View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6855_low_20 (Length: 389)

Name: NF6855_low_20
Description: NF6855
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6855_low_20
NF6855_low_20
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (7-371)||(52009-52373)
scaffold0025 (44-124)||(84538-84619)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (46-380)||(17607641-17607982)
chr1 (225-380)||(17022261-17022415)
chr1 (221-333)||(46144527-46144639)
chr1 (221-333)||(49998645-49998757)
chr1 (247-333)||(52399378-52399464)
chr1 (30-195)||(37235095-37235267)
chr1 (221-333)||(40437599-40437710)
chr1 (221-331)||(33396074-33396185)
chr1 (44-197)||(27673710-27673871)
chr1 (44-124)||(8539088-8539169)
chr1 (44-124)||(8604327-8604408)
chr1 (28-124)||(21194116-21194214)
chr1 (28-137)||(16655451-16655561)
chr1 (221-293)||(20821724-20821797)
chr1 (101-137)||(17022510-17022546)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (44-379)||(34558573-34558923)
chr3 (7-380)||(17203368-17203748)
chr3 (7-380)||(12020653-12021033)
chr3 (221-371)||(21168049-21168200)
chr3 (222-380)||(18968794-18968958)
chr3 (222-333)||(4163513-4163624)
chr3 (221-333)||(43428863-43428975)
chr3 (221-333)||(4147005-4147117)
chr3 (221-333)||(6229961-6230073)
chr3 (100-380)||(15549220-15549508)
chr3 (221-333)||(14817024-14817136)
chr3 (221-333)||(25105287-25105399)
chr3 (221-314)||(17319905-17319998)
chr3 (221-331)||(8603428-8603538)
chr3 (44-197)||(33369989-33370151)
chr3 (221-331)||(17759763-17759873)
chr3 (221-331)||(19061083-19061193)
chr3 (44-131)||(14522425-14522513)
chr3 (96-197)||(12951915-12952023)
chr3 (44-137)||(48420607-48420701)
chr3 (221-313)||(17392099-17392193)
chr3 (221-314)||(5229400-5229493)
chr3 (221-286)||(27050518-27050583)
chr3 (92-197)||(17957519-17957632)
chr3 (222-296)||(38377137-38377212)
chr3 (44-129)||(15516683-15516769)
chr3 (44-137)||(54652844-54652938)
chr3 (69-137)||(47983840-47983909)
chr3 (69-137)||(47993127-47993196)
chr3 (69-137)||(48002414-48002483)
chr3 (69-137)||(48011700-48011769)
chr3 (29-131)||(12489829-12489932)
chr3 (222-294)||(17385633-17385704)
chr3 (222-293)||(41660382-41660453)
chr3 (44-129)||(19945562-19945648)
chr3 (44-137)||(39654842-39654936)
chr3 (219-280)||(10711335-10711396)
chr3 (98-134)||(16819836-16819873)
chr3 (98-137)||(2450519-2450559)
chr3 (98-137)||(7852736-7852776)
chr3 (108-136)||(14079524-14079552)
chr3 (98-137)||(22273970-22274010)
chr3 (98-137)||(33340771-33340811)
chr3 (99-134)||(49231143-49231179)
chr3 (99-134)||(51159670-51159706)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (44-380)||(29800-30151)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-380)||(98297-98648)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (44-380)||(48354045-48354397)
chr7 (29-380)||(9609947-9610314)
chr7 (29-380)||(9837519-9837886)
chr7 (44-380)||(16921060-16921411)
chr7 (7-371)||(16918287-16918659)
chr7 (192-380)||(34242410-34242600)
chr7 (225-371)||(17225247-17225393)
chr7 (221-380)||(14939484-14939642)
chr7 (221-380)||(15367077-15367235)
chr7 (221-371)||(33558409-33558560)
chr7 (221-333)||(4437608-4437720)
chr7 (221-333)||(4445009-4445121)
chr7 (221-380)||(31499910-31500077)
chr7 (44-197)||(9057778-9057938)
chr7 (221-331)||(16382286-16382397)
chr7 (221-331)||(45148318-45148429)
chr7 (221-314)||(21539499-21539592)
chr7 (250-298)||(19066380-19066428)
chr7 (221-314)||(15979400-15979493)
chr7 (221-296)||(8564901-8564977)
chr7 (44-137)||(10861983-10862077)
chr7 (221-293)||(4483498-4483571)
chr7 (221-293)||(21676356-21676429)
chr7 (221-293)||(28719224-28719297)
chr7 (222-293)||(9322388-9322459)
chr7 (96-170)||(13376555-13376636)
chr7 (98-134)||(13912306-13912343)
chr7 (98-197)||(15952289-15952396)
chr7 (98-134)||(32495748-32495785)
chr7 (98-137)||(2027488-2027528)
chr7 (248-280)||(17910752-17910784)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (44-377)||(68199-68547)
scaffold0009 (251-314)||(255777-255840)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (44-380)||(18275521-18275872)
chr4 (221-380)||(38763485-38763645)
chr4 (221-377)||(42707458-42707618)
chr4 (255-380)||(19823802-19823926)
chr4 (222-333)||(12732904-12733015)
chr4 (250-380)||(7187268-7187402)
chr4 (44-197)||(15014406-15014568)
chr4 (254-333)||(10105523-10105602)
chr4 (254-333)||(31114528-31114607)
chr4 (254-380)||(15676248-15676377)
chr4 (51-137)||(12245404-12245490)
chr4 (221-296)||(24237655-24237731)
chr4 (243-298)||(17213192-17213247)
chr4 (224-314)||(54364899-54364990)
chr4 (222-314)||(5372022-5372114)
chr4 (96-197)||(15043803-15043910)
chr4 (96-197)||(15110514-15110621)
chr4 (221-293)||(19558102-19558175)
chr4 (44-197)||(41257489-41257651)
chr4 (44-123)||(43282509-43282589)
chr4 (222-293)||(41257679-41257750)
chr4 (236-294)||(10115706-10115764)
chr4 (98-134)||(14950948-14950985)
chr4 (98-134)||(15288199-15288236)
chr4 (98-134)||(22355755-22355792)
chr4 (98-134)||(26678964-26679001)
chr4 (236-280)||(11923441-11923485)
chr4 (98-137)||(18247114-18247154)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (44-376)||(15932034-15932379)
chr8 (44-380)||(26010148-26010489)
chr8 (221-380)||(29296601-29296764)
chr8 (221-333)||(24266758-24266870)
chr8 (225-380)||(17283962-17284116)
chr8 (222-380)||(38636993-38637150)
chr8 (223-333)||(24553904-24554014)
chr8 (221-333)||(7469005-7469117)
chr8 (221-331)||(17265631-17265742)
chr8 (28-137)||(23836150-23836259)
chr8 (44-197)||(37654772-37654934)
chr8 (250-380)||(23227377-23227511)
chr8 (221-331)||(19332953-19333064)
chr8 (221-314)||(24238293-24238387)
chr8 (221-299)||(25608794-25608873)
chr8 (221-314)||(45560541-45560634)
chr8 (70-197)||(23148767-23148901)
chr8 (222-314)||(33171011-33171102)
chr8 (221-314)||(18042884-18042977)
chr8 (221-293)||(11543283-11543356)
chr8 (221-293)||(22312438-22312511)
chr8 (222-293)||(22498625-22498697)
chr8 (48-133)||(33171230-33171316)
chr8 (98-134)||(16040550-16040587)
chr8 (44-137)||(17284202-17284294)
chr8 (98-134)||(24930304-24930341)
chr8 (98-137)||(6775421-6775461)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-380)||(198493-198846)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (138-380)||(12142-12392)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (221-380)||(1404-1563)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (221-380)||(25649855-25650015)
chr6 (44-369)||(22363337-22363668)
chr6 (70-380)||(21621829-21622146)
chr6 (221-380)||(18630942-18631105)
chr6 (223-333)||(32350834-32350944)
chr6 (222-380)||(25918382-25918539)
chr6 (225-352)||(29604294-29604421)
chr6 (221-331)||(11374179-11374290)
chr6 (221-314)||(31162212-31162305)
chr6 (44-197)||(22847010-22847172)
chr6 (221-308)||(16375143-16375230)
chr6 (221-331)||(29161838-29161949)
chr6 (258-331)||(15006013-15006086)
chr6 (221-297)||(22463438-22463514)
chr6 (44-132)||(18382825-18382913)
chr6 (251-314)||(17857741-17857804)
chr6 (221-331)||(5485659-5485768)
chr6 (221-293)||(21930666-21930739)
chr6 (221-294)||(4173003-4173076)
chr6 (221-293)||(16135053-16135126)
chr6 (242-279)||(23090078-23090115)
chr6 (106-197)||(16888943-16889041)
chr6 (222-314)||(34965660-34965751)
chr6 (222-289)||(19852973-19853040)
chr6 (44-129)||(18582224-18582310)
chr6 (250-292)||(23220471-23220513)
chr6 (221-294)||(4228612-4228685)
chr6 (98-197)||(15736371-15736478)
chr6 (98-134)||(19609312-19609349)
chr6 (98-137)||(13622303-13622343)
chr6 (98-137)||(14627800-14627840)
chr6 (250-314)||(18104827-18104890)
chr6 (98-137)||(25174486-25174526)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (219-380)||(23364-23529)
scaffold0021 (221-380)||(19101-19264)
scaffold0021 (221-380)||(28677-28840)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (221-371)||(5622762-5622913)
chr5 (221-333)||(24082867-24082979)
chr5 (226-380)||(21224040-21224193)
chr5 (221-360)||(26561120-26561260)
chr5 (221-330)||(6455434-6455543)
chr5 (226-333)||(29912810-29912917)
chr5 (221-331)||(14343089-14343199)
chr5 (221-327)||(33627717-33627823)
chr5 (44-197)||(37982305-37982466)
chr5 (222-323)||(21108292-21108394)
chr5 (44-137)||(21615947-21616040)
chr5 (254-380)||(18532161-18532290)
chr5 (254-380)||(22055125-22055254)
chr5 (44-137)||(431370-431463)
chr5 (47-137)||(19861158-19861248)
chr5 (29-137)||(23492980-23493089)
chr5 (221-293)||(11964720-11964793)
chr5 (28-137)||(28901004-28901114)
chr5 (28-137)||(28937399-28937509)
chr5 (96-197)||(3672867-3672975)
chr5 (221-314)||(20455420-20455513)
chr5 (29-136)||(20833110-20833218)
chr5 (98-197)||(25425481-25425588)
chr5 (221-280)||(24851791-24851850)
chr5 (98-134)||(4201275-4201312)
chr5 (98-134)||(7424610-7424647)
chr5 (98-134)||(18779302-18779339)
chr5 (98-134)||(27185024-27185061)
chr5 (98-137)||(11277-11317)
chr5 (98-137)||(21074799-21074839)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (221-380)||(24881305-24881471)
chr2 (236-380)||(40641634-40641777)
chr2 (44-298)||(9782053-9782314)
chr2 (236-333)||(25132939-25133036)
chr2 (228-331)||(6093580-6093684)
chr2 (250-333)||(19665392-19665475)
chr2 (254-380)||(24342740-24342869)
chr2 (47-137)||(66493-66584)
chr2 (44-197)||(19658823-19658983)
chr2 (221-331)||(20272130-20272241)
chr2 (44-137)||(22787163-22787257)
chr2 (44-137)||(24088504-24088598)
chr2 (25-137)||(25600889-25601003)
chr2 (318-380)||(9782346-9782407)
chr2 (221-314)||(45619361-45619454)
chr2 (250-314)||(24562225-24562289)
chr2 (98-197)||(21140735-21140842)
chr2 (221-280)||(39668572-39668630)
chr2 (221-293)||(18534598-18534670)
chr2 (343-380)||(19661036-19661073)
chr2 (107-136)||(19670337-19670366)
chr2 (98-197)||(21275717-21275824)
chr2 (44-137)||(25304489-25304582)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (221-333)||(6491-6603)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (221-333)||(3291-3403)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (225-370)||(5434-5579)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (224-380)||(433-588)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (221-333)||(1338-1450)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (219-314)||(2285-2380)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (254-370)||(50274-50390)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (29-197)||(24722-24900)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (44-197)||(23601-23762)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (221-331)||(11349-11460)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (230-308)||(1132-1210)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (221-331)||(10680-10791)
scaffold0013 (44-137)||(34394-34487)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (251-371)||(105965-106089)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (221-314)||(9534-9628)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (44-197)||(3579-3734)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (222-293)||(34787-34858)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (68-137)||(32513-32583)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (250-331)||(1570-1651)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (221-314)||(12467-12560)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (222-293)||(44935-45007)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (223-314)||(329-420)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (221-296)||(2301-2376)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (222-314)||(130636-130727)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (221-331)||(15215-15325)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (92-197)||(1453-1566)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (48-134)||(6279-6365)
scaffold0175 (343-380)||(6611-6648)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (222-293)||(85189-85260)
scaffold0004 (222-314)||(26307-26398)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (250-296)||(4711-4757)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (98-134)||(2324-2361)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (96-137)||(7518-7559)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (98-134)||(17580-17617)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (98-134)||(897-934)
scaffold0269 (98-134)||(15153-15190)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (98-197)||(90076-90183)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (98-137)||(2768-2808)


Alignment Details
Target: scaffold0025 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52373 - 52009
Alignment:
Q  7 atggacatcatcggaatagttctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgt 106  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52373 atggactttatcggaatagttctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactaaccttacatgattaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgt 52274  T
Q  107 tgatatgatatttatcatgagatgttgtatgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatgcatgttaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  52273 tgatatgatatttatcatgagatgttgtatgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttaatgttgaatacatgttgat 52174  T
Q  207 gaattataatccttgtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgt 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52173 gaattataatccttgtcatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgt 52074  T
Q  307 aattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgct 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52073 aattggaggtttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgct 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 84619 - 84538
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcat 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  84619 tatgatcttttgtgactagccttaaatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattattatatgttggatatgatatttatcat 84538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17607982 - 17607641
Alignment:
Q  46 tgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------a 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  17607982 tgatcattcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtatgagtgaattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctctta 17607883  T
Q  139 cttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatgcatgttaatgaattataatccttgtgatgactcttaagtga 238  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  17607882 cttggaatatgagaaataattgaattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatacatgttgatgaattatgatcattataatgactcttaagtga 17607783  T
Q  239 ataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |    
T  17607782 ataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttgtcg 17607683  T
Q  339 tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17607682 tatgttgcgtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 17607641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 225 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17022415 - 17022261
Alignment:
Q  225 tgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17022415 tgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggagatgtactttt 17022316  T
Q  325 acattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17022315 acattgtgttgttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 17022261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46144639 - 46144527
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  46144639 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 46144540  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  46144539 ttttacattgtgt 46144527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 49998645 - 49998757
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  49998645 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtag 49998744  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    ||||| |||||||    
T  49998745 ttttatattgtgt 49998757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52399464 - 52399378
Alignment:
Q  247 atgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52399464 atgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 52399378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Original strand, 37235095 - 37235267
Alignment:
Q  30 ttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagat 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37235095 ttaagccaattatatatgatctttcatgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttgatatgatatttatcataaaat 37235194  T
Q  130 gttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaa 195  Q
    | ||||||       |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  37235195 gctgtatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaa 37235267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 40437599 - 40437710
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  40437599 gtgatgactcttaattggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 40437698  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
     ||||||||||||    
T  40437699 -tttacattgtgt 40437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33396185 - 33396074
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  33396185 gtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 33396086  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  33396085 cttttacattgt 33396074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27673871 - 27673710
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg----- 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  || || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||         
T  27673871 tatgatctttcgtgactagccttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtcgtatgttctc 27673772  T
Q  138 --acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
      |||| ||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27673771 ttacttggaatatgagaaatgattggagtgatgaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 27673710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 8539088 - 8539169
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8539088 tatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcat 8539169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 8604327 - 8604408
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8604327 tatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcat 8604408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21194214 - 21194116
Alignment:
Q  28 ctttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcat 124  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||  || || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21194214 ctttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagctttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgatatatgttggatatgatatttatcat 21194116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16655561 - 16655451
Alignment:
Q  28 ctttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttga-tatgatatttatcatg 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  16655561 ctttaagccaattatcttatgatctt-cgtgactagccttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcata 16655463  T
Q  126 agatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||    
T  16655462 agatgttgtatg 16655451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20821797 - 20821724
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20821797 gtgatgactctcaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20821724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17022546 - 17022510
Alignment:
Q  101 atatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17022546 atatgttgatatgatatttatcataagatgttatatg 17022510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34558923 - 34558573
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  34558923 tatgatctttcgtgattagccttatatgactaaatgaagatgtgcgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 34558824  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttg-------aatgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | |||| ||||       ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  34558823 tacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgcagttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatctttggtgatgac 34558724  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  34558723 tcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacat 34558624  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtcca 379  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34558623 tgtgttgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtcca 34558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17203748 - 17203368
Alignment:
Q  7 atggacatcatcggaatagttctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgt 106  Q
    |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  |||||| || || || || | ||||    
T  17203748 atggactttatcagaatagttctataagccaatggtatatgatcttttgtgactagcttcatatgactaaatgaagatgtatgaatgaatggtgaaatgt 17203649  T
Q  107 tgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgt-tgaatgc 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||   ||||||     
T  17203648 tgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaca--attggattggtgaaactatatgaagtagttgattaatgaatgt 17203551  T
Q  199 atgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
     |||| ||||||||| ||  ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17203550 gtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 17203451  T
Q  297 tgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17203450 tgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttgaggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 17203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12021033 - 12020653
Alignment:
Q  7 atggacatcatcggaatagttctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgt 106  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  ||| || || || || || | ||||    
T  12021033 atggactttatcggaatagttctttaagccaatggtatatgatcttttgtgactagcttcatatgactaaatgaagatatatgaatgaatggtgaaatgt 12020934  T
Q  107 tgatatgatatttatcatgagatgttgtatga-------cttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttga-tgttgaatgc 198  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||        ||| | |||||||| |  ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||| |  ||||||     
T  12020933 ggatatgatatttatcataagattttgtatgttctcttgcttgggatatgagaca--attggattggtgaaactatatgaagtagttgaataatgaatgt 12020836  T
Q  199 atgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
     |||| ||||||| | ||  ||  | | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12020835 gtgttgatgaattgtgatattttggcggtgtctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagt 12020736  T
Q  297 tgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12020735 tgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 12020653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 21168049 - 21168200
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  21168049 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtac 21168148  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgct 371  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21168149 ttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 21168200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18968958 - 18968794
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttact 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  | ||||    
T  18968958 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaatgtgtact 18968859  T
Q  322 tttacattgtg------tagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||      ||  | || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18968858 tttacattgtgttggtatatgtatatgttgagtagttgcattattgggtctttgcttatgtccat 18968794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Original strand, 4163513 - 4163624
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttact 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  4163513 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgggtggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtact 4163612  T
Q  322 tttacattgtgt 333  Q
    ||||||||||||    
T  4163613 tttacattgtgt 4163624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 43428863 - 43428975
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  43428863 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtac 43428962  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  43428963 ttttacattgtgt 43428975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 4147005 - 4147117
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |    
T  4147005 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgttc 4147104  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  4147105 ttttacattgtgt 4147117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 6229961 - 6230073
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  6229961 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtgtac 6230060  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    ||||| |||||||    
T  6230061 ttttatattgtgt 6230073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15549508 - 15549220
Alignment:
Q  100 tatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgt 191  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||       |||| |||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |      
T  15549508 tatatgttggatatgatattttccatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaca--attggattggtgaaactacatgatgtagttgttaa 15549411  T
Q  192 -tgaatgcatgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgtt 288  Q
     |||||| ||||| ||||||| | ||  ||  ||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15549410 atgaatgtatgttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgtt 15549311  T
Q  289 gttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15549310 gttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaatttgtagagttgcattatttgctctttgct-atgtccat 15549220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 14817024 - 14817136
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  14817024 gtgatgactcttaaatgaataatgacatgttgatcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatataattggaggtgtac 14817123  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  14817124 ttttacattgtgt 14817136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 25105287 - 25105399
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||| | |||    
T  25105287 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggtgtac 25105386  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  25105387 ttttacattgtgt 25105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 17319905 - 17319998
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17319905 gtgatgactcttaattgaataatgacattttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggag 17319998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8603538 - 8603428
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||| | |||    
T  8603538 gtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgtac 8603439  T
Q  321 ttttacattgt 331  Q
    |||||||||||    
T  8603438 ttttacattgt 8603428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 33369989 - 33370151
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgta------- 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||           
T  33369989 tatgatctttagtgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatggattgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 33370088  T
Q  136 -tgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
     | |||| |||||||||||||| ||  | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33370089 tttacttggaatatgagaaatatttgaagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 33370151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 17759763 - 17759873
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  17759763 gtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 17759861  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  17759862 cttttacattgt 17759873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 19061083 - 19061193
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  19061083 gtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 19061181  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  19061182 cttttacattgt 19061193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 14522425 - 14522513
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgt 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14522425 tatgatctttcgtgactaaccttgtatgactaaattgtgatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcatgagatgt 14522513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12952023 - 12951915
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttga 188  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  12952023 ttgttatatggagatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttga 12951924  T
Q  189 tgttgaatg 197  Q
    |||||||||    
T  12951923 tgttgaatg 12951915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 48420701 - 48420607
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||  | ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48420701 tatgatctttcgtgactagccttgaatgactaaatggagatgtgtgaacgaatttttatgtgttggatatgatatttatcataagatgttgtatg 48420607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17392193 - 17392099
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatg--cttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgga 313  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| | ||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17392193 gtgatgactcttatttgaattgtgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatgga 17392099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 5229400 - 5229493
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  5229400 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 5229493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27050583 - 27050518
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattg 286  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27050583 gtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattg 27050518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Original strand, 17957519 - 17957632
Alignment:
Q  92 tggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgta 183  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| ||||| ||    
T  17957519 tggatggttatatgttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatata 17957618  T
Q  184 tttgatgttgaatg 197  Q
     |||||||||||||    
T  17957619 gttgatgttgaatg 17957632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 296
Target Start/End: Original strand, 38377137 - 38377212
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  38377137 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgtcgaagt 38377212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15516769 - 15516683
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagat 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||  || || || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  15516769 tatgatctttagtgactagccttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagat 15516683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Original strand, 54652844 - 54652938
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54652844 tatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttgtatatgatatttgtcatgggatgttgtatg 54652938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 47983909 - 47983840
Alignment:
Q  69 atgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47983909 atgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 47983840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 47993196 - 47993127
Alignment:
Q  69 atgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47993196 atgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 47993127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 48002483 - 48002414
Alignment:
Q  69 atgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48002483 atgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 48002414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 48011769 - 48011700
Alignment:
Q  69 atgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48011769 atgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 48011700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Original strand, 12489829 - 12489932
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatga 126  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||| | | |||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  12489829 tttaagccaattgtcttatgatctttcgtgactaacct-atatgactaagtagagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataa 12489927  T
Q  127 gatgt 131  Q
    |||||    
T  12489928 gatgt 12489932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17385704 - 17385633
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaa 294  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  17385704 tgatgactcttat-tgaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttggtgaa 17385633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41660453 - 41660382
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41660453 tgatgactcttaatagaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19945648 - 19945562
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagat 129  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||  || || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19945648 tatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagat 19945562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39654936 - 39654842
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||  |||||  || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39654936 tatgatctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatg 39654842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 280
Target Start/End: Original strand, 10711335 - 10711396
Alignment:
Q  219 ttgtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatg 280  Q
    ||||||||||||||  ||  || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10711335 ttgtgatgactcttttgtcgattatgacttgttgattgtgtggatctaaatacttgataatg 10711396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16819873 - 16819836
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16819873 gttatatgttggatatgatatttatcatgagatgttgt 16819836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 2450519 - 2450559
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2450519 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 2450559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7852776 - 7852736
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7852776 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 7852736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14079552 - 14079524
Alignment:
Q  108 gatatgatatttatcatgagatgttgtat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079552 gatatgatatttatcatgagatgttgtat 14079524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22274010 - 22273970
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22274010 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 22273970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33340811 - 33340771
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33340811 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 33340771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 49231179 - 49231143
Alignment:
Q  99 ttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49231179 ttatatgttggatatgatatttatcatgagatgttgt 49231143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Original strand, 51159670 - 51159706
Alignment:
Q  99 ttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51159670 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 51159706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30151 - 29800
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  30151 tatgatctttcgtgactaaccttatatgactaaatgaagatgtatgagtgaattgttatagcttgatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctct 30052  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||  ||||       || |||||| ||||||||| | | ||| |||||||    
T  30051 tacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgacctttggtgatgac 29952  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29951 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat 29852  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29851 tgtgttgttgtatgttgagtatttgcattatttggtctttgcttatgtccat 29800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Original strand, 98297 - 98648
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  98297 tatgatcttttgtgactagccttatatgattaaatgtagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 98396  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || | |||| ||||||||| ||| ||| ||| |||    
T  98397 tacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatctttggtgacgac 98496  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  98497 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacat 98596  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  98597 tgtgttgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 98648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48354397 - 48354045
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||          
T  48354397 tatgatctttcgtgactaggcttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgataattatcataagatgttgtatgttctct 48354298  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  48354297 tacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgac 48354198  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48354197 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat 48354098  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48354097 tgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccat 48354045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9610314 - 9609947
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgag 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9610314 tttaagccaattgtcttatgatctttcttgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcatatg 9610215  T
Q  128 atgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattat 213  Q
    ||||||||||       |||| |||| ||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || |||||| |||||||||    
T  9610214 atgttgtatgttctcttacttggaatgtgagaaatatttggactggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattat 9610115  T
Q  214 aatccttg-tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgg 312  Q
     ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9610114 gatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattga 9610015  T
Q  313 agttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9610014 aggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 9609947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9837886 - 9837519
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgag 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9837886 tttaagccaattgtcttatgatctttcttgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcatatg 9837787  T
Q  128 atgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattat 213  Q
    ||||||||||       |||| |||| ||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || |||||| |||||||||    
T  9837786 atgttgtatgttctcttacttggaatgtgagaaatatttggactggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattat 9837687  T
Q  214 aatccttg-tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgg 312  Q
     ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9837686 gatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgt 9837587  T
Q  313 agttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9837586 atgtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 9837519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Original strand, 16921060 - 16921411
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||          
T  16921060 tatgatctttcgtgactggccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttctatgttgatatgatatttatcttaagatgttgtatgttctct 16921159  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     ||||  |||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||  ||| |||||||    
T  16921160 tactttaaatatgagaagtatttagagtggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgac 16921259  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16921260 tcttaattgaataatgacatgttgatagtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat 16921359  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16921360 tgtgttgttgtatgttgagtaattgcattatttggtctttgcttatgtccat 16921411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16918659 - 16918287
Alignment:
Q  7 atggacatcatcggaatagttctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgt 106  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||  |||||| || || || || | ||||    
T  16918659 atggactttatcggaatagttctttaagccaatggtatatgatctattgtgactagcttcatatgactaaatgaagatgtatgaatgaatggtgaaatgt 16918560  T
Q  107 tgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgt-tgaatgc 198  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||       |||| | |||||||| |  ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||   ||||||     
T  16918559 tgatatgatatttatcatcatatgttgtatgttctcttacttggcatatgagaca--attggattggtgaaactatatgaagtagttgattaatgaatgt 16918462  T
Q  199 atgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
     |||| ||||||| | ||  ||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16918461 gtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagt 16918362  T
Q  297 tgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgct 371  Q
    ||   ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  16918361 tgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacattgtgttgttgtaagttgtggagttgcattatttggtgtttgct 16918287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 380
Target Start/End: Original strand, 34242410 - 34242600
Alignment:
Q  192 tgaatgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgt 290  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34242410 tgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttatttgaataatgacatgttaattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 34242509  T
Q  291 tgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  34242510 tgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgtttatgtccat 34242600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Original strand, 17225247 - 17225393
Alignment:
Q  225 tgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17225247 tgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtactttt 17225346  T
Q  325 acattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgct 371  Q
    ||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17225347 acattgtgttgttgtaagttgtagagttgcattatttggtctttgct 17225393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14939642 - 14939484
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14939642 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtac 14939543  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  14939542 ttttacattgtat-gtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgcccat 14939484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15367235 - 15367077
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15367235 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtac 15367136  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  15367135 ttttacattgtat-gtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgaccat 15367077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33558560 - 33558409
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  33558560 gtgatgactcttaattgaataacgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtac 33558461  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgct 371  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  33558460 ttttacattgtgttcgtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 33558409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4437720 - 4437608
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  4437720 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtac 4437621  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  4437620 ttttacattgtgt 4437608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4445121 - 4445009
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  4445121 gtgatgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtac 4445022  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  4445021 ttttacattgtgt 4445009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31500077 - 31499910
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  31500077 gtgatgactcttaattgaatattgacatgttgattgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 31499978  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg-------tacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| | ||       || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31499977 ttttacattgtgttggtgtattgtatatgttgagtagtttgcattatttagtctttgcttatgtccat 31499910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 9057778 - 9057938
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||          
T  9057778 tatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaaaatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatacttatcataagatgttgtatgttctct 9057877  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9057878 tacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 9057938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16382397 - 16382286
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  16382397 gtgatgactcttaattgaattatgacttaattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 16382298  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  16382297 cttttacattgt 16382286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45148429 - 45148318
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||| ||||| | ||    
T  45148429 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtgta 45148330  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  45148329 cttttacattgt 45148318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 21539499 - 21539592
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21539499 gtgatgactcttatttaaattgtgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaaatggag 21539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19066428 - 19066380
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19066428 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttg 19066380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 15979400 - 15979493
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||| ||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15979400 gtgatgactcttacttaaatcgtgacttgttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggag 15979493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 8564901 - 8564977
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8564901 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 8564977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Original strand, 10861983 - 10862077
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||  || || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10861983 tatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 10862077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4483571 - 4483498
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4483571 gtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Original strand, 21676356 - 21676429
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21676356 gtgatgactctaaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 21676429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28719297 - 28719224
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  28719297 gtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttga 28719224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 9322388 - 9322459
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9322388 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 9322459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13376636 - 13376555
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaa 170  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||       |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  13376636 ttgttatatggagatatgatatttatcatgtgatgttgtatgttcccttacttggaatatgagaaataattggagtggtgaa 13376555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 13912306 - 13912343
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13912306 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 13912343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 15952289 - 15952396
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  15952289 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 15952388  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  15952389 gttgaatg 15952396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 32495748 - 32495785
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32495748 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 32495785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2027528 - 2027488
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2027528 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 2027488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17910784 - 17910752
Alignment:
Q  248 tgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatg 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17910784 tgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatg 17910752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 68547 - 68199
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  68547 tatgatatttcgtgactagccttgtatgactaaatgaaggtgtgtgaatggattgttacatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 68448  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     ||||  ||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||| |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  68447 tacttgaaatatgagaaatgtttggagtggtgaaactacatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgac 68348  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  68347 tcttaattgattaatgacatgttgattgtgtggacgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacat 68248  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtc 377  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68247 tgtgttgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtc 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Original strand, 255777 - 255840
Alignment:
Q  251 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  255777 tgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttcttcaatgtagttggag 255840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18275872 - 18275521
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  18275872 tatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagaggtgtgaatgaattgttatacgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 18275773  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||  |||| || |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  18275772 tacttagaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatgtgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgac 18275673  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18275672 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacat 18275573  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||| | || ||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18275572 tgtattgtcgtatgttgagtaggtacattatttggtcttttcttatgtccat 18275521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38763645 - 38763485
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38763645 gtgatgactcttaattgaataatggcatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtac 38763546  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38763545 ttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccat 38763485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42707618 - 42707458
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||    
T  42707618 gtgatgactcttgattgaataatgacatgctgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtac 42707519  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtc 377  Q
    ||||||||||||| | ||    || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  42707518 ttttacattgtgttggtgtatataagttgagtagttgcattattcggtatttgcttatgtc 42707458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19823926
Alignment:
Q  255 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgc 354  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttgtagagttgc 19823901  T
Q  355 attatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19823902 attatttggtctttgct-atgtccat 19823926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12733015 - 12732904
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttact 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  12733015 tgatgactcttaattgaataatgacatgacgattgtgtggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtact 12732916  T
Q  322 tttacattgtgt 333  Q
    ||||||||||||    
T  12732915 tttacattgtgt 12732904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 7187268 - 7187402
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag--ttgtacg--ttg 345  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |   |||| |  |||    
T  7187268 ttgactgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 7187367  T
Q  346 agtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  7187368 agtagttgcattattcgttctttgcttatgtccat 7187402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 15014406 - 15014568
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgta------- 135  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||           
T  15014406 tatggtctttcttgactagccttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttctc 15014505  T
Q  136 -tgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
     | |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  15014506 tttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 15014568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 333
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105602
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt 333  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 10105602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114528
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt 333  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 31114528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676377
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag----ttgtacgttgagta 349  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |     |||| ||||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgtaagttgagta 15676347  T
Q  350 gttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15676348 tttgcattgttgggtctttgct-atgtccat 15676377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 137
Target Start/End: Original strand, 12245404 - 12245490
Alignment:
Q  51 tttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12245404 tttcgtgactagccttatatgactaaatgaagaagtgggaatgacttgttgtatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatg 12245490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24237731 - 24237655
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24237731 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 24237655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Original strand, 17213192 - 17213247
Alignment:
Q  243 tgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  17213192 tgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttg 17213247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 314
Target Start/End: Original strand, 54364899 - 54364990
Alignment:
Q  224 atgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  54364899 atgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggag 54364990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Original strand, 5372022 - 5372114
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  5372022 tgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 5372114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15043910 - 15043803
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttga 188  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||       |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15043910 ttgttatatggagatatgatatttatcataagatgtt-tatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttga 15043812  T
Q  189 tgttgaatg 197  Q
    |||||||||    
T  15043811 tgttgaatg 15043803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Original strand, 15110514 - 15110621
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttga 188  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||       |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15110514 ttgttatatggagatatgatatttatcataagatgtt-tatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttga 15110612  T
Q  189 tgttgaatg 197  Q
    |||||||||    
T  15110613 tgttgaatg 15110621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19558175 - 19558102
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19558175 gtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 19558102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 41257489 - 41257651
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatga---- 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| | ||          
T  41257489 tatgatctttcgtgactagccttatacaactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgataattatcataaggtgtggcattttccc 41257588  T
Q  139 ----cttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
        ||| |||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41257589 tttgcttggaatatgaaaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtatttgatgttgaatg 41257651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 43282509 - 43282589
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatca 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||  || || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  43282509 tatgatctttcgtgacttgccttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgttttggatatgatatttatca 43282589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 41257679 - 41257750
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  41257679 tgatgactcttatttgaattatgacttgattgttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 41257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 294
Target Start/End: Original strand, 10115706 - 10115764
Alignment:
Q  236 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaa 294  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||    
T  10115706 tgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaa 10115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14950985 - 14950948
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14950985 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 14950948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 15288199 - 15288236
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15288199 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 15288236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 22355755 - 22355792
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22355755 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 22355792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26679001 - 26678964
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26679001 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 26678964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 11923441 - 11923485
Alignment:
Q  236 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatg 280  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11923441 tgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaagtacttgataatg 11923485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18247154 - 18247114
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18247154 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 18247114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15932379 - 15932034
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  15932379 tatgatatttcgtgactagccttatatgactaaacgaagatgtgtgaatgaattgttatatattgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 15932280  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgt-----tgaatgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgactc 230  Q
     |||| | |||||||||||| || || ||||||| |||  |||||||  ||| ||     ||||||||| || ||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  15932279 tacttggcatatgagaaatatttggagtggtgaaactatgtgatgtagatgaagtattaatgaatgcatattgatgaattgtgatctttggtgatgactc 15932180  T
Q  231 ttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattg 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15932179 ttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaaatgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattg 15932080  T
Q  331 tgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgt 376  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15932079 tattgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgt 15932034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26010489 - 26010148
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||          
T  26010489 tatgatctttcgttactagccttatatgactaattggagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgat-tttatcataagatgttgtatgttctct 26010391  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgtt-------gaatgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgac 228  Q
     |||  ||||||||||| || || || || |||| |||  ||||||| |||| |||       |||| || ||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  26010390 tactgggaatatgagaa-tatttggagtgatgaaactatgtgatgtagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatctttggtgatgac 26010292  T
Q  229 tcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacat 328  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  26010291 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgt--------gataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacat 26010200  T
Q  329 tgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26010199 tgtattgttgtatgttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 26010148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29296764 - 29296601
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | |||    
T  29296764 gtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtac 29296665  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| | ||    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29296664 ttttacattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 29296601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24266870 - 24266758
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||    
T  24266870 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 24266771  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  24266770 ttttacattgtgt 24266758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17284116 - 17283962
Alignment:
Q  225 tgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttt 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  17284116 tgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtactttt 17284017  T
Q  325 acattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17284016 acattatgttgttgtgagttgtggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 17283962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Original strand, 38636993 - 38637150
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttact 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  38636993 tgatgactcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtact 38637092  T
Q  322 tttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  38637093 tttacattgtat-gtt-tatgttgagtagtttgcattatggagtctttgcttatgtccat 38637150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 333
Target Start/End: Original strand, 24553904 - 24554014
Alignment:
Q  223 gatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactt 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  24553904 gatgactcttaattgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactt 24554003  T
Q  323 ttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||    
T  24554004 ttacattgtgt 24554014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7469117 - 7469005
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||    
T  7469117 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgtac 7469018  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  7469017 ttttacattgtgt 7469005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17265742 - 17265631
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  17265742 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 17265643  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  17265642 cttttacattgt 17265631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23836259 - 23836150
Alignment:
Q  28 ctttaagccaattgtatatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgag 127  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23836259 ctttaagtcaattatatatgatctttcgtgactagccgtatatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttatatgttgatatgatatttatcataag 23836160  T
Q  128 atgttgtatg 137  Q
    ||||| ||||    
T  23836159 atgttatatg 23836150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 37654772 - 37654934
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgta------- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||           
T  37654772 tatgatctttcgtgactagccttatatgactaaatgatgacgtgtgaatggattgttctatgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 37654871  T
Q  136 -tgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
     | |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37654872 tttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 37654934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 380
Target Start/End: Original strand, 23227377 - 23227511
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag--ttgtacg--ttg 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |   |||| |  |||    
T  23227377 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 23227476  T
Q  346 agtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  23227477 agtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 23227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 19332953 - 19333064
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||| | ||||| || || || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  19332953 gtgatgactctttattgaattataacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 19333052  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  19333053 cttttacattgt 19333064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24238387 - 24238293
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  24238387 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatataaatggag 24238293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25608873 - 25608794
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttga 299  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25608873 gtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25608794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 45560541 - 45560634
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  45560541 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 45560634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23148901 - 23148767
Alignment:
Q  70 tgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgta-------tgacttcgaatatgagaaataattag 161  Q
    |||||||||| ||||||  || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||       | |||| |||||||||||||| ||      
T  23148901 tgactaaatgatgatgtgtga-tgaattgttagatgttgtatatgatatttatcatgagatgttgtattttctcttacttggaatatgagaaatatttga 23148803  T
Q  162 attggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23148802 aatggtgaaactatatgatgtatttgacgttgaatg 23148767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33171102 - 33171011
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  33171102 tgatgactcttaattgaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 33171011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 18042884 - 18042977
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  18042884 gtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 18042977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11543356 - 11543283
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  11543356 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttga 11543283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22312511 - 22312438
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| | | | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22312511 gtgatgactcttaatttatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 22312438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 22498625 - 22498697
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  22498625 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttga 22498697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33171316 - 33171230
Alignment:
Q  48 atctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttg 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  || || |||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  33171316 atctttcgtgactagccttgcatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttg 33171230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 16040550 - 16040587
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16040550 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 16040587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17284294 - 17284202
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |  ||||||||||  |||||| || || ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17284294 tatgaccttttgtgactagcttcatttgactaaatgaagatgtatgaatgaattgtgacatgttgatatgata-tgatcatgagatgttgtatg 17284202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 24930304 - 24930341
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24930304 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 24930341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 6775421 - 6775461
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6775421 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 6775461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Original strand, 198493 - 198846
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgag--tggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg---- 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||  | |  || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||        
T  198493 tatgatctttcgtaactagccttatatgactagatgaagatgtgtgtgaatgaattgttgtatgttgatatgatatttatcataaaatgttgtatgttct 198592  T
Q  138 ---acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatccttg-tgatg 226  Q
       |||| |||||||||||||| || || ||||||| |||   |||||| |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||    
T  198593 cttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatgcgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatg 198692  T
Q  227 actcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttac 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  198693 actcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttac 198792  T
Q  327 attgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  198793 attgtattgttgaatgttgagtagttgcattatttggtatttgcttatgtccat 198846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12392 - 12142
Alignment:
Q  138 acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttga-------atgcatgttaatgaattataatcctt-gtgatgact 229  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||| |||||       || |||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  12392 acttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttagtgatgact 12293  T
Q  230 cttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacatt 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  12292 cttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacatt 12193  T
Q  330 gtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12192 gtgttgttatatgttgagtagttgtattatttggtctttgcttatgtccat 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Original strand, 1404 - 1563
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1404 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcatgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtac 1503  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  1504 ttttacattgtgttgttgtatgttaagtagttgcattatttggtctatacttatgtccat 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25650015 - 25649855
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||     
T  25650015 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattcgaggtgtaa 25649916  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  25649915 ttttacattgtgttcttgtatgttgagtagtttgcattattgggtcgttgcttatgtccat 25649855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 369
Target Start/End: Original strand, 22363337 - 22363668
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||          
T  22363337 tatgatcttttgtgactagcttcatatgactaaatgaagatgtatgaatgaattgtgatatgttgatatgatacttatcataagatgttgtatgttctct 22363436  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatgcatgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaa 234  Q
     |||| |||||||||| |  || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||||| | ||  ||  ||| ||||||||||    
T  22363437 tacttggaatatgagaca--atcagattggtgaaactatatgaagtagttgat-tagaatgagtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaa 22363533  T
Q  235 gtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgta 334  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| |     
T  22363534 ttgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtatt 22363633  T
Q  335 gttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttg 369  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22363634 gttgtaagttgtggagttgcattatttgatctttg 22363668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21622146 - 21621829
Alignment:
Q  70 tgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattaga 162  Q
    ||||| |||| | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||| || ||||||| |  ||||||    
T  21622146 tgactcaatgataatgtatgaatgaattgtgatatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggattatgagaca--attaga 21622049  T
Q  163 ttggtgaagctacatgatgtatttgatgt-tgaatgcatgttaatgaattataatcctt--gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgt 259  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   ||||||  |||| ||||| | | ||  ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21622048 ttggtgaaactacatgaagtagttaattaatgaatgtgtgttgatgaactgtgatagtttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgt 21621949  T
Q  260 ggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattat 359  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||||||    
T  21621948 ggatgtgaatgctcgatagtgcaattgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacattgtgttgttgtaaattgtagagttgcattat 21621849  T
Q  360 ttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21621848 ttggtctttgct-atgtccat 21621829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Original strand, 18630942 - 18631105
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||    
T  18630942 gtgatgattcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtac 18631041  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| | ||    |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18631042 ttttacattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 18631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32350944 - 32350834
Alignment:
Q  223 gatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactt 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  32350944 gatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactt 32350845  T
Q  323 ttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||    
T  32350844 ttacattgtgt 32350834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25918539 - 25918382
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttact 321  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  25918539 tgataactcttaattgtataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctact 25918440  T
Q  322 tttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  25918439 tttacattgtgttgttgtaagttgtagagttgcattatctaatctttgct-atgtccat 25918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29604421 - 29604294
Alignment:
Q  225 tgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttt 324  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||    
T  29604421 tgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtactttt 29604322  T
Q  325 acattgtgtagttgtacgttgagtagtt 352  Q
    ||||||||| | | || |||||||||||    
T  29604321 acattgtgttggtatatgttgagtagtt 29604294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 11374179 - 11374290
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  11374179 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgta 11374278  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  11374279 cttttacattgt 11374290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162305
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31162212 gtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggag 31162305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22847172 - 22847010
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgta------- 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||           
T  22847172 tatgatctttcgtgactaaacttatatgactaaatgaagatgtttgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttctc 22847073  T
Q  136 -tgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
     | |||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22847072 tttactttgaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 22847010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16375230 - 16375143
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaa 308  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16375230 gtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaa 16375143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 29161838 - 29161949
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||    
T  29161838 gtgatgactcttaatttaattatgactttattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtgta 29161937  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  29161938 cttttacattgt 29161949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 331
Target Start/End: Original strand, 15006013 - 15006086
Alignment:
Q  258 gtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgt 331  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15006013 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 15006086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 22463438 - 22463514
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagtt 297  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22463438 gtgatgactcttatttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Original strand, 18382825 - 18382913
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||  || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18382825 tatgacctttcgtgactagccgtatatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttgatatgatatttatcataagatgtt 18382913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Original strand, 17857741 - 17857804
Alignment:
Q  251 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17857741 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggag 17857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 5485659 - 5485768
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||  | | |||||||| ||||  | |||    
T  5485659 gtgatgtctcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggatgtgtac 5485757  T
Q  321 ttttacattgt 331  Q
    |||||||||||    
T  5485758 ttttacattgt 5485768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21930739 - 21930666
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21930739 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttga 21930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 4173003 - 4173076
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaa 294  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  4173003 gtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa 4173076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16135126 - 16135053
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  16135126 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttga 16135053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 279
Target Start/End: Original strand, 23090078 - 23090115
Alignment:
Q  242 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23090078 atgacttgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 23090115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 16888943 - 16889041
Alignment:
Q  106 ttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  16888943 ttgatatgataattatcatgagatgttgtattttctcttacttgaaatatgagaaataattgaattggtgaaactatatgatgtagttaatgttgaatg 16889041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34965751 - 34965660
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  34965751 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 34965660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19853040 - 19852973
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttg 289  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  19853040 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18582310 - 18582224
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagat 129  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||  || || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18582310 tatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagat 18582224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23220513 - 23220471
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttg 292  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23220513 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttg 23220471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 4228612 - 4228685
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaa 294  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  4228612 gtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtacgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa 4228685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 15736371 - 15736478
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  15736371 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttttgaatggtgaaactatatgatatagttgat 15736470  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  15736471 gttgaatg 15736478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19609349 - 19609312
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19609349 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 19609312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 13622303 - 13622343
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13622303 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 13622343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 14627800 - 14627840
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14627800 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 14627840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Original strand, 18104827 - 18104890
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||| |||| |||||||||    
T  18104827 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttg-aggtgatcaatataattggag 18104890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25174526 - 25174486
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25174526 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 25174486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 380
Target Start/End: Original strand, 23364 - 23529
Alignment:
Q  219 ttgtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttt 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |    
T  23364 ttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgt 23463  T
Q  319 acttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||| ||||||| | ||    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23464 acttttagattgtgttgctgtgtataagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Original strand, 19101 - 19264
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||    
T  19101 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggatgtgtac 19200  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| | ||    || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  19201 ttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 19264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Original strand, 28677 - 28840
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | |||    
T  28677 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggatgtgtac 28776  T
Q  321 ttttacattgtgtagttg----tacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||||||||||| | ||    || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  28777 ttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 28840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 5622762 - 5622913
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  5622762 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggagatgtac 5622861  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgct 371  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5622862 ttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 5622913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24082979 - 24082867
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  24082979 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 24082880  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  24082879 ttttacattgtgt 24082867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 226 - 380
Target Start/End: Original strand, 21224040 - 21224193
Alignment:
Q  226 gactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttta 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||    
T  21224040 gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtactttta 21224139  T
Q  326 cattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21224140 cattgtgttgttgtaagttatggagttgcgttatttggtttttgct-atgtccat 21224193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 360
Target Start/End: Original strand, 26561120 - 26561260
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  26561120 gtgatgactcttaattgaataacgacatgttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtac 26561219  T
Q  321 ttttacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatt 360  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  26561220 ttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattatt 26561260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6455543 - 6455434
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  6455543 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtac 6455444  T
Q  321 ttttacattg 330  Q
    | ||||||||    
T  6455443 tcttacattg 6455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29912917 - 29912810
Alignment:
Q  226 gactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttta 325  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  29912917 gactcttaatggaatgatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggtgtactttta 29912818  T
Q  326 cattgtgt 333  Q
    ||||||||    
T  29912817 cattgtgt 29912810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 14343089 - 14343199
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||    
T  14343089 gtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgtac 14343188  T
Q  321 ttttacattgt 331  Q
    |||||||||||    
T  14343189 ttttacattgt 14343199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 327
Target Start/End: Original strand, 33627717 - 33627823
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  33627717 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgactgtgtggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 33627816  T
Q  321 ttttaca 327  Q
    |||||||    
T  33627817 ttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37982466 - 37982305
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg----- 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||  || || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||         
T  37982466 tatgacctttcgtgactagccttatatgactaaaggaagaggtgtgaatgaattgttatatgtaggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctc 37982367  T
Q  138 --acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
      |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37982366 ttacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 37982305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21108394 - 21108292
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21108394 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 21108295  T
Q  321 ttt 323  Q
    |||    
T  21108294 ttt 21108292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21616040 - 21615947
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21616040 tatgatctttcgtgactagccttatatgaataaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatg 21615947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532290
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag----ttgtacgttgagta 349  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     |||| ||||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 18532260  T
Q  350 gttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  18532261 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 18532290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055254
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag----ttgtacgttgagta 349  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     |||| ||||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatgtaagttgagta 22055224  T
Q  350 gttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22055225 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 22055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 431463 - 431370
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| | | |||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  431463 tatgatctttcgtgactagcct-atatgactaagtagagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcattagatgttgtatg 431370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19861248 - 19861158
Alignment:
Q  47 gatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||   || ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19861248 gatctttcgtgactagccttatatgactaaatgaagatgcgtgaatgacttgttgtagattgatatgatatttatcataagatgttgtatg 19861158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23493089 - 23492980
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatga 126  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| | | |||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  23493089 tttaagccaattgtcttatgatcattcgtgactagcct-atatgactaagtagagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataa 23492991  T
Q  127 gatgttgtatg 137  Q
    |||||||||||    
T  23492990 gatgttgtatg 23492980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11964793 - 11964720
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11964793 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 11964720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28901114 - 28901004
Alignment:
Q  28 ctttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttga-tatgatatttatcatg 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  28901114 ctttaagccaattatcttatgatctt-cgtgactagccttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcata 28901016  T
Q  126 agatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||    
T  28901015 agatgttgtatg 28901004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28937509 - 28937399
Alignment:
Q  28 ctttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttga-tatgatatttatcatg 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  28937509 ctttaagccaattatcttatgatctt-cgtgactagccttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcata 28937411  T
Q  126 agatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||    
T  28937410 agatgttgtatg 28937399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3672975 - 3672867
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttga 188  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||       || | |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  3672975 ttgttatatggagatatgatatttatcataagatgttgtatgctctcttacctggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatttagttga 3672876  T
Q  189 tgttgaatg 197  Q
    |||||||||    
T  3672875 tgttgaatg 3672867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 20455420 - 20455513
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  20455420 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 20455513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 136
Target Start/End: Original strand, 20833110 - 20833218
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatga 126  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  || |||||||  |||||  || || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  20833110 tttaagccaattgtcttatgatcattcgtgactagccttatgtgtctaaatgaagatgtgtga-tgaattgttaaatgttggatatgatatttatcataa 20833208  T
Q  127 gatgttgtat 136  Q
    |||| |||||    
T  20833209 gatgatgtat 20833218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25425588 - 25425481
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  25425588 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 25425489  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  25425488 gttgaatg 25425481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 280
Target Start/End: Original strand, 24851791 - 24851850
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatg 280  Q
    ||||||||||||  ||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24851791 gtgatgactcttttgttgattatgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatg 24851850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 4201275 - 4201312
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4201275 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 4201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7424647 - 7424610
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7424647 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 7424610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 18779302 - 18779339
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18779302 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 18779339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 27185024 - 27185061
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27185024 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 27185061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11317 - 11277
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11317 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 11277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 21074799 - 21074839
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21074799 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 21074839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24881471 - 24881305
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  24881471 gtgatgactcttgaatgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 24881372  T
Q  321 ttttacattgtgt------agttgtacgttgagtagtt-gcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||      |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24881371 ttttacattgtgttggtgcatgtgtatgttgagtagttggcattattgggtctttgcttatgtccat 24881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 380
Target Start/End: Original strand, 40641634 - 40641777
Alignment:
Q  236 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| | ||| |    
T  40641634 tgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactttgttg 40641733  T
Q  336 ttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40641734 ttgtaagttgtggagttgcatcatttggtctttgct-atgtccat 40641777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Original strand, 9782053 - 9782314
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg------ 137  Q
    |||||||||| ||  ||||| | | |||||||||||  |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  9782053 tatgatcttttgtagctagcttcatatgactaaatgaagatgtatgaatgaattgtgatatgttgatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct 9782152  T
Q  138 -acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgt-tgaatgcatgttaatgaattataatccttg-tgatgactcttaa 234  Q
     |||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||   ||||||  |||| ||||||| | ||  ||| || |||||||| |    
T  9782153 tacttggaatatgagaca--attggattggtgaaactatatgaagtagttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataattggtggtgactcttca 9782250  T
Q  235 gtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttg 298  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9782251 atgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttg 9782314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25133036 - 25132939
Alignment:
Q  236 tgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25133036 tgaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgt 25132939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6093684 - 6093580
Alignment:
Q  228 ctcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttac 326  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  6093684 ctcttaattgaattatgacttgattgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttac 6093585  T
Q  327 attgt 331  Q
    |||||    
T  6093584 attgt 6093580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19665475 - 19665392
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  19665475 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgt 19665392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 380
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342869
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtag----ttgtacgttgagta 349  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |     |||| ||||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 24342839  T
Q  350 gttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  24342840 attgcattgttaggtctttgct-atgtccat 24342869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 66584 - 66493
Alignment:
Q  47 gatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66584 gatctttcgtgactagccttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttgtatatgatatttatcataagatgttgtatg 66493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19658983 - 19658823
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg----- 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||   |||||  || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  19658983 tatgatccttcgtgactagccttatgtgtctaaataaagatgtgtga-tgaattgttaaatgttggatatgatatttatcatgagatgttgtattttctt 19658885  T
Q  138 --acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
      |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19658884 ttacttggaatatgagaaatatttgaattggtgaaactatatgatgtatttgatgttgaatg 19658823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20272241 - 20272130
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||| |||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || | ||    
T  20272241 gtgatgactcttatttgaattatgacttgattgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtgta 20272142  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  20272141 cttttacattgt 20272130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Original strand, 22787163 - 22787257
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  |||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22787163 tatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatg 22787257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Original strand, 24088504 - 24088598
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||  || || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24088504 tatgatctttagtgactagccttgtatgactaaatggagatgtgagaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtggtatg 24088598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25601003 - 25600889
Alignment:
Q  25 gttctttaagccaattgtat-atgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatg-ttgatatgatatttatc 122  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||  || || |||||||| || | |||||||||||||||    
T  25601003 gttctttaaaccaattgtcttatgatctttcgtgactagtcttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgctggatatgatatttatc 25600904  T
Q  123 atgagatgttgtatg 137  Q
    || |||| |||||||    
T  25600903 ataagatattgtatg 25600889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 380
Target Start/End: Original strand, 9782346 - 9782407
Alignment:
Q  318 tacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9782346 tacttttacattgtgttgttgtaagttgtgaagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 9782407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Original strand, 45619361 - 45619454
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  45619361 gtgatgactcatatttgaattgtgacttgttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaaatggag 45619454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Original strand, 24562225 - 24562289
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  24562225 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggag 24562289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21140842 - 21140735
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  21140842 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 21140743  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  21140742 gttgaatg 21140735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 280
Target Start/End: Original strand, 39668572 - 39668630
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatg 280  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39668572 gtgatgactcttt-gttaattatgacctgttgattgtatggatgtaaatgcttgataatg 39668630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18534670 - 18534598
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  18534670 gtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaa-tacttgataatgcaattgttgttga 18534598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19661073 - 19661036
Alignment:
Q  343 ttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19661073 ttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 19661036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 136
Target Start/End: Original strand, 19670337 - 19670366
Alignment:
Q  107 tgatatgatatttatcatgagatgttgtat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19670337 tgatatgatatttatcatgagatgttgtat 19670366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 21275717 - 21275824
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  21275717 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 21275816  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  21275817 gttgaatg 21275824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25304582 - 25304489
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||  |||||  || ||   |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  25304582 tatgatctttcgtaactagctgtatatgactaaatgaggatgtgtgaatgacatgttgtatgttgatacgatatttatcataagatgttatatg 25304489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 6491
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  6603 gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtatggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaagttgagaaatgtaattggaggtgtac 6504  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    ||||||| |||||    
T  6503 ttttacactgtgt 6491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 3291 - 3403
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||    
T  3291 gtgatgactcttaattgaataatgacatgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtac 3390  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||||||||||||    
T  3391 ttttacattgtgt 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5579 - 5434
Alignment:
Q  225 tgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttactttt 324  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | || | ||    
T  5579 tgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgtt 5480  T
Q  325 acattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgc 370  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5479 acattgtgttgttgtaagttgtggagttgcattatttggtctttgc 5434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 588 - 433
Alignment:
Q  224 atgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||| | ||||||    
T  588 atgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgcaattgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttt 489  T
Q  324 tacattgtgtagttgtacgttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  488 tacattgtgttgttgtaagttgtagagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1338
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttac 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  1450 gtgatgactcttaattgaataatgacttcttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtac 1351  T
Q  321 ttttacattgtgt 333  Q
    |||| ||||||||    
T  1350 ttttgcattgtgt 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2380
Alignment:
Q  219 ttgtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2285 ttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaactggag 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50274
Alignment:
Q  254 ttgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgtagttgtacgttgagtagttg 353  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| |||| | |||||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgtaagttgtggagttg 50291  T
Q  354 cattatttggtctttgc 370  Q
    |||||||||||||||||    
T  50290 cattatttggtctttgc 50274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Original strand, 24722 - 24900
Alignment:
Q  29 tttaagccaattgt-atatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttg-atatgatatttatcatga 126  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24722 tttaagccaattatcatatgatctttcgtgactagccttatatgactaaataatgatgtgtgaatggattgttatatgttgaatataatatttatcatga 24821  T
Q  127 gatgttgta--------tgacttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
    | |||||||        | ||||  ||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24822 ggtgttgtattttctcgttacttgaaatatgataaatatttggagtggtgaaactatatgatgtatttgatgttgaatg 24900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 23601 - 23762
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgtatg----- 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||         
T  23601 tatgatctttcgtgactagccttgtatgactaaatggagatatgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctc 23700  T
Q  138 --acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
      |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  23701 ttacttggaatatgagaaataattgaagtggtgaaactatctgatgtagttgatgttgaatg 23762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11460 - 11349
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||    
T  11460 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgta 11361  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  11360 cttttacattgt 11349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Original strand, 1132 - 1210
Alignment:
Q  230 cttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaa 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1132 cttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 10680 - 10791
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||    
T  10680 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgta 10779  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  10780 cttttacattgt 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34487 - 34394
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||  || ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34487 tatgacctttcgtaactagccgtatatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttaatatgaaatttatcataagatgttgtatg 34394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 371
Target Start/End: Original strand, 105965 - 106089
Alignment:
Q  251 tgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgtgt--agttgtacg--ttga 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |  |||| |  ||||    
T  105965 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttgatgtgtatgaattga 106064  T
Q  347 gtagttgcattatttggtctttgct 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  106065 gtagttgcattattcggtctttgct 106089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9534
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  9628 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtcgatcaatataaatggag 9534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3734 - 3579
Alignment:
Q  44 tatgatctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgta---tgac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||  || | || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |  |    
T  3734 tatgatctttcgtgactagccttatatgact-aatgaagatgtgtgaat-gaatgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctc 3637  T
Q  140 ttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgatgttgaatg 197  Q
    || |||||||||||||| || || ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3636 ttggaatatgagaaatatttggagtggcgaaactatatgatgtagttgatgttgaatg 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 34787 - 34858
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34787 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttga 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32583 - 32513
Alignment:
Q  68 catgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||||| |||||  || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32583 catgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtatg 32513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Original strand, 1570 - 1651
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagttttacttttacattgt 331  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  1570 ttgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtgtacttttacattgt 1651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12560 - 12467
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||| |||||    
T  12560 gtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaaatggag 12467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 44935 - 45007
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44935 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttga 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 329
Alignment:
Q  223 gatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  420 gatgactcttatttgaattgtgacttgatgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaaatggag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 2301 - 2376
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2301 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattaattgtgtggac-taaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 130727 - 130636
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || ||| |||| |||||||||    
T  130727 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg-aggtgatcaatataattggag 130636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 15215 - 15325
Alignment:
Q  221 gtgatgactcttaagtgaataatgacatgttg-attgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagtttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||| ||||  | | |||||||| ||||| | ||    
T  15215 gtgatgactcttaattgaattatgacttgatggattgtgtggaagtaaatactttataattcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggaggtgta 15313  T
Q  320 cttttacattgt 331  Q
    ||||||||||||    
T  15314 cttttacattgt 15325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1566
Alignment:
Q  92 tggattgttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgta 183  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| |||||||     
T  1453 tggatggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatgtg 1552  T
Q  184 tttgatgttgaatg 197  Q
     |||||||||||||    
T  1553 gttgatgttgaatg 1566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 6279 - 6365
Alignment:
Q  48 atctttcgtgactagccttacatgactaaatggtgatgtacgagtggattgttatatgtt-gatatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6279 atctttcgtgactagccttatgtgactaagtgaagatgtatga-tgaattgttagatgttggatatgatattgatcataagatgttgt 6365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 380
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6648
Alignment:
Q  343 ttgagtagttgcattatttggtctttgctgatgtccat 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6611 ttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 85260 - 85189
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttga 293  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  85260 tgatgactcttaattgaattataacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 85189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26398 - 26307
Alignment:
Q  222 tgatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 314  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  26398 tgatgacttttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 26307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4757 - 4711
Alignment:
Q  250 ttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgtaattgttgttgaagt 296  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4757 ttgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 2324 - 2361
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2324 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 2361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7518
Alignment:
Q  96 ttgttatatgttgatatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7559 ttgttgtatgttgatatgatgtttatcataagatgttgtatg 7518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17617 - 17580
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17617 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 17580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 897
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  934 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15190 - 15153
Alignment:
Q  98 gttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15190 gttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 15153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 90076 - 90183
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg-------acttcgaatatgagaaataattagattggtgaagctacatgatgtatttgat 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||||| |  || || ||||||| ||| ||||| || |||||    
T  90076 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 90175  T
Q  190 gttgaatg 197  Q
    ||||||||    
T  90176 gttgaatg 90183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Original strand, 2768 - 2808
Alignment:
Q  98 gttatatgttg-atatgatatttatcatgagatgttgtatg 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2768 gttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatg 2808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University