View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6865A_low_115 (Length: 285)

Name: NF6865A_low_115
Description: NF6865A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6865A_low_115
NF6865A_low_115
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (8-285)||(5853003-5853280)
chr8 (8-285)||(1484576-1484853)
chr8 (8-285)||(14409155-14409432)
chr8 (8-285)||(4542084-4542361)
chr8 (8-285)||(22001927-22002204)
chr8 (8-283)||(14823949-14824226)
chr8 (8-285)||(20045906-20046183)
chr8 (8-285)||(24485754-24486032)
chr8 (8-276)||(27472127-27472395)
chr8 (8-285)||(4483454-4483732)
chr8 (8-277)||(16413026-16413296)
chr8 (8-285)||(15070734-15071012)
chr8 (10-275)||(18677777-18678043)
chr8 (8-275)||(32121912-32122180)
chr8 (8-247)||(16401635-16401875)
chr8 (8-209)||(15202889-15203090)
chr8 (8-229)||(24048841-24049062)
chr8 (8-249)||(1326642-1326884)
chr8 (8-257)||(20403481-20403731)
chr8 (8-249)||(38549715-38549957)
chr8 (8-238)||(16198115-16198346)
chr8 (8-249)||(19936618-19936850)
chr8 (10-257)||(19896523-19896771)
chr8 (38-238)||(25657893-25658094)
chr8 (8-166)||(14397451-14397609)
chr8 (41-257)||(45290385-45290602)
chr8 (8-167)||(20403765-20403924)
chr8 (10-167)||(19896807-19896964)
chr8 (8-167)||(27471934-27472093)
chr8 (8-168)||(15202696-15202856)
chr8 (8-167)||(32122214-32122373)
chr8 (10-167)||(38549524-38549681)
chr8 (8-167)||(38549330-38549488)
chr8 (8-167)||(16401250-16401408)
chr8 (8-167)||(16401442-16401601)
chr8 (8-135)||(45290258-45290385)
chr8 (8-167)||(15071046-15071205)
chr8 (8-167)||(16412833-16412992)
chr8 (175-285)||(20403401-20403511)
chr8 (175-285)||(45290572-45290682)
chr8 (8-167)||(15202503-15202662)
chr8 (8-167)||(19897000-19897159)
chr8 (8-159)||(24049104-24049255)
chr8 (175-285)||(32810105-32810215)
chr8 (175-285)||(15203109-15203219)
chr8 (175-285)||(19896442-19896553)
chr8 (8-167)||(19936425-19936584)
chr8 (175-276)||(38549988-38550090)
chr8 (176-285)||(19936882-19936993)
chr8 (175-285)||(16401908-16402020)
chr8 (175-285)||(1326915-1327031)
chr8 (8-145)||(11361024-11361161)
chr8 (175-276)||(20982604-20982710)
chr8 (175-249)||(13425336-13425411)
chr8 (175-249)||(20982498-20982573)
chr8 (8-93)||(32810263-32810348)
chr8 (186-249)||(13425241-13425305)
chr8 (179-249)||(21513636-21513707)
chr8 (176-249)||(18815609-18815683)
chr8 (38-147)||(15319989-15320098)
chr8 (38-147)||(15500358-15500467)
chr8 (49-167)||(1484887-1485005)
chr8 (176-249)||(36733302-36733376)
chr8 (176-249)||(38988730-38988804)
chr8 (176-249)||(39019827-39019901)
chr8 (78-147)||(29759429-29759498)
chr8 (183-249)||(5083001-5083068)
chr8 (129-167)||(5852931-5852969)
chr8 (129-167)||(14409083-14409121)
chr8 (129-167)||(20045834-20045872)
chr8 (49-147)||(22007097-22007195)
chr8 (38-147)||(272164-272273)
chr8 (38-147)||(643576-643685)
chr8 (38-147)||(829382-829491)
chr8 (78-147)||(13663129-13663198)
chr8 (50-135)||(17150628-17150713)
chr8 (136-167)||(16401185-16401216)
chr8 (129-167)||(4483765-4483803)
chr8 (176-210)||(6573743-6573777)
chr8 (129-167)||(14824260-14824298)
chr8 (176-210)||(17438110-17438144)
chr8 (176-210)||(17979142-17979176)
chr8 (176-210)||(18819393-18819427)
chr8 (176-210)||(20517910-20517944)
chr8 (176-210)||(22207535-22207569)
chr8 (176-210)||(22258951-22258985)
chr8 (176-210)||(22355990-22356024)
chr8 (176-210)||(22473855-22473889)
chr8 (176-210)||(23669840-23669874)
chr8 (176-210)||(23669966-23670000)
chr8 (176-210)||(23670029-23670063)
chr8 (176-210)||(36405773-36405807)
chr8 (176-210)||(38988654-38988688)
chr8 (176-210)||(38988833-38988867)
chr8 (176-210)||(39019751-39019785)
chr8 (176-210)||(39019930-39019964)
chr8 (49-119)||(39364118-39364188)
chr8 (49-119)||(44522814-44522884)
chr8 (38-127)||(223305-223394)
chr8 (38-127)||(688076-688165)
chr8 (38-127)||(736928-737017)
chr8 (38-127)||(860823-860912)
chr8 (177-210)||(4381456-4381489)
chr8 (177-210)||(18817125-18817158)
chr8 (38-147)||(22089373-22089482)
chr8 (60-101)||(22449550-22449591)
chr8 (176-209)||(22473919-22473952)
chr8 (38-119)||(44477018-44477099)
chr8 (38-119)||(44480280-44480361)
chr8 (174-210)||(6573678-6573714)
chr8 (53-105)||(19866496-19866548)
[»] chr7 (113 HSPs)
chr7 (8-285)||(14948833-14949110)
chr7 (8-285)||(15376424-15376701)
chr7 (8-285)||(20384834-20385111)
chr7 (8-285)||(32125665-32125942)
chr7 (8-285)||(16410233-16410510)
chr7 (8-283)||(18640448-18640723)
chr7 (8-285)||(27217034-27217312)
chr7 (8-285)||(18430886-18431163)
chr7 (8-285)||(21189306-21189583)
chr7 (10-285)||(18627740-18628015)
chr7 (8-285)||(456495-456773)
chr7 (8-285)||(16232694-16232972)
chr7 (8-285)||(41523091-41523369)
chr7 (8-285)||(41525553-41525831)
chr7 (8-283)||(26355692-26355969)
chr7 (8-283)||(26358144-26358421)
chr7 (8-285)||(13869522-13869800)
chr7 (8-285)||(24702412-24702680)
chr7 (8-285)||(24704859-24705127)
chr7 (8-277)||(11303429-11303699)
chr7 (8-277)||(16213866-16214136)
chr7 (52-285)||(11393041-11393275)
chr7 (8-249)||(8940489-8940735)
chr7 (8-249)||(14269667-14269909)
chr7 (8-249)||(15081552-15081794)
chr7 (8-277)||(16108399-16108669)
chr7 (8-277)||(23664663-23664933)
chr7 (8-277)||(29796790-29797062)
chr7 (8-277)||(29800609-29800881)
chr7 (8-249)||(8468945-8469187)
chr7 (10-257)||(11972750-11972998)
chr7 (8-247)||(45847365-45847605)
chr7 (68-209)||(13841305-13841446)
chr7 (8-167)||(14156789-14156944)
chr7 (8-167)||(8940769-8940927)
chr7 (8-167)||(10501104-10501263)
chr7 (8-167)||(14269281-14269440)
chr7 (8-167)||(38897745-38897904)
chr7 (8-166)||(25926840-25926998)
chr7 (8-166)||(1856940-1857097)
chr7 (15-167)||(14156603-14156755)
chr7 (8-166)||(13918113-13918272)
chr7 (8-167)||(14269474-14269633)
chr7 (8-167)||(16214170-16214329)
chr7 (175-285)||(14269940-14270050)
chr7 (8-161)||(15081359-15081512)
chr7 (8-167)||(8940962-8941121)
chr7 (8-167)||(21189113-21189272)
chr7 (175-285)||(11972670-11972780)
chr7 (15-134)||(10500945-10501064)
chr7 (10-167)||(17985097-17985254)
chr7 (175-285)||(15081825-15081937)
chr7 (175-285)||(38898106-38898218)
chr7 (175-285)||(8940346-8940458)
chr7 (201-285)||(8468814-8468898)
chr7 (201-285)||(13841186-13841270)
chr7 (49-167)||(45847213-45847331)
chr7 (175-276)||(45847638-45847739)
chr7 (170-249)||(38897995-38898075)
chr7 (80-168)||(11310239-11310327)
chr7 (8-70)||(23461802-23461864)
chr7 (176-254)||(13745569-13745648)
chr7 (175-249)||(15119918-15119993)
chr7 (8-82)||(11310133-11310206)
chr7 (49-167)||(15376272-15376390)
chr7 (49-167)||(20384682-20384800)
chr7 (50-147)||(11286976-11287073)
chr7 (176-225)||(9743795-9743845)
chr7 (129-167)||(16410544-16410582)
chr7 (129-167)||(18628051-18628089)
chr7 (129-167)||(18640757-18640795)
chr7 (38-76)||(20110741-20110779)
chr7 (129-167)||(26355620-26355658)
chr7 (129-167)||(26358072-26358110)
chr7 (78-147)||(125965-126034)
chr7 (38-147)||(7822013-7822122)
chr7 (38-147)||(7829324-7829433)
chr7 (38-147)||(27102512-27102621)
chr7 (38-147)||(27109860-27109969)
chr7 (38-147)||(27175705-27175814)
chr7 (38-147)||(38784604-38784713)
chr7 (176-223)||(25941523-25941571)
chr7 (176-239)||(38294567-38294631)
chr7 (175-210)||(20619574-20619609)
chr7 (176-210)||(8473053-8473087)
chr7 (176-210)||(8514393-8514427)
chr7 (176-210)||(8851889-8851923)
chr7 (49-127)||(10000996-10001074)
chr7 (129-167)||(13869833-13869871)
chr7 (176-210)||(14153622-14153656)
chr7 (176-210)||(15119972-15120006)
chr7 (176-210)||(15576619-15576653)
chr7 (129-167)||(27217346-27217384)
chr7 (176-210)||(33556906-33556940)
chr7 (176-210)||(33556968-33557002)
chr7 (176-210)||(36301549-36301583)
chr7 (176-210)||(37538497-37538531)
chr7 (176-210)||(37538651-37538685)
chr7 (176-210)||(43747765-43747799)
chr7 (176-210)||(48213658-48213692)
chr7 (177-210)||(4691559-4691592)
chr7 (38-119)||(10896371-10896452)
chr7 (176-209)||(13745506-13745539)
chr7 (177-210)||(15576494-15576527)
chr7 (177-210)||(20253005-20253038)
chr7 (38-107)||(23664500-23664569)
chr7 (50-119)||(29004416-29004485)
chr7 (177-210)||(43747828-43747861)
chr7 (8-36)||(11393010-11393038)
chr7 (174-206)||(14153671-14153703)
chr7 (176-208)||(15576556-15576588)
chr7 (51-135)||(15951607-15951691)
chr7 (176-239)||(43747672-43747736)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (8-285)||(21923002-21923279)
chr1 (8-285)||(13989040-13989317)
chr1 (8-285)||(21474797-21475075)
chr1 (8-277)||(21840949-21841218)
chr1 (8-277)||(15859719-15859988)
chr1 (8-277)||(16362100-16362370)
chr1 (8-277)||(23593444-23593714)
chr1 (9-249)||(16274967-16275209)
chr1 (8-257)||(29776942-29777192)
chr1 (8-257)||(31612567-31612817)
chr1 (8-209)||(29298492-29298693)
chr1 (8-239)||(27161297-27161529)
chr1 (8-252)||(22122725-22122970)
chr1 (8-194)||(29535317-29535503)
chr1 (8-194)||(13227129-13227315)
chr1 (8-257)||(22050547-22050797)
chr1 (8-167)||(15859513-15859672)
chr1 (8-167)||(31612851-31613010)
chr1 (8-167)||(29298727-29298886)
chr1 (8-167)||(31613044-31613203)
chr1 (175-285)||(29776862-29776972)
chr1 (8-160)||(9044715-9044867)
chr1 (8-167)||(29777226-29777385)
chr1 (175-285)||(29298310-29298420)
chr1 (8-157)||(40129387-40129536)
chr1 (8-167)||(22122531-22122691)
chr1 (8-167)||(16274773-16274932)
chr1 (175-285)||(16275240-16275351)
chr1 (175-274)||(22050767-22050866)
chr1 (175-285)||(22122945-22123055)
chr1 (175-285)||(31612487-31612597)
chr1 (8-167)||(16401407-16401566)
chr1 (22-167)||(27161118-27161263)
chr1 (8-92)||(43543269-43543353)
chr1 (176-263)||(27161518-27161605)
chr1 (97-167)||(10812612-10812682)
chr1 (49-167)||(13989351-13989469)
chr1 (8-108)||(10812716-10812816)
chr1 (51-147)||(21650883-21650979)
chr1 (49-147)||(21858592-21858690)
chr1 (175-209)||(29298439-29298473)
chr1 (243-285)||(43543225-43543267)
chr1 (176-256)||(12710130-12710211)
chr1 (38-147)||(17003909-17004018)
chr1 (176-223)||(22824136-22824184)
chr1 (8-107)||(16401274-16401373)
chr1 (40-119)||(18060577-18060656)
chr1 (176-211)||(44891752-44891787)
chr1 (176-210)||(7321576-7321610)
chr1 (176-210)||(7321639-7321673)
chr1 (176-210)||(18120834-18120868)
chr1 (137-167)||(21474733-21474763)
chr1 (176-210)||(24720419-24720453)
chr1 (49-147)||(44035830-44035928)
chr1 (176-210)||(50544144-50544178)
chr1 (177-210)||(6833570-6833603)
chr1 (8-53)||(43630299-43630344)
chr1 (177-210)||(50544207-50544240)
chr1 (176-223)||(21244669-21244717)
chr1 (51-119)||(24815242-24815310)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (8-285)||(134385-134662)
scaffold0028 (8-285)||(136854-137131)
scaffold0028 (8-285)||(139323-139600)
scaffold0028 (8-285)||(141792-142069)
scaffold0028 (8-285)||(144261-144538)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (8-285)||(18334303-18334580)
chr6 (8-285)||(24422721-24422998)
chr6 (8-285)||(33861968-33862245)
chr6 (8-285)||(33864452-33864729)
chr6 (8-285)||(2290891-2291168)
chr6 (8-285)||(1540622-1540899)
chr6 (8-285)||(12742491-12742769)
chr6 (8-285)||(19858633-19858907)
chr6 (8-285)||(8055203-8055481)
chr6 (8-285)||(26924351-26924628)
chr6 (8-250)||(1598266-1598508)
chr6 (8-277)||(30676420-30676690)
chr6 (8-277)||(34963555-34963825)
chr6 (8-285)||(22782401-22782678)
chr6 (8-256)||(19847682-19847927)
chr6 (8-277)||(28289047-28289315)
chr6 (8-277)||(25688684-25688954)
chr6 (8-256)||(23992626-23992874)
chr6 (26-263)||(17377576-17377814)
chr6 (8-249)||(18914142-18914384)
chr6 (8-249)||(31630251-31630493)
chr6 (8-277)||(12942383-12942641)
chr6 (8-249)||(19005361-19005603)
chr6 (8-225)||(25535641-25535859)
chr6 (8-167)||(1875-2034)
chr6 (8-167)||(8834-8993)
chr6 (8-167)||(1598542-1598701)
chr6 (8-163)||(26924158-26924313)
chr6 (8-167)||(19005637-19005796)
chr6 (8-167)||(19847489-19847648)
chr6 (8-163)||(18914615-18914770)
chr6 (8-166)||(27557016-27557174)
chr6 (8-167)||(25688988-25689147)
chr6 (8-167)||(30676227-30676386)
chr6 (8-166)||(23415258-23415416)
chr6 (8-120)||(15892119-15892231)
chr6 (175-285)||(18914001-18914111)
chr6 (175-285)||(19005220-19005330)
chr6 (10-167)||(85-242)
chr6 (18-163)||(18914422-18914567)
chr6 (10-167)||(31630060-31630217)
chr6 (8-167)||(1598735-1598894)
chr6 (175-276)||(31630524-31630626)
chr6 (175-285)||(15875480-15875590)
chr6 (8-105)||(17883208-17883305)
chr6 (38-167)||(25689181-25689310)
chr6 (124-249)||(15875621-15875737)
chr6 (48-167)||(25737128-25737247)
chr6 (8-74)||(25737028-25737094)
chr6 (223-285)||(18937259-18937321)
chr6 (77-167)||(22981326-22981416)
chr6 (77-167)||(23806992-23807082)
chr6 (192-277)||(25656811-25656897)
chr6 (10-66)||(9029-9085)
chr6 (49-167)||(18334151-18334269)
chr6 (49-147)||(19984130-19984228)
chr6 (49-167)||(24423032-24423150)
chr6 (176-249)||(35056707-35056781)
chr6 (38-147)||(16240296-16240405)
chr6 (38-147)||(16556945-16557054)
chr6 (38-147)||(16633501-16633610)
chr6 (38-147)||(16650175-16650284)
chr6 (38-147)||(25904474-25904584)
chr6 (176-233)||(32259078-32259136)
chr6 (129-167)||(33864763-33864801)
chr6 (49-147)||(35016015-35016113)
chr6 (38-147)||(10487971-10488080)
chr6 (38-147)||(16377248-16377357)
chr6 (38-147)||(16384572-16384681)
chr6 (38-127)||(27654597-27654686)
chr6 (245-285)||(1595723-1595763)
chr6 (8-44)||(22981450-22981486)
chr6 (8-44)||(23806922-23806958)
chr6 (175-210)||(18928117-18928152)
chr6 (49-147)||(22226580-22226679)
chr6 (137-167)||(2290827-2290857)
chr6 (176-210)||(10445379-10445413)
chr6 (176-210)||(13284937-13284971)
chr6 (176-210)||(20411319-20411353)
chr6 (176-210)||(20411382-20411416)
chr6 (49-127)||(21776107-21776185)
chr6 (129-167)||(22782712-22782750)
chr6 (175-220)||(25920948-25920994)
chr6 (129-167)||(26924086-26924124)
chr6 (176-210)||(29044491-29044525)
chr6 (176-210)||(35056631-35056665)
chr6 (176-210)||(35056694-35056728)
chr6 (78-119)||(16133087-16133128)
chr6 (38-119)||(18455449-18455530)
chr6 (46-147)||(22593590-22593691)
chr6 (49-93)||(10905416-10905460)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (8-285)||(10732651-10732928)
chr5 (8-285)||(20909186-20909463)
chr5 (8-285)||(39245310-39245587)
chr5 (8-285)||(264479-264756)
chr5 (8-285)||(42245076-42245353)
chr5 (8-285)||(29346154-29346431)
chr5 (8-285)||(29348627-29348904)
chr5 (8-285)||(29351100-29351377)
chr5 (8-275)||(17516874-17517142)
chr5 (8-285)||(38619610-38619888)
chr5 (8-256)||(2154342-2154591)
chr5 (8-285)||(39363558-39363836)
chr5 (8-249)||(20901631-20901873)
chr5 (8-285)||(23064687-23064965)
chr5 (8-277)||(37804613-37804883)
chr5 (9-209)||(20917558-20917758)
chr5 (8-257)||(32027647-32027897)
chr5 (8-209)||(29330234-29330434)
chr5 (38-277)||(9776540-9776780)
chr5 (8-167)||(20901438-20901597)
chr5 (8-167)||(17516488-17516647)
chr5 (10-167)||(17516683-17516840)
chr5 (8-167)||(295985-296144)
chr5 (8-167)||(2154149-2154308)
chr5 (8-167)||(32028318-32028477)
chr5 (8-167)||(32028511-32028670)
chr5 (175-285)||(32027567-32027677)
chr5 (8-167)||(32028124-32028284)
chr5 (8-167)||(295792-295951)
chr5 (175-285)||(20917830-20917940)
chr5 (8-167)||(20917364-20917523)
chr5 (8-167)||(29330468-29330627)
chr5 (175-279)||(29330111-29330215)
chr5 (8-167)||(32027931-32028090)
chr5 (175-256)||(20901904-20901986)
chr5 (179-249)||(18743965-18744036)
chr5 (49-147)||(27183180-27183278)
chr5 (38-147)||(22883904-22884013)
chr5 (176-249)||(1628169-1628243)
chr5 (38-135)||(43444009-43444106)
chr5 (129-167)||(264407-264445)
chr5 (129-167)||(20909497-20909535)
chr5 (175-209)||(20917777-20917811)
chr5 (129-167)||(39245621-39245659)
chr5 (129-167)||(39363869-39363907)
chr5 (38-127)||(11923-12012)
chr5 (78-147)||(1220384-1220453)
chr5 (78-147)||(10778832-10778901)
chr5 (38-147)||(21933243-21933352)
chr5 (38-147)||(21939413-21939522)
chr5 (38-127)||(25426197-25426286)
chr5 (38-147)||(35581340-35581449)
chr5 (38-147)||(36990639-36990748)
chr5 (178-249)||(21399896-21399968)
chr5 (38-145)||(7424879-7424986)
chr5 (175-210)||(8833821-8833856)
chr5 (175-210)||(21503315-21503350)
chr5 (49-167)||(23064999-23065117)
chr5 (175-210)||(26761795-26761830)
chr5 (49-124)||(31478959-31479034)
chr5 (176-210)||(8833885-8833919)
chr5 (176-210)||(14026596-14026630)
chr5 (176-210)||(14026659-14026693)
chr5 (176-210)||(16062683-16062717)
chr5 (176-210)||(16062844-16062878)
chr5 (176-210)||(18743839-18743873)
chr5 (176-210)||(20198318-20198352)
chr5 (176-210)||(21399796-21399830)
chr5 (176-210)||(26749355-26749389)
chr5 (176-210)||(26749418-26749452)
chr5 (176-210)||(30611368-30611402)
chr5 (177-210)||(1628044-1628077)
chr5 (50-127)||(11342210-11342287)
chr5 (38-119)||(19511781-19511862)
chr5 (176-209)||(21399733-21399766)
chr5 (38-119)||(22367095-22367176)
chr5 (176-209)||(24067290-24067323)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (8-285)||(15118063-15118340)
chr4 (8-285)||(50222050-50222327)
chr4 (8-285)||(44615462-44615740)
chr4 (10-285)||(44772796-44773075)
chr4 (8-285)||(1837230-1837497)
chr4 (8-285)||(7640897-7641180)
chr4 (8-277)||(14970417-14970687)
chr4 (8-277)||(15534363-15534633)
chr4 (8-277)||(3515189-3515459)
chr4 (8-249)||(52872783-52873025)
chr4 (8-242)||(29267570-29267805)
chr4 (8-277)||(36038052-36038322)
chr4 (8-285)||(49547484-49547762)
chr4 (8-249)||(362390-362632)
chr4 (8-277)||(19242882-19243152)
chr4 (8-209)||(11965-12166)
chr4 (8-277)||(14048759-14049029)
chr4 (8-249)||(19617777-19618019)
chr4 (8-257)||(52312764-52313013)
chr4 (11-249)||(15495887-15496126)
chr4 (8-249)||(14746222-14746464)
chr4 (9-249)||(19857798-19858029)
chr4 (129-285)||(18239251-18239407)
chr4 (8-167)||(52872590-52872749)
chr4 (8-165)||(362668-362825)
chr4 (8-167)||(14746029-14746188)
chr4 (8-167)||(19858064-19858223)
chr4 (8-167)||(14970224-14970383)
chr4 (8-167)||(18214721-18214880)
chr4 (8-167)||(19617584-19617743)
chr4 (8-167)||(362859-363018)
chr4 (8-167)||(3515493-3515652)
chr4 (8-167)||(52313240-52313399)
chr4 (121-249)||(18214992-18215121)
chr4 (175-282)||(12185-12292)
chr4 (175-285)||(15355202-15355312)
chr4 (33-167)||(15495716-15495850)
chr4 (175-285)||(18215152-18215262)
chr4 (175-285)||(52312684-52312794)
chr4 (8-167)||(52313047-52313206)
chr4 (175-285)||(15496949-15497059)
chr4 (175-285)||(52873056-52873166)
chr4 (175-277)||(19618050-19618152)
chr4 (8-186)||(30147189-30147367)
chr4 (147-249)||(15355068-15355171)
chr4 (57-167)||(14185621-14185731)
chr4 (175-285)||(14746495-14746607)
chr4 (201-276)||(362268-362343)
chr4 (175-257)||(19857684-19857767)
chr4 (8-74)||(12778393-12778459)
chr4 (49-167)||(22725284-22725401)
chr4 (8-59)||(18214914-18214965)
chr4 (8-70)||(14185525-14185587)
chr4 (50-147)||(14951270-14951367)
chr4 (97-163)||(14745925-14745991)
chr4 (38-147)||(14995644-14995753)
chr4 (49-145)||(55377197-55377293)
chr4 (8-67)||(22725435-22725494)
chr4 (49-167)||(15117911-15118029)
chr4 (49-147)||(25120046-25120144)
chr4 (46-147)||(43281694-43281795)
chr4 (8-59)||(15489666-15489717)
chr4 (38-135)||(16731688-16731785)
chr4 (38-127)||(18247759-18247848)
chr4 (130-167)||(44772723-44772760)
chr4 (38-127)||(47357203-47357292)
chr4 (49-167)||(7640745-7640863)
chr4 (175-210)||(9923590-9923625)
chr4 (38-145)||(15287859-15287966)
chr4 (38-145)||(15294969-15295076)
chr4 (175-210)||(25513031-25513066)
chr4 (49-147)||(5683367-5683465)
chr4 (176-210)||(10272792-10272826)
chr4 (176-210)||(12622676-12622710)
chr4 (176-210)||(13164410-13164444)
chr4 (176-210)||(13164522-13164556)
chr4 (176-210)||(14508054-14508088)
chr4 (176-210)||(15041855-15041889)
chr4 (176-210)||(15112535-15112569)
chr4 (49-127)||(22355071-22355149)
chr4 (176-210)||(25512938-25512972)
chr4 (176-210)||(26922468-26922502)
chr4 (176-210)||(46740440-46740474)
chr4 (176-210)||(46740566-46740600)
chr4 (176-210)||(55582552-55582586)
chr4 (38-119)||(630280-630361)
chr4 (38-127)||(10643766-10643855)
chr4 (50-87)||(18218875-18218912)
chr4 (244-285)||(19857618-19857659)
chr4 (176-209)||(26445174-26445207)
chr4 (177-210)||(35660201-35660234)
chr4 (176-209)||(40229671-40229704)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (8-285)||(17463352-17463629)
chr3 (8-285)||(34159500-34159777)
chr3 (8-285)||(55476665-55476942)
chr3 (8-285)||(16453991-16454269)
chr3 (8-285)||(6468845-6469122)
chr3 (8-285)||(15977707-15977984)
chr3 (8-285)||(13153966-13154243)
chr3 (8-285)||(10247434-10247711)
chr3 (8-285)||(13544199-13544475)
chr3 (8-285)||(45606617-45606895)
chr3 (8-285)||(12567734-12568011)
chr3 (8-285)||(7781057-7781335)
chr3 (8-285)||(28848332-28848599)
chr3 (8-285)||(13151501-13151778)
chr3 (8-275)||(46822445-46822713)
chr3 (8-277)||(27165434-27165704)
chr3 (8-277)||(53301214-53301484)
chr3 (8-285)||(8499694-8499972)
chr3 (8-285)||(15412605-15412883)
chr3 (8-277)||(54521004-54521274)
chr3 (8-276)||(10557091-10557360)
chr3 (8-249)||(12119364-12119606)
chr3 (8-238)||(13436520-13436751)
chr3 (8-257)||(41124141-41124391)
chr3 (8-257)||(38961548-38961799)
chr3 (8-257)||(17444474-17444724)
chr3 (8-277)||(29544552-29544822)
chr3 (8-209)||(16282468-16282669)
chr3 (8-209)||(25237094-25237295)
chr3 (8-225)||(24513910-24514128)
chr3 (8-209)||(25229507-25229708)
chr3 (8-184)||(20629902-20630078)
chr3 (89-277)||(12305327-12305516)
chr3 (8-174)||(10379613-10379779)
chr3 (8-167)||(41124425-41124584)
chr3 (8-166)||(15465448-15465606)
chr3 (8-167)||(27165738-27165897)
chr3 (8-167)||(46822747-46822906)
chr3 (8-167)||(53301021-53301180)
chr3 (8-167)||(55319014-55319173)
chr3 (8-166)||(26054975-26055133)
chr3 (38-167)||(14567432-14567561)
chr3 (8-167)||(38961355-38961514)
chr3 (8-166)||(5223677-5223835)
chr3 (8-164)||(8500009-8500165)
chr3 (20-167)||(10557394-10557541)
chr3 (8-167)||(55318821-55318980)
chr3 (175-285)||(16282689-16282799)
chr3 (8-167)||(13937490-13937649)
chr3 (8-167)||(20629709-20629868)
chr3 (175-285)||(8899268-8899378)
chr3 (175-285)||(41124061-41124171)
chr3 (175-285)||(38961769-38961879)
chr3 (10-167)||(16282277-16282434)
chr3 (175-285)||(9707484-9707595)
chr3 (8-167)||(17444281-17444440)
chr3 (46-168)||(36528447-36528569)
chr3 (175-254)||(17444694-17444773)
chr3 (175-285)||(11913928-11914040)
chr3 (23-167)||(17393201-17393345)
chr3 (57-167)||(16358234-16358344)
chr3 (175-241)||(25237009-25237075)
chr3 (8-88)||(16358378-16358458)
chr3 (60-168)||(3264323-3264431)
chr3 (18-91)||(15007868-15007941)
chr3 (8-74)||(36528348-36528414)
chr3 (22-68)||(10555766-10555812)
chr3 (103-167)||(15007988-15008052)
chr3 (8-67)||(8899418-8899477)
chr3 (8-57)||(12305525-12305574)
chr3 (38-159)||(25058286-25058407)
chr3 (176-249)||(25201323-25201397)
chr3 (49-167)||(34159811-34159929)
chr3 (51-147)||(16934824-16934920)
chr3 (49-167)||(55476976-55477094)
chr3 (8-66)||(14567595-14567653)
chr3 (176-233)||(15025934-15025992)
chr3 (129-167)||(17463663-17463701)
chr3 (49-147)||(49231768-49231866)
chr3 (77-147)||(51158683-51158753)
chr3 (38-147)||(1468614-1468723)
chr3 (38-127)||(14528625-14528714)
chr3 (175-239)||(17044330-17044395)
chr3 (176-220)||(18700200-18700245)
chr3 (8-74)||(3264464-3264530)
chr3 (129-167)||(6468773-6468811)
chr3 (129-167)||(15412916-15412954)
chr3 (176-210)||(17207567-17207601)
chr3 (176-210)||(25201247-25201281)
chr3 (176-210)||(50351882-50351916)
chr3 (176-209)||(3528206-3528239)
chr3 (38-127)||(8276474-8276563)
chr3 (38-119)||(16979504-16979585)
chr3 (38-119)||(18889958-18890039)
chr3 (50-147)||(30152450-30152547)
chr3 (177-210)||(50351664-50351697)
chr3 (177-210)||(54330969-54331002)
chr3 (176-208)||(17207632-17207664)
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (8-285)||(18809117-18809394)
chr2 (8-285)||(23711724-23712001)
chr2 (8-285)||(26505553-26505830)
chr2 (8-285)||(26508031-26508308)
chr2 (8-285)||(28577273-28577550)
chr2 (8-285)||(24897906-24898183)
chr2 (8-285)||(24905343-24905620)
chr2 (8-285)||(24900389-24900666)
chr2 (8-285)||(24902866-24903143)
chr2 (8-285)||(24907818-24908095)
chr2 (8-285)||(39682487-39682765)
chr2 (8-285)||(23709243-23709520)
chr2 (8-285)||(571571-571849)
chr2 (8-285)||(23131036-23131314)
chr2 (8-285)||(23133503-23133781)
chr2 (8-285)||(23135764-23136031)
chr2 (8-285)||(34402232-34402510)
chr2 (8-277)||(20261401-20261671)
chr2 (8-285)||(32039209-32039486)
chr2 (8-233)||(45027615-45027840)
chr2 (8-249)||(23706927-23707169)
chr2 (8-249)||(24671235-24671477)
chr2 (8-249)||(24642459-24642701)
chr2 (8-249)||(24681654-24681896)
chr2 (8-249)||(24918350-24918592)
chr2 (8-249)||(38967689-38967931)
chr2 (8-209)||(24368077-24368278)
chr2 (8-277)||(32214641-32214901)
chr2 (10-256)||(24529259-24529506)
chr2 (8-257)||(6726249-6726499)
chr2 (8-257)||(41523783-41524033)
chr2 (8-277)||(10684473-10684745)
chr2 (8-209)||(21154718-21154919)
chr2 (8-209)||(22105716-22105917)
chr2 (60-275)||(25616365-25616581)
chr2 (8-145)||(23931775-23931912)
chr2 (8-167)||(22105951-22106110)
chr2 (8-163)||(41523397-41523552)
chr2 (8-167)||(41523590-41523749)
chr2 (8-167)||(24529064-24529223)
chr2 (8-167)||(21154525-21154684)
chr2 (8-167)||(24368312-24368471)
chr2 (8-167)||(24918626-24918785)
chr2 (175-285)||(6726169-6726279)
chr2 (175-285)||(38967548-38967658)
chr2 (8-164)||(23931949-23932105)
chr2 (8-167)||(6726533-6726692)
chr2 (8-167)||(23709050-23709209)
chr2 (10-165)||(32214449-32214604)
chr2 (179-285)||(21154942-21155048)
chr2 (8-167)||(21154332-21154491)
chr2 (8-167)||(23706543-23706702)
chr2 (8-167)||(24681930-24682089)
chr2 (175-285)||(22105587-22105697)
chr2 (8-162)||(23706735-23706889)
chr2 (175-285)||(24367948-24368058)
chr2 (8-165)||(45027422-45027579)
chr2 (11-167)||(24671511-24671667)
chr2 (175-285)||(23707200-23707312)
chr2 (175-285)||(24642732-24642844)
chr2 (175-285)||(24918207-24918319)
chr2 (178-285)||(24671092-24671201)
chr2 (175-263)||(24681535-24681623)
chr2 (8-69)||(31345570-31345631)
chr2 (102-166)||(31345490-31345554)
chr2 (227-283)||(45029784-45029840)
chr2 (176-249)||(21368365-21368439)
chr2 (49-167)||(18809428-18809546)
chr2 (176-249)||(23799457-23799531)
chr2 (175-217)||(41524003-41524045)
chr2 (46-147)||(67339-67440)
chr2 (78-159)||(16900803-16900884)
chr2 (78-159)||(16994194-16994275)
chr2 (181-257)||(22686144-22686221)
chr2 (38-147)||(24686598-24686707)
chr2 (115-167)||(24642373-24642425)
chr2 (129-167)||(23131347-23131385)
chr2 (129-167)||(23711652-23711690)
chr2 (129-167)||(26505864-26505902)
chr2 (129-167)||(26508342-26508380)
chr2 (129-167)||(27920403-27920441)
chr2 (49-167)||(28577584-28577702)
chr2 (129-167)||(32039137-32039175)
chr2 (129-167)||(34402161-34402199)
chr2 (38-147)||(11232213-11232322)
chr2 (38-127)||(19887275-19887364)
chr2 (38-147)||(22514060-22514169)
chr2 (38-147)||(27261332-27261441)
chr2 (38-147)||(28776662-28776771)
chr2 (78-147)||(34823750-34823819)
chr2 (51-147)||(12727711-12727807)
chr2 (176-223)||(22686062-22686110)
chr2 (137-167)||(571883-571913)
chr2 (176-210)||(1384411-1384445)
chr2 (176-210)||(20915475-20915509)
chr2 (176-210)||(21316436-21316470)
chr2 (176-210)||(21336329-21336363)
chr2 (176-210)||(21368352-21368386)
chr2 (176-210)||(22690051-22690085)
chr2 (176-210)||(22694647-22694681)
chr2 (129-167)||(23133814-23133852)
chr2 (176-210)||(25587416-25587450)
chr2 (176-210)||(36736894-36736928)
chr2 (137-167)||(39682799-39682829)
chr2 (177-210)||(1384349-1384382)
chr2 (38-119)||(6483113-6483194)
chr2 (38-119)||(21081348-21081429)
chr2 (176-209)||(28345851-28345884)
chr2 (131-167)||(23708980-23709016)
chr2 (49-109)||(34135059-34135119)
chr2 (49-93)||(44584588-44584632)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (8-285)||(94585-94862)
scaffold0023 (8-277)||(17150-17420)
scaffold0023 (8-167)||(16957-17116)
scaffold0023 (49-167)||(94896-95014)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (8-285)||(6121-6398)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (8-285)||(40574-40851)
scaffold0044 (38-159)||(37848-37968)
scaffold0044 (129-167)||(40885-40923)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (8-285)||(14121-14399)
scaffold0230 (8-250)||(23241-23484)
scaffold0230 (8-167)||(22888-23047)
scaffold0230 (81-167)||(23121-23207)
scaffold0230 (9-51)||(20722-20764)
scaffold0230 (8-45)||(23081-23118)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (8-285)||(37995-38273)
scaffold0134 (49-167)||(38307-38425)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-285)||(20921-21193)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (8-285)||(13566-13844)
scaffold0444 (129-167)||(13878-13916)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (8-277)||(9424-9693)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (8-277)||(4876-5146)
scaffold0716 (8-167)||(5180-5339)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (8-285)||(4013-4293)
scaffold0741 (8-167)||(3820-3979)
scaffold0741 (8-163)||(3627-3782)
scaffold0741 (115-167)||(3541-3593)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (8-277)||(11470-11741)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (8-277)||(3205-3475)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (8-249)||(234-476)
scaffold0494 (175-249)||(507-582)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (8-263)||(6646-6902)
scaffold0317 (8-167)||(6453-6612)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (8-250)||(416-659)
scaffold1792 (8-167)||(853-1012)
scaffold1792 (81-167)||(693-779)
scaffold1792 (8-45)||(782-819)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (8-249)||(30229-30471)
scaffold0149 (8-167)||(30505-30664)
scaffold0149 (177-256)||(30116-30196)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (8-249)||(10001-10243)
scaffold0043 (10-167)||(10277-10434)
scaffold0043 (8-167)||(10470-10629)
scaffold0043 (175-209)||(9936-9970)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (8-249)||(799-1041)
scaffold0747 (18-167)||(1075-1224)
scaffold0747 (175-285)||(656-768)
scaffold0747 (8-135)||(1227-1353)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (8-238)||(6682-6903)
scaffold0574 (8-167)||(6937-7096)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (8-200)||(42999-43191)
scaffold0040 (50-241)||(13379-13571)
scaffold0040 (8-167)||(43225-43384)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (30-285)||(15094-15352)
scaffold0306 (8-214)||(11050-11256)
scaffold0306 (8-167)||(10857-11016)
scaffold0306 (8-167)||(15398-15556)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (38-285)||(53612-53862)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (8-277)||(38366-38636)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (57-277)||(1610-1831)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (90-277)||(10955-11142)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (8-203)||(7996-8191)
scaffold0278 (8-167)||(8225-8384)
scaffold0278 (8-164)||(8421-8577)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (8-194)||(68227-68413)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-285)||(501258-501516)
scaffold0001 (8-167)||(501550-501709)
scaffold0001 (49-105)||(139589-139645)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (8-167)||(1740-1899)
scaffold1296 (8-74)||(1640-1706)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (8-166)||(31497-31655)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (8-167)||(18423-18582)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (77-232)||(57708-57864)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (8-166)||(33465-33623)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (8-166)||(17947-18105)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (8-167)||(8311-8470)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (16-166)||(7408-7558)
scaffold0711 (8-167)||(7208-7367)
scaffold0711 (77-165)||(7084-7172)
scaffold0711 (8-36)||(7593-7621)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (175-285)||(27963-28073)
scaffold0114 (111-257)||(28043-28190)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (8-166)||(39626-39784)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (8-166)||(19799-19957)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (41-167)||(36749-36875)
scaffold0151 (8-167)||(36909-37068)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (175-285)||(10765-10875)
scaffold0513 (163-249)||(10647-10734)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (175-285)||(15150-15262)
scaffold0106 (151-249)||(15030-15119)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (187-285)||(35955-36054)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (175-285)||(1204-1316)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (175-256)||(9934-10016)
scaffold0145 (177-238)||(10005-10067)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (8-74)||(75615-75681)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-159)||(113317-113468)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (38-147)||(6196-6305)
scaffold0335 (175-210)||(1098-1133)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (38-147)||(8566-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (38-147)||(30470-30579)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (176-254)||(15282-15361)
scaffold0174 (182-239)||(15350-15408)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (177-239)||(16263-16326)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (8-74)||(405-471)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (38-147)||(725-834)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (49-147)||(6941-7039)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (77-147)||(12520-12590)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (49-147)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (49-147)||(40628-40726)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (38-147)||(1375-1484)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (38-147)||(38375-38484)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (38-147)||(110065-110174)
scaffold0035 (38-147)||(118566-118675)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (49-145)||(15780-15876)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (176-210)||(7319-7353)
scaffold0639 (176-210)||(7382-7416)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (176-210)||(2564-2598)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (176-210)||(687-721)
scaffold0462 (176-210)||(6193-6227)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (176-210)||(9999-10033)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (176-210)||(29846-29880)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (176-210)||(3150-3184)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (176-210)||(24654-24688)
scaffold0162 (176-210)||(24717-24751)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (176-210)||(7508-7542)
scaffold0108 (177-210)||(7445-7478)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (176-210)||(36287-36321)
scaffold0086 (176-208)||(36350-36382)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (49-135)||(53958-54044)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (176-210)||(62023-62057)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (176-210)||(46667-46701)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (49-147)||(19911-20009)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (77-147)||(39965-40035)
scaffold0034 (77-147)||(45448-45518)
scaffold0034 (77-147)||(79003-79073)
scaffold0034 (176-220)||(120190-120235)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (176-210)||(142775-142809)
scaffold0020 (45-81)||(103716-103752)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (176-210)||(29394-29428)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (78-147)||(1296-1365)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (38-147)||(18205-18314)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (177-210)||(18520-18553)
scaffold0213 (38-147)||(28469-28578)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (170-210)||(18424-18464)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (176-231)||(66762-66818)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 5853003 - 5853280
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5853003 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 5853102  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853103 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 5853202  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853203 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 5853280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1484853 - 1484576
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1484853 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 1484754  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484753 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 1484654  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484653 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 1484576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 14409155 - 14409432
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14409155 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14409254  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409255 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 14409354  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409355 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 14409432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 4542084 - 4542361
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  4542084 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgact 4542183  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542184 tcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 4542283  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542284 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 4542361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22002204 - 22001927
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002204 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 22002105  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002104 tcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 22002005  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22002004 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 22001927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14824226 - 14823949
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14824226 tgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14824127  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14824126 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg 14824027  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgattattattt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  14824026 ttgtaaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattattt 14823949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 20045906 - 20046183
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  20045906 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcact 20046005  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20046006 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg 20046105  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046106 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 20046183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24485754 - 24486032
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24485754 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 24485853  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24485854 tcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24485953  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24485954 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttga 24486032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Original strand, 27472127 - 27472395
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27472127 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgact 27472226  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27472227 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 27472326  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatt 276  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27472327 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttt-aagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4483732 - 4483454
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4483732 tgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 4483633  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4483632 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 4483533  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483532 tttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 4483454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 16413026 - 16413296
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16413026 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgact 16413125  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16413126 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 16413225  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16413226 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 16413296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15071012 - 15070734
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15071012 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 15070913  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    | |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15070912 taaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 15070813  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15070812 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttga 15070734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Original strand, 18677777 - 18678043
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18677777 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttc 18677876  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-t 208  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  18677877 aaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtt 18677976  T
Q  209 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgat 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  18677977 tgtgaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32122180 - 32121912
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32122180 tgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgact 32122081  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32122080 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg 32121981  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  32121980 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 16401635 - 16401875
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16401635 tgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgact 16401734  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16401735 tcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 16401834  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttata 247  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16401835 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 15202889 - 15203090
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15202889 tgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15202988  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15202989 tcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatg 15203088  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  15203089 tt 15203090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24049062 - 24048841
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049062 tgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 24048963  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24048962 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24048864  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccat 229  Q
     |||||||||||||||||| |||    
T  24048863 tttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 1326642 - 1326884
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  1326642 tgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 1326741  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1326742 tcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg 1326841  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1326842 tttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20403731 - 20403481
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403731 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 20403632  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403631 tgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 20403532  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  20403531 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 20403481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 38549715 - 38549957
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38549715 tgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgact 38549814  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38549815 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 38549914  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38549915 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16198346 - 16198115
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16198346 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgact 16198247  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16198246 ttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 16198147  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16198146 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 19936618 - 19936850
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19936618 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgact 19936717  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||              
T  19936718 tcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatg---------t 19936808  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19936809 ttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19896771 - 19896523
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  19896771 aaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttc 19896672  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-t 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19896671 aaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtt 19896572  T
Q  209 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
    | ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19896571 tatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatata 19896523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  237 ga 238  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 14397451 - 14397609
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397451 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 14397550  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397551 tcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 257
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290602
Alignment:
Q  41 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  141 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  240 gtgttatatgtatatata 257  Q
     |  ||||||||| ||||    
T  45290585 ttagtatatgtatgtata 45290602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20403924 - 20403765
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  20403924 tgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 20403825  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403824 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19896964 - 19896807
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19896964 aaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 19896865  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896864 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 27471934 - 27472093
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27471934 tgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 27472033  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472034 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 15202696 - 15202856
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15202696 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgact 15202795  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 168  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202796 tcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32122373 - 32122214
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  32122373 tgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 32122274  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122273 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 38549524 - 38549681
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  38549524 aaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttc 38549623  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549624 aaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 38549330 - 38549488
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38549330 tgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacg 38549429  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549430 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16401250 - 16401408
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16401250 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacg 16401348  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401349 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16401442 - 16401601
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16401442 tgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgact 16401541  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401542 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 45290258 - 45290385
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290258 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 45290357  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45290358 tcaaaaggatttatagaacttgagttat 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15071205 - 15071046
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  15071205 tgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 15071106  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071105 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16412833 - 16412992
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||      
T  16412833 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatg 16412932  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412933 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403401
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 20403412  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  20403411 ttattatttga 20403401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290682
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 45290671  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  45290672 ttattatttga 45290682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 15202503 - 15202662
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  15202503 tgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacg 15202602  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202603 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19897159 - 19897000
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  19897159 tgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacg 19897060  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897059 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24049255 - 24049104
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24049255 tgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 24049156  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049155 tcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810105
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttga 32810116  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  32810115 ttattatttga 32810105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203219
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15203208  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  15203209 ttattatttga 15203219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896442
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataat-gtttcaagatgttg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttg 19896454  T
Q  274 attattatttga 285  Q
    ||||||||||||    
T  19896453 attattatttga 19896442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 19936425 - 19936584
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||  ||||||| || |     
T  19936425 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcg 19936524  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936525 ttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 276
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttg 273  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  274 att 276  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936993
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgttg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttg 19936981  T
Q  274 attattatttga 285  Q
    ||||| ||||||    
T  19936982 attatcatttga 19936993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16402020
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 16402007  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  16402008 gattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327031
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatataatgtttcaaga 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||  |||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgaga 1327014  T
Q  269 tgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||    
T  1327015 tgttgattattatttga 1327031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11361161 - 11361024
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||     
T  11361161 tgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacg 11361062  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  11361061 tcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 276
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata----atgtttcaagat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 32810348 - 32810263
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 93  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  32810348 tgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  186 aattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320098
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  15320089 tcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500467
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  15500458 tcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  183 atgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 5852931 - 5852969
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852931 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 14409083 - 14409121
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409083 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 20045834 - 20045872
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045834 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007195
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22007097 ggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 272164 - 272273
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  272164 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 272263  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  272264 tcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 643685 - 643576
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  643685 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 643586  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  643585 tcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 829491 - 829382
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  829491 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 829392  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  829391 tcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 135
Target Start/End: Original strand, 17150628 - 17150713
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    ||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  17150628 gtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttat 17150713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 167
Target Start/End: Original strand, 16401185 - 16401216
Alignment:
Q  136 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401185 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4483803 - 4483765
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483803 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 6573743 - 6573777
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6573743 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 6573777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14824298 - 14824260
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824298 gagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 17438110 - 17438144
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17438110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17438144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 17979142 - 17979176
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17979142 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17979176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 18819393 - 18819427
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18819393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18819427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 20517910 - 20517944
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20517910 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20517944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22207569 - 22207535
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22207569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22207535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 22258951 - 22258985
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22258951 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22258985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22356024 - 22355990
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22356024 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22355990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22473889 - 22473855
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22473889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22473855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23669874 - 23669840
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23669874 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 23669840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23670000 - 23669966
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23670000 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 23669966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23670063 - 23670029
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23670063 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 23670029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 36405773 - 36405807
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36405773 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36405807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38988688 - 38988654
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38988688 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 38988654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38988867 - 38988833
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38988867 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 38988833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39019785 - 39019751
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39019785 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 39019751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39019964 - 39019930
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39019964 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 39019930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223394
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 223394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688165
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 688165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737017
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 737017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860912
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 860912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 4381456 - 4381489
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4381456 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 4381489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 18817125 - 18817158
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18817125 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18817158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22089373 - 22089482
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||| |||||||      
T  22089373 aattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatga 22089472  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22089473 tcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Original strand, 22449550 - 22449591
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22449550 gaaagttgtagatataaatgttagctttcaaatgtcattggt 22449591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22473952 - 22473919
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22473952 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44477099 - 44477018
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44477099 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44480361 - 44480280
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44480361 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 6573678 - 6573714
Alignment:
Q  174 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6573678 atatgcttgatgaattattatatgaatgtatatgttg 6573714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  53 taaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 113)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 14948833 - 14949110
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14948833 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14948932  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948933 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 14949032  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949033 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 14949110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 15376424 - 15376701
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15376424 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15376523  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376524 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 15376623  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376624 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 15376701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 20384834 - 20385111
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20384834 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 20384933  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384934 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 20385033  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385034 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 20385111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32125942 - 32125665
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32125942 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgact 32125843  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125842 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 32125743  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125742 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 32125665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16410510 - 16410233
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16410510 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 16410411  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410410 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg 16410311  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16410310 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 16410233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18640723 - 18640448
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18640723 tgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgact 18640624  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640623 tcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg 18640524  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattattt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18640523 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattt 18640448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27217312 - 27217034
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27217312 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 27217213  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27217212 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 27217113  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217112 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 27217034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18431163 - 18430886
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18431163 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgact 18431064  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431063 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 18430964  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18430963 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 18430886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 21189306 - 21189583
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21189306 tgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgact 21189405  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21189406 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatagt 21189505  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189506 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 21189583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18628015 - 18627740
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18628015 aaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 18627916  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18627915 aaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18627816  T
Q  210 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18627815 gtgaatacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttga 18627740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 456773 - 456495
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  456773 tgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 456674  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  456673 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 456574  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  456573 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 456495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16232972 - 16232694
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16232972 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaat 16232873  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16232872 tcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 16232773  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232772 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 16232694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41523369 - 41523091
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41523369 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 41523270  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41523269 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 41523170  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41523169 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 41523091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41525831 - 41525553
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41525831 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 41525732  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41525731 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 41525632  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525631 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 41525553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 26355692 - 26355969
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26355692 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgact 26355791  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26355792 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg 26355891  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgattattattt 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  26355892 ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattattt 26355969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 26358144 - 26358421
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358144 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgact 26358243  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26358244 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg 26358343  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgattattattt 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  26358344 ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattattt 26358421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13869800 - 13869522
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13869800 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 13869701  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13869700 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 13869601  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13869600 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttga 13869522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24702680 - 24702412
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702680 tgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 24702581  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              
T  24702580 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg---------t 24702490  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702489 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24702412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24705127 - 24704859
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24705127 tgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 24705028  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              
T  24705027 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg---------t 24704937  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24704936 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24704859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11303699 - 11303429
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11303699 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 11303600  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  11303599 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 11303500  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11303499 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 11303429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16214136 - 16213866
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16214136 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 16214037  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16214036 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatg 16213937  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16213936 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgatta 16213866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 52 - 285
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393275
Alignment:
Q  52 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  152 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 250  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T
Q  251 atatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393241 atatatgatgttttaagatgttgattattatttga 11393275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8940735 - 8940489
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggttt 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8940735 tgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttt 8940636  T
Q  104 gacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940635 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 8940536  T
Q  204 tatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8940535 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 14269667 - 14269909
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  14269667 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgact 14269766  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14269767 tcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 14269866  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14269867 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 15081552 - 15081794
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15081552 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15081651  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15081652 tcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 15081751  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15081752 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 16108399 - 16108669
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  16108399 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgact 16108498  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  16108499 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 16108598  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16108599 tttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 16108669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 23664663 - 23664933
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23664663 tgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 23664762  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  23664763 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 23664862  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  23664863 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaatta 23664933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29797062 - 29796790
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29797062 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 29796963  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  29796962 tcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 29796863  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  29796862 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaatta 29796790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29800881 - 29800609
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800881 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 29800782  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  29800781 tcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 29800682  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  29800681 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaatta 29800609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8469187 - 8468945
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8469187 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgact 8469088  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8469087 tcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8468988  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8468987 tttttgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11972998 - 11972750
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11972998 aaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 11972899  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-t 208  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11972898 aaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtt 11972799  T
Q  209 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
    | ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  11972798 tatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 11972750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 45847365 - 45847605
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    ||| ||||||||    
T  45847365 tgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgact 45847464  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45847465 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg 45847564  T
Q  208 t-tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttata 247  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45847565 tctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841305
Alignment:
Q  68 taggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  168 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 13841305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 14156789 - 14156944
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156789 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 14156884  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156885 tcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8940927 - 8940769
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  8940927 tgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 8940829  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940828 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 10501104 - 10501263
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10501104 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgact 10501203  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501204 tcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 14269281 - 14269440
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||      
T  14269281 tgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatg 14269380  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269381 tcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 38897745 - 38897904
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38897745 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacg 38897844  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897845 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 25926840 - 25926998
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||| ||||     
T  25926840 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacg 25926939  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926940 tcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 1856940 - 1857097
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  1856940 tgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacg 1857038  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857039 tcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 14156603 - 14156755
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14156603 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 14156702  T
Q  115 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156703 gatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 13918113 - 13918272
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  13918113 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgac 13918212  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918213 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 14269474 - 14269633
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  14269474 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacg 14269573  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269574 tcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16214329 - 16214170
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  16214329 tgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacg 16214230  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214229 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270050
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 14270039  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  14270040 ttattatttga 14270050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 15081359 - 15081512
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  15081359 tgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 15081458  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15081459 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8941121 - 8940962
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  8941121 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaag 8941022  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941021 tcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 21189113 - 21189272
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  21189113 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacg 21189212  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189213 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972670
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattga 11972681  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  11972680 ttattatttga 11972670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 10500945 - 10501064
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10500945 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 10501044  T
Q  115 gatttatagaactagagtta 134  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  10501045 gatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 17985097 - 17985254
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||||||| | |    
T  17985097 aaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattcc 17985196  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985197 aaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081937
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 15081924  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  15081925 gattatgatttga 15081937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898218
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 38898205  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  38898206 gattatcatttga 38898218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940346
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 8940359  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  8940358 gattatcatttga 8940346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8468898 - 8468814
Alignment:
Q  201 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8468898 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttga 8468814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841186
Alignment:
Q  201 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttttgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 13841186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 276
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttg 273  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttt-aagatgttg 45847736  T
Q  274 att 276  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  170 ttgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  80 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 168  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 23461802 - 23461864
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 70  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461802 tgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745648
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11310206 - 11310133
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgtta 82  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11310206 tgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 225
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16410582 - 16410544
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410582 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18628089 - 18628051
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628089 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18640795 - 18640757
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640795 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110741
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataa 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataa 20110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 26355620 - 26355658
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355620 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 26358072 - 26358110
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358072 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7822122 - 7822013
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  7822122 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7822023  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  7822022 tcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7829433 - 7829324
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  7829433 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7829334  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  7829333 tcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 27102512 - 27102621
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  27102512 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27102611  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27102612 tcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 27109860 - 27109969
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  27109860 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27109959  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27109960 tcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27175814 - 27175705
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  27175814 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27175715  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27175714 tcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 38784604 - 38784713
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  38784604 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38784703  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  38784704 tcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatatt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20619609 - 20619574
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20619609 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20619574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8473087 - 8473053
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8473087 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8473053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 8514393 - 8514427
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8514393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8514427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 8851889 - 8851923
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8851889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8851923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001074
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 10001074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13869871 - 13869833
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869871 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 14153622 - 14153656
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14153622 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 14153656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 15119972 - 15120006
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15119972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15120006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 15576619 - 15576653
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15576619 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15576653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27217384 - 27217346
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217384 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 33556906 - 33556940
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33556906 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 33556940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 33556968 - 33557002
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33556968 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 33557002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 36301549 - 36301583
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36301549 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36301583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37538531 - 37538497
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37538531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 37538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37538685 - 37538651
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37538685 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 37538651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43747799 - 43747765
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43747799 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 43747765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 48213658 - 48213692
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48213658 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 48213692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 4691559 - 4691592
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4691559 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 4691592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 10896371 - 10896452
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  10896371 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 13745506 - 13745539
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13745506 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13745539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 15576494 - 15576527
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15576494 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15576527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 20253005 - 20253038
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20253005 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20253038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 107
Target Start/End: Original strand, 23664500 - 23664569
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  23664500 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgact 23664569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 29004485 - 29004416
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004485 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43747861 - 43747828
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43747861 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 43747828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 36
Target Start/End: Original strand, 11393010 - 11393038
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtaca 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393010 tgaaatgaaaactggtattgattggtaca 11393038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Original strand, 14153671 - 14153703
Alignment:
Q  174 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14153671 atatgattgatgaattattatatgaatgtatat 14153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 208
Target Start/End: Original strand, 15576556 - 15576588
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15576556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 15576588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 135
Target Start/End: Original strand, 15951607 - 15951691
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15951607 tgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttat 15951691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43747736 - 43747672
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  43747736 atgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 43747672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 21923002 - 21923279
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21923002 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 21923101  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923102 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 21923201  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923202 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 21923279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13989317 - 13989040
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13989317 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 13989218  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989217 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 13989118  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13989117 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 13989040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 21474797 - 21475075
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21474797 tgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 21474896  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21474897 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 21474996  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21474997 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 21475075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21841218 - 21840949
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21841218 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 21841119  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21841118 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 21841019  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21841018 ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 21840949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 15859719 - 15859988
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15859719 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgact 15859818  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15859819 tcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatc 15859918  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15859919 ttgcgaatacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgatta 15859988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16362370 - 16362100
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16362370 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgact 16362271  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16362270 tcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 16362171  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16362170 tttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 16362100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 23593444 - 23593714
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  23593444 tgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 23593543  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23593544 tcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 23593643  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23593644 tttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 23593714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 16274967 - 16275209
Alignment:
Q  9 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaa-tgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  16274967 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcact 16275066  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16275067 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatg 16275166  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16275167 tttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29777192 - 29776942
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29777192 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgact 29777093  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777092 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 29776993  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  29776992 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 29776942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31612817 - 31612567
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612817 tgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgact 31612718  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612717 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 31612618  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || | | || ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  31612617 tttatcagtatgatattgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 31612567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298693 - 29298492
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29298693 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgact 29298594  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298593 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 29298494  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  29298493 tt 29298492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Original strand, 27161297 - 27161529
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161297 tgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 27161396  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27161397 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 27161496  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
     || ||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  27161497 tttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 22122725 - 22122970
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22122725 tgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgact 22122824  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122825 tcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 22122924  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 252  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  22122925 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29535503 - 29535317
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29535503 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgact 29535404  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 194  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535403 tcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13227315 - 13227129
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13227315 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 13227216  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227215 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 22050547 - 22050797
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| | |      
T  22050547 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatg 22050646  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050647 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 22050746  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  22050747 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 22050797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 15859513 - 15859672
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15859513 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacc 15859612  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859613 tcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31613010 - 31612851
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31613010 tgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgact 31612911  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612910 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29298886 - 29298727
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||     
T  29298886 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacg 29298787  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298786 tcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31613203 - 31613044
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||     
T  31613203 tgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacg 31613104  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613103 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776862
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 29776873  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  29776872 ttattatttga 29776862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 9044715 - 9044867
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| | ||     
T  9044715 tgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacg 9044814  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9044815 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29777385 - 29777226
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  29777385 tgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 29777286  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777285 ttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298310
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 29298321  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  29298320 ttattatttga 29298310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40129536 - 40129387
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  40129536 tgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggca 40129437  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggt 157  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129436 tcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 22122531 - 22122691
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22122531 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttac 22122630  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122631 ttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16274773 - 16274932
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  16274773 tgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacg 16274872  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274873 tcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275351
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  274 attattatttga 285  Q
    ||||||||||||    
T  16275340 attattatttga 16275351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 274
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050866
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123055
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattga 22123044  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  22123045 ttattatttga 22123055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612487
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattga 31612498  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  31612497 ttattatttga 31612487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16401566 - 16401407
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||| | ||     
T  16401566 tgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacg 16401467  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401466 tggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 27161118 - 27161263
Alignment:
Q  22 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat 121  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||    
T  27161118 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttat 27161217  T
Q  122 agaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161218 agaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43543353 - 43543269
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaat 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43543353 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 263
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Original strand, 10812716 - 10812816
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||||||| | || | |||||||||||    
T  10812716 tgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgact 10812815  T
Q  108 t 108  Q
    |    
T  10812816 t 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21858690 - 21858592
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21858690 ggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298439
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29298439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543225
Alignment:
Q  243 ttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 43543225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710130
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatgaatatat 12710130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17004018 - 17003909
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  17004018 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 17003919  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  17003918 tcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatatt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16401373 - 16401274
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16401373 tgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggcatttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgact 16401274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060656
Alignment:
Q  40 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattt 18060656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44891787 - 44891752
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44891787 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgt 44891752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 7321576 - 7321610
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7321576 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7321610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 7321639 - 7321673
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7321639 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7321673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18120868 - 18120834
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18120868 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18120834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 21474733 - 21474763
Alignment:
Q  137 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474733 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 24720419 - 24720453
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24720419 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 24720453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50544178 - 50544144
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50544178 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50544144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6833603 - 6833570
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6833603 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 6833570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Original strand, 43630299 - 43630344
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgt 53  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43630299 tgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50544240 - 50544207
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50544240 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50544207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Original strand, 21244669 - 21244717
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatatt 223  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21244669 atgattgataaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 21244717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Original strand, 24815242 - 24815310
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24815242 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgattt 24815310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 134662 - 134385
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134662 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 134563  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134562 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 134463  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  134462 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 134385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 137131 - 136854
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  137131 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 137032  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137031 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 136932  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  136931 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 136854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 139600 - 139323
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  139600 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 139501  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139500 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 139401  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  139400 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 139323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 142069 - 141792
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  142069 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 141970  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141969 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 141870  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  141869 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 141792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 144538 - 144261
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  144538 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 144439  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144438 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 144339  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  144338 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 144261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 18334303 - 18334580
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18334303 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 18334402  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334403 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 18334502  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334503 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 18334580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24422998 - 24422721
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24422998 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 24422899  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422898 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 24422799  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422798 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24422721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33862245 - 33861968
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33862245 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 33862146  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862145 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 33862046  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33862045 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 33861968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33864729 - 33864452
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33864729 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 33864630  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864629 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 33864530  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864529 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 33864452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 2290891 - 2291168
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2290891 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 2290990  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290991 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 2291090  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291091 ttgtgaatacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 2291168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 1540622 - 1540899
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1540622 tgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 1540721  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540722 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 1540821  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1540822 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 1540899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12742769 - 12742491
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12742769 tgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 12742670  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12742669 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 12742570  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742569 tttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 12742491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 19858633 - 19858907
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  19858633 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgact 19858729  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858730 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 19858829  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19858830 ctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttga 19858907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8055481 - 8055203
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8055481 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgact 8055382  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8055381 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8055282  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055281 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 8055203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 26924351 - 26924628
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26924351 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 26924450  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26924451 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 26924550  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924551 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttga 26924628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1598508 - 1598266
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1598508 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 1598409  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1598408 tcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 1598309  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598308 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 30676420 - 30676690
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676420 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 30676519  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30676520 tcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 30676619  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30676620 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 30676690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34963825 - 34963555
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963825 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 34963726  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34963725 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 34963626  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34963625 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 34963555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22782678 - 22782401
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22782678 tgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 22782579  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22782578 tcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 22782479  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22782478 ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttga 22782401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 19847682 - 19847927
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19847682 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat----gctagatttctaatgccgttggtttgact 19847777  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19847778 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 19847877  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847878 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 19847927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 28289047 - 28289315
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289047 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 28289146  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  28289147 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 28289246  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  28289247 tttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaatta 28289315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25688954 - 25688684
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25688954 tgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgact 25688855  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-t 206  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25688854 tcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatt 25688755  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  25688754 tttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgatta 25688684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23992874 - 23992626
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||     
T  23992874 tgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacg 23992775  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23992774 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 23992675  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992674 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 23992626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 263
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377814
Alignment:
Q  26 tgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  126 ctagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattg 224  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  225 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgttt 263  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18914384 - 18914142
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  18914384 tgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaact 18914285  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18914284 tcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 18914185  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914184 tttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 31630251 - 31630493
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31630251 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgact 31630350  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31630351 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 31630450  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31630451 tttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12942641 - 12942383
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||    
T  12942641 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgact 12942554  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  12942553 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 12942454  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12942453 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 12942383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19005603 - 19005361
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005603 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 19005504  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  19005503 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatg 19005404  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  19005403 tttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25535859 - 25535641
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535859 tgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 25535760  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25535759 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 25535660  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgt 225  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25535659 tttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 1875 - 2034
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1875 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 1974  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1975 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 8834 - 8993
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8834 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 8933  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8934 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1598701 - 1598542
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  1598701 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaca 1598602  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598601 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 26924158 - 26924313
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26924158 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 26924257  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924258 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19005796 - 19005637
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19005796 tgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgact 19005697  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005696 tcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 19847489 - 19847648
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || || ||||     
T  19847489 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacg 19847588  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847589 tcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18914770 - 18914615
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  18914770 tgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgaca 18914671  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914670 tcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27557174 - 27557016
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  27557174 tgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacg 27557075  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557074 ttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25689147 - 25688988
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||     
T  25689147 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacg 25689048  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689047 tcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 30676227 - 30676386
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||     
T  30676227 tgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacg 30676326  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676327 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23415416 - 23415258
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| ||||     
T  23415416 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacg 23415317  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415316 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 15892119 - 15892231
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15892119 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgact 15892218  T
Q  108 tcaaaaggattta 120  Q
    |||||||||||||    
T  15892219 tcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914001
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 18914012  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  18914011 ttattatttga 18914001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005220
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 19005231  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  19005230 ttattatttga 19005220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 85 - 242
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  85 aaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtc 184  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  185 aaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18914567 - 18914422
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  18914567 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgat 18914468  T
Q  118 ttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914467 tgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 31630060 - 31630217
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31630060 aaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtc 31630159  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630160 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1598894 - 1598735
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  1598894 tgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacg 1598795  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598794 ttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 276
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  274 att 276  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875480
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15875491  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  15875490 ttattatttga 15875480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 17883208 - 17883305
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17883208 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  124 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatatt 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatg---------tttgtgaatacgatatt 15875647  T
Q  224 gtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  15875646 gttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  48 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  148 gcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25737094 - 25737028
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737094 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937259
Alignment:
Q  223 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 18937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656811
Alignment:
Q  192 tatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgatta 25656811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 9029 - 9085
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9029 aaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240296
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||      
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16240305 tcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557054
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16557045 tcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633610
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16633601 tcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650284
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||| |||||||      
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16650275 tcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904474
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaactagagttata 136  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||| |||||||     
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  137 gtcaaattact 147  Q
     ||||||||||    
T  25904484 atcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgatt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33864801 - 33864763
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864801 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 35016015 - 35016113
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  35016015 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10488080 - 10487971
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  10488080 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 10487981  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  10487980 tcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16377248 - 16377357
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  16377248 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16377347  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16377348 tcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16384572 - 16384681
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  16384572 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16384671  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16384672 tcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654686
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 27654686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595723
Alignment:
Q  245 atatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 1595723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 22981450 - 22981486
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981450 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 23806958 - 23806922
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23806958 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18928152 - 18928117
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18928152 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18928117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 22226580 - 22226679
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22226580 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Original strand, 2290827 - 2290857
Alignment:
Q  137 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290827 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10445413 - 10445379
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10445413 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 10445379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13284971 - 13284937
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13284971 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 13284937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 20411319 - 20411353
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20411319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20411353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 20411382 - 20411416
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20411382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20411416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776185
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaact 21776185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22782750 - 22782712
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782750 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25920994 - 25920948
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgat 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25920994 tatgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatacgat 25920948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 26924086 - 26924124
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924086 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29044525 - 29044491
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29044525 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29044491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35056665 - 35056631
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35056665 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35056631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35056728 - 35056694
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35056728 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35056694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 119
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133128
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgattt 16133128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 18455449 - 18455530
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||    
T  18455449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 22593590 - 22593691
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||    
T  22593590 ttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatta 22593689  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  22593690 ct 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 10732651 - 10732928
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10732651 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 10732750  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732751 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 10732850  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10732851 ttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 10732928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20909463 - 20909186
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20909463 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 20909364  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909363 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 20909264  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909263 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 20909186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39245587 - 39245310
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39245587 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 39245488  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245487 tcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 39245388  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245387 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 39245310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 264479 - 264756
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  264479 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgact 264578  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264579 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 264678  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  264679 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 264756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 42245076 - 42245353
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42245076 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgact 42245175  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245176 tcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 42245275  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245276 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 42245353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29346431 - 29346154
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346431 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 29346332  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  29346331 tcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg 29346232  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29346231 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 29346154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29348904 - 29348627
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29348904 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgact 29348805  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  29348804 tcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg 29348705  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348704 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 29348627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29351377 - 29351100
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29351377 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgact 29351278  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  29351277 tcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg 29351178  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29351177 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 29351100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Original strand, 17516874 - 17517142
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17516874 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 17516973  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17516974 tcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 17517073  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  17517074 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38619888 - 38619610
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  38619888 tgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgact 38619789  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38619788 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 38619689  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38619688 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttga 38619610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 2154342 - 2154591
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154342 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgact 2154441  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154442 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 2154541  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154542 tttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 2154591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39363836 - 39363558
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  39363836 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgact 39363737  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39363736 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 39363637  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363636 tttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 39363558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 20901631 - 20901873
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20901631 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgact 20901730  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20901731 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 20901830  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901831 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23064965 - 23064687
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  23064965 tgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgact 23064866  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064865 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 23064766  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23064765 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttga 23064687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 37804613 - 37804883
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37804613 tgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 37804712  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  37804713 tcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 37804812  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37804813 tttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaatta 37804883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Original strand, 20917558 - 20917758
Alignment:
Q  9 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20917558 gaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 20917657  T
Q  109 caaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917658 caaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 20917757  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  20917758 t 20917758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32027897 - 32027647
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32027897 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgact 32027798  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027797 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 32027698  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  32027697 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 32027647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29330434 - 29330234
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  29330434 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatt 29330335  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330334 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 29330236  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  29330235 tt 29330234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776540
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  237 gaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  9776580 gaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaatta 9776540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 20901438 - 20901597
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  20901438 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacg 20901537  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901538 tcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 17516488 - 17516647
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  17516488 tgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 17516587  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516588 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 17516683 - 17516840
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17516683 aaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtc 17516782  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516783 aaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 295985 - 296144
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  295985 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacg 296084  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296085 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 2154149 - 2154308
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  2154149 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacg 2154248  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154249 tcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028477 - 32028318
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||     
T  32028477 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacg 32028378  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028377 tcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028670 - 32028511
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  32028670 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgaca 32028571  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028570 tcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027567
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 32027578  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  32027577 ttattatttga 32027567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028284 - 32028124
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg-tttgac 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32028284 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgac 32028185  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
     |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028184 gtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 295792 - 295951
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  295792 tgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgaca 295891  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295892 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917940
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 20917929  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  20917930 ttattatttga 20917940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 20917364 - 20917523
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  20917364 tgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacg 20917463  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917464 tcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29330627 - 29330468
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||     
T  29330627 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacg 29330528  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330527 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330111
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatta 29330116  T
Q  275 ttatt 279  Q
    |||||    
T  29330115 ttatt 29330111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028090 - 32027931
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||| | |||||  |||     
T  32028090 tgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacg 32027991  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027990 tcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 256
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901986
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 20901986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884013
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22884004 tcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444106
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttat 43444106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 264407 - 264445
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264407 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20909535 - 20909497
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909535 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917811
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20917811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39245659 - 39245621
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245659 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39363907 - 39363869
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363907 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11923
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 11923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 21933243 - 21933352
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  21933243 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21933342  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  21933343 tcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 21939413 - 21939522
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  21939413 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21939512  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  21939513 tcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426197
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaact 25426197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35581449 - 35581340
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  35581449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 35581350  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  35581349 tcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 36990639 - 36990748
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  36990639 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 36990738  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  36990739 tcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 249
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  178 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424879
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||      
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  7424886 tcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Original strand, 8833821 - 8833856
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8833821 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8833856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21503350 - 21503315
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21503350 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21503315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23065117 - 23064999
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| ||| |||||||    
T  23065117 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggtccaattact 23065019  T
Q  148 gcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23065018 gcacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26761830 - 26761795
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26761830 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 26761795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31479034 - 31478959
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttataga 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31479034 ggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttaga 31478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 8833885 - 8833919
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8833885 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8833919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 14026596 - 14026630
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14026596 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 14026630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 14026659 - 14026693
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14026659 atgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttg 14026693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16062717 - 16062683
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16062717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 16062683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16062878 - 16062844
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16062878 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 16062844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18743873 - 18743839
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18743873 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18743839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 20198318 - 20198352
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20198318 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20198352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 21399796 - 21399830
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21399796 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21399830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26749389 - 26749355
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26749389 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 26749355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26749452 - 26749418
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26749452 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 26749418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30611402 - 30611368
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30611402 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 30611368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 1628044 - 1628077
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1628044 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1628077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342210
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 11342210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19511862 - 19511781
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  19511862 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 21399733 - 21399766
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21399733 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367176
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||    
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattt 22367176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067290
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24067290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 15118063 - 15118340
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15118063 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15118162  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118163 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 15118262  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118263 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 15118340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 50222050 - 50222327
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50222050 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 50222149  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222150 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 50222249  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222250 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 50222327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44615740 - 44615462
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44615740 tgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 44615641  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615640 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 44615541  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615540 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 44615462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Original strand, 44772796 - 44773075
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772796 aaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 44772895  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44772896 aaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtt 44772995  T
Q  210 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata----atgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44772996 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttga 44773075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 1837230 - 1837497
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1837230 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 1837329  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  1837330 taaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatg 1837419  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837420 ttgtgaaaacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 1837497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 7640897 - 7641180
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  7640897 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcact 7640996  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7640997 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg 7641096  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata------atgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||      || ||| |||||||||||||||||||||    
T  7641097 ttgtgaatacgatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttga 7641180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 14970417 - 14970687
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970417 tgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14970516  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14970517 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg 14970616  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14970617 tttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 14970687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15534633 - 15534363
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534633 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15534534  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  15534533 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 15534434  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15534433 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 15534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3515459 - 3515189
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3515459 tgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 3515360  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-t 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  3515359 tcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatt 3515260  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3515259 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 3515189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 52872783 - 52873025
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52872783 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgact 52872882  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52872883 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 52872982  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52872983 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29267805 - 29267570
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29267805 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgact 29267706  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29267705 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 29267606  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 242  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267605 tttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36038322 - 36038052
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36038322 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgact 36038223  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||     
T  36038222 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatata 36038123  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36038122 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 36038052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 49547484 - 49547762
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49547484 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 49547583  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  49547584 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 49547683  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49547684 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttga 49547762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 362632 - 362390
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  362632 tgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgact 362533  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  362532 tcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 362433  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362432 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19243152 - 19242882
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19243152 tgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 19243053  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19243052 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 19242953  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19242952 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 19242882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 11965 - 12166
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11965 tgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 12064  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12065 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 12164  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  12165 tt 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14049029 - 14048759
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14049029 tgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14048930  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  14048929 tcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatg 14048830  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14048829 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 14048759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 19617777 - 19618019
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  19617777 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgact 19617876  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19617877 tcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 19617976  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19617977 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52313013 - 52312764
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  52313013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttact 52312914  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312913 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 52312815  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  52312814 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 52312764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 15495887 - 15496126
Alignment:
Q  11 aatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||     
T  15495887 aatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcg 15495986  T
Q  111 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-tt 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  15495987 aaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 15496086  T
Q  210 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496087 ctgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 14746222 - 14746464
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14746222 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgact 14746321  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14746322 ttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatg 14746421  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14746422 tttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19858029 - 19857798
Alignment:
Q  9 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858029 gaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 19857930  T
Q  109 caaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 208  Q
    |||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |    
T  19857929 caaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg---------tt 19857839  T
Q  209 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857838 tgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Original strand, 18239251 - 18239407
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtcca 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239251 gagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtcca 18239350  T
Q  229 tgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239351 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 18239407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 52872590 - 52872749
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||     
T  52872590 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacg 52872689  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872690 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 362825 - 362668
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  362825 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaca 362726  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362725 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 14746029 - 14746188
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  14746029 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacg 14746128  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746129 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19858223 - 19858064
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19858223 tgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 19858124  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858123 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 14970224 - 14970383
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  14970224 tgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 14970323  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970324 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 18214721 - 18214880
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  18214721 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 18214820  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214821 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 19617584 - 19617743
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  19617584 tgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacg 19617683  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617684 ccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 363018 - 362859
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  363018 tgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 362919  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362918 tcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3515652 - 3515493
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  3515652 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacg 3515553  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515552 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52313399 - 52313240
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  52313399 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 52313300  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313299 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 249
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  121 tagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacga 219  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  220 tattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12292
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 12284  T
Q  275 ttattatt 282  Q
    ||||||||    
T  12285 ttattatt 12292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355312
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15355301  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  15355302 ttattatttga 15355312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  33 tacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  133 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215262
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 18215251  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||| ||||||    
T  18215252 ttatgatttga 18215262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312684
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 52312695  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  52312694 ttattatttga 52312684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52313206 - 52313047
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| ||||     
T  52313206 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacg 52313107  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313106 tcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497059
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15497048  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  15497049 ttattatttga 15497059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873166
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 52873155  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  52873156 ttattatttga 52873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618152
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 19618149  T
Q  275 tta 277  Q
    |||    
T  19618150 tta 19618152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30147367 - 30147189
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || | |  ||   |||| | ||||| ||||     
T  30147367 tgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgaca 30147268  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 186  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147267 acaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 249
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  147 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  246 tatg 249  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  157 tcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746607
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 14746594  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  14746595 gattatcatttga 14746607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 362343 - 362268
Alignment:
Q  201 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  362343 gtatatgttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857684
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatata 19857684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 12778393 - 12778459
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778393 tgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 18214914 - 18214965
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18214914 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14185587 - 14185525
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 70  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14185587 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtag 14185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14995753 - 14995644
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  14995753 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatga 14995654  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  14995653 tcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 22725435 - 22725494
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 67  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22725435 tgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 15489666 - 15489717
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 59  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15489666 tgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731688
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247759
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 18247759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 167
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  130 agttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357203
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaact 47357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 7640745 - 7640863
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| || ||||||||    
T  7640745 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggttaaattact 7640843  T
Q  148 gcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7640844 gcacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9923625 - 9923590
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9923625 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 9923590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287966
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||      
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  15287959 tcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295076
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||      
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  15295069 tcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25513066 - 25513031
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25513066 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25513031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10272826 - 10272792
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10272826 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 10272792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12622710 - 12622676
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12622710 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 12622676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13164444 - 13164410
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13164444 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 13164410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13164556 - 13164522
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13164556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 13164522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14508088 - 14508054
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14508088 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 14508054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 15041855 - 15041889
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15041855 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15041889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15112569 - 15112535
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15112569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15112535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355149
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 22355149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25512972 - 25512938
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25512972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25512938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 26922468 - 26922502
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26922468 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 26922502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46740474 - 46740440
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46740474 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 46740440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46740600 - 46740566
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46740600 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 46740566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 55582586 - 55582552
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55582586 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 55582552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 630280 - 630361
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  630280 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643766
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaact 10643766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218912
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagcttt 87  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857618
Alignment:
Q  244 tatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 19857618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26445207 - 26445174
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26445207 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26445174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35660234 - 35660201
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35660234 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35660201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40229704 - 40229671
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40229704 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 40229671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17463629 - 17463352
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17463629 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 17463530  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463529 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 17463430  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463429 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 17463352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34159777 - 34159500
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34159777 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 34159678  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159677 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 34159578  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159577 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 34159500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 55476942 - 55476665
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55476942 tgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 55476843  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476842 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 55476743  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476742 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 55476665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 16453991 - 16454269
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16453991 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 16454090  T
Q  108 tcaaaa-ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454091 tcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 16454190  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454191 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 16454269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 6468845 - 6469122
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6468845 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 6468944  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468945 tcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 6469044  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469045 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 6469122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15977984 - 15977707
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15977984 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 15977885  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977884 tcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 15977785  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15977784 ttgtgaatacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttga 15977707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 13153966 - 13154243
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13153966 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 13154065  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154066 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 13154165  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154166 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 13154243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 10247434 - 10247711
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10247434 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 10247533  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  10247534 tcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg 10247633  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10247634 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 10247711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13544475 - 13544199
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544475 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 13544376  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544375 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaat-actgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 13544277  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13544276 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttga 13544199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 45606617 - 45606895
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45606617 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 45606716  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45606717 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 45606816  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45606817 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 45606895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12568011 - 12567734
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12568011 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 12567912  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12567911 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 12567812  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12567811 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttga 12567734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 7781057 - 7781335
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7781057 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgact 7781156  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7781157 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatg 7781256  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781257 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 7781335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 28848332 - 28848599
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28848332 tgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 28848431  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  28848432 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatg 28848521  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848522 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 28848599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 13151501 - 13151778
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13151501 tgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 13151600  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13151601 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg 13151700  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13151701 ttgtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 13151778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46822713 - 46822445
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46822713 tgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 46822614  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46822613 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 46822514  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  46822513 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27165704 - 27165434
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27165704 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgact 27165605  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27165604 tcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 27165505  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27165504 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 27165434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 53301214 - 53301484
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  53301214 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgact 53301313  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53301314 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 53301413  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53301414 tttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 53301484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8499972 - 8499694
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8499972 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgact 8499873  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8499872 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8499773  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8499772 tttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttga 8499694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15412883 - 15412605
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15412883 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 15412784  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15412783 tcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatg 15412684  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  15412683 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttga 15412605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54521274 - 54521004
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54521274 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 54521175  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  54521174 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 54521075  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54521074 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 54521004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10557360 - 10557091
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  10557360 tgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttact 10557261  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10557260 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg 10557161  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatt 276  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10557160 tttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 12119364 - 12119606
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12119364 tgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 12119463  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12119464 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 12119563  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12119564 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13436751 - 13436520
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13436751 tgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 13436652  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13436651 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatg 13436552  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13436551 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41124391 - 41124141
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41124391 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgact 41124292  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41124291 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatg 41124192  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  41124191 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 41124141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 38961548 - 38961799
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtc-gttggtttgac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38961548 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgac 38961647  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961648 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 38961747  T
Q  207 g-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
    | || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  38961748 gtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 38961799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 17444474 - 17444724
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444474 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 17444573  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444574 tcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 17444673  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  17444674 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 17444724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 29544552 - 29544822
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29544552 tgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatt 29544651  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||     
T  29544652 tcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatata 29544751  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29544752 tttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 29544822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 16282468 - 16282669
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16282468 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgact 16282567  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282568 tcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 16282667  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  16282668 tt 16282669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25237295 - 25237094
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||| |||    
T  25237295 tgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaact 25237196  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237195 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 25237096  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  25237095 tt 25237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24514128 - 24513910
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  24514128 tgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 24514029  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24514028 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24513929  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgt 225  Q
     |||||||||| |||||||    
T  24513928 tttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25229708 - 25229507
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  |||| |||    
T  25229708 tgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaact 25229609  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229608 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 25229509  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  25229508 tt 25229507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 20629902 - 20630078
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20629902 tgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 20630001  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630002 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305327
Alignment:
Q  89 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  189 tagtatatgaatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 12305327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10379779 - 10379613
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10379779 tgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 10379680  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 174  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379679 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41124584 - 41124425
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41124584 tgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 41124485  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124484 tcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15465606 - 15465448
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  15465606 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacg 15465507  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465506 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27165897 - 27165738
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  27165897 tgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 27165798  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165797 tcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46822906 - 46822747
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46822906 tgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 46822807  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822806 tcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 53301021 - 53301180
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  53301021 tgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 53301120  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301121 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 55319014 - 55319173
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  55319014 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 55319113  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319114 tcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 26054975 - 26055133
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  26054975 tgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacg 26055074  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055075 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 38961355 - 38961514
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38961355 tgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 38961454  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961455 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5223835 - 5223677
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  5223835 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacg 5223736  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223735 tcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8500165 - 8500009
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  8500165 tgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 8500066  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 164  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500065 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10557541 - 10557394
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||    
T  10557541 tggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgattt 10557442  T
Q  120 atagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557441 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 55318821 - 55318980
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||     
T  55318821 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgaca 55318920  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318921 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282799
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 16282788  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  16282789 ttattatttga 16282799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 13937490 - 13937649
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13937490 tgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 13937589  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937590 tcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 20629709 - 20629868
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20629709 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgaca 20629808  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    | |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629809 ttaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899268
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 8899279  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||| ||||||    
T  8899278 ttatgatttga 8899268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124061
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 41124072  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  41124071 ttattatttga 41124061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961879
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttgg 38961868  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  38961869 ttattatttga 38961879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 16282277 - 16282434
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| || |||  ||    
T  16282277 aaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtc 16282376  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282377 aaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707595
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  274 attattatttga 285  Q
    ||||||||||||    
T  9707584 attattatttga 9707595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 17444281 - 17444440
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||     
T  17444281 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacg 17444380  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444381 tcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  146 ctgcacgtaggtcacagtgaata 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914040
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 11914027  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  11914028 gattatcatttga 11914040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17393345 - 17393201
Alignment:
Q  23 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttata 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17393345 tattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgattttta 17393246  T
Q  123 gaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393245 gaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 167
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  157 tcacagtgaat 167  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 16358378 - 16358458
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttc 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16358378 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| |||||| || ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  160 cagtgaata 168  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15007941 - 15007868
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15007941 actggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36528414 - 36528348
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36528414 tgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  22 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  103 tgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8899477 - 8899418
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 67  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899477 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12305574 - 12305525
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaac 57  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12305574 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25058407 - 25058286
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  25058407 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatga 25058308  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  25058307 tcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 55477094 - 55476976
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacta-gagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |   || ||||||| |||||||||||    
T  55477094 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattt-tcggtttatgagttatggtcaaattact 55476996  T
Q  148 gcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55476995 gcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 14567595 - 14567653
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 66  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567595 tgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgatt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17463701 - 17463663
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463701 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49231866 - 49231768
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  49231866 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 1468614 - 1468723
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  1468614 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 1468713  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  1468714 tcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528714
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaact 14528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 3264464 - 3264530
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3264464 tgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtat 3264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 6468773 - 6468811
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468773 gagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15412954 - 15412916
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412954 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17207601 - 17207567
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17207601 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17207567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25201281 - 25201247
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25201281 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25201247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 50351882 - 50351916
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351882 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50351916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 3528206 - 3528239
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3528206 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3528239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276563
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaact 8276563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16979585 - 16979504
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  16979585 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 16979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18890039 - 18889958
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  18890039 aattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30152547 - 30152450
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  30152547 gtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351697
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50351697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 54330969 - 54331002
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54330969 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 54331002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17207664 - 17207632
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17207664 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 17207632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18809394 - 18809117
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18809394 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 18809295  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809294 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 18809195  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18809194 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 18809117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 23711724 - 23712001
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23711724 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 23711823  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711824 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 23711923  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23711924 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 23712001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26505830 - 26505553
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26505830 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 26505731  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505730 tcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 26505631  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505630 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 26505553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26508308 - 26508031
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26508308 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 26508209  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508208 tcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 26508109  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26508108 ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 26508031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28577550 - 28577273
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28577550 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 28577451  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577450 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 28577351  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28577350 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 28577273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24897906 - 24898183
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24897906 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 24898005  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898006 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 24898105  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898106 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24898183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24905343 - 24905620
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24905343 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 24905442  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905443 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 24905542  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905543 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24905620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24900389 - 24900666
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24900389 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 24900488  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24900489 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg 24900588  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900589 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24900666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24902866 - 24903143
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24902866 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 24902965  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24902966 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg 24903065  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903066 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24903143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 24907818 - 24908095
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24907818 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgact 24907917  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907918 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 24908017  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908018 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 24908095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39682765 - 39682487
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39682765 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 39682666  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39682665 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 39682566  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682565 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 39682487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 23709243 - 23709520
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23709243 tgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgact 23709342  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709343 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 23709442  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709443 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 23709520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 571849 - 571571
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  571849 tgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacg 571750  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  571749 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 571650  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  571649 tttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 571571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23131314 - 23131036
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23131314 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 23131215  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23131214 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 23131115  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23131114 tttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 23131036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23133781 - 23133503
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23133781 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 23133682  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23133681 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 23133582  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133581 tttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 23133503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23136031 - 23135764
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23136031 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgact 23135932  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  23135931 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagta----------tatg 23135842  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  23135841 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttga 23135764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 34402232 - 34402510
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34402232 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgact 34402331  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34402332 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatg 34402431  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402432 tttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 34402510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20261671 - 20261401
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20261671 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 20261572  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  20261571 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 20261472  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20261471 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 20261401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 32039209 - 32039486
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  32039209 tgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgact 32039308  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039309 tcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 32039408  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32039409 ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttga 32039486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 45027615 - 45027840
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45027615 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgact 45027714  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027715 tcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 45027814  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45027815 ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 23706927 - 23707169
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23706927 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgact 23707026  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23707027 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 23707126  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23707127 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24671477 - 24671235
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671477 tgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgact 24671378  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24671377 tcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24671278  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24671277 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 24642459 - 24642701
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642459 tgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 24642558  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24642559 tcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24642658  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642659 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24681896 - 24681654
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24681896 tgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggct 24681797  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24681796 tccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24681697  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24681696 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24918592 - 24918350
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24918592 tgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgact 24918493  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24918492 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 24918393  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24918392 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38967931 - 38967689
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38967931 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgact 38967832  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38967831 tcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 38967732  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38967731 tttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24368278 - 24368077
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24368278 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 24368179  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368178 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 24368079  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  24368078 tt 24368077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 32214641 - 32214901
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32214641 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgact 32214740  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  32214741 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg---------t 32214831  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32214832 ttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 32214901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 24529259 - 24529506
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24529259 aaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttc 24529358  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-t 208  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24529359 aaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 24529458  T
Q  209 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24529459 tgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatat 24529506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6726499 - 6726249
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726499 tgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 6726400  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6726399 tcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatg 6726300  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  6726299 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 6726249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 257
Target Start/End: Original strand, 41523783 - 41524033
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41523783 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgact 41523882  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41523883 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg 41523982  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     || ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  41523983 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 41524033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 10684473 - 10684745
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10684473 tgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 10684572  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat- 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10684573 tcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatata 10684672  T
Q  207 gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata--atgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  10684673 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaatta 10684745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21154718 - 21154919
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21154718 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 21154817  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154818 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 21154917  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  21154918 tt 21154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22105917 - 22105716
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22105917 tgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 22105818  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105817 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 22105718  T
Q  208 tt 209  Q
    ||    
T  22105717 tt 22105716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616365
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  160 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataa 258  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatga 25616382  T
Q  259 tgtttcaagatgttgat 275  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25616381 tgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23931912 - 23931775
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23931912 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgact 23931813  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23931812 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22106110 - 22105951
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  22106110 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 22106011  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106010 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 41523397 - 41523552
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41523397 tgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 41523496  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523497 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 41523590 - 41523749
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  41523590 tgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgact 41523689  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523690 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 24529064 - 24529223
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  24529064 tgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacg 24529163  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529164 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 21154525 - 21154684
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  21154525 tgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 21154624  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154625 tcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24368471 - 24368312
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  24368471 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 24368372  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368371 tcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24918785 - 24918626
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||     
T  24918785 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacg 24918686  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918685 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726169
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 6726180  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  6726179 ttattatttga 6726169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967548
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttga 38967559  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  38967558 ttattatttga 38967548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23932105 - 23931949
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  23932105 tgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacg 23932006  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 164  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23932005 tcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6726692 - 6726533
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  6726692 tgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 6726593  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726592 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 23709050 - 23709209
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  23709050 tgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacg 23709149  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709150 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 32214449 - 32214604
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  32214449 aaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtc 32214548  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 165  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214549 aaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155048
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattat 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattat 21155041  T
Q  279 tatttga 285  Q
    |||||||    
T  21155042 tatttga 21155048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 21154332 - 21154491
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  21154332 tgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 21154431  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154432 tcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 23706543 - 23706702
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  |      
T  23706543 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatg 23706642  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706643 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24682089 - 24681930
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||| || ||||     
T  24682089 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgaca 24681990  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681989 tcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105587
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22105598  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||| ||||||    
T  22105597 ttataatttga 22105587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 23706735 - 23706889
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| ||| ||| ||||     
T  23706735 tgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacg 23706834  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacag 162  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23706835 tcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367948
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttgg 24367959  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  24367958 ttattatttga 24367948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 45027422 - 45027579
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  45027422 tgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacg 45027521  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 165  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027522 tcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24671667 - 24671511
Alignment:
Q  11 aatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttca 110  Q
    ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||  |||||| |||    
T  24671667 aatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatca 24671568  T
Q  111 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671567 aaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707312
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 23707299  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  23707300 gattatcatttga 23707312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642844
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 24642831  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  24642832 gattatgatttga 24642844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918207
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 24918220  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  24918219 gattatcatttga 24918207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671092
Alignment:
Q  178 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgttgat 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgat 24671102  T
Q  276 tattatttga 285  Q
    ||| ||||||    
T  24671101 tatcatttga 24671092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681535
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgttt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgttt 24681535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31345631 - 31345570
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345631 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  102 ttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45029840
Alignment:
Q  227 catgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattattt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattattt 45029840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 217
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686144
Alignment:
Q  181 tgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatata 22686144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686707
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| | |||||      
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  24686698 tcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  115 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23131385 - 23131347
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131385 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 23711652 - 23711690
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711652 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26505902 - 26505864
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505902 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26508380 - 26508342
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508380 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 27920403 - 27920441
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920403 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 32039137 - 32039175
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039137 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 34402161 - 34402199
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402161 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 11232213 - 11232322
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  11232213 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 11232312  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  11232313 tcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887364
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaact 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaact 19887364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22514060 - 22514169
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  22514060 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 22514159  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22514160 tcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27261441 - 27261332
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||      
T  27261441 aattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatga 27261342  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27261341 tcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 28776662 - 28776771
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  28776662 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 28776761  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  28776762 tcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12727807 - 12727711
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12727807 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatatt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 571913 - 571883
Alignment:
Q  137 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571913 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 1384411 - 1384445
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1384411 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1384445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20915509 - 20915475
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915509 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20915475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 21316436 - 21316470
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21316436 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 21336329 - 21336363
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21336329 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21336363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21368386 - 21368352
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21368386 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21368352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22690085 - 22690051
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22690085 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22690051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22694681 - 22694647
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22694681 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22694647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23133852 - 23133814
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133852 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 25587416 - 25587450
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25587416 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25587450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 36736894 - 36736928
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36736894 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36736928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39682829 - 39682799
Alignment:
Q  137 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682829 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 1384349 - 1384382
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1384349 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1384382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6483194 - 6483113
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483194 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 21081348 - 21081429
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  21081348 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgattt 21081429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 28345851 - 28345884
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28345851 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 28345884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  131 gttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 109
Target Start/End: Original strand, 34135059 - 34135119
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135059 ggtgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatg 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 94862 - 94585
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94862 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 94763  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94762 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 94663  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  94662 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 94585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 17150 - 17420
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17150 tgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgact 17249  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17250 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatg 17349  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17350 cttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 17420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 16957 - 17116
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||      
T  16957 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgata 17056  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17057 tcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6398 - 6121
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6398 tgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 6299  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6298 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 6199  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6198 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40851 - 40574
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40851 tgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 40752  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40751 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 40652  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  40651 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttga 40574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37848
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  37869 tcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40923 - 40885
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14399 - 14121
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14399 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 14300  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14299 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 14200  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14199 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 14121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 23241 - 23484
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23241 tgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgact 23340  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23341 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 23440  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 22888 - 23047
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  22888 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 22987  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22988 tcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 167
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  81 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 20722 - 20764
Alignment:
Q  9 gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggt 51  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20722 gaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 23081 - 23118
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtc 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23081 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38273 - 37995
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38273 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 38174  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38173 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 38074  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38073 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 37995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |     ||||||| ||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  149 cacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 20921
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21193 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 21094  T
Q  114 ggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21093 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 20994  T
Q  213 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20993 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 20921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13844 - 13566
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13844 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgact 13745  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13744 tcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 13645  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13644 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 13566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13916 - 13878
Alignment:
Q  129 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13916 gagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9693 - 9424
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9693 tgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgact 9594  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9593 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 9494  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  9493 ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgatta 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5146 - 4876
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  5146 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgact 5047  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5046 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 4947  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  4946 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgatta 4876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 5180
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||     
T  5339 tgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacg 5240  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5239 tcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 4013 - 4293
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 4112  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4113 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 4212  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  4213 tttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 4293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 3820 - 3979
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||      
T  3820 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatg 3919  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3920 tcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 3627 - 3782
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  3627 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgagg 3726  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 163  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3727 tcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  115 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11741 - 11470
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  11741 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgact 11642  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11641 tcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 11542  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-taatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11541 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatta 11470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 3205
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3475 tgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 3376  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3375 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg 3276  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  3275 tttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgatta 3205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 234 - 476
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  234 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 333  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  334 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 433  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  434 tttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 6646 - 6902
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||  |||     
T  6646 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacg 6745  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6746 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 6845  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgttt 263  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6846 tttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6612
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  6453 tgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacg 6552  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6553 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 659 - 416
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  659 tgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgact 560  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  559 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatg 460  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  459 tttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1012 - 853
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  1012 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 913  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  912 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  81 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 819 - 782
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtc 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  819 tgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30471 - 30229
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  30471 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcact 30372  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30371 tcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 30272  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30271 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30664 - 30505
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||| ||||     
T  30664 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacg 30565  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30564 tcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30116
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 30116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10243 - 10001
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10243 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgact 10144  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10143 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatg 10044  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10043 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10277
Alignment:
Q  10 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  10434 aaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatc 10335  T
Q  110 aaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10334 aaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10629 - 10470
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  10629 tgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacg 10530  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10529 tcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 799
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1041 tgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 942  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  941 tcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatg 842  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  841 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  118 ttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 656
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 669  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  668 gattatcatttga 656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1227
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  1353 tgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacg 1255  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  1254 tctaaacgatttatagaacttgagttat 1227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6903 - 6682
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6903 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 6804  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  6803 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg---------t 6713  T
Q  208 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6712 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7096 - 6937
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  7096 tgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacg 6997  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43191 - 42999
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43191 tgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 43092  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43091 tcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgaat 42999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 241
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  150 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43384 - 43225
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43384 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacg 43285  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43284 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15094
Alignment:
Q  30 tggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactag 129  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||| |    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  130 agttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtcca 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtcca 15153  T
Q  229 tgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  15152 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 15094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 11050 - 11256
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||  |||     
T  11050 tgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacg 11149  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11150 tcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 11249  T
Q  208 ttgtgaa 214  Q
    |||||||    
T  11250 ttgtgaa 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 10857 - 11016
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  10857 tgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacg 10956  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15556 - 15398
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15556 tgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgaca 15458  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457 tcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53862
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  237 gaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgttgattattatttga 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  53812 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttga 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Original strand, 38366 - 38636
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| |||| | ||||||||  ||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38366 tgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 38465  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38466 tcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 38565  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38566 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 38636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1610
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  157 tcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata 255  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata 1632  T
Q  256 taatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    | || ||| |||||||||||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgatta 1610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10955
Alignment:
Q  90 aatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  190 agtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgatta 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 10955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7996
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8191 tgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgact 8092  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 203  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8091 tcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8384 - 8225
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  8384 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacg 8285  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8284 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8577 - 8421
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  | ||||| ||||     
T  8577 tgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacg 8478  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 164  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8477 tcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 68413 - 68227
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  68413 tgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgact 68314  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68313 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 501516 - 501258
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501516 tgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgact 501418  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||| |||||||||    
T  501417 tcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa-------------------tatgtatgtatatg 501337  T
Q  208 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  501336 tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttga 501258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 501709 - 501550
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  501709 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatg 501610  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501609 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1899 - 1740
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1899 tgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 1800  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1799 tcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1706 - 1640
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1706 tgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31655 - 31497
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  31655 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacg 31556  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31555 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18423
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  18582 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacg 18483  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18482 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57708
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaata 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgat 232  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33623 - 33465
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  33623 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacg 33524  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33523 taaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18105 - 17947
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| ||||     
T  18105 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacg 18006  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18005 tcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8470 - 8311
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8470 tgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgact 8371  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8370 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7558
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |    
T  7408 aaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatg 7507  T
Q  116 atttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7508 atttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 7208 - 7367
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||     
T  7208 tgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacg 7307  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7308 tcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 36
Target Start/End: Original strand, 7593 - 7621
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtaca 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7593 tgaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27963
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 27974  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
    |||||||||||    
T  27973 ttattatttga 27963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28043
Alignment:
Q  111 aaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-tt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  210 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatata 257  Q
     ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtata 28043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39784 - 39626
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||     
T  39784 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacg 39685  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39684 tcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 19799 - 19957
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  19799 tgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacg 19898  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 166  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19899 tcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  41 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  141 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 36909 - 37068
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36909 tgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacg 37008  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37009 tcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10875
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttga 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttga 10864  T
Q  275 ttattatttga 285  Q
     ||||||||||    
T  10865 gtattatttga 10875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  163 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15262
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 15249  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  15250 gattatcatttga 15262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  151 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatg---------tttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36054
Alignment:
Q  187 attagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatg-aagtgttatatgtatatataatgtttcaagatgttgattattatttga 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttga 36054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1316
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatataatgtttca--agatgtt 272  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgttgagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 1303  T
Q  273 gattattatttga 285  Q
    |||||| ||||||    
T  1304 gattatcatttga 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9934
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 256  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatat 9934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 75615 - 75681
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75615 tgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 113468 - 113317
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  113468 tgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgact 113369  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
     ||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  113368 ccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1098
Alignment:
Q  175 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1133 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||      
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30470
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  30479 tcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 254  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15350
Alignment:
Q  182 gatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaa 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 405
Alignment:
Q  8 tgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  471 tgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtat 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7039
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6941 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 12520 - 12590
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12520 atgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1375
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||| |||||||      
T  1484 aattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatga 1385  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  1384 tcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38484 - 38375
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  38484 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38385  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  38384 tcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110174
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  110165 tcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118675
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||      
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  118666 tcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15876 - 15780
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaatta 145  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  15876 ggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7353
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 7382 - 7416
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2598
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2564 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 721 - 687
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  721 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6227 - 6193
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6227 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 6193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10033 - 9999
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10033 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 9999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29880 - 29846
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29880 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3184 - 3150
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3184 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 3150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 24654 - 24688
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24654 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 24688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 24717 - 24751
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 24751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 7508 - 7542
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7508 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7478
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7445 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 36287 - 36321
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36287 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 208
Target Start/End: Original strand, 36350 - 36382
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36350 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 36382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54044 - 53958
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttat 135  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  54044 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttat 53958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 62057 - 62023
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  62057 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 62023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 46667 - 46701
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46667 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 46701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 19911 - 20009
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19911 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 120235 - 120190
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgat 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  120235 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 120190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 142809 - 142775
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  142809 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 142775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 103752 - 103716
Alignment:
Q  45 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgtt 81  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  103752 cttaggtgtaaacatgaaaattgtaggtataaatgtt 103716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29428 - 29394
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29428 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18205
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||| |||||||      
T  18314 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatga 18215  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  18214 tcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18553 - 18520
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18553 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28469
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||      
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  28478 tcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 210
Target Start/End: Original strand, 18424 - 18464
Alignment:
Q  170 ttgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 210  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18424 ttgattatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttg 18464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66818
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatga 231  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  66762 atgaatgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatga 66818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University