View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6845_low_8 (Length: 377)

Name: NF6845_low_8
Description: NF6845
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6845_low_8
NF6845_low_8
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-361)||(19674229-19674589)
chr8 (1-360)||(28362023-28362379)
chr8 (1-361)||(16277345-16277702)
chr8 (1-361)||(27608972-27609329)
chr8 (1-361)||(2137326-2137683)
chr8 (1-360)||(19208428-19208784)
chr8 (1-361)||(14557418-14557772)
chr8 (2-361)||(19687890-19688246)
chr8 (1-357)||(31489821-31490174)
chr8 (1-361)||(18710377-18710734)
chr8 (1-360)||(33258514-33258870)
chr8 (1-361)||(31354315-31354672)
chr8 (2-368)||(16283241-16283604)
chr8 (1-190)||(3329754-3329943)
chr8 (1-190)||(19518378-19518567)
chr8 (1-190)||(29829104-29829293)
chr8 (4-190)||(12092968-12093154)
chr8 (2-169)||(19286257-19286424)
chr8 (219-360)||(3329575-3329716)
chr8 (219-361)||(19286468-19286610)
chr8 (219-360)||(12092792-12092933)
chr8 (219-361)||(29829328-29829470)
chr8 (221-285)||(19518280-19518344)
chr8 (34-156)||(19659305-19659427)
chr8 (34-156)||(44562928-44563050)
chr8 (80-156)||(9354495-9354571)
chr8 (215-368)||(44563103-44563256)
chr8 (218-368)||(9354627-9354777)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (2-361)||(11635283-11635642)
chr2 (2-361)||(11641472-11641831)
chr2 (2-361)||(34279237-34279593)
chr2 (1-357)||(32049585-32049938)
chr2 (1-361)||(34286141-34286498)
chr2 (1-361)||(34291201-34291558)
chr2 (1-360)||(21677280-21677636)
chr2 (1-361)||(28882001-28882358)
chr2 (1-361)||(23128663-23129020)
chr2 (2-361)||(12655330-12655686)
chr2 (2-361)||(22926125-22926481)
chr2 (1-357)||(34861467-34861820)
chr2 (1-357)||(37686010-37686363)
chr2 (1-357)||(37701275-37701628)
chr2 (1-357)||(37925280-37925633)
chr2 (2-368)||(20837706-20838069)
chr2 (1-361)||(13936641-13936998)
chr2 (2-368)||(27434534-27434897)
chr2 (1-360)||(31876068-31876424)
chr2 (1-360)||(16829436-16829792)
chr2 (1-360)||(16891689-16892045)
chr2 (1-357)||(19416600-19416953)
chr2 (1-190)||(12716870-12717059)
chr2 (1-361)||(27816761-27817124)
chr2 (1-186)||(261034-261219)
chr2 (1-190)||(40233286-40233475)
chr2 (1-361)||(39051919-39052282)
chr2 (1-190)||(12586588-12586777)
chr2 (1-190)||(27803479-27803668)
chr2 (1-190)||(39889849-39890038)
chr2 (1-190)||(9350259-9350448)
chr2 (1-190)||(27776994-27777183)
chr2 (1-155)||(37374948-37375102)
chr2 (221-368)||(40233515-40233662)
chr2 (219-361)||(37375163-37375305)
chr2 (227-361)||(260850-260984)
chr2 (218-360)||(39890075-39890217)
chr2 (221-361)||(12716699-12716839)
chr2 (221-361)||(27777226-27777366)
chr2 (221-361)||(27803711-27803851)
chr2 (221-361)||(9350079-9350219)
chr2 (221-361)||(12586814-12586954)
chr2 (2-156)||(21703460-21703614)
chr2 (210-368)||(21703254-21703412)
chr2 (215-361)||(31891425-31891571)
chr2 (2-156)||(19456717-19456871)
chr2 (215-368)||(19456511-19456664)
chr2 (34-156)||(31891624-31891746)
chr2 (215-368)||(27118686-27118839)
chr2 (80-156)||(3784523-3784599)
chr2 (80-156)||(27118557-27118633)
chr2 (80-156)||(34156880-34156956)
chr2 (80-155)||(34303600-34303675)
chr2 (80-181)||(27392859-27392960)
chr2 (80-156)||(16163468-16163544)
chr2 (215-368)||(34303393-34303546)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (2-361)||(5005677-5006036)
chr4 (1-357)||(27163429-27163782)
chr4 (1-361)||(24592422-24592776)
chr4 (1-361)||(6569659-6570016)
chr4 (2-361)||(17013807-17014163)
chr4 (2-361)||(14664825-14665181)
chr4 (1-360)||(40105747-40106103)
chr4 (1-361)||(14763412-14763769)
chr4 (1-360)||(31126627-31126983)
chr4 (1-361)||(14098347-14098704)
chr4 (1-361)||(21969507-21969864)
chr4 (1-190)||(30753548-30753737)
chr4 (1-190)||(18800898-18801087)
chr4 (1-190)||(33674086-33674275)
chr4 (1-190)||(39850429-39850618)
chr4 (1-136)||(19373067-19373202)
chr4 (2-169)||(54833197-54833364)
chr4 (219-357)||(18800725-18800863)
chr4 (219-361)||(54833408-54833550)
chr4 (1-169)||(36344809-36344977)
chr4 (219-361)||(36344623-36344765)
chr4 (221-361)||(33673906-33674046)
chr4 (221-360)||(30753777-30753916)
chr4 (221-361)||(39850661-39850801)
chr4 (2-156)||(1900067-1900221)
chr4 (2-156)||(15227680-15227834)
chr4 (215-368)||(15227887-15228040)
chr4 (2-156)||(15285235-15285389)
chr4 (215-368)||(15285029-15285182)
chr4 (13-169)||(24112483-24112639)
chr4 (13-169)||(34189254-34189410)
chr4 (218-360)||(24112682-24112824)
chr4 (218-360)||(34189069-34189211)
chr4 (80-181)||(14235810-14235911)
chr4 (80-156)||(24460912-24460988)
chr4 (210-368)||(1900269-1900427)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (1-361)||(28116103-28116463)
chr3 (1-361)||(7072964-7073321)
chr3 (1-357)||(7996314-7996667)
chr3 (1-357)||(10642822-10643175)
chr3 (1-361)||(4796802-4797159)
chr3 (1-361)||(4721383-4721740)
chr3 (1-361)||(35880518-35880875)
chr3 (1-361)||(6192068-6192425)
chr3 (1-357)||(47023205-47023558)
chr3 (1-361)||(29148904-29149261)
chr3 (2-361)||(28339055-28339411)
chr3 (2-361)||(31964622-31964978)
chr3 (2-361)||(50134220-50134576)
chr3 (1-361)||(4416668-4417028)
chr3 (2-361)||(5609471-5609827)
chr3 (1-361)||(18330426-18330778)
chr3 (2-368)||(8301409-8301769)
chr3 (1-361)||(18051014-18051371)
chr3 (1-361)||(21674445-21674802)
chr3 (2-361)||(8295728-8296081)
chr3 (2-368)||(15892848-15893211)
chr3 (1-360)||(17985106-17985462)
chr3 (1-361)||(18277201-18277558)
chr3 (1-361)||(18292502-18292859)
chr3 (1-361)||(18307803-18308160)
chr3 (80-360)||(5713058-5713335)
chr3 (80-360)||(5723968-5724245)
chr3 (80-360)||(5757232-5757509)
chr3 (80-360)||(5768123-5768400)
chr3 (1-361)||(10395888-10396242)
chr3 (1-357)||(5013464-5013817)
chr3 (1-357)||(24327911-24328264)
chr3 (1-360)||(18224943-18225299)
chr3 (1-190)||(11110678-11110867)
chr3 (1-169)||(15741420-15741588)
chr3 (1-190)||(29665302-29665491)
chr3 (1-190)||(36997406-36997595)
chr3 (1-190)||(20577179-20577368)
chr3 (1-190)||(6542791-6542980)
chr3 (1-190)||(48465667-48465856)
chr3 (1-190)||(51781763-51781952)
chr3 (1-190)||(51796852-51797041)
chr3 (2-190)||(18242480-18242668)
chr3 (1-190)||(22871191-22871380)
chr3 (1-190)||(22886250-22886439)
chr3 (209-361)||(15741243-15741395)
chr3 (1-169)||(20065798-20065966)
chr3 (1-169)||(8211493-8211661)
chr3 (2-169)||(5466738-5466905)
chr3 (1-156)||(5596717-5596872)
chr3 (218-361)||(22387727-22387870)
chr3 (1-169)||(4347022-4347190)
chr3 (1-169)||(28021030-28021198)
chr3 (218-361)||(22871005-22871148)
chr3 (218-361)||(22886064-22886207)
chr3 (219-360)||(6542612-6542753)
chr3 (221-361)||(48465896-48466036)
chr3 (218-361)||(4346836-4346979)
chr3 (227-361)||(8211713-8211847)
chr3 (221-360)||(36997227-36997366)
chr3 (219-360)||(18242706-18242847)
chr3 (221-361)||(11110498-11110638)
chr3 (219-360)||(5596507-5596648)
chr3 (220-360)||(5466953-5467093)
chr3 (218-361)||(28021241-28021384)
chr3 (221-361)||(20576996-20577136)
chr3 (221-361)||(29665119-29665259)
chr3 (263-360)||(51782034-51782131)
chr3 (263-360)||(51797123-51797221)
chr3 (215-368)||(32292715-32292868)
chr3 (218-368)||(31034259-31034409)
chr3 (215-368)||(18530351-18530504)
chr3 (13-169)||(4892977-4893133)
chr3 (215-368)||(16626648-16626801)
chr3 (80-156)||(18530228-18530304)
chr3 (13-169)||(22387913-22388069)
chr3 (13-169)||(32438921-32439077)
chr3 (218-340)||(4893176-4893298)
chr3 (2-156)||(16626854-16627008)
chr3 (80-156)||(17994132-17994208)
chr3 (80-155)||(4625778-4625853)
chr3 (218-360)||(32439120-32439262)
chr3 (219-360)||(20066010-20066151)
chr3 (80-156)||(5652221-5652297)
chr3 (218-368)||(17993926-17994076)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-361)||(16736454-16736811)
chr7 (1-361)||(16751508-16751865)
chr7 (1-361)||(17523324-17523681)
chr7 (1-361)||(17529534-17529891)
chr7 (1-357)||(45387135-45387488)
chr7 (1-361)||(5127784-5128141)
chr7 (1-361)||(5147334-5147691)
chr7 (1-361)||(2154365-2154722)
chr7 (1-360)||(9618443-9618799)
chr7 (1-360)||(26275089-26275445)
chr7 (1-361)||(11424770-11425127)
chr7 (1-360)||(26319864-26320220)
chr7 (1-361)||(10916862-10917216)
chr7 (1-357)||(26669912-26670265)
chr7 (2-368)||(16503367-16503730)
chr7 (2-368)||(16518403-16518766)
chr7 (2-361)||(26435050-26435406)
chr7 (1-360)||(4145118-4145474)
chr7 (1-360)||(24592536-24592892)
chr7 (1-190)||(11441352-11441541)
chr7 (1-190)||(26538035-26538224)
chr7 (1-190)||(31124703-31124892)
chr7 (1-190)||(31564561-31564750)
chr7 (1-186)||(26485910-26486095)
chr7 (1-190)||(3445086-3445275)
chr7 (219-360)||(31564385-31564526)
chr7 (221-357)||(26537868-26538004)
chr7 (219-360)||(31124927-31125068)
chr7 (221-360)||(3445315-3445454)
chr7 (263-360)||(11441623-11441720)
chr7 (2-150)||(16041119-16041267)
chr7 (215-368)||(2108992-2109145)
chr7 (215-368)||(26484697-26484850)
chr7 (13-169)||(5159326-5159482)
chr7 (210-368)||(16041321-16041479)
chr7 (2-148)||(16450199-16450345)
chr7 (215-368)||(39211010-39211163)
chr7 (218-368)||(2775365-2775515)
chr7 (218-360)||(5159525-5159667)
chr7 (215-368)||(16449985-16450138)
chr7 (221-322)||(26485756-26485857)
chr7 (80-156)||(31088657-31088733)
chr7 (80-156)||(45733334-45733410)
chr7 (215-360)||(18540802-18540947)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (1-361)||(16749642-16749999)
chr6 (1-361)||(26918168-26918525)
chr6 (1-361)||(26999861-27000218)
chr6 (1-361)||(15424368-15424725)
chr6 (1-361)||(26988789-26989146)
chr6 (2-361)||(13299002-13299358)
chr6 (1-361)||(24304669-24305026)
chr6 (2-361)||(24863506-24863862)
chr6 (5-368)||(22934924-22935281)
chr6 (5-368)||(23857369-23857726)
chr6 (1-360)||(29572801-29573157)
chr6 (2-360)||(4757550-4757908)
chr6 (1-360)||(30558068-30558424)
chr6 (1-360)||(16944079-16944435)
chr6 (1-190)||(3695851-3696040)
chr6 (4-190)||(4546003-4546189)
chr6 (4-190)||(4724362-4724548)
chr6 (4-190)||(28207233-28207419)
chr6 (1-190)||(27007500-27007689)
chr6 (1-190)||(27360229-27360418)
chr6 (1-190)||(27450572-27450761)
chr6 (1-190)||(34463580-34463769)
chr6 (2-190)||(4772786-4772974)
chr6 (1-190)||(16673915-16674104)
chr6 (1-190)||(27484905-27485094)
chr6 (1-190)||(17025050-17025239)
chr6 (1-190)||(26116638-26116827)
chr6 (1-190)||(26777846-26778035)
chr6 (1-169)||(27044178-27044346)
chr6 (1-169)||(29549266-29549434)
chr6 (209-368)||(27272624-27272783)
chr6 (1-156)||(29501194-29501349)
chr6 (219-360)||(4773009-4773150)
chr6 (221-357)||(3696086-3696222)
chr6 (221-361)||(34463397-34463537)
chr6 (227-360)||(4545827-4545960)
chr6 (218-361)||(29549477-29549620)
chr6 (219-361)||(27044390-27044532)
chr6 (227-360)||(4724186-4724319)
chr6 (227-360)||(28207465-28207598)
chr6 (1-169)||(4525077-4525245)
chr6 (219-360)||(4525289-4525430)
chr6 (219-360)||(27360044-27360185)
chr6 (219-360)||(27450387-27450528)
chr6 (221-361)||(16674144-16674284)
chr6 (219-361)||(27007730-27007872)
chr6 (219-360)||(26116462-26116603)
chr6 (218-360)||(26777667-26777809)
chr6 (219-360)||(27485132-27485273)
chr6 (219-360)||(29501418-29501559)
chr6 (9-181)||(22477501-22477673)
chr6 (219-366)||(20160704-20160851)
chr6 (219-366)||(22171980-22172127)
chr6 (215-368)||(14143329-14143482)
chr6 (215-368)||(26787943-26788096)
chr6 (215-368)||(27196316-27196469)
chr6 (215-368)||(27252771-27252924)
chr6 (216-368)||(27290414-27290566)
chr6 (80-162)||(20160571-20160653)
chr6 (80-162)||(22172178-22172260)
chr6 (218-308)||(27629804-27629894)
chr6 (80-156)||(13522323-13522399)
chr6 (80-156)||(28162527-28162603)
chr6 (80-156)||(33374506-33374582)
chr6 (219-361)||(17025280-17025422)
chr6 (80-156)||(8892560-8892636)
chr6 (80-156)||(8903795-8903871)
chr6 (77-170)||(27629948-27630041)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (1-361)||(41674509-41674866)
chr5 (1-361)||(9548548-9548905)
chr5 (1-361)||(15658765-15659122)
chr5 (1-360)||(8665481-8665837)
chr5 (1-361)||(23717993-23718350)
chr5 (1-361)||(33777287-33777644)
chr5 (1-361)||(23752455-23752812)
chr5 (1-361)||(11549154-11549511)
chr5 (1-357)||(30168269-30168622)
chr5 (1-360)||(5637710-5638066)
chr5 (1-360)||(9317251-9317607)
chr5 (1-361)||(22999119-22999476)
chr5 (1-357)||(30151818-30152171)
chr5 (1-360)||(12131955-12132311)
chr5 (1-360)||(26480192-26480548)
chr5 (1-360)||(2510851-2511207)
chr5 (2-361)||(30934437-30934790)
chr5 (2-368)||(24688155-24688518)
chr5 (1-361)||(6874102-6874462)
chr5 (1-360)||(15758863-15759219)
chr5 (1-360)||(18375418-18375774)
chr5 (1-360)||(33516156-33516512)
chr5 (1-360)||(29967072-29967428)
chr5 (1-360)||(30029215-30029571)
chr5 (47-368)||(24969870-24970182)
chr5 (1-190)||(31431228-31431417)
chr5 (1-190)||(18500921-18501110)
chr5 (1-190)||(24681237-24681426)
chr5 (1-190)||(24723764-24723953)
chr5 (1-190)||(37358828-37359017)
chr5 (2-190)||(37671665-37671853)
chr5 (1-190)||(43078049-43078238)
chr5 (1-190)||(3789326-3789515)
chr5 (1-190)||(13325017-13325206)
chr5 (1-190)||(31826592-31826781)
chr5 (1-190)||(28649026-28649215)
chr5 (1-190)||(37754768-37754957)
chr5 (1-190)||(37771172-37771361)
chr5 (219-361)||(18500735-18500877)
chr5 (1-186)||(28959975-28960160)
chr5 (1-190)||(40473725-40473914)
chr5 (219-361)||(28649250-28649392)
chr5 (218-360)||(34616532-34616674)
chr5 (219-361)||(37770992-37771134)
chr5 (227-360)||(31431463-31431596)
chr5 (219-360)||(37754995-37755136)
chr5 (2-368)||(23892007-23892370)
chr5 (219-361)||(37671488-37671630)
chr5 (221-361)||(43078269-43078409)
chr5 (1-156)||(32599676-32599831)
chr5 (218-361)||(32599477-32599620)
chr5 (219-360)||(3789556-3789697)
chr5 (1-169)||(34616321-34616489)
chr5 (2-146)||(25198833-25198977)
chr5 (221-360)||(31826413-31826552)
chr5 (218-360)||(28959792-28959934)
chr5 (219-360)||(37358649-37358790)
chr5 (221-361)||(24681457-24681597)
chr5 (221-361)||(24723984-24724124)
chr5 (221-361)||(40473554-40473694)
chr5 (210-368)||(22888476-22888634)
chr5 (215-368)||(29889080-29889233)
chr5 (13-169)||(33292340-33292496)
chr5 (210-368)||(25199035-25199193)
chr5 (219-360)||(13324835-13324976)
chr5 (15-156)||(22888287-22888428)
chr5 (218-360)||(33292539-33292681)
chr5 (80-156)||(13184852-13184928)
chr5 (80-156)||(13440698-13440774)
chr5 (80-156)||(33877129-33877205)
chr5 (80-156)||(11325676-11325752)
chr5 (2-42)||(24951911-24951951)
chr5 (218-368)||(11325808-11325958)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-361)||(41793416-41793773)
chr1 (1-360)||(10962460-10962816)
chr1 (1-357)||(28584771-28585124)
chr1 (1-361)||(51638008-51638365)
chr1 (2-156)||(20460899-20461053)
chr1 (210-368)||(16208132-16208290)
chr1 (210-368)||(20340436-20340594)
chr1 (215-368)||(28151863-28152016)
chr1 (80-156)||(20340642-20340718)
chr1 (215-361)||(20461082-20461228)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-361)||(27083-27440)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-361)||(237-595)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-360)||(7348-7704)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (2-357)||(9178-9530)
scaffold0159 (2-357)||(19807-20159)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-361)||(47093-47450)
scaffold0089 (2-368)||(40170-40533)
scaffold0089 (2-366)||(29555-29916)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-360)||(15039-15395)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-360)||(30244-30599)
scaffold0124 (2-156)||(20204-20358)
scaffold0124 (215-368)||(20390-20543)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-360)||(26310-26667)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (4-190)||(7731-7917)
scaffold0038 (227-360)||(7963-8096)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-190)||(9-198)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (1-190)||(5779-5971)
scaffold0415 (219-361)||(6015-6160)
scaffold0415 (314-368)||(2018-2072)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (1-169)||(8023-8191)
scaffold0336 (218-361)||(9571-9714)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (215-368)||(46909-47072)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (210-368)||(2759-2917)
scaffold0260 (80-156)||(2965-3041)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (9-181)||(21366-21538)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (218-309)||(94-185)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 19674229 - 19674589
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674229 tggagccagtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 19674328  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  19674329 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 19674428  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19674429 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 19674528  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674529 acagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28362379 - 28362023
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  28362379 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 28362280  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  28362279 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 28362183  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28362182 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 28362083  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28362082 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 28362023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 16277345 - 16277702
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277345 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccg 16277444  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  16277445 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 16277541  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16277542 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 16277641  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16277642 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 16277702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27609329 - 27608972
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27609329 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgtcgtattctcagcatcctttctttccg 27609230  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  27609229 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 27609133  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27609132 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 27609033  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27609032 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 27608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2137683 - 2137326
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137683 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccg 2137584  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  2137583 tcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 2137487  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  2137486 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 2137387  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2137386 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 2137326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19208784 - 19208428
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  19208784 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 19208685  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  19208684 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 19208588  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19208587 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 19208488  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19208487 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 19208428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 14557418 - 14557772
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14557418 tggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccg 14557517  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  14557518 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt------caac 14557611  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  14557612 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 14557711  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14557712 acagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 14557772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 19687890 - 19688246
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19687890 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgc 19687989  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||               
T  19687990 cattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggtt---caacaaca 19688086  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  19688087 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 19688186  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19688187 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 19688246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31490174 - 31489821
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  31490174 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 31490075  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||              
T  31490074 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggtt---caacaac 31489978  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31489977 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 31489878  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31489877 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 31489821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 18710377 - 18710734
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  18710377 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 18710476  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  18710477 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacagc 18710576  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaa---gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgac 297  Q
             | ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18710577 agc------agcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 18710670  T
Q  298 tagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18710671 tagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 18710734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33258514 - 33258870
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  33258514 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 33258613  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  33258614 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 33258710  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258711 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 33258810  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33258811 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 33258870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 31354315 - 31354672
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31354315 tggagccggtcaatccatggccaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 31354414  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| |  |||| ||  ||||||||              
T  31354415 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaac 31354514  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31354515 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 31354611  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31354612 acagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31354672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Original strand, 16283241 - 16283604
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16283241 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgc 16283340  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  16283341 cattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16283440  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
            |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||    
T  16283441 acaac---atcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccaga 16283537  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  16283538 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 16283604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3329943 - 3329754
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  3329943 tggagccggtcaatccatggctatcgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccattcttccca 3329844  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3329843 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 3329754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19518567 - 19518378
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19518567 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 19518468  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19518467 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 19518378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 29829104 - 29829293
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  29829104 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 29829203  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29829204 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgtcggtt 29829293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12093154 - 12092968
Alignment:
Q  4 agccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcca 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  12093154 agccggccaatctatggctactattgctcctatcaatgcagctcaagtgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccg 12093055  T
Q  104 ttttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12093054 ttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 12092968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 19286257 - 19286424
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  19286257 ggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccac 19286356  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    | ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  19286357 cgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacag 19286424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329575
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 3329575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286610
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19286610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092792
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 12092792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829470
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 29829470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19518344 - 19518280
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagg 285  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19518344 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19659427 - 19659305
Alignment:
Q  34 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 133  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  19659427 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 19659328  T
Q  134 caacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  19659327 caacctcaggtacccgttaatgc 19659305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 44562928 - 44563050
Alignment:
Q  34 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 133  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||     
T  44562928 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 44563027  T
Q  134 caacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  44563028 caacctcaggtacccgttaatgc 44563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 9354495 - 9354571
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9354495 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 9354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563256
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||| ||||||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 44563256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 368
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9354777
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||| ||||||  | |||||| || || || |||||||| ||  | ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 9354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11635642 - 11635283
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11635642 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgc 11635543  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  11635542 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11635443  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11635442 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 11635343  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11635342 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11635283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11641831 - 11641472
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11641831 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgc 11641732  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  11641731 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11641632  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11641631 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 11641532  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11641531 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11641472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 34279237 - 34279593
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279237 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgc 34279336  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  34279337 cattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaaca 34279433  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34279434 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaga 34279533  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34279534 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34279593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 32049585 - 32049938
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32049585 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 32049684  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  32049685 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 32049781  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32049782 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 32049881  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32049882 acagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 32049938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 34286141 - 34286498
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34286141 tggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccg 34286240  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  34286241 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 34286337  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34286338 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 34286437  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34286438 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34286498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 34291201 - 34291558
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34291201 tggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccg 34291300  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  34291301 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 34291397  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34291398 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 34291497  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34291498 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34291558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21677636 - 21677280
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677636 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 21677537  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  21677536 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 21677440  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21677439 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 21677340  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21677339 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 21677280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 28882001 - 28882358
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882001 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 28882100  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  28882101 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 28882197  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  28882198 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 28882297  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28882298 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 28882358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23129020 - 23128663
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129020 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccg 23128921  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  23128920 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 23128824  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  23128823 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 23128724  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23128723 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 23128663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 12655330 - 12655686
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655330 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 12655429  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||               
T  12655430 cattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 12655526  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  12655527 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaga 12655626  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12655627 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 12655686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22926481 - 22926125
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22926481 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 22926382  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  22926381 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 22926285  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22926284 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 22926185  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22926184 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22926125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 34861467 - 34861820
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  34861467 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 34861566  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  34861567 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 34861663  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34861664 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 34861763  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34861764 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 34861820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37686363 - 37686010
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37686363 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37686264  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  37686263 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 37686167  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37686166 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 37686067  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37686066 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37686010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37701628 - 37701275
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37701628 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37701529  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  37701528 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 37701432  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37701431 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 37701332  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37701331 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37701275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 37925280 - 37925633
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37925280 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37925379  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  37925380 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 37925476  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37925477 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 37925576  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37925577 acagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37925633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Original strand, 20837706 - 20838069
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837706 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcatccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 20837805  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||               
T  20837806 cattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 20837902  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20837903 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactaga 20838002  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||||||| ||||||    
T  20838003 cagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatc 20838069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13936998 - 13936641
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936998 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 13936899  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  13936898 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggtt---caacaac 13936802  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  13936801 aacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactag 13936702  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
     ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  13936701 gcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 13936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27434897 - 27434534
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27434897 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccac 27434798  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  27434797 cattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaaca 27434701  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  27434700 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccaga 27434601  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  27434600 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27434534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 31876068 - 31876424
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31876068 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 31876167  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  31876168 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 31876264  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31876265 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 31876364  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31876365 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31876424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16829792 - 16829436
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  16829792 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 16829693  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  16829692 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 16829596  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16829595 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactag 16829496  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16829495 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 16829436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 16891689 - 16892045
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  16891689 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 16891788  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  16891789 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 16891885  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16891886 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactag 16891985  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16891986 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 16892045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19416953 - 19416600
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  19416953 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 19416854  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  19416853 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 19416757  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416756 aacaacaaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 19416657  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19416656 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 19416600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12717059 - 12716870
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12717059 tggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 12716960  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12716959 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 12716870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 27816761 - 27817124
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27816761 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 27816860  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  27816861 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaac 27816960  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagcta---gacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgac 297  Q
             | ||||||  ||   |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  27816961 aacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgac 27817060  T
Q  298 tagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27817061 taggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 27817124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 261219 - 261034
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  261219 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 261120  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgcc 186  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  261119 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgcc 261034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 40233286 - 40233475
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  40233286 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 40233385  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40233386 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 40233475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39052282 - 39051919
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  39052282 tggagccggtcaatcaatagcaaccgttgctcctaccaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 39052183  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  39052182 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaac 39052083  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagcta---gacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgac 297  Q
             | ||||||  ||   |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  39052082 aacagcagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgac 39051983  T
Q  298 tagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  39051982 taggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 39051919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 12586588 - 12586777
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12586588 tggagccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 12586687  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12586688 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 12586777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27803479 - 27803668
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27803479 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 27803578  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27803579 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 27803668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39889849 - 39890038
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  39889849 tggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 39889948  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39889949 ccgttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 39890038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9350448 - 9350259
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9350448 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 9350349  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9350348 ccgttttaccatcagtaccccctgctaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggtt 9350259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27776994 - 27777183
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27776994 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 27777093  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27777094 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 27777183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 37374948 - 37375102
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  37374948 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaacgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccg 37375047  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatg 155  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  37375048 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatg 37375102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 368
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233662
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 40233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375305
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37375305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260850
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 260850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890217
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtga 39890217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12716839 - 12716699
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  12716839 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12716740  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12716739 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 12716699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777366
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 27777366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27803851
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27803810  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27803811 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 27803851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9350079
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||  | ||||| |    
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 9350079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12586954
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12586913  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12586914 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 12586954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21703614 - 21703460
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  21703614 ggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccac 21703515  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21703514 cattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 21703460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21703412 - 21703254
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||  ||    
T  21703412 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 21703254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891425
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 31891425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19456871 - 19456717
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||| |    
T  19456871 ggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccac 19456772  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19456771 cattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 19456717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19456664 - 19456511
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  19456664 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 19456565  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19456564 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 19456511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31891746 - 31891624
Alignment:
Q  34 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggt 133  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||     
T  31891746 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 31891647  T
Q  134 caacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  31891646 caacctcaggtacccgttaatgc 31891624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27118839
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||| ||||||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 27118839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 3784523 - 3784599
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3784523 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 3784599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 27118557 - 27118633
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27118557 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 27118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 34156880 - 34156956
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34156880 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 34156956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34303675 - 34303600
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34303675 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatg 34303600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Original strand, 27392859 - 27392960
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  27392859 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 27392958  T
Q  180 ag 181  Q
    ||    
T  27392959 ag 27392960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 16163468 - 16163544
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16163468 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16163544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303393
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||| ||||||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 34303393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 5005677 - 5006036
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5005677 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgc 5005776  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  5005777 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5005876  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5005877 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 5005976  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5005977 caaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27163782 - 27163429
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27163782 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 27163683  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  27163682 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 27163586  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27163585 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 27163486  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27163485 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 27163429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24592776 - 24592422
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592776 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 24592677  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||              
T  24592676 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt------caac 24592583  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24592582 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 24592483  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24592482 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 24592422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 6569659 - 6570016
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569659 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 6569758  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              
T  6569759 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagtt---caacagc 6569855  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6569856 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 6569955  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6569956 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6570016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 17013807 - 17014163
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013807 ggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 17013906  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||               
T  17013907 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 17014003  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17014004 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccaga 17014103  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  17014104 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 17014163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 14664825 - 14665181
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664825 ggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgc 14664924  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||               
T  14664925 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 14665021  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  14665022 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccaga 14665121  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14665122 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 14665181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40106103 - 40105747
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  40106103 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 40106004  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||              
T  40106003 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggtt---caacaac 40105907  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40105906 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactag 40105807  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40105806 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 40105747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14763769 - 14763412
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  14763769 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 14763670  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| || |||| ||  ||||||||              
T  14763669 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaac 14763570  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14763569 aacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 14763473  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763472 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 14763412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31126983 - 31126627
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  31126983 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 31126884  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  31126883 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 31126787  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31126786 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 31126687  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31126686 acagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31126627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 14098347 - 14098704
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  14098347 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 14098446  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  14098447 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 14098543  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14098544 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 14098643  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14098644 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgat 14098704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 21969507 - 21969864
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21969507 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 21969606  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  21969607 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 21969703  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21969704 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactag 21969803  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
     || || ||  | ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  21969804 gcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 21969864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30753548 - 30753737
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30753548 tggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 30753647  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30753648 ccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 30753737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18801087 - 18800898
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18801087 tggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 18800988  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18800987 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 18800898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33674275 - 33674086
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  33674275 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 33674176  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674175 ccattttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 33674086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39850429 - 39850618
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  39850429 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 39850528  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39850529 ccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 39850618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19373067 - 19373202
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  19373067 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 19373166  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaa 136  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19373167 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaa 19373202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 54833197 - 54833364
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  54833197 ggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccac 54833296  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    | ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  54833297 cgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacag 54833364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800725
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 18800725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833550
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 54833550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36344977 - 36344809
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |      
T  36344977 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccta 36344878  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  36344877 ccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 36344809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344623
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 36344623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673906
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 33673906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30753916
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||    
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 30753916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850801
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 39850801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 1900067 - 1900221
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  1900067 ggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccac 1900166  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1900167 cattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 1900221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 15227680 - 15227834
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| ||||  |||| ||  || ||||||||||| |||||||| |    
T  15227680 ggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccac 15227779  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15227780 cattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 15227834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 15227887 - 15228040
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  15227887 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctc 15227986  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15227987 cacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 15228040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15285389 - 15285235
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | ||||| |  |||| ||||| ||  || |||||||||||||||||||| |    
T  15285389 ggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccac 15285290  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15285289 cattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 15285235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15285182 - 15285029
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  15285182 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 15285083  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15285082 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatc 15285029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 24112483 - 24112639
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  24112483 atccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 24112582  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  24112583 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 24112639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34189410 - 34189254
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  34189410 atccaaggctactgtcgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 34189311  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  34189310 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 34189254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112824
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 24112824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34189069
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 34189069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14235911 - 14235810
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  14235911 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 14235812  T
Q  180 ag 181  Q
    ||    
T  14235811 ag 14235810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24460988 - 24460912
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24460988 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24460912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Original strand, 1900269 - 1900427
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||    
T  1900269 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaa 1900368  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||||| ||  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  1900369 gcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 1900427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28116463 - 28116103
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28116463 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 28116364  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  28116363 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 28116264  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28116263 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 28116164  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28116163 acagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 7072964 - 7073321
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072964 tggagccagtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 7073063  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  7073064 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 7073160  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073161 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 7073260  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7073261 acaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 7073321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 7996314 - 7996667
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7996314 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 7996413  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  7996414 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 7996510  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7996511 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 7996610  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7996611 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 7996667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 10642822 - 10643175
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10642822 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 10642921  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  10642922 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 10643018  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10643019 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 10643118  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10643119 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 10643175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4797159 - 4796802
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797159 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 4797060  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  4797059 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 4796963  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4796962 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 4796863  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4796862 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 4796802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 4721383 - 4721740
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4721383 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccg 4721482  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||              
T  4721483 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagtt---caacaac 4721579  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  4721580 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 4721679  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  4721680 acagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 4721740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 35880518 - 35880875
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880518 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 35880617  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  35880618 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 35880714  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  35880715 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaa 35880814  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35880815 acagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 35880875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 6192068 - 6192425
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6192068 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcg 6192167  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||              
T  6192168 ccattttatcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 6192264  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  6192265 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 6192364  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  6192365 acagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 6192425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 47023205 - 47023558
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  47023205 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 47023304  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  47023305 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 47023401  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47023402 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 47023501  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47023502 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 47023558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29149261 - 29148904
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29149261 tggagccggtcaatccatggctactattgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttccca 29149162  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||              
T  29149161 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 29149065  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29149064 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactag 29148965  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29148964 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29148904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 28339055 - 28339411
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  28339055 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 28339154  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  28339155 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 28339251  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28339252 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 28339351  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28339352 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28339411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31964978 - 31964622
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  31964978 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 31964879  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  31964878 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 31964782  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31964781 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 31964682  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31964681 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31964622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50134576 - 50134220
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  50134576 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 50134477  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  50134476 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 50134380  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50134379 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 50134280  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50134279 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 50134220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 4416668 - 4417028
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  4416668 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 4416767  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  4416768 ccgttttatcatcagcaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaac 4416867  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4416868 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 4416967  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4416968 acagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4417028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5609827 - 5609471
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || |    
T  5609827 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgacgtattctcagcatccgttcttcccac 5609728  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  5609727 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 5609631  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5609630 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 5609531  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5609530 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5609471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 18330426 - 18330778
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18330426 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttcca 18330525  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  18330526 ccattttatcat-----ccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 18330617  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  18330618 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccag 18330717  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18330718 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 18330778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8301769 - 8301409
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301769 ggagccggtcaatccatggctattgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 8301670  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||               
T  8301669 cattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt------caaca 8301576  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8301575 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 8301476  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8301475 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 8301409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 18051014 - 18051371
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18051014 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccg 18051113  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  18051114 ccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 18051210  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  18051211 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccag 18051310  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  18051311 acagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 18051371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 21674445 - 21674802
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21674445 tggagccggtcaacccatggctaccgtggctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccg 21674544  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||              
T  21674545 ccattttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccatcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagtt---caacaac 21674641  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674642 aacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactag 21674741  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21674742 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 21674802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 8295728 - 8296081
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295728 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 8295827  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||               
T  8295828 cattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaatt------caaca 8295921  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8295922 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccaga 8296021  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  8296022 cagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 8296081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15893211 - 15892848
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15893211 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgc 15893112  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  15893111 ccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 15893012  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
            |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  15893011 acaac---atcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 15892915  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15892914 cagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 15892848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17985462 - 17985106
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  17985462 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 17985363  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  17985362 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 17985266  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17985265 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 17985166  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17985165 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 17985106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18277558 - 18277201
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  18277558 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 18277459  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| || |||| ||  ||||||||              
T  18277458 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaac 18277359  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18277358 aacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 18277262  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277261 acagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18277201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18292859 - 18292502
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  18292859 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 18292760  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| || |||| ||  ||||||||              
T  18292759 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaac 18292660  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18292659 aacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 18292563  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292562 acagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18292502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18308160 - 18307803
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  18308160 tggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 18308061  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| || |||| ||  ||||||||              
T  18308060 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaactgccggttcaacaacaac 18307961  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18307960 aacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 18307864  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307863 acagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18307803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Original strand, 5713058 - 5713335
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5713058 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5713157  T
Q  180 agatgccggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 279  Q
    || ||||||||                  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713158 agttgccggttcaacaacaacaacaa---aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5713254  T
Q  280 aagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5713255 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5713335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Original strand, 5723968 - 5724245
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5723968 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5724067  T
Q  180 agatgccggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 279  Q
    || ||||||||                  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724068 agttgccggttcaacaacaacaacaa---aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5724164  T
Q  280 aagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5724165 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5724245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5757509 - 5757232
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5757509 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5757410  T
Q  180 agatgccggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 279  Q
    || ||||||||                  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757409 agttgccggttcaacaacaacaacaa---aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5757313  T
Q  280 aagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5757312 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5757232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5768400 - 5768123
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5768400 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaac 5768301  T
Q  180 agatgccggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 279  Q
    || ||||||||                  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768300 agttgccggttcaacaacaacaacaa---aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5768204  T
Q  280 aagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5768203 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5768123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 10395888 - 10396242
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10395888 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccg 10395987  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| |   ||||||| |||| |||              
T  10395988 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggt---acaacagttgccagtt---caacaac 10396081  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||    
T  10396082 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactag 10396181  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396182 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 10396242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 5013464 - 5013817
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  5013464 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 5013563  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  5013564 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 5013660  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5013661 aacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 5013760  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5013761 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 5013817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 24327911 - 24328264
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  24327911 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 24328010  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  24328011 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 24328107  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328108 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 24328207  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24328208 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 24328264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 18224943 - 18225299
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  18224943 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 18225042  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  18225043 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 18225139  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18225140 aacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 18225239  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18225240 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 18225299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11110867 - 11110678
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11110867 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 11110768  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11110767 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 11110678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15741588 - 15741420
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741588 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 15741489  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  15741488 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacag 15741420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29665491 - 29665302
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  29665491 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 29665392  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29665391 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 29665302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36997595 - 36997406
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36997595 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 36997496  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36997495 ccgttttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 36997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20577368 - 20577179
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20577368 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 20577269  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20577268 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 20577179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6542980 - 6542791
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  6542980 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 6542881  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6542880 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 6542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 48465667 - 48465856
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  48465667 tggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 48465766  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48465767 ccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 48465856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 51781763 - 51781952
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  51781763 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 51781862  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51781863 ccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 51781952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 51796852 - 51797041
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  51796852 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 51796951  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51796952 ccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 51797041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 18242480 - 18242668
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18242480 ggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 18242579  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    | ||||||||||| ||| || |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18242580 cgttttatcatcagtactctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggtt 18242668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22871380 - 22871191
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  22871380 tggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 22871281  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22871280 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 22871191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22886439 - 22886250
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  22886439 tggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 22886340  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22886339 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 22886250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15741395 - 15741243
Alignment:
Q  209 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15741395 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 15741296  T
Q  309 aaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15741295 agcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 15741243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 20065798 - 20065966
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065798 tggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 20065897  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  20065898 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 20065966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 8211493 - 8211661
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  8211493 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttccca 8211592  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  8211593 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 8211661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 5466738 - 5466905
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  5466738 ggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 5466837  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  5466838 cattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 5466905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5596872 - 5596717
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  5596872 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttccca 5596773  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  5596772 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgc 5596717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387727
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22387727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4347190 - 4347022
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  4347190 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagcccaaatgcctccgtcatacccatgtatgccgtattctcagcatccgttcttccca 4347091  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  4347090 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 4347022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 28021030 - 28021198
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  28021030 tggagccgggcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 28021129  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  28021130 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 28021198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22871005
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22886064
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22886064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542612
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||  | |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 6542612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466036
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 48466036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346836
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4346836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8211847
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 8211847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997227
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||    
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 36997227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18242847
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 18242847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110498
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||    
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11110498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5596648 - 5596507
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  5596648 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 5596549  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5596548 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5596507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 360
Target Start/End: Original strand, 5466953 - 5467093
Alignment:
Q  220 tagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacct 319  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||    
T  5466953 tagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 5467052  T
Q  320 gatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5467053 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5467093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021384
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28021384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20576996
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 20577037  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20577036 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 20576996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29665119
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 29665119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 360
Target Start/End: Original strand, 51782034 - 51782131
Alignment:
Q  263 cttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51782034 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 51782131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 360
Target Start/End: Original strand, 51797123 - 51797221
Alignment:
Q  263 cttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctc-caaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  51797123 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 51797221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32292868
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 32292868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034259
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 31034259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530504
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 18530504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 4892977 - 4893133
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  4892977 atccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 4893076  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  4893077 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 4893133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16626801 - 16626648
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  16626801 caagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16626702  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16626701 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16626648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 18530228 - 18530304
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18530228 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgc 18530304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22388069 - 22387913
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  || || ||||||||||| ||||| ||  | |||||||||    
T  22388069 atccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcat 22387970  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  22387969 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 22387913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 32438921 - 32439077
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  32438921 atccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 32439020  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  32439021 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 32439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 340
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893298
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| | ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttc 340  Q
    | || || || ||||||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttc 4893298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16627008 - 16626854
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| ||||  ||||  |  || ||||||||||| |||||||| |    
T  16627008 ggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccac 16626909  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16626908 cgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgc 16626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17994208 - 17994132
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17994208 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 17994132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 4625778 - 4625853
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4625778 tctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatg 4625853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439262
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 32439262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066151
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
     |  || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 20066151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 5652221 - 5652297
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5652221 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 5652297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993926
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatc 17993926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16736811 - 16736454
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736811 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 16736712  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16736711 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 16736615  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16736614 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 16736515  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16736514 acagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16736454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16751865 - 16751508
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751865 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 16751766  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16751765 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 16751669  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16751668 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 16751569  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16751568 acagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16751508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 17523324 - 17523681
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523324 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 17523423  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  17523424 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 17523520  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17523521 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 17523620  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17523621 acagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17523681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17529891 - 17529534
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529891 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 17529792  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  17529791 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 17529695  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17529694 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 17529595  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17529594 acagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17529534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 45387135 - 45387488
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45387135 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 45387234  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  45387235 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 45387331  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45387332 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 45387431  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45387432 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 45387488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 5127784 - 5128141
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127784 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 5127883  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  5127884 ccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 5127980  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  5127981 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 5128080  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5128081 acagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5128141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5147691 - 5147334
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  5147691 tggagccggtcaatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 5147592  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              
T  5147591 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccgatt---caacaac 5147495  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5147494 aacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 5147395  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147394 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5147334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 2154365 - 2154722
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154365 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 2154464  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||              
T  2154465 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggtt---caacaac 2154561  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  2154562 aacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 2154661  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2154662 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 2154722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 9618443 - 9618799
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  9618443 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 9618542  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  9618543 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 9618639  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9618640 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 9618739  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9618740 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 9618799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26275445 - 26275089
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26275445 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 26275346  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  26275345 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 26275249  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26275248 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 26275149  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26275148 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26275089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11425127 - 11424770
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425127 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 11425028  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  11425027 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 11424931  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  11424930 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccag 11424831  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11424830 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 11424770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26320220 - 26319864
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26320220 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 26320121  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              
T  26320120 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaac 26320021  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26320020 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 26319924  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26319923 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10917216 - 10916862
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10917216 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgccttcgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccg 10917117  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  10917116 ccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt------caac 10917023  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  10917022 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 10916923  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10916922 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 10916862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26670265 - 26669912
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26670265 tggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 26670166  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  26670165 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 26670069  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26670068 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 26669969  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26669968 acagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatg 26669912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16503730 - 16503367
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16503730 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgc 16503631  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  16503630 cattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggtt---caacaaca 16503534  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16503533 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 16503434  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16503433 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 16503367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16518766 - 16518403
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16518766 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgc 16518667  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  16518666 cattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggtt---caacaaca 16518570  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16518569 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 16518470  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16518469 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 16518403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 26435050 - 26435406
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  26435050 ggagccggtcagtccatggccactgttgctcctatcagtgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccac 26435149  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||               
T  26435150 cgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagtt---caacaaca 26435246  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26435247 acaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactaga 26435346  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26435347 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26435406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4145474 - 4145118
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  4145474 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 4145375  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||| |  |||| ||  ||||||||              
T  4145374 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaacaac 4145275  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4145274 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 4145178  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4145177 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 4145118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24592892 - 24592536
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  24592892 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 24592793  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  24592792 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 24592696  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592695 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 24592596  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24592595 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 24592536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 11441352 - 11441541
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11441352 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 11441451  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11441452 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 11441541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26538224 - 26538035
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  26538224 tggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 26538125  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26538124 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 26538035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 31124703 - 31124892
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31124703 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 31124802  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31124803 ccgttttatcatcagtaccctttgcaaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 31124892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31564750 - 31564561
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  31564750 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccca 31564651  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31564650 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 31564561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26486095 - 26485910
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  26486095 tggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 26485996  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgcc 186  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26485995 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgcc 26485910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3445086 - 3445275
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3445086 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 3445185  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3445186 ccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 3445275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564385
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31564385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537868
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||    
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 26537868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125068
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31125068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445454
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||    
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 3445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 360
Target Start/End: Original strand, 11441623 - 11441720
Alignment:
Q  263 cttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11441623 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 11441720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 16041119 - 16041267
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  16041119 ggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccac 16041218  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 150  Q
    |||| |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  16041219 cattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgt 16041267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108992
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2108992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26484850
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 5159326 - 5159482
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  5159326 atccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 5159425  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  5159426 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 5159482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Original strand, 16041321 - 16041479
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||    
T  16041321 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 16041420  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||| ||||||    
T  16041421 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatc 16041479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16450345 - 16450199
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| ||||  || | || ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  16450345 ggagccggtcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccac 16450246  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtaccc 148  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16450245 cattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaccc 16450199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39211010
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||    |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 39211010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 368
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775515
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159667
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 5159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449985
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16449985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26485857 - 26485756
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  26485857 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 26485758  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  26485757 at 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31088733 - 31088657
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31088733 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 31088657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 45733334 - 45733410
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45733334 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 45733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 360
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18540947
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||| || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 18540947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 16749642 - 16749999
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749642 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 16749741  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||              
T  16749742 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 16749838  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16749839 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactag 16749938  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16749939 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16749999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 26918168 - 26918525
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918168 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 26918267  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||              
T  26918268 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggtt---caacaac 26918364  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  26918365 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 26918464  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918465 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26918525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 26999861 - 27000218
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999861 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 26999960  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  26999961 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 27000057  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27000058 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 27000157  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27000158 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 27000218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15424725 - 15424368
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424725 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccg 15424626  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  15424625 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---gaacaac 15424529  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15424528 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactag 15424429  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15424428 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 15424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 26988789 - 26989146
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988789 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 26988888  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  26988889 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 26988985  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  26988986 atcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccag 26989085  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26989086 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 26989146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13299358 - 13299002
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299358 ggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 13299259  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||               
T  13299258 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 13299162  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  13299161 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaga 13299062  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13299061 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 13299002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24305026 - 24304669
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24305026 tggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccg 24304927  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || |||              
T  24304926 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagtttccagtt---caacaac 24304830  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  24304829 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 24304730  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24304729 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 24304669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 24863506 - 24863862
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863506 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 24863605  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  24863606 cattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaaca 24863702  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  24863703 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaga 24863802  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24863803 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 24863862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22935281 - 22934924
Alignment:
Q  5 gccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccat 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22935281 gccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccat 22935182  T
Q  105 tttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnnnnn 204  Q
    | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||                  
T  22935181 tctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt------caacaaca 22935088  T
Q  205 nnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacag 304  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  22935087 acaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacag 22934988  T
Q  305 ggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  22934987 ggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 22934924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23857726 - 23857369
Alignment:
Q  5 gccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccat 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23857726 gccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccat 23857627  T
Q  105 tttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnnnnn 204  Q
    | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||                  
T  23857626 tctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt------caacaaca 23857533  T
Q  205 nnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacag 304  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  23857532 acaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacag 23857433  T
Q  305 ggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  23857432 ggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 23857369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 29572801 - 29573157
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  29572801 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 29572900  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  29572901 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 29572997  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  29572998 aacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactag 29573097  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29573098 gcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 29573157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 4757550 - 4757908
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  4757550 ggagccggtcaatcaatggctactgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccac 4757649  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||               
T  4757650 cgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4757749  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
            | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4757750 acagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactaga 4757849  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4757850 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 4757908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30558424 - 30558068
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  30558424 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 30558325  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  30558324 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 30558228  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30558227 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactag 30558128  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30558127 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 30558068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16944435 - 16944079
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  16944435 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 16944336  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16944335 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacagc 16944239  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944238 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 16944139  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16944138 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 16944079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3695851 - 3696040
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3695851 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 3695950  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3695951 ccgttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 3696040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4546189 - 4546003
Alignment:
Q  4 agccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  4546189 agccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccg 4546090  T
Q  104 ttttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4546089 ttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 4546003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4724548 - 4724362
Alignment:
Q  4 agccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  4724548 agccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccg 4724449  T
Q  104 ttttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4724448 ttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 4724362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 28207233 - 28207419
Alignment:
Q  4 agccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  28207233 agccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccg 28207332  T
Q  104 ttttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28207333 ttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 28207419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27007500 - 27007689
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  27007500 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttccca 27007599  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27007600 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 27007689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27360418 - 27360229
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27360418 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccca 27360319  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27360318 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 27360229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27450761 - 27450572
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27450761 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccca 27450662  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27450661 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 27450572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34463769 - 34463580
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34463769 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 34463670  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34463669 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 34463580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 4772786 - 4772974
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  4772786 ggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccac 4772885  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4772886 cgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 4772974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 16673915 - 16674104
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  16673915 tggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 16674014  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16674015 ccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 16674104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27484905 - 27485094
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  27484905 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 27485004  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27485005 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggtt 27485094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 17025050 - 17025239
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  17025050 tggagccggtcaagctatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 17025149  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17025150 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 17025239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26116827 - 26116638
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  26116827 tggagccggtcaatctatagctaccgttgctcctatcaatacagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcattcgttcttccca 26116728  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26116727 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagataaaacaacagttgccggtt 26116638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26778035 - 26777846
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26778035 tggagccgggcaatcaatggctactgttgcacctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 26777936  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26777935 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 26777846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 27044178 - 27044346
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  27044178 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 27044277  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  27044278 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 27044346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 29549266 - 29549434
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  29549266 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccca 29549365  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  29549366 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 29549434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27272783 - 27272624
Alignment:
Q  209 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggta 308  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  27272783 aatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggta 27272684  T
Q  309 aaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  27272683 agcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27272624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 29501194 - 29501349
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  29501194 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttccca 29501293  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  29501294 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgc 29501349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773150
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 4773150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 357
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696222
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 3696222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463397
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34463397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545827
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 4545827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549620
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29549620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044532
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27044532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724186
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 4724186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207598
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 28207598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 4525077 - 4525245
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  4525077 tggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 4525176  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  4525177 ccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 4525245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525430
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtga 4525430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27360044
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 27360044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450387
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 27450387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674284
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16674284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27007872
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27007872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116462
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26116462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777667
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26777667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485273
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 27485273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 29501418 - 29501559
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  29501418 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 29501517  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29501518 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 29501559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22477673 - 22477501
Alignment:
Q  9 gtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccatttta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| | |||| ||| ||||  |||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22477673 gtcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattcta 22477574  T
Q  109 tcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 181  Q
    |||| | || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22477573 tcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacag 22477501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 366
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20160851
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||  | |||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtcca 366  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||| ||||    
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 20160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171980
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||  | |||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtcca 366  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||| ||||    
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 22171980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14143329
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  | |  |||||||| ||  | |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 14143329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788096
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  | |  |||||||| ||  | |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26788096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196469
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  | |  |||||||| ||  | |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252771
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  | |  |||||||| ||  | |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27252771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290414
Alignment:
Q  216 aagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaacccc 315  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| |  || || |||||||| ||  | ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  316 acctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 27290414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Original strand, 20160571 - 20160653
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 162  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20160571 tctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 20160653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22172260 - 22172178
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 162  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22172260 tctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 22172178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27629894 - 27629804
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggta 308  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27629894 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggta 27629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13522399 - 13522323
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13522399 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13522323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 28162527 - 28162603
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28162527 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 28162603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33374582 - 33374506
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33374582 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33374506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025422
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
     || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 17025422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8892636 - 8892560
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8892636 tctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8892560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8903871 - 8903795
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8903871 tctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8903795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27630041 - 27629948
Alignment:
Q  77 tattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 170  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  27630041 tattctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacaga 27629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 41674509 - 41674866
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41674509 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtatgctcagcatcctttctttccg 41674608  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  41674609 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 41674705  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41674706 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 41674805  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41674806 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 41674866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9548905 - 9548548
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548905 tggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 9548806  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||              
T  9548805 ccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccgatt---caacaac 9548709  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9548708 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 9548609  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9548608 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 9548548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15659122 - 15658765
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15659122 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 15659023  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  15659022 ccgttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 15658926  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15658925 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactag 15658826  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658825 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 15658765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8665837 - 8665481
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665837 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccg 8665738  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  8665737 ccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 8665641  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8665640 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 8665541  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8665540 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 8665481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23718350 - 23717993
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718350 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 23718251  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  23718250 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 23718154  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  23718153 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 23718054  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23718053 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 23717993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 33777287 - 33777644
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777287 tggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 33777386  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||              
T  33777387 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 33777483  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  33777484 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 33777583  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  33777584 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 33777644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23752812 - 23752455
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752812 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 23752713  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  23752712 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 23752616  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  23752615 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 23752516  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  23752515 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 23752455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 11549154 - 11549511
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  11549154 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttcca 11549253  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  11549254 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 11549350  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  11549351 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 11549450  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11549451 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 11549511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 30168269 - 30168622
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  30168269 tggagccggtcaatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 30168368  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  30168369 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 30168465  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30168466 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactag 30168565  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30168566 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 30168622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 5637710 - 5638066
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  5637710 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 5637809  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  5637810 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 5637906  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5637907 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 5638006  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5638007 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 5638066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 9317251 - 9317607
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  9317251 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 9317350  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  9317351 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 9317447  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9317448 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 9317547  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9317548 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 9317607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22999476 - 22999119
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999476 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 22999377  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  22999376 ccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 22999280  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  22999279 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccag 22999180  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  22999179 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgat 22999119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 30151818 - 30152171
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  30151818 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 30151917  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  30151918 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 30152014  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30152015 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 30152114  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30152115 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 30152171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 12131955 - 12132311
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  12131955 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 12132054  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              
T  12132055 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaac 12132154  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12132155 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 12132251  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12132252 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 12132311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 26480192 - 26480548
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26480192 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 26480291  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  26480292 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 26480388  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26480389 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 26480488  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26480489 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 2510851 - 2511207
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2510851 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 2510950  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  2510951 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgtccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 2511047  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2511048 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 2511147  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2511148 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 2511207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 30934437 - 30934790
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30934437 ggagccggccaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgc 30934536  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||               
T  30934537 cattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt------caaca 30934630  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  30934631 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccaga 30934730  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  30934731 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 30934790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24688518 - 24688155
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24688518 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgc 24688419  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||               
T  24688418 cattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaaca 24688322  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  24688321 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 24688222  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24688221 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 24688155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 6874102 - 6874462
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  6874102 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 6874201  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  6874202 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaac 6874301  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6874302 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 6874401  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6874402 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6874462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15759219 - 15758863
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  15759219 tggagcaggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 15759120  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15759119 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 15759023  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15759022 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 15758923  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15758922 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 15758863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18375774 - 18375418
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  18375774 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 18375675  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  18375674 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 18375578  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18375577 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 18375478  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18375477 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 18375418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 33516156 - 33516512
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  33516156 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 33516255  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  33516256 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 33516352  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33516353 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactag 33516452  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33516453 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 33516512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29967428 - 29967072
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  29967428 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 29967329  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  29967328 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 29967232  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967231 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 29967132  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29967131 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 29967072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 30029215 - 30029571
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  30029215 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 30029314  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  30029315 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 30029411  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029412 aacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactag 30029511  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30029512 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 30029571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 368
Target Start/End: Original strand, 24969870 - 24970182
Alignment:
Q  47 caaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtac 146  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24969870 caaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtac 24969969  T
Q  147 ccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgat 246  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||                   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24969970 ccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaac---------atcaacaagctagacctactttccctccgataccgat 24970060  T
Q  247 gttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtct 346  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24970061 gttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtcc 24970160  T
Q  347 gatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  24970161 gatctcaaatgtgatttccatc 24970182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 31431228 - 31431417
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31431228 tggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 31431327  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31431328 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 31431417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18501110 - 18500921
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18501110 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 18501011  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18501010 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 18500921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 24681237 - 24681426
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24681237 tggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 24681336  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24681337 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 24681426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 24723764 - 24723953
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24723764 tggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 24723863  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24723864 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 24723953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37359017 - 37358828
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37359017 tggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37358918  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37358917 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 37358828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37671853 - 37671665
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  37671853 ggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 37671754  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37671753 cgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 37671665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 43078049 - 43078238
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43078049 tggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccca 43078148  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43078149 ccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 43078238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3789326 - 3789515
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3789326 tggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccca 3789425  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3789426 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 3789515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13325206 - 13325017
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  13325206 tggagctggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccca 13325107  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13325106 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 13325017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31826781 - 31826592
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31826781 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 31826682  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31826681 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 31826592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 28649026 - 28649215
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28649026 tggagccggtcaagctatggctactgttgcaactatcaatacagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccg 28649125  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28649126 ccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagtttccggtt 28649215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 37754768 - 37754957
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37754768 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37754867  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37754868 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 37754957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37771361 - 37771172
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37771361 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 37771262  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37771261 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 37771172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500735
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18500735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28960160 - 28959975
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  28960160 tggagccgggcaatcaacggctactgttgcacctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 28960061  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgcc 186  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28960060 ccgttttatcatcagtaccctttgccacagggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgcc 28959975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40473914 - 40473725
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  40473914 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttccca 40473815  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473814 ccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 40473725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649392
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28649392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616674
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 34616674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770992
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37770992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431596
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31431596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755136
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 37755136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Original strand, 23892007 - 23892370
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||      
T  23892007 ggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaa 23892106  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |  || || ||| ||||||||   ||||||               
T  23892107 cattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaaca 23892206  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
            |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||| |||| |  |||||||| || || || |||    
T  23892207 acaac---atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccaga 23892303  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  23892304 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatc 23892370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671488
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37671488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078409
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 43078409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32599831 - 32599676
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  32599831 tggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 32599732  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  32599731 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgc 32599676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599477
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 32599477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789697
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 3789697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 34616321 - 34616489
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  34616321 tggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 34616420  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  34616421 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 34616489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 25198833 - 25198977
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25198833 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccac 25198932  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtac 146  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  25198933 cattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtac 25198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826413
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||    
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 31826413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959792
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 28959792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358649
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 37358649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681597
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 24681597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724124
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 24724124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473554
Alignment:
Q  221 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctg 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |    
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  321 atccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgat 40473554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Original strand, 22888476 - 22888634
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| || | |  |||||||| || || || |||||||| ||    
T  22888476 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 22888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29889080
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||| | || |||||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatc 29889080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 33292340 - 33292496
Alignment:
Q  13 atccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  | || ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  33292340 atccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcat 33292439  T
Q  113 caataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  33292440 cagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacag 33292496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Original strand, 25199035 - 25199193
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||    
T  25199035 atcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 25199134  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  25199135 gcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatc 25199193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324835
Alignment:
Q  219 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacc 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  319 tgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
     || || || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtga 13324835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888428
Alignment:
Q  15 ccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatca 114  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
Q  115 ataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
     || ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  22888387 gtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgc 22888428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292681
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||  | ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 33292681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13184928 - 13184852
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13184928 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13184852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13440774 - 13440698
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13440774 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13440698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 33877129 - 33877205
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33877129 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33877205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Original strand, 11325676 - 11325752
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  11325676 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaacctcaggtacccgttaatgc 11325752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 42
Target Start/End: Original strand, 24951911 - 24951951
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgc 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24951911 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgc 24951951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 368
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11325958
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || || || ||| |||| |  | |||||| || || || |||||||| ||  | ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatc 11325958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41793773 - 41793416
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41793773 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccg 41793674  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||              
T  41793673 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 41793577  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41793576 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 41793477  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41793476 acagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 41793416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 10962460 - 10962816
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  10962460 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 10962559  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  10962560 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaac 10962656  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10962657 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactag 10962756  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10962757 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 10962816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 28584771 - 28585124
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  28584771 tggagccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 28584870  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  28584871 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 28584970  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28584971 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 28585067  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28585068 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 28585124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 51638008 - 51638365
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  51638008 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 51638107  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              
T  51638108 ccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagataaaacaacagatgccggtt---caacaac 51638204  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51638205 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactag 51638304  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
     ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51638305 gcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 51638365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 20460899 - 20461053
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||| || ||  | |||||| | ||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||| |    
T  20460899 ggagccggtcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccac 20460998  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20460999 cattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16208290 - 16208132
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||    
T  16208290 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaa 16208191  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16208190 acctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16208132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20340594 - 20340436
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || |||||| |||| |  |||||||| |  || || |||||||| ||    
T  20340594 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 20340495  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20340494 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20340436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152016
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||| |  |||||||| || || |  |||||||| ||  | |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 28152016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20340718 - 20340642
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20340718 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 361
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461228
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgat 20461228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 27083 - 27440
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27083 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccg 27182  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  27183 ccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 27279  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27280 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccag 27379  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27380 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 27440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 237
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  595 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 496  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||              
T  495 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 399  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc-tgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgacta 299  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  398 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaacca 299  T
Q  300 gacagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  298 gacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgat 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7704 - 7348
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  7704 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 7605  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              
T  7604 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaac 7505  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7504 aacaa---aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 7408  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7407 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9530 - 9178
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  9530 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 9431  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  9430 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 9334  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9333 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 9234  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9233 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 19807 - 20159
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19807 ggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccac 19906  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  19907 cgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt---caacaaca 20003  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20004 acaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactaga 20103  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatg 357  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20104 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 20159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47450 - 47093
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47450 tggagccggtcaacccatggctactgttgctcttatcaatgcagcccaaatgcctccatcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 47351  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  47350 ccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 47254  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  47253 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccag 47154  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47153 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 47093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40533 - 40170
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40533 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgc 40434  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||               
T  40433 cattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaaca 40337  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40336 acaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 40237  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40236 cagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 40170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 29555 - 29916
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555 ggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgc 29654  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnnn 201  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||               
T  29655 cattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 29754  T
Q  202 nnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactaga 301  Q
            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  29755 acaac---atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccaga 29851  T
Q  302 cagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtcca 366  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  29852 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttcca 29916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15395 - 15039
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  15395 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccca 15296  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  15295 ccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt---caacaac 15199  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15198 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 15099  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15098 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 15039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 30244 - 30599
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30244 tggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccg 30343  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||              
T  30344 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagtt---caacaac 30440  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30441 aacaacaaaatcagcaagctagacctacttt-cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactag 30539  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30540 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtga 30599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 20204 - 20358
Alignment:
Q  2 ggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||      
T  20204 ggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccat 20303  T
Q  102 cattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20304 cattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20543
Alignment:
Q  215 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccc 314  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||  | |    
T  20390 caagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20489  T
Q  315 cacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20490 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 20543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26667 - 26310
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26667 tggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 26568  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttnnnnnnnnnn 200  Q
    || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||              
T  26567 ccgttttatcatcagtacccgttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagaggaaacaacagttgccggtt---caacaac 26471  T
Q  201 nnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactag 300  Q
            |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26470 aacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 26371  T
Q  301 acagggtaaaaccccacctgatccgttgcctcc-aaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26370 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 26310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 7731 - 7917
Alignment:
Q  4 agccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcca 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  7731 agccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccg 7830  T
Q  104 ttttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7831 ttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 7917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8096
Alignment:
Q  227 actttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccacctgatccgt 326  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  327 tgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtga 360  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga 8096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 9
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  198 tggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 99  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
    || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  98 ccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 5779 - 5971
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatcca-tggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttcc 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5779 tggagccggtcaatcaaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttccc 5878  T
Q  100 gcc-attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaa-ttgcccaacagatgaaacaacagatgccggtt 190  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5879 accgtttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatttgcccaacagatgaaacaacagttgccggtt 5971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 361
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6160
Alignment:
Q  219 ctagaccta-ctttccctccgataccgatgtt-atatgctgagttgcttccaacttt-actccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaacccc 315  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  6015 ctagacctaacttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccacc 6114  T
Q  316 acctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6115 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2072 - 2018
Alignment:
Q  314 ccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2072 ccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 8023 - 8191
Alignment:
Q  1 tggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccg 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  8023 tggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccca 8122  T
Q  101 ccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacag 169  Q
    || ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||    
T  8123 ccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacag 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9714
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaaaaccccac 317  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  318 ctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46909
Alignment:
Q  215 caagctagacctacttt-ccctccgatacc-gatgttatatgctgagttgcttccaac---tttactccaaagaggg-cattgtacgac-tagacagggt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |   ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||     
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  308 aaaa--ccccacctgatccgttgcctccaaggttc-gggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatc 46909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2759
Alignment:
Q  210 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| | || |||||| |||| |  |||||||| |  || || |||||||| ||    
T  2917 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 2818  T
Q  310 aaccccacctgatccgttgcctccaaggttcgggtctgatctcaaatgtgatgtccatc 368  Q
      | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2817 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3041 - 2965
Alignment:
Q  80 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3041 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 21366 - 21538
Alignment:
Q  9 gtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcataccaatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccatttta 108  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||  | |||||| | ||||| ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  21366 gtcaatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 21465  T
Q  109 tcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 181  Q
    ||| || || || |  || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  21466 tcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 21538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 309
Target Start/End: Original strand, 94 - 185
Alignment:
Q  218 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggtaa 309  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  94 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaa 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University