View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6864A_low_7 (Length: 525)

Name: NF6864A_low_7
Description: NF6864A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6864A_low_7
NF6864A_low_7
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (14-525)||(2581-3092)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (14-525)||(20340258-20340769)
chr1 (58-525)||(16207954-16208418)
chr1 (23-525)||(20460935-20461413)
chr1 (176-525)||(28151845-28152194)
chr1 (65-525)||(41793231-41793694)
chr1 (65-525)||(10962539-10963002)
chr1 (176-525)||(51638201-51638550)
chr1 (20-525)||(28584805-28585313)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (23-522)||(16041155-16041654)
chr7 (14-520)||(31088278-31088784)
chr7 (23-522)||(16449810-16450309)
chr7 (14-520)||(45733283-45733789)
chr7 (176-525)||(26484679-26485028)
chr7 (176-522)||(2108817-2109163)
chr7 (176-525)||(39210832-39211181)
chr7 (176-525)||(2775344-2775693)
chr7 (38-525)||(16518225-16518715)
chr7 (38-525)||(16503189-16503679)
chr7 (65-525)||(10916677-10917137)
chr7 (20-525)||(5127818-5128326)
chr7 (65-525)||(11424585-11425048)
chr7 (326-525)||(26682809-26683008)
chr7 (326-525)||(4200682-4200881)
chr7 (65-525)||(2154444-2154907)
chr7 (176-499)||(18540784-18541107)
chr7 (62-525)||(5147149-5147615)
chr7 (62-525)||(26435125-26435591)
chr7 (20-499)||(5159348-5159827)
chr7 (65-525)||(4144932-4145395)
chr7 (65-525)||(26274903-26275366)
chr7 (65-525)||(16736269-16736732)
chr7 (65-525)||(16751323-16751786)
chr7 (65-525)||(17529349-17529812)
chr7 (65-525)||(17523403-17523866)
chr7 (65-525)||(26319678-26320141)
chr7 (200-525)||(3445315-3445640)
chr7 (65-525)||(45387214-45387677)
chr7 (65-525)||(26669723-26670186)
chr7 (198-525)||(31564199-31564526)
chr7 (176-525)||(9618636-9618985)
chr7 (65-525)||(24592350-24592813)
chr7 (209-525)||(11441590-11441906)
chr7 (62-525)||(26537679-26538148)
chr7 (176-525)||(31124905-31125254)
chr7 (65-141)||(11441431-11441507)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (23-522)||(22888310-22888809)
chr5 (14-520)||(13184473-13184979)
chr5 (38-525)||(25198884-25199371)
chr5 (14-525)||(33877078-33877589)
chr5 (14-520)||(13440319-13440825)
chr5 (14-520)||(11325625-11326131)
chr5 (38-525)||(23892058-23892548)
chr5 (164-525)||(29888902-29889263)
chr5 (38-525)||(24969876-24970360)
chr5 (38-525)||(24687977-24688467)
chr5 (65-525)||(30934515-30934975)
chr5 (20-525)||(33777321-33777829)
chr5 (65-525)||(23752270-23752733)
chr5 (65-525)||(23717808-23718271)
chr5 (68-525)||(11549236-11549696)
chr5 (65-525)||(22998934-22999397)
chr5 (65-525)||(9548363-9548826)
chr5 (20-499)||(33292362-33292841)
chr5 (65-525)||(15658580-15659043)
chr5 (65-525)||(32599292-32599752)
chr5 (65-525)||(8665295-8665758)
chr5 (19-525)||(18375232-18375741)
chr5 (65-525)||(12132034-12132497)
chr5 (65-525)||(34616400-34616860)
chr5 (198-525)||(37671303-37671630)
chr5 (65-525)||(15758677-15759140)
chr5 (198-525)||(28649250-28649577)
chr5 (19-525)||(30168302-30168811)
chr5 (19-525)||(33516189-33516698)
chr5 (176-525)||(9317444-9317793)
chr5 (176-525)||(30152011-30152360)
chr5 (209-525)||(31431466-31431782)
chr5 (66-499)||(41674589-41675025)
chr5 (176-525)||(2511044-2511393)
chr5 (176-525)||(26480385-26480734)
chr5 (200-525)||(31826227-31826552)
chr5 (65-525)||(6874181-6874647)
chr5 (176-525)||(37358463-37358812)
chr5 (198-522)||(18500553-18500877)
chr5 (65-525)||(43078128-43078594)
chr5 (65-525)||(29966886-29967349)
chr5 (176-525)||(5637903-5638252)
chr5 (176-525)||(30029408-30029757)
chr5 (198-525)||(13324649-13324976)
chr5 (198-525)||(37770807-37771134)
chr5 (198-525)||(3789556-3789883)
chr5 (198-525)||(37754995-37755322)
chr5 (200-525)||(24681457-24681782)
chr5 (200-525)||(24723984-24724309)
chr5 (200-525)||(40473369-40473694)
chr5 (176-525)||(28959606-28959955)
chr5 (65-141)||(31431307-31431383)
chr5 (62-141)||(3789402-3789481)
chr5 (65-141)||(18500955-18501031)
chr5 (65-141)||(28649105-28649181)
chr5 (65-141)||(37358862-37358938)
chr5 (65-141)||(37671699-37671775)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (23-525)||(16626470-16626972)
chr3 (23-523)||(18530186-18530680)
chr3 (14-520)||(17993753-17994259)
chr3 (14-520)||(4625727-4626233)
chr3 (14-521)||(5652170-5652677)
chr3 (176-525)||(32292697-32293046)
chr3 (176-525)||(31034081-31034430)
chr3 (14-520)||(5713007-5713516)
chr3 (14-520)||(5723917-5724426)
chr3 (14-520)||(5757051-5757560)
chr3 (14-520)||(5767942-5768451)
chr3 (20-525)||(15892670-15893178)
chr3 (20-525)||(8301231-8301736)
chr3 (38-525)||(8295779-8296266)
chr3 (20-525)||(22387542-22388047)
chr3 (38-525)||(18051066-18051556)
chr3 (65-525)||(4796617-4797080)
chr3 (20-525)||(18330460-18330963)
chr3 (65-525)||(29148719-29149182)
chr3 (20-525)||(35880552-35881060)
chr3 (20-525)||(6192102-6192610)
chr3 (65-525)||(15741058-15741509)
chr3 (20-522)||(4721417-4721922)
chr3 (65-525)||(7073043-7073506)
chr3 (68-525)||(10395970-10396427)
chr3 (62-525)||(18277016-18277482)
chr3 (62-525)||(18292317-18292783)
chr3 (62-525)||(18307618-18308084)
chr3 (21-499)||(32438944-32439422)
chr3 (20-525)||(8211527-8212032)
chr3 (65-525)||(28115918-28116384)
chr3 (65-525)||(5466816-5467279)
chr3 (65-525)||(4346651-4347111)
chr3 (65-525)||(28021109-28021569)
chr3 (19-525)||(17984920-17985429)
chr3 (65-499)||(20065877-20066311)
chr3 (176-525)||(4416864-4417213)
chr3 (20-396)||(4892999-4893375)
chr3 (20-525)||(21674479-21674987)
chr3 (200-525)||(11110313-11110638)
chr3 (65-525)||(31964437-31964900)
chr3 (65-525)||(50134035-50134498)
chr3 (65-525)||(5609286-5609749)
chr3 (200-525)||(36997041-36997366)
chr3 (65-525)||(47023284-47023747)
chr3 (198-525)||(6542426-6542753)
chr3 (65-525)||(7996393-7996856)
chr3 (65-525)||(10642901-10643364)
chr3 (176-525)||(28339247-28339596)
chr3 (200-525)||(48465896-48466221)
chr3 (200-525)||(29664934-29665259)
chr3 (20-525)||(5596321-5596838)
chr3 (20-525)||(18224977-18225485)
chr3 (176-525)||(20576811-20577160)
chr3 (260-525)||(51782052-51782317)
chr3 (197-525)||(22870820-22871148)
chr3 (197-525)||(22885879-22886207)
chr3 (65-525)||(5013543-5014006)
chr3 (260-525)||(51797141-51797407)
chr3 (176-525)||(18242684-18243033)
chr3 (176-525)||(24328104-24328453)
chr3 (62-141)||(29665336-29665415)
chr3 (65-141)||(11110712-11110788)
chr3 (65-141)||(6542825-6542901)
chr3 (65-141)||(36997440-36997516)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (23-525)||(15284851-15285353)
chr4 (23-525)||(15227716-15228218)
chr4 (23-522)||(1900103-1900602)
chr4 (14-520)||(24460533-24461039)
chr4 (23-525)||(14235448-14235953)
chr4 (19-495)||(15391291-15391764)
chr4 (47-525)||(17013867-17014348)
chr4 (20-525)||(24592237-24592742)
chr4 (20-525)||(14664858-14665366)
chr4 (20-499)||(34188909-34189388)
chr4 (62-525)||(36344438-36344901)
chr4 (65-525)||(6569738-6570201)
chr4 (62-525)||(14763227-14763693)
chr4 (21-499)||(24112506-24112984)
chr4 (65-525)||(5005755-5006221)
chr4 (20-525)||(31126441-31126949)
chr4 (20-525)||(14098381-14098889)
chr4 (65-525)||(27163240-27163703)
chr4 (20-525)||(54833230-54833735)
chr4 (198-525)||(18800536-18800863)
chr4 (176-525)||(40105561-40105910)
chr4 (65-525)||(21969586-21970049)
chr4 (200-525)||(33673721-33674046)
chr4 (200-525)||(30753777-30754102)
chr4 (200-525)||(39850661-39850986)
chr4 (20-121)||(19373101-19373202)
chr4 (65-141)||(18800932-18801008)
chr4 (65-141)||(30753627-30753703)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (23-525)||(19456333-19456835)
chr2 (23-522)||(21703079-21703578)
chr2 (14-521)||(27118506-27119013)
chr2 (14-525)||(34303215-34303726)
chr2 (14-520)||(3784472-3784978)
chr2 (14-520)||(34156829-34157334)
chr2 (14-520)||(16163417-16163923)
chr2 (15-520)||(31891245-31891750)
chr2 (19-525)||(27392813-27393298)
chr2 (38-525)||(27434356-27434846)
chr2 (38-525)||(23128478-23128968)
chr2 (65-525)||(28882080-28882543)
chr2 (38-525)||(12655381-12655871)
chr2 (47-525)||(20837766-20838247)
chr2 (65-525)||(22925940-22926403)
chr2 (200-525)||(40233515-40233840)
chr2 (65-525)||(13936456-13936919)
chr2 (65-525)||(21677094-21677557)
chr2 (200-517)||(9349902-9350219)
chr2 (68-495)||(34286223-34286653)
chr2 (68-495)||(34291283-34291713)
chr2 (65-525)||(11635098-11635564)
chr2 (65-525)||(11641287-11641753)
chr2 (65-525)||(37925359-37925822)
chr2 (62-525)||(37375024-37375490)
chr2 (65-411)||(34279315-34279664)
chr2 (65-525)||(16829250-16829713)
chr2 (65-525)||(16891768-16892231)
chr2 (65-525)||(32049664-32050127)
chr2 (65-525)||(31876147-31876610)
chr2 (65-525)||(37685821-37686284)
chr2 (65-525)||(37701086-37701549)
chr2 (176-522)||(34861660-34862006)
chr2 (260-525)||(12586874-12587139)
chr2 (176-525)||(12716514-12716863)
chr2 (200-525)||(27777226-27777551)
chr2 (200-525)||(27816984-27817309)
chr2 (209-525)||(260665-260981)
chr2 (176-525)||(27803687-27804036)
chr2 (200-525)||(39051734-39052059)
chr2 (176-525)||(39890054-39890403)
chr2 (65-525)||(19416411-19416874)
chr2 (65-196)||(261009-261140)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (14-520)||(33374127-33374633)
chr6 (14-525)||(13521939-13522450)
chr6 (15-520)||(28162477-28162982)
chr6 (14-520)||(8892182-8892687)
chr6 (14-520)||(8903417-8903922)
chr6 (152-525)||(22456800-22457176)
chr6 (23-423)||(22477241-22477644)
chr6 (176-525)||(14143151-14143500)
chr6 (176-525)||(26787925-26788274)
chr6 (176-525)||(27196298-27196647)
chr6 (176-525)||(27252593-27252942)
chr6 (164-525)||(27290236-27290597)
chr6 (62-525)||(20160568-20161031)
chr6 (62-525)||(22171800-22172263)
chr6 (38-525)||(22934746-22935233)
chr6 (38-525)||(23857191-23857678)
chr6 (20-525)||(24304484-24304992)
chr6 (38-525)||(13298817-13299307)
chr6 (65-525)||(16749721-16750184)
chr6 (65-525)||(26988868-26989331)
chr6 (20-525)||(26918202-26918710)
chr6 (38-525)||(15424183-15424673)
chr6 (65-516)||(26999940-27000394)
chr6 (20-525)||(29549300-29549805)
chr6 (38-525)||(24863557-24864047)
chr6 (101-525)||(27272446-27272876)
chr6 (65-525)||(4525156-4525616)
chr6 (65-525)||(27044257-27044718)
chr6 (176-525)||(29572994-29573343)
chr6 (19-525)||(30557882-30558391)
chr6 (198-525)||(4773009-4773336)
chr6 (198-525)||(4757767-4758094)
chr6 (200-525)||(16674144-16674469)
chr6 (209-525)||(4545641-4545957)
chr6 (198-525)||(27007730-27008057)
chr6 (200-525)||(3696086-3696411)
chr6 (176-525)||(27359858-27360207)
chr6 (176-525)||(27450201-27450550)
chr6 (209-525)||(4724000-4724316)
chr6 (209-525)||(28207468-28207784)
chr6 (20-525)||(29501228-29501745)
chr6 (176-525)||(26777481-26777830)
chr6 (200-525)||(34463212-34463537)
chr6 (198-525)||(17025280-17025607)
chr6 (65-525)||(16943893-16944356)
chr6 (198-525)||(26116276-26116603)
chr6 (176-525)||(27485110-27485459)
chr6 (404-525)||(17092306-17092427)
chr6 (65-196)||(27629907-27630038)
chr6 (65-141)||(3695930-3696006)
chr6 (65-141)||(4546037-4546113)
chr6 (65-141)||(4724396-4724472)
chr6 (65-141)||(17025129-17025205)
chr6 (65-141)||(26777880-26777956)
chr6 (65-141)||(27007579-27007655)
chr6 (65-141)||(28207309-28207385)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (14-521)||(19658926-19659432)
chr8 (14-520)||(44562923-44563427)
chr8 (14-525)||(9354444-9354956)
chr8 (19-495)||(22080790-22081263)
chr8 (176-521)||(33244649-33244994)
chr8 (38-524)||(16283292-16283781)
chr8 (65-525)||(27608787-27609250)
chr8 (20-525)||(18710411-18710919)
chr8 (38-525)||(16277397-16277887)
chr8 (20-525)||(19687923-19688431)
chr8 (38-525)||(2137141-2137631)
chr8 (65-525)||(14557497-14557957)
chr8 (65-525)||(31354394-31354857)
chr8 (20-525)||(31489632-31490140)
chr8 (65-525)||(19674308-19674774)
chr8 (20-525)||(19286290-19286795)
chr8 (65-525)||(19208242-19208705)
chr8 (65-525)||(28361837-28362300)
chr8 (198-525)||(3329389-3329716)
chr8 (198-525)||(12092606-12092933)
chr8 (198-525)||(29829328-29829655)
chr8 (176-525)||(33258707-33259056)
chr8 (354-525)||(189256-189427)
chr8 (65-141)||(3329788-3329864)
chr8 (65-141)||(19518412-19518488)
chr8 (65-141)||(29829183-29829259)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (23-522)||(20240-20717)
scaffold0124 (38-525)||(30296-30785)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (164-475)||(1-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (19-495)||(21391-21864)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (262-522)||(1844-2103)
scaffold0415 (260-522)||(6080-6344)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (46-525)||(29614-30096)
scaffold0089 (46-525)||(39992-40474)
scaffold0089 (65-525)||(46908-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (38-525)||(27135-27625)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (20-525)||(52-561)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (338-525)||(541-728)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (168-525)||(9542-9899)
scaffold0336 (65-175)||(8102-8212)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (19-525)||(14853-15362)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (65-525)||(7162-7625)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (65-525)||(8989-9452)
scaffold0159 (176-525)||(19999-20348)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (176-525)||(26124-26474)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (209-525)||(7966-8282)
scaffold0038 (65-141)||(7807-7883)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (278-486)||(46764-46981)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3092 - 2581
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3092 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 2993  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2992 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 2893  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    || |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  2892 tccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcct 2793  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  2792 aggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcatta 2693  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2692 accaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 2593  T
Q  514 tcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||    
T  2592 tcccagacttga 2581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20340769 - 20340258
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20340769 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 20340670  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20340669 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 20340570  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    || |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  20340569 tccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcct 20340470  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20340469 aggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcatta 20340370  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340369 accaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 20340270  T
Q  514 tcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||    
T  20340269 tcccagacttga 20340258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16208418 - 16207954
Alignment:
Q  58 gcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatg 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16208418 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatg 16208319  T
Q  158 caacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16208318 caacaacagccaccagttcaacaacaaca---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttc 16208222  T
Q  258 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208221 tcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctct 16208122  T
Q  358 gggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  16208121 gggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctc 16208022  T
Q  458 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16208021 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttga 16207954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Original strand, 20460935 - 20461413
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20460935 aatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaac 20461034  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||                     |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20461035 ctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatg---------------------caacaacagca---acaagctagacctacctttcctccgatact 20461110  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20461111 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 20461210  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20461211 tctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 20461310  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20461311 aattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagact 20461410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28152194
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 28151944  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28151945 tcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 28152044  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28152045 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 28152144  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28152145 cacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttga 28152194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41793694 - 41793231
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||  || ||| ||||||    
T  41793694 tctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaac 41793595  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  41793594 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 41793495  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  41793494 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 41793395  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  41793394 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 41793295  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  41793294 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 41793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 10962539 - 10963002
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  10962539 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 10962638  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | || |  ||    
T  10962639 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagag 10962738  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  10962739 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggt 10962838  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  10962839 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 10962938  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| ||||||||    
T  10962939 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttga 10963002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 51638201 - 51638550
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  51638201 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 51638300  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  51638301 ctaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 51638400  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51638401 gtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaat 51638500  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51638501 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51638550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 28584805 - 28585313
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  |||||||||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| |    
T  28584805 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 28584904  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    | ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || ||||     
T  28584905 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctcc 28585004  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  28585005 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 28585104  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  28585105 ttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatc 28585204  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||    
T  28585205 aagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 28585304  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  28585305 gagacttga 28585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 16041155 - 16041654
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16041155 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaac 16041254  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16041255 ctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 16041354  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16041355 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 16041454  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  16041455 tctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaa 16041554  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16041555 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagact 16041654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31088784 - 31088278
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31088784 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 31088685  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31088684 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 31088585  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  31088584 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 31088485  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  31088484 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 31088385  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31088384 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 31088285  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  31088284 tcccaga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16450309 - 16449810
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16450309 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 16450210  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16450209 ctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16450110  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |    
T  16450109 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgt 16450010  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||    
T  16450009 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaa 16449910  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449909 agttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 45733283 - 45733789
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45733283 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 45733382  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45733383 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 45733482  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  45733483 tctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 45733582  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  45733583 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 45733682  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45733683 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 45733782  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  45733783 tcccaga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26485028
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 26484778  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26484779 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 26484878  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26484879 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 26484978  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26484979 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26485028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2108817
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2109064  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2109063 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 2108964  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2108963 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 2108864  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108863 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39210832
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 39211082  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39211081 tcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaagg 39210982  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39210981 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 39210882  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39210881 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 39210832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 2775344 - 2775693
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775344 caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 2775443  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2775444 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 2775543  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2775544 atgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 2775643  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2775644 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 2775693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16518715 - 16518225
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16518715 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16518616  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  | | ||| || ||| |||||||||  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  16518615 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 16518516  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  16518515 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 16518416  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||    
T  16518415 tgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttg 16518316  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16518315 agaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16503679 - 16503189
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16503679 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16503580  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  | | ||| || ||| |||||||||  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  16503579 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 16503480  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  16503479 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 16503380  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  16503379 tgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 16503280  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16503279 agaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16503189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10916677
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 10917038  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||    
T  10917037 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 10916938  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  10916937 gcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcat 10916838  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  10916837 gatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatc 10916738  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10916737 ctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 10916677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 5127818 - 5128326
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  5127818 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtc 5127917  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||     
T  5127918 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcc 5128017  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5128018 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaagg 5128117  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  5128118 ttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 5128217  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  5128218 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 5128317  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  5128318 tagacttga 5128326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11425048 - 11424585
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  11425048 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 11424949  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  11424948 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 11424849  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  11424848 agggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 11424749  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  11424748 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 11424649  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  11424648 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 11424585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 326 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682809
Alignment:
Q  326 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  426 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 326 - 525
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200881
Alignment:
Q  326 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  426 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 2154444 - 2154907
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  | | ||| || ||  ||||||    
T  2154444 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaac 2154543  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   |  |||||||   |||||||  |||| |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  2154544 agttgctggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 2154643  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||    
T  2154644 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggt 2154743  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  2154744 catgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 2154843  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  2154844 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 2154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 499
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18541107
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 18540883  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||    
T  18540884 tcagacaggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggg 18540983  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || |||    
T  18540984 gtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaat 18541083  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    || ||||| ||||| |||||||||    
T  18541084 catgctgccgtgaatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5147615 - 5147149
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| |||    
T  5147615 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 5147516  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    |||||   ||  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  5147515 aacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5147416  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  5147415 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 5147316  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||    
T  5147315 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 5147216  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  5147215 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 5147149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435591
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| |||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 26435224  T
Q  162 aacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    |||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |     
T  26435225 aacagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactcca 26435324  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  26435325 gagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 26435424  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||    
T  26435425 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 26435524  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26435525 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26435591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 499
Target Start/End: Original strand, 5159348 - 5159827
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  5159348 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 5159447  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  5159448 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 5159547  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||    
T  5159548 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttc 5159647  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
    |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| | || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||    
T  5159648 cgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaag 5159747  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    | || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  5159748 ggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4145395 - 4144932
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  4145395 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 4145296  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    | |  || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  4145295 aactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 4145196  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  4145195 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 4145096  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  4145095 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 4144996  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  4144995 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 4144932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26275366 - 26274903
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  26275366 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 26275267  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  26275266 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 26275167  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  26275166 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 26275067  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26275066 catgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26274967  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  26274966 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 26274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16736732 - 16736269
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  16736732 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16736633  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  16736632 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 16736533  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  16736532 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 16736433  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  16736432 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 16736333  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  16736332 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 16736269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16751786 - 16751323
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  16751786 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16751687  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  16751686 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 16751587  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  16751586 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 16751487  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  16751486 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 16751387  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  16751386 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 16751323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17529812 - 17529349
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  17529812 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 17529713  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  17529712 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 17529613  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  17529612 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 17529513  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  17529512 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 17529413  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  17529412 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 17529349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 17523403 - 17523866
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  17523403 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 17523502  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  17523503 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 17523602  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||    
T  17523603 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggt 17523702  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  17523703 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 17523802  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  17523803 atccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 17523866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26320141 - 26319678
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  26320141 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 26320042  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    || | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  26320041 agacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 26319942  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  26319941 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 26319842  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26319841 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26319742  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26319741 atcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26319678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445640
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 3445614  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  3445615 gtatgtgaggaaactcctagacttga 3445640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 45387214 - 45387677
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  45387214 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 45387313  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  45387314 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 45387413  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  45387414 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 45387513  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  45387514 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 45387613  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  45387614 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 45387677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26670186 - 26669723
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  26670186 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 26670087  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  26670086 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 26669987  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  26669986 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 26669887  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  26669886 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 26669787  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26669786 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26669723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564199
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31564199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 9618636 - 9618985
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9618636 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9618735  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||    
T  9618736 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggg 9618835  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  9618836 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 9618935  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  9618936 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 9618985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24592813 - 24592350
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  24592813 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 24592714  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  24592713 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 24592614  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  24592613 aggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 24592514  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  24592513 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 24592414  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  24592413 atcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 24592350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Original strand, 11441590 - 11441906
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11441590 tttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 11441689  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||    
T  11441690 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 11441789  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||    
T  11441790 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgag 11441889  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11441890 gaagctcctagacttga 11441906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26538148 - 26537679
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||    
T  26538148 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 26538049  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaaca------gcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctact 255  Q
    |||||   || ||||||||||||||      ||| ||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||    
T  26538048 aacagttgccggttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttact 26537949  T
Q  256 tctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgct 355  Q
     |  |||||||| ||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  26537948 ccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgcc 26537849  T
Q  356 ctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcc 455  Q
     | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||    
T  26537848 ttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 26537749  T
Q  456 tcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26537748 tcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26537679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 31124905 - 31125254
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  31124905 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 31125004  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || ||    
T  31125005 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggg 31125104  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||    
T  31125105 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaat 31125204  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31125205 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31125254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 11441431 - 11441507
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11441431 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 11441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 22888310 - 22888809
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22888310 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 22888409  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22888410 ctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 22888509  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22888510 aatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 22888609  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||    
T  22888610 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 22888709  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22888710 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagact 22888809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13184979 - 13184473
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13184979 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13184880  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13184879 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13184780  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13184779 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 13184680  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  13184679 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 13184580  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13184579 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 13184480  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  13184479 tcccaga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 25198884 - 25199371
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25198884 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgtta 25198983  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25198984 acgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccga 25199083  T
Q  238 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25199084 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgt 25199183  T
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  25199184 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgaga 25199283  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25199284 acaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttga 25199371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Original strand, 33877078 - 33877589
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877078 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33877177  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33877178 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33877277  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  33877278 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 33877377  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  33877378 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcatta 33877477  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877478 accaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 33877577  T
Q  514 tcccagacttga 525  Q
    |||| |||||||    
T  33877578 tcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13440825 - 13440319
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13440825 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13440726  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13440725 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13440626  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13440625 tctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 13440526  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  13440525 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 13440426  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13440425 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 13440326  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  13440325 tcccaga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 11325625 - 11326131
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11325625 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 11325724  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11325725 tgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 11325824  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  11325825 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 11325924  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  11325925 aagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcatta 11326024  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11326025 accaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 11326124  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  11326125 tcccaga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 23892058 - 23892548
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23892058 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtca 23892157  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  23892158 atgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgc 23892257  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  23892258 cgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaa 23892357  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||    
T  23892358 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttg 23892457  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892458 agaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 23892548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 164 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29888902
Alignment:
Q  164 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 263  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagag 29889164  T
Q  264 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889163 ggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 29889064  T
Q  364 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 463  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29889063 tgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaat 29888964  T
Q  464 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29888963 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttga 29888902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 24969876 - 24970360
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24969876 cctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 24969975  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 237  Q
    ||||  | | ||| || ||| |||||||||  || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24969976 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca---tcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctga 24970072  T
Q  238 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgt 337  Q
    ||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||    
T  24970073 gttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 24970172  T
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||    || |||||||    
T  24970173 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgaga 24970272  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||  |||||||||||| ||||||||    
T  24970273 ataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttga 24970360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24688467 - 24687977
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24688467 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 24688368  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    || |  | | ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||    
T  24688367 atacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgc 24688268  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || || |||||     
T  24688267 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaa 24688168  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  24688167 tgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 24688068  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24688067 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24687977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 30934515 - 30934975
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  30934515 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 30934614  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||    
T  30934615 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 30934714  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  30934715 acattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcat 30934814  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  30934815 gatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatc 30934914  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30934915 ctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30934975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 33777321 - 33777829
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  33777321 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 33777420  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||     
T  33777421 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 33777520  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  33777521 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 33777620  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||  | |    
T  33777621 ttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatc 33777720  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  33777721 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 33777820  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  33777821 tagacttga 33777829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23752733 - 23752270
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  23752733 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 23752634  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  23752633 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatag 23752534  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  23752533 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 23752434  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  23752433 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 23752334  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23752333 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23718271 - 23717808
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  23718271 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 23718172  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  23718171 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatag 23718072  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  23718071 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 23717972  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  23717971 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 23717872  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23717871 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23717808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 525
Target Start/End: Original strand, 11549236 - 11549696
Alignment:
Q  68 cagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||     
T  11549236 cagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagt 11549335  T
Q  168 caccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
      ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||    
T  11549336 tgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 11549435  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  11549436 gcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcat 11549535  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  11549536 gatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatc 11549635  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11549636 ctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttga 11549696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22999397 - 22998934
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  22999397 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 22999298  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  22999297 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 22999198  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  22999197 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggt 22999098  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  22999097 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 22998998  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22998997 atcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22998934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548363
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 9548727  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||  ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  ||    
T  9548726 agatgccgattcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaag 9548627  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  9548626 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggt 9548527  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  9548526 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 9548427  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9548426 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 9548363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 499
Target Start/End: Original strand, 33292362 - 33292841
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  33292362 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 33292461  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  33292462 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttttcctcctat 33292561  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||    
T  33292562 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttc 33292661  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
    |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||    
T  33292662 cgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaag 33292761  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    | || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  33292762 ggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15659043 - 15658580
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  15659043 tctcagcatcctttctttccgccgttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 15658944  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  15658943 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 15658844  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  15658843 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 15658744  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  15658743 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 15658644  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||    
T  15658643 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttga 15658580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32599752 - 32599292
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||||||  | ||||| |    
T  32599752 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatc 32599653  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||    
T  32599652 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagagg 32599553  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  32599552 acactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcat 32599453  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    || || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  32599452 gacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatc 32599353  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||||||    
T  32599352 cgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttga 32599292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8665758 - 8665295
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  8665758 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 8665659  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  8665658 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 8665559  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  8665558 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 8665459  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  8665458 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 8665359  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  8665358 atccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 8665295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18375741 - 18375232
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||     
T  18375741 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 18375642  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  18375641 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctc 18375542  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
      ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  18375541 ctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaag 18375442  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  18375441 gttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgat 18375342  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  18375341 caagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctc 18375242  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  18375241 ctagacttga 18375232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 12132034 - 12132497
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  12132034 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 12132133  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    || | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  12132134 agacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 12132233  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  12132234 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 12132333  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  12132334 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 12132433  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  12132434 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 12132497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 34616400 - 34616860
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | ||  |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  34616400 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 34616499  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||    
T  34616500 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagg 34616599  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||    
T  34616600 acattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcat 34616699  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  34616700 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatc 34616799  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  34616800 cgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 34616860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671303
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37671303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15759140 - 15758677
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  15759140 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 15759041  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  15759040 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 15758941  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  15758940 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 15758841  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  15758840 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 15758741  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  15758740 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 15758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649577
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 28649577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Original strand, 30168302 - 30168811
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||||    
T  30168302 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggt 30168401  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    |||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || ||||    
T  30168402 caacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctc 30168501  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  30168502 cgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaag 30168601  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  30168602 gttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgat 30168701  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||    
T  30168702 caagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactc 30168801  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  30168802 ctagacttga 30168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Original strand, 33516189 - 33516698
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||     
T  33516189 catcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 33516288  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  33516289 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctc 33516388  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
      ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  33516389 ctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaag 33516488  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  33516489 gttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgat 33516588  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||    
T  33516589 cagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctc 33516688  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  33516689 cgagacttga 33516698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 9317444 - 9317793
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  9317444 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9317543  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  9317544 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 9317643  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  9317644 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 9317743  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  9317744 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 9317793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 30152011 - 30152360
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  30152011 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 30152110  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  30152111 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 30152210  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  30152211 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 30152310  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  30152311 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 30152360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Original strand, 31431466 - 31431782
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31431466 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 31431565  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  31431566 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 31431665  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||    
T  31431666 cattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 31431765  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  31431766 gaagctcctagacttga 31431782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 499
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41675025
Alignment:
Q  66 ctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaaca 165  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| |||||||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaaca 41674688  T
Q  166 gccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcaga 262  Q
    |   || |||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||    
T  41674689 gttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaaga 41674788  T
Q  263 gggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtc 362  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |    
T  41674789 gggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggcc 41674888  T
Q  363 atgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaa 462  Q
    |||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||    
T  41674889 atgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataa 41674988  T
Q  463 tcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41674989 tccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 2511044 - 2511393
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  2511044 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 2511143  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  2511144 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 2511243  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||    
T  2511244 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaat 2511343  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  2511344 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 2511393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 26480385 - 26480734
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26480385 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26480484  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||    
T  26480485 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggg 26480584  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  26480585 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 26480684  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  26480685 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 26480734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826227
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31826253  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  31826252 gtatgtgaggaaactcctagacttga 31826227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 6874181 - 6874647
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  6874181 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 6874280  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc------atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||||||||| |      |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| | || || ||| |||| |     
T  6874281 agttgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactcca 6874380  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  6874381 gagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 6874480  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||    
T  6874481 ggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 6874580  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  6874581 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 6874647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37358812 - 37358463
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  37358812 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 37358713  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || ||    
T  37358712 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggg 37358613  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37358612 gtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaat 37358513  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  37358512 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37358463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500553
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | || | |||||||||||| |||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 43078128 - 43078594
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  43078128 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 43078227  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaaca------gcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || ||||||||||||||      ||| ||| |  | ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |     
T  43078228 agttgccggttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactcca 43078327  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  43078328 gagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 43078427  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |    
T  43078428 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 43078527  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  43078528 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 43078594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29967349 - 29966886
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  29967349 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 29967250  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  29967249 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 29967150  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||    
T  29967149 aggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggt 29967050  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  29967049 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 29966950  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  29966949 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 29966886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 5637903 - 5638252
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5637903 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5638002  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||    
T  5638003 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggg 5638102  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  5638103 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 5638202  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  5638203 catgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 5638252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 30029408 - 30029757
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  30029408 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 30029507  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || ||    
T  30029508 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggg 30029607  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  30029608 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 30029707  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  30029708 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 30029757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324649
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 13324649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770807
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
     | || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||| | ||||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagacttga 37770807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789883
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 3789883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755322
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 37755322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681782
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24681656  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  24681657 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24681756  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24681757 gtatgtgaggaagctcctagacttga 24681782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724309
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24724183  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  24724184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24724283  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24724284 gtatgtgaggaagctcctagacttga 24724309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473369
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40473495  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40473494 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 40473395  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  40473394 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 40473369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28959955 - 28959606
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  28959955 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 28959856  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  28959855 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 28959756  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||    
T  28959755 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 28959656  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || ||||| || ||||| || || | ||||||  |||| ||||||||    
T  28959655 catgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttga 28959606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 31431307 - 31431383
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31431307 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 31431383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Original strand, 3789402 - 3789481
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789402 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgc 3789481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18501031 - 18500955
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18501031 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 18500955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 28649105 - 28649181
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  28649105 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 28649181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37358938 - 37358862
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  37358938 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 37358862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37671775 - 37671699
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  37671775 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 37671699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16626972 - 16626470
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16626972 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 16626873  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626872 ctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16626773  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16626772 aatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 16626673  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16626672 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 16626573  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626572 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16626473  T
Q  523 tga 525  Q
    |||    
T  16626472 tga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 523
Target Start/End: Original strand, 18530186 - 18530680
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  18530186 aatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 18530285  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530286 ctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaaca------gcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 18530379  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18530380 aatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 18530479  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18530480 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 18530579  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18530580 aattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagact 18530679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17994259 - 17993753
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17994259 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 17994160  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17994159 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 17994060  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17994059 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 17993960  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  17993959 aagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 17993860  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17993859 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 17993760  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  17993759 tcccaga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 4625727 - 4626233
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4625727 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccat 4625826  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4625827 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 4625926  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  4625927 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 4626026  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  4626027 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 4626126  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4626127 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagc 4626226  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  4626227 tcccaga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 521
Target Start/End: Original strand, 5652170 - 5652677
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  5652170 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaat 5652269  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5652270 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 5652369  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  5652370 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctccc 5652469  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  5652470 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 5652569  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5652570 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagc 5652669  T
Q  514 tcccagac 521  Q
    ||||||||    
T  5652670 tcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32293046
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 32292796  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32292797 tcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 32292896  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32292897 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 32292996  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32292997 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 32293046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034081
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 31034331  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31034330 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 31034231  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31034230 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 31034131  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31034130 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 31034081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 5713007 - 5713516
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  5713007 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5713106  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| ||    
T  5713107 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5713206  T
Q  211 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 310  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5713207 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 5713306  T
Q  311 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctca 410  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  5713307 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctca 5713406  T
Q  411 taaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagga 510  Q
    |  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5713407 ttgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagga 5713506  T
Q  511 agctcccaga 520  Q
    ||||||||||    
T  5713507 agctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 5723917 - 5724426
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  5723917 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5724016  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| ||    
T  5724017 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5724116  T
Q  211 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 310  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5724117 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 5724216  T
Q  311 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctca 410  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  5724217 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctca 5724316  T
Q  411 taaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagga 510  Q
    |  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5724317 ttgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagga 5724416  T
Q  511 agctcccaga 520  Q
    ||||||||||    
T  5724417 agctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5757560 - 5757051
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  5757560 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5757461  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| ||    
T  5757460 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5757361  T
Q  211 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 310  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5757360 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 5757261  T
Q  311 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctca 410  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  5757260 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctca 5757161  T
Q  411 taaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagga 510  Q
    |  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5757160 ttgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagga 5757061  T
Q  511 agctcccaga 520  Q
    ||||||||||    
T  5757060 agctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5768451 - 5767942
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  5768451 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5768352  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||  |||  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| ||    
T  5768351 cgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctacttt 5768252  T
Q  211 tcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcct 310  Q
     |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5768251 ccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcct 5768152  T
Q  311 cccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctca 410  Q
    || ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  5768151 ccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctca 5768052  T
Q  411 taaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagga 510  Q
    |  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5768051 ttgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagga 5767952  T
Q  511 agctcccaga 520  Q
    ||||||||||    
T  5767951 agctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15893178 - 15892670
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  15893178 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 15893079  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||     
T  15893078 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctcc 15892979  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  15892978 gataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccagg 15892879  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  15892878 ttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 15892779  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  15892778 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 15892679  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  15892678 tagacttga 15892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8301736 - 8301231
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||| |||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  8301736 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 8301637  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  8301636 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 8301537  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8301536 accgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 8301437  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||    
T  8301436 aggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaag 8301337  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    ||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||    
T  8301336 gaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctag 8301237  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  8301236 acttga 8301231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 8295779 - 8296266
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  8295779 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgtta 8295878  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 237  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  8295879 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctga 8295978  T
Q  238 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgt 337  Q
    ||| || |||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||   || || ||||| |||    
T  8295979 gttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 8296078  T
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||    
T  8296079 gattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgaga 8296178  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  8296179 ataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 8296266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22388047 - 22387542
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  22388047 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 22387948  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  22387947 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttttcctcctat 22387848  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22387847 accaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 22387748  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||    
T  22387747 aggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaag 22387648  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    ||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||    
T  22387647 gaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctag 22387548  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  22387547 acttga 22387542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 18051066 - 18051556
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18051066 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 18051165  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  18051166 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 18051265  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   || || |||||     
T  18051266 tgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaa 18051365  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  18051366 tgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 18051465  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18051466 agaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttga 18051556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4797080 - 4796617
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  4797080 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 4796981  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  4796980 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 4796881  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  4796880 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 4796781  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  4796780 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 4796681  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4796680 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 4796617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 18330460 - 18330963
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||     ||| ||||| ||||||    
T  18330460 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc-----cctctgccaccgggtc 18330554  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  18330555 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 18330654  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  18330655 gataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 18330754  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  18330755 ttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 18330854  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  18330855 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 18330954  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  18330955 tagacttga 18330963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29149182 - 29148719
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  29149182 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 29149083  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  29149082 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 29148983  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  29148982 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 29148883  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  29148882 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 29148783  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  29148782 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 29148719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 35880552 - 35881060
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  35880552 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 35880651  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  35880652 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 35880751  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||    
T  35880752 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaagg 35880851  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | |    
T  35880852 ttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatc 35880951  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  35880952 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcc 35881051  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  35881052 tagacttga 35881060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 6192102 - 6192610
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| | || ||| ||||| ||||||    
T  6192102 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatcattagtaccctctgccaccgggtc 6192201  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||     
T  6192202 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 6192301  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||    
T  6192302 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaagg 6192401  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  6192402 ttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 6192501  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  6192502 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 6192601  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  6192602 tagacttga 6192610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15741509 - 15741058
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||  |||          
T  15741509 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagttgc------ 15741416  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
          |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  15741415 ------cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 15741322  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  15741321 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggt 15741222  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  15741221 catgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgaca 15741122  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15741121 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15741058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 522
Target Start/End: Original strand, 4721417 - 4721922
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  4721417 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 4721516  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | | ||| || ||  ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  4721517 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 4721616  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||    
T  4721617 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaagg 4721716  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||| |||||  | |    
T  4721717 ttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatc 4721816  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  4721817 aaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 4721916  T
Q  517 cagact 522  Q
     |||||    
T  4721917 tagact 4721922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 7073043 - 7073506
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  7073043 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 7073142  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  7073143 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 7073242  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || || || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  7073243 agggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 7073342  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  7073343 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 7073442  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  7073443 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 7073506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 525
Target Start/End: Original strand, 10395970 - 10396427
Alignment:
Q  68 cagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  |   |||||||     
T  10395970 cagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggt---acaacagt 10396066  T
Q  168 caccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
      ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||    
T  10396067 tgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagagg 10396166  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10396167 acactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcat 10396266  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  10396267 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatc 10396366  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  10396367 ctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 10396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18277482 - 18277016
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  18277482 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18277383  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  18277382 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18277283  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  18277282 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 18277183  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18277182 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 18277083  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18277082 acaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18277016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18292783 - 18292317
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  18292783 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18292684  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  18292683 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18292584  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  18292583 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 18292484  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18292483 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 18292384  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18292383 acaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18292317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18308084 - 18307618
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  18308084 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18307985  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  18307984 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18307885  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  18307884 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 18307785  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  18307784 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 18307685  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18307684 acaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18307618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 499
Target Start/End: Original strand, 32438944 - 32439422
Alignment:
Q  21 tcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtca 120  Q
    |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||    
T  32438944 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 32439043  T
Q  121 acctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgata 220  Q
    ||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||    
T  32439044 acctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctata 32439143  T
Q  221 ccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttcc 320  Q
    |||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||    
T  32439144 ccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttcc 32439243  T
Q  321 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagg 420  Q
      ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | |||||    
T  32439244 gctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagg 32439343  T
Q  421 aaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32439344 gaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 8211527 - 8212032
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  8211527 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 8211626  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||  || |||||||  ||    
T  8211627 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagactaacttttcctcctat 8211726  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8211727 accaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 8211826  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||    
T  8211827 aggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaag 8211926  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    | ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||    
T  8211927 ggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctag 8212026  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  8212027 acttga 8212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28116384 - 28115918
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  28116384 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 28116285  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |     
T  28116284 agatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactcca 28116185  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |     
T  28116184 gagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcttta 28116085  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  28116084 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcg 28115985  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  28115984 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 28115918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 5466816 - 5467279
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||  |    
T  5466816 tctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacgtc 5466915  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa---gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    | || ||||||||||| || ||||| || |||   | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  5466916 aaccgccagttcaacagcagcagcagcagcaatatgatagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagag 5467015  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  5467016 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 5467115  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  5467116 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 5467215  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  5467216 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 5467279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4347111 - 4346651
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  4347111 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 4347012  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||    
T  4347011 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagagg 4346912  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  4346911 acactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcat 4346812  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||| ||||    
T  4346811 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatc 4346712  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4346711 ctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4346651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 28021109 - 28021569
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  28021109 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 28021208  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||    
T  28021209 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagg 28021308  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||    
T  28021309 gcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttat 28021408  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  28021409 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatc 28021508  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28021509 ctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 28021569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17985429 - 17984920
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||     
T  17985429 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 17985330  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  17985329 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctc 17985230  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
      ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  17985229 ctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaag 17985130  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  17985129 gttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgat 17985030  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||    
T  17985029 caagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctc 17984930  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  17984929 ctagacttga 17984920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 499
Target Start/End: Original strand, 20065877 - 20066311
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  20065877 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 20065976  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||    
T  20065977 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagagg 20066076  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||    || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||    
T  20066077 acactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcat 20066176  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    |||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  20066177 gatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatc 20066276  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20066277 cgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 4416864 - 4417213
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  4416864 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 4416963  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||    
T  4416964 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 4417063  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4417064 gtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaat 4417163  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4417164 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4417213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 396
Target Start/End: Original strand, 4892999 - 4893375
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  4892999 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4893098  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  4893099 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 4893198  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  | || || ||||| ||||||    
T  4893199 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttc 4893298  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 396  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  4893299 cactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 21674479 - 21674987
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||| ||||||    
T  21674479 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgccattttaccatcagtaccccctgccaccgggtc 21674578  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| || ||| | || ||  | |  || || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||||| || |||||||     
T  21674579 aacctcaagtgcccatcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcc 21674678  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  21674679 tataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaagg 21674778  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  21674779 ttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 21674878  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  21674879 aagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 21674978  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  21674979 tagacttga 21674987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110313
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11110439  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||     
T  11110438 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaa 11110339  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  11110338 gtgtgtgaggaagctccaagacttga 11110313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31964900 - 31964437
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  31964900 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 31964801  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  31964800 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 31964701  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  31964700 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 31964601  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  31964600 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 31964501  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  31964500 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 31964437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 50134498 - 50134035
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  50134498 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 50134399  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  50134398 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 50134299  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  50134298 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 50134199  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  50134198 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 50134099  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  50134098 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 50134035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5609749 - 5609286
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  5609749 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 5609650  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  5609649 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 5609550  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  5609549 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 5609450  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  5609449 catgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 5609350  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  5609349 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 5609286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997041
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 36997067  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36997066 gtatgtgaggaaactcctagacttga 36997041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 47023284 - 47023747
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  47023284 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 47023383  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  47023384 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 47023483  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  47023484 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 47023583  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  47023584 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 47023683  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  47023684 atccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 47023747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542426
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | | |||||||||| ||||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagacttga 6542426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 7996393 - 7996856
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  7996393 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 7996492  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  7996493 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 7996592  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  7996593 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 7996692  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  7996693 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 7996792  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  7996793 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 7996856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 10642901 - 10643364
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  10642901 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 10643000  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  10643001 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 10643100  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  10643101 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 10643200  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  10643201 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 10643300  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || |||||    
T  10643301 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttga 10643364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 28339247 - 28339596
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  28339247 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28339346  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || ||    
T  28339347 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggg 28339446  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||    
T  28339447 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaat 28339546  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  28339547 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 28339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466221
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 48466095  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  48466096 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 48466195  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  48466196 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 48466221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29664934
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29665060  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  29665059 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaa 29664960  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  29664959 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 29664934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5596838 - 5596321
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || |    
T  5596838 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 5596739  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--------ag----ctagacctac 207  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||||||    ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||        ||    ||||||| ||    
T  5596738 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggcacaacaccaaccgccaattcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtatactagaccaac 5596639  T
Q  208 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 307  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5596638 cttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 5596539  T
Q  308 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 407  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |    
T  5596538 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 5596439  T
Q  408 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 507  Q
    ||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  5596438 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 5596339  T
Q  508 ggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5596338 ggaagctcctagacttga 5596321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 18224977 - 18225485
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| |    
T  18224977 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 18225076  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    | ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||     
T  18225077 agcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcc 18225176  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  18225177 tataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 18225276  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  18225277 ttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatc 18225376  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||    
T  18225377 aagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 18225476  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     || |||||    
T  18225477 taggcttga 18225485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20577160 - 20576811
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||| ||||||||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  20577160 caacaacagcagcatcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 20577061  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  20577060 ctaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 20576961  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  20576960 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 20576861  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20576860 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20576811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 525
Target Start/End: Original strand, 51782052 - 51782317
Alignment:
Q  260 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 359  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  51782052 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttag 51782151  T
Q  360 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcga 459  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||    
T  51782152 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttga 51782251  T
Q  460 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51782252 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51782317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870820
Alignment:
Q  197 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 296  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  297 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 396  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  397 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 496  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  497 gaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 22870820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885879
Alignment:
Q  197 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 296  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  297 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 396  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  397 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 496  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  497 gaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 22885879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 5013543 - 5014006
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  5013543 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 5013642  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  ||    
T  5013643 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagag 5013742  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  5013743 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 5013842  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  5013843 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 5013942  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  5013943 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 5014006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 525
Target Start/End: Original strand, 51797141 - 51797407
Alignment:
Q  260 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccca-ggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |     
T  51797141 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcctta 51797240  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |    
T  51797241 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 51797340  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  51797341 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 51797407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 18242684 - 18243033
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  18242684 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 18242783  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || ||    
T  18242784 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggg 18242883  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||    
T  18242884 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 18242983  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  18242984 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18243033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 24328104 - 24328453
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  24328104 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 24328203  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  24328204 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 24328303  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||    
T  24328304 gtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaat 24328403  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  24328404 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 24328453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29665415 - 29665336
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29665415 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 29665336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11110788 - 11110712
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11110788 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 11110712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6542901 - 6542825
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  6542901 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 6542825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36997516 - 36997440
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||    
T  36997516 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgc 36997440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15285353 - 15284851
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15285353 aatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 15285254  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15285253 ctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15285154  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  15285153 aatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgg 15285054  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15285053 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 15284954  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15284953 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagact 15284854  T
Q  523 tga 525  Q
    |||    
T  15284853 tga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Original strand, 15227716 - 15228218
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227716 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 15227815  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15227816 ctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15227915  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  15227916 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgt 15228015  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||    
T  15228016 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaa 15228115  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  15228116 agttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagact 15228215  T
Q  523 tga 525  Q
    |||    
T  15228216 tga 15228218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 1900103 - 1900602
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1900103 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 1900202  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900203 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 1900302  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||| | |    
T  1900303 aatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgt 1900402  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||    
T  1900403 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 1900502  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900503 agttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 1900602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24461039 - 24460533
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24461039 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 24460940  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24460939 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 24460840  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24460839 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 24460740  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  24460739 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 24460640  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24460639 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagc 24460540  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  24460539 tcccaga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14235953 - 14235448
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |    
T  14235953 aatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacc 14235854  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14235853 cataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgat 14235754  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14235753 accaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttc 14235654  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  14235653 catttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagg 14235554  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  14235553 gaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccag 14235454  T
Q  520 acttga 525  Q
     |||||    
T  14235453 tcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15391764 - 15391291
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat---cg 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||   |||||   ||    
T  15391764 catcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccg 15391668  T
Q  116 ggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||| |||||||| |  | |   ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15391667 ggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggct---caacaacagcagcaacaaaccagacctacctttcctc 15391571  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15391570 cgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccag 15391471  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  15391470 gttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgac 15391371  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 495  Q
     | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15391370 tagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 525
Target Start/End: Original strand, 17013867 - 17014348
Alignment:
Q  47 tacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcg 146  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  17013867 tacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattg 17013966  T
Q  147 ttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttact 243  Q
     ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  17013967 ctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 17014066  T
Q  244 cccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttc 343  Q
     |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||     
T  17014067 tccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttt 17014166  T
Q  344 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaact 443  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||      
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  444 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 17014348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24592742 - 24592237
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  24592742 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24592643  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  24592642 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 24592543  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24592542 accgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24592443  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||    
T  24592442 aggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaag 24592343  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    ||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||    
T  24592342 gaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctag 24592243  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  24592242 acttga 24592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 14664858 - 14665366
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  14664858 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 14664957  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  14664958 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 14665057  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  14665058 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 14665157  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  14665158 ttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 14665257  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  14665258 aaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 14665357  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  14665358 tagacttga 14665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34189388 - 34188909
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  34189388 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 34189289  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  34189288 aacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctat 34189189  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||    
T  34189188 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttc 34189089  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
    |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||    
T  34189088 cgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaag 34188989  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
    | || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34188988 ggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36344901 - 36344438
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  36344901 tactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 36344802  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||    
T  36344801 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 36344702  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  36344701 aggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 36344602  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  36344601 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 36344502  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  36344501 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 36344438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 6569738 - 6570201
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| ||||||    
T  6569738 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 6569837  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  6569838 agatgccagttcaacagcaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 6569937  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||    
T  6569938 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggt 6570037  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  6570038 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 6570137  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  6570138 atcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 6570201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14763693 - 14763227
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  14763693 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 14763594  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    | || |  || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  14763593 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 14763494  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  14763493 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 14763394  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  14763393 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 14763294  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  14763293 acaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 14763227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 499
Target Start/End: Original strand, 24112506 - 24112984
Alignment:
Q  21 tcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtca 120  Q
    |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||    
T  24112506 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 24112605  T
Q  121 acctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgata 220  Q
    ||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||    
T  24112606 acctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctata 24112705  T
Q  221 ccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttcc 320  Q
    |||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||    
T  24112706 ccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttcc 24112805  T
Q  321 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagg 420  Q
      ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | |||||    
T  24112806 gctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagg 24112905  T
Q  421 aaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24112906 gaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 5005755 - 5006221
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  5005755 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 5005854  T
Q  165 agccaccagttcaac------aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||      |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  5005855 agatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5005954  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |     
T  5005955 gagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcctta 5006054  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| || || || |||||||| ||  |||| || |||||||    
T  5006055 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 5006154  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  5006155 acaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 5006221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31126949 - 31126441
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  31126949 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 31126850  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    | ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||     
T  31126849 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcc 31126750  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  31126749 tataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaagg 31126650  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  31126649 ttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 31126550  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    | |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31126549 agggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctcc 31126450  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  31126449 gagacttga 31126441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 14098381 - 14098889
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  14098381 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 14098480  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    | ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||     
T  14098481 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcc 14098580  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  14098581 tataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaagg 14098680  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  14098681 ttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 14098780  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||    
T  14098781 aagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 14098880  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  14098881 gagacttga 14098889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27163703 - 27163240
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  27163703 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 27163604  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  27163603 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 27163504  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  27163503 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 27163404  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  27163403 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 27163304  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27163303 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27163240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 54833230 - 54833735
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| |||| |    
T  54833230 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 54833329  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| | | ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || |||||||  ||    
T  54833330 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctat 54833429  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  54833430 acctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttc 54833529  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||    
T  54833530 aggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaag 54833629  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    | ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||    
T  54833630 ggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctag 54833729  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  54833730 acttga 54833735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800536
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 18800536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40105910 - 40105561
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  40105910 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacga 40105811  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  40105810 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 40105711  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40105710 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 40105611  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  40105610 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 40105561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 21969586 - 21970049
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  21969586 tctcagcatcctttcttcccgccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 21969685  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  21969686 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 21969785  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||    
T  21969786 aggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 21969885  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  21969886 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 21969985  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| ||| ||||||||    
T  21969986 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttga 21970049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673721
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33673847  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  33673846 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 33673747  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||| ||| ||||||||    
T  33673746 gtgtgtgaggaagttcctagacttga 33673721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30754102
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30754076  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  30754077 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 30754102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850986
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39850860  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  39850861 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39850960  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  39850961 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 39850986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 121
Target Start/End: Original strand, 19373101 - 19373202
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19373101 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 19373200  T
Q  120 aa 121  Q
    ||    
T  19373201 aa 19373202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18801008 - 18800932
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  18801008 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 18800932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 30753627 - 30753703
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  30753627 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 30753703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19456835 - 19456333
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  19456835 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 19456736  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19456735 ctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 19456636  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19456635 aatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 19456536  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19456535 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 19456436  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19456435 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagact 19456336  T
Q  523 tga 525  Q
    |||    
T  19456335 tga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21703578 - 21703079
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21703578 aatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 21703479  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21703478 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 21703379  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21703378 aatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 21703279  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||    
T  21703278 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaa 21703179  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703178 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 21703079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 521
Target Start/End: Original strand, 27118506 - 27119013
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27118506 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 27118605  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27118606 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccc 27118705  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27118706 tccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctccc 27118805  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  27118806 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 27118905  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27118906 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 27119005  T
Q  514 tcccagac 521  Q
    ||||||||    
T  27119006 tcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34303726 - 34303215
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34303726 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34303627  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34303626 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 34303527  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34303526 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctccc 34303427  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  34303426 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 34303327  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34303326 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagc 34303227  T
Q  514 tcccagacttga 525  Q
    ||||||||||||    
T  34303226 tcccagacttga 34303215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 3784472 - 3784978
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3784472 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 3784571  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  3784572 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcc 3784671  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3784672 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 3784771  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  3784772 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 3784871  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3784872 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 3784971  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  3784972 tcccaga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 34156829 - 34157334
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34156829 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34156928  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34156929 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 34157028  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  34157029 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 34157128  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  34157129 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatag 34157227  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34157228 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 34157327  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  34157328 tcccaga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 16163417 - 16163923
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16163417 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 16163516  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16163517 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 16163616  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16163617 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 16163716  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  16163717 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 16163816  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16163817 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 16163916  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  16163917 tcccaga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31891750 - 31891245
Alignment:
Q  15 tggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31891750 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 31891651  T
Q  115 gggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcct 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31891650 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 31891551  T
Q  215 ctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccca 314  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31891550 ctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaa 31891451  T
Q  315 ggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaa 414  Q
    |||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  31891450 ggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcataga 31891351  T
Q  415 ccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagct 514  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31891350 ccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagct 31891251  T
Q  515 cccaga 520  Q
    ||||||    
T  31891250 cccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Original strand, 27392813 - 27393298
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    ||  |||||    
T  27392813 catcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggt 27392912  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctga 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||                     |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  27392913 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaa---------------------caacagcaacaacaaaccagacctacctttcctccga 27392991  T
Q  219 taccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggtt 318  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27392992 taccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggtt 27393091  T
Q  319 ccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaa 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  27393092 ccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcag 27393191  T
Q  419 ggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccca 518  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||| |||||    
T  27393192 ggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttccca 27393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27434846 - 27434356
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27434846 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27434747  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  27434746 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 27434647  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || ||| || |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   || ||||||||     
T  27434646 tgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaa 27434547  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  27434546 tgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 27434447  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27434446 agaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27434356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23128968 - 23128478
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23128968 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23128869  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  23128868 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 23128769  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  23128768 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 23128669  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  23128668 tgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 23128569  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23128568 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23128478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 28882080 - 28882543
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  28882080 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 28882179  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  28882180 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 28882279  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  28882280 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 28882379  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  28882380 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 28882479  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28882480 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 28882543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 12655381 - 12655871
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12655381 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 12655480  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||    
T  12655481 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 12655580  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  12655581 tgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 12655680  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  12655681 tgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 12655780  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12655781 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12655871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 525
Target Start/End: Original strand, 20837766 - 20838247
Alignment:
Q  47 tacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcg 146  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  20837766 tacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcg 20837865  T
Q  147 ttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttact 243  Q
     ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20837866 ctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 20837965  T
Q  244 cccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttc 343  Q
     || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   || ||||| || |||||||||    
T  20837966 tccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttc 20838065  T
Q  344 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaact 443  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||      
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  444 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 20838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22926403 - 22925940
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  22926403 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 22926304  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  22926303 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 22926204  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  22926203 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 22926104  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  22926103 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 22926004  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22926003 atccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 22925940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233840
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaa 40233814  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  40233815 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 40233840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13936919 - 13936456
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  13936919 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 13936820  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    |||  || |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  13936819 agctgccggttcaacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 13936720  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||    
T  13936719 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 13936620  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  13936619 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 13936520  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  13936519 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 13936456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21677557 - 21677094
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  21677557 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 21677458  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  21677457 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 21677358  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  21677357 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 21677258  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  21677257 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 21677158  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  21677157 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 21677094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9349902
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||      
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9350020  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9350019 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 9349920  T
Q  500 gtatatgaggaagctccc 517  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9349919 gtatatgaggaagctccc 9349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 495
Target Start/End: Original strand, 34286223 - 34286653
Alignment:
Q  68 cagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||     
T  34286223 cagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacaga 34286322  T
Q  168 caccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
      || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||    
T  34286323 tgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagg 34286422  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||     
T  34286423 gcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcac 34286522  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  34286523 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatc 34286622  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 495  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286623 ctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 495
Target Start/End: Original strand, 34291283 - 34291713
Alignment:
Q  68 cagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||     
T  34291283 cagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacaga 34291382  T
Q  168 caccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
      || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||    
T  34291383 tgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagg 34291482  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||     
T  34291483 gcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcac 34291582  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  34291583 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatc 34291682  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 495  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291683 ctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11635564 - 11635098
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  11635564 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 11635465  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  11635464 agatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 11635365  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |     
T  11635364 gagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgcctta 11635265  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 11635098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11641753 - 11641287
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  11641753 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 11641654  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||||||||| || |||      |||||||||||||| || |||| |||||  ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  11641653 agatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 11641554  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |     
T  11641553 gagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgcctta 11641454  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttga 11641287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 37925359 - 37925822
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  37925359 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 37925458  T
Q  165 agccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  37925459 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 37925558  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||    
T  37925559 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggt 37925658  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  37925659 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 37925758  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37925759 atcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37925822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Original strand, 37375024 - 37375490
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||| | ||| ||| ||  | ||||    
T  37375024 tactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgtcatcgctcaacaggtacaac 37375123  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaag---ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || |||    ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |     
T  37375124 atcaaccgcccgttcaacagcagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactcca 37375223  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  37375224 gagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcccta 37375323  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  37375324 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 37375423  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | || ||||||||| ||||||||    
T  37375424 acaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttga 37375490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 411
Target Start/End: Original strand, 34279315 - 34279664
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  34279315 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 34279414  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  34279415 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaag 34279514  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  34279515 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 34279614  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcat 411  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  34279615 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 34279664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16829713 - 16829250
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  16829713 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16829614  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||    
T  16829613 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagag 16829514  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||    
T  16829513 aggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 16829414  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  16829413 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 16829314  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16829313 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16829250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 16891768 - 16892231
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  16891768 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16891867  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||    
T  16891868 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagag 16891967  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||    
T  16891968 aggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 16892067  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  16892068 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 16892167  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16892168 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 32049664 - 32050127
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  32049664 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 32049763  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  32049764 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 32049863  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || || |||||  | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  32049864 agggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 32049963  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  32049964 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 32050063  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  32050064 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttga 32050127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 31876147 - 31876610
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  31876147 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 31876246  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| |  ||    
T  31876247 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagag 31876346  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||    
T  31876347 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggt 31876446  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  31876447 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 31876546  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  31876547 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 31876610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37686284 - 37685821
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  37686284 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 37686185  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  37686184 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 37686085  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37686084 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 37685985  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  37685984 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 37685885  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37685884 atccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37685821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37701549 - 37701086
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  37701549 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 37701450  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  37701449 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 37701350  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37701349 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 37701250  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  37701249 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 37701150  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  37701149 atccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 37701086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 522
Target Start/End: Original strand, 34861660 - 34862006
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  34861660 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 34861759  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  34861760 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 34861859  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  34861860 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 34861959  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  34861960 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 34862006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 525
Target Start/End: Original strand, 12586874 - 12587139
Alignment:
Q  260 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 359  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |    
T  12586874 agaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 12586973  T
Q  360 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcga 459  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||    
T  12586974 gtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcga 12587073  T
Q  460 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  12587074 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 12587139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12716863 - 12716514
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  12716863 caacaacaacagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 12716764  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  12716763 ctaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 12716664  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||    
T  12716663 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 12716564  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12716563 catgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12716514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777551
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27777425  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27777426 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27777525  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  27777526 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 27777551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817309
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27817083  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27817084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27817183  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27817184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27817283  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  27817284 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 27817309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 260981 - 260665
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  260981 tttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgc 260882  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||    
T  260881 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 260782  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  |||    
T  260781 cattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgag 260682  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  260681 gaagttcctagacttga 260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 27803687 - 27804036
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||| ||||| ||| |  | ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  27803687 caacaacancagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 27803786  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || ||    
T  27803787 ctaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggg 27803886  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  27803887 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 27803986  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27803987 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27804036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051734
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39051960  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  39051959 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39051860  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  39051859 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39051760  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  39051759 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 39051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 39890054 - 39890403
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||    
T  39890054 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 39890153  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  39890154 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 39890253  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||| ||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  39890254 gtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaat 39890353  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39890354 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39890403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19416874 - 19416411
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  19416874 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 19416775  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||| || || || || ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  19416774 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 19416675  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  19416674 aggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 19416575  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||    
T  19416574 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgaca 19416475  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  19416474 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 19416411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 261140 - 261009
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  261140 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 261041  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 196  Q
    ||   ||||||||||||||||| || ||||||    
T  261040 agttgccagttcaacaacaacaacaacaacaa 261009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33374633 - 33374127
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33374633 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33374534  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33374533 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33374434  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  33374433 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 33374334  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  33374333 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatag 33374234  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374233 accaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 33374134  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  33374133 tcccaga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13522450 - 13521939
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522450 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13522351  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13522350 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13522251  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13522250 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 13522151  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  13522150 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcatta 13522051  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522050 accaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 13521951  T
Q  514 tcccagacttga 525  Q
    |||| |||||||    
T  13521950 tcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 28162477 - 28162982
Alignment:
Q  15 tggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28162477 tggacatcaatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 28162576  T
Q  115 gggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcct 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28162577 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 28162676  T
Q  215 ctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccca 314  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||    
T  28162677 ctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctccca 28162776  T
Q  315 ggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaa 414  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  28162777 agttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcataga 28162876  T
Q  415 ccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagct 514  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28162877 ccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagct 28162976  T
Q  515 cccaga 520  Q
    ||||||    
T  28162977 cccaga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8892687 - 8892182
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  8892687 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccat 8892588  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8892587 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8892488  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  8892487 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 8892388  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  8892387 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatag 8892289  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8892288 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagc 8892189  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  8892188 tcccaga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8903922 - 8903417
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8903922 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 8903823  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8903822 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8903723  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  8903722 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 8903623  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  8903622 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatag 8903524  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8903523 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagc 8903424  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  8903423 tcccaga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 152 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22457176 - 22456800
Alignment:
Q  152 caaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccga 248  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22457176 caaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccga 22457077  T
Q  249 ctctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatca 348  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22457076 ctctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatca 22456977  T
Q  349 aggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccct 448  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  22456976 aggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccct 22456877  T
Q  449 catgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456876 catgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 22456800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22477644 - 22477241
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22477644 aatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaac 22477545  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaac---agcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477544 ctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgat 22477445  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22477444 accaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttc 22477345  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22477344 cgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaag 22477245  T
Q  420 gaaa 423  Q
    ||||    
T  22477244 gaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143151
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 14143401  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14143400 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 14143301  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14143300 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 14143201  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14143200 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 14143151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26788274
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 26788024  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26788025 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 26788124  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26788125 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 26788224  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26788225 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26788274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196647
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27196397  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27196398 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 27196497  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27196498 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 27196597  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196598 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 27196647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252593
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaa 27252843  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27252842 tcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 27252743  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27252742 atgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaat 27252643  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27252642 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 27252593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 164 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290236
Alignment:
Q  164 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 263  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagag 27290498  T
Q  264 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290497 ggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 27290398  T
Q  364 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 463  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  27290397 tgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaat 27290298  T
Q  464 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | |||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27290297 cttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttga 27290236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Original strand, 20160568 - 20161031
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |    
T  20160568 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 20160667  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  20160668 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacag 20160767  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  20160768 agggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggt 20160867  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||| || ||||    
T  20160868 catgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgaca 20160967  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20160968 atcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22172263 - 22171800
Alignment:
Q  62 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaac 161  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |    
T  22172263 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 22172164  T
Q  162 aacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||    
T  22172163 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacag 22172064  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  22172063 agggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggt 22171964  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||| || ||||    
T  22171963 catgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgaca 22171864  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171863 atcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22935233 - 22934746
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22935233 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 22935134  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 237  Q
    ||||  | | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  22935133 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctga 22935034  T
Q  238 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgt 337  Q
    ||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||    
T  22935033 gttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 22934934  T
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||    
T  22934933 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgaga 22934834  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22934833 ataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22934746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23857678 - 23857191
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23857678 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 23857579  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccga 237  Q
    ||||  | | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  23857578 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctga 23857479  T
Q  238 gttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgt 337  Q
    ||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||    
T  23857478 gttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 23857379  T
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||    
T  23857378 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgaga 23857279  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23857278 ataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23857191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24304992 - 24304484
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  24304992 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24304893  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || ||||     
T  24304892 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagtttccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 24304793  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  24304792 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 24304693  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  24304692 ttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 24304593  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||    
T  24304592 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 24304493  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  24304492 tagacttga 24304484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13299307 - 13298817
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13299307 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 13299208  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||    
T  13299207 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 13299108  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  13299107 tgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 13299008  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  13299007 tgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 13298908  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13298907 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 13298817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 16749721 - 16750184
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  16749721 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 16749820  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  16749821 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 16749920  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  16749921 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 16750020  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  16750021 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 16750120  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16750121 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16750184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 26988868 - 26989331
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  26988868 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 26988967  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   |||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  26988968 agttgccagttcaacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatag 26989067  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  26989068 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 26989167  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  26989168 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 26989267  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26989268 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 26989331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 26918202 - 26918710
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  26918202 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 26918301  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||  | | ||| || | | ||||||||   || |||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  26918302 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 26918401  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  26918402 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 26918501  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |    
T  26918502 ttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatc 26918601  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26918602 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 26918701  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  26918702 tagacttga 26918710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15424673 - 15424183
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15424673 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 15424574  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  15424573 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 15424474  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  15424473 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 15424374  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  15424373 tgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 15424274  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15424273 agaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15424183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 516
Target Start/End: Original strand, 26999940 - 27000394
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||    
T  26999940 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 27000039  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  27000040 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 27000139  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  27000140 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 27000239  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  27000240 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 27000339  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000340 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 29549300 - 29549805
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  29549300 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 29549399  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||    
T  29549400 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcctat 29549499  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29549500 accaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29549599  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||    
T  29549600 aggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaag 29549699  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    ||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  |    
T  29549700 gaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctgg 29549799  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  29549800 acttga 29549805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 24863557 - 24864047
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||||| || ||||||||||    
T  24863557 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgtta 24863656  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  24863657 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 24863756  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  24863757 tgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 24863856  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  24863857 tgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 24863956  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24863957 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24864047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27272876 - 27272446
Alignment:
Q  101 tatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttca------acaacaacagcatcaac 194  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||  | || ||||| | || |||||| |||||||||||      |||||||||| |||| |    
T  27272876 tatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgtgcagcagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacaacagaatcagc 27272777  T
Q  195 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctcc 294  Q
    |||  |||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  27272776 aagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagccccc 27272677  T
Q  295 acctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtac 394  Q
    |||| |||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||     
T  27272676 acctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtat 27272577  T
Q  395 attgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatga 494  Q
    || || |||||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27272576 atcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatga 27272477  T
Q  495 ttgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27272476 tcgaagtatgtgaggtagctcctagacttga 27272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 4525156 - 4525616
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  4525156 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 4525255  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||    
T  4525256 aaccgccagttcaacagcagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 4525355  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | ||||||    
T  4525356 acattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcat 4525455  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||    
T  4525456 gatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatc 4525555  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4525556 cactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4525616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 27044257 - 27044718
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  27044257 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 27044356  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||    
T  27044357 aaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagg 27044456  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  27044457 gcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcat 27044556  T
Q  365 gatgttgaaggat-gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 463  Q
    ||||| || || | | || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  27044557 gatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaat 27044656  T
Q  464 cctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27044657 ccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27044718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 29572994 - 29573343
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| |    
T  29572994 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 29573093  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  29573094 ctaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 29573193  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  29573194 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaat 29573293  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  29573294 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 29573343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30558391 - 30557882
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||     
T  30558391 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 30558292  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30558291 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctc 30558192  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
      ||||||||||||||||| ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  30558191 ctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaag 30558092  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  30558091 gttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgat 30557992  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||    
T  30557991 cagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctc 30557892  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  30557891 cgagacttga 30557882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773336
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4773336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758094
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4758094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674469
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 16674443  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  16674444 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 16674469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4545957 - 4545641
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  4545957 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 4545858  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||    
T  4545857 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 4545758  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||    
T  4545757 cattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 4545658  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  4545657 gaagctcctagacttga 4545641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008057
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  |||| |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | | |||||||||| ||||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagacttga 27008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696411
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||     
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 3696385  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
     | | ||| |||||||| ||||||||    
T  3696386 atgtgtgatgaagctcctagacttga 3696411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27360207 - 27359858
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27360207 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27360108  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  27360107 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 27360008  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    ||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27360007 atgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaat 27359908  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27359907 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27359858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27450550 - 27450201
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  27450550 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaa 27450451  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  27450450 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 27450351  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    ||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27450350 atgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaat 27450251  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27450250 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27450201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4724316 - 4724000
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  4724316 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 4724217  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||    
T  4724216 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 4724117  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | || |||||  | || |||||||||||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||    
T  4724116 cattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 4724017  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  4724016 gaagctcctagacttga 4724000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Original strand, 28207468 - 28207784
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  28207468 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 28207567  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  28207568 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaact 28207667  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||    
T  28207668 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 28207767  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  28207768 gaagctcctagacttga 28207784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 29501228 - 29501745
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| | || |    
T  29501228 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 29501327  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca--------ag----ctagacctac 207  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| ||||||    ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||        ||    ||||||| ||    
T  29501328 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggcacaacatcaaccgccaattcaacaacaacaacaacaacagcagcagcagtatactagaccaac 29501427  T
Q  208 ctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttg 307  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29501428 cttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttg 29501527  T
Q  308 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 407  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |    
T  29501528 cctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaac 29501627  T
Q  408 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 507  Q
    ||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  29501628 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 29501727  T
Q  508 ggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  29501728 ggaagctcctagacttga 29501745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26777830 - 26777481
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  26777830 caacagcagcagcagcaatatgctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 26777731  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  26777730 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggg 26777631  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  26777630 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 26777531  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||  ||| ||||||||    
T  26777530 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttga 26777481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463212
Alignment:
Q  200 agacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 299  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  300 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  400 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 499  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34463238  T
Q  500 gtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  34463237 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 34463212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025607
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 17025607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16944356 - 16943893
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  16944356 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16944257  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||| ||||| ||   ||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  16944256 agatgccggttcaacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 16944157  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||    
T  16944156 aggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggt 16944057  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  16944056 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 16943957  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  16943956 atccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 16943893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116276
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || |||||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 26116304  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  26116303 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 26116276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 27485110 - 27485459
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  27485110 caacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaa 27485209  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || ||    
T  27485210 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggg 27485309  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || |||    
T  27485310 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaat 27485409  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  27485410 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 27485459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092306
Alignment:
Q  404 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 503  Q
    ||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  504 atgaggaagctcccagacttga 525  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttga 17092306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27630038 - 27629907
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || |||||    
T  27630038 tctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaac 27629939  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  27629938 aaccaccagttcagcaacaacaacagcaacaa 27629907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 3695930 - 3696006
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3695930 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 3696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4546113 - 4546037
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  4546113 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 4546037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4724472 - 4724396
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  4724472 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 4724396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 17025129 - 17025205
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  17025129 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 17025205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26777956 - 26777880
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26777956 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 26777880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 27007579 - 27007655
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  27007579 tctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 27007655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 28207309 - 28207385
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  28207309 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 28207385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19659432 - 19658926
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19659432 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 19659333  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19659332 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 19659233  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  19659232 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctccc 19659133  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  19659132 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatag 19659034  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19659033 accaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 19658934  T
Q  514 tcccagac 521  Q
    ||||||||    
T  19658933 tcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 520
Target Start/End: Original strand, 44562923 - 44563427
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44562923 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 44563022  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44563023 cgggacaacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 44563122  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44563123 tctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 44563222  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataa 413  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  44563223 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatag 44563321  T
Q  414 accaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 513  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44563322 accaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagc 44563420  T
Q  514 tcccaga 520  Q
    |||||||    
T  44563421 tcccaga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 525
Target Start/End: Original strand, 9354444 - 9354956
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9354444 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 9354543  T
Q  114 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9354544 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 9354643  T
Q  214 tctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctccc 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9354644 tctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctccc 9354743  T
Q  314 aggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt-aaaaaagctcata 412  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  9354744 aagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcata 9354843  T
Q  413 aaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaag 512  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||    
T  9354844 gaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaag 9354943  T
Q  513 ctcccagacttga 525  Q
     ||| ||||||||    
T  9354944 ttcctagacttga 9354956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22081263 - 22080790
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcg--- 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||   |||||||       
T  22081263 catcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccg 22081167  T
Q  116 ggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||    | |||||| || |||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  22081166 ggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagca---acaaaccagacctacctttcctc 22081070  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
     |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22081069 cgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccag 22080970  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22080969 gttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgac 22080870  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 495  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080869 cagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 176 - 521
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244994
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaa 33244748  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33244749 ccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaagg 33244848  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  33244849 atgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaac 33244948  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 521  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33244949 cacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 38 - 524
Target Start/End: Original strand, 16283292 - 16283781
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16283292 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccatta 16283391  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16283392 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgc 16283491  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  16283492 tgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaa 16283591  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  16283592 tgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 16283691  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttg 524  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  16283692 agaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttg 16283781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27609250 - 27608787
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  27609250 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 27609151  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  27609150 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatag 27609051  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  27609050 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 27608951  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  27608950 catgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 27608851  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27608850 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27608787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 18710411 - 18710919
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |    
T  18710411 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 18710510  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa---gctagacctacctttcctct 216  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||| ||||||||   || ||||||||||| ||||| || |||   |||||||| || |||||||     
T  18710511 aacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcc 18710610  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||    
T  18710611 tataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaagg 18710710  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  18710711 ttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 18710810  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710811 aaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 18710910  T
Q  517 cagacttga 525  Q
    | |||||||    
T  18710911 cggacttga 18710919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 16277397 - 16277887
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16277397 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 16277496  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||    
T  16277497 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 16277596  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || || |||||     
T  16277597 tgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaa 16277696  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  16277697 tgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 16277796  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16277797 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16277887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 19687923 - 19688431
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| ||||||    
T  19687923 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtc 19688022  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||    | |||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || ||||     
T  19688023 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 19688122  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  19688123 gataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaagg 19688222  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | |    
T  19688223 ttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatc 19688322  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    ||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||    
T  19688323 aaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcc 19688422  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  19688423 tagacttga 19688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2137631 - 2137141
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2137631 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 2137532  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  2137531 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgc 2137432  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  2137431 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 2137332  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | || ||||    
T  2137331 tgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttg 2137232  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||    
T  2137231 agaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttga 2137141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 14557497 - 14557957
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  14557497 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 14557596  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagg 264  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||    
T  14557597 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagg 14557696  T
Q  265 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcat 364  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  14557697 gcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcat 14557796  T
Q  365 gatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatc 464  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  14557797 gatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatc 14557896  T
Q  465 ctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14557897 ctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 14557957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 31354394 - 31354857
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  31354394 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 31354493  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    | |  || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  ||    
T  31354494 aactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagag 31354593  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||    
T  31354594 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggt 31354693  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  31354694 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgaca 31354793  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  31354794 atccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttga 31354857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31490140 - 31489632
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  31490140 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 31490041  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| |||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || ||||     
T  31490040 aacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctcc 31489941  T
Q  217 gataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccagg 316  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  31489940 gataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaagg 31489841  T
Q  317 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 416  Q
    |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  31489840 ttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatc 31489741  T
Q  417 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 516  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||    
T  31489740 aagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 31489641  T
Q  517 cagacttga 525  Q
     ||||||||    
T  31489640 gagacttga 31489632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Original strand, 19674308 - 19674774
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  19674308 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 19674407  T
Q  165 agccaccagttcaac------aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttct 258  Q
    ||   || |||||||      |||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |     
T  19674408 agatgccggttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 19674507  T
Q  259 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 358  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |     
T  19674508 gagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgcctta 19674607  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcg 458  Q
    ||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  459 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 19674774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Original strand, 19286290 - 19286795
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| |||| |    
T  19286290 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 19286389  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgat 219  Q
    |||||||||| || || |||||| | | ||| ||  | ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| || |||||||  ||    
T  19286390 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctat 19286489  T
Q  220 accaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 319  Q
    ||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  19286490 acctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttc 19286589  T
Q  320 cattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaag 419  Q
       ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||    
T  19286590 aggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaag 19286689  T
Q  420 gaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccag 519  Q
    | ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||    
T  19286690 ggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctag 19286789  T
Q  520 acttga 525  Q
    ||||||    
T  19286790 acttga 19286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19208705 - 19208242
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  19208705 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 19208606  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  19208605 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 19208506  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  19208505 agggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 19208406  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  19208405 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 19208306  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  19208305 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 19208242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28362300 - 28361837
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  28362300 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 28362201  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  28362200 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 28362101  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||    
T  28362100 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggt 28362001  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    ||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  28362000 catgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 28361901  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  28361900 atcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 28361837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329389
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 3329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092606
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 12092606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 525
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829655
Alignment:
Q  198 ctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 297  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  298 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 397  Q
    | ||||||||||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29829527  T
Q  398 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 497  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  29829528 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 29829627  T
Q  498 aggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | || | |||||||||||| ||||||||    
T  29829628 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29829655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 33258707 - 33259056
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||    
T  33258707 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 33258806  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || ||    
T  33258807 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggg 33258906  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  33258907 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaat 33259006  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  33259007 catgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 33259056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 354 - 525
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189427
Alignment:
Q  354 ctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgt 453  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  454 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 189427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3329864 - 3329788
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  3329864 tctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 3329788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19518488 - 19518412
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  19518488 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 19518412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 29829183 - 29829259
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  29829183 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 29829259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 20240 - 20717
Alignment:
Q  23 aatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20240 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20339  T
Q  123 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20340 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaa---------------------caacagcagcaacaagctagacctacctttcccccgatacc 20418  T
Q  223 aatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20419 aatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgt 20518  T
Q  323 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  20519 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagg-a 20617  T
Q  423 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20618 aattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagact 20717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 30296 - 30785
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30296 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 30395  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  30396 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccta-ctttcctcctataccaatgttgtatgc 30494  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||  | || || ||  |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || ||     
T  30495 agaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaa 30594  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  30595 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30694  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30695 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 164 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 1
Alignment:
Q  164 cagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagag 263  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  264 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 363  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtca 113  T
Q  364 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaat 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112 tgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaat 13  T
Q  464 cctcttccgaat 475  Q
    ||||||||||||    
T  12 cctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 495
Target Start/End: Original strand, 21391 - 21864
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    ||  |||||    
T  21391 catcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggt 21490  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctga 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||  |  | | |||| ||   ||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  21491 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaacagca---gcaacaacaaaccagacctacctttcctccga 21587  T
Q  219 taccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggtt 318  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21588 taccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggtt 21687  T
Q  319 ccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaa 418  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||     
T  21688 ccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccag 21787  T
Q  419 ggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 495  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788 ggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 262 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1844
Alignment:
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagact 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 522
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6344
Alignment:
Q  260 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctg 358  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  |     
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgcctta 6179  T
Q  359 ggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt-gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctc 457  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| |||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||    
T  6180 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctc 6279  T
Q  458 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 522  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6280 gacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 525
Target Start/End: Original strand, 29614 - 30096
Alignment:
Q  46 gtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtc 145  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  29614 gtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaata 29713  T
Q  146 gttcagcaaatgcaacaacagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttac 242  Q
    | ||| || ||| ||||||||   || |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  29714 gctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgc 29813  T
Q  243 tcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgattt 342  Q
    | |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||    
T  29814 ttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattt 29913  T
Q  343 ccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaac 442  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||     
T  29914 ccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataat 30013  T
Q  443 ttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  30014 gtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttga 30096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40474 - 39992
Alignment:
Q  46 gtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtc 145  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  40474 gtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaatt 40375  T
Q  146 gttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttac 242  Q
    | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  40374 gctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgc 40275  T
Q  243 tcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgattt 342  Q
    | |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||   || || ||||| ||||||||    
T  40274 ttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattt 40175  T
Q  343 ccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaac 442  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  |||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||     
T  40174 ccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataat 40075  T
Q  443 ttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40074 gtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 39992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 46908
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||    
T  47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 47272  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||    
T  47271 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatag 47172  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  47171 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 47072  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  47071 catgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgaca 46972  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  46971 atcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 46908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 525
Target Start/End: Original strand, 27135 - 27625
Alignment:
Q  38 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtta 137  Q
    |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27135 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27234  T
Q  138 atgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaac---aacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgc 234  Q
    ||||  ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||    
T  27235 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgc 27334  T
Q  235 cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaag 334  Q
     ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||     
T  27335 tgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaa 27434  T
Q  335 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 434  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||||||  | || ||||    
T  27435 tgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttg 27534  T
Q  435 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27535 agaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 561 - 52
Alignment:
Q  20 atcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtc 119  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  561 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 462  T
Q  120 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctct 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||| ||||||||   || |||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||     
T  461 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctcc 362  T
Q  217 gataccaatgttgtatgc-cgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
    |||||| ||||| |||||   |||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  361 gataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaa 262  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  261 gttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgat 162  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  161 caaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctc 62  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  61 ctagacttga 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 338 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 541
Alignment:
Q  338 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 437  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  438 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    | ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| |||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttga 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 168 - 525
Target Start/End: Original strand, 9542 - 9899
Alignment:
Q  168 caccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggca 267  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||||||    
T  9542 caccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggca 9641  T
Q  268 ctgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgat 367  Q
     || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  9642 ttgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgat 9741  T
Q  368 gttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctc 467  Q
    || || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||    
T  9742 gtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctc 9841  T
Q  468 ttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9842 ttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 9899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 175
Target Start/End: Original strand, 8102 - 8212
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||  | ||||| |    
T  8102 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 8201  T
Q  165 agccaccagtt 175  Q
    |||| ||||||    
T  8202 agccgccagtt 8212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15362 - 14853
Alignment:
Q  19 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggt 118  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||     
T  15362 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 15263  T
Q  119 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctc 215  Q
    || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15262 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctc 15163  T
Q  216 tgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccag 315  Q
      ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  15162 ctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaag 15063  T
Q  316 gttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaac 415  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |     
T  15062 gttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgat 14963  T
Q  416 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 515  Q
    ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||    
T  14962 caagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctc 14863  T
Q  516 ccagacttga 525  Q
    | ||||||||    
T  14862 ctagacttga 14853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7625 - 7162
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  7625 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 7526  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagc---atcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    || | || |||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  7525 agacgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 7426  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  7425 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggt 7326  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  7325 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 7226  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  7225 atcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttga 7162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9452 - 8989
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaac 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| || ||||| |||||  | |  || || ||| ||||||    
T  9452 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 9353  T
Q  165 agccaccagttcaacaacaacagca---tcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcag 261  Q
    ||   || |||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||    
T  9352 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 9253  T
Q  262 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 361  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  9252 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggt 9153  T
Q  362 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgaca 461  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  9152 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgaca 9053  T
Q  462 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  9052 atcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Original strand, 19999 - 20348
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  19999 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 20098  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  20099 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 20198  T
Q  376 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 475  Q
     || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  20199 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaat 20298  T
Q  476 cacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    || || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  20299 catgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttga 20348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26474 - 26124
Alignment:
Q  176 caacaacaacagcatcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26474 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 26375  T
Q  276 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcc-caggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaag 374  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |    
T  26374 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagg 26275  T
Q  375 gatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaa 474  Q
    | || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  26274 ggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaa 26175  T
Q  475 tcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 525  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| ||||||||    
T  26174 tcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttga 26124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 525
Target Start/End: Original strand, 7966 - 8282
Alignment:
Q  209 tttcctctgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  7966 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 8065  T
Q  309 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagct 408  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  8066 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaact 8165  T
Q  409 cataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgag 508  Q
    |||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||    
T  8166 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 8265  T
Q  509 gaagctcccagacttga 525  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8266 gaagctcctagacttga 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7883
Alignment:
Q  65 tctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||    
T  7807 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgc 7883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 46981 - 46764
Alignment:
Q  278 agacagggcaa--gcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat-tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtc--atg-atgttg 371  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| |    
T  46981 agacagggcaaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcg 46882  T
Q  372 aaggatgc-tacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaaccttt--gagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctct 468  Q
    | || ||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||||     ||||  ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  46881 aggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctct 46782  T
Q  469 tccgaatcacgctgctgt 486  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  46781 tccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University