View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6845_low_1 (Length: 801)

Name: NF6845_low_1
Description: NF6845
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6845_low_1
NF6845_low_1
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (19-336)||(27622911-27623228)
chr6 (19-328)||(27283574-27283883)
chr6 (29-335)||(13517400-13517713)
chr6 (22-328)||(30551193-30551506)
chr6 (34-267)||(33369703-33369944)
chr6 (34-267)||(29556241-29556482)
chr6 (22-267)||(27200870-27201123)
chr6 (22-267)||(27248110-27248363)
chr6 (51-267)||(4539032-4539256)
chr6 (19-267)||(28214138-28214394)
chr6 (29-265)||(34457761-34458005)
chr6 (32-267)||(29579717-29579960)
chr6 (49-267)||(26792516-26792742)
chr6 (22-252)||(27064174-27064412)
chr6 (51-267)||(26109674-26109899)
chr6 (34-267)||(27014409-27014650)
chr6 (34-267)||(29508106-29508347)
chr6 (22-328)||(27491811-27492125)
chr6 (34-252)||(14138689-14138915)
chr6 (34-328)||(27209584-27209886)
chr6 (34-328)||(27239342-27239644)
chr6 (1-267)||(27355356-27355630)
chr6 (49-252)||(4764462-4764673)
chr6 (34-267)||(26927437-26927679)
chr6 (22-267)||(26665910-26666163)
chr6 (22-267)||(26771881-26772134)
chr6 (43-267)||(28167188-28167420)
chr6 (49-328)||(4531994-4532280)
chr6 (34-267)||(16756506-16756748)
chr6 (22-267)||(4779584-4779837)
chr6 (22-267)||(16937279-16937532)
chr6 (28-267)||(8898950-8899197)
chr6 (22-267)||(16680832-16681085)
chr6 (34-335)||(24298966-24299275)
chr6 (51-267)||(15405803-15406028)
chr6 (51-267)||(15417590-15417815)
chr6 (43-267)||(24870402-24870635)
chr6 (34-328)||(27031706-27032008)
chr6 (43-328)||(22928067-22928360)
chr6 (34-328)||(13292157-13292460)
chr6 (34-328)||(27025827-27026129)
chr6 (82-328)||(20131253-20131500)
chr6 (82-328)||(22201370-22201617)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (516-793)||(15775710-15775987)
chr8 (148-336)||(15775288-15775476)
chr8 (22-267)||(29836023-29836276)
chr8 (29-265)||(28355223-28355467)
chr8 (22-272)||(33265420-33265678)
chr8 (43-267)||(18716177-18716409)
chr8 (19-328)||(12085937-12086253)
chr8 (22-265)||(31483142-31483393)
chr8 (60-328)||(31361267-31361542)
chr8 (43-329)||(22074135-22074429)
chr8 (22-267)||(44567680-44567934)
chr8 (22-265)||(19201654-19201906)
chr8 (22-267)||(19681156-19681409)
chr8 (43-328)||(18797404-18797697)
chr8 (34-328)||(21341394-21341697)
chr8 (34-328)||(14569841-14570143)
chr8 (34-328)||(15774260-15774562)
chr8 (34-267)||(2130552-2130794)
chr8 (34-335)||(19694802-19695111)
chr8 (22-267)||(9361304-9361556)
chr8 (32-267)||(22139598-22139842)
chr8 (34-328)||(33249049-33249351)
chr8 (45-328)||(16260635-16260926)
chr8 (45-267)||(19654610-19654841)
chr8 (34-328)||(27602137-27602439)
chr8 (51-267)||(19910451-19910676)
chr8 (521-670)||(15775884-15776032)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (516-793)||(24813123-24813400)
chr4 (148-336)||(24813634-24813822)
chr4 (22-328)||(54840097-54840410)
chr4 (22-328)||(31119756-31120069)
chr4 (22-328)||(21976410-21976723)
chr4 (29-265)||(20331743-20331987)
chr4 (29-267)||(27156632-27156878)
chr4 (34-328)||(14752762-14753063)
chr4 (22-328)||(40098879-40099192)
chr4 (32-267)||(6576552-6576796)
chr4 (43-328)||(5701256-5701548)
chr4 (43-329)||(15379482-15379776)
chr4 (49-267)||(18793949-18794175)
chr4 (34-267)||(36323643-36323884)
chr4 (34-267)||(36337852-36338093)
chr4 (43-267)||(39857342-39857574)
chr4 (43-335)||(15275864-15276164)
chr4 (32-267)||(5012597-5012841)
chr4 (43-327)||(15234546-15234838)
chr4 (22-267)||(33667107-33667360)
chr4 (32-266)||(1906984-1907227)
chr4 (34-267)||(24119359-24119601)
chr4 (34-328)||(24585616-24585918)
chr4 (22-267)||(14105250-14105503)
chr4 (22-267)||(30760470-30760723)
chr4 (34-267)||(34182263-34182504)
chr4 (148-328)||(24814547-24814726)
chr4 (34-267)||(17019747-17019989)
chr4 (43-189)||(14671717-14671871)
chr4 (521-670)||(24813078-24813226)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (516-793)||(13178078-13178355)
chr5 (148-336)||(13178636-13178824)
chr5 (22-328)||(15752004-15752317)
chr5 (22-328)||(30036128-30036441)
chr5 (22-328)||(33523086-33523399)
chr5 (29-335)||(33881815-33882128)
chr5 (22-267)||(31819627-31819880)
chr5 (29-265)||(40466757-40467001)
chr5 (34-267)||(6881007-6881248)
chr5 (34-267)||(9543934-9544175)
chr5 (22-328)||(18493914-18494227)
chr5 (51-328)||(37351810-37352094)
chr5 (22-267)||(37745555-37745808)
chr5 (32-327)||(22895119-22895422)
chr5 (22-267)||(28953001-28953254)
chr5 (22-328)||(43084956-43085262)
chr5 (22-267)||(9324165-9324419)
chr5 (22-267)||(26487075-26487329)
chr5 (43-267)||(2517768-2518000)
chr5 (22-269)||(12138864-12139119)
chr5 (29-328)||(30158729-30159035)
chr5 (34-267)||(18121639-18121881)
chr5 (22-267)||(3796235-3796488)
chr5 (34-267)||(15651967-15652208)
chr5 (22-267)||(32589481-32589734)
chr5 (22-267)||(37761676-37761929)
chr5 (29-265)||(11330343-11330587)
chr5 (49-335)||(24730678-24730971)
chr5 (49-267)||(31438166-31438392)
chr5 (43-328)||(8658639-8658931)
chr5 (43-327)||(25207012-25207304)
chr5 (43-327)||(25271168-25271460)
chr5 (22-267)||(34623201-34623454)
chr5 (22-267)||(5644502-5644755)
chr5 (22-335)||(13317965-13318285)
chr5 (22-335)||(30175170-30175490)
chr5 (22-267)||(28655947-28656200)
chr5 (28-267)||(37664710-37664957)
chr5 (22-267)||(13435875-13436128)
chr5 (22-267)||(18368736-18368989)
chr5 (34-328)||(23726931-23727233)
chr5 (32-328)||(23898587-23898892)
chr5 (43-267)||(41681408-41681638)
chr5 (34-328)||(11556048-11556350)
chr5 (34-267)||(23632664-23632906)
chr5 (34-328)||(22992286-22992588)
chr5 (57-328)||(13179962-13180241)
chr5 (53-267)||(33299249-33299472)
chr5 (34-328)||(33784176-33784478)
chr5 (34-328)||(24976538-24976840)
chr5 (34-267)||(24608939-24609181)
chr5 (34-267)||(30941324-30941566)
chr5 (521-670)||(13178033-13178181)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (516-793)||(3790872-3791149)
chr2 (148-336)||(3790473-3790661)
chr2 (22-328)||(19409718-19410031)
chr2 (22-328)||(13929845-13930158)
chr2 (22-328)||(37932072-37932385)
chr2 (22-267)||(3789138-3789391)
chr2 (22-328)||(16822572-16822885)
chr2 (22-328)||(16898595-16898908)
chr2 (29-328)||(37679132-37679438)
chr2 (29-328)||(37694397-37694703)
chr2 (22-328)||(32056447-32056760)
chr2 (29-265)||(253948-254192)
chr2 (22-265)||(21670469-21670720)
chr2 (29-263)||(34297851-34298093)
chr2 (43-335)||(27397051-27397351)
chr2 (29-265)||(9343283-9343527)
chr2 (29-265)||(16168180-16168424)
chr2 (29-265)||(27810405-27810649)
chr2 (29-265)||(39045178-39045423)
chr2 (32-327)||(21696423-21696726)
chr2 (22-328)||(39896764-39897077)
chr2 (22-335)||(22921371-22921691)
chr2 (43-335)||(31882987-31883286)
chr2 (29-265)||(37945161-37945405)
chr2 (29-267)||(12593516-12593762)
chr2 (22-267)||(34161536-34161789)
chr2 (43-267)||(37384371-37384603)
chr2 (49-335)||(12709851-12710144)
chr2 (22-267)||(11628479-11628732)
chr2 (22-267)||(34868329-34868582)
chr2 (32-267)||(34268216-34268460)
chr2 (43-267)||(27123216-27123448)
chr2 (22-265)||(27782918-27783169)
chr2 (43-335)||(19449638-19449939)
chr2 (49-267)||(40240245-40240471)
chr2 (34-267)||(23117481-23117723)
chr2 (43-272)||(27427761-27428000)
chr2 (34-323)||(28888939-28889236)
chr2 (34-267)||(31868102-31868344)
chr2 (34-140)||(20844600-20844706)
chr2 (34-267)||(12662175-12662418)
chr2 (606-670)||(3791130-3791194)
chr2 (227-335)||(20844802-20844909)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (34-336)||(3451936-3452246)
chr7 (22-333)||(26268209-26268527)
chr7 (29-328)||(26678233-26678539)
chr7 (516-670)||(3452501-3452655)
chr7 (19-317)||(26508848-26509154)
chr7 (29-328)||(26663041-26663347)
chr7 (29-265)||(16744711-16744955)
chr7 (22-267)||(31083812-31084066)
chr7 (34-328)||(2779929-2780230)
chr7 (49-335)||(31130616-31130910)
chr7 (22-267)||(26441938-26442191)
chr7 (29-267)||(26596356-26596603)
chr7 (22-328)||(31557533-31557847)
chr7 (22-267)||(26313052-26313306)
chr7 (22-267)||(4206069-4206322)
chr7 (22-267)||(45393913-45394166)
chr7 (22-265)||(4138436-4138687)
chr7 (22-267)||(11447582-11447835)
chr7 (34-267)||(22148573-22148814)
chr7 (43-327)||(16443134-16443426)
chr7 (22-267)||(26519501-26519754)
chr7 (43-323)||(16048027-16048315)
chr7 (43-267)||(39206353-39206585)
chr7 (43-267)||(45737995-45738227)
chr7 (516-667)||(26267899-26268050)
chr7 (22-265)||(24585726-24585978)
chr7 (34-328)||(11417931-11418233)
chr7 (34-267)||(5154768-5155010)
chr7 (57-267)||(5140526-5140744)
chr7 (43-328)||(10848299-10848592)
chr7 (34-215)||(22152800-22152989)
chr7 (34-215)||(22208715-22208904)
chr7 (43-335)||(5165078-5165378)
chr7 (34-328)||(2161257-2161558)
chr7 (34-267)||(16511637-16511879)
chr7 (34-335)||(10910071-10910380)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (22-328)||(24334835-24335148)
chr3 (22-335)||(18231851-18232171)
chr3 (22-328)||(28109250-28109564)
chr3 (22-328)||(10649730-10650042)
chr3 (22-328)||(17978238-17978551)
chr3 (22-328)||(5020370-5020683)
chr3 (22-267)||(6536090-6536343)
chr3 (34-267)||(11103731-11103972)
chr3 (22-335)||(28345830-28346150)
chr3 (29-265)||(5589705-5589949)
chr3 (29-265)||(5717721-5717965)
chr3 (29-265)||(5728631-5728875)
chr3 (29-265)||(5763493-5763737)
chr3 (29-265)||(29658316-29658560)
chr3 (34-267)||(31029613-31029854)
chr3 (34-267)||(32445801-32446042)
chr3 (43-328)||(16617776-16618070)
chr3 (43-328)||(22041087-22041381)
chr3 (29-328)||(32297297-32297603)
chr3 (32-266)||(4340047-4340289)
chr3 (34-328)||(18285666-18285967)
chr3 (34-328)||(18300967-18301268)
chr3 (22-267)||(22864211-22864464)
chr3 (22-267)||(22879270-22879523)
chr3 (22-335)||(31957736-31958056)
chr3 (34-267)||(4630430-4630671)
chr3 (22-265)||(47030114-47030366)
chr3 (49-267)||(4423582-4423808)
chr3 (22-267)||(17970227-17970481)
chr3 (22-328)||(18249377-18249690)
chr3 (22-267)||(5602660-5602913)
chr3 (22-267)||(20570203-20570456)
chr3 (34-252)||(5473638-5473864)
chr3 (1-267)||(16404139-16404413)
chr3 (43-267)||(48472590-48472822)
chr3 (49-267)||(21681406-21681632)
chr3 (22-267)||(10402811-10403064)
chr3 (22-267)||(51788681-51788934)
chr3 (43-267)||(20072693-20072925)
chr3 (43-328)||(15367923-15368217)
chr3 (32-328)||(19701064-19701368)
chr3 (22-267)||(28027930-28028183)
chr3 (34-328)||(29142063-29142365)
chr3 (34-328)||(35887409-35887711)
chr3 (22-267)||(8218284-8218537)
chr3 (34-328)||(4728275-4728577)
chr3 (34-328)||(5658783-5659085)
chr3 (34-328)||(6208544-6208846)
chr3 (34-328)||(18057917-18058219)
chr3 (34-328)||(4789940-4790242)
chr3 (34-328)||(8282769-8283071)
chr3 (32-328)||(16422854-16423158)
chr3 (148-267)||(16599406-16599525)
chr3 (34-328)||(15886026-15886328)
chr3 (34-328)||(18337273-18337575)
chr3 (34-267)||(22380949-22381191)
chr3 (148-328)||(7080022-7080201)
chr3 (34-328)||(4690324-4690626)
chr3 (51-328)||(15734425-15734710)
chr3 (34-138)||(7079877-7079981)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (22-323)||(51644921-51645229)
chr1 (22-267)||(10951791-10952044)
chr1 (49-265)||(10969369-10969593)
chr1 (22-267)||(3647846-3648099)
chr1 (22-267)||(28591780-28592033)
chr1 (32-328)||(16201276-16201580)
chr1 (43-267)||(28156425-28156657)
chr1 (43-267)||(41786640-41786872)
chr1 (51-323)||(20333667-20333947)
chr1 (34-328)||(14692162-14692464)
chr1 (34-328)||(14694844-14695146)
chr1 (34-328)||(14697528-14697830)
chr1 (34-328)||(14700209-14700511)
chr1 (43-323)||(20467504-20467792)
chr1 (34-187)||(21891136-21891297)
chr1 (159-232)||(13769558-13769631)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (19-267)||(14636-14892)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (29-267)||(2361-2607)
scaffold0322 (43-328)||(12769-13062)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (43-328)||(8187-8479)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (43-335)||(28012-28310)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (22-267)||(10615-10869)
scaffold0143 (34-328)||(33981-34283)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (34-328)||(12725-13026)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (22-267)||(2483-2736)
scaffold0159 (22-99)||(18505-18582)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (43-335)||(25808-26108)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (22-267)||(16273-16526)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (43-327)||(490-782)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (34-335)||(24212-24521)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (34-267)||(3921-4163)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (34-267)||(8966-9209)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (34-139)||(40064-40171)
scaffold0099 (224-267)||(39922-39965)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (224-328)||(1309-1412)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (34-90)||(6751-6807)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (224-267)||(13281-13324)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27623228 - 27622911
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623228 cataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctaccctcagccatggttctggtacgtctcccaacgg 27623129  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27623128 cgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtc 27623029  T
Q  219 aaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcattt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623028 aaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcattt 27622929  T
Q  319 gcaatatcaatgtcagtg 336  Q
     |||||||||||||||||    
T  27622928 ccaatatcaatgtcagtg 27622911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27283883 - 27283574
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283883 cataacggcgttatccccagtcgggtcttccagaattctatccccagtaagttgattagctatctaccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 27283784  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtc-gtgtctacaaactat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | | ||  | |||||||||||||      
T  27283783 cgttatctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctcttcaaaactgtgtctacaaactgc 27283684  T
Q  218 caaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatt 317  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27283683 caacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatt 27283585  T
Q  318 tgcaatatcaa 328  Q
    | |||| ||||    
T  27283584 tccaatgtcaa 27283574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13517713 - 13517400
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  13517713 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 13517614  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  13517613 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 13517514  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  13517513 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 13517415  T
Q  321 aatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||||||| |||||    
T  13517414 aatatcaatatcagt 13517400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30551506 - 30551193
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30551506 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 30551407  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30551406 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 30551307  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  30551306 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 30551208  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30551207 catttccaatgtcaa 30551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33369944 - 33369703
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33369944 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33369845  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  33369844 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 33369745  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33369744 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 33369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 29556241 - 29556482
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  29556241 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctatctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtcatcttcaaaaa 29556340  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  29556341 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 29556440  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29556441 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29556482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 27200870 - 27201123
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27200870 aacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 27200969  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27200970 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 27201069  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27201070 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27201123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27248363 - 27248110
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248363 aacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 27248264  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27248263 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 27248164  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27248163 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27248110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4539256 - 4539032
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga----- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||         
T  4539256 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 4539157  T
Q  146 ---tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattc 242  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||||    
T  4539156 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattc 4539057  T
Q  243 atacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  4539056 atacatgcataatcatgcatattac 4539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 28214138 - 28214394
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28214138 cataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacga 28214237  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctac 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28214238 cgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctac 28214337  T
Q  211 aaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28214338 aaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28214394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34458005 - 34457761
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34458005 ttttccccagtcaggtcttccaagactctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 34457906  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  34457905 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 34457806  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34457805 cagtcatgcgttacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 34457761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 29579717 - 29579960
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  29579717 tccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcacacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccata 29579816  T
Q  132 gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||||||| | ||        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||      
T  29579817 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacag 29579916  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579917 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29579960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 26792516 - 26792742
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||       
T  26792516 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcgtctccaaagaggatttccaagaatg 26792615  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  26792616 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 26792715  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792716 tcatacatgcataatcatgcatattac 26792742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Original strand, 27064174 - 27064412
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  27064174 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagtcgcatacttgcctgccctcagccatggttctgatacgtctcccaacgacgt 27064273  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27064274 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 27064373  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcat 252  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27064374 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcat 27064412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26109899 - 26109674
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaa-cggcgttatctccaaagaggatttctatgatg-- 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | || |      
T  26109899 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggt 26109800  T
Q  148 ------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  26109799 gtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcatt 26109700  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26109699 catacatgcataatcatgcatattac 26109674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 27014409 - 27014650
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27014409 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagtcgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27014508  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  27014509 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 27014608  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27014609 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27014650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 29508106 - 29508347
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29508106 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttacatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 29508205  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  29508206 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 29508305  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29508306 atgcattacaagcattcatacatgcataattatgcatattac 29508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 27491811 - 27492125
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  27491811 aacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggtcccgaaacgtctcccaacgacg 27491910  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | || |        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27491911 tcatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 27492010  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgtt 312  Q
    | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  27492011 aatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatatt 27492109  T
Q  313 gcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||| |||| ||||    
T  27492110 gcatttccaatgtcaa 27492125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14138915 - 14138689
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14138915 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14138816  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  14138815 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 14138716  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcat 252  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14138715 atgcattacaagcattcatacatgcat 14138689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 27209584 - 27209886
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27209584 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 27209683  T
Q  134 ggattt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  27209684 ggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 27209783  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  27209784 catgcattacaagcattcatacatgcataaccatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatg 27209882  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  27209883 tcaa 27209886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27239644 - 27239342
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27239644 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 27239545  T
Q  134 ggattt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  27239544 ggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 27239445  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  27239444 catgcattacaagcattcatacatgcataaccatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatg 27239346  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  27239345 tcaa 27239342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27355630 - 27355356
Alignment:
Q  1 cagcaatgagatggacatcataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttc 100  Q
    ||||| |||||||  || || ||||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||    
T  27355630 cagcactgagatgcccagcacaacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctc 27355531  T
Q  101 cggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttcc 192  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27355530 cgatacgtcccccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttcc 27355431  T
Q  193 ccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27355430 ccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27355356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Original strand, 4764462 - 4764673
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4764462 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4764561  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4764562 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4764661  T
Q  241 tcatacatgcat 252  Q
    ||||||||||||    
T  4764662 tcatacatgcat 4764673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 26927437 - 26927679
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927437 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcgagttgattagctatctatcctcagccttggttccgatacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 26927536  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  26927537 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 26927636  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26927637 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26927679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26666163 - 26665910
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  26666163 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgt 26666064  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26666063 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26665964  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26665963 ctgccaacagtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26665910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26772134 - 26771881
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  26772134 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgt 26772035  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26772034 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26771935  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26771934 ctgccaacagtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 28167188 - 28167420
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  28167188 gtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28167287  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  28167288 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 28167387  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28167388 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28167420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 328
Target Start/End: Original strand, 4531994 - 4532280
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4531994 caagattctatccccagcaagttgcatagctaccagccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4532093  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4532094 tgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4532193  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  4532194 tcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 4532280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 16756506 - 16756748
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16756506 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 16756605  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  16756606 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 16756705  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16756706 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16756748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 4779584 - 4779837
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  4779584 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgt 4779683  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4779684 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaaaattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 4779783  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4779784 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4779837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16937532 - 16937279
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16937532 aacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagtcacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 16937433  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||| || ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16937432 catctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 16937333  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16937332 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16937279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8899197 - 8898950
Alignment:
Q  28 gttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 127  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  8899197 gttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctc 8899098  T
Q  128 caaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 219  Q
    || ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  8899097 catagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgcca 8898998  T
Q  220 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8898997 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 8898950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 16680832 - 16681085
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16680832 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 16680931  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| ||||||| ||        | | |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16680932 catctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 16681031  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16681032 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16681085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24299275 - 24298966
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24299275 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24299176  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  24299175 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 24299076  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||     
T  24299075 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatg 24298977  T
Q  325 tcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||||    
T  24298976 tcaatatcagt 24298966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15406028 - 15405803
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatt--------tcta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        | |     
T  15406028 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15405929  T
Q  143 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  15405928 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 15405829  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15405828 catacatgcataatcatgcatattac 15405803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15417815 - 15417590
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatt--------tcta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        | |     
T  15417815 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15417716  T
Q  143 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  15417715 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 15417616  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15417615 catacatgcataatcatgcatattac 15417590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 24870402 - 24870635
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  24870402 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 24870501  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    || |  |||||||||     
T  24870502 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccagcagtcatgcatta 24870601  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24870602 caagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24870635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 27031706 - 27032008
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27031706 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27031805  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    ||||  |    
T  27031806 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatgctccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccaacagt 27031905  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  27031906 catgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 27032004  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  27032005 tcaa 27032008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22928360 - 22928067
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  22928360 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacatctcccaacgatgttatctccaaagaggatttcca 22928261  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    ||||  ||||||||      
T  22928260 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcatca 22928161  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  22928160 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 22928067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13292460 - 13292157
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattag-ctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 132  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  13292460 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagactaccggccctcagccttggtcccgatacgtcccccaacgacgtcatctccaaag 13292361  T
Q  133 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | ||| | |||||||||||    ||||      
T  13292360 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaattgtgtctacaaatcgccaacag 13292261  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  13292260 tcatgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaat 13292162  T
Q  324 atcaa 328  Q
     ||||    
T  13292161 gtcaa 13292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 27025827 - 27026129
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27025827 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcataactaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27025926  T
Q  134 ggatt--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||        | | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  27025927 ggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactttgtctacaaatcgccaacagt 27026026  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  27026027 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 27026125  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  27026126 tcaa 27026129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 328
Target Start/End: Original strand, 20131253 - 20131500
Alignment:
Q  82 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 173  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  20131253 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 20131352  T
Q  174 ctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtct 273  Q
    |||  |||||||||||     | |||   || | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |     
T  20131353 ctccgatgtcttgtct-----gagaaactgtct-tacaaattgccaaccatcatgcatttcaagcatccatacatgcataatcatgcatactacgtgccc 20131446  T
Q  274 atacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20131447 atgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgttgcatttccaatgtcaa 20131500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22201617 - 22201370
Alignment:
Q  82 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 173  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22201617 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 22201518  T
Q  174 ctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtct 273  Q
    |||  |||||||||||     | |||   || | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |     
T  22201517 ctccgatgtcttgtct-----gagaaactgtct-tacaaattgccaaccatcatgcatttcaagcatccatacatgcataatcatgcatactacgtgccc 22201424  T
Q  274 atacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  22201423 atgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgttgcatttccaatgtcaa 22201370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 516 - 793
Target Start/End: Original strand, 15775710 - 15775987
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775710 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 15775809  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775810 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 15775909  T
Q  716 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15775910 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 15775987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Original strand, 15775288 - 15775476
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15775288 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 15775387  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagtg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15775388 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcagtg 15775476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 29836023 - 29836276
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29836023 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 29836122  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29836123 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 29836222  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29836223 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29836276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28355467 - 28355223
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28355467 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 28355368  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28355367 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 28355268  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28355267 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 28355223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 33265420 - 33265678
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  33265420 aacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgt 33265519  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     || ||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33265520 catttccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 33265619  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtc 272  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33265620 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtc 33265678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 18716177 - 18716409
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  18716177 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18716276  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  18716277 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 18716376  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18716377 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18716409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12086253 - 12085937
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12086253 cataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacga 12086154  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctac 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12086153 cgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctac 12086054  T
Q  211 aaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatg 310  Q
    ||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| |||     
T  12086053 aaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcata 12085955  T
Q  311 ttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    | |||||| ||| |||||    
T  12085954 tcgcatttccaacatcaa 12085937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31483393 - 31483142
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  31483393 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaaattgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 31483294  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31483293 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31483194  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    ||  | ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31483193 ctgccgacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 31483142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 31361267 - 31361542
Alignment:
Q  60 ccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagc 151  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | | || ||||    
T  31361267 ccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagc 31361366  T
Q  152 acgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31361367 acgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgca 31361466  T
Q  252 tgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31361467 taatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatcaa 31361542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22074429 - 22074135
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      
T  22074429 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttcca 22074330  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  22074329 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 22074230  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaat 329  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22074229 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-aaaactattataccacccatacatgttgcatttccaatgtcaat 22074135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 44567680 - 44567934
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  44567680 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgcatagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 44567779  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga---------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
     |||||||||||||||||| | ||         | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567780 catctccaaagaggatttccaagaaatgtgtaatatagcgcgagccgctacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 44567879  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567880 aatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 44567934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19201906 - 19201654
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19201906 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagctgtggttccgacacgtctcccaacgacg 19201807  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19201806 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagttgtgcttacaa 19201707  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19201706 actgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 19201654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 19681156 - 19681409
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  19681156 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 19681255  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19681256 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 19681355  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19681356 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 19681409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 18797404 - 18797697
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  18797404 gtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18797503  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  18797504 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 18797603  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||    
T  18797604 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttataccatccatgcatatcgcatttccaatgtcaa 18797697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21341697 - 21341394
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 132  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21341697 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 21341598  T
Q  133 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||      
T  21341597 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacag 21341498  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  21341497 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 21341399  T
Q  324 atcaa 328  Q
     ||||    
T  21341398 gtcaa 21341394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 14569841 - 14570143
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14569841 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14569940  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    |||| ||    
T  14569941 ggatttccaagaatgtgtagtatagcacgagccactgtgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacaat 14570040  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  14570041 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 14570139  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  14570140 tcaa 14570143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 15774260 - 15774562
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15774260 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 15774359  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  ||||  |    
T  15774360 ggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacagt 15774459  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||     
T  15774460 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgtcgcatttccaatg 15774558  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  15774559 tcaa 15774562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2130794 - 2130552
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2130794 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 2130695  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    || |  |    
T  2130694 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccagcagt 2130595  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2130594 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Original strand, 19694802 - 19695111
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  19694802 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaaga 19694901  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  19694902 ggatttccaggaatgtgtaatataacacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 19695001  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  19695002 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 19695100  T
Q  325 tcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||||    
T  19695101 tcaatatcagt 19695111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 9361304 - 9361556
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||   || ||| | ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  9361304 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttacatacctaccggccctcagctatggt-ccgatacgtcccccaacgacgt 9361402  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||  | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361403 catctccaaagaggattttcaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 9361502  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9361503 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9361556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 22139598 - 22139842
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22139598 tccccagtagagtcttccgagattctgtccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaa 22139697  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||     
T  22139698 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaaca 22139797  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22139798 gtcatgcattacaagcattcatacacgcataatcatgcatattac 22139842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 33249049 - 33249351
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33249049 cccagtagagtcttccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33249148  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  33249149 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtttgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 33249248  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  33249249 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 33249347  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  33249348 tcaa 33249351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 328
Target Start/End: Original strand, 16260635 - 16260926
Alignment:
Q  45 cttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc---- 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  16260635 cttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccagg 16260734  T
Q  141 ----tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 235  Q
        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  ||||||||  ||    
T  16260735 aatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcataaca 16260834  T
Q  236 atcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| ||||  |||  |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  16260835 agcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttgat-gaaaccgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 16260926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19654841 - 19654610
Alignment:
Q  45 cttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc---- 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  19654841 cttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccagg 19654742  T
Q  141 ----tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 235  Q
        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||| |||| |||||  |||| |||| ||    
T  19654741 aatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctaccaactgtcaacagtcatacattaca 19654642  T
Q  236 atcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19654641 agcattcatacatgcataatcatgcatattac 19654610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27602439 - 27602137
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  27602439 cccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcagctccaaaga 27602340  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| || | | |||   | |||||||||    ||||  |    
T  27602339 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcgaaactgcgtctacaaatcgccaacagt 27602240  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  27602239 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 27602141  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  27602140 tcaa 27602137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19910676 - 19910451
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |     
T  19910676 agattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 19910577  T
Q  143 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
    | || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  19910576 taatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 19910477  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19910476 catacatgcataatcatgcatattac 19910451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 670
Target Start/End: Original strand, 15775884 - 15776032
Alignment:
Q  521 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 619  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  15775884 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 15775981  T
Q  620 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 670  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15775982 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagtttgtccc 15776032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 516 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 24813400 - 24813123
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813400 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccactttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 24813301  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813300 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 24813201  T
Q  716 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813200 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 24813123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24813822 - 24813634
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24813822 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccatgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 24813723  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagtg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24813722 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcagtg 24813634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 54840097 - 54840410
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  54840097 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 54840196  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54840197 catctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaataatccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 54840296  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  54840297 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 54840395  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  54840396 catttccaatgtcaa 54840410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31120069 - 31119756
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  31120069 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 31119970  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31119969 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31119870  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  31119869 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 31119771  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  31119770 catttccaatgtcaa 31119756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 21976410 - 21976723
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  21976410 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 21976509  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21976510 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 21976609  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  21976610 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 21976708  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  21976709 catttccaatgtcaa 21976723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20331987 - 20331743
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  20331987 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 20331888  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  20331887 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 20331788  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20331787 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 20331743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27156878 - 27156632
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27156878 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 27156779  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  27156778 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 27156679  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27156678 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14753063 - 14752762
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14753063 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14752964  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  14752963 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 14752864  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  14752863 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 14752765  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  14752764 caa 14752762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40099192 - 40098879
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  40099192 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 40099093  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40099092 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 40098993  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| | |    
T  40098992 ataccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatatcg 40098894  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||||||||    
T  40098893 catttccaatatcaa 40098879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 6576552 - 6576796
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6576552 tccccagtggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 6576651  T
Q  132 -gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
     ||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  6576652 agaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaactgccaaca 6576751  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6576752 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6576796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 5701256 - 5701548
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  5701256 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 5701355  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  5701356 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 5701455  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  5701456 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 5701548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15379776 - 15379482
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      
T  15379776 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttcca 15379677  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  15379676 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 15379577  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaat 329  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15379576 caagcgttcatacatgcataatcatgcatattacgtgtccatacatttaat-aaaactattataccacccatacatgttgcatttccaatgtcaat 15379482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18794175 - 18793949
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  18794175 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 18794076  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  18794075 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 18793976  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18793975 tcatacatgcataatcatgcatattac 18793949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36323884 - 36323643
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  36323884 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaagga 36323785  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  36323784 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 36323685  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36323684 atgcattacaagcattcatgcatgcataatcatgcacattac 36323643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36338093 - 36337852
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  36338093 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaagga 36337994  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  36337993 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 36337894  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36337893 atgcattacaagcattcatgcatgcataatcatgcacattac 36337852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 39857342 - 39857574
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |    
T  39857342 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 39857441  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   ||||||||| |    
T  39857442 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaatagtcatgcattac 39857541  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39857542 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39857574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15276164 - 15275864
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||      
T  15276164 gtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacaacgttatctccaaagaggatttcca 15276065  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  15276064 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 15275965  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 333  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  15275964 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactattataccacctatacatgttgcatttccaatgtcaatttca 15275866  T
Q  334 gt 335  Q
    ||    
T  15275865 gt 15275864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 5012597 - 5012841
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5012597 tccccagtcgggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 5012696  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg-cccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||      
T  5012697 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgccccaacactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaata 5012796  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5012797 gtcacgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5012841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 15234546 - 15234838
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  15234546 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 15234645  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||| ||  | || ||||||||||     
T  15234646 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaagctgcccacaatcatgcatta 15234745  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 327  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |  || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15234746 caagcattcatacatgcataatcatgcataccatgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 15234838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33667360 - 33667107
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  33667360 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 33667261  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33667260 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 33667161  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33667160 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 33667107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Original strand, 1906984 - 1907227
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1906984 tccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaa 1907083  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||| ||||     
T  1907084 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactaccaaca 1907183  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatta 266  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1907184 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatta 1907227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 24119359 - 24119601
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||   |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  24119359 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatctactggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgatgtcatctccaaaga 24119458  T
Q  134 ggatttc---------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||          | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  |    
T  24119459 ggattttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagt 24119558  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24119559 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24119601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24585918 - 24585616
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24585918 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24585819  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  24585818 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 24585719  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  24585718 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 24585620  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  24585619 tcaa 24585616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 14105250 - 14105503
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14105250 aacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccgaccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 14105349  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14105350 catctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 14105449  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  | ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14105450 atgcccacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 14105503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 30760470 - 30760723
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  30760470 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 30760569  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||| |||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30760570 catctccaaaaaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 30760669  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30760670 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 30760723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34182504 - 34182263
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34182504 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 34182405  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||    
T  34182404 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacgaattgccaacagtc 34182305  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34182304 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24814726 - 24814547
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  24814726 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcataca 24814627  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  24814626 tgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 24814547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 17019747 - 17019989
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17019747 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 17019846  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  17019847 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 17019946  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17019947 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 17019989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 14671717 - 14671871
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  14671717 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 14671816  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 189  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14671817 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtct 14671871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 24813226 - 24813078
Alignment:
Q  521 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 619  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  24813226 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 24813129  T
Q  620 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 670  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813128 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 24813078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 516 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 13178355 - 13178078
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178355 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgatgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 13178256  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178255 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagttcaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 13178156  T
Q  716 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13178155 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 13178078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13178824 - 13178636
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13178824 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 13178725  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagtg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13178724 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcagtg 13178636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15752317 - 15752004
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15752317 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 15752218  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15752217 catccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 15752118  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  15752117 atgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 15752019  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  15752018 catttccaatgtcaa 15752004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 30036128 - 30036441
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30036128 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 30036227  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||| ||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30036228 catccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 30036327  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  30036328 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 30036426  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  30036427 catttccaatgtcaa 30036441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 33523086 - 33523399
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  33523086 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 33523185  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33523186 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 33523285  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  33523286 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 33523384  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  33523385 catttccaatgtcaa 33523399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 335
Target Start/End: Original strand, 33881815 - 33882128
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33881815 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 33881914  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  33881915 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 33882014  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  33882015 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 33882113  T
Q  321 aatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||||||| |||||    
T  33882114 aatatcaatatcagt 33882128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31819880 - 31819627
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31819880 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 31819781  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31819780 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcatgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31819681  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31819680 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31819627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40467001 - 40466757
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  40467001 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 40466902  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  40466901 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 40466802  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40466801 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 40466757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 6881007 - 6881248
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6881007 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 6881106  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  6881107 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 6881206  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6881207 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6881248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9544175 - 9543934
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9544175 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 9544076  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  9544075 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 9543976  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9543975 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9543934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18494227 - 18493914
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18494227 aacggcgttttccccggtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctactggccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 18494128  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||   ||||     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18494127 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 18494028  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||| | ||| |||    
T  18494027 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccgtgcatattg 18493929  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18493928 catttccaatgtcaa 18493914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37352094 - 37351810
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga----- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||         
T  37352094 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 37351995  T
Q  146 ---tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattc 242  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||||||||| ||| |||||    
T  37351994 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctaccaaatgccaacagtcatgcattacaagcattc 37351895  T
Q  243 atacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||   || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  37351894 atacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-ggaactgttataacatccatgcatattgcatttccaatatcaa 37351810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37745808 - 37745555
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37745808 aacggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 37745709  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37745708 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgttttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 37745609  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37745608 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37745555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 327
Target Start/End: Original strand, 22895119 - 22895422
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22895119 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 22895218  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  22895219 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgacttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 22895318  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 322  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22895319 gtcatgcattgcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaa 22895417  T
Q  323 tatca 327  Q
    |||||    
T  22895418 tatca 22895422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28953254 - 28953001
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  28953254 aacggcgttttccccagtaaagtcttccgagattctgtccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgt 28953155  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc------tatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28953154 catctccaaagaggattttcaagaatatgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 28953055  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28953054 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28953001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 43084956 - 43085262
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43084956 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 43085055  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga-tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
     ||||||| |||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  43085056 catctccagagaggatttccaagaatatagcacgagccattacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 43085155  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  43085156 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttcc 43085254  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  43085255 aatgtcaa 43085262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 9324165 - 9324419
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9324165 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 9324264  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9324265 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 9324364  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9324365 aatgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9324419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 26487075 - 26487329
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26487075 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 26487174  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26487175 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 26487274  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26487275 aatgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26487329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 2517768 - 2518000
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  2517768 gtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggctccggtacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 2517867  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| |    
T  2517868 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattac 2517967  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2517968 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2518000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 12138864 - 12139119
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  12138864 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 12138963  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12138964 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 12139063  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacat 269  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12139064 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacat 12139119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Original strand, 30158729 - 30159035
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||  |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  30158729 ttttccccagtcaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctatcctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 30158828  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  30158829 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 30158928  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  30158929 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttcc 30159027  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  30159028 aatgtcaa 30159035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18121881 - 18121639
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18121881 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18121782  T
Q  134 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaa-tgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||| |        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |    
T  18121781 ggatttccaggaatgcgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaaatgtcttgtcttcccggtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagt 18121682  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18121681 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18121639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 3796235 - 3796488
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  3796235 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 3796334  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3796335 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 3796434  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3796435 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15652208 - 15651967
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | | |||||||||||    
T  15652208 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggtttcgacacgtctcccaacgacatcatctccaaaga 15652109  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  15652108 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 15652009  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15652008 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 15651967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32589734 - 32589481
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  32589734 aacggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 32589635  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||| |||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  32589634 catccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctttcccgcgaagtcgtgcctacaaa 32589535  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32589534 ctgccaacgatcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 32589481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 37761676 - 37761929
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37761676 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcacagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 37761775  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37761776 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 37761875  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37761876 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37761929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 11330343 - 11330587
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11330343 ttttccccagtcaggtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 11330442  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  11330443 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccgctacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 11330542  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11330543 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 11330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 335
Target Start/End: Original strand, 24730678 - 24730971
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  24730678 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 24730777  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  24730778 tgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 24730877  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  24730878 tcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcagt 24730971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 31438166 - 31438392
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  31438166 caagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 31438265  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  31438266 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 31438365  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31438366 tcatacatgcataatcatgcatattac 31438392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8658931 - 8658639
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |    
T  8658931 gtcttccgagattctatttccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccagcgacgtcatctccaaagaggatttcca 8658832  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  8658831 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 8658732  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  8658731 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 8658639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 25207012 - 25207304
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25207012 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctccaaagaggattccca 25207111  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
     ||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | |||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  25207112 ggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25207211  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 327  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25207212 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatca 25207304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 25271168 - 25271460
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25271168 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctccaaagaggattccca 25271267  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
     ||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | |||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  25271268 ggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25271367  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 327  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25271368 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatca 25271460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 34623201 - 34623454
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34623201 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgcccccagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 34623300  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34623301 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 34623400  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34623401 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34623454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 5644502 - 5644755
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  ||||||||| ||  ||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  5644502 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctgtctacagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 5644601  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5644602 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 5644701  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5644702 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5644755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13318285 - 13317965
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  13318285 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgt 13318186  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13318185 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 13318086  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |    
T  13318085 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcg 13317987  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| ||||| |||| |||||    
T  13317986 catttccaataacaatatcagt 13317965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 30175170 - 30175490
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30175170 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 30175269  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||| |||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30175270 catctccaaagaagatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaa 30175369  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |    
T  30175370 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcacaatcatgcgtaatacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcg 30175468  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  30175469 catttccaatatcaatatcagt 30175490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 28655947 - 28656200
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||    
T  28655947 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaaggtgcatacctacctgccctcagccttgactccgatacgtctcccaacgacgt 28656046  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||| |||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28656047 catctccaaagaagatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 28656146  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28656147 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37664957 - 37664710
Alignment:
Q  28 gttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 127  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  37664957 gttttccccagtaaagtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagccttggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctc 37664858  T
Q  128 caaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 219  Q
    ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  37664857 caaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 37664758  T
Q  220 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37664757 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37664710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13436128 - 13435875
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||| | |||    
T  13436128 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccagccctcagccttggctctgatacgtctcccaatgacgt 13436029  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13436028 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 13435929  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13435928 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 13435875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18368989 - 18368736
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18368989 aacggcgttttccccagtggagtctctcaaggctctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 18368890  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||| || ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18368889 catctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 18368790  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18368789 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18368736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 23726931 - 23727233
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23726931 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 23727030  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  | ||  |    
T  23727031 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccgacagt 23727130  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  23727131 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 23727229  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  23727230 tcaa 23727233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 23898587 - 23898892
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaa 130  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23898587 tccccagtagagtcttccgagattctatccccaagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaa 23898686  T
Q  131 agaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaac 221  Q
    ||||||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||    
T  23898687 agaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaac 23898786  T
Q  222 catcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgca 321  Q
      |||| |||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| ||||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  23898787 agtcatacattacaagcattcgtacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttgat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcattttca 23898885  T
Q  322 atatcaa 328  Q
    || ||||    
T  23898886 atgtcaa 23898892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 41681408 - 41681638
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct- 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |     
T  41681408 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagttacctgccctcagtcatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttttc 41681507  T
Q  142 -----atg----atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
         |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||    
T  41681508 caagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgacttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcgtt 41681607  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
         ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41681608 ----acattcatacatgcataatcacgcatattac 41681638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 11556048 - 11556350
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11556048 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11556147  T
Q  134 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||| |        | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  11556148 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 11556247  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  11556248 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 11556346  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  11556347 tcaa 11556350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 23632664 - 23632906
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23632664 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 23632763  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||||  ||||  |    
T  23632764 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaactgccaacagt 23632863  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632864 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 23632906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22992588 - 22992286
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22992588 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22992489  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  22992488 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 22992389  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  22992388 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 22992290  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  22992289 tcaa 22992286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13180241 - 13179962
Alignment:
Q  57 tatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgt 148  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | | || |    
T  13180241 tatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatat 13180142  T
Q  149 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  13180141 agcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcataca 13180042  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  13180041 tgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 13179962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 267
Target Start/End: Original strand, 33299249 - 33299472
Alignment:
Q  53 attctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | |     
T  33299249 attctatccccagcaagttgcatagctaccggccctccgcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgta 33299348  T
Q  145 atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattca 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  33299349 atatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattca 33299448  T
Q  244 tacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  33299449 tacatgcataatcatgcatattac 33299472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 33784176 - 33784478
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |   ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33784176 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcaacttaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33784275  T
Q  134 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||| |        | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  33784276 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 33784375  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  33784376 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 33784474  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  33784475 tcaa 33784478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 24976538 - 24976840
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24976538 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24976637  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccg-tgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | |  ||| | |||||||||||    ||||      
T  24976638 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcagaact-gtgtctacaaatcgccaacag 24976736  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24976737 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaat 24976835  T
Q  324 atcaa 328  Q
     ||||    
T  24976836 gtcaa 24976840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 24608939 - 24609181
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24608939 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaaga 24609038  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  24609039 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 24609138  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24609139 cgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24609181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 30941324 - 30941566
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30941324 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 30941423  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |   |||||||||||    ||||  |    
T  30941424 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctccgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 30941523  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30941524 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 30941566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 13178181 - 13178033
Alignment:
Q  521 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 619  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  13178181 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 13178084  T
Q  620 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 670  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13178083 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 13178033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 516 - 793
Target Start/End: Original strand, 3790872 - 3791149
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790872 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccaggttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 3790971  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3790972 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctatgagccggtgcagtt 3791071  T
Q  716 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3791072 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 3791149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 336
Target Start/End: Original strand, 3790473 - 3790661
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3790473 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 3790572  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagtg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3790573 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcagtg 3790661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19410031 - 19409718
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19410031 aacggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 19409932  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19409931 catccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 19409832  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  19409831 atgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 19409733  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19409732 catttccaatgtcaa 19409718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13930158 - 13929845
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13930158 aacggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 13930059  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13930058 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 13929959  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  13929958 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 13929860  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13929859 catttccaatgtcaa 13929845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 37932072 - 37932385
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  37932072 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 37932171  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37932172 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 37932271  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||   || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  37932272 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgctcatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 37932370  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||||||||    
T  37932371 catttccaatatcaa 37932385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 3789138 - 3789391
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  3789138 aacggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 3789237  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3789238 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 3789337  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3789338 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3789391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16822885 - 16822572
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16822885 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 16822786  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16822785 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 16822686  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16822685 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 16822587  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16822586 catttccaatgtcaa 16822572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 16898595 - 16898908
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16898595 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 16898694  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16898695 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 16898794  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16898795 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 16898893  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16898894 catttccaatgtcaa 16898908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37679438 - 37679132
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37679438 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 37679339  T
Q  129 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    | ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37679338 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37679239  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  37679238 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 37679140  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  37679139 aatgtcaa 37679132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37694703 - 37694397
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37694703 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 37694604  T
Q  129 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    | ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37694603 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37694504  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  37694503 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 37694405  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  37694404 aatgtcaa 37694397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 32056447 - 32056760
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||    
T  32056447 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgt 32056546  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32056547 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 32056646  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  32056647 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 32056745  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  32056746 catttccaatgtcaa 32056760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 254192 - 253948
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  254192 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 254093  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  254092 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 253993  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  253992 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 253948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21670720 - 21670469
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  21670720 aacggcgttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 21670621  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21670620 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 21670521  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21670520 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataagcatgcatatt 21670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Original strand, 34297851 - 34298093
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  34297851 tttttcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 34297950  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  34297951 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 34298050  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcata 263  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34298051 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcata 34298093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Original strand, 27397051 - 27397351
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  27397051 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 27397150  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |   |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  27397151 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctacgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 27397250  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 333  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  27397251 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaatttca 27397349  T
Q  334 gt 335  Q
    ||    
T  27397350 gt 27397351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9343527 - 9343283
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  9343527 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 9343428  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  9343427 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 9343328  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9343327 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 9343283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 16168180 - 16168424
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16168180 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 16168279  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  16168280 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 16168379  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16168380 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 16168424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 27810405 - 27810649
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27810405 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 27810504  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  27810505 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 27810604  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27810605 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcctatt 27810649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39045423 - 39045178
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaa-gttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  39045423 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 39045324  T
Q  128 caaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 219  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  39045323 caaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 39045224  T
Q  220 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39045223 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 39045178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21696726 - 21696423
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696726 tccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgttatctccaaa 21696627  T
Q  132 gaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    ||||||||| | ||   ||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  21696626 gaggatttccaggaatgtgtaatattgcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 21696527  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 322  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  21696526 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaa 21696428  T
Q  323 tatca 327  Q
    |||||    
T  21696427 tatca 21696423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 39896764 - 39897077
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39896764 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 39896863  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39896864 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgcgcctacaaa 39896963  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  39896964 atgccaacagtcatgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 39897062  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  39897063 catttccaatgtcaa 39897077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22921691 - 22921371
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22921691 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 22921592  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22921591 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 22921492  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  22921491 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattg 22921393  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||| ||||| |||||    
T  22921392 catttccaatgtcaatatcagt 22921371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Original strand, 31882987 - 31883286
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  31882987 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 31883086  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  31883087 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 31883186  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 334  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  31883187 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaatatcag 31883285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37945405 - 37945161
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  37945405 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgtcatctcc 37945306  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37945305 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37945206  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
       ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37945205 tagtcatgcattaccagcattcatacatgcataatcatgcatatt 37945161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 12593516 - 12593762
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12593516 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 12593615  T
Q  129 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    | ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12593616 atagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgtcaa 12593715  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |  ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12593716 cagtcatgcattacaggcattcatacatgcataatcatgcgtattac 12593762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 34161536 - 34161789
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||    
T  34161536 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccagccctcagccttggctctgatacgtctcccaacgacgt 34161635  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34161636 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 34161735  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34161736 ctgccaacagtcatgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattac 34161789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 37384371 - 37384603
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |    
T  37384371 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 37384470  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  37384471 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 37384570  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37384571 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37384603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12710144 - 12709851
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  12710144 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 12710045  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  12710044 tgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 12709945  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  12709944 tcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcagt 12709851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11628732 - 11628479
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  11628732 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgt 11628633  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11628632 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 11628533  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11628532 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatacatattac 11628479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 34868329 - 34868582
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34868329 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 34868428  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868429 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 34868528  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34868529 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34868582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34268460 - 34268216
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34268460 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 34268361  T
Q  132 gaggatttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    ||||||||| | | |||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  34268360 gaggatttccaggaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 34268261  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34268260 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34268216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 27123216 - 27123448
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  27123216 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 27123315  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  27123316 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 27123415  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27123416 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27123448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 27782918 - 27783169
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  27782918 aacggcgtttttcccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctaccaacgacat 27783017  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27783018 catctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 27783117  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27783118 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 27783169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19449939 - 19449638
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19449939 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttct 19449840  T
Q  142 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
    |        |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||| ||    
T  19449839 aagaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcgtt 19449740  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtc 332  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||| ||||| ||    
T  19449739 acaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgtatattgcattttcaatgtcaatttc 19449641  T
Q  333 agt 335  Q
    |||    
T  19449640 agt 19449638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 40240245 - 40240471
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-------- 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||            
T  40240245 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatg 40240344  T
Q  141 tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
    | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  40240345 tgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 40240444  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40240445 tcatacatacataatcatgcatattac 40240471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 23117481 - 23117723
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23117481 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgcctcccaacgacgtcatctccaaaga 23117580  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca- 223  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||| ||     
T  23117581 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaa-tcgcaaacag 23117679  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23117680 tcatgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattac 23117723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27428000 - 27427761
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc- 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  27428000 gtcttccgagattctgtccccagcaagttgcataagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaggaggatttcc 27427901  T
Q  141 -------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
           | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  27427900 aggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 27427801  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtc 272  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27427800 acaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtc 27427761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 28888939 - 28889236
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28888939 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 28889038  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  28889039 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatactccaacatcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 28889138  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28889139 catgcataacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacacacccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaat 28889236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31868344 - 31868102
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||   || ||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31868344 cccagtagagtcttccgagattctatccccatcaagtttcatacctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 31868245  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||||  |    
T  31868244 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaaatgccaacagt 31868145  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31868144 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31868102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 140
Target Start/End: Original strand, 20844600 - 20844706
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20844600 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 20844699  T
Q  134 ggatttc 140  Q
     ||||||    
T  20844700 tgatttc 20844706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 12662175 - 12662418
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 132  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12662175 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 12662274  T
Q  133 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||| ||||||    ||||      
T  12662275 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtttacaaatcgccaacag 12662374  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12662375 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 12662418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 606 - 670
Target Start/End: Original strand, 3791130 - 3791194
Alignment:
Q  606 aatctccagtgattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 670  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3791130 aatccccagtgatttccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 3791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Original strand, 20844802 - 20844909
Alignment:
Q  227 tgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatc 326  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||| ||    
T  20844802 tgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcctatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatgtc 20844900  T
Q  327 aatgtcagt 335  Q
    ||| |||||    
T  20844901 aatatcagt 20844909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 336
Target Start/End: Original strand, 3451936 - 3452246
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3451936 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccggtacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 3452035  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3452036 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttggcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatc 3452135  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3452136 atgcatttcaatcattcatgcatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatat 3452235  T
Q  326 caatgtcagtg 336  Q
    |||||||||||    
T  3452236 caatgtcagtg 3452246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26268527 - 26268209
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  26268527 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggt-ccgaaacgtctcccaacgacgt 26268429  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26268428 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26268329  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268328 ctgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgcatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 26268229  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtca 333  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  26268228 catttccaatacaaatgtca 26268209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26678539 - 26678233
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26678539 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 26678440  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  26678439 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaactgccaa 26678340  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  26678339 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatcacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 26678241  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  26678240 aatgtcaa 26678233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 516 - 670
Target Start/End: Original strand, 3452501 - 3452655
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3452501 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatccccagt 3452600  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 670  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3452601 gatttccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 3452655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26509154 - 26508848
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26509154 cataacggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctacccccagcaagttgattagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacga 26509055  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||    
T  26509054 cgttatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtcta 26508955  T
Q  210 caaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacat 309  Q
    ||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| |||||||||||    
T  26508954 caaactgccaacagtcatgcattacaaccattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacat 26508856  T
Q  310 gttgcatt 317  Q
     |||||||    
T  26508855 attgcatt 26508848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26663347 - 26663041
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26663347 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 26663248  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  26663247 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaactgccaa 26663148  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  26663147 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatcacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 26663049  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||| ||||    
T  26663048 aatgtcaa 26663041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16744955 - 16744711
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16744955 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgtcacgtctcccaacgacgtcatctcc 16744856  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16744855 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 16744756  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16744755 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 16744711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31084066 - 31083812
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31084066 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 31083967  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31083966 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 31083867  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31083866 actgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31083812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 2779929 - 2780230
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2779929 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtcatcttcaaaga 2780028  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  2780029 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 2780128  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  2780129 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgt 2780227  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  2780228 caa 2780230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 335
Target Start/End: Original strand, 31130616 - 31130910
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccat-ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga-- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||      
T  31130616 caagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccattggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaat 31130715  T
Q  146 ------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatca 239  Q
          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||    
T  31130716 gtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagca 31130815  T
Q  240 ttcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  31130816 ttcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcagt 31130910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 26441938 - 26442191
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26441938 aacggcgttttccccggtggggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 26442037  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26442038 catctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26442137  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26442138 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcgtattac 26442191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 26596356 - 26596603
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccat-ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  26596356 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctattggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 26596455  T
Q  128 caaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 219  Q
    ||||||||||||| | ||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  26596456 caaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 26596555  T
Q  220 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26596556 acagtcatgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattac 26596603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31557847 - 31557533
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31557847 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 31557748  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
      |||||||||||||||||| | || |        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31557747 ccatctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 31557648  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgtt 312  Q
    | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  31557647 aatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatatt 31557549  T
Q  313 gcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||| |||| ||||    
T  31557548 gcatttccaatgtcaa 31557533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26313306 - 26313052
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26313306 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 26313207  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26313206 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcttgcctacaa 26313107  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26313106 aatgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26313052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 4206069 - 4206322
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4206069 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcggccatggttccggcacgtctcccaacgacgt 4206168  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4206169 catctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 4206268  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4206269 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4206322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 45393913 - 45394166
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  45393913 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgt 45394012  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||| | | ||        | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45394013 catctccaaagaggattcccaagaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 45394112  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45394113 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 45394166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4138687 - 4138436
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  4138687 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 4138588  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4138587 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 4138488  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4138487 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 4138436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 11447582 - 11447835
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  11447582 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 11447681  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11447682 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 11447781  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447782 atgccaacagtcatgcattacaaacattcatacatgcatgatcatgcatattac 11447835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 22148573 - 22148814
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22148573 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22148672  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  22148673 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 22148772  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22148773 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcacattac 22148814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16443426 - 16443134
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  16443426 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggctccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 16443327  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  16443326 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatacttcaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 16443227  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 327  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16443226 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaataaaactt-ttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 16443134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 26519501 - 26519754
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  26519501 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 26519600  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26519601 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26519700  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26519701 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26519754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Original strand, 16048027 - 16048315
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  16048027 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgactttatctccaaagaggatttcca 16048126  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  16048127 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 16048226  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    | | |||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  16048227 cgagcattcatacatgtataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 16048315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39206585 - 39206353
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  39206585 gtctcccaagattctatcctcagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 39206486  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  39206485 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 39206386  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39206385 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39206353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 45737995 - 45738227
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  45737995 gtctcccaagattctatccccagcaaattgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 45738094  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  45738095 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 45738194  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45738195 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 45738227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 516 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26268050 - 26267899
Alignment:
Q  516 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26268050 cacccctattaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatccccagt 26267951  T
Q  616 gattcccatacatgttcggataagtggctagttc-agtccaagaacagcttgt 667  Q
    || |    | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26267950 gaatatgtttc-tgttcggtcaagtggctagttcaagtccaagaacagcttgt 26267899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24585978 - 24585726
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  24585978 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccttcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 24585879  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaa-tgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24585878 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaa 24585779  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |||  ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24585778 actgccaacagtcatgcgttacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 24585726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11418233 - 11417931
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11418233 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11418134  T
Q  134 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    ||||||| |        | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  11418133 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 11418034  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  11418033 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 11417935  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  11417934 tcaa 11417931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 5154768 - 5155010
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5154768 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5154867  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  5154868 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 5154967  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5154968 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5155010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5140744 - 5140526
Alignment:
Q  57 tatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgt 148  Q
    |||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||        | | |  |    
T  5140744 tatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaatgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacat 5140645  T
Q  149 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5140644 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattcatacat 5140545  T
Q  249 gcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5140544 gcataatcatgcatattac 5140526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 10848299 - 10848592
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||      
T  10848299 gtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcgtagcaacccgccctcagccatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttcca 10848398  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||| ||     
T  10848399 agaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcgtta 10848498  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  10848499 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatctgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 10848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 22152800 - 22152989
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22152800 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22152899  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaact 215  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22152900 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaact 22152989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 22208715 - 22208904
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22208715 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22208814  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaact 215  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22208815 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaact 22208904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Original strand, 5165078 - 5165378
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  5165078 gtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 5165177  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  5165178 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 5165277  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 333  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  5165278 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaatatca 5165376  T
Q  334 gt 335  Q
    ||    
T  5165377 gt 5165378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 2161257 - 2161558
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2161257 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagcta-ctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcgtctccaaaga 2161355  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  |||| ||    
T  2161356 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacaat 2161455  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  2161456 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 2161554  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  2161555 tcaa 2161558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16511879 - 16511637
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16511879 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 16511780  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  16511779 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagtcattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 16511680  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16511679 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16511637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10910380 - 10910071
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10910380 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacaacgtcatctccaaaga 10910281  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccg-tgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | |||| | |||||||||||    ||||      
T  10910280 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgctgaact-gtgtctacaaatcgccaacag 10910182  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10910181 tcgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatacatattgcatttccaat 10910083  T
Q  324 atcaatgtcagt 335  Q
     ||||| |||||    
T  10910082 gtcaatatcagt 10910071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 24334835 - 24335148
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24334835 aacggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 24334934  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24334935 catccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 24335034  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  24335035 atgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 24335133  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24335134 catttccaatgtcaa 24335148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 18231851 - 18232171
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  18231851 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 18231950  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18231951 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 18232050  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  18232051 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 18232149  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||| |||| ||||||    
T  18232150 catttccaatgtcaacgtcagt 18232171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28109564 - 28109250
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtc-gggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28109564 aacggcgttttccccagtcagggttttccaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacg 28109465  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28109464 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttcccggtgaagtcgtgcctacaa 28109365  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgtt 312  Q
    |||   |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||    
T  28109364 actgctaacagtcatgcatcacaagcattcatacatgcataaccatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatatt 28109266  T
Q  313 gcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||| |||| ||||    
T  28109265 gcatttccaatgtcaa 28109250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 10649730 - 10650042
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  10649730 aacggcgttttccccagtaag-tcttccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 10649828  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10649829 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 10649928  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  10649929 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 10650027  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10650028 catttccaatgtcaa 10650042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17978551 - 17978238
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  17978551 aacggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 17978452  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17978451 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgttttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 17978352  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17978351 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattg 17978253  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    || || |||| ||||    
T  17978252 cagttccaatgtcaa 17978238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 5020370 - 5020683
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5020370 aacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgt 5020469  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||||||||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5020470 catctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaa 5020569  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  5020570 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 5020668  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||||||||    
T  5020669 catttccaatatcaa 5020683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6536343 - 6536090
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6536343 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 6536244  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6536243 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 6536144  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6536143 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6536090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11103972 - 11103731
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11103972 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11103873  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||  ||    
T  11103872 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtc 11103773  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11103772 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 11103731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 28345830 - 28346150
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  28345830 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 28345929  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28345930 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 28346029  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  28346030 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattg 28346128  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||| ||||| |||||    
T  28346129 catttccaatgtcaatatcagt 28346150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5589949 - 5589705
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5589949 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctctagcaagttgcatacctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5589850  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  5589849 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 5589750  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5589749 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5589705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 5717721 - 5717965
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5717721 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5717820  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5717821 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5717920  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5717921 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5717965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 5728631 - 5728875
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5728631 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5728730  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5728731 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5728830  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5728831 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5728875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5763737 - 5763493
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5763737 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5763638  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5763637 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5763538  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5763537 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5763493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29658560 - 29658316
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||    
T  29658560 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccaacacgtctcccaacgacgtcatctcc 29658461  T
Q  129 aaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||    
T  29658460 aaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgcgcctacaaactgccaa 29658361  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29658360 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 29658316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31029854 - 31029613
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31029854 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccgtggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 31029755  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||  ||    
T  31029754 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtacctacaaaatgccaacagtc 31029655  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31029654 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31029613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 32445801 - 32446042
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  32445801 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatcaccaaaga 32445900  T
Q  134 ggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  32445901 ggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 32446000  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32446001 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 32446042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16618070 - 16617776
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  16618070 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttcc 16617971  T
Q  142 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
    |        |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  16617970 aagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 16617871  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16617870 tcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgtccatacatttgat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaa 16617776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 22041087 - 22041381
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  22041087 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttcc 22041186  T
Q  142 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
    |        |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  22041187 aagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 22041286  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22041287 tcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgtccatacatttgat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaa 22041381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Original strand, 32297297 - 32297603
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  32297297 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcgagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 32297396  T
Q  129 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    | ||||||| ||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||    
T  32297397 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaa 32297496  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 320  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  32297497 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttcc 32297595  T
Q  321 aatatcaa 328  Q
    ||||||||    
T  32297596 aatatcaa 32297603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4340289 - 4340047
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4340289 tccccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 4340190  T
Q  132 gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||      
T  4340189 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacag 4340090  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatta 266  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4340089 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatta 4340047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18285967 - 18285666
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18285967 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18285868  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  18285867 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 18285768  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18285767 atgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 18285669  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  18285668 caa 18285666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18301268 - 18300967
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18301268 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18301169  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  18301168 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 18301069  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18301068 atgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 18300970  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  18300969 caa 18300967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22864464 - 22864211
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22864464 aacggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 22864365  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22864364 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaa 22864265  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22864264 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22864211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22879523 - 22879270
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22879523 aacggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 22879424  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22879423 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaa 22879324  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22879323 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22879270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31958056 - 31957736
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||    
T  31958056 aacggtgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacaacgt 31957957  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31957956 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31957857  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  31957856 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattg 31957758  T
Q  314 catttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||| ||||| |||||    
T  31957757 catttccaatgtcaatatcagt 31957736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 4630430 - 4630671
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  4630430 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacatgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatcaccaaaga 4630529  T
Q  134 ggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  4630530 ggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 4630629  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4630630 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4630671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 47030114 - 47030366
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaa-gttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  47030114 aacggcgttttccccagtggagtcttccaagattctatctccagcaaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacg 47030213  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47030214 tcatcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 47030313  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47030314 aatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 47030366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 4423582 - 4423808
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4423582 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4423681  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4423682 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctataaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4423781  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4423782 tcatacatgcataatcatgcatattac 4423808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17970481 - 17970227
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcg 120  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  17970481 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccaatatgtctcccaacgacg 17970382  T
Q  121 ttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
    | |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17970381 tcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaa 17970282  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    | |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17970281 agtgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 17970227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Original strand, 18249377 - 18249690
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  18249377 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtcccccaacgacgt 18249476  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18249477 catctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 18249576  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  18249577 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattg 18249675  T
Q  314 catttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18249676 catttccaatgtcaa 18249690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5602913 - 5602660
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  5602913 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 5602814  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5602813 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 5602714  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5602713 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5602660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20570456 - 20570203
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||   || ||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20570456 aacggcgttttccccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttacatacctaccggtcctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 20570357  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20570356 catctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtctcccccgtgaagtcgtgcctacaaa 20570257  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570256 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 20570203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Original strand, 5473638 - 5473864
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5473638 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5473737  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  5473738 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 5473837  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcat 252  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5473838 atgcattacaagcattcatacatgcat 5473864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16404413 - 16404139
Alignment:
Q  1 cagcaatgagatggacatcataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttc 100  Q
    ||||| |||||||  || || ||||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||    
T  16404413 cagcactgagatgcccagcacaacggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctc 16404314  T
Q  101 cggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttcc 192  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16404313 cgatacgtcccccaacgacgtcatctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttcc 16404214  T
Q  193 ccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16404213 ccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16404139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 48472590 - 48472822
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  48472590 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 48472689  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  48472690 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 48472789  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48472790 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 48472822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 21681406 - 21681632
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-------- 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||            
T  21681406 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatg 21681505  T
Q  141 tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  21681506 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 21681605  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21681606 tcatacatgcataatcatgcatattac 21681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 10402811 - 10403064
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10402811 aacggcgttttccccggtggggtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggcccccggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 10402910  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10402911 catctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 10403010  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10403011 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10403064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 51788681 - 51788934
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  51788681 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgt 51788780  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51788781 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 51788880  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51788881 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 51788934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 20072693 - 20072925
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  20072693 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 20072792  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  20072793 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgatgtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 20072892  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20072893 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 20072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 15367923 - 15368217
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  15367923 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcaaccatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttcc 15368022  T
Q  141 -------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
           | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  15368023 aagaatgtgtgatgtagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgggaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 15368122  T
Q  233 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  15368123 acaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatctgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 15368217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 19701064 - 19701368
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19701064 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaatggcgttatctccaaa 19701163  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    || ||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||   |||||||||||||  ||||     
T  19701164 gaagatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctatgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 19701263  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 322  Q
     |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  19701264 gtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacaagcccatgcatttgat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaa 19701362  T
Q  323 tatcaa 328  Q
    | ||||    
T  19701363 tgtcaa 19701368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 28027930 - 28028183
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  28027930 aacggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgt 28028029  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||| ||||||||||| | ||        |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28028030 catctccgaagaggatttccaagaatgtgtaatgtagcacgagccactacttgcccattactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaa 28028129  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28028130 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28028183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29142365 - 29142063
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  29142365 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccgaaga 29142266  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  29142265 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 29142166  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||     
T  29142165 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcgtttccaatg 29142067  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  29142066 tcaa 29142063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 35887409 - 35887711
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35887409 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 35887508  T
Q  134 ggatt--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||        | | | || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||   ||||||||||||| |||||  |    
T  35887509 ggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatacttcaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgtcaacagt 35887608  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  35887609 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 35887707  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  35887708 tcaa 35887711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 8218284 - 8218537
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8218284 aacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatctccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 8218383  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| |||||||||| | ||        | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8218384 catctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccacgtgcccaatactctaacgccttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 8218483  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8218484 ctgccaacagtcatgcattacaagcgttcatacatgcataatcatgcatattac 8218537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 4728275 - 4728577
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4728275 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4728374  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  4728375 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 4728474  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  4728475 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 4728573  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  4728574 tcaa 4728577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 5658783 - 5659085
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5658783 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5658882  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  ||||  |    
T  5658883 ggatttccaggaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacagt 5658982  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  5658983 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 5659081  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  5659082 tcaa 5659085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 6208544 - 6208846
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6208544 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 6208643  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  6208644 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 6208743  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  6208744 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 6208842  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  6208843 tcaa 6208846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 18057917 - 18058219
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18057917 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18058016  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  18058017 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 18058116  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  18058117 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 18058215  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  18058216 tcaa 18058219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4790242 - 4789940
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  4790242 cccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccgaaga 4790143  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  4790142 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 4790043  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     
T  4790042 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttataccatccatgcatatcgcatttccaatg 4789944  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  4789943 tcaa 4789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8283071 - 8282769
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8283071 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 8282972  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  |    
T  8282971 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagt 8282872  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  8282871 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 8282773  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  8282772 tcaa 8282769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Original strand, 16422854 - 16423158
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16422854 tccccagtagagtcttccgagattctatcccctgcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 16422953  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| || | | | |   ||||||||||||   ||||     
T  16422954 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtacccaatactccagtgccttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaaccgccaaca 16423053  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 322  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| | |    
T  16423054 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatataat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccga 16423152  T
Q  323 tatcaa 328  Q
    ||||||    
T  16423153 tatcaa 16423158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 267
Target Start/End: Original strand, 16599406 - 16599525
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||    
T  16599406 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaatagtcatgcattacaagcattcataca 16599505  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  16599506 tgcataatcatgcatattac 16599525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15886328 - 15886026
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15886328 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 15886229  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |    ||||||||||    ||||  |    
T  15886228 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactatgtctacaaatcgccaacagt 15886129  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  15886128 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 15886030  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  15886029 tcaa 15886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 18337273 - 18337575
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18337273 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcgtagctacctgccctcagccagggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18337372  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  18337373 ggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaatcgccaacagt 18337472  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  18337473 catgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttgtatcatccatgcatattgcatttccaatg 18337571  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  18337572 tcaa 18337575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22381191 - 22380949
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22381191 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22381092  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  22381091 ggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaatcgccaacagt 22380992  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22380991 catgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22380949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 328
Target Start/End: Original strand, 7080022 - 7080201
Alignment:
Q  148 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7080022 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacgaattgccaacggtcatgcattacaagcattcataca 7080121  T
Q  248 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||||| ||||||| |||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||| ||||    
T  7080122 tgcataatcatgcctattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatgtcaa 7080201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 4690324 - 4690626
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4690324 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4690423  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  4690424 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 4690523  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  4690524 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaata 4690622  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  4690623 tcaa 4690626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15734710 - 15734425
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |     
T  15734710 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcaaccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 15734611  T
Q  143 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |   |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| |||  |||    
T  15734610 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctacgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagaatt 15734511  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  15734510 catacatgcatagtcatgcatattatgtgcctatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatgtcaa 15734425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 7079877 - 7079981
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  7079877 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgttatccccagaga 7079976  T
Q  134 ggatt 138  Q
     ||||    
T  7079977 agatt 7079981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 51644921 - 51645229
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  51644921 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 51645020  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51645021 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 51645120  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 313  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  51645121 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattg 51645219  T
Q  314 catttgcaat 323  Q
    ||||| ||||    
T  51645220 catttccaat 51645229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 10951791 - 10952044
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  10951791 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgt 10951890  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10951891 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaa 10951990  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10951991 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10952044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Original strand, 10969369 - 10969593
Alignment:
Q  49 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  10969369 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 10969468  T
Q  146 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 240  Q
         | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  10969469 tgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 10969568  T
Q  241 tcatacatgcatgatcatgcatatt 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10969569 tcatacatgcataatcatgcatatt 10969593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 3647846 - 3648099
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3647846 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 3647945  T
Q  122 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     ||||||| ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3647946 catctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 3648045  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3648046 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3648099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 28591780 - 28592033
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28591780 aacggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccctagcaagttacatacctaccagccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 28591879  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28591880 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 28591979  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28591980 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28592033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16201580 - 16201276
Alignment:
Q  32 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16201580 tccccagtagagtcttccgagattctacccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaacggtgttatctccaaa 16201481  T
Q  132 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 222  Q
    |||||||||        | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  16201480 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 16201381  T
Q  223 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 322  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  16201380 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaa 16201282  T
Q  323 tatcaa 328  Q
    | ||||    
T  16201281 tgtcaa 16201276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 28156425 - 28156657
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  28156425 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28156524  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  28156525 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 28156624  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28156625 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28156657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41786872 - 41786640
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  41786872 gtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 41786773  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  41786772 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 41786673  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41786672 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 41786640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20333947 - 20333667
Alignment:
Q  51 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |     
T  20333947 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtg 20333848  T
Q  143 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 241  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  20333847 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcatt 20333748  T
Q  242 catacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20333747 catacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaat 20333667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14692464 - 14692162
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14692464 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14692365  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14692364 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14692265  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14692264 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14692166  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  14692165 tcaa 14692162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14695146 - 14694844
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14695146 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14695047  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14695046 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14694947  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14694946 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14694848  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  14694847 tcaa 14694844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14697830 - 14697528
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14697830 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14697731  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14697730 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14697631  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14697630 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14697532  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  14697531 tcaa 14697528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14700511 - 14700209
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14700511 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14700412  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14700411 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14700312  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14700311 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14700213  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  14700212 tcaa 14700209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Original strand, 20467504 - 20467792
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  20467504 gtcttccgagattctatccccagcaagttacatagctacctaccctcagccatggttccgatatgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 20467603  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |   |||   |||||||||| ||  ||||  |||||||||     
T  20467604 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtggccaatactccaatgccttgtctgtctctacgaaacggtgtctacaagctgccaacagtcatgcatta 20467703  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20467704 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 20467792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21891297 - 21891136
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21891297 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 21891198  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgt 187  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21891197 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgt 21891136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 232
Target Start/End: Original strand, 13769558 - 13769631
Alignment:
Q  159 actacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||    
T  13769558 actacgtgcccaatactctaatgtattgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcatt 13769631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 14636 - 14892
Alignment:
Q  19 cataacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  14636 cataacggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacga 14735  T
Q  119 cgttatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctac 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14736 cgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctac 14835  T
Q  211 aaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14836 aaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 14892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2607
Alignment:
Q  29 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||    
T  2361 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctttggttccgacacgtctcccaacaacgtcatctcc 2460  T
Q  129 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 220  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  2461 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 2560  T
Q  221 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2561 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Original strand, 12769 - 13062
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12769 gtcttccgagattctatccgcaacaagtttcatagctacctgccctcggccgtggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 12868  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| ||||  ||||  |||| ||||     
T  12869 gggatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctactaactgccaacagtcatacatta 12968  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  12969 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcacccatgcatattgcatttccaatgtcaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8479 - 8187
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  8479 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 8380  T
Q  143 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 234  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  8379 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 8280  T
Q  235 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 328  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  8279 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 8187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Original strand, 28012 - 28310
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28012 gtcttccgagattctatccccagcaagttatatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 28111  T
Q  143 tg-atg-----tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 235  Q
     | |||     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||    
T  28112 agaatgtgtgatataacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctcagcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattaca 28211  T
Q  236 atcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcagt 335  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  28212 agcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttcccatgtcaatttcagt 28310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 10615 - 10869
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  10615 aacggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgcatagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgt 10714  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga---------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaa 212  Q
     |||||||||||||||||| | ||         | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  10715 catctccaaagaggatttccaagaaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccctgtgaagtcgtgcttacaa 10814  T
Q  213 actatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10815 actgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 33981 - 34283
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33981 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 34080  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  34081 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 34180  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  34181 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaata 34279  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  34280 tcaa 34283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 12725 - 13026
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12725 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 12824  T
Q  134 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 225  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  12825 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 12924  T
Q  226 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  12925 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgt 13023  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  13024 caa 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2736 - 2483
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||    
T  2736 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgt 2637  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2636 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 2537  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2536 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18582
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggtt 99  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  18505 aacggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggtt 18582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26108 - 25808
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26108 gtcttccgagattctttccccagcaagttgcttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 26009  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  26008 agaatgtgtgatatagcatgagccactacgtgcccaatagtccaatgttttgtgtgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25909  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 333  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  || | |||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  25908 caagcattcatacatgcataatcatgcatactatgtgcccatacatttgat-aaaactattataccacccatacatctttcatttccaatgtcaatttca 25810  T
Q  334 gt 335  Q
    ||    
T  25809 gt 25808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 16273 - 16526
Alignment:
Q  22 aacggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 121  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16273 aacggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 16372  T
Q  122 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 213  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16373 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatataacacgagccactacgtgcccaatactctgatgttttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 16472  T
Q  214 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16473 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcacaatcatgcatattac 16526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 490 - 782
Alignment:
Q  43 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  490 gtcttccgagattctatccccagcaggttgcatagctacctgccctcaaccatggttctgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccg 589  T
Q  141 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 233  Q
          | | || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||| ||  | || ||||||||||     
T  590 ggaatgtgtaatatagcacgagacactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaagctgcccacaatcatgcatta 689  T
Q  234 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 327  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |  || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  690 caagcattcatacatgcataatcatgcatacaaagtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24521 - 24212
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24521 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24422  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    | |||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |   | |||||||||    || |  |    
T  24421 gaatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctccgcggaactgcgtctacaaatcgccagcagt 24322  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 324  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | || |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||     
T  24321 cgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacatgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatg 24223  T
Q  325 tcaatgtcagt 335  Q
    ||||| |||||    
T  24222 tcaatatcagt 24212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4163 - 3921
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 133  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4163 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgcccttagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4064  T
Q  134 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 224  Q
    |||| ||        | | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  4063 ggatgtccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 3964  T
Q  225 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3963 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9209 - 8966
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 132  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9209 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatggctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 9110  T
Q  133 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 223  Q
    ||||| ||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||      
T  9109 aggatgtccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacag 9010  T
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9009 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 8966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40171 - 40064
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccc-tcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 131  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40171 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcattaactacctgcccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 40072  T
Q  132 gaggattt 139  Q
    ||||||||    
T  40071 gaggattt 40064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39965 - 39922
Alignment:
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39965 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1412 - 1309
Alignment:
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 323  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  1412 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 1314  T
Q  324 atcaa 328  Q
     ||||    
T  1313 gtcaa 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Original strand, 6751 - 6807
Alignment:
Q  34 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctca 90  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6751 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctca 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13324 - 13281
Alignment:
Q  224 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 267  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13324 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 13281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University