View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6865A_low_120 (Length: 284)

Name: NF6865A_low_120
Description: NF6865A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6865A_low_120
NF6865A_low_120
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-284)||(16041124-16041407)
chr7 (1-284)||(16450057-16450340)
chr7 (1-256)||(31088523-31088778)
chr7 (1-256)||(45733289-45733544)
chr7 (21-284)||(16503459-16503725)
chr7 (21-284)||(16518495-16518761)
chr7 (21-284)||(10916947-10917210)
chr7 (21-284)||(5127790-5128056)
chr7 (42-278)||(5159326-5159562)
chr7 (1-284)||(11424835-11425121)
chr7 (21-284)||(2154371-2154637)
chr7 (42-284)||(26435055-26435300)
chr7 (21-284)||(5147419-5147685)
chr7 (21-284)||(4145202-4145468)
chr7 (21-284)||(16736539-16736805)
chr7 (21-284)||(16751593-16751859)
chr7 (21-284)||(17523330-17523596)
chr7 (21-284)||(17529619-17529885)
chr7 (1-100)||(2109064-2109163)
chr7 (1-100)||(26484679-26484778)
chr7 (21-284)||(45387141-45387407)
chr7 (1-100)||(18540784-18540883)
chr7 (1-100)||(39211082-39211181)
chr7 (21-284)||(26319948-26320214)
chr7 (21-284)||(9618449-9618715)
chr7 (21-284)||(26275173-26275439)
chr7 (1-100)||(2775344-2775443)
chr7 (135-284)||(11441358-11441507)
chr7 (135-284)||(24592737-24592886)
chr7 (80-284)||(26485885-26486089)
chr7 (135-284)||(3445092-3445241)
chr7 (135-284)||(26538069-26538218)
chr7 (135-284)||(31124709-31124858)
chr7 (135-284)||(31564595-31564744)
chr7 (21-284)||(26669993-26670259)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-284)||(1900072-1900355)
chr4 (1-283)||(15227686-15227968)
chr4 (1-283)||(15285101-15285383)
chr4 (1-256)||(24460778-24461033)
chr4 (1-282)||(14235698-14235982)
chr4 (21-284)||(24592507-24592770)
chr4 (21-283)||(14664831-14665096)
chr4 (1-282)||(15391511-15391790)
chr4 (21-283)||(17013813-17014078)
chr4 (42-278)||(24112483-24112719)
chr4 (42-278)||(34189174-34189410)
chr4 (42-284)||(36344729-36344971)
chr4 (21-284)||(14763497-14763763)
chr4 (42-284)||(6569665-6569910)
chr4 (42-284)||(14098353-14098598)
chr4 (42-284)||(54833202-54833444)
chr4 (42-284)||(31126732-31126977)
chr4 (21-284)||(27163510-27163776)
chr4 (42-284)||(21969513-21969758)
chr4 (135-284)||(5005682-5005831)
chr4 (155-284)||(19373073-19373202)
chr4 (135-284)||(30753554-30753703)
chr4 (135-284)||(40105948-40106097)
chr4 (135-284)||(18800932-18801081)
chr4 (135-284)||(33674120-33674269)
chr4 (135-284)||(39850435-39850584)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-284)||(21703326-21703609)
chr2 (1-256)||(27118512-27118767)
chr2 (1-256)||(31891490-31891745)
chr2 (1-283)||(19456583-19456865)
chr2 (1-256)||(34156835-34157090)
chr2 (1-256)||(34303465-34303720)
chr2 (1-256)||(3784478-3784733)
chr2 (1-256)||(16163423-16163678)
chr2 (21-284)||(27434626-27434892)
chr2 (21-284)||(23128748-23129014)
chr2 (21-284)||(12655335-12655601)
chr2 (21-284)||(28882007-28882273)
chr2 (21-284)||(20837711-20837977)
chr2 (3-284)||(13936708-13936992)
chr2 (1-282)||(27392788-27393048)
chr2 (21-284)||(34279242-34279508)
chr2 (21-284)||(37925286-37925552)
chr2 (21-284)||(34286147-34286413)
chr2 (21-284)||(34291207-34291473)
chr2 (21-284)||(11635368-11635637)
chr2 (135-284)||(11641677-11641826)
chr2 (21-284)||(21677364-21677630)
chr2 (42-284)||(16829541-16829786)
chr2 (42-284)||(16891695-16891940)
chr2 (45-284)||(31876074-31876316)
chr2 (21-284)||(32049591-32049857)
chr2 (147-284)||(37374954-37375091)
chr2 (80-284)||(261009-261213)
chr2 (21-284)||(34861473-34861739)
chr2 (21-284)||(37686091-37686357)
chr2 (21-284)||(37701356-37701622)
chr2 (141-284)||(12716910-12717053)
chr2 (135-284)||(39889855-39890004)
chr2 (135-284)||(40233292-40233441)
chr2 (21-284)||(22926210-22926476)
chr2 (135-280)||(19416798-19416943)
chr2 (135-284)||(12586594-12586743)
chr2 (141-284)||(39052133-39052276)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-276)||(22888287-22888562)
chr5 (1-284)||(25198838-25199121)
chr5 (1-256)||(13184718-13184973)
chr5 (1-256)||(33877084-33877339)
chr5 (1-256)||(11325631-11325886)
chr5 (1-256)||(13440564-13440819)
chr5 (1-281)||(23892015-23892298)
chr5 (21-280)||(30934446-30934705)
chr5 (21-284)||(11549160-11549426)
chr5 (21-284)||(23718078-23718344)
chr5 (21-284)||(23752540-23752806)
chr5 (21-238)||(24969876-24970090)
chr5 (21-283)||(33777294-33777559)
chr5 (21-284)||(22999204-22999470)
chr5 (21-284)||(24688247-24688513)
chr5 (42-278)||(33292340-33292576)
chr5 (3-284)||(32599544-32599825)
chr5 (3-112)||(29889154-29889263)
chr5 (42-284)||(18375523-18375768)
chr5 (21-284)||(9548633-9548899)
chr5 (21-284)||(30168275-30168541)
chr5 (21-284)||(41674515-41674781)
chr5 (42-284)||(33516162-33516407)
chr5 (42-284)||(34616327-34616569)
chr5 (135-284)||(3789332-3789481)
chr5 (135-284)||(31431234-31431383)
chr5 (21-284)||(8665565-8665831)
chr5 (21-284)||(12131961-12132227)
chr5 (21-284)||(15658850-15659116)
chr5 (21-284)||(5637716-5637982)
chr5 (21-284)||(9317257-9317523)
chr5 (21-284)||(26480198-26480464)
chr5 (21-283)||(15758947-15759212)
chr5 (141-284)||(24681243-24681386)
chr5 (141-284)||(24723770-24723913)
chr5 (135-284)||(18500955-18501104)
chr5 (135-284)||(31826626-31826775)
chr5 (135-284)||(37358862-37359011)
chr5 (135-284)||(37671699-37671848)
chr5 (135-284)||(43078055-43078204)
chr5 (21-284)||(30151824-30152090)
chr5 (42-280)||(29967177-29967418)
chr5 (42-280)||(30029225-30029466)
chr5 (135-284)||(6874108-6874257)
chr5 (135-284)||(37771206-37771355)
chr5 (21-284)||(2510857-2511123)
chr5 (135-283)||(13325051-13325199)
chr5 (246-284)||(24951916-24951954)
chr5 (135-284)||(37754774-37754923)
chr5 (135-284)||(28649032-28649181)
chr5 (243-284)||(40473867-40473908)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-284)||(16626720-16627003)
chr3 (1-256)||(17993998-17994253)
chr3 (1-256)||(4625733-4625988)
chr3 (1-256)||(5652176-5652431)
chr3 (1-282)||(18530157-18530432)
chr3 (21-284)||(15892940-15893206)
chr3 (21-284)||(8301501-8301764)
chr3 (21-284)||(18051020-18051286)
chr3 (9-284)||(8295733-8296008)
chr3 (21-256)||(5713013-5713251)
chr3 (21-256)||(5723923-5724161)
chr3 (21-256)||(5757316-5757554)
chr3 (21-256)||(5768207-5768445)
chr3 (21-284)||(35880524-35880790)
chr3 (21-278)||(22387812-22388069)
chr3 (21-284)||(4796887-4797153)
chr3 (42-278)||(4892977-4893213)
chr3 (21-284)||(18330432-18330693)
chr3 (3-278)||(32438921-32439196)
chr3 (42-284)||(8211499-8211741)
chr3 (21-284)||(29148989-29149255)
chr3 (21-284)||(4721389-4721655)
chr3 (21-284)||(6192074-6192340)
chr3 (42-284)||(20065804-20066046)
chr3 (21-282)||(7072972-7073236)
chr3 (135-284)||(15741433-15741582)
chr3 (21-284)||(18277286-18277552)
chr3 (21-284)||(18292587-18292853)
chr3 (21-284)||(18307888-18308154)
chr3 (1-284)||(10395894-10396177)
chr3 (3-284)||(4346903-4347184)
chr3 (42-284)||(17985211-17985456)
chr3 (42-284)||(18224949-18225194)
chr3 (42-280)||(28021040-28021278)
chr3 (21-284)||(28116188-28116457)
chr3 (1-100)||(32292697-32292796)
chr3 (81-284)||(5596663-5596866)
chr3 (1-100)||(31034331-31034430)
chr3 (135-284)||(29665336-29665485)
chr3 (21-284)||(7996320-7996586)
chr3 (21-284)||(10642828-10643094)
chr3 (21-284)||(47023211-47023477)
chr3 (42-284)||(21674451-21674696)
chr3 (134-284)||(5466743-5466893)
chr3 (135-284)||(6542825-6542974)
chr3 (135-284)||(11110712-11110861)
chr3 (135-284)||(22871225-22871374)
chr3 (135-284)||(22886284-22886433)
chr3 (21-284)||(28339060-28339326)
chr3 (21-284)||(31964707-31964973)
chr3 (21-284)||(50134305-50134571)
chr3 (135-284)||(5013470-5013619)
chr3 (135-280)||(24327921-24328066)
chr3 (135-284)||(36997440-36997589)
chr3 (21-284)||(5609556-5609822)
chr3 (80-284)||(18242485-18242689)
chr3 (135-284)||(4416674-4416823)
chr3 (135-284)||(20577213-20577362)
chr3 (135-284)||(48465673-48465822)
chr3 (135-284)||(51781769-51781918)
chr3 (135-284)||(51796858-51797007)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-256)||(2831-3086)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (1-256)||(13522189-13522444)
chr6 (1-256)||(28162482-28162737)
chr6 (1-256)||(33374372-33374627)
chr6 (1-256)||(8892426-8892681)
chr6 (1-256)||(8903661-8903916)
chr6 (1-282)||(22477389-22477673)
chr6 (1-284)||(20160498-20160781)
chr6 (1-284)||(22172050-22172333)
chr6 (21-284)||(22935016-22935279)
chr6 (21-284)||(23857461-23857724)
chr6 (21-284)||(15424453-15424719)
chr6 (21-284)||(24304754-24305020)
chr6 (21-283)||(13299087-13299352)
chr6 (21-284)||(26988795-26989061)
chr6 (42-284)||(29549272-29549514)
chr6 (21-284)||(26918174-26918440)
chr6 (21-284)||(26999867-27000133)
chr6 (21-284)||(16749648-16749914)
chr6 (21-284)||(24863511-24863777)
chr6 (1-124)||(22457050-22457176)
chr6 (21-284)||(4525083-4525346)
chr6 (42-284)||(27044184-27044426)
chr6 (1-112)||(27290486-27290597)
chr6 (81-284)||(29501200-29501403)
chr6 (42-284)||(30558173-30558418)
chr6 (3-284)||(29572807-29573091)
chr6 (5-100)||(14143405-14143500)
chr6 (5-100)||(26787925-26788020)
chr6 (5-100)||(27196298-27196393)
chr6 (5-100)||(27252847-27252942)
chr6 (80-272)||(27629907-27630099)
chr6 (135-284)||(4546037-4546186)
chr6 (135-284)||(4724396-4724545)
chr6 (135-284)||(27007506-27007655)
chr6 (135-284)||(28207236-28207385)
chr6 (80-284)||(27484911-27485115)
chr6 (135-284)||(3695857-3696006)
chr6 (135-284)||(4757555-4757704)
chr6 (135-284)||(4772791-4772940)
chr6 (135-280)||(16944280-16944425)
chr6 (135-284)||(17025056-17025205)
chr6 (135-284)||(27360263-27360412)
chr6 (135-284)||(27450606-27450755)
chr6 (135-284)||(34463614-34463763)
chr6 (135-284)||(26116672-26116821)
chr6 (135-280)||(26777880-26778025)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-256)||(20340508-20340763)
chr1 (1-284)||(16208204-16208484)
chr1 (1-284)||(20460904-20461163)
chr1 (1-100)||(28151845-28151944)
chr1 (21-280)||(28584781-28585043)
chr1 (21-284)||(41793501-41793767)
chr1 (42-284)||(10962466-10962711)
chr1 (42-284)||(51638014-51638259)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-256)||(9354450-9354705)
chr8 (1-256)||(19659171-19659426)
chr8 (1-256)||(44562929-44563184)
chr8 (9-284)||(16283246-16283524)
chr8 (1-282)||(22081010-22081288)
chr8 (21-284)||(2137411-2137677)
chr8 (21-284)||(14557424-14557687)
chr8 (21-284)||(16277351-16277617)
chr8 (21-284)||(27609057-27609323)
chr8 (21-284)||(19687895-19688161)
chr8 (21-284)||(18710383-18710649)
chr8 (42-284)||(19286262-19286504)
chr8 (135-282)||(19674237-19674384)
chr8 (135-284)||(31490019-31490168)
chr8 (21-284)||(31354321-31354587)
chr8 (1-100)||(33244649-33244748)
chr8 (21-284)||(19208512-19208778)
chr8 (135-284)||(3329788-3329937)
chr8 (135-284)||(29829110-29829259)
chr8 (21-284)||(28362107-28362373)
chr8 (135-284)||(19518412-19518561)
chr8 (135-280)||(33258524-33258669)
chr8 (135-280)||(12093002-12093147)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-284)||(20209-20471)
scaffold0124 (42-284)||(30250-30494)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (21-284)||(29560-29826)
scaffold0089 (21-284)||(40262-40528)
scaffold0089 (21-284)||(47178-47444)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-282)||(21366-21644)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (21-284)||(27089-27355)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (42-284)||(344-589)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (5-112)||(205-312)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (42-284)||(15144-15389)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (21-284)||(7432-7698)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (101-284)||(8029-8212)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (42-284)||(26416-26661)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (135-284)||(7734-7883)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (21-284)||(9259-9525)
scaffold0159 (21-284)||(19812-20078)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (135-284)||(43-192)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16041407 - 16041124
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041407 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 16041308  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16041307 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 16041208  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16041207 ggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 16041124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 16450057 - 16450340
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16450057 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 16450156  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16450157 agctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaag 16450256  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16450257 ggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccg 16450340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 31088523 - 31088778
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31088523 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31088622  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31088623 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 31088722  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31088723 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 31088778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45733544 - 45733289
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  45733544 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 45733445  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45733444 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 45733345  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45733344 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 45733289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 16503459 - 16503725
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16503459 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtt 16503558  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  16503559 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacgg 16503658  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503659 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 16503725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 16518495 - 16518761
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16518495 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtt 16518594  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  16518595 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacgg 16518694  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518695 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 16518761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 10916947 - 10917210
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  10916947 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttca 10917046  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |    
T  10917047 tctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcac 10917146  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||| ||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917147 atatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 10917210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5128056 - 5127790
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5128056 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 5127957  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  5127956 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 5127857  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127856 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 5127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5159562 - 5159326
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  5159562 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 5159463  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || |     
T  5159462 cagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaa 5159363  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5159362 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11424835 - 11425121
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttg 97  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | ||||||||    
T  11424835 ttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11424934  T
Q  98 ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
    |||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  11424935 ttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaag 11425034  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    || ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425035 aaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 11425121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2154637 - 2154371
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||  |   ||||||||    
T  2154637 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgtt 2154538  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
      || || ||| | |  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  2154537 ttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 2154438  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154437 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 2154371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26435300 - 26435055
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  26435300 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcat 26435201  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  26435200 tgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggagg 26435101  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26435100 catttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccg 26435055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 5147419 - 5147685
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||  ||   ||||||||    
T  5147419 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtt 5147518  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  5147519 tcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 5147618  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| || ||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5147619 catatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccg 5147685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 4145202 - 4145468
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  4145202 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 4145301  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    | |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  4145302 gtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 4145401  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4145402 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 4145468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 16736539 - 16736805
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  16736539 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 16736638  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  16736639 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16736738  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16736739 catatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 16736805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 16751593 - 16751859
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  16751593 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 16751692  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  16751693 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16751792  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16751793 catatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 16751859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17523596 - 17523330
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  17523596 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 17523497  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  17523496 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 17523397  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17523396 catatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 17523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 17529619 - 17529885
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  17529619 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 17529718  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  17529719 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 17529818  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17529819 catatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 17529885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 2109064 - 2109163
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2109064 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26484778 - 26484679
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26484778 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45387407 - 45387141
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  45387407 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 45387308  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |    
T  45387307 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 45387208  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45387207 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 45387141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18540883 - 18540784
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18540883 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 39211082 - 39211181
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  39211082 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 26319948 - 26320214
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  26319948 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtt 26320047  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  26320048 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 26320147  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26320148 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 26320214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9618715 - 9618449
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  9618715 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 9618616  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  9618615 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 9618516  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9618515 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 9618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 26275173 - 26275439
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  26275173 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 26275272  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  26275273 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 26275372  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26275373 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 26275439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2775443 - 2775344
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  2775443 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441358
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 11441408  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11441407 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 11441358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 24592737 - 24592886
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  24592737 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 24592836  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24592837 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 24592886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 26485885 - 26486089
Alignment:
Q  80 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 179  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || |||    
T  26485885 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactga 26485984  T
Q  180 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatt 279  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  26485985 tggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgatt 26486084  T
Q  280 gaccg 284  Q
    |||||    
T  26486085 gaccg 26486089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3445241 - 3445092
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  3445241 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 3445142  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3445141 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 3445092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 26538069 - 26538218
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||    
T  26538069 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 26538168  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  26538169 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccg 26538218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31124858 - 31124709
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| | ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  31124858 gcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 31124759  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31124758 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 31124709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 31564595 - 31564744
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  31564595 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 31564694  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31564695 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 31564744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 26669993 - 26670259
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  26669993 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 26670092  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  26670093 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 26670192  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  26670193 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccg 26670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1900355 - 1900072
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1900355 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttg 1900256  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1900255 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 1900156  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1900155 ggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 1900072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15227968 - 15227686
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15227968 ttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 15227869  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227868 agctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 15227769  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15227768 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgacc 15227686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15285101 - 15285383
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285101 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 15285200  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15285201 agttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 15285300  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15285301 ggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgacc 15285383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 24460778 - 24461033
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24460778 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 24460877  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24460878 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaag 24460977  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24460978 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 24461033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14235698 - 14235982
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttg 97  Q
    |||| ||||||||| | ||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  14235698 ttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttg 14235797  T
Q  98 ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
     ||| | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  14235798 ctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaag 14235897  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    || ||||||||||||||||||  |||| |||||  | |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  14235898 aaaggatgctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgac 14235982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 24592507 - 24592770
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||    
T  24592507 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 24592606  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |    
T  24592607 tctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcac 24592706  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592707 atatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 24592770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14665096 - 14664831
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  14665096 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 14664997  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  14664996 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 14664897  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
     ||||| |||||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664896 tgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 14664831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15391511 - 15391790
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||       
T  15391511 ttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg--- 15391607  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
    | |  | |||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| |||    
T  15391608 agccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaag 15391704  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagc-aacagtagccatggattgac 282  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| | |||  |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15391705 aaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgac 15391790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17014078 - 17013813
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  17014078 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 17013979  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  17013978 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 17013879  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    |||||| |||||  | ||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013878 cgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 17013813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24112719 - 24112483
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  24112719 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 24112620  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || |     
T  24112619 cagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaa 24112520  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24112519 ctgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 34189174 - 34189410
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  34189174 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 34189273  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || |     
T  34189274 cagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaa 34189373  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34189374 ctgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 36344729 - 36344971
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  36344729 gcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 36344828  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |     
T  36344829 caggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcat 36344928  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36344929 ttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 36344971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 14763497 - 14763763
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  14763497 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 14763596  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    |||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  14763597 gcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 14763696  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14763697 cacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 14763763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6569910 - 6569665
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg---ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  6569910 gcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcat 6569811  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  6569810 taacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 6569711  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6569710 catttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 6569665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14098598 - 14098353
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  14098598 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 14098499  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  14098498 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 14098399  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14098398 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 14098353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54833444 - 54833202
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| |    
T  54833444 gcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattga 54833345  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |     
T  54833344 caggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcat 54833245  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54833244 ttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 54833202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 31126732 - 31126977
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  31126732 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 31126831  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  31126832 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 31126931  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31126932 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 31126977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 27163510 - 27163776
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  27163510 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 27163609  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |    
T  27163610 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 27163709  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27163710 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 27163776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21969758 - 21969513
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||    
T  21969758 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 21969659  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||   ||||||    
T  21969658 tgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggagg 21969559  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21969558 catttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 21969513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5005831 - 5005682
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  5005831 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 5005732  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5005731 gaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 5005682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373073
Alignment:
Q  155 ttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattg 254  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  255 ataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccg 19373073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753554
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 30753604  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30753603 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccg 30753554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 40105948 - 40106097
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  40105948 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 40106047  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40106048 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 40106097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 18800932 - 18801081
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  18800932 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 18801031  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18801032 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccg 18801081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 33674120 - 33674269
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  33674120 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 33674219  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33674220 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 33674269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39850584 - 39850435
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  39850584 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 39850485  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39850484 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccg 39850435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 21703326 - 21703609
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703326 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 21703425  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21703426 aactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 21703525  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21703526 ggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 21703609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27118767 - 27118512
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27118767 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27118668  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27118667 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 27118568  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27118567 ggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 27118512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 31891490 - 31891745
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31891490 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 31891589  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31891590 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 31891689  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31891690 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 31891745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 19456583 - 19456865
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19456583 ttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 19456682  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19456683 agctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 19456782  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19456783 ggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgacc 19456865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34157090 - 34156835
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  34157090 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 34156991  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34156990 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 34156891  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34156890 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 34156835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 34303465 - 34303720
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34303465 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 34303564  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34303565 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 34303664  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303665 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 34303720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3784733 - 3784478
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  3784733 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 3784634  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3784633 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 3784534  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3784533 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 3784478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16163678 - 16163423
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16163678 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 16163579  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16163578 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaag 16163479  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16163478 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 16163423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 27434626 - 27434892
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||| ||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  27434626 agtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 27434725  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  27434726 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacgg 27434825  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434826 cgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 27434892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 23128748 - 23129014
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  23128748 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 23128847  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  23128848 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 23128947  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128948 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 23129014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12655601 - 12655335
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  12655601 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 12655502  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  12655501 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 12655402  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655401 cgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 12655335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28882273 - 28882007
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  28882273 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 28882174  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  28882173 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 28882074  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882073 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 28882007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20837977 - 20837711
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  20837977 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 20837878  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  20837877 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 20837778  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||| | |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837777 cgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 20837711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 13936708 - 13936992
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgtt 99  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||   |||||||||||||    
T  13936708 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgtt 13936807  T
Q  100 gaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaa 199  Q
    |||| ||  ||||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  13936808 gaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaa 13936907  T
Q  200 gggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936908 aggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 13936992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27393048 - 27392788
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||          
T  27393048 ttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttg------ 27392955  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
                   ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| |||||     
T  27392954 ---------------ttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaa 27392870  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||   ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||    
T  27392869 ggatgctgagagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgac 27392788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34279508 - 34279242
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  34279508 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 34279409  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  34279408 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 34279309  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279308 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 34279242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37925552 - 37925286
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  37925552 agtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 37925453  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  37925452 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 37925353  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37925352 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 37925286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34286413 - 34286147
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  34286413 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 34286314  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||  |    
T  34286313 tcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacgg 34286214  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34286213 catatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 34286147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34291473 - 34291207
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  34291473 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 34291374  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||  |    
T  34291373 tcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacgg 34291274  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34291273 catatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 34291207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 11635368 - 11635637
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat------gctgttgttgttgaactggtggctgtt 114  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||      | |||||||||||||| ||   |||||    
T  11635368 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgtt 11635467  T
Q  115 gttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 214  Q
    ||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  11635468 gtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaata 11635567  T
Q  215 ttgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11635568 cggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 11635637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 11641677 - 11641826
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  11641677 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 11641776  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11641777 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 11641826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 21677364 - 21677630
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21677364 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 21677463  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  21677464 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 21677563  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677564 catatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 21677630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 16829541 - 16829786
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  16829541 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 16829640  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  16829641 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16829740  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16829741 catttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 16829786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16891940 - 16891695
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  16891940 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 16891841  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  16891840 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16891741  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16891740 catttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 16891695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31876316 - 31876074
Alignment:
Q  45 tacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |    
T  31876316 tacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattga 31876217  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    |||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |     
T  31876216 cgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 31876117  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31876116 ttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 31876074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32049857 - 32049591
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  32049857 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 32049758  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |    
T  32049757 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 32049658  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||   |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32049657 catatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 32049591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37374954
Alignment:
Q  147 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 246  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 37374992  T
Q  247 cagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37374991 ttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccg 37374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261213
Alignment:
Q  80 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 179  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  180 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatt 279  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  261109 tgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgatt 261208  T
Q  280 gaccg 284  Q
    |||||    
T  261209 gaccg 261213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34861739 - 34861473
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  34861739 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 34861640  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  34861639 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 34861540  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34861539 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 34861473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 37686091 - 37686357
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  37686091 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 37686190  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  37686191 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 37686290  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37686291 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 37686357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 37701356 - 37701622
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  37701356 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 37701455  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  37701456 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 37701555  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37701556 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 37701622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Original strand, 12716910 - 12717053
Alignment:
Q  141 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggta 240  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |    
T  12716910 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 12717009  T
Q  241 gctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12717010 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccg 12717053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39890004 - 39889855
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  39890004 gcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 39889905  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39889904 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 39889855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40233441 - 40233292
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||    
T  40233441 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 40233342  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40233341 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 40233292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 22926210 - 22926476
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  22926210 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 22926309  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  22926310 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 22926409  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22926410 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 22926476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Original strand, 19416798 - 19416943
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  19416798 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 19416897  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19416898 gaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattg 19416943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12586743 - 12586594
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || || ||  |||    
T  12586743 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacg 12586644  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12586643 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccg 12586594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Original strand, 39052133 - 39052276
Alignment:
Q  141 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggta 240  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  ||||||| |    
T  39052133 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 39052232  T
Q  241 gctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||||| |||||| |||||||||| || || || |||||||||    
T  39052233 tttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccg 39052276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22888562 - 22888287
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888562 ttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 22888463  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22888462 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 22888363  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatgg 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22888362 ggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25199121 - 25198838
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199121 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 25199022  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25199021 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 25198922  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198921 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 25198838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13184718 - 13184973
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13184718 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 13184817  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13184818 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 13184917  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13184918 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 13184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33877339 - 33877084
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33877339 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33877240  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33877239 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 33877140  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33877139 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 33877084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11325886 - 11325631
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  11325886 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 11325787  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11325786 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 11325687  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11325686 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 11325631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13440564 - 13440819
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13440564 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 13440663  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13440664 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 13440763  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13440764 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 13440819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23892298 - 23892015
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23892298 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttg 23892199  T
Q  101 ---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23892198 ttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaag 23892099  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattga 281  Q
    || ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23892098 aaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattga 23892015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30934705 - 30934446
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  30934705 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttca 30934606  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |    
T  30934605 tctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcac 30934506  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    ||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30934505 atatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattg 30934446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11549426 - 11549160
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  11549426 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 11549327  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  11549326 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacgg 11549227  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549226 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 11549160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 23718078 - 23718344
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  23718078 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 23718177  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  23718178 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 23718277  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718278 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 23718344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 23752540 - 23752806
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  23752540 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 23752639  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  23752640 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 23752739  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752740 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 23752806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24970090 - 24969876
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  24970090 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatg---ttgttgttgaaccggcagctgttgtttca 24969994  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  24969993 tctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgc 24969894  T
Q  221 atacgggtacaacggagg 238  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  24969893 atatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33777559 - 33777294
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  33777559 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 33777460  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  33777459 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 33777360  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777359 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 33777294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 22999204 - 22999470
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  22999204 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 22999303  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  22999304 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 22999403  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999404 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 22999470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 24688247 - 24688513
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  24688247 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 24688346  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  24688347 tcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacgg 24688446  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688447 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 24688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33292576 - 33292340
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  33292576 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 33292477  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || |     
T  33292476 cagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaa 33292377  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33292376 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 32599544 - 32599825
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaa 102  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||    
T  32599544 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaa 32599643  T
Q  103 ctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaaggg 202  Q
    |||| || || ||||| |  |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  32599644 ctggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgg 32599743  T
Q  203 atgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32599744 atgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccg 32599825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 29889154 - 29889263
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  29889154 gtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgag 29889253  T
Q  103 ctggtggctg 112  Q
    |||| |||||    
T  29889254 ctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 18375523 - 18375768
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  18375523 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 18375622  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  18375623 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 18375722  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18375723 catttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 18375768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 9548633 - 9548899
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||  ||   ||||||||    
T  9548633 agtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtt 9548732  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  9548733 tcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 9548832  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9548833 catatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 9548899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30168541 - 30168275
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  30168541 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 30168442  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  30168441 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatgg 30168342  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30168341 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccg 30168275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41674781 - 41674515
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  41674781 agtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 41674682  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||  |    
T  41674681 tcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacgg 41674582  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674581 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 41674515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33516407 - 33516162
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  33516407 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 33516308  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  33516307 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 33516208  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33516207 catttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 33516162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34616569 - 34616327
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| |    
T  34616569 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattga 34616470  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||  || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |     
T  34616469 caggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 34616370  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     || || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34616369 ttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccg 34616327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789332
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 3789382  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3789381 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 3789332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31431383 - 31431234
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  31431383 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 31431284  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31431283 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccg 31431234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 8665565 - 8665831
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  8665565 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 8665664  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  8665665 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 8665764  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8665765 catatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 8665831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12132227 - 12131961
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  12132227 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtt 12132128  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  12132127 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 12132028  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12132027 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 12131961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 15658850 - 15659116
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  15658850 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 15658949  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  15658950 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 15659049  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| || ||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15659050 cacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 15659116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5637982 - 5637716
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5637982 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 5637883  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  5637882 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 5637783  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5637782 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 5637716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9317523 - 9317257
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  9317523 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 9317424  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  9317423 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 9317324  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9317323 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 9317257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26480464 - 26480198
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  26480464 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 26480365  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  26480364 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 26480265  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26480264 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 26480198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 15758947 - 15759212
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  15758947 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 15759046  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  15759047 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 15759146  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15759147 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacc 15759212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24681386 - 24681243
Alignment:
Q  141 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggta 240  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |    
T  24681386 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 24681287  T
Q  241 gctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24681286 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccg 24681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24723913 - 24723770
Alignment:
Q  141 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggta 240  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |    
T  24723913 acgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 24723814  T
Q  241 gctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24723813 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccg 24723770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501104
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 18501054  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18501055 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 18501104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 31826626 - 31826775
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  31826626 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 31826725  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31826726 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 31826775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37359011
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 37358961  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37358962 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 37359011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 37671699 - 37671848
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  37671699 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 37671798  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37671799 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 37671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43078204 - 43078055
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||| |||    
T  43078204 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacg 43078105  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43078104 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccg 43078055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30152090 - 30151824
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  30152090 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 30151991  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  30151990 tcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 30151891  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30151890 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 30151824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Original strand, 29967177 - 29967418
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  29967177 gcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcat 29967276  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  29967277 tgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 29967376  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29967377 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 29967418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30029466 - 30029225
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  30029466 gcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcat 30029367  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  30029366 tgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 30029267  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30029266 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 30029225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6874257 - 6874108
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  6874257 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 6874158  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6874157 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccg 6874108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 37771206 - 37771355
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || ||| |||    
T  37771206 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacg 37771305  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37771306 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccg 37771355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2511123 - 2510857
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  2511123 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 2511024  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||  || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  2511023 tcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 2510924  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2510923 catatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 2510857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 13325051 - 13325199
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  13325051 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 13325150  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13325151 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgacc 13325199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24951954 - 24951916
Alignment:
Q  246 gcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24951954 gcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 24951916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37754923 - 37754774
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || ||  |||    
T  37754923 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacg 37754824  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37754823 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccg 37754774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28649181 - 28649032
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  28649181 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 28649082  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| | ||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  28649081 gaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccg 28649032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Original strand, 40473867 - 40473908
Alignment:
Q  243 tgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40473867 tgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccg 40473908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 16626720 - 16627003
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16626720 ttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 16626819  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16626820 agctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaag 16626919  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16626920 ggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 16627003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 17993998 - 17994253
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17993998 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 17994097  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17994098 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 17994197  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17994198 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 17994253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4625988 - 4625733
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  4625988 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 4625889  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4625888 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaag 4625789  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4625788 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 4625733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5652431 - 5652176
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5652431 ttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 5652332  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5652331 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaag 5652232  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5652231 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5652176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18530432 - 18530157
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  18530432 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg------ 18530339  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18530338 agctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 18530239  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18530238 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgac 18530157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 15892940 - 15893206
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   ||||||||    
T  15892940 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 15893039  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |    
T  15893040 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacgg 15893139  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893140 cgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 15893206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 8301501 - 8301764
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  8301501 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttca 8301600  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  8301601 tctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgc 8301700  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| | |||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8301701 atatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccg 8301764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18051286 - 18051020
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  18051286 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 18051187  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  18051186 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacgg 18051087  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051086 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 18051020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8296008 - 8295733
Alignment:
Q  9 tgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtg 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||      
T  8296008 tgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggca 8295909  T
Q  109 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 208  Q
     |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  8295908 actgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 8295809  T
Q  209 agagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| ||  ||||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295808 agaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 8295733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5713251 - 5713013
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5713251 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 5713152  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713151 tcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 5713052  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5713051 cgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5713013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5724161 - 5723923
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5724161 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 5724062  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724061 tcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 5723962  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5723961 cgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5723923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 5757316 - 5757554
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5757316 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 5757415  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757416 tcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 5757515  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5757516 cgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5757554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 5768207 - 5768445
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5768207 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 5768306  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768307 tcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 5768406  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5768407 cgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5768445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35880790 - 35880524
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  35880790 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 35880691  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  35880690 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 35880591  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880590 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 35880524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 22387812 - 22388069
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  22387812 agtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgca 22387911  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
      || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  22387912 cctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgc 22388011  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    ||| |||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22388012 ataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 4796887 - 4797153
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  4796887 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 4796986  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  4796987 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 4797086  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797087 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 4797153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4893213 - 4892977
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  4893213 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 4893114  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || |     
T  4893113 cagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaa 4893014  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4893013 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18330693 - 18330432
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  18330693 agtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 18330594  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  18330593 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacgg 18330499  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330498 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 18330432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32439196 - 32438921
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaa 102  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||    
T  32439196 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaa 32439097  T
Q  103 ctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaaggg 202  Q
    |||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  32439096 ctggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgg 32438997  T
Q  203 atgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 278  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32438996 atgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 32438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8211741 - 8211499
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| |    
T  8211741 gcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattga 8211642  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |     
T  8211641 caggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcat 8211542  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211541 ttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 8211499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 29148989 - 29149255
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  29148989 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 29149088  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  29149089 tcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacgg 29149188  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29149189 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccg 29149255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4721655 - 4721389
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  4721655 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 4721556  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
      || || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  |    
T  4721555 ttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacgg 4721456  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721455 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 4721389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6192340 - 6192074
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  6192340 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 6192241  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |    
T  6192240 tcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacgg 6192141  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192140 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 6192074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20066046 - 20065804
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| |    
T  20066046 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattga 20065947  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |     
T  20065946 caggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcat 20065847  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20065846 ttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 20065804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7073236 - 7072972
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  7073236 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 7073137  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  7073136 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 7073037  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073036 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgac 7072972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 15741433 - 15741582
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  |||    
T  15741433 gcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 15741532  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741533 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 15741582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 18277286 - 18277552
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  18277286 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 18277385  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    |||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  18277386 gcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18277485  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18277486 cacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 18277552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 18292587 - 18292853
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  18292587 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 18292686  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    |||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  18292687 gcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18292786  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18292787 cacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 18292853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 18307888 - 18308154
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  18307888 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 18307987  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    |||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  18307988 gcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18308087  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18308088 cacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccg 18308154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10396177 - 10395894
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttg 97  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | ||||||||    
T  10396177 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 10396078  T
Q  98 ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
    |||||||||   |||||||  |   || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  10396077 ttgaactggcaactgttgtacc---tgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaag 10395981  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    || |||||||| || ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10395980 aaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 10395894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 4346903 - 4347184
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaa 102  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||    
T  4346903 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaa 4347002  T
Q  103 ctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaaggg 202  Q
    |||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  4347003 ctggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgg 4347102  T
Q  203 atgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||| ||  ||  | | |||||  ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347103 atgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccg 4347184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 17985211 - 17985456
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  17985211 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 17985310  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  17985311 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 17985410  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17985411 catttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 17985456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18225194 - 18224949
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  18225194 gcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcat 18225095  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  18225094 tgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 18224995  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18224994 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 18224949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28021278 - 28021040
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| |    
T  28021278 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattga 28021179  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |     
T  28021178 caggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 28021079  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
     || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021078 ttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattg 28021040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 28116188 - 28116457
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat------gctgttgttgttgaactggtggctgtt 114  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||      | |||||||||||||| ||   |||||    
T  28116188 agtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgtt 28116287  T
Q  115 gttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 214  Q
    ||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  28116288 gtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaata 28116387  T
Q  215 ttgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
      ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28116388 cggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 28116457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32292796 - 32292697
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32292796 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Original strand, 5596663 - 5596866
Alignment:
Q  81 tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgat 180  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||    
T  5596663 tgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgat 5596762  T
Q  181 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5596763 gataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattg 5596862  T
Q  281 accg 284  Q
    ||||    
T  5596863 accg 5596866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 31034331 - 31034430
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31034331 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665485
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 29665435  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29665436 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 29665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7996586 - 7996320
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  7996586 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 7996487  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |    
T  7996486 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 7996387  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||   |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7996386 catatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 7996320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10643094 - 10642828
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  10643094 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 10642995  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  |    
T  10642994 tcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 10642895  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||   |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10642894 catatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 10642828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47023477 - 47023211
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  47023477 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 47023378  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  47023377 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacgg 47023278  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |   || |||||  ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47023277 catgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 47023211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21674696 - 21674451
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  || |    
T  21674696 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgt 21674597  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | | ||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  |||||||    
T  21674596 tgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 21674497  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21674496 catttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccg 21674451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5466893 - 5466743
Alignment:
Q  134 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaac 233  Q
    |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||    
T  5466893 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgac 5466794  T
Q  234 ggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5466793 ggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccg 5466743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 6542825 - 6542974
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  6542825 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 6542924  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6542925 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccg 6542974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110861
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 11110811  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11110812 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 11110861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 22871225 - 22871374
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  22871225 gcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 22871324  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22871325 gaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccg 22871374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 22886284 - 22886433
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  22886284 gcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 22886383  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22886384 gaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccg 22886433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28339326 - 28339060
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  28339326 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 28339227  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28339226 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 28339127  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28339126 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 28339060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 31964707 - 31964973
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  31964707 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 31964806  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  31964807 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 31964906  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31964907 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 31964973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 50134305 - 50134571
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  50134305 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 50134404  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  50134405 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 50134504  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50134505 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 50134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5013619 - 5013470
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  5013619 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 5013520  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5013519 gaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 5013470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24328066 - 24327921
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  24328066 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 24327967  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24327966 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 24327921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997589
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 36997539  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36997540 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 36997589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 5609556 - 5609822
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  5609556 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 5609655  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||       
T  5609656 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgt 5609755  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5609756 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 5609822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18242689 - 18242485
Alignment:
Q  80 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 179  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||  || |||    
T  18242689 ttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactga 18242590  T
Q  180 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatt 279  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18242589 tgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgatt 18242490  T
Q  280 gaccg 284  Q
    |||||    
T  18242489 gaccg 18242485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4416823 - 4416674
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  4416823 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 4416724  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4416723 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccg 4416674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 20577213 - 20577362
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  20577213 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 20577312  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20577313 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 20577362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48465822 - 48465673
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||   || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||  |||    
T  48465822 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 48465723  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  48465722 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccg 48465673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51781918 - 51781769
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  51781918 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 51781819  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51781818 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 51781769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51797007 - 51796858
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || |||||  |||    
T  51797007 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 51796908  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51796907 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 51796858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 2831 - 3086
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2831 ttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttg 2930  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2931 agctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 3030  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3031 ggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 3086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13522189 - 13522444
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13522189 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 13522288  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13522289 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 13522388  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13522389 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 13522444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28162737 - 28162482
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28162737 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28162638  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28162637 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 28162538  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28162537 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcattgat 28162482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 33374372 - 33374627
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33374372 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33374471  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33374472 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 33374571  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33374572 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 33374627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8892426 - 8892681
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8892426 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 8892525  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8892526 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaag 8892625  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8892626 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 8892681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8903661 - 8903916
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8903661 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 8903760  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8903761 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaag 8903860  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8903861 agatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 8903916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22477389 - 22477673
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgt---tgttg 97  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||    
T  22477389 ttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22477488  T
Q  98 ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22477489 ttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaag 22477588  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  22477589 aagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20160781 - 20160498
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20160781 ttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttg 20160682  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| ||||     
T  20160681 agctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaa 20160582  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||| |||||||| || ||| || ||||    |||||||  |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20160581 ggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccg 20160498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 22172050 - 22172333
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  22172050 ttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttg 22172149  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| ||||     
T  22172150 agctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaa 22172249  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||| |||||||| || ||| || ||||    |||||||  |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22172250 ggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccg 22172333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 22935016 - 22935279
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||    
T  22935016 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 22935115  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  22935116 tctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgc 22935215  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22935216 atatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccg 22935279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 23857461 - 23857724
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||    
T  23857461 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 23857560  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  23857561 tctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgc 23857660  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23857661 atatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccg 23857724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 15424453 - 15424719
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||||   ||||||||    
T  15424453 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtt 15424552  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  15424553 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 15424652  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424653 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 15424719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 24304754 - 24305020
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  24304754 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtt 24304853  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |    
T  24304854 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacgg 24304953  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24304954 cacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccg 24305020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 13299087 - 13299352
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  13299087 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 13299186  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  13299187 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 13299286  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 283  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299287 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgacc 13299352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26989061 - 26988795
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttg---ttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||   ||||||||    
T  26989061 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtt 26988962  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  26988961 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 26988862  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988861 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 26988795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29549514 - 29549272
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| |    
T  29549514 gcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattga 29549415  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |     
T  29549414 caggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcat 29549315  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549314 ttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 29549272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26918440 - 26918174
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  26918440 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 26918341  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     | | || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  26918340 tcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 26918241  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918240 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 26918174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27000133 - 26999867
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  27000133 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 27000034  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  27000033 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 26999934  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999933 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 26999867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16749914 - 16749648
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  16749914 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 16749815  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  16749814 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16749715  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749714 cacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccg 16749648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24863777 - 24863511
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  24863777 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 24863678  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  24863677 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 24863578  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863577 cgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 24863511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 22457050 - 22457176
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttg 97  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |   |||||||    
T  22457050 ttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T
Q  98 ttgaactggtggctgttgttgcatttg 124  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  22457150 ttgaaccggtgactgttgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4525346 - 4525083
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||  |  || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |    
T  4525346 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgta 4525247  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
      || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||      
T  4525246 cctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcat 4525147  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4525146 atatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccg 4525083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27044426 - 27044184
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| |    
T  27044426 gcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattga 27044327  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |     
T  27044326 caggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 27044227  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27044226 ttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 27044184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27290486 - 27290597
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  27290486 ttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttg 27290585  T
Q  101 aactggtggctg 112  Q
    | | ||||||||    
T  27290586 agccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29501403 - 29501200
Alignment:
Q  81 tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgat 180  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||    
T  29501403 tgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgat 29501304  T
Q  181 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29501303 gataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattg 29501204  T
Q  281 accg 284  Q
    ||||    
T  29501203 accg 29501200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 30558173 - 30558418
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  30558173 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 30558272  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  30558273 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 30558372  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30558373 catttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 30558418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29573091 - 29572807
Alignment:
Q  3 gtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgtt 99  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||   | ||||||||||    
T  29573091 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgtt 29572992  T
Q  100 gaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaa 199  Q
    |||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  29572991 gaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 29572892  T
Q  200 gggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29572891 cggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 29572807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 14143405 - 14143500
Alignment:
Q  5 gcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14143405 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26788020 - 26787925
Alignment:
Q  5 gcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26788020 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27196393 - 27196298
Alignment:
Q  5 gcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27196393 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 27252847 - 27252942
Alignment:
Q  5 gcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27252847 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 272
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630099
Alignment:
Q  80 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 179  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || | || || || |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  180 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagcc 272  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | |||||    ||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacattaacaggggcgacagtagcc 27630099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546186
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 4546136  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4546137 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 4546186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724545
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 4724495  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4724496 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 4724545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007506
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  |||  ||||  |||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatataggtatgacg 27007556  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27007555 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 27007506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207236
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 28207286  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28207285 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 28207236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27485115 - 27484911
Alignment:
Q  80 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 179  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||    
T  27485115 ttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactga 27485016  T
Q  180 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatt 279  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27485015 tgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgatt 27484916  T
Q  280 gaccg 284  Q
    |||||    
T  27484915 gaccg 27484911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695857
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 3695907  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3695906 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 3695857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4757704 - 4757555
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  4757704 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 4757605  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4757604 gaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccg 4757555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4772940 - 4772791
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  4772940 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 4772841  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4772840 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 4772791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Original strand, 16944280 - 16944425
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  16944280 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 16944379  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16944380 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 16944425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17025056
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 17025106  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17025105 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccg 17025056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 27360263 - 27360412
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  27360263 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 27360362  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27360363 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 27360412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 27450606 - 27450755
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  27450606 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 27450705  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27450706 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 27450755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 34463614 - 34463763
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  34463614 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 34463713  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34463714 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccg 34463763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 26116672 - 26116821
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  26116672 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 26116771  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  26116772 gaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccg 26116821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26778025
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || |||||  |||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 26777979  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26777980 gaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattg 26778025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20340508 - 20340763
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20340508 ttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttg 20340607  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20340608 agctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 20340707  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20340708 ggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 20340763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 16208204 - 16208484
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16208204 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgttgttgttg 16208300  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||||||||||||| |||||     
T  16208301 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaa 16208400  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||||||   ||| | |||  |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16208401 ggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 16208484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20461163 - 20460904
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||       
T  20461163 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgttgttg--- 20461070  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
                      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20461069 ------------------catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaa 20460988  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20460987 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccg 20460904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28151944 - 28151845
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28151944 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28585043 - 28584781
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  28585043 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 28584944  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28584943 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 28584844  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |  |||||||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28584843 catatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 28584781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 41793501 - 41793767
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  41793501 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 41793600  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| ||  || | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  |    
T  41793601 tcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacgg 41793700  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41793701 catatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccg 41793767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10962711 - 10962466
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  10962711 gcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcat 10962612  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  10962611 tgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 10962512  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10962511 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 10962466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51638259 - 51638014
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||  || || ||  | |  ||||    
T  51638259 gcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcat 51638160  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  51638159 tgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 51638060  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51638059 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 51638014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9354705 - 9354450
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  9354705 ttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 9354606  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354605 agctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 9354506  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9354505 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 9354450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 19659171 - 19659426
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19659171 ttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 19659270  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19659271 agctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaag 19659370  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19659371 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 19659426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44563184 - 44562929
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44563184 ttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 44563085  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44563084 agctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaa 44562985  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44562984 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 44562929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16283524 - 16283246
Alignment:
Q  9 tgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactg 105  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |    
T  16283524 tgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccg 16283425  T
Q  106 gtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatg 205  Q
    |   |||||||| ||| || ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  16283424 gcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatg 16283325  T
Q  206 ctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283324 ctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 16283246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22081010 - 22081288
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||       
T  22081010 ttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgctgttg--- 22081106  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaag 197  Q
    | |    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| |||    
T  22081107 agccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaag 22081203  T
Q  198 aagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    || ||||||||||||||||||   ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22081204 aaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgac 22081288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 2137411 - 2137677
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  2137411 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 2137510  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  2137511 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacgg 2137610  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137611 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 2137677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14557687 - 14557424
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 120  Q
    |||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  14557687 agtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttca 14557588  T
Q  121 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 220  Q
    | || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |    
T  14557587 tctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcac 14557488  T
Q  221 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||| |||||  ||||||| |  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14557487 atatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccg 14557424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16277617 - 16277351
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  16277617 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 16277518  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  16277517 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16277418  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277417 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 16277351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 27609057 - 27609323
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  27609057 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 27609156  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||       
T  27609157 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacga 27609256  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609257 cacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 27609323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19688161 - 19687895
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| |    ||||||||    
T  19688161 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtt 19688062  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  |    
T  19688061 tcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacgg 19687962  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19687961 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 19687895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18710649 - 18710383
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||   ||||||||    
T  18710649 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtt 18710550  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  18710549 tcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18710450  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18710449 cacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 18710383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19286504 - 19286262
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaa 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| |    
T  19286504 gcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattga 19286405  T
Q  142 cgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtag 241  Q
    | || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |     
T  19286404 caggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcat 19286305  T
Q  242 ctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19286304 ttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccg 19286262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19674384 - 19674237
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  19674384 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 19674285  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19674284 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgac 19674237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 31490019 - 31490168
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||    
T  31490019 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacg 31490118  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31490119 gaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccg 31490168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31354587 - 31354321
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||    
T  31354587 agtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgtt 31354488  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
    | |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  31354487 gtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 31354388  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31354387 catatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccg 31354321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33244748 - 33244649
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33244748 ttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 19208512 - 19208778
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  19208512 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 19208611  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  19208612 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 19208711  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19208712 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 19208778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3329937
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 3329887  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3329888 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccg 3329937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29829110
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 29829160  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29829159 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccg 29829110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 28362107 - 28362373
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  28362107 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 28362206  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28362207 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 28362306  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28362307 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccg 28362373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518561
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 19518511  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19518512 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccg 19518561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33258669 - 33258524
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  33258669 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 33258570  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33258569 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 33258524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Original strand, 12093002 - 12093147
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||  ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  12093002 gcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 12093101  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 280  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12093102 gaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattg 12093147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20471 - 20209
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||              
T  20471 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgct---------- 20382  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20381 -----------gttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaag 20293  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20292 ggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccg 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30494 - 30250
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||    
T  30494 gcatacaacattggtataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcat 30396  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  30395 taacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30295 catttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 30250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29826 - 29560
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   ||||||||    
T  29826 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 29727  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  29726 tcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 29627  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||||| | ||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29626 cgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccg 29560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40528
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  40262 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtt 40361  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  |    
T  40362 tcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacgg 40461  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| ||||||  |||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40462 cgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 40528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 47178 - 47444
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  47178 agtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 47277  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  47278 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 47377  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    | |||| |||||  | ||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47378 cacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccg 47444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21644 - 21366
Alignment:
Q  1 ttgtgcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||        
T  21644 ttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgctgtta--- 21548  T
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    | |  |  |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| |||||     
T  21547 agccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaa 21448  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgac 282  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  21447 ggatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgac 21366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27355 - 27089
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||    
T  27355 agtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtt 27256  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |    
T  27255 tcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 27156  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||||| |||||  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27155 cgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 27089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 344 - 589
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||    
T  344 gcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 443  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  |||||||    
T  444 taacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 543  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  544 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 205 - 312
Alignment:
Q  5 gcagtgccctctgagaagtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaact 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  205 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagct 304  T
Q  105 ggtggctg 112  Q
    ||||||||    
T  305 ggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 15144 - 15389
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||    
T  15144 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcat 15243  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||||||    
T  15244 tgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 15343  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15344 catttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccg 15389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 7432 - 7698
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  7432 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtt 7531  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  7532 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 7631  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7632 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 7698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8212 - 8029
Alignment:
Q  101 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 200  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  8212 aactggcggctgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaac 8113  T
Q  201 ggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8112 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccg 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26661
Alignment:
Q  42 gcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcat 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| | | || ||  | |  ||||    
T  26416 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcat 26515  T
Q  139 taacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 238  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||||||    
T  26516 tgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagg 26615  T
Q  239 tagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26616 catttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccg 26661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7734
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||  |||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 7784  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7783 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccg 7734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 9259 - 9525
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  9259 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 9358  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  9359 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 9458  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9459 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 9525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20078 - 19812
Alignment:
Q  21 agtaaagtcgggagtaattcggcatacaacattgggatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 117  Q
    |||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||    
T  20078 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtt 19979  T
Q  118 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattg 217  Q
     ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  19978 tcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 19879  T
Q  218 cgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |  ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19878 catatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccg 19812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 43 - 192
Alignment:
Q  135 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || ||  |||    
T  43 gcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacg 142  T
Q  235 gaggtagctgagcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccg 284  Q
    |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  143 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccg 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University