View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6865A_low_274 (Length: 229)

Name: NF6865A_low_274
Description: NF6865A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6865A_low_274
NF6865A_low_274
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (4-184)||(33848456-33848636)
chr4 (11-184)||(9388387-9388558)
chr4 (1-184)||(16278613-16278796)
chr4 (4-160)||(28382474-28382630)
chr4 (5-146)||(33848572-33848712)
chr4 (5-159)||(16278421-16278573)
chr4 (4-160)||(15280396-15280552)
chr4 (7-146)||(41791273-41791413)
chr4 (5-154)||(14698272-14698421)
chr4 (5-146)||(15242457-15242599)
chr4 (4-160)||(16359114-16359271)
chr4 (45-181)||(53388033-53388171)
chr4 (5-160)||(16278498-16278654)
chr4 (5-154)||(4170580-4170729)
chr4 (4-146)||(4170666-4170808)
chr4 (4-146)||(6511447-6511589)
chr4 (4-146)||(14698358-14698500)
chr4 (4-146)||(15989930-15990072)
chr4 (4-146)||(55503042-55503183)
chr4 (4-159)||(10313366-10313520)
chr4 (4-146)||(56116144-56116286)
chr4 (4-160)||(286739-286896)
chr4 (7-144)||(56116029-56116166)
chr4 (4-159)||(14942662-14942817)
chr4 (46-163)||(21190078-21190195)
chr4 (4-147)||(16359167-16359310)
chr4 (35-146)||(15448426-15448537)
chr4 (44-146)||(15242418-15242520)
chr4 (4-146)||(31117347-31117486)
chr4 (44-163)||(13881362-13881482)
chr4 (42-146)||(15449756-15449860)
chr4 (44-139)||(14942624-14942719)
chr4 (44-160)||(47127139-47127257)
chr4 (73-163)||(13877703-13877793)
chr4 (4-116)||(15242534-15242648)
chr4 (35-176)||(15989740-15989881)
chr4 (48-176)||(24047832-24047960)
chr4 (5-80)||(41791261-41791337)
chr4 (5-146)||(27027599-27027747)
chr4 (4-80)||(15448473-15448549)
chr4 (45-146)||(41791352-41791453)
chr4 (5-118)||(55503120-55503234)
chr4 (44-125)||(3337084-3337166)
chr4 (6-119)||(33684861-33684974)
chr4 (4-80)||(3336989-3337065)
chr4 (4-119)||(6511395-6511511)
chr4 (46-174)||(33684861-33684989)
chr4 (5-154)||(55503082-55503230)
chr4 (44-146)||(6511526-6511628)
chr4 (79-174)||(20899755-20899849)
chr4 (83-174)||(27027532-27027622)
chr4 (68-146)||(3337001-3337079)
chr4 (5-132)||(31117425-31117550)
chr4 (79-159)||(15990035-15990115)
chr4 (35-174)||(15242525-15242666)
chr4 (6-92)||(15449798-15449884)
chr4 (7-159)||(56115909-56116063)
chr4 (4-160)||(6511394-6511550)
chr4 (1-119)||(15989835-15989957)
chr4 (5-154)||(15989962-15990111)
chr4 (8-80)||(24047832-24047903)
chr4 (5-119)||(56116223-56116338)
chr4 (41-147)||(6511486-6511592)
chr4 (15-119)||(27027547-27027652)
chr4 (7-146)||(56115949-56116090)
chr4 (112-174)||(56116291-56116353)
chr4 (5-81)||(20899759-20899835)
chr4 (44-147)||(55503042-55503144)
chr4 (76-139)||(27027691-27027754)
chr4 (113-174)||(18221088-18221149)
chr4 (4-68)||(21190114-21190178)
chr4 (4-138)||(27027653-27027788)
chr4 (79-147)||(53388029-53388097)
chr4 (5-68)||(9388458-9388520)
chr4 (45-119)||(20899759-20899834)
chr4 (83-159)||(8710573-8710651)
chr4 (5-81)||(13877706-13877783)
chr4 (83-148)||(4170742-4170807)
chr4 (4-101)||(8710551-8710652)
chr4 (6-62)||(13881385-13881441)
chr4 (83-148)||(14698434-14698499)
chr4 (4-68)||(16278536-16278600)
chr4 (83-159)||(41791220-41791296)
chr4 (4-68)||(47127139-47127203)
chr4 (4-106)||(56115986-56116090)
chr4 (4-119)||(15989757-15989872)
chr4 (5-68)||(53388033-53388096)
chr4 (5-66)||(56116105-56116166)
chr4 (83-160)||(6511551-6511627)
chr4 (37-135)||(3336973-3337072)
chr4 (44-147)||(15448397-15448498)
chr4 (79-146)||(16278417-16278483)
chr4 (6-68)||(21190078-21190138)
chr4 (79-146)||(33848650-33848716)
chr4 (4-81)||(53388072-53388150)
chr4 (45-90)||(13877807-13877853)
chr4 (36-69)||(18229730-18229763)
chr4 (79-119)||(13877817-13877857)
chr4 (4-68)||(13881419-13881482)
chr4 (127-159)||(31131813-31131845)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (4-184)||(23339558-23339738)
chr2 (4-160)||(44620583-44620739)
chr2 (4-160)||(25035983-25036139)
chr2 (5-146)||(23339482-23339622)
chr2 (4-146)||(21239482-21239625)
chr2 (4-146)||(21242032-21242175)
chr2 (45-181)||(20591424-20591561)
chr2 (7-146)||(28348743-28348882)
chr2 (5-154)||(31503141-31503290)
chr2 (4-146)||(31503227-31503369)
chr2 (5-154)||(31505707-31505856)
chr2 (4-146)||(31505793-31505935)
chr2 (4-146)||(31755602-31755743)
chr2 (44-160)||(24274238-24274354)
chr2 (4-146)||(24504344-24504485)
chr2 (44-160)||(41685076-41685194)
chr2 (4-126)||(24274276-24274399)
chr2 (44-174)||(23374868-23374998)
chr2 (45-146)||(21239445-21239546)
chr2 (45-146)||(21241995-21242096)
chr2 (5-119)||(21239561-21239677)
chr2 (5-119)||(21242111-21242227)
chr2 (83-160)||(12628184-12628261)
chr2 (44-146)||(28352568-28352670)
chr2 (5-118)||(31755551-31755665)
chr2 (47-174)||(10040234-10040361)
chr2 (7-118)||(10040234-10040345)
chr2 (4-119)||(23374883-23374998)
chr2 (5-154)||(24504297-24504445)
chr2 (5-154)||(31755555-31755703)
chr2 (35-174)||(28348676-28348816)
chr2 (4-80)||(28348731-28348807)
chr2 (5-118)||(24504293-24504407)
chr2 (4-147)||(31503266-31503409)
chr2 (35-174)||(28352501-28352641)
chr2 (94-162)||(24275717-24275784)
chr2 (83-162)||(22109435-22109513)
chr2 (7-146)||(10040152-10040294)
chr2 (4-81)||(22109437-22109514)
chr2 (44-148)||(31503303-31503409)
chr2 (44-148)||(31505869-31505975)
chr2 (4-107)||(31505870-31505975)
chr2 (4-119)||(28352516-28352632)
chr2 (83-159)||(21239602-21239677)
chr2 (83-159)||(21242152-21242227)
chr2 (5-106)||(25035944-25036047)
chr2 (44-147)||(31755641-31755743)
chr2 (4-68)||(41685076-41685140)
chr2 (44-119)||(22109438-22109514)
chr2 (4-139)||(31518254-31518394)
chr2 (79-139)||(31518500-31518561)
chr2 (5-139)||(31518418-31518557)
chr2 (4-81)||(12628183-12628261)
chr2 (81-139)||(25035942-25036000)
chr2 (5-68)||(21239445-21239506)
chr2 (5-68)||(21241995-21242056)
chr2 (4-101)||(23085379-23085479)
chr2 (8-81)||(20591466-20591540)
chr2 (4-63)||(22841018-22841076)
chr2 (79-146)||(23339478-23339544)
chr2 (41-159)||(31518274-31518397)
chr2 (83-121)||(23148578-23148616)
chr2 (83-121)||(23560368-23560406)
chr2 (83-139)||(20353407-20353464)
chr2 (48-120)||(22840916-22840992)
chr2 (4-101)||(25651228-25651329)
chr2 (1-42)||(43708194-43708235)
chr2 (35-63)||(23085339-23085367)
chr2 (83-147)||(24274317-24274380)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (8-184)||(17794946-17795122)
chr8 (1-146)||(7301445-7301590)
chr8 (5-159)||(28853525-28853679)
chr8 (4-146)||(45135282-45135425)
chr8 (5-146)||(17795062-17795202)
chr8 (7-146)||(44431543-44431682)
chr8 (4-160)||(22145734-22145892)
chr8 (5-146)||(7301527-7301668)
chr8 (7-159)||(44431648-44431800)
chr8 (44-160)||(44523203-44523320)
chr8 (5-163)||(17614528-17614686)
chr8 (4-146)||(6608591-6608733)
chr8 (5-154)||(6608670-6608819)
chr8 (45-160)||(17614609-17614724)
chr8 (5-176)||(20459858-20460028)
chr8 (4-146)||(28853616-28853757)
chr8 (4-160)||(22059728-22059884)
chr8 (44-146)||(32949595-32949697)
chr8 (4-138)||(19881865-19881999)
chr8 (35-146)||(43111961-43112072)
chr8 (45-146)||(45135245-45135346)
chr8 (4-146)||(19881778-19881921)
chr8 (45-147)||(7301372-7301473)
chr8 (4-147)||(22145695-22145839)
chr8 (48-175)||(38186102-38186230)
chr8 (5-119)||(21415584-21415698)
chr8 (48-176)||(21861647-21861775)
chr8 (35-174)||(43111894-43112034)
chr8 (44-159)||(22145695-22145811)
chr8 (5-119)||(45135361-45135477)
chr8 (5-118)||(44431492-44431606)
chr8 (4-119)||(32949543-32949659)
chr8 (5-80)||(7301605-7301680)
chr8 (5-146)||(7301372-7301512)
chr8 (7-174)||(363599-363767)
chr8 (4-80)||(19881766-19881842)
chr8 (4-80)||(43111949-43112025)
chr8 (4-147)||(22059689-22059831)
chr8 (84-163)||(15004830-15004909)
chr8 (83-172)||(19881713-19881801)
chr8 (35-174)||(44431476-44431616)
chr8 (4-174)||(362181-362351)
chr8 (79-147)||(19881974-19882042)
chr8 (5-174)||(21415544-21415713)
chr8 (35-162)||(32949540-32949668)
chr8 (4-80)||(17614572-17614647)
chr8 (4-80)||(20459915-20459990)
chr8 (4-159)||(22521885-22522044)
chr8 (83-159)||(45135402-45135477)
chr8 (73-176)||(20454246-20454348)
chr8 (41-147)||(28853655-28853760)
chr8 (8-119)||(21861647-21861758)
chr8 (44-119)||(24708121-24708197)
chr8 (4-68)||(44523203-44523266)
chr8 (83-146)||(19881935-19881998)
chr8 (35-147)||(19881817-19881930)
chr8 (83-148)||(6608592-6608657)
chr8 (4-68)||(15004075-15004138)
chr8 (45-120)||(15267117-15267196)
chr8 (45-105)||(43112040-43112100)
chr8 (4-139)||(22434639-22434778)
chr8 (5-81)||(17794970-17795047)
chr8 (85-159)||(44431766-44431840)
chr8 (83-160)||(7301645-7301721)
chr8 (6-81)||(15004830-15004906)
chr8 (6-139)||(20385147-20385284)
chr8 (27-80)||(20454303-20454356)
chr8 (79-160)||(20459952-20460032)
chr8 (7-68)||(23647586-23647646)
chr8 (83-160)||(24708122-24708198)
chr8 (19-119)||(38186114-38186214)
chr8 (63-119)||(44523183-44523240)
chr8 (79-147)||(21415540-21415608)
chr8 (45-120)||(22521966-22522045)
chr8 (5-68)||(45135245-45135306)
chr8 (79-146)||(17795140-17795206)
chr8 (83-149)||(15004076-15004141)
chr8 (45-139)||(22434599-22434697)
chr8 (83-148)||(22059690-22059754)
chr8 (79-159)||(7301368-7301446)
chr8 (44-107)||(15004075-15004139)
chr8 (5-68)||(19881975-19882038)
chr8 (79-147)||(45135241-45135307)
[»] scaffold0525 (9 HSPs)
scaffold0525 (4-184)||(8657-8836)
scaffold0525 (4-160)||(11266-11423)
scaffold0525 (5-147)||(11228-11370)
scaffold0525 (4-159)||(11188-11342)
scaffold0525 (8-148)||(8771-8910)
scaffold0525 (44-160)||(11188-11304)
scaffold0525 (4-147)||(8734-8875)
scaffold0525 (5-159)||(8799-8952)
scaffold0525 (79-159)||(8877-8956)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (5-184)||(296153-296331)
chr1 (5-160)||(2333371-2333527)
chr1 (4-160)||(20630926-20631083)
chr1 (4-160)||(14432662-14432819)
chr1 (4-159)||(20586733-20586888)
chr1 (5-163)||(22900604-22900762)
chr1 (5-146)||(45306915-45307057)
chr1 (4-160)||(36181224-36181381)
chr1 (4-159)||(20579040-20579195)
chr1 (45-160)||(22900566-22900681)
chr1 (11-146)||(293834-293970)
chr1 (44-171)||(24087117-24087245)
chr1 (4-147)||(20630979-20631122)
chr1 (5-146)||(2333293-2333434)
chr1 (5-176)||(20901001-20901170)
chr1 (45-147)||(18823553-18823655)
chr1 (45-146)||(45306994-45307095)
chr1 (41-137)||(21181471-21181567)
chr1 (4-159)||(18823462-18823618)
chr1 (48-175)||(28312068-28312195)
chr1 (5-80)||(45306903-45306979)
chr1 (45-147)||(20579170-20579271)
chr1 (45-147)||(20586863-20586964)
chr1 (35-174)||(21181503-21181643)
chr1 (44-159)||(20631007-20631122)
chr1 (44-174)||(28204699-28204830)
chr1 (5-146)||(20579131-20579271)
chr1 (5-146)||(20586824-20586964)
chr1 (35-174)||(293767-293907)
chr1 (4-119)||(293782-293898)
chr1 (4-119)||(20901095-20901211)
chr1 (4-119)||(28204699-28204815)
chr1 (41-160)||(16400611-16400732)
chr1 (83-176)||(18270183-18270275)
chr1 (83-176)||(18274837-18274929)
chr1 (4-119)||(21181512-21181628)
chr1 (5-119)||(18270200-18270315)
chr1 (5-119)||(18274854-18274969)
chr1 (4-120)||(18823461-18823578)
chr1 (4-80)||(22900643-22900718)
chr1 (44-160)||(20901094-20901211)
chr1 (114-160)||(37358201-37358247)
chr1 (4-119)||(24087129-24087245)
chr1 (79-139)||(18270259-18270319)
chr1 (79-139)||(18274913-18274973)
chr1 (9-80)||(19209465-19209536)
chr1 (83-159)||(45306863-45306938)
chr1 (6-147)||(21181397-21181537)
chr1 (83-176)||(19209407-19209500)
chr1 (4-80)||(20901057-20901132)
chr1 (8-80)||(28312124-28312195)
chr1 (41-137)||(44823102-44823202)
chr1 (87-146)||(19209477-19209536)
chr1 (4-82)||(36181223-36181302)
chr1 (79-146)||(296269-296335)
chr1 (79-119)||(20043868-20043909)
chr1 (4-68)||(21181354-21181419)
chr1 (79-119)||(45918252-45918293)
chr1 (79-119)||(2333289-2333329)
chr1 (7-63)||(24960026-24960081)
chr1 (44-119)||(37358202-37358278)
chr1 (5-68)||(45307034-45307095)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (4-171)||(22759079-22759246)
chr5 (4-146)||(26495487-26495630)
chr5 (5-163)||(16256325-16256483)
chr5 (5-163)||(16259919-16260077)
chr5 (4-146)||(29325597-29325740)
chr5 (5-163)||(22593638-22593796)
chr5 (5-163)||(22597193-22597351)
chr5 (45-160)||(16259881-16259996)
chr5 (45-160)||(22590045-22590160)
chr5 (45-160)||(22593600-22593715)
chr5 (45-160)||(22597155-22597270)
chr5 (4-162)||(22469774-22469932)
chr5 (5-163)||(22590083-22590241)
chr5 (5-159)||(43120790-43120942)
chr5 (5-159)||(43124323-43124475)
chr5 (8-160)||(26361399-26361553)
chr5 (4-184)||(27869772-27869950)
chr5 (35-160)||(16256276-16256402)
chr5 (45-146)||(26495566-26495667)
chr5 (7-146)||(22759004-22759143)
chr5 (5-160)||(23693108-23693262)
chr5 (5-119)||(26495435-26495551)
chr5 (45-159)||(8953034-8953148)
chr5 (47-146)||(29325562-29325661)
chr5 (45-119)||(16256248-16256322)
chr5 (5-145)||(22357911-22358051)
chr5 (4-147)||(27869695-27869835)
chr5 (5-119)||(29325676-29325792)
chr5 (5-151)||(23671488-23671633)
chr5 (4-106)||(43120881-43120982)
chr5 (4-106)||(43124414-43124515)
chr5 (4-139)||(27869733-27869867)
chr5 (41-174)||(24277643-24277777)
chr5 (41-174)||(24384436-24384570)
chr5 (83-171)||(4397426-4397514)
chr5 (4-80)||(24277646-24277722)
chr5 (4-80)||(24384491-24384567)
chr5 (5-146)||(16256286-16256427)
chr5 (5-107)||(23693082-23693184)
chr5 (4-176)||(22357950-22358123)
chr5 (45-160)||(22357911-22358027)
chr5 (4-80)||(16256364-16256439)
chr5 (4-80)||(16259958-16260033)
chr5 (83-159)||(26495435-26495510)
chr5 (83-159)||(29325717-29325792)
chr5 (79-146)||(22357907-22357974)
chr5 (44-146)||(43120881-43120982)
chr5 (44-146)||(43124414-43124515)
chr5 (4-120)||(22469949-22470069)
chr5 (4-80)||(22593677-22593752)
chr5 (4-80)||(22597232-22597307)
chr5 (6-139)||(21559424-21559562)
chr5 (4-80)||(22590122-22590197)
chr5 (7-159)||(22758964-22759116)
chr5 (6-101)||(26706359-26706458)
chr5 (6-101)||(26976093-26976192)
chr5 (5-101)||(7785121-7785219)
chr5 (44-121)||(8953072-8953150)
chr5 (85-139)||(21495001-21495055)
chr5 (5-68)||(26495606-26495667)
chr5 (5-82)||(26361476-26361554)
chr5 (82-120)||(17023000-17023038)
chr5 (7-68)||(29325562-29325621)
chr5 (79-160)||(23693186-23693266)
chr5 (4-68)||(23693083-23693146)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (4-181)||(13395856-13396035)
chr7 (4-146)||(16006020-16006162)
chr7 (4-160)||(38827797-38827953)
chr7 (4-160)||(48784846-48785002)
chr7 (4-160)||(13733840-13733996)
chr7 (5-146)||(16005941-16006083)
chr7 (1-181)||(17506136-17506316)
chr7 (1-181)||(17546898-17547078)
chr7 (4-146)||(8775925-8776068)
chr7 (5-154)||(21743701-21743850)
chr7 (44-174)||(35365924-35366053)
chr7 (4-176)||(14189354-14189525)
chr7 (4-147)||(13849919-13850062)
chr7 (4-146)||(21743622-21743764)
chr7 (4-159)||(13395778-13395933)
chr7 (4-146)||(124486-124627)
chr7 (6-146)||(4993111-4993252)
chr7 (4-160)||(48784925-48785080)
chr7 (6-174)||(13849999-13850168)
chr7 (44-146)||(13849881-13849983)
chr7 (4-172)||(14192109-14192276)
chr7 (4-160)||(48784964-48785119)
chr7 (35-159)||(16573169-16573293)
chr7 (35-159)||(16592369-16592493)
chr7 (5-146)||(8776004-8776144)
chr7 (4-146)||(13255680-13255820)
chr7 (45-146)||(4993190-4993291)
chr7 (44-139)||(38827936-38828031)
chr7 (44-154)||(48743288-48743398)
chr7 (44-137)||(709609-709702)
chr7 (45-146)||(16006098-16006199)
chr7 (4-174)||(16573075-16573246)
chr7 (4-174)||(16592416-16592587)
chr7 (5-146)||(14192072-14192211)
chr7 (7-105)||(21065502-21065600)
chr7 (48-175)||(13255414-13255541)
chr7 (5-80)||(4993099-4993175)
chr7 (5-80)||(16005929-16006005)
chr7 (5-118)||(124564-124678)
chr7 (5-154)||(124526-124674)
chr7 (5-119)||(8775873-8775989)
chr7 (4-120)||(13255628-13255743)
chr7 (8-119)||(11660764-11660874)
chr7 (45-160)||(14189278-14189392)
chr7 (45-160)||(14192072-14192186)
chr7 (35-176)||(48743227-48743369)
chr7 (48-146)||(16458959-16459056)
chr7 (4-119)||(13850037-13850153)
chr7 (79-160)||(17506096-17506177)
chr7 (79-160)||(17547037-17547118)
chr7 (52-172)||(47976002-47976121)
chr7 (35-160)||(14189305-14189431)
chr7 (5-126)||(40555756-40555882)
chr7 (4-119)||(14189314-14189430)
chr7 (41-106)||(16573260-16573325)
chr7 (41-106)||(16592337-16592402)
chr7 (39-149)||(13255716-13255825)
chr7 (83-173)||(711021-711110)
chr7 (48-176)||(11660747-11660874)
chr7 (5-107)||(16458919-16459021)
chr7 (44-147)||(124486-124588)
chr7 (4-146)||(709647-709777)
chr7 (8-119)||(13255430-13255541)
chr7 (5-106)||(38827889-38827992)
chr7 (112-159)||(8775873-8775920)
chr7 (79-138)||(40555752-40555812)
chr7 (4-70)||(709713-709779)
chr7 (41-119)||(711017-711096)
chr7 (4-101)||(15689926-15690025)
chr7 (4-101)||(15697519-15697618)
chr7 (44-139)||(15731803-15731902)
chr7 (7-146)||(11660815-11660956)
chr7 (113-163)||(13407736-13407786)
chr7 (35-120)||(16668610-16668699)
chr7 (35-120)||(17642980-17643069)
chr7 (83-160)||(13395779-13395855)
chr7 (44-139)||(15725457-15725554)
chr7 (35-120)||(21519336-21519424)
chr7 (83-148)||(21743623-21743688)
chr7 (4-68)||(48743296-48743360)
chr7 (4-139)||(7507496-7507636)
chr7 (4-139)||(7507619-7507759)
chr7 (35-162)||(16458904-16459031)
chr7 (45-147)||(8776043-8776144)
chr7 (4-63)||(15725496-15725554)
chr7 (112-159)||(16005889-16005936)
chr7 (85-148)||(21065462-21065525)
chr7 (45-159)||(4993059-4993175)
chr7 (44-78)||(47975967-47976001)
chr7 (4-60)||(8757395-8757452)
chr7 (4-68)||(8776044-8776106)
chr7 (4-101)||(12202048-12202149)
chr7 (41-138)||(22122715-22122816)
chr7 (5-81)||(35365938-35366014)
chr7 (41-138)||(40555916-40556017)
chr7 (83-138)||(8757396-8757452)
chr7 (5-120)||(15689865-15689984)
chr7 (5-120)||(15697458-15697577)
chr7 (5-68)||(16006138-16006199)
chr7 (4-139)||(40555837-40555977)
chr7 (80-154)||(13865390-13865465)
chr7 (38-120)||(14038579-14038665)
chr7 (38-120)||(14348609-14348695)
chr7 (79-160)||(14192068-14192147)
chr7 (85-146)||(21065502-21065563)
chr7 (4-139)||(22122636-22122776)
chr7 (4-60)||(22122759-22122816)
chr7 (35-146)||(38827889-38828002)
chr7 (4-60)||(40555960-40556017)
chr7 (35-67)||(709638-709670)
chr7 (36-68)||(13407846-13407878)
chr7 (36-68)||(13865332-13865364)
chr7 (79-147)||(16006137-16006203)
chr7 (95-139)||(23442324-23442368)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (4-174)||(179738-179909)
chr3 (4-181)||(16799347-16799525)
chr3 (4-160)||(15010449-15010605)
chr3 (4-160)||(2035336-2035493)
chr3 (4-160)||(2039077-2039234)
chr3 (4-160)||(2042818-2042975)
chr3 (4-160)||(14037826-14037983)
chr3 (4-160)||(14041294-14041451)
chr3 (4-159)||(10554073-10554227)
chr3 (7-139)||(10989915-10990047)
chr3 (5-160)||(23396058-23396214)
chr3 (5-154)||(18958550-18958701)
chr3 (41-147)||(52338960-52339066)
chr3 (4-147)||(2039038-2039181)
chr3 (4-147)||(2042779-2042922)
chr3 (4-146)||(54972935-54973078)
chr3 (4-146)||(54975545-54975688)
chr3 (4-146)||(54978155-54978298)
chr3 (44-160)||(603939-604056)
chr3 (4-160)||(2038843-2038998)
chr3 (4-160)||(2038921-2039076)
chr3 (4-160)||(2038960-2039115)
chr3 (4-160)||(2042584-2042739)
chr3 (4-160)||(2042662-2042817)
chr3 (4-160)||(2042701-2042856)
chr3 (4-147)||(2035297-2035440)
chr3 (4-159)||(2038999-2039153)
chr3 (4-159)||(2042740-2042894)
chr3 (44-159)||(14951842-14951958)
chr3 (45-160)||(179701-179816)
chr3 (4-138)||(52339041-52339175)
chr3 (44-146)||(6806018-6806120)
chr3 (4-160)||(2038804-2038959)
chr3 (4-160)||(2042545-2042700)
chr3 (4-120)||(10553994-10554110)
chr3 (45-160)||(16799487-16799604)
chr3 (44-160)||(39230430-39230546)
chr3 (45-147)||(54973093-54973194)
chr3 (45-147)||(54975703-54975804)
chr3 (45-147)||(54978313-54978414)
chr3 (4-119)||(6806056-6806172)
chr3 (83-160)||(7631933-7632010)
chr3 (4-147)||(16799421-16799565)
chr3 (5-80)||(54972923-54972999)
chr3 (5-80)||(54975533-54975609)
chr3 (5-80)||(54978143-54978219)
chr3 (4-174)||(6806018-6806187)
chr3 (83-184)||(55292743-55292843)
chr3 (83-163)||(30206558-30206638)
chr3 (5-159)||(54973041-54973194)
chr3 (5-159)||(54975651-54975804)
chr3 (5-159)||(54978261-54978414)
chr3 (5-139)||(3395001-3395140)
chr3 (4-176)||(23396136-23396308)
chr3 (83-160)||(54046463-54046540)
chr3 (44-159)||(2035297-2035412)
chr3 (4-139)||(6819033-6819170)
chr3 (49-176)||(10834465-10834592)
chr3 (5-119)||(10989991-10990106)
chr3 (35-174)||(10989981-10990121)
chr3 (4-68)||(52339001-52339065)
chr3 (35-174)||(52339110-52339250)
chr3 (4-119)||(52339119-52339235)
chr3 (41-175)||(1989356-1989491)
chr3 (4-119)||(39230431-39230546)
chr3 (1-68)||(54973054-54973121)
chr3 (1-68)||(54975664-54975731)
chr3 (1-68)||(54978274-54978341)
chr3 (83-174)||(17211123-17211213)
chr3 (4-66)||(18958602-18958663)
chr3 (4-119)||(14951842-14951958)
chr3 (5-159)||(16799449-16799604)
chr3 (79-160)||(18958625-18958705)
chr3 (4-68)||(603939-604002)
chr3 (5-146)||(10554046-10554187)
chr3 (79-146)||(23396054-23396121)
chr3 (4-81)||(30206557-30206635)
chr3 (79-159)||(3394997-3395079)
chr3 (9-136)||(6818963-6819085)
chr3 (35-139)||(52338992-52339098)
chr3 (5-159)||(14951778-14951918)
chr3 (6-139)||(15232141-15232278)
chr3 (6-139)||(15238009-15238146)
chr3 (79-147)||(16799540-16799608)
chr3 (4-81)||(54046463-54046541)
chr3 (83-154)||(54972888-54972958)
chr3 (83-154)||(54975498-54975568)
chr3 (83-154)||(54978108-54978178)
chr3 (83-160)||(2035298-2035374)
chr3 (32-80)||(10834487-10834535)
chr3 (83-174)||(6818887-6818976)
chr3 (5-81)||(7631933-7632010)
chr3 (85-159)||(10989875-10989949)
chr3 (79-148)||(14951774-14951842)
chr3 (1-57)||(43928388-43928445)
chr3 (4-63)||(3395082-3395142)
chr3 (44-119)||(17211138-17211214)
chr3 (44-119)||(55292742-55292818)
chr3 (85-120)||(9884-9919)
chr3 (4-68)||(18958558-18958624)
chr3 (83-132)||(43928391-43928441)
chr3 (4-81)||(55292742-55292819)
chr3 (7-139)||(1989281-1989416)
chr3 (6-63)||(10834381-10834437)
chr3 (85-146)||(10989915-10989976)
chr3 (102-139)||(18367772-18367809)
chr3 (44-80)||(15446424-15446460)
chr3 (28-63)||(18367775-18367811)
chr3 (85-121)||(35984717-35984753)
chr3 (79-159)||(54973120-54973198)
chr3 (79-159)||(54975730-54975808)
chr3 (79-159)||(54978340-54978418)
[»] scaffold0500 (3 HSPs)
scaffold0500 (4-163)||(11727-11887)
scaffold0500 (5-147)||(11688-11831)
scaffold0500 (79-147)||(11684-11752)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (5-171)||(15686428-15686594)
chr6 (5-181)||(2288238-2288415)
chr6 (4-146)||(8522533-8522676)
chr6 (4-160)||(16101992-16102149)
chr6 (32-181)||(15538810-15538962)
chr6 (4-176)||(13763942-13764113)
chr6 (6-159)||(23621241-23621394)
chr6 (44-154)||(29492450-29492561)
chr6 (4-160)||(12595607-12595763)
chr6 (44-160)||(16829487-16829604)
chr6 (46-160)||(16812467-16812582)
chr6 (4-146)||(13764283-13764425)
chr6 (45-146)||(8522612-8522713)
chr6 (4-120)||(13764231-13764347)
chr6 (48-176)||(23352115-23352243)
chr6 (5-119)||(8522481-8522597)
chr6 (57-160)||(16804648-16804752)
chr6 (4-138)||(13764057-13764191)
chr6 (4-139)||(13764134-13764269)
chr6 (47-176)||(221618-221747)
chr6 (45-159)||(15538952-15539068)
chr6 (4-139)||(23621200-23621334)
chr6 (45-159)||(24440865-24440978)
chr6 (5-146)||(13764361-13764502)
chr6 (45-161)||(29848499-29848615)
chr6 (8-119)||(23352132-23352243)
chr6 (5-80)||(29848499-29848573)
chr6 (5-159)||(15538912-15539068)
chr6 (83-159)||(8522481-8522556)
chr6 (79-147)||(15539004-15539072)
chr6 (4-68)||(16829541-16829604)
chr6 (41-160)||(23621197-23621316)
chr6 (73-176)||(24266659-24266762)
chr6 (7-101)||(21469786-21469879)
chr6 (4-80)||(23621317-23621394)
chr6 (7-120)||(29265486-29265602)
chr6 (4-139)||(1639059-1639199)
chr6 (4-139)||(12389463-12389603)
chr6 (4-68)||(29492498-29492561)
chr6 (44-139)||(1584259-1584358)
chr6 (4-81)||(15538831-15538909)
chr6 (79-139)||(13751328-13751390)
chr6 (4-147)||(13764244-13764385)
chr6 (35-159)||(13764310-13764434)
chr6 (6-68)||(16812521-16812582)
chr6 (79-160)||(2288234-2288315)
chr6 (4-119)||(2288277-2288393)
chr6 (5-139)||(13751332-13751472)
chr6 (4-82)||(15686505-15686584)
chr6 (79-146)||(29848495-29848561)
chr6 (6-101)||(9185938-9186035)
chr6 (35-159)||(13764076-13764200)
chr6 (4-119)||(15538832-15538949)
chr6 (7-80)||(221675-221747)
chr6 (79-148)||(15686424-15686492)
chr6 (4-139)||(25806861-25807001)
chr6 (5-68)||(8522652-8522713)
chr6 (4-82)||(16812466-16812545)
chr6 (11-63)||(22346692-22346743)
chr6 (33-68)||(16804702-16804737)
chr6 (29-68)||(17027230-17027269)
chr6 (7-68)||(25772710-25772770)
chr6 (79-147)||(8522651-8522717)
chr6 (4-82)||(16804647-16804726)
chr6 (32-80)||(24266717-24266765)
[»] scaffold0860 (3 HSPs)
scaffold0860 (4-163)||(148-307)
scaffold0860 (44-160)||(230-346)
scaffold0860 (4-119)||(231-346)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (5-154)||(32745-32894)
scaffold0141 (4-139)||(32838-32972)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (5-154)||(81918-82067)
scaffold0049 (4-139)||(81840-81974)
[»] scaffold0109 (7 HSPs)
scaffold0109 (5-146)||(2061-2202)
scaffold0109 (7-145)||(2140-2278)
scaffold0109 (5-80)||(2049-2124)
scaffold0109 (83-174)||(1994-2084)
scaffold0109 (85-159)||(2244-2318)
scaffold0109 (7-106)||(2217-2318)
scaffold0109 (85-146)||(2217-2278)
[»] scaffold0026 (9 HSPs)
scaffold0026 (4-147)||(20895-21039)
scaffold0026 (4-174)||(20788-20960)
scaffold0026 (44-146)||(20975-21076)
scaffold0026 (7-120)||(35577-35691)
scaffold0026 (55-139)||(23941-24026)
scaffold0026 (83-174)||(23866-23957)
scaffold0026 (6-68)||(23934-23996)
scaffold0026 (4-81)||(23880-23958)
scaffold0026 (7-63)||(24808-24863)
[»] scaffold0381 (4 HSPs)
scaffold0381 (5-163)||(13986-14146)
scaffold0381 (79-147)||(13982-14050)
scaffold0381 (4-119)||(14025-14142)
scaffold0381 (4-81)||(14065-14143)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (7-159)||(137562-137714)
scaffold0003 (5-174)||(137468-137638)
scaffold0003 (85-159)||(137680-137754)
scaffold0003 (85-139)||(81269-81323)
[»] scaffold0609 (3 HSPs)
scaffold0609 (4-163)||(4313-4472)
scaffold0609 (6-160)||(4395-4548)
scaffold0609 (4-147)||(4369-4511)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (4-174)||(59151-59319)
scaffold0004 (5-118)||(59283-59397)
scaffold0004 (4-139)||(205343-205483)
scaffold0004 (6-146)||(59217-59356)
scaffold0004 (79-160)||(59320-59401)
scaffold0004 (35-120)||(384090-384179)
[»] scaffold0008 (10 HSPs)
scaffold0008 (5-146)||(12508-12650)
scaffold0008 (7-152)||(13152-13296)
scaffold0008 (4-107)||(12586-12689)
scaffold0008 (4-146)||(13109-13251)
scaffold0008 (4-80)||(13188-13263)
scaffold0008 (6-160)||(13071-13226)
scaffold0008 (79-146)||(12504-12571)
scaffold0008 (79-147)||(13066-13134)
scaffold0008 (83-147)||(13030-13094)
scaffold0008 (95-139)||(124965-125009)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (45-160)||(134263-134380)
scaffold0021 (5-68)||(134263-134326)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (4-146)||(40174-40316)
scaffold0058 (6-119)||(40137-40250)
scaffold0058 (46-160)||(40137-40251)
scaffold0058 (4-179)||(40213-40388)
[»] scaffold0338 (4 HSPs)
scaffold0338 (5-146)||(3943-4084)
scaffold0338 (5-176)||(3983-4153)
scaffold0338 (4-80)||(4020-4096)
scaffold0338 (79-146)||(3939-4006)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (4-172)||(50684-50852)
scaffold0042 (45-116)||(50939-51010)
scaffold0042 (4-101)||(50875-50973)
scaffold0042 (38-160)||(50774-50900)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (4-139)||(34876-35011)
scaffold0034 (5-163)||(34916-35074)
scaffold0034 (4-80)||(34954-35030)
[»] scaffold0825 (3 HSPs)
scaffold0825 (4-145)||(1804-1945)
scaffold0825 (35-174)||(1873-2013)
scaffold0825 (4-80)||(1882-1958)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (44-146)||(6088-6190)
scaffold0044 (5-119)||(6127-6242)
scaffold0044 (36-160)||(6118-6243)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (45-146)||(2830-2931)
scaffold0107 (35-160)||(2777-2903)
scaffold0107 (4-80)||(2818-2894)
[»] scaffold0151 (4 HSPs)
scaffold0151 (44-146)||(2173-2276)
scaffold0151 (44-146)||(9017-9120)
scaffold0151 (4-174)||(2106-2276)
scaffold0151 (4-174)||(8950-9120)
[»] scaffold0126 (3 HSPs)
scaffold0126 (35-174)||(5685-5825)
scaffold0126 (44-146)||(5752-5854)
scaffold0126 (8-119)||(5700-5812)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (45-132)||(1417-1505)
scaffold0131 (5-57)||(1414-1466)
scaffold0131 (5-68)||(1443-1505)
scaffold0131 (79-147)||(1442-1509)
[»] scaffold0586 (3 HSPs)
scaffold0586 (5-119)||(1503-1617)
scaffold0586 (5-174)||(1488-1657)
scaffold0586 (79-147)||(1593-1661)
[»] scaffold0395 (4 HSPs)
scaffold0395 (7-159)||(8961-9112)
scaffold0395 (7-147)||(8841-8983)
scaffold0395 (35-120)||(10013-10102)
scaffold0395 (7-106)||(8921-9021)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (54-139)||(165629-165714)
scaffold0007 (4-61)||(165657-165714)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-174)||(10554-10724)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (47-176)||(223630-223759)
scaffold0012 (7-80)||(223630-223702)
[»] scaffold0635 (3 HSPs)
scaffold0635 (47-174)||(6709-6836)
scaffold0635 (7-118)||(6725-6836)
scaffold0635 (7-146)||(6776-6918)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (44-160)||(9618-9735)
scaffold0556 (114-176)||(9546-9608)
scaffold0556 (4-119)||(9619-9735)
[»] scaffold0447 (3 HSPs)
scaffold0447 (44-174)||(13898-14027)
scaffold0447 (4-80)||(13952-14027)
scaffold0447 (11-160)||(13989-14143)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (44-174)||(11893-12022)
scaffold0383 (4-80)||(11947-12022)
scaffold0383 (11-160)||(11984-12138)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (4-139)||(7048-7187)
[»] scaffold1098 (5 HSPs)
scaffold1098 (55-139)||(1125-1210)
scaffold1098 (83-174)||(1050-1141)
scaffold1098 (6-68)||(1118-1180)
scaffold1098 (4-81)||(1064-1142)
scaffold1098 (7-63)||(1992-2047)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (79-160)||(10466-10546)
scaffold0491 (5-81)||(10466-10542)
[»] scaffold1276 (2 HSPs)
scaffold1276 (83-163)||(128-207)
scaffold1276 (44-80)||(172-208)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (8-139)||(29323-29459)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (4-120)||(34475-34594)
scaffold0069 (4-63)||(29298-29356)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (7-120)||(92723-92840)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (9-139)||(20683-20818)
[»] scaffold2046 (2 HSPs)
scaffold2046 (79-139)||(112-174)
scaffold2046 (5-139)||(30-170)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (35-120)||(177909-177998)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (113-174)||(120021-120082)
scaffold0016 (36-68)||(120142-120174)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (85-139)||(524714-524768)
[»] scaffold0453 (2 HSPs)
scaffold0453 (83-139)||(3036-3093)
scaffold0453 (4-62)||(3035-3094)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (9-139)||(6554-6690)
scaffold0273 (4-71)||(6584-6653)
scaffold0273 (81-159)||(6615-6696)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (41-100)||(2808-2869)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (4-139)||(1528-1668)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (7-63)||(8455-8510)
scaffold0335 (85-139)||(3666-3720)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (7-176)||(21233-21404)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (45-120)||(21848-21927)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (29-68)||(19374-19413)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (85-120)||(20775-20810)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (85-139)||(17929-17983)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (36-120)||(8572-8660)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (44-80)||(15732-15768)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33848636 - 33848456
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33848636 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 33848538  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33848537 aatgtcttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaattggtgctaccttga 33848456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Original strand, 9388387 - 9388558
Alignment:
Q  11 ggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgcctt 110  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9388387 ggcttatgccatggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 9388485  T
Q  111 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388486 gtcattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcgtagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 9388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16278613 - 16278796
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||| || |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16278613 aaatgttgggggcttacgctccggaat-gctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccc 16278711  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278712 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 16278796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28382630 - 28382474
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  28382630 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 28382532  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28382531 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 28382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33848712 - 33848572
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33848712 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 33848614  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  33848613 tgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 33848572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 16278421 - 16278573
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16278421 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa 16278519  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16278520 tgctttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16278573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 15280396 - 15280552
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  15280396 tgttgagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 15280494  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15280495 aacgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15280552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41791413 - 41791273
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa- 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41791413 tgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 41791315  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41791314 tgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 41791273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14698421 - 14698272
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  14698421 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 14698323  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14698322 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 14698272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 15242457 - 15242599
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15242457 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctgga 15242555  T
Q  104 a-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15242556 attgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 15242599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16359271 - 16359114
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16359271 tgttgagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 16359173  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16359172 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16359114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 53388033 - 53388171
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53388033 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattgttgggggcttatgccccgg 53388132  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53388133 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 53388171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 16278498 - 16278654
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  16278498 gttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 16278596  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  16278597 aatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgctccggaatgctttgtcattcaac 16278654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4170729 - 4170580
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  4170729 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 4170631  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    |||   |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4170630 aat-tttcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 4170580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4170808 - 4170666
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4170808 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 4170710  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4170709 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 4170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6511589 - 6511447
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  6511589 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctgg 6511491  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||    
T  6511490 aatgccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatg 6511447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14698500 - 14698358
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14698500 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 14698402  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  14698401 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 14698358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15990072 - 15989930
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15990072 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctgg 15989974  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  15989973 aatgctttgtcattaaaaatgttgagggtttatgccctggaatg 15989930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 55503042 - 55503183
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55503042 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 55503140  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  55503141 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 55503183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10313520 - 10313366
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10313520 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatgcttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgg 10313422  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10313421 gatgc-ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 10313366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 56116144 - 56116286
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56116144 tgttgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaaattggtgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 56116242  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||| | ||||||    
T  56116243 aatgccttgtcgttcaatctgttgagggctcatgcactggaatg 56116286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 286896 - 286739
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccg-ttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |  ||||||| | ||||||||    
T  286896 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactattgagggctcatgccctg 286798  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  286797 gaatgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatacttagtcattcaac 286739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 56116029 - 56116166
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  56116029 tgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgtaat 56116127  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |  |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||    
T  56116128 gatttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 56116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 14942662 - 14942817
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  14942662 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14942760  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  14942761 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcacctgaatgcttagtcattcaa 14942817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 163
Target Start/End: Original strand, 21190078 - 21190195
Alignment:
Q  46 ttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  21190078 ttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctagaat 21190177  T
Q  146 gcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  21190178 gcttggtcattcaacacg 21190195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16359310 - 16359167
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16359310 tgttgagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 16359212  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16359211 aatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 16359167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 15448426 - 15448537
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  15448426 tcattcaattgttgagggcacatgccctagaatgttaatcattcaagtgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcagattgttgagggctca 15448525  T
Q  135 tgccccggaatg 146  Q
    ||||| ||||||    
T  15448526 tgccctggaatg 15448537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 15242418 - 15242520
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  15242418 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcatttaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 15242517  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  15242518 atg 15242520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 31117347 - 31117486
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31117347 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctgga 31117445  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  31117446 atg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatg 31117486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13881482 - 13881362
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  13881482 tgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctag 13881383  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  13881382 attgcttagtcattcaacacg 13881362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Original strand, 15449756 - 15449860
Alignment:
Q  42 attgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  15449756 attgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgaggacttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 15449855  T
Q  142 gaatg 146  Q
    |||||    
T  15449856 gaatg 15449860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Original strand, 14942624 - 14942719
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  14942624 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccc 14942719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 47127139 - 47127257
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47127139 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgtcgggggcttatgccccg 47127238  T
Q  142 gaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  47127239 gaatgcttagtcattcaac 47127257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13877793 - 13877703
Alignment:
Q  73 tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13877793 tcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgccttgtcactcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 13877703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Original strand, 15242534 - 15242648
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  15242534 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 15242633  T
Q  102 gaatgccttgtcatt 116  Q
    |||||| | ||||||    
T  15242634 gaatgcttagtcatt 15242648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15989881 - 15989740
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 133  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||  |||||||||  |||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15989881 tcattcaattgttgaggacttataccctagaatgctttgtcattcaactattgaaggctcatgccctggaatgc-ttatcattcaaattgttgggggctt 15989783  T
Q  134 atgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15989782 atgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 15989740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 24047832 - 24047960
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24047832 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatg 24047930  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| |||||| | || |||||||||    
T  24047931 cttagtcattcaacaagttgaaaatggtgc 24047960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41791337 - 41791261
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41791337 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 41791261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27027747 - 27027599
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggat------tatg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| |      ||||    
T  27027747 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttgtcattcaaactgttgagggctcatgcctatg 27027649  T
Q  97 ccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27027648 ccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 27027599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 15448473 - 15448549
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattca-attgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15448473 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcagattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 15448549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41791453 - 41791352
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  41791453 gttgagggctcatgccttggaacgctcgtcattcaaccgatgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 41791354  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  41791353 tg 41791352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 55503120 - 55503234
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  55503120 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 55503218  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| | ||||||||    
T  55503219 aatgcttagtcattca 55503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3337166 - 3337084
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgtt 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3337166 tgttgagggctcataccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaattgtt 3337084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Original strand, 33684861 - 33684974
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| ||||||| |||||    
T  33684861 ttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccatggaa 33684959  T
Q  105 tgccttgtcattcaa 119  Q
    ||| | |||||||||    
T  33684960 tgcttagtcattcaa 33684974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3337065 - 3336989
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3337065 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 3336989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6511511 - 6511395
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |    
T  6511511 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggattatgccccg 6511413  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  6511412 gaatgcttagtcattcaa 6511395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 33684861 - 33684989
Alignment:
Q  46 ttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33684861 ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccatggaa 33684959  T
Q  145 tgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||    
T  33684960 tgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 33684989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 55503082 - 55503230
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  55503082 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 55503179  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503180 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 55503230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6511628 - 6511526
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  6511628 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 6511530  T
Q  143 aatg 146  Q
    ||||    
T  6511529 aatg 6511526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Original strand, 20899755 - 20899849
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20899755 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20899849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27027622 - 27027532
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27027622 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 27027532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3337079 - 3337001
Alignment:
Q  68 gttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3337079 gttaattattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 3337001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 31117425 - 31117550
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  31117425 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 31117522  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||||    
T  31117523 atg-ttcatcattcaaattgttgggggct 31117550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15990115 - 15990035
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  15990115 aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 15990035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 15242525 - 15242666
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggc 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  15242525 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggc 15242623  T
Q  132 ttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  15242624 ttatgccccggaatgcttagtcatttaacacgttgaaaatggt 15242666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Original strand, 15449798 - 15449884
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggat 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  15449798 ttgaggacttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggat 15449884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 56115909 - 56116063
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  56115909 tgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgctctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 56116007  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    | |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  56116008 acgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 56116063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6511550 - 6511394
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| |  ||||||    
T  6511550 tgttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccct 6511453  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6511452 ggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggattatgccccggaatgcttagtcattcaac 6511394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15989957 - 15989835
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaat---tgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatg 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||  ||||     
T  15989957 aaatgttgagggtttatgccctggaatggatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctgaaatgtttatcattcaattgttgaggacttata 15989858  T
Q  97 ccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  15989857 ccctagaatgctttgtcattcaa 15989835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15990111 - 15989962
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  15990111 gttgagggcttatgccctggaa-tgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 15990013  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    |||||  || |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15990012 gaatg-tttatcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtca 15989962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 24047832 - 24047903
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24047832 gagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 24047903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 56116223 - 56116338
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  56116223 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcgttcaatctgttgagggctcatgcactggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 56116321  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  56116322 aatgcttagtcattcaa 56116338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6511592 - 6511486
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6511592 aattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaactgttgagggcttatgccc 6511494  T
Q  140 cggaatgc 147  Q
     |||||||    
T  6511493 tggaatgc 6511486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27027652 - 27027547
Alignment:
Q  15 tatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||    
T  27027652 tatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 27027554  T
Q  113 cattcaa 119  Q
    |||||||    
T  27027553 cattcaa 27027547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 56115949 - 56116090
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  || |||||   | |||||| ||||||||||||    
T  56115949 tgagggcttatgctctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgga 56116047  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  56116048 atgctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatg 56116090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 174
Target Start/End: Original strand, 56116291 - 56116353
Alignment:
Q  112 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  56116291 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 56116353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Original strand, 20899759 - 20899835
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20899759 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 20899835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 55503042 - 55503144
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||   |||| |||||||||||| ||    
T  55503042 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaacc-gttgagggcttatgccctgg 55503139  T
Q  143 aatgc 147  Q
    |||||    
T  55503140 aatgc 55503144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27027754 - 27027691
Alignment:
Q  76 ttcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27027754 ttcaatcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 27027691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18221149 - 18221088
Alignment:
Q  113 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  18221149 cattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 18221088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 21190114 - 21190178
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21190114 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctagaatg 21190178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27027788 - 27027653
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  27027788 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 27027689  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
     ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27027688 aaatg-tttgtcattcaaactgttgagggctcatgcc 27027653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 53388029 - 53388097
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  53388029 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 53388097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 9388458 - 9388520
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  9388458 gttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatg 9388520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Original strand, 20899759 - 20899834
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  20899759 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 20899834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8710651 - 8710573
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  8710651 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttaagggctcatgccccgtgaatgcttaatcattcaa 8710573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13877783 - 13877706
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13877783 gttgaaggcttatgccctggaat-gccttgtcactcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 13877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4170807 - 4170742
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4170807 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 4170742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 8710652 - 8710551
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  8710652 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttaagggctcatgccccgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccc 8710553  T
Q  100 tg 101  Q
    ||    
T  8710552 tg 8710551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13881441 - 13881385
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccct 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13881441 ttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccct 13881385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14698499 - 14698434
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14698499 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 14698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 16278536 - 16278600
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16278536 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 16278600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41791296 - 41791220
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg-ccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41791296 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcccccggaatgcttagtcattcaa 41791220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 47127139 - 47127203
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47127139 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 47127203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 56115986 - 56116090
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  56115986 tgttgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccct 56116084  T
Q  101 ggaatg 106  Q
    ||||||    
T  56116085 ggaatg 56116090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15989872 - 15989757
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  15989872 tgttgaggacttataccctagaat-gctttgtcattcaactattgaaggctcatgccctggaatgcttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 15989774  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  15989773 aatgcttagtcattcaa 15989757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 53388033 - 53388096
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53388033 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 53388096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 56116105 - 56116166
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaa 66  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56116105 gttgagggcttatgccctgtaa-tgatttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 56116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6511627 - 6511551
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  6511627 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 6511551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3337072 - 3336973
Alignment:
Q  37 attcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 134  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  3337072 attcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggctta 3336974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 15448397 - 15448498
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||  |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  15448397 tgttaagggctcatgctctggaatgttaatcattcaattgttgagggcacatgccctagaatg-ttaatcattc-aagtgttgagggcttatgccctgga 15448494  T
Q  144 atgc 147  Q
    ||||    
T  15448495 atgc 15448498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 16278417 - 16278483
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16278417 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 16278483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Original strand, 21190078 - 21190138
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||| ||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21190078 ttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 21190138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33848716 - 33848650
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  33848716 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 33848650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 53388072 - 53388150
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  53388072 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcgttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 53388150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 13877853 - 13877807
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgaggg 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  13877853 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaggg 13877807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18229763 - 18229730
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18229763 cattcaattgttgggggctcatgccctggaatgt 18229730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13877857 - 13877817
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  13877857 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 13877817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13881482 - 13881419
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  13881482 tgttgagggctcatgctctggaat-gctttgtcattcaaccattgagggcttatgccctggaatg 13881419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 31131813 - 31131845
Alignment:
Q  127 ggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31131813 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 31131845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 23339558 - 23339738
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23339558 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 23339656  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23339657 aatgtcttgtcattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgatggaattggtgctaccttga 23339738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44620739 - 44620583
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44620739 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 44620641  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44620640 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 44620583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 25035983 - 25036139
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  25035983 tgttgagggctcatgccctagaat-gattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctgg 25036081  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25036082 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 25036139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 23339482 - 23339622
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23339482 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaa 23339580  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  23339581 tgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 23339622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 21239482 - 21239625
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21239482 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 21239580  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21239581 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21239625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 21242032 - 21242175
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21242032 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 21242130  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21242131 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21242175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 20591424 - 20591561
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591424 gttgagggctcataccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgccatgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 20591523  T
Q  144 atgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20591524 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 20591561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28348882 - 28348743
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28348882 tgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaat 28348784  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  28348783 gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 28348743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31503290 - 31503141
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  31503290 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 31503192  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31503191 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 31503141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31503369 - 31503227
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31503369 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 31503271  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31503270 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 31503227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31505856 - 31505707
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  31505856 gttgagggcttatgccatggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 31505758  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31505757 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 31505707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31505935 - 31505793
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31505935 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccatgg 31505837  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31505836 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 31505793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31755743 - 31755602
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31755743 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 31755645  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31755644 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 31755602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 24274238 - 24274354
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  24274238 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 24274337  T
Q  144 atgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||| |||| |||||    
T  24274338 atgctttgtcattcaac 24274354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24504485 - 24504344
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24504485 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgga 24504387  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  24504386 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctggaatg 24504344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 41685076 - 41685194
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41685076 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 41685175  T
Q  142 gaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  41685176 gaatgcttagtcattcaac 41685194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 24274276 - 24274399
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24274276 tgttgagggcttatgccctcgaata-ccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctg 24274374  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24274375 gaatgccttgtcattcaaattgttg 24274399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23374998 - 23374868
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374998 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 23374900  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  23374899 aatgcttagtcattcaacaagttgaaaatggt 23374868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 21239445 - 21239546
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  21239445 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 21239544  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  21239545 tg 21239546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 21241995 - 21242096
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  21241995 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 21242094  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  21242095 tg 21242096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 21239561 - 21239677
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  21239561 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 21239660  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  21239661 aatgcttagtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 21242111 - 21242227
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  21242111 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 21242210  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  21242211 aatgcttagtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 12628184 - 12628261
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12628184 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 12628261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28352670 - 28352568
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  28352670 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 28352571  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  28352570 atg 28352568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31755665 - 31755551
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  31755665 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 31755567  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| | ||||||||    
T  31755566 aatgcttagtcattca 31755551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 10040234 - 10040361
Alignment:
Q  47 tgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10040234 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 10040332  T
Q  146 gcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  10040333 gcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 10040361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Original strand, 10040234 - 10040345
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |||||    
T  10040234 tgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 10040332  T
Q  106 gccttgtcattca 118  Q
    || | ||||||||    
T  10040333 gcttagtcattca 10040345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23374998 - 23374883
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  23374998 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 23374900  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  23374899 aatgcttagtcattcaa 23374883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24504445 - 24504297
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | || ||||||    
T  24504445 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctgg 24504348  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504347 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 24504297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31755703 - 31755555
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  31755703 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 31755606  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755605 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 31755555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28348816 - 28348676
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  28348816 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggct 28348718  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||    
T  28348717 tatgccccggaatgattagtcattcaacccgttgaaaatggt 28348676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28348807 - 28348731
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28348807 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 28348731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24504407 - 24504293
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  24504407 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 24504309  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| | ||||||||    
T  24504308 aatgcttagtcattca 24504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31503409 - 31503266
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  31503409 tgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccct 31503311  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  31503310 ggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 31503266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28352641 - 28352501
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  28352641 tcattcaactgttgatggcttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggct 28352543  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  28352542 tatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 28352501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 162
Target Start/End: Original strand, 24275717 - 24275784
Alignment:
Q  94 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacac 162  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24275717 atgccctggaatgtcta-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 24275784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22109513 - 22109435
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacac 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22109513 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacac 22109435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 10040152 - 10040294
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaa--ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || |||||| ||||||||||    
T  10040152 tgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggcttatgccctg 10040250  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10040251 gaatgccttgtcattc-aactgttgagggctcatgcccaggaatg 10040294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22109514 - 22109437
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22109514 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 22109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31503409 - 31503303
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |    
T  31503409 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 31503310  T
Q  142 gaatgct 148  Q
    |||||||    
T  31503309 gaatgct 31503303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31505975 - 31505869
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |    
T  31505975 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 31505876  T
Q  142 gaatgct 148  Q
    |||||||    
T  31505875 gaatgct 31505869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31505975 - 31505870
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  31505975 tgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccct 31505877  T
Q  101 ggaatgc 107  Q
    |||||||    
T  31505876 ggaatgc 31505870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28352632 - 28352516
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  28352632 tgttgatggcttatgtcctggaat-gacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 28352534  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  28352533 gaatgcttagtcattcaa 28352516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 21239602 - 21239677
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21239602 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 21242152 - 21242227
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21242152 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Original strand, 25035944 - 25036047
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  25035944 gttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 25036042  T
Q  102 gaatg 106  Q
    |||||    
T  25036043 gaatg 25036047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31755743 - 31755641
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||   |||| |||||||||||| ||    
T  31755743 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaacc-gttgagggcttatgccctgg 31755646  T
Q  143 aatgc 147  Q
    |||||    
T  31755645 aatgc 31755641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 41685076 - 41685140
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41685076 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 41685140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22109514 - 22109438
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  22109514 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 22109438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31518394 - 31518254
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  31518394 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 31518295  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || |||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31518294 tgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 31518254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31518561 - 31518500
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31518561 aaccgttgagggcttttgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 31518500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31518557 - 31518418
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaa--tgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| ||  |||||||| | |||||||    
T  31518557 gttgagggcttttgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgacttcttaatcattcaaattgttgagggctaatgccct 31518458  T
Q  101 g-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    | ||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31518457 gtgaatgctagttcattcaaattgtttagggcttatgccc 31518418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 12628183 - 12628261
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12628183 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 12628261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 139
Target Start/End: Original strand, 25035942 - 25036000
Alignment:
Q  81 ccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  25035942 ccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccc 25036000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 21239445 - 21239506
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21239445 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 21239506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 21241995 - 21242056
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21241995 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 21242056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23085479 - 23085379
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  23085479 tgttgagggcttatgccctgtgaatgctttttcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccct 23085380  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  23085379 g 23085379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 81
Target Start/End: Original strand, 20591466 - 20591540
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  20591466 gagggcttatgccctggaa-tgccatgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 20591540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22841076 - 22841018
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  22841076 tgttgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctg 22841018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 23339478 - 23339544
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  23339478 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 23339544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31518397 - 31518274
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 136  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  31518397 aattgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatg 31518298  T
Q  137 ccccg-gaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||| | ||||||||| ||| ||||    
T  31518297 ccctgtgaatgcttaatcattcaa 31518274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23148616 - 23148578
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaat 121  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148616 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaat 23148578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23560406 - 23560368
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaat 121  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23560406 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaat 23560368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 20353407 - 20353464
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  20353407 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagtgcttatgccc 20353464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22840992 - 22840916
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22840992 gagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctgtaatgccttgtcattcaaa 22840916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25651329 - 25651228
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  25651329 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaacccgttgagggctcatgccctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccc 25651230  T
Q  100 tg 101  Q
    ||    
T  25651229 tg 25651228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 43708194 - 43708235
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa 42  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  43708194 aaatgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 43708235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23085367 - 23085339
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23085367 tcattcaattgttgagggctcatgccctg 23085339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Original strand, 24274317 - 24274380
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||||    
T  24274317 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacta-ttgagggcttatgccctggaatgc 24274380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17795122 - 17794946
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17795122 gagggcttatgccctggaat-gttttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 17795024  T
Q  107 ccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795023 ccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 17794946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301445 - 7301590
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7301445 aaatgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccc 7301543  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||||    
T  7301544 tggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 7301590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28853679 - 28853525
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  28853679 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 28853581  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28853580 aatgtcca-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 28853525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 45135282 - 45135425
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45135282 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 45135380  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45135381 aactgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45135425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17795202 - 17795062
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17795202 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgtggagggcttatgccctggaa 17795104  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  17795103 tgttttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 17795062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44431682 - 44431543
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44431682 tgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgaaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 44431584  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  44431583 gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 44431543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 22145734 - 22145892
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  22145734 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccct 22145832  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22145833 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 22145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301527 - 7301668
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7301527 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgaa 7301625  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
     |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  7301626 ttgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 7301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44431800 - 44431648
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||     
T  44431800 tgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccattgagggcttatgccctgtaac 44431702  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  44431701 gccttgtcattcaaagcggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 44431648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 44523203 - 44523320
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44523203 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 44523302  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |||||    
T  44523303 aatgcttagtcattcaac 44523320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17614686 - 17614528
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17614686 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 17614588  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  17614587 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttacgctccggaatgcttagtcattcaacacg 17614528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 6608591 - 6608733
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6608591 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 6608689  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  6608690 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 6608733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 6608670 - 6608819
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  6608670 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 6608768  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6608769 aatg-ttcatcattcaaagtgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 6608819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17614724 - 17614609
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17614724 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 17614625  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  17614624 tgctttgtcattcaac 17614609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20460028 - 20459858
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20460028 gttgaggacttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgga 20459930  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  20459929 atgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20459858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28853757 - 28853616
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28853757 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcgttcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 28853659  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  28853658 atgccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatg 28853616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 22059728 - 22059884
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  22059728 tgttgagggcttatgcccagggat-gctatgtcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcagctgttgagggctcatgccctgg 22059826  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22059827 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 22059884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32949697 - 32949595
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  32949697 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 32949598  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  32949597 atg 32949595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19881999 - 19881865
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  19881999 tgttgagggcttatgccccggaat-gccttgtcattcaaattgtcgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagtgcttatgccctgg 19881901  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19881900 aatgctttttcattcaaactgttgagggcttatgcc 19881865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43112072 - 43111961
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  43112072 tcattcaactgttgagggctcatgccttggaatattaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctca 43111973  T
Q  135 tgccccggaatg 146  Q
    ||||| ||||||    
T  43111972 tgccctggaatg 43111961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Original strand, 45135245 - 45135346
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  45135245 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45135344  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  45135345 tg 45135346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19881921 - 19881778
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  19881921 tgttgagtgcttatgccctggaat-gctttttcattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgtttatcattcaaactgttgacggcttatgccctg 19881823  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19881822 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 19881778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 7301372 - 7301473
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7301372 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 7301470  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  7301471 tgc 7301473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 22145695 - 22145839
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  22145695 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctatgtcatttaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctg 22145793  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22145794 gaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 22145839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Original strand, 38186102 - 38186230
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccc-tggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38186102 gagggctcatgcccctggaatgctttgtcattcaaccgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 38186200  T
Q  146 gcttagtcactcaacacgatggaaatggtg 175  Q
    ||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  38186201 gcttagtcattcaacatgttgaaaatggtg 38186230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 21415584 - 21415698
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  21415584 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaattgctgggggcttatgccctgga 21415682  T
Q  104 atgccttgtcattcaa 119  Q
    |||| | |||||||||    
T  21415683 atgcttagtcattcaa 21415698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 21861647 - 21861775
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||   |||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861647 gagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactactgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatg 21861745  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  21861746 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 21861775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43112034 - 43111894
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  43112034 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggct 43111936  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  43111935 tatcccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 43111894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 22145695 - 22145811
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  22145695 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcatttaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctgg 22145794  T
Q  143 aatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  22145795 aatgctttgtcattcaa 22145811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 45135361 - 45135477
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  45135361 gttgagggcttatgccctggaactgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 45135460  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  45135461 aatgcttagtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44431606 - 44431492
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||||| ||    
T  44431606 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgagggcttatgccccgg 44431508  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| | ||||||||    
T  44431507 aatgcttagtcattca 44431492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32949659 - 32949543
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||     
T  32949659 tgttgagggcttatgccttggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgcccta 32949561  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  32949560 gaatgcttagtcattcaa 32949543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Original strand, 7301605 - 7301680
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7301605 gttgagggcttatgccctg-aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 7301680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 7301372 - 7301512
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  7301372 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctgga 7301469  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||||    
T  7301470 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 7301512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 363767 - 363599
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  363767 tgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggactgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 363669  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  363668 atga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19881842 - 19881766
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19881842 tgttgacggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 19881766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43112025 - 43111949
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43112025 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 43111949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 22059689 - 22059831
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| ||  ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22059689 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctatgtcattcaactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaactgttgatggcttatgccctgg 22059787  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22059788 aatgctttgtcattc-agctgttgagggctcatgccctggaatgc 22059831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 163
Target Start/End: Original strand, 15004830 - 15004909
Alignment:
Q  84 ttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  15004830 ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaacacg 15004909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19881801 - 19881713
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatg 172  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19881801 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 19881713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44431616 - 44431476
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||    
T  44431616 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgagggct 44431518  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  44431517 tatgccccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 44431476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 362181 - 362351
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||   |  |||||||| | |||||||| |||| ||||     
T  362181 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactattgagggcttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttatacccta 362279  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  362280 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttaagccccggaatacctagtcattcaacacgttgaaaatggt 362351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19882042 - 19881974
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19882042 aaccgttgagggcttatgccctagaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccccggaatgc 19881974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 21415544 - 21415713
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  21415544 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 21415642  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  |  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  21415643 gaatgt-tcatcattcaa-ttgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21415713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32949668 - 32949540
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  32949668 tcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggct 32949570  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacac 162  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32949569 tatgccctagaatgcttagtcattcaacac 32949540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17614647 - 17614572
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17614647 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 17614572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20459990 - 20459915
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20459990 tgttgacggcttatgccctagaa-tgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 20459915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 22521885 - 22522044
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  22521885 tgttgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctagatcattcaaaccgttgagggctcatgccct 22521983  T
Q  101 g-gaatgcctt-gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    | |||||| ||   |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22521984 gtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 22522044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 45135402 - 45135477
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45135402 gttgagggctcatgccctggaatgtcca-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20454348 - 20454246
Alignment:
Q  73 tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatg 172  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20454348 tcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgt-ttatcattcaaattatcaggggcttatgccctgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 20454250  T
Q  173 gtgc 176  Q
    ||||    
T  20454249 gtgc 20454246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28853760 - 28853655
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  28853760 aattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcgttcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccc 28853663  T
Q  140 cggaatgc 147  Q
     |||||||    
T  28853662 tggaatgc 28853655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Original strand, 21861647 - 21861758
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  21861647 gagggctcatgccctagaat-gctttgtcattcaactactgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatg 21861745  T
Q  107 ccttgtcattcaa 119  Q
    | | |||||||||    
T  21861746 cttagtcattcaa 21861758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Original strand, 24708121 - 24708197
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24708121 tgttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaaccgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 24708197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 44523203 - 44523266
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44523203 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg 44523266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19881998 - 19881935
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  19881998 gttgagggcttatgccccggaatgccttgtcattcaaattgtcgagggctcatgccctggaatg 19881935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19881930 - 19881817
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||| |||||  ||||    
T  19881930 tcattcaattgttgagtgcttatgccctggaatgctttttcattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgt-ttatcattcaaactgttgacggct 19881832  T
Q  133 tatgccccggaatgc 147  Q
    ||||||| |||||||    
T  19881831 tatgccctggaatgc 19881817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 6608592 - 6608657
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6608592 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 6608657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 15004075 - 15004138
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15004075 tgttgagggcttatgccctagaat-gctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 15004138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15267196 - 15267117
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15267196 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 15267117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43112100 - 43112040
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  43112100 gttgaggactcatgtcctggaatgttaatcattcaactgttgagggctcatgccttggaat 43112040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 22434639 - 22434778
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  22434639 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccct 22434738  T
Q  101 g-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    | ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22434739 gtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 22434778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17795047 - 17794970
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||    
T  17795047 gttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaac 17794970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44431840 - 44431766
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  44431840 tgagggctcatgccttggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 44431766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 7301645 - 7301721
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7301645 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaatttgttggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7301721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 15004830 - 15004906
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15004830 ttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaac 15004906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20385284 - 20385147
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg- 101  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||     
T  20385284 ttgagggcttatgccctgtgaaggccttgtcgttcaaactgttgagggctcatgccttgtggatgttaatcattcaaactgttgaggactcatgccctgt 20385185  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||    
T  20385184 gaatgctagttcgttcaaattgttgagggcttatgccc 20385147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20454356 - 20454303
Alignment:
Q  27 ttgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20454356 ttgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgtttatcattcaa 20454303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20460032 - 20459952
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  20460032 aaccgttgaggacttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 20459952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 23647586 - 23647646
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23647586 tgagggctcatgctctggaac-gccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctggaatg 23647646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 24708122 - 24708198
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708122 gttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaacc-gttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 24708198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 38186114 - 38186214
Alignment:
Q  19 ccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattc 117  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  38186114 ccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattc 38186212  T
Q  118 aa 119  Q
    ||    
T  38186213 aa 38186214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 119
Target Start/End: Original strand, 44523183 - 44523240
Alignment:
Q  63 ggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  44523183 ggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 44523240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 21415540 - 21415608
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||    
T  21415540 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgc 21415608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 22521966 - 22522045
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22521966 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 22522045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 45135245 - 45135306
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45135245 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 45135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17795206 - 17795140
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  17795206 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 17795140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 149
Target Start/End: Original strand, 15004076 - 15004141
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt 149  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  15004076 gttgagggcttatgccctagaatgctttgttattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctt 15004141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 139
Target Start/End: Original strand, 22434599 - 22434697
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22434599 gttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccc 22434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 22059690 - 22059754
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||    
T  22059690 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgcccagggatgct 22059754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 7301368 - 7301446
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  7301368 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 7301446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Original strand, 15004075 - 15004139
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgc 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15004075 tgttgagggcttatgccctagaatgctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 15004139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19882038 - 19881975
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19882038 gttgagggcttatgccctagaa-tgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccccggaatg 19881975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 45135241 - 45135307
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  45135241 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgc 45135307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 9)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8836 - 8657
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8836 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 8738  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8737 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgaaggaaatggtgctaccttga 8657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 11266 - 11423
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||| ||    
T  11266 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccttg 11364  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11365 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggactgcttagtcattcaac 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 11228 - 11370
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11228 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgga 11326  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  11327 atgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgc 11370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 11188 - 11342
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11188 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 11286  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  11287 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 11342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8910 - 8771
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  8910 gagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 8812  T
Q  107 ccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8811 ctttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgct 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 11188 - 11304
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  11188 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 11286  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  11287 aatgctttgtcattcaac 11304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8875 - 8734
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  8875 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctgg 8777  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  8776 aatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8799
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  8952 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctgga 8854  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  8853 atgctttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8956 - 8877
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  8956 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 8877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 296331 - 296153
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  296331 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa 296233  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  296232 tgtcttgtcattcaaattgttgggggcttaagccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaaatggtgataccttga 296153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 2333371 - 2333527
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  2333371 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccttgga 2333469  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgtt-gggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2333470 atgccttgtcattcaaattgttggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2333527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20631083 - 20630926
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  20631083 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 20630985  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20630984 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 20630926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 14432662 - 14432819
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  14432662 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14432760  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14432761 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14432819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20586888 - 20586733
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  20586888 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctg 20586790  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20586789 gaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20586733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 22900604 - 22900762
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22900604 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 22900702  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22900703 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22900762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45307057 - 45306915
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307057 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 45306959  T
Q  104 a-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45306958 attgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45306915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36181381 - 36181224
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  36181381 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 36181283  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36181282 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 36181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20579195 - 20579040
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  20579195 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctg 20579097  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20579096 gaacg-ttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20579040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22900566 - 22900681
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22900566 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22900665  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22900666 tgctttgtcattcaac 22900681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 293970 - 293834
Alignment:
Q  11 ggcttatgccc-tggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgcc 108  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  293970 ggcttatgcccctggaat-gccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgcc 293872  T
Q  109 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  293871 ttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 293834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24087245 - 24087117
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087245 tgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 24087146  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacgatggaaat 171  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  24087145 aatgcttagtcattcaacatgttggaaat 24087117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20631122 - 20630979
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20631122 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 20631024  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20631023 aatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 20630979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 2333293 - 2333434
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2333293 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgtcgagggctcgtgccctggagtgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctgga 2333391  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2333392 atgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 2333434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20901170 - 20901001
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| ||||  |    
T  20901170 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccatggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttattcccttca 20901072  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  20901071 atgt-ttatcattcaaattgttgggg-cttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20901001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18823655 - 18823553
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    
T  18823655 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaa 18823556  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  18823555 tgc 18823553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45307095 - 45306994
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  45307095 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45306996  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  45306995 tg 45306994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 21181471 - 21181567
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgc 137  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21181471 aattgttgagggcttatgccatggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgc 21181567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18823618 - 18823462
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  18823618 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccct 18823520  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
     |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18823519 agaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 18823462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28312195 - 28312068
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28312195 gagggctcatgccctgaaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttttgccccggaatg 28312097  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtg 175  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28312096 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 28312068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45306979 - 45306903
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45306979 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 45306903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20579271 - 20579170
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20579271 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaa 20579173  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  20579172 tgc 20579170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20586964 - 20586863
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20586964 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaa 20586866  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  20586865 tgc 20586863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 21181503 - 21181643
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  21181503 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctggaaggt-ttatcattcaaattgttgggggct 21181601  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  21181602 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20631122 - 20631007
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  20631122 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 20631024  T
Q  143 aatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  20631023 aatgctttgtcattcaa 20631007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 28204699 - 28204830
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28204699 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 28204797  T
Q  142 gaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28204798 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 28204830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20579271 - 20579131
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  20579271 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctgga 20579174  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20579173 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 20579131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20586964 - 20586824
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  20586964 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctgga 20586867  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20586866 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 20586824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 293907 - 293767
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  293907 tcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggct 293809  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  293808 tatgccccggaatgcttagtcattcaactcgttgaaaatggt 293767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 293898 - 293782
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  293898 tgttgagggcttatgccttggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 293800  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  293799 gaatgcttagtcattcaa 293782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20901211 - 20901095
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  20901211 tgttgagggctcatgccctgtaa-tgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccatg 20901113  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| |||||||||||    
T  20901112 gaatgctttgtcattcaa 20901095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 28204699 - 28204815
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  28204699 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 28204797  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  28204798 gaatgcttagtcattcaa 28204815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16400732 - 16400611
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |    
T  16400732 aattgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttattc 16400634  T
Q  138 cccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16400633 cccggaatgcttagtcattcaac 16400611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18270275 - 18270183
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| | |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  18270275 gttgagggctcatgccctggagtgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18270183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18274929 - 18274837
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| | |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  18274929 gttgagggctcatgccctggagtgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18274837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 21181512 - 21181628
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  21181512 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctggaaggtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 21181610  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  21181611 gaatgcttagtcattcaa 21181628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18270315 - 18270200
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  18270315 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 18270217  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  18270216 aatgcttagtcattcaa 18270200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18274969 - 18274854
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  18274969 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 18274871  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  18274870 aatgcttagtcattcaa 18274854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18823578 - 18823461
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  18823578 tgttgagggttcatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 18823480  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  18823479 gaatgcttagtcattcaaa 18823461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 22900643 - 22900718
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22900643 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 22900718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20901211 - 20901094
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||  |    
T  20901211 tgttgagggctcatgccctgtaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccatg 20901113  T
Q  142 gaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  20901112 gaatgctttgtcattcaac 20901094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37358247 - 37358201
Alignment:
Q  114 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37358247 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 37358201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24087245 - 24087129
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  24087245 tgttgagggctcatgccctagaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 24087147  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  24087146 gaatgcttagtcattcaa 24087129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18270319 - 18270259
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18270319 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18270259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18274973 - 18274913
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18274973 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18274913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19209536 - 19209465
Alignment:
Q  9 agggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19209536 agggcttatgccttggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttattattcaa 19209465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45306938 - 45306863
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45306938 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgtggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45306863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Original strand, 21181397 - 21181537
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21181397 ttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattgaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatgattcaaattgttgagggcttatgccatgga 21181495  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||  |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21181496 atg-ttaatcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgc 21181537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19209500 - 19209407
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  19209500 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttattattcaaattgttgggggcttatcccctggaatgcttaagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 19209407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20901132 - 20901057
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||    
T  20901132 tgttgagggcttatgccatggaa-tgctttgtcattcaactgttgagggcttattcccttcaatgtttatcattcaa 20901057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28312195 - 28312124
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28312195 gagggctcatgccctgaaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgtttatcattcaa 28312124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 44823102 - 44823202
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||    
T  44823102 aattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatg 44823201  T
Q  137 c 137  Q
    |    
T  44823202 c 44823202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19209536 - 19209477
Alignment:
Q  87 agggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19209536 agggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 19209477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36181302 - 36181223
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  36181302 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacc 36181223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 296335 - 296269
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  296335 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 296269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20043909 - 20043868
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20043909 aaccgttgagggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 20043868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 21181354 - 21181419
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21181354 tgttaagggcttatgccttgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatg 21181419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45918293 - 45918252
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45918293 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 45918252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Original strand, 2333289 - 2333329
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2333289 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 2333329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24960081 - 24960026
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24960081 tgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggctgatgccctg 24960026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37358278 - 37358202
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  37358278 tgttgagggctcatgccctggaatgatcattattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 37358202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45307095 - 45307034
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  45307095 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 45307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 22759079 - 22759246
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22759079 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctgg 22759177  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  22759178 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacatgttggaaat 22759246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26495630 - 26495487
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26495630 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 26495532  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  26495531 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 26495487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 16256325 - 16256483
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16256325 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 16256423  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16256424 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16256483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 16259919 - 16260077
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16259919 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 16260017  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16260018 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16260077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 29325597 - 29325740
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29325597 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccttgg 29325695  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325696 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 29325740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 22593638 - 22593796
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22593638 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctgg 22593736  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22593737 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 22597193 - 22597351
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22597193 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctgg 22597291  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22597292 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22597351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 16259881 - 16259996
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16259881 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16259980  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  16259981 tgctttgtcattcaac 16259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22590045 - 22590160
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22590045 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22590144  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22590145 tgctttgtcattcaac 22590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22593600 - 22593715
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22593600 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22593699  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22593700 tgctttgtcattcaac 22593715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22597155 - 22597270
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22597155 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22597254  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22597255 tgctttgtcattcaac 22597270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22469932 - 22469774
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22469932 tgttgagggctcatgccctggaaa-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctg 22469834  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacac 162  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22469833 aaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 22469774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 22590083 - 22590241
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  22590083 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctag 22590181  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22590182 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22590241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43120942 - 43120790
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  43120942 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 43120845  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43120844 atgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 43120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43124475 - 43124323
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  43124475 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 43124378  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43124377 atgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 43124323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 26361399 - 26361553
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26361399 gagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaa 26361497  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26361498 tgccttgtcattgaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 26361553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 27869772 - 27869950
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||  | |||||||    
T  27869772 tgttgagggctcatgccctggaatg---ttatcattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgaggactcatgccct 27869868  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctaccttga 184  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27869869 gaaatg--ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtggtaccttga 27869950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 16256276 - 16256402
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 133  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16256276 tcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctc 16256375  T
Q  134 atgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  16256376 atgccctggaatgctttgtcattcaac 16256402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26495667 - 26495566
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  26495667 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 26495568  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  26495567 tg 26495566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 22759004 - 22759143
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    |||||||  ||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22759004 tgagggcacatgccctagaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaat 22759102  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22759103 gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 22759143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23693262 - 23693108
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23693262 gttgagggctcttgccctggaat-gcctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgga 23693164  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||| |||||    
T  23693163 atgcctcgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaac 23693108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26495551 - 26495435
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  26495551 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 26495452  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  26495451 aatgcttagtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 8953034 - 8953148
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8953034 gttgagggctcatgcccttgaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttggggacttatgccccgga 8953132  T
Q  144 atgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8953133 atgcttagtcattcaa 8953148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 29325562 - 29325661
Alignment:
Q  47 tgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325562 tgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 29325661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Original strand, 16256248 - 16256322
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16256248 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16256322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 22357911 - 22358051
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  22357911 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgagggcttatgccctgg 22358009  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||    
T  22358010 aatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaat 22358051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 27869695 - 27869835
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  27869695 tgttgagggcttatgccctggaatg--cttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaactgttgagggctcatgccctgg 27869792  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||  || |||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  27869793 aatg--ttatcattctaattgttgagagctcatgccctggaatgc 27869835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 29325676 - 29325792
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  29325676 gttgagggcttatgccttggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 29325775  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  29325776 aatgcttagtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23671633 - 23671488
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23671633 gttgagggctcatgccctggaat-gcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaatcgttgagggctcatgccctgga 23671535  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 151  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  23671534 atgccttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgcttag 23671488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43120982 - 43120881
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43120982 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 43120884  T
Q  104 atg 106  Q
    |||    
T  43120883 atg 43120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43124515 - 43124414
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43124515 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 43124417  T
Q  104 atg 106  Q
    |||    
T  43124416 atg 43124414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 27869733 - 27869867
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | | |||||||||    
T  27869733 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtta-tcattctaattgttgagagctcatgccctgg 27869830  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  27869831 aatgccttgtcattcaaactgttgaggactcatgccc 27869867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Original strand, 24277643 - 24277777
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24277643 aattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcc 24277741  T
Q  139 ccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  24277742 ccggaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24277777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24384570 - 24384436
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24384570 aattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgcc 24384472  T
Q  139 ccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  24384471 ccggaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24384436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4397514 - 4397426
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaat 171  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  4397514 gttgagggctcatgccctgaaatgccttgtcattcaaattattgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 4397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 24277646 - 24277722
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24277646 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 24277722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24384567 - 24384491
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24384567 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 24384491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 16256286 - 16256427
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | |||||||||    
T  16256286 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 16256384  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  16256385 aatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatg 16256427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23693184 - 23693082
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  23693184 gttgagggctcatgccctggaat-gcctcgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaacgggtgaaggatgatgccctgga 23693086  T
Q  104 atgc 107  Q
    ||||    
T  23693085 atgc 23693082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 22357950 - 22358123
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  22357950 tgttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 22358047  T
Q  102 gaatgccttg-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||   ||  ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| | |||||| | || |||||||||    
T  22358048 gaatatttttatcattcaaattgttgaggtcttatgccctagaatgcttagttattcaacatgttgaaaatggtgc 22358123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 22357911 - 22358027
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22357911 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgagggcttatgccctgg 22358009  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  22358010 aatgctttgtcattcaac 22358027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 16256364 - 16256439
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16256364 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 16256439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 16259958 - 16260033
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16259958 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 16260033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26495510 - 26495435
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26495510 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 29325717 - 29325792
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29325717 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 22357907 - 22357974
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22357907 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 22357974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43120982 - 43120881
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  43120982 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 43120885  T
Q  143 aatg 146  Q
    ||||    
T  43120884 aatg 43120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43124515 - 43124414
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  43124515 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 43124418  T
Q  143 aatg 146  Q
    ||||    
T  43124417 aatg 43124414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22470069 - 22469949
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||  |||||| | |||||||| | ||||||    
T  22470069 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgttgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctttaactattcaaactgttgagggctcatgccc 22469970  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22469969 tggaatgccttgtcattcaaa 22469949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 22593677 - 22593752
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22593677 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 22593752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 22597232 - 22597307
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22597232 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatgttcatcattcaa 22597307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 21559424 - 21559562
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  21559424 ttgagggcttttgccttgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctg 21559523  T
Q  102 -gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
     ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21559524 tgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 21559562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 22590122 - 22590197
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22590122 tgttgagggctcatgccctggaa-tgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctagaatgttcatcattcaa 22590197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 22758964 - 22759116
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  22758964 tgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaaattggtgagggcacatgccctagaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 22759062  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||  || |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22759063 atg-tttatcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 22759116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 26706458 - 26706359
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26706458 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26706359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 26976192 - 26976093
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26976192 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26976093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7785219 - 7785121
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7785219 gttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcaagtcattcaatcgttgagggcttatgccctg 7785121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 121
Target Start/End: Original strand, 8953072 - 8953150
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||  |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  8953072 tgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttggggacttatgccccggaatgcttagtcattcaaat 8953150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21495055 - 21495001
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  21495055 tgagggatcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 21495001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 26495667 - 26495606
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26495667 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 26495606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 26361476 - 26361554
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcatt-caattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 82  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  26361476 gttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattgaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 26361554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Original strand, 17023000 - 17023038
Alignment:
Q  82 cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17023000 cgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17023038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 29325562 - 29325621
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29325562 tgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 29325621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23693266 - 23693186
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23693266 aaccgttgagggctcttgccctggaatgcctcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaac 23693186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23693146 - 23693083
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||| || | |||||||||||||    
T  23693146 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaacgggtgaaggatgatgccctggaatg 23693083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 13395856 - 13396035
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  13395856 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccct 13395954  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13395955 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 13396035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006162 - 16006020
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16006162 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttataccctgg 16006064  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16006063 aatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 16006020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38827953 - 38827797
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  38827953 tgttgagggctcatgccctagaat-gattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctgg 38827855  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38827854 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 38827797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48785002 - 48784846
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  48785002 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 48784904  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48784903 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 48784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 13733840 - 13733996
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  13733840 tgttgagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatactatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctgg 13733938  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13733939 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 13733996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006083 - 16005941
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16006083 gttgagggcttataccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 16005985  T
Q  104 a-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16005984 attgccttgtcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatg 16005941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 17506136 - 17506316
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||| ||||||| | || ||||| || |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17506136 aaatgttgggggcttacgtcccggaat-gctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccc 17506234  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  17506235 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17506316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17547078 - 17546898
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||| ||||||| | || ||||| || |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17547078 aaatgttgggggcttacgtcccggaat-gctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccc 17546980  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  17546979 tggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17546898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8776068 - 8775925
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8776068 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 8775970  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||    
T  8775969 aactgccttgtcattcaatctattgagggctcatgccctggaatg 8775925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 21743701 - 21743850
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  21743701 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 21743799  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21743800 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 21743850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35366053 - 35365924
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| | | |    
T  35366053 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgaggggttatgccctggaatgccttgtcattc-aactggtgagggcttatgctctgca 35365955  T
Q  144 atgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35365954 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 35365924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 14189354 - 14189525
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14189354 tgttgagggctcatgccctagaat-gccttgtcattcaacttttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctgg 14189452  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14189453 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaacgcctagtcattcaacacgttggaaatggtgc 14189525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 13849919 - 13850062
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  13849919 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgagggcttatgccctag 13850017  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13850018 attgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 13850062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 21743622 - 21743764
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21743622 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 21743720  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21743721 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21743764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 13395778 - 13395933
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13395778 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 13395876  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  13395877 aatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 13395933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 124486 - 124627
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  124486 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 124584  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  124585 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 124627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4993252 - 4993111
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4993252 ttgagggcttatgccctggaat-gccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattgaaccgttgagggctcatgccctggaa 4993154  T
Q  105 -tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
     |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4993153 ttgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 4993111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48785080 - 48784925
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48785080 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 48784982  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  48784981 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 13849999 - 13850168
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  13849999 ttgagggcttatgccctaga-ttgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 13850097  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13850098 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 13850168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 13849881 - 13849983
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  13849881 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 13849980  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  13849981 atg 13849983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 14192109 - 14192276
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| |||||||| ||    
T  14192109 tgttgagggcttatgccctagaat-gctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgccccgg 14192207  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatg 172  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  14192208 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcctagtcattcaacacgttggaaatg 14192276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48785119 - 48784964
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48785119 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 48785021  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  48785020 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16573293 - 16573169
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 134  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16573293 tcattcaactgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggctta 16573194  T
Q  135 tgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16573193 tgccctggaatgctttgtcattcaa 16573169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 16592369 - 16592493
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 134  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16592369 tcattcaactgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggctta 16592468  T
Q  135 tgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16592469 tgccctggaatgctttgtcattcaa 16592493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8776144 - 8776004
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8776144 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctgga 8776047  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8776046 atgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 8776004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13255820 - 13255680
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13255820 tgttgagtgcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctgga 13255722  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13255721 atgctttggcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatg 13255680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4993291 - 4993190
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4993291 gttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 4993192  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  4993191 tg 4993190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38828031 - 38827936
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  38828031 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccc 38827936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48743398 - 48743288
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||    
T  48743398 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctgga 48743299  T
Q  144 atgcttagtca 154  Q
    |||||| ||||    
T  48743298 atgctttgtca 48743288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 137
Target Start/End: Original strand, 709609 - 709702
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  709609 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaattccttgtcattcaaattgttgagggctcatgc 709702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16006199 - 16006098
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16006199 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16006100  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  16006099 tg 16006098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16573246 - 16573075
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || | ||| |||    
T  16573246 tgttgagggcttatgccctggaat-gtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcct 16573148  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16573147 ggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16573075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 16592416 - 16592587
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || | ||| |||    
T  16592416 tgttgagggcttatgccctggaat-gtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcct 16592514  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16592515 ggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 14192072 - 14192211
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14192072 gttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 14192169  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  14192170 atgccttgtcattc-aactggtgagggcttatgccccggaatg 14192211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 21065502 - 21065600
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21065502 tgagggcttatgccctggaat-gctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccatggaat 21065600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13255541 - 13255414
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13255541 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgaaggcttatgccctggaatgt-ttatctttcaaattgttgagggcttatgccccggaatg 13255443  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtg 175  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13255442 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 13255414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4993175 - 4993099
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4993175 gttgagggctcatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 4993099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16006005 - 16005929
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16006005 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 16005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 124564 - 124678
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  124564 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 124662  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| | ||||||||    
T  124663 aatgcttagtcattca 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 124526 - 124674
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  124526 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 124623  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124624 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 124674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8775989 - 8775873
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  8775989 gttgagggcttatgccctggaactgccttgtcattcaatctattgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 8775890  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  8775889 aatgcttagtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13255743 - 13255628
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||| | |||||| |||    
T  13255743 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttggcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattggtgagggctcatgcccggga 13255645  T
Q  104 atgccttgtcattcaaa 120  Q
    | |||||||| ||||||    
T  13255644 acgccttgtcgttcaaa 13255628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11660874 - 11660764
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgc 107  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||     
T  11660874 gagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgagagcttatgccctggaatgtttatcattcaattgtttagggcttatgccctggaatgt 11660776  T
Q  108 cttgtcattcaa 119  Q
     | |||||||||    
T  11660775 ttagtcattcaa 11660764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 14189278 - 14189392
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||    
T  14189278 gttgagggc-catgccctagaatgtttatcattcaattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaa 14189376  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||| | |||| |||||    
T  14189377 tgccttgtcattcaac 14189392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 14192072 - 14192186
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||    
T  14192072 gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaa 14192170  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||| | |||| |||||    
T  14192171 tgccttgtcattcaac 14192186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48743369 - 48743227
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||| | || ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  48743369 tcattcaattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatgctttgtcattcagattgttgggg-ct 48743271  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||    
T  48743270 tatgccccagaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 48743227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16459056 - 16458959
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||    
T  16459056 gagggctcatgccctagaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-gttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatg 16458959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 13850037 - 13850153
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  13850037 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 13850135  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  13850136 gaatgcttagtcattcaa 13850153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 17506096 - 17506177
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  17506096 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17547118 - 17547037
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  17547118 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17547037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 172
Target Start/End: Original strand, 47976002 - 47976121
Alignment:
Q  52 gctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47976002 gctcatgtcctgaaatgttaatcgttcaactgttgaggactcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattag 47976100  T
Q  152 tcactcaacacgatggaaatg 172  Q
    | | |||||||| || |||||    
T  47976101 taattcaacacgttgaaaatg 47976121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 14189305 - 14189431
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  14189305 tcattcaattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaactt-ttgagggct 14189403  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  14189404 tatgccctggaatgctttgtcattcaac 14189431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 40555756 - 40555882
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||    
T  40555756 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccttgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggttcatgccct 40555855  T
Q  101 g-gaatgccttgtcattcaaattgttg 126  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  40555856 gtgaatgtcttgtcattcaaattgttg 40555882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 14189314 - 14189430
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  14189314 tgttgagggattatgccctggaa-tgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaacttttgagggcttatgccctg 14189412  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| |||||||||||    
T  14189413 gaatgctttgtcattcaa 14189430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16573325 - 16573260
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  16573325 aattgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg 16573260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 106
Target Start/End: Original strand, 16592337 - 16592402
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  16592337 aattgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg 16592402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13255825 - 13255716
Alignment:
Q  39 tcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  13255825 tcaattgttgagtgcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaa-ttgttgagggcttatgc 13255728  T
Q  138 cccggaatgctt 149  Q
    || |||||||||    
T  13255727 cctggaatgctt 13255716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 173
Target Start/End: Original strand, 711021 - 711110
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatgg 173  Q
    |||||||| | |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  711021 gttgagggctcatgcactggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatgg 711110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11660874 - 11660747
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||||  || |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  11660874 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagagcttatgccctggaatgt-ttatcattcaa-ttgtttagggcttatgccctggaatg 11660777  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
     ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  11660776 tttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 11660747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16459021 - 16458919
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||    
T  16459021 gttgagggcttatgccctggaatgg--ttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcgtatgctctgg 16458924  T
Q  103 aatgc 107  Q
    |||||    
T  16458923 aatgc 16458919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Original strand, 124486 - 124588
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||   |||| |||||||||||| ||    
T  124486 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaacc-gttgagggcttatgccctgg 124583  T
Q  143 aatgc 147  Q
    |||||    
T  124584 aatgc 124588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 709647 - 709777
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||             |||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  709647 tgttgagggcttatgccctggaatt-ccttgtcattcaaattgttgagggctcatgc-------------tcattcaaactgttgatggcttatgccctg 709732  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  709733 gaatgccttgtcatttaaactgttgagggctcatgccctggaatg 709777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13255541 - 13255430
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  13255541 gagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgaaggcttatgccctggaatgtttatctttcaaattgttgagggcttatgccccggaatg 13255443  T
Q  107 ccttgtcattcaa 119  Q
    | | |||||||||    
T  13255442 cttagtcattcaa 13255430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 38827992 - 38827889
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  38827992 gttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 38827894  T
Q  102 gaatg 106  Q
    |||||    
T  38827893 gaatg 38827889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8775920 - 8775873
Alignment:
Q  112 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8775920 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 40555752 - 40555812
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40555752 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 40555812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 709713 - 709779
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgtt 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  709713 tgttgatggcttatgccctggaat-gccttgtcatttaaactgttgagggctcatgccctggaatgtt 709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 711017 - 711096
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  711017 aattgttgagggctcatgcactggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 711096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15690025 - 15689926
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15690025 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctg 15689926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15697618 - 15697519
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15697618 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctg 15697519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Original strand, 15731803 - 15731902
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15731803 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 15731902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11660956 - 11660815
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaa--ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  |||  ||||| | ||||||||    
T  11660956 tgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatccg-ggagggctcatgccctg 11660859  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  11660858 gaatgctttgtcattc-aattgttgagagcttatgccctggaatg 11660815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13407786 - 13407736
Alignment:
Q  113 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13407786 cattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacg 13407736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 16668610 - 16668699
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16668610 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 16668699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 17642980 - 17643069
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17642980 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17643069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 13395779 - 13395855
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  13395779 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13395855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15725554 - 15725457
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15725554 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacttttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 15725457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 21519336 - 21519424
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21519336 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttgactattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtcttgtcattcaaa 21519424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 21743623 - 21743688
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21743623 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 21743688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48743360 - 48743296
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  48743360 tgttgagggcttatgccctggaa-tcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatg 48743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 7507496 - 7507636
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||    
T  7507496 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggttcatgccctgtgaatacttaattattcaaactgttgagggctcatgccc 7507595  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7507596 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 7507636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 7507619 - 7507759
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||| ||| |||||||| | ||||||    
T  7507619 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggttcatgccctgtgaatacttaattattcaaactgttgagggctcatgccc 7507718  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7507719 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 7507759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16459031 - 16458904
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 133  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  |  ||||||||| ||||| |||| |    
T  16459031 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatggttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaactgttgagggcgt 16458933  T
Q  134 atgccccggaatgcttagtcactcaacac 162  Q
    |||| | |||||||||||| | |||||||    
T  16458932 atgctctggaatgcttagttattcaacac 16458904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8776144 - 8776043
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||| |||    
T  8776144 gttgagggctcatgccctggaatgctcgccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgc-tcgtcattcaact-gttgagggcttatgccctgga 8776047  T
Q  144 atgc 147  Q
    ||||    
T  8776046 atgc 8776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15725554 - 15725496
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15725554 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaacttttgagggctcatgccctg 15725496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16005936 - 16005889
Alignment:
Q  112 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16005936 tcattcaaattgttgggagcttatgccccggaatgtttagtcattcaa 16005889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Original strand, 21065462 - 21065525
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  21065462 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgct 21065525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4993175 - 4993059
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||    |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4993175 gttgagggctcatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgtagggggcttatgccaag 4993077  T
Q  142 gaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4993076 gaatgcttagtcattcaa 4993059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Original strand, 47975967 - 47976001
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975967 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 47976001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 8757395 - 8757452
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgcc 60  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8757395 tgttgagggcttatgcactgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 8757452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8776106 - 8776044
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8776106 tgttgagggctcatgccctggaat--gctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 8776044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 12202048 - 12202149
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  12202048 tgttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccc 12202147  T
Q  100 tg 101  Q
    ||    
T  12202148 tg 12202149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Original strand, 22122715 - 22122816
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22122715 aattgttgagggatcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatg 22122814  T
Q  137 cc 138  Q
    ||    
T  22122815 cc 22122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35366014 - 35365938
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  35366014 gttgaggggttatgccctggaat-gccttgtcattcaactggtgagggcttatgctctgcaatgcttagtcattcaac 35365938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 138
Target Start/End: Original strand, 40555916 - 40556017
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40555916 aattgttgagggatcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatg 40556015  T
Q  137 cc 138  Q
    ||    
T  40556016 cc 40556017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 138
Target Start/End: Original strand, 8757396 - 8757452
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8757396 gttgagggcttatgcactgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 8757452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15689984 - 15689865
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||  | |||    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||    
T  15689984 gttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccct 15689885  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  15689884 tgaatgtcttgtcattcaaa 15689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15697577 - 15697458
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||  | |||    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||    
T  15697577 gttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccct 15697478  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  15697477 tgaatgtcttgtcattcaaa 15697458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16006199 - 16006138
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16006199 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 16006138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 40555837 - 40555977
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||| | ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  40555837 tgttgagggttcatgccctgtgaatgtcttgtcattcaaattgttgagggtccatgccatgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggatcatgccc 40555936  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40555937 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccc 40555977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Original strand, 13865390 - 13865465
Alignment:
Q  80 accgttgagggattatgccctggaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  13865390 accgttgggggcttatgtcctggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgcgccggaatgctcagtca 13865465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14038665 - 14038579
Alignment:
Q  38 ttcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14038665 ttcaattggtgagggctcatgccttgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 14038579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14348695 - 14348609
Alignment:
Q  38 ttcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14348695 ttcaattggtgagggctcatgccttgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 14348609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 14192068 - 14192147
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  14192068 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-tttatcattc-aattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 14192147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Original strand, 21065502 - 21065563
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21065502 tgagggcttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21065563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 22122636 - 22122776
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||| | ||||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  22122636 tgttgagggttcatgccctgtgaatgtnttgtcattcaaattgttgagggtccatgccatgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggatcatgccc 22122735  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22122736 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccc 22122776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 22122759 - 22122816
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgcc 60  Q
    ||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22122759 tgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 22122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38828002 - 38827889
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||  ||||| |||||    
T  38828002 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggct 38827903  T
Q  133 tatgccccggaatg 146  Q
     |||||| ||||||    
T  38827902 catgccctggaatg 38827889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 40555960 - 40556017
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgcc 60  Q
    ||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40555960 tgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 40556017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 709638 - 709670
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaat 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  709638 tcattcaattgttgagggcttatgccctggaat 709670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13407878 - 13407846
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13407878 cattcaattgttgggggctcatgccctggaatg 13407846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 13865332 - 13865364
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13865332 cattcaattgttgggggctcatgccctggaatg 13865364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16006203 - 16006137
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16006203 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgc 16006137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23442368 - 23442324
Alignment:
Q  95 tgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23442368 tgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 23442324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 179738 - 179909
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  179738 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgatttgtcattcaactgttgagggcttacgccctg 179836  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  179837 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16799525 - 16799347
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16799525 tgttgggggcttatgccccggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 16799427  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16799426 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 16799347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 15010449 - 15010605
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||    
T  15010449 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttcagggctcatgccctgg 15010547  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15010548 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2035336 - 2035493
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  2035336 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 2035434  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2035435 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2035493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2039077 - 2039234
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  2039077 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 2039175  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2039176 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2042818 - 2042975
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  2042818 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 2042916  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2042917 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2042975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14037983 - 14037826
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  14037983 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14037885  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14037884 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14037826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14041451 - 14041294
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  14041451 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 14041353  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14041352 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14041294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10554227 - 10554073
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10554227 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctagaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgga 10554129  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  10554128 atgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 10554073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Original strand, 10989915 - 10990047
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10989915 tgagggcttatgccctgtaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 10990013  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  10990014 gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccc 10990047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 23396058 - 23396214
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| |    
T  23396058 gttgagcgcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgggggcttatgccctag 23396156  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23396157 aatgccttgtcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaac 23396214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18958701 - 18958550
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  18958701 gttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgga 18958603  T
Q  104 a-tgccttgtcatt-caaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958602 aatgccttgtcatttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 18958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Original strand, 52338960 - 52339066
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcccc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  52338960 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccct 52339059  T
Q  141 ggaatgc 147  Q
    |||||||    
T  52339060 ggaatgc 52339066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 2039038 - 2039181
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2039038 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2039136  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  2039137 aatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgc 2039181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 2042779 - 2042922
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042779 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042877  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  2042878 aatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgc 2042922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54973078 - 54972935
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54973078 tgttgagggctcatgctctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 54972980  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54972979 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54972935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54975688 - 54975545
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54975688 tgttgagggctcatgctctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 54975590  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54975589 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54975545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54978298 - 54978155
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54978298 tgttgagggctcatgctctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 54978200  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54978199 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54978155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Original strand, 603939 - 604056
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  603939 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccag 604038  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |||||    
T  604039 aatgcttagtcattcaac 604056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2038843 - 2038998
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2038843 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2038941  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2038942 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2038921 - 2039076
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2038921 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2039019  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2039020 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2038960 - 2039115
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2038960 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2039058  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2039059 aatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2042584 - 2042739
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042584 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042682  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2042683 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2042662 - 2042817
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042662 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042760  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2042761 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2042701 - 2042856
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042701 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042799  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2042800 aatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 2035297 - 2035440
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2035297 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2035395  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  2035396 aatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgc 2035440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 2038999 - 2039153
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2038999 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2039097  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2039098 aatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2039153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Original strand, 2042740 - 2042894
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042740 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042838  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2042839 aatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2042894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 14951842 - 14951958
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14951842 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccgg 14951941  T
Q  143 aatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14951942 aatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 179701 - 179816
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  179701 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaa 179800  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    || || |||| |||||    
T  179801 tgatttgtcattcaac 179816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 52339041 - 52339175
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  52339041 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagagctcatgccctgaaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgccctgg 52339139  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  52339140 aatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgcc 52339175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 6806018 - 6806120
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  6806018 tgttgagggctcatgccctggaatgctaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 6806117  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  6806118 atg 6806120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2038804 - 2038959
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2038804 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2038902  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2038903 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 2042545 - 2042700
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2042545 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgg 2042643  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2042644 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10554110 - 10553994
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10554110 tgttgggggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctgg 10554012  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaa 120  Q
    || |||||||| ||||||    
T  10554011 aacgccttgtcgttcaaa 10553994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16799604 - 16799487
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799604 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 16799505  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  16799504 aatgctttgtcattcaac 16799487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39230546 - 39230430
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39230546 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgggggcttatgccccgg 39230448  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |||||    
T  39230447 aatgcttagtcattcaac 39230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54973194 - 54973093
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54973194 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54973096  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  54973095 tgc 54973093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54975804 - 54975703
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54975804 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54975706  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  54975705 tgc 54975703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54978414 - 54978313
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54978414 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54978316  T
Q  145 tgc 147  Q
    |||    
T  54978315 tgc 54978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 6806056 - 6806172
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |    
T  6806056 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgggggcttatgccccg 6806154  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  6806155 gaatgcttagtcattcaa 6806172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7632010 - 7631933
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7632010 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16799565 - 16799421
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  16799565 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctg 16799467  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16799466 gaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 16799421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54972999 - 54972923
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54972999 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54972923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54975609 - 54975533
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54975609 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54975533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54978219 - 54978143
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54978219 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 54978143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 6806018 - 6806187
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  6806018 tgttgagggctcatgccctggaatg--ctaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 6806115  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  6806116 gaatgt-ttatcattcaaactgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6806187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Original strand, 55292743 - 55292843
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacctt 182  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||   || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55292743 gttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaacc-gtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacctt 55292841  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  55292842 ga 55292843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 30206558 - 30206638
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30206558 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 30206638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54973194 - 54973041
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  54973194 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctgga 54973097  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||||||| |||| ||||    
T  54973096 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54973041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54975804 - 54975651
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  54975804 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctgga 54975707  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||||||| |||| ||||    
T  54975706 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54975651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54978414 - 54978261
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  54978414 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctgga 54978317  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||||||| |||| ||||    
T  54978316 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaa 54978261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 3395001 - 3395140
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||    
T  3395001 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccct 3395100  T
Q  101 g-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3395101 gtgaatgacttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 3395140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 23396136 - 23396308
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||  |||| |  ||||||||||    
T  23396136 tgttgggggcttatgccctagaat-gccttgtcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaactattgatgacttatgccctg 23396234  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  23396235 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgatatacttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 23396308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 54046540 - 54046463
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  54046540 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Original strand, 2035297 - 2035412
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||    
T  2035297 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctgg 2035395  T
Q  143 aatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  2035396 aatgctttgtcattcaa 2035412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6819170 - 6819033
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  || |||| | ||||||||    
T  6819170 tgttgagggattatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccatgaaatgtttatcattcaaactatttagggctcatgccctg 6819071  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6819070 gaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 6819033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Original strand, 10834465 - 10834592
Alignment:
Q  49 agggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10834465 agggctcatgccctggagtgttttgtcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgc 10834563  T
Q  148 ttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||    
T  10834564 ttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 10834592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 10989991 - 10990106
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  10989991 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 10990089  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  10990090 aatgcttagtcattcaa 10990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 10989981 - 10990121
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  10989981 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatga-tcatcattcaaattgttgggggct 10990079  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  10990080 tatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 10990121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 52339001 - 52339065
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52339001 tgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 52339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 52339110 - 52339250
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  52339110 tcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatga-tcatcattcaaattgttgggggct 52339208  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  52339209 tatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 52339250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 52339119 - 52339235
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  52339119 tgttgatggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 52339217  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  52339218 gaatgcttagtcattcaa 52339235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 175
Target Start/End: Original strand, 1989356 - 1989491
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1989356 aattggtgggggcgcatgccctggaatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccctagaatgt-ttatcattcacattgttgggggcttatgcc 1989454  T
Q  139 ccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtg 175  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  1989455 ctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 1989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39230546 - 39230431
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||| |||||||| ||    
T  39230546 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgggggcttatgccccgg 39230448  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  39230447 aatgcttagtcattcaa 39230431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 54973121 - 54973054
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54973121 aaatgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 54973054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 54975731 - 54975664
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54975731 aaatgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 54975664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 54978341 - 54978274
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54978341 aaatgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 54978274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17211213 - 17211123
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  17211213 gttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 17211123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18958663 - 18958602
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18958663 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaa 18958602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 14951842 - 14951958
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||  |||||||| |||||||| |    
T  14951842 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccg 14951940  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  14951941 gaatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16799604 - 16799449
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  16799604 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 16799506  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16799505 gaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16799449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18958705 - 18958625
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  18958705 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 18958625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 603939 - 604002
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  603939 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 604002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10554187 - 10554046
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||| ||| |||||||||||    
T  10554187 gttgagggctcatgccctagaatg--ctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccctgg 10554090  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10554089 aatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 10554046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 23396054 - 23396121
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  23396054 aaccgttgagcgcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatg 23396121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 30206557 - 30206635
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30206557 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 30206635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 3394997 - 3395079
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  3394997 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 3395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6819085 - 6818963
Alignment:
Q  9 agggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||      ||||| |||||    
T  6819085 agggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgtagagg------gccctagaatg 6818993  T
Q  107 ccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 136  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6818992 cattgtcattcaaactgttgagggcttatg 6818963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 139
Target Start/End: Original strand, 52338992 - 52339098
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  52338992 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagagct 52339091  T
Q  133 tatgccc 139  Q
     ||||||    
T  52339092 catgccc 52339098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 14951778 - 14951918
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||            | |||||||| | |||||||||||    
T  14951778 gttgagggctcatgcccttgaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg------------ctgttgagggctcatgccctggaa 14951864  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  14951865 tgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 14951918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15232278 - 15232141
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccctg- 101  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||     
T  15232278 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaccgttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgt 15232179  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15232178 gaatgctagttcattcaatttgttgagggcttatgccc 15232141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15238146 - 15238009
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccctg- 101  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||     
T  15238146 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaccgttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgt 15238047  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15238046 gaatgctagttcattcaatttgttgagggcttatgccc 15238009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16799608 - 16799540
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  16799608 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 16799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 54046541 - 54046463
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54046541 tgttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54972958 - 54972888
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54972958 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 54972888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54975568 - 54975498
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54975568 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 54975498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54978178 - 54978108
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54978178 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtca 54978108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Original strand, 2035298 - 2035374
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2035298 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2035374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 10834487 - 10834535
Alignment:
Q  32 ttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10834487 ttgtcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgtttatcattcaa 10834535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6818976 - 6818887
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  6818976 gttgagggcttatgtcctgtaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttat-acccggaattcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6818887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7632010 - 7631933
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  7632010 gttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 10989875 - 10989949
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  10989875 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaa 10989949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 14951774 - 14951842
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14951774 aaccgttgagggctcatgcccttgaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgct 14951842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43928445 - 43928388
Alignment:
Q  1 aaatgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcat 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43928445 aaatgttgagggcttatgccatgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcat 43928388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 3395082 - 3395142
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3395082 tgttgagggctcatgccctgtgaatgacttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 3395142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17211214 - 17211138
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17211214 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 17211138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Original strand, 55292742 - 55292818
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  55292742 tgttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 55292818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9919 - 9884
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9919 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 9884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18958624 - 18958558
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcatt--caattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  18958624 tgttgagggctcatgccctggaaatgccttgtcatttcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 18958558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43928441 - 43928391
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43928441 gttgagggcttatgccatgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggct 43928391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 55292742 - 55292819
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  55292742 tgttgagggcttatgccct-gaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 55292819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Original strand, 1989281 - 1989416
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||  | || |||   |||||||||    
T  1989281 tgagggctcatgccctggaac-gctttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattggtgggggcgcatgccctgg 1989379  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  1989380 aatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccc 1989416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Original strand, 10834381 - 10834437
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  10834381 ttgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctg 10834437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Original strand, 10989915 - 10989976
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10989915 tgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 10989976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 139
Target Start/End: Original strand, 18367772 - 18367809
Alignment:
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18367772 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 18367809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15446460 - 15446424
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15446460 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15446424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 63
Target Start/End: Original strand, 18367775 - 18367811
Alignment:
Q  28 tgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18367775 tgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 18367811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35984753 - 35984717
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaat 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35984753 tgagggcttacgccctggaatgccttgtcattcaaat 35984717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54973198 - 54973120
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54973198 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54973120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54975808 - 54975730
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54975808 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54975730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54978418 - 54978340
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54978418 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54978340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 11727 - 11887
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11727 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctg 11825  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11826 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 11887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11831
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| | ||||||||    
T  11688 gttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 11786  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  11787 gaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgc 11831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 11684 - 11752
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11684 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgc 11752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Original strand, 15686428 - 15686594
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  15686428 gttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctgga 15686526  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15686527 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 15686594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 2288238 - 2288415
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  2288238 gttgaaggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaactattgagggttcatgccctgg 2288336  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2288337 aatgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 2288415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8522676 - 8522533
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8522676 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgg 8522578  T
Q  103 aa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8522577 aattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 8522533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16102149 - 16101992
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16102149 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 16102051  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16102050 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16101992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15538962 - 15538810
Alignment:
Q  32 ttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttggg 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538962 ttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgggatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttggg 15538863  T
Q  129 ggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctacct 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15538862 ggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 15538810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13764113 - 13763942
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  13764113 tgttgatggcttatgccctggtat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccgtggaatttttatcattcaattgttgagggcttatgccctgg 13764015  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  13764014 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 13763942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 23621241 - 23621394
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23621241 ttgagggctcatgccctggaat-gctttgacattcaactgttgagggttcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgtaa 23621339  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23621340 tgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29492561 - 29492450
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29492561 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 29492462  T
Q  143 aatgcttagtca 154  Q
    ||||||||||||    
T  29492461 aatgcttagtca 29492450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12595763 - 12595607
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  12595763 tgttgagggcttatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 12595665  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12595664 aatgccttgtcattcaaattgttggggacttatgccctagaatgcttagtcattcaac 12595607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16829604 - 16829487
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829604 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 16829505  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    | |||||||||| |||||    
T  16829504 attgcttagtcattcaac 16829487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16812582 - 16812467
Alignment:
Q  46 ttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16812582 ttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggat 16812483  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||| |||||    
T  16812482 tgcttagtcattcaac 16812467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13764425 - 13764283
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  13764425 tgttgagggcttatgccctagaat-gatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctgg 13764327  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13764326 aatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 13764283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8522713 - 8522612
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  8522713 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 8522614  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  8522613 tg 8522612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13764347 - 13764231
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13764347 tgttgatggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctgg 13764249  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  13764248 aatgcctggtcgttcaaa 13764231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23352243 - 23352115
Alignment:
Q  48 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23352243 gagggctcatgccttggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 23352145  T
Q  147 cttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  23352144 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 23352115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8522597 - 8522481
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  8522597 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 8522498  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  8522497 aatgcttagtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16804752 - 16804648
Alignment:
Q  57 tgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcac 155  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  16804752 tgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttggggtcttatgccccggattgcttagtcat 16804653  T
Q  156 tcaac 160  Q
    |||||    
T  16804652 tcaac 16804648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13764191 - 13764057
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  13764191 tgttgagggcttatgccctggaat-gatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctgg 13764093  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 138  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13764092 tatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgcc 13764057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13764269 - 13764134
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  13764269 tgttgagggcttatgccctggaat-gcctggtcgttcaaactgccgagggctcatgctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctgg 13764171  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13764170 aatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 13764134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 221747 - 221618
Alignment:
Q  47 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  221747 tgagggatcatgccctggaatgcttcgtcactcaattgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaat 221649  T
Q  146 gcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  221648 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 221618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15539068 - 15538952
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15539068 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgggggcttatgctccgg 15538969  T
Q  143 aatgcttagtcactcaa 159  Q
    || |||| |||| ||||    
T  15538968 aaagctttgtcattcaa 15538952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 23621200 - 23621334
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  23621200 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttttcattcaactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattcaactgttgagggttcatgccctgg 23621298  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  23621299 aatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccc 23621334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24440978 - 24440865
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24440978 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatg-tttatcattgaaattgtt-ggggcttatgccccgga 24440881  T
Q  144 atgcttagtcactcaa 159  Q
    |||| |||||| ||||    
T  24440880 atgcgtagtcattcaa 24440865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13764502 - 13764361
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||  || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||    
T  13764502 gttgagggcttatgccctgtaat-gcctggtcatttaaactgctgagggctcattctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctaga 13764404  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13764403 atgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 13764361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 161
Target Start/End: Original strand, 29848499 - 29848615
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  29848499 gttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaatttttgagggcttatgcctcgaa 29848597  T
Q  144 atgcttagtcactcaaca 161  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  29848598 atgcttagtcattcaaca 29848615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23352243 - 23352132
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaatg 106  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||    
T  23352243 gagggctcatgccttggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 23352145  T
Q  107 ccttgtcattcaa 119  Q
    | | |||||||||    
T  23352144 cttagtcattcaa 23352132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Original strand, 29848499 - 29848573
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29848499 gttgagggcttatgcccttgaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 29848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15539068 - 15538912
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||  |||| ||| |||||| | |    
T  15539068 gttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgggggcttatgctccg 15538970  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| ||||    
T  15538969 gaaagctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgggatgctttgtcattcaa 15538912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8522556 - 8522481
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8522556 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15539072 - 15539004
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15539072 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 15539004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16829604 - 16829541
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16829604 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16829541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Original strand, 23621197 - 23621316
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  23621197 aattgttgagggctcatgccctggaatgctttttcattcaactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattc-aactgttgagggttcatgccc 23621295  T
Q  140 cggaatgcttagtcactcaac 160  Q
     ||||||||| |||| |||||    
T  23621296 tggaatgctttgtcattcaac 23621316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24266762 - 24266659
Alignment:
Q  73 tcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcactcaacacgatggaaat 171  Q
    ||||||||||||| | || | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  24266762 tcattcaaccgttaacggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgcttaagtcattcaacacgttgaaaat 24266664  T
Q  172 ggtgc 176  Q
    |||||    
T  24266663 ggtgc 24266659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21469879 - 21469786
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| | ||||||||    
T  21469879 tgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctggaatgctagtcattcaattggtgagggctcatgccctg 21469786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 23621317 - 23621394
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23621317 tgttgagggcttatgccctgtaa-tgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29265602 - 29265486
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| ||||||| |||    
T  29265602 tgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggcttatgccttgg 29265504  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29265503 aatgccttgtcattcaaa 29265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1639199 - 1639059
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaaccg-ttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| | ||||||    
T  1639199 tgttgagggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactattgagggctcatgccc 1639100  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1639099 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1639059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12389603 - 12389463
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattca-accgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| | ||||||    
T  12389603 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcagactgttgagggctcatgccc 12389504  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || |||||| |  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12389503 tgtgaatgcttaatcattcaaattgttaagggctcatgccc 12389463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29492561 - 29492498
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29492561 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg 29492498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1584358 - 1584259
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1584358 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1584259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15538909 - 15538831
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15538909 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 15538831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Original strand, 13751328 - 13751390
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13751328 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccc 13751390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13764385 - 13764244
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  13764385 tgttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaattgttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 13764288  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||  || |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||    
T  13764287 gaatgt-ttatcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgc 13764244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13764434 - 13764310
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||| ||||||  ||||    
T  13764434 tcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaa-ttgttgatggct 13764337  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  13764336 tatgccctggaatgctttgtcattcaa 13764310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16812582 - 16812521
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16812582 ttgagggctcatgccctggaat-gctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16812521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 2288234 - 2288315
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | |||| |||||    
T  2288234 aaccgttgaaggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaac 2288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 2288277 - 2288393
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||  |||| ||| |||||||| |    
T  2288277 tgttgagggctcaagccctggaa-tgccttgtcattcaactattgagggttcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 2288375  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    |||||| | |||||||||    
T  2288376 gaatgcttagtcattcaa 2288393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 13751332 - 13751472
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc--aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||| | ||||||    
T  13751332 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaaattgttgagggctcatgccc 13751431  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || |||| |    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13751432 tgtgaatactagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 13751472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 15686505 - 15686584
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15686505 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 15686584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 29848495 - 29848561
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  29848495 aaccgttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatg 29848561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Original strand, 9185938 - 9186035
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  9185938 ttgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaattgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctg 9186035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13764200 - 13764076
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | |||||||||| ||  || |||||||| ||||||  ||||    
T  13764200 tcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgt-ttatcattcaa-ttgttgatggct 13764103  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||    
T  13764102 tatgccctggtatgctttgtcattcaa 13764076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15538949 - 15538832
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| ||| |||||||||    
T  15538949 tgttgagggctcatgccctggga-tgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccct 15538851  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  15538850 ggaatgcttagtcattcaa 15538832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 221747 - 221675
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||| | |||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  221747 tgagggatcatgccctggaat-gcttcgtcactcaattgttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 221675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 15686424 - 15686492
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15686424 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aacagttgagggcttatgccctggaatgct 15686492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25807001 - 25806861
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||    
T  25807001 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 25806902  T
Q  100 tg-gaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  25806901 tgtgaatgc-tagtccattcaaattgttgaaggcttatgccc 25806861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8522713 - 8522652
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8522713 gttgagggctcatgccctggaatg--ctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatg 8522652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16812545 - 16812466
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  16812545 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggattgcttagtcattcaacc 16812466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22346743 - 22346692
Alignment:
Q  11 ggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22346743 ggctcatgccctggaac-gccttgtcattcaattggtgagggctcatgccctg 22346692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16804737 - 16804702
Alignment:
Q  33 tgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16804737 tgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 16804702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 17027230 - 17027269
Alignment:
Q  29 gccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17027230 gccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctggaatg 17027269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25772770 - 25772710
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25772770 tgagggctcatgccctggaac-gctttgtcgttcaattggtgagggctcattccctggaatg 25772710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8522717 - 8522651
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  8522717 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgc 8522651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16804726 - 16804647
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  16804726 tgttgagggctcatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttggggtcttatgccccggattgcttagtcattcaacc 16804647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24266765 - 24266717
Alignment:
Q  32 ttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24266765 ttgtcattcaaccgttaacggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 24266717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 148
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  307 tgttgagggcttatgccctgggat-gccttgtcatccaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggatcatgccctgg 209  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  208 aatgtcttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 230
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||    
T  346 tgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctgggatgccttgtca-tccaactgttgagggctcatgccctgg 248  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  247 aatgctttgtcattcaac 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 231
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||  |  |||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  346 tgttgagggctcatgccctagaat-gctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctgggatgccttgtcatccaactgttgagggctcatgccctgg 248  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| |||||||||||    
T  247 aatgctttgtcattcaa 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32894 - 32745
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  32894 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 32796  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32795 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32972 - 32838
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32972 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 32874  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  32873 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccc 32838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 81918 - 82067
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  81918 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 82016  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 154  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82017 aatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 82067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 81840 - 81974
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  81840 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctgga 81938  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  81939 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccc 81974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 7)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2202 - 2061
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2202 gttgagggcttatgccctggaat-gctttatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccgttgagggattatgccctaga 2104  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2103 atgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2278 - 2140
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2278 tgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 2180  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    || || ||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||    
T  2179 gctttatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaat 2140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2124 - 2049
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2124 gttgagggattatgccctagaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 2049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1994
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  2084 gttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2318 - 2244
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2318 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2318 - 2217
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  2318 tgagggctcatgccctggaat-gccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 2220  T
Q  104 atg 106  Q
    |||    
T  2219 atg 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2278 - 2217
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2278 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 9)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21039 - 20895
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  21039 tgttgagggtttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggttcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgaggatttatgccctg 20941  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20940 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgc 20895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20960 - 20788
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||    
T  20960 tgttgaggatttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccct 20862  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20861 ggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21076 - 20975
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  21076 tgttgaggg-tcatgccctggaatgttaatcatttaactgttgagggtttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggttcatgccctgga 20978  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  20977 atg 20975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35577
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||  | |||||| ||| |||||||||    
T  35691 tgagggctcatgtcctggaat-gccttgtcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctaatttatccaattggtgagggcttacgccctggaa 35593  T
Q  105 tgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||    
T  35592 tgccttgtcattcaaa 35577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24026 - 23941
Alignment:
Q  55 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24026 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 23941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23957 - 23866
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23957 gttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 23866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23996 - 23934
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  23996 ttgagggcttatgccctagaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatg 23934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23958 - 23880
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  23958 tgttgagggctcatgccctagaat-gccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaac 23880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24863 - 24808
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  24863 tgagggctcatgccctggaac-gccttgttgttcaattggtgagggctcatgccctg 24808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 13986 - 14146
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  13986 gttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctg 14084  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14085 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 14146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 13982 - 14050
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13982 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgc 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 14025 - 14142
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  14025 tgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccct 14123  T
Q  101 ggaatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  14124 ggaatgcttagtcattcaa 14142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 14065 - 14143
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14065 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 14143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 137714 - 137562
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||     
T  137714 tgagggcttattccctggaat-gctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaacagttgagggcttatgccctagaac 137616  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  137615 gccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 137562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 137638 - 137468
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  137638 gttgagggcttatgccctagaac-gccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 137540  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  137539 gaatga-tcattattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 137468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 137754 - 137680
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  137754 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttattccctggaatgctttgtcattcaa 137680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Original strand, 81269 - 81323
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  81269 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 81323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4472 - 4313
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  4472 tgttgcgggcttatgccctgggat-gccttgtcatccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 4374  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4373 aatgccttgtcattcaaattgttgagggcttgtgccctggaatgcttagtcattcaacacg 4313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4548 - 4395
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  4548 ttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccctggga 4450  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||| || || | ||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  4449 tgccttgtca-tccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaac 4395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4369
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |  |||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  4511 tgttgagggcttatgccctggaa-tgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccctgggatgccttgtcatccaactattgagggctaatgccctgg 4413  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  4412 aatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgc 4369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 59319 - 59151
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  59319 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcacctgttgagggctcatgctctggaatgttttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 59221  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  59220 aatg--ttatcattaaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 59151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 59397 - 59283
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  59397 gttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctgg 59299  T
Q  103 aatgccttgtcattca 118  Q
    ||||| ||||||||||    
T  59298 aatgctttgtcattca 59283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 205343 - 205483
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | ||||||    
T  205343 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgtttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 205442  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  205443 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 205483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 59356 - 59217
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |||| ||||||    
T  59356 ttgagggctcatgctctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcacctgttgagggctcatgctctggaa 59258  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    ||  ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  59257 tgttttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 59217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 59401 - 59320
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| | ||||||||| |||| |||||    
T  59401 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaac 59320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 384179 - 384090
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  384179 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 384090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 10)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 12508 - 12650
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||     
T  12508 gttgagggcttatgccttggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctga 12606  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  12607 aatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 12650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 13152 - 13296
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13152 tgagggcttatgccctgaaat-gctttgtcattcatctgttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaat 13250  T
Q  106 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 152  Q
    |  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13251 gt-ttatcattcaaattgtttggggcttatgccccagaatgcttagt 13296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 12586 - 12689
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12586 tgttgagggcttatgccctgaaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctgg 12684  T
Q  103 aatgc 107  Q
    |||||    
T  12685 aatgc 12689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 13109 - 13251
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  13109 tgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtcattcaaaccgctgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcatctgttgacggcttatgccctg 13207  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13208 gaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatg 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 13188 - 13263
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13188 tgttgacggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 13263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 13071 - 13226
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||| |||||| ||||||||||     
T  13071 ttgagggcttatgccctggaa-tgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgctgagggcttatgccctga 13169  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  13170 aatgctttgtcattc-atctgttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 12504 - 12571
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  12504 aaccgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 12571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 13066 - 13134
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13066 aaccattgagggcttatgccctggaatgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgc 13134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13094
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||    
T  13030 gttgagggcttatgccttggatagccttgtcattcaaaccattgagggcttatgccctggaatgc 13094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Original strand, 124965 - 125009
Alignment:
Q  95 tgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  124965 tgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 125009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 160
Target Start/End: Original strand, 134263 - 134380
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134263 gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 134362  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| |||||    
T  134363 aatgcttagtcattcaac 134380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 134263 - 134326
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  134263 gttgagggctcatgccctggaa-tgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatg 134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 40174 - 40316
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  40174 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttactccctgg 40272  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||    
T  40273 aatgccttgtcattcaaactgttaagggctcatgccctggaatg 40316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Original strand, 40137 - 40250
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40137 ttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaa 40235  T
Q  105 tgccttgtcattcaa 119  Q
    ||| |||||||||||    
T  40236 tgctttgtcattcaa 40250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 160
Target Start/End: Original strand, 40137 - 40251
Alignment:
Q  46 ttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  40137 ttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaa 40235  T
Q  145 tgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||| |||| |||||    
T  40236 tgctttgtcattcaac 40251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 40213 - 40388
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||  |  |||||||| | ||| |||| | ||||||||    
T  40213 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttactccctggaatgccttgtcattcaaactgttaagggctcatgccctg 40311  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgctac 179  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  |||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  40312 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttaaggcccagaatgttatgtcattcaacacgttgaaaatggtactac 40388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 3943 - 4084
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  3943 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccatgga 4041  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  4042 atgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatg 4084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 3983 - 4153
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaa-ccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  3983 gttgagggctcatgccctggaatgt--ttatcattcaattgttgagggcttatgccatggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctgg 4080  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  4081 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 4153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 4020 - 4096
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4020 tgttgagggcttatgccatggaat-gccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 4096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 3939 - 4006
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  3939 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatg 4006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50852 - 50684
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  50852 tgttgagggctcatgcccttgaat-gccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctg 50754  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatg 172  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  50753 gaatgt-ttatcattcaaattgtttggggcttatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatg 50684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 51010 - 50939
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51010 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 50939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 50973 - 50875
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc--aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50973 tgttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattttaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttatcgttcaatcgttgagggcttatgccctg 50875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50900 - 50774
Alignment:
Q  38 ttcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 133  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  50900 ttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctt 50801  T
Q  134 atgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||    
T  50800 atgccctagaatgctttgtcattcaac 50774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 34876 - 35011
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34876 tgttgagggcttatgccctggaat-gctttgtcattcaacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggattatgccctag 34974  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34975 aatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 35011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 34916 - 35074
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |    
T  34916 gttgagggtttatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggattatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctag 35014  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35015 aatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacg 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 34954 - 35030
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34954 tgttgagggattatgccctagaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaa 35030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 1804 - 1945
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  1804 tgttgagggcttatgcgttggaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcataccctagaatgttaatcattcaactgttgaggactgatgccctgg 1902  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  1903 aatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaat 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2013
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | ||||| || | ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  1873 tcattcaactgttgaggactgatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggggct 1971  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1972 tacaccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 1882 - 1958
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1882 tgttgaggactgatgccctggaat-gccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatatttatcattcaa 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Original strand, 6088 - 6190
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  6088 tgttgagggctcatgccctggaatgttaagcattcaaccgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 6187  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  6188 atg 6190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 6127 - 6242
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctgg 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| ||| |||||||| ||    
T  6127 gttgagggcttatgccctagaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatctttcaaattgttgggggcttatgccccgg 6225  T
Q  103 aatgccttgtcattcaa 119  Q
    ||||| | |||||||||    
T  6226 aatgcttagtcattcaa 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Original strand, 6118 - 6243
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 133  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||    
T  6118 cattcaaccgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatctttcaaattgttgggggctt 6216  T
Q  134 atgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6217 atgccccggaatgcttagtcattcaac 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2931 - 2830
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||    
T  2931 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 2832  T
Q  145 tg 146  Q
    ||    
T  2831 tg 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2903 - 2777
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | |||||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||    
T  2903 tcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttaggggct 2805  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2804 tatgccgcggaatgcttagtcattcaac 2777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2894 - 2818
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2894 tgttgagggcttatgccctggaa-tgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2276 - 2173
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  2276 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 2177  T
Q  143 aatg 146  Q
    ||||    
T  2176 aatg 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9120 - 9017
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  9120 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 9021  T
Q  143 aatg 146  Q
    ||||    
T  9020 aatg 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2276 - 2106
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  2276 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 2178  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  2177 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9120 - 8950
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  9120 tgttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 9022  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  9021 gaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 8950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5825 - 5685
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  5825 tcattcaattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcatttaaattgttgggggct 5727  T
Q  133 tatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  5726 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 5685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5854 - 5752
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5854 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 5755  T
Q  144 atg 146  Q
    |||    
T  5754 atg 5752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5812 - 5700
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatca-ttcaaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||    
T  5812 gagggcttatgccctggaa-tgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcatttaaattgttgggggcttatgccccggaat 5714  T
Q  106 gccttgtcattcaa 119  Q
    || | |||||||||    
T  5713 gcttagtcattcaa 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1417
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1505 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggct 1417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1466 - 1414
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1466 gttgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaaattgttgagggctcat 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1443
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  1505 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1442
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  1509 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1617 - 1503
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  1617 gttgagggctcatgccctggaat-gccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaattgctgggggcttatgccctgga 1519  T
Q  104 atgccttgtcattcaa 119  Q
    |||| | |||||||||    
T  1518 atgcttagtcattcaa 1503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1488
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaatt-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  1657 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 1559  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  |  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1558 gaatgt-tcatcattcaa-ttgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1661 - 1593
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||    
T  1661 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgc 1593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 8961 - 9112
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||| | |||||||||||    
T  8961 tgagggcttatgccctggaat-gcctt-tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgaaaatcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaa 9058  T
Q  105 tgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  9059 tgt-tcatcattcaaattgttgggggcttaagccccggaaagctcagtcattcaa 9112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 147
Target Start/End: Original strand, 8841 - 8983
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaac-cgttgagggattatgccctgga 103  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  |  || |||||  || |||||| | |||||||| |    
T  8841 tgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctgaa 8939  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 147  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  8940 atgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaatgc 8983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 10013 - 10102
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10013 tcattcaattggtgagggctcattccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgggggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 10102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Original strand, 8921 - 9021
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggattatgccctggaa 104  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    |||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  8921 tgagggctcatgccctgaaat-gctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcctttcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 9019  T
Q  105 tg 106  Q
    ||    
T  9020 tg 9021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 139
Target Start/End: Original strand, 165629 - 165714
Alignment:
Q  54 tcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  165629 tcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 165657 - 165714
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc-aattgttgagggctcatgccc 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  165657 tgttgagggcttatgccctggaa-tgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10724 - 10554
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccg-ttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| |  ||||||| | ||||||||    
T  10724 tgttgagggcttatgccctagaataccct-gtcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctg 10626  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  10625 gaatgt-ttatcattcaaattattgggggcttatgccccggaatgcttactcattcaacacgttgaaaatggt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 176
Target Start/End: Original strand, 223630 - 223759
Alignment:
Q  47 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  223630 tgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgaggggttatgccatggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttgtgtcccagaat 223728  T
Q  146 gcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  223729 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 223759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 223630 - 223702
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  223630 tgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaattgttgaggggttatgccatggaatgtttatcattcaa 223702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6836 - 6709
Alignment:
Q  47 tgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 145  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6836 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 6738  T
Q  146 gcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  6737 gcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6836 - 6725
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctggaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| |||||    
T  6836 tgagggcttatgccctggaat-gccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 6738  T
Q  106 gccttgtcattca 118  Q
    || | ||||||||    
T  6737 gcttagtcattca 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6918 - 6776
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaa--ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || |||||| ||||||||||    
T  6918 tgagggctcatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggcttatgccctg 6820  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 146  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  6819 gaatgccttgtcattc-aactgttgagggctcatgcccaggaatg 6776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9735 - 9618
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  |    
T  9735 tgttgacggctcatgccctggaatgctttgtcattaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgcccttg 9636  T
Q  143 aatgcttagtcactcaac 160  Q
     |||||| |||| |||||    
T  9635 tatgctttgtcattcaac 9618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9608 - 9546
Alignment:
Q  114 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  9608 attcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcctagtcattcaacacattggaaatggtgc 9546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9735 - 9619
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| | |||||||     
T  9735 tgttgacggctcatgccctggaat-gctttgtcattaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctt 9637  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaa 119  Q
    | |||| |||||||||||    
T  9636 gtatgctttgtcattcaa 9619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14027 - 13898
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14027 tgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggg-cttatgccccga 13930  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  13929 aatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 13898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14027 - 13952
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14027 tgttgagggctcatgccttggaat-gcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatatttatcattcaa 13952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14143 - 13989
Alignment:
Q  11 ggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggattatgccctg-gaatg 106  Q
    |||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  14143 ggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaattgttgagggcttatgccctgtgaatggtagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatg 14044  T
Q  107 ccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    | ||  | ||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||| |||||    
T  14043 ctttaactattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaac 13989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12022 - 11893
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12022 tgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggg-cttatgccccga 11925  T
Q  143 aatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  11924 aatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 11893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12022 - 11947
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12022 tgttgagggctcatgccttggaat-gcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatatttatcattcaa 11947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12138 - 11984
Alignment:
Q  11 ggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggattatgccctg-gaatg 106  Q
    |||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  12138 ggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaattgttgagggcttatgccctgtgaatggtagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatg 12039  T
Q  107 ccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    | ||  | ||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||| |||||    
T  12038 ctttaactattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaac 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7187 - 7048
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccct 100  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||    
T  7187 tgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccct 7088  T
Q  101 g-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    | ||||||  | | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7087 gtgaatgctattttatttaaattgttgagggcttatgccc 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 1125
Alignment:
Q  55 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1210 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1050
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1141 gttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaacttttgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1180 - 1118
Alignment:
Q  6 ttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1180 ttgagggcttatgccctagaat-gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatg 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 1064
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1142 tgttgagggctcatgccctagaat-gccttgtcattcaaacttttgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaac 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2047 - 1992
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2047 tgagggctcatgccctggaac-gccttgttgttcaattggtgagggctcatgccctg 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10466
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaac 160  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10546 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10542 - 10466
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 81  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10542 gttgagggctcatgccctggaat-gctttgtcattcaactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 207 - 128
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacg 163  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  207 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 172
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  208 tgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 29323 - 29459
Alignment:
Q  8 gagggcttatgccctg-gaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg- 101  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||||     
T  29323 gagggcttatgccctatgaatt-ccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgt 29421  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29422 gaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 29459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 34594 - 34475
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  34594 tgttgagggctcatgccctggaaca-ccttgtcatttaattgttgagggcttatgccctgtgactgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccc 34496  T
Q  100 tggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  34495 tggaatgctttgtcattcaaa 34475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29356 - 29298
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  29356 tgttgagggctcatgccctggaac-gccttgtcgttcaattgttgaggggttatgccctg 29298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 92723 - 92840
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaa--ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || || ||| | ||||||||    
T  92723 tgagggcttatgccctggaa-cgccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgtgggctcatgccctg 92821  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||||||||||||||    
T  92822 gaatgccttgtcattcaaa 92840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20818 - 20683
Alignment:
Q  9 agggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctg-ga 103  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| | || ||||| ||    
T  20818 agggcttatgccttgtgaatgcctcgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcattccctgcga 20719  T
Q  104 atgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20718 atgctatttcattcaaattgttgagggcttatgccc 20683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 112
Alignment:
Q  79 aaccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  174 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccc 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 30
Alignment:
Q  5 gttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattc--aattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||| | ||||||    
T  170 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaaattgttgagggctcatgccc 71  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || |||| |    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  70 tgtgaatactagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 177998 - 177909
Alignment:
Q  35 tcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  177998 tcattcaattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 177909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 120082 - 120021
Alignment:
Q  113 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggt 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  120082 cattcaaattgttgggggctcatgccccagaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 120021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 120174 - 120142
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  120174 cattcaattgttgggggctcatgccctggaatg 120142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 524768 - 524714
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  524768 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 524714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3093 - 3036
Alignment:
Q  83 gttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3093 gttgaggggttatgccctgtgaatgccttgtccttcaaattgttgagggctcatgccc 3036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3094 - 3035
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccct 62  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3094 tgttgaggggttatgccctgtgaatgccttgtccttcaaattgttgagggctcatgccct 3035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6690 - 6554
Alignment:
Q  9 agggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa--ttgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggattatgccctg-g 102  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |    
T  6690 agggcttatgccccgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtg 6591  T
Q  103 aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    ||||     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6590 aatgttagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 6554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 6653 - 6584
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctg-gaatgtta 71  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6653 tgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgtta 6584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6696 - 6615
Alignment:
Q  81 ccgttgagggattatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcactcaa 159  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  6696 ccgttaagggcttatgccccgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 100
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2869
Alignment:
Q  41 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggattatgccct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  2808 aattgttgagggctcatgccctggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccct 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 1528 - 1668
Alignment:
Q  4 tgttgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaat-tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccc 99  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||    
T  1528 tgttgagggcttgtgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggatcatgccttgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 1627  T
Q  100 tg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1628 tgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 8455 - 8510
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg 63  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8455 tgagggcttatgccctagaac-gccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctg 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Original strand, 3666 - 3720
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  3666 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagagcttatgccc 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21404 - 21233
Alignment:
Q  7 tgagggcttatgccctggaattgccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaa--ccgttgagggattatgccctg 101  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  |||||  |||| | |||||  |||  ||||| | |||||||     
T  21404 tgagggctcatgccctggaat-gccttgtcgttcaattggtgagggcttatgccgtatgaatgctttaacctttcaaatccgg-gagggctcatgcccta 21307  T
Q  102 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcactcaacacgatggaaatggtgc 176  Q
    |||||| || |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  21306 gaatgctttttcattcaact-gttgagggcttatgcctcggaatgcttagttattcaacacgttaaaaatggtgc 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 21848 - 21927
Alignment:
Q  45 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21848 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 21927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19413 - 19374
Alignment:
Q  29 gccttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatg 68  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19413 gccttgtcgttcaattggtgagggctcatgccctggaatg 19374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20810 - 20775
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20810 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 20775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17929
Alignment:
Q  85 tgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 139  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  17983 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8660 - 8572
Alignment:
Q  36 cattcaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggattatgccctggaatgccttgtcattcaaa 120  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8660 cattcaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaa 8572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 80
Target Start/End: Original strand, 15732 - 15768
Alignment:
Q  44 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15732 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University