View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6866A_low_407 (Length: 207)

Name: NF6866A_low_407
Description: NF6866A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6866A_low_407
NF6866A_low_407
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (27-188)||(22407286-22407447)
chr1 (30-188)||(49966560-49966717)
chr1 (59-183)||(44036024-44036148)
chr1 (32-186)||(18506269-18506422)
chr1 (30-188)||(21717115-21717271)
chr1 (32-186)||(35053754-35053909)
chr1 (25-188)||(20826206-20826368)
chr1 (30-183)||(2422065-2422217)
chr1 (25-177)||(27330861-27331012)
chr1 (25-188)||(35523508-35523672)
chr1 (25-184)||(41210961-41211119)
chr1 (25-186)||(5675690-5675850)
chr1 (95-188)||(22353186-22353279)
chr1 (95-188)||(15862592-15862685)
chr1 (95-184)||(22250113-22250202)
chr1 (25-188)||(51657400-51657565)
chr1 (80-184)||(17147695-17147801)
chr1 (93-188)||(20956127-20956225)
chr1 (112-182)||(41218372-41218442)
chr1 (103-171)||(37845654-37845722)
chr1 (91-168)||(51451544-51451623)
chr1 (140-183)||(21858472-21858515)
chr1 (103-173)||(20930380-20930450)
chr1 (103-171)||(20444653-20444721)
chr1 (103-171)||(20527025-20527092)
chr1 (103-171)||(20530418-20530486)
chr1 (129-185)||(20894886-20894942)
chr1 (99-168)||(22365686-22365757)
chr1 (139-183)||(45050598-45050642)
chr1 (25-185)||(9785340-9785489)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (27-188)||(32897641-32897802)
chr6 (35-183)||(19984298-19984446)
chr6 (32-188)||(25645918-25646073)
chr6 (25-186)||(18776129-18776291)
chr6 (25-188)||(16230606-16230768)
chr6 (33-186)||(18569507-18569660)
chr6 (30-188)||(18824637-18824795)
chr6 (95-188)||(25174578-25174671)
chr6 (95-188)||(27655147-27655240)
chr6 (95-188)||(33315628-33315721)
chr6 (30-188)||(4989921-4990079)
chr6 (30-188)||(15736160-15736319)
chr6 (30-184)||(35016770-35016923)
chr6 (80-188)||(18004002-18004111)
chr6 (29-184)||(18431555-18431708)
chr6 (93-188)||(18840555-18840650)
chr6 (32-185)||(25745422-25745574)
chr6 (33-186)||(22431169-22431320)
chr6 (99-188)||(13622160-13622251)
chr6 (25-188)||(16105477-16105638)
chr6 (47-188)||(16826872-16827014)
chr6 (80-184)||(26088787-26088893)
chr6 (99-188)||(14627658-14627748)
chr6 (48-188)||(16084999-16085136)
chr6 (80-185)||(18087846-18087953)
chr6 (47-182)||(23152184-23152318)
chr6 (130-188)||(18824841-18824899)
chr6 (130-188)||(18840696-18840754)
chr6 (80-184)||(23976490-23976595)
chr6 (25-185)||(25368428-25368590)
chr6 (53-188)||(18397845-18397982)
chr6 (25-188)||(18582202-18582367)
chr6 (47-145)||(13015910-13016006)
chr6 (95-153)||(25903975-25904033)
chr6 (47-188)||(19628352-19628490)
chr6 (98-189)||(22867073-22867166)
chr6 (146-188)||(1658915-1658957)
chr6 (147-188)||(19609401-19609442)
chr6 (139-183)||(1651148-1651192)
chr6 (93-162)||(28195924-28195995)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (25-188)||(44054834-44054997)
chr4 (24-188)||(821196-821358)
chr4 (25-188)||(45460040-45460202)
chr4 (35-183)||(25120215-25120363)
chr4 (25-188)||(15273736-15273898)
chr4 (25-188)||(16521701-16521863)
chr4 (25-188)||(33739177-33739339)
chr4 (95-188)||(5683906-5683999)
chr4 (25-180)||(30233626-30233780)
chr4 (95-188)||(18247206-18247299)
chr4 (30-188)||(21960657-21960814)
chr4 (25-186)||(12900853-12901015)
chr4 (30-184)||(23271015-23271166)
chr4 (25-188)||(44345740-44345902)
chr4 (80-188)||(7133479-7133588)
chr4 (25-188)||(54119356-54119518)
chr4 (91-188)||(26679053-26679152)
chr4 (93-188)||(9294543-9294638)
chr4 (33-171)||(53705902-53706039)
chr4 (91-188)||(22355604-22355703)
chr4 (30-186)||(55377673-55377828)
chr4 (95-188)||(18167809-18167903)
chr4 (25-169)||(8873631-8873774)
chr4 (46-159)||(19019506-19019617)
chr4 (25-188)||(19698447-19698607)
chr4 (25-188)||(19709032-19709192)
chr4 (80-184)||(19999442-19999547)
chr4 (103-171)||(53908963-53909031)
chr4 (130-188)||(15212465-15212523)
chr4 (95-168)||(14995127-14995202)
chr4 (99-188)||(18251103-18251194)
chr4 (103-188)||(13245362-13245447)
chr4 (34-162)||(13810709-13810838)
chr4 (91-168)||(10487603-10487682)
chr4 (91-168)||(16329069-16329148)
chr4 (130-184)||(15212557-15212611)
chr4 (25-184)||(18294100-18294260)
chr4 (142-188)||(10643099-10643145)
chr4 (103-168)||(110391-110456)
chr4 (130-176)||(15212373-15212419)
chr4 (80-163)||(18109838-18109923)
chr4 (147-188)||(15288106-15288147)
chr4 (147-188)||(15295216-15295257)
chr4 (142-186)||(18495604-18495649)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (30-188)||(25121456-25121614)
chr8 (35-183)||(29759210-29759358)
chr8 (33-182)||(22322525-22322674)
chr8 (25-186)||(20480586-20480748)
chr8 (25-188)||(19994234-19994396)
chr8 (25-186)||(37610284-37610443)
chr8 (103-188)||(41245577-41245662)
chr8 (93-188)||(24107629-24107724)
chr8 (33-188)||(20568356-20568511)
chr8 (33-188)||(20574549-20574704)
chr8 (95-184)||(22007638-22007727)
chr8 (98-188)||(21680118-21680209)
chr8 (47-188)||(20648541-20648683)
chr8 (25-168)||(3432661-3432801)
chr8 (99-188)||(28836613-28836704)
chr8 (25-188)||(21696477-21696639)
chr8 (91-184)||(13663635-13663730)
chr8 (95-184)||(13722174-13722265)
chr8 (80-185)||(24386843-24386950)
chr8 (80-188)||(20655158-20655268)
chr8 (93-188)||(28556902-28556998)
chr8 (25-188)||(18611427-18611587)
chr8 (99-188)||(24930160-24930251)
chr8 (25-172)||(16406149-16406295)
chr8 (100-188)||(22908532-22908622)
chr8 (91-184)||(24718564-24718658)
chr8 (98-186)||(16417178-16417266)
chr8 (80-184)||(16874074-16874180)
chr8 (95-186)||(17730612-17730706)
chr8 (25-168)||(16040335-16040478)
chr8 (30-168)||(16042123-16042261)
chr8 (80-162)||(38532601-38532685)
chr8 (91-168)||(5237128-5237207)
chr8 (91-168)||(24662391-24662470)
chr8 (102-171)||(16194917-16194986)
chr8 (63-179)||(22144136-22144250)
chr8 (142-188)||(43374782-43374828)
chr8 (139-183)||(24548137-24548181)
chr8 (91-168)||(43684587-43684666)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (28-188)||(71539-71699)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (35-183)||(22273803-22273951)
chr2 (35-183)||(22283036-22283184)
chr2 (25-188)||(21275503-21275665)
chr2 (25-188)||(12643001-12643163)
chr2 (25-183)||(36891794-36891952)
chr2 (70-183)||(27260479-27260592)
chr2 (25-188)||(42179342-42179504)
chr2 (95-188)||(19887825-19887918)
chr2 (80-188)||(3800036-3800144)
chr2 (25-188)||(4449312-4449476)
chr2 (95-188)||(21140894-21140987)
chr2 (30-187)||(270069-270226)
chr2 (33-186)||(6878359-6878513)
chr2 (33-184)||(12637255-12637406)
chr2 (93-188)||(25211893-25211988)
chr2 (106-188)||(16900279-16900361)
chr2 (106-188)||(16993670-16993752)
chr2 (95-184)||(34823220-34823309)
chr2 (33-184)||(8942564-8942715)
chr2 (95-184)||(12727181-12727270)
chr2 (106-188)||(22581094-22581178)
chr2 (80-188)||(24572526-24572636)
chr2 (103-170)||(20628580-20628647)
chr2 (91-168)||(14907583-14907662)
chr2 (91-168)||(23819112-23819191)
chr2 (25-168)||(28972974-28973118)
chr2 (91-168)||(20014052-20014131)
chr2 (103-171)||(461646-461714)
chr2 (142-185)||(8887056-8887099)
chr2 (103-171)||(43644158-43644226)
chr2 (80-185)||(9653983-9654078)
chr2 (142-188)||(22862400-22862446)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (47-183)||(23510908-23511044)
chr5 (25-188)||(9731762-9731924)
chr5 (25-188)||(21393103-21393265)
chr5 (25-183)||(20711056-20711214)
chr5 (33-184)||(28258520-28258669)
chr5 (30-188)||(1169602-1169759)
chr5 (25-188)||(24184295-24184458)
chr5 (95-188)||(11369-11462)
chr5 (95-188)||(10779344-10779437)
chr5 (95-188)||(16535220-16535313)
chr5 (95-188)||(29191785-29191878)
chr5 (25-186)||(17472823-17472983)
chr5 (25-186)||(4864185-4864343)
chr5 (95-184)||(11341660-11341749)
chr5 (100-188)||(11338021-11338111)
chr5 (30-188)||(11582897-11583055)
chr5 (98-188)||(19404497-19404588)
chr5 (95-184)||(22884454-22884543)
chr5 (91-188)||(1220890-1220989)
chr5 (91-188)||(4201124-4201223)
chr5 (95-188)||(18779155-18779250)
chr5 (93-188)||(110145-110240)
chr5 (27-186)||(21652485-21652645)
chr5 (47-188)||(27184830-27184972)
chr5 (80-185)||(21649748-21649855)
chr5 (25-186)||(23453869-23454032)
chr5 (25-186)||(23465374-23465537)
chr5 (30-188)||(23513818-23513977)
chr5 (95-188)||(22367647-22367742)
chr5 (99-188)||(25425640-25425732)
chr5 (91-168)||(21234670-21234749)
chr5 (30-168)||(23505663-23505802)
chr5 (95-184)||(25901488-25901580)
chr5 (91-168)||(20615547-20615626)
chr5 (91-168)||(37051919-37051998)
chr5 (99-163)||(35792275-35792341)
chr5 (147-188)||(7424699-7424740)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (37-183)||(125746-125892)
chr7 (25-188)||(12753797-12753958)
chr7 (25-186)||(3894011-3894173)
chr7 (29-184)||(44864162-44864316)
chr7 (70-188)||(11286129-11286247)
chr7 (27-183)||(12544801-12544956)
chr7 (25-188)||(369803-369965)
chr7 (70-180)||(26071396-26071506)
chr7 (70-180)||(26095183-26095293)
chr7 (27-188)||(45453346-45453505)
chr7 (25-185)||(47288693-47288852)
chr7 (25-188)||(14252277-14252440)
chr7 (47-188)||(15823514-15823655)
chr7 (95-188)||(15851241-15851334)
chr7 (25-186)||(112381-112543)
chr7 (95-188)||(16417487-16417580)
chr7 (25-188)||(2027580-2027742)
chr7 (25-186)||(142546-142708)
chr7 (95-188)||(15952144-15952237)
chr7 (91-188)||(13912155-13912254)
chr7 (30-188)||(13867163-13867323)
chr7 (25-188)||(32495532-32495696)
chr7 (100-188)||(7291876-7291966)
chr7 (33-177)||(39047785-39047928)
chr7 (95-188)||(11515250-11515345)
chr7 (103-171)||(11582027-11582095)
chr7 (93-186)||(12249263-12249358)
chr7 (25-188)||(13273669-13273833)
chr7 (80-185)||(18981044-18981151)
chr7 (93-188)||(49048942-49049040)
chr7 (80-184)||(13757497-13757603)
chr7 (93-188)||(7285361-7285458)
chr7 (25-188)||(15629697-15629860)
chr7 (98-188)||(16571246-16571338)
chr7 (98-188)||(16594324-16594416)
chr7 (91-168)||(15442707-15442786)
chr7 (91-168)||(30263272-30263351)
chr7 (25-188)||(10861927-10862092)
chr7 (103-171)||(16210691-16210759)
chr7 (140-183)||(1937973-1938016)
chr7 (80-143)||(3048688-3048751)
chr7 (112-163)||(13038299-13038350)
chr7 (130-186)||(7285504-7285559)
chr7 (80-163)||(2191684-2191769)
chr7 (142-188)||(36051578-36051624)
chr7 (103-163)||(3058966-3059026)
chr7 (25-133)||(35093783-35093890)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (33-186)||(256001-256153)
scaffold0011 (33-186)||(262607-262759)
scaffold0011 (103-170)||(193515-193582)
scaffold0011 (103-188)||(124454-124539)
scaffold0011 (103-188)||(75855-75940)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (35-183)||(32287-32435)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (35-183)||(40409-40557)
scaffold0078 (91-188)||(38372-38471)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (70-188)||(7709-7827)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (25-188)||(25809-25972)
scaffold0037 (30-186)||(70486-70641)
scaffold0037 (98-188)||(93611-93701)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (25-183)||(137897-138054)
scaffold0021 (25-188)||(87353-87504)
scaffold0021 (30-161)||(10608-10740)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (33-188)||(6453-6607)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (25-188)||(14842-15004)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (25-188)||(18909707-18909869)
chr3 (25-188)||(53769678-53769840)
chr3 (30-175)||(54423001-54423145)
chr3 (26-188)||(16183094-16183255)
chr3 (25-188)||(17099628-17099789)
chr3 (25-185)||(318695-318854)
chr3 (25-188)||(13837777-13837938)
chr3 (30-185)||(22145362-22145517)
chr3 (25-188)||(6147927-6148087)
chr3 (91-188)||(17957375-17957472)
chr3 (95-188)||(22274062-22274155)
chr3 (25-188)||(50113218-50113378)
chr3 (95-188)||(2450374-2450467)
chr3 (27-188)||(53899605-53899767)
chr3 (33-186)||(12350934-12351087)
chr3 (25-188)||(35122600-35122763)
chr3 (102-188)||(47786041-47786127)
chr3 (26-188)||(11198653-11198816)
chr3 (80-185)||(23491423-23491530)
chr3 (25-183)||(15469552-15469709)
chr3 (95-188)||(16819925-16820019)
chr3 (93-186)||(11062184-11062279)
chr3 (25-188)||(14297412-14297574)
chr3 (25-188)||(14303039-14303201)
chr3 (95-188)||(49231232-49231326)
chr3 (30-188)||(12562563-12562722)
chr3 (103-188)||(13816426-13816511)
chr3 (103-188)||(15860308-15860393)
chr3 (25-163)||(17523552-17523690)
chr3 (103-188)||(19571932-19572017)
chr3 (103-188)||(33340864-33340949)
chr3 (25-180)||(8630767-8630920)
chr3 (25-160)||(17138418-17138553)
chr3 (98-188)||(14294342-14294434)
chr3 (98-188)||(14299969-14300061)
chr3 (95-185)||(25057764-25057856)
chr3 (106-182)||(17937416-17937492)
chr3 (47-188)||(51159475-51159617)
chr3 (25-188)||(7852828-7852993)
chr3 (80-143)||(38167007-38167070)
chr3 (98-185)||(40938647-40938736)
chr3 (102-171)||(12031164-12031233)
chr3 (102-171)||(2048969-2049038)
chr3 (25-138)||(16260149-16260261)
chr3 (30-163)||(19945565-19945700)
chr3 (103-171)||(19230968-19231036)
chr3 (142-188)||(14522487-14522533)
chr3 (139-183)||(15574958-15575002)
chr3 (139-183)||(15613977-15614021)
chr3 (142-184)||(10737434-10737476)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (74-188)||(2925-3039)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (32-186)||(3540-3695)
scaffold0447 (32-86)||(8256-8309)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (32-186)||(6148-6303)
scaffold0383 (95-188)||(1425-1518)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (91-188)||(20446-20543)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (30-186)||(13283-13438)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (25-186)||(145595-145757)
scaffold0025 (102-173)||(147698-147769)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (25-188)||(1925-2087)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (25-185)||(12826-12985)
scaffold0359 (25-183)||(243-400)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (27-186)||(47043-47201)
scaffold0068 (27-186)||(60491-60649)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (70-183)||(3579-3692)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (25-173)||(18263-18410)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (25-188)||(39230-39392)
scaffold0034 (25-188)||(44713-44875)
scaffold0034 (130-188)||(39126-39184)
scaffold0034 (99-168)||(78487-78558)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-186)||(237099-237261)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (69-188)||(7781-7900)
scaffold0195 (69-188)||(13170-13289)
scaffold0195 (142-188)||(20305-20351)
scaffold0195 (142-188)||(18221-18267)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (25-184)||(108580-108739)
scaffold0022 (34-183)||(113652-113800)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-188)||(6461-6594)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (80-185)||(1507-1612)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (25-182)||(13120-13275)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (95-188)||(6199-6292)
scaffold0003 (103-171)||(216932-217000)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (25-188)||(129405-129568)
scaffold0028 (103-188)||(89938-90023)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (25-180)||(18510-18667)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (33-188)||(43051-43205)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (26-188)||(17485-17646)
scaffold0244 (25-188)||(23903-24065)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (30-184)||(28951-29104)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (95-184)||(27939-28028)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (95-188)||(155402-155495)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (80-188)||(2162-2272)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (28-187)||(825-984)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (25-188)||(95383-95545)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (46-186)||(23990-24128)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (25-188)||(145840-146005)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (25-159)||(53462-53593)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (80-183)||(54548-54653)
scaffold0032 (99-152)||(14590-14645)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (25-183)||(52361-52517)
scaffold0018 (25-183)||(56313-56469)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (44-153)||(21588-21696)
scaffold0008 (112-173)||(129390-129451)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (103-186)||(5770-5853)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (95-187)||(17670-17764)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (99-188)||(986-1077)
scaffold0269 (99-188)||(15242-15333)
scaffold0269 (25-134)||(12021-12129)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (99-188)||(254-345)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (80-184)||(11062-11168)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (25-188)||(14350-14512)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (112-182)||(8354-8424)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (25-162)||(2540-2677)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (93-189)||(6807-6906)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (103-170)||(2085-2152)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (69-136)||(1817-1884)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (99-188)||(2740-2831)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (93-189)||(2343-2442)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (33-144)||(505-615)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (31-136)||(5515-5619)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (103-173)||(7890-7960)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (142-188)||(248741-248787)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (114-171)||(40502-40559)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (99-168)||(396-467)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (91-168)||(21581-21660)
scaffold0141 (91-168)||(25836-25915)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (99-154)||(330964-331021)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (112-173)||(4788-4849)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (103-171)||(6332-6400)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (91-184)||(2723-2819)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (103-171)||(27696-27763)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (142-180)||(1575-1613)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (151-188)||(59638-59675)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407447
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 22407447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966560
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966617 tg-atgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 49966560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 183
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036148
Alignment:
Q  59 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  159 catgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttact 44036148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506269
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 18506269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21717115
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 21717115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053754
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttag 35053754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826368
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 20826368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422217
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttact 2422217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331012
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctat 27331012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523672
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 35523672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210961
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttactt 41210961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5675850
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttag 5675850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353186
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 22353186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862685
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 15862685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250202
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttactt 22250202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657565
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaa 51657565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147695
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  178 cttactt 184  Q
     ||||||    
T  17147701 attactt 17147695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956225
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaa 20956225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218372
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttac 41218372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451544
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 51451544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858472
Alignment:
Q  140 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact 21858472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20894942
Alignment:
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttactta 20894942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365686
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgt 22365686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050598
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact 45050598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785489
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    ||||||||||          |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaat----------gatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttactta 9785489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897641
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 32897641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984446
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 19984446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 188
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646073
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaa 25646073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18776129
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  125 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttag 18776129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230606
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 16230606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569507
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  133 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 18569507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824795
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 18824795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174578
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 25174578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655240
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 27655240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315721
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 33315721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989921
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 4989921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736319
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaa 15736319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35016923
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttactt 35016923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004111
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  179 ttacttagaa 188  Q
    ||||||||||    
T  18004102 ttacttagaa 18004111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431555
Alignment:
Q  29 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    | ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttactt 18431555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840650
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 18840650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 185
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745574
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttactta 25745574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22431169
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttag 22431169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622251
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 13622251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105477
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16105477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827014
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 16827014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088787
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  178 cttactt 184  Q
    |||||||    
T  26088793 cttactt 26088787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627748
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaa 14627748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084999
Alignment:
Q  48 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 147  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  148 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16084999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18087953
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  178 cttactta 185  Q
    ||||||||    
T  18087946 cttactta 18087953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23152184
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttac 23152184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824899
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 18824899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840754
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 18840754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976490
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  179 ttactt 184  Q
    ||||||    
T  23976495 ttactt 23976490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368590
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttactta 25368590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397845
Alignment:
Q  53 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 149  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  150 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18397882 gatg-atatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 18397845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582202
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 18582202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016006
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 13016006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 153  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628352
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 19628352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22867073
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaac 189  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaac 22867073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 188
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1658957
Alignment:
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaa 1658957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609401
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 19609401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651192
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact 1651192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28195995
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatg 162  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatg 28195995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 6e-76; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054834
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaa 44054834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821358
Alignment:
Q  24 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 821358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460202
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaa 45460202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120363
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 25120363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273898
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 15273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521701
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 16521701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33739177
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 33739177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5683999
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 5683999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233780
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatctt 30233780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247206
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 18247206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21960814
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaa 21960814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901015
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttag 12901015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271166
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttactt 23271166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345740
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 44345740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133588
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  179 ttacttagaa 188  Q
    ||||||||||    
T  7133579 ttacttagaa 7133588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119518
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaa 54119518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679053
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294543
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 9294543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355703
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377828
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttag 55377828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167809
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaa 18167809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  46 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  146 atatgatgtttatc 159  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698607
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 19698607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709192
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 19709192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999442
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 178  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  179 ttactt 184  Q
    ||||||    
T  19999447 ttactt 19999442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212465
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 15212465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14995127
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgt 14995127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251194
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 18251194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245362
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 13245362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 162
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13810838
Alignment:
Q  34 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  133 atgattgta--ttggatatgatgtttatcatg 162  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatg 13810838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487603
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 10487603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329148
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 16329148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212557
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactt 15212557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294260
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttactt 18294260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10643099
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 10643099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212373
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgcta 176  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcta 15212373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18109923
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 163  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatga 18109923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288147
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 15288147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295257
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 15295257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 186
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495649
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttag 18495649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121456
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaa 25121456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29759210
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 29759210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 182
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322674
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttac 22322674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480586
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 20480586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994396
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 19994396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610284
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttag 37610284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245577
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 41245577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107724
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 24107724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 188
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568511
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  133 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 20568511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 188
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574704
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  133 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||  |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 20574704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007727
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttactt 22007727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21680118
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 21680118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648683
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttg 144  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaa 20648683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3432801
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgt 3432801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836613
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 28836613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696477
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  125 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 21696477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663730
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttactt 13663730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722265
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttactt 13722265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24386950
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  178 cttactta 185  Q
    ||||||||    
T  24386943 cttactta 24386950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655268
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  178 cttacttagaa 188  Q
    |||||||||||    
T  20655258 cttacttagaa 20655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556902
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaa 28556902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611427
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 18611427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930251
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 24930251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908622
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 22908622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718658
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactt 184  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttactt 24718658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16417178
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttag 16417178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874180
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  178 cttactt 184  Q
     ||||||    
T  16874174 attactt 16874180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730706
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttag 17730706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040478
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgt 16040478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042261
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgt 16042261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532601
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatg 162  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatg 38532601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5237128
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 5237128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662470
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 24662470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  63 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 160  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  161 tgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43374828
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 43374828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24548137
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact 24548137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684587
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 43684587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 188
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71699
Alignment:
Q  28 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 127  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  128 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaa 71699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273803
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 22273803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22283036
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttact 22283036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275665
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 21275665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643163
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 12643163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36891952
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact 36891952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260479
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  170 tatgctatcttact 183  Q
    ||||||||| ||||    
T  27260492 tatgctatcatact 27260479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179504
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaa 42179504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887918
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 19887918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800144
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  180 tacttagaa 188  Q
    |||||||||    
T  3800136 tacttagaa 3800144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449476
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 4449476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140894
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 21140894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270069
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  130 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaga 187  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttaga 270069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878359
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  133 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 6878359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637406
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttactt 12637406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211893
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 25211893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900279
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16900279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993670
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16993670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823220
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttactt 34823220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942564
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttactt 8942564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727181
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttactt 12727181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581178
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 22581178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572636
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  178 cttacttagaa 188  Q
    |||||||||||    
T  24572626 cttacttagaa 24572636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907662
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 14907662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23819112
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 23819112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972974
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  125 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    ||||| |||||    | ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatg--ttggatatgatgtttatcatggaatgt 28972974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20014052
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 20014052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8887056
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 8887056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654078
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaat----------gatatgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862400
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaa 22862400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510908
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattact 23510908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731924
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 9731924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21393103
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaa 21393103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20711056
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact 20711056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258520
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttactt 28258520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169759
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaa 1169759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184458
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 24184458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11369
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 11369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779437
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 10779437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16535220
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16535220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191878
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 29191878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17472983
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttag 17472983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4864185
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttag 4864185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341660
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttactt 11341660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338111
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaa 11338111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582897
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 11582897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404497
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatg-ttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 19404497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884543
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttactt 22884543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1220989
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201223
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779250
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 18779250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110240
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 110240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652645
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  127 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttag 21652645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27184972
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 27184972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649748
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  178 cttactta 185  Q
    ||||||||    
T  21649755 cttactta 21649748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453869
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  123 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttag 23453869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465374
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  123 gtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttag 23465374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513818
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaa 23513818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367742
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22367742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425640
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaa 25425640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234749
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 21234749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901580
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttactt 25901580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615547
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgt 20615547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051919
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgt 37051919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792341
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 163  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatga 35792341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424699
Alignment:
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 7424699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125746
Alignment:
Q  37 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 136  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  137 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttact 125746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753797
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaa 12753797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3894011
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttag 3894011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44864162
Alignment:
Q  29 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 44864162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11286129
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  170 tatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11286147 tatgttatcttacttagaa 11286129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12544956
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttact 12544956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369803
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 369803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071506
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  170 tatgctatctt 180  Q
    |||||||||||    
T  26071496 tatgctatctt 26071506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095293
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  170 tatgctatctt 180  Q
    |||||||||||    
T  26095283 tatgctatctt 26095293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453505
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  127 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaa 45453505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288693
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 47288693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252440
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaa 14252440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823655
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  147 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 15823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851241
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 15851241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112543
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttag 112543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417487
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 16417487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027580
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaa 2027580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142546
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttag 142546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952237
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 15952237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912254
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867323
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  129 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaa 13867323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495696
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 32495696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291876
Alignment:
Q  100 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 7291876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39047928
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctat 39047928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515250
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaa 11515250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249358
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttag 12249358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273669
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaa 13273669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981151
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  178 cttactta 185  Q
    ||||||||    
T  18981144 cttactta 18981151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049040
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaa 49049040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757497
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  178 cttactt 184  Q
     ||||||    
T  13757503 attactt 13757497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 188
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285458
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaa 7285458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629697
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  125 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaa 15629697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571338
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 16571338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594324
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 16594324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15442786
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 15442786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263351
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 30263351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862092
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
     |||||||||| || ||  ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaa 10862092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938016
Alignment:
Q  140 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 1938016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285559
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttag 7285559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191769
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 163  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatga 2191769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051578
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaa 36051578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 163  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  125 atgaatgaa 133  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 7e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256153
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 256153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262759
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 262759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124539
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaa 124539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 75855 - 75940
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaa 75940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32435
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact 32435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40409
Alignment:
Q  35 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 134  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  135 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact 40409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38471
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7709
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  170 tatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7727 tatgctatcttacttagaa 7709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 25809 - 25972
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaa 25972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70641
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttag 70641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93611
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaa 93611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138054
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttact 138054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87353
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaa 87353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10608
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcat 161  Q
     ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcat 10608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 188
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6607
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 6607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15004
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 15004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909707
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 18909707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769678
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaa 53769678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183255
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  126 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 16183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099628
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaa 17099628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 318695 - 318854
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttactta 318854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837777
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 13837777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145517
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  129 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttactta 22145517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148087
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaa 6148087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957472
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 17957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274062
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 22274062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113378
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 50113378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450467
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaa 2450467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899767
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  127 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 53899767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351087
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  132 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 12351087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122600
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 35122600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786127
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaa 47786127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11198816
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  126 tgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 11198816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491423
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  178 cttactta 185  Q
    ||||||||    
T  23491430 cttactta 23491423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469709
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact 15469709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819925
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaa 16819925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062279
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 11062279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297412
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 14297412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14303039
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaa 14303039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231232
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaa 49231232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562722
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  130 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaa 12562722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816426
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaa 13816426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860393
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaa 15860393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572017
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaa 19572017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340864
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaa 33340864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630767
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt 180  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgat-attatcatgagatgtgtatgctatctt 8630767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138418
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatca 160  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatca 17138418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294342
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 14294342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299969
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 14299969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057764
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttactta 25057764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937416
Alignment:
Q  106 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttac 17937416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159617
Alignment:
Q  47 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  145 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 51159617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852828
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaa 7852828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938647
Alignment:
Q  98 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttactta 40938647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260149
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  125 atgaatgaatgatt 138  Q
    |||||||| |||||    
T  16260162 atgaatgagtgatt 16260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945565
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  129 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatga 163  Q
    ||||||| || |||  | |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatga 19945565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522533
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 14522533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574958
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact 15574958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613977
Alignment:
Q  139 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact 15613977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737434
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttactt 10737434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3039
Alignment:
Q  74 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  174 ctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||    
T  3025 ctatcttacttagaa 3039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3540
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttag 3540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 6148
Alignment:
Q  32 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  132 aatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttag 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1425
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20543
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 20543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13438
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145595
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 145595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  102 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2087
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 12826 - 12985
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactta 185  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttactta 12985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 243
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttact 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 47043
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttag 47043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60491
Alignment:
Q  27 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  127 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttag 60491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3579
Alignment:
Q  70 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  170 tatgctatcttact 183  Q
    |||| |||||||||    
T  3592 tatgatatcttact 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39230
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 39230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44713
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 44713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 39126
Alignment:
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 39126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78487
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 78487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 237099
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  125 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 237099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Original strand, 7781 - 7900
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  169 gtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  7881 gtatgatatcctacttagaa 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13289
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  169 gtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  13270 gtatgatatcctacttagaa 13289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20305
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 20305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18221
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaa 18221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108580
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttactt 108580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113800
Alignment:
Q  34 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  134 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttact 113800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6461
Alignment:
Q  54 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 153  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  154 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 6461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1612
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 179  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  180 tactta 185  Q
    ||||||    
T  1607 tactta 1612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 13120
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac 13120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6199
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaa 6199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129405
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  124 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaa 129405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90023
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaa 90023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18667
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt 180  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctt 18667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 188
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43205
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  133 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaa 43205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17646
Alignment:
Q  26 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 125  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  126 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaa 17646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24065
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaa 24065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28951
Alignment:
Q  30 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 129  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  130 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttactt 28951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27939
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttactt 27939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155495
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaa 155495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2272
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  178 cttacttagaa 188  Q
    |||||||||||    
T  2262 cttacttagaa 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 825
Alignment:
Q  28 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  128 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaga 187  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttaga 825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95383
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaa 95383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23990
Alignment:
Q  46 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 145  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  146 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttag 23990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145840
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  124 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaa 145840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 159  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54548
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  178 cttact 183  Q
    ||||||    
T  54553 cttact 54548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 152  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52517
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact 52517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56469
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttact 183  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact 56469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21588
Alignment:
Q  44 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  144 ggatatgatg 153  Q
    ||||||||||    
T  21597 ggatatgatg 21588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 5770 - 5853
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttag 186  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttag 5853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17670
Alignment:
Q  95 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaga 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaga 17670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 986
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15242
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaa 15242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  125 atgaatgaat 134  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 254
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11168
Alignment:
Q  80 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 177  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  178 cttactt 184  Q
    |||||||    
T  11162 cttactt 11168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14512
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  125 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaa 14512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8354
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttac 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttac 8354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2677
Alignment:
Q  25 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  125 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatg 162  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6807
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaac 189  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||    
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  69 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2831
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaa 2831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2343
Alignment:
Q  93 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaac 189  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||    
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 505 - 615
Alignment:
Q  33 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 132  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  133 atgattgtattg 144  Q
    ||||||||||||    
T  604 atgattgtattg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5619
Alignment:
Q  31 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  131 gaatga 136  Q
    ||||||    
T  5614 gaatga 5619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 248741 - 248787
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 248787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  114 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 396
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgatt--gtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgt 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21581
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgt 21581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25836
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt 25836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  99 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 154  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  112 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Original strand, 2723 - 2819
Alignment:
Q  91 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttactt 184  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || ||  ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttactt 2819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  103 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 171  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 180
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1613
Alignment:
Q  142 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatctt 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59638
Alignment:
Q  151 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaa 59638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University