt 24021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 23803 - 23746
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23803 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 23746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1850 - 1696
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| || |  |    
T  1850 ttttctcatacgaacttaagctatacttttaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagtttgatttgtgag 1751  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttg 390  Q
     |||||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1750 ttttcaaacttgaataagttatcttattttggaaattatcaatgttggccgtttg 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 32209 - 32305
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  32209 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Original strand, 32315 - 32410
Alignment:
Q  421 tttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttat 515  Q
    |||||| || |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  32315 tttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattggatatgatgtttat 32410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 32479 - 32529
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32479 tgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatga 32529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 286
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  412 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggacggaaatgttttttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgact 314  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  313 aagtgaatttgtatgattgaatgattgt 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 12812 - 12959
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||| |    
T  12812 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tttttggtcggaaatgtttcttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataa 12910  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| || |||||||||||    
T  12911 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattttattggatatgatgtttatc 12959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 13028 - 13071
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13028 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 13071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 161
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 444
Target Start/End: Original strand, 90580 - 90796
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||  |    
T  90580 cttggattttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacttgattgattaagcttgttt 90679  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    | |  | |||||||||| |    |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||     
T  90680 tgtgagttttcaaactttatattgttgccttactttgagaaattatcgatgttggccgtttgccacatggtatgga-taattgtcggaaatgattctttt 90778  T
Q  428 -agccaattatcttatga 444  Q
     |||||||| ||||||||    
T  90779 aagccaattgtcttatga 90796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Original strand, 137885 - 138030
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||| || ||||||||||||    
T  137885 ttatcaatgttggccggtggcaactcgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgact 137983  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  137984 aagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttatc 138030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 87454 - 87402
Alignment:
Q  446 ttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87454 ttgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 87402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 138099 - 138149
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  138099 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 138149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10757 - 10645
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || | |||| |||| ||||||||||    
T  10757 ttatcaatgttggtcatttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgact 10659  T
Q  471 aagtgaagttgtat 484  Q
    ||||||||||||||    
T  10658 aagtgaagttgtat 10645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 87311 - 87263
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  87311 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatga 87263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10499
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgat 627  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10540 tgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgat 10499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 87516 - 87453
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaatt 435  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  87516 ttatcaatgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcgaaaatgtttcttgagccaatt 87453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 113251 - 113121
Alignment:
Q  89 attgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagt 188  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |    
T  113251 attgggtttaatcaagtctttagagtgaataattgagtatgtatttatggatttgggaatatgaatgtgttgatggtttgagaaattttttgggtggaat 113152  T
Q  189 tgaatcggtgaaaacggg-ttttgagctaaa 218  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  113151 tgaatcggagaaaaggggtttttgagctaaa 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 146017 - 145890
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |||| ||| ||| ||  || |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  146017 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttcctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgact 145918  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  145917 aagtgaagttgtataaatgaatgattgt 145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 145794 - 145761
Alignment:
Q  592 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  145794 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 145761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 14828 - 14975
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  14828 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgg 14926  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14927 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 14975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15201
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15152 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 15201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 3944 - 3682
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  3944 cttgggttttctcatacgaacttaagctatacttcgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcgtgaatacatgattgattaagattg--t 3847  T
Q  330 tttagga--tttcaaacttgaataa-gttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctt 426  Q
    |||| ||  |||||||||| | ||| ||| ||| | ||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||| || |  |||| ||||||||| |||||    
T  3846 tttaagagttttcaaactttattaatgttaccttgttttgggatttatcaatgttgg-cgtttgccacttgatatgaa--ttttatcggaaatggttctt 3750  T
Q  427 t--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatg 493  Q
    |  |||||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  3749 ttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagccttatatgactaa-tgaagatgtgtgaatgaatg 3682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 131131 - 130979
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagga 336  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || |  |     
T  131131 tttctcatacgaacttaagctattctttggactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacaagattgattaagattgagttgttagt 131032  T
Q  337 tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  131031 tttcaaacttgaataagttaccttgttttgaaaagtatcaatgttggtcgttt 130979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 113664 - 113776
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaa 503  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  113664 tttttggtcggaagtgttccttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattgaa 113763  T
Q  504 tgtgatgtttatc 516  Q
    | |||| ||||||    
T  113764 tatgatatttatc 113776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 378 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 108744 - 108628
Alignment:
Q  378 tgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtga 476  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||   | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  108744 tgttggccgtttgccacttgatatgg---tattgtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtga 108648  T
Q  477 agttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  108647 agttgtatgaatgaatgatt 108628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 113845 - 113887
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  113845 tgatgttgaatgacattgttgataattgataatcatgttgatg 113887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 105915 - 106010
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  105915 cttgggttttatcatacaatcttaagctattctttgaactaatgtttaatag-ttgtaagtggcttaagttcttgtttacatggttgattaagattg 106010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 34854 - 34970
Alignment:
Q  30 tttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtata 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  34854 tttttgtgaaaacttatcataactttctctaagagccgtgaaacttttctaaacttgatattgaatttaatgaagtacttagagcgaataattgagtatg 34953  T
Q  130 catttatgtatttggga 146  Q
     | | ||||||||||||    
T  34954 taatgatgtatttggga 34970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 248827 - 248877
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  248827 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 248877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 223320 - 223377
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  223320 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 223377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 223234 - 223262
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  223234 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 223262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 256014 - 256126
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaa 503  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  256014 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 256113  T
Q  504 tgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||||||||    
T  256114 tatgatgtttatc 256126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 262620 - 262732
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaa 503  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  262620 tttttggtcggaaatgtttcttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 262719  T
Q  504 tgtgatgtttatc 516  Q
    | |||||||||||    
T  262720 tatgatgtttatc 262732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 637
Target Start/End: Original strand, 75980 - 76031
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatgaa 637  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  75980 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaa 76031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 193486 - 193443
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  193486 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgt 193443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 636
Target Start/End: Original strand, 256199 - 256246
Alignment:
Q  590 gttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  256199 gttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 256246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 636
Target Start/End: Original strand, 262805 - 262852
Alignment:
Q  590 gttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  262805 gttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 262852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 124579 - 124629
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  124579 tgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatga 124629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3714 - 3588
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||| |||||||| | | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  3714 ttatccatgttggctggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgact 3616  T
Q  471 aagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  3615 aagtgaagttgtatgaataaatgattgt 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 3497 - 3454
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3497 tgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8328 - 8251
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgt 449  Q
    ||||| |||||||| | | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8328 ttatccatgttggctggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatganttgt 8251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 476
Target Start/End: Original strand, 1194 - 1437
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1194 ttgggttttctcatacgaactttagctattctttgaactaatgtctaatagcttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tt 1291  T
Q  331 ttag-gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttc--ttt 427  Q
    | || | |||| ||||||  |||||| | | |  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||||||  ||     
T  1292 tgagagctttc-aacttgtctaagtttctttgtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg--tttttgtcagaaatgtttcctttg 1388  T
Q  428 agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtga 476  Q
    | |||||| ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||    
T  1389 aaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtga 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 503
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||| | | |||||||||||||||| |||||||| |    
T  662 cttgggttttctcatacgaacttaagttatactttgaaccaacgtctaatagtttgtaagtggtttaatttcatgactacatgattgatcaagattgatt 563  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    | |  | |||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  562 tgtgagttttcaaacttgaataagttatcttattttgaaaattatcaatgttggccgttt 503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 381
Target Start/End: Original strand, 34360 - 34507
Alignment:
Q  234 gattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttta 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  34360 gattttctcatacgaacttaaactaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttgtg 34459  T
Q  334 ggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgtt 381  Q
     | ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  34460 agttttcaaacttgaacaagttactttgctttgaaaattatcaatgtt 34507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21290 - 21132
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  21290 ttgggttttctcacacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatactttgtaagtggcttaatctcatgactacatgattgattaagatggagtt 21191  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     | || ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21190 gtcggttttaaaacttgattaagttaccttgctttgaaaattatcaaagttggccgttt 21132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29290 - 29154
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29290 cttgggttttctcacacgaacttaagttaatctttgaactaatgtttactagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatggaat 29191  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttg 366  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29190 tgtaggttttaaaacttgaataagttgcctagctttg 29154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26811 - 26548
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26811 cttgggttttctcatacgaacttaagatattctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaacctcatgactacatgattgattaagattgatt 26712  T
Q  330 tttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgt-ttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt- 427  Q
    | |  | |||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||| | || ||||   ||| ||| ||||| ||||||     
T  26711 tgtgagttttcaaacttaaataggttaccttgttttgaaagttatcaatgttggctgtgttgccacttcatatgga--ctttatcgaaaatggttcttta 26614  T
Q  428 agccaattatcttatgagt-tgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    ||||||||||||||| | | | | |||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  26613 agccaattatcttataactctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaat 26548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 494
Target Start/End: Original strand, 330735 - 331001
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  330735 cttggattttctcatacggagttaagctaatctttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagctctggaccacatgatggattaagatt--at 330832  T
Q  330 tttag---gatttcaaacttgaat-aagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttct 425  Q
    ||| |   | |||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||   || | |||  |||||||| ||||    
T  330833 tttggtgagctttcaaacttgaatcaagttgttta-ctttggaaattatcaatgttgaccggttgtcacttaatacaga-tctttaccggaaatgattct 330930  T
Q  426 --ttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatga 494  Q
      |||||||||| |||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  330931 tcttagccaattgtcttgtgatttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 331001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 85657 - 85501
Alignment:
Q  233 ggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatttt 332  Q
    |||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  85657 ggattttctcatacgaacttgaactaatctttgaactaatgtttaatagttcgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaaaattgatttgt 85558  T
Q  333 aggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
      | |||||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  85557 gagttttcaaacttaaataggttaccttgtttcgaaaattatcaatgttggccgttt 85501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 369 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1001 - 874
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  1001 aattatcaatgttggctggttgccacttgatacgg-tttttggtcggaaatgtt-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacga 904  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  903 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 11076 - 11192
Alignment:
Q  11 tacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtactta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  11076 tacacatgggtcatgtggatttttgttaaaacttatcataactttttatttgagccgtagaacttttcaaaacttaataatggg-ttaatgaagtacttg 11174  T
Q  111 gagtgaataattgagtat 128  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  11175 gggtgaatgattgtgtat 11192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 11323 - 11373
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  11323 tgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatga 11373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 407
Target Start/End: Original strand, 13593 - 13770
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  13593 ttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgatctaatgtttaatagtttgtaagtggcttaagctcaggactacatgattgattaagattgatgt 13692  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataa-gttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattt 407  Q
     || | ||||||| || ||||| ||| ||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  13693 ataagctttcaaaatttaataatgttaccttgttttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatatggattt 13770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 498
Target Start/End: Original strand, 2925 - 2991
Alignment:
Q  432 aattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgt 2991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 629
Target Start/End: Original strand, 3082 - 3123
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3082 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 351
Target Start/End: Original strand, 24569 - 24690
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  24569 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatatctaatagtttgtaagtggcttaagttcttgattacatgattgtttaagatt--at 24666  T
Q  330 tttagga--tttcaaacttgaata 351  Q
    ||| |||  |||||||||||||||    
T  24667 tttgggagttttcaaacttgaata 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 500
Target Start/End: Original strand, 6466 - 6561
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6466 tttttggtcggaaatggttcttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 6561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 6647 - 6690
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6647 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1804 - 1707
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattga 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1804 cttgggttttctcatacgaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagatcatgattacatgattgattaagattga 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Original strand, 3222 - 3437
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  3222 ttgggttttctcatacggacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaactggcttaagctcatgactacttgattgattaagattgtttt 3321  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttga-aaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-- 427  Q
     |  | ||||||| || |    |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||      
T  3322 gtgagttttcaaattttatattgttgccttactttgagaaattatcgatgttggccgtttgccacatggtatgga-taattgtcggaaatgattctttta 3420  T
Q  428 agccaattatcttatga 444  Q
    |||||||| ||||||||    
T  3421 agccaattgtcttatga 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 7724 - 7871
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | ||||| |||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7724 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatgcgg---tattgtcagaaatggttctttcgagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatat 7820  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  7821 gactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatc 7871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 13113 - 13260
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | ||||| |||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13113 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatgcgg---tattgtcagaaatggttctttcgagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatat 13209  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  13210 gactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatc 13260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Original strand, 7941 - 7989
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7941 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgat 7989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Original strand, 13330 - 13378
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13330 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgat 13378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 18181 - 18138
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18181 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgt 18138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 20265 - 20222
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20265 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgt 20222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 1762 - 1876
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||   | |||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1762 ttatcaatgttggccgtttgccaattgattcgg---tattgtcggaaatggttctttcgagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatga 1858  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatga 486  Q
    |||||| |||||||||||    
T  1859 ctaagtaaagttgtatga 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 634
Target Start/End: Original strand, 1916 - 1961
Alignment:
Q  589 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgat 634  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1916 tgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgat 1961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5968 - 5872
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5968 cttgggttttatcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttatgttcttgattacatgattgattaagattg 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 326
Target Start/End: Original strand, 117545 - 117629
Alignment:
Q  242 catacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  117545 catacgaacttaagctatcctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 117629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 167191 - 167276
Alignment:
Q  4 aaattattacacattggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataactttttctttaagccgtggaacttttccaaacttgatat 90  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  167191 aaattactacacacgggtcatgtggatttttgtgaaa-cttatcataactttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatat 167276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 167462 - 167519
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  167462 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgataaggtgggtgaata 167519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6107 - 5982
Alignment:
Q  20 gtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataact-ttttctt--taagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||    
T  6107 gtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtga 6009  T
Q  117 ataattgagtatacatttatgtatttg 143  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  6008 ataattgaatatgcatgtatatatttg 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6160
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  6065 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttcacgactacatgattgattaagatt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47211 - 47089
Alignment:
Q  375 caatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagt 474  Q
    ||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||| | || |||||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47211 caatgttggtcggtggccacttgatatgg-tttttgggcgaaaatgtttattgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagt 47113  T
Q  475 gaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  47112 gaagttgtatgaatgaatgattgt 47089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 60659 - 60537
Alignment:
Q  375 caatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagt 474  Q
    ||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||| | || |||||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60659 caatgttggtcggtggccacttgatatgg-tttttgggcgaaaatgtttattgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagt 60561  T
Q  475 gaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  60560 gaagttgtatgaatgaatgattgt 60537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 47000 - 46957
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47000 tgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgt 46957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 60448 - 60405
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  60448 tgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgt 60405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21688 - 21601
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21688 gtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 21601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 21533 - 21483
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21533 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatga 21483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2041
Alignment:
Q  374 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaag 473  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   || ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  1916 tcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-ttttcggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaag 2014  T
Q  474 tgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2015 tgaagttgtatgaatgaatgattgttt 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 2127 - 2170
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2127 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 2170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 3735 - 3888
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    ||||||||||||||||   ||||   ||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  3735 ttttctcatacgaactgtggctaatctttgaactaatgtttaatagttcataagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattgatttatgag 3834  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
     || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3835 tttccaaacttgaataagttatcttgttttgaaaattatcaatgttggccgttt 3888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Original strand, 23393 - 23490
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattga 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  23393 cttgggttttctcatacgaacttaagttattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggtttaagctcatgactacatgattgattaagattga 23490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 385
Target Start/End: Original strand, 44508 - 44657
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |   | ||||||||||||||||||||||||| || |       
T  44508 ttttctcatacgaacttaagctaatctttgaactaatgtttaatagttcataagtggcttgaactcatgactacatgattgattaagattgatttgttat 44607  T
Q  336 atttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggcc 385  Q
     || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44608 tttccaaacttgaataagttaccttgttttgaaaattatcaatgttggcc 44657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1849 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1849
Description:

Target: scaffold1849; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 842
Alignment:
Q  130 catttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggtttt 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  922 catttatgtatttggcaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatgttttgggtggaattgaatcagtgaaaacgggtttt 842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1849; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 500 - 405
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  500 cttgggttttcgcatacggacttaagctgtactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagatt 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7746 - 7650
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7746 cttgggttttatcatgcgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgattacatgattgattaagattg 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13418 - 13323
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  13418 cttgggttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagattatgactacatgattgattaagatt 13323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 11869 - 11988
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||    
T  11869 ttgggttttctcataagaacttaagctaatcttcggactaatgtctaatagtctgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattacctt 11968  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaat 350  Q
     | || ||||||||||||||    
T  11969 gtgggttttcaaacttgaat 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 45116 - 45195
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    |||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45116 atgattgattaagattgatttgtgagttttcaaacttgaataagttgtctagctttgaaaattatcaatgttggtcgttt 45195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Original strand, 1027 - 1122
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1027 ttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaaggtcatgactacatgattgattaagattg 1122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2163
Alignment:
Q  246 cgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag-gatttcaaac 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||| |||    
T  2446 cgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgattgattaagattg--tttgagagctttc-aac 2350  T
Q  345 ttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcgg-aaatgtttcttt--agccaattatctta 441  Q
    |||  |||||||| | |  |||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||     
T  2349 ttgtctaagttgctttgtcttgggaatcatcaatgatggccgtttgccacttgatacgg--tttttgtcggaaaaagtttcttttgaaccaattttcttg 2252  T
Q  442 tgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg-aatgat----tgtttgaatgtgatgtttatcttaaggtga 525  Q
    | |  | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |    | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2251 taatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaaatggttatattttggaatgtgatgtttatcttaaggtga 2163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 2030
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2103 aaggtgatgatattggtgaatccatatatattgtttattatgatatggtgggtgaat-atatatatatgttgttg 2030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13281 - 13162
Alignment:
Q  377 atgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtga 476  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13281 atgttggccggtggccacttgatatgg-tttttagtcgaaaatgtttctcgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatggctaagtga 13184  T
Q  477 agttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  13183 atttgtatgaatgaatgattgt 13162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 13073 - 13031
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13073 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 13031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 753 - 611
Alignment:
Q  303 tgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |  | ||||||||||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  753 tgactacatgattgattaagattaatttgtgcgttttcaaacttgaataagttactttattttgagaattatcaatgttggtcatttgccacatgatttt 654  T
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttc--tttagccaattatcttatga 444  Q
    || | ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||    
T  653 ga-tatttgtcggaaatgattcatttaagccaattgtcttatga 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 425
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  467 tgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatg 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2452 - 2356
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattga 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  2452 ttgggttttctcatacgaacttaagctatactttcaactaatgtctaatagtttgtaagtagcttaagatcatgattacatgattgattaagattga 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 437 - 516
Target Start/End: Original strand, 1506 - 1586
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1506 tcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 413 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6490
Alignment:
Q  413 cggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgt 511  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  6594 cggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgt 6495  T
Q  512 ttatc 516  Q
    |||||    
T  6494 ttatc 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 6421 - 6371
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6421 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 6371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 519 - 593
Target Start/End: Original strand, 9323 - 9394
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9323 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtg---aatatatatatgatgttg 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 27800 - 27850
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27800 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 27850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30221 - 30099
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatat 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  | | |||||||  |||||||    
T  30221 aattatcaatgttggtcgtttgccacttgatatggattt---gtcggaaatgattcttttgagccaattatcttatgatctttcgtgactaaccttatat 30125  T
Q  467 gactaagtgaagttgtatgattgaat 492  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  30124 gactaaatgaagatgtatgagtgaat 30099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30254
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  30322 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatgtttaatagtttgtaagtggcttaag 30254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 198286 - 198382
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  198286 cttgggttttctcatacgaacttgagctattctttgaactaatatttaatagtttgtaagtggtttaagctcatgactacatgattgattaagattg 198382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 927 - 840
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  927 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgagtgattaaga 840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5895
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  5982 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgagtgattaaga 5895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 411 - 498
Target Start/End: Original strand, 524 - 611
Alignment:
Q  411 gtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  524 gtcggaaatgcttcttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatgaatgattgt 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 623
Target Start/End: Original strand, 686 - 719
Alignment:
Q  590 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3603
Alignment:
Q  409 ttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatg 505  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||     
T  3713 ttgtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggata 3614  T
Q  506 tgatgtttatc 516  Q
    |||||||||||    
T  3613 tgatgtttatc 3603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 3534 - 3484
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3534 tgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttgatgtgtgatga 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4515 - 4428
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  4515 ttttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtccaatagtttgtaagtggcttaagctcatgactacatgagtgattaaga 4428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6970 - 6831
Alignment:
Q  260 catttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcct 359  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| | |    
T  6970 cattcgaactaatgtctaatagtttgtaaatggcttaagttcatgattacatgagtgattaagattgagttgtgagttttcaaacttgaataagttactt 6871  T
Q  360 agctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatgat 399  Q
       ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6870 tattttgggaattatcaatgttgtccgtttgccacttgat 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12745 - 12675
Alignment:
Q  520 aggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12745 aggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatatggtgggtg---aatatatatatgatgttg 12675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 41581 - 41538
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41581 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 41538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 59938 - 59840
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaacta--atttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  59938 cttgggttttcttacacgaacttaagctatcctttgaactataatgtctaatagtttgtaagtggcttaagttcttgattacatgattaattaagattg 59840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 496
Target Start/End: Original strand, 2526 - 2651
Alignment:
Q  369 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt-agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatg 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||||| |||| || ||||   ||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  2526 aattgtcaatgttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatg 2622  T
Q  468 actaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2623 actaagtgaagttgtatgagtgaatgatt 2651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 2745 - 2788
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2745 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 2788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 325
Target Start/End: Original strand, 2401 - 2484
Alignment:
Q  242 catacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  | ||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2401 catacgaacttaagctattttttatactaatgtctaatagtccgtaagtgagttaagttcatgactacatgattgattaagatt 2484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 516
Target Start/End: Original strand, 43062 - 43176
Alignment:
Q  403 gattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttg 501  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || |||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  43062 gatttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatta 43161  T
Q  502 aatgtgatgtttatc 516  Q
    ||| |||||||||||    
T  43162 aatatgatgtttatc 43176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 628
Target Start/End: Original strand, 43245 - 43287
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatg 628  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43245 tgatgtttaatgacattgttgattattgatagttatgttgatg 43287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8307 - 8258
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8307 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatg 8258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8489 - 8396
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| | |||||| || || || || | ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8489 tttttagtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattatggtgactatgtttaaataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 8396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Original strand, 11061 - 11122
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11061 tcttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgt 11122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 11213 - 11256
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11213 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgt 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 498
Target Start/End: Original strand, 17505 - 17598
Alignment:
Q  405 ttttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||  || || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17505 tttttggtcggaaatgtttcctgaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 498
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24017
Alignment:
Q  378 tgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaa 477  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||  || || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23898 tgttggccggtggccacttgatatgg-tttttggtcggaaatgtttcctgaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaa 23996  T
Q  478 gttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  23997 gttgtatgaatgaataattgt 24017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 593
Target Start/End: Original strand, 24219 - 24286
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24219 tgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgatgtggtgggtg---aatatatatatgatgttg 24286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 630
Target Start/End: Original strand, 17687 - 17731
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17687 tgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgta 17731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 593
Target Start/End: Original strand, 17800 - 17867
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17800 tgatgatattgataaatccatatacattgtttattacgatgtggtgggtg---aatatatatatgatgttg 17867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34698 - 34530
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaat 329  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||       
T  34698 cttgggttttcttatgtgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttacgttcatgaccacatgattgattaagattg-tc 34600  T
Q  330 tttagga-tttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgtttgccacatga 398  Q
    || |||| |||||||||| |    ||| |||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34599 ttgaggattttcaaacttcatgttgttaccttcttttggaaattgtcaatgttggccgtttgccacatga 34530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 98119 - 98215
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattg 326  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  98119 cttgggttttctcatacaaacttgagctattctttgaaataatgtttaatagtttgtaagtggcttaagttcatgactacattattgattaagattg 98215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 69640 - 69590
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  69640 tgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatga 69590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 69688 - 69644
Alignment:
Q  627 tgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatcatgagat 671  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69688 tgtatgatgaaccgtggatgttgaatatgatatttatcaggagat 69644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 5497 - 5611
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgact 470  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||   | ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |  || | | || |||||||||||||||    
T  5497 ttatcaatgttggccgtatgccacttgatacag-tttttggtcagaaatgtttcttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgact 5595  T
Q  471 aagtgaagttgtatga 486  Q
    ||||||||||||||||    
T  5596 aagtgaagttgtatga 5611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 625
Target Start/End: Original strand, 6634 - 6667
Alignment:
Q  592 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttg 625  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6634 tgaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 6667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 382
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1962
Alignment:
Q  235 attttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaattttag 334  Q
    |||||| ||||||||| || ||||   |||||||||||   | |||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |      
T  1815 attttcgcatacgaacataggctaatctttgaactaatgcttgatagttcgtaagtggcttaagctcgtgactacatgattgattaagattgatttgtga 1914  T
Q  335 gatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttg 382  Q
    | |||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  1915 gttttcaaacttaaacaagttaccttgctttgaaaaatatcaatgttg 1962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6985 - 6861
Alignment:
Q  371 ttatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttcttt--agccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||   | |||||||||||| |||||   || ||||   ||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  6985 ttatcaatgttggccgtttgccacttgatacgg---tattgtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttatcgtgactattcatatatga 6889  T
Q  469 ctaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6888 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 6861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 6767 - 6724
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6767 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgt 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 32457 - 32407
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32457 tgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 32407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 32547 - 32518
Alignment:
Q  645 tgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32547 tgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 32518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 635
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2468
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2419 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatg 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 496
Target Start/End: Original strand, 2161 - 2220
Alignment:
Q  437 tcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2161 tcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 2220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 644 - 674
Target Start/End: Original strand, 2329 - 2359
Alignment:
Q  644 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329 atgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 2359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10837 - 10749
Alignment:
Q  236 ttttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  10837 ttttctcatacggacttaagctaatctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaagctcttgaccacatgatt-attaagatt 10749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6712 - 6644
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6712 cttgggttttctcatacaaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaag 6644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16137 - 16069
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16137 cttgggttttctcatacaaacttaagctatactttgaactaatgtctaatagtttgtaagtggcttaag 16069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4206 - 4145
Alignment:
Q  237 tttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  4206 tttctcatacgaacttaagctattctttgaactaatgtctaatagtttgtaagtgggttaag 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 523 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34331 - 34264
Alignment:
Q  523 tgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaataatatatatatgatgttg 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  34331 tgatgatattggtgaatccatatacattggttattatgatgtggtgggtg---aatatatatatgatgttg 34264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 34442 - 34400
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgta 630  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34442 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgta 34400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 34256 - 34220
Alignment:
Q  531 ttggtgaatccatatacattccttattatgatatggt 567  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34256 ttggtgagtccatatacattctttattatgatatggt 34220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 34704 - 34676
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34704 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 34676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 892
Alignment:
Q  230 cttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagatt 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  |||||||||||  || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  987 cttgggttttctcatacgaacttaagccacactttgaactaatacctaatagtttgtgagtggcttaagctcatgaccacatgattgattaagatt 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2056 - 2013
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgt 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2096
Alignment:
Q  461 ttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 516  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatc 2096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Original strand, 6437 - 6480
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6437 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgt 6480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Original strand, 17378 - 17428
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17378 tgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatga 17428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 636
Target Start/End: Original strand, 5902 - 5947
Alignment:
Q  591 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5902 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatga 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Original strand, 5755 - 5809
Alignment:
Q  446 ttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgttt 500  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5755 ttgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 383
Target Start/End: Original strand, 4831 - 4904
Alignment:
Q  310 atgattgattaagattgaattttaggatttcaaacttgaataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttgg 383  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  | | |||||||||| | ||||||||||    
T  4831 atgattgattaagattgaattgtaggttttcaaacttgaacaagtgactttgctttgaaaagtgtcaatgttgg 4904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 498
Target Start/End: Original strand, 71558 - 71651
Alignment:
Q  406 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt 498  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  71558 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatgaatgaatgattgt 71651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 621
Target Start/End: Original strand, 71741 - 71774
Alignment:
Q  588 atgttgaatgacattgttgattattgataatcat 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71741 atgttgaatgacattgttgattattgataatcat 71774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 521 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 1454 - 1399
Alignment:
Q  521 ggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1454 ggtgatgatattggtgtatcgatatacattgtttattatgatatggtgggtgaata 1399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 2443 - 2562
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||   ||    
T  2443 ttgggttttctcataagaacttaagctaatgttcggactaatgtctaatagtctgtaagtggcttaagctcatgactacacgattgattaagattatctt 2542  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaat 350  Q
     | || ||||||||||||||    
T  2543 gtgggttttcaaacttgaat 2562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Original strand, 10698 - 10817
Alignment:
Q  231 ttggattttctcatacgaacttaagctatcatttgaactaatttctaatagtttgcaaggggcttaagtccttgactacatgattgattaagattgaatt 330  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   || | |||||| ||||||||| || ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||   ||    
T  10698 ttgggttttctcataagaacttaagctaatgttcggactaatgtctaatagtctgtaagtggcttaagctcatgactacacgattgattaagattatctt 10797  T
Q  331 ttaggatttcaaacttgaat 350  Q
     | || ||||||||||||||    
T  10798 gtgggttttcaaacttgaat 10817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14503
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14554 tgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgttaatgtgtgatga 14503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2260
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgt 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2303 tgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgt 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2455 - 2397
Alignment:
Q  438 cttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgatt 496  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2455 cttatgatttatcgtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgatt 2397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 8953 - 8903
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatga 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  8953 tgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatga 8903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 9001 - 8963
Alignment:
Q  627 tgtatgatgaatcgtagatgttgaatatgatatttatca 665  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9001 tgtatgatgaaccgtagatgttgaatatgttatttatca 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 576
Target Start/End: Original strand, 7260 - 7316
Alignment:
Q  519 aaggtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtgaata 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  7260 aaggtgatgatattggtgaatccatatacattgtttattatgata-agtgggtgaata 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36992 - 36951
Alignment:
Q  348 aataagttgcctagctttgaaaattatcaatgttggccgttt 389  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36992 aataagttacctagctttgaaaattatcaatgttgaccgttt 36951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 2662 - 2615
Alignment:
Q  525 atgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggtgggtg 572  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2662 atgatattggtgagtccatatacattgtttattatgatatggtgggtg 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4681
Alignment:
Q  586 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatca 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4715 tgatgttgaatgacattgttgattgttgataatca 4681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16827 - 16782
Alignment:
Q  522 gtgatgattttggtgaatccatatacattccttattatgatatggt 567  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16827 gtgatgatattggtgagtccatatacattgtttattatgatatggt 16782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 527
Target Start/End: Original strand, 24259 - 24287
Alignment:
Q  499 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24259 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatg 24287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University