View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6856_low_5 (Length: 497)

Name: NF6856_low_5
Description: NF6856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6856_low_5
NF6856_low_5
[»] chr8 (123 HSPs)
chr8 (183-478)||(9992797-9993102)
chr8 (183-478)||(44295446-44295752)
chr8 (183-478)||(8054486-8054791)
chr8 (183-478)||(41996675-41996979)
chr8 (184-478)||(32104516-32104822)
chr8 (183-477)||(5457202-5457507)
chr8 (183-478)||(16996567-16996873)
chr8 (183-478)||(37129352-37129659)
chr8 (186-478)||(9270151-9270453)
chr8 (183-478)||(32412920-32413226)
chr8 (183-478)||(36545460-36545765)
chr8 (183-478)||(31712752-31713060)
chr8 (186-479)||(5989759-5990046)
chr8 (183-467)||(5328095-5328383)
chr8 (183-478)||(16937017-16937323)
chr8 (242-478)||(31874214-31874457)
chr8 (183-478)||(12248389-12248698)
chr8 (183-476)||(3925369-3925672)
chr8 (194-478)||(10042902-10043195)
chr8 (347-478)||(14115681-14115812)
chr8 (194-478)||(32256410-32256705)
chr8 (183-478)||(17019248-17019536)
chr8 (183-478)||(17549685-17549973)
chr8 (186-478)||(15665669-15665974)
chr8 (183-336)||(9799689-9799842)
chr8 (183-478)||(12243894-12244200)
chr8 (184-478)||(23766869-23767174)
chr8 (186-334)||(18190532-18190680)
chr8 (183-324)||(16937950-16938091)
chr8 (183-474)||(2629046-2629349)
chr8 (190-432)||(32061970-32062223)
chr8 (184-338)||(10148232-10148392)
chr8 (186-338)||(14530597-14530749)
chr8 (187-418)||(1215023-1215265)
chr8 (183-460)||(13977556-13977846)
chr8 (184-325)||(2024897-2025044)
chr8 (190-330)||(10338510-10338656)
chr8 (186-478)||(27534093-27534396)
chr8 (183-325)||(14600370-14600518)
chr8 (190-455)||(37719993-37720268)
chr8 (9-85)||(9993204-9993280)
chr8 (183-325)||(23970860-23971003)
chr8 (183-422)||(18994075-18994317)
chr8 (183-325)||(4757457-4757605)
chr8 (345-478)||(37659096-37659229)
chr8 (186-326)||(11298443-11298583)
chr8 (183-331)||(31202752-31202905)
chr8 (183-325)||(24790842-24790988)
chr8 (188-325)||(24700141-24700287)
chr8 (188-476)||(31147512-31147811)
chr8 (184-338)||(32778645-32778805)
chr8 (190-338)||(16809144-16809291)
chr8 (183-478)||(7280807-7281111)
chr8 (183-323)||(11162197-11162343)
chr8 (183-325)||(2234142-2234290)
chr8 (183-329)||(13575881-13576033)
chr8 (196-305)||(15237231-15237340)
chr8 (183-325)||(37612945-37613093)
chr8 (183-304)||(28296787-28296914)
chr8 (183-294)||(26538709-26538820)
chr8 (183-325)||(5526111-5526259)
chr8 (183-325)||(9501878-9502025)
chr8 (183-325)||(30026554-30026702)
chr8 (189-334)||(32920929-32921074)
chr8 (183-332)||(7014151-7014294)
chr8 (189-329)||(7269150-7269290)
chr8 (183-338)||(12357076-12357229)
chr8 (183-338)||(13570439-13570598)
chr8 (226-325)||(39067411-39067510)
chr8 (183-294)||(7579527-7579644)
chr8 (368-478)||(26937655-26937765)
chr8 (183-253)||(37659226-37659296)
chr8 (183-325)||(43936852-43937000)
chr8 (183-325)||(19720318-19720470)
chr8 (225-325)||(40490253-40490353)
chr8 (183-325)||(1809910-1810042)
chr8 (266-478)||(5917510-5917726)
chr8 (229-315)||(22787809-22787895)
chr8 (183-325)||(41362041-41362190)
chr8 (195-391)||(283701-283885)
chr8 (195-391)||(631992-632176)
chr8 (195-391)||(817804-817988)
chr8 (196-325)||(31308457-31308592)
chr8 (190-329)||(18196831-18196970)
chr8 (225-325)||(15286753-15286853)
chr8 (225-325)||(15467122-15467222)
chr8 (225-303)||(3204506-3204584)
chr8 (183-315)||(6833646-6833774)
chr8 (225-325)||(37128215-37128308)
chr8 (225-325)||(31407471-31407568)
chr8 (359-418)||(18190711-18190770)
chr8 (184-293)||(10951970-10952084)
chr8 (184-293)||(10959975-10960089)
chr8 (350-432)||(11298616-11298698)
chr8 (183-224)||(31874459-31874500)
chr8 (271-338)||(3028297-3028364)
chr8 (401-476)||(3681055-3681130)
chr8 (183-291)||(35778777-35778891)
chr8 (225-303)||(12329958-12330036)
chr8 (225-329)||(28298458-28298559)
chr8 (347-409)||(32920843-32920905)
chr8 (183-253)||(45310908-45310978)
chr8 (382-478)||(14327609-14327705)
chr8 (265-314)||(14918429-14918478)
chr8 (183-219)||(2968936-2968972)
chr8 (184-329)||(4928218-4928369)
chr8 (366-469)||(13864498-13864601)
chr8 (347-476)||(26582745-26582870)
chr8 (249-300)||(45445677-45445728)
chr8 (184-230)||(589029-589075)
chr8 (184-230)||(624847-624893)
chr8 (232-294)||(26673509-26673571)
chr8 (248-290)||(42447874-42447916)
chr8 (268-333)||(12111103-12111168)
chr8 (183-223)||(19443856-19443897)
chr8 (226-307)||(26582625-26582706)
chr8 (190-294)||(36261279-36261384)
chr8 (231-295)||(2656060-2656124)
chr8 (183-215)||(7883044-7883076)
chr8 (265-313)||(10334813-10334861)
chr8 (183-231)||(10334885-10334933)
chr8 (265-329)||(20993097-20993161)
chr8 (183-219)||(38545488-38545524)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (184-478)||(23067527-23067832)
chr4 (183-478)||(4634413-4634719)
chr4 (183-478)||(9661983-9662289)
chr4 (183-478)||(46716572-46716878)
chr4 (183-478)||(14542190-14542496)
chr4 (183-476)||(53903713-53904015)
chr4 (183-478)||(41486705-41487010)
chr4 (183-476)||(54420418-54420723)
chr4 (191-478)||(9474224-9474523)
chr4 (196-478)||(30469814-30470107)
chr4 (184-470)||(37869097-37869393)
chr4 (190-478)||(42972168-42972467)
chr4 (217-468)||(52555452-52555714)
chr4 (217-479)||(34115368-34115636)
chr4 (226-478)||(32189110-32189372)
chr4 (184-478)||(20961578-20961883)
chr4 (183-478)||(14346561-14346867)
chr4 (183-478)||(29474006-29474312)
chr4 (183-478)||(43156906-43157213)
chr4 (183-478)||(46728598-46728904)
chr4 (184-333)||(23002612-23002760)
chr4 (183-478)||(7242464-7242753)
chr4 (183-478)||(15729659-15729965)
chr4 (236-478)||(31601087-31601342)
chr4 (183-478)||(38434729-38435034)
chr4 (183-478)||(44374953-44375248)
chr4 (184-478)||(16992002-16992306)
chr4 (183-478)||(51646224-51646528)
chr4 (188-478)||(6789559-6789860)
chr4 (184-476)||(46775537-46775838)
chr4 (184-470)||(29589040-29589337)
chr4 (186-331)||(626226-626377)
chr4 (183-476)||(9549571-9549868)
chr4 (343-478)||(3169556-3169691)
chr4 (189-432)||(23926217-23926471)
chr4 (186-337)||(50981395-50981546)
chr4 (186-471)||(50002874-50003153)
chr4 (186-418)||(33020608-33020851)
chr4 (183-478)||(4959252-4959557)
chr4 (184-338)||(6082111-6082264)
chr4 (183-478)||(29576799-29577106)
chr4 (183-338)||(6408726-6408881)
chr4 (186-329)||(3673778-3673921)
chr4 (184-322)||(25658479-25658617)
chr4 (183-329)||(7060619-7060771)
chr4 (183-325)||(20887421-20887569)
chr4 (213-478)||(28990428-28990704)
chr4 (183-311)||(30416305-30416434)
chr4 (184-328)||(53647912-53648063)
chr4 (183-331)||(7083485-7083639)
chr4 (183-309)||(34668497-34668622)
chr4 (194-387)||(40861176-40861363)
chr4 (183-329)||(477685-477837)
chr4 (183-325)||(11209977-11210125)
chr4 (183-329)||(36124021-36124173)
chr4 (183-325)||(45350734-45350882)
chr4 (183-325)||(45360213-45360361)
chr4 (183-478)||(2945267-2945574)
chr4 (343-478)||(1645404-1645539)
chr4 (347-478)||(30416446-30416577)
chr4 (186-322)||(32616526-32616668)
chr4 (183-325)||(393938-394086)
chr4 (186-327)||(5388805-5388946)
chr4 (183-328)||(31311761-31311904)
chr4 (183-325)||(31522255-31522403)
chr4 (183-329)||(38943821-38943973)
chr4 (183-325)||(42197862-42198010)
chr4 (227-331)||(26674666-26674770)
chr4 (183-329)||(26742136-26742288)
chr4 (185-325)||(6911989-6912135)
chr4 (347-478)||(46386627-46386758)
chr4 (183-329)||(4622382-4622527)
chr4 (225-471)||(35658251-35658507)
chr4 (183-325)||(8517123-8517271)
chr4 (183-325)||(13965852-13966000)
chr4 (183-293)||(24568379-24568495)
chr4 (225-478)||(26576223-26576486)
chr4 (183-325)||(43244045-43244193)
chr4 (184-391)||(3159211-3159418)
chr4 (347-478)||(12519786-12519917)
chr4 (225-328)||(47466208-47466311)
chr4 (375-473)||(1125076-1125174)
chr4 (183-294)||(7084280-7084399)
chr4 (183-325)||(8712816-8712965)
chr4 (184-291)||(27395159-27395272)
chr4 (183-329)||(31932552-31932704)
chr4 (183-325)||(39837903-39838051)
chr4 (225-329)||(22757390-22757493)
chr4 (386-478)||(40859804-40859896)
chr4 (183-329)||(6882252-6882401)
chr4 (183-294)||(18502506-18502623)
chr4 (183-338)||(28837352-28837512)
chr4 (183-478)||(38169836-38170143)
chr4 (183-325)||(50801511-50801659)
chr4 (183-329)||(51152420-51152571)
chr4 (183-262)||(12519976-12520055)
chr4 (183-294)||(30202378-30202495)
chr4 (183-285)||(24611462-24611570)
chr4 (183-329)||(37431461-37431613)
chr4 (183-325)||(46267975-46268122)
chr4 (183-329)||(55600210-55600362)
chr4 (186-338)||(5814627-5814785)
chr4 (186-325)||(20399569-20399715)
chr4 (184-326)||(19885645-19885787)
chr4 (183-338)||(27091004-27091165)
chr4 (225-338)||(11817337-11817449)
chr4 (183-329)||(12716796-12716948)
chr4 (183-329)||(56236495-56236647)
chr4 (234-434)||(1657295-1657506)
chr4 (194-254)||(3169742-3169802)
chr4 (397-477)||(6408574-6408654)
chr4 (183-322)||(24100452-24100590)
chr4 (190-338)||(26625369-26625516)
chr4 (183-294)||(29266568-29266684)
chr4 (183-285)||(44756703-44756811)
chr4 (194-254)||(1645293-1645353)
chr4 (184-329)||(24789479-24789632)
chr4 (184-329)||(24818627-24818780)
chr4 (347-478)||(4622562-4622693)
chr4 (185-307)||(9781490-9781609)
chr4 (194-329)||(22066745-22066880)
chr4 (191-253)||(10680692-10680754)
chr4 (191-253)||(10894332-10894394)
chr4 (225-338)||(4518634-4518747)
chr4 (225-326)||(7860921-7861022)
chr4 (183-320)||(33288821-33288957)
chr4 (183-295)||(40198221-40198334)
chr4 (236-329)||(56172118-56172211)
chr4 (191-271)||(10665522-10665602)
chr4 (191-271)||(10879667-10879747)
chr4 (217-329)||(15182764-15182876)
chr4 (265-325)||(39523719-39523779)
chr4 (231-290)||(1532108-1532167)
chr4 (225-303)||(22621746-22621825)
chr4 (183-262)||(38545831-38545910)
chr4 (184-291)||(44021260-44021366)
chr4 (347-422)||(44021434-44021509)
chr4 (225-332)||(56062276-56062383)
chr4 (191-253)||(10715981-10716043)
chr4 (191-253)||(10929751-10929813)
chr4 (183-229)||(24826050-24826096)
chr4 (347-429)||(31311647-31311729)
chr4 (347-413)||(38545938-38546004)
chr4 (230-290)||(4644058-4644118)
chr4 (276-336)||(9255074-9255134)
chr4 (183-325)||(19745698-19745847)
chr4 (183-325)||(19793959-19794108)
chr4 (347-430)||(9526198-9526281)
chr4 (266-329)||(31994318-31994381)
chr4 (190-329)||(47923551-47923690)
chr4 (347-413)||(5388710-5388776)
chr4 (347-409)||(11817255-11817317)
chr4 (191-329)||(17220075-17220213)
chr4 (235-293)||(22121769-22121827)
chr4 (234-294)||(3171345-3171404)
chr4 (347-391)||(5814563-5814607)
chr4 (347-391)||(8712747-8712791)
chr4 (191-279)||(10710450-10710538)
chr4 (191-279)||(10924220-10924308)
chr4 (230-302)||(21662625-21662697)
chr4 (230-302)||(21671389-21671461)
chr4 (265-329)||(22049171-22049235)
chr4 (347-419)||(29257414-29257486)
chr4 (231-295)||(34024268-34024332)
chr4 (225-293)||(46829733-46829801)
[»] chr5 (120 HSPs)
chr5 (186-478)||(29310035-29310338)
chr5 (183-478)||(6886856-6887162)
chr5 (183-478)||(31645959-31646265)
chr5 (183-478)||(28618732-28619038)
chr5 (183-476)||(35906401-35906705)
chr5 (183-478)||(4070681-4070986)
chr5 (183-478)||(10923812-10924117)
chr5 (183-478)||(5378432-5378738)
chr5 (183-478)||(20270844-20271151)
chr5 (183-476)||(41554619-41554923)
chr5 (183-478)||(9034623-9034926)
chr5 (183-478)||(33486247-33486553)
chr5 (184-478)||(2415530-2415837)
chr5 (183-478)||(18472404-18472710)
chr5 (183-478)||(19645715-19646025)
chr5 (183-476)||(6647587-6647895)
chr5 (190-478)||(8811837-8812135)
chr5 (183-477)||(15710673-15710980)
chr5 (184-326)||(3495139-3495281)
chr5 (183-479)||(34844045-34844352)
chr5 (347-477)||(4726781-4726911)
chr5 (184-476)||(34873993-34874285)
chr5 (183-474)||(40774894-40775197)
chr5 (186-418)||(40564838-40565081)
chr5 (184-472)||(32387601-32387899)
chr5 (183-472)||(29154356-29154656)
chr5 (190-472)||(28500825-28501118)
chr5 (183-338)||(11734509-11734670)
chr5 (186-324)||(37219298-37219435)
chr5 (186-427)||(6074417-6074669)
chr5 (183-325)||(20483495-20483643)
chr5 (188-413)||(20145902-20146138)
chr5 (214-470)||(32390373-32390623)
chr5 (184-327)||(28662362-28662505)
chr5 (183-325)||(6281353-6281501)
chr5 (183-338)||(34866712-34866868)
chr5 (183-338)||(14910354-14910509)
chr5 (183-337)||(17325342-17325494)
chr5 (183-329)||(41358319-41358470)
chr5 (186-325)||(17095908-17096053)
chr5 (183-325)||(26293919-26294067)
chr5 (188-470)||(8957344-8957637)
chr5 (185-325)||(26294740-26294886)
chr5 (347-478)||(41063249-41063380)
chr5 (183-293)||(37425448-37425558)
chr5 (183-325)||(17699862-17700010)
chr5 (183-325)||(17732051-17732198)
chr5 (183-314)||(177768-177905)
chr5 (186-325)||(2555017-2555162)
chr5 (183-322)||(7771485-7771630)
chr5 (347-476)||(13007824-13007952)
chr5 (183-325)||(28040938-28041086)
chr5 (183-325)||(39179509-39179657)
chr5 (183-329)||(42505077-42505227)
chr5 (366-478)||(22397420-22397532)
chr5 (183-322)||(39308431-39308568)
chr5 (183-325)||(39531072-39531224)
chr5 (183-338)||(29098076-29098237)
chr5 (375-473)||(34893825-34893923)
chr5 (187-325)||(6635557-6635701)
chr5 (183-327)||(12439359-12439503)
chr5 (186-339)||(12524345-12524498)
chr5 (183-325)||(17331637-17331785)
chr5 (183-325)||(18654091-18654239)
chr5 (184-330)||(27241359-27241511)
chr5 (183-329)||(32347387-32347539)
chr5 (183-329)||(3740636-3740789)
chr5 (183-285)||(17218058-17218159)
chr5 (225-331)||(23428546-23428652)
chr5 (347-476)||(13079277-13079405)
chr5 (183-325)||(23881780-23881928)
chr5 (183-310)||(6681541-6681674)
chr5 (187-307)||(24288641-24288760)
chr5 (187-307)||(24373462-24373581)
chr5 (183-294)||(33164133-33164250)
chr5 (183-325)||(34431366-34431521)
chr5 (226-325)||(980739-980841)
chr5 (183-239)||(4726681-4726737)
chr5 (225-325)||(42609453-42609553)
chr5 (183-294)||(32309836-32309953)
chr5 (183-294)||(42781341-42781458)
chr5 (183-329)||(25962209-25962361)
chr5 (183-239)||(28423714-28423770)
chr5 (403-478)||(41358169-41358244)
chr5 (347-478)||(41988282-41988413)
chr5 (183-315)||(42396174-42396312)
chr5 (227-293)||(37425343-37425409)
chr5 (227-322)||(3079047-3079143)
chr5 (347-476)||(13080285-13080415)
chr5 (343-419)||(25770795-25770871)
chr5 (185-285)||(11647533-11647639)
chr5 (228-287)||(26905364-26905423)
chr5 (190-329)||(39591338-39591477)
chr5 (233-328)||(43494180-43494275)
chr5 (183-294)||(13422108-13422215)
chr5 (344-478)||(37425154-37425283)
chr5 (359-432)||(17325527-17325600)
chr5 (233-294)||(26240413-26240474)
chr5 (183-294)||(586083-586197)
chr5 (225-285)||(907658-907718)
chr5 (232-288)||(17523256-17523312)
chr5 (183-231)||(29663039-29663087)
chr5 (347-413)||(12524517-12524583)
chr5 (380-478)||(34866557-34866655)
chr5 (184-295)||(39558168-39558285)
chr5 (347-432)||(35455268-35455353)
chr5 (183-223)||(9196695-9196735)
chr5 (183-262)||(13079458-13079537)
chr5 (184-219)||(19200261-19200296)
chr5 (183-281)||(22923625-22923722)
chr5 (183-322)||(25770903-25771046)
chr5 (268-338)||(28388871-28388941)
chr5 (268-305)||(39915789-39915826)
chr5 (213-262)||(41988428-41988477)
chr5 (183-215)||(13007480-13007512)
chr5 (265-337)||(20187391-20187463)
chr5 (230-290)||(20257525-20257585)
chr5 (231-295)||(27266689-27266753)
chr5 (265-329)||(39416018-39416082)
chr5 (265-329)||(39532101-39532165)
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (183-478)||(3088342-3088648)
chr3 (183-478)||(43029813-43030119)
chr3 (183-478)||(50519913-50520219)
chr3 (184-478)||(1165075-1165380)
chr3 (183-478)||(22286430-22286735)
chr3 (190-478)||(28994994-28995293)
chr3 (183-476)||(45664353-45664657)
chr3 (183-478)||(20202918-20203224)
chr3 (183-478)||(20200736-20201042)
chr3 (183-478)||(21803660-21803967)
chr3 (190-478)||(29182295-29182592)
chr3 (184-478)||(33977604-33977909)
chr3 (183-473)||(33076419-33076721)
chr3 (183-467)||(43839195-43839490)
chr3 (183-478)||(47914271-47914578)
chr3 (183-473)||(11846684-11846984)
chr3 (185-478)||(912992-913300)
chr3 (183-338)||(10977524-10977679)
chr3 (223-478)||(54240216-54240482)
chr3 (183-478)||(20251787-20252092)
chr3 (186-478)||(32237677-32237980)
chr3 (183-478)||(22844182-22844488)
chr3 (183-478)||(4019725-4020034)
chr3 (194-478)||(40797163-40797458)
chr3 (347-478)||(41882263-41882394)
chr3 (183-478)||(35501447-35501743)
chr3 (194-476)||(21586031-21586324)
chr3 (184-474)||(32089610-32089910)
chr3 (183-478)||(25939174-25939463)
chr3 (186-478)||(7656207-7656499)
chr3 (183-478)||(29776368-29776674)
chr3 (186-476)||(37051728-37052031)
chr3 (184-475)||(39340332-39340630)
chr3 (194-463)||(42106283-42106563)
chr3 (183-325)||(54706404-54706552)
chr3 (183-331)||(48401395-48401549)
chr3 (183-325)||(1074566-1074714)
chr3 (183-329)||(30155962-30156114)
chr3 (183-280)||(46926743-46926840)
chr3 (183-325)||(13701674-13701822)
chr3 (183-329)||(31462427-31462579)
chr3 (183-338)||(48652121-48652282)
chr3 (183-329)||(49627776-49627928)
chr3 (184-310)||(53402945-53403077)
chr3 (186-338)||(1806140-1806292)
chr3 (183-320)||(3457236-3457379)
chr3 (183-329)||(2598368-2598513)
chr3 (186-329)||(3312732-3312877)
chr3 (183-338)||(33637690-33637851)
chr3 (183-325)||(14585771-14585919)
chr3 (183-329)||(41868005-41868156)
chr3 (183-325)||(53155102-53155250)
chr3 (183-329)||(55455167-55455319)
chr3 (184-325)||(4082017-4082164)
chr3 (184-329)||(40883548-40883699)
chr3 (184-287)||(14740373-14740476)
chr3 (183-325)||(39610519-39610664)
chr3 (232-331)||(48401139-48401238)
chr3 (183-325)||(40012944-40013092)
chr3 (183-325)||(45047806-45047954)
chr3 (183-325)||(11819392-11819541)
chr3 (186-329)||(50460480-50460630)
chr3 (183-475)||(36540375-36540654)
chr3 (183-294)||(2192418-2192535)
chr3 (183-322)||(31270621-31270766)
chr3 (183-338)||(32080435-32080596)
chr3 (184-326)||(43243101-43243243)
chr3 (184-328)||(105721-105870)
chr3 (183-325)||(24483368-24483516)
chr3 (183-329)||(55446353-55446505)
chr3 (183-478)||(40461670-40461979)
chr3 (183-318)||(27831400-27831534)
chr3 (183-472)||(33793903-33794193)
chr3 (194-307)||(40365536-40365650)
chr3 (183-332)||(28876760-28876909)
chr3 (183-292)||(30293126-30293235)
chr3 (183-472)||(34767122-34767415)
chr3 (183-325)||(48855186-48855334)
chr3 (183-293)||(55090371-55090487)
chr3 (237-329)||(2148045-2148137)
chr3 (403-478)||(14741234-14741310)
chr3 (225-325)||(35175017-35175117)
chr3 (226-325)||(22485274-22485373)
chr3 (183-331)||(34960601-34960754)
chr3 (347-478)||(53426928-53427059)
chr3 (183-315)||(36623935-36624072)
chr3 (183-294)||(50981138-50981255)
chr3 (183-294)||(51084272-51084389)
chr3 (183-324)||(19645501-19645647)
chr3 (184-293)||(4817553-4817668)
chr3 (184-328)||(34103431-34103580)
chr3 (190-325)||(38530233-38530374)
chr3 (228-313)||(25373817-25373902)
chr3 (183-325)||(36691471-36691619)
chr3 (183-329)||(21084411-21084562)
chr3 (208-478)||(22893417-22893699)
chr3 (190-283)||(51742140-51742233)
chr3 (225-325)||(54238739-54238840)
chr3 (183-223)||(25111841-25111881)
chr3 (359-478)||(40365356-40365474)
chr3 (279-338)||(14741156-14741215)
chr3 (190-294)||(40401206-40401316)
chr3 (265-315)||(27189193-27189243)
chr3 (183-329)||(3961454-3961606)
chr3 (187-281)||(19148328-19148428)
chr3 (235-332)||(47587103-47587200)
chr3 (234-329)||(31730917-31731011)
chr3 (183-280)||(33070486-33070584)
chr3 (236-334)||(43897286-43897384)
chr3 (305-338)||(41882210-41882243)
chr3 (265-325)||(4206314-4206374)
chr3 (230-330)||(47437897-47437997)
chr3 (347-410)||(25373935-25373998)
chr3 (265-332)||(26412577-26412644)
chr3 (355-418)||(27831289-27831352)
chr3 (231-290)||(30648549-30648608)
chr3 (350-457)||(50460341-50460448)
chr3 (247-294)||(51990617-51990664)
chr3 (266-329)||(53962408-53962471)
chr3 (190-244)||(48053071-48053125)
chr3 (201-262)||(33070012-33070073)
chr3 (183-290)||(50194141-50194244)
chr3 (280-329)||(53427088-53427137)
chr3 (398-478)||(1220151-1220231)
chr3 (241-293)||(3462953-3463005)
chr3 (183-215)||(20464770-20464802)
chr3 (183-219)||(23799753-23799789)
chr3 (183-215)||(46304326-46304358)
chr3 (234-294)||(51059995-51060055)
[»] chr2 (153 HSPs)
chr2 (183-478)||(41176988-41177294)
chr2 (183-478)||(25771575-25771881)
chr2 (183-478)||(43567003-43567308)
chr2 (183-478)||(44167390-44167695)
chr2 (183-478)||(27023817-27024123)
chr2 (183-478)||(27191011-27191321)
chr2 (183-478)||(27840825-27841135)
chr2 (213-478)||(7640064-7640340)
chr2 (183-476)||(3465061-3465365)
chr2 (206-478)||(36508059-36508342)
chr2 (184-478)||(3603115-3603420)
chr2 (190-478)||(43928985-43929284)
chr2 (183-478)||(38822202-38822506)
chr2 (183-478)||(3390562-3390859)
chr2 (183-478)||(5930553-5930859)
chr2 (249-478)||(25516622-25516862)
chr2 (183-478)||(6090020-6090325)
chr2 (183-478)||(16720526-16720832)
chr2 (183-478)||(4878412-4878720)
chr2 (186-478)||(25622725-25623029)
chr2 (183-478)||(37883783-37884089)
chr2 (183-478)||(13268702-13269008)
chr2 (183-472)||(26491438-26491737)
chr2 (188-413)||(35353835-35354071)
chr2 (186-478)||(19580683-19580986)
chr2 (183-338)||(18141159-18141314)
chr2 (183-475)||(15673642-15673949)
chr2 (198-478)||(10589225-10589516)
chr2 (186-338)||(9207037-9207189)
chr2 (183-329)||(11931162-11931308)
chr2 (183-332)||(12366155-12366304)
chr2 (183-478)||(9715222-9715528)
chr2 (190-478)||(2251033-2251329)
chr2 (183-329)||(15920164-15920310)
chr2 (368-478)||(44951549-44951659)
chr2 (186-478)||(5071051-5071354)
chr2 (184-478)||(28228352-28228657)
chr2 (183-325)||(34471269-34471413)
chr2 (186-418)||(3397660-3397903)
chr2 (380-478)||(16879851-16879949)
chr2 (380-478)||(16991984-16992082)
chr2 (347-478)||(7443419-7443550)
chr2 (183-329)||(34480255-34480401)
chr2 (183-332)||(40125674-40125821)
chr2 (183-325)||(4739638-4739786)
chr2 (183-325)||(20560797-20560945)
chr2 (183-325)||(33012357-33012505)
chr2 (183-325)||(36868317-36868465)
chr2 (183-323)||(5754593-5754739)
chr2 (183-478)||(25237009-25237310)
chr2 (183-325)||(12704996-12705143)
chr2 (183-320)||(19953837-19953974)
chr2 (189-434)||(31125063-31125319)
chr2 (183-325)||(32015562-32015710)
chr2 (183-325)||(44942595-44942743)
chr2 (183-325)||(35333814-35333962)
chr2 (183-338)||(11798202-11798362)
chr2 (183-322)||(16136390-16136535)
chr2 (183-325)||(11937530-11937678)
chr2 (183-313)||(12890781-12890917)
chr2 (183-325)||(13878673-13878821)
chr2 (183-325)||(14018798-14018946)
chr2 (183-329)||(25068146-25068298)
chr2 (183-325)||(27095998-27096146)
chr2 (183-325)||(34416427-34416575)
chr2 (183-338)||(4732357-4732519)
chr2 (183-338)||(44441660-44441815)
chr2 (183-325)||(43473809-43473957)
chr2 (190-458)||(20036532-20036810)
chr2 (183-315)||(9689649-9689787)
chr2 (183-322)||(38534969-38535114)
chr2 (368-478)||(24500617-24500727)
chr2 (183-329)||(45035274-45035420)
chr2 (225-325)||(22597444-22597545)
chr2 (183-325)||(29543102-29543250)
chr2 (183-325)||(43696177-43696325)
chr2 (184-325)||(28261570-28261717)
chr2 (183-325)||(32314734-32314882)
chr2 (183-270)||(39481201-39481288)
chr2 (186-325)||(4426326-4426471)
chr2 (184-331)||(9978343-9978496)
chr2 (232-329)||(27665840-27665938)
chr2 (183-338)||(38384130-38384291)
chr2 (183-329)||(4603980-4604132)
chr2 (183-325)||(17267790-17267938)
chr2 (183-325)||(31908481-31908629)
chr2 (183-251)||(11550344-11550412)
chr2 (347-478)||(11550448-11550580)
chr2 (183-325)||(18089076-18089226)
chr2 (226-294)||(30933573-30933641)
chr2 (226-325)||(41797904-41798003)
chr2 (183-330)||(10286678-10286833)
chr2 (183-293)||(11942709-11942825)
chr2 (183-329)||(13740318-13740470)
chr2 (265-478)||(17068676-17068899)
chr2 (265-478)||(17118574-17118797)
chr2 (225-329)||(20570263-20570367)
chr2 (367-478)||(19953700-19953810)
chr2 (255-329)||(7072716-7072790)
chr2 (226-332)||(14825848-14825954)
chr2 (183-322)||(28230761-28230906)
chr2 (183-294)||(34962659-34962776)
chr2 (225-294)||(44589212-44589281)
chr2 (265-329)||(17056229-17056293)
chr2 (265-329)||(17095246-17095310)
chr2 (225-315)||(106559-106650)
chr2 (347-478)||(29734320-29734451)
chr2 (347-478)||(29812468-29812599)
chr2 (362-421)||(31262821-31262880)
chr2 (184-305)||(15786248-15786367)
chr2 (347-457)||(42105618-42105727)
chr2 (183-326)||(23256309-23256451)
chr2 (183-332)||(4703433-4703588)
chr2 (350-474)||(17074769-17074892)
chr2 (230-329)||(11580862-11580961)
chr2 (183-229)||(25516914-25516960)
chr2 (399-472)||(40125525-40125598)
chr2 (350-470)||(17056325-17056444)
chr2 (350-470)||(17084308-17084427)
chr2 (230-293)||(20598399-20598463)
chr2 (273-333)||(44951657-44951717)
chr2 (236-295)||(33839120-33839179)
chr2 (186-285)||(39963549-39963648)
chr2 (234-293)||(40039044-40039103)
chr2 (183-229)||(3527397-3527443)
chr2 (183-305)||(8064466-8064587)
chr2 (183-294)||(18763654-18763762)
chr2 (211-338)||(31262662-31262786)
chr2 (183-290)||(32448423-32448526)
chr2 (231-291)||(36234189-36234249)
chr2 (225-293)||(45693822-45693890)
chr2 (184-300)||(12183015-12183127)
chr2 (190-253)||(13547173-13547236)
chr2 (184-223)||(14826319-14826358)
chr2 (184-231)||(19904898-19904945)
chr2 (280-338)||(6431184-6431242)
chr2 (234-304)||(6510789-6510859)
chr2 (183-229)||(7071439-7071485)
chr2 (278-332)||(7443339-7443393)
chr2 (232-294)||(11561406-11561468)
chr2 (183-328)||(17792764-17792914)
chr2 (184-230)||(27666577-27666623)
chr2 (247-284)||(13113361-13113398)
chr2 (265-294)||(34962821-34962850)
chr2 (230-290)||(8806058-8806118)
chr2 (183-231)||(15439881-15439929)
chr2 (347-391)||(15920091-15920135)
chr2 (212-338)||(29734471-29734601)
chr2 (183-215)||(30923263-30923295)
chr2 (347-391)||(34471183-34471227)
chr2 (183-215)||(36942928-36942960)
chr2 (183-215)||(37876412-37876444)
chr2 (438-478)||(41842078-41842118)
[»] chr1 (133 HSPs)
chr1 (183-478)||(22344590-22344896)
chr1 (183-478)||(44562427-44562733)
chr1 (183-478)||(15276124-15276434)
chr1 (183-476)||(6212592-6212896)
chr1 (183-476)||(45659146-45659450)
chr1 (183-478)||(23257218-23257524)
chr1 (183-478)||(12967411-12967716)
chr1 (183-478)||(38646714-38647020)
chr1 (183-478)||(630462-630768)
chr1 (184-478)||(38644476-38644781)
chr1 (184-478)||(36621482-36621786)
chr1 (184-476)||(14716955-14717252)
chr1 (238-478)||(21326603-21326854)
chr1 (183-478)||(15698329-15698634)
chr1 (183-478)||(49651974-49652271)
chr1 (183-467)||(44513680-44513975)
chr1 (183-478)||(28213178-28213489)
chr1 (183-475)||(8893426-8893728)
chr1 (184-478)||(2350752-2351056)
chr1 (183-478)||(11121106-11121412)
chr1 (190-476)||(40992440-40992727)
chr1 (184-478)||(33177277-33177581)
chr1 (184-478)||(52839660-52839965)
chr1 (183-476)||(46589279-46589584)
chr1 (183-430)||(13969318-13969576)
chr1 (183-478)||(26199710-26200016)
chr1 (183-478)||(27469386-27469692)
chr1 (303-478)||(5832364-5832550)
chr1 (300-478)||(4564646-4564835)
chr1 (186-338)||(34566962-34567114)
chr1 (183-478)||(12147726-12148032)
chr1 (184-340)||(1768206-1768356)
chr1 (183-338)||(26771387-26771542)
chr1 (183-478)||(33703188-33703494)
chr1 (183-292)||(5844458-5844567)
chr1 (183-427)||(34659319-34659574)
chr1 (370-478)||(23320570-23320678)
chr1 (190-326)||(29067340-29067476)
chr1 (190-337)||(13691448-13691595)
chr1 (184-478)||(10264839-10265138)
chr1 (183-325)||(29205577-29205725)
chr1 (183-478)||(10877476-10877783)
chr1 (183-478)||(47392268-47392570)
chr1 (183-338)||(18343899-18344054)
chr1 (183-331)||(28677803-28677957)
chr1 (183-325)||(4882041-4882188)
chr1 (225-325)||(29726309-29726409)
chr1 (183-325)||(3233080-3233228)
chr1 (183-325)||(13488200-13488348)
chr1 (183-325)||(44517457-44517605)
chr1 (183-338)||(12871902-12872063)
chr1 (225-338)||(47551376-47551489)
chr1 (225-325)||(45193340-45193440)
chr1 (183-325)||(15390916-15391064)
chr1 (226-323)||(20413094-20413191)
chr1 (183-325)||(37822027-37822175)
chr1 (225-325)||(7995289-7995389)
chr1 (183-307)||(30853625-30853748)
chr1 (184-285)||(33938709-33938816)
chr1 (184-320)||(42276669-42276811)
chr1 (347-478)||(48654894-48655025)
chr1 (184-294)||(900377-900486)
chr1 (190-325)||(27535006-27535147)
chr1 (186-337)||(37662638-37662785)
chr1 (183-325)||(423956-424104)
chr1 (187-325)||(14265593-14265736)
chr1 (189-329)||(23791284-23791424)
chr1 (183-329)||(25032767-25032919)
chr1 (183-293)||(51418325-51418441)
chr1 (184-325)||(32784388-32784535)
chr1 (183-329)||(33486700-33486855)
chr1 (198-273)||(21326851-21326926)
chr1 (344-478)||(32539039-32539174)
chr1 (183-327)||(13152732-13152884)
chr1 (183-325)||(17347886-17348032)
chr1 (183-329)||(32878998-32879150)
chr1 (184-304)||(42491202-42491325)
chr1 (183-325)||(45750787-45750935)
chr1 (183-478)||(22031780-22032075)
chr1 (347-475)||(37684943-37685071)
chr1 (347-475)||(37700446-37700574)
chr1 (234-330)||(40862555-40862651)
chr1 (347-476)||(900226-900354)
chr1 (183-293)||(10304904-10305020)
chr1 (183-325)||(15790940-15791087)
chr1 (229-325)||(10627308-10627404)
chr1 (254-338)||(28399085-28399169)
chr1 (362-478)||(29067179-29067294)
chr1 (360-478)||(34566818-34566934)
chr1 (183-325)||(25278515-25278656)
chr1 (225-326)||(15312339-15312440)
chr1 (188-253)||(32538888-32538953)
chr1 (438-478)||(1768095-1768135)
chr1 (226-332)||(6788150-6788249)
chr1 (267-338)||(171301-171372)
chr1 (186-294)||(2597248-2597362)
chr1 (225-323)||(29551477-29551576)
chr1 (225-336)||(48003495-48003606)
chr1 (273-332)||(48654809-48654868)
chr1 (236-338)||(9298154-9298256)
chr1 (248-326)||(43504111-43504189)
chr1 (237-294)||(13999282-13999339)
chr1 (183-290)||(19061092-19061195)
chr1 (192-293)||(33001843-33001944)
chr1 (183-329)||(10599169-10599321)
chr1 (233-329)||(38783357-38783453)
chr1 (446-478)||(52752153-52752185)
chr1 (184-231)||(10188555-10188602)
chr1 (266-329)||(10188645-10188708)
chr1 (230-329)||(50107646-50107744)
chr1 (231-290)||(50165929-50165988)
chr1 (183-245)||(171500-171562)
chr1 (248-294)||(3101984-3102030)
chr1 (183-229)||(16141022-16141068)
chr1 (236-294)||(33125543-33125601)
chr1 (347-413)||(37662405-37662471)
chr1 (347-432)||(13691616-13691701)
chr1 (350-391)||(29938454-29938495)
chr1 (236-293)||(32301664-32301720)
chr1 (204-301)||(35356254-35356350)
chr1 (233-290)||(38520367-38520424)
chr1 (272-329)||(45425249-45425306)
chr1 (184-216)||(5856160-5856192)
chr1 (347-427)||(8224355-8224435)
chr1 (183-219)||(8758062-8758098)
chr1 (347-391)||(13152657-13152701)
chr1 (183-215)||(26535591-26535623)
chr1 (183-215)||(27456744-27456776)
chr1 (183-219)||(28666479-28666515)
chr1 (230-294)||(34878127-34878191)
chr1 (231-295)||(40880843-40880907)
chr1 (183-215)||(44915894-44915926)
chr1 (347-391)||(47551312-47551356)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (184-478)||(23843103-23843408)
chr6 (183-478)||(12576159-12576465)
chr6 (184-478)||(13233787-13234092)
chr6 (183-478)||(11426071-11426381)
chr6 (183-478)||(19759918-19760224)
chr6 (184-473)||(31748092-31748392)
chr6 (184-478)||(8632875-8633176)
chr6 (183-478)||(20845138-20845449)
chr6 (186-478)||(16913457-16913761)
chr6 (183-478)||(548550-548850)
chr6 (183-478)||(8644375-8644664)
chr6 (266-472)||(7049381-7049598)
chr6 (184-478)||(10744713-10745017)
chr6 (184-478)||(32457776-32458076)
chr6 (183-469)||(20496332-20496629)
chr6 (184-478)||(4663499-4663804)
chr6 (186-478)||(34020735-34021036)
chr6 (183-402)||(5416903-5417132)
chr6 (183-329)||(30813362-30813514)
chr6 (184-476)||(15127808-15128111)
chr6 (183-338)||(12653982-12654143)
chr6 (221-478)||(32804425-32804692)
chr6 (183-325)||(8693335-8693483)
chr6 (183-325)||(19402516-19402664)
chr6 (183-325)||(21507518-21507666)
chr6 (183-327)||(4660735-4660885)
chr6 (183-338)||(12481043-12481204)
chr6 (190-336)||(33541216-33541362)
chr6 (183-329)||(14782819-14782971)
chr6 (183-325)||(31705474-31705622)
chr6 (183-294)||(4921572-4921683)
chr6 (183-325)||(23101072-23101220)
chr6 (183-324)||(33129833-33129971)
chr6 (184-322)||(6295914-6296058)
chr6 (184-322)||(6302724-6302868)
chr6 (183-325)||(15589789-15589937)
chr6 (183-325)||(23654559-23654706)
chr6 (186-322)||(23637789-23637929)
chr6 (184-326)||(15469926-15470069)
chr6 (183-325)||(4394079-4394227)
chr6 (183-476)||(31804352-31804650)
chr6 (350-473)||(1944231-1944354)
chr6 (183-325)||(1106527-1106679)
chr6 (183-325)||(29920581-29920729)
chr6 (184-410)||(892482-892719)
chr6 (194-329)||(904558-904693)
chr6 (347-478)||(5544837-5544968)
chr6 (183-294)||(35219577-35219694)
chr6 (185-294)||(13871292-13871406)
chr6 (186-293)||(22530524-22530631)
chr6 (183-338)||(2488418-2488579)
chr6 (225-334)||(8978468-8978577)
chr6 (233-336)||(16338044-16338147)
chr6 (233-336)||(18248802-18248905)
chr6 (225-300)||(35039010-35039085)
chr6 (183-294)||(2304502-2304619)
chr6 (183-253)||(5146307-5146383)
chr6 (183-281)||(31936297-31936401)
chr6 (184-326)||(15176099-15176242)
chr6 (183-237)||(5545062-5545116)
chr6 (377-478)||(904398-904499)
chr6 (226-338)||(12651922-12652034)
chr6 (265-329)||(14730910-14730974)
chr6 (225-329)||(16328802-16328906)
chr6 (214-290)||(20742833-20742909)
chr6 (189-305)||(23588000-23588116)
chr6 (346-418)||(33541383-33541455)
chr6 (183-294)||(6127857-6127974)
chr6 (183-304)||(28943579-28943705)
chr6 (225-294)||(9043842-9043911)
chr6 (378-478)||(22530410-22530509)
chr6 (231-290)||(17334941-17335000)
chr6 (235-294)||(31680760-31680819)
chr6 (232-338)||(3359040-3359146)
chr6 (183-229)||(6419543-6419589)
chr6 (184-293)||(27135433-27135547)
chr6 (235-329)||(29285039-29285133)
chr6 (437-478)||(5417141-5417182)
chr6 (184-253)||(33197596-33197665)
chr6 (230-290)||(20226032-20226092)
chr6 (230-290)||(22120016-22120076)
chr6 (183-215)||(25337822-25337854)
chr6 (230-290)||(28634942-28635002)
chr6 (183-215)||(33052973-33053005)
[»] chr7 (141 HSPs)
chr7 (183-478)||(40775397-40775700)
chr7 (183-478)||(26017336-26017642)
chr7 (186-478)||(47749864-47750167)
chr7 (183-478)||(49167055-49167361)
chr7 (183-478)||(7986022-7986328)
chr7 (184-478)||(11001973-11002278)
chr7 (183-478)||(30992502-30992807)
chr7 (183-478)||(134823-135129)
chr7 (184-457)||(19895363-19895647)
chr7 (183-478)||(8611301-8611608)
chr7 (184-478)||(43806829-43807134)
chr7 (184-478)||(42490833-42491137)
chr7 (183-478)||(24470523-24470841)
chr7 (183-478)||(24475471-24475789)
chr7 (184-476)||(37399730-37400033)
chr7 (183-478)||(40476837-40477143)
chr7 (183-478)||(8319445-8319751)
chr7 (183-473)||(772578-772879)
chr7 (183-478)||(28015487-28015793)
chr7 (183-443)||(47156547-47156821)
chr7 (183-476)||(39090220-39090524)
chr7 (186-478)||(29804360-29804659)
chr7 (207-478)||(5024758-5025040)
chr7 (183-334)||(18753980-18754131)
chr7 (183-338)||(38649036-38649191)
chr7 (183-335)||(25854890-25855041)
chr7 (183-478)||(23732072-23732377)
chr7 (186-427)||(21552136-21552388)
chr7 (194-476)||(41748216-41748509)
chr7 (184-478)||(46918530-46918834)
chr7 (183-332)||(34893394-34893543)
chr7 (183-419)||(35134880-35135109)
chr7 (186-418)||(21328979-21329222)
chr7 (183-430)||(33530153-33530411)
chr7 (183-418)||(35141341-35141570)
chr7 (194-413)||(2532136-2532366)
chr7 (183-325)||(21990971-21991119)
chr7 (204-419)||(34594221-34594447)
chr7 (184-331)||(40657902-40658044)
chr7 (183-325)||(42644964-42645112)
chr7 (196-478)||(43483730-43484011)
chr7 (183-331)||(32741046-32741200)
chr7 (183-329)||(37375720-37375871)
chr7 (183-329)||(46025719-46025871)
chr7 (347-478)||(25855073-25855204)
chr7 (183-338)||(35362786-35362940)
chr7 (183-322)||(24319887-24320032)
chr7 (183-458)||(37890168-37890453)
chr7 (183-325)||(6667704-6667852)
chr7 (183-478)||(14707713-14708016)
chr7 (205-476)||(36350300-36350581)
chr7 (183-325)||(37593392-37593540)
chr7 (183-478)||(44681590-44681898)
chr7 (183-325)||(48304056-48304204)
chr7 (183-328)||(4621044-4621195)
chr7 (183-324)||(17508868-17509015)
chr7 (183-324)||(17544199-17544346)
chr7 (187-331)||(42603447-42603597)
chr7 (183-329)||(36719224-36719377)
chr7 (183-325)||(11833327-11833475)
chr7 (183-329)||(17473425-17473577)
chr7 (183-329)||(17579637-17579789)
chr7 (183-329)||(44482542-44482698)
chr7 (183-325)||(1280801-1280949)
chr7 (183-329)||(15123681-15123833)
chr7 (183-325)||(22747173-22747321)
chr7 (183-325)||(36579005-36579153)
chr7 (183-329)||(22379387-22379533)
chr7 (183-325)||(2622901-2623049)
chr7 (183-325)||(10094749-10094897)
chr7 (183-325)||(41288265-41288413)
chr7 (234-338)||(38273185-38273289)
chr7 (183-338)||(45482351-45482509)
chr7 (184-338)||(3266673-3266830)
chr7 (190-329)||(5684660-5684805)
chr7 (190-329)||(5709710-5709855)
chr7 (184-303)||(24988165-24988290)
chr7 (184-315)||(45457221-45457358)
chr7 (347-478)||(9933977-9934104)
chr7 (183-325)||(36253239-36253387)
chr7 (186-413)||(45949372-45949598)
chr7 (183-325)||(10574673-10574822)
chr7 (183-322)||(39532639-39532784)
chr7 (183-325)||(9785626-9785774)
chr7 (183-277)||(16273719-16273817)
chr7 (183-325)||(21603767-21603915)
chr7 (183-325)||(27535737-27535884)
chr7 (183-325)||(40761897-40762045)
chr7 (183-283)||(8180151-8180258)
chr7 (190-338)||(22751683-22751831)
chr7 (185-288)||(26161301-26161409)
chr7 (359-478)||(10250348-10250467)
chr7 (347-476)||(23177436-23177565)
chr7 (183-325)||(32643277-32643425)
chr7 (186-334)||(14733748-14733894)
chr7 (232-324)||(17230413-17230505)
chr7 (375-478)||(24045161-24045264)
chr7 (184-291)||(32587207-32587317)
chr7 (183-286)||(15674027-15674136)
chr7 (380-478)||(22751568-22751666)
chr7 (235-329)||(37714769-37714863)
chr7 (401-478)||(13008580-13008657)
chr7 (225-329)||(6646321-6646425)
chr7 (233-329)||(25531743-25531839)
chr7 (194-291)||(28664631-28664734)
chr7 (183-260)||(43847347-43847430)
chr7 (232-338)||(9137237-9137343)
chr7 (350-478)||(34893241-34893367)
chr7 (265-329)||(29352516-29352580)
chr7 (232-324)||(46881502-46881594)
chr7 (231-290)||(20116769-20116828)
chr7 (190-293)||(28314298-28314401)
chr7 (183-294)||(5238274-5238391)
chr7 (232-277)||(14810825-14810870)
chr7 (232-277)||(15257820-15257865)
chr7 (265-314)||(27704837-27704886)
chr7 (183-231)||(31254795-31254843)
chr7 (183-219)||(32312921-32312957)
chr7 (362-478)||(38649227-38649341)
chr7 (230-293)||(43256285-43256346)
chr7 (183-219)||(48643490-48643526)
chr7 (231-290)||(7640605-7640664)
chr7 (231-290)||(21266578-21266637)
chr7 (184-219)||(35306163-35306198)
chr7 (235-329)||(26638349-26638443)
chr7 (233-290)||(6559065-6559122)
chr7 (231-295)||(433521-433585)
chr7 (187-243)||(10250185-10250240)
chr7 (183-215)||(17611648-17611680)
chr7 (183-219)||(20206207-20206243)
chr7 (183-231)||(24533563-24533611)
chr7 (242-294)||(25308689-25308741)
chr7 (231-295)||(26492548-26492612)
chr7 (183-215)||(28407723-28407755)
chr7 (272-332)||(31724907-31724967)
chr7 (270-338)||(32312848-32312916)
chr7 (183-231)||(33095800-33095848)
chr7 (183-215)||(35261554-35261586)
chr7 (231-295)||(35667062-35667126)
chr7 (183-219)||(38277218-38277254)
chr7 (183-215)||(41553241-41553273)
[»] scaffold0722 (1 HSPs)
scaffold0722 (183-478)||(5204-5510)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (198-478)||(11896-12187)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (183-478)||(36659-36960)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (183-478)||(244766-245065)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (196-478)||(11144-11434)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (270-478)||(9423-9642)
scaffold0045 (184-274)||(1600-1690)
scaffold0045 (183-248)||(48029-48094)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (347-478)||(980-1111)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (184-413)||(136754-136993)
scaffold0018 (438-478)||(137002-137042)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (183-478)||(10007-10295)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (184-473)||(11455-11757)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (186-418)||(25193-25436)
[»] scaffold0294 (2 HSPs)
scaffold0294 (183-325)||(3731-3879)
scaffold0294 (225-275)||(5910-5960)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (183-325)||(12914-13057)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (186-338)||(105321-105479)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (183-338)||(35371-35532)
[»] scaffold0432 (1 HSPs)
scaffold0432 (183-325)||(2112-2254)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (183-325)||(6793-6942)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (183-325)||(74473-74621)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (183-321)||(93998-94129)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (347-478)||(994-1125)
scaffold0157 (183-262)||(856-935)
[»] scaffold0536 (1 HSPs)
scaffold0536 (183-294)||(3235-3352)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (183-325)||(6445-6593)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (183-285)||(403912-404020)
[»] scaffold0580 (2 HSPs)
scaffold0580 (184-326)||(470-613)
scaffold0580 (184-326)||(8209-8352)
[»] scaffold0999 (2 HSPs)
scaffold0999 (225-327)||(1996-2098)
scaffold0999 (347-391)||(1921-1965)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (225-293)||(1916-1984)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (347-478)||(6640-6769)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (187-320)||(20907-21046)
[»] scaffold1294 (1 HSPs)
scaffold1294 (204-329)||(1065-1190)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (344-476)||(91254-91385)
scaffold0023 (184-245)||(91101-91162)
scaffold0023 (265-329)||(91164-91228)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (239-293)||(404481-404535)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (183-223)||(22310-22350)
[»] scaffold1379 (1 HSPs)
scaffold1379 (225-329)||(789-897)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (233-327)||(3476-3570)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (233-327)||(35963-36057)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (230-290)||(83265-83325)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (190-260)||(10307-10377)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (184-230)||(30284-30330)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (183-215)||(7979-8011)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 123)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9993102 - 9992797
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9993102 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccgtgtta 9993003  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9993002 atagcataaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctcggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 9992903  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9992902 cgttgattggatctgcattggattgaagcttatctgacaatttgaaccgatcaaatatctaagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcacacaaagacga 9992803  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  9992802 cgaaca 9992797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 44295752 - 44295446
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44295752 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 44295653  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||| |||||    
T  44295652 ataggataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 44295553  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44295552 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 44295453  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  44295452 acgaaca 44295446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 8054486 - 8054791
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  8054486 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacccgctcacaacatccatttta 8054585  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | || || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  8054586 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaatagccatgtctccggatctgcaa-gtggatgacgccaaag 8054684  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8054685 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 8054784  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  8054785 acgaaca 8054791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41996979 - 41996675
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41996979 gatattcattcatttaaattgatcgagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 41996880  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggct-------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||       || |||||||||||||||||||||||||    
T  41996879 atagcataaaacgacaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagctatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 41996780  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  41996779 tcattgattggatctgcactgaatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaatcaagaaagacaa--aacgtcgcacaaagacg 41996682  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  41996681 acgaaca 41996675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 32104516 - 32104822
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32104516 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 32104615  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgac-gccaaag 371  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          || || || |||||||||||||||||| | |||||    
T  32104616 tagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacggtcaaag 32104715  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    |  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  32104716 ttattgattgaatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgttgcacaaagatg 32104815  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  32104816 acaaaca 32104822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 183 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 5457507 - 5457202
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  5457507 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctcacaacacccatgcta 5457408  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  5457407 atagcataaaacgacaaggtacaaatggctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacggcaaag 5457308  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5457307 ttattgattggatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacttgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacgaagacg 5457208  T
Q  472 acgaac 477  Q
    ||||||    
T  5457207 acgaac 5457202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 16996567 - 16996873
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996567 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatatgatgcaaattcgctaaaaacaaataggttgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 16996666  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |             ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  16996667 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacatatatgactatatttaaatatccggaataaccatgttttcagatttgcaacgtggatgacgccaaag 16996766  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996767 tcattgattggatctgcactggatcgaagccgaactgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaggaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 16996866  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  16996867 acgaaca 16996873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 37129352 - 37129659
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaatt-aatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  | || |||    
T  37129352 gatattcattctttcaaattgaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctatgaacaggctcacaaagttcacgtt 37129451  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |           || ||||||||||||||||||||||||    
T  37129452 aatagcataaaacgtcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaa 37129551  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37129552 gtcattgattggatctgcacttgatcgaagctgatctgacaatctgaagcgttcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagac 37129651  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  37129652 gacgaaca 37129659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9270453 - 9270151
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  9270453 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaa-agactcacaacatccatgttaaca 9270355  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | || ||| | ||||||| | | |||| |||| ||| |     
T  9270354 gcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcagaataaccatgtctccagatctgcaccatagatgccgccgaagcca 9270255  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9270254 tcgattggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 9270155  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  9270154 aaca 9270151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32413226 - 32412920
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32413226 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatctgaaaaggctcacaacatacatgtta 32413127  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |  |           || ||||  ||||| |||||||||||||    
T  32413126 atagcttaaaacgacaaagtacaaatgtctacacgtatgactatatctaaatcttcggaataatcatgtatccggatctataacgtagatgacgccaaag 32413027  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32413026 tcattgattggatctgcacaggatcgaagctgatctgacaatctgaaccaatcaaatacctgaaagaaacaagaaaaacaaacaacatcgcacaaagacg 32412927  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  32412926 atgaaca 32412920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 36545460 - 36545765
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36545460 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgtt 36545557  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||          || ||| | ||||||||||||||||  ||||||    
T  36545558 aatagcataaaacgacaaagtacaattgcttacacatatgactatatttaaatcaccggaacaaccatgtctctggatctgcaacgtggatggagccaaa 36545657  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36545658 gtcattgattgggtttgcactggatcaaagctaatctgacaacctgaatcgatcaaatacctgagagaaaatagaaaaacatagaacgtcgcacaaagac 36545757  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||| ||||    
T  36545758 gactaaca 36545765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 31712752 - 31713060
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  31712752 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccatgt 31712851  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    ||||| ||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||          || ||| | ||||||||| | |||||  ||||    
T  31712852 taataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcaccggaatactgatgtctccatatctgcaacattgatgagtccaa 31712951  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31712952 agtcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgaacaaatacctaaacgaagcaagaaagacaaacaacgtcgcacaaaga 31713051  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  31713052 cgacgaaca 31713060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5990046 - 5989759
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  5990046 attcattcatttaaattaatatagtacatcaatagaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaatattcatgttaata 5989947  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatc 385  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||      || || |||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||    
T  5989946 gcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctc------cggatttgcaacgttgacgacacaaaagtcattgattgaatc 5989853  T
Q  386 tgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaacat 479  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| | || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5989852 tgcactgaatcgaagttgacctgacaatctgaaccgaagaaatacttgagcgaaataagaaagacaaacaacgccgcacaaagacgacgaacat 5989759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5328383 - 5328095
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  5328383 gatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaa--aaaaggatgaatctgtaaataggctcacaacattcatgtta 5328286  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||   ||||||||||    
T  5328285 atagtataaaacggcaaagtacaaatgcatacacatataactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtg---gacgccaaag 5328189  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5328188 tcattgattggatctgcactagatcaaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatactt--gagagacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 5328095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 16937017 - 16937323
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16937017 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgcttaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtta 16937116  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || ||| | ||||||||||| || ||| ||||||    
T  16937117 atagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctagatctgcaacgttgacgactccaaag 16937216  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16937217 tcattgatttgatatgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactaaacaaatacctgaacgaaacacgaaaggcaaacaatgtcgcacaaagacg 16937316  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  16937317 atgaaca 16937323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31874457 - 31874214
Alignment:
Q  242 aaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc--- 338  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31874457 aaaaggatgaatatgtgaagaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccgga 31874358  T
Q  339 -------tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacc 431  Q
           || |||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31874357 aaaaccatgtctcggatctgcaacgtggatgacggcaaa-tacctga--caatctgcactggatcgaagatgttctgacaatctgaaccgatcaaatacc 31874261  T
Q  432 taagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31874260 tgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacgacgaaca 31874214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 12248389 - 12248698
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  12248389 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcatcatccatgtta 12248488  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||          | || ||| |||||||||| || || ||| ||||||    
T  12248489 ataacataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctctgaatctgcaaagttgacgactccaaag 12248588  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctg---atctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    || |||||| |||||||||||| | |||| ||   |||||| ||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12248589 tcattgatttgatctgcactggttcgaagttgatcatctgataatctgaatcgaacaaatacctgaatgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaag 12248688  T
Q  469 acgacgaaca 478  Q
    ||||||||||    
T  12248689 acgacgaaca 12248698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Original strand, 3925369 - 3925672
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  3925369 gatattcattcattcaaatgggtagagtacatcgataca-tgaaaatttgctaaaaacaaaactgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtta 3925467  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||          || || | |||||||||||| || ||| ||||||    
T  3925468 ataacataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgattatatttaagtctccggaatactcatgtctccaaatctgcaacgttgacgactccaaag 3925567  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3925568 tcattgatttgatctgcacttgatcgaagctgatctgactatctgaatcgaacaaatacctgaatgaaacaagaaaggcaaacaaggtcgcacaaagacg 3925667  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  3925668 acgaa 3925672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10043195 - 10042902
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10043195 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaa-gataaatctctgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaa 10043097  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |  |||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| |||||||  |||||| |    
T  10043096 cgacaaagtactaaag-ctacacatataactatatttaagtctccggaatacacatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagttattgatttg 10042998  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  10042997 atctgcactagatcgaagctgatctgacaatttgaactgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaataacgtcgcactaagacaacgaaca 10042902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 14115681 - 14115812
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14115681 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaa 14115780  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  14115781 aaacaaacaatttcgcaaaaagacaacgaaca 14115812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 478
Target Start/End: Original strand, 32256410 - 32256705
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  32256410 attcaaattgacagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatattaataacataaaa 32256509  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  32256510 cggcaaagtactaaagccgacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattgatttg 32256609  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32256610 atctgcacatgatcgaagctgatttaacaatctaaaccgaacaaatacccgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacaaaca 32256705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17019536 - 17019248
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  17019536 gatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgtta 17019437  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||        || |||||| |||| || |||||| || ||||||||    
T  17019436 atagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctcc-------gatttgcaacatggacgatgccaaaatcattgattgg 17019344  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||| |||||  ||| | |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||   ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17019343 atctgcattggatcaaagttaatctgaaaatctgatccgaacaaatacttagatgaaacaagaaagacaaacaacaatgcacaaagacgacgaaca 17019248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17549973 - 17549685
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  17549973 gatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgtta 17549874  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||        || |||||| |||| || |||||| || ||||||||    
T  17549873 atagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctcc-------gatttgcaacatggacgatgccaaaatcattgattgg 17549781  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||| |||||  ||| | |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||   ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17549780 atctgcattggatcaaagttaatctgaaaatctgatccgaacaaatacttagatgaaacaagaaagacaaacaacaatgcacaaagacgacgaaca 17549685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15665974 - 15665669
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15665974 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgccaaaaacaaaaaggacgaatctgcaaacaaactcacaacatccatgttaata 15665875  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat--gactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||  || ||| |||| ||||||  ||||  ||||||||| || |||||          || || || ||||||||||  |||||| |||||||    
T  15665874 gcataaaacggcatagtgcaaaagcctaccaatatgagactatattcaagtctccgaaatacccatgtctccggatctgcaacgctgatgacaccaaagt 15665775  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |   ||||| || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  15665774 cattgattggatctgcactggatctaagctgacctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaacaggatagacaaacaacgctgcacaaagacga 15665675  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    | ||||    
T  15665674 caaaca 15665669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 336
Target Start/End: Original strand, 9799689 - 9799842
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  9799689 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaatgctctaaaaacaaaaaagaggaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtta 9799788  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct 336  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9799789 atagcataaaactaaaacgtacaaaagcctacacatatgactatattcaaatct 9799842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 12243894 - 12244200
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  12243894 gatattcattcgttcaaactgatagagtacatcgatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 12243993  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctgg-----------ct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| ||||           || || | ||||||| | || |||  ||||    
T  12243994 ataacataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatataactatattcaagtct-ctggaatacccatatctccggaactgcaacattgacgacatcaaa 12244092  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||      
T  12244093 gtcattgattggatctgcattggatcaaagctgatatgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaaaaacgacaaacaacgccgcacaaagtt 12244192  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  12244193 gacgaaca 12244200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23767174 - 23766869
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||     
T  23767174 atattcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatgaaaattcgctagaataaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcccagcatccatgttag 23767075  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg--------gct--cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    |||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||||||||||   |||| |        | |  || ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  23767074 tagcataaaacggcagagtattaaagcctacacatatgactatatttatgcctccggatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgactccaaagtc 23766975  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
     ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23766974 attgatttaatctacactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacatgaatgaaccaaaaaaatacaaacaacgtcgcacaaagacga 23766875  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  23766874 cgaaca 23766869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 18190532 - 18190680
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  18190532 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatattaata 18190631  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat 334  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18190632 gcataaaacgacaaagtacacaagcctacaaatatgactatattaaaat 18190680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Original strand, 16937950 - 16938091
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||  ||||||||||    
T  16937950 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgcgaacaaactcacagaatccatgtta 16938049  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16938050 ataccataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgact 16938091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2629349 - 2629046
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc-gatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  2629349 gatattaattcattcaagttgatagagtacatccgatacaatgaaaattagctgaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaactcacaacatccatgtt 2629250  T
Q  282 aatagc--ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    ||||||  |||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||          || |||  |||| |||  | || ||| ||||    
T  2629249 aatagcatataaaacgacaaagtactaaatcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacacatgtctccgatctacaatattgaggactccaa 2629150  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2629149 agtcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctg-accaaacaaatgcctgaacgaaacaagaaagacaaacaatgtcgcacaaaga 2629051  T
Q  470 cgacg 474  Q
     ||||    
T  2629050 tgacg 2629046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32062223 - 32061970
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32062223 attcatttaaaatgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatcaatgtgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 32062124  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  |||||| || | || |||| ||||||||||||| ||||||          | || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  32062123 aaaacgacaaagtgcataagcatacaaatatgactatattaaaatctttggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgg 32062024  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  32062023 ttggatctgcacttgatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaacacct 32061970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10148392 - 10148232
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  10148392 atattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaatcctaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatcca 10148293  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10148292 tgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatatttaagtctcc 10148232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 14530597 - 14530749
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14530597 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacagattcattaaaaacaaaaatgatgaatctgtgagcaaactcacaacatccatgttaata 14530696  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  14530697 gcataaaacggcaaagtacacaagcctataaatatgactatattaaaatctcc 14530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 418
Target Start/End: Original strand, 1215023 - 1215265
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatag 286  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  1215023 ttcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaacatcaatgttaataa 1215122  T
Q  287 cataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc----------tcctggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgt 375  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||||| || | |||| ||| |||||          ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  1215123 cataaaacgacaaagtacataagcctacatatgtaactacattaaaatctctggaatagtcctgcctcgggatctgcaacgttgatgaggccaaagtcat 1215222  T
Q  376 tgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||    
T  1215223 tggttggatctgcactagatcaaagctgatttgacaatctgaa 1215265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13977846 - 13977556
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |||||  |||||| |||| ||||||    
T  13977846 gatattcattcgttcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaaaagaaatgaatctgcgaacaaactcacagcatctatgtta 13977747  T
Q  283 atagcataa--aacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    |||||||||  |||  ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||| |  |           || ||||||||||| || || | |||    
T  13977746 atagcataattaacggcaaggtacaaaagcctgcacatatgattatattcaagtctccagaatactcatatctccggatctgcaacgttgacgatgtcaa 13977647  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtc 460  Q
    |||||||||||| || ||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13977646 agtcgttgattgaatttgcactgaatcgaagttgatctgataatctgaaccggtcaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtc 13977556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Original strand, 2024897 - 2025044
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2024897 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatcca 2024996  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   ||| ||||| |||||||||    
T  2024997 tgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgtctacaaatatgacta 2025044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 330
Target Start/End: Original strand, 10338510 - 10338656
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgat---ata---atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10338510 attcattcaaattaatagagtacatcaatgcaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 10338609  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattt 330  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  10338610 tagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatattt 10338656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 27534093 - 27534396
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  27534093 attcatttatttaaattgaaagagtacatcgatgcaatacaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 27534192  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |  |           || || |||||||| ||||||||| |||||     
T  27534193 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctacggaatagtcacgtttccggatatgcaacgttgatgacgcctaagtca 27534292  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | || |||| |||||| | ||    ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27534293 ttggttggatctgcactggatcgaagctaatctgacaatctgatctgaacaaacacctaa-acaagagggaaaacacaaacaacgccgcacaaagacgac 27534391  T
Q  474 gaaca 478  Q
     ||||    
T  27534392 aaaca 27534396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 14600370 - 14600518
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  14600370 gatatttattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatcc 14600469  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  14600470 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 14600518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37720268 - 37719993
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||  ||| || ||||||| ||||||||||    
T  37720268 attcattcaaattgatagagtacatcgatc-aatgtaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctccgaacaaactcgcagcatccatattaatagcat 37720170  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |          || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  37720169 aaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctacggaatacctatgtctctggatctgcaacgttgatgaagccaaagtctttga 37720070  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaaca 455  Q
    || |||||||||||||| |||| || ||||| | | | |||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  37720069 ttagatctgcactggatcgaagttggtctgatattctaaaccgaacaaatacccgaacgaaacaagaaagacaaaca 37719993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9993280 - 9993204
Alignment:
Q  9 gtttggtgttaatatttttcataggctcatgaaatgaaaaatcaaaattatcctataagtagagagtgttttgatat 85  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993280 gtttggtgttaacatttttcataggctcatgaaatgaaaaatcaaaattatcctataagtagagagtgttttgatat 9993204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 23970860 - 23971003
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgc-aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23970860 gatatacattcgttcaaattgatagagtacatcgatacaataccaaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtt 23970959  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  23970960 aatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaaaatgacta 23971003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18994317 - 18994075
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||   |||||||||||||||||    
T  18994317 gataatcattcattcaaattaatagagtacatcgatacattgcaaat-cgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacaacatccatgtta 18994219  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    ||||||||||||  || |||||||| || | || |||||| |||||| || |||||    |   ||  |||||||||||||| || |||||| || || |    
T  18994218 atagcataaaacgacatagtacaaaagcttgcatatatgattatattcaactctccagaatacttcagatctgcaacgtggacgatgccaaaatcattta 18994119  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccga 422  Q
    ||| |||| |||  |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  18994118 ttgaatcttcaccagatcaaagctgatctgacaatctgaaccga 18994075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4757605 - 4757457
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4757605 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 4757506  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  4757505 atgttaataacataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 4757457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37659229 - 37659096
Alignment:
Q  345 gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag 444  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||    
T  37659229 gaatctgcaacgttgacgacttcaaagtcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacgaaacaag 37659130  T
Q  445 aaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37659129 aaaggcaaacaacgtcgtacaaagacgacgaaca 37659096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 11298443 - 11298583
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11298443 attcatttattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcacttaaaataaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatccatgttaata 11298542  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    |||||||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||    
T  11298543 gcataaaacaacaaagtacataatactacaaatatgactat 11298583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31202905 - 31202752
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31202905 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 31202807  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  31202806 atgttaatagtataaaatggcaaagtacctatgcctacaaataggactatattta 31202752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 24790842 - 24790988
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  24790842 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa--aaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 24790939  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24790940 atgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 24790988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24700287 - 24700141
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  24700287 tcattcattcaaattcatagagtacatcgatacaattcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgtt 24700188  T
Q  282 aatagcataaaaca---ccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  24700187 aatagcataaaacagtgccaacgtacatatgcctacaaatatgacta 24700141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 476
Target Start/End: Original strand, 31147512 - 31147811
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  31147512 tcattcattaaaattaatatagtacatcgttacaatgcaaattcactaaaaa--aaaatgatgaatatgcgaacaaattcactgcatccatgttaatagc 31147609  T
Q  288 ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc--gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgt 375  Q
    ||||||   ||||||| ||| ||||||| |||||  |||||| || |||||          || |||  || ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  31147610 ataaaatgacaaagtataaaagcctacatatatggttatattcaagtctccgaaatactcatgtctctggattctgcaacgtggacgacgtcaaagtcat 31147709  T
Q  376 tgattggatctgcactggattgaagctgatc---tgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||   ||||||  |||||||| ||||||||| |  ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||    
T  31147710 tgattggatctgcattggattaaagttgatcacatgacaaactgaaccgaacaaatacctgaatgaaaca--aaaaagaaccaacctcgcactaagacga 31147807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Original strand, 32778645 - 32778805
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  32778645 atattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactcacaacaacca 32778744  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  32778745 tattaatagcataaaacggcaaagtacctatggctacaaatatgactatattcaagtctcc 32778805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16809291 - 16809144
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||  |||||| ||||  |||||||| |||    
T  16809291 attcattcaaattgatagagtatat-gatatagtgcaaattcgtaaaaaacaaaaatgatgaatctgcgtacaaactcacatcatctttgttaataacat 16809193  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16809192 aaaacaacaaagtacagaagcctacacatatgactatattcaagtctcc 16809144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 7280807 - 7281111
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||| |||||  |||||| || |||||  |||| |||||||||||||    
T  7280807 gatatgcattcattcaaattgatagagttcatcgatacaatactaattcgataaaaagaaaaagaatgaatttgcgaacaaactcataacatccatgtta 7280906  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||| || | |||          || ||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  7280907 atatcataaaacaacaaagtacaaaaacatacttatatgactatattcaagtatccggaatacccatgtctctagatctgcaacgtggacgacg-caaag 7281005  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || | ||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||    |||||||  || |||||||| || |||||||||||    
T  7281006 tcatagattgaatctgcactgg-tcgaagcggatatgacaatctaaaccgaacaaatacctgcatgaaacaaataagacaaacaatgttgcacaaagacg 7281104  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  7281105 acgaaca 7281111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11162343 - 11162197
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||      ||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11162343 gatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgggaacaaactcacaacatcc 11162244  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac 323  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||    
T  11162243 atgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgac 11162197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 2234142 - 2234290
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| |||||    
T  2234142 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaataaactcacatcatcc 2234241  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || |||||||||||||||  |||||||   ||||||| | |||||||||    
T  2234242 atattaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctaaaaatatgacta 2234290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 13575881 - 13576033
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||      |||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  13575881 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatcc 13575980  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || | ||| |||||||||    
T  13575981 atgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcttaaaaatacgactatatt 13576033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 305
Target Start/End: Original strand, 15237231 - 15237340
Alignment:
Q  196 tcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15237231 tcaaattgatagagtacatcaatagaataaaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgagaacaagctcacaacatctatgttaatagcataaaacc 15237330  T
Q  296 ccaaagtaca 305  Q
     |||||||||    
T  15237331 acaaagtaca 15237340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37613093 - 37612945
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||      | |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  37613093 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 37612994  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  37612993 atgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 37612945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 304
Target Start/End: Original strand, 28296787 - 28296914
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  28296787 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 28296886  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtac 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28296887 atgttaatagcataaaacggcaaagtac 28296914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26538820 - 26538709
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  26538820 gataatcattcattcaaattgattgagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgtca 26538721  T
Q  283 atagcataaaac 294  Q
    | ||| ||||||    
T  26538720 acagcgtaaaac 26538709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5526259 - 5526111
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||     
T  5526259 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataagttcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcagcatct 5526160  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5526159 atgttaatagcataaaacgacaaggtacatatgtctacaaatatgacta 5526111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9502025 - 9501878
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  9502025 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaagttcgctaaaaacaaaaa-gctgaatctgtaaacaaactcacaacatcc 9501927  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||    
T  9501926 atgttaataacataaaacggcaaagtacttattcctacaaatatgacta 9501878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 30026554 - 30026702
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||      ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||    
T  30026554 gatatttattcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagtatcc 30026653  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  30026654 atgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatgacta 30026702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32921074 - 32920929
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32921074 cattcatgcacattgatagagtacatcaatgcaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaactcacaacatccatgttaatagca 32920975  T
Q  289 taaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat 334  Q
     |||||  || |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  32920974 caaaacgacatagtacataagcctacaaacatgactatattaaaat 32920929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Original strand, 7014151 - 7014294
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatat-aatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||       ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | |||||    
T  7014151 gatattcattcattcaaattgatagagt-------tatgaatgaaaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaataaactcacaacaactatgtt 7014243  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  7014244 aataacataaaacaacaaagtactaaaacctacacatatgactataattaa 7014294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 329
Target Start/End: Original strand, 7269150 - 7269290
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||  |||| | |||||||||||||| ||    
T  7269150 catttattcaaattgatagagttcatcgatacaatacaaattcgataaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaactcatagcatccatgttaatatca 7269249  T
Q  289 taaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| ||| | ||||||||    
T  7269250 taaaacaacaaagtacaaaaacctactcatgtaactatatt 7269290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12357229 - 12357076
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12357229 gatattcattcattcaaatttttaaagtacattgata--atacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgtta 12357132  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||| |||||    || |||||| |  |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12357131 atagaataaattggcagagtacataaacctacaaatatgactatattaaagtctcc 12357076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 13570439 - 13570598
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||       | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13570439 gatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatttaaatttgttaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 13570538  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||  ||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  13570539 atgttaatagcataaaacggc--agtacctatgcctacaaacatgactatattcatatctcc 13570598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Original strand, 39067411 - 39067510
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39067411 aaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcagagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 39067510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 7579527 - 7579644
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  7579527 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaactcacaacatcc 7579626  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7579627 atgttaatagcataaaac 7579644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26937765 - 26937655
Alignment:
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26937765 aaagtcattgattggatttgcactagatcaaagctgatctgacaatctgaaccgaataaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaa 26937666  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    | |||||||||    
T  26937665 gtcgacgaaca 26937655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37659296 - 37659226
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37659296 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 37659226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 43936852 - 43937000
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  43936852 gatatttattcattcgaattgatagagtagatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 43936951  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  43936952 atgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgacta 43937000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19720470 - 19720318
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaat----agagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaac 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||  |    
T  19720470 gatattcattcattcaaattgattgatagagtacatcgatacaatacaaatcgaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtggacaaactcactgc 19720371  T
Q  273 atccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  19720370 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtgcctatgcctacaaatatgacta 19720318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 40490253 - 40490353
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||| | ||||||||    
T  40490253 caaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagtataaaacggcaaaatacctatgcctataaatatgact 40490352  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  40490353 a 40490353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 1809910 - 1810042
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||          ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  1809910 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaa----------acaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagtta 1809999  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1810000 atagcataaagtggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 1810042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 478
Target Start/End: Original strand, 5917510 - 5917726
Alignment:
Q  266 tcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||          || | |||  |||||||    
T  5917510 tcacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacaatagcctacacatatgaatatattcaagtctccaaaatacccatgtcttcgggtctgcaa 5917609  T
Q  355 cgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaac 454  Q
     |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||       | |||||||||| |||||||| ||||||||| |   ||| | |||| ||||||    
T  5917610 tgctgacgacgccaaagtcattgattggatctgcactgga-------tcatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaataggaaagacaaac 5917702  T
Q  455 aacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5917703 aacgtcgcacaaagacgacgaaca 5917726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22787895 - 22787809
Alignment:
Q  229 ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22787895 ttcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtagatatgcctaca 22787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41362190 - 41362041
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaa-atgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||      |||||||| |||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  41362190 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcatttacgctaaaaaaaaaagaggatgaatctatgaacaaactcacaacatc 41362091  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||| |||||||||    
T  41362090 catgttaatagcataaaacggcagggtacctatgcctacaaatatgacta 41362041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Original strand, 283701 - 283885
Alignment:
Q  195 ttcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||  ||||    |||||||||||||||||||||     
T  283701 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaa----cgaacaaactca-tggatccatgttaatagcataaaat 283794  T
Q  295 accaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||      || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  283795 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctc------cggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattgatttgatctgcact 283885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 632176 - 631992
Alignment:
Q  195 ttcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||  ||||    |||||||||||||||||||||     
T  632176 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaac----gaacaaactcatgg-atccatgttaatagcataaaat 632083  T
Q  295 accaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||      || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  632082 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctc------cggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattgatttgatctgcact 631992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 817988 - 817804
Alignment:
Q  195 ttcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||  ||||    |||||||||||||||||||||     
T  817988 ttcaaaatgatagagtacat-gatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaac----gaacaaactcatgg-atccatgttaatagcataaaat 817895  T
Q  295 accaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
       |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||      || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  817894 ggaaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagtctc------cggatctgcaacgtggacgacgctaaagtcattgatttgatctgcact 817804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31308592 - 31308457
Alignment:
Q  196 tcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  31308592 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaagttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccatgttattagcat 31308493  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  31308492 aaaactgcaaagtatttatgcctacaaatatgacta 31308457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Original strand, 18196831 - 18196970
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||   || ||| || |||||  ||| |||| | ||||||||| ||||    
T  18196831 attcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaggaatcaatctgcgaacaaactcccaacgttcatgttaatcgcat 18196930  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||  ||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  18196931 aaaacggcaaagtacagaagactacaaatatgactatatt 18196970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 15286753 - 15286853
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||  |||||||    
T  15286753 caaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaactcacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgact 15286852  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  15286853 a 15286853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 15467122 - 15467222
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||  |||||||    
T  15467122 caaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaactcacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgact 15467221  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  15467222 a 15467222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Original strand, 3204506 - 3204584
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3204506 caaattcactaaaaacaaaaatgatgaatctttgaacaaactcacatcatccatgttaataacataaaacggcaaagta 3204584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6833774 - 6833646
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaac----atccat 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||   |||||||    ||||||    
T  6833774 gatattcattcattcaaattgatagagtacat--------tgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgcaaacaaattcacaacatcgatccat 6833683  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  6833682 gttaatagcataaaaaagcaaaatacaaaagcctaca 6833646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 37128215 - 37128308
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37128215 caaattcattaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcaca-------tgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgact 37128307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 31407471 - 31407568
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  31407471 caaattcgctaaaaacaaaaa-gatgaatctgtgaacaaactcacatcat--atgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgact 31407567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 418
Target Start/End: Original strand, 18190711 - 18190770
Alignment:
Q  359 gatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18190711 gatgacgccaaagtcattggttggatctgcactggatcgaagctgatttgacaatctgaa 18190770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Original strand, 10951970 - 10952084
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt-----cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||     || |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  10951970 atattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaattaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatccat 10952069  T
Q  279 gttaatagcataaaa 293  Q
    | |||||||||||||    
T  10952070 gataatagcataaaa 10952084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Original strand, 10959975 - 10960089
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt-----cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||     || |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  10959975 atattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaattaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatccat 10960074  T
Q  279 gttaatagcataaaa 293  Q
    | |||||||||||||    
T  10960075 gataatagcataaaa 10960089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 11298616 - 11298698
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  11298616 tgcaacgtttatgacgccaaagtcattggttggatctgcactggatcaaagctaatctgacaatctgatccgaacaaacacct 11298698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31874500 - 31874459
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31874500 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg 31874459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3028364 - 3028297
Alignment:
Q  271 acatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  3028364 acatccatgttaataacataaaatgacaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagtctcc 3028297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3681130 - 3681055
Alignment:
Q  401 ctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    ||||| ||||||| | |||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  3681130 ctgatatgacaatctaaaccgaacaaataccagaaagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcatgaagacgacgaa 3681055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 35778777 - 35778891
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||      ||||||||| |||| |||| ||||| |||||   ||||||||||     
T  35778777 gatattcattcattcaaaatgataaagtacatcgatataatacaaactcaaagtagctaaaaaccaaaaggatgcatatgcgaacaaattcacaacatct 35778876  T
Q  277 atgttaatagcataa 291  Q
    |||||| ||||||||    
T  35778877 atgttattagcataa 35778891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12330036 - 12329958
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12330036 caaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatctgggaacaaattcacagcatccgtgttaatagcataaaacgacaaagta 12329958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 28298458 - 28298559
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||| | ||   |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||||    
T  28298458 caaattcactaaaaataaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatctacgt---tagcataaaacaacaacatacaaatgcatacgaatatgact 28298554  T
Q  325 atatt 329  Q
    |||||    
T  28298555 atatt 28298559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32920905 - 32920843
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctga 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| | ||||||    
T  32920905 atctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgattggatccacactggatcgaagttaatctga 32920843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Original strand, 45310908 - 45310978
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45310908 gatattaattcattcaaattgataaagtatatcgatactatacaattttgctaaaaacaaaaatgatgaat 45310978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14327705 - 14327609
Alignment:
Q  382 gatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | | |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14327705 gatctgcactgtatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaacacttga-acaaaagggaaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacaaaca 14327609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 14918429 - 14918478
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctac 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  14918429 ctcacaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctac 14918478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2968972 - 2968936
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2968972 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata 2968936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4928369 - 4928218
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||      | |||||||||||| ||||||| |  |||||  ||||| |||||||    
T  4928369 atatttattaattcaagttgatagagtacatcaatataatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatctccgaacaaactcacgacatcca 4928270  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
     |||||||| |||||||| | || ||   |||||| || |||||||||||||    
T  4928269 agttaatagtataaaacaacgaaatagttatgcctgcaaatatgactatatt 4928218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13864601 - 13864498
Alignment:
Q  366 ccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcaca 465  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||     |||||||||| |||||||||| |||| |    
T  13864601 ccaaagtcatggattgaatatgcactgtatcgaagctgatctgacaatctgaactgaagaaatacctgcataaaacaagaaagacaaacaacgccgcaga 13864502  T
Q  466 aaga 469  Q
    ||||    
T  13864501 aaga 13864498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Original strand, 26582745 - 26582870
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||| | || |||||  |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |  |||||||| |    
T  26582745 atctgcaacgtggatcatgctaaagtaattgattagatatgca---gattgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatatccgaacgaaacaag-a 26582840  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    |||||||||||   |||||||| |||||||    
T  26582841 aaacaaacaacaatgcacaaagtcgacgaa 26582870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 45445677 - 45445728
Alignment:
Q  249 tgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaa 300  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45445677 tgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaa 45445728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 589029 - 589075
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  589029 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 589075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 624893 - 624847
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  624893 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 624847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 26673509 - 26673571
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26673509 gctaaaaacaaaaaagatgaatctacgaacaaactcacatcatccatgttaataacataaaac 26673571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 42447874 - 42447916
Alignment:
Q  248 atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42447874 atgaatatgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 42447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 333
Target Start/End: Original strand, 12111103 - 12111168
Alignment:
Q  268 acaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 333  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  12111103 acaacatcaatgttaatagtataaaacgacaaagtacatatgcctatggataagactatatttaaa 12111168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 19443856 - 19443897
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc-gatataat 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19443856 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcagatataat 19443897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Original strand, 26582625 - 26582706
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| | | |||||||||||| |||| |||  | |||||||||    
T  26582625 aaattcgctaaaaataaaagtgatgaatatgcgaataagctcatagcctccatgttaataccatagaacgacgaagtacaaa 26582706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36261384 - 36261279
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaaca-aaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||  | |||||| |||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  ||||||||| ||    
T  36261384 attcattcaaatttttagagtacgtcgatacaatacaaattcattgaaaacataaaaggataaatatgtcaacaaacttacaacatatatgttaatatca 36261285  T
Q  289 taaaac 294  Q
    ||||||    
T  36261284 taaaac 36261279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2656124 - 2656060
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  2656124 cgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataaca 2656060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 7883044 - 7883076
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7883044 gatattcattcattcaaatcaatagagtacatc 7883076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10334861 - 10334813
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgccta 313  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  10334861 ctcacaatatccatgttaataacataaaacaacaaagtactcatgccta 10334813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10334933 - 10334885
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  10334933 gatatccattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattc 10334885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20993161 - 20993097
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  20993161 ctcacaatatccatgttaatagtataaaataacagagtacatatgcatacaaatatgattatatt 20993097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 38545488 - 38545524
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38545488 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgata 38545524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 23067527 - 23067832
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23067527 atattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 23067626  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||          || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23067627 tagcataaaacggcaaggtacaaaggcctacacatatgactatatttaaatatccggaatagccatgtctccgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 23067726  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23067727 cattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacga 23067826  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  23067827 cgaaca 23067832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4634719 - 4634413
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4634719 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctcacatcatccatgtta 4634620  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |           || |||||||||||||||||| ||||||    
T  4634619 atagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacaccaaag 4634520  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4634519 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 4634420  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  4634419 acgaaca 4634413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9662289 - 9661983
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9662289 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacatcatccatgtta 9662190  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  9662189 atagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 9662090  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662089 tcattgattgcatctgcactggatcgaagctgatctaacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 9661990  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  9661989 acgaaca 9661983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 46716572 - 46716878
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46716572 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 46716671  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  46716672 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatatctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 46716771  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46716772 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 46716871  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  46716872 acgaaca 46716878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 14542190 - 14542496
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14542190 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcatatcatccatgtta 14542289  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||| |||||||||  |||||    
T  14542290 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaaagtggatgacaacaaag 14542389  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14542390 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 14542489  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  14542490 acgaaca 14542496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 53904015 - 53903713
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  53904015 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacagcatccatgtta 53903916  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc--------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||  || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  53903915 atagaataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataaatgtttccagatctgtaacgtggatgacgccaaagtc 53903816  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  53903815 attgattggatctgcactggatcgaagctgatctggcaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaggaaaaacaaacaacgtcgtacgaagacgac 53903716  T
Q  474 gaa 476  Q
    |||    
T  53903715 gaa 53903713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41487010 - 41486705
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41487010 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgaaataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 41486911  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||          || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41486910 atagcat-aaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactagatttagatctccggaataaccatgtctccagatctgcaacgtggatgacgccaaag 41486812  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41486811 tcattgattggatttgcactgtatcgaagctaatttgacaatctgaaccgatcaaatagctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgttgcacaaagacg 41486712  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  41486711 acgaaca 41486705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Original strand, 54420418 - 54420723
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54420418 gatattcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 54420517  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||| |||||    
T  54420518 atagcataaaacatcaaagtacaaatgcttacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 54420617  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattg-aagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54420618 tcattgattgaatctgcactagatcgaaagttgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctcagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 54420717  T
Q  471 gacgaa 476  Q
    ||||||    
T  54420718 gacgaa 54420723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 478
Target Start/End: Original strand, 9474224 - 9474523
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9474224 ttcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgagtatgtgaacaggctcacaacatccacgttaatagcat 9474323  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  9474324 aaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtctcaggatctgcaatgtggatgacgtcaaagtcattga 9474423  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9474424 ttggatctacactggatcgaagttgatcagacaatctgaaccaatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 9474523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 196 - 478
Target Start/End: Original strand, 30469814 - 30470107
Alignment:
Q  196 tcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  30469814 tcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcagatcatccatgttaatagcataaaacg 30469913  T
Q  296 ccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggat 384  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30469914 gaaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggat 30470013  T
Q  385 ctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30470014 ctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaacacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacaaaca 30470107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 184 - 470
Target Start/End: Original strand, 37869097 - 37869393
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37869097 atattcatttattcaaattgatagagtacatctatataatgcaaattcattaaaaacaaaag-gatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 37869195  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctgg-----------ctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37869196 taacataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgggataaccatgtcttcggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 37869295  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37869296 cattgattggatttgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaataccttagagaaacaagaaaaataaataacgtcgcacaaagac 37869393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 42972467 - 42972168
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  42972467 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaggctcacaatatccatgttaatagcac 42972368  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc----------tcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42972367 aaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctttggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattga 42972268  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42972267 ttggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagaaaaataacgtcgcataaagacgacgaaca 42972168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 217 - 468
Target Start/End: Original strand, 52555452 - 52555714
Alignment:
Q  217 atataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  52555452 atataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgttaatagcataaaagtacaaggtacaaatgcctacac 52555551  T
Q  317 atatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||          || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52555552 atatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccgaatctgcaacatggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagctgat 52555651  T
Q  406 ctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52555652 ttgacaatctgaaccgattaaatacctaagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgtacaaag 52555714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 217 - 479
Target Start/End: Original strand, 34115368 - 34115636
Alignment:
Q  217 atataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacac 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34115368 atataatgtaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaataggctcagaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacac 34115467  T
Q  317 atatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34115468 atatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgccaaaatcattgattggatctacactggattgaagctgat 34115567  T
Q  406 ctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaacat 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||| ||||||||    
T  34115568 ctgacaatctgaaccgatcaaatacctaagagaaacaaaaaaaa-----aacgtcgcacaaagacaacgaacat 34115636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 226 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32189372 - 32189110
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32189372 aaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgatta 32189273  T
Q  326 tatttaaatctcctgg----------ctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatt 414  Q
    ||||||||||||| |           ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  32189272 tatttaaatctccggagtaaacacgtctccagatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactgg-tcgaagctgatctgacaatc 32189174  T
Q  415 tgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32189173 tgaaccaatcaaacacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 32189110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20961883 - 20961578
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  20961883 atattcatttattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctataagcaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgttat 20961784  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20961783 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgaatatatttaaatctccggaataatcatgtttccgtatctgcaacgtggatgacgtcaaagt 20961684  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||    
T  20961683 cattgattgaatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagacgaaaaaccaacgtcgtacaaagatga 20961584  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  20961583 cgaaca 20961578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14346867 - 14346561
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  14346867 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaagaggatgaatccgtgaacaaactcacagcatccatgtta 14346768  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||          | ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  14346767 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctagaatacacatggctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 14346668  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14346667 tcattgatttgatttgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcgagcaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaacgacg 14346568  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  14346567 acgaaca 14346561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 29474006 - 29474312
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29474006 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcaatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtta 29474105  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||          || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  29474106 atagcataaaacggcaaagtactaaagactacacatatgactatatttaagcctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 29474205  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29474206 tcattgatttgatctgcactggatcgaagatggtctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaaagcaaacaacgtcgcacaaagacg 29474305  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  29474306 acgaaca 29474312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43157213 - 43156906
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43157213 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtta 43157114  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat----------ctcctg-gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |          ||| || |  || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  43157113 atagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctatggaatactcatgtgtccggatctgcaacgttgaggactccaaag 43157014  T
Q  372 tcgttgattggatc-tgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43157013 tcattgatttgatcttgcactgaatcgaagctgatctaacaatctgaaccgaacaaatacctgaatgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagtc 43156914  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  43156913 gacgaaca 43156906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 46728598 - 46728904
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  46728598 gatattaattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgtta 46728697  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||  |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||          | || || ||||| |||||||| || |||  |||||    
T  46728698 ataatataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctccgaatttgcaacgttgacgacttcaaag 46728797  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46728798 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaaggcaaacaacgtcgtacaaagacg 46728897  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  46728898 acgaaca 46728904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Original strand, 23002612 - 23002760
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23002612 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaa-caaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 23002710  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 333  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23002711 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 23002760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 7242464 - 7242753
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  || |||||||||||||||    
T  7242464 gatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaataaacttacaacatccatgtta 7242563  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||      || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  7242564 atagtataaaacgacaaaatacaaaagcctacacatctgactatattcaagtctc------cggatctgcaacgtggacgacgccaaagtcatttattgg 7242657  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||  || |||  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7242658 atctggcctagatcaaagttggtctgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacgaaataagaaagacaaacaacttcgcacaaagacgacgaaca 7242753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 15729659 - 15729965
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15729659 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaatttgctaacaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacagcatccatgtta 15729758  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||| | ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || |||||||||||| | || ||| |||||     
T  15729759 atagcgtgaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccgaaatacctatgtctccgaatctgcaacattgacgactccaaaa 15729858  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15729859 tcattgatttgatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaactgaacaaatacctgaacgaaacaagaaaggcaaacaacgtcgcacaaagacg 15729958  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  15729959 acgaaca 15729965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 478
Target Start/End: Original strand, 31601087 - 31601342
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc 335  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31601087 aaaataaaaaggatgaatatgtgaacaggttcacaacatccatgttaatagcataaagcggcaaggtacaaatgcctacacatataactatatttaaatc 31601186  T
Q  336 tcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatc 424  Q
    |||          || ||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  31601187 tccgaaataaccatgtctctgggtctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccaatc 31601286  T
Q  425 aa--atacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||  |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31601287 aaatatacctgagagaaacaagaaagataaacaatgtcgcacaaagacgacgaaca 31601342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 38435034 - 38434729
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  38435034 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgaaaatttgccaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacatcatccatgtta 38434935  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || | || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  38434934 atagcataaaatgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtcccggatctgcaacgttgacgactccaaagt 38434835  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||  || ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38434834 cattgattttatctgcactggatcgaagctgatctagtaatctgaattgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcggacaaagacga 38434735  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  38434734 cgaaca 38434729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 44374953 - 44375248
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44374953 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatagatctgtgaacaggctcacaacatccatttta 44375052  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |           || |||||||||||| ||||||||||||    
T  44375053 atagcataaaatggcaaggtagaaatgcctacacatatgactatattttaatctccgggataaccatgtctccggatctgcaacgtgtatgacgccaaag 44375152  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||           || |||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  44375153 tcattgattggatc-----------gaggctgatctaacaatctgaaccaattaaatatctgagagaaataaaaaagacaaataacgtcgcacacagacg 44375241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16992306 - 16992002
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16992306 atatttattcatt-aaattgatagagtacatcgatacaatgaaaactcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctcacaacatccatgttaa 16992208  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||          | || || || |||||||| ||  | |||  ||||||    
T  16992207 tagcataaaacagcaaagtattaaagcctacacatatgacaatatttaagtctctggaatacccatgtctccggatctgcaatgtttacgacttcaaagt 16992108  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||| |   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16992107 cattgatttgatatgcactggatcgaagctgatctgataatctgaaccgaaagaatacctgaacaaaacaagaaaggcaaacaacgtcgcacaaagacga 16992008  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    | ||||    
T  16992007 caaaca 16992002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 51646528 - 51646224
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||     |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  51646528 gatattcattcattcaaattgataga-----tcgatgcaatgaaaattcgccaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgtta 51646434  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggc-tcgaat---ctgcaacgtggatgacgcca 368  Q
    ||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||          | || | ||| ||   ||||||||| || ||  |||    
T  51646433 atagcataaaacggcaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatacccatgtcttcggatctgctgcaacgttgacgattcca 51646334  T
Q  369 aagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51646333 aagtcatcgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgataatctgaaccgaacaaatacttgagcgaaacaagaaagacaaacaacatcgcacaaag 51646234  T
Q  469 acgacgaaca 478  Q
    ||||||||||    
T  51646233 acgacgaaca 51646224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 478
Target Start/End: Original strand, 6789559 - 6789860
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaaca-aaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatag 286  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  6789559 tcattcaatcaaattaatagagtgcatcactacaatgcaaattcgctaaaaacataaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccatgttaatag 6789658  T
Q  287 cataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc----------ctggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgt 375  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||| || ||||           || | || |||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  6789659 cataaaacaacaaagttcaaa-acctacacatatcactatattaaagtctctataatataaatgtcttctaatctgcaacatggatgatgccaaagtcat 6789757  T
Q  376 tgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacga 475  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  6789758 tgattggatctgcgtaggatcgaagctgatctgacattctgaattgaacaaataccttaacgaaacaagaaagacaaacaatggcgcacaaagacgacga 6789857  T
Q  476 aca 478  Q
    |||    
T  6789858 aca 6789860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Original strand, 46775537 - 46775838
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||    
T  46775537 atattcattcattcaaattgataaggaatatcgataaaatgcaaattcgctcaaaacaaaaaggctgaatatgcaaacaaactcacaacatctatgttaa 46775636  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |  |          || ||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  46775637 tagcataaaacgacaaagcacaaaagcctacacatatgattatattcaagtctccggaatactatgtatccgtatctgcaacgttgatgacgtcaaattc 46775736  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |  ||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  46775737 attgattggatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacatgaacgaagcaaaaaagacaaacaacgccgcacaaa-acgac 46775835  T
Q  474 gaa 476  Q
    |||    
T  46775836 gaa 46775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 470
Target Start/End: Original strand, 29589040 - 29589337
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  29589040 atattcattcattcaaattgatggagtacattgatgcaatgaaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacatcatccatgttaa 29589139  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  29589140 tagcataaaacgacaaagtactaaagcatacacatatgactatatttaagtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgaagactccaaagt 29589239  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    | |||| | |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||  || ||||||||| |  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  29589240 cattgagttgatctgcactggatcgaagttgatcaaacaatctgaaatgaacaaatacctgaacgaaacaagaatgacaaacaaggtcgcacaaagac 29589337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Original strand, 626226 - 626377
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  626226 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatg 626325  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  626326 ttaatagcataaaacggcaaagtacccatgcctacaaatatgactatattta 626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9549868 - 9549571
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        || ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  9549868 gatattcattcattcaaattaatatagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaa-------tatctgtgaactgactcaaagcatccatgtta 9549776  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          || |||   |||||||||||| ||||   |||||    
T  9549775 atagcataaaacggcaaagtacaaatgtctatacatatgactatatttaaatctccagaataatcatgtctcttgatctgcaacgtgaatgatttcaaag 9549676  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaa-caacgtcgcacaaagac 470  Q
    |  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||    
T  9549675 taattgattggatctgtactagatcgaaactgatatgacaa-tcgagccgatcaaataccttagagaaacaagaaagacaaaccaacgtagcacgacgac 9549577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3169691 - 3169556
Alignment:
Q  343 tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaaca 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||    
T  3169691 tcgaatctgcaaagtggatgacgcgaaagtcattgattgaatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgaacaaatatctgaacgaaaca 3169592  T
Q  443 agaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3169591 agaaagacaaacaacgccgcacaaagacaacgaaca 3169556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23926471 - 23926217
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23926471 cattcgttcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagca 23926372  T
Q  289 taaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttg 377  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||          || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  23926371 tcaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagtcatgtctctggatctgcaacgttgatgatgccaaagtcattg 23926272  T
Q  378 attggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
     ||||||||||| |  || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  23926271 gttggatctgcatttaatcgaagctgatatgagaatttgaaccgaacaaacacct 23926217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 337
Target Start/End: Original strand, 50981395 - 50981546
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50981395 attcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 50981494  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
     ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50981495 tcataaaacaacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctc 50981546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 471
Target Start/End: Original strand, 50002874 - 50003153
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||                 ||| ||||||||||    
T  50002874 attcattcattcaaatagatatagtacatcgatataatgcgaattcgctaaaaacaaaaaggatgaata-----------------cattcatgttaata 50002956  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
     ||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |          || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  50002957 acataaaacggcaaagtgcaaatgcctacaactatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtctctgaatctgtaacgttgataacgccaaagtcg 50003056  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50003057 ttgattgaatttgcactggatcgaagctgatctgacaatctggactaatctaatacctgagagaaacaagaaagacaaacatcgtcgcacaaagacg 50003153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Original strand, 33020608 - 33020851
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||   |||| |||||||||||||||    
T  33020608 attcattcattcaaattgatagagtacatcgaagtaatataaattccctaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaattcacgacatccatgttaata 33020707  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    ||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||          || || ||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  33020708 gcataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaataatcatgtctccgaatctacaacgttgatgacgccaaagtca 33020807  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  33020808 ttggttggatttgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaa 33020851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 4959252 - 4959557
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  4959252 gatattcattcattcatattgataaagtacatcgttacaatgcaaatttgttaaaaacaaaaagaatgaacatgcgaacaaactcacaacatcaatgtta 4959351  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||  ||||||||||| || |||          | || || || ||||||||||  || ||||||||||    
T  4959352 atagcataaaactgcaaagtacaaaagtctacacccatgactatattcaagtctacggaatacccatgtctccggatctgcaacgctgacgacgccaaag 4959451  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||   |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  4959452 tcattgattggatctgcact-aatctaagctgatctgacatttcgaaccgaacaaatacaggaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaaaaca 4959550  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  4959551 acgaaca 4959557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Original strand, 6082111 - 6082264
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6082111 atatttatttattcaaattgatagagtacatcgataca-tccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 6082209  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  6082210 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 6082264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 29576799 - 29577106
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |   ||||  |||||||||||| | ||     
T  29576799 gatattcattcattcaaattgataaagtatatcaatacaatgcaaatttgctaataacaaaaatgatgaatctacaaacaaactcacaacatccctcttt 29576898  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||          || | ||| ||||||||||| || |||||||||     
T  29576899 atagtataaaacggcaaggtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatattcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaaa 29576998  T
Q  372 tc-gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||  |||||||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  29576999 tcatttgattggatatgcgctggatctaagccgatatgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaaaaaagacaaacaacgccgcacaaagac 29577098  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    | ||||||    
T  29577099 gtcgaaca 29577106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6408881 - 6408726
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||  ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  6408881 gatattcattcatttaaattgacaaagtacattgatataataaaaatttgataaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatttta 6408782  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6408781 atagcataaaacagcaaagtaccaaagcctacacagatgactatatttaagtctcc 6408726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3673921 - 3673778
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3673921 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatataaatttgttaaaaataaaaaggacgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 3673822  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  3673821 gcataaaacggcaaagtacacaagcctacaaatatgactatatt 3673778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25658617 - 25658479
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25658617 atattcattcattcaaattgacaaaatacattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaataatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttga 25658518  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25658517 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatga 25658479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7060771 - 7060619
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  7060771 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaaatgtgaacaaactcacaacatcc 7060672  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  7060671 atgttaatagcataaaacgataaagtacctatgcctacaaatatgactatatt 7060619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 20887421 - 20887569
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20887421 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 20887520  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20887521 atgttaatatcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 20887569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28990704 - 28990428
Alignment:
Q  213 atcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcct 312  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  28990704 atcgatacaatgcaaatccgttaaaaacaaaaacgataaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagtct 28990605  T
Q  313 acacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagc 401  Q
     |||||||||  ||||| || |||||          || | ||  |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  28990604 gcacatatgataatattaaagtctccagaatacacatgtcttcagatctgcaacgtggacgacgtcaaaatcattgattggatatgcactagatcgaagc 28990505  T
Q  402 tgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||||||||| ||||| || ||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  28990504 taatctgacaatctgaacggaacaaatgcctgaacgaaacaagaaagacagacaacaccgcacaaagacaacgaaca 28990428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 30416305 - 30416434
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaac-aaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  30416305 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtt 30416404  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcc 311  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  30416405 aatagcataaaacggcaaagtactaatgcc 30416434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53648063 - 53647912
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg-------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  53648063 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcataacatcc 53647964  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  53647963 atgttaatagcattaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatat 53647912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 7083485 - 7083639
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  7083485 gatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 7083584  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  7083585 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgactatattta 7083639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34668622 - 34668497
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34668622 gatatttattcatttaaattgataaagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacagcatccatgtta 34668523  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatg 309  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||||    
T  34668522 atag-ataaaacggcaaaatacaaatg 34668497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 40861363 - 40861176
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40861363 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgttaaaaacgaaaaggatgaatctatgaacaaactcgcatcatccatgttaatagcataaaa 40861264  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctg 387  Q
    |  |||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||      || ||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  40861263 cgacaaagtactaaagcttacacatctgactatatttaagtctc------cggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattaatttgatctg 40861176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 477685 - 477837
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |      || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  477685 gatattcattcattcaaatcgatagagtacattgatacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaacgatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 477784  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  477785 atgttaatagcataaaacgtcaaagtacctacgcctacaaatatgactatatt 477837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 11209977 - 11210125
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  11209977 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaatccaaattcactaaaaacataaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 11210076  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11210077 atgataatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgacta 11210125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 36124021 - 36124173
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36124021 gatattcattctttcaaattgatagagtccatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 36124120  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36124121 atgttaatagcataaatcggcaaagcacatatgcctacaaatatgactatatt 36124173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 45350734 - 45350882
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  45350734 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 45350833  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45350834 atgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 45350882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 45360213 - 45360361
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  45360213 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 45360312  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45360313 atgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 45360361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2945574 - 2945267
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  2945574 gatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacgatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagcatccatgtta 2945475  T
Q  283 atagcataaaac-accaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    ||| || |||||   ||| ||||||| ||||  |||| | |||||||| || |||||          || || || |||||||| ||  | |||||||||    
T  2945474 ataacaaaaaacgggcaaggtacaaaagcctgaacatgttactatattcaagtctccgaaatacctatgtctccggatctgcaatgttaacgacgccaaa 2945375  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||| || ||||| | |||| | ||||    
T  2945374 gtcattgattgtgtcttcactggatcgaaattgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaaaaaacactaacaatgccgcatacagac 2945275  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    || |||||    
T  2945274 gatgaaca 2945267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 343 - 478
Target Start/End: Original strand, 1645404 - 1645539
Alignment:
Q  343 tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaaca 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||||    
T  1645404 tcgaatctgcaaagtggatgacgtgaaagtcattgattgaatctgccctagattgaaactgatctgacaatttgaaccaaacaaatatctgaacgaaaca 1645503  T
Q  443 agaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1645504 agaaagacaaacaacgccgcacaaagacaacgaaca 1645539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 30416446 - 30416577
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||    
T  30416446 atctgcaacgttgatgactccaaagtcattgatttgatctgcactggatcaaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacccaaacaaaacaaaaa 30416545  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30416546 agagaaacaacgtcgcgcaaagacgacgaaca 30416577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 32616526 - 32616668
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  32616526 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcttaacatccatg 32616625  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
     ||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||    
T  32616626 ctaatagcataaaacggcaaagtgcatatgcctacaaatatga 32616668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 393938 - 394086
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  393938 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 394037  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  394038 atgttaatagcataaaacgggaaagtacatatgcctacaaatatgacta 394086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5388946 - 5388805
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  5388946 attcattcatttaaattgatagagtacatcgctacaatacaaattcgttaaaaatataaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgctaata 5388847  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||||||   |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5388846 gcataaaacggaaaagtacataagcctacaaatatgactata 5388805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31311904 - 31311761
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  31311904 gatattcattcattaaaattgatatagtatat-gatacaatgtaaattcattaaaaacaaagatgatgaatatgcgaacaaact-acaacatccatgtta 31311807  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31311806 atagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacacatgactatat 31311761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31522403 - 31522255
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||      |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31522403 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 31522304  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
     |||||||||||||||||   |||||||  |||||| || |||||||||    
T  31522303 ttgttaatagcataaaacggaaaagtacttatgcctgcaaatatgacta 31522255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 38943821 - 38943973
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | |||||    
T  38943821 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatatcatcc 38943920  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  38943921 atgttaatagcataaaacgacaaagtatttatgcctacaaatatgactatatt 38943973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42198010 - 42197862
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  42198010 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaaactcacaacatcc 42197911  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  42197910 atgtcaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgacta 42197862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26674770 - 26674666
Alignment:
Q  227 aattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  26674770 aattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacagaaaagtacctatgcctacaaatatgactgt 26674671  T
Q  327 attta 331  Q
    |||||    
T  26674670 attta 26674666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 26742136 - 26742288
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgat---ata---atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   |||   || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  26742136 gatattcattcattcaaattgatatagtgcatcgatgcaatacaaatccaaattcgctataaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 26742235  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  26742236 atgttaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctacaaatatgactatatt 26742288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6912135 - 6911989
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  6912135 tattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccat 6912036  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| |||||||||    
T  6912035 gttaatagcataaaacagcaaggtatctatgcctacaaatatgacta 6911989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 46386627 - 46386758
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  46386627 atctgcaacgttgacaacgccaaagtcattgattggatcagcactagatcgaagttgatatgacaatttgaacagaacaaatacctaaacgaaacaagaa 46386726  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  46386727 aaacaaacaatgacgcacaaacacggcgaaca 46386758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 4622382 - 4622527
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||| || |||||  |||||| |||||||||||    
T  4622382 gatattcatttattgaaattgatagagtacattaatacaatgcaaatttgctaaaaacaacga-gatgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgtta 4622480  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  4622481 atagcataaaacgacaaagtacgaacgcctacacacatgactatatt 4622527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 471
Target Start/End: Original strand, 35658251 - 35658507
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||||    
T  35658251 caaattcgctaaaaataaaaatgatgaatttatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacataagtttacaaatatgact 35658350  T
Q  325 atatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    ||||| ||||||          | || || || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  35658351 atattaaaatctctggaatagacatgcctccggatctgcaacgttgatgacgtcaaagtcattggttgaatctgcacttgatcaaaactgatctgacaat 35658450  T
Q  414 ttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
     | ||| || |||| ||| || | ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35658451 ctaaactgaacaaacaccgaaca-aaagagaaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 35658507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 8517123 - 8517271
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||    
T  8517123 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactaacaatatcc 8517222  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||    
T  8517223 atgttaatagcataaaacagcaaagtacctatgcttataaatatgacta 8517271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13966000 - 13965852
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| |||||    
T  13966000 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattccctaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaactcacagcatcc 13965901  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  13965900 atgttaatagcataaaacggcaaagtccctatgcctacaaatatgacta 13965852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 24568379 - 24568495
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  24568379 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacattc 24568478  T
Q  277 atgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||||||||||    
T  24568479 atgttaatagcataaaa 24568495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 478
Target Start/End: Original strand, 26576223 - 26576486
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26576223 caaattcaccaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaattcacaacatccatgataataacataatacggtaaagtactaaagcctacacatatgact 26576322  T
Q  325 atatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||||| | |||||          || | ||| ||||||| ||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  26576323 atatttgagtctccggaatactcatgtcttcggatctgcatcgttgacgactccaaagtcattgatttgatctgcactagatcgaagctgatttgacaat 26576422  T
Q  414 ttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
     |||| ||| ||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26576423 ctgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaggaaagacaaacaa-gtcgcacaacgacgacaaaca 26576486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 43244045 - 43244193
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  43244045 gatattcattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacaacatcc 43244144  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  43244145 atgttaatagcataaaccggcaaagtgcttatgcctacaaatatgacta 43244193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3159418 - 3159211
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||       ||||||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||||| |||||    
T  3159418 atattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatctgcaaacaatctcacaatatcca 3159319  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttg 377  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || || ||||      || ||||||||||| |||||||| ||| || |||    
T  3159318 tgttaatagcatgaaacagcaaagtacttatgcctacaaatatgactatgttcaagtctc------cggatctgcaacgttgatgacgctaaaatcattg 3159225  T
Q  378 attggatctgcact 391  Q
    || |||| ||||||    
T  3159224 atcggatatgcact 3159211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12519917 - 12519786
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |  || |||||||    
T  12519917 atctgcaacatggacgacgctaatgtcattgattggatctgcactagatcgaagttgatctgacaatttgaaccaaacaaatacctgaacgatacaagaa 12519818  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12519817 agacaatcaacttcgcacaaatacgacgaaca 12519786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47466311 - 47466208
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  47466311 caaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacataaacctacaaatatgact 47466212  T
Q  325 atat 328  Q
    ||||    
T  47466211 atat 47466208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1125174 - 1125076
Alignment:
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  1125174 ttgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatttgaaccaaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaatcaacgtcgcaaaaagacgac 1125076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7084399 - 7084280
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata--------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  7084399 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcat 7084300  T
Q  275 ccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7084299 ccatgttaatagcataaaac 7084280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8712965 - 8712816
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  8712965 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcatc 8712866  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8712865 catgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta 8712816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27395272 - 27395159
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  27395272 atattcattcattcaaattgatagagttcatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatggtgaatatttgaacaaactcacaacagcca 27395173  T
Q  278 tgttaatagcataa 291  Q
    ||||||||||||||    
T  27395172 tgttaatagcataa 27395159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31932704 - 31932552
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||      | ||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  31932704 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgacacaatacaaattcaaaatcgttaaaaacaaaaagtatgaatatgcgaacaaactcataacatcc 31932605  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  31932604 atgttaatagcataaaacaatagagtacatatgcctacaaatatgattatatt 31932552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39838051 - 39837903
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||       |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  39838051 gatattcattcattcaaattgttagagtatatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 39837952  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  39837951 atggtaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 39837903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22757493 - 22757390
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  22757493 caaattcgctaaaaa-aaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggctaagtacctatgcctacaaatatgact 22757395  T
Q  325 atatt 329  Q
    |||||    
T  22757394 atatt 22757390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40859896 - 40859804
Alignment:
Q  386 tgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40859896 tgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacccgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 40859804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6882401 - 6882252
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  6882401 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaactcacaacatcc 6882302  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |   ||||||||||||||  |||||||   ||| ||||| |||||||||||||    
T  6882301 a---taatagcataaaacggcaaagtatttatgtctacaaatatgactatatt 6882252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 18502506 - 18502623
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||    
T  18502506 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagaatcc 18502605  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18502606 atgttaatagcataaaac 18502623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28837512 - 28837352
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| |||||    
T  28837512 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaataaactcacatcatcc 28837413  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    || ||||| |||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28837412 atattaat-gcataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 28837352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 38169836 - 38170143
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |||||   ||| | ||||||||||    
T  38169836 gatattaattcattcaaattgatatagcacatcgatccaaatgcaaatttgctaaaaataaaaaagataaatctgcgaacaaattcataccatccatgtt 38169935  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagta-caaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg---gctc--------gaatctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |    |||        | || |||||||| |||||||||||    
T  38169936 aatagcataaaataacaaagtagaaaaagcctacacgtatgactatattcaagtctccggaatactcatgcatcaggatttgcaacgttgatgacgccaa 38170035  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |  ||||    
T  38170036 agtcattgattggatcagcactagatcaaagttgatatgacaatctgaacggaataaatacctga-acaaacaagaaagacaaacaacgtcgtaagaaga 38170134  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||| ||||    
T  38170135 cgacaaaca 38170143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50801659 - 50801511
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||      |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  50801659 gatattcatttattcaaattgatagagtgcatcaataaaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggctgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 50801560  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  50801559 atgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 50801511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51152571 - 51152420
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      |||||||||||  ||| || || | ||||||||  ||||||||||||    
T  51152571 gatattcat-cattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacttaaaggaagactttgtgaacaaactcacaacatcc 51152473  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  51152472 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatttgcctacaaatatgactatatt 51152420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12520055 - 12519976
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  12520055 gatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaaca 12519976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30202495 - 30202378
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||      |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  30202495 gatattcattcaatcaaattgatagagtacatctatacaatacaaatctaaattcgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaactcacaacatcc 30202396  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30202395 atgttaatagcataaaac 30202378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 24611462 - 24611570
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  24611462 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 24611561  T
Q  277 atgttaata 285  Q
    |||||||||    
T  24611562 atgttaata 24611570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37431613 - 37431461
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||      |||||||| |||| |||||||| |||||||    |||||||||||    
T  37431613 gatattctttcttttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaaattgctaaaaataaaactgatgaatctgtgaacgaattcacaacatcc 37431514  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37431513 atgttaataacgtaaaacaacaaaatacacatgcctacaaatatgactatatt 37431461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46268122 - 46267975
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||  |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  46268122 gatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaactcacaacatcc 46268024  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||    
T  46268023 atgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgacta 46267975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 55600210 - 55600362
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||   ||||| |||||    
T  55600210 gatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatctaaaatcactaaaaacaaaaaggataaatttgtgatcaaattcacatcatcc 55600309  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  55600310 atgttaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctacaaatatgattatatt 55600362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5814785 - 5814627
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| |||||||      |||||||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  5814785 attcattcattcagactgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattagctaaaagaaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatg 5814686  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||    ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  5814685 ttaatagcataaaatggaaaagtatttatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 5814627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 20399569 - 20399715
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||      || |||| |||||| | ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  20399569 attcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaattcaaattcgccaaaagcaaaaaaggatgaatccgtgaacaaactcacaacatccat 20399668  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20399669 ggtaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta 20399715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Original strand, 19885645 - 19885787
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||  |||||| || |||||||||    
T  19885645 atattcatttattcaaattgatacagtatatcaatacaatttaaatttgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagcagccatgttaa 19885744  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    || ||| || |  ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19885745 tatcatgaagcgacaaagtacaaaagcctactcatatgactat 19885787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27091165 - 27091004
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||     
T  27091165 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaacttacaacatct 27091066  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||| || ||||||| ||||| |||||    
T  27091065 atgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttacaaatgtgactatgtttaagtctcc 27091004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11817449 - 11817337
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  11817449 caaattcactaaaagcgaaaa-gatgaacatgtgaacaaactcacaacatctattttaatagaataaaacggcaaagtacataagcctacatatatgact 11817351  T
Q  325 atatttaaatctcc 338  Q
    ||||| ||||||||    
T  11817350 atattaaaatctcc 11817337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 12716796 - 12716948
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||| || ||||       ||||||| || |||||||||| || ||| |  ||||||||||||    
T  12716796 gatattcatttattcaaattgataaattacatcgatacaatacatattcaaaggcactaaaaataagaatgatgaatctgcgaagaaactcacaacatcc 12716895  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12716896 atattaatagtataaaacaacaaagtatttatgcctacacatatgactatatt 12716948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 56236495 - 56236647
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |      || |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   | |||  ||||    
T  56236495 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaaatcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaatttacattatcc 56236594  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  56236595 atgttaatagcataaaacggcaatgtatctatgcctacaaatatgattatatt 56236647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 434
Target Start/End: Original strand, 1657295 - 1657506
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 333  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||  |||| |||  |  |||||||||||||||||||||||     
T  1657295 taaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcaactatgttaatagcataaaacggcaaaatactgaatcctacacatatgactatatttaag 1657394  T
Q  334 tct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccga 422  Q
    |||          | || || || ||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||    
T  1657395 tctctggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcattgatttgatttgcactggatcgaagctaatctgactatctgaatcga 1657494  T
Q  423 tcaaatacctaa 434  Q
     |||||||||||    
T  1657495 acaaatacctaa 1657506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3169802 - 3169742
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaata 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3169802 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagattaata 3169742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6408654 - 6408574
Alignment:
Q  397 gaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaac 477  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6408654 gaagctgatttgacaatttgaactgaacaattacctaaacgaaacaagtaagacaaacaatgtcgcacaaagacgacgaac 6408574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24100590 - 24100452
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||||||||||| | |||        |||||||||    
T  24100590 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaatttcgctaaaaacaaaaatgatgaatctatga-------tacaacatcc 24100498  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    | ||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||||    
T  24100497 acgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctacagatatga 24100452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26625516 - 26625369
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    |||| ||||| || ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||||||||    
T  26625516 attcgttcaatttgataaaggacatcaatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaattcataacatccttgttaatagcat 26625417  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
      |||| |||||| |||  ||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  26625416 -taacaacaaagtgcaatagcctacaaacatgactatattcaagtctcc 26625369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 29266568 - 29266684
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||      |||| ||||||||  ||||||  ||||||||  |||||| |||||    
T  29266568 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctagaaacaaaag-gatgaaactgtgaacaaactcacagcatcc 29266666  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29266667 atgttaatagcataaaac 29266684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 44756703 - 44756811
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||    
T  44756703 gatattcattcatccaaattgatagagtacatcggtacaatagaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacagcatcc 44756802  T
Q  277 atgttaata 285  Q
    |||||||||    
T  44756803 atgttaata 44756811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 254
Target Start/End: Original strand, 1645293 - 1645353
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaata 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  1645293 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaaaaaagattaata 1645353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24789632 - 24789479
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat--------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||         ||  |||||||||||||||||||| | ||||||  ||  ||||||     
T  24789632 atattcgttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacatt 24789533  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  24789532 catgttaatagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatgattatatt 24789479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 329
Target Start/End: Original strand, 24818627 - 24818780
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat--------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||         ||  |||||||||||||||||||| | ||||||  ||  ||||||     
T  24818627 atattcgttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacatt 24818726  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  24818727 catgttaatagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatgattatatt 24818780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 4622562 - 4622693
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |  || ||||||| |||||||| | ||||||| ||  |||||||||    
T  4622562 atcagcaacgtggaggacatcaaagtcgttgattgaatttgcattggatcgaaaccaatatgacaatctgaaccgaaccaatacctgagcaaaacaagaa 4622661  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  4622662 agacaaacagcgccacacaaagacgacaaaca 4622693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 307
Target Start/End: Original strand, 9781490 - 9781609
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaat 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||| ||| |||||    
T  9781490 tattcattcattcaaatta-tagagtaaatcaatttaataca--tttgctaaaaacaaaaataatgaatcgacaaacaaactcacaacattcatcttaat 9781586  T
Q  285 agcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  9781587 agcataaaataccaaagtacaaa 9781609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 22066745 - 22066880
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| | |||||    
T  22066745 attcaaattgttagagtacgtcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaatgataaatttgcgaacaaactcataacattcatgttcataacctaaaa 22066844  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
        ||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  22066845 tggtaaaatacataagcctacaaatatgactatatt 22066880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 10680692 - 10680754
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10680692 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 10680754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 10894332 - 10894394
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10894332 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 10894394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Original strand, 4518634 - 4518747
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||  ||||||||||  ||||||||  |||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  4518634 caaattcgctaaaaagaaatatgatgtatctgcgaacaaactcacaacatatatgttaattacataaagcaacaatgtacatatgcatacatatatgact 4518733  T
Q  325 atatttaaatctcc 338  Q
    ||||| || |||||    
T  4518734 atattcaagtctcc 4518747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Original strand, 7860921 - 7861022
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||| ||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  7860921 caaattcgttaaaaacaaaaagaatgaatctgtaaataaactcacaacatctatgttaatagcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgact 7861020  T
Q  325 at 326  Q
    ||    
T  7861021 at 7861022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 320
Target Start/End: Original strand, 33288821 - 33288957
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||||  |||||| |  |||||  |||||| |||||||||||    
T  33288821 gatattcattcattcaaattaattggatacaccgatacaatacaactttgctaaaaataaaaagaatgaatttaggaacattctcacatcatccatgtta 33288920  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    |||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  33288921 atagaatacaaccacaaagta-aaaagcctacaaatat 33288957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Original strand, 40198221 - 40198334
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| || | |||| ||| |||||||||||||||||| | |  |||||  |||||||||| | ||||    
T  40198221 gatattctttcattcaaaatgatagagtacatcaatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgagtctacgaacaaactcacaacattcctgtt 40198320  T
Q  282 aatagcataaaaca 295  Q
    |||| |||||||||    
T  40198321 aataacataaaaca 40198334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 56172211 - 56172118
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  56172211 aaaacaaaaaggttgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacgacaatgtacatatgcctacaaatacgattatatt 56172118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 271
Target Start/End: Original strand, 10665522 - 10665602
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaa 271  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  10665522 ttcattcaaattgttggagtacatcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttttgaacaaactcacaa 10665602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 271
Target Start/End: Original strand, 10879667 - 10879747
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaa 271  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  10879667 ttcattcaaattgttggagtacatcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttttgaacaaactcacaa 10879747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15182876 - 15182764
Alignment:
Q  217 atataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacac 316  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| || |||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||  || |||||| |||||||||     
T  15182876 atataattcaaagtcgctaaaaataaaatggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctatattaatagcatacaacgacatagtacatatgcctacaa 15182777  T
Q  317 atatgactatatt 329  Q
    || ||| ||||||    
T  15182776 atgtgaatatatt 15182764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39523779 - 39523719
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  39523779 ctcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgacta 39523719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1532167 - 1532108
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1532167 cgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcata 1532108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22621825 - 22621746
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaa-tgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22621825 caaactcgctaaagacaaaaaatgatgaatatgcgaacatacccacaacatccatattaatatcataaaacagcaaagta 22621746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Original strand, 38545831 - 38545910
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  38545831 gatattcattcattcaaattgatatagtacattgatacagtataaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaaca 38545910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 44021260 - 44021366
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | || || |||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||    
T  44021260 atattcatttattcaaattgatatattatat-gatacaatttaaattcgctaaaaacaaaacagatgaatatgtgaacaaactcgcagcattcatgttaa 44021358  T
Q  284 tagcataa 291  Q
    | ||||||    
T  44021359 ttgcataa 44021366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Original strand, 44021434 - 44021509
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccga 422  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||| ||||||||    
T  44021434 atctgcaacgtggacgacgtcaaagtcattaattggatctgcactgaatcaaagttgttctgacaatctgaaccga 44021509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 56062383 - 56062276
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||  ||| ||||| |||||| |    
T  56062383 caaagtcgctaaaaacaaaaaggattaatatacgaacaaacttacaacatccatattaatagcatgaaacaacatggtacctatgactacaaatatgatt 56062284  T
Q  325 atatttaa 332  Q
    ||||||||    
T  56062283 atatttaa 56062276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 10715981 - 10716043
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10715981 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaat 10716043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 10929751 - 10929813
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10929751 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaatacaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaat 10929813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24826096 - 24826050
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  24826096 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaat 24826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31311729 - 31311647
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaata 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||  ||| ||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  31311729 atctgcaacgtggatgacgacaaagtcattaatttgatctgtactggatcaaagttgataggacaatctgaaccgaacaaata 31311647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Original strand, 38545938 - 38546004
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  38545938 atctgcaacgttgatgacgcaaaagtcattgattgaatttgcacttgatctaagctgatctgacaat 38546004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4644118 - 4644058
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4644118 tcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcata 4644058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 336
Target Start/End: Original strand, 9255074 - 9255134
Alignment:
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct 336  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  9255074 catgttaatagcataaaacaacatagtacatatgcctacaaatatgattatgttcaaatct 9255134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19745847 - 19745698
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaa--tgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      ||| ||||||||||||  |||||||| |||||  |  |||||| |||    
T  19745847 gatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtgataaa-ctcacatcat 19745749  T
Q  275 ccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  19745748 ccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgacta 19745698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 19793959 - 19794108
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaa--tgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      ||| ||||||||||||  |||||||| |||||  |  |||||| |||    
T  19793959 gatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtgataaa-ctcacatcat 19794057  T
Q  275 ccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  19794058 ccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgacta 19794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 430
Target Start/End: Original strand, 9526198 - 9526281
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatac 430  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| || |||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  9526198 atctgcaacgttgacgacgccaacgtcatttattatatctgcactggatcgaaactgatatgataatttgaatcgaacaaatac 9526281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31994381 - 31994318
Alignment:
Q  266 tcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  31994381 tcacaatatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcgtacaaatatgattatatt 31994318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47923690 - 47923551
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |   |||| ||| ||| ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||   |||||| |||| ||||||||||||    
T  47923690 attcattcaaattgacgaagtatatcaatacaatacaaattcaataaaaataaaaaggatgaatctctgaacaaattcacaaaatccttgttaatagcat 47923591  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||    |||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  47923590 aaaatggtaaagtagataagcctacaaatatgactatatt 47923551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5388776 - 5388710
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5388776 atctacaacgttgatgacgtcaaagtcattggttcgatttgcactggatcgaatctgatctgacaat 5388710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11817317 - 11817255
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctga 409  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11817317 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattggttggatctgtactagatcgaagctgatctga 11817255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17220213 - 17220075
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||  || |||||||| ||||||  |||||||||||| |  ||| |  |||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  17220213 ttcattcaaattgttagagtacgtcgataccatacaaattcgttaaaaattaaaatgatgaatttccgaataaactcataacattcatgttcataacata 17220114  T
Q  291 aaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||    ||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  17220113 aaatggtaaaatacataagcctacaaatatgactatatt 17220075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22121827 - 22121769
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22121827 aaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataaagtcacaacattcatgttaatagcataaaa 22121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 294
Target Start/End: Original strand, 3171345 - 3171404
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3171345 taaaaataaaaatgatgaa-ataagaacaaactcacaacatacatgttaatagcataaaac 3171404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5814607 - 5814563
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  5814607 atctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgatcgaatctgcact 5814563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8712791 - 8712747
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8712791 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgatcggatctgcact 8712747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10710538 - 10710450
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| ||||    
T  10710538 ttcattcaaattgttggagtgcgtcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttctgaacaaactcataacattcatg 10710450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10924308 - 10924220
Alignment:
Q  191 ttcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||  | |||| | |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| ||||    
T  10924308 ttcattcaaattgttggagtgcgtcgatacaatacaacttcgctaaaagcaaaaatgatgaatttctgaacaaactcataacattcatg 10924220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21662697 - 21662625
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagt 302  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  21662697 tcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagt 21662625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21671461 - 21671389
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagt 302  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  21671461 tcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagt 21671389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 22049171 - 22049235
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||||||||| |||  ||||||||    
T  22049171 ctcacaacatccatgttaataacataaaacagaaaagtatttatgcctacaaatacaactatatt 22049235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29257486 - 29257414
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaac 419  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| || |||| ||  ||| |||||||||||| |||||    
T  29257486 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgattggatttgtactgtatcaaagttgatctgacaatctgaac 29257414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 34024268 - 34024332
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34024268 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataaca 34024332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46829801 - 46829733
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||| ||  ||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  46829801 caaaatcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcaaacaaactcacaacattcatgttaataacataaaa 46829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 120)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 29310035 - 29310338
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29310035 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgttaata 29310134  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||||     
T  29310135 gcataaaacggcaaagtagaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtca 29310234  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29310235 ttgattggatctgcactggatcgaagctgatctgataatttgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 29310334  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  29310335 aaca 29310338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 6886856 - 6887162
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6886856 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 6886955  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  6886956 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaattaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 6887055  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6887056 tcattgattggatctgcactggatcgaagctaatctaacaatctgaactgatcaaatacctgagagaagcaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 6887155  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  6887156 acgaaca 6887162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31646265 - 31645959
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31646265 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 31646166  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||| ||||||    
T  31646165 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacaccaaag 31646066  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31646065 tcattgattggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaaggaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 31645966  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  31645965 acgaaca 31645959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28619038 - 28618732
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28619038 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtcaacaggctcacatcatccatgtta 28618939  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  28618938 atagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatttccgaaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 28618839  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28618838 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctaaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaataacgtcgcacaaagacg 28618739  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  28618738 atgaaca 28618732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 35906705 - 35906401
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35906705 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgctaaaaactaaaagtatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 35906606  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          ||  | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35906605 atagcataaaacgacaaaatacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataaccatgtatccggatctgcaatgtggatgacgccaaag 35906506  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906505 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatccgataatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 35906406  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  35906405 acgaa 35906401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4070986 - 4070681
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4070986 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaggataaatctatgaagaggctcacagcatccatgtta 4070887  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  4070886 atagcataaaacgc-aaagtacaaatacctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 4070788  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4070787 tcattgattggatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaaacgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 4070688  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  4070687 acgaaca 4070681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 10923812 - 10924117
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  10923812 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaaattgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacgtctatgtta 10923911  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |           || ||||||||||||||| |||||||||    
T  10923912 atagcataaaacgacaaagtacaaatgcctatacatatgactatatttaaatctcctgaataaccattcatccggatctgcaacgtggataacgccaaag 10924011  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10924012 tcgttgattggatctgcactgcattgaagttgatccgacaatttgaaccgatcaaatatctgagagaaacaagaaaaac-aacaacgtcgcacaaagacg 10924110  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  10924111 acgaaca 10924117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5378738 - 5378432
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5378738 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaatcaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 5378639  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||          || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  5378638 atagcataaaacaacaaggtacaaattcctacacatatgactacatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 5378539  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5378538 tcattgatttgatctgcattggatcgaaactgatccgacaatctgaaccgatcaaacatctgagagaaacaagaaagacaagcaatgtcgcacaaagacg 5378439  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  5378438 acgaaca 5378432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20271151 - 20270844
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatga-tgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20271151 gatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtt 20271052  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| |||||    
T  20271051 aatagcataaaacgacaaagtactaaagtctacacatatgactatatttaagtctccgaaatatccatgtctccggatctgcaacgttgaagactccaaa 20270952  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20270951 gtcattgatttgatctgcactggattgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaaggcaaacaacgtcgcacaaagac 20270852  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  20270851 gacgaaca 20270844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41554923 - 41554619
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41554923 gatatccattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtta 41554824  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||  ||||||    
T  41554823 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgattccaaag 41554724  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41554723 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgagcgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaggacg 41554624  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  41554623 acgaa 41554619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 9034623 - 9034926
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9034623 gatatccattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaa---aaacggtggatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 9034719  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||          || | | | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  9034720 atggcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatataactatatttaaatctccgaaataaccatgtctttggatctgcaacatgaatgaccccaaag 9034819  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  9034820 tcattgattggatctgcactagatcgaaactgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacagacaatgtcgcacaaagacg 9034919  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  9034920 aggaaca 9034926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 33486247 - 33486553
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  33486247 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgataaaataaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccacgtta 33486346  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  33486347 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgaccatatttaagtctccagaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 33486446  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33486447 tcattggtttgatctgcactggatcgaagctgatttgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 33486546  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  33486547 acgaaca 33486553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2415837 - 2415530
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2415837 atattcattcattcaaattgatagagtatatcgatgtaatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgttaa 2415738  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacac--atatgactatatttaaatc----------tcctggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||          || || | ||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  2415737 tagcataaaacgacaaagtataaatgcctacacatatatgactatatttatgtcttcggaataatcatgtcttcggatctgcaacgtggatgaagttaaa 2415638  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  2415637 gtcgttgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaaagtaacaaaaaagacaaacaatgtcgcacaaagac 2415538  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
     |||||||    
T  2415537 aacgaaca 2415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 18472404 - 18472710
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18472404 gatattcatttattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaagttcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtta 18472503  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||          || ||| | |||| |||||| || |||  |||||    
T  18472504 atagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatgtaagtctccggaatactcatgtctccagatctacaacgttgacgactacaaag 18472603  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18472604 tcattgatttgatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaatgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 18472703  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  18472704 aggaaca 18472710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 19645715 - 19646025
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19645715 gatattcattcattcaaatcgata-agtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 19645813  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctac------acatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacg 365  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||          || | ||| || |||||||||||||||     
T  19645814 atagcataaaacgacaaaatacaaatgcctacgtatatacatatgactatattcaaatctccggaataaccatgtcttcggat-tgcaacgtggatgaca 19645912  T
Q  366 ccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcaca 465  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19645913 ccaaagtcattgattggatctgcacttgatcgaatctgatctgacaatctgaatctaacaaatacttcaaagaaacaagaaagacaaacaacgtcacaca 19646012  T
Q  466 aagacgacgaaca 478  Q
    |||||||| ||||    
T  19646013 aagacgacaaaca 19646025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Original strand, 6647587 - 6647895
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaat----agagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||    
T  6647587 gatattcattcattcaaattgattgatagaatacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaataaactcacaacatccat 6647686  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgcc 367  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||          || || || ||||||||||| |||||||||    
T  6647687 gttaatagcttaaaacggaaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgcc 6647786  T
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||| || |   |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6647787 gaagtcattgattggatctgcacttgatctaagctgacctgacaatctgaaccgaacaaatagctgaataaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaa 6647886  T
Q  468 gacgacgaa 476  Q
    |||||||||    
T  6647887 gacgacgaa 6647895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Original strand, 8811837 - 8812135
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  8811837 attcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaagttcgctaaaaacgaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcat 8811936  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || ||| | ||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  8811937 aaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaataccattgtctccagatctgcaacgttgatgactctaaagtcattga 8812036  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |   |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8812037 tttgatctgcactggaccgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacccgaacaaaacaagaaagacaaacaac-tcccacaaagacgacgaaca 8812135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15710980 - 15710673
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  15710980 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcaatacaatgcaaattcactaaaaccaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtta 15710881  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac---tatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgcca 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||   ||||||||||| |||          || ||| | ||||||||||| |||||||||     
T  15710880 atagcataaaacaacaaagtacaaaagactacgcatatgactattatatttaaatatccggaatacatatgtctctagatctgcaacgttgatgacgcc- 15710782  T
Q  369 aagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15710781 aagccattgattggatctgcactagatctaagctgatctgacaattcgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgccacacaaag 15710682  T
Q  469 acgacgaac 477  Q
    || ||||||    
T  15710681 acaacgaac 15710673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3495281 - 3495139
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3495281 atatttattcgttcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacaaccatgttaa 3495182  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3495181 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcttacacatatgactat 3495139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34844352 - 34844045
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34844352 gatattcattaatgcaaattgatagagtacatctatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgtta 34844253  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |  |           ||  |||||||| | || ||| ||||||    
T  34844252 atagtataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcgccagaatacccatatctccgggtctgcaacattgacgactccaaag 34844153  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  34844152 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcgagcaaatacctgaacgaaacaaaaaagacaaacaacgtcgtataaagatg 34844053  T
Q  472 acgaacat 479  Q
    || |||||    
T  34844052 acaaacat 34844045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 477
Target Start/End: Original strand, 4726781 - 4726911
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4726781 atctgcaacgtagatgacaccaaagtcattgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaa 4726880  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaac 477  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4726881 agacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaac 4726911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 34874285 - 34873993
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || || |||||||||||||    
T  34874285 atattcattcatttaaattaatagagtgcatcaatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactaacgacatccatgttaa 34874186  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||| ||||   ||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  34874185 tagcaaaaaatggcaaagtataaaagtctacacacatgaccatatttata-ctcatgtctccggatatgcaacgttgacgacgccaaagtcattcattgg 34874087  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||   ||||| || | |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  34874086 atctgcactagatcgaagttgatatgacaatttgaatcggataaatatctgaaagaaacaagaaagacaaacaacgccacacaaagatgacgaa 34873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 183 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40775197 - 40774894
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||  |||| |  ||| ||||||    
T  40775197 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaatttgctaaaaattaaaaggatgaacatgtgaacaaactcagaggatctatgtta 40775098  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||          || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  40775097 atagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtttccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgaagactccaaag 40774998  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaa-acaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  40774997 tcattgatttgatctacactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaatacaaggttgcacaaagac 40774898  T
Q  471 gacg 474  Q
    ||||    
T  40774897 gacg 40774894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Original strand, 40564838 - 40565081
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  40564838 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 40564937  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||          || || || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  40564938 gcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 40565037  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  40565038 ttggttggatttgcactggatcgaaactgatctgacaatatgaa 40565081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 32387899 - 32387601
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||||| ||||    
T  32387899 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacactgcaaattcgttaacaacaaaaaagataaatttgcgaacaaactcacaacatccatattaa 32387800  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa--atct------cc--tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    || ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||      ||  || || || |||||||||||| | || | |||| |    
T  32387799 taacataaaacgacaaggtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtatctggaacacctatgtctccggatctgcaacgtgaacgatgtcaaaat 32387700  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32387699 cattgattggatctgcactagatcgaagctggtctgacaa-ttgaatcgaacaaatacctgaataaaacaagaaaggcaaacaacgccgcacaaagacga 32387601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 29154656 - 29154356
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  29154656 gatattcatttattcaaattgatagagtatattaatacaatataaattctctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacatactcacatcatccatgtta 29154557  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||          || || || ||||||||| |||||||| |||||     
T  29154556 atagcataaaacgacaaagtacaaaaacctacacatacgattatatttaactctccggaatactcatgtctccggatctgcaacatggatgacaccaaaa 29154457  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || || ||||||||||||||| || |||||  || ||||||| | |||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  29154456 tcattaattggatctgcactgaatcgaagcctatttgacaatctaaaccgaacaaatgcctaaacgaaaaaagaaagacaaccaacatcgcacaaagacg 29154357  T
Q  472 a 472  Q
    |    
T  29154356 a 29154356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28501118 - 28500825
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  28501118 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctgaaaataaaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcaa 28501019  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |  |||||          || || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  28501018 aaaacgacaaagtacaaacacctacagatatgactatattcatgtctccagaatacccatgtctccggatctgcaacgtggaggacgacaaagtcattga 28500919  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||  |  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  28500918 ttggatccgtactggatcgaagttgatatgacaatctgaaccgaacaaatacccgaacgaaataagaaagacaaacaatgccgcactaagacga 28500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 11734509 - 11734670
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  11734509 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacaacc 11734608  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  11734609 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 11734670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37219435 - 37219298
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37219435 attcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaaattcgctaaaa-caaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 37219337  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  37219336 gcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgact 37219298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 427
Target Start/End: Original strand, 6074417 - 6074669
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6074417 attcattcattcacattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaata 6074516  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    ||| |||||  || || ||| | | ||||| | ||||||||||| |||| |          | || || || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  6074517 gcacaaaacggcatagaacataagtctacaaacatgactatattaaaatatctggaataaccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 6074616  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaa 427  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  6074617 ttgattggatctacactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgaacaaa 6074669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20483643 - 20483495
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20483643 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 20483544  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20483543 atgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgacta 20483495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 413
Target Start/End: Original strand, 20145902 - 20146138
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20145902 tcattcattcaaattgatagagtgtatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaataagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaatgttaatagc 20146001  T
Q  288 ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcga-----------atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgtt 376  Q
    ||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |  | ||           |||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  20146002 ataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcttcggaatagacatgcatctggatctgcaacgttcatgacgccaaagtcatt 20146101  T
Q  377 gattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20146102 gattggatctgcactagatcgaagctgatctaacaat 20146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 470
Target Start/End: Original strand, 32390373 - 32390623
Alignment:
Q  214 tcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgccta 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  32390373 tcgatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaaaccta 32390472  T
Q  314 cacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||||||   | |||| || ||||| |      | |||||| ||||| |||| |||| || || ||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  32390473 cacatatagttgtattcaagtctccag------aactgcaatgtggacgacgacaaaatcattaattagatctacactagattgaagctaatctgataat 32390566  T
Q  414 ttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32390567 ttgaaccgaacaaatacccgaatgaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaagac 32390623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28662505 - 28662362
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  | || ||||||||||||||    
T  28662505 atattcattcattcaaattgaaagagtacgtcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgagtctatgaacaaacacataacatccatgttaa 28662406  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  28662405 tagcataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactata 28662362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6281501 - 6281353
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  6281501 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 6281402  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  6281401 atgttaatagcataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgacta 6281353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34866868 - 34866712
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaaca-aaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  34866868 gatattcattcattcaaattgatatagtgcatcaatacaatgcaaattcgctaaaaaaacaaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtt 34866769  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||| | ||||| || |||||    
T  34866768 aatagcaaaaaacgtcaaagtacaaaaggctacacatatggccatattcaagtctcc 34866712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 14910354 - 14910509
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||| | |||||||||||    
T  14910354 gatattcattcattcaaattgttagagtacaacgatacaataaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaaaaactcatagcatccatgtta 14910453  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14910454 atagcataaaacggcaaaatactaaaacctacacatataactatatttaagtctcc 14910509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 337
Target Start/End: Original strand, 17325342 - 17325494
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||  ||||||||||||||    
T  17325342 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtaaacaaact--caacatccatgtta 17325439  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
    |||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17325440 atagcataaaatgacaaagtacataagcctacatatatgactatattaaaatctc 17325494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41358470 - 41358319
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc-----ca 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||      |    
T  41358470 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgttaaaaacaaaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatcaatttga 41358371  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  41358370 tgttaatagcattaaaccgcaaagtacaaaagtctaaacatatgactatatt 41358319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 17095908 - 17096053
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  17095908 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatg 17096007  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  17096008 ttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 17096053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26294067 - 26293919
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26294067 gatattcattcattcaaatagatagagtacgtcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 26293968  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  26293967 atattaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 26293919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8957637 - 8957344
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||  || || |||||||||||||| ||||||| |||| |||   ||||||||| |||||||||| |    
T  8957637 tcattcattccaattgatagagtacatcgatgcaatataagttagctaaaaacaaaaaggatgaatttgtggacaaattcacaacattcatgttaataac 8957538  T
Q  288 ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggc-------tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgtt 376  Q
    |||||||  ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||    | ||        || ||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8957537 ataaaacgacaaagtacacaagccaacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagccatatctccggatctgcaacgttgatgacgcaaaagtcatt 8957438  T
Q  377 gattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8957437 ggttgaatctgcattggatcgaagctgatctgacaatctgaactgaacaaacacctga-acaagagagaaaagacaaacaacgtcgcacaaagac 8957344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 26294740 - 26294886
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  26294740 tattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccat 26294839  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  26294840 gttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgacta 26294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 41063249 - 41063380
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  41063249 atctgcaacgtggatgatgtcaaagtcattaattggatctgcactggatcgaagctgatataagaatctgaaccgatcaaatagccgagagaaataagaa 41063348  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  41063349 aaacaaacaacgtcgctcaaagccgacaaaca 41063380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37425558 - 37425448
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  37425558 gatattcattaattcaaattgatagagtagatcgatacaataagaattcgataaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatctatgtta 37425459  T
Q  283 atagcataaaa 293  Q
    |||||||||||    
T  37425458 atagcataaaa 37425448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17700010 - 17699862
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa------tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||      | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17700010 gatattcattgaatcaaattgatagagtacatcgatacaaaacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17699911  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  17699910 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctacaaatatgacta 17699862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 17732051 - 17732198
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17732051 gatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaga-gatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17732149  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17732150 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 17732198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 314
Target Start/End: Original strand, 177768 - 177905
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  177768 gatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 177867  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctac 314  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||    
T  177868 atgttaatagcctaaaacggcaaagtacctatgcctac 177905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 2555017 - 2555162
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgc------taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |        |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2555017 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttcttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatg 2555116  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  2555117 ttaatagcgtaaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgacta 2555162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 7771485 - 7771630
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  7771485 gatatttattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagctcacatcatcc 7771584  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||    
T  7771585 atgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatga 7771630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13007952 - 13007824
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  13007952 atctacaacgttgatgacgcaaaagtcaatgattggatatgccctggatttaagctgatatgataatttgatccgaacaaatacctgagcgaa-caagaa 13007854  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007853 agacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 13007824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28041086 - 28040938
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| |||||    
T  28041086 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgagtaaactcacatcatcc 28040987  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28040986 atgttagtagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 28040938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 39179509 - 39179657
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||||||||||||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  39179509 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttatgaacaaactcacaacatcc 39179608  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  39179609 atgttaatagcataaaacgacaaagtacatatatctacaaatatgacta 39179657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 42505077 - 42505227
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg----ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||     ||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  42505077 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcagtctctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccat 42505176  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  42505177 gttaatagcatgaaacgacagagtatctatgcctacaaatatgactatatt 42505227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 366 - 478
Target Start/End: Original strand, 22397420 - 22397532
Alignment:
Q  366 ccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcaca 465  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  22397420 ccaaagtcattgatttgatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacgaaataagaaagacaaacaatgtcgcaca 22397519  T
Q  466 aagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||    
T  22397520 aagacgacgaaca 22397532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 39308431 - 39308568
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||  |||||| |||| || |||    
T  39308431 gatattcattcattcaatttgataaagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaa--aaagatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatctatatta 39308528  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||  ||| |||||||||    
T  39308529 atagcataaaacggcaaaatacaaaatcctgcacatatga 39308568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 39531072 - 39531224
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgcta----aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaac 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| |    
T  39531072 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatatgaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatc 39531171  T
Q  273 atccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39531172 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 39531224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29098237 - 29098076
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| ||| |    
T  29098237 gatattcactcattcaaattgatagaatacatcggtacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatttgtgaacaaactcacatcatac 29098138  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  29098137 atgttaatagcataaaacggcaaggtacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 29098076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 473
Target Start/End: Original strand, 34893825 - 34893923
Alignment:
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    ||||||| || |||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34893825 ttgattgaatttgcactggaacgaagttaatctgacaatatgaaccgatcaaatagctgagggaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 34893923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6635701 - 6635557
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||     
T  6635701 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagtatccatga 6635602  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6635601 taatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgacta 6635557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 327
Target Start/End: Original strand, 12439359 - 12439503
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  12439359 gatattcattcattcaacttgataaagtatata-atataaattcaaattcgctaaaaataaaaatgataaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtt 12439457  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  12439458 aatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgattata 12439503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 339
Target Start/End: Original strand, 12524345 - 12524498
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||  | | ||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12524345 attcattcatttaaattgatagattatattcaaacaatacaaattcgctaaaaatagagaggatgaatatgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 12524444  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcct 339  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  12524445 gcataaaatgacaaagtacaaaagcctacaaatatgattatattaaagtctcct 12524498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17331785 - 17331637
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||   |||    
T  17331785 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatattcc 17331686  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||  ||||||||| |||||||||    
T  17331685 atgttaatagcataaaacggcaagatacctatgcctacaaatatgacta 17331637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18654239 - 18654091
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||    
T  18654239 gatattcattcattcaaattgatagactacattgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatcc 18654140  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  18654139 atgttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgacta 18654091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27241511 - 27241359
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||      |||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  27241511 atattcattaattcaaattcatagagtacatcgatacaatagaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcca 27241412  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattt 330  Q
     ||||||||||||||||  |||| |||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  27241411 cgttaatagcataaaacggcaaaatacctaggcctacaaatatgactatattt 27241359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 32347387 - 32347539
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgc------aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |      |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||||    
T  32347387 gatattcattcattcaaattgacagtgtacatcgatacaatacgaattcaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaatacatcc 32347486  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  32347487 atgttaatagcataaaacggcaaagtagttatgcctacaaatatgactatatt 32347539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3740789 - 3740636
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatga-tgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||      |||||||||||||| || ||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3740789 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatccaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggaatgaatctatgaacaaactcacaacatc 3740690  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  3740689 catgttactagcataaagcggcaaagtacctatgcctataaatatgactatatt 3740636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17218159 - 17218058
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17218159 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaattcgctaaaaac-gaaaggatgaatctatgaacaatctcacaacatccatgtta 17218061  T
Q  283 ata 285  Q
    |||    
T  17218060 ata 17218058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23428652 - 23428546
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23428652 caaattcgctataaacgaaaaggataaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggaaaagtacctatgcctacaaatatgact 23428553  T
Q  325 atattta 331  Q
    |||||||    
T  23428552 atattta 23428546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13079405 - 13079277
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |  ||| ||||||    
T  13079405 atctacaacgttgatgacgcaaaagtcaatgattggatatgccctggatttaagctgatatgataatttgatccgaacaaatacctgaacgaa-caagaa 13079307  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13079306 agacaaacaatgtcgcacaaagacgacgaa 13079277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 23881780 - 23881928
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  23881780 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgcaaaaaagaaaaaggatgaatttgtggacaaactcacaacatcc 23881879  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||   ||| ||||| |||||||||    
T  23881880 atgttaatagcataaaccgacaaagtatctatgactacaaatatgacta 23881928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 6681541 - 6681674
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||| ||||     
T  6681541 gatattcattcattctaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaacttacatcatca 6681640  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgc 310  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  6681641 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgc 6681674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Original strand, 24288641 - 24288760
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata- 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||     
T  24288641 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatat 24288738  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  24288739 gcataaaatgacaaagtacaaa 24288760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24373581 - 24373462
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata- 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||     
T  24373581 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatat 24373484  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  24373483 gcataaaatgacaaagtacaaa 24373462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 33164133 - 33164250
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||  |||||||  || ||||  |||||| |||||    
T  33164133 gatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatccgtaaacaaactcacatcatcc 33164232  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33164233 atgttaatagcataaaac 33164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34431521 - 34431366
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggc-------tcac 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |       ||||    
T  34431521 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaagtcac 34431422  T
Q  270 aacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  34431421 aatatccaagttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta 34431366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Original strand, 980739 - 980841
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca---tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  980739 aaattcgttaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatga 980838  T
Q  323 cta 325  Q
    |||    
T  980839 cta 980841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 239
Target Start/End: Original strand, 4726681 - 4726737
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4726681 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaa 4726737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42609553 - 42609453
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  42609553 caaattcgctaaaaagaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatgacataaaacggcaaagtatttatgcctacaaatatgact 42609454  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  42609453 a 42609453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32309953 - 32309836
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||      | |||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  32309953 gatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcaaagtcgttaaaaataaaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacatcc 32309854  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||| |||||||    
T  32309853 atgttaataggataaaac 32309836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42781458 - 42781341
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||      |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  42781458 gatatttatttattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaaggatgaatttgttaacaaactcacaacatcc 42781359  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42781358 atgttaatagcataaaac 42781341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25962361 - 25962209
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||      |||||||||| ||||| ||| ||| || ||| |  |||||||||| |    
T  25962361 gatatccattcattcaaattgataaagtacatcgataaaatttaaatccaaaatcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaagaaactcacaacattc 25962262  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  25962261 atgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactatatt 25962209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 239
Target Start/End: Original strand, 28423714 - 28423770
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28423714 gatattcattcattcaaattgatatagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaa 28423770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41358244 - 41358169
Alignment:
Q  403 gatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41358244 gatctgacaatctgaaccgaacaaatacctaattaaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaacacgacgaaca 41358169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41988413 - 41988282
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| | | ||||||| |||  ||||||| ||    
T  41988413 atctgtaacgttgacgacgcaaaaatcattgattgaatctgcactgcattgaagctgatatgacaacctgaaacaaacaaatacttaaacgaaacaaaaa 41988314  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  41988313 agacaaacaaagccgcacaaagacgacaaaca 41988282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Original strand, 42396174 - 42396312
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      || ||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| |    
T  42396174 gatattcattcattcaaattgatagaatatatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaagggattaatatgtgaacaaactcacaacattc 42396273  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||    
T  42396274 atgttaataacataaaacggaaaagtacctatgcctaca 42396312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37425409 - 37425343
Alignment:
Q  227 aattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37425409 aattcgataaaaacaaaaatgatgaatatgtgatcaaactcacaacatctatgttaatagtataaaa 37425343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 322
Target Start/End: Original strand, 3079047 - 3079143
Alignment:
Q  227 aattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  3079047 aattcgctaaaaacaaaaaaggatgagtctgtgaacaaactcacagcatccatgttaataacataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatga 3079143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13080415 - 13080285
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  ||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |  ||| ||||||    
T  13080415 atctacaacgttgatgatgcaaaagtcaatgattcgatatgccctggatttaagctgatatgataatttgatccgaacaaatacctgaacgaa-caagaa 13080317  T
Q  447 aaacaaacaacgtcg--cacaaagacgacgaa 476  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13080316 agacaaacaacgtcgcacacaaagacgacgaa 13080285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25770871 - 25770795
Alignment:
Q  343 tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaac 419  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  25770871 tcgaatctgcaacattgacgacgccaaagtcatcgattgaatctgcactggatcggaactgatctgacaatttgaac 25770795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11647639 - 11647533
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||     
T  11647639 tattcattcacttcaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgtacaaactcacaacatccac 11647540  T
Q  279 gttaata 285  Q
    |||||||    
T  11647539 gttaata 11647533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 287
Target Start/End: Original strand, 26905364 - 26905423
Alignment:
Q  228 attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  26905364 attcgctaaaaacaaaaatggtgaatgtgtgaacaaactcgcaacatccatgttaatagc 26905423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39591477 - 39591338
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||   |||||| ||||| | ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||| |||    
T  39591477 attcatttaaattgatagagtacctcaatacaatacaaatttattaaaaataaaaaggttgaatctgcgaacaaactcataacatccatgttaataacat 39591378  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||  |||| |||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  39591377 aaaacgacaaaatacataagcctacatatatgaatatatt 39591338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43494275 - 43494180
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    ||||||||||||   | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  43494275 ctaaaaacaaaaggcaagaatctgtgaacaaactcacaacatccgtgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgaatatat 43494180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13422215 - 13422108
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat-tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  13422215 gatattcattcattcaaattgataga-tacatc-atata---caaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagtt 13422121  T
Q  282 aatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||    
T  13422120 aatagcataaaac 13422108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37425283 - 37425154
Alignment:
Q  344 cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaa 443  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||     |||| | ||| || |||||||||    |||||||    
T  37425283 cgaatctgcaacgttgaggactccaaagtcattgatttgatctacactggatcaaagctga-----caatctaaactgaacaaatacctgtacgaaacaa 37425189  T
Q  444 gaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37425188 gaatgacaaacaacgtcgcacaaagacgacaaaca 37425154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Original strand, 17325527 - 17325600
Alignment:
Q  359 gatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  17325527 gatgacgacaaagtcattggttggatctgcaccggattgaagttgatctgacaatctgaatcgaacaaacacct 17325600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Original strand, 26240413 - 26240474
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26240413 ctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcgcaacatctatgttaatagcataaaac 26240474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 586197 - 586083
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgat-----ataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||  ||| || ||| ||||||||| ||||| | | |||| |  |||||||||||||    
T  586197 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatactacataatttaaagtccctataaacaaaaa-gatgattctatgaa-aaactcacaacatcca 586100  T
Q  278 tgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||||||    
T  586099 tgttaatagcataaaac 586083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 907658 - 907718
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  907658 caaattcgctaaacacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaatatccatattaata 907718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 17523256 - 17523312
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  17523256 gctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccaagataatagca 17523312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 29663039 - 29663087
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29663039 gatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattc 29663087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Original strand, 12524517 - 12524583
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  12524517 atctacaacgttgatgacaccaaagtcattgattggatctacactggatcaaagttgatctgacaat 12524583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34866655 - 34866557
Alignment:
Q  380 tggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||| || |  |||| |||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  34866655 tggatctgcactagatcgaagcttatatgacaatttgaatcgaacaaatatctgaatgaaaaaagaaagataaactacgccgtacaaagacgacgaaca 34866557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Original strand, 39558168 - 39558285
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||      ||||||||||| ||||  |||||| ||  ||||   | |||||||  |    
T  39558168 atattcatccattcaaattaatagagtacattgatataatacaaatccaaagtcgctaaaaactaaaagtatgaatttgcaaacaaattgacaacattta 39558267  T
Q  278 tgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39558268 tgttaatagcataaaaca 39558285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35455353 - 35455268
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||| || | ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  35455353 atctgcaacgttgatgacaccaaagttattgattgaatctacattcgatcgaagctgatctgaaaacttgaaccgaacaaacacct 35455268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 9196695 - 9196735
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataat 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9196695 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataat 9196735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13079537 - 13079458
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||    
T  13079537 gatattcattctttcagattgatagagtatactgatacaatgcaaattcgctaacatcaaaaaggatgaatctgcgaaca 13079458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Original strand, 19200261 - 19200296
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19200261 atattcattcattcaaattaataaagtacatcgata 19200296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 281
Target Start/End: Original strand, 22923625 - 22923722
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||   ||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  22923625 gatattcatttgtttaaattgatagaatacattgatataaagtaaattcgttaaaaacaaaaaacgtgaatatgcaaaca-actcacaacatccatgtt 22923722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25771046 - 25770903
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc----gatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||| ||||   ||| || || |||||  |||||||  | |||    
T  25771046 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgattgatacaatacaaattcgctaaaaataaaaggtatggatctgcgaacaaactcacaatgttcat 25770947  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
     ||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25770946 cttaatagaataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatga 25770903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 338
Target Start/End: Original strand, 28388871 - 28388941
Alignment:
Q  268 acaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||| || |||||    
T  28388871 acaacatctattttaataacataaaacaacaaaatacaaaagtctacacatatgattatattcaagtctcc 28388941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39915826 - 39915789
Alignment:
Q  268 acaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtaca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39915826 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtaca 39915789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41988477 - 41988428
Alignment:
Q  213 atcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  41988477 atcgatacaatgcaaattcgttaaaaacaaaagagatgaatatgcgaaca 41988428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13007512 - 13007480
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13007512 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 13007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 337
Target Start/End: Original strand, 20187391 - 20187463
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  20187391 ctcacaacattcatgtcaatagcataaaaccacagagtatctatgcctacaaatattactatatttaagtctc 20187463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Original strand, 20257525 - 20257585
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20257525 tcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacata 20257585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 27266689 - 27266753
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  27266689 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataaca 27266753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 39416018 - 39416082
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||   || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39416018 ctcacaaaatccattttaatagcaaaaaatgacagagtacatatgcctacaaatatgactatatt 39416082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 39532101 - 39532165
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||     |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39532101 ctcacaacatcaattttaatagcataaaacggtcgagtacatatgcctacaaatatgactatatt 39532165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 3088342 - 3088648
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3088342 gatatttattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatatta 3088441  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  3088442 atagcataaaacaacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 3088541  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3088542 tcattgattggatctgcactggatcgaagatgatctgacaatctgaagcgattaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 3088641  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  3088642 acgaaca 3088648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43030119 - 43029813
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43030119 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 43030020  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||| ||||||    
T  43030019 atagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgactccaaag 43029920  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029919 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 43029820  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  43029819 acgaaca 43029813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 50520219 - 50519913
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50520219 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 50520120  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||  || | ||||||||||||||||||||||||     
T  50520119 atagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccagatctgcaacgtggatgacgccaaaa 50520020  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50520019 tcattgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 50519920  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  50519919 acgaaca 50519913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 1165075 - 1165380
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1165075 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacatcatccatgttaa 1165174  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1165175 tagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 1165274  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1165275 cattgattggatctgcactggatcgaagctgatctaacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgttgcacaaagacga 1165374  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  1165375 cgaaca 1165380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 22286430 - 22286735
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22286430 gatattcattcattcaa-ttgagagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 22286528  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||  || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  22286529 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccagatctgcaacgtggatgacgtcaaag 22286628  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22286629 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatatgaagcgatcaaatgcctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 22286728  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  22286729 acgaaca 22286735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Original strand, 28994994 - 28995293
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28994994 attcattcaaatcgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 28995093  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28995094 aaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattga 28995193  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28995194 ttggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaagcgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 28995293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45664657 - 45664353
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45664657 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaggctcacaacatccatgtta 45664558  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  45664557 atagcataaaattgcaaggtacaaatgcatacacatacgactatatttaaatctccgggataaccatatctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 45664458  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  45664457 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaatatg 45664358  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  45664357 acgaa 45664353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 20202918 - 20203224
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20202918 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatacaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactcacaacatccatgtta 20203017  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  20203018 atagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataatcatgtctccgaatttgcaacgtggaagacgccgaag 20203117  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20203118 tcattgattggatctgcacttgattgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaataactgagagaaacaagaaaaacaaacaacctcacacaaagatg 20203217  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  20203218 acaaaca 20203224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 20200736 - 20201042
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20200736 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatacaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactcacaacatccatgtta 20200835  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || || || ||||||||||| |||||| |||    
T  20200836 atagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccgaaataatcatgtctccggatttgcaacgtggaagacgccgaag 20200935  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20200936 tcattgattggatctgcacttgattgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaataactgagagaaacaagaaaaacaaacaacctcacacaaagatg 20201035  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  20201036 acaaaca 20201042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21803967 - 21803660
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21803967 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgtta 21803868  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||          || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21803867 atagcatgaaacatcaaagtacaagtgcctacacatatgactgtatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 21803768  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaaga--aaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    || |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||    
T  21803767 tcattgattggatttgcacgggatcgaagctgatctaacaa-ttgaaccaatcaaatacctaagagaaacaaaaacaaaaaaaaaaacgtcgcacaaaga 21803669  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  21803668 cgacgaaca 21803660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Original strand, 29182295 - 29182592
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182295 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaatgatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 29182394  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||| | |||| || |||||||||||| |||| | ||||    
T  29182395 aaaatgacaaaatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccaaaataatcatgtctccagatctacagcgtggatgacgctaaagccattga 29182494  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182495 ttggatctgcactggatcaaagctga--tgacaatctgaaccgatcaaatacttgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 29182592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 33977604 - 33977909
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33977604 atattcattcattcaaattgaaaaggtacatcgataaaatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacagactcacaacatccatgttaa 33977703  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |           || |||||||||||||||||| |||||||    
T  33977704 taacataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatataactatatttaaatttccagaataaccatatttccggatctgcaacgtggatgacaccaaagt 33977803  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33977804 cattgattggatctgcactgaatcgaaactgatctaacaaactgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagacaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 33977903  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  33977904 cgaaca 33977909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 33076721 - 33076419
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33076721 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatggtgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacaatatccatgtta 33076622  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||          || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  33076621 atagcataaaacggcaaagtacaaatgccaacacatatgactatattcaaatctccggaataaccatgcctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 33076522  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaaca-agaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||    
T  33076521 tcattgattggatctgcactggatcaaagctaatctaacaatctgaaccgatcaaatacctgaaagaaacacaagaaaacaaacaaggtcgcacgaaaac 33076422  T
Q  471 gac 473  Q
    |||    
T  33076421 gac 33076419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 467
Target Start/End: Original strand, 43839195 - 43839490
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43839195 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaatttgctaaaaataaaaagaatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 43839294  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |             ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43839295 atatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatcttcggaataaccacgtcttcggatctgcaacgtggatgacgccagag 43839394  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43839395 ttattgattggatctgcactgaatcgaagttgatctgacaatctaaactgattaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaa 43839490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 47914271 - 47914578
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  47914271 gatattcattaattcaaatgaaaagagtacatcgatgtaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagcctgacaacatccatgtta 47914370  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||          ||  |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  47914371 atagcataaaatgacaaagtacaaatgtctacacacatgactatgtttaaatctccgaaacaaccatgtttaaggatctgcaacgtggatgacgccaaag 47914470  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagag-aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47914471 tcattgattggatctgcactgaatcgaagctgatataacaatctgaactaatcaaatacctgagagaaaacaagaaaaacaaacaacgtcggacaaagac 47914570  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||| ||||    
T  47914571 gacaaaca 47914578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11846984 - 11846684
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11846984 gatattcattcattcaaattgacagagtacatcaataaaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgagtatgtgaacaggctgacaacatccatttta 11846885  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          || || || ||||||||||||||||||||||||     
T  11846884 atagtataaaacggaaaaatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccagaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaaa 11846785  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  11846784 tcattgattggatatgcatcggatcaaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaga-aaaaaacgtcgcacaaagacg 11846686  T
Q  472 ac 473  Q
    ||    
T  11846685 ac 11846684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 478
Target Start/End: Original strand, 912992 - 913300
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaatt--aataga--gtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  912992 tattcattcattcaaattcaaattgatagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgt 913091  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || ||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  913092 taatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccgaaatacctttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaa 913191  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  913192 agtcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacccaaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaaga 913291  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  913292 cgacgaaca 913300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10977679 - 10977524
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10977679 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatatcatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 10977580  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10977579 atagcataaaacagcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctcc 10977524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 54240482 - 54240216
Alignment:
Q  223 tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  54240482 tgcaaattcgctaaaaacaaataggatgaatctgtaaacaggctcacaacatctatgttaatagtataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatga 54240383  T
Q  323 ctatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgaca 411  Q
    |||||||||||||| |          || ||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||    
T  54240382 ctatatttaaatcttcgtaataatcatgtctccggatctgcaacatggatgtcgccaaagtcattgattggatttgcactgaatcgaagctgatctcaca 54240283  T
Q  412 atttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54240282 atctgaaccgatcaaatacctgatagaaacaagaaaaacaaacaacatcgcacaaagacgtcgaaca 54240216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20252092 - 20251787
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20252092 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcaata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatatgtgaacagactcacaacatccatgtt 20251995  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||          || || || ||||||||||||||||  | ||||    
T  20251994 aatagtataaaacggcaaagtacaattgcttacacatataactatatttaaatcaccaaaacaaccatgtctccggatctgcaacgtggatggagtcaaa 20251895  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  20251894 gtcattgattggatttgcactggatcgaagctaatctgacaacctgaaccgatcgaatacctgagagaaaatagaaaaacatataacgtcacacaaagac 20251795  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  20251794 gacgaaca 20251787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 32237677 - 32237980
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||    
T  32237677 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaacaacaaagaggatgaatctgcgaacaaacacacaacatccatgttaata 32237776  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||          || | ||| ||||||||||||||  ||  |||||||     
T  32237777 gcataaaactgcaaagcacaaaagcctacacatatgactaaattcaaatctccgaaatatccatgtcttcggatctgcaacgtggacaacatcaaagtca 32237876  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32237877 ttgattgaatgtgcactggatctaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaactagaaagacaaacaacgccgcacaaagacgacg 32237976  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  32237977 aaca 32237980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22844488 - 22844182
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22844488 gatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgcttaaaacaaaaaggacgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgtta 22844389  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||          || | ||| |||||||| || ||  || ||||||    
T  22844388 atagcataaaacgacaaagtactaaagcctacgcatatgactatatttaggtctccggaatacccatgtcttcggatctgcaatgttgacaactccaaag 22844289  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22844288 tcattgatttgatctgcacttgatcgaagttgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 22844189  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  22844188 acgaaca 22844182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4020034 - 4019725
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  4020034 gatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatgcaaattcgcaaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatccatgtta 4019935  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |||||          || || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  4019934 atagcataaaacgacaaagtacataagcctatacagattactatattcaagtctccagaatactcatgcctccggatctgcaacgttgacgacgccaaag 4019835  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaa---aacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |   |||||| |||   || |||||||| |||||||||    
T  4019834 tcattgattggatctgcactggatctaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaacaataaagacaaaaaacaacgccgcacaaag 4019735  T
Q  469 acgacgaaca 478  Q
    ||||||||||    
T  4019734 acgacgaaca 4019725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40797458 - 40797163
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40797458 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatctatgttaatagcataaaa 40797359  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || || |||| ||| || |||||| |||||||| |||||| |    
T  40797358 cgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatctacaatgttgatgactccaaagtcattgatttg 40797259  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40797258 atctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacccgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 40797163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 41882263 - 41882394
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41882263 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattaaatctgcactggattgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaa 41882362  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41882363 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 41882394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 35501447 - 35501743
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35501447 gatattcattcattcaaattgataaaatacatcgata--atgcaaatttgctaaaaac--------tgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 35501536  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| |||||||   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||          || ||| | ||||||||||||||||  | |||||    
T  35501537 atatcataaaatgacaaagtataattgcttacacatatgactatatttaaatcaccagaacaaccatgtctccggatctgcaacgtggatggagtcaaag 35501636  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35501637 tcattgattgaatttgcattggatcgaagctaatctgacaacctgaaccgatcaaatacctgagagaaaatagaaaaacatataacgtcgcacaaagacg 35501736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21586324 - 21586031
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21586324 attcaaatttataaagtaaatagatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatcgatgttaatagcataaaa 21586225  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    || ||||||||||| | |||||||||| |||||||| || |||||          || || || |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21586224 cagcaaagtacaaaaggctacacatatcactatattcaactctccggaatacacatgtctccggatctccaacgtggacgacgtcaaagtcattgattgg 21586125  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    || ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |   |||||| ||| |||||||| |||  | ||||||||||||    
T  21586124 atttgcactgaatcgaagctggtctgacaatctgaaccgaacaagtacctgaacaaaacaaaaaagacaaacaaagtcaaaaaaagacgacgaa 21586031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 474
Target Start/End: Original strand, 32089610 - 32089910
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||| ||||| |||    
T  32089610 atattcattcactcaaattgatagagtacattaatacaatgcaaattcgttaaaaacaaaaacgatgaatctgtgcacaaactcacaacaaccatgataa 32089709  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||          || |||| || | |||||| || |||| |||| ||    
T  32089710 tagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatgtgactatattcaagtctccggaatacctatgtctcggatattcaacgttgacgacgtcaaaatc 32089809  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| | |  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  32089810 attgattggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctaaaccaaacaaatacatgaacgaaacaagaaagacaaacaatgccccacaaagacgac 32089909  T
Q  474 g 474  Q
    |    
T  32089910 g 32089910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 25939174 - 25939463
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |  |||||   ||||||||||||||||     
T  25939174 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatgcaaattcattaaaaataaaaaggatgaatctacgaacaaattcacaacatccatgttg 25939273  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||||||| |    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |      ||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  25939274 atagcataagatggtaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtgtccag------atctgtaacgttgactacgccaaagtcattgattgg 25939367  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||  | |||||| || |  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25939368 atctgcactgaatctaagctgatctaacaatctgaacataacaaatatctgaacgaaacaacaaagacaaacaacgccgcacaaagacgactaaca 25939463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 7656207 - 7656499
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||| | ||||||       ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||     
T  7656207 attcattcattcaaattgaaaaagtatatcgatataatgcgaatttgttaaaaag------gatgaatctctaaacaggctcacaacattcatgttaatg 7656300  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |           ||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  7656301 gcataaaactacaaagtacaaatgcttagacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccgaatttgcaacgtggatgacgctaaagtca 7656400  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||||||||||     ||| ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  7656401 ttgattggat-----ctgtatcaaagctgatctaacaatctaaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaatatcgcacaaagacgacg 7656495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 29776368 - 29776674
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||  ||||||||| ||||||||    
T  29776368 gatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgatcaaactcacaacaaccatgtta 29776467  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||          | || || || || ||  |||||||  || ||||||    
T  29776468 atagcgtaaaacgacaaagtacaaaagcctgcacatatgactatattcaagtctctgaaatacccttgtctccggatttgtgacgtggacaacaccaaag 29776567  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  29776568 ttattgattggatttgcactgaatctaagctgatctgacaatcaaaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgccgtacaaagacg 29776667  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  29776668 acgaaca 29776674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37052031 - 37051728
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta--- 282  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||       
T  37052031 attcattcattcaaattgacagagtacatcgatgcaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaaaaaactcacaacatccatgttaata 37051932  T
Q  283 -atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggct-------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
     ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |    | |||       || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37051931 tatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcttcggaatagctatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaa 37051832  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag--aaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    ||| || |  ||| |||||||||||||||| |||    
T  37051831 gttattggttggatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaatcgagcaaacacct----gaaccatggaaaagacaaacaacgtcgcactaag 37051736  T
Q  469 acgacgaa 476  Q
    ||||||||    
T  37051735 acgacgaa 37051728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 39340630 - 39340332
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||    ||||    
T  39340630 atattcattctttcaaattgatagggtatatcgatacaatgcaaattccctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatc----ttaa 39340535  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||          || || || ||||||||||| || |||| ||||||    
T  39340534 tagcataaaacggaaaagtataaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatacacatgtctccggatctgcaacgttgacgacgacaaagt 39340435  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||| ||| ||||| |||  ||| |||| ||||||| | |||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39340434 cattgattgaatcagcactagatctaagttgatatgacaatctaaaccgaacaaatacattaacgaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaagacga 39340335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42106563 - 42106283
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42106563 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgttaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 42106464  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaac-gtggatgacgccaaagtcgttgattg 381  Q
    |   | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||          || || || || ||||||  | |||||| |||||||| ||||||     
T  42106463 cgagagagtactaaaacctacacatatgactgtatttaagtctccggaatacccttgtctccggatttgcaacttttgatgac-ccaaagtcattgattt 42106365  T
Q  382 gatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgca 463  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  42106364 gatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacccaaacaaaacaagaaagacaaataacgtcgca 42106283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 54706404 - 54706552
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  54706404 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 54706503  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54706504 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 54706552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48401549 - 48401395
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  48401549 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 48401450  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48401449 atgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattta 48401395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 1074566 - 1074714
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  1074566 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatcc 1074665  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  1074666 atgttaatagcataaaacggcaaagtaaatatgtctacaaatatgacta 1074714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 30155962 - 30156114
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30155962 gatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatatgtgaacaaactcacaacatcc 30156061  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  30156062 atgttaatagcataaaacgacaaagtatatatgcctacaaatatgactatatt 30156114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46926840 - 46926743
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46926840 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgt 46926743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 13701674 - 13701822
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  13701674 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactcacaacatcc 13701773  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13701774 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 13701822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 31462427 - 31462579
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  31462427 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcaaaacatcc 31462526  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  31462527 atgttaatagaataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgattatatt 31462579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 48652121 - 48652282
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||      ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  48652121 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaactccaaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 48652220  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48652221 atgttaatagcataaaacagcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 48652282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 49627776 - 49627928
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  | |||| |||||    
T  49627776 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaatcccacatcatcc 49627875  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  49627876 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatatt 49627928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53403077 - 53402945
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  53403077 atattcatgcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactaacaacatcca 53402978  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgc 310  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  53402977 tgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgc 53402945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 1806140 - 1806292
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  1806140 attcattcattcgaattgatggagtacatcgatttaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacaaactcacaacatccttgttaata 1806239  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| ||  |||| |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  1806240 gcataatacggcaaaatacataagcctataaatatgactatattaaaatctcc 1806292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3457379 - 3457236
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  3457379 gatattcattcatttaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactcacaacatcc 3457280  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3457279 atgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatat 3457236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2598513 - 2598368
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||||| || |||||||    
T  2598513 gatattcatgtattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatcc-ctaaaaacaaaaaggatgaatttgcaaacaaactcacaatattcatgtta 2598415  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598414 atagcataacacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 2598368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3312877 - 3312732
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg--caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3312877 attcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatatccaaattctctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaagtcacaacatccatgttaa 3312778  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3312777 tagcataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactatatt 3312732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33637851 - 33637690
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  33637851 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 33637752  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  33637751 atgttaatagcataaaatggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 33637690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14585919 - 14585771
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||  |||||    
T  14585919 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgagcaaactcacggcatcc 14585820  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14585819 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 14585771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 41868005 - 41868156
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| |    
T  41868005 gatatgcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaccat-c 41868103  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  41868104 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctacaaatatgactatatt 41868156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 53155102 - 53155250
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53155102 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgaataatctgtgaacaaactcacaacatcc 53155201  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53155202 atgttaatagcgtaaaaaggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 53155250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 55455319 - 55455167
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||      ||||||||||| || ||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  55455319 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatctgtgaataaactcacatcatcc 55455220  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  55455219 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatatt 55455167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4082164 - 4082017
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  4082164 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaccaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacaacatcca 4082065  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  4082064 tgttaatagcataaaacggaaaagtacatatggctacaaatatgacta 4082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 329
Target Start/End: Original strand, 40883548 - 40883699
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||     
T  40883548 atattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccg 40883647  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  40883648 tgttaatagcataaaacgacaaagtacccaagcctacaaatatgactatatt 40883699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 287
Target Start/End: Original strand, 14740373 - 14740476
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14740373 atatttattcattcaaattgaaagagtacatcgatgtaatgcaaattcgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagcctcacagcatccatgttaa 14740472  T
Q  284 tagc 287  Q
    ||||    
T  14740473 tagc 14740476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39610664 - 39610519
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||   |||    
T  39610664 gatattcattcattcaaattaatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcaca---tcc 39610568  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  39610567 atgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 39610519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48401238 - 48401139
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48401238 gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatatgactatattta 48401139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 40012944 - 40013092
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  40012944 gatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaactcacaacatcc 40013043  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  40013044 atgttaatagcataaaacggcaacgtacatatccctacaaatatgacta 40013092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45047954 - 45047806
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      ||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||| |||||    
T  45047954 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaatgatgaatcagtgaacaaactcacatcatcc 45047855  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  45047854 atgttaataggataaaacggcaaagtacatatgcctacatatataacta 45047806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11819541 - 11819392
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgcta--aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  11819541 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctataaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcat 11819442  T
Q  275 ccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11819441 ccatgttaatagcataaaacggc-aagtacctatgcctacaaatatgacta 11819392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 50460630 - 50460480
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaa-------acaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||||| |||||||       ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  50460630 attcatttatttaaattgacagagtacatcgatgcaattcaaatttgctaaaagttaagaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccat 50460531  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50460530 gttaacaacataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgactatatt 50460480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 475
Target Start/End: Original strand, 36540375 - 36540654
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||| || |||    
T  36540375 gatatccattcattcaaattgatatagtacatcgatacactgaaaattcagtaaaaacaaaaaggttgaatctgtaaacaaactcacaacatctatatta 36540474  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||| ||||||||  ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| || ||            |||||||||| || ||| ||| |||| ||||||      
T  36540475 ataacataaaacggcaaagtactgaagcctacacaaatgactatattcaagtc------------tctgcaacgttgaggactccagagtcattgattta 36540562  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacga 475  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36540563 atctgtactgaatcgaagttgatctgacaatctgaaccggacaaatacttgaatgaaacaagaaagacaaacaacatcccac-aagacgacga 36540654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2192535 - 2192418
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||| ||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  2192535 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacaacatcc 2192436  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2192435 atgttaatagcataaaac 2192418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31270766 - 31270621
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31270766 gatatttattcattcaaatggatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 31270667  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31270666 atgttaattgcatacaacggcaaagtacatatgcctacaaatatga 31270621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 32080435 - 32080596
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | |||||    
T  32080435 gatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcatatcatcc 32080534  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  32080535 atgttaatagcataaaaagacaaggtacctacgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 32080596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43243243 - 43243101
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| |||||||    
T  43243243 atatgcattcattcaacttgataaagtacatcaatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaagaaactcacatcatcgatgttaa 43243144  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    | |||||||||   ||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  43243143 ttgcataaaacgaaaaaatacaaaaacctacacatataactat 43243101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Original strand, 105721 - 105870
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat-----tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||     || |||| |||||||| ||||||| |  |||||  |||||| |||||||    
T  105721 atattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatcaaagtcactaagaacaaaaaggatgaatctccgaacaaactcacatcatccat 105820  T
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  105821 gttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactatat 105870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 24483368 - 24483516
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  24483368 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggataaacctgtgaacaaactcacaacatcc 24483467  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  24483468 atgttaatatcataaaacggcaaagtccttatgcctacaaatatgacta 24483516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 55446505 - 55446353
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||     
T  55446505 gatattcattcattcaaattgacagagtatatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagtcacatcatct 55446406  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||| || | |||||||||||||    
T  55446405 atgttaatagcataaaacagcaaagtatctatgcatataaatatgactatatt 55446353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 40461670 - 40461979
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc---catg 279  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||| || |||||   ||||||||||   ||||    
T  40461670 gatattaatttattcaaattgataaagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaatgaaaattttgaatctgcgaacaaagtcacaacatccatcatg 40461769  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcga-atctgcaacgtggatgacgcca 368  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||          | || ||| | |||||||| |||||  |||| |    
T  40461770 ttaaaagcatagaacgacaaagtacaaaaggctatacatatgactatattcaagtctctgtgatacccatgtctccagatctgcaaggtggaaaacgcta 40461869  T
Q  369 aagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaag 468  Q
    || || |||||||||||| ||   |||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  |    ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40461870 aattcattgattggatctacatatgatcaaagctaatctgacaatctgaaccaatcaaatatatgtatgaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaag 40461969  T
Q  469 acgacgaaca 478  Q
    ||||||||||    
T  40461970 acgacgaaca 40461979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27831534 - 27831400
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||  |||||| || |||||  |||||||||||||||| |    
T  27831534 gatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatttaa-ttcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtca 27831436  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacat 318  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||    
T  27831435 atagcataaaacgacaaaatacaaaagactacacat 27831400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 33794193 - 33793903
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | || |||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||||  || || ||  ||| |||||| |||||||    
T  33794193 gatattcatttattcaaattgatagagcaaattgatacaatgcaagttctttaaaaacaaaaaggttgaagctgcgatcaaactcgcaacattcatgtta 33794094  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta--aat-ctcctggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||| |  ||| | | || | ||  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  33794093 ataacataaaacagcaaagtacgaaagcctacac--atgactatattcaagaatacccatgtcttcagatctgcaacgtggatgacgctaaaatcaatga 33793996  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||| |   |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  33793995 ttggatatacactggattgaagttgatatgataatctgaatcgaccaaatacctgaacaaaacaacaaaaac-aacaacaccgcacaaagacga 33793903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40365650 - 40365536
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaa 292  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40365650 attcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaattcgttaaaaataaaaaaggatgcatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaa 40365551  T
Q  293 acaccaaagtacaaa 307  Q
    ||  |||||||||||    
T  40365550 acgacaaagtacaaa 40365536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28876909 - 28876760
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||| | || |||||||| ||  ||||  |||||||||| | |||||    
T  28876909 gatatttattcattcaaattgatagagtatatcaatacaatacaaattcgctgaaaaaagaagtgatgaatttgcaaacaaactcacaacattcgtgtta 28876810  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||| |||||||   ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  28876809 ataccataaaatgacaaagtacaaaagcatacgcatatgactatatttaa 28876760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30293235 - 30293126
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||| || ||||    
T  30293235 gatattcattcaatcaaattgatagaatatattgatacaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcaaacaagctcacatcattcaagtta 30293136  T
Q  283 atagcataaa 292  Q
    ||||||||||    
T  30293135 atagcataaa 30293126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 34767415 - 34767122
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaa-ttaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||        ||  ||| || | | ||||||    
T  34767415 gatattcattcattcaaaattgatagagtacatcaatacaacgtaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaa--------caaactcgcagcgttcatgtt 34767324  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||          || ||| | || ||||| ||||| ||| |||||    
T  34767323 aatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacataagactatattcaagtctccggaatacccatgtctccggatatgcaatgtggacgacaccaaa 34767224  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
     || || ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| || ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  34767223 atcattaattagatctgcacttgatcgaagttgttctgacaatttgaactgaacaaatacttgaacgaaacaagaaagacaaacaacatcacacaaagac 34767124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48855334 - 48855186
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| | |||| |  ||||||||||||    
T  48855334 gatattaattcattcaaattgatagagtacatcgaaacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaataaactcacaacatcc 48855235  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  48855234 atgttaataacataaaacggcaatgtacctatgcctacaaatatgacta 48855186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 55090371 - 55090487
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| || |||||    
T  55090371 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcccatcatcc 55090470  T
Q  277 atgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||||||||||    
T  55090471 atgttaatagcataaaa 55090487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2148137 - 2148045
Alignment:
Q  237 aaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2148137 aaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtacaaatgtctacaaatatgactatatt 2148045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 403 - 478
Target Start/End: Original strand, 14741234 - 14741310
Alignment:
Q  403 gatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaa-caagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14741234 gatctgacaatctgaactaatcaaatacctgagagaaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 14741310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35175117 - 35175017
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35175117 caaattcactaaaaacaaaaggaatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacacatatgact 35175018  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  35175017 a 35175017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22485373 - 22485274
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22485373 aaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttcatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 22485274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 34960601 - 34960754
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||    
T  34960601 gatattcattcattcaaattgatagac-acatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactcacagcttcc 34960699  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  34960700 atgttaataacataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgactgtattta 34960754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 53427059 - 53426928
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |   |||||||||    
T  53427059 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgattggatctgcactatatctaagcttatctgacaatctaaaccgaacaaatacctgaacaaaacaagaa 53426960  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  53426959 agacaaacaaaggcacacaaagatgacgaaca 53426928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Original strand, 36623935 - 36624072
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcg-----atataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||    
T  36623935 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcggtacaatataaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaat-tgttaacaaaatcacaacatcc 36624033  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||    
T  36624034 atgttaatagcataaaacggtaaattacatatgcctaca 36624072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 50981138 - 50981255
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||    
T  50981138 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaactcacaacttcc 50981237  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    || |||| ||||||||||    
T  50981238 atattaaaagcataaaac 50981255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 51084272 - 51084389
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||    
T  51084272 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaactcacaacttcc 51084371  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    || |||| ||||||||||    
T  51084372 atattaaaagcataaaac 51084389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19645647 - 19645501
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||      ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  19645647 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaattcaaattcaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacat-c 19645549  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  19645548 atgttaaaagcataaaacataaaattatcgatgcctacaaatatgact 19645501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Original strand, 4817553 - 4817668
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcg-----atataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     |||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4817553 atatttattcattcaaattgatagagtacattggtacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaagcatgaatatgtgaacaaactcacaacatcca 4817652  T
Q  278 tgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4817653 tgttaatagtataaaa 4817668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Original strand, 34103431 - 34103580
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||      ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  34103431 atattcattcgttcaaattgatagagtatatcgatataatacaaatttatattcgctaaaaataaagaggatgaat-tgtgaacaaattcacaacatcca 34103529  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  34103530 tgttaatagcacaaaacggcaaagtatttatgactacaaatatgactatat 34103580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38530374 - 38530233
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||   |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||| | ||||||||||||    
T  38530374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaacccaaattttttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaaactcaaagcatccatgttaa 38530275  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38530274 taacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 38530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 313
Target Start/End: Original strand, 25373817 - 25373902
Alignment:
Q  228 attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgccta 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  25373817 attcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagccta 25373902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 36691471 - 36691619
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||      || |||||||| |||| ||| ||| ||||| ||  |||||||||||     
T  36691471 gatattcattcattcaaatcgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacgaaaaggataaatttgtgagcaacctcacaacatct 36691570  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  36691571 atgttaataacataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta 36691619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 21084411 - 21084562
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa-----attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||     |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||| | ||| ||    
T  21084411 gatatccattcgttcgaattgatagagtacatcgatacaatacaatacaaattcgctaaaaacaaagatgatgaatctgcgaacaatctcatatcattca 21084510  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||  | |||| || |||||||||||||    
T  21084511 tgttaatagcataaaacgacaaaatacttaagcctgcatatatgactatatt 21084562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 478
Target Start/End: Original strand, 22893417 - 22893699
Alignment:
Q  208 agtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||| | ||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  22893417 agtacatcgatataatgttaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaacacacaacaactatgttaatagcataaattaacaaagttcaaa 22893516  T
Q  308 tgcctacacatatgactatatttaaatctcctggc------------tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggat 395  Q
       |||   |||||||||||||||| ||||  ||             ||| |  ||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22893517 aatctagggatatgactatatttaagtctctcggaatacccatgtattcggacttgcaacgtgaacaacgccaaagtcattgattagatctgcactggat 22893616  T
Q  396 tgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
      || || || ||||||| ||||||   |||||| || |  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  22893617 caaaactcatatgacaatatgaaccatacaaatatctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgccgtacaaagatgacgaaca 22893699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51742233 - 51742140
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  51742233 attcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcgccaaaaaaaaaaagaatgaatatgcgaacgaactcacaacatccatgttaa 51742140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 54238739 - 54238840
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta-caaatgcctacacatatgac 323  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  54238739 caaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacaaccatgttaacagcatgaaacggcaaagtaccatatgtctacaaatatgac 54238838  T
Q  324 ta 325  Q
    ||    
T  54238839 ta 54238840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 25111841 - 25111881
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25111841 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataat 25111881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40365474 - 40365356
Alignment:
Q  359 gatgacgccaaagtcg-ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaac 457  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||  ||| | | |||||||||||||    
T  40365474 gatgacgccaaagtccattgatttgatctgta-tggattgaagctgatctgacaatctaaactgaacaaatacctaaacgaatcta-aaaaacaaacaac 40365377  T
Q  458 gtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | || ||||||||||| ||||    
T  40365376 gccgtacaaagacgacaaaca 40365356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 14741156 - 14741215
Alignment:
Q  279 gttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14741156 gttaatagaataaaacgacaaagtacaaacgcctacacatatgactatttttaaatctcc 14741215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 294
Target Start/End: Original strand, 40401206 - 40401316
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||    
T  40401206 attcattcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaatttaatgccgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactcacatcatatatgttaa 40401305  T
Q  284 tagcataaaac 294  Q
    | |||| ||||    
T  40401306 tcgcatgaaac 40401316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 27189193 - 27189243
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27189193 ctcacagcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacacatgcctaca 27189243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 3961454 - 3961606
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||       ||| ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  3961454 gatattcatttattcaaattgataaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcactataaacaaaaatgatgaatttgcaaacaaactcacaacatcc 3961553  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    || |||||| ||||||||     |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  3961554 atattaataacataaaacgatggagtatatatgcctacaaatatgactatatt 3961606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19148428 - 19148328
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||      ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  19148428 ttcattcattcaaattgatagtgtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaattaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgt 19148329  T
Q  281 t 281  Q
    |    
T  19148328 t 19148328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Original strand, 47587103 - 47587200
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  47587103 aaaaacaaaatggatgaatctgcgaacaaactcacatcattcatgttaatagcataaaacgacagagtataaaagcctacaaatatgactatttttaa 47587200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31731011 - 31730917
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||   ||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31731011 taaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacat-catgttaataacattaaacggtaaactacgcatgcctacaaatatgactatatt 31730917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33070584 - 33070486
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaat-gatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||  || |||| |||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  33070584 gatatttattcattcaaattgatggagtgtattgatacaatataaatttgctaaaaacaaaaataaatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgt 33070486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 334
Target Start/End: Original strand, 43897286 - 43897384
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat 334  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||  |||| |||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  43897286 aaaacaaaaaagataaatttgtgaacaaactcaaaacatataggttaataacataaaacaacaaagtacatatacctactaatatgactatattcaaat 43897384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 41882210 - 41882243
Alignment:
Q  305 aaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41882210 aaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 41882243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Original strand, 4206314 - 4206374
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  4206314 ctcacaacatccatattaatagtataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgacta 4206374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Original strand, 47437897 - 47437997
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||  || | | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| | ||||| |||||    
T  47437897 tcgctaaaaacaaaaggaatgaatatgcgaacaaactaatatcatacatgttaatagcataaaacaataaagtacatatgtctacaaacatgaccatatt 47437996  T
Q  330 t 330  Q
    |    
T  47437997 t 47437997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Original strand, 25373935 - 25373998
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgac 410  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  25373935 atctgcaacgtgaacgacgtcaaagtcattgattagatatgcactggatcgaagttgatctgac 25373998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26412644 - 26412577
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26412644 ctcacaacattcatgttaataacataaaaggagaaagttcaaaaacctacacatatgactatatttaa 26412577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27831352 - 27831289
Alignment:
Q  355 cgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  27831352 cgtggacgacgccaaagtcatggattagatctgcactagatcaaagctgatctgacaatctgaa 27831289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Original strand, 30648549 - 30648608
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30648549 cgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 30648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 50460448 - 50460341
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |  |||| |||||| |    
T  50460448 tgcaacgttgacaacgtcaaagttattgattggatttgcattggatcgaaactgatctgacaatctaaaccgaacaaataactgaacgaaataagaaaga 50460349  T
Q  450 caaacaac 457  Q
    ||||||||    
T  50460348 caaacaac 50460341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Original strand, 51990617 - 51990664
Alignment:
Q  247 gatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51990617 gatgaatttgtgaacaaactcacaacatcaatgttaatagcataaaac 51990664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53962471 - 53962408
Alignment:
Q  266 tcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  53962471 tcacaacatccatgttaacagtataaaacaacagagtatctatgcctacaaatatgactatatt 53962408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 244
Target Start/End: Original strand, 48053071 - 48053125
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaa 244  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  48053071 attcattcaaattgatagagtatatcgatgcaatgcaaattcgttaaaaataaaa 48053125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33070073 - 33070012
Alignment:
Q  201 ttaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33070073 ttaattgagtacattgatacaatataaattcgctaaaaacaaaaatgattcatatgcgaaca 33070012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 290
Target Start/End: Original strand, 50194141 - 50194244
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||   | ||| |||  |||||||||||  ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  50194141 gatattcattcattcaaattgatataatacatc---agaat-caacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtta 50194236  T
Q  283 atagcata 290  Q
    ||||||||    
T  50194237 atagcata 50194244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53427137 - 53427088
Alignment:
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53427137 ttaataacataaaatcacaaagtacaaaagcctacacatatgactatatt 53427088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 478
Target Start/End: Original strand, 1220151 - 1220231
Alignment:
Q  398 aagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||| ||||||  ||||  || |||||||| ||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1220151 aagctgatatgacaacctgaaatgaacaaatacccaaacgaaacaaaaaagacaaacaaagccgcacaaagacgacgaaca 1220231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Original strand, 3462953 - 3463005
Alignment:
Q  241 aaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3462953 aaaaatgataaatatataaacaaacttacaacatccatgttaatagcataaaa 3463005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 20464770 - 20464802
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20464770 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 20464802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 23799753 - 23799789
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23799753 gatattcattcattcaaattgatagagtacatagata 23799789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 46304326 - 46304358
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46304326 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 46304358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51060055 - 51059995
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||| || |||||    
T  51060055 taaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaacttacaacatccacattaataacacaaaac 51059995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 153)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41177294 - 41176988
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177294 gatattcattcattcaaattgaaagagtaaatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 41177195  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177194 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgaatatatttaaatctccggaataaccatgttttcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 41177095  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177094 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatttgaagcgatcaaatacttgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 41176995  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  41176994 acgaaca 41176988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25771881 - 25771575
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25771881 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 25771782  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||          ||  || | ||||||||||||||||||||||||     
T  25771781 atagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccagatctgcaacgtggatgacgccaaaa 25771682  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25771681 tcattgattggatctacactggatcgaagctgatctaacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 25771582  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  25771581 acgaaca 25771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43567308 - 43567003
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43567308 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcaatatattgcaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 43567210  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||| ||||||    
T  43567209 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacaccaaag 43567110  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43567109 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgattaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 43567010  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  43567009 acgaaca 43567003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 44167390 - 44167695
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44167390 gatattcattcattcaattgaa-agagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaggctcacatcatccatgtta 44167488  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |           || ||||||||||||||||||| |||||    
T  44167489 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 44167588  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44167589 tcattgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaagcgatcaaatagctgagcgaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 44167688  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  44167689 acgaaca 44167695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 27023817 - 27024123
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27023817 gatatttattcattcaaatcgatagagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 27023916  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||| ||||||    
T  27023917 atagcataaaatggcaaagtacaattgcccacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgactccaaag 27024016  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024017 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaattgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 27024116  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  27024117 acgaaca 27024123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 27191011 - 27191321
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  27191011 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcatggcatccatgtta 27191110  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc--------------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgcc 367  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||  || | |||||||||||||||||||||    
T  27191111 atagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgcatgtttccagatctgcaacgtggatgacgcc 27191210  T
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27191211 aaagtcattgattggatctacactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 27191310  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  27191311 gacgacgaaca 27191321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 27840825 - 27841135
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||    
T  27840825 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcatggcatccatgtta 27840924  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc--------------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgcc 367  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||  || | |||||||||||||||||||||    
T  27840925 atagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgcatgtttccagatctgcaacgtggatgacgcc 27841024  T
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27841025 aaagtcattgattggatctacactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 27841124  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  27841125 gacgacgaaca 27841135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 213 - 478
Target Start/End: Original strand, 7640064 - 7640340
Alignment:
Q  213 atcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcct 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7640064 atcgataaaatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcct 7640163  T
Q  313 acacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7640164 acacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagc 7640263  T
Q  402 tgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640264 tgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 7640340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 3465365 - 3465061
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3465365 gatatccattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaagctcacaacatccatgtta 3465266  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||  || | ||||||||||||||||||||||||     
T  3465265 atagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccgaaataaccatgtttctggatctgcaacgtggatgacgccaaaa 3465166  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465165 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacttgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 3465066  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  3465065 acgaa 3465061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 36508342 - 36508059
Alignment:
Q  206 agagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtaca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36508342 agagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaagcaaaaaggatgaatctgtgaacaggttcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaca 36508243  T
Q  306 aatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactgga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |           || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36508242 aatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactgga 36508143  T
Q  395 ttgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36508142 tcgaagctgatctgacaatctgaagtgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacaacgaaca 36508059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3603420 - 3603115
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3603420 atattcattcattcaaatttatatagtacttcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 3603321  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3603320 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtcttcggatctgcaacatggatgacgtcaaagt 3603221  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3603220 cattgattggatctgcactggatcgaagttgatatagcaatttgaacggatcaaatatctgagagaaacaaaccaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 3603121  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  3603120 cgaaca 3603115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Original strand, 43928985 - 43929284
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43928985 attcattcaaattgatcaagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgttaatagcat 43929084  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43929085 aaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattga 43929184  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43929185 ttgaatctgcacttgatcgaaactgatctaacaatctgaaccgatcaaatacctgatagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 43929284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 38822506 - 38822202
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  38822506 gatattcattcattcaaattaa--gagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacatgctcacaacattcatgtta 38822409  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  38822408 ataacatgaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacatggatgacgtcaaag 38822309  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38822308 tcattgattggatctgcactggatcgaagcaaatctggcaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 38822209  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  38822208 acgaaca 38822202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3390859 - 3390562
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3390859 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagtctcacatcatccatgtta 3390760  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  3390759 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatagctatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 3390660  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  3390659 tcattgattggatctgcactggatcgaagcttatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagag---------aaacaaacaacgtcgcacaaagacg 3390569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5930859 - 5930553
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5930859 gatattcatttattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaattcgtgaacatgctcacaacatccatatta 5930760  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || || || ||||||||||||||| || |||||     
T  5930759 atagcataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatgaccatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggataacaccaaaa 5930660  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5930659 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctcacaatctgaaccgatcaaatacatgatagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaaacg 5930560  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  5930559 acgaaca 5930553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 249 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25516862 - 25516622
Alignment:
Q  249 tgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct----- 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |         
T  25516862 tgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagcca 25516763  T
Q  344 ------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagag 437  Q
          || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  25516762 tgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagag 25516663  T
Q  438 aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25516662 aaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacgacgaaca 25516622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6090325 - 6090020
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6090325 gatactcattcattcaaattgaaagagtacatcaatataatgcaaattcgctcaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagattcacaacatccatgcta 6090226  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |           || |||||||||||||||||| | ||||    
T  6090225 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcatacaca-atgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacactaaag 6090127  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6090126 tcattgattggatatgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatatctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagaag 6090027  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  6090026 atgaaca 6090020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 16720526 - 16720832
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16720526 gatattcattcatgtaaattgatataatacaacgatataatgcaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacagactcacatcatccatgtta 16720625  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||  || | ||||||||||||||||| ||||||     
T  16720626 atagcataaaatgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaagtctccagaataatcatgtatctggatctgcaacgtggatgaagccaaaa 16720725  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16720726 tcgttgattggatctgcacgagatcaaagctgatttgataatctgaaccgaacaaatacctgaaagtaacaagaaaaacaaacaacgtcacacaaagacg 16720825  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  16720826 acgaaca 16720832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 4878412 - 4878720
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata--atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  4878412 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccatgt 4878511  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    ||||| ||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||          || ||| | ||||||||| | |||||  ||||    
T  4878512 taataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcaccggaatactgatgtctccatatctgcaacattgatgagtccaa 4878611  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4878612 agtcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgaacaaatacctaaacgaagcaagaaagacaaacaacgtcgcacaaaga 4878711  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  4878712 cgacgaaca 4878720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 25622725 - 25623029
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  25622725 attcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgttaata 25622824  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||          || | ||||||||| ||||| || |||| |||||||     
T  25622825 gcataaaacgtcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctccggaatactcatgtcttcgaatctgtaacgttgacgacgtcaaagtca 25622924  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaa-gaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25622925 ttgattgaatctgcactgaatctaagctgatatgacaatctgaaccgaaaaaatacctgagtaaaacaaggaaagacaaacaacgccgcacaaagacgac 25623024  T
Q  474 gaaca 478  Q
    |||||    
T  25623025 gaaca 25623029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37884089 - 37883783
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  37884089 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcaatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtta 37883990  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat----------ctcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |          ||| || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  37883989 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtatctagaatactcatgtctccgtatctgcaacgttgacgactccaaag 37883890  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37883889 tcattgatttgatctgcattggatcaaagctgatatgacaatctgaatcgaacaaatacgtcaacgaaacaagaaagacaaacaacatcgcacaaagacg 37883790  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  37883789 acgaaca 37883783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13269008 - 13268702
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||    
T  13269008 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactcataacatccatgtta 13268909  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctgg------------ctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||            | || |||| |||||| || |||||||||    
T  13268908 atatcataaaacagcaaagtacaaaagcttacacatgtgactatattcaagtct-ctggaatactcatgtccccggatcttcaacgttgaagacgccaaa 13268810  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||   ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13268809 gtcgttgattggatatgcattggatcaaagttgatctgacaatctgaatcgaataaatacctagacgaaacgaaaaagacaaacaacgtcgcacaaagac 13268710  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  13268709 gacgaaca 13268702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26491737 - 26491438
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  26491737 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacattatccatgtta 26491638  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  26491637 atagtataacacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatgcccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 26491538  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26491537 tcattgatttgatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaata-ctgaacgaaacaagaaacacaaacaacgtcacacaaagacg 26491439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 188 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35354071 - 35353835
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35354071 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 35353972  T
Q  288 ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgtt 376  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||          || || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35353971 ataaaacaacaaagtacataagcctataaatatgactatattaaaatctccgaaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcatt 35353872  T
Q  377 gattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35353871 ggttggatctgcactggatcgaagatgatctgacaat 35353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 19580683 - 19580986
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19580683 attcatccattcaaattgatagagtgcatcgatacaatgaaaatttgctaaaaacaaaaagtttgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 19580782  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  |||||||| || | ||||| |||||| ||||||||| |||||          || || || ||||||||||| ||  || ||||||||     
T  19580783 gcataaaactgcaaagtactaaagtctacagatatgattatatttaagtctccggaatatccatgtctccggatctgcaacgttgacaactccaaagtca 19580882  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19580883 ttgatttgatatgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacaaaacaaaaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 19580982  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  19580983 aaca 19580986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 18141159 - 18141314
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||  ||||||||||    
T  18141159 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgattaatctgtaaacaagcccacagtatccatgtta 18141258  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18141259 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 18141314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 475
Target Start/End: Original strand, 15673642 - 15673949
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaa-----tagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||  |||||||||||||    
T  15673642 gatattcattcattcaaattaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctga-aacaaactcacaacatcca 15673740  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgc 366  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || ||| | ||||||||| | || ||| |    
T  15673741 tgttaatagcataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatatccatgtctccagatctgcaacattgacgactc 15673840  T
Q  367 caaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaa 466  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15673841 caaagtcattgatttgatctatactggatcgaagctgatatgacaatctgaatcgaacaaaaacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaa 15673940  T
Q  467 agacgacga 475  Q
    |||||||||    
T  15673941 agacgacga 15673949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 198 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10589516 - 10589225
Alignment:
Q  198 aaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacacc 297  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  10589516 aaattgatagagtatatcgatacaatgaaaatccgctaaaaacgaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggc 10589417  T
Q  298 aaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatct 386  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||| |          || ||| | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10589416 aaagtattaaagcctatacatatgactatatttaagtcttcggaatacccttgtctccggatctgcaacgttgatgactccaaagtcattgatttgatct 10589317  T
Q  387 gcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10589316 gcactggatcaaagctgatctgacactctgaaccgaacaaatacccgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 10589225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 9207037 - 9207189
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9207037 attcattcatttgaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctcacaacattcatgttaata 9207136  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
     ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9207137 acataaaacggcaaaacacaaattcctacacatatgactatatttaaatctcc 9207189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11931308 - 11931162
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  11931308 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 11931209  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11931208 atagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatatt 11931162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12366304 - 12366155
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  12366304 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctctcaacatccatgtta 12366205  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12366204 atagcataaaacgaaaaagtactaaagcctacacatatgacaatatttaa 12366155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 9715222 - 9715528
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||||||||  |||||    
T  9715222 gatattcatttattcaaattgatagagtacaccgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatctttgtta 9715321  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||| |          || ||| | || | |||||||||  |||||||||    
T  9715322 ataacatataacgacaaagtacaaaagcctacacgtttgactatattcaagtctgcggaatatctatgtctctggatttacaacgtggagaacgccaaag 9715421  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  9715422 tcattgattggatatgcactggattgaatctgatatgacaatttgaaccaaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaatgccgcacaaagatg 9715521  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  9715522 acaaaca 9715528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 478
Target Start/End: Original strand, 2251033 - 2251329
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2251033 attcattcaaattgatagagtacatcgaagcaatataaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat-tgtgaacaaactcacgacatccatgttaatagcat 2251131  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg---------gc--tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |         ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  2251132 aaaactgcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaataaccatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgg 2251231  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag---aaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacga 475  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||      ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2251232 ttggatttgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaattgaacaaacacct-----caacaagggaaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacaa 2251326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15920310 - 15920164
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  15920310 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcgcaacatcaatgtta 15920211  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15920210 atagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatatt 15920164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 44951659 - 44951549
Alignment:
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44951659 aaagtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgtacaaa 44951560  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  44951559 gacgacgaaca 44951549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 5071051 - 5071354
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  5071051 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaataacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaata 5071150  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  || | |||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||          || || || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  5071151 gcataaaacggcataatacataagcctacaaatatgactatattaaaatatccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 5071250  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    | | |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | | ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5071251 tcggttggatctacactagatcgaagttgatctgacaatctgaaccgaacaaacacctga-acaagagagaaaagacaaacaaagtcgcacaaagacgac 5071349  T
Q  474 gaaca 478  Q
     ||||    
T  5071350 aaaca 5071354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28228657 - 28228352
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||  ||||  ||||||||||||||   ||    
T  28228657 atattcattcattcaaattgatagagaacatcgatataatgcaaattcactaaaaacaaaaaagattaatttgctaacaaactcacaacatccataacaa 28228558  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat---------ttaaat-ctcctggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||         | |||| ||| || | ||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  28228557 tagcataatacgacaaagtaaaaaagcctacacatatgactatattcaagcctctgaaatactcatgtcttcggatctacaacgtgggcgacgccaaagt 28228458  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||  |    
T  28228457 cattgattggatctgcattggatcaaagctgatatgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacgaaacaagaaagacaaacaaaaccgcacaaagataa 28228358  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  28228357 cgaaca 28228352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34471413 - 34471269
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat--tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34471413 gatatacattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatcctcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgt 34471314  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  34471313 taatagcataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgacta 34471269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Original strand, 3397660 - 3397903
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3397660 attcattcattcaaattgatagagtacattgatgcaatacaaattctttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacaaccatgttaata 3397759  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||          || || || |||||||| || |||||||||||||||     
T  3397760 gcataaaacgacaaagtacataagcatacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagccatgtctccggatctgcaatgttgatgacgccaaagtca 3397859  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  3397860 ttggttgaatctgcactggatcgaagatgatctgacaatctgaa 3397903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Original strand, 16879851 - 16879949
Alignment:
Q  380 tggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16879851 tggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 16879949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Original strand, 16991984 - 16992082
Alignment:
Q  380 tggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16991984 tggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 16992082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 7443419 - 7443550
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |   |||||||||    
T  7443419 atctgcaacgttgatgactccaaagtcattgatttgatctgcactggattgaagctgatcttacaatctgaaccgaacaaatacccgaacaaaacaagaa 7443518  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7443519 agacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 7443550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34480401 - 34480255
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34480401 gatattcattcgttcaaattgatagagtacaccggtacaatgtaaattcactaagaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtta 34480302  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34480301 atagaataaaacgacaaagtacaaaaacctacacatatgactatatt 34480255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40125821 - 40125674
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  40125821 gatattcattcattcaaattgatagagtacatagatacaatgaaaatccgttaaaaacaaaaagaatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgtta 40125722  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||  |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40125721 atagc--aaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaa 40125674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4739786 - 4739638
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4739786 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 4739687  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  4739686 atgttaatagcataaaacaacaaagtatctatgcctacaaatatgacta 4739638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 20560797 - 20560945
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20560797 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 20560896  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20560897 atgttaatagtataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgacta 20560945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33012505 - 33012357
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  33012505 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcc 33012406  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  33012405 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgccttcaaatatgacta 33012357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36868465 - 36868317
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||      ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  36868465 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgtacaaactcacaacatcc 36868366  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36868365 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 36868317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5754739 - 5754593
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  5754739 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatcc 5754640  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac 323  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  5754639 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgac 5754593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237310
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||   |||  ||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  25237009 gatattctttcattcaaattgatagagtatatcgatacaatgcaaattcgttaaaacgtaaatggataaatctgggaacaaactcacaacatccatgtta 25237108  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat----------ctcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |          ||| || || ||||| |||||||| || ||| | ||||    
T  25237109 ataacataaaacggcaaaatagaaaagcctacacatatgattatatttaagtcccccgaatactcatgtctccgaatttgcaacgttgacgactcaaaag 25237208  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||       ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25237209 tcattgattgaatctgcactggattgaagctgatctggcaacctgaatcgaacaaatacc-----cgaacgaaaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacg 25237303  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  25237304 acgaaca 25237310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12705143 - 12704996
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12705143 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 12705044  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12705043 gtgttaatagcataaaac-gcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 12704996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19953974 - 19953837
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||    
T  19953974 gatattcattctttcaaattgatagagtatatctatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctccgaacaaactcataacatccatgtta 19953875  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  19953874 atagcctaaaacggcaaagtacaaaaacctacacatat 19953837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 434
Target Start/End: Original strand, 31125063 - 31125319
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||| ||    
T  31125063 catttattcaaattgataaagtacattgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaaaaaacttacaacatccatgttaatatca 31125162  T
Q  289 taaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttg 377  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||          || || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  31125163 taaaacggcaaagtacataagcctacaaatataactatattaaaatctccggaatagtcatgcctccgaatctgcaacattgatgacgccaaagtcattg 31125262  T
Q  378 attggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaa 434  Q
    ||||||||| ||||  || |||| |||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  31125263 attggatctacactaaatcgaagttgatatgacaatctgaatcgaacaaacacctaa 31125319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32015710 - 32015562
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | |||||||    
T  32015710 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaagcaaaaatgttgaatatgtgaacaaacttaaaacatcc 32015611  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  32015610 atgttaatagcataaaacagcaaagtatttatgcctacaaatatgacta 32015562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44942743 - 44942595
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  44942743 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctataaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 44942644  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44942643 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 44942595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35333962 - 35333814
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  35333962 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 35333863  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  35333862 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 35333814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 11798202 - 11798362
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  11798202 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaattcaaattcaaagtcgctaaaaataaaaa-gatgaatctgcgaacaaactcacaacatcc 11798300  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  11798301 atgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 11798362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16136535 - 16136390
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||    
T  16136535 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacattatcc 16136436  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||    
T  16136435 atgttaatagcataaaacggcaaagttcctatgcctacaaatatga 16136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 11937530 - 11937678
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  11937530 gatattcatttatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaatttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaactaactcacaacatcc 11937629  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11937630 atgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 11937678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 12890781 - 12890917
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12890781 gatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 12890880  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgccta 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  12890881 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgccta 12890917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 13878673 - 13878821
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  13878673 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 13878772  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||    
T  13878773 atgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgacta 13878821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 14018798 - 14018946
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  14018798 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 14018897  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||    
T  14018898 atgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgacta 14018946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25068298 - 25068146
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||     
T  25068298 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatca 25068199  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
     |||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  25068198 gtgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatatt 25068146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27096146 - 27095998
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27096146 gatattcattcattcaaattgatggagtacatagatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 27096047  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27096046 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 27095998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 34416427 - 34416575
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| || |||| ||||||||  || |||||||||    
T  34416427 gatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaagacgaatctgtgaacaaacttacaacatcc 34416526  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34416527 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 34416575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4732519 - 4732357
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat-------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||       |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4732519 gatattcattaattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 4732420  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4732419 catgttaatagcataaaacaacaaaaaatttatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 4732357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44441815 - 44441660
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  |||| | |||||||||||    
T  44441815 gatatttattgattcaaattgatagaatacattgatacattgcaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatctgcgaacaaactcatagcatccatgtta 44441716  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||    
T  44441715 atagcttaaaacggcaaagtacaaaagtccacacatatgactatattcaagtctcc 44441660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 43473809 - 43473957
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  43473809 gatattcattcattcaaatcgatataatacattgatataatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 43473908  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  43473909 atgttaatagcataaaacggcaaagtactcatgcctacaaatatgacta 43473957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20036810 - 20036532
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||| | ||||||||| |||||||  |||| |||||||  | ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20036810 attcattcaaattgataaactacat-gatacactgcaaattctctaaaaaagaaaaggatgaatccgagaataaactcacaacatccatgttaatagcat 20036712  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||   |||||||| | ||||||||||  ||||||||  || ||| |          || || || ||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  20036711 aaaacggtaaagtacagaagcctacacattagactatatccaagtctacggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacggcgccaaagtcattga 20036612  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacg 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20036611 ttggatctgcactggatcgaagccaatctgacaatctgaactgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacg 20036532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Original strand, 9689649 - 9689787
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||    
T  9689649 gatatacattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcatagcatcc 9689748  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  9689749 atgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctaca 9689787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 38534969 - 38535114
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  38534969 gatattcattcattcaaattgatagagtacat-gatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 38535067  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaa-gtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||||||    
T  38535068 atgttaatagcataaaacggcaaatgtacatatgtctacaaatatga 38535114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 368 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24500727 - 24500617
Alignment:
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24500727 aaagtcattcatttgatctgcactggatcgaagctgatctgataatctgaaccgaacaaatacatgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaa 24500628  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  24500627 gacgacgaaca 24500617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45035420 - 45035274
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  45035420 gataatcattcatgtaaattaataaagtacatcgatataatacaaattagtgaaaaacataaaagatgaatctatgaacaaactcacgacatccatgtta 45035321  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| || |||| |||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  45035320 atagcataaaccagcaaaatacacaagcctacaaatataactatatt 45035274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22597545 - 22597444
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac 323  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  22597545 caaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcataacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaccaatgcctacaaatatgac 22597446  T
Q  324 ta 325  Q
    ||    
T  22597445 ta 22597444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29543250 - 29543102
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      ||||||||||||||  | |||| ||||||||  || |||||||||    
T  29543250 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaagaaagaatttgtgaacaaactaacaacatcc 29543151  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
     |||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  29543150 gtgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgacta 29543102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43696325 - 43696177
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||      ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||| |||||    
T  43696325 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatcgatgaacaaactcacatcatcc 43696226  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  43696225 atgttaatatcataaaacggcaaagtacatgtgcttacaaatatgacta 43696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Original strand, 28261570 - 28261717
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  28261570 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgataaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacaacatcca 28261669  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || ||||| |||||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28261670 tggtaataacataaaatgacaaagtaccgatgcctacaaatatgacta 28261717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32314882 - 32314734
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa-------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  32314882 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaaatccaaattcgtttaaaacaaaaaggatgaat-tgtgaacaaactcaaaacatc 32314784  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  32314783 catgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 32314734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 270
Target Start/End: Original strand, 39481201 - 39481288
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcaca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  39481201 gatattcattcattcaaattaatacattacatcagtataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatgtgtaaacaagctcaca 39481288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 4426326 - 4426471
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatata------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |      || |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||  |||| | ||||||||    
T  4426326 attcattcattcaaattcatagagtacatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaactaaaaggatgaatttatgaacaaactcatagcatccatg 4426425  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4426426 ttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgacta 4426471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 9978343 - 9978496
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgca------aattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||      |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  9978343 atattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacacatccaaattcgctaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaactcacatcatcca 9978442  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||  | ||||||| ||||||| |||||||    
T  9978443 tgttaatatcataaaacggaaaagtacttacgcctacaaatatgacgatattta 9978496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27665938 - 27665840
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatat-gtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27665938 gctaaaaacaaaaatgatgaatattgcgaacaaactcacaacatctatgttaatagtataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatgactatatt 27665840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 38384130 - 38384291
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| | |||||    
T  38384130 gatattcattcattcaaattgataaagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacgtgtgaacaaactcagagcatcc 38384229  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  38384230 atgttaatagcctaaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgactatatttaagtctcc 38384291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 4603980 - 4604132
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |      |||| ||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||||    
T  4603980 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatccgctagaaacaaaaaagatgaatctctgaacaaactcacaatatcc 4604079  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||||| |||||||||||||    
T  4604080 atgttaatagcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgactatatt 4604132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 17267790 - 17267938
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||| |    
T  17267790 gatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatac 17267889  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  17267890 acgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 17267938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 31908481 - 31908629
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |    
T  31908481 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcattc 31908580  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  31908581 atgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 31908629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 251
Target Start/End: Original strand, 11550344 - 11550412
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatga 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11550344 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatga 11550412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 11550448 - 11550580
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgatt-ggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaaga 445  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||    
T  11550448 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgatttggatctacactggatctaagttgttctgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacgaaacaaga 11550547  T
Q  446 aaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  11550548 aagacaaaaaacgccgcacaaagacgacaaaca 11550580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 18089076 - 18089226
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc- 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  18089076 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 18089175  T
Q  276 -catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
     ||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||| || |||||||||    
T  18089176 acatattaatagcataaaacggcaaaatacctatgcctgcaaatatgacta 18089226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30933641 - 30933573
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30933641 aaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaac 30933573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41798003 - 41797904
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  41798003 aaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatataacta 41797904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Original strand, 10286678 - 10286833
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||    
T  10286678 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcaaaatatcc 10286777  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagta--caaatgcctacacatatgactatattt 330  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||     ||||||||| ||||||||||||||    
T  10286778 atgttaatagcataaaccggcaaagtatctctatgcctacaaatatgactatattt 10286833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11942825 - 11942709
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||      || ||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||| ||    
T  11942825 gatattcattcattcaaatcgatagagtacgtcgatataatacaaattcaaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacaccc 11942726  T
Q  277 atgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||||||||||    
T  11942725 atgttaatagcataaaa 11942709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 13740318 - 13740470
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||    
T  13740318 gatattctttcattcaaattgataaagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgagtttgtgaacaaactcacagcatcc 13740417  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  13740418 atgttaatactataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgactatatt 13740470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 478
Target Start/End: Original strand, 17068676 - 17068899
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat---------ttaaat-ctcctggct-cgaatctgca 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||         | |||| | | || || || || ||||    
T  17068676 ctcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacggatatgca 17068775  T
Q  354 acgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaa 453  Q
    |||| || |||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| ||  ||||||| ||| |||||    
T  17068776 acgtcgacgacgtcaaaatcattgttttgatctgcactggattgaagctgatctaacaattt-aaaggaataaatacccaaacgaaacaaaaaagacaaa 17068874  T
Q  454 caacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  17068875 caacaccgcacaaagacgacgaaca 17068899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 478
Target Start/End: Original strand, 17118574 - 17118797
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa--tct--------cctggct-cgaatctgca 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||        | || || ||||| ||||    
T  17118574 ctcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaacgcctacacatatgactatattcaagcttctgaaatacccatgtctacgaatatgca 17118673  T
Q  354 acgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaa 453  Q
    |||| ||  ||| |||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||  ||||||| ||  ||||||| ||| |||||    
T  17118674 acgttgacaacgtcaaaatcattgttttgatctgcactagattgaagctgatctgacaatct-aaaggaataaatacccaaacgaaacaaaaaagacaaa 17118772  T
Q  454 caacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  17118773 caacaccgcacaaagacgacgaaca 17118797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20570367 - 20570263
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||| ||||  |||||||    
T  20570367 caaaatcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacagcatctatgttaatagcataaaacgacaaagtagctatgcttacaactatgact 20570268  T
Q  325 atatt 329  Q
    |||||    
T  20570267 atatt 20570263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 19953810 - 19953700
Alignment:
Q  367 caaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaa 466  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19953810 caaagtcattgattg-atctgcattggatttaagatgatctgacaatctgaaccgaacaaatacttgaacaaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaa 19953712  T
Q  467 agacgacgaaca 478  Q
    ||||||| ||||    
T  19953711 agacgacaaaca 19953700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 329
Target Start/End: Original strand, 7072716 - 7072790
Alignment:
Q  255 tgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  7072716 tgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgactatatt 7072790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14825954 - 14825848
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  14825954 aaatttgctaaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaattcacaacatccatgttaatagtataaatatccaacgtacaaaagcctacaaatatgacta 14825855  T
Q  326 tatttaa 332  Q
    |||||||    
T  14825854 tatttaa 14825848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 28230761 - 28230906
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| |||||||   | ||||  |||||| | |||    
T  28230761 gatattcgttcattcaaattgttagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcactaaacaaactcacagcctcc 28230860  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28230861 atgttaatagtataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatga 28230906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 34962659 - 34962776
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||      ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  || ||| |||||    
T  34962659 gatattcattcattcaaattgatagagtacataaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaacaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatcc 34962758  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34962759 atgttaatagcataaaac 34962776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44589281 - 44589212
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44589281 caaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaac 44589212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 17056229 - 17056293
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17056229 ctcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatatt 17056293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 17095246 - 17095310
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17095246 ctcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgactatatt 17095310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 106650 - 106559
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatat-gtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  106650 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaaactagtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcatgaaacgacaaagtatatatgcctaca 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29734451 - 29734320
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||| | | |  ||||| ||||    
T  29734451 atcttcaacgttgacgactccaaagtcattgatttgatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaatcgaacaaatccttgaacgaaaccagaa 29734352  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
      ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  29734351 ggacaaacaacgtcgtacaacgacgacaaaca 29734320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 29812468 - 29812599
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||  ||||||| || |||||| |  ||||||||||    
T  29812468 atctgcaacgttgacgattccaaaatcattgattggatctgcactggatctaaactgatataacaatccgaaccgaacacatacctgaatgaaacaagaa 29812567  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29812568 agaaaaacaacaccgcacaaagacgacgaaca 29812599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 421
Target Start/End: Original strand, 31262821 - 31262880
Alignment:
Q  362 gacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccg 421  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31262821 gacgccaaagtcgttgattgaatttgcactcgattgaagctgatctgacaatctgaaccg 31262880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Original strand, 15786248 - 15786367
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||  |||||||||||    
T  15786248 atattaattcattcaaattgatagagtacattgatacaatagaaattctctagaaacaaaaatgattaatctccaaacaaactcaca--atccatgttaa 15786345  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtaca 305  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  15786346 tggcataaaacatcaaagtaca 15786367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 457
Target Start/End: Original strand, 42105618 - 42105727
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||  |    
T  42105618 atctgcaacgttgacaactccaaagtcattgatttgatctgcactgaatcgaagctgatttgacaatttgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaa-ca 42105716  T
Q  447 aaacaaacaac 457  Q
    |||||||||||    
T  42105717 aaacaaacaac 42105727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 326
Target Start/End: Original strand, 23256309 - 23256451
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| | | || |||||||||| | ||  || |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  23256309 gatattcattcattcaaattgataaggtatatcgatataaattcgaaatcgctaaaaaaagaa--gaagaatatgtaaacaaactcacaacatccatgtt 23256406  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    |||| ||||||||   | |||||| || |||||| ||||||||||    
T  23256407 aatatcataaaacggtagagtacatatacctacaaatatgactat 23256451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4703588 - 4703433
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||      || ||||||||||| ||||||| |   ||||  ||| ||||| ||    
T  4703588 gatattcattcatccaaattgacagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgccaaaaacaaaaaggatgaattttcaaacaaactcgcaacaacc 4703489  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||||||  ||||||||  | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4703488 atgttaataatataaaacagtatagtacatatgcttacaaatatgactatatttaa 4703433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 474
Target Start/End: Original strand, 17074769 - 17074892
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    |||||||| || |||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  17074769 tgcaacgtcgacgacgtcaaaatcattgttttgatctgcactggattgaagctgatctaacaattt-aaaggaataaatacccaaacgaaacaaaaaaga 17074867  T
Q  450 caaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  17074868 caaacaacaccgcacaaagacgacg 17074892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 329
Target Start/End: Original strand, 11580862 - 11580961
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  | |||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  11580862 tcgctaaaaacaaaaacgatgaatttacggacaaactcacaacatccatgttaatagtacaaaacgacaaagtacatatgtctacaaatatgaccatatt 11580961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25516960 - 25516914
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25516960 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaat 25516914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40125598 - 40125525
Alignment:
Q  399 agctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40125598 agctgatctgacaatctgaatcgaataaatacctgaacgaaacaagaaagacaaagaacgtcgcacaaagacga 40125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Original strand, 17056325 - 17056444
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    |||||||| || |||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  17056325 tgcaacgtcgacgacgtcaaaatcattgttttgatctgcactggattgaagctgatctaacaattt-aaaggaataaatacccaaacgaaacaaaaaaga 17056423  T
Q  450 caaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  17056424 caaacaacaccgcacaaagac 17056444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 470
Target Start/End: Original strand, 17084308 - 17084427
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    |||||||| || |||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  17084308 tgcaacgtcgacgacgtcaaaatcattgttttgatctgcactggattgaagctgatctaacaattt-aaaggaataaatacccaaacgaaacaaaaaaga 17084406  T
Q  450 caaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  17084407 caaacaacaccgcacaaagac 17084427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 293
Target Start/End: Original strand, 20598399 - 20598463
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaa-atgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  20598399 tcgctaaaaacaaaaaatgatgaatttgtgaacatgctcacaacatacatgttaaaaggataaaa 20598463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44951717 - 44951657
Alignment:
Q  273 atccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 333  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  44951717 atccatgttaatagtataaaacagcaaagtacaattgtttacacatatgactatatataaa 44951657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 295
Target Start/End: Original strand, 33839120 - 33839179
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 aaaacaaaaataatgaatttgcgaaaaaactcacaacatccatgttaatagcataaaaca 33839179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39963648 - 39963549
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  39963648 attcatttcttcaaatagatagagtaaatcgataaaatacaaatttgctaaaaacaaaatggatgaatatccgaacaaactcgcaacattcatgttaata 39963549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 293
Target Start/End: Original strand, 40039044 - 40039103
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40039044 taaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactcacaacgtccatgttaatagcataaaa 40039103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3527443 - 3527397
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  3527443 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 3527397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 305
Target Start/End: Original strand, 8064466 - 8064587
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||| | ||||| || ||| |  ||||||||||   | |||    
T  8064466 gatattcattcattcacattgatagagtatat-gatataataaagattcgttaaaaacaaaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacataagtttta 8064564  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtaca 305  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  8064565 atagcataaaacgacaaagtaca 8064587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18763762 - 18763654
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat-tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   ||||| |||||||||||  ||| | ||||| || |||||  ||||||||| ||| |||    
T  18763762 gatattcattcattcaaatcaatagagtacatc-agata---caaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtt 18763667  T
Q  282 aatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||    
T  18763666 aatagcataaaac 18763654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 338
Target Start/End: Original strand, 31262662 - 31262786
Alignment:
Q  211 acatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgc 310  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||| ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||  |     
T  31262662 acatcaatataatacaaattcgataaaaa---aaatgatgaatctgtaaacaaatttacaacatccatgttaataacattaaacgacaaagtacaatagt 31262758  T
Q  311 ctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||    
T  31262759 ctacaaacatgactatattcaagtctcc 31262786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 290
Target Start/End: Original strand, 32448423 - 32448526
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||   | ||| |||  || ||||||| | ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32448423 gatattcattcattcaaattgatagaatacatc---agaat-caagatcactaaaaatataaatgatgaatctatgaacaaactcacaacatccaagtta 32448518  T
Q  283 atagcata 290  Q
    ||||||||    
T  32448519 atagcata 32448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36234249 - 36234189
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataa 291  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36234249 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataa 36234189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Original strand, 45693822 - 45693890
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45693822 caaagtcgctaaaaacaaaaatgatgattctgcaaacaaactcacatcatctatgttaatagcataaaa 45693890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 300
Target Start/End: Original strand, 12183015 - 12183127
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| ||| |||||| | |||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||||||     ||||    
T  12183015 atattaattcattcaatttgatagagtatatcaatacaatacaaatttgttaaaaacaaaatagatgaatctgcgaacaaactcacaacatt----ttaa 12183110  T
Q  284 tagcataaaacaccaaa 300  Q
    |||||||||||| ||||    
T  12183111 tagcataaaacatcaaa 12183127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13547236 - 13547173
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13547236 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatatgaatttgctaaaaacaaaattgatgaat 13547173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 223
Target Start/End: Original strand, 14826319 - 14826358
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataat 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14826319 atattcattcattcaaatttatagaatacatcgatataat 14826358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19904945 - 19904898
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19904945 atattcattcatttaaattgatatagtacatcgatataatacaaattc 19904898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 338
Target Start/End: Original strand, 6431184 - 6431242
Alignment:
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  6431184 ttaatcgcataaaacggcaaagtacatatgcatacaaatatgactatatttaagtctcc 6431242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6510859 - 6510789
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtac 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |  || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  6510859 taaaaataaaaatgatgaatatgcgaacaaactcaaagtatgcatgttaatagcataaaacagcagagtac 6510789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 7071439 - 7071485
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  7071439 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaat 7071485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 332
Target Start/End: Original strand, 7443339 - 7443393
Alignment:
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  7443339 tgttaatagcataaaactgtaaagtactaaagcctacacatatgattatatttaa 7443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 11561406 - 11561468
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11561406 gctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatccatgttaatagcagaaaac 11561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17792914 - 17792764
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgc-----taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||       | ||| || ||| ||||||| || |||||    ||||||||| |    
T  17792914 gatattcattaattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgttaaagcataaaagatgaatttgcgaacaaaaacacaacatcta 17792815  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    |||||||||||||||| |  | |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  17792814 tgttaatagcataaaatagtagagtatatatgcctacaaatatgactatat 17792764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27666623 - 27666577
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  27666623 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatt 27666577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13113398 - 13113361
Alignment:
Q  247 gatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaat 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13113398 gatgaatatgtgaacaagttcacaacatccatgttaat 13113361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 294
Target Start/End: Original strand, 34962821 - 34962850
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34962821 ctcacaacatccatgttaatagcataaaac 34962850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8806118 - 8806058
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8806118 tcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcata 8806058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15439929 - 15439881
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15439929 gatatttattcatttaaattgatagattacatcgatataatacaaattc 15439881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15920135 - 15920091
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15920135 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgatcggatctgcact 15920091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29734601 - 29734471
Alignment:
Q  212 catcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggct--cacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatg 309  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||  ||  |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |    
T  29734601 catcgttacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggattaatctgtaaacaaactatcacagcatccatgttaatagtataaaacggcaaagtactaaag 29734502  T
Q  310 cctacacatatgact--atatttaaatctcc 338  Q
     |||  |||||||||  |||||||| |||||    
T  29734501 tctagccatatgactatatatttaagtctcc 29734471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 30923263 - 30923295
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30923263 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 30923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34471227 - 34471183
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34471227 atctgcaacgttgacaacgccaaagtcattgattggatctgcact 34471183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 36942928 - 36942960
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36942928 gatattcattcattcaaatcaatagagtacatc 36942960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 37876412 - 37876444
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37876412 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 37876444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41842118 - 41842078
Alignment:
Q  438 aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41842118 aaacaagaaagacaaacaacgcagcacaaagacgacgaaca 41842078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 133)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 22344590 - 22344896
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22344590 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgtta 22344689  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22344690 atagcataaaacagtaaagtacaattacctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtatccggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 22344789  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344790 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 22344889  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  22344890 acgaaca 22344896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 44562427 - 44562733
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44562427 gatattcattcagtcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 44562526  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44562527 atagcataaaacggcaagatacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtagatgacgccaaag 44562626  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44562627 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaacctatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaatgtcgcacaaagacg 44562726  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  44562727 acgaaca 44562733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 15276124 - 15276434
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15276124 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 15276223  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc----------tcctggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15276224 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctctggaataatcatgtctccagatctgcaacgtggatgacgccaaag 15276323  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag----aaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||| |||||||||    
T  15276324 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctcacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaagaaaaaaaaaacaacatcgcacaaa 15276423  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  15276424 gacgacgaaca 15276434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Original strand, 6212592 - 6212896
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6212592 gatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 6212691  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||          || || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  6212692 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacccatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctacaacgtggatgacgccaaag 6212791  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6212792 tcattgattggatctgcacttgatcgaagctgatctgacaacatgaatcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacg 6212891  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  6212892 acgaa 6212896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 45659450 - 45659146
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45659450 gatattcattcatttaaatcgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 45659351  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctg-gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          | ||   ||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  45659350 atagtataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatacttaaatctttggaataaccatgttttcggatctacaacgtagatgacgtcaaag 45659251  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45659250 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaccaacgtcgcacaaagacg 45659151  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  45659150 acgaa 45659146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23257524 - 23257218
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23257524 gatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaacaggctcacaacatccatgtta 23257425  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  23257424 atagcacaaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatctaaatctccggaataatcatgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 23257325  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257324 tcattgattggatctgcagtggatcgaagctaattagacaatctggaccaatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 23257225  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  23257224 acgaaca 23257218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 12967411 - 12967716
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12967411 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatagtgcaaatttgctaaaaacaaaaatgataaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 12967510  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          || ||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  12967511 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatattt-aatctccggaataatcatgtctccagatctacaacgtggatgacaccaaag 12967609  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12967610 tcattgattggatatgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaatgtcgcacaaagacg 12967709  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  12967710 acgaaca 12967716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 38647020 - 38646714
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38647020 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaggctcacaacatccatgtta 38646921  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  38646920 atagcataaaaaggcaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 38646821  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38646820 tcattgatttgatctacactagatcgaagctgatctggcaatctgaaccggttaaatacatgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 38646721  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  38646720 acgaaca 38646714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 630462 - 630768
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  630462 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacagactcgcaacatccatgtta 630561  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          || ||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  630562 atagcataaagtggcaaggtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccaggtctgcaacgtggatgacgtcaaag 630661  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  630662 tcattgattagatctgcactggatcgaagctggtctgacaatcttgaccgatcaaatacttgagagaaacaagaaagacgaacaacgtcgcacaaagacg 630761  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  630762 acgaaca 630768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 38644476 - 38644781
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644476 atattcattcatttaaattgatagagtacatcaatataatgcaaatttgctaaaaactaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 38644575  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          || ||| | |||||||||||||||||| ||| | |    
T  38644576 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatttttaaatctccggaataaccatgtctctggatctgcaacgtggatgactccacaat 38644675  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38644676 catggattgaatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgagccaatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacga 38644775  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  38644776 cgaaca 38644781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 36621786 - 36621482
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36621786 atattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaagaatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 36621687  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct---------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         | || || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36621686 tagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatctctggaataacatgtctccggatctgcaacgtggatgatgccaaagtc 36621587  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36621586 attgattggatttgcactggatcaaagttgatgtgacaatctgaaccgatcaaatacctgaaagaaacaagaaaaacaaactatgtcgcacaaagacgac 36621487  T
Q  474 gaaca 478  Q
     ||||    
T  36621486 aaaca 36621482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Original strand, 14716955 - 14717252
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14716955 atattcattcattcaaattgataaagtacatagatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcaca---tccatgttaa 14717051  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||          |  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14717052 tagcataaaacgc-aaagtacaattgcctacacat--gactatatttaaatctccgaaataaccatttctccggatctgcaacgtggatgacgccaatgt 14717148  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717149 cattgattggatctgcactggatcgaatctgatctgacaatctgaaccgatcaaatatctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 14717248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 238 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21326854 - 21326603
Alignment:
Q  238 aacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21326854 aacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctt 21326755  T
Q  338 c----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaa 426  Q
    |          || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21326754 cggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaa 21326655  T
Q  427 atacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326654 atacctgagaaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 21326603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15698634 - 15698329
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  15698634 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatatgtgagcctgctcacaacatcaatgtta 15698535  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |             | | |||||||||||||||||||||||||    
T  15698534 atagcataaaacggcaacatacaattgcctacacatatgactatttttaaatcttcggaataaccatgtttttggatctgcaacgtggatgacgccaaag 15698435  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15698434 tcattgattgaatctgcaccggatcgaagctgatctgacaatctgaaccaatcaaatacctgagagaaacaa-caaaacaaacaacgtcgcccaaagacg 15698336  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  15698335 atgaaca 15698329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 49652271 - 49651974
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49652271 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaagctcacaacaaccatgtta 49652172  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  49652171 atagcataaaacagcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccaggataaccatgtctcaggatctgcaatgtagatgacgccaaag 49652072  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||         | ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49652071 tcattgattggatttgcattggatcgaagctgatctg---------aacgatcaattacttgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgtacaaagacg 49651981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 467
Target Start/End: Original strand, 44513680 - 44513975
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  44513680 gatattcattcatttaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactcacaacatccatgtta 44513779  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  44513780 ataacataaaacagcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 44513879  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44513880 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaa 44513975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28213489 - 28213178
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28213489 gatattcatttattcaaattgataaagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagattcacatcatccatgtta 28213390  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctac------acatatgactatatttaaatctcctggct---cgaatct-------gcaacgtggatgacgc 366  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||| |||      ||||| ||||||||| |||||||| |  |   | | |||       |||||||||||||| |    
T  28213389 atagcataaaacggcaaaatataaatgcatacggatacacatacgactatattcaaatctccggaataaccaagtctccggattgcaacgtggatgacac 28213290  T
Q  367 caaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaa 466  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28213289 caaagtcattgattggatctacactggatcgaatctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaaagaaacaagaaagacaaacaatgtcgcacaa 28213190  T
Q  467 agacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||    
T  28213189 agacgacgaaca 28213178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8893728 - 8893426
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||    
T  8893728 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctaggaacaaactcataacatccatgtta 8893629  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||          || || || |||| |||||| || |||| |||||    
T  8893628 atagcataaaacaacagagtacaaaagcctacacatatgactata-ttcaatctccggaatacctatgtctccggatctacaacgttgacgacgtcaaag 8893530  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  8893529 tcattgattggatttgcactggatctaagctgatctgaaaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaacaagaaagacaaacaacgcctcacaaagacg 8893430  T
Q  472 acga 475  Q
    ||||    
T  8893429 acga 8893426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 2351056 - 2350752
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2351056 atattcgttcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaa-tgatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 2350958  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggc-------tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    | ||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2350957 tagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagctatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaagt 2350858  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaa-acaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||| | | |||   ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2350857 cattggttggatttgcactggattgaagctaatctgacaatccgaaccgaacaaacacctga-acaaaagggaaaagacaaacaacgtcgcacagagacg 2350759  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  2350758 accaaca 2350752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11121412 - 11121106
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11121412 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaagttcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaatatccatgtta 11121313  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||          || || || |||||||| || || ||| ||||||    
T  11121312 atagtataaaacgacaaagtactcaggcctacacatatgactgtatttaaatctccggaatacatatgtctccggatctgcaatgttgaagactccaaag 11121213  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  11121212 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacatgaacaaaacaagaaagacaaacaacgttgcacaaagatg 11121113  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  11121112 acgaaca 11121106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 40992727 - 40992440
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40992727 attcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaatatccatgttaatagtat 40992628  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||          || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40992627 aaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgattatatttaaatatccggaatattcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattga 40992528  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    ||| |||| ||  |||| ||| || |||          |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40992527 ttgcatctacatcggatcgaaactaatc----------aaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaacacaaacaacgtcgcacgaagatgacgaa 40992440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 33177277 - 33177581
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  33177277 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaa 33177376  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||          || || || || ||||| || || ||| |||||||    
T  33177377 ttgcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccataatactcatgtctccggatttgcaatgttgacgacaccaaagt 33177476  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  33177477 cattgattggatctgcactggatctaagttgatctgacaatctgaaccgaacaaatacatgaacaaaacaa-aaacacaaacaacgttgcacaaagacgg 33177575  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  33177576 cgaaca 33177581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 52839965 - 52839660
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| |||||||  || ||||  |||||||||||||||||||    
T  52839965 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgaaaattcactaaaagtaaaaaggatgaatccgtaaacaaactcacaacatccatgttaa 52839866  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |||          || ||| | || |||||||| || ||| |||||||    
T  52839865 tagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatacgactatagttaagtttccgaaatacccatgtctccagatttgcaacgttgacgactccaaagt 52839766  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  52839765 cattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgagctgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtctcacaaagatga 52839666  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  52839665 cgaaca 52839660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 46589584 - 46589279
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  46589584 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgtta 46589485  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc-------ct----ggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||       ||     |  || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  46589484 ataacataaaacgacaaagtactaaagtctacacatatgagtatatttaagtctctgaaatactcatgtgtccggatctgcaacgttgaggactccaaag 46589385  T
Q  372 tcgttg-attggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    || ||| ||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  46589384 tcattgaattgattttgcactgaattgaaactgatctgacaatctgaaccgaacaaatacttgagcgaaacaagaaagacaaacaccgccgcacaaagac 46589285  T
Q  471 gacgaa 476  Q
    ||||||    
T  46589284 gacgaa 46589279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 430
Target Start/End: Original strand, 13969318 - 13969576
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  13969318 gatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgcaaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 13969417  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat----------ctcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |          ||| || || || ||||||||||| || |||| |||||    
T  13969418 ataacataaaacggcaaagtacaaaagcctatacatattactatattcaagtttccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgtcaaag 13969517  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatac 430  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13969518 tcattgattggatctgcactggatctaagctgatttgacaatttgaaccgaacaaatac 13969576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26200016 - 26199710
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||  || || ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  26200016 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgccacaatgaaaattcactaaaaacaaaaagaattaacatgtgaataaactcacaacatccatgtta 26199917  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||          || | ||| ||||||| ||| || |||  |||||    
T  26199916 atagcataaaacaacaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctccataatacgtatgtcttcggatctgcatcgttgacgacttcaaag 26199817  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26199816 tcattgatttgatttgtactggatcgaagctgatctgacaacctgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagataaacaacgtcgcacaaagacg 26199717  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  26199716 acgaaca 26199710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 27469386 - 27469692
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  || ||||  |||||| |||||||||||    
T  27469386 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcaatataatgaaaattcgataaaaataaaaaggatgaatccgtaaacaaactcacatcatccatgtta 27469485  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||          | || || || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  27469486 atagcataaaatgacaaagtattaaagcctacacttatgactatatttaactctctagaatatccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaag 27469585  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
     | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27469586 ccattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctaaattgaacaattacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 27469685  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  27469686 atgaaca 27469692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 303 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5832550 - 5832364
Alignment:
Q  303 acaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  5832550 acaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataatcatgtctccagatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattgattagatctgcact 5832451  T
Q  392 ggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5832450 ggatcgaagctggtctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaatacgacgaaca 5832364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 300 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4564835 - 4564646
Alignment:
Q  300 agtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  4564835 agtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaatgtggatgacaccaaagtcattgattgaatctgc 4564736  T
Q  389 actggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4564735 actggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaataagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgactaaca 4564646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34567114 - 34566962
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34567114 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaata 34567015  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34567014 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctcc 34566962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 12147726 - 12148032
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  12147726 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaagggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgtta 12147825  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
     |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||          || || || || |||||||| || ||| ||||||    
T  12147826 gtagcataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgactatacttaagtctccggaatacccatgtctccggatttgcaacgttgacgactccaaag 12147925  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||  ||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||     
T  12147926 tcattctttttatctgcactagatcgaagttgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaatgttgcacaaaaaca 12148025  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  12148026 acgaaca 12148032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 184 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1768356 - 1768206
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1768356 atattcattcattcaaattgaaatattacatcgatataatg-----tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtggacag-ctcacaacatccatgttaa 1768263  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg 340  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1768262 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacaaatatgactatgtttaaatctcctg 1768206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26771542 - 26771387
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||  ||||||||| ||||||||    
T  26771542 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaagatgaattaacgaacaaactcacaacaaccatgtta 26771443  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26771442 atagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctcc 26771387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 33703188 - 33703494
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||  ||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  33703188 gatattcattcgtttaaattgatagagtacatcgatacaataaaaaatttctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagtatccatgtta 33703287  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||          | || || || |||| |||||| || | | ||||||    
T  33703288 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctctggaatatccatgtctacggatctccaacgttgacggctccaaag 33703387  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||| | | ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33703388 tcattgatttgatctacactggatcaaacctgatctgacaatctgaatcaaacaaatacgtgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 33703487  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    || ||||    
T  33703488 acaaaca 33703494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5844567 - 5844458
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5844567 gatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcgcaacatccatgtta 5844468  T
Q  283 atagcataaa 292  Q
    ||||||||||    
T  5844467 atagcataaa 5844458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 427
Target Start/End: Original strand, 34659319 - 34659574
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  34659319 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaatttgctaaaaacataaaggatgaatttgcgagcaaactcacaacatccatgtta 34659418  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||          | |  || || |||||||| || || ||||||||||    
T  34659419 atagcataaaatggcaaagtaaaaaagcctacacttatgactatattcaagtctttggaatacccatatctccggatctgcaatgttgacgacgccaaag 34659518  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaa 427  Q
    || ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34659519 tcattgattggatctgcattggatctaagctgatatgacaatctgaaccgaacaaa 34659574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23320678 - 23320570
Alignment:
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23320678 agtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacatgagagaaacaagaaagacaaataacgtcgcacaaaga 23320579  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  23320578 cgacgaaca 23320570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29067476 - 29067340
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  29067476 attcattcaaatagatagagtacatcaataaaatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctgcgaacaatttcacagcatccatgttaatagcat 29067377  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29067376 aaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactat 29067340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 337
Target Start/End: Original strand, 13691448 - 13691595
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13691448 attcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaatagcat 13691547  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
    |||||  |||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13691548 aaaacggcaaaatacataagcctacaaatatgactatattaaaatctc 13691595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10265138 - 10264839
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  10265138 atattcattcattcaaactaacatagtacatcgatataatataaattctttaaaaacaaaaatgatgaatcagtaaacaaactcataacattcatgttaa 10265039  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttga 378  Q
    ||| ||| |||  |||| |||||| | ||   ||||||| |||||| || | |||    |  ||| | |||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  10265038 tagtatacaacggcaaaatacaaaagtctgtgcatatgattatattcaagtttccgaaatacctctagatctgcaacgtggacgacgtcaaagttattga 10264939  T
Q  379 ttggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||| |||| ||  | |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10264938 ttggatttgcaatgactcgaagttgatctgacaatctgaatcgaacaaatacctgaacgaaaaaagaaaaacaaacaacgttgcacaaagacgacgaaca 10264839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29205725 - 29205577
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  29205725 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatcc 29205626  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29205625 atgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgacta 29205577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10877783 - 10877476
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||  |||||  |||| ||| ||    
T  10877783 gatattcgtttattcaaattgatagagtatatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatacatctgcgaacaaactcacttcatcgatgcta 10877684  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcga-atctgcaacgtggatgac-gccaaa 370  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||          | || ||| | || | |||||| |  ||| ||||||    
T  10877683 atagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactacattcaattctctggaatacacatgtctccagatttacaacgttgccgacggccaaa 10877584  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| | ||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  10877583 gtcattgattgaatctgcactggattgaaaatgatatgacaatatgaaccgaaccaatacataaatgaaacaagaaagacaaacaacgccacacaaagac 10877484  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
     |||||||    
T  10877483 aacgaaca 10877476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 47392570 - 47392268
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||||  ||||||||||||||||||    
T  47392570 gatattcatttattcaaat--atagagcacatcaatacaatgcaaattcgctaaaagcaaaaaagataaatcagcgaacaaactcacaacatccatgtta 47392473  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc----------ctggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||           || | ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  47392472 ataacgtaaaacgacaaagtacaaaagcatacacatatgactatattcaagtctctgaagaaccaatgtcttcggatctacaacgtggacgacgccaaag 47392373  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || || ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||  | |||||| |||||| || |  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47392372 tcatttattggatctacactgga-tcaagctgatctgaaaacctaaaccgaacaaatatctgaacgaaacaa-aaagacaaacaacgccgcacaaagacg 47392275  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  47392274 acgaaca 47392268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18344054 - 18343899
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  18344054 gatatttatttattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccctgtta 18343955  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  18343954 atagcataaaacggcaaggtacccatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 18343899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Original strand, 28677803 - 28677957
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  28677803 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatcc 28677902  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  28677903 atgttaatagcataaaacggaaaagtacctatgcctacaaatatgactatattta 28677957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 4882041 - 4882188
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||| |||||  |||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  4882041 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa-aaaaagaatgaatttgtgaacaaactcacagcatcc 4882139  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4882140 atgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 4882188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 29726309 - 29726409
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  29726309 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgact 29726408  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  29726409 a 29726409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3233228 - 3233080
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||       ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||  |    
T  3233228 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaacggattaatatgtgaacaaactcacaacactc 3233129  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3233128 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 3233080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 13488200 - 13488348
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  |||||| |||||    
T  13488200 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagataaatttgtgaataaactcacatcatcc 13488299  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13488300 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 13488348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44517605 - 44517457
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  44517605 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgactctgtgaacaaactcacaacatcc 44517506  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44517505 atgttaatagcataaaacggtgaagtacatatgcctacaaatatgacta 44517457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12872063 - 12871902
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||      |||||||||||||||| |||| || | ||||||  |||||| |||||    
T  12872063 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaggatggatttatgaacaaactcacagcatcc 12871964  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  12871963 atgttattagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaagtatgactatattcaagtctcc 12871902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47551489 - 47551376
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  47551489 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaatggcaaagtatctatgcctacaaatatgact 47551390  T
Q  325 atatttaaatctcc 338  Q
    ||||| || |||||    
T  47551389 atattcaagtctcc 47551376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 45193340 - 45193440
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  45193340 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtaaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 45193439  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  45193440 a 45193440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 15390916 - 15391064
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||    
T  15390916 gatatttattcattcaacttgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaactcacagcatcc 15391015  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  15391016 atattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 15391064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20413191 - 20413094
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20413191 aaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgac 20413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 37822027 - 37822175
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  37822027 gatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaaaaaactcacagcatcc 37822126  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||   || |||||| |||||||||    
T  37822127 atgttaatagtataaaacggcaaagtatctatacctacaaatatgacta 37822175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 7995289 - 7995389
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  7995289 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaatgataaagtacttatgcctacaaatatgact 7995388  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  7995389 a 7995389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 307
Target Start/End: Original strand, 30853625 - 30853748
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||  ||||  |||||||||||||| |||    
T  30853625 gatattcatttattcaaattgatataatacatcgatacaatgcaaattcgctagaa-caaaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccatatta 30853723  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaa 307  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  30853724 attgcataaaacaacaaagtacaaa 30853748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 285
Target Start/End: Original strand, 33938709 - 33938816
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  33938709 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcca 33938808  T
Q  278 tgttaata 285  Q
    ||||||||    
T  33938809 tgttaata 33938816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42276811 - 42276669
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  42276811 atatgcattctttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatcca 42276712  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  42276711 tgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatat 42276669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 48654894 - 48655025
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||  | ||||||| | |  ||||||| ||    
T  48654894 atctgcaacatgaatgacgccaaagtcattgattggatctgcactgaatcgaagctaatatgacaatctgaactaaacaaatacatgaacgaaacaataa 48654993  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48654994 agacaaacaacgttgtacaaagacgacgaaca 48655025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 900486 - 900377
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||   |||||||||||||| ||||    
T  900486 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatctgcaaacgaactcacaacatccatattaa 900388  T
Q  284 tagcataaaac 294  Q
    | |||||||||    
T  900387 ttgcataaaac 900377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27535147 - 27535006
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      ||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27535147 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 27535048  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||| ||||    
T  27535047 tagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatataacta 27535006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37662785 - 37662638
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||     ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  37662785 attcatccattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaaaaaa----ctgaatctgtgaacaaactcacaacattcatgttaata 37662690  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctc 337  Q
    ||||||||   ||||||||  | ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  37662689 gcataaaatgacaaagtacgtaagcctacaaatatgactataataaaatctc 37662638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 423956 - 424104
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| || |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  423956 gatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaactcacaacatcc 424055  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  424056 atgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgacta 424104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14265736 - 14265593
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  14265736 ttcattctttcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatga-tctgtgaacaaactcacaacatccatgt 14265638  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||    
T  14265637 taatagcataaaacagcaaagtgtctatgcctacaaatatgacta 14265593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23791424 - 23791284
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa-ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||     
T  23791424 cattcattcaaattaacagagtacatcgatgcaatacaaaattcgttaaaa-caaaaatgatgaatatgagaacaaactcacaacatttatgttaatagt 23791326  T
Q  288 ataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||| ||||| ||| |  | |||| |||||||||||||    
T  23791325 ataaaacaacaaagcacataaacttacaaatatgactatatt 23791284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 25032767 - 25032919
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||     
T  25032767 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaattcacaacatca 25032866  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| | |||| |||| || ||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  25032867 atgttaacaacatagaacatcagagtatctatgcctacaaatatgactatatt 25032919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51418441 - 51418325
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  51418441 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaagtttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 51418342  T
Q  277 atgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||| | |||||||    
T  51418341 atgttaacaacataaaa 51418325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32784535 - 32784388
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||    
T  32784535 atattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaattttttaacaaactcacaacattca 32784436  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||| |||| |||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  32784435 tgttaataacatataacggcaaactacttatgcctacaaatatgacta 32784388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 33486700 - 33486855
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  33486700 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 33486799  T
Q  277 atg----ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  33486800 atgttaattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatat-actatatt 33486855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21326926 - 21326851
Alignment:
Q  198 aaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaaca 273  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21326926 aaattgatagagtacataaatataatgcaaatacgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaaca 21326851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 478
Target Start/End: Original strand, 32539039 - 32539174
Alignment:
Q  344 cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaacc-gatcaaatacctaagagaaaca 442  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| |     |||||    
T  32539039 cgaatctgcaatatggacaacgccaaagtcattgattggatttgcactgaatcgaagcagatctgacaatctgaaccaaaacaaatacatggacaaaaca 32539138  T
Q  443 agaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32539139 ataaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 32539174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13152884 - 13152732
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacat-------cgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||       | |||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  13152884 gatattcattcattcaaattgatagagtacatatcaatacaatataaatccaaatccgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcat 13152785  T
Q  275 ccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  13152784 ccatgtcaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatacgactata 13152732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17348032 - 17347886
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||      | ||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17348032 gatattcactcatttaaattgatagagtacatcgatataatataaatttaaattctctaaaaacaaaacggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcc 17347933  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17347932 --gttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctataaatatgacta 17347886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32879150 - 32878998
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||      |||||||||| ||||| ||| ||| || |||||  |||||| || ||    
T  32879150 gataatcattcattcaaattgatttagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaacatactcacatcaccc 32879051  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32879050 atgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatatt 32878998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42491325 - 42491202
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  42491325 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgataaaaa---aaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatcca 42491229  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtac 304  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  42491228 tgttaataacataaaacgacaaagtac 42491202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45750935 - 45750787
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| |||||    
T  45750935 gatattcgttcgttcaaattgatagagtacatcaatacaataaaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaactcacagcatcc 45750836  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45750835 atgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 45750787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 22031780 - 22032075
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || || ||||||| |   ||||   ||||| ||| ||| |||    
T  22031780 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcactaaaaataataaggatgaatcttcaaacaaattcacatcattcatatta 22031879  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattg 381  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||| |  | |  || | |   ||     | ||||||||| |||||||    
T  22031880 atatcataaaacgacaaagtacaaaagtctacacatatgattatattcaagtctccggaatactcatgt-ctctgtcaccaatgccaaagtcattgattg 22031978  T
Q  382 gatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |  |||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  22031979 gatctacactggatcgaaactggtctgacaatatgaactgaacaaataccggaacgaaacaagaaaggcaaacaacgccacataaagacgacgaaca 22032075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 475
Target Start/End: Original strand, 37684943 - 37685071
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||  | |  ||||||||||    
T  37684943 atctgcaacgttgacgactccaaagtcattaatttaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcaaacaaatatttgaacgaaacaagaa 37685042  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacga 475  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  37685043 agacaaacaacgtcatacaaagacgacga 37685071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37700574 - 37700446
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||  | |  ||||||||||    
T  37700574 atctgcaacgttgacgactccaaagtcattaatttaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaatcaaacaaatatttgaacgaaacaagaa 37700475  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacga 475  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  37700474 agacaaacaacgtcatacaaagacgacga 37700446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Original strand, 40862555 - 40862651
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattt 330  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  40862555 taaaaacaaagatgatgaatctgcgaacaaactcaaaacatccatgttaatagcataaaacgacagagtacttatgcctacaaatatgactatattt 40862651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 900354 - 900226
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||| || ||| ||    ||||||| ||    
T  900354 atctacaacgtggatgacgtcaaagtcattgattggatccgcactggatcaaagttgatatgacaatctgaaccgaacagatatctggacgaaacaaaaa 900255  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  900254 agacaaacaa-gttgcacaaagacgacgaa 900226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10305020 - 10304904
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||      | |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  10305020 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaaattgataaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaacatcc 10304921  T
Q  277 atgttaatagcataaaa 293  Q
    || ||||||||||||||    
T  10304920 attttaatagcataaaa 10304904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 15790940 - 15791087
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |||||||||||    
T  15790940 gatattcatttattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatatgtgaa-aaaatcacaacatcc 15791038  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  15791039 atgttattaacataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgacta 15791087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10627404 - 10627308
Alignment:
Q  229 ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  10627404 ttcgctacaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatattaatagtctaaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatcacta 10627308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 338
Target Start/End: Original strand, 28399085 - 28399169
Alignment:
Q  254 atgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  28399085 atgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatattcaagtctcc 28399169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29067294 - 29067179
Alignment:
Q  362 gacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcg 461  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |   |||||||||| ||||||||||  |    
T  29067294 gacgccaaag-cattgattgaatttgcacttgatcgaagctgatctgaaaatttgaaccgaataaatacttgaacaaaacaagaaagacaaacaacgctg 29067196  T
Q  462 cacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||||    
T  29067195 cacaaagacgacgaaca 29067179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34566934 - 34566818
Alignment:
Q  360 atgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag--aaaaacaaacaac 457  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||| || |    ||| || |  ||| |||||||||    
T  34566934 atgacgccaaagtcattggttggatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaatcgaacaaacactt----gaaccagggaaaagacaaacaac 34566839  T
Q  458 gtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  34566838 gtcgcacaaagacgacaaaca 34566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 25278515 - 25278656
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| ||| ||     
T  25278515 gatattaactcattcaaattgatagattataacgataaaatacaaatt-gttaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatacatattg 25278613  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||| | | || ||||||  |||||| |||||||||    
T  25278614 atagcataaaatagctaaatacaaaatcctacaaatatgacta 25278656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Original strand, 15312339 - 15312440
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  15312339 caaagtcgttaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcataatacatatggctacaaatatgact 15312438  T
Q  325 at 326  Q
    ||    
T  15312439 at 15312440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 253
Target Start/End: Original strand, 32538888 - 32538953
Alignment:
Q  188 tcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32538888 tcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattcactaaatacaaagatgatgaat 32538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1768135 - 1768095
Alignment:
Q  438 aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1768135 aaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaagacgacgaaca 1768095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6788249 - 6788150
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| | | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||    
T  6788249 aaattcgttaaaaacaaaagggatgaatctataaacaaactcacaacatccatattaatagcataaaaca-------gcaaatgcctacaaatatgacta 6788157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 171372 - 171301
Alignment:
Q  267 cacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||    
T  171372 cacaacttctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacatatatgattatattcaagtctcc 171301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 294
Target Start/End: Original strand, 2597248 - 2597362
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||| | || |||||||      | |||||| |||||| |||||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  2597248 attcattcattcgaattgatagagtaaatcgatgtgatacaaattcaaagtcgttaaaaataaaaattatgaatatatgatcaaagtcacaacatccatg 2597347  T
Q  280 ttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||||||    
T  2597348 ttaatagcataaaac 2597362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 323
Target Start/End: Original strand, 29551477 - 29551576
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcac-aacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgac 323  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| || |||| | ||||||||| |||||||    
T  29551477 caaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcaaacaaactcactaacattcatgctaatagcatagaacagcagagtatatatgcctacaaatatgac 29551576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48003606 - 48003495
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| |||  || |  |||||||    
T  48003606 caaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatttgtaaacaaaatcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgaatataattatgact 48003507  T
Q  325 atatttaaatct 336  Q
    ||||| ||||||    
T  48003506 atattcaaatct 48003495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 332
Target Start/End: Original strand, 48654809 - 48654868
Alignment:
Q  273 atccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  48654809 atccatgttaatagcataaaataacaaagtgcaaaagcctacgcatatgattatatttaa 48654868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Original strand, 9298154 - 9298256
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc 335  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||| | |||||| |||||| || ||    
T  9298154 aaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccatgttaatagtataaaatgacaaagtacctatgcctataaatatgattatattcaagtc 9298253  T
Q  336 tcc 338  Q
    |||    
T  9298254 tcc 9298256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43504189 - 43504111
Alignment:
Q  248 atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  43504189 atgaatatgcgaacaaactcacataatctatgttcatagcataaaacaacaaagtacatattcctacaaatatgactat 43504111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13999339 - 13999282
Alignment:
Q  237 aaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13999339 aaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacgtccatgttaataacataaaac 13999282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19061195 - 19061092
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||   | ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  19061195 gatattcattcattcaaattgatataatacatc---agaat-caagatcgctaaaaacataaaagatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagtta 19061100  T
Q  283 atagcata 290  Q
    ||||||||    
T  19061099 atagcata 19061092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33001944 - 33001843
Alignment:
Q  192 tcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataa 291  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| |   |||| ||| ||| || | |||||||||||||||    
T  33001944 tcattctaattgatagagtaaatcgataaaatacaaattcactaaaaacaaaatggatgaatctccaaacaagcttacatcaacaatgttaatagcataa 33001845  T
Q  292 aa 293  Q
    ||    
T  33001844 aa 33001843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10599321 - 10599169
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg-----caaattcgctaaaaacaaaaa-tgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||      |||| ||| |||||||||||  | |||||| |  |||||  |||||| |||||    
T  10599321 gatatttattcattcaaatttattgagtacatcgatacaataaaattcaaagtcgttaaaaacaaaatgttatgaatctccgaacaaactcacagcatcc 10599222  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  10599221 atattaatagcatagaacgacaaagtacatatatctacaaatatgactatatt 10599169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38783453 - 38783357
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||   || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  38783453 ctaaaaacaaaaatgataaatttgcgagcaaactcaaaacatccatgttaataatataaaatgacatagtacatatgcctataaatatgactatatt 38783357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 52752185 - 52752153
Alignment:
Q  446 aaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52752185 aaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 52752153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 10188555 - 10188602
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  10188555 atattcattcattcaaattaatagagtacattggtacaatacaaattc 10188602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 329
Target Start/End: Original strand, 10188645 - 10188708
Alignment:
Q  266 tcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  10188645 tcacaacattcatgttaatagcataaaacagaggagtacatatacctacaaatatgactatatt 10188708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 329
Target Start/End: Original strand, 50107646 - 50107744
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||   ||||||||| ||| |||||||||    
T  50107646 tcgctaaaaacaaaa-tgatgaatctacgaacaaactctcaacatccatgttaaaaggataaaacgacaaagtatgtatgcctacaaatacgactatatt 50107744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Original strand, 50165929 - 50165988
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50165929 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 50165988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 171562 - 171500
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaa 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  171562 gatattcattcatttaaattgatagagtatattgatattatgcaaatttgttaaaaataaaaa 171500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3102030 - 3101984
Alignment:
Q  248 atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3102030 atgaatatgttaacagactcacaacatccatgcgaatagcataaaac 3101984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16141068 - 16141022
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  16141068 gatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaat 16141022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 294
Target Start/End: Original strand, 33125543 - 33125601
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33125543 aaaataaaaaggataaatatgcgaacaaactcacaacgtccatgttaatagcataaaac 33125601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37662471 - 37662405
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  37662471 atctgcaacgttattgacaccaaagtcattggttggatctgcactagatcgaagctgatctaacaat 37662405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 13691616 - 13691701
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct 432  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  13691616 atctgcaacgttgatgacgtcaaagtcattagttggatttgcactagatcgaagatgatttgacaatctgaatcgaacaaacacct 13691701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29938495 - 29938454
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29938495 tgcaacgttgataacgccaaagtcattgattggatctgcact 29938454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32301720 - 32301664
Alignment:
Q  236 aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32301720 aaaacaaaaa-gatgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 32301664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 35356254 - 35356350
Alignment:
Q  204 atagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaag 301  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||  |||||| || |||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  35356254 atagagtacatcaatataatgcagattcgttaataataaaaa-aatgaatttgcgaacaaactcataaaatccatactaatagcataaaacaacaaag 35356350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 290
Target Start/End: Original strand, 38520367 - 38520424
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38520367 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 38520424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Original strand, 45425249 - 45425306
Alignment:
Q  272 catccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||| |||||| ||||||    
T  45425249 catccatgttaatagcataaaacgactaagtgcatatgcctacaaatatgattatatt 45425306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5856192 - 5856160
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcg 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5856192 atattcattcattcaaattgatagagtacatcg 5856160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8224435 - 8224355
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaa 427  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| || ||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  8224435 atctgcatcgttgacgacgccaaagtcattaattagatatgcacgggatcgaatctgatcagacaatctgaaccgaacaaa 8224355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8758098 - 8758062
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8758098 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgata 8758062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13152701 - 13152657
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13152701 atctgtaacgttgatgacgccaaagtcattgatcggatctgcact 13152657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26535623 - 26535591
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26535623 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 26535591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27456776 - 27456744
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27456776 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 27456744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28666515 - 28666479
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28666515 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgata 28666479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Original strand, 34878127 - 34878191
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34878127 tcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaac 34878191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 40880843 - 40880907
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  |||||||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40880843 cgctaaaaacgtaaatgatgcatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataaca 40880907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44915926 - 44915894
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44915926 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 44915894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47551356 - 47551312
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47551356 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgattggatctgcact 47551312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 23843103 - 23843408
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23843103 atattcattcattcaaattgatagagtacatccatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctcacaacatccatgctaa 23843202  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23843203 tagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacatatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagt 23843302  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23843303 cattgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacga 23843402  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  23843403 cgaaca 23843408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 12576159 - 12576465
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12576159 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatagatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaggctcacagtatccatgtta 12576258  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  12576259 atagcataaaacgacaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 12576358  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12576359 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaaggaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 12576458  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  12576459 acgaaca 12576465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 13233787 - 13234092
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233787 atattcattaattcaaattgatagagtatatcaatataatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 13233886  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||          || || || |||||||||||||||||||||||| |    
T  13233887 tagcataaaacgacaaaatacagttgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaaat 13233986  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233987 cattgattggatctgcactagatcgaaactgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 13234086  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  13234087 cgaaca 13234092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11426381 - 11426071
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  11426381 gatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacatcatccatgtta 11426282  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat----gactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgcc 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |             ||| |||| ||||||||||||||||    
T  11426281 atagcataaaacaacaaagtacaaatgcctacacatatgactgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctacaacgtggatgacgcc 11426182  T
Q  368 aaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 467  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11426181 aaagtcattgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagagatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaa 11426082  T
Q  468 gacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||    
T  11426081 gacgacgaaca 11426071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 19760224 - 19759918
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19760224 gatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgataaaaacaaaaaggataaatatgtgaacaggctcacaacattcatgtta 19760125  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||          || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  19760124 atagcataaaatggcaaggtacaaatgtctgcacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 19760025  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760024 tcattgattggatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaaccgatcaaatacatgagagaaacaagaaatacaaacaacgtcgcacaaagacg 19759925  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  19759924 atgaaca 19759918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31748392 - 31748092
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31748392 atatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 31748293  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || || ||||||| |||||||||  ||||    
T  31748292 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccatatctccgtatttgcaacgaggatgacgctgaagt 31748193  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    |  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31748192 caatgattgaatctgcacttgatcgaagctgatctgacaatctgtactgatcaaatacatgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 31748093  T
Q  473 c 473  Q
    |    
T  31748092 c 31748092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 8632875 - 8633176
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8632875 atattcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctcacaacattcatgttaa 8632974  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||| |||||||||||||||||    
T  8632975 tagcatgaaatgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaatgtggatgacgccaaagt 8633074  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
      ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8633075 aattgattggatctgcgttggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatc-aatacctgagagaaacaagaaaaaca---aacgtcgcacaaagacga 8633170  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  8633171 cgaaca 8633176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20845449 - 20845138
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagg-----ctcacaacatcca 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||      |||||||||||||    
T  20845449 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacagaacagactcacaacatcca 20845350  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgc 366  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||          ||  || | || |||||||||||||||||    
T  20845349 tgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacaaatatgactatatttaaatatccggaataaccatgtttctggatttgcaacgtggatgacgc 20845250  T
Q  367 caaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaa 466  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20845249 cgaagtcattgattggatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatatctgagagaaacaagaaaaacaaacagcgtcgcacaa 20845150  T
Q  467 agacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||    
T  20845149 agacgacgaaca 20845138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16913761 - 16913457
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtg---aacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16913761 attcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtggtgaacaggctcacaacatccatgtta 16913662  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |           || ||||||||||||||||||||| |||    
T  16913661 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatatccggaataatcatctttccggatctgcaacgtggatgacgcc-aag 16913563  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16913562 tcattgattggatctgcactgtattgaaactgatctgacaatctgaacagatcaaatacatgagagaaac-agaaaaacaaacaacgtcgcacaaggacg 16913464  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    | |||||    
T  16913463 atgaaca 16913457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 548550 - 548850
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  548550 gatattcattgattcaaattgatagagtacatcaatataatgcaaattcgcaaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 548649  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||          || ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  548650 atagcataaaacgacaaagtacaactgcctac------gactatatttaaatctccggaataatcatgtctccagatctgcagcgtggatgacgccaaag 548743  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||    
T  548744 taattgattggatctgcactagatcgaagctgatatgacaatctgaaccgatcaaatacctgatagaaacaagaaaaagaaacaacgtcacatgaagacg 548843  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  548844 acgaaca 548850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 8644664 - 8644375
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  8644664 gatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaacaagaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 8644565  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||      || ||||  ||||| || |||||||||||| |||||||     
T  8644564 atagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatattaaagtctc------cggatctataacgttgacgacgccaaagtcattgattga 8644471  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||| |   |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  8644470 atctgcaatggatctaagttgatcagacaatctgaaccaaacaaatacctgaacaaaacaagaaagacaagcaacgccgcacaaagacgaccaaca 8644375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7049598 - 7049381
Alignment:
Q  266 tcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |           || ||||||||    
T  7049598 tcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataatcatatctccggatctgcaa 7049499  T
Q  355 cgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaac 454  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7049498 cgtggatgatgtcaaagtcattgattgcatctgcactggatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaac 7049399  T
Q  455 aacgtcgcacaaagacga 472  Q
    |||||| |||||||||||    
T  7049398 aacgtctcacaaagacga 7049381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10745017 - 10744713
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||    
T  10745017 atattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaattgaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgctaa 10744918  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||          || || || || |||||||| || ||| |||||||    
T  10744917 tagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatttgcaacgttgacgactccaaagt 10744818  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | || ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10744817 cattaatttgat-tgcaccggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctaaacgaaccaagaaaggcaaacaacgtcgcacaaagacga 10744719  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  10744718 cgaaca 10744713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32458076 - 32457776
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32458076 atattcattcatttaaattgataaagtgcatcgatataatgcaaattcaataaaaataaataggataaatctgcgaacaggctcataacatccatgttaa 32457977  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattt------aaatctcctggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgtt 376  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  |      ||   || ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||  |     
T  32457976 aagcataaaacaacaaagtacaaatgcctgcacatatgaccataaatctccagaataatcatgtatccgaatctgcaacgtggatgacgccaacgtaatc 32457877  T
Q  377 gattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32457876 gattggatctgcactgaatcgaagttggtctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaag-aaaataaacaatgtcgcacaaagacgacgaa 32457778  T
Q  477 ca 478  Q
    ||    
T  32457777 ca 32457776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 183 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20496629 - 20496332
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||| |||    
T  20496629 gatattcattcattcaaattgatagcgtacattgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatatta 20496530  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||          |  ||| | || |||||||| || ||| ||||||    
T  20496529 atagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaagtctccggaatacccatctctcaagatatgcaacgttgacgacaccaaag 20496430  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |   |||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  20496429 tcattgattggatttgcactggatctaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacaaaacaaaaaagacaaacaaagtcgtacaaaga 20496332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 4663499 - 4663804
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4663499 atattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 4663598  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||||||||||   || ||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||  |  |           |||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  4663599 tagcataaaatggcatagtactaaagcttacacatatgaccatatttaagtctcaagaatacatatttctccgaatcagcaacattgatgactccaaagt 4663698  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||| ||| |||||||||| | | ||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  4663699 cattgatttgatatgcactggatcgtaactgatatgacaatcagaaccaaacaaatacctgaacgaaacaataaaaaaaaacaaagtcgcacaaagatga 4663798  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  4663799 cgaaca 4663804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34021036 - 34020735
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  34021036 attcattcattcatattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatacatgttaata 34020937  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc----------tcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||          || || || || || |||||||| ||| |||||||||||     
T  34020936 gcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatcatcggaatagtcgtgcctccggatttgcaacgttgattacgccaaagtca 34020837  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||| | || |||| ||||  ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34020836 ttggttggatctacactagatcgaggctgatctgacaatctgatctgaacaaacacct--gaacaagaggaaaaacaaacaacgtcgtacaaagacgaca 34020739  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  34020738 aaca 34020735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 402
Target Start/End: Original strand, 5416903 - 5417132
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  5416903 gatattcattcattcaaattaatagagtacat-gatacaacacaattttgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactcacaacatccatgtta 5417001  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||          ||  || | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5417002 atagcataaaacggcaaagtacaaaagcatacacatatgactatattcaagtctccgaaatacccatgtatctggatctgcaacgtggacgacaccaaag 5417101  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagct 402  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  5417102 tctttgattggatctgcactgcatcgaagct 5417132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30813514 - 30813362
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  30813514 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 30813415  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  30813414 atgttaatagcataaaacgccaaggtacctatgcctacaaatatgactatatt 30813362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Original strand, 15127808 - 15128111
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||||   |||||||||||||||||    
T  15127808 atattcattcattcaaatcgatagagtacattaatacaacgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatcaatctacgaacaaattcacaacatccatgtta 15127907  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| || || ||| | |  |          || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15127908 ataacataaaacaacagagtacagaagcctacacatatgactatgttcaagtcttcagaatatttagcctccggatctgcaacgtggacaacgccaaagt 15128007  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||| |||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||| || ||||||| | |  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15128008 cattgatttgatctgcagtggatcgaagttgaattgacaatctgaacagaacaaatacttgaatgaaagaagaaagacaaacaacatcgcacaaagacga 15128107  T
Q  473 cgaa 476  Q
    ||||    
T  15128108 cgaa 15128111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 12653982 - 12654143
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |      |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||    
T  12653982 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatcc 12654081  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12654082 atgttaatagcataaaacgacaaaatacatatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 12654143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32804692 - 32804425
Alignment:
Q  221 aatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32804692 aatgcaaattggctaaaaacaaaaaggataaatctg-gaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatat 32804594  T
Q  321 gactatatttaaatc----------tcctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctga 409  Q
     |||||||| || ||          || || || ||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |    
T  32804593 aactatattcaagtctctggaatattcatgtctccgaatctacaacatggacgacaccaaagtcattgattggatctgcacttgatcgaagttgatctca 32804494  T
Q  410 caatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||| |||| | | ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  32804493 caatctgaatcaaacaaatacatgaacgaaacaagaaagacaaacaacgccatacaaagacgaggaaca 32804425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 8693335 - 8693483
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  8693335 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 8693434  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8693435 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 8693483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 19402516 - 19402664
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  19402516 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagtatcc 19402615  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19402616 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 19402664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 21507518 - 21507666
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  21507518 gatattcattcattcaaactgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatcc 21507617  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21507618 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 21507666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4660885 - 4660735
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||      |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| |||||    
T  4660885 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacatcatcc 4660786  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  4660785 atgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgattata 4660735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 12481043 - 12481204
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  12481043 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 12481142  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12481143 atgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatatgactatattcaagtctcc 12481204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 336
Target Start/End: Original strand, 33541216 - 33541362
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  33541216 attcattcaaattgttagagtacattaatgcaatataaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcatgacatccatgttaatagcat 33541315  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct 336  Q
     ||||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  33541316 gaaacgacaaagtacataagcctacaaacatgactatattaaaatct 33541362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 14782819 - 14782971
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||||    
T  14782819 gatattcagtcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacattatcc 14782918  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  14782919 atgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgactatatt 14782971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31705622 - 31705474
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||     
T  31705622 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattggctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaaactcacaacatct 31705523  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31705522 atgttaatagcataaaacaacaaagtacctatgcctacaaatatgacta 31705474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 4921572 - 4921683
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  4921572 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgataccatacaaactcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactcataacattcatgtta 4921671  T
Q  283 atagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||    
T  4921672 atagcataaaac 4921683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 23101072 - 23101220
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaa-acaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |      ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23101072 gatattcattcat-caaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 23101170  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23101171 catgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgacta 23101220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33129971 - 33129833
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||||||    
T  33129971 gatattcattcattcaaatga-tagaatacatcgatataatgaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatatgaaca--aatacatcatccatgtta 33129875  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||| ||||||||  |||||| | ||  |||||||||||||||    
T  33129874 ataacataaaacgacaaagtgctaaaacctacacatatgact 33129833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 6295914 - 6296058
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      ||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||    
T  6295914 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactcacaacatcca 6296013  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  6296014 tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatga 6296058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 6302724 - 6302868
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||      ||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||    
T  6302724 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactcacaacatcca 6302823  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  6302824 tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatga 6302868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 15589789 - 15589937
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| |||||    
T  15589789 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaccaactcacagcatcc 15589888  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||    
T  15589889 atgttaatagcataaaacggcaaagtacgtatacctacaaatatgacta 15589937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23654706 - 23654559
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  23654706 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 23654608  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  23654607 atgttaatagcataaaacggcaagttacatatgcctacaaatatgacta 23654559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 322
Target Start/End: Original strand, 23637789 - 23637929
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  23637789 attcattcattcaaattaataaagtacatcgatacaatacaaattcaattttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacagtatccatg 23637888  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  23637889 tta--agcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatga 23637929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Original strand, 15469926 - 15470069
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15469926 atattcattcattcaaattgatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaaaaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 15470025  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||| ||||||||   | |||||| || |||||| ||||||||||    
T  15470026 atatcataaaacggtagagtacatattcctacaaatatgactat 15470069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4394227 - 4394079
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |      |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  4394227 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaactctcaacatcc 4394128  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  4394127 atgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 4394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 31804650 - 31804352
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || || |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  31804650 gatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataataaaaattcgctagaaa-aaagat-ataaatatgtgaagaaactcacagcatccatgtta 31804553  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || | |||||    ||| ||||||||| ||||           ||  | |||||||||||||| || |   ||||||    
T  31804552 atagcataaaacggcaaagtactaaagtctaca----tgattatatttaagtctctgaaatactcatgttttcgaatctgcaacgttgacggttccaaag 31804457  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || || ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  || ||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31804456 tcattcatttgatctgcactagatcgaatctgatctgacaatctgaattgagcaaatacttgagcgaaacaagaaagacaaacaatgtcgcactaagacg 31804357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1944354 - 1944231
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |  || |||||||| |    
T  1944354 tgcaacgtggacgacgccaaaattattgattggatccgcattggatcgaagctgatatgacaatttgaaccaaacaattacctgaacgacacaagaaaga 1944255  T
Q  450 caaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  1944254 caaacaacgccgcacaaagacgac 1944231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 1106527 - 1106679
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc----------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaac 272  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |          ||||||||| |||| ||||||| | ||||||  |||||| |    
T  1106527 gatattcattcattcagattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttctgaacaaactcacatc 1106626  T
Q  273 atccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1106627 atccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 1106679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 29920581 - 29920729
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | | |||||      |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  29920581 gatattcgttcattcaaattgataaagtacatcgatacattacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatcc 29920680  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||| ||||| |||||||||    
T  29920681 atgttaatagcataaaacgacaaagtatccatgactacaaatatgacta 29920729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 892719 - 892482
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||    
T  892719 atattcattaattcaaattgatagaatgaattgatacaatacaaatttgttaaaaacaaaaatgatggatctgcgaacaaactcacgacatccatgttaa 892620  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||  |||||||   ||| |||||   | |||||||||||||||||| || ||||| || |           ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  892619 taatataaaacgataaaatacaataacttacacatatgactatattcaagtctccgggatactcatgtctccgaatttgcaacgtggacaacgccaaagt 892520  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgac 410  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  892519 cattgattggatctgcactgggtcgaagcagatctgac 892482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 904693 - 904558
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  904693 attcaaattgatgcagtacatcgatacaattaaagtttgctaaaaacaaaaatgatgaatcggcgaacaaactcacaatattcatgttaatagtataaaa 904594  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  904593 cgacaaagtacaaaagcctacacggatgactatatt 904558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5544968 - 5544837
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | |||| |||| |  |||| |||||    
T  5544968 atctgcaacgtgaaaaacaccaaagtcgttgattggatatgcacaggatcgaatctgatatgacattctgaaccaaacaaacacctgaacgaaataagaa 5544869  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5544868 agacaaacaacgtcacacaaagacgacgaaca 5544837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 35219577 - 35219694
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | ||||     
T  35219577 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcagagcatca 35219676  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35219677 atgttaatagcataaaac 35219694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 294
Target Start/End: Original strand, 13871292 - 13871406
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa------tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||      | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  13871292 tattcattcattcaaattgatagtgtacataaatataaaataaatccaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatctgtgaacaaactcacaacatccat 13871390  T
Q  279 gttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||    
T  13871391 gttaatagcataaaac 13871406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22530631 - 22530524
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||   |  |||||||||    
T  22530631 attcattgatttaaatttgtagagtacatcgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacattctttatgttaata 22530532  T
Q  286 gcataaaa 293  Q
    ||||||||    
T  22530531 gcataaaa 22530524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2488579 - 2488418
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||     
T  2488579 gatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaacttacaacatct 2488480  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||| || ||||||| ||||| |||||    
T  2488479 atgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttacaaatgtgactatgtttaagtctcc 2488418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 334
Target Start/End: Original strand, 8978468 - 8978577
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||  || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8978468 caaagtcgccaaaaacaaaaaagatgaaattgcgaacaaactcacaacatccatgttcataacataaaacgacatagtacatatgcctacaaatatgact 8978567  T
Q  325 atatttaaat 334  Q
    ||||| ||||    
T  8978568 atattcaaat 8978577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 16338044 - 16338147
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||    
T  16338044 ctaaaaacaaaaaagatgaatctgcaaacaaacttacaacatccatattaatagcataaaacaataaagtactaatgcctactaatatgattatattcaa 16338143  T
Q  333 atct 336  Q
    ||||    
T  16338144 atct 16338147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 18248802 - 18248905
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||| || |||  |||| |||||| |||||| ||    
T  18248802 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacaatattcatattaatagcataaaacgccatagttcacatgtatacaaatatgattatattcaa 18248901  T
Q  333 atct 336  Q
    ||||    
T  18248902 atct 18248905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35039085 - 35039010
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaa 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35039085 caaagtcgttaaaaacaaaaatgataaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaa 35039010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Original strand, 2304502 - 2304619
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||      |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||| ||||    
T  2304502 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaagataaattagtgaacaaactcacaatatcc 2304601  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2304602 atgttaataacataaaac 2304619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5146383 - 5146307
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatat------aatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5146383 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaat 5146307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 281
Target Start/End: Original strand, 31936297 - 31936401
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgca------aattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  31936297 gatattcgttcattcaaattgatagagtacatagatacaatacatatctaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatct 31936396  T
Q  277 atgtt 281  Q
    |||||    
T  31936397 atgtt 31936401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15176242 - 15176099
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |   || |||| ||||||||||| || |||||| | ||||  |||| ||||| |||||||    
T  15176242 atattcattcattcaaattgatagggtatatcgatataaatttgaaatcgccaaaaacaaaaaagacgaatatataaacaaactcataacattcatgtta 15176143  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||| ||||||||   | |||||| || |||||| ||||||||||    
T  15176142 atatcataaaacggtagagtacatattcctacaaatatgactat 15176099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5545116 - 5545062
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  5545116 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattcgctaaa 5545062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 904499 - 904398
Alignment:
Q  377 gattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||  | |   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  904499 gattggatatgcattggatcgaagctgatctgacagtctgaaccgaacatatagttgaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcacacaaagacggcgaa 904400  T
Q  477 ca 478  Q
    ||    
T  904399 ca 904398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Original strand, 12651922 - 12652034
Alignment:
Q  226 aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |||  | ||| |||| |||||||||||||   |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12651922 aaattcgataaaaacaaaaatgatgaatttacgaacaaactcgtagcattcatgctaatagcataaaatgacaaattacaaaaacctacacatatgacta 12652021  T
Q  326 tatttaaatctcc 338  Q
    |||| || |||||    
T  12652022 tattcaagtctcc 12652034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14730974 - 14730910
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  14730974 ctcacatcatccatgttaataacataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatgattatatt 14730910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 16328802 - 16328906
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||| ||||  |||||| |    
T  16328802 caaagtcgctataaacaaaaaagatgaatatgcaaacaaacttacaacatccatattaatagcataaaacaacagagtacttatgtctactaatatgatt 16328901  T
Q  325 atatt 329  Q
    |||||    
T  16328902 atatt 16328906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 20742833 - 20742909
Alignment:
Q  214 tcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  20742833 tcgatagaatgcaaattcgctaaaaacacaaaggatgaaaatgcgaacaaactcataacattcatgttaataacata 20742909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23588116 - 23588000
Alignment:
Q  189 cattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagca 288  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||    |||||||||||||||||||   |    
T  23588116 cattcattcaaattgacatagtacatcgatacaatactaattcgctaaaaataaaaatgataaatttgcaaactaattcacaacatccatgttaatgata 23588017  T
Q  289 taaaacaccaaagtaca 305  Q
    ||||||  |||||||||    
T  23588016 taaaactgcaaagtaca 23588000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Original strand, 33541383 - 33541455
Alignment:
Q  346 aatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  33541383 aatctgaaacgttgatgacaccaaagtcattggttggatctgcactggaacgaagctgatctaacaatctgaa 33541455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6127974 - 6127857
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||  |||||| |||||    
T  6127974 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttaaattataaattcaaagtagctaaaagcaaaaaggatgaatttgcaaacaaactcacatcatcc 6127875  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  6127874 atgttaaaagcataaaac 6127857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28943705 - 28943579
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc-----gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||     | ||||||| |||| ||||||| ||  ||||  ||||||| || ||    
T  28943705 gatattcattcatccaaattgatagagtatattgatataatacaaattcataatgttaaaaacgaaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaaaataca 28943606  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtac 304  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28943605 tgttaataacataaaaccacaaagtac 28943579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Original strand, 9043842 - 9043911
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  9043842 caaagtcgttaaaaataaaaatgatggatatgtgaacaaactcaaagcatccatgttaatatcataaaac 9043911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22530509 - 22530410
Alignment:
Q  378 attggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaac 477  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||   || ||| ||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  22530509 attggatctgcactggatcgaagttgatctgaccatcaaaatcgaacaaatacttaa-acaaaaaagaaagacaaacaacatcgcacaaagatgatgaac 22530411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17335000 - 17334941
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17335000 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 17334941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31680819 - 31680760
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31680819 aaaaacaaaaagaatgaatatatgaacaaactcacaacttccatattaatagcataaaac 31680760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3359146 - 3359040
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||||||   |||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||  ||||| ||||||||| |||| |||||||| |    
T  3359146 gctaaaaacaaaaggaatgaatttgcgaacaaactcacgacattcatgttaatagcataaagcggcattgtacatatgcctacaaatataactatattca 3359047  T
Q  332 aatctcc 338  Q
    || ||||    
T  3359046 aaactcc 3359040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 6419543 - 6419589
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  6419543 gatattcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaat 6419589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27135547 - 27135433
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgcta-----aaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat 278  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||   |     |||| ||||||||||||||||||||||   | | ||||||||     
T  27135547 atattcatttattcaaactgatagactaaatcgatataatacaaattcaaaatcaataaaagaaaaatgatgaatatgtgaacaaagtaaaaacatccaa 27135448  T
Q  279 gttaatagcataaaa 293  Q
    |||||||||||||||    
T  27135447 gttaatagcataaaa 27135433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29285133 - 29285039
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||   | |||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  29285133 aaaaacaaaaaggatggatatgcgaacaaactcacgacattcatgttaataacataaaacggaagagtacatatagctacaaatatgactatatt 29285039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 478
Target Start/End: Original strand, 5417141 - 5417182
Alignment:
Q  437 gaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5417141 gaaacaagaaagagaaacaacgccgcacaaagacgacgaaca 5417182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33197665 - 33197596
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaat 253  Q
    |||| |||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  33197665 atatacatttattcaaattgattgaatacatcgatacaatgcaaattcactaaaaataaatctgatgaat 33197596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20226092 - 20226032
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  20226092 tcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcata 20226032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22120076 - 22120016
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22120076 tcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcata 22120016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25337854 - 25337822
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25337854 gatatttattcattcaaattaatagagtacatc 25337822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Original strand, 28634942 - 28635002
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  28634942 tcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatcgcata 28635002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 33052973 - 33053005
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33052973 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 33053005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 141)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40775700 - 40775397
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40775700 gatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaa---aaaggatgaatatgtgaacatgctcacaacatccatgtta 40775604  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||          || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  40775603 atagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtctctggatctgcaacgtggatgacgccaaag 40775504  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40775503 tcattgattggatctgcactagatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 40775404  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  40775403 acgaaca 40775397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 26017336 - 26017642
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26017336 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgtta 26017435  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26017436 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccgaatttgcaacgtgaatgacgccaaag 26017535  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26017536 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 26017635  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  26017636 acgaaca 26017642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 47750167 - 47749864
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47750167 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattcgctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaacagactcacaacatccatgttaata 47750068  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | || ||| | ||||||||| |||||| |||| |||||     
T  47750067 gcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtctccagatctgcaacatggatgccgccgaagtca 47749968  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47749967 tcgattggatctgcactggatcgaaactgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 47749868  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  47749867 aaca 47749864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 49167361 - 49167055
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49167361 gatattcattcattcaaattgaaagagtatatcaatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacatcatccatgtta 49167262  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||| ||||    
T  49167261 atagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgctaaag 49167162  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49167161 tcattgattagatctgcactggatcgaagctgatctaacaatctgaagcgatcaaatacctgggagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 49167062  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  49167061 acgaaca 49167055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7986328 - 7986022
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7986328 gatattcattcattcaaattgatagagtagatcgatataatacaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 7986229  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |             ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7986228 atagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacttaggactatatttaaatctccggaataaccatgtattcggatctgcaacgtggatgacgtcaaag 7986129  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7986128 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatttgacaatctgaacggatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcacacaaagacg 7986029  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  7986028 acgaaca 7986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11002278 - 11001973
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11002278 atattcattcattcaaattaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaacattcatgttaa 11002179  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  11002178 tagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctacaacgtgaatgacgccaaagt 11002079  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11002078 cattgattagatctgcactgaatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgttgcacaaagacga 11001979  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  11001978 cgaaca 11001973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 30992502 - 30992807
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30992502 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaag-gatgaatatgtgaacagactcacaacatctatgtta 30992600  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          || || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  30992601 atagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgcctccggatctgcaacgtggatgatgtcaaag 30992700  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30992701 tcattgattggatctgcactagatcgaagttgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaccaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacg 30992800  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  30992801 acgaaca 30992807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 134823 - 135129
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  134823 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgtta 134922  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| |||||| |   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |          || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  134923 ataacataaagcgaaaaggtacagatgcctacacatatgactatatttaaatattcgaaataaccatgtctccagatctgcaacgtggatgacgccaaag 135022  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  135023 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatttgacaatctgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaatcaaacaacgtcgcacaaaaacg 135122  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  135123 acgaaca 135129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 184 - 457
Target Start/End: Original strand, 19895363 - 19895647
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895363 atattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataggctcacaacatccatgttaa 19895462  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||          || || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19895463 tagcataaaacggcacagtacaattgtctacccatatgactatatttaaatctccagaataatcatgtctccgaatctacaacgtggatgacgccaaagt 19895562  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaac 457  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19895563 cattgattgaatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaac 19895647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 8611301 - 8611608
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca-ggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8611301 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaatacgctaagaacaaaaaggatgaatatgtgagcctggctcacaacatccatgtt 8611400  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |           || ||||||||||||||||||||||||    
T  8611401 aatagcataaaacggcaaagtacaaatacctacacatatgactatatttaaatctctggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgacgccaaa 8611500  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8611501 gttattgattggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaagcgatcaaacacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 8611600  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||| ||||    
T  8611601 gactaaca 8611608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 43806829 - 43807134
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43806829 atattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaagaatgatgaatctgtgaacaggatcacaacatccatgttaa 43806928  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    ||| |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |           || |||||||||||||||| |||||||||    
T  43806929 tagtataaaacggcaagatacaaatgcttacacatatgactatatttaaatatccggaatagccatatctccggatctgcaacgtggatgccgccaaagt 43807028  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43807029 cattgattggatctgcactagatcgaagctgatcttacaatctgaaccgatcaaacacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagatga 43807128  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  43807129 cgaaca 43807134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 42491137 - 42490833
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42491137 atattcattcattcaaattgatagagtacatcgacataatgcaaattcgctaaaaacaaaag-gataaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 42491039  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||          || || || |||||||||||||||||||||| |||    
T  42491038 tagcataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattactatatttaaatatccggaataaccgtgtctccggatctgcaacgtggatgacgccacagt 42490939  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  42490938 cattgactggatctgcactagatcgaagctgatctgacagtctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaatgtcgcacaaaggcaa 42490839  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    ||||||    
T  42490838 cgaaca 42490833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24470841 - 24470523
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24470841 gatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtt 24470742  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatg-------- 362  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |             ||| |||||||| |||||||            
T  24470741 aatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctgcaatgtggatgcaacgtgg 24470642  T
Q  363 ---acgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgt 459  Q
       ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24470641 atgacgccaaagtcattgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgt 24470542  T
Q  460 cgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24470541 cgcacaaagacgacgaaca 24470523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24475789 - 24475471
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24475789 gatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgtt 24475690  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg-----------gctcgaatctgcaacgtggatg-------- 362  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |             ||| |||||||| |||||||            
T  24475689 aatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgttttcggatctgcaatgtggatgcaacgtgg 24475590  T
Q  363 ---acgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgt 459  Q
       ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24475589 atgacgccaaagtcattgattgaatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaagcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgt 24475490  T
Q  460 cgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24475489 cgcacaaagacgacgaaca 24475471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37400033 - 37399730
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37400033 atattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaaagctaaatttgtgaacagactcacaacatctatgttaa 37399934  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |           ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  37399933 tagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctcatgaataaccatgtctccgaatttgtaacgtggatgacgtcaaagt 37399834  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37399833 cattgattggatctgcactggatcgaagctaatcggacaatttgaatcaatcaaatacttgaaagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacga 37399734  T
Q  473 cgaa 476  Q
    ||||    
T  37399733 cgaa 37399730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40477143 - 40476837
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  40477143 gatattcattcattcaaattgaaagagaacatcaatataatgcaaattcacttaaaacaaaaaggatgaatctgtgaatagactaacaacatccatgtta 40477044  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |           || |||| |||||||||||||| |||||    
T  40477043 ataacataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattactatatttaaatctccggaataatcatatttccggatctacaacgtggatgacgtcaaag 40476944  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476943 tcattgattggatctgcacttgatcgaagctgatctgacaatctgaagtgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 40476844  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  40476843 acgaaca 40476837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 8319751 - 8319445
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||    
T  8319751 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatatagtgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaatagactcacagtatccatgtta 8319652  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||          || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  8319651 atagcataaaatgacaaattacaaatgcatgcacatatggctatattcaaatctccggaacaaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 8319552  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8319551 tcattgattgggtctgcactggatcaaagctgatctaacaatctgaaccgatcaaatgcctgagagaaacaagaaagacaaacaaggttgcacaaagacg 8319452  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  8319451 acgaaca 8319445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 772879 - 772578
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  772879 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaagctcacaatatccatgtta 772780  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||          || ||| | |||| ||| || || ||||||||||    
T  772779 atagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgactatttttcattctccgaaatactcatgtctctggatcttcaatgttgacgacgccaaag 772680  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  772679 tcattgattggatctgcactagattgaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaatatcgcacaaagacg 772580  T
Q  472 ac 473  Q
    ||    
T  772579 ac 772578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28015793 - 28015487
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28015793 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgtta 28015694  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||          || || || |||||||| || || ||| ||||||    
T  28015693 atagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgaatatatttaagcctccagaatacctatgtctccggatctgcaatgttgacgactccaaag 28015594  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28015593 tcattgatttgatctgcactggatcgaagctgatctaacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaaggcaaacaacgtcgcacaaagacg 28015494  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  28015493 acgaaca 28015487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47156821 - 47156547
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47156821 gatattcattcattcaaattaaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgtta 47156722  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||  ||||||    
T  47156721 ataacataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaatctccggaataaccatgtttccggatctgcaacgtggatgataccaaag 47156622  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaacc---gatcaaatacctaagagaaacaa 443  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||||||||    
T  47156621 tcattgattagatctgcactgtatcgaagttgatatgacaatctgaagcattcatcaaatacctgagagaaacaa 47156547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39090524 - 39090220
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  39090524 gatattcattcattcaaattgataaagtacgttgatacaaggaaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaacctcacaatatccatgtta 39090425  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat----------ctcctggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| |||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |          ||| || ||| ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  39090424 atatcataaaatggcaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaagtcactgtaatactcatgtctctgaatctgcaacattgatgactccaaag 39090325  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39090324 tcattgaattgatttgcactggatcgaagctgatatgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagatg 39090225  T
Q  472 acgaa 476  Q
    |||||    
T  39090224 acgaa 39090220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 478
Target Start/End: Original strand, 29804360 - 29804659
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  29804360 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacgacatccatgttaata 29804459  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||          || || || ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  29804460 gcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgactatatttaaatatccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgatgccaaagtca 29804559  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaag-aaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgac 473  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29804560 ttggttggatctgcatcggatcgaagctgatctgataatctgaatcgaacaaacacct-----gaacaagaaaaaaaaaacaacgtcgcacaaagacgac 29804654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 207 - 478
Target Start/End: Original strand, 5024758 - 5025040
Alignment:
Q  207 gagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaa 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |    
T  5024758 gagtacatcgatacaatgaaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcatgaaacgacaaaatacta 5024857  T
Q  307 atgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggat 395  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||          || || || ||||||||| | || ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  5024858 aagcctacacatttgactatatttaagtctccagaatacctatgtctccggatctgcaacattgacgactccaaagtcattgatttgatctggactggat 5024957  T
Q  396 tgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5024958 cgaatctgatctgacaatctgaaccgaacaaatacctaaatgaaataagaaaggaaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 5025040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18754131 - 18753980
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||| |||||||    
T  18754131 gatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacagactcacaacattcatgtta 18754032  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18754031 atagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgactatatttaaat 18753980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 38649036 - 38649191
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  38649036 gatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtta 38649135  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| |||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38649136 atagcaaaaaacggcaaagtactaaagcttacacatatgactatatttaagtctcc 38649191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 335
Target Start/End: Original strand, 25854890 - 25855041
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25854890 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata--atgtaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtaaacagactcacaacatccatgtt 25854987  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatc 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25854988 aatagcataaaacaacaaagtacaattgcttacacatatgactatatttaaatc 25855041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 23732072 - 23732377
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||| || |||||  |||||| |||| || |||    
T  23732072 gatattcattcatttaaattgataaagtacattgatataatgtaaattcgtcaagaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcaca-catcaatttta 23732170  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa--atct--------cctggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||        | |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23732171 atagcataaaacgacaaagtacaaaagcatacacatatgattatattcaagtatctgaaatagtcgtttctccagatctgcaacgtggacgacgccaaag 23732270  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  23732271 tcattgattggatctgcactggatcgaagctaatttgacaatctgaaccgaccaaatacctgaacgaaacaagaaagacaaacagcgacgcacaaagatg 23732370  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  23732371 acgaaca 23732377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 427
Target Start/End: Original strand, 21552136 - 21552388
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21552136 attcattcatttaaattgatagagtatattgatgtaatacaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctatgaacaaactcacatcatccatgttaata 21552235  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggc-tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
     ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||          || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  21552236 acataaaacagcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccgaaatagtcatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaagtca 21552335  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaa 427  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21552336 ttggttggatctgcagtggatcgaagcggatctgacaatctgaaccgatcaaa 21552388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 476
Target Start/End: Original strand, 41748216 - 41748509
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41748216 attcaaattgatatagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaggataaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaa 41748315  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |  |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||          || ||| | |||||| | || |||||| |||||||| |||||| |    
T  41748316 cggcaaagtactaaaacctacacatataactatatttaagtctccggaatacccttgtctccagatctgcgatgttgatgactccaaagtcattgatttg 41748415  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41748416 atctgcatttgatcgaagttgatctgacgatctgaaccgaacaaatacccaaacaaaacaagaaagacaaacaacgtcgcactaagacggcgaa 41748509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 46918834 - 46918530
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||| ||||||||    
T  46918834 atattcattcattcaaattaacagagtatatcgatacaatgcaaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatacatgttaa 46918735  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||          || ||| | ||||||||| || |  || | |||||    
T  46918734 tagcataaaacggcaaagtacaaaagcctatacatatgactatattcaagtctccaaaatactcatgtctctggatctgcaacatgcacaacactaaagt 46918635  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | ||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  46918634 cattgattgaatttgcattggatctaagctgatctgacaatctgaaccgaacaaat-cctgaacgaaacaagaatgacaaacaacaccgcacaaagacga 46918536  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    | ||||    
T  46918535 caaaca 46918530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34893543 - 34893394
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34893543 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatgaaaattcgctaaaaatattaaggatgaatctgtgaacaaactcacaatatccatgtta 34893444  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34893443 atagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgactatatttaa 34893394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 419
Target Start/End: Original strand, 35134880 - 35135109
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||  ||||||||||||||  ||    
T  35134880 gatattcattcattcaaatcaatatagtacatcgatacaatgcaaattcactaaaaa-taaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatacta 35134978  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||      | || |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  35134979 ataacataaaacgacaaagtacaaaagtttacacatatgactatattcaagtc------cccggatctgcaatgtggatgacacgaaagtcattgattgg 35135072  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaac 419  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  35135073 atctgcacttgatcgaagccgatctgataatttgaac 35135109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Original strand, 21328979 - 21329222
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21328979 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattcacaacatccatgttaata 21329078  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctgg------------ctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtc 373  Q
    |||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||            | || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21329079 gcataaaacggcaaagtgcacaagcctacaaatatgactatattaaaatat-ctggaatagtcatgcccccggatctgcaacgttgataacgccaaagtc 21329177  T
Q  374 gttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
     ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||    
T  21329178 attggttggatctgcactagatcgaagttgatctgacaatctgaa 21329222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 430
Target Start/End: Original strand, 33530153 - 33530411
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33530153 gatatgcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattcgctaaaaacaaaagagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgtta 33530252  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||          || ||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  33530253 ataacataacacggcaaaatacaaaaacctacacttatgactatattcaagtctccgaaatactcatgtctcaggatctgcaacgttgatgacgccaaat 33530352  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatac 430  Q
    || |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33530353 tcattgattggatttgcactggatctaagctgatttgacaatctgaaccgaacaaatac 33530411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 418
Target Start/End: Original strand, 35141341 - 35141570
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  35141341 gatattcattcatttaaactgatagagtacatcgatacaatgcaaattcgcttaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgtta 35141440  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |||  |||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||||||| || |||      ||| |||||||| ||||| ||| | |||||| |||||| |    
T  35141441 ataatataaaacaacaaaatacaaaagcatacatatatgactatattcaagtct------tcggatctgcaatgtggacgacactaaagtcattgattag 35141534  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    || |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  35141535 atatgcactggatcgaagtcgatctgataatttgaa 35141570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2532366 - 2532136
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2532366 attcaaattgatagagtacatcgatgtaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatgcatgttaaaagcataaaa 2532267  T
Q  294 caccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    |   ||||||||   ||||||| |||| |||||||| || |||||          || || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2532266 cggaaaagtacattagcctacaaatataactatattaaattctccggaatagccatgcctccggatctgcaacgttgatgacgccaaagtcattggttgg 2532167  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2532166 atctgcactggatcgaagatgatctgacaat 2532136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21991119 - 21990971
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21991119 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 21991020  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21991019 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 21990971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 419
Target Start/End: Original strand, 34594221 - 34594447
Alignment:
Q  204 atagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  34594221 atagtgtacatcgatgtaatacaaattcgctaaaaacaaaaatgattaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtg 34594320  T
Q  304 caaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctg---------gc--tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactg 392  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |         ||  |||  ||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||     
T  34594321 catatgcctacaaacatgactatattaaaagttccggaatagtcatgccttcgggtctacaacgttgatgacaccaaagtcattggttggatctgcacta 34594420  T
Q  393 gattgaagctgatctgacaatttgaac 419  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34594421 gattgaagctgatatgataatttgaac 34594447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40658044 - 40657902
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  40658044 atattcattcattcaaattgatagggtacatcgatataatgcaaatttcctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagactcgcaacgtccatgttaa 40657945  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||     ||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40657944 ta-----aaacgacagagtacaaatgcatacacatatgattatattta 40657902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42645112 - 42644964
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||      |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  42645112 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 42645013  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  42645012 atgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgacta 42644964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43484011 - 43483730
Alignment:
Q  196 tcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43484011 tcaaattgatatagttcatctatacaatgaaaattcgctaaaaacgaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacg 43483912  T
Q  296 ccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggat 384  Q
     |||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||          || || || ||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||    
T  43483911 acaaagtattaaagcctacacatatgactatatttatgtctccggaatacctttgtctccggatctgcaacgttgatgactcaaaagtcattgatttgat 43483812  T
Q  385 ctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
     |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43483811 atgcactggatcgatgctgatttgacaatctgaaccgaaca------------aaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 43483730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32741200 - 32741046
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32741200 gatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 32741101  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  32741100 atgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatgactatattta 32741046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 37375720 - 37375871
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacat----cgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  37375720 gatattcattcattcaaattgatagagtacatgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaactcacagcatcca 37375819  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37375820 tgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatatt 37375871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 46025719 - 46025871
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| |||||    
T  46025719 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactcacagcatcc 46025818  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46025819 atgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatatt 46025871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 25855073 - 25855204
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  25855073 atctgaaatgtggatggagccaaagtcattgattggatttgcactggatcgaagctaatctgacaacctgaaccgatcaaatacctgagagaaaatagaa 25855172  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25855173 aaacatataacgtcgcacaaagacgacgaaca 25855204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Original strand, 35362786 - 35362940
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  35362786 gatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaactcacaaaatccatgtta 35362885  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||| |||||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||    
T  35362886 atagca-aaaacggctaagtacaaaaggctacacatatgattatattcaagtctcc 35362940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 24319887 - 24320032
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24319887 gatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 24319986  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  24319987 atgttgatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatga 24320032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 458
Target Start/End: Original strand, 37890168 - 37890453
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||  |||||| ||||||||||     
T  37890168 gatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaattcgttaaaaacaaataagatgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgttg 37890267  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    | | ||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||  ||||| || |||          | ||   ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  37890268 acaacataaaacggaaaagtacaaaagtctagacatatgatcatattcaagtcttcggaatacacatgatccgaatttgcaacgtggacgacgctaatgt 37890367  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacg 458  Q
    | |||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  37890368 cattgactggatctgcagcggatcaaagctgatctgacaatctgaaacgaacaaatacgtgaacgaaacaagaaaaacaaacaacg 37890453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6667852 - 6667704
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||      |||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  6667852 gatattcattcattcaaattgatagagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatcc 6667753  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6667752 atgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 6667704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14708016 - 14707713
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||| |||||  ||||||    
T  14708016 gataatcattcattcaaaatgatagagtacattgatacaatacaaattcactaaaaacaaaaaggatgact-tgtgaacaaactcataacatttatgtta 14707918  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc---------tggctcga-atctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||  ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||         || ||  | ||||||||| |||| || |  |||||    
T  14707917 atat-ataaaatggcaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcatgtatccagaataccatgtcttcagatctgcaacatggacgatgataaagt 14707819  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacga 472  Q
    | || |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14707818 cattaattggatctgcattggatcgaagatgatcagacaatttgaatcgaacaaatacctaaatgaaacaagaaagacaaacaacgccgcacaaaaacga 14707719  T
Q  473 cgaaca 478  Q
    | ||||    
T  14707718 ctaaca 14707713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 36350581 - 36350300
Alignment:
Q  205 tagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtac 304  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  36350581 tagagtatatcaatataatacaaattcgtaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtac 36350482  T
Q  305 aaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc---------tggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactgga 394  Q
    |||  ||||||||||| || ||||| || |||||         || || |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||||| |    
T  36350481 aaaaacctacacatataaccatattcaagtctccagaatactatgtctccgaatctgcaacgttgacgacgccaaagccattgattggatccgcactgaa 36350382  T
Q  395 ttgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    |  |||||||| ||||||| | |  ||| |||||| || |   |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36350381 tcaaagctgatatgacaatctaagtcgaacaaatatctgaaccaaacaaaaaagacaaacaacgtcacactaagacgacgaa 36350300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37593540 - 37593392
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  37593540 gatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaatatcc 37593441  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  37593440 atgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgtctacaaatatgacta 37593392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 44681898 - 44681590
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaa-acaaaaa-tgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    ||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  44681898 gatatccatccatccaaatggatagagtacatggatacaatgcagattcgttaaaacacaaaaaatgatgaatctgcgaacaaacgcacaacatccatgt 44681799  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatct----------cctggct-cgaatctgcaacgtggatgacgccaa 369  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||          | || || |||||||||||| ||||| | | |||    
T  44681798 taatagcttaaaacgacaaagtacaaaagtctacatatatgactatttttaagtctctggaatacccatgtctccgaatctgcaacctggattatgtcaa 44681699  T
Q  370 agtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaaga 469  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  44681698 agtcattgattggatctacaccggatcgaagctggtttgacaatctgaacataataaatatctaaacgaaacaagaaagacaaacaacgtcccacaaaaa 44681599  T
Q  470 cgacgaaca 478  Q
    |||||||||    
T  44681598 cgacgaaca 44681590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 48304056 - 48304204
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||      || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  48304056 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaatttcactaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcataacatcc 48304155  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  48304156 atgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 48304204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Original strand, 4621044 - 4621195
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||| |    
T  4621044 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaactcacaacattc 4621143  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatat 328  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4621144 atgttaatagcataaaatgacaaagtacatatgcctacaaatatgactatat 4621195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Original strand, 17508868 - 17509015
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17508868 gatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17508967  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  17508968 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgact 17509015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17544346 - 17544199
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17544346 gatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17544247  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  17544246 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgact 17544199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Original strand, 42603447 - 42603597
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42603447 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 42603546  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42603547 taatagcataaaacggcaaagttcctatgcctacaaatatgactatattta 42603597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 36719224 - 36719377
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatg-atgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  36719224 gatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatc 36719323  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  36719324 catgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctacaaatatgactatatt 36719377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11833475 - 11833327
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgc------taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||      |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  11833475 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgcattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 11833376  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    || |||||||||||||||  |||||||   ||||||| | |||||||||    
T  11833375 atattaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctataaatatgacta 11833327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 17473425 - 17473577
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17473425 gatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17473524  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  17473525 atgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatatt 17473577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17579789 - 17579637
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17579789 gatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 17579690  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  17579689 atgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgactatatt 17579637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 44482542 - 44482698
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||| |||||    
T  44482542 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaataaactcacatcatcc 44482641  T
Q  277 atgtta----atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44482642 atgttaatatatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactatatt 44482698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 1280801 - 1280949
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | |||||    
T  1280801 gatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatcc 1280900  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1280901 atgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaactatgacta 1280949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 15123681 - 15123833
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctca------caacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||      ||||||||    
T  15123681 gatattcattcattcaaattgatagagtagatcaatacaaagcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactcagacttgcaacatcc 15123780  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||| |||||| |   ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15123781 atgttaatatcataaagcggaaaagtacaaaaacctacacatatgactatatt 15123833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 22747173 - 22747321
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||       ||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||    
T  22747173 gatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatttactaaaaacaaaaaggatgattctgtgaacaaactcacatcatcc 22747272  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22747273 atgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta 22747321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 36579005 - 36579153
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  36579005 gatattcattcgttcaaattgatagagtacattaatataatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 36579104  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  36579105 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcccacaaatatgacta 36579153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 22379387 - 22379533
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||    
T  22379387 gatatacatccattcaaattgataaagtacatcgatgcaatgtaaattctttaaaaacaaaaaagatgaatctaagaacaatctcacaacaaccatgtta 22379486  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  22379487 atagcataaaacggcaaagtaaaaaaacctgcacatatgactatatt 22379533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2623049 - 2622901
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||      | | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  2623049 gatattcattcattcaaattgatagagtacatctatataatataaatctaaatttgataaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacattc 2622950  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  2622949 atgttaatagcataagacgacaaaatacctatgcctacaaatatgacta 2622901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10094897 - 10094749
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||     
T  10094897 gatattcattcattcaaattgatagagtatattaatacaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatca 10094798  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10094797 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta 10094749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41288413 - 41288265
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  41288413 gatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatcc 41288314  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| || |||||||||    
T  41288313 atgttaatagcataaaacggcaaagtacttgtgcctgcaaatatgacta 41288265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38273289 - 38273185
Alignment:
Q  234 taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaa 333  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||     
T  38273289 taaaaacaaaaaggatgaatttgctaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgccaacaaatatgactatattcaag 38273190  T
Q  334 tctcc 338  Q
    |||||    
T  38273189 tctcc 38273185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45482509 - 45482351
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  45482509 gatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaa---aaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 45482413  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   || |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  45482412 atgttaatagcataaaacgacaaagtatctatacctacaaatatgactatattcaagtctcc 45482351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3266830 - 3266673
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||      | |||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||   ||||    
T  3266830 atattcattcattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcaca---tcca 3266734  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3266733 tgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactatatttaagtctcc 3266673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5684805 - 5684660
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||      |||||||||||  | ||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  5684805 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5684706  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  5684705 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatgactatatt 5684660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5709855 - 5709710
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||      |||||||||||  | ||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  5709855 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5709756  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  5709755 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatgactatatt 5709710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 24988165 - 24988290
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |    
T  24988165 atattcattcatttaaattgatagaatacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatatgaacaaaatcacaacatcta 24988264  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||    
T  24988265 tgttaatagtataaaacgacaaagta 24988290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Original strand, 45457221 - 45457358
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |      || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  45457221 atattgattcattcaaattgatagagtacatcgacacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcca 45457320  T
Q  278 tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctaca 315  Q
    | |||||||||||||||  |||| || | |||||||||    
T  45457321 tattaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctaca 45457358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9934104 - 9933977
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |  ||||||||||    
T  9934104 atctgcaacgttgacgactccaaagtcattgatttgatctgcactggatcaaagctgatctgacaatctgaatc-aacaaatacctgaacgaaacaagaa 9934006  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  9934005 agaca---aacgtcgcacaaagacgacgaaca 9933977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36253387 - 36253239
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36253387 gatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggaagaatctgtgaacaaactcacaacatcc 36253288  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
     |||||||||||||||||  |||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  36253287 gtgttaatagcataaaacgacaaaatatctatgcctacaaatatgacta 36253239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 413
Target Start/End: Original strand, 45949372 - 45949598
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| ||           |    
T  45949372 attcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacgaat-cgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacatca-----------a 45949459  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||          || ||| | ||||||||||| || ||||||||||||     
T  45949460 gcataaaacagcaaagtacataagcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtca 45949559  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  45949560 ttgattggatctgcacttgatcgaagctgatatgacaat 45949598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10574822 - 10574673
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaac-aaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||      ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  10574822 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatataaatctaaattcgctaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacagcatc 10574723  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| | |||||||||    
T  10574722 catgttaatagcataaaacggcaaagtacatgtgcctataaatatgacta 10574673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 39532639 - 39532784
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| ||| |    
T  39532639 gatattaattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatgtgtgaacaaactcacatcattc 39532738  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatga 322  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||| ||||||    
T  39532739 atgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcatacaaatatga 39532784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9785774 - 9785626
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |      ||||||||| |||   |||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  9785774 gatattcattcattcaaattgatagggtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaactaaatgaatgaatttgtgaacaaactcacatcatcc 9785675  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  9785674 atgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 9785626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16273817 - 16273719
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaa----aatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16273817 gatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattcgctaaaaataaaaaggaatgatgaatatgtgaacaaactcacagcatcca 16273719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21603915 - 21603767
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgc------taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||        |||||| ||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  21603915 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcattaaaaagaaaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 21603816  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  21603815 atgttaatagcgtaaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgacta 21603767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27535884 - 27535737
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||  |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27535884 gatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaactcacaacatcc 27535786  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||    
T  27535785 atgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgacta 27535737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40762045 - 40761897
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata------atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |      || |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| | |||||    
T  40762045 gatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaaagaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatatcatcc 40761946  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  40761945 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcttacaaatatgacta 40761897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8180258 - 8180151
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaac-atc 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  8180258 gatattcattcattcaaattgatagagtacattcatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacaatc 8180159  T
Q  276 catgttaa 283  Q
    ||||||||    
T  8180158 catgttaa 8180151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22751831 - 22751683
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | || ||   || |||||   |||||||||| ||||||||| |||    
T  22751831 attcactcaagtttatagagtacatcgatacaatataaattcgttaaaaacaaacaagacgaggctgcgaacaaattcacaacatctatgttaataacat 22751732  T
Q  290 aaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22751731 aaaacggtaaagtacaaaagcctacacatatgactatattcaattctcc 22751683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26161409 - 26161301
Alignment:
Q  185 tattcattcattcaaattaatagagtacatcgatata-----atgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatg 279  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |     || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  26161409 tatttattcattcaaattgatagagtatatcgataaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatg 26161310  T
Q  280 ttaatagca 288  Q
    |||||||||    
T  26161309 ttaatagca 26161301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 478
Target Start/End: Original strand, 10250348 - 10250467
Alignment:
Q  359 gatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacg 458  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| |  |||| || ||| ||||||||||    
T  10250348 gatgactccaaagtcattgatttgatctgcactcgatcgaagctgttctgacaatctgaacggaacaaattcctgaacgaaataaaaaagacaaacaacg 10250447  T
Q  459 tcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
     | |||||||||||||||||    
T  10250448 ccacacaaagacgacgaaca 10250467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 476
Target Start/End: Original strand, 23177436 - 23177565
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||   || ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |   |||||||||    
T  23177436 atctgcaacgtggatgacgccaaagtgattgatttgatttataccatatcgaagctgatttggcaatttgaaccaaacaaatacctgaacaaaacaagaa 23177535  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23177536 agacagacaacgccgcacaaagacgacgaa 23177565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32643425 - 32643277
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||       |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| | |||    
T  32643425 gatattcattcattcaagttgatagagtacaccgatacaatataaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacatcttcc 32643326  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||  ||||||||| |||||||||    
T  32643325 atgttaatagcataaaacggcaagatacttatgcctacaaatatgacta 32643277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Original strand, 14733748 - 14733894
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14733748 attcattcattcaaattgatatgatacatcaatgcaatagaaattcg-taaaaacaaaaaggataaat-tgtgaacaaactcacgacatccatgttaata 14733845  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaat 334  Q
    ||||||||   |||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14733846 gcataaaatggcaaagtgcataagcctacaaatatgactatattaaaat 14733894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17230505 - 17230413
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||   ||||||||||||||||||    
T  17230505 gctaaaaacaaaaatcatgaatctgcgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatcacaacgtatttatgcctacacatatgact 17230413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 478
Target Start/End: Original strand, 24045161 - 24045264
Alignment:
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacg 474  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  24045161 ttgattgaatctgcactagatctaagttgatctgacaatctgaatcgatcaaatacatgagcaaaacaagaaatacaaacaatgccacacaaagacgacg 24045260  T
Q  475 aaca 478  Q
    ||||    
T  24045261 aaca 24045264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 32587207 - 32587317
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacat--cgatataatg-caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||| |||  |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32587207 atattcattcattcaaattgatcgagtacattacaatacaatttcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgt 32587306  T
Q  281 taatagcataa 291  Q
    ||||| |||||    
T  32587307 taatatcataa 32587317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 286
Target Start/End: Original strand, 15674027 - 15674136
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||       |||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15674027 gatattcattcattcaaattgattgagtacatcgataaaatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatcc 15674126  T
Q  277 atgttaatag 286  Q
    || |||||||    
T  15674127 atattaatag 15674136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22751666 - 22751568
Alignment:
Q  380 tggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||  | |  |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22751666 tggatctgcattggatcgaagctgatctgacaatctgaactgaacaaatagttgaacgaaacaagaaaggcaaacaacgccgcataaagacgacgaaca 22751568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37714863 - 37714769
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  37714863 aaaaataaaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgtaaataacataaaacaaaagagtatatatgcctacaaatatgactatatt 37714769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 478
Target Start/End: Original strand, 13008580 - 13008657
Alignment:
Q  401 ctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13008580 ctgatatgacaatctgaaccgaacaaatacctgaacgaaataagaaagacaaacaacgccgcacaaagacgacgaaca 13008657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 6646321 - 6646425
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  6646321 caaactcggtaaaaacaaaaatgatgaatcgacgaataaactcacaacatccatgttaatagcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgact 6646420  T
Q  325 atatt 329  Q
    |||||    
T  6646421 atatt 6646425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25531839 - 25531743
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||  |  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  25531839 ctaaaaataaaaatgatgaatttgcgaacaaaccaacaacatccatgttaatagcataaaccaacagagtatctatgcctacaaatatgactatatt 25531743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Original strand, 28664631 - 28664734
Alignment:
Q  194 attcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagc 287  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| |||| |||||||    
T  28664631 attcaaattgatagattacatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacagcattcatgctaatagc 28664730  T
Q  288 ataa 291  Q
    ||||    
T  28664731 ataa 28664734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43847430 - 43847347
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43847430 gatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaa 43847347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9137343 - 9137237
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatattta 331  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  9137343 gctaaaaacaaaaaggatgaatttacgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacttatgtctacaaatatgactaaattca 9137244  T
Q  332 aatctcc 338  Q
    | |||||    
T  9137243 agtctcc 9137237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34893367 - 34893241
Alignment:
Q  350 tgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaa 449  Q
    |||||||| || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||   | ||||||||||   ||||||||||| |    
T  34893367 tgcaacgttgaggactccaaagtcattaatttgatctgcactggatcaaagctgatctgacaaactgaatgaaacaaataccta--cgaaacaagaaaga 34893270  T
Q  450 caaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||  | | ||||||||||||||||    
T  34893269 caaacaagattgtacaaagacgacgaaca 34893241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29352580 - 29352516
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29352580 ctcacaacattcatgttaatagtataaaatagaaaagtacatatgcctacaaatatgactatatt 29352516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46881594 - 46881502
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||| | ||||||||    
T  46881594 gctaaaaacaaaaatgacgaatttgtgaacaaacttgtaacatccatgttaatagtataaaacgacatagtacatatgcctataaatatgact 46881502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20116828 - 20116769
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20116828 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 20116769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 293
Target Start/End: Original strand, 28314298 - 28314401
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcat 289  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || ||| || |||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  28314298 attcgttcaaattgatagagtacatcgttacaatacatatttactaaatataaaaaggatgaatatgcaaacaaactcacaacatccatgtgaatagaat 28314397  T
Q  290 aaaa 293  Q
    ||||    
T  28314398 aaaa 28314401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5238391 - 5238274
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||      | |||||| ||||| ||||||| || |||||  |||||| |||||    
T  5238391 gatatttattcattcaaattgacagagtacatccatacaatacaaattcaaaatcgttaaaaataaaaaggatgaatttgagaacaaactcacatcatcc 5238292  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5238291 atgttaataacataaaac 5238274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14810870 - 14810825
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14810870 gctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatcca 14810825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15257865 - 15257820
Alignment:
Q  232 gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15257865 gctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaacaaactcacaacatcca 15257820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 27704837 - 27704886
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctac 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  27704837 ctcacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctac 27704886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 31254795 - 31254843
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  31254795 gatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaattc 31254843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32312957 - 32312921
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32312957 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata 32312921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 478
Target Start/End: Original strand, 38649227 - 38649341
Alignment:
Q  362 gacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcg 461  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||| | |  |||| ||||||  ||||||||||||    
T  38649227 gactccaaagtcattgatttgatatgca-tggatcgaagctgatctaacaatctgatc-gaacaaatacttgaacgaaaaaagaaaggcaaacaacgtcg 38649324  T
Q  462 cacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||||||||| ||||    
T  38649325 cacaaagacgacaaaca 38649341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 293
Target Start/End: Original strand, 43256285 - 43256346
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43256285 tcgctagaaacaaaaatgatgaataagtaaacaaactca--acatccatgttaatagcataaaa 43256346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 48643490 - 48643526
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48643490 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata 48643526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Original strand, 7640605 - 7640664
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7640605 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 7640664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21266637 - 21266578
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21266637 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 21266578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Original strand, 35306163 - 35306198
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35306163 atattcattcattcaaattaatagagcacatcgata 35306198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Original strand, 26638349 - 26638443
Alignment:
Q  235 aaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |  |||| |||| |||||| ||||||    
T  26638349 aaaaacaaaaatgacaaatctgtgaataaactcacaacatccatgttattatcataaaacgacaaagtccttatgcatacaaatatgaatatatt 26638443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6559122 - 6559065
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||    
T  6559122 ctaaaaacgtaaatgatgaatatgtgaacaaactcatagcatccaagttaatagcata 6559065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 433521 - 433585
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  433521 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataaca 433585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 10250185 - 10250240
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaa 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||    
T  10250185 ttcattcattcaaattgatagagtatat-gatacaacgaaaattcgctaaaaacaaa 10250240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17611680 - 17611648
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17611680 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 17611648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20206243 - 20206207
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20206243 gatattcattcattcaaattgacagagtacatcgata 20206207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 24533563 - 24533611
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24533563 gatatttattcaatcaaattgatagagtacatcaatataatacaaattc 24533611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25308741 - 25308689
Alignment:
Q  242 aaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25308741 aaaatgatgaatatacgaacaaactcacaaaattcatgttaatagcataaaac 25308689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26492612 - 26492548
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  26492612 cgctaaaaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataaca 26492548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 28407723 - 28407755
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28407723 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 28407755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31724967 - 31724907
Alignment:
Q  272 catccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  31724967 catccatgttaataacataaaacgacagagtaaatatgcctacaaatatgattatatttaa 31724907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32312916 - 32312848
Alignment:
Q  270 aacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| | |||| || ||||||||||||| || |||||    
T  32312916 aacattcatgttaatagcataaaacgacaaactacataagcctccaaatatgactatattcaagtctcc 32312848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 33095800 - 33095848
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc 231  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  33095800 gatattcattcattcaaatcgataaaatacatcgatataattcaaattc 33095848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35261586 - 35261554
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35261586 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 35261554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 35667062 - 35667126
Alignment:
Q  231 cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  35667062 cgctaaaaacgtaaatgatgaatttgtgaacaaactcacgacatccaagttaatatcatataaca 35667126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38277254 - 38277218
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38277254 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgata 38277218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Original strand, 41553241 - 41553273
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41553241 gatattcattcattcaaattaatagaatacatc 41553273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0722 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0722
Description:

Target: scaffold0722; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 5204 - 5510
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccat-gtt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5204 gatattcattcattcaaatttatagagtacatcgatataatacaaatttgctaaaaacaaaaagg-tgaatctgtgaacaggctcacaacatccattgtt 5302  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaa 370  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5303 aatagcataaaacggcaaggtacaagtgcctacacatatgactatatttaaatctccggaatagccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaa 5402  T
Q  371 gtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5403 gtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatatgacaatatgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaagacaaacaacgtcgcacaaagac 5502  T
Q  471 gacgaaca 478  Q
    ||||||||    
T  5503 gacgaaca 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 198 - 478
Target Start/End: Original strand, 11896 - 12187
Alignment:
Q  198 aaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacacc 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  11896 aaattgatagagtacatcgatgtaatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacatgctcacatcatccatgttaatagcataaaatgac 11995  T
Q  298 aaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatct 386  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||          || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11996 aaagtacaaatgcctacgcatgtgactatatttaaatctccggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatct 12095  T
Q  387 gcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096 gcactaaatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 12187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 36960 - 36659
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36960 gatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaatttgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 36861  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |           || |||||||||||||||||||||||||    
T  36860 atagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgactatatttaaatctccagaataaccctgtatccggatctgcaacgtggatgacgccaaag 36761  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||     |||||||||||||||||    
T  36760 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaactgatcaaatacctgagagaaacaaaaaaaa-----aacgtcgcacaaagacg 36666  T
Q  472 acgaaca 478  Q
    |||||||    
T  36665 acgaaca 36659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 245065 - 244766
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  245065 gatattcattcattcaaattgatatagtacaacgatataatgcaaattcattaaaaacaaataggac-----tgtgaacaggctcacaacatccatgtta 244971  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtggatgacgccaaag 371  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||   |||||||||| |  |           ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  244970 atagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatcgctaa--ttaaatctccggaataatcatatctccgaatctacaacgtggatgacgccaaag 244873  T
Q  372 tcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244872 tcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccggtcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacg 244773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11434 - 11144
Alignment:
Q  196 tcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaaca 295  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  11434 tcaaattgatagagtacatctatataatgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaat-tgtgaatagactcacagcatccatattaatagcataaaacg 11336  T
Q  296 ccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggat 384  Q
     |||||||||| ||||||| |||  ||||||| | |||||||           || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11335 gcaaagtacaattgcctacgcat--gactatactcaaatctctggaataaccatgtctccggatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcattgattggat 11238  T
Q  385 ctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11237 atgcactagatccaagctgatttgacaatctaaatcgatcaaatacctgagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcataaagacggcgaaca 11144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 270 - 478
Target Start/End: Original strand, 9423 - 9642
Alignment:
Q  270 aacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggct-----------cgaatctgcaacgtg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |           || ||||||||||||    
T  9423 aacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatcttcggaataaccatgtttccggatctgcaacgtg 9522  T
Q  359 gatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacg 458  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9523 gatgacgccaaagtcattgattgaatctgcactggatcgaagctgatatgataatctaaagtgattaaatacctaagagaaacaaggaaaacaaaaaacg 9622  T
Q  459 tcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  9623 tcgcacaaagaagacgaaca 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Original strand, 1600 - 1690
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacat 274  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1600 atattcattcattcaaattgaaagagtacattgatataatgcaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaggctcacaacat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 248
Target Start/End: Original strand, 48029 - 48094
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatga 248  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48029 gatatttattctttcaaattgatatagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatga 48094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 980 - 1111
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  980 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcattgattggatctgcactggatcgaagctgatctgacaatctgaaccgatcaaatacctgagagaaacaagaa 1079  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1080 aaacaaacaatttcgcaaaaagacaacgaaca 1111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 413
Target Start/End: Original strand, 136754 - 136993
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  136754 atattcattcattcaaattgatagtgtacattgatataatgaaaattcgttaaaaacaaaaa-gataaatttgtgaacacactcacaacatccatgttaa 136852  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |||||||||||| ||| ||||  | || ||| ||||||||||||||||| |||||          || ||| | ||||||||||| || ||| |||||||    
T  136853 tagcataaaacagcaaggtactgaagcttacgcatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctggatctgcaacgttgacgactccaaagt 136952  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaat 413  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  136953 cgttgatttgatctgcacttgatcgaagttgatctgacaat 136993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 478
Target Start/End: Original strand, 137002 - 137042
Alignment:
Q  438 aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  137002 aaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgatgaaca 137042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 478
Target Start/End: Original strand, 10007 - 10295
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||| ||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  10007 gatattctttcattcaaattagtagagtaactcaatacaatacaaaatcgataaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgtta 10106  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcctggctcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattgg 382  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||      ||| | |||||| | || || | |||| || ||||||||    
T  10107 atagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgactatcttcaagtctc------cgagt-tgcaacatcgacgatgacaaaatcattgattgg 10199  T
Q  383 atctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    |||| || |||||  ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||   ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10200 atctccattggatcaaagctaatctgacaatttgatccaaacaaatacctagacgaaacaagaaagacaaacaacaatgcacaaagacgacgaaca 10295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 473
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11757
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  11455 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgaaaattcgttaaaataaaaaaggatgaatctgttaacaaactcacaacatccatgttag 11554  T
Q  284 tagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----------tggctc-gaatctgcaacgtggatgacgccaaagt 372  Q
    |  |||||||    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||          ||  || | ||||||||||| || ||| ||||| |    
T  11555 tgacataaaatggtaaagtattaaagcctacacatatgactatatttaagtctccagaatacccatgtttctggatctgcaacgttgacgactccaaaat 11654  T
Q  373 cgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacct--aagagaaacaagaaaaacaaacaacgtcgcacaaagac 470  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  || ||||||| |  | || ||| || ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  11655 cattgatttgatctgcactggatcgaagctgatttgacaatctgaattgaacaaatacatgaacgaaaaaaaaaaaagacaaataacgtcgcacaaagtc 11754  T
Q  471 gac 473  Q
    |||    
T  11755 gac 11757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Original strand, 25193 - 25436
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaata 285  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |  ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  25193 attcatttattcaaattgatagaatacatcgctgcaatacagatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacatccatgttaata 25292  T
Q  286 gcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc----tggc-------tcgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcg 374  Q
    ||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    | ||       ||| ||||||||||| |||||||||||| ||     
T  25293 gcataaaatggcaaagtacataggcctacaaatatgactatattaaaatctccggaatagccatgccttcggatctgcaacgttgatgacgccaaaatca 25392  T
Q  375 ttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaa 418  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  25393 ttggttggatctgcattggatcaaagctaatctgacaatctgaa 25436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 3731 - 3879
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  3731 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcggtaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcc 3830  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3831 atgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgacta 3879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 275
Target Start/End: Original strand, 5910 - 5960
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  5910 caaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 5960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 12914 - 13057
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgc-aaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtt 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |    
T  12914 gatattcattaattcaaattaatagagtacaacgatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgat 13013  T
Q  282 aatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  13014 aatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 105479 - 105321
Alignment:
Q  186 attcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca------tg 279  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||      |     
T  105479 attcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaatacaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatccaggtttttt 105380  T
Q  280 ttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  105379 ttaatagcataaaacaacaaagtatataagcctacaaatatgactatattaaaatctcc 105321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35532 - 35371
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |      |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  35532 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacaacatcc 35433  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatttaaatctcc 338  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
T  35432 atgttaatagcataaaacagtaaagtacatatgcctataaatatgacaatattcaagtctcc 35371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2254
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| |  ||||||||||    
T  2112 gatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagtatccatgtta 2211  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||| ||||  |||||||   ||||||||| |||||||||    
T  2212 atagcattaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgacta 2254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Original strand, 6793 - 6942
Alignment:
Q  183 gatattcattcatt-caaattaatagagtacatcgatataatgcaaa------ttcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatc 275  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  6793 gatattcattcatttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 6892  T
Q  276 catgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6893 catgttaatagcataaaatggtaaagtacatatgcctacaaatatgacta 6942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 74621 - 74473
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaat------tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  74621 gatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagtcacaacatcc 74522  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||    
T  74521 atgttaatagcataaaacggcaaagtacctgtgcctacaaatatgacta 74473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 321
Target Start/End: Original strand, 93998 - 94129
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  93998 gatattaattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatgcaaattcgttaaaag-------gataaatttgtgaacagactcacaacatccatgtta 94090  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatg 321  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  94091 ataacataaaatgacaaagtacaaatgcctgcacatatg 94129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 994 - 1125
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |  || |||||||    
T  994 atctgcaacatggacgacgctaatgtcattgattggatctgcactagatcgaagttgatctgacaatttgaaccaaacaaatacctgaacgatacaagaa 1093  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  1094 agacaatcaacttcgcacaaatacgacgaaca 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 262
Target Start/End: Original strand, 856 - 935
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  856 gatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatacaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaaca 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3352 - 3235
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt------cgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||      ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| |||||    
T  3352 gatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacatcatcc 3253  T
Q  277 atgttaatagcataaaac 294  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3252 atgttaatagcataaaac 3235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6593 - 6445
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcg------ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| || |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  6593 gatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaactcacaacatcc 6494  T
Q  277 atgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 325  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6493 atgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgacta 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 403912 - 404020
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  403912 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatcc 404011  T
Q  277 atgttaata 285  Q
    |||||||||    
T  404012 atgttaata 404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0580
Description:

Target: scaffold0580; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Original strand, 470 - 613
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| | | || ||||||| |||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  470 atattcattcatttaaatttatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 569  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||| |||||||    | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  570 atatcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgactat 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 326
Target Start/End: Original strand, 8209 - 8352
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgtta 282  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| | | || ||||||| |||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  8209 atattcattcatttaaatttatagggtatatcgatataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgtta 8308  T
Q  283 atagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactat 326  Q
    ||| |||||||    | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8309 atatcataaaatggtagagtacatatgcctacaaatatgactat 8352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0999 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0999
Description:

Target: scaffold0999; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2098 - 1996
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgact 324  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2098 caaattcgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgtcaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatacgact 1999  T
Q  325 ata 327  Q
    |||    
T  1998 ata 1996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0999; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1965 - 1921
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcact 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1965 atctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgatcggatctgcact 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1350 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1984 - 1916
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1984 caaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaa 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 478
Target Start/End: Original strand, 6640 - 6769
Alignment:
Q  347 atctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaatacctaagagaaacaagaa 446  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | || | ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  6640 atctgcaatgtggatgacgccgaagttgttgattggattttcagttgatcgaagttgatctgacaatctaaaccgatcaaatgcctgaacgaaacaagaa 6739  T
Q  447 aaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaaca 478  Q
    | ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  6740 agacaaataacgccgcac--agacgacgaaca 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21046 - 20907
Alignment:
Q  187 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||      |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||  |||||| |||||||||    
T  21046 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatccaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctttaaacaaactcacatcatccatgt 20947  T
Q  281 taatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||    
T  20946 taatagcataaaacgacaaagtacatatccctacaaatat 20907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1294 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1294
Description:

Target: scaffold1294; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1065
Alignment:
Q  204 atagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagta 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||| |||| ||||||| |   ||||  |||||   ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  1190 atagagtacatcgatataatctaaatttgtcaaaaaccaaaaagatgaatctaccaacaaactcacggtatctatgttaatagcataaaacgacaaagta 1091  T
Q  304 caaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  1090 caaaagcctacacatatgactatatt 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 476
Target Start/End: Original strand, 91254 - 91385
Alignment:
Q  344 cgaatctgcaacgtggatgacgccaaagtcgttgattggatctgcactggattgaagctgatctgacaatttgaaccgatcaaata-cctaagagaaaca 442  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| | ||| |    
T  91254 cgaatctgcaacgtggacaacgccaaagtcat-gatttgatctacactggatcaaaactgatttgacaatttgaaccgaacaaatatcataaca-aaaaa 91351  T
Q  443 agaaaaacaaacaacgtcgcacaaagacgacgaa 476  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  91352 agaaagacatacaacgtcgtacaaagacgacgaa 91385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Original strand, 91101 - 91162
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaa 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  91101 atatttattcattcaaattgatagagtacattaatacaatgcaaattcactaaaaacaaaaa 91162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 91164 - 91228
Alignment:
Q  265 ctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactatatt 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  91164 ctcacaacattcatgttaatagcattgaacgacaaagtacaaaagcctacatatatgaccatatt 91228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 404481 - 404535
Alignment:
Q  239 acaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  404481 acaaaaatgatgaatatgtgaacaaactgacaacatccatgttaataacataaaa 404535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 22310 - 22350
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22310 gatattcattcattcaaattaataaagtacatcgatataat 22350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1379
Description:

Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 789 - 897
Alignment:
Q  225 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatcca----tgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatat 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||| ||    |||||||| ||||||||  |||| |||  ||| ||||| ||||    
T  789 caaattcgctaaaaacaagaatgatgaaactgtgaacaaactcacaacatgcatctgtgttaataacataaaacggcaaaatacttatgtctacaaatat 888  T
Q  321 gactatatt 329  Q
    |||||||||    
T  889 gactatatt 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Original strand, 3476 - 3570
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| || | ||| |||||||    
T  3476 ctaaaaacaaaaagaatgaatatgaaaacaaattcacaacatccatgttaatatcataaaacaacaaaatacacatgcttataaatacgactata 3570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36057 - 35963
Alignment:
Q  233 ctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgactata 327  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| || | ||| |||||||    
T  36057 ctaaaaacaaaaagaatgaatatgcaaacaaattcacaacatccatgttaataacataaaacaacaaaatacatatgcttataaatacgactata 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 290
Target Start/End: Original strand, 83265 - 83325
Alignment:
Q  230 tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcata 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  83265 tcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 83325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10377 - 10307
Alignment:
Q  190 attcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10377 attcattcaaattgatagagtatattaatataatataaattcgttataaacaaaaaggatgaatttgtgaa 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30330 - 30284
Alignment:
Q  184 atattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgcaaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30330 atattcattcattcaaattgataaaatacatcgatataatacaaatt 30284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8011 - 7979
Alignment:
Q  183 gatattcattcattcaaattaatagagtacatc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8011 gatattcattcattcaaattgatagagtacatc 7979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University