View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6856_high_4 (Length: 562)

Name: NF6856_high_4
Description: NF6856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6856_high_4
NF6856_high_4
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (12-538)||(9549133-9549659)
chr5 (12-538)||(24680483-24681009)
chr5 (12-538)||(24723010-24723536)
chr5 (12-538)||(31827009-31827535)
chr5 (12-538)||(15759447-15759973)
chr5 (12-538)||(9316497-9317023)
chr5 (12-538)||(12131201-12131727)
chr5 (12-538)||(26479438-26479964)
chr5 (12-538)||(30151064-30151590)
chr5 (12-538)||(30167515-30168041)
chr5 (12-538)||(2510097-2510623)
chr5 (12-538)||(5636956-5637482)
chr5 (12-538)||(8666065-8666591)
chr5 (15-538)||(18376002-18376525)
chr5 (12-538)||(11548400-11548926)
chr5 (12-538)||(22999704-23000230)
chr5 (15-538)||(29967656-29968179)
chr5 (15-538)||(30028464-30028987)
chr5 (12-538)||(6873348-6873874)
chr5 (12-538)||(33515402-33515928)
chr5 (12-538)||(30933682-30934208)
chr5 (12-538)||(33776533-33777059)
chr5 (12-538)||(23718578-23719101)
chr5 (12-538)||(24688747-24689273)
chr5 (12-538)||(24951156-24951682)
chr5 (53-538)||(15659350-15659835)
chr5 (53-538)||(28960388-28960874)
chr5 (53-538)||(13325434-13325919)
chr5 (53-538)||(37754055-37754540)
chr5 (53-538)||(41673796-41674281)
chr5 (131-538)||(40474142-40474549)
chr5 (131-538)||(3788691-3789098)
chr5 (131-538)||(18501338-18501745)
chr5 (71-538)||(34615626-34616093)
chr5 (53-538)||(37771589-37772074)
chr5 (53-538)||(43077336-43077821)
chr5 (164-538)||(32600059-32600433)
chr5 (12-537)||(23891252-23891777)
chr5 (53-538)||(28648313-28648798)
chr5 (53-538)||(31430515-31431000)
chr5 (53-538)||(37672082-37672567)
chr5 (164-538)||(37359245-37359619)
chr5 (53-538)||(33291615-33292100)
chr5 (12-537)||(25198078-25198603)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (12-538)||(11440598-11441124)
chr7 (12-538)||(3444332-3444858)
chr7 (12-538)||(26670493-26671019)
chr7 (12-538)||(4145702-4146228)
chr7 (12-538)||(5127030-5127556)
chr7 (12-538)||(9617689-9618215)
chr7 (12-538)||(11425355-11425881)
chr7 (12-538)||(16737039-16737565)
chr7 (12-538)||(16752093-16752619)
chr7 (12-538)||(17522570-17523096)
chr7 (12-538)||(17530119-17530645)
chr7 (12-538)||(45386381-45386907)
chr7 (12-538)||(26275673-26276199)
chr7 (12-538)||(26320448-26320974)
chr7 (12-538)||(24593120-24593646)
chr7 (12-538)||(2153611-2154137)
chr7 (12-538)||(10917444-10917970)
chr7 (12-538)||(16518995-16519520)
chr7 (12-519)||(16503978-16504484)
chr7 (53-538)||(26486323-26486808)
chr7 (53-538)||(26538452-26538937)
chr7 (164-538)||(22142850-22143224)
chr7 (131-538)||(31124068-31124475)
chr7 (164-538)||(5147919-5148293)
chr7 (164-538)||(26434447-26434821)
chr7 (53-538)||(31564978-31565463)
chr7 (53-534)||(5120539-5121020)
chr7 (12-537)||(16040364-16040889)
chr7 (12-534)||(16450578-16451100)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (12-538)||(51781009-51781535)
chr3 (12-538)||(51796096-51796622)
chr3 (12-538)||(36997823-36998349)
chr3 (12-538)||(18329672-18330198)
chr3 (12-538)||(4720629-4721155)
chr3 (12-538)||(5610056-5610582)
chr3 (12-538)||(31965207-31965733)
chr3 (12-538)||(6191314-6191840)
chr3 (12-538)||(50134805-50135331)
chr3 (13-538)||(24327158-24327683)
chr3 (12-538)||(7995560-7996086)
chr3 (12-538)||(10642068-10642594)
chr3 (12-538)||(28338301-28338826)
chr3 (12-538)||(29149489-29150015)
chr3 (12-538)||(4415914-4416440)
chr3 (12-538)||(5012710-5013236)
chr3 (12-538)||(18224189-18224715)
chr3 (12-538)||(17985690-17986216)
chr3 (12-538)||(4797387-4797913)
chr3 (12-477)||(14447712-14448177)
chr3 (12-538)||(35879764-35880290)
chr3 (12-538)||(8294973-8295499)
chr3 (12-538)||(15741816-15742339)
chr3 (12-538)||(18050260-18050786)
chr3 (12-538)||(8301998-8302521)
chr3 (12-538)||(15893440-15893966)
chr3 (131-538)||(8210858-8211265)
chr3 (53-538)||(21673732-21674217)
chr3 (53-538)||(7072251-7072736)
chr3 (53-538)||(22871608-22872093)
chr3 (53-538)||(22886667-22887152)
chr3 (131-538)||(20577596-20578003)
chr3 (131-538)||(48465032-48465439)
chr3 (53-538)||(10395175-10395660)
chr3 (53-538)||(47022492-47022977)
chr3 (53-538)||(6543208-6543693)
chr3 (53-538)||(29665719-29666204)
chr3 (53-538)||(5466024-5466509)
chr3 (131-538)||(5597100-5597507)
chr3 (131-538)||(11111095-11111502)
chr3 (164-538)||(18277786-18278160)
chr3 (53-538)||(4347418-4347903)
chr3 (164-538)||(18293087-18293461)
chr3 (164-538)||(18308388-18308762)
chr3 (53-538)||(28020317-28020802)
chr3 (164-538)||(18241877-18242251)
chr3 (53-538)||(28116691-28117176)
chr3 (53-534)||(4892252-4892733)
chr3 (53-538)||(32438196-32438681)
chr3 (131-534)||(22388313-22388716)
chr3 (12-537)||(18529390-18529920)
chr3 (12-471)||(15334768-15335227)
chr3 (28-515)||(16627259-16627746)
chr3 (12-92)||(15727995-15728075)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (12-538)||(18709623-18710149)
chr8 (12-538)||(19209012-19209538)
chr8 (12-538)||(28362607-28363133)
chr8 (12-538)||(33257760-33258286)
chr8 (12-538)||(31490402-31490928)
chr8 (12-538)||(27609557-27610083)
chr8 (15-538)||(31353563-31354087)
chr8 (12-538)||(2137911-2138437)
chr8 (12-538)||(14556664-14557190)
chr8 (12-538)||(16276591-16277117)
chr8 (12-538)||(19687135-19687661)
chr8 (53-538)||(19285543-19286028)
chr8 (53-538)||(19279138-19279624)
chr8 (53-538)||(3330171-3330656)
chr8 (53-538)||(19518795-19519280)
chr8 (53-538)||(12093385-12093870)
chr8 (164-538)||(29828502-29828876)
chr8 (12-483)||(16282489-16282957)
chr8 (131-538)||(19673594-19674001)
chr8 (28-520)||(22081542-22082034)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (12-538)||(30752794-30753320)
chr4 (12-538)||(33678037-33678563)
chr4 (12-538)||(24593004-24593530)
chr4 (12-538)||(14097593-14098119)
chr4 (12-538)||(40106331-40106857)
chr4 (12-538)||(31127211-31127737)
chr4 (12-538)||(27164010-27164536)
chr4 (16-538)||(21968757-21969279)
chr4 (12-538)||(17013052-17013578)
chr4 (12-538)||(14664070-14664596)
chr4 (53-538)||(39849716-39850201)
chr4 (53-538)||(54832483-54832968)
chr4 (53-538)||(36345205-36345690)
chr4 (164-538)||(19372465-19372839)
chr4 (164-538)||(6569057-6569431)
chr4 (164-538)||(14763997-14764371)
chr4 (53-531)||(5004963-5005441)
chr4 (164-534)||(24111869-24112239)
chr4 (12-534)||(1899312-1899834)
chr4 (53-534)||(34189654-34190135)
chr4 (29-519)||(15226942-15227432)
chr4 (54-534)||(14236222-14236702)
chr4 (28-483)||(15392082-15392537)
chr4 (51-519)||(15285637-15286105)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (12-538)||(12717287-12717813)
chr2 (12-538)||(11642060-11642586)
chr2 (12-538)||(34860713-34861239)
chr2 (12-538)||(37686591-37687117)
chr2 (12-538)||(37701856-37702382)
chr2 (18-538)||(11635871-11636391)
chr2 (12-538)||(22926710-22927236)
chr2 (13-538)||(19417181-19417706)
chr2 (12-538)||(21677864-21678390)
chr2 (12-538)||(37924526-37925052)
chr2 (15-538)||(31875317-31875840)
chr2 (12-538)||(16830020-16830546)
chr2 (12-538)||(16890935-16891461)
chr2 (16-538)||(32048835-32049357)
chr2 (12-538)||(23129248-23129774)
chr2 (12-538)||(28881247-28881773)
chr2 (12-538)||(20836951-20837477)
chr2 (12-510)||(12654575-12655073)
chr2 (12-538)||(27435126-27435651)
chr2 (51-538)||(34278521-34279008)
chr2 (53-538)||(12585875-12586360)
chr2 (131-538)||(39052510-39052917)
chr2 (131-538)||(261447-261853)
chr2 (131-538)||(9350676-9351083)
chr2 (131-538)||(40232651-40233058)
chr2 (53-538)||(39889136-39889621)
chr2 (131-538)||(27816126-27816533)
chr2 (53-538)||(27776281-27776766)
chr2 (131-538)||(37374313-37374720)
chr2 (164-538)||(13937226-13937600)
chr2 (53-538)||(27802766-27803251)
chr2 (252-538)||(34285627-34285913)
chr2 (252-538)||(34290687-34290973)
chr2 (12-537)||(21703844-21704369)
chr2 (51-534)||(19457104-19457587)
chr2 (28-520)||(27392043-27392534)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (12-538)||(51637254-51637780)
chr1 (12-538)||(10961706-10962232)
chr1 (12-538)||(41794001-41794527)
chr1 (12-538)||(28584017-28584543)
chr1 (12-537)||(16208719-16209243)
chr1 (28-519)||(20460160-20460651)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (12-538)||(26917415-26917940)
chr6 (12-538)||(16944663-16945189)
chr6 (12-538)||(29572047-29572573)
chr6 (12-538)||(16748888-16749414)
chr6 (12-538)||(30558652-30559178)
chr6 (12-538)||(15424953-15425479)
chr6 (12-538)||(13299587-13300113)
chr6 (12-538)||(26988038-26988561)
chr6 (12-538)||(26999106-26999633)
chr6 (12-538)||(24305254-24305780)
chr6 (12-538)||(24862751-24863277)
chr6 (12-538)||(22935513-22936040)
chr6 (12-538)||(23857958-23858485)
chr6 (53-538)||(26778263-26778748)
chr6 (131-538)||(34463997-34464404)
chr6 (53-538)||(4756836-4757321)
chr6 (53-538)||(4772072-4772557)
chr6 (53-538)||(29548553-29549038)
chr6 (53-538)||(4524364-4524849)
chr6 (131-538)||(29500559-29500966)
chr6 (53-538)||(27043464-27043950)
chr6 (53-538)||(3695177-3695662)
chr6 (53-538)||(16673202-16673687)
chr6 (53-538)||(28206517-28207002)
chr6 (53-538)||(4546420-4546905)
chr6 (53-538)||(27006787-27007272)
chr6 (131-538)||(17024415-17024822)
chr6 (53-538)||(4724779-4725264)
chr6 (53-538)||(27360646-27361131)
chr6 (53-538)||(27450989-27451474)
chr6 (164-538)||(26117055-26117429)
chr6 (164-538)||(27484303-27484677)
chr6 (186-534)||(27630349-27630697)
chr6 (130-534)||(27273223-27273628)
chr6 (51-537)||(20159774-20160266)
chr6 (51-537)||(22172565-22173057)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (12-538)||(823-1349)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-538)||(15623-16146)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (12-538)||(7932-8458)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (12-538)||(26329-26855)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (12-538)||(29490-30016)
scaffold0124 (12-537)||(19448-19974)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (12-538)||(47678-48204)
scaffold0089 (12-538)||(40762-41288)
scaffold0089 (12-538)||(28800-29326)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (53-538)||(7310-7795)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (53-538)||(7015-7500)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (326-538)||(5339-5550)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (140-534)||(40826-41220)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (64-441)||(48959-49348)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-520)||(20620-21112)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (28-483)||(120929-121384)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (421-538)||(26895-27013)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (64-105)||(104-145)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9549659 - 9549133
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549659 acatcaacacgcagcacggaagcatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 9549560  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9549559 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggacttcgaccggtacaacggg 9549460  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9549459 ctaacttgtcctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 9549360  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9549359 tggaagacgccgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 9549260  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9549259 ccgactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgtccgt 9549160  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9549159 atcactcctgctttagatgaagaagaa 9549133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 24680483 - 24681009
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24680483 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 24680582  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24680583 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 24680682  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24680683 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 24680782  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24680783 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 24680882  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24680883 tcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 24680982  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24680983 atcactcctgctttagatgaagaagaa 24681009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 24723010 - 24723536
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24723010 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 24723109  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24723110 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 24723209  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24723210 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 24723309  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24723310 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 24723409  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24723410 tcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 24723509  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24723510 atcactcctgctttagatgaagaagaa 24723536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31827535 - 31827009
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31827535 acatcaacacacagcatgaaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 31827436  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31827435 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgga 31827336  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31827335 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccattgttttcaggatagtttga 31827236  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31827235 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 31827136  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31827135 tcgtttaaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 31827036  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31827035 atcactcctgctttagatgaagaagaa 31827009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15759973 - 15759447
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  15759973 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 15759874  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15759873 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 15759774  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  15759773 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 15759674  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15759673 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccactacgggtttaacac 15759574  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15759573 tcgactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 15759474  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15759473 atcacccctgctttagatgaagaagaa 15759447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 9316497 - 9317023
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  9316497 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 9316596  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9316597 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 9316696  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  9316697 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 9316796  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  9316797 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 9316896  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  9316897 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 9316996  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9316997 atcactcctgctttagatgaggaagaa 9317023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 12131201 - 12131727
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  12131201 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 12131300  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  12131301 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 12131400  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  12131401 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 12131500  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  12131501 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 12131600  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  12131601 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 12131700  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12131701 atcactcctgctttagatgaggaagaa 12131727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 26479438 - 26479964
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  26479438 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 26479537  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26479538 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 26479637  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  26479638 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 26479737  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26479738 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 26479837  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26479838 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 26479937  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26479938 atcactcctgctttagatgaggaagaa 26479964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 30151064 - 30151590
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  30151064 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 30151163  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  30151164 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 30151263  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  30151264 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 30151363  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  30151364 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 30151463  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30151464 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 30151563  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30151564 atcactcctgctttagatgaggaagaa 30151590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 30167515 - 30168041
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  30167515 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 30167614  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  30167615 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 30167714  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  30167715 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 30167814  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  30167815 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 30167914  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30167915 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 30168014  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30168015 atcacccctgctttagatgaagaagaa 30168041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 2510097 - 2510623
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  2510097 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 2510196  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  2510197 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 2510296  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  2510297 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 2510396  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  2510397 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 2510496  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  2510497 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 2510596  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2510597 atcactcctgctttagatgaagaagaa 2510623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 5636956 - 5637482
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |  |||||||    
T  5636956 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccagaccaatcg 5637055  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5637056 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 5637155  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  5637156 ctaacctgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 5637255  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5637256 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 5637355  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5637356 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 5637455  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5637456 atcactcctgctttagatgaggaagaa 5637482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8666591 - 8666065
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  8666591 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 8666492  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8666491 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 8666392  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  8666391 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 8666292  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8666291 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 8666192  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  8666191 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 8666092  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8666091 atcactcctgctttagatgaggaagaa 8666065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18376525 - 18376002
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  18376525 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagg 18376426  T
Q  115 gaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggcta 214  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18376425 gaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggcta 18376326  T
Q  215 acctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgg 314  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18376325 acttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatgg 18376226  T
Q  315 aagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcg 414  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18376225 aggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcg 18376126  T
Q  415 attgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatc 514  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18376125 actgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatc 18376026  T
Q  515 actcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18376025 actcctgctttagatgaggaagaa 18376002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 11548400 - 11548926
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11548400 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 11548499  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11548500 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 11548599  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11548600 ctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 11548699  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11548700 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 11548799  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  11548800 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 11548899  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  11548900 attactcccgctcttgatgaagaagaa 11548926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23000230 - 22999704
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23000230 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccatcatgagatcaaagccaatcg 23000131  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23000130 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcgaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 23000031  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23000030 ctaacttgtccccataaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaggatagtttga 22999931  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22999930 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgagttagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 22999831  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| ||||  ||||||||     
T  22999830 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggctgctgcccgc 22999731  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||    
T  22999730 attactcctgctcttgatgaagaagaa 22999704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 29968179 - 29967656
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  29968179 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagg 29968080  T
Q  115 gaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggcta 214  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29968079 gagtgcaaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggcta 29967980  T
Q  215 acctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgg 314  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29967979 acttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatgg 29967880  T
Q  315 aagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcg 414  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  29967879 aggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcg 29967780  T
Q  415 attgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatc 514  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  29967779 actgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatc 29967680  T
Q  515 actcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  29967679 actcctgctttagatgaggaagaa 29967656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 30028464 - 30028987
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  30028464 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagg 30028563  T
Q  115 gaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggcta 214  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30028564 gagtgcaaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggcta 30028663  T
Q  215 acctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgg 314  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30028664 acttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatgg 30028763  T
Q  315 aagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcg 414  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  30028764 aggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcg 30028863  T
Q  415 attgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatc 514  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  30028864 actgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatc 30028963  T
Q  515 actcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  30028964 actcctgctttagatgaggaagaa 30028987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 6873348 - 6873874
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  6873348 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 6873447  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  6873448 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 6873547  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||    
T  6873548 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagcctga 6873647  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  6873648 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 6873747  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  6873748 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 6873847  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6873848 atcactcctgctttagatgaagaagaa 6873874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 33515402 - 33515928
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  33515402 acatcaacacacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 33515501  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  33515502 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 33515601  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  33515602 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 33515701  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  33515702 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 33515801  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  33515802 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 33515901  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33515902 atcactcctgctttagatgaggaagaa 33515928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 30933682 - 30934208
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30933682 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcg 30933781  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30933782 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatctcggatttcgaccgatacaacggg 30933881  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  30933882 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 30933981  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30933982 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 30934081  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| ||||||||||    
T  30934082 ccgattgaagccgaatagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgt 30934181  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  30934182 attactcccgctcttgatgaagaagaa 30934208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 33776533 - 33777059
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33776533 acatcaacacacaccacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 33776632  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33776633 aggaaatgcagactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 33776732  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33776733 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatcctctgctttcaggatagtttga 33776832  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33776833 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 33776932  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||| |||||||||     
T  33776933 ccgattgaagccgaacagggaattccttagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 33777032  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  33777033 attactcccgctcttgatgaagaagaa 33777059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23719101 - 23718578
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23719101 acatcaacacacagcacggaagcatccccg-aaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 23719003  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23719002 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 23718903  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23718902 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttga 23718803  T
Q  312 tggaagatgccg-ctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaaca 410  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23718802 tggaagatgctgacagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaaca 23718703  T
Q  411 ctcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccg 510  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||| || || || |   |||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| ||||  ||||||||    
T  23718702 cccggttgaagccgaacagggaattcctcagatctctctccc---agaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggctgctgcccg 23718606  T
Q  511 tatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
     || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  23718605 cattactcccgctcttgatgaagaagaa 23718578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24689273 - 24688747
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24689273 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcg 24689174  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24689173 agggaatgcggactctttcaaaactcaggatctctgcttggtgccaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 24689074  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  24689073 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaggtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttga 24688974  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24688973 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccactgctttcaaaagccactatgggtttaacac 24688874  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||| ||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||| |||||||||     
T  24688873 cagatttaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcgcagagatggaggggggcagctgcccgc 24688774  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  24688773 attactcccgctcttgatgaagaagaa 24688747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 24951156 - 24951682
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24951156 acatcaacacacaccacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 24951255  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24951256 agggaatgcggactctttcaagactcaggatctctgcttggtgcctaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 24951355  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  24951356 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttga 24951455  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24951456 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 24951555  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  24951556 cagattgaagccgaacagggagttcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 24951655  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  24951656 attactcccgctcttgatgaagaagaa 24951682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15659835 - 15659350
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  15659835 atggaagagagaatggaagagcttgccaaagaactccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 15659736  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  15659735 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 15659636  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15659635 gatgggcaactacaaagacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 15659536  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15659535 gatgtccacacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 15659436  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15659435 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 15659350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28960874 - 28960388
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || |||||||||||||    
T  28960874 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctttgcttgg 28960775  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaa-gttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaa 251  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  28960774 tatcgaaggtagatgttccaaaaaaagttcaaagttccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgga 28960675  T
Q  252 agatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaa 351  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |    
T  28960674 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgtagagtggtatactagtctgagcaaaga 28960575  T
Q  352 tgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 451  Q
    |||  ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28960574 tgatgtccacacctttgatgagctagccaccgctttcaggagtcactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatct 28960475  T
Q  452 cagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960474 cagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 28960388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13325919 - 13325434
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  13325919 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 13325820  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  13325819 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 13325720  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13325719 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 13325620  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13325619 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 13325520  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13325519 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 13325434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 37754055 - 37754540
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  37754055 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaactcaggatctctgcttgg 37754154  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    |||| || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  37754155 tgtcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 37754254  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  37754255 gatgggcaactacaaggacaatgatccccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 37754354  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37754355 gatgtccatacttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 37754454  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37754455 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 37754540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 41673796 - 41674281
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  41673796 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 41673895  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  41673896 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 41673995  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41673996 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 41674095  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674096 gatgtccacacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 41674195  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674196 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 41674281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40474549 - 40474142
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  40474549 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 40474450  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  40474449 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 40474350  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40474349 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 40474250  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40474249 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 40474150  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  40474149 aagaagaa 40474142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 3788691 - 3789098
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  3788691 aaaacccaggatctctgcttggtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 3788790  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  3788791 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 3788890  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3788891 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctggccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 3788990  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788991 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 3789090  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  3789091 aagaagaa 3789098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18501745 - 18501338
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  18501745 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 18501646  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  18501645 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 18501546  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18501545 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 18501446  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18501445 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaatgaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 18501346  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  18501345 aagaagaa 18501338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 71 - 538
Target Start/End: Original strand, 34615626 - 34616093
Alignment:
Q  71 gaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttc 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || ||||| || || || || |||||||    
T  34615626 gaacttgctaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttagtatcgaaggtagatgttc 34615725  T
Q  171 ctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaaga 270  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||||||||| || || ||    
T  34615726 caaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgggcaactacaagga 34615825  T
Q  271 caatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgat 370  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||    
T  34615826 caatgattcctttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgat 34615925  T
Q  371 gatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagct 470  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34615926 gagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtt 34616025  T
Q  471 tccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616026 tccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 34616093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37772074 - 37771589
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  37772074 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 37771975  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  37771974 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaaatcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 37771875  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  37771874 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 37771775  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37771774 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 37771675  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37771674 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 37771589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 43077336 - 43077821
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  43077336 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 43077435  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  43077436 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 43077535  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  43077536 gatgggcaactacaaggacaatgattccctgatgatccattacttccaagacagtatgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 43077635  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43077636 gatgtccatacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 43077735  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43077736 agaaaaaggaggaaagtttccatgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 43077821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32600433 - 32600059
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32600433 gatgctccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 32600334  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |    
T  32600333 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccatac 32600234  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600233 ttttgatgaactagccactgctttcaagagccactatgggtttaacacttgattgaagccgaataggaagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 32600134  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600133 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 32600059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Original strand, 23891252 - 23891777
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  23891252 acatcaacgcacatcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccg 23891351  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23891352 agggaatggggactcttttaggactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccccaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 23891451  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |    
T  23891452 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcattattcactgcttccaagatagcttaa 23891551  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23891552 tggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 23891651  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      ||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||| |||| ||||     
T  23891652 cagattgaagccaaacagggaatttctcagatctctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggaggggggcagctacccgc 23891751  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    || ||||| ||| | |||||||||||    
T  23891752 attactcccgctcttgatgaagaaga 23891777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 28648313 - 28648798
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  28648313 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 28648412  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  28648413 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 28648512  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    |||||| || || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28648513 gatgggtaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 28648612  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28648613 gatgtccacacttttgatgagctagctgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 28648712  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28648713 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 28648798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 31430515 - 31431000
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  31430515 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 31430614  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  31430615 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 31430714  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31430715 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 31430814  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  | ||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31430815 gatgttcatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 31430914  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430915 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 31431000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37672567 - 37672082
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  37672567 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 37672468  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  37672467 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 37672368  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  37672367 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 37672268  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37672267 gatgtccatacttttgatgagctggccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 37672168  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37672167 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 37672082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37359619 - 37359245
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  37359619 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaact 37359520  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  37359519 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 37359420  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37359419 ttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 37359320  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37359319 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 37359245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 33291615 - 33292100
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  33291615 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 33291714  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  33291715 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagtttaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 33291814  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  33291815 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 33291914  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33291915 gatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccattatgggttcaatacaagactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 33292014  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292015 agaagaaggaggaaagtttccgtgaatacgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 33292100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Original strand, 25198078 - 25198603
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||| | |  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  25198078 acatcaacgcacatcaacgaagcatccccttgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatcaaagctaaccg 25198177  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||    
T  25198178 agggaacagagactcttttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatggg 25198277  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  25198278 ctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaa 25198377  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  25198378 tggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 25198477  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      | ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||  |||||||| || ||  |||| |||| |||||||||     
T  25198478 caggttgaaaccaaacagggaatttcttagatctctctcccaaaagaaagatgaaagcttccacgagtatgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 25198577  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||    
T  25198578 atcactcccgctcttgatgaagaaga 25198603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 11440598 - 11441124
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11440598 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 11440697  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11440698 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 11440797  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11440798 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 11440897  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11440898 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 11440997  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11440998 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 11441097  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11441098 atcactcctgctttagatgaagaagaa 11441124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 3444332 - 3444858
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3444332 acatcaacacacagcacggaagtacccccgtaaccaagaccatggaagagatgatgggggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 3444431  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3444432 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 3444531  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3444532 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 3444631  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3444632 tggaggatgctgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 3444731  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3444732 tcgtttaaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 3444831  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3444832 atcactcctgctttagatgaagaagaa 3444858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26671019 - 26670493
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  26671019 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 26670920  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26670919 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 26670820  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26670819 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 26670720  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26670719 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 26670620  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26670619 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 26670520  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26670519 atcactcctgctttagatgaggaagaa 26670493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4146228 - 4145702
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  4146228 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 4146129  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  4146128 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 4146029  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  4146028 ctaatttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 4145929  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4145928 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 4145829  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  4145828 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 4145729  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4145728 atcactcctgctttagatgaagaagaa 4145702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 5127030 - 5127556
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5127030 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 5127129  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127130 agggaatgcggactctttcaaaactcaagacctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 5127229  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5127230 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 5127329  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5127330 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 5127429  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  5127430 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgctcagagatggaggggggcagctgcccgc 5127529  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  5127530 attactcccgctcttgatgaagaagaa 5127556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 9617689 - 9618215
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  9617689 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 9617788  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9617789 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 9617888  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  9617889 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 9617988  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  9617989 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 9618088  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  9618089 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 9618188  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9618189 atcactcctgctttagatgaggaagaa 9618215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11425881 - 11425355
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11425881 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 11425782  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425781 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaatagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 11425682  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11425681 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattctcttatgatccactgctttcaggatagtttga 11425582  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11425581 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 11425482  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  11425481 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 11425382  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  11425381 attactcccgctcttgatgaagaagaa 11425355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16737565 - 16737039
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  16737565 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 16737466  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16737465 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 16737366  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16737365 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 16737266  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16737265 tggaagatgccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 16737166  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16737165 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 16737066  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16737065 atcactcctgctttagatgaagaagaa 16737039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16752619 - 16752093
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  16752619 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 16752520  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16752519 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 16752420  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16752419 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 16752320  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16752319 tggaagatgccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 16752220  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16752219 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 16752120  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16752119 atcactcctgctttagatgaagaagaa 16752093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 17522570 - 17523096
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  17522570 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 17522669  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  17522670 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 17522769  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  17522770 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 17522869  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17522870 tggaagatgccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 17522969  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  17522970 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 17523069  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17523070 atcactcctgctttagatgaagaagaa 17523096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17530645 - 17530119
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  17530645 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 17530546  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  17530545 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 17530446  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  17530445 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 17530346  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17530345 tggaagatgccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 17530246  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  17530245 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 17530146  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17530145 atcactcctgctttagatgaagaagaa 17530119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 45386381 - 45386907
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  45386381 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 45386480  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  45386481 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 45386580  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  45386581 ctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 45386680  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  45386681 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 45386780  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45386781 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 45386880  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  45386881 atcactcctgctttagatgaagaagaa 45386907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26276199 - 26275673
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  26276199 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 26276100  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26276099 agggaatgcaaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 26276000  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  26275999 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 26275900  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26275899 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 26275800  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26275799 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 26275700  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26275699 atcactcctgctttagatgaggaagaa 26275673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26320974 - 26320448
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  26320974 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 26320875  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26320874 agggaatgcaaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 26320775  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  26320774 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 26320675  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26320674 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 26320575  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26320574 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 26320475  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26320474 atcactcctgctttagatgaggaagaa 26320448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24593646 - 24593120
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  24593646 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 24593547  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  24593546 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 24593447  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24593446 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 24593347  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24593346 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 24593247  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  24593246 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 24593147  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24593146 atcactcctgctttagatgaggaagaa 24593120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 2153611 - 2154137
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2153611 acatcaacacaccgtacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagcccatcg 2153710  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2153711 agggaatgcgaactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacggg 2153810  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2153811 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 2153910  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2153911 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 2154010  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  2154011 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 2154110  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  2154111 attactcccgctcttgatgaagaagaa 2154137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10917970 - 10917444
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  10917970 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactctgtcatgaaatcaaagccaatcg 10917871  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10917870 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 10917771  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10917770 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggaaattacaaacacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttga 10917671  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10917670 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 10917571  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| || | ||||||||||    
T  10917570 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggagcagctgcccgt 10917471  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||| | ||| | ||||||||||||    
T  10917470 attactaccgctcttgatgaagaagaa 10917444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16519520 - 16518995
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16519520 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaactatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 16519421  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16519420 agggaatgcagactctttcaaaactcaagatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatggg 16519321  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  16519320 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttga 16519221  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16519220 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagcc-atgctttcaaaagccactatgggtttaatac 16519122  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  16519121 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 16519022  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||  | ||||||||||||    
T  16519021 attactcccgcccttgatgaagaagaa 16518995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 16504484 - 16503978
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16504484 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 16504385  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  16504384 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatctcggatttcgaccgatacaatggg 16504285  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  16504284 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttga 16504185  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16504184 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagcc-atgctttcaaaagccactatgggtttaatac 16504086  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  16504085 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccctgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 16503986  T
Q  512 atcactcc 519  Q
    || |||||    
T  16503985 attactcc 16503978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26486808 - 26486323
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  26486808 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 26486709  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26486708 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26486609  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |     
T  26486608 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagcctgagcaaagac 26486509  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486508 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 26486409  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486408 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 26486323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26538937 - 26538452
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  26538937 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 26538838  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26538837 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26538738  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  26538737 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 26538638  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26538637 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacacccgattgaagccgaatagggagtttctcatgtccctatctc 26538538  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26538537 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 26538452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 22142850 - 22143224
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22142850 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 22142949  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  22142950 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 22143049  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22143050 ttttgacgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 22143149  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143150 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 22143224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 31124068 - 31124475
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || || |||||||| |    
T  31124068 aaaacccaggatctctgcttggtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgccctcaaaatc 31124167  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  31124168 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 31124267  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31124268 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagg 31124367  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124368 gagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 31124467  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  31124468 aagaagaa 31124475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5148293 - 5147919
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5148293 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 5148194  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  5148193 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaaaatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 5148094  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5148093 ttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 5147994  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5147993 gaaagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 5147919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 26434447 - 26434821
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26434447 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 26434546  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  26434547 acaaggacaatgattcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 26434646  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26434647 ttttgatgaactagccgctgctttcaagagtcattatgggtttaacactcgattgaagccgaacagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggag 26434746  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26434747 gaaagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 26434821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31565463 - 31564978
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  31565463 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 31565364  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || ||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  31565363 tatcgaaggtagatattccaaaaaagttcaaagtcccgtagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 31565264  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  31565263 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 31565164  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31565163 gatgtccatacttttgatgagctggccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 31565064  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31565063 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcacaaagatggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 31564978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 53 - 534
Target Start/End: Original strand, 5120539 - 5121020
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5120539 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 5120638  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  5120639 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaa 5120738  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    |||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||    
T  5120739 gatgagcaactacaaggataatgattcccttatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctaagcaaagat 5120838  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5120839 gatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccattatgggttcaatacaagactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 5120938  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5120939 agaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 5121020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Original strand, 16040364 - 16040889
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  16040364 acatcaacgcgcatcacggaagcatgcacgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 16040463  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||    
T  16040464 agggaacggggactctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatggg 16040563  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||  | |    
T  16040564 ctgacttgtccccataaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcctaa 16040663  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||  | || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| |  || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16040664 tggaagacactgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagctgttgcattcaaaagccactatgggtttaatac 16040763  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||| |||||||||     
T  16040764 caggttgaaaccaaacagggaatttctcagatccctttcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 16040863  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||    
T  16040864 atcactcccgctcttgatgaagaaga 16040889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16451100 - 16450578
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  16451100 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 16451001  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| |  ||| || | || ||||| ||||| |||||| |  |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||    
T  16451000 agggaacggagaccctgttaagactcatgatctctgcttgataccaaaggtggacgtccctaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatggg 16450901  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    ||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  16450900 ctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactccgacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagattaa 16450801  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16450800 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 16450701  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  |||||||| || ||  |||||||||||||||||||     
T  16450700 caggttgaaaccaaacagggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagcttccacgagtatgcacagagatggagaggggtagctgcccgc 16450601  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||| ||| | ||||||||    
T  16450600 atcactcccgctcttgatgaaga 16450578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 51781009 - 51781535
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51781009 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 51781108  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51781109 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 51781208  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51781209 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 51781308  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51781309 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 51781408  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51781409 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 51781508  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  51781509 atcactcctgctttagatgaagaagaa 51781535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 51796096 - 51796622
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51796096 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 51796195  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51796196 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 51796295  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51796296 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 51796395  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51796396 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 51796495  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51796496 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 51796595  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  51796596 atcactcctgctttagatgaagaagaa 51796622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36998349 - 36997823
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  36998349 acatcaacacacagcatggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactgcgtcatgagatcaaggccaatcg 36998250  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36998249 agggaatgcggactttttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 36998150  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36998149 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattataaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 36998050  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36998049 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 36997950  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36997949 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 36997850  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36997849 atcactcctgctttagatgaagaagaa 36997823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 18329672 - 18330198
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18329672 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 18329771  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18329772 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 18329871  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18329872 ctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 18329971  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18329972 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 18330071  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||| |||||||||     
T  18330072 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 18330171  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  18330172 attactcccgctctggatgaagaagaa 18330198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 4720629 - 4721155
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4720629 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 4720728  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720729 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 4720828  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4720829 ctaacttgtccacaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 4720928  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4720929 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagcaactacgggtttaacac 4721028  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||| |||||||||     
T  4721029 tcgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 4721128  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  4721129 attactcccgctcttgatgaagaagaa 4721155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5610582 - 5610056
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  5610582 acatcaacacacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 5610483  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5610482 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 5610383  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  5610382 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 5610283  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5610282 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 5610183  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5610182 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 5610083  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5610082 atcactcctgctttagatgaggaagaa 5610056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31965733 - 31965207
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  31965733 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 31965634  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  31965633 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 31965534  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31965533 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 31965434  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  31965433 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 31965334  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31965333 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 31965234  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31965233 atcactcctgctttagatgaggaagaa 31965207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 6191314 - 6191840
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6191314 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 6191413  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6191414 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcctagatttcgaccggtacaacggg 6191513  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6191514 ctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 6191613  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6191614 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 6191713  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||| |||||||||     
T  6191714 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 6191813  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  6191814 attactcccgctcttgatgaagaagaa 6191840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 50135331 - 50134805
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  50135331 acatccacacacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagattcaggccaatcg 50135232  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  50135231 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacggg 50135132  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  50135131 ctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 50135032  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  50135031 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 50134932  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50134931 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 50134832  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50134831 atcactcctgctttagatgaggaagaa 50134805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 538
Target Start/End: Original strand, 24327158 - 24327683
Alignment:
Q  13 catcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||     
T  24327158 catcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcga 24327257  T
Q  113 gggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggc 212  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24327258 gggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggc 24327357  T
Q  213 taacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgat 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  24327358 taacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgat 24327457  T
Q  313 ggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacact 412  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  24327458 ggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacact 24327557  T
Q  413 cgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgta 512  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  24327558 cgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgta 24327657  T
Q  513 tcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24327658 tcactcctgctttagatgaggaagaa 24327683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 7995560 - 7996086
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  7995560 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 7995659  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7995660 agggaataccgactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 7995759  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  7995760 ctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 7995859  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  7995860 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 7995959  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  7995960 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 7996059  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7996060 atcactcctgctttagatgaggaagaa 7996086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 10642068 - 10642594
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  10642068 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 10642167  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  10642168 agggaataccgactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 10642267  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  10642268 ctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 10642367  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  10642368 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 10642467  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  10642468 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 10642567  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10642568 atcactcctgctttagatgaggaagaa 10642594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 28338301 - 28338826
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  28338301 acatcaacacacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 28338400  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28338401 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 28338500  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  28338501 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 28338600  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  28338601 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatggg-ttaacac 28338699  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28338700 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcaaaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 28338799  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28338800 atcactcctgctttagatgaggaagaa 28338826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 29150015 - 29149489
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29150015 acatcaacacacagcacagaagtatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcagagccaatcg 29149916  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29149915 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 29149816  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29149815 ctaacttgtccccaaaaccacatcattaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 29149716  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29149715 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 29149616  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  29149615 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 29149516  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  29149515 attactcccgctcttgatgaagaagaa 29149489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 4415914 - 4416440
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  4415914 acatcaacacacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 4416013  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  4416014 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggacgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacggg 4416113  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  4416114 ctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 4416213  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4416214 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 4416313  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  4416314 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 4416413  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4416414 atcactcctgctttagatgaagaagaa 4416440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 5012710 - 5013236
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  5012710 acatcaacacacagcacaaaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 5012809  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  5012810 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccagtacaacggg 5012909  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  5012910 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 5013009  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5013010 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 5013109  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5013110 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 5013209  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5013210 atcactcctgctttagatgaggaagaa 5013236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 18224189 - 18224715
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  18224189 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 18224288  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  18224289 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 18224388  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  18224389 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 18224488  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  18224489 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccataccttggatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 18224588  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18224589 tcgactgaggccaaatagggagttcctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 18224688  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18224689 atcactcctgctttagatgaggaagaa 18224715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17986216 - 17985690
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  17986216 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 17986117  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  17986116 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 17986017  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  17986016 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 17985917  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| || || || |||||||||||    
T  17985916 tggaggatgccgcagaatggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaaaagccattatgggtttaacac 17985817  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  17985816 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 17985717  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17985716 atcactcctgctttagatgaggaagaa 17985690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4797913 - 4797387
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4797913 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgaccgaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 4797814  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4797813 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacggg 4797714  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4797713 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 4797614  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  4797613 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 4797514  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||| ||     
T  4797513 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgctcgc 4797414  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  4797413 attactcccgctcttgatgaagaagaa 4797387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14448177 - 14447712
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14448177 acatcaacacaccgtacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 14448078  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  14448077 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacggg 14447978  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14447977 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 14447878  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14447877 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 14447778  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtga 477  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14447777 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtga 14447712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 35879764 - 35880290
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35879764 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctgcagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 35879863  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35879864 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatttccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 35879963  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35879964 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 35880063  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35880064 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgacgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 35880163  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  35880164 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 35880263  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  35880264 attactcccgctcttgatgaagaagaa 35880290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 8294973 - 8295499
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8294973 acatcaacacaccatacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 8295072  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  8295073 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttagtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 8295172  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8295173 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgttcgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 8295272  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8295273 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgatttagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 8295372  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||| ||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  8295373 ccgactgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaacgaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 8295472  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  8295473 attactcccgctcttgatgaagaagaa 8295499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15742339 - 15741816
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15742339 acatcaacacacaacacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 15742240  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15742239 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 15742140  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15742139 ctgacttgtccccagaatcacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 15742040  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15742039 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 15741940  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || || || || ||||| || || || |   |||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  15741939 ccgattgaagccgaacagagaattcctcagatctctctccc---agaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 15741843  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  15741842 attactcccgctcttgatgaagaagaa 15741816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 18050260 - 18050786
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18050260 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcg 18050359  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18050360 agggaatgcagactctttcaaatctcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 18050459  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||  | ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  18050460 ctgccttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtctggaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttga 18050559  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18050560 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 18050659  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  18050660 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 18050759  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  18050760 attactcccgctcttgatgaagaagaa 18050786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8302521 - 8301998
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  8302521 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccatcatgaaatcaaagccaatcg 8302422  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  8302421 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 8302322  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  8302321 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttga 8302222  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8302221 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattggccactgctttcaaaagccactatgggtttaacac 8302122  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |   |||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  8302121 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctccc---agaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 8302025  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  8302024 attactcccgctcttgatgaagaagaa 8301998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15893966 - 15893440
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15893966 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 15893867  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||    
T  15893866 agggaatgcagactctttcaaaactcatgatctttgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccgaatttcgaccgatacaatggg 15893767  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||  ||| || ||||| ||||    
T  15893766 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactacttccaagatagcttga 15893667  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  15893666 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 15893567  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    | |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  15893566 tagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 15893467  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  15893466 attactcccgctcttgatgaagaagaa 15893440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 8210858 - 8211265
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  8210858 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 8210957  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  8210958 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaagacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 8211057  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8211058 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagtcattacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 8211157  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211158 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 8211257  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  8211258 aagaagaa 8211265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 21673732 - 21674217
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  21673732 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 21673831  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  21673832 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 21673931  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  21673932 gatgggcaactacaaggataatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 21674031  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674032 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 21674131  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674132 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 21674217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 7072251 - 7072736
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  7072251 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 7072350  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  7072351 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 7072450  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7072451 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 7072550  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072551 gatgtccacacttttgatgagctagccgccgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 7072650  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072651 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 7072736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22872093 - 22871608
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || |||||||    
T  22872093 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttgg 22871994  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  22871993 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 22871894  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  22871893 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 22871794  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871793 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 22871694  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871693 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 22871608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22887152 - 22886667
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || |||||||    
T  22887152 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttgg 22887053  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  22887052 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 22886953  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  22886952 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 22886853  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886852 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 22886753  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886752 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 22886667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20578003 - 20577596
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  20578003 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 20577904  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  20577903 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 20577804  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20577803 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 20577704  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20577703 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 20577604  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  20577603 aagaagaa 20577596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 48465032 - 48465439
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  48465032 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 48465131  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  48465132 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 48465231  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48465232 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 48465331  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48465332 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgccttagatg 48465431  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  48465432 aagaagaa 48465439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 10395175 - 10395660
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  10395175 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccatgatctctgcttag 10395274  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||    
T  10395275 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgttcggaa 10395374  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  10395375 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 10395474  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395475 gatgtccatacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 10395574  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395575 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 10395660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 47022492 - 47022977
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| || ||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  47022492 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggctaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 47022591  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  47022592 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 47022691  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47022692 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 47022791  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47022792 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagtcattacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 47022891  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47022892 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 47022977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6543693 - 6543208
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  6543693 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 6543594  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  6543593 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgaaa 6543494  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  6543493 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 6543394  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543393 gatgtccatacttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 6543294  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543293 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 6543208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 29666204 - 29665719
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  29666204 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 29666105  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  29666104 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 29666005  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  29666004 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 29665905  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665904 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 29665805  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665804 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 29665719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 5466024 - 5466509
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5466024 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 5466123  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  5466124 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 5466223  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5466224 gatgggcaactacaaagacaatgatccccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 5466323  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5466324 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtccctcaggtccctatctc 5466423  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466424 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 5466509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5597507 - 5597100
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  5597507 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacggactgacttgtcctcaaaatc 5597408  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  5597407 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 5597308  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5597307 gtatagtagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 5597208  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5597207 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 5597108  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  5597107 aagaagaa 5597100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11111502 - 11111095
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  11111502 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 11111403  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  11111402 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 11111303  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11111302 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 11111203  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11111202 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaagaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 11111103  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  11111102 aagaagaa 11111095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18278160 - 18277786
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18278160 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18278061  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  |    
T  18278060 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccacac 18277961  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18277960 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgactgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 18277861  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277860 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 18277786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4347903 - 4347418
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4347903 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4347804  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  4347803 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 4347704  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||   ||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4347703 gatgggcaactacaaggacaatgattcgtttatgatccattacttccaagatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4347604  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  4347603 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctt 4347504  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347503 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtgaagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4347418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18293461 - 18293087
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18293461 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18293362  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  |    
T  18293361 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccacac 18293262  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18293261 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagccattacgggtttaacactcgactgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 18293162  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293161 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 18293087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18308762 - 18308388
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18308762 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacaggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18308663  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  |    
T  18308662 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccacac 18308563  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18308562 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgactgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 18308463  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308462 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 18308388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 28020317 - 28020802
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  28020317 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 28020416  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||| ||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  28020417 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgagctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 28020516  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28020517 gatgggcaactacaaggacaacgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 28020616  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||| ||  ||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020617 gatgtccatacctttgacgagctagccaccactttcaggagccactatgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 28020716  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020717 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 28020802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 18241877 - 18242251
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  18241877 gatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 18241976  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  18241977 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 18242076  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18242077 ttttgatgagctggccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggag 18242176  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242177 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 18242251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28117176 - 28116691
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| | ||  |||||| | ||||| || || || ||||| |    
T  28117176 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaagtggagactctattaaaacccaggacctctgcttag 28117077  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  28117076 tatcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 28116977  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    || || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  28116976 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 28116877  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28116876 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 28116777  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116776 agaaaaaagaggaaagtttccgtgaatatgcacaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 28116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 534
Target Start/End: Original strand, 4892252 - 4892733
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4892252 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4892351  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  4892352 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaa 4892451  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    |||| |||| || || |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4892452 gatgagcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttaagcaaagat 4892551  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4892552 gatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccattatgggttcaatacaagactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 4892651  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4892652 agaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 4892733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 32438196 - 32438681
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  32438196 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 32438295  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  32438296 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 32438395  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || |  ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  32438396 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaaggcagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 32438495  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32438496 gatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccattatgggttcaacacaagattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctgtctc 32438595  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438596 agaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 32438681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 131 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22388716 - 22388313
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  22388716 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 22388617  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  |||| |||||||| |||||| |||| || || || |||||||||| |||||| ||  |||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  22388616 atattgtcaagtatgtccggaagatgagcaactacaaggataatgattcccctatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 22388517  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| | |||||| ||||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  || ||||||||||||||    
T  22388516 gtatactagtctaagcaaagatgatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccagtatgggttcaatacaagactgaagccaaatagg 22388417  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22388416 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 22388317  T
Q  531 aaga 534  Q
    ||||    
T  22388316 aaga 22388313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Original strand, 18529390 - 18529920
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| | || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  18529390 acatcaacgcgcatcacggaagtatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 18529489  T
Q  112 ggggaatgcgg---actct-ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaag-tggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtaca 206  Q
     ||||| | ||   || || || || ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||| || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||    
T  18529490 agggaacgggggaaaccctatttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgataca 18529589  T
Q  207 acgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatag 306  Q
    | ||||  || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||    
T  18529590 atgggcggacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatag 18529689  T
Q  307 tttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggttt 406  Q
     || |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  18529690 cttaatggaagacgctgcggaatggtatactagcttgagcaaagattacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggttt 18529789  T
Q  407 aacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctg 506  Q
    || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| |||||    
T  18529790 aataccaggttgaaaccaaacagggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggagaggggcagctg 18529889  T
Q  507 cccgtatcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  18529890 cccgcatcactcccgctcttgatgaagaaga 18529920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15335227 - 15334768
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| | || | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  15335227 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgattagaactatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 15335128  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | |||| || | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||    
T  15335127 agggaacggggaccctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatggg 15335028  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  15335027 ctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaa 15334928  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| | |||||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  15334927 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 15334828  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagctt 471  Q
      | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  15334827 caggttgaaaccaaacagggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagctt 15334768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16627746 - 16627259
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | ||||| | |||| ||    
T  16627746 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaactgagggaacggggaccct 16627647  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | |    
T  16627646 gttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccctaga 16627547  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |||||||| || || ||    
T  16627546 accacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcaga 16627447  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     ||||| || || ||||||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| |  |||||  ||||||| ||  | ||||| |||||     
T  16627446 atggtacaccagcttgagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaaaccactattggtttaataccaggttgaaaccaaac 16627347  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatca 515  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  16627346 agggaatttctcagatctctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggaggggggcagctgcccgcatca 16627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15728075 - 15727995
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtc 92  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15728075 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggattgaggaacttgctaaagaactccgtc 15727995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 18709623 - 18710149
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709623 acatcaacacgcagcacggaagcatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 18709722  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18709723 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtgcatgttcctaaaaatttcaaaatcccggacttcgaccggtacaacggg 18709822  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18709823 ctaacttgtcctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 18709922  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18709923 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 18710022  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18710023 ccgactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaagaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 18710122  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18710123 atcactcctgctttagatgaagaagaa 18710149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19209538 - 19209012
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  19209538 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 19209439  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  19209438 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 19209339  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  19209338 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 19209239  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19209238 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 19209139  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  19209138 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 19209039  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19209038 atcactcctgctttagatgaggaagaa 19209012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28363133 - 28362607
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  28363133 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 28363034  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28363033 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 28362934  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  28362933 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 28362834  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  28362833 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 28362734  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28362733 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 28362634  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28362633 atcactcctgctttagatgaggaagaa 28362607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 33257760 - 33258286
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  33257760 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 33257859  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  33257860 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 33257959  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  33257960 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 33258059  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  33258060 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 33258159  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  33258160 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 33258259  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33258260 atcactcctgctttagatgaggaagaa 33258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31490928 - 31490402
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  31490928 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 31490829  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  31490828 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 31490729  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31490728 ctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 31490629  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  31490628 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 31490529  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31490528 tcgactgaggccaaatagggagtttctcagatccctatcccagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 31490429  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31490428 atcacccctgctttagatgaagaagaa 31490402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27610083 - 27609557
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27610083 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 27609984  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27609983 aggaaatgcagactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 27609884  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  27609883 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 27609784  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27609783 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 27609684  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| || | ||||||||||    
T  27609683 ccgattgaagccgaacagggaattccttagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcacagagatggaggggagcagctgcccgt 27609584  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||    
T  27609583 attactcctgctcttgatgaagaagaa 27609557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 31353563 - 31354087
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagcc-aatcggg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| ||| | |    
T  31353563 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgttaaagaactccgtcacgagatccaggcccaatggag 31353662  T
Q  114 ggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggct 213  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31353663 ggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggct 31353762  T
Q  214 aacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatg 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31353763 aacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattccctcatgatccactgttttcaggatagtctgatg 31353862  T
Q  314 gaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactc 413  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31353863 gaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactc 31353962  T
Q  414 gattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtat 513  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  31353963 gactgaggccaaatagggagtttctcagatccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaagatggagaggggcagctgcccgtat 31354062  T
Q  514 cactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  31354063 cactcctgctttagatgaggaagaa 31354087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2138437 - 2137911
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2138437 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 2138338  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2138337 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacggg 2138238  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2138237 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 2138138  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2138137 tggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 2138038  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  2138037 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaagaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 2137938  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  2137937 attactcccgctcttgatgaagaagaa 2137911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 14556664 - 14557190
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14556664 acatcaacacaccatacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 14556763  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14556764 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatataacggg 14556863  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14556864 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttga 14556963  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14556964 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 14557063  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| ||||||||||    
T  14557064 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaagaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgt 14557163  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  14557164 attactcccgctcttgatgaagaagaa 14557190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 16276591 - 16277117
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16276591 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccagtcg 16276690  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16276691 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacggg 16276790  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  16276791 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 16276890  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  16276891 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 16276990  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  16276991 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaagaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 16277090  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  16277091 attactcccgctcttgatgaagaagaa 16277117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 19687135 - 19687661
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19687135 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcg 19687234  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19687235 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctccttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacggg 19687334  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  19687335 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttga 19687434  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19687435 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaacgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 19687534  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||| | |||||||| || ||||| || || ||  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  19687535 ccgattgaagtcgaatagggaattcctcagatctctctcctagaagaaggaagaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 19687634  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  19687635 attactcccgctcttgatgaagaagaa 19687661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 19285543 - 19286028
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  19285543 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaactcaggatctctgcttag 19285642  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19285643 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19285742  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||    
T  19285743 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaaagat 19285842  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19285843 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 19285942  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19285943 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 19286028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19279624 - 19279138
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  19279624 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 19279525  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19279524 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19279425  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  19279424 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 19279325  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccc-tatct 451  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19279324 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtcccttatct 19279225  T
Q  452 cagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19279224 cagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 19279138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3330656 - 3330171
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  3330656 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 3330557  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  3330556 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 3330457  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3330456 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 3330357  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3330356 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 3330257  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3330256 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 3330171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19519280 - 19518795
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  19519280 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 19519181  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19519180 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19519081  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  19519080 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 19518981  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19518980 gatgtccatacttttgatgagctagccactggtttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccttatctc 19518881  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19518880 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 19518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12093870 - 12093385
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  ||||||| || || || |||||||    
T  12093870 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccatcaaaacccaggacctctgcttgg 12093771  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  12093770 tatcgaaggtggatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 12093671  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12093670 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 12093571  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12093570 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 12093471  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12093470 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 12093385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 29828502 - 29828876
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29828502 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 29828601  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |    
T  29828602 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccatac 29828701  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29828702 ttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 29828801  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29828802 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 29828876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 483
Target Start/End: Original strand, 16282489 - 16282957
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  16282489 acatcaacacacattacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccg 16282588  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||    
T  16282589 agggaacggggactcttttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgttcctaagaagttcaagatcccggattacgaccgatacaatggg 16282688  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  16282689 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaa 16282788  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16282789 tggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaaa---acgtccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 16282885  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgc 483  Q
      ||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282886 cagattgaagccaaacagggaattcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgc 16282957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 19673594 - 19674001
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  19673594 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 19673693  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    || || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  19673694 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaacgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 19673793  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19673794 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacactcggttgaggccaaatagg 19673893  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19673894 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaagaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 19673993  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  19673994 aagaagaa 19674001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22082034 - 22081542
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||| ||| | |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  22082034 cggaagcatcctcgtgattaaaacaatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagcgatact 22081935  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  22081934 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatgtccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 22081835  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||  || ||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  22081834 atcccatcatcaaatatgtccggaagatggctaactacttagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 22081735  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     |||||||| || || |||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||  || |||| |||||     
T  22081734 atggtataccagcttaagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggttcaacaccagactgaaaccaaac 22081635  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcct 520  Q
    ||||| || || |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||  ||||||||| | ||||||    
T  22081634 agggaattccttaggtccctttgctagaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggaggggggcggctgcccgtgttactcct 22081542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 30752794 - 30753320
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30752794 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 30752893  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30752894 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 30752993  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30752994 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 30753093  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30753094 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 30753193  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30753194 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcaaaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 30753293  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30753294 atcactcctgctttagatgaagaagaa 30753320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 33678563 - 33678037
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33678563 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 33678464  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33678463 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 33678364  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33678363 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 33678264  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33678263 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttaagcaagaatgacatccatacctttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 33678164  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33678163 tcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 33678064  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33678063 atcactcctgctttagatgaagaagaa 33678037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24593530 - 24593004
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24593530 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 24593431  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24593430 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 24593331  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24593330 ctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 24593231  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24593230 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 24593131  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| ||||||||||    
T  24593130 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgt 24593031  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  24593030 attactcccgctcttgatgaagaagaa 24593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 14097593 - 14098119
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  14097593 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 14097692  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14097693 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 14097792  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  14097793 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 14097892  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14097893 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 14097992  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14097993 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagttttcgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 14098092  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14098093 atcactcctgctttagatgaggaagaa 14098119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 40106857 - 40106331
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  40106857 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 40106758  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  40106757 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 40106658  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  40106657 ctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 40106558  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  40106557 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 40106458  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  40106457 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 40106358  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40106357 atcactcctgctttagatgaggaagaa 40106331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31127737 - 31127211
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  31127737 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 31127638  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  31127637 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 31127538  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31127537 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 31127438  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  31127437 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 31127338  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31127337 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 31127238  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31127237 atcactcctgctttagatgaggaagaa 31127211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27164536 - 27164010
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  27164536 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatagaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 27164437  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  27164436 agggaatacagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgacaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 27164337  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  27164336 ctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 27164237  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  27164236 tggaggacgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 27164137  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27164136 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 27164037  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27164036 atcactcctgctttagatgaggaagaa 27164010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 538
Target Start/End: Original strand, 21968757 - 21969279
Alignment:
Q  16 caacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcggggg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||    
T  21968757 caacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgaggg 21968856  T
Q  116 aatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaa 215  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21968857 agtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaa 21968956  T
Q  216 cctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgga 315  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  21968957 cttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatgga 21969056  T
Q  316 agatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcga 415  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  21969057 ggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcga 21969156  T
Q  416 ttgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatca 515  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  21969157 ctgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatca 21969256  T
Q  516 ctcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21969257 ctcctgctttagatgaggaagaa 21969279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 17013052 - 17013578
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17013052 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 17013151  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17013152 agggaatgcggactctttcaaaacccaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 17013251  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17013252 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttga 17013351  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17013352 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 17013451  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  17013452 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 17013551  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  17013552 attactcccgctcttgatgaagaagaa 17013578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 14664070 - 14664596
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14664070 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcg 14664169  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14664170 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 14664269  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  14664270 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttga 14664369  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14664370 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 14664469  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  14664470 cagattgaagccgaacagggagttcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 14664569  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  14664570 attactcccgctcttgatgaagaagaa 14664596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 39849716 - 39850201
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||  |||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  39849716 atggaagagagaatggcagaacttgccgaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 39849815  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  39849816 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 39849915  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  39849916 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 39850015  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850016 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactatgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 39850115  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850116 agaagaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaagatggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 39850201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 54832483 - 54832968
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  54832483 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaactcaggatctctgcttag 54832582  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  54832583 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 54832682  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||    
T  54832683 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaaagat 54832782  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54832783 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 54832882  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54832883 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 54832968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 36345690 - 36345205
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  36345690 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 36345591  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||| |||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  36345590 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtccttaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 36345491  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  36345490 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 36345391  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  | ||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36345390 gatgttcatacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 36345291  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36345290 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 36345205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 19372465 - 19372839
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19372465 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 19372564  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  19372565 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 19372664  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19372665 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaa 19372764  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19372765 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 19372839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 6569057 - 6569431
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6569057 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 6569156  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  6569157 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 6569256  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6569257 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagtcattacgggtttaacactcgactgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 6569356  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569357 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggagcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 6569431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14764371 - 14763997
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14764371 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 14764272  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    || || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||  |    
T  14764271 acaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccacac 14764172  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14764171 ttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgactgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 14764072  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764071 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 14763997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 531
Target Start/End: Original strand, 5004963 - 5005441
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  5004963 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 5005062  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  5005063 tatcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 5005162  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    || || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  5005163 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 5005262  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5005263 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 5005362  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatga 531  Q
    |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5005363 agaaaaaagaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatga 5005441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 164 - 534
Target Start/End: Original strand, 24111869 - 24112239
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24111869 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 24111968  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||  |    
T  24111969 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccacac 24112068  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||  |||||||||| || || || ||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24112069 ttttgatgagctagcaaccgctttcaaaagccattatgggttcaatacaagactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 24112168  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24112169 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 24112239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 534
Target Start/End: Original strand, 1899312 - 1899834
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  1899312 acatcaacgcacatcacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 1899411  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||    
T  1899412 agggaacggggactctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccctaagaagttcaagatcccagagtttgaccgatacaatggg 1899511  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  1899512 ctaacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaa 1899611  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  1899612 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 1899711  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      ||||||| ||||| ||||| |||||||  || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||   |||| |||| |||||||||     
T  1899712 cagattgaaaccaaacagggaatttctcatatctctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacaaatatggaggggggcagctgcccgc 1899811  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||| ||| | ||||||||    
T  1899812 atcactcccgctcttgatgaaga 1899834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34190135 - 34189654
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  34190135 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 34190036  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  34190035 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 34189936  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34189935 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 34189836  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34189835 gatgtccacacttttgatgagctagcagccgctttcaaaagccattatgggttcaatacaagactgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 34189736  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34189735 agaagaaggaggaaagtttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 34189654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 519
Target Start/End: Original strand, 15226942 - 15227432
Alignment:
Q  29 ggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctt 128  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || || ||||| | |||| ||     
T  15226942 ggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccatcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggaccctg 15227041  T
Q  129 tcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaa 228  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  15227042 ttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaa 15227141  T
Q  229 ccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgag 328  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| || |||||||| || || ||     
T  15227142 ccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaa 15227241  T
Q  329 tggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaata 428  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| |    
T  15227242 tggtatactagcttgagcaaagatgacgtttatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaataccaggttgaaaccaaaca 15227341  T
Q  429 gggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcc 519  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15227342 gggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgcatcactcc 15227432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14236702 - 14236222
Alignment:
Q  54 tggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggt 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |  ||  || | || ||||| ||||| ||||||||    
T  14236702 tggaggagaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgaggaaacggtgatcctgttaagactcatgatctctgcttggt 14236603  T
Q  154 gtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaag 253  Q
      |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  14236602 accaaaggtggacgtccctaaaaagttcaaagtcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtcctcaaaaccacattatcaagtatgtccggaag 14236503  T
Q  254 atgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatg 353  Q
    ||||  || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||||||| | | |    
T  14236502 atggctaactactcagacaatgattcactcatgattcactgcttccaggatagcttaatggaagacgctgcagaatggtataccagcttgagcagagacg 14236403  T
Q  354 acatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctca 453  Q
    |||| ||| | ||||| || || || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||    
T  14236402 acattcatacttttgacgaattggctgctgctttcaaaagccattatgggtttaagaccaggttgaagccaaatagggaatttcttagatcccttttcca 14236303  T
Q  454 gaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||| || ||||||||||| || || || || ||  |||| |||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  14236302 gaagaaagatgaaagcttccgcgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgtattacccctgctcttgatgaaga 14236222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 15392537 - 15392082
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||| | | |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  15392537 cggaagcatccccttgattaaaacaatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagcgatact 15392438  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  15392437 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatgtccctaagaagttcaaggttctggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 15392338  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||  |    
T  15392337 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaattacgcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcata 15392238  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     |||||||| || || |||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||  || |||| ||||||    
T  15392237 atggtataccagcttaagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggttcaacaccagactgaaaccaaat 15392138  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgc 483  Q
    ||||| || || |||||||| |  |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15392137 agggaattccttaggtccctttgccagaagaaagatgaaagctttcgcgagtatgc 15392082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 15286105 - 15285637
Alignment:
Q  51 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 150  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  |||| | |   ||  || | || ||||| |||||||||||    
T  15286105 ccatggaagaaaggatagaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaacaggggaagtagtgatactattaagactcatgatctttgctt 15286006  T
Q  151 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 250  Q
    |||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15286005 ggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccga 15285906  T
Q  251 aagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaa 350  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||     
T  15285905 aagatgggtaattactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaag 15285806  T
Q  351 atgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatc 450  Q
    ||||| | ||  | |||||||| || || || |||||||| |  || || |||||||| ||  | ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  15285805 atgacgttcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaaaccattatgggtttaataccaggttgaaaccaagcagggaatttctcagatccctctc 15285706  T
Q  451 tcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcc 519  Q
     || ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15285705 ccaaaagaaagatgaaagcttctgcgagtatgcgcagagatggaggggggcagctgcccgcatcactcc 15285637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12717813 - 12717287
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12717813 acatcaacacacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcg 12717714  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12717713 agggaatgcggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggg 12717614  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12717613 ctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttga 12717514  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12717513 tggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagcagctgctttcaagagccactacgggtttaacac 12717414  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12717413 tcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 12717314  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12717313 atcactcctgctttagatgaagaagaa 12717287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11642586 - 11642060
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  11642586 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 11642487  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11642486 agggaatgcagactctgtcaaaactcgagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 11642387  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  11642386 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 11642287  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  11642286 tggaggatgctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 11642187  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11642186 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 11642087  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11642086 atcactcctgctttagatgaagaagaa 11642060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 34860713 - 34861239
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  34860713 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 34860812  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34860813 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 34860912  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  34860913 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 34861012  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  34861013 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 34861112  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  34861113 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 34861212  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34861213 atcactcctgctttagatgaggaagaa 34861239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37687117 - 37686591
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  37687117 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 37687018  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37687017 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 37686918  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  37686917 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 37686818  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37686817 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 37686718  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37686717 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 37686618  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37686617 atcactcctgctttagatgaggaagaa 37686591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37702382 - 37701856
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  37702382 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 37702283  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37702282 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 37702183  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  37702182 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 37702083  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37702082 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 37701983  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37701982 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 37701883  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37701882 atcactcctgctttagatgaggaagaa 37701856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11636391 - 11635871
Alignment:
Q  18 acacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||    
T  11636391 acacacagcacggaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaa 11636292  T
Q  118 tgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacc 217  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11636291 tgcagactctgtcaaaactcgagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaact 11636192  T
Q  218 tgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaag 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  11636191 tgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggagg 11636092  T
Q  318 atgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgatt 417  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  11636091 atgctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttgatgaattagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcgact 11635992  T
Q  418 gaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcact 517  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11635991 gaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatcact 11635892  T
Q  518 cctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11635891 cctgctttagatgaagaagaa 11635871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22927236 - 22926710
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  22927236 acatcaacacacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 22927137  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  22927136 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacggg 22927037  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  22927036 ctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 22926937  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22926936 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 22926837  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22926836 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgt 22926737  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22926736 atcactcctgctttagatgaagaagaa 22926710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19417706 - 19417181
Alignment:
Q  13 catcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||     
T  19417706 catcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcga 19417607  T
Q  113 gggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggc 212  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  19417606 gggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggc 19417507  T
Q  213 taacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgat 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19417506 taacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgat 19417407  T
Q  313 ggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacact 412  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19417406 ggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacact 19417307  T
Q  413 cgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgta 512  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  19417306 cgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgta 19417207  T
Q  513 tcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19417206 tcactcctgctttagatgaggaagaa 19417181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21678390 - 21677864
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||    
T  21678390 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccg 21678291  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21678290 aggaaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 21678191  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  21678190 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 21678091  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21678090 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 21677991  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  21677990 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 21677891  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21677890 atcactcctgctttagatgaagaagaa 21677864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 37924526 - 37925052
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  37924526 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 37924625  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37924626 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 37924725  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  37924726 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 37924825  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37924826 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 37924925  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37924926 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 37925025  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37925026 atcactcctgctttagatgaggaagaa 37925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 31875317 - 31875840
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  31875317 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagg 31875416  T
Q  115 gaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggcta 214  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31875417 gaatacagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggcta 31875516  T
Q  215 acctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgg 314  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  31875517 acttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatgg 31875616  T
Q  315 aagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcg 414  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  31875617 aggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcg 31875716  T
Q  415 attgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatc 514  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  31875717 actgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatc 31875816  T
Q  515 actcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  31875817 actcctgctttagatgaggaagaa 31875840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16830546 - 16830020
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  16830546 acatcaacacacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 16830447  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16830446 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 16830347  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16830346 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 16830247  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16830246 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 16830147  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16830146 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 16830047  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16830046 atcactcctgctttagatgaggaagaa 16830020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 16890935 - 16891461
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  16890935 acatcaacacacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 16891034  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16891035 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 16891134  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16891135 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 16891234  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16891235 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 16891334  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16891335 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 16891434  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16891435 atcactcctgctttagatgaggaagaa 16891461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 538
Target Start/End: Original strand, 32048835 - 32049357
Alignment:
Q  16 caacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcggggg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||    
T  32048835 caacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgaggg 32048934  T
Q  116 aatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaa 215  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32048935 agtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaa 32049034  T
Q  216 cctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgga 315  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  32049035 cttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatgga 32049134  T
Q  316 agatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcga 415  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  32049135 ggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcga 32049234  T
Q  416 ttgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatca 515  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32049235 ctgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatca 32049334  T
Q  516 ctcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32049335 ctcctgctttagatgaggaagaa 32049357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23129774 - 23129248
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23129774 acatcaacacacagcacggaagcacccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctagagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 23129675  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  23129674 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccaatacaacggg 23129575  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23129574 ctgacctgtccccagaaccacatcatcaagtacatccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 23129475  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23129474 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 23129375  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  23129374 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 23129275  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  23129274 attactcccgctcttgatgaagaagaa 23129248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 28881247 - 28881773
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28881247 acatcaacacacaacacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 28881346  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28881347 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 28881446  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  28881447 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 28881546  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28881547 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 28881646  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  28881647 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttcggtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 28881746  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  28881747 attactcccgctcttgatgaagaagaa 28881773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 20836951 - 20837477
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20836951 acatcaacacaccgcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactctgtcatgagatcaaagccaatcg 20837050  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20837051 agggaatgcagactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 20837150  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  20837151 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 20837250  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20837251 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaaagacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 20837350  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  20837351 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttctgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 20837450  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  20837451 attactcccgctcttgatgaagaagaa 20837477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 510
Target Start/End: Original strand, 12654575 - 12655073
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12654575 acatcaacacaccgcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 12654674  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12654675 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 12654774  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  12654775 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttga 12654874  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12654875 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttgatgaattagccgttgctttcaagagccactacgggtttaatac 12654974  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccg 510  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||    
T  12654975 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccg 12655073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27435651 - 27435126
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27435651 acatcaacacacagcatggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 27435552  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  27435551 agggaatgcagactctttcaaaactcaggatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggacttcgaccgatacaatggg 27435452  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  27435451 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttga 27435352  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27435351 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaacac 27435252  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  27435251 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggag-ggggcagctgcccgc 27435153  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||  | ||||||||||||    
T  27435152 attactcccgcccttgatgaagaagaa 27435126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 538
Target Start/End: Original strand, 34278521 - 34279008
Alignment:
Q  51 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 150  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||    
T  34278521 ccatggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgctt 34278620  T
Q  151 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 250  Q
     || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||||||     
T  34278621 agtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgg 34278720  T
Q  251 aagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaa 350  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  34278721 aagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaag 34278820  T
Q  351 atgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatc 450  Q
    ||||  ||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34278821 atgatgtccacacttttgatgagctagccgccgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatc 34278920  T
Q  451 tcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34278921 tcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 34279008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 12585875 - 12586360
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  12585875 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 12585974  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  12585975 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 12586074  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  12586075 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 12586174  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12586175 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagtcattacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 12586274  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12586275 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 12586360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 39052917 - 39052510
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  39052917 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 39052818  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  39052817 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 39052718  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39052717 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 39052618  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39052617 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 39052518  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  39052517 aagaagaa 39052510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 261853 - 261447
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  261853 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 261754  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  261753 atattgtcaaatatgtccggaa-atgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 261655  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  261654 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 261555  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  261554 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaagaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 261455  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  261454 aagaagaa 261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 9351083 - 9350676
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  9351083 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 9350984  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||  ||||||||||||| || |||||    
T  9350983 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagcctgatggaagatgctgcggagtg 9350884  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9350883 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagg 9350784  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350783 gagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 9350684  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  9350683 aagaagaa 9350676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 40232651 - 40233058
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  40232651 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 40232750  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  |||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  40232751 atattgtcaaatatgtacggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 40232850  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40232851 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 40232950  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40232951 gagtttcttaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 40233050  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  40233051 aagaagaa 40233058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 39889136 - 39889621
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  39889136 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccgttaaaacccaggatctctgcttgg 39889235  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  39889236 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 39889335  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39889336 gatgggcaactacaaggataatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 39889435  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39889436 gatgtccatacttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 39889535  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39889536 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 39889621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 27816126 - 27816533
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  27816126 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 27816225  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  27816226 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 27816325  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27816326 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 27816425  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27816426 gagtttctcaggtctctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 27816525  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  27816526 aagaagaa 27816533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 27776281 - 27776766
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||||||  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27776281 atggaagagagaatggcagaacttgccgaagagctccgtcgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27776380  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27776381 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27776480  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  27776481 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 27776580  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27776581 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtctctatctc 27776680  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27776681 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagcagcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27776766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 37374313 - 37374720
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  37374313 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccagagtttgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 37374412  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  37374413 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 37374512  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37374513 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccacacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 37374612  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37374613 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 37374712  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  37374713 aagaagaa 37374720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13937600 - 13937226
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13937600 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 13937501  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  13937500 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 13937401  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937400 ttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 13937301  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13937300 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgcatcacccctgctttagatgaagaagaa 13937226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 27802766 - 27803251
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27802766 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27802865  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  27802866 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 27802965  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |     
T  27802966 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaggac 27803065  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27803066 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttcttaggtccttatctc 27803165  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803166 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 252 - 538
Target Start/End: Original strand, 34285627 - 34285913
Alignment:
Q  252 agatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaa 351  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |    
T  34285627 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaaga 34285726  T
Q  352 tgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 451  Q
    |||  ||||  | ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34285727 tgatgtccacacttttgatgagctagccgccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 34285826  T
Q  452 cagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34285827 cagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 34285913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 252 - 538
Target Start/End: Original strand, 34290687 - 34290973
Alignment:
Q  252 agatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaa 351  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |    
T  34290687 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaaga 34290786  T
Q  352 tgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 451  Q
    |||  ||||  | ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34290787 tgatgtccacacttttgatgagctagccgccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 34290886  T
Q  452 cagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34290887 cagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 34290973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 21704369 - 21703844
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  21704369 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaagaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccg 21704270  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | ||||||| | || ||||| || || ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| |||    
T  21704269 agggaacggggactctgttaagactcatgacctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatggg 21704170  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  21704169 ctgacttgtccccataaccatatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaa 21704070  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  21704069 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 21703970  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||| |||||||||     
T  21703969 cagattaaaaccaaacagggaatttctcagatccctttcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 21703870  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||    
T  21703869 atcactcccgctcttgatgaagaaga 21703844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19457587 - 19457104
Alignment:
Q  51 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 150  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| | |   ||  || | || ||||| |||||||||||    
T  19457587 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccggggaagtagtgatactgttaagactcatgatctttgctt 19457488  T
Q  151 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 250  Q
    |||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  19457487 ggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagaattcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccga 19457388  T
Q  251 aagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaa 350  Q
    |||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||     
T  19457387 aagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaag 19457288  T
Q  351 atgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatc 450  Q
    ||||| | ||  | |||||||| || || || |||||||| |  ||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  19457287 atgacgttcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaaaccactatgggtttaataccaggttgaaaccaaacagggaatttctcagatccctctc 19457188  T
Q  451 tcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
     || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  19457187 ccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcgcagagatggaggggggcagctgcccgcatcactcccgctcttgatgaaga 19457104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 520
Target Start/End: Original strand, 27392043 - 27392534
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  27392043 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaggaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagtgatact 27392142  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  27392143 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 27392242  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||   |||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |  ||    
T  27392243 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactactttcaagatagtctaatggaagatgctggaga 27392342  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     |||||||| || ||||||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||  |  |||| |||||     
T  27392343 atggtataccagcttgagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggttcaacaccaggctgaaaccaaac 27392442  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcct 520  Q
    ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  27392443 aggga-ttcctcaggtcccttttccagaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggaggggggcagctgcccgtgttactcct 27392534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 51637254 - 51637780
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  51637254 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 51637353  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  51637354 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 51637453  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  51637454 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 51637553  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  51637554 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 51637653  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  51637654 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 51637753  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  51637754 atcactcctgctttagatgaagaagaa 51637780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 10961706 - 10962232
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  10961706 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatgggggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 10961805  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  10961806 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtatcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 10961905  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  10961906 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 10962005  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  10962006 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 10962105  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  10962106 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 10962205  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10962206 atcactcctgctttagatgaggaagaa 10962232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 41794527 - 41794001
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  41794527 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 41794428  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  41794427 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 41794328  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  41794327 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 41794228  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  41794227 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 41794128  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41794127 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 41794028  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41794027 atcactcctactttagatgaggaagaa 41794001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 28584017 - 28584543
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  28584017 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagaaatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 28584116  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28584117 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 28584216  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  28584217 ctaacttgtccccaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 28584316  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  28584317 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 28584416  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28584417 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 28584516  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28584517 atcactcctgctttagatgaggaagaa 28584543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16209243 - 16208719
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  16209243 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatgaaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccg 16209144  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | | ||||| | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||    
T  16209143 agggaacgggaactctattaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatggg 16209044  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  16209043 ctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactataaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaa 16208944  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16208943 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaaaatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 16208844  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||| |||||||||     
T  16208843 cagattgaaaccaaacagggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggag-ggggcagctgcccgc 16208745  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||    
T  16208744 atcactcccgctcttgacgaagaaga 16208719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 519
Target Start/End: Original strand, 20460160 - 20460651
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | |||| ||    
T  20460160 cggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaagatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggaccct 20460259  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  |||| || ||||||||  |||| || ||| |||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  20460260 gttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacattcccaagaagttcaaggtcccagagttcaaccgatacaatgggctgacttgtccccaga 20460359  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |||||||| || || ||    
T  20460360 accacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcaga 20460459  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     ||||| || || ||||||  | | ||||| ||  | |||| ||| || || || |||||||| |  |||||  ||||||| ||  | |||||||||||     
T  20460460 atggtacaccagcttgagccgagacgacattcacacttttgttgaattggctgctgctttcaaaaaccactataggtttaataccaggttgaagccaaac 20460559  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcc 519  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  20460560 agggaatttctcagatccctctcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcactaagatggaggggggcagcttcccgcatcactcc 20460651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 26917415 - 26917940
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26917415 acatcaacacacaacacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactc-gtcatgagatcaaagccaatcg 26917513  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26917514 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 26917613  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26917614 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 26917713  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26917714 tggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacac 26917813  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||| |||||||||     
T  26917814 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacaaagatggaggggggcagctgcccgc 26917913  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  26917914 attactcccgctcttgatgaagaagaa 26917940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16945189 - 16944663
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  16945189 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 16945090  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16945089 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 16944990  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16944989 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 16944890  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16944889 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 16944790  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16944789 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 16944690  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16944689 atcactcctgctttagatgaggaagaa 16944663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 29572047 - 29572573
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  29572047 acatcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 29572146  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  29572147 agggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 29572246  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  29572247 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 29572346  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  29572347 tggaggatgccgcagagtggtacactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 29572446  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  29572447 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 29572546  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29572547 atcactcctgctttagatgaggaagaa 29572573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 16748888 - 16749414
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16748888 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 16748987  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16748988 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 16749087  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16749088 ctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 16749187  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16749188 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccataccttcgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 16749287  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  16749288 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 16749387  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  16749388 attactcccgctcttgatgaagaagaa 16749414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 30559178 - 30558652
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  30559178 acatcaacacacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcg 30559079  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  30559078 agggagtgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 30558979  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  30558978 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 30558879  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  30558878 tggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 30558779  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30558778 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 30558679  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30558678 atcactcctgctttagatgaggaagaa 30558652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15425479 - 15424953
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15425479 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaaatccgtcatgaaattaaagccaatcg 15425380  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15425379 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 15425280  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  15425279 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttga 15425180  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15425179 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 15425080  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  15425079 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 15424980  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  15424979 attactcccgctcttgatgaagaagaa 15424953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13300113 - 13299587
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13300113 acatcaacacaccgtacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcg 13300014  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  13300013 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacggg 13299914  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13299913 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttga 13299814  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13299813 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 13299714  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  13299713 ccgattgaagccgaacagggaattcctcaaatctctctcccagaagaaagaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 13299614  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  13299613 attactcccgctcttgatgaagaagaa 13299587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 26988038 - 26988561
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26988038 acatcaacacacagcatggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 26988137  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  26988138 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgg- 26988236  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26988237 ctaac-tgtcc-cagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 26988334  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26988335 tggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 26988434  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  26988435 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 26988534  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  26988535 attactcccgctcttgatgaagaagaa 26988561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 26999106 - 26999633
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26999106 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatgaaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 26999205  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26999206 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacggg 26999305  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcagga-tagtttg 310  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  26999306 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggattagtttg 26999405  T
Q  311 atggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaaca 410  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26999406 atggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaaca 26999505  T
Q  411 ctcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccg 510  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||| ||    
T  26999506 cccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgctcg 26999605  T
Q  511 tatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
     || |||||  || | ||||||||||||    
T  26999606 cattactcccactcttgatgaagaagaa 26999633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24305780 - 24305254
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24305780 acatcaacacaccatacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaggagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcg 24305681  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24305680 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 24305581  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24305580 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 24305481  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24305480 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 24305381  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| || | ||||||||||    
T  24305380 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaggaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggagcagctgcccgt 24305281  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  24305280 attactcccgctcttgatgaagaagaa 24305254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 24862751 - 24863277
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24862751 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaacaatggaggagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcg 24862850  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24862851 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttagtgtcaaaggtggatatccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 24862950  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24862951 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttga 24863050  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24863051 tggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 24863150  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  24863151 ccgtttgaagccgaacagggagttcctcagatccctctctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 24863250  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  24863251 attactcccgctcttgatgaagaagaa 24863277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22936040 - 22935513
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22936040 acatcaacacacagcgcggaagcatccccgtgatcaaaacaatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcg 22935941  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22935940 agggaatgcagactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 22935841  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  22935840 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttga 22935741  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22935740 tggaagatgctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 22935641  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggta-gctgcccg 510  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||  |||| |||| | ||||||||    
T  22935640 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcgtagagatggaggggggcaggctgcccg 22935541  T
Q  511 tatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
     || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  22935540 cattactcccgctcttgatgaagaagaa 22935513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23858485 - 23857958
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23858485 acatcaacacacagcgcggaagcatccccgtgatcaaaacaatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcg 23858386  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23858385 agggaatgcagactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 23858286  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  23858285 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttga 23858186  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23858185 tggaagatgctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 23858086  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggta-gctgcccg 510  Q
      |||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||  |||| |||| | ||||||||    
T  23858085 cagattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcgtagagatggaggggggcaggctgcccg 23857986  T
Q  511 tatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
     || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  23857985 cattactcccgctcttgatgaagaagaa 23857958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26778748 - 26778263
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  26778748 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 26778649  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26778648 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26778549  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26778548 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 26778449  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26778448 gatgtccacacctttgatgagctagccaccgctttcaggagtcactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 26778349  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26778348 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 26778263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 34464404 - 34463997
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  34464404 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 34464305  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  34464304 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 34464205  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34464204 gtatactagtctgagcaaagatgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 34464105  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34464104 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 34464005  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  34464004 aagaagaa 34463997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 4756836 - 4757321
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4756836 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4756935  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4756936 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4757035  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4757036 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4757135  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4757136 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagtcactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 4757235  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757236 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4757321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 4772072 - 4772557
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4772072 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4772171  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4772172 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4772271  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4772272 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4772371  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4772372 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 4772471  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772472 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4772557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 29548553 - 29549038
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  29548553 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 29548652  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  |||||||||| || ||    
T  29548653 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgttcggaa 29548752  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29548753 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 29548852  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29548853 gatgtccacacttttgatgagctagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 29548952  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29548953 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggaagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 29549038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 4524364 - 4524849
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  4524364 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggatctctgcttgg 4524463  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4524464 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4524563  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4524564 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4524663  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4524664 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 4524763  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4524764 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4524849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 29500559 - 29500966
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  29500559 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 29500658  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  29500659 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 29500758  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29500759 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccattacgggtttaacactcgattgaagccgaatagg 29500858  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29500859 gagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatg 29500958  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  29500959 aagaagaa 29500966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 27043464 - 27043950
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27043464 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaacccaggatctctgcttag 27043563  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgtt-cctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaa 251  Q
    | || || || |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  27043564 tatcgaaggtagatgttaccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgga 27043663  T
Q  252 agatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaa 351  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |    
T  27043664 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaaga 27043763  T
Q  352 tgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatct 451  Q
    |||  ||||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27043764 tgatgtccacacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatct 27043863  T
Q  452 cagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043864 cagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27043950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 3695177 - 3695662
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  3695177 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 3695276  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  3695277 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 3695376  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  3695377 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 3695476  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695477 gatgtccatacttttgatgaactagccgctgctttcaagagccattacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 3695576  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3695577 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgcatcacccctgctttagatgaagaagaa 3695662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 16673202 - 16673687
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  16673202 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 16673301  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  16673302 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 16673401  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16673402 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 16673501  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16673502 gatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 16673601  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16673602 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgccttagatgaagaagaa 16673687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 28206517 - 28207002
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  28206517 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 28206616  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  28206617 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 28206716  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28206717 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 28206816  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206817 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 28206916  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206917 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 28207002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4546905 - 4546420
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  4546905 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 4546806  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4546805 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4546706  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  4546705 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagac 4546606  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546605 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 4546506  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546505 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4546420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 27006787 - 27007272
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27006787 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27006886  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  27006887 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 27006986  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27006987 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 27007086  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27007087 gatgtccatacctttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 27007186  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007187 agaaaaaggaggagagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27007272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 131 - 538
Target Start/End: Original strand, 17024415 - 17024822
Alignment:
Q  131 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 230  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  17024415 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 17024514  T
Q  231 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 330  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  17024515 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 17024614  T
Q  331 gtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagg 430  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17024615 gtatactagtctgagcaaagacgatgtccatacttttgatgagctagccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagg 17024714  T
Q  431 gagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatg 530  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17024715 gagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcacccctgctttagatg 17024814  T
Q  531 aagaagaa 538  Q
    ||||||||    
T  17024815 aagaagaa 17024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4725264 - 4724779
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || ||||| |    
T  4725264 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttag 4725165  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4725164 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4725065  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  4725064 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 4724965  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724964 gatgtccatacttttgatgagctagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 4724865  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724864 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 4724779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27361131 - 27360646
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27361131 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27361032  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27361031 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27360932  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  27360931 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 27360832  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27360831 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 27360732  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27360731 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcacaaagatggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27360646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27451474 - 27450989
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27451474 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27451375  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27451374 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27451275  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  27451274 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 27451175  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27451174 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctc 27451075  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27451074 agaaaaaggaggaaagtttccgggaatatgcacaaagatggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 27450989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26117429 - 26117055
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  26117429 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaact 26117330  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  26117329 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 26117230  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     ||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26117229 ttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctcagaaaaaggag 26117130  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26117129 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtattactcctgctttagatgaagaagaa 26117055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 538
Target Start/End: Original strand, 27484303 - 27484677
Alignment:
Q  164 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  27484303 gatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 27484402  T
Q  264 aaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatcc 363  Q
    | || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |    
T  27484403 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccatac 27484502  T
Q  364 ctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggag 463  Q
     |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27484503 ttttgatgagttggccactgctttcaagagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagttcctcaggtccctatctcagaaaaaggag 27484602  T
Q  464 gaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27484603 gaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatgactcctgctttagatgaagaagaa 27484677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27630697 - 27630349
Alignment:
Q  186 tcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttat 285  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  27630697 tcccggagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatcaaatatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgactcacttat 27630598  T
Q  286 gatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgct 385  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||| || ||| | || ||     
T  27630597 gatccactgcttccaggatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactggtttgagcaaggatgacatccatacttttgacgagttatctgctgcc 27630498  T
Q  386 ttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgc 485  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  27630497 ttcaagagtcattacgggttcaataccagattaaagccaaatagggaatctctcaggtccctctctcagaagaaggacgaaagtttccgtgaatatgccc 27630398  T
Q  486 aaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    ||||  ||||  | |  ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  27630397 aaagatggaggagagctgctgcccgtattactcccgctctagaagaaga 27630349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 27273628 - 27273223
Alignment:
Q  130 caaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaac 229  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || || || |||||  |||| || ||||||  |||||||||||| || |||||||||||     
T  27273628 caaaactcatgatctttgtttggtatccaaagtggacatcccgaagaaattcaagctcccagagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaat 27273529  T
Q  230 cacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagt 329  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27273528 catatcatcaagtatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagt 27273429  T
Q  330 ggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgat-ttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaata 428  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  | ||||| ||| ||| | || || ||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  27273428 ggtatactggtttgagcaaggatgacatccacacttttgacgatgttatctgctgccttcaagagtcattacgggttcaataccagattaaagccaaata 27273329  T
Q  429 gggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttaga 528  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| || |  ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  27273328 gggaatctctcaggtccctctctcagaagaaagacgaaagtttccgtgaatatgcccaaagatggaggggagctgctgcccgtattactcccgctctaga 27273229  T
Q  529 tgaaga 534  Q
     |||||    
T  27273228 ggaaga 27273223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 537
Target Start/End: Original strand, 20159774 - 20160266
Alignment:
Q  51 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaa------aactcaagatct 144  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || |||||    ||| || | ||      || ||| |||||    
T  20159774 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacagtgaccctgttaatgttaaaaatcatgatct 20159873  T
Q  145 ttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat 244  Q
     ||||||||  |||  |||||  | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||     
T  20159874 atgcttggtaccaagggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtac 20159973  T
Q  245 gtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttga 344  Q
    ||||| |||||| | || ||    ||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  20159974 gtccgcaagatgagtaactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttga 20160073  T
Q  345 gcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtc 444  Q
    ||||  |||||||| || | |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  20160074 gcaaggatgacatctatacttttgatgaattagctgctgctttcaaaaaccactatgggtttaatactaggctgaaaccaaacagggaatttctcagatc 20160173  T
Q  445 cctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
     || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20160174 tctttcccaaaagaaagatgaaagcttccgtgaatatgcccagagatggagaggggcagctgcccgtatcactcccgctcttgatgaagaaga 20160266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 22173057 - 22172565
Alignment:
Q  51 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaa------aactcaagatct 144  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || |||||    ||| || | ||      || ||| |||||    
T  22173057 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacagtgaccctgttaatgttaaaaatcatgatct 22172958  T
Q  145 ttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat 244  Q
     ||||||||  |||  |||||  | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||     
T  22172957 atgcttggtaccaagggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtac 22172858  T
Q  245 gtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttga 344  Q
    ||||| |||||| | || ||    ||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  22172857 gtccgcaagatgagtaactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttga 22172758  T
Q  345 gcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtc 444  Q
    ||||  |||||||| || | |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |  |||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  22172757 gcaaggatgacatctatacttttgatgaattagctgctgctttcaaaaaccactatgggtttaatactaggctgaaaccaaacagggaatttctcagatc 22172658  T
Q  445 cctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
     || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22172657 tctttcccaaaagaaagatgaaagcttccgtgaatatgcccagagatggagaggggcagctgcccgtatcactcccgctcttgatgaagaaga 22172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1349 - 823
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1349 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaagaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 1250  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1249 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacggg 1150  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1149 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 1050  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1049 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 950  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  ||||||||| |||||||||     
T  949 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggagaggggcagctgcccgc 850  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  849 attactcccgctcttgatgaagaagaa 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16146 - 15623
Alignment:
Q  15 tcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||    
T  16146 tcaacacacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagg 16047  T
Q  115 gaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggcta 214  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16046 gaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccgatacaacgggcta 15947  T
Q  215 acctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatgg 314  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15946 acttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatgg 15847  T
Q  315 aagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcg 414  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15846 aggatgccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcg 15747  T
Q  415 attgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatc 514  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  15746 actgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatc 15647  T
Q  515 actcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  15646 actcctgctttagatgaggaagaa 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8458 - 7932
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  8458 acatcaacacacagtacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagaaatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcg 8359  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
      ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8358 atggaatgcagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacggg 8259  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  8258 ctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctga 8159  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8158 tggaggatgccgcaaagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacac 8059  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  8058 tcgactgaggccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgt 7959  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7958 atcactcctgctttagatgaggaagaa 7932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 26329 - 26855
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26329 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 26428  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26429 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 26528  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26529 ctaacttgtcctcagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttga 26628  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26629 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 26728  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||| ||     
T  26729 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgctcgc 26828  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  26829 attactcccgctcttgatgaagaagaa 26855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 29490 - 30016
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29490 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcg 29589  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29590 agggaatgcggactctttctaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacggg 29689  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29690 ctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttga 29789  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29790 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaagagccactatgggtttaacac 29889  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||| | || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||| ||     
T  29890 ccgattgaagccgaacaggaaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgctcgc 29989  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  29990 attactcccgctcttgatgaagaagaa 30016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 537
Target Start/End: Original strand, 19448 - 19974
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  19448 acatcaacgcgcatcacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccg 19547  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     ||||| | ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||    
T  19548 agggaacggggactctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaagtcccagagttcgaccgatacaatggg 19647  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  19648 ctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaa 19747  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  19748 tggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 19847  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaaggggga-gaggggtagctgcccg 510  Q
      | ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||  ||| | |||| ||||| |||    
T  19848 caggttgaaaccaaacagggaattcctcagatccctttcccaaaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagagatggagggggggcagctgtccg 19947  T
Q  511 tatcactcctgctttagatgaagaaga 537  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||    
T  19948 catcactcccgctcttgatgaagaaga 19974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 48204 - 47678
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48204 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcg 48105  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48104 aggaaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacggg 48005  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48004 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggaaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttga 47905  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47904 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccataccttcgatgaattagccgttgctttcaagagccactatgggtttaacac 47805  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  47804 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 47705  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  47704 attactcccgctcttgatgaagaagaa 47678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 41288 - 40762
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41288 acatcaacacacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcg 41189  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41188 agggaatgcggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatggg 41089  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  41088 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttga 40989  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  40988 tggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgttgctttcaaaagccactatgggtttaacac 40889  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
      |||||||||| || || || || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||| |||| |||||||||     
T  40888 cagattgaagccgaacagagaattcctcagatctctctcgcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcacagagatggaggggggcagctgcccgc 40789  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  40788 attactcccgctcttgatgaagaagaa 40762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 28800 - 29326
Alignment:
Q  12 acatcaacacacagcacggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  28800 acatcaacacacaccacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatca 28899  T
Q  112 ggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacggg 211  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28900 agggaatgcggactctttcaagactcaggatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatggg 28999  T
Q  212 ctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttga 311  Q
    || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  29000 ctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttga 29099  T
Q  312 tggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacac 411  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  29100 tggaagatgctacagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttgatgaattagccgctgctttcaaaagccactatgggtttaatac 29199  T
Q  412 tcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgt 511  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||| |||||||||     
T  29200 ccgattgaagccgaacagggaattcctcagatctctctcccaaaagaaggaggaaagcttccgtgaatacgcgcagagatggaggggggcagctgcccgc 29299  T
Q  512 atcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||    
T  29300 attactcccgctcttgatgaagaagaa 29326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7795
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  7310 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccatcaaaacccaggatctctgcttag 7409  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  7410 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 7509  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |     
T  7510 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagac 7609  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7610 gatgtccatacttttgatgaactagccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgattgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 7709  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7710 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 7795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 53 - 538
Target Start/End: Original strand, 7015 - 7500
Alignment:
Q  53 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 152  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  7015 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 7114  T
Q  153 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 252  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  7115 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 7214  T
Q  253 gatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaaaaat 352  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7215 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagat 7314  T
Q  353 gacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcaggtccctatctc 452  Q
    ||  ||||| | ||||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315 gatgtccatacttttgatgagctggccaccgctttcaggagccactacgggtttaacactcgtttgaagccgaatagggagtttctcaggtccctatctc 7414  T
Q  453 agaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7415 agaaaaaggaggaaagtttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcagctgcccgtatcactcctgctttagatgaagaagaa 7500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 326 - 538
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5550
Alignment:
Q  326 gagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaa 425  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  5339 gagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttgatgagttagccaccgctttcaagagccattatgggtttaacactcgactgaggccaa 5438  T
Q  426 atagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgcttt 525  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5439 atagg-agtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatcactcctgcttt 5537  T
Q  526 agatgaagaagaa 538  Q
    |||||| ||||||    
T  5538 agatgaggaagaa 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 140 - 534
Target Start/End: Original strand, 40826 - 41220
Alignment:
Q  140 gatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatca 239  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || || |||||  |||| || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  40826 gatctatgtttggtatccaaagtggacattccgaagaaattcaagctcccagaattcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatca 40925  T
Q  240 aatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactag 339  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40926 agtatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgccgcagagtggtatactgg 41025  T
Q  340 tttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctc 439  Q
    |||||||||  |||| |||||  | ||||| || ||| | || || ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  41026 tttgagcaaggatgatatccacacttttgacgaattatctgctgccttcaagagtcattacgggttcaataccagattgaagccaaatagggaatctctc 41125  T
Q  440 aggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcctgctttagatgaaga 534  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| || |  ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  41126 aggtccctctctcagaagaaagacgaaagtttccgtgaatatgcccaaagatggaggggagctgctgcccgtattactcccgctctagaggaaga 41220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49348 - 48959
Alignment:
Q  64 gatggaggaacttg-ctaaagaactccgtcat-gagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaag-atctttgcttggtgtcaaaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |  ||    
T  49348 gatggaggaacttgactaaagaactccgtcatagaaatcaaagctaatcgagggaatgcggactctttcaagactcagggatctctgcttggtgccgtaa 49249  T
Q  161 g-tggatgttcc-taaaaagttcaaaa-tcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat-gtccgaaagatg 256  Q
    | ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49248 ggtggatgtaccctaagaagttcaaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatagtccgaaagatg 49149  T
Q  257 ggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatc-cacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgct-gagtggtatactagtttgagcaaaaatga 354  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||  ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49148 ggtaactacaaagacaatgattcactcatgatttcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgctagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 49049  T
Q  355 catccat-ccctttgatgatttagccgccgc-tttcaagagtcacta-cgggtttaacactcgattgaagccaaatagggagtttctcag 441  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| || |||||  |||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||    
T  49048 catccataccttttgatgaattagccgctgcgtttcaaaagccactatggggtttaacaccagattgaagccgaacagggagttcctcag 48959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 520
Target Start/End: Original strand, 20620 - 21112
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  20620 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaggaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagtgatact 20719  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  20720 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 20819  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  20820 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 20919  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     |||||||| || ||||||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||  |  |||| |||||     
T  20920 atggtataccagcttgagccgagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggttcaacaccaggctgaaaccaaac 21019  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcct 520  Q
    ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |   |||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  21020 agggaattcctcaggtcccttttccagaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgcacagatatggaggggggcagctgcccgtgttactcct 21112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 121384 - 120929
Alignment:
Q  28 cggaagcatccccgtaactaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 127  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||| ||||||||   |   ||  ||    
T  121384 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgttaaggaactccgtcggtaaattaaagctaatcggggatgtagtgatact 121285  T
Q  128 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 227  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  121284 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 121185  T
Q  228 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattaaaaagacaatgattcccttatgatccacggctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 327  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  121184 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 121085  T
Q  328 gtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatccctttgatgatttagccgccgctttcaagagtcactacgggtttaacactcgattgaagccaaat 427  Q
     |||||||| || || |||  | | ||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||  |  |||| |||||     
T  121084 atggtataccagctttagcttagacgacattcacacttttgatgaattggctgctgctttcaaaagccactatgggttcaacaccaggctgaaaccaaac 120985  T
Q  428 agggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtgagtatgc 483  Q
    ||||| || |||| | |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  120984 agggaattcctcaagccccttttacagaagaaagatgaaagcttccgcgagtatgc 120929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 421 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 27013 - 26895
Alignment:
Q  421 gccaaatagggagtttctcaggtccctatctcagaagaaggaggaaagcttccgtg-agtatgcgcaaagggggagaggggtagctgcccgtatcactcc 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  27013 gccaaatagggagtttctcaggtcctaatctcagaagaaggaggaaagtttccgtgaaatatgcgcaaaggtggagaggggcggctgcccgtatcactcc 26914  T
Q  520 tgctttagatgaagaagaa 538  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  26913 tgctttagatgaggaagaa 26895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 104
Alignment:
Q  64 gatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  145 gatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagc 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University