View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6866A_low_243 (Length: 247)

Name: NF6866A_low_243
Description: NF6866A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6866A_low_243
NF6866A_low_243
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (13-229)||(21382093-21382309)
chr8 (13-229)||(21098794-21099009)
chr8 (13-229)||(21104115-21104330)
chr8 (13-229)||(23911441-23911655)
chr8 (13-229)||(8314467-8314683)
chr8 (13-229)||(8322846-8323062)
chr8 (20-229)||(21843524-21843733)
chr8 (20-229)||(20038981-20039189)
chr8 (20-229)||(21939996-21940206)
chr8 (21-229)||(17620755-17620961)
chr8 (20-229)||(16418620-16418830)
chr8 (21-229)||(23454945-23455154)
chr8 (49-229)||(24034049-24034230)
chr8 (21-218)||(14352181-14352378)
chr8 (39-229)||(21538573-21538765)
chr8 (117-229)||(20712537-20712649)
chr8 (173-229)||(11346953-11347009)
chr8 (173-229)||(19767684-19767740)
chr8 (173-229)||(22370102-22370158)
chr8 (178-229)||(20002279-20002330)
chr8 (173-229)||(22033555-22033611)
chr8 (173-229)||(22099655-22099711)
chr8 (173-229)||(22102552-22102608)
chr8 (178-229)||(21831181-21831232)
chr8 (20-89)||(20712470-20712539)
chr8 (178-229)||(22817755-22817806)
chr8 (180-228)||(18572977-18573025)
chr8 (186-228)||(19902174-19902216)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (13-229)||(123369-123584)
scaffold0029 (186-228)||(77391-77433)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (13-229)||(9582893-9583108)
chr7 (13-229)||(16119849-16120064)
chr7 (13-225)||(23515067-23515278)
chr7 (13-229)||(14551098-14551314)
chr7 (13-229)||(8717865-8718080)
chr7 (13-229)||(13673856-13674071)
chr7 (13-229)||(18593352-18593567)
chr7 (13-229)||(18618117-18618332)
chr7 (20-229)||(4312564-4312772)
chr7 (20-229)||(538755-538964)
chr7 (20-229)||(12567020-12567229)
chr7 (21-229)||(12548805-12549012)
chr7 (20-229)||(8780936-8781146)
chr7 (20-227)||(9003958-9004165)
chr7 (20-229)||(20108375-20108584)
chr7 (21-228)||(48801777-48801983)
chr7 (23-229)||(9264939-9265145)
chr7 (20-229)||(13657873-13658081)
chr7 (20-229)||(11921307-11921512)
chr7 (20-229)||(16532100-16532311)
chr7 (20-229)||(16633351-16633562)
chr7 (166-229)||(16465616-16465679)
chr7 (173-229)||(825783-825839)
chr7 (173-229)||(4461242-4461298)
chr7 (173-229)||(14221718-14221774)
chr7 (173-229)||(15916776-15916832)
chr7 (173-229)||(18287761-18287817)
chr7 (173-229)||(27291496-27291552)
chr7 (166-229)||(15206584-15206647)
chr7 (171-229)||(5397273-5397331)
chr7 (180-229)||(15065935-15065984)
chr7 (176-229)||(9194544-9194597)
chr7 (173-225)||(6713072-6713124)
chr7 (173-228)||(4791383-4791438)
chr7 (173-228)||(15348532-15348587)
chr7 (173-213)||(15522517-15522557)
chr7 (186-228)||(15940731-15940773)
chr7 (20-98)||(16465743-16465821)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (13-229)||(15699555-15699770)
chr6 (13-229)||(22165549-22165764)
chr6 (13-229)||(22243812-22244027)
chr6 (13-229)||(22061503-22061718)
chr6 (20-229)||(24855245-24855453)
chr6 (13-229)||(22767116-22767331)
chr6 (13-229)||(20170242-20170458)
chr6 (20-229)||(18448140-18448349)
chr6 (20-229)||(23023093-23023302)
chr6 (20-229)||(25625691-25625899)
chr6 (23-229)||(2181063-2181269)
chr6 (20-225)||(20107784-20107989)
chr6 (28-229)||(18854026-18854226)
chr6 (20-229)||(21560554-21560762)
chr6 (20-229)||(25631269-25631477)
chr6 (21-229)||(29595697-29595904)
chr6 (20-229)||(25963248-25963457)
chr6 (20-229)||(25967895-25968104)
chr6 (25-229)||(30671807-30672011)
chr6 (14-117)||(20016339-20016443)
chr6 (20-139)||(19585631-19585750)
chr6 (166-229)||(18184874-18184937)
chr6 (172-229)||(35270971-35271028)
chr6 (166-229)||(18731868-18731931)
chr6 (166-229)||(20218981-20219044)
chr6 (166-229)||(22113006-22113069)
chr6 (173-229)||(11204004-11204060)
chr6 (173-225)||(23517835-23517887)
chr6 (173-229)||(29686601-29686657)
chr6 (20-60)||(29686449-29686489)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (13-229)||(11496614-11496829)
chr4 (13-229)||(13822913-13823128)
chr4 (19-229)||(42709731-42709940)
chr4 (14-229)||(15254349-15254563)
chr4 (21-229)||(10630758-10630965)
chr4 (20-229)||(3354646-3354855)
chr4 (21-229)||(18291945-18292153)
chr4 (21-229)||(17484910-17485118)
chr4 (20-229)||(18081459-18081669)
chr4 (20-229)||(45234232-45234441)
chr4 (21-229)||(38426745-38426938)
chr4 (21-229)||(56580539-56580748)
chr4 (23-98)||(8092559-8092634)
chr4 (166-229)||(14653998-14654061)
chr4 (173-227)||(15865647-15865701)
chr4 (173-229)||(10650547-10650603)
chr4 (173-229)||(15260109-15260165)
chr4 (173-229)||(16682913-16682969)
chr4 (178-229)||(15409534-15409585)
chr4 (173-229)||(9488878-9488934)
chr4 (169-229)||(8092427-8092487)
chr4 (180-228)||(17296250-17296298)
chr4 (20-60)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (13-229)||(10602472-10602687)
chr3 (13-229)||(13504881-13505096)
chr3 (13-229)||(11947407-11947622)
chr3 (13-229)||(16448760-16448975)
chr3 (13-229)||(7600355-7600570)
chr3 (13-229)||(9360971-9361186)
chr3 (13-229)||(15556942-15557157)
chr3 (13-229)||(16373565-16373780)
chr3 (13-229)||(12187076-12187291)
chr3 (13-229)||(37942378-37942593)
chr3 (21-228)||(12193491-12193697)
chr3 (13-225)||(6814868-6815079)
chr3 (13-229)||(10147011-10147226)
chr3 (13-229)||(15645001-15645216)
chr3 (13-229)||(10160173-10160388)
chr3 (13-228)||(13187418-13187632)
chr3 (21-228)||(3245589-3245795)
chr3 (21-229)||(2721305-2721511)
chr3 (20-229)||(13097711-13097919)
chr3 (20-229)||(4382751-4382961)
chr3 (21-229)||(13001425-13001634)
chr3 (20-229)||(10546936-10547148)
chr3 (20-229)||(20156515-20156722)
chr3 (20-229)||(1992803-1993011)
chr3 (20-229)||(13690608-13690816)
chr3 (20-229)||(11398215-11398424)
chr3 (20-229)||(14348588-14348797)
chr3 (23-229)||(22637702-22637908)
chr3 (21-229)||(3279191-3279399)
chr3 (23-229)||(17387839-17388045)
chr3 (20-229)||(12160207-12160416)
chr3 (13-111)||(16655798-16655897)
chr3 (173-229)||(27356728-27356784)
chr3 (172-229)||(13601220-13601277)
chr3 (173-229)||(3339226-3339282)
chr3 (173-229)||(12776534-12776590)
chr3 (173-229)||(13136210-13136266)
chr3 (173-229)||(20584262-20584318)
chr3 (178-229)||(15946773-15946824)
chr3 (166-221)||(17045847-17045902)
chr3 (166-221)||(17048007-17048062)
chr3 (171-229)||(14445768-14445826)
chr3 (173-229)||(15619283-15619339)
chr3 (173-229)||(13195458-13195514)
chr3 (174-229)||(8686387-8686442)
chr3 (166-229)||(20225754-20225817)
chr3 (178-229)||(13068306-13068357)
chr3 (198-229)||(2005499-2005530)
chr3 (13-60)||(13601062-13601108)
chr3 (173-229)||(16703307-16703363)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (13-229)||(22665062-22665277)
chr2 (13-229)||(117543-117758)
chr2 (13-229)||(22044660-22044875)
chr2 (13-229)||(25357511-25357726)
chr2 (13-229)||(16775651-16775866)
chr2 (20-229)||(11615-11823)
chr2 (13-229)||(24795285-24795500)
chr2 (13-229)||(17590407-17590622)
chr2 (13-229)||(27627580-27627796)
chr2 (20-229)||(25144757-25144966)
chr2 (21-229)||(5500265-5500473)
chr2 (20-229)||(25804267-25804475)
chr2 (22-224)||(25370890-25371091)
chr2 (21-229)||(23798922-23799129)
chr2 (20-229)||(23643950-23644160)
chr2 (20-103)||(24502168-24502251)
chr2 (74-229)||(24178193-24178348)
chr2 (173-229)||(23159385-23159441)
chr2 (173-229)||(23570642-23570698)
chr2 (173-229)||(27631655-27631711)
chr2 (173-229)||(27768816-27768872)
chr2 (178-229)||(24171510-24171561)
chr2 (166-229)||(24506802-24506865)
chr2 (173-229)||(23257570-23257625)
chr2 (173-225)||(24321328-24321380)
chr2 (166-229)||(25337651-25337714)
chr2 (168-210)||(23648123-23648165)
chr2 (183-228)||(29955868-29955913)
chr2 (184-228)||(19805618-19805662)
chr2 (180-228)||(21512567-21512615)
chr2 (173-228)||(24019068-24019123)
chr2 (186-228)||(17334606-17334648)
chr2 (20-101)||(27631506-27631585)
chr2 (20-60)||(15532753-15532792)
chr2 (20-60)||(24019228-24019267)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (13-229)||(20595831-20596046)
chr5 (13-229)||(20602117-20602332)
chr5 (13-229)||(20608408-20608623)
chr5 (13-229)||(15735534-15735749)
chr5 (13-204)||(23710701-23710892)
chr5 (13-229)||(23748051-23748266)
chr5 (20-229)||(24940540-24940749)
chr5 (13-229)||(18072900-18073115)
chr5 (13-229)||(24953174-24953389)
chr5 (21-211)||(20622170-20622359)
chr5 (13-229)||(20790714-20790929)
chr5 (20-229)||(23600636-23600845)
chr5 (20-229)||(24219752-24219961)
chr5 (20-225)||(20444843-20445048)
chr5 (34-229)||(21387410-21387605)
chr5 (24-229)||(20916456-20916660)
chr5 (20-98)||(22948518-22948596)
chr5 (21-141)||(20575510-20575630)
chr5 (173-229)||(22317513-22317569)
chr5 (173-229)||(25006808-25006864)
chr5 (173-229)||(30759655-30759711)
chr5 (166-229)||(18484212-18484275)
chr5 (179-229)||(25116171-25116221)
chr5 (173-229)||(26847803-26847859)
chr5 (184-229)||(25175261-25175306)
chr5 (173-225)||(22855723-22855775)
chr5 (184-228)||(27270563-27270607)
chr5 (180-228)||(17412736-17412784)
chr5 (20-101)||(22317639-22317719)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (13-229)||(27046874-27047089)
chr1 (13-229)||(17094601-17094816)
chr1 (13-229)||(21798662-21798878)
chr1 (13-229)||(20237456-20237671)
chr1 (23-225)||(8653126-8653327)
chr1 (20-229)||(52938621-52938830)
chr1 (20-229)||(3989944-3990154)
chr1 (27-229)||(19364043-19364244)
chr1 (141-229)||(14070632-14070720)
chr1 (171-225)||(19875648-19875702)
chr1 (166-229)||(21784472-21784535)
chr1 (166-229)||(4027832-4027895)
chr1 (173-226)||(16382578-16382631)
chr1 (166-229)||(8947515-8947578)
chr1 (21-101)||(21784598-21784677)
chr1 (186-228)||(18478234-18478276)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-229)||(15678-15893)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (13-229)||(1038-1253)
scaffold0404 (166-229)||(3461-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-229)||(615-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (20-229)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (23-229)||(2852-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (20-229)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (28-229)||(11064-11264)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (20-229)||(2287-2496)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (21-229)||(14662-14869)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-229)||(831-1041)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (20-229)||(7941-8149)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-229)||(120954-121162)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (23-229)||(482-687)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (70-229)||(164403-164562)
scaffold0011 (166-228)||(172254-172316)
scaffold0011 (166-229)||(161995-162058)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (20-229)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (20-229)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (20-229)||(97726-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (20-229)||(510-718)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (110-229)||(10206-10325)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-229)||(13002-13207)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (110-229)||(8750-8869)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (23-229)||(35104-35307)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (20-229)||(5090-5295)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (67-227)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (67-227)||(232789-232948)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (165-229)||(38508-38572)
scaffold0096 (48-92)||(38631-38675)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (166-229)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (166-229)||(50506-50569)
scaffold0035 (186-228)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (171-229)||(912-970)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (173-229)||(2762-2818)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (20-87)||(2859-2926)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (178-229)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (166-225)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (173-229)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (173-229)||(54849-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (166-229)||(1839-1902)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (166-229)||(37743-37806)
scaffold0116 (21-101)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (173-228)||(1193-1248)
scaffold0094 (20-60)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (166-229)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (166-229)||(45228-45291)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (171-225)||(37868-37922)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (179-229)||(72572-72622)
scaffold0037 (179-229)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (184-229)||(18218-18263)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (173-213)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (186-226)||(3251-3291)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (20-60)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21098811  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  21098810 tgtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21104132  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  21104131 tgtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaa-ttgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 23911638  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  23911639 tatgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 8322864  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || || ||||||||||||    
T  8322863 gtatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 21843535  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  21843534 ggagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
     |||||||||   ||| || |||| ||||| ||||     ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaat-gtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 20038991  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  20038990 gagtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgg 21940008  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  21940007 gggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||    ||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggg 17620952  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  17620953 agtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgg 16418632  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  16418631 gggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  121 gagacatgtgcttt-aattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-ggg 218  Q
    |||||||    ||| ||||| ||||||||| ||  |    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23455045 gagacataaattttcaattg-aattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23455143  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  23455144 ggagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034230
Alignment:
Q  49 ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaaattgtc 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaa-ttgtc 24034147  T
Q  148 atttgata-taactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |  || |  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034148 atatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||| ||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataac-tgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||| | || || | ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 229
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538765
Alignment:
Q  39 aacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  | ||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  137 ttgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| ||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538673 ttgaa-ttgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgtta-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 215  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgatt-aaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgt 20712635  T
Q  216 gggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||    
T  20712636 aggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 89  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 123567  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  123568 tgtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 9583091  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  9583092 tgtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16119866  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  16119865 tgtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 23515265  T
Q  213 tgtgggggagttt 225  Q
    |||||||||||||    
T  23515266 tgtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa-ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaa-ttgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 14551296  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14551297 gtgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8718063  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  8718064 tgtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13674054  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  13674055 tatgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18593369  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  18593368 tatgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18618315  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  18618316 tatgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattg-aattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 4312762  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  4312763 gagtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 538766  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  538765 ggagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||  | || || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggg 12567218  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  12567219 ggagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgat-ataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12548912 gagacatgt-atttaatt-aaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggg 12548815  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  12548814 gagtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  120 ggagacat--gtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||  ||  |||||||| ||||||||| || ||    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattg-aattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 8780948  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  8780947 gggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaa-ttgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggg 9004156  T
Q  219 ggagtttga 227  Q
    |||||||||    
T  9004157 ggagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattg-aattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtggg 20108573  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  20108574 ggagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataa-ct--gttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||| | ||| |||| |||||||||   |||||| ||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattg-aattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgg 48801788  T
Q  218 gggagtttgat 228  Q
    |||||||||||    
T  48801787 gggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  123 gacatgtg-ctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||  |  ||| |||| ||||||||| || ||    || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattg-aattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 9264947  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  9264946 gtttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    ||    ||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13658071  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  13658072 gagtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||   || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaat-gtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 11921318  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  11921317 ggagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagt----gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||   || ||||| |    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatga---aaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16532295  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  16532296 atgggggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagt----gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||   || ||||| |    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatga---aaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16633367  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  16633366 atgggggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465616
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  176 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791383
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 213
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16465821 - 16465743
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtac 98  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16465821 cacacacacactcacttaggactagactgatgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15699753  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  15699754 tgtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22165566  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  22165565 tgtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22244010  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  22244011 tgtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22061520  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  22061519 tatgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 24855256  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  24855255 ggagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 22767134  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  22767133 gtatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatat-aactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 20170439  T
Q  211 agtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  20170440 agtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18448338  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  18448339 ggagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23023291  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  23023292 ggagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatgggg 25625889  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  25625890 gagtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  || |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgtta-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 2181261  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  2181262 gtttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaaattgtcatttgatataac-tgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||  | ||| ||||| ||||||||| || | || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattg-aattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 20107792  T
Q  218 gggagttt 225  Q
    ||||||||    
T  20107791 gggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  128 gtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    |||  |||||| |||||||||| |||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttga 18854224  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  18854225 tg 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaatt-aaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 21560564  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  21560563 gagtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataa-ct--gttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 216  Q
     |||| ||  | |||||||| |||||||||   |||||| ||   ||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattg-aattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtg 25631282  T
Q  217 ggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  25631281 ggggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||    | ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29595797 gagacatgtgttttaatt-aaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggg 29595895  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  29595896 agtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataact-gttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||     |||||||||| ||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaa-ttgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 25963446  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  25963447 ggagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataact-gttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||     |||||||||| ||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaa-ttgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 25968093  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  25968094 ggagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  25 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 124  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  125 catgtgctttaattgaaattgtcatttgatataact-gttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 223  Q
    ||     |||||||||| ||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaa-ttgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 30671813  T
Q  224 ttgatg 229  Q
    ||||||    
T  30671812 ttgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaag 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  113 ccctt 117  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585631
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattg 139  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattg 19585631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  172 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 11496631  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  11496630 tgtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13823111  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  13823112 tgtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  19 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 42709742  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  42709741 ggagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  114 ccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15254547  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15254548 gtgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaatt-aaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 10630955  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  10630956 gagtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtggg 3354844  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  3354845 ggagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18292143  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  18292144 gagtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||| |||||    || ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaatt-aaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 17484920  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  17484919 gagtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 18081471  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  18081470 gggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||| |||||    || ||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatt-taattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctggg 45234243  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  45234242 ggagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||   | | |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgat---aatatta-----------tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 38426929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 56580550  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  56580549 ggagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtac 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 227
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  169 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 12515042 - 12515081
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12515042 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 12515081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10602489  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  10602488 tgtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13504898  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  13504897 tgtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaag 11947605  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  11947606 tgtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16448777  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  16448776 tatgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 7600553  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  7600554 tatgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 9360988  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  9360987 tatgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaag 15556959  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  15556958 tgtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 16373583  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  16373582 gtatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 12187094  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  12187093 gtatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 37942575  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  37942576 gtatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatgggg 12193500  T
Q  220 gagtttgat 228  Q
    |||||||||    
T  12193499 gagtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 6815065  T
Q  212 gtgtgggggagttt 225  Q
    || || ||||||||    
T  6815066 gtatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaa 10147208  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  10147209 gtatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga--ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 15645198  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  15645199 gtatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 10160191  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  10160190 gtatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 13187435  T
Q  212 gtgtgggggagtttgat 228  Q
    || ||||||||||||||    
T  13187434 gtatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaa-ttgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 3245597  T
Q  221 agtttgat 228  Q
    ||||||||    
T  3245596 agtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||| | |||    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2721405 gagacataagttttaattg-aattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 2721502  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  2721503 agtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtgggg 13097909  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  13097910 gagtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 4382949  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  4382950 gggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 13001436  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  13001435 ggagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  117 tgaggagacatgtgcttt-aattgaaattgtcatttgata-taactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 214  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaatt--aattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 10546951  T
Q  215 tgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||    
T  10546950 tgggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataac-tgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||| |||| || | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatt-taattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtggg 20156526  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  20156525 ggagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |     
T  1992903 ggagacataagttttaatt-taattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggaga 1993001  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  1993002 gagtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtgggg 13690806  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  13690807 gagtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
     |||||||  | ||| ||||| ||||||| | || ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattg-aattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtggg 11398413  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  11398414 ggagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataac-tgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||   | |||||||| ||||||||| || ||   | || |  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattg-aattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14348599  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  14348598 ggagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    | |||  | |||||||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22637802 ggcataagttttaattg-aattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtagggga 22637900  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  22637901 gtttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgat-ataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||   | |||||||  ||||||||| || | |  | ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatt-taattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 3279389  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  3279390 gagtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    || ||  | |||||||||| ||||||  |||||    ||||   |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaa-ttgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17388037  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  17388038 gtttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 12160219  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  12160218 gggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  172 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 17045847 - 17045902
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045847 tgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 17048007 - 17048062
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048007 tgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  174 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  198 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Original strand, 13601062 - 13601108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13601062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 13601108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 16703307 - 16703363
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16703307 atgtttataccttttgctttaggttaagcaaagattcaagcatggaggagtttgatg 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22665260  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  22665261 tgtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaag 117741  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  117742 tgtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22044677  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  22044676 tatgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 25357709  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  25357710 tatgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16775849  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  16775850 tatgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtgggg 11625  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  11624 gagtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24795302  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  24795301 tatgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17590605  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  17590606 tatgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttg-ggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 27627778  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  27627779 gtatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 25144768  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  25144767 ggagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 5500275  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  5500274 gagtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||| ||||  | |||||||||| ||||||| || ||    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaa-ttgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25804277  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  25804276 gagtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagg 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  122 agacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataa--ctg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||   ||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattg-aattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 25370896  T
Q  219 ggagtt 224  Q
    ||||||    
T  25370895 ggagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||  ||     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggg 23798931  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  23798930 agtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 23643950 - 23644160
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacat-ttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23643950 cacacacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttg 23644049  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644050 aggagacacgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 23644148  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  23644149 gggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502251
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttg 24502251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  74 atgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctacta 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| | | |||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  174 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  168 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  183 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 27631506 - 27631585
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||    
T  27631506 cacacacacactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaat-aagtttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 27631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 15532753 - 15532792
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532753 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24019267 - 24019228
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24019267 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 24019228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20595848  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  20595847 tgtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20602134  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  20602133 tgtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20608425  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  20608424 tgtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15735732  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  15735733 tgtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 23748249  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  23748250 tatgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 24940738  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  24940739 ggagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga--ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 18073097  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  18073098 gtatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 24953192  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  24953191 gtatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20790732  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  20790731 gtatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23600647  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    ||| |||||||    
T  23600646 ggaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtggg 24219950  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  24219951 ggagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgat-ataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtggg 20444850  T
Q  219 ggagttt 225  Q
    |||||||    
T  20444849 ggagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  34 cttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  134 t-aattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    | ||||| ||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattg-aattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  24 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  124 acatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 223  Q
    ||||| | ||| |||  ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  20916560 acatgagttttgatt-taattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagt 20916462  T
Q  224 ttgatg 229  Q
    ||||||    
T  20916461 ttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtac 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575630
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaa 141  Q
    |||||||| | ||| ||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaa 20575630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22317719 - 22317639
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  22317719 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22317639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27047072  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  27047073 tgtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17094618  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  17094617 tgtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20237654  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  20237655 tgtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataac--tgtt-agtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||   ||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaa-ttgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 8653321  T
Q  220 gagttt 225  Q
    ||||||    
T  8653322 gagttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 52938632  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  52938631 ggagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgg 3990142  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  3990143 gggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 229
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  27 acactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 126  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  127 tgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    || | ||| |||||| ||||||| ||  ||     ||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 19364241  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  19364242 atg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  141 aattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15876  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  15877 tgtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaag 1236  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  1237 tatgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 3461 - 3524
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3461 tgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcg-aattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaa 633  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  632 gtgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  320 ggagacatgtattttaatt-aaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 418  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  419 gagtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2958 gacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtggga 2860  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  2859 gtttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtggg 251881  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  251880 ggagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  128 gtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11164 gtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttga 11262  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  11263 tg 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatt-taattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 2298  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  2297 ggagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaatt-aaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 14671  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  14670 agtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactg-ttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 1029  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  1030 gggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
     |||||||||| |||| || ||| |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagtt-aaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggg 8139  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  8140 gagtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgtta-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||| | | |  | | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaatt-aaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 121152  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  121153 gagtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    |||||    |||||||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattg-aattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 680  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  681 tttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  70 agaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgtta-gtgc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||||  ||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgc 164464  T
Q  169 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164463 taccatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 1306  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  1307 gggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 58640  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  58639 gggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgg 97738  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  97737 gggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||| ||  | ||| |||||| ||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggg 520  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  519 gagtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  110 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatt 10227  T
Q  209 caagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  10226 caagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13002
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||   ||  ||  ||||| ||||| |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    |||||  | |||||||||| || | || |||||    || |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13107 gacataagttttaattgaa-ttattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggag 13009  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  13008 tttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 229
Target Start/End: Original strand, 8750 - 8869
Alignment:
Q  110 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttag-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatt 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8750 aagcctttgaggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatt 8848  T
Q  209 caagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8849 caagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35104
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||      |||| |  ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 216  Q
      |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |        ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaa-ttgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtg 35117  T
Q  217 ggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  35116 ggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 5090 - 5295
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||  | | | || || | ||    
T  5090 cacacacacactcacttgagactt-attgttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaatgaaaccttaga 5185  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  ||||| |||  ||||||||| || |||   | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5186 ggagacataagcttttatttgaattgtcatatgttatcttttttattgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 5285  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  5286 gagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12609
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataa--ctgtt- 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||| |||||||   ||||||  |||||     
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaa-ttgtcat---atataatcctgttt 12545  T
Q  164 agtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12546 attgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataa--ctgtt- 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||| |||||||   ||||||  |||||     
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaa-ttgtcat---atataatcctgttt 232853  T
Q  164 agtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232852 attgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38572 - 38508
Alignment:
Q  165 gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38572 gtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38631
Alignment:
Q  48 gttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta 92  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgatta 38631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagcgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 1041 - 1080
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1041 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Original strand, 37868 - 37922
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37868 ctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5830
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5869 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University