View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6846_low_6 (Length: 294)

Name: NF6846_low_6
Description: NF6846
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6846_low_6
NF6846_low_6
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (22-282)||(113727-113987)
scaffold0029 (46-177)||(108713-108844)
scaffold0029 (190-278)||(95048-95136)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (14-282)||(19880299-19880567)
chr6 (14-271)||(34644598-34644855)
chr6 (22-282)||(18795691-18795951)
chr6 (43-282)||(21563173-21563412)
chr6 (43-282)||(21569032-21569271)
chr6 (22-281)||(19454422-19454681)
chr6 (22-282)||(15460337-15460597)
chr6 (22-264)||(8761953-8762195)
chr6 (28-272)||(5296232-5296476)
chr6 (22-266)||(14378937-14379181)
chr6 (22-266)||(14380487-14380731)
chr6 (43-266)||(21472618-21472841)
chr6 (22-269)||(10467869-10468116)
chr6 (43-281)||(15897096-15897334)
chr6 (43-269)||(22434883-22435109)
chr6 (43-269)||(22443281-22443507)
chr6 (46-270)||(27188449-27188673)
chr6 (46-270)||(27260567-27260791)
chr6 (22-266)||(24365429-24365673)
chr6 (43-281)||(22761496-22761734)
chr6 (44-281)||(20636343-20636580)
chr6 (46-177)||(16926684-16926815)
chr6 (23-266)||(19436019-19436262)
chr6 (43-266)||(19488313-19488536)
chr6 (43-179)||(23079573-23079709)
chr6 (43-143)||(29590961-29591061)
chr6 (46-177)||(16962489-16962620)
chr6 (43-177)||(16625758-16625892)
chr6 (22-176)||(28281833-28281987)
chr6 (28-177)||(25113658-25113807)
chr6 (46-282)||(5838263-5838499)
chr6 (41-194)||(19865776-19865929)
chr6 (46-282)||(1542128-1542364)
chr6 (49-196)||(25608908-25609055)
chr6 (46-177)||(28262241-28262372)
chr6 (46-177)||(28340990-28341121)
chr6 (44-213)||(27564863-27565032)
chr6 (43-143)||(2873844-2873944)
chr6 (49-179)||(18406991-18407121)
chr6 (43-130)||(18196774-18196861)
chr6 (124-266)||(25769208-25769350)
chr6 (46-143)||(18449650-18449747)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (14-282)||(6555-6823)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (22-282)||(19613802-19614062)
chr7 (41-282)||(11387309-11387550)
chr7 (22-282)||(14263106-14263366)
chr7 (22-282)||(19148338-19148598)
chr7 (22-282)||(20747737-20747997)
chr7 (22-282)||(15101465-15101725)
chr7 (22-268)||(16071157-16071403)
chr7 (22-266)||(13022500-13022744)
chr7 (43-281)||(12205683-12205921)
chr7 (22-266)||(11305125-11305369)
chr7 (22-266)||(16949334-16949578)
chr7 (22-266)||(26117467-26117711)
chr7 (22-281)||(13666665-13666924)
chr7 (22-266)||(268-513)
chr7 (22-269)||(14285238-14285485)
chr7 (25-266)||(12457783-12458024)
chr7 (22-266)||(49153444-49153688)
chr7 (43-177)||(14955785-14955919)
chr7 (49-281)||(320948-321180)
chr7 (54-213)||(15147801-15147960)
chr7 (43-177)||(8708836-8708970)
chr7 (43-213)||(11771146-11771316)
chr7 (43-177)||(18550663-18550797)
chr7 (22-176)||(23504732-23504886)
chr7 (43-177)||(44790256-44790390)
chr7 (43-213)||(10872190-10872360)
chr7 (43-269)||(14333535-14333761)
chr7 (22-176)||(18052815-18052969)
chr7 (43-143)||(8199893-8199993)
chr7 (43-259)||(11236118-11236334)
chr7 (22-266)||(13967530-13967774)
chr7 (43-143)||(15159962-15160062)
chr7 (44-143)||(18179007-18179106)
chr7 (43-209)||(16223-16389)
chr7 (22-267)||(15341573-15341818)
chr7 (44-177)||(23202519-23202652)
chr7 (44-177)||(23508646-23508779)
chr7 (43-143)||(13687329-13687429)
chr7 (44-176)||(15204851-15204983)
chr7 (167-266)||(12456845-12456944)
chr7 (43-177)||(12688731-12688866)
chr7 (28-213)||(9597252-9597437)
chr7 (44-143)||(11552008-11552107)
chr7 (44-196)||(14212886-14213038)
chr7 (43-182)||(14040921-14041060)
chr7 (43-182)||(14350951-14351090)
chr7 (64-218)||(15625744-15625898)
chr7 (19-134)||(40027-40142)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (22-282)||(32555-32815)
scaffold0076 (22-266)||(55778-56022)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (22-282)||(49392-49652)
scaffold0028 (46-282)||(44319-44555)
scaffold0028 (44-143)||(9781-9880)
scaffold0028 (44-111)||(16275-16342)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (22-282)||(21679835-21680095)
chr5 (22-281)||(22463003-22463262)
chr5 (22-281)||(20822505-20822764)
chr5 (22-266)||(24619352-24619596)
chr5 (22-266)||(24715583-24715827)
chr5 (22-266)||(24748611-24748855)
chr5 (22-281)||(28893999-28894258)
chr5 (22-281)||(28915470-28915729)
chr5 (22-281)||(28922825-28923084)
chr5 (22-272)||(23079146-23079396)
chr5 (56-281)||(20774811-20775036)
chr5 (22-266)||(14886048-14886292)
chr5 (22-281)||(22234977-22235236)
chr5 (22-266)||(24797454-24797698)
chr5 (22-230)||(28930738-28930946)
chr5 (43-269)||(21563051-21563277)
chr5 (139-282)||(21889933-21890076)
chr5 (22-266)||(37542438-37542682)
chr5 (43-179)||(23472400-23472536)
chr5 (22-266)||(25849142-25849386)
chr5 (43-269)||(27667568-27667794)
chr5 (43-143)||(16357710-16357810)
chr5 (43-143)||(27519614-27519714)
chr5 (43-143)||(34567702-34567802)
chr5 (43-143)||(40709988-40710088)
chr5 (28-266)||(22503746-22503984)
chr5 (44-270)||(23574810-23575036)
chr5 (46-143)||(41772050-41772147)
chr5 (43-143)||(27611562-27611662)
chr5 (46-177)||(19771134-19771265)
chr5 (43-282)||(23441279-23441518)
chr5 (43-141)||(21872128-21872226)
chr5 (43-141)||(21876408-21876506)
chr5 (43-269)||(22331965-22332191)
chr5 (49-179)||(25427605-25427735)
chr5 (25-266)||(20343349-20343590)
chr5 (43-143)||(14998817-14998917)
chr5 (43-143)||(22135876-22135976)
chr5 (43-143)||(27684478-27684578)
chr5 (43-143)||(29475151-29475251)
chr5 (43-230)||(26737805-26737992)
chr5 (47-125)||(21497150-21497228)
chr5 (43-177)||(37290574-37290708)
chr5 (22-176)||(17268391-17268545)
chr5 (44-282)||(21882018-21882256)
chr5 (43-104)||(20467176-20467237)
chr5 (82-251)||(21830878-21831047)
chr5 (44-196)||(18776951-18777103)
chr5 (52-143)||(21338384-21338475)
chr5 (22-99)||(846-923)
chr5 (46-259)||(21408230-21408443)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (22-282)||(13971223-13971483)
chr3 (22-282)||(14087439-14087699)
chr3 (22-282)||(10419148-10419408)
chr3 (22-281)||(12359630-12359889)
chr3 (22-258)||(17187164-17187400)
chr3 (46-282)||(14574689-14574925)
chr3 (22-282)||(17493396-17493656)
chr3 (22-269)||(31694289-31694536)
chr3 (22-269)||(31939682-31939929)
chr3 (22-266)||(47124726-47124970)
chr3 (22-281)||(13319605-13319864)
chr3 (43-282)||(16827327-16827566)
chr3 (22-275)||(16337615-16337868)
chr3 (22-266)||(11960272-11960516)
chr3 (22-282)||(16835613-16835873)
chr3 (43-281)||(15228416-15228654)
chr3 (43-281)||(15234284-15234522)
chr3 (19-282)||(14580053-14580316)
chr3 (46-213)||(15347383-15347550)
chr3 (22-152)||(12179234-12179364)
chr3 (26-266)||(18133453-18133693)
chr3 (44-179)||(16491317-16491452)
chr3 (43-269)||(5424065-5424291)
chr3 (22-176)||(44778119-44778273)
chr3 (46-143)||(6601631-6601728)
chr3 (25-266)||(16328766-16329007)
chr3 (43-143)||(15588527-15588627)
chr3 (43-143)||(16636668-16636768)
chr3 (43-143)||(20061189-20061289)
chr3 (43-143)||(43163992-43164092)
chr3 (43-143)||(48426342-48426442)
chr3 (46-213)||(53384156-53384323)
chr3 (49-195)||(17490693-17490839)
chr3 (22-176)||(41178394-41178548)
chr3 (43-143)||(10006495-10006595)
chr3 (43-143)||(10907105-10907205)
chr3 (137-269)||(11302991-11303123)
chr3 (43-143)||(13253585-13253685)
chr3 (43-179)||(15260489-15260625)
chr3 (43-269)||(15401652-15401878)
chr3 (43-269)||(15340038-15340264)
chr3 (44-213)||(14125730-14125899)
chr3 (43-143)||(15724069-15724169)
chr3 (22-176)||(13942896-13943050)
chr3 (41-177)||(12499109-12499245)
chr3 (44-279)||(14875635-14875870)
chr3 (43-176)||(16693026-16693159)
chr3 (44-143)||(16411418-16411517)
chr3 (80-143)||(16755757-16755820)
chr3 (44-213)||(16806083-16806252)
chr3 (22-176)||(16380031-16380185)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (22-282)||(24179-24439)
scaffold0090 (22-282)||(20017-20277)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (41-282)||(20060918-20061159)
chr1 (22-281)||(19855458-19855717)
chr1 (22-269)||(19662084-19662331)
chr1 (22-281)||(20855707-20855966)
chr1 (22-269)||(23197193-23197440)
chr1 (22-281)||(20939010-20939269)
chr1 (22-271)||(20834847-20835096)
chr1 (22-266)||(24098550-24098794)
chr1 (22-266)||(31538944-31539188)
chr1 (43-257)||(16373707-16373921)
chr1 (22-230)||(21952113-21952321)
chr1 (52-281)||(21750093-21750322)
chr1 (22-150)||(21744499-21744627)
chr1 (44-179)||(431085-431220)
chr1 (43-269)||(51332461-51332687)
chr1 (22-266)||(20295580-20295824)
chr1 (49-213)||(41352636-41352800)
chr1 (43-143)||(16349564-16349664)
chr1 (46-213)||(33390000-33390167)
chr1 (43-143)||(21838241-21838341)
chr1 (43-179)||(22110277-22110413)
chr1 (43-179)||(22114126-22114262)
chr1 (43-177)||(19107625-19107759)
chr1 (43-269)||(21831468-21831694)
chr1 (49-213)||(16077630-16077794)
chr1 (43-269)||(19759841-19760067)
chr1 (43-213)||(21025394-21025564)
chr1 (19-196)||(21234675-21234852)
chr1 (44-281)||(22361213-22361450)
chr1 (43-122)||(24793585-24793664)
chr1 (43-119)||(17043983-17044059)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (44-282)||(23099455-23099693)
chr2 (25-282)||(27209590-27209847)
chr2 (22-266)||(23277560-23277804)
chr2 (22-269)||(24949371-24949618)
chr2 (22-266)||(1064535-1064779)
chr2 (43-269)||(23111517-23111743)
chr2 (22-266)||(20829043-20829287)
chr2 (22-258)||(31831450-31831686)
chr2 (22-266)||(23294719-23294963)
chr2 (22-266)||(19651465-19651709)
chr2 (43-281)||(24710803-24711041)
chr2 (43-143)||(16923796-16923896)
chr2 (43-143)||(16926267-16926367)
chr2 (43-143)||(16983059-16983159)
chr2 (43-143)||(16999907-17000007)
chr2 (43-143)||(17064624-17064724)
chr2 (43-143)||(22324292-22324392)
chr2 (43-143)||(27218923-27219023)
chr2 (50-213)||(24676326-24676489)
chr2 (22-176)||(12575227-12575381)
chr2 (49-179)||(23067262-23067391)
chr2 (43-177)||(27372142-27372276)
chr2 (43-143)||(44385005-44385105)
chr2 (44-179)||(23107167-23107302)
chr2 (22-176)||(27788615-27788768)
chr2 (44-177)||(21144478-21144611)
chr2 (43-143)||(10869757-10869857)
chr2 (43-143)||(41607821-41607921)
chr2 (44-143)||(24876186-24876285)
chr2 (43-141)||(24263279-24263377)
chr2 (46-281)||(45533113-45533349)
chr2 (52-177)||(21324711-21324836)
chr2 (41-213)||(24706916-24707088)
chr2 (241-282)||(27364713-27364754)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (22-282)||(1051-1311)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (22-280)||(68540-68798)
scaffold0034 (22-271)||(3831-4080)
scaffold0034 (22-282)||(12786-13039)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (22-282)||(2208-2468)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (22-282)||(430-690)
scaffold0120 (44-269)||(13239-13464)
scaffold0120 (44-179)||(7291-7426)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (22-282)||(20984865-20985125)
chr8 (43-282)||(21841620-21841859)
chr8 (43-266)||(19852630-19852853)
chr8 (43-266)||(19858666-19858889)
chr8 (46-282)||(23656130-23656366)
chr8 (41-266)||(22372150-22372375)
chr8 (22-281)||(20974974-20975228)
chr8 (22-266)||(14566361-14566605)
chr8 (43-257)||(20395471-20395685)
chr8 (22-266)||(31415789-31416036)
chr8 (22-266)||(29302744-29302988)
chr8 (44-282)||(19979170-19979408)
chr8 (41-266)||(22376791-22377016)
chr8 (41-266)||(22382966-22383191)
chr8 (22-266)||(6604877-6605121)
chr8 (22-230)||(21324587-21324794)
chr8 (43-266)||(20009260-20009482)
chr8 (43-267)||(20389317-20389541)
chr8 (50-149)||(21921082-21921181)
chr8 (49-266)||(6680330-6680547)
chr8 (22-266)||(16270542-16270786)
chr8 (49-213)||(19483409-19483573)
chr8 (49-213)||(23651313-23651477)
chr8 (44-179)||(21252250-21252385)
chr8 (22-176)||(31570160-31570314)
chr8 (43-177)||(17673362-17673496)
chr8 (43-269)||(20017602-20017828)
chr8 (44-282)||(21165878-21166116)
chr8 (43-257)||(23886252-23886466)
chr8 (22-266)||(12305977-12306221)
chr8 (43-143)||(19114032-19114132)
chr8 (43-131)||(22247772-22247860)
chr8 (95-266)||(803064-803235)
chr8 (44-179)||(21393205-21393340)
chr8 (44-179)||(21787699-21787834)
chr8 (43-213)||(22041131-22041301)
chr8 (44-177)||(21043753-21043886)
chr8 (43-143)||(18857919-18858019)
chr8 (14-282)||(22052066-22052334)
chr8 (44-196)||(30312484-30312636)
chr8 (22-97)||(27355924-27355999)
chr8 (49-179)||(1267544-1267674)
chr8 (19-179)||(15534689-15534849)
chr8 (43-196)||(32601433-32601586)
chr8 (19-134)||(19869044-19869159)
chr8 (154-282)||(16407495-16407623)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (22-280)||(27901525-27901783)
chr4 (22-282)||(15002239-15002499)
chr4 (22-269)||(15357995-15358242)
chr4 (43-279)||(15413922-15414158)
chr4 (22-266)||(29452412-29452656)
chr4 (22-266)||(3263669-3263913)
chr4 (22-266)||(33224076-33224320)
chr4 (23-257)||(16148873-16149107)
chr4 (23-257)||(16153019-16153253)
chr4 (46-282)||(15247061-15247297)
chr4 (43-238)||(15320317-15320512)
chr4 (23-266)||(11206107-11206350)
chr4 (136-269)||(15078785-15078918)
chr4 (43-251)||(8707088-8707296)
chr4 (41-213)||(16354079-16354251)
chr4 (43-266)||(14695266-14695489)
chr4 (41-176)||(15071602-15071737)
chr4 (43-194)||(15146521-15146672)
chr4 (23-281)||(1648153-1648411)
chr4 (43-143)||(8387688-8387788)
chr4 (43-143)||(12477876-12477976)
chr4 (43-143)||(18298481-18298581)
chr4 (43-143)||(19777429-19777529)
chr4 (43-143)||(29038040-29038140)
chr4 (46-213)||(23956953-23957120)
chr4 (43-269)||(8052259-8052485)
chr4 (22-176)||(51605667-51605821)
chr4 (22-179)||(14160710-14160867)
chr4 (22-230)||(20892171-20892379)
chr4 (14-266)||(44660733-44660985)
chr4 (46-177)||(27712578-27712709)
chr4 (44-177)||(12524918-12525051)
chr4 (52-177)||(14850011-14850136)
chr4 (43-119)||(14681867-14681943)
chr4 (44-177)||(40474282-40474415)
chr4 (43-259)||(14302614-14302830)
chr4 (19-179)||(18614436-18614596)
chr4 (43-230)||(18226082-18226269)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (43-269)||(10974-11200)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (22-282)||(5598-5858)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (22-281)||(111-370)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (22-272)||(323882-324132)
scaffold0004 (43-251)||(202367-202575)
scaffold0004 (43-199)||(118477-118633)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (22-282)||(1732-1992)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (22-282)||(29225-29485)
scaffold0026 (49-179)||(30216-30346)
scaffold0026 (22-92)||(50168-50238)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (22-282)||(28385-28645)
scaffold0139 (22-282)||(34638-34898)
scaffold0139 (81-158)||(95-172)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (22-282)||(47912-48172)
scaffold0053 (22-281)||(56725-56984)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (43-266)||(27708-27931)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (22-269)||(46277-46524)
scaffold0010 (22-266)||(41211-41455)
scaffold0010 (50-266)||(3098-3314)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (23-269)||(24755-25001)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (22-271)||(13379-13628)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (22-282)||(4944-5204)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (46-282)||(48272-48508)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-282)||(89323-89583)
scaffold0001 (22-282)||(90001-90261)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (46-269)||(40879-41102)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (22-272)||(15290-15540)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (22-271)||(149749-149997)
scaffold0011 (22-281)||(194582-194841)
scaffold0011 (50-179)||(25439-25568)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (46-282)||(5918-6154)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (22-266)||(43967-44211)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (22-282)||(50753-51013)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (43-282)||(146-385)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (22-269)||(182-429)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (46-282)||(1037-1273)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (22-266)||(10935-11179)
scaffold0298 (22-266)||(14705-14949)
scaffold0298 (22-282)||(21151-21411)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (22-266)||(42101-42345)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-266)||(249797-250041)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (22-269)||(2769-3016)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (43-259)||(5988-6206)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (14-281)||(2225-2492)
scaffold0222 (22-266)||(8244-8488)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (22-267)||(6116-6361)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (22-282)||(32579-32839)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (22-282)||(566-824)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (22-266)||(20578-20822)
scaffold0104 (22-266)||(23398-23642)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (22-282)||(27793-28052)
scaffold0067 (22-281)||(51058-51317)
scaffold0067 (22-281)||(60092-60351)
scaffold0067 (22-281)||(66480-66739)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (22-266)||(100440-100684)
scaffold0020 (94-213)||(181436-181555)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (22-269)||(2363-2610)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (22-269)||(851-1098)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (46-280)||(3346-3580)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (98-282)||(16448-16632)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (78-282)||(6264-6468)
scaffold0149 (78-282)||(10695-10899)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (22-281)||(13177-13436)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (43-281)||(9707-9945)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (64-281)||(11902-12119)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (22-266)||(10335-10579)
scaffold0235 (22-266)||(20549-20793)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (22-281)||(20289-20548)
scaffold0058 (46-99)||(58093-58146)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (83-269)||(1-187)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (43-281)||(16876-17114)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (43-259)||(18114-18330)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (22-266)||(4330-4574)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (22-269)||(3932-4177)
scaffold0035 (49-236)||(43012-43199)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (19-258)||(516-755)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (41-282)||(79391-79632)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (22-266)||(7023-7267)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (22-230)||(12405-12613)
scaffold0180 (43-179)||(31652-31788)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (22-221)||(108859-109058)
scaffold0031 (43-194)||(62930-63081)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (43-266)||(218316-218539)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (43-281)||(177161-177399)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (22-259)||(3150-3387)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (41-266)||(15379-15604)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (22-259)||(30163-30400)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (46-282)||(18517-18753)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (23-263)||(32198-32438)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (22-266)||(45701-45945)
scaffold0114 (44-143)||(19241-19340)
scaffold0114 (22-199)||(21138-21315)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (23-141)||(35422-35540)
scaffold0156 (148-282)||(28393-28527)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (70-279)||(39685-39894)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (43-179)||(16925-17061)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (22-266)||(15591-15835)
scaffold0089 (43-266)||(10621-10844)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (43-179)||(16148-16284)
scaffold0040 (52-179)||(112396-112523)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (43-266)||(13652-13875)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (43-179)||(10240-10376)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (52-179)||(7561-7688)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (43-282)||(7182-7421)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (43-194)||(29470-29621)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (43-266)||(23084-23307)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (43-177)||(8670-8804)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (43-213)||(102470-102640)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (61-266)||(5215-5420)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (41-230)||(5091-5280)
scaffold0270 (41-230)||(12221-12410)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (49-266)||(5241-5458)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (50-213)||(3431-3594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (44-179)||(7643-7778)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (44-143)||(7356-7455)
scaffold0358 (69-155)||(3534-3620)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (44-179)||(14111-14246)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (44-179)||(37-172)
scaffold0319 (44-179)||(2540-2675)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (44-179)||(25845-25979)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-233)||(28150-28361)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (41-176)||(277727-277862)
scaffold0005 (23-267)||(261491-261735)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (44-194)||(50688-50838)
scaffold0081 (44-269)||(19783-20008)
scaffold0081 (44-269)||(35207-35432)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (22-282)||(80710-80970)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (22-266)||(142-390)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-179)||(7231-7366)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (43-194)||(26230-26381)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (43-269)||(2089-2315)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (43-269)||(8120-8346)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (22-176)||(14178-14331)
scaffold0261 (22-176)||(22357-22510)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (43-251)||(23978-24179)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (44-282)||(4253-4491)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (44-177)||(8639-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (52-213)||(7995-8156)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (49-178)||(38853-38982)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (43-179)||(966-1102)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (22-282)||(6381-6641)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (43-179)||(4383-4519)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (44-143)||(2200-2299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (43-194)||(24723-24874)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (43-266)||(9915-10138)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (22-176)||(96438-96592)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (44-213)||(1655-1824)
scaffold0044 (44-213)||(15395-15564)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (46-266)||(85421-85641)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (43-266)||(6790-7013)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (44-131)||(32473-32560)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (44-177)||(38720-38853)
scaffold0042 (19-110)||(66745-66836)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (22-110)||(1712-1800)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (52-119)||(12900-12967)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (44-143)||(28268-28367)
scaffold0023 (43-179)||(3355-3491)
scaffold0023 (79-179)||(131377-131477)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (49-179)||(39828-39958)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (69-179)||(6492-6602)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (44-110)||(18967-19033)
scaffold0017 (43-119)||(196377-196453)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (43-119)||(23972-24048)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (22-176)||(11664-11818)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (43-218)||(115804-115979)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (43-113)||(13980-14050)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (46-104)||(343-401)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (46-171)||(16466-16591)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 113987 - 113727
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  113987 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 113888  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113887 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 113788  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113787 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 108713 - 108844
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  108713 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtca 108812  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  108813 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Original strand, 95048 - 95136
Alignment:
Q  190 tgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttga 278  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  95048 tgtgaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttga 95136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19880567 - 19880299
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19880567 acatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtag 19880468  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19880467 aaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtg 19880368  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880367 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 19880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 34644598 - 34644855
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34644598 acatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtag 34644697  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  34644698 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtg 34644797  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34644798 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaac 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18795951 - 18795691
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18795951 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 18795852  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18795851 tacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttggg 18795752  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795751 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 18795691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563412
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569271
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19454681 - 19454422
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19454681 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19454582  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19454581 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 19454482  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  19454481 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagtggatgt 19454422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15460597 - 15460337
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  15460597 cagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 15460498  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||| | | || |||||||| |||||    
T  15460497 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttggg 15460398  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15460397 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttgatgtc 15460337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 8761953 - 8762195
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  8761953 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 8762052  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8762053 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8762152  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaa 264  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8762153 gatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaa 8762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296476
Alignment:
Q  28 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  128 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 227  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  228 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 272  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 5296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 14378937 - 14379181
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14378937 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14379036  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14379037 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14379136  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379137 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14379181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 14380487 - 14380731
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14380487 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14380586  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14380587 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14380686  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14380687 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14380731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21472841 - 21472618
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  21472841 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 21472742  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  21472741 taaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 21472642  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| ||||| || |||||    
T  21472641 tttcttgaacagtattagggaagc 21472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 10467869 - 10468116
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  10467869 cagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacat 10467968  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  10467969 tgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggg 10468068  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10468069 gatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 10468116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897096
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  15897134 attcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 15897096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434883
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 22434910  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22434909 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443281
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22443308  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22443307 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22443281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27188673 - 27188449
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27188673 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27188574  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27188573 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27188474  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaa 270  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27188473 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27188449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Original strand, 27260567 - 27260791
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27260567 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27260666  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27260667 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27260766  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaa 270  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27260767 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27260791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24365673 - 24365429
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  24365673 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacct 24365574  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  24365573 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 24365474  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24365473 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761734
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatga 22761695  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  22761696 attcctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 22761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 281
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636580
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 20636542  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  20636543 tttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgt 20636580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926815
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19436262 - 19436019
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||||| ||    
T  19436262 agaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacatt 19436163  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     || ||||| ||  |||||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||  |     
T  19436162 gcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcagg 19436063  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19436062 atgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagc 19436019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488536
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| |||| || |||||||| ||||  |  ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtattaaagaagc 19488536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079573
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagattt 23079573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591061
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  29591061 t 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962620
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16962620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625892
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 16625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 28281833 - 28281987
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  28281833 cagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 28281932  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  28281933 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 28281987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113658
Alignment:
Q  28 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 127  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  128 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 25113658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838499
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || || |||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| || |||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattt 5838462  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
      ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  5838463 tctgaatagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 5838499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19865929 - 19865776
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||    
T  19865929 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgat 19865830  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    ||| || || || ||| | || || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  19865829 ggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtga 19865776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542364
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || || |||||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 1542327  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  1542328 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 1542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609055
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaat 25609055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 28262241 - 28262372
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28262241 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28262340  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28262341 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Original strand, 28340990 - 28341121
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28340990 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28341089  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28341090 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |   | || || ||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2873944
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  2873944 t 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407121
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 18407121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196861
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769208
Alignment:
Q  124 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggca 223  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  224 tgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||| |||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagc 25769208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449650
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 6555 - 6823
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6555 acatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtag 6654  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6655 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtg 6754  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6755 cagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19614062 - 19613802
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19614062 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 19613963  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19613962 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19613863  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19613862 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 19613802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 11387309 - 11387550
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11387309 tattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgat 11387408  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  11387409 ggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagt 11387508  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11387509 gatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 14263106 - 14263366
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14263106 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14263205  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    ||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  14263206 tacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttggg 14263305  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14263306 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19148598 - 19148338
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19148598 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19148499  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  19148498 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 19148399  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19148398 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20747997 - 20747737
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20747997 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20747898  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  20747897 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 20747798  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20747797 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 15101465 - 15101725
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  15101465 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgt 15101564  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15101565 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15101664  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  15101665 tatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 15101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 16071157 - 16071403
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  16071157 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacat 16071256  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16071257 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 16071356  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcac 268  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  16071357 tatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcac 16071403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13022744 - 13022500
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  13022744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 13022645  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  13022644 tacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggg 13022545  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  13022544 gatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 13022500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205921
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     || ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtattaaagaagcacaggaggttgatgt 12205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 11305125 - 11305369
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  11305125 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 11305224  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  11305225 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 11305324  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11305325 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 16949334 - 16949578
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16949334 cagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 16949433  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  16949434 tgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 16949533  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||  || |||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16949534 gatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagc 16949578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 26117467 - 26117711
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || |    
T  26117467 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactt 26117566  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || || |||||  | || ||||| |||||||||| |  ||||||| | || |||||    
T  26117567 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttggg 26117666  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26117667 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 26117711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13666924 - 13666665
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  13666924 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgt 13666825  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  13666824 tgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggg 13666725  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  13666724 gatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagtagatgt 13666665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 268 - 513
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgccttgagtagaaagacg 120  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | || |||||     
T  268 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagaca 367  T
Q  121 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgg 220  Q
    || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||| |||||| | |||||||    
T  368 ttgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttgg 467  T
Q  221 gcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    | ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  468 ggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 14285238 - 14285485
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  14285238 cagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacac 14285337  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  || |||||| | ||||||||    
T  14285338 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttggg 14285437  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  14285438 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcaca 14285485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12458024 - 12457783
Alignment:
Q  25 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 124  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12458024 aggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgc 12457925  T
Q  125 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 224  Q
    | ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||| ||    
T  12457924 atatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggat 12457825  T
Q  225 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  12457824 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 12457783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49153688 - 49153444
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || |    
T  49153688 cagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactt 49153589  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  49153588 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttggg 49153489  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| | | || ||||| |||||| |||||||    
T  49153488 aatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagc 49153444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14955919 - 14955785
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14955919 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14955820  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14955819 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 14955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 281
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321180
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 248  Q
    | || ||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| |||||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| ||| |||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttctt 321147  T
Q  249 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  321148 gaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  54 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 153  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  154 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708836
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 8708836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771316
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | || ||| |||| || || || || ||||||||||| ||| | || || || |||| ||| |||||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtg 11771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550797
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 18550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 23504732 - 23504886
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||     
T  23504732 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgc 23504831  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23504832 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 23504886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790390
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | || || || || || || || ||||||||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 44790390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872190
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 10872190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333535
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14333661 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14333562  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  14333561 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14333535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 18052815 - 18052969
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  18052815 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacac 18052914  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  18052915 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 18052969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199893
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  8199893 t 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236334
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  243 attcttgaatagtatca 259  Q
    |||| |||| |||||||    
T  11236318 attcctgaaaagtatca 11236334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 13967530 - 13967774
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | || || |    
T  13967530 cagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactt 13967629  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  13967630 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggg 13967729  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13967730 gatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160062
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  15160062 t 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18179106 - 18179007
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18179106 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 16223 - 16389
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  16223 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 16322  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagag 209  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||    
T  16323 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15341818 - 15341573
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||     
T  15341818 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgc 15341719  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | ||||||||    
T  15341718 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttggg 15341619  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 267  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  15341618 catgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagca 15341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 23202519 - 23202652
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23202519 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23202619 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23202652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 23508646 - 23508779
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23508646 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23508746 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23508779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687329
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  13687329 t 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204851
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
     || || || ||| | |||||  ||||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagaga 15204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  167 agtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12688866 - 12688731
Alignment:
Q  43 ttgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 141  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  12688866 ttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T
Q  142 gtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    || |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12688766 gttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9597437 - 9597252
Alignment:
Q  28 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 127  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || |    
T  9597437 agatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcata 9597338  T
Q  128 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  9597337 tgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552107
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14213038 - 14212886
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  14213038 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 14212939  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
     |  || ||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  14212938 tagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaat 14212886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040921
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 182  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14040921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350951
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 182  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625744
Alignment:
Q  64 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 163  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  164 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 218  Q
    | |||||||||||| | || || || |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagtt 15625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40142
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  40027 agacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 40126  T
Q  119 cgttacacatgtcggc 134  Q
    | || |||||||||||    
T  40127 ccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 32555 - 32815
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32555 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 32654  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32655 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 32754  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32755 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 32815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 55778 - 56022
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  55778 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 55877  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  55878 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 55977  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  55978 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49652
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49392 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 49491  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49492 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 49591  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49592 tatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44319
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 44356  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  44355 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 44319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9781
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16275
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagt 111  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 21679835 - 21680095
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21679835 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21679934  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21679935 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 21680034  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680035 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 21680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22463262 - 22463003
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22463262 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 22463163  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  22463162 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 22463063  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22463062 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20822764 - 20822505
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  20822764 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 20822665  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || | | | || ||||||||||||||    
T  20822664 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttggg 20822565  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822564 tatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 20822505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 24619352 - 24619596
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24619352 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24619451  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24619452 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24619551  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24619552 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 24715583 - 24715827
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24715583 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24715682  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24715683 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24715782  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24715783 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748855
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24748611 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24748710  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24748711 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24748810  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24748811 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 28893999 - 28894258
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28893999 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28894098  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28894099 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28894198  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28894199 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28894258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 28915470 - 28915729
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28915470 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28915569  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28915570 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28915669  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28915670 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28915729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 28922825 - 28923084
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28922825 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28922924  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28922925 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28923024  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28923025 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28923084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 23079146 - 23079396
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || || |    
T  23079146 cagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacat 23079245  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||    
T  23079246 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggg 23079345  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 272  Q
     |||||||| || || | | | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23079346 gatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaaca 23079396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774811
Alignment:
Q  56 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 155  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  156 gttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 255  Q
    ||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  256 atcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgt 20774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 14886048 - 14886292
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14886048 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 14886147  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14886148 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14886247  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14886248 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 22234977 - 22235236
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22234977 cagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 22235076  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  22235077 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 22235176  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| | || || || | ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||    
T  22235177 gatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaggtagatgt 22235236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 24797454 - 24797698
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |    
T  24797454 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactt 24797553  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  24797554 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 24797653  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  24797654 aatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 28930738 - 28930946
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28930738 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28930837  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28930838 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28930937  T
Q  222 catgttgaa 230  Q
     ||||||||    
T  28930938 tatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563277
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||  | || || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21563251 gttcttgaacagtatcaaagaagcaca 21563277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 282
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890076
Alignment:
Q  139 atggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 238  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  239 atgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21890076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 37542438 - 37542682
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || |    
T  37542438 cagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactt 37542537  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  37542538 tgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| | | ||||| || |||||| |||||||    
T  37542638 aatgttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagc 37542682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472400
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 23472400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25849386 - 25849142
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  25849386 cagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactt 25849287  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  25849286 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 25849187  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| | || ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25849186 gatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667794
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 27667767  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| || |||| |||||||||    
T  27667768 atttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27667794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357710
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16357710 t 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519614
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  27519614 t 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567702
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  34567702 t 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709988
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  40709988 t 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503746
Alignment:
Q  28 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  128 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 227  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  228 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  22503784 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574810
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 23574837  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaa 270  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  23574836 ttcctgaagagtatcaaagaagcacaa 23574810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41772147 - 41772050
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  41772147 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611562
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  27611562 t 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19771265 - 19771134
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19771265 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 19771166  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19771165 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441279
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtga 23441319  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  23441318 atttatgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 23441279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 21872128 - 21872226
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21872128 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 21876408 - 21876506
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21876408 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332191
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22332065 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22332164  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  22332165 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 22332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427605
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaattt 25427605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20343590 - 20343349
Alignment:
Q  25 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 124  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  20343590 aggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgc 20343491  T
Q  125 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 224  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| | |||||||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  20343490 acatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggat 20343391  T
Q  225 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20343390 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14998917
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  14998917 t 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135876
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  22135876 t 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684578
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  27684578 t 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475251
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  29475251 t 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 26737805 - 26737992
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  26737805 ttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 26737904  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 230  Q
    | || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  26737905 taaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21497228 - 21497150
Alignment:
Q  47 aggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21497228 aggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 37290574 - 37290708
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  37290574 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 37290673  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  37290674 tcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagat 37290708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 17268391 - 17268545
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  17268391 cagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 17268490  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  17268491 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 17268545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882018
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || |||||||| || || ||||||| |||| | ||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |  || | ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaa 21882057  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21882056 tttctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 21882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467237
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 20467237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  82 aaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaa 181  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | |    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  182 gccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 251  Q
    | || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18777103 - 18776951
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  18777103 tgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  18777003 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 18776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338475
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||| | | || ||||| || ||||||||    
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 846 - 923
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 99  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  846 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408230
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | || || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  246 cttgaatagtatca 259  Q
     || ||||||||||    
T  21408243 ttttaatagtatca 21408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 13971223 - 13971483
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13971223 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgt 13971322  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13971323 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 13971422  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  13971423 tatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtc 13971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14087699 - 14087439
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  14087699 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacat 14087600  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14087599 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttggg 14087500  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14087499 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 14087439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 10419148 - 10419408
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  10419148 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 10419247  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||||||||||||    
T  10419248 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttggg 10419347  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10419348 tatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttgatgtc 10419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 12359630 - 12359889
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12359630 cagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgt 12359729  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  12359730 tgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 12359829  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12359830 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtagatgt 12359889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17187400 - 17187164
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  17187400 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 17187301  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  17187300 tgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttggg 17187201  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 258  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  17187200 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14574925 - 14574689
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 14574826  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  14574825 atgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 14574726  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  14574725 cttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 14574689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17493656 - 17493396
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17493656 cagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgt 17493557  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || ||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  17493556 tgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggg 17493457  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  17493456 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 17493396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 31694289 - 31694536
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31694289 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31694388  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31694389 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31694488  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31694489 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31694536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31939929 - 31939682
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31939929 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31939830  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31939829 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31939730  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31939729 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31939682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47124970 - 47124726
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  47124970 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 47124871  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  47124870 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 47124771  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47124770 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 13319605 - 13319864
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |    
T  13319605 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagacct 13319704  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||    
T  13319705 tacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggg 13319804  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  13319805 gatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgtgaagctcagcaggtagatgt 13319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Original strand, 16827327 - 16827566
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  16827327 ttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 16827426  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  16827427 taaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 16827526  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16827527 tttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 16337615 - 16337868
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16337615 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16337714  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16337715 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 16337814  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggt 275  Q
     |||||||  ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16337815 aatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagctcagcaggt 16337868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 11960272 - 11960516
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  11960272 cagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacat 11960371  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  11960372 tgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 11960471  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||  ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11960472 gatgatgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11960516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 16835613 - 16835873
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  16835613 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactt 16835712  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |  |||||||| || || || |||||||||||  | || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  16835713 tgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttggg 16835812  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16835813 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 16835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228416
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15228416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234284
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 282
Target Start/End: Original strand, 14580053 - 14580316
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14580053 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14580152  T
Q  119 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 218  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | | ||||||||  || |    
T  14580153 atttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagct 14580252  T
Q  219 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     || |||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  | |||||||||    
T  14580253 aggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtattaaggaagcacagaaagttgatgtc 14580316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347550
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
      || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12179364 - 12179234
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12179364 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgt 12179265  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatt 152  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12179264 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133693
Alignment:
Q  26 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  126 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 225  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||| || ||||| |||||||  |||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatg 18133652  T
Q  226 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     | || || || | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  18133653 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 18133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491452
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 16491452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424291
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 5424264  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  5424265 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 5424291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44778273 - 44778119
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  44778273 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 44778174  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44778173 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 44778119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6601728 - 6601631
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6601728 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 16328766 - 16329007
Alignment:
Q  25 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 124  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  16328766 aggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattac 16328865  T
Q  125 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 224  Q
    | ||||| ||  | ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  16328866 atatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggat 16328965  T
Q  225 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
      |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16328966 aatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588627
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  15588627 t 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636668
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16636668 t 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061289
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  20061289 t 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163992
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  43163992 t 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426342
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  48426342 t 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 53384156 - 53384323
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  53384156 aaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 53384255  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
      || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  53384256 gagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 53384323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490693
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaa 195  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaa 17490693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41178548 - 41178394
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  41178548 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 41178449  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  41178448 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 41178394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006495
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  10006495 t 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10907105
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  10907105 t 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303123
Alignment:
Q  137 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  237 taatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 11303123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253585
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  13253585 t 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260489
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagattt 15260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401878
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15401752 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15401851  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15401852 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15401878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340038
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15340164 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15340065  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15340064 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |  || || || ||||| || | |||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724169
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  15724169 t 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13943050 - 13942896
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  13943050 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 13942951  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  13942950 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 13942896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12499245 - 12499109
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  12499245 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 12499146  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    ||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  12499145 ggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagat 12499109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 279
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875870
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || ||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 279  Q
    || ||||| ||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  14875835 tttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgat 14875870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16693159 - 16693026
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||    
T  16693159 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatgg 16693060  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| |||||    
T  16693059 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagaga 16693026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 16411418 - 16411517
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16411418 tgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755820
Alignment:
Q  80 gtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |  || || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 16380031 - 16380185
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  16380031 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 16380130  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16380131 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 16380185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24439 - 24179
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24439 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 24340  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24339 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 24240  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24239 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20277 - 20017
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  20277 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 20178  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20177 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 20078  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20077 tatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 20060918 - 20061159
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060918 tattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 20061017  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20061018 ggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagt 20061117  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20061118 gaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtc 20061159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19855717 - 19855458
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19855717 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19855618  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  19855617 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 19855518  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19855517 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 19855458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 19662084 - 19662331
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19662084 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 19662183  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  19662184 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggg 19662283  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19662284 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 19662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 20855707 - 20855966
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20855707 cagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20855806  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  20855807 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 20855906  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20855907 tatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgt 20855966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 23197193 - 23197440
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  23197193 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgt 23197292  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23197293 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 23197392  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23197393 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcaca 23197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 20939010 - 20939269
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  20939010 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 20939109  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  20939110 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggg 20939209  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  20939210 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 20939269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 20834847 - 20835096
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20834847 cagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20834946  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||    
T  20834947 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggg 20835046  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 271  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20835047 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 24098550 - 24098794
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24098550 cagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 24098649  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24098650 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 24098749  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24098750 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 31538944 - 31539188
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  31538944 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 31539043  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  31539044 tgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 31539143  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31539144 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  243 attcttgaatagtat 257  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21952321 - 21952113
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21952321 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 21952222  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||||||||    
T  21952221 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 21952122  T
Q  222 catgttgaa 230  Q
     ||| ||||    
T  21952121 gatgctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750093
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 251  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||||||||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  252 tagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 21750093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Original strand, 21744499 - 21744627
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21744499 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21744598  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaa 150  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  21744599 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431220
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagattt 431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332687
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || || || || || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  51332661 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 51332687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20295824 - 20295580
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20295824 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactt 20295725  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || ||  | || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20295724 tgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggg 20295625  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  20295624 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Original strand, 41352636 - 41352800
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  41352636 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 41352735  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  41352736 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 41352800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349664
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16349664 t 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390167
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838241
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  21838241 t 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110277
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22110277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114126
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19107759 - 19107625
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||    
T  19107759 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatgg 19107660  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19107659 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19107625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831468
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  21831594 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21831495  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  21831494 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 21831468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760067
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    |  | ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  ||| |||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||    
T  19760041 atttatgaatagtataaaagaagcaca 19760067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025394
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21025394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Original strand, 21234675 - 21234852
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  21234675 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 21234774  T
Q  119 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
    |||| || ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  21234775 cgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 21234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 281
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361450
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggt 22361312  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     ||  | || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  22361313 aaaatagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 22361412  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    || ||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  22361413 tttttgaagagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 22361450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 122
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 17043983 - 17044059
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 119  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043983 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099693
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 27209590 - 27209847
Alignment:
Q  25 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 124  Q
    ||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27209590 aggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgc 27209689  T
Q  125 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 224  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| ||    
T  27209690 acatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtat 27209789  T
Q  225 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27209790 gctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23277804 - 23277560
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23277804 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 23277705  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23277704 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23277605  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||  |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23277604 gattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagc 23277560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24949618 - 24949371
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  24949618 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 24949519  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  24949518 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggg 24949419  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |  | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24949418 gatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcaca 24949371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1064779 - 1064535
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  1064779 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 1064680  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  1064679 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 1064580  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1064579 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111517
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || ||| |||| || ||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23111543 attcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20829287 - 20829043
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20829287 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 20829188  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20829187 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 20829088  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20829087 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31831686 - 31831450
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  31831686 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 31831587  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  31831586 tacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 31831487  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 258  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  31831486 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23294963 - 23294719
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  23294963 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgt 23294864  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| |  |||||||    
T  23294863 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggg 23294764  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23294763 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 19651465 - 19651709
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  19651465 cagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 19651564  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  19651565 tgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 19651664  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19651665 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 19651709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710803
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24710842  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  24710841 atttctgaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatgt 24710803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923796
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16923796 t 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926267
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16926267 t 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16983059
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16983059 t 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999907
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  16999907 t 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064624
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  17064624 t 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324392
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  22324392 t 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218923
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  27218923 t 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  50 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 149  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  150 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12575381 - 12575227
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  12575381 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 12575282  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  12575281 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 12575227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067262
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 23067262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372142
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 27372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385105
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  44385105 t 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107302
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagattt 23107302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27788768 - 27788615
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  27788768 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 27788669  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  27788668 t-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 27788615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 21144478 - 21144611
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21144478 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21144577  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  21144578 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 21144611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869757
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  10869757 t 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41607921
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  41607921 t 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876285
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263279
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 141  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533113
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa-t 244  Q
      || || ||||| || ||  |||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||| |    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 45533150  T
Q  245 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    | ||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||    
T  45533149 ttttggatagtatcaaagaggctcaaaaggtggatgt 45533113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324836
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagat 21324836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 24706916 - 24707088
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||    
T  24706916 tattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgat 24707015  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24707016 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 282
Target Start/End: Original strand, 27364713 - 27364754
Alignment:
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27364713 gaattcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtc 27364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1051
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1311 cagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacat 1212  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1211 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttggg 1112  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1111 tatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 68798 - 68540
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  68798 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 68699  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  68698 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 68599  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 280  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68598 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatg 68540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 3831 - 4080
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3831 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgt 3930  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  3931 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggg 4030  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 271  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4031 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 12786 - 13039
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  12786 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 12885  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || |||||  |  ||||||||||| ||||||| || || || | ||||||       || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12886 tgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 12978  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  12979 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtc 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2468
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  2208 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 2307  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2308 tgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 2407  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  2408 tatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 430 - 690
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  430 cagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 529  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  530 tgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 629  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  630 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtc 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13239
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||| | |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 13265  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||    
T  13264 tttctgaagagtattaaagaagcaca 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7291
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 20984865 - 20985125
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20984865 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgt 20984964  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20984965 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 20985064  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20985065 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttgatgtc 20985125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841620
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21841659 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19852853 - 19852630
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19852853 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19852754  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19852753 taaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19852654  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19852653 tttcttgaatagtatcagagaagc 19852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19858889 - 19858666
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19858889 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19858790  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19858789 taaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19858690  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19858689 tttcttgaatagtatcagagaagc 19858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23656366 - 23656130
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23656366 aaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 23656267  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  23656266 aagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 23656167  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23656166 cttgagtagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 23656130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22372375 - 22372150
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22372375 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 22372276  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||  | || |||||||||   |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22372275 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 22372176  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    || ||||| || ||||||||||||||    
T  22372175 gatttcttaaacagtatcagagaagc 22372150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 20974974 - 20975228
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20974974 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20975073  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || |||||     || ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20975074 tgcatatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 20975168  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  20975169 gatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagcaaaacaagtggatgt 20975228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14566605 - 14566361
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  14566605 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 14566506  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14566505 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14566406  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14566405 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 257
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || || ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  243 attcttgaatagtat 257  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 31415789 - 31416036
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  31415789 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacat 31415888  T
Q  122 tacacatgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 218  Q
    | || ||||| ||     ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  31415889 tgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagtt 31415988  T
Q  219 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31415989 ggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagc 31416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 29302744 - 29302988
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  29302744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacat 29302843  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | | ||||||    
T  29302844 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacggttggg 29302943  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||    
T  29302944 gatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979170
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || |||||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  19979208 tttttgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 19979170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Original strand, 22376791 - 22377016
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22376791 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22376890  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22376891 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22376990  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22376991 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Original strand, 22382966 - 22383191
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22382966 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22383065  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22383066 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22383165  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22383166 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22383191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6605121 - 6604877
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6605121 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 6605022  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  6605021 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 6604922  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6604921 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 21324587 - 21324794
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  21324587 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 21324686  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  21324687 tgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggg 21324785  T
Q  222 catgttgaa 230  Q
     ||| ||||    
T  21324786 gatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 20009260 - 20009482
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  20009260 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20009358  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||    
T  20009359 taaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtga 20009458  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| | ||||| ||||||    
T  20009459 tttcttgaacaatatcatagaagc 20009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389317
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || ||| | || || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagca 267  Q
     |||||||| | ||||| |||||||    
T  20389341 gttcttgaacaatatcaaagaagca 20389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921181
Alignment:
Q  50 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680330
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 248  Q
    | || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  249 gaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  6680347 gaacagtatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 16270542 - 16270786
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16270542 cagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16270641  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16270642 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 16270741  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  16270742 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Original strand, 19483409 - 19483573
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  19483409 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 19483508  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  19483509 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 19483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252250
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21252250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 31570160 - 31570314
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  31570160 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 31570259  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31570260 ttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 31570314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673496
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    | |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 17673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017828
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  20017702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 20017801  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  20017802 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20017828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166116
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | || ||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 21166077  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21166078 tttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtc 21166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || || ||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  243 attcttgaatagtat 257  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12306221 - 12305977
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || |    
T  12306221 cagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacat 12306122  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12306121 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 12306022  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  12306021 gatgttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19114032
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  19114032 t 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 131
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247860
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  95 ttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  195 attgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393340
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21393340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787834
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21787834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22041301 - 22041131
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  22041301 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 22041202  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  22041201 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043753
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagat 21043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857919
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  18857919 t 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22052334 - 22052066
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22052334 acatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 22052235  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |     
T  22052234 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcata 22052135  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  22052134 tagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 22052066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 30312484 - 30312636
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  30312484 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  30312584 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 30312636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27355999 - 27355924
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttg 97  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27355999 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267544
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagattt 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15534849 - 15534689
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  15534849 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 15534750  T
Q  119 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15534749 cattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagattt 15534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32601586 - 32601433
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  32601586 ttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 32601487  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 196  Q
    | |  || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  32601486 ttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaat 32601433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19869159 - 19869044
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||| |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  19869159 agacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 19869060  T
Q  119 cgttacacatgtcggc 134  Q
    | || |||||||||||    
T  19869059 ccttgcacatgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 282
Target Start/End: Original strand, 16407495 - 16407623
Alignment:
Q  154 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 253  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || | | ||||||||| |  |||| ||| |||| || |||| ||||||  |||| |    
T  16407495 gagttaattgagcagtttagagatatgagcttggtttgtgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaaga 16407594  T
Q  254 gtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||    
T  16407595 gtattaaagaagcacaaaaagttgatgtc 16407623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27901783 - 27901525
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27901783 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 27901684  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||    
T  27901683 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttggg 27901584  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 280  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27901583 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttgatg 27901525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 15002239 - 15002499
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15002239 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15002338  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15002339 tgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15002438  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15002439 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagatgatgtc 15002499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 15357995 - 15358242
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15357995 cagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgt 15358094  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| ||    
T  15358095 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagg 15358194  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358195 gatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcaca 15358242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 279
Target Start/End: Original strand, 15413922 - 15414158
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15413922 ttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 15414021  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15414022 ttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15414121  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 279  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  15414122 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgat 15414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 29452412 - 29452656
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  29452412 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 29452511  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  29452512 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 29452611  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29452612 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 3263669 - 3263913
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  3263669 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 3263768  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  3263769 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 3263868  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3263869 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33224320 - 33224076
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  33224320 cagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 33224221  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  33224220 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 33224121  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33224120 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagc 33224076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16149107 - 16148873
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16149107 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16149008  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16149007 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16148908  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 257  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16148907 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16153253 - 16153019
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16153253 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16153154  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16153153 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16153054  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 257  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16153053 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15247297 - 15247061
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15247297 aaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 15247198  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  15247197 aagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgattt 15247098  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  15247097 cttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 15247061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320317
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 238  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaata 15320317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 266
Target Start/End: Original strand, 11206107 - 11206350
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  11206107 agaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacttt 11206206  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||     
T  11206207 gcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggg 11206306  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11206307 atgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078785
Alignment:
Q  136 atgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatca 235  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  236 ataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtatcagggaagcaca 15078785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707088
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  243 attcttgaa 251  Q
     ||||||||    
T  8707096 gttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 16354079 - 16354251
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  16354079 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 16354178  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  16354179 ggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695266
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14695289 attcttgaacagtatcaaagaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15071737 - 15071602
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  15071737 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 15071638  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15071637 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146672
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 15146672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Original strand, 1648153 - 1648411
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  1648153 agaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacatt 1648252  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || ||| |  | || ||     
T  1648253 gcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttggg 1648352  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1648353 atgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgt 1648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387688
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  8387688 t 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477876
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  12477876 t 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298481
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  18298481 t 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777529
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  19777529 t 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038140
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  143 t 143  Q
    |    
T  29038140 t 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23957120 - 23956953
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  23957120 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 23957021  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23957020 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052485
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8052359 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 8052458  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  8052459 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 8052485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 51605667 - 51605821
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  51605667 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 51605766  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  51605767 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 51605821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14160867 - 14160710
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  14160867 cagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagacct 14160768  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||  | |||||||||||    
T  14160767 tgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagattt 14160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20892379 - 20892171
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20892379 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 20892280  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20892279 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 20892180  T
Q  222 catgttgaa 230  Q
     ||| ||||    
T  20892179 gatgctgaa 20892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 44660733 - 44660985
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |     
T  44660733 acatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaa 44660832  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     || || || || ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |     
T  44660833 gaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 44660932  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  44660933 cagttgggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27712709 - 27712578
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  27712709 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 27712610  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  27712609 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 27712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524918
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12524918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850136
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagat 14850136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681867
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40474415 - 40474282
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  40474415 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 40474316  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     || || || || || || || ||||||||||||    
T  40474315 caaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 40474282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302830
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  243 attcttgaatagtatca 259  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14302814 attcctgaaaagtatca 14302830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 18614436 - 18614596
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  18614436 agacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaaga 18614535  T
Q  119 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || ||||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  18614536 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagattt 18614596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 18226082 - 18226269
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18226082 ttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatgg 18226181  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 230  Q
    | |   | ||||||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  18226182 ttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaa 18226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11200 - 10974
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11200 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 11101  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  11100 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtga 11001  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000 tttcttgaatagtatcagagaagcaca 10974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5598
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5858 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgt 5759  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5758 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 5659  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5658 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttgatgtc 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 111 - 370
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  111 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 210  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  211 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttggg 310  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  311 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 324132 - 323882
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  324132 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 324033  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  324032 tgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 323933  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 272  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  323932 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaaca 323882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 251
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  243 attcttgaa 251  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118477
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 199  Q
    | || || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgt 118477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1992
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1732 cagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 1831  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||  |||||||    
T  1832 tgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggg 1931  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1932 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29485 - 29225
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  29485 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 29386  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  29385 tgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 29286  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  29285 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30216
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagattt 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 50238 - 50168
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 92  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50238 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28645 - 28385
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  28645 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 28546  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  28545 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 28446  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28445 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34898 - 34638
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  34898 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 34799  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  34798 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 34699  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  34698 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 34638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 95 - 172
Alignment:
Q  81 taaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagtt 158  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagtt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 47912 - 48172
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  47912 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgt 48011  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  48012 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttggg 48111  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  48112 tatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtc 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 56725 - 56984
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||     
T  56725 cagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgc 56824  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || ||||||||  |||||  ||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  56825 tgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 56924  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  56925 aatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 56984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27708
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  27731 tttcttgaacagtatcagagaagc 27708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 46277 - 46524
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  46277 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgt 46376  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  46377 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 46476  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46477 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 46524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 41211 - 41455
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  41211 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 41310  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41311 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 41410  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41411 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3098
Alignment:
Q  50 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 149  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  150 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 249  Q
     |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  250 aatagtatcagagaagc 266  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3114 aatagtatcaaagaagc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 269
Target Start/End: Original strand, 24755 - 25001
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755 agagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgtt 24854  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     || ||||  ||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||     
T  24855 gcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttgggg 24954  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24955 atgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 25001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13379
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13628 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 13529  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13528 tgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggg 13429  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 271  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13428 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4944
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  5204 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgt 5105  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |    
T  5104 tgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgag 5005  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5004 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48272
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48308 cttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtc 48272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89583
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  89323 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 89422  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  89423 tgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 89522  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  89523 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 89583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 90001 - 90261
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  90001 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 90100  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  90101 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 90200  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  90201 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 90261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41102 - 40879
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  41102 aaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 41003  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  41002 aagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 40903  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  40902 cttgaatagtatccgagaagcaca 40879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15290
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  15540 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggt 15441  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15440 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15341  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 272  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 149997 - 149749
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  149997 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 149899  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |  | ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  149898 tgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 149799  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 271  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149798 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 194582 - 194841
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||    
T  194582 cagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgt 194681  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | || || |||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  194682 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggg 194781  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  194782 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagtggatgt 194841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25568
Alignment:
Q  50 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  150 atttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagattt 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5918
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5954 cttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 43967
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |    
T  44211 cagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacat 44112  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44111 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 44012  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44011 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 50753 - 51013
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||    
T  50753 cagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgt 50852  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||     
T  50853 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggc 50952  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50953 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 146
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  385 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 286  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  285 taaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 186  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  185 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 182
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  429 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgt 330  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||    
T  329 tgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgg 230  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  229 gatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcaca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1273 - 1037
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  1273 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaa 1174  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    |||| |||||||| || ||  |||  ||||| || || ||||||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  1173 aggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtgattt 1074  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1073 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 10935 - 11179
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10935 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 11034  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  11035 tgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 11134  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11135 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 14705 - 14949
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14705 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 14804  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  14805 tgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 14904  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14905 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 14949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21411 - 21151
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| |  | |||||    
T  21411 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgt 21312  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  21311 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 21212  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  21211 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 21151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42345 - 42101
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  42345 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 42246  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  42245 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 42146  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42145 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 250041 - 249797
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  250041 cagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 249942  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |    
T  249941 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcg 249842  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  249841 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagc 249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2769
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||| ||    
T  3016 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgt 2917  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  2916 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 2817  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2816 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6206
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  241 gaattcttgaatagtatca 259  Q
    || |||||||| |||||||    
T  6188 gatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2492
Alignment:
Q  14 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2225 acatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtag 2324  T
Q  114 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     || ||||| || |||||  | |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||     
T  2325 gaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgtt 2424  T
Q  214 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    |||||||| ||| |||| || || | ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  2425 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtagatgt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8244
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8488 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgt 8389  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || |||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8388 tgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8289  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8288 gatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagc 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6361
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  6116 cagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 6215  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  6216 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggg 6315  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6316 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32839 - 32579
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| || || ||||    
T  32839 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgt 32740  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  32739 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 32640  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||    
T  32639 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagtggatgtc 32579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 566 - 824
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  566 cagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgt 664  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  665 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggg 764  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     ||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  765 gatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20822 - 20578
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  20822 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacat 20723  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20722 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 20623  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20622 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23642 - 23398
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  23642 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacat 23543  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23542 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23443  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23442 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28052 - 27793
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||    
T  28052 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcagaa-gacgt 27954  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |  | ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || |||||||| || |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  27953 tggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttggg 27854  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  27853 tatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 27793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 51058 - 51317
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  51058 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 51157  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  51158 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 51257  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  51258 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 51317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 60092 - 60351
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  60092 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 60191  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  60192 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 60291  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  60292 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 60351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66739
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  66480 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 66579  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  66580 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 66679  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  66680 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 66739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 100440 - 100684
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  100440 cagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacat 100539  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||  ||||| | || |||||    
T  100540 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggg 100639  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  100640 gatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 100684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  94 gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  194 aattgttaccccagagtgtg 213  Q
    ||| || | | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 2363 - 2610
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  2363 cagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 2462  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |||  ||||||| ||||||||    
T  2463 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttggg 2562  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     |||||||| || |||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2563 tatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Original strand, 851 - 1098
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  851 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgt 950  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||| ||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  951 tgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttggg 1050  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1051 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3580 - 3346
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  3580 aaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaa 3481  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||| |||  |||||||  ||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  3480 aggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 3381  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3380 cttgaacagtatcagagaagcacagcaagttgatg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  98 cagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  198 gttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    || | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 282
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6468
Alignment:
Q  78 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  178 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 277  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  278 atgtc 282  Q
    |||||    
T  6464 atgtc 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 282
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10899
Alignment:
Q  78 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  178 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 277  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  278 atgtc 282  Q
    |||||    
T  10895 atgtc 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 13177 - 13436
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  13177 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 13276  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13277 tgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggg 13376  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| ||||||| || | | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  13377 gatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9945
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9907 gttcttggatagtattagagaagcacagaaggttgatgt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11902
Alignment:
Q  64 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 163  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || || |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  164 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 263  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  264 agcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  11919 agcgcaacaagtggatgt 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10579
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  10335 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 10434  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  10435 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 10534  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  10535 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 10579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20793
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  20549 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 20648  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  20649 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 20748  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20749 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20289
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20548 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacat 20449  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  20448 tgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 20349  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  20348 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 20289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 269
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  83 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 182  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  183 ccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcaca 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17114
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||||||||| | ||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  17076 attcttgaacaatattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 17114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18330
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  243 attcttgaatagtatca 259  Q
    |||||||||||||||||    
T  18314 attcttgaatagtatca 18330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4574
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  4330 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 4429  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  4430 tacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 4529  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||    
T  4530 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagc 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 3932
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||    
T  4177 cagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgt 4078  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  4077 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttggg 3980  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3979 aatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcaca 3932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 236  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 516
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 118  Q
    ||||||||||||||  | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  755 agacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 656  T
Q  119 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 218  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||    
T  655 ccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 556  T
Q  219 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 258  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  555 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 79391 - 79632
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  79391 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgat 79490  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| |  || || |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  | || |||||||| ||  ||| |    
T  79491 ggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagt 79590  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  79591 gaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7267
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  7023 cagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 7122  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  7123 tgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 7222  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     |||||||| || || | | | || |||||||||||| |||||||    
T  7223 gatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagc 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12613
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12405 cagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgc 12504  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  12505 tgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 12604  T
Q  222 catgttgaa 230  Q
     ||| ||||    
T  12605 gatgctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31788
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 31788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 109058 - 108859
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||    
T  109058 cagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgt 108959  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  108958 tgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63081
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    | || |  || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 63081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218539
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||    
T  218516 attcttgaacaatatcaaagaagc 218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177399
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  177161 ttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatgg 177260  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  177261 ttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 177360  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 281  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  177361 attcttgaacagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 177399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 3150 - 3387
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  3150 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 3249  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3250 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 3349  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 259  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3350 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15604
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  15379 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 15478  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 240  Q
    ||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| ||  | ||||| || ||||  || ||||||||| ||||||| ||| | |  ||  ||| |    
T  15479 ggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagt 15578  T
Q  241 gaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15579 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 15604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30400
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  30163 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 30262  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  30263 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 30362  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 259  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  30363 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18753 - 18517
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  18753 aaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaa 18654  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
    | || |||||||| || ||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||| |||||||| ||| ||||  | |||| ||| ||    
T  18653 aagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgattt 18554  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18553 cttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32438
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  32198 agagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacatt 32297  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | ||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||     
T  32298 acatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggg 32397  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 263  Q
    ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  32398 atgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45945 - 45701
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||      
T  45945 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccc 45846  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  45845 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 45746  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||||||| |||||||    
T  45745 aatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 45701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19340
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21315 - 21138
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21315 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 21216  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 199  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  21215 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgt 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35540 - 35422
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  35540 agagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgtt 35441  T
Q  123 acacatgtcggccatgatg 141  Q
     |||||||| || ||||||    
T  35440 gcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28393
Alignment:
Q  148 gaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattct 247  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  248 tgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28427 tgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 279
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39894
Alignment:
Q  70 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagt 169  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  170 ttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||  || |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  270 acaggttgat 279  Q
    | | ||||||    
T  39885 aaaagttgat 39894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16925
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagattt 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15835
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15591 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactt 15690  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |  |||||||    
T  15691 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttggg 15790  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15791 aaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10621
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||  | ||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  10644 attcttgaacagtattaaagaagc 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16148
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagattt 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112523
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagattt 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13652
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || | || ||| | || ||| ||| |||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  13675 attcttgaacagtatcaaagaagc 13652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10240
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagattt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7688
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7421 - 7182
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||    
T  7421 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatgg 7322  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||| || |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  7321 ttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 7222  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  7221 atttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29621
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23307
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || || ||| | |||||  |||||||| | || ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||| || |||||||| | ||||||    
T  23284 attttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8670
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8804 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8705  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
    |||  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  8704 tgagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | || || || ||||| || || ||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5215
Alignment:
Q  61 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttac 160  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  161 tcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcag 260  Q
    | || |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |||||||||||| |||||||     
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 5221  T
Q  261 agaagc 266  Q
    ||||||    
T  5220 agaagc 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5280 - 5091
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  5280 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 5181  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 230  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  5180 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12221
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  12410 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 12311  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 230  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12310 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 266
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5458
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||||||    |    
T  5241 gattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgag 5340  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 248  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || || | | | |||||    
T  5341 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaacagtaatttctt 5440  T
Q  249 gaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||||||||| |||||||    
T  5441 gaatagtatccgagaagc 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  50 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 149  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  150 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7643
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7356
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3620
Alignment:
Q  69 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 155  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14246
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 37
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2540
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 2540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25979
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || |||||  | || ||||||||||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagattt 25979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28361 - 28150
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || || || |    
T  28361 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacat 28262  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  28261 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 28162  T
Q  222 catgttgaaaat 233  Q
     ||| |||||||    
T  28161 gatgctgaaaat 28150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 277727 - 277862
Alignment:
Q  41 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 140  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  277727 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 277826  T
Q  141 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||    
T  277827 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagaga 277862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 261735 - 261491
Alignment:
Q  23 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 122  Q
    ||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  |    
T  261735 agaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacact 261636  T
Q  123 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 222  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | |||||||||    
T  261635 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggc 261536  T
Q  223 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 267  Q
    ||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  261535 atgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagca 261491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50688
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtga 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19783
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 19809  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19808 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35207
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 35233  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  35232 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 35207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 80710 - 80970
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||      
T  80710 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacac 80809  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  |||||||    
T  80810 tacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttggg 80909  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  80910 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 80970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 142
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  390 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 291  T
Q  122 ----tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagt 217  Q
        || | ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||    
T  290 tgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagt 191  T
Q  218 tgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||| ||| |||| ||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  190 tggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7366
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26230
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    | |  || || ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtga 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2089
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | ||  | || ||| | | ||| |||||||  ||  | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  2115 atttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8120
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8246 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8147  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagcaca 269  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  8146 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14331
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14178 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14276  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  14277 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 22357 - 22510
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22357 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22455  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22456 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 251
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24179
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  243 attcttgaa 251  Q
     ||||||||    
T  24171 gttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4491
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||  |||||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggt 4352  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 243  Q
     |  || || ||||| ||  | |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  4353 tagagagttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaa 4452  T
Q  244 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    ||  | || ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  4453 tttctaaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8639
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 151  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  152 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
    | |||||  | || |||||||||||||| ||  | || |||||||||| | | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38982
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagatt 178  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagagatt 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Original strand, 966 - 1102
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagattt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6641 - 6381
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  6641 cagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 6542  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 221  Q
    | || ||||  || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || |||||  | ||||||||    
T  6541 ttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 6442  T
Q  222 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 282  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  6441 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 6381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4383
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggattt 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2200
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24723
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 194  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10138
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || ||||| ||| | || || |||||| ||||||| ||  | || |||||| ||| |||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    |||  |||||||||| | ||||||    
T  10115 atttctgaatagtattaaagaagc 10138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 96592 - 96438
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  96592 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 96493  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  96492 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagaga 96438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 213  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 266
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85641
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 245  Q
      || |||||||| || || ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | || || |||||||| |||||  |||||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaatt 85620  T
Q  246 cttgaatagtatcagagaagc 266  Q
     || || | ||||| ||||||    
T  85621 ttttaacactatcaaagaagc 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 266
Target Start/End: Original strand, 6790 - 7013
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||     
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatga 6889  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 242  Q
    | || || || ||| | || || ||||||||||| || ||| | || || ||| ||| |||  |||||||| |||| || ||| |||| ||   || |||    
T  6890 tcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtga 6989  T
Q  243 attcttgaatagtatcagagaagc 266  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  6990 attcttgaacagtattaaagaagc 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32560
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 131  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  32473 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38853
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  144 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 177  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 66836 - 66745
Alignment:
Q  19 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 110  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  66836 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 66745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 110
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1800
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 110  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1712 cagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  52 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28367
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 143  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3491
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagattt 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131377
Alignment:
Q  79 ggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatt 178  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  131377 t 131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39828
Alignment:
Q  49 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  149 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 39828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6492
Alignment:
Q  69 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcag 168  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  169 tttagagattt 179  Q
    || ||||||||    
T  6502 ttcagagattt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19033
Alignment:
Q  44 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 110  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 19033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196453
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 119  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 119
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11818
Alignment:
Q  22 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  11664 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 11763  T
Q  122 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 176  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||  | || || |||||||||||    
T  11764 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagaga 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  143 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 218  Q
    | || ||  | ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14050
Alignment:
Q  43 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtag 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 343
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16591
Alignment:
Q  46 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 145  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  146 aggaatttgagttactcgagcagttt 171  Q
    | || ||||||||  | |||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University