View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6867A_low_15 (Length: 459)

Name: NF6867A_low_15
Description: NF6867A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6867A_low_15
NF6867A_low_15
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (7-444)||(821196-821646)
chr4 (8-393)||(44054612-44054997)
chr4 (8-400)||(33738948-33739339)
chr4 (8-400)||(45460040-45460432)
chr4 (8-393)||(16521479-16521863)
chr4 (8-393)||(12900853-12901240)
chr4 (8-400)||(44345510-44345902)
chr4 (18-393)||(25120215-25120589)
chr4 (13-393)||(21960657-21961036)
chr4 (8-379)||(30233626-30233998)
chr4 (125-395)||(10642875-10643145)
chr4 (8-395)||(54119356-54119731)
chr4 (63-395)||(19999216-19999547)
chr4 (86-395)||(13245140-13245447)
chr4 (78-392)||(14994888-14995202)
chr4 (78-260)||(5683906-5684088)
chr4 (189-395)||(53706054-53706260)
chr4 (202-393)||(53909047-53909238)
chr4 (13-344)||(23271015-23271342)
chr4 (74-395)||(10487359-10487682)
chr4 (187-400)||(7133711-7133924)
chr4 (187-395)||(18167482-18167686)
chr4 (74-395)||(16329069-16329392)
chr4 (187-395)||(9294213-9294419)
chr4 (192-393)||(110171-110371)
chr4 (186-395)||(15288271-15288478)
chr4 (125-393)||(15273958-15274226)
chr4 (8-222)||(15273736-15273949)
chr4 (187-396)||(8373041-8373249)
chr4 (201-393)||(8873770-8873961)
chr4 (187-395)||(14950708-14950914)
chr4 (187-395)||(22355826-22356032)
chr4 (186-395)||(15295381-15295588)
chr4 (186-392)||(18246881-18247083)
chr4 (189-393)||(34393744-34393948)
chr4 (195-395)||(47356014-47356214)
chr4 (78-222)||(18247155-18247299)
chr4 (125-393)||(18495604-18495875)
chr4 (177-393)||(5684153-5684370)
chr4 (210-395)||(26338174-26338355)
chr4 (63-214)||(7133479-7133631)
chr4 (186-393)||(15212032-15212239)
chr4 (76-223)||(9294491-9294638)
chr4 (8-260)||(18294100-18294354)
chr4 (8-221)||(19698447-19698657)
chr4 (8-221)||(19709032-19709242)
chr4 (74-222)||(26679002-26679152)
chr4 (113-223)||(15212413-15212523)
chr4 (78-214)||(18167766-18167903)
chr4 (74-222)||(22355604-22355754)
chr4 (187-395)||(26678733-26678929)
chr4 (17-393)||(13810709-13811098)
chr4 (217-393)||(13049455-13049630)
chr4 (13-213)||(55377673-55377873)
chr4 (177-343)||(18294418-18294580)
chr4 (189-320)||(8044021-8044153)
chr4 (82-209)||(18251103-18251232)
chr4 (113-222)||(15212311-15212419)
chr4 (130-222)||(15288106-15288198)
chr4 (130-222)||(15295216-15295308)
chr4 (16-154)||(53705902-53706039)
chr4 (125-260)||(34394020-34394156)
chr4 (63-260)||(18109838-18110038)
chr4 (8-152)||(8873631-8873774)
chr4 (29-142)||(19019506-19019617)
chr4 (86-154)||(53908963-53909031)
chr4 (295-393)||(43282757-43282855)
chr4 (295-393)||(52266840-52266938)
chr4 (325-393)||(13751694-13751762)
chr4 (113-172)||(15212552-15212611)
chr4 (295-368)||(15852696-15852769)
chr4 (211-260)||(19019390-19019439)
chr4 (129-223)||(8373321-8373415)
chr4 (213-260)||(8373431-8373478)
chr4 (303-393)||(15043631-15043721)
chr4 (303-393)||(15110703-15110793)
chr4 (213-259)||(47356297-47356343)
chr4 (86-151)||(110391-110456)
chr4 (295-356)||(27959759-27959820)
chr4 (295-356)||(34197544-34197605)
chr4 (186-248)||(18110114-18110176)
chr4 (295-348)||(37958436-37958489)
chr4 (295-356)||(41167314-41167375)
chr4 (128-236)||(15043789-15043898)
chr4 (128-236)||(15110526-15110635)
chr4 (298-367)||(41257728-41257797)
chr4 (195-223)||(15212605-15212633)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (10-400)||(22407286-22407676)
chr1 (13-400)||(49966331-49966717)
chr1 (15-395)||(18506044-18506422)
chr1 (13-393)||(2422065-2422445)
chr1 (42-393)||(44036024-44036373)
chr1 (78-395)||(15862592-15862907)
chr1 (8-395)||(41210733-41211119)
chr1 (13-393)||(21716895-21717271)
chr1 (15-393)||(35053532-35053909)
chr1 (8-393)||(35523508-35523894)
chr1 (8-393)||(5675690-5676074)
chr1 (78-395)||(22250113-22250429)
chr1 (63-395)||(17147469-17147801)
chr1 (95-393)||(41218143-41218442)
chr1 (123-393)||(21858246-21858515)
chr1 (112-395)||(20894886-20895168)
chr1 (78-260)||(22353097-22353279)
chr1 (82-395)||(22365442-22365757)
chr1 (122-395)||(45050371-45050642)
chr1 (125-393)||(20826428-20826696)
chr1 (8-222)||(20826206-20826419)
chr1 (190-393)||(37845737-37845939)
chr1 (127-395)||(7641803-7642067)
chr1 (8-393)||(51657400-51657798)
chr1 (195-395)||(22352815-22353015)
chr1 (74-395)||(51451300-51451623)
chr1 (8-393)||(9785340-9785707)
chr1 (190-387)||(20444442-20444638)
chr1 (190-387)||(20530207-20530403)
chr1 (190-393)||(20526808-20527010)
chr1 (195-395)||(18060885-18061084)
chr1 (8-237)||(27330861-27331088)
chr1 (155-395)||(17003512-17003747)
chr1 (210-395)||(22034536-22034717)
chr1 (190-393)||(20930163-20930367)
chr1 (210-395)||(21651228-21651411)
chr1 (186-395)||(41393139-41393346)
chr1 (210-395)||(22029384-22029566)
chr1 (217-395)||(22226668-22226846)
chr1 (225-393)||(18602351-18602518)
chr1 (225-393)||(5073608-5073775)
chr1 (76-223)||(20956127-20956278)
chr1 (225-358)||(20121965-20122098)
chr1 (210-281)||(22031007-22031078)
chr1 (295-368)||(38034997-38035070)
chr1 (298-393)||(22836628-22836723)
chr1 (295-393)||(27673543-27673641)
chr1 (211-260)||(20253246-20253295)
chr1 (295-368)||(36357713-36357786)
chr1 (86-154)||(37845654-37845722)
chr1 (295-370)||(20956341-20956416)
chr1 (160-249)||(22836478-22836568)
chr1 (295-356)||(19601911-19601972)
chr1 (86-156)||(20930380-20930450)
chr1 (298-367)||(37235336-37235405)
chr1 (86-154)||(20444653-20444721)
chr1 (86-154)||(20527025-20527092)
chr1 (86-154)||(20530418-20530486)
chr1 (192-240)||(27673692-27673740)
chr1 (298-356)||(5471758-5471816)
chr1 (299-367)||(8539328-8539396)
chr1 (299-367)||(8604567-8604635)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (13-400)||(25121227-25121614)
chr8 (8-400)||(19994234-19994626)
chr8 (16-400)||(22322525-22322909)
chr8 (18-393)||(29758984-29759358)
chr8 (86-400)||(41245348-41245662)
chr8 (74-395)||(24718564-24718886)
chr8 (8-393)||(37610059-37610443)
chr8 (30-393)||(20648541-20648906)
chr8 (125-395)||(43374782-43375050)
chr8 (8-393)||(20480365-20480748)
chr8 (63-393)||(20655158-20655491)
chr8 (8-395)||(3432661-3433043)
chr8 (63-393)||(24386843-24387175)
chr8 (63-395)||(16874074-16874406)
chr8 (81-393)||(16416952-16417266)
chr8 (81-393)||(21679894-21680209)
chr8 (16-393)||(20568356-20568734)
chr8 (16-393)||(20574549-20574927)
chr8 (78-395)||(22007638-22007947)
chr8 (8-393)||(21696253-21696639)
chr8 (186-395)||(6775492-6775700)
chr8 (74-395)||(5236884-5237207)
chr8 (74-395)||(24662391-24662714)
chr8 (122-395)||(24547910-24548181)
chr8 (186-395)||(22908745-22908952)
chr8 (187-393)||(24930375-24930582)
chr8 (195-395)||(224430-224630)
chr8 (195-395)||(700843-701043)
chr8 (195-395)||(738053-738253)
chr8 (195-395)||(861948-862148)
chr8 (187-392)||(24107848-24108050)
chr8 (195-395)||(13663905-13664104)
chr8 (195-395)||(13723180-13723379)
chr8 (78-393)||(17730612-17730931)
chr8 (74-395)||(43684343-43684666)
chr8 (155-395)||(272435-272670)
chr8 (155-395)||(643179-643414)
chr8 (155-395)||(828985-829220)
chr8 (190-391)||(16195001-16195202)
chr8 (76-222)||(24107629-24107775)
chr8 (128-393)||(270429-270687)
chr8 (128-393)||(645233-645491)
chr8 (128-393)||(830968-831226)
chr8 (82-222)||(28836562-28836704)
chr8 (74-260)||(13663635-13663823)
chr8 (210-395)||(22089729-22089910)
chr8 (13-313)||(16042123-16042424)
chr8 (8-221)||(18611377-18611587)
chr8 (78-260)||(13722174-13722358)
chr8 (210-395)||(15320345-15320526)
chr8 (210-395)||(15500714-15500895)
chr8 (63-393)||(38532341-38532685)
chr8 (83-222)||(22908532-22908673)
chr8 (186-326)||(28836353-28836490)
chr8 (82-221)||(24930160-24930302)
chr8 (193-393)||(28543628-28543826)
chr8 (187-313)||(16040621-16040748)
chr8 (225-393)||(16675624-16675791)
chr8 (229-393)||(21853199-21853361)
chr8 (294-393)||(37605685-37605783)
chr8 (229-393)||(21845794-21845956)
chr8 (129-222)||(6775326-6775420)
chr8 (76-198)||(28556874-28556998)
chr8 (187-260)||(13722433-13722506)
chr8 (187-260)||(13722581-13722654)
chr8 (187-260)||(13722729-13722802)
chr8 (187-260)||(13722877-13722950)
chr8 (187-260)||(13723025-13723098)
chr8 (8-222)||(16040335-16040549)
chr8 (295-393)||(18768135-18768233)
chr8 (8-155)||(16406149-16406295)
chr8 (327-393)||(16203739-16203804)
chr8 (295-368)||(39448198-39448271)
chr8 (177-223)||(17151399-17151445)
chr8 (211-260)||(18618138-18618187)
chr8 (295-356)||(21199547-21199608)
chr8 (295-356)||(31195658-31195719)
chr8 (191-231)||(17151521-17151561)
chr8 (213-260)||(224301-224348)
chr8 (213-260)||(700714-700761)
chr8 (213-260)||(737924-737971)
chr8 (213-260)||(861819-861866)
chr8 (213-260)||(17151288-17151335)
chr8 (85-154)||(16194917-16194986)
chr8 (187-221)||(18618028-18618062)
chr8 (46-162)||(22144136-22144250)
chr8 (298-356)||(23148624-23148682)
chr8 (295-356)||(21192120-21192181)
chr8 (295-393)||(22737250-22737349)
chr8 (189-240)||(37654901-37654952)
chr8 (298-356)||(23835950-23836008)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (8-400)||(21392874-21393265)
chr5 (10-400)||(21652485-21652877)
chr5 (8-400)||(20710823-20711214)
chr5 (16-400)||(28258286-28258669)
chr5 (78-393)||(16534999-16535313)
chr5 (30-400)||(23510676-23511044)
chr5 (8-393)||(24184295-24184681)
chr5 (8-392)||(4863961-4864343)
chr5 (186-395)||(11582565-11582774)
chr5 (78-395)||(22884454-22884770)
chr5 (81-393)||(19404273-19404588)
chr5 (63-393)||(21649523-21649855)
chr5 (187-393)||(1169923-1170129)
chr5 (83-393)||(11338021-11338334)
chr5 (13-260)||(1169602-1169848)
chr5 (125-395)||(11341327-11341597)
chr5 (186-395)||(1221112-1221318)
chr5 (186-395)||(22367865-22368071)
chr5 (186-395)||(7424368-7424575)
chr5 (186-395)||(17473150-17473359)
chr5 (8-395)||(23453641-23454032)
chr5 (8-395)||(23465146-23465537)
chr5 (74-395)||(21234670-21234993)
chr5 (186-395)||(21074870-21075076)
chr5 (187-395)||(110364-110571)
chr5 (187-395)||(4201347-4201553)
chr5 (125-393)||(9731984-9732252)
chr5 (186-392)||(11044-11246)
chr5 (189-395)||(23513487-23513693)
chr5 (8-222)||(9731762-9731975)
chr5 (74-393)||(20615305-20615626)
chr5 (8-260)||(17472823-17473075)
chr5 (199-395)||(25192390-25192585)
chr5 (189-392)||(29192004-29192203)
chr5 (186-395)||(10779560-10779766)
chr5 (125-395)||(25425313-25425580)
chr5 (195-395)||(43445142-43445341)
chr5 (186-395)||(18779374-18779582)
chr5 (78-223)||(10779344-10779489)
chr5 (74-393)||(37051677-37051998)
chr5 (78-222)||(11318-11462)
chr5 (78-222)||(29191785-29191929)
chr5 (187-393)||(27185095-27185301)
chr5 (155-395)||(21933512-21933747)
chr5 (155-395)||(21939682-21939917)
chr5 (155-395)||(35580945-35581180)
chr5 (155-395)||(37010516-37010751)
chr5 (13-222)||(11582846-11583055)
chr5 (125-395)||(19498491-19498752)
chr5 (210-395)||(23327644-23327825)
chr5 (210-395)||(24595192-24595373)
chr5 (76-223)||(110145-110292)
chr5 (187-393)||(25901707-25901911)
chr5 (217-393)||(35792544-35792719)
chr5 (74-222)||(1220890-1221040)
chr5 (74-222)||(4201124-4201274)
chr5 (189-388)||(11212986-11213183)
chr5 (30-222)||(27184830-27185023)
chr5 (13-222)||(23513767-23513977)
chr5 (78-222)||(18779155-18779301)
chr5 (82-222)||(25425589-25425732)
chr5 (8-312)||(24474367-24474654)
chr5 (78-222)||(22367647-22367793)
chr5 (78-223)||(11341605-11341749)
chr5 (78-223)||(25901488-25901635)
chr5 (130-222)||(7424648-7424740)
chr5 (229-393)||(27008705-27008867)
chr5 (129-219)||(19498764-19498855)
chr5 (82-260)||(35792275-35792456)
chr5 (295-368)||(7727296-7727369)
chr5 (298-393)||(3672685-3672780)
chr5 (295-368)||(23492722-23492794)
chr5 (13-151)||(23505663-23505802)
chr5 (295-356)||(32967547-32967608)
chr5 (296-356)||(37189501-37189561)
chr5 (213-260)||(43445013-43445060)
chr5 (339-393)||(24470996-24471049)
chr5 (295-367)||(431149-431221)
chr5 (296-356)||(28888649-28888709)
chr5 (128-249)||(5452007-5452130)
chr5 (298-393)||(5452190-5452285)
chr5 (298-367)||(21615735-21615804)
chr5 (298-367)||(24226842-24226911)
chr5 (189-240)||(3672849-3672900)
chr5 (298-356)||(19860967-19861025)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (10-393)||(32897419-32897802)
chr6 (12-400)||(18431322-18431708)
chr6 (15-400)||(25645918-25646302)
chr6 (16-395)||(18569281-18569660)
chr6 (18-393)||(19984298-19984671)
chr6 (13-395)||(35016770-35017151)
chr6 (8-393)||(18775907-18776291)
chr6 (8-393)||(16105254-16105638)
chr6 (63-395)||(18087846-18088181)
chr6 (186-400)||(18004234-18004448)
chr6 (30-393)||(23151956-23152318)
chr6 (129-395)||(1658915-1659181)
chr6 (63-395)||(23976264-23976595)
chr6 (16-393)||(22430944-22431320)
chr6 (184-394)||(15736440-15736650)
chr6 (15-355)||(25745422-25745763)
chr6 (186-395)||(27655348-27655554)
chr6 (187-395)||(16827138-16827345)
chr6 (187-395)||(4989592-4989797)
chr6 (125-393)||(16230278-16230546)
chr6 (8-222)||(16230555-16230768)
chr6 (187-395)||(33315844-33316049)
chr6 (205-393)||(31627134-31627322)
chr6 (186-392)||(25174253-25174455)
chr6 (122-395)||(1651148-1651419)
chr6 (36-393)||(18397622-18397982)
chr6 (202-392)||(11214836-11215026)
chr6 (13-223)||(18824637-18824847)
chr6 (31-287)||(16084882-16085136)
chr6 (192-395)||(16239058-16239262)
chr6 (78-222)||(25174527-25174671)
chr6 (13-223)||(4989869-4990079)
chr6 (155-395)||(10487574-10487809)
chr6 (155-395)||(16377518-16377753)
chr6 (155-395)||(16384842-16385077)
chr6 (186-394)||(13622374-13622583)
chr6 (186-395)||(14627871-14628078)
chr6 (177-393)||(15861425-15861642)
chr6 (78-218)||(27655147-27655287)
chr6 (76-223)||(18840555-18840702)
chr6 (30-400)||(13015910-13016260)
chr6 (187-392)||(18825023-18825225)
chr6 (187-392)||(18843083-18843286)
chr6 (78-217)||(33315628-33315767)
chr6 (63-214)||(18004002-18004154)
chr6 (13-214)||(15736160-15736362)
chr6 (82-222)||(13622160-13622302)
chr6 (113-223)||(18824841-18824951)
chr6 (113-223)||(18840696-18840806)
chr6 (244-393)||(18128981-18129129)
chr6 (187-393)||(1554536-1554741)
chr6 (30-222)||(16826872-16827065)
chr6 (217-395)||(17343578-17343753)
chr6 (210-395)||(16557301-16557482)
chr6 (210-395)||(16650531-16650712)
chr6 (8-222)||(18582151-18582367)
chr6 (210-393)||(26088532-26088713)
chr6 (210-395)||(29870760-29870942)
chr6 (8-393)||(25368428-25368827)
chr6 (76-393)||(28195924-28196250)
chr6 (82-214)||(14627658-14627791)
chr6 (217-393)||(23993858-23994032)
chr6 (30-221)||(19628302-19628490)
chr6 (81-393)||(22866864-22867166)
chr6 (210-395)||(22226926-22227110)
chr6 (275-395)||(19609192-19609310)
chr6 (130-222)||(19609350-19609442)
chr6 (290-393)||(16084112-16084215)
chr6 (63-172)||(26088782-26088893)
chr6 (129-207)||(21776791-21776870)
chr6 (295-393)||(15738945-15739043)
chr6 (78-136)||(25903975-25904033)
chr6 (143-213)||(16301107-16301178)
chr6 (211-260)||(1554817-1554866)
chr6 (335-393)||(18741146-18741203)
chr6 (295-356)||(16889122-16889183)
chr6 (295-368)||(33323532-33323605)
chr6 (295-368)||(35137326-35137399)
chr6 (298-354)||(22846867-22846923)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (12-395)||(44863934-44864316)
chr7 (8-400)||(47288461-47288852)
chr7 (8-393)||(369580-369965)
chr7 (10-400)||(12544801-12545190)
chr7 (13-400)||(13867163-13867552)
chr7 (10-393)||(45453346-45453728)
chr7 (30-393)||(15823514-15823881)
chr7 (53-400)||(26071396-26071743)
chr7 (53-400)||(26095183-26095530)
chr7 (8-393)||(12753575-12753958)
chr7 (20-393)||(125520-125892)
chr7 (53-393)||(11285904-11286247)
chr7 (8-393)||(3893789-3894173)
chr7 (8-393)||(112381-112767)
chr7 (8-400)||(142313-142708)
chr7 (63-395)||(18981044-18981378)
chr7 (125-395)||(36051356-36051624)
chr7 (63-395)||(13757271-13757603)
chr7 (76-393)||(12249263-12249584)
chr7 (123-393)||(1937973-1938240)
chr7 (186-400)||(7291540-7291753)
chr7 (78-249)||(15851163-15851334)
chr7 (186-392)||(15952360-15952563)
chr7 (74-395)||(15442707-15443030)
chr7 (187-393)||(32495819-32496025)
chr7 (192-393)||(3058741-3058941)
chr7 (189-394)||(13038373-13038576)
chr7 (189-393)||(11582109-11582311)
chr7 (186-393)||(2027250-2027457)
chr7 (186-392)||(16417162-16417364)
chr7 (81-393)||(16571246-16571563)
chr7 (81-393)||(16594099-16594416)
chr7 (8-222)||(14252277-14252491)
chr7 (189-395)||(16210472-16210676)
chr7 (74-393)||(30263272-30263593)
chr7 (187-393)||(13912378-13912582)
chr7 (155-395)||(27102783-27103018)
chr7 (155-395)||(27110131-27110366)
chr7 (155-395)||(27175308-27175543)
chr7 (155-395)||(38784875-38785110)
chr7 (16-273)||(39047785-39048042)
chr7 (186-395)||(2191960-2192168)
chr7 (186-395)||(16480200-16480407)
chr7 (78-222)||(16417436-16417580)
chr7 (155-395)||(7821616-7821851)
chr7 (155-395)||(7828927-7829162)
chr7 (8-393)||(13273436-13273833)
chr7 (189-395)||(15926059-15926261)
chr7 (187-393)||(11514816-11515020)
chr7 (186-395)||(26010455-26010662)
chr7 (208-395)||(15525769-15525956)
chr7 (8-222)||(32495532-32495747)
chr7 (78-214)||(15952144-15952280)
chr7 (74-222)||(13912155-13912305)
chr7 (83-222)||(7291825-7291966)
chr7 (8-393)||(15629464-15629860)
chr7 (187-393)||(15761634-15761839)
chr7 (78-223)||(11515198-11515345)
chr7 (217-393)||(42057458-42057632)
chr7 (76-393)||(49048942-49049272)
chr7 (8-222)||(2027529-2027742)
chr7 (76-223)||(7285361-7285510)
chr7 (192-395)||(18255090-18255294)
chr7 (216-393)||(13571525-13571701)
chr7 (8-264)||(10861927-10862187)
chr7 (254-395)||(2436316-2436456)
chr7 (252-393)||(25293608-25293747)
chr7 (218-395)||(10988304-10988479)
chr7 (63-260)||(2191684-2191884)
chr7 (129-214)||(16480034-16480120)
chr7 (113-212)||(7285504-7285603)
chr7 (86-154)||(11582027-11582095)
chr7 (177-223)||(11515092-11515138)
chr7 (211-260)||(15761509-15761558)
chr7 (86-154)||(16210691-16210759)
chr7 (63-126)||(3048688-3048751)
chr7 (95-146)||(13038299-13038350)
chr7 (298-367)||(9058007-9058076)
chr7 (298-392)||(10862231-10862326)
chr7 (299-356)||(15913817-15913874)
chr7 (86-146)||(3058966-3059026)
chr7 (8-116)||(35093783-35093890)
chr7 (295-333)||(13376423-13376461)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (16-400)||(256001-256384)
scaffold0011 (16-385)||(262607-262975)
scaffold0011 (86-395)||(124454-124761)
scaffold0011 (86-395)||(75855-76162)
scaffold0011 (189-395)||(193304-193508)
scaffold0011 (86-153)||(193515-193582)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (11-393)||(71539-71921)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (16-400)||(6453-6837)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (8-400)||(25809-26200)
scaffold0037 (13-400)||(70486-70873)
scaffold0037 (81-254)||(93527-93701)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (8-395)||(6147927-6148311)
chr3 (9-400)||(16183094-16183489)
chr3 (8-400)||(50113218-50113602)
chr3 (13-393)||(22145362-22145740)
chr3 (86-395)||(13816201-13816511)
chr3 (8-400)||(17099397-17099789)
chr3 (86-395)||(19571932-19572241)
chr3 (8-393)||(318695-319081)
chr3 (8-393)||(35122377-35122763)
chr3 (86-395)||(15860308-15860616)
chr3 (8-393)||(8630538-8630920)
chr3 (8-392)||(15469552-15469931)
chr3 (10-393)||(53899605-53899989)
chr3 (9-393)||(11198653-11199040)
chr3 (85-356)||(47786041-47786314)
chr3 (16-393)||(12350934-12351312)
chr3 (63-388)||(23491202-23491530)
chr3 (8-393)||(14297188-14297574)
chr3 (8-393)||(14302815-14303201)
chr3 (78-400)||(25057531-25057856)
chr3 (81-393)||(14294119-14294434)
chr3 (76-393)||(11062184-11062504)
chr3 (81-393)||(14299746-14300061)
chr3 (81-393)||(40938421-40938736)
chr3 (13-390)||(12562563-12562944)
chr3 (187-395)||(16819598-16819802)
chr3 (186-393)||(33340534-33340740)
chr3 (125-395)||(18909379-18909647)
chr3 (13-393)||(19945317-19945700)
chr3 (122-395)||(15574731-15575002)
chr3 (125-393)||(17957533-17957802)
chr3 (189-393)||(51159742-51159945)
chr3 (125-393)||(53769350-53769618)
chr3 (186-392)||(22273737-22273939)
chr3 (122-395)||(15613750-15614021)
chr3 (8-222)||(18909656-18909869)
chr3 (8-222)||(53769627-53769840)
chr3 (195-395)||(8269673-8269869)
chr3 (195-395)||(8276784-8276980)
chr3 (191-393)||(2048751-2048953)
chr3 (190-393)||(19230751-19230953)
chr3 (186-392)||(2450590-2450791)
chr3 (195-395)||(49230902-49231102)
chr3 (78-222)||(22274011-22274155)
chr3 (186-393)||(7852499-7852705)
chr3 (155-395)||(1468885-1469120)
chr3 (78-222)||(2450374-2450518)
chr3 (8-215)||(13837733-13837938)
chr3 (187-395)||(16745433-16745638)
chr3 (201-393)||(17913527-17913717)
chr3 (186-393)||(16259732-16259938)
chr3 (155-395)||(44228116-44228354)
chr3 (74-218)||(17957375-17957520)
chr3 (217-395)||(27839395-27839573)
chr3 (199-393)||(14522580-14522775)
chr3 (210-395)||(30152024-30152205)
chr3 (78-223)||(49231180-49231326)
chr3 (78-214)||(16819882-16820019)
chr3 (89-247)||(17937333-17937492)
chr3 (8-222)||(7852777-7852993)
chr3 (30-223)||(51159475-51159669)
chr3 (8-393)||(17138157-17138553)
chr3 (262-400)||(30205137-30205274)
chr3 (13-158)||(54423001-54423145)
chr3 (210-395)||(12265775-12265959)
chr3 (205-393)||(17523691-17523877)
chr3 (210-393)||(5227406-5227585)
chr3 (192-395)||(15939725-15939929)
chr3 (253-393)||(10737247-10737386)
chr3 (298-395)||(14846034-14846130)
chr3 (86-222)||(33340812-33340949)
chr3 (217-393)||(45859709-45859884)
chr3 (225-393)||(55315085-55315252)
chr3 (191-305)||(12031249-12031364)
chr3 (212-333)||(16935168-16935286)
chr3 (297-395)||(8305693-8305789)
chr3 (8-146)||(17523552-17523690)
chr3 (8-260)||(16260014-16260261)
chr3 (298-395)||(18905171-18905266)
chr3 (76-240)||(39654757-39654925)
chr3 (225-393)||(41268931-41269098)
chr3 (256-393)||(13976964-13977101)
chr3 (256-393)||(13956132-13956269)
chr3 (192-296)||(14843815-14843919)
chr3 (301-393)||(12951743-12951835)
chr3 (296-356)||(15874893-15874953)
chr3 (63-126)||(38167007-38167070)
chr3 (211-260)||(9303753-9303802)
chr3 (85-154)||(12031164-12031233)
chr3 (296-356)||(11330382-11330442)
chr3 (125-176)||(14522487-14522538)
chr3 (298-393)||(15516426-15516521)
chr3 (187-249)||(11883518-11883580)
chr3 (85-154)||(2048969-2049038)
chr3 (125-213)||(10737388-10737476)
chr3 (160-240)||(15516590-15516671)
chr3 (298-367)||(38812367-38812436)
chr3 (295-367)||(12490105-12490177)
chr3 (86-154)||(19230968-19231036)
chr3 (305-393)||(39654607-39654695)
chr3 (350-393)||(14287785-14287828)
chr3 (210-273)||(18897982-18898045)
chr3 (303-393)||(11883645-11883735)
chr3 (363-395)||(11813554-11813586)
chr3 (189-240)||(33370118-33370169)
chr3 (295-356)||(14060614-14060675)
chr3 (296-368)||(55442145-55442218)
chr3 (365-393)||(47786311-47786339)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (37-400)||(6232-6594)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (8-400)||(1925-2317)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (8-400)||(12826-13217)
scaffold0359 (8-249)||(161-400)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (8-400)||(36891794-36892185)
chr2 (18-393)||(22273577-22273951)
chr2 (18-393)||(22282810-22283184)
chr2 (8-393)||(4449312-4449698)
chr2 (16-395)||(8942335-8942715)
chr2 (16-395)||(12637255-12637632)
chr2 (16-393)||(6878134-6878513)
chr2 (125-393)||(8886832-8887099)
chr2 (125-393)||(22862179-22862446)
chr2 (187-393)||(25600652-25600858)
chr2 (53-393)||(27260274-27260592)
chr2 (127-395)||(12726742-12727010)
chr2 (74-395)||(20013811-20014131)
chr2 (89-393)||(22581094-22581402)
chr2 (74-395)||(14907583-14907906)
chr2 (74-395)||(23818868-23819191)
chr2 (187-395)||(34822887-34823093)
chr2 (186-395)||(21275788-21275994)
chr2 (187-395)||(3800375-3800580)
chr2 (187-395)||(5889559-5889764)
chr2 (186-394)||(24966987-24967195)
chr2 (8-222)||(21275503-21275716)
chr2 (186-392)||(19888041-19888243)
chr2 (186-392)||(21140569-21140771)
chr2 (8-222)||(12643001-12643214)
chr2 (185-374)||(25877210-25877399)
chr2 (125-393)||(12643223-12643491)
chr2 (192-392)||(43644243-43644442)
chr2 (63-393)||(24572526-24572860)
chr2 (189-395)||(461427-461631)
chr2 (125-393)||(7320179-7320450)
chr2 (187-392)||(24827831-24828034)
chr2 (8-222)||(42179342-42179555)
chr2 (78-222)||(19887825-19887969)
chr2 (155-395)||(11232484-11232719)
chr2 (89-242)||(16900207-16900361)
chr2 (89-242)||(16993598-16993752)
chr2 (155-395)||(22514331-22514566)
chr2 (189-395)||(20628662-20628863)
chr2 (78-222)||(21140843-21140987)
chr2 (8-393)||(28972732-28973118)
chr2 (155-395)||(28776932-28777167)
chr2 (63-222)||(3800036-3800195)
chr2 (63-393)||(9653983-9654296)
chr2 (148-393)||(22691175-22691419)
chr2 (148-393)||(22695822-22696066)
chr2 (210-395)||(23773226-23773407)
chr2 (210-395)||(24686954-24687135)
chr2 (211-393)||(15632088-15632269)
chr2 (76-198)||(25211866-25211988)
chr2 (13-203)||(270035-270226)
chr2 (78-223)||(34823165-34823309)
chr2 (78-223)||(12727126-12727270)
chr2 (290-393)||(269878-269981)
chr2 (225-393)||(17397894-17398061)
chr2 (8-249)||(22787108-22787351)
chr2 (298-393)||(721162-721257)
chr2 (86-153)||(20628580-20628647)
chr2 (160-249)||(721317-721407)
chr2 (295-368)||(23822894-23822967)
chr2 (295-368)||(23824838-23824911)
chr2 (295-368)||(23831973-23832046)
chr2 (295-393)||(22787408-22787506)
chr2 (295-356)||(19670515-19670576)
chr2 (217-310)||(22693040-22693133)
chr2 (217-310)||(22697687-22697780)
chr2 (125-240)||(24088566-24088683)
chr2 (298-356)||(24088752-24088810)
chr2 (295-368)||(4663-4735)
chr2 (346-395)||(22692979-22693028)
chr2 (346-395)||(22697626-22697675)
chr2 (295-368)||(24295958-24296031)
chr2 (86-154)||(461646-461714)
chr2 (177-222)||(3800257-3800302)
chr2 (295-356)||(19658678-19658739)
chr2 (125-223)||(12727020-12727118)
chr2 (86-154)||(43644158-43644226)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (8-394)||(137897-138280)
scaffold0021 (8-400)||(87127-87504)
scaffold0021 (13-393)||(10357-10740)
scaffold0021 (345-400)||(77069-77124)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (18-393)||(32287-32660)
scaffold0184 (289-400)||(34037-34147)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (18-393)||(40184-40557)
scaffold0078 (186-400)||(38594-38807)
scaffold0078 (74-222)||(38372-38522)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (53-393)||(7485-7827)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (95-393)||(8125-8424)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (15-393)||(3318-3695)
scaffold0447 (15-69)||(8256-8309)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (15-393)||(5926-6303)
scaffold0383 (78-260)||(1336-1518)
scaffold0383 (187-393)||(1057-1262)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (52-393)||(7781-8123)
scaffold0195 (52-393)||(13170-13512)
scaffold0195 (125-393)||(20084-20351)
scaffold0195 (125-393)||(18000-18267)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (53-393)||(3352-3692)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (27-393)||(21351-21696)
scaffold0008 (192-393)||(129466-129668)
scaffold0008 (95-156)||(129390-129451)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (8-393)||(12891-13275)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (10-393)||(46819-47201)
scaffold0068 (10-393)||(60267-60649)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (8-370)||(44513-44875)
scaffold0034 (113-393)||(38903-39184)
scaffold0034 (82-395)||(78242-78558)
scaffold0034 (8-223)||(39178-39392)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (74-320)||(20446-20692)
scaffold0039 (366-395)||(20686-20715)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (8-393)||(52361-52743)
scaffold0018 (8-393)||(56313-56695)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (13-390)||(13283-13660)
scaffold0396 (217-395)||(16133-16311)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (8-393)||(236874-237261)
scaffold0009 (187-393)||(270813-271020)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (16-390)||(505-861)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (86-385)||(5770-6069)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (189-395)||(28575-28780)
scaffold0116 (13-260)||(28857-29104)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (78-393)||(27714-28028)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (8-395)||(14350-14734)
scaffold0138 (189-320)||(28261-28394)
scaffold0138 (189-320)||(40257-40390)
scaffold0138 (187-260)||(28472-28545)
scaffold0138 (187-260)||(40468-40541)
scaffold0138 (295-356)||(23801-23862)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (125-400)||(15064-15338)
scaffold0251 (8-222)||(14842-15055)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (63-393)||(54330-54653)
scaffold0032 (186-395)||(109344-109552)
scaffold0032 (82-135)||(14590-14645)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (63-393)||(11062-11394)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (177-395)||(18831-19049)
scaffold0234 (8-260)||(18510-18767)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (129-393)||(32275-32541)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (153-400)||(14364-14613)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (187-400)||(95006-95219)
scaffold0044 (8-260)||(95294-95545)
scaffold0044 (229-393)||(66745-66907)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (125-393)||(248741-249008)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (57-255)||(2925-3124)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (186-392)||(155618-155821)
scaffold0023 (78-222)||(155402-155546)
scaffold0023 (210-395)||(732-913)
scaffold0023 (254-395)||(35024-35163)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (9-320)||(17485-17797)
scaffold0244 (8-320)||(23903-24216)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (74-395)||(2723-3044)
scaffold0124 (160-393)||(22940-23168)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (177-393)||(145223-145438)
scaffold0025 (8-260)||(145502-145757)
scaffold0025 (190-393)||(147482-147685)
scaffold0025 (85-156)||(147698-147769)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (186-395)||(90147-90352)
scaffold0028 (187-395)||(129076-129281)
scaffold0028 (8-223)||(129353-129568)
scaffold0028 (86-222)||(89938-90075)
scaffold0028 (295-356)||(78410-78471)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (192-395)||(4531-4734)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (187-393)||(17340-17545)
scaffold0315 (78-222)||(17618-17764)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (187-386)||(2395-2593)
scaffold0597 (63-218)||(2162-2319)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (192-395)||(27781-27982)
scaffold0162 (86-154)||(27696-27763)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (82-393)||(154-467)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (74-395)||(25592-25915)
scaffold0141 (74-395)||(21337-21660)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-393)||(145621-146005)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (186-392)||(5874-6076)
scaffold0003 (191-393)||(217016-217218)
scaffold0003 (78-222)||(6148-6292)
scaffold0003 (86-154)||(216932-217000)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (189-395)||(1874-2078)
scaffold1140 (86-153)||(2085-2152)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (189-395)||(6415-6619)
scaffold0218 (86-154)||(6332-6400)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (207-393)||(8771-8957)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (191-395)||(2958-3162)
scaffold0761 (82-222)||(2740-2882)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (194-395)||(245-446)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-241)||(43051-43275)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (17-249)||(113652-113883)
scaffold0022 (8-393)||(108343-108739)
scaffold0022 (217-395)||(6441-6619)
scaffold0022 (295-368)||(106297-106370)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (187-393)||(41399-41605)
scaffold0132 (162-222)||(41677-41737)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (82-260)||(164-345)
scaffold1734 (189-273)||(1-86)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (155-395)||(37978-38213)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (190-393)||(40291-40487)
scaffold0106 (97-154)||(40502-40559)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (205-395)||(69456-69646)
scaffold0031 (205-393)||(30768-30957)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (29-260)||(23898-24128)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (76-393)||(6575-6906)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (63-222)||(1507-1666)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (187-393)||(1889-2095)
scaffold0610 (52-119)||(1817-1884)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (210-395)||(30042-30223)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (147-330)||(29942-30127)
scaffold0120 (8-156)||(18263-18410)
scaffold0120 (324-400)||(27260-27336)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (11-240)||(754-984)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (8-393)||(2540-2937)
[»] scaffold0269 (5 HSPs)
scaffold0269 (82-222)||(935-1077)
scaffold0269 (82-222)||(15191-15333)
scaffold0269 (283-393)||(771-880)
scaffold0269 (283-393)||(15027-15136)
scaffold0269 (8-117)||(12021-12129)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (160-393)||(6577-6805)
scaffold0750 (14-174)||(5515-5676)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (217-395)||(106690-106867)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (186-395)||(17353-17560)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (192-393)||(7673-7875)
scaffold0498 (86-156)||(7890-7960)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (210-393)||(11322-11504)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (190-393)||(4862-5067)
scaffold0266 (95-156)||(4788-4849)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (217-387)||(51728-51897)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (245-392)||(4823-4970)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (76-390)||(2114-2442)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (268-385)||(58899-59016)
scaffold0051 (134-247)||(59561-59675)
scaffold0051 (225-272)||(59375-59422)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (125-222)||(1575-1672)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (189-320)||(34334-34466)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (217-395)||(1078-1262)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (210-380)||(5700-5867)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (289-395)||(9291-9396)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (310-395)||(14988-15073)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (194-393)||(20391-20600)
scaffold0150 (194-393)||(27220-27429)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (266-393)||(4092-4218)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (266-393)||(48932-49058)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (279-393)||(4534-4648)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (8-142)||(53462-53593)
scaffold0066 (187-249)||(53141-53203)
scaffold0066 (211-260)||(53279-53328)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (302-393)||(197482-197572)
scaffold0004 (82-137)||(330964-331021)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (252-388)||(4469-4603)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (295-368)||(4728-4801)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (295-368)||(7041-7114)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (296-393)||(7290-7387)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (295-368)||(71655-71728)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (295-367)||(3667-3739)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (194-249)||(429-484)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (298-393)||(6021-6116)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (357-395)||(992-1030)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (295-356)||(4759-4820)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (295-367)||(117977-118049)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (125-246)||(23663-23786)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (295-345)||(12936-12986)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (296-355)||(78206-78265)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (186-236)||(6400-6450)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (298-356)||(34203-34261)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (217-281)||(2696-2761)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 444
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821646
Alignment:
Q  7 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtga 821393  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821394 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 821493  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg---------------attgttgtcgcattatcgag 391  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||    
T  821494 gcaaatgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcgtatatattgaggtgaaaattgtggaggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgag 821593  T
Q  392 tcctcgtacgagtcctttattatannnnnnnggtaattcaatagccttattat 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  821594 tccttgtacgagtcctttattatctttttttggtaattcaatagccttattat 821646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054612
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaagctaaatgtaat 44054798  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 44054698  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44054697 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 44054612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33738948
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaagctatatgtgat 33739141  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 33739041  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33739040 caaatgttttggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 33738948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460432
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgagat 45460238  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatttaattgtgtacggacatgttttcttgataat 45460338  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  45460339 gcaaatgttgtagagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtac 45460432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521479
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 16521665  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16521664 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 16521565  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16521564 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16521479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901240
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 12901051  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12901052 gatagttgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgata 12901151  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901152 atgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 12901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345510
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgttgaaactatatgtgat 44345704  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgatttcttgataat 44345604  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44345603 gcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 44345510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120589
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 25120413  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25120414 tgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 25120513  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25120514 tggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 25120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21961036
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 21960855  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21960856 atgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 21960955  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||||| || |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21960956 gatgtggagatgatcaatataatcaagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 21961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233998
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggcgaaactatatgag 30233823  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30233824 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgtggtgatgatgaatcttataatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 30233923  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgt 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30233924 atgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10642875
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataac 10643046  T
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10643045 attgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagat 10642947  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642946 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 10642875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119731
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtga 54119553  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  54119554 tagttgatgtggaatgacattgttgat----------catgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 54119643  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54119644 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 54119731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999216
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    |||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19999447 ttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 19999349  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    |||||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19999348 ggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagg 19999252  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19999251 ttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 19999216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245140
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 13245349  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  13245348 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattgtgt 13245249  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13245248 gtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 13245151  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  13245150 tatcgagtcct 13245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 78 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14994888
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| |    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat 14995103  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatga 273  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14995102 ga-gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatga 14995004  T
Q  274 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggat 373  Q
     ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14995003 tttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatctatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggat 14994907  T
Q  374 tgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14994906 tgttgtcgcattatcgagt 14994888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5684088
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 53706054 - 53706260
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||     
T  53706054 tggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgg 53706153  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  53706154 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatc 53706253  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  53706254 gagtcct 53706260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 202 - 393
Target Start/End: Original strand, 53909047 - 53909238
Alignment:
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || |||||||||||||    
T  53909047 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttg 53909146  T
Q  302 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909147 ataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 53909238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271342
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtt 23271210  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  23271211 gatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatgatgaatactacgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgc-aa 23271309  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 344  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  23271310 tgttgtgaagataattaatataattgaatgttg 23271342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487359
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 10487583  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10487582 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 10487484  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  10487483 tatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 10487385  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  10487384 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 10487359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 400
Target Start/End: Original strand, 7133711 - 7133924
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  7133711 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 7133810  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  7133811 ggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcatta 7133910  T
Q  387 tcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||| ||||    
T  7133911 tcgagtccttgtac 7133924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18167686 - 18167482
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  18167686 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgt 18167589  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  18167588 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 18167491  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  18167490 tcgagtcct 18167482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329392
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 16329168  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16329169 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 16329267  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  16329268 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 16329366  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  16329367 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 16329392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9294419 - 9294213
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  9294419 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 9294320  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9294319 gagcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 9294222  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  9294221 tcgagtcct 9294213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110171
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggca 110272  T
Q  292 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 391  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  110271 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 110173  T
Q  392 tc 393  Q
    ||    
T  110172 tc 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 15288271 - 15288478
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15288271 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 15288370  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  15288371 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcatt 15288468  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  15288469 atcgagtcct 15288478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 15273958 - 15274226
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15273958 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15274056  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  15274057 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 15274155  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15274156 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 15274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273949
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15273934  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15273935 agttgatgttgaatg 15273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 187 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8373249 - 8373041
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8373249 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 8373150  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8373149 gggcatgttctcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 8373051  T
Q  387 tcgagtcctc 396  Q
    ||||||||||    
T  8373050 tcgagtcctc 8373041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 201 - 393
Target Start/End: Original strand, 8873770 - 8873961
Alignment:
Q  201 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  8873770 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtatgggcatgttttctt 8873869  T
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8873870 gataatgcaaattttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 8873961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14950914 - 14950708
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||  || |    
T  14950914 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattttgtgt 14950815  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  14950814 gggcatgttttcttgataatgc-aatattgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 14950717  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  14950716 tcgagtcct 14950708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 22355826 - 22356032
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  22355826 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 22355925  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||    
T  22355926 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataaccaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaactgttgtcgcatta 22356023  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  22356024 tcgagtcct 22356032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 15295381 - 15295588
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15295381 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 15295480  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  15295481 tgggcatgttttcttgagaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcatt 15295578  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  15295579 atcgagtcct 15295588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18247083 - 18246881
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  18247083 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 18246986  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  || ||||||||||    
T  18246985 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgattttttgtcgcatt 18246888  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  18246887 atcgagt 18246881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34393948 - 34393744
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  34393948 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 34393849  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34393848 gacatgttttcttgataaagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattat 34393750  T
Q  388 cgagtc 393  Q
    ||||||    
T  34393749 cgagtc 34393744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47356214 - 47356014
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||    
T  47356214 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggaatg 47356115  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47356114 ttttcttgataatgcaa-taatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 47356016  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  47356015 ct 47356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247155
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 18247200  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247199 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 18247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495875
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatg 18495703  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18495704 acattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgggtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtgaag 18495803  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18495804 atgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggaaagatgtcgcattatcgagtc 18495875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 393
Target Start/End: Original strand, 5684153 - 5684370
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgag 274  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||     
T  5684153 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgat 5684252  T
Q  275 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 374  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  5684253 ttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgt-gatt 5684351  T
Q  375 gttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5684352 gttgtcgcattatcgagtc 5684370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26338355 - 26338174
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  26338355 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 26338259  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26338258 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 26338174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133631
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133579 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15212239 - 15212032
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| ||    
T  15212239 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgt 15212140  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||    
T  15212139 gtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgt-aattgttgtcgcat 15212041  T
Q  385 tatcgagtc 393  Q
    |||||||||    
T  15212040 tatcgagtc 15212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294491
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 9294539  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294538 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatga 9294491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294354
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcgtgaaactatatgt 18294298  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18294299 gatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698657
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19698641  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19698642 atagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709242
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19709226  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  19709227 atagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679002
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679052 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 26679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212413
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 15212424  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  15212423 atgttgaatga 15212413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167766
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 18167804  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167803 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355754
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355704 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 22355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26678929 - 26678733
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| | | ||| ||||    
T  26678929 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattgtgtat 26678830  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||          |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  26678829 gggcatgt----------atgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcatta 26678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13811098
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| | | |||||||||||||||  ||| |||||| || | ||| ||| |  | ||||     
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaattatctcaggtagtg 13810906  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||   ||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||    
T  13810907 gatgttgaatgacgttgttgattgttgatgatcatgttgatgatgtaataaagaatcatatttgaattatgatttggttgtgtatggacatgatttcttg 13811006  T
Q  302 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  13811007 ataatggaattgttgtggaaataatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtaatgtcgcattatcgagtc 13811098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Original strand, 13049455 - 13049630
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13049455 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 13049553  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13049554 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377873
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatacgtgatagtt 55377871  T
Q  212 ga 213  Q
    ||    
T  55377872 ga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 18294418 - 18294580
Alignment:
Q  177 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagt 275  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||  ||||| |    
T  18294418 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgt-----ggtgatgatgaatgttatgatt 18294512  T
Q  276 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 343  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||    
T  18294513 taattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtt 18294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8044153 - 8044021
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  8044153 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 8044054  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8044053 gacatgttttcttgataatgcaaatgatgtgga 8044021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251232
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagga 18251202  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18251203 atgtttgaatagtgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212311
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttg 15212321  T
Q  213 atgttgaatg 222  Q
    ||||||||||    
T  15212320 atgttgaatg 15212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288198
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatttgatagttgatgtttaatg 15288198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295308
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 15295308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34394156 - 34394020
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34394156 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 34394058  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34394057 acattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18110038
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 159  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| || | || | |      
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatgagatattgttttccc 18109937  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18109938 tattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 18110036  T
Q  259 tg 260  Q
    ||    
T  18110037 tg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  129 atatgatgtttatc 142  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Original strand, 43282757 - 43282855
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  43282757 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 43282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Original strand, 52266840 - 52266938
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  52266840 tttcttgataatgcaattgttgtagagatgatcaatatatttggaagttatcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 52266938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 393
Target Start/End: Original strand, 13751694 - 13751762
Alignment:
Q  325 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13751694 atcaatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 13751762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212552
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaat 15212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 15852696 - 15852769
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15852696 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 15852769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19019439 - 19019390
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19019439 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8373415 - 8373321
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373415 atatgatatttatcatgagatgttgttttctctcttacttggaatatga-gaatgctggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8373478 - 8373431
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8373478 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15043721 - 15043631
Alignment:
Q  303 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15043721 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15043631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 393
Target Start/End: Original strand, 15110703 - 15110793
Alignment:
Q  303 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15110703 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15110793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356297
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgat 47356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27959820 - 27959759
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27959820 tttcttgataatgcaaacgtagtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 27959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 34197544 - 34197605
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34197544 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaccaatatatttggaagttgtcctttatattg 34197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 18110114 - 18110176
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 248  Q
    ||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18110114 gaatggttaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgt 18110176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Original strand, 37958436 - 37958489
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37958436 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcct 37958489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 41167314 - 41167375
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| | |||||||    
T  41167314 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcatttatattg 41167375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15043898 - 15043789
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||| |||| | |  |||| ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  15043898 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15043799  T
Q  227 tgttgattat 236  Q
    || |||||||    
T  15043798 tgatgattat 15043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Original strand, 15110526 - 15110635
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||| |||| | |  |||| ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  15110526 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15110625  T
Q  227 tgttgattat 236  Q
    || |||||||    
T  15110626 tgatgattat 15110635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 41257728 - 41257797
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  41257728 cttgataatgcaattgtggttgagatgatcaatataattggaagttatcctttatattgttgtgaaaatt 41257797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15212633 - 15212605
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212633 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 15212605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407676
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatag 22407485  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 22407585  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22407586 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtac 22407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966331
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49966617 tga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 49966519  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49966518 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtttatggacatgttttcttgataatgcaaat 49966419  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49966418 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 49966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506044
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18506224  T
Q  215 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  18506223 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttacttgtgtgtgggcat-ttttcttgataatgctaatgt 18506125  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18506124 tgcggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 18506044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422445
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 2422263  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2422264 gatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 2422363  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422364 tgtggtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 2422445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 393
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036373
Alignment:
Q  42 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  142 catgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttact-agaatataaggaatg-ttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 44036221  T
Q  241 aatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggat 340  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |    
T  44036222 aatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggt 44036321  T
Q  341 gttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44036322 gttgtcctatacattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 44036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 395
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862907
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15862692 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttg 15862791  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
     ||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  15862792 attgtgtgtgggcatgtttccttgataatgc-aatgttgtggagatattcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgtt 15862889  T
Q  378 gtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15862890 gtcgcattatcgagtcct 15862907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210733
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtga 41210922  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  41210921 tagttggcgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttgataat 41210822  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41210821 gcaaatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 41210733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21716895
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagtt 21717074  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21717073 gatgttgaatgacattgttg---attgataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgtttttttgataatgcaaa 21716977  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21716976 tgttgtggagatgagcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 21716895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053532
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  115 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagtt 35053711  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35053710 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 35053613  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35053612 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagtc 35053532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523894
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||     
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaaccatatga 35523706  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  35523707 gataaatgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgcgtatggacatgttttcttgata 35523805  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35523806 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 35523894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5676074
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 5675888  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||  |||   |||||||||||||||||    
T  5675889 tagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatgaattgattgtatatagacatgttttcttgataat 5675988  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5675989 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5676074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 395
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250429
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 22250211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagt 275  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  22250212 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatt 22250310  T
Q  276 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 375  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  22250311 taattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgt-gattg 22250409  T
Q  376 ttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22250410 ttgtcgcattatcgagtcct 22250429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147469
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17147701 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 17147603  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17147602 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 17147505  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17147504 ttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcct 17147469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218143
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtga 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtga 41218343  T
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg-ttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 292  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41218342 aactatatgtgattgttgatgtagaataacaatgattgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgagcat 41218243  T
Q  293 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41218242 gttttcttgataatgcaaataatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagt 41218144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 123 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858246
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21858417  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21858416 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggag 21858317  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21858316 gtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 21858246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 112 - 395
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20895168
Alignment:
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagt 20894985  T
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20894986 tgatgt-gaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 20895084  T
Q  311 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20895085 -tgttgtggagataatcaatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtcct 20895168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353097
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22353179 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 22353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365442
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-g 22365659  T
Q  179 aatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||    
T  22365658 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgattt 22365560  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  22365559 aattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgt 22365461  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22365460 tgtcgcattatcgagtcct 22365442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050371
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 45050544  T
Q  221 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  45050543 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 45050445  T
Q  321 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45050444 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 45050371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 20826428 - 20826696
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20826428 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 20826526  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  20826527 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 20826625  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20826626 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 20826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826419
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 20826404  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  20826405 agttgatgttgaatg 20826419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845939
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatggg 37845836  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37845837 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 37845935  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  37845936 agtc 37845939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 395
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7642067
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat-gctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  7641901 attgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggtatgttttcttgataatac-aatgttgtggagatc 7641997  T
Q  325 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641998 atcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 7642067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657798
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatat 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaatgtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatat 51657597  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcat 292  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||    
T  51657598 gaggtggttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacat 51657697  T
Q  293 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  51657698 gatttcatgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgttgcattatcgagt 51657797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22353015 - 22352815
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  22353015 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 22352916  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22352915 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtc 22352817  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  22352816 ct 22352815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451300
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 51451524  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |    
T  51451523 aatatga-gaatgcatgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgc 51451425  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  51451424 tatgatttaattgtttatgggcatgttctcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 51451326  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  51451325 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 51451300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785707
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 9785528  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  9785529 tagttgatgttgaataacattgttga-------taatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgtgcatgctttcttgataat 9785621  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| |  | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9785622 gcaaatgatgtggagaggaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9785707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444442
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20444539  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20444538 catgttttcttgataatgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20444442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530207
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20530304  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20530303 catgttttcttgataatgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20530207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526808
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20526911  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20526910 catgtcttcttgataatgtaaatcatgtggagatgaacaatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgt-gattgttgtcgcattatcg 20526812  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  20526811 agtc 20526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 18060885 - 18061084
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  18060885 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 18060984  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18060985 tttccttggtaatgc-aatgttgtggatataatcaatataattgggtgtagtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 18061082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331088
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 27331056  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattatt 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27331057 atagttaatgttgaatgacattgttgattatt 27331088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17003747 - 17003512
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17003747 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 17003650  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    || |||| ||||| |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17003649 tgggatgatgaattctatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 17003553  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17003552 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 17003512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22034717 - 22034536
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22034717 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22034621  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22034620 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 22034536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20930367 - 20930163
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | ||| |||||    
T  20930367 ggtgaaactatatgtgatagttgatgaatgaaggaccttattgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgattttaattgtgtatg 20930268  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20930267 agcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattat 20930169  T
Q  388 cgagtc 393  Q
    ||||||    
T  20930168 cgagtc 20930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 21651228 - 21651411
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||     
T  21651228 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgcatgggcatgttgtcttgataatgc- 21651326  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21651327 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcct 21651411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41393346 - 41393139
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  || ||     
T  41393346 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaactgtgtg 41393247  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  41393246 tagacatgtttccttgataatgc-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 41393149  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  41393148 atcgagtcct 41393139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22029566 - 22029384
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22029566 ttgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22029470  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22029469 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 22029384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22226846 - 22226668
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22226846 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 22226748  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22226747 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 22226668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Original strand, 18602351 - 18602518
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  18602351 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 18602449  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18602450 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 18602518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Original strand, 5073608 - 5073775
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5073608 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 5073706  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  5073707 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattggtgtcgcattatcgagtc 5073775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956278
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaat 20956226  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20956227 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 358
Target Start/End: Original strand, 20121965 - 20122098
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20121965 attgttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgaggaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 20122063  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20122064 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 20122098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Original strand, 22031007 - 22031078
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22031007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttatttg 22031078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 38034997 - 38035070
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  38034997 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 38035070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Original strand, 22836628 - 22836723
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  22836628 cttggtaatgcaattgttgtggaaatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattatgaggtgatgtcgcattatcgagtc 22836723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27673641 - 27673543
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  27673641 tttcttgataatacaattgttttggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtggtgtcgcattatcgagtc 27673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20253295 - 20253246
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20253295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 36357713 - 36357786
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36357713 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 36357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Original strand, 20956341 - 20956416
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20956341 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 20956416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 249
Target Start/End: Original strand, 22836478 - 22836568
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  22836478 tcttacttagaatgtgagaaacacttgaaatggaaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgtt 22836568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19601972 - 19601911
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19601972 tttcttgacaatgcaaatgttgtggagatcatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 37235336 - 37235405
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  37235336 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttaaattgttgtgaaaatt 37235405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27673740 - 27673692
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27673740 tgaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatatggttgattattgat 27673692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Original strand, 5471758 - 5471816
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5471758 cttgataatgcaattgtggtggaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 5471816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 367
Target Start/End: Original strand, 8539328 - 8539396
Alignment:
Q  299 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8539328 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 367
Target Start/End: Original strand, 8604567 - 8604635
Alignment:
Q  299 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8604567 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121227
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagttg 25121415  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25121414 atgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 25121315  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25121314 gttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 25121227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994626
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 19994432  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 19994532  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    | |||||   |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19994533 gtaaatgaaatggagataatcaatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 19994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 400
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322909
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccacatgtgatagttgatg 22322724  T
Q  216 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22322725 ttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttaataatgc-aatgt 22322823  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22322824 tgtggaggtaatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtac 22322909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29758984
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 29759160  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29759159 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 29759060  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759059 tggagatgaacaacataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 29758984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 86 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245348
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgctt 41245563  T
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||  ||| |||    
T  41245562 gaatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatgaattgattgtgta 41245463  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245462 tggacatgttttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 41245363  T
Q  386 atcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| ||||    
T  41245362 atcgagtccttgtac 41245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718886
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 172  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| ||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaat 24718663  T
Q  173 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactat 271  Q
     | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24718664 atga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactat 24718762  T
Q  272 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 371  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24718763 gatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtgg 24718862  T
Q  372 attgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  24718863 attgttgtcacattatcgagtcct 24718886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610059
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatcggtgaatctatatgtga 37610246  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  37610245 tagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataa 37610146  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37610145 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37610059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 393
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648906
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg-- 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacat 20648739  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20648740 tgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgggtatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 20648839  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20648840 caatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 20648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43375050
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 43374881  T
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  43374882 attgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagata 43374979  T
Q  325 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374980 atcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 43375050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480365
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaattatatgt 20480550  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || |||||  ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| |||    
T  20480549 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgttatgatttaattgtgtatagacatgttttctttata 20480452  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20480451 atgcaaatgttgtggagatgaacaatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaa-tgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655491
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20655258 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgat 20655357  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  20655358 gatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtgg 20655457  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20655458 tgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 20655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3433043
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtg 3432855  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3432856 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataa 3432955  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3432956 tgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 3433043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24387175
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    ||||||||  |||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24386943 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaat 24387042  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24387043 gatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatacaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgg 24387142  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24387143 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24387175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874406
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  16874174 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 16874272  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16874273 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 16874370  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874371 ttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 16874406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16416952
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttaggatgtaagaaa 16417167  T
Q  181 tacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttat 278  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||     
T  16417166 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaa 16417067  T
Q  279 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 378  Q
    ||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16417066 ttgtgcgtggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattg 16416967  T
Q  379 tcgcattatcgagtc 393  Q
    || ||||||||||||    
T  16416966 tcacattatcgagtc 16416952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21679894
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 21680111  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  21680110 aatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgattt 21680011  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
      ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21680010 cattgtgtatggacatgttctcttgataatgcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgt 21679911  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||    
T  21679910 tgtcgcattatcgagtc 21679894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568734
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20568553  T
Q  214 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20568554 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaat 20568653  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568654 gttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20568734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574927
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  116 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    || |||||||  |  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20574746  T
Q  214 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20574747 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaat 20574846  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574847 gttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20574927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 395
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007947
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatat-ga 22007736  T
Q  178 gaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagt 275  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  22007737 gaatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg-------ttgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaattctatgatt 22007828  T
Q  276 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 375  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22007829 taattgtgtatgggaatgttttcttgataatgc-aatgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattg 22007927  T
Q  376 ttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22007928 ttgtcgcattatcgagtcct 22007947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696253
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||      
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatataa 21696443  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||  ||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21696442 ggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgcgataatgaatcttatgatttgtttgtgtatgggcatattttcttgat 21696343  T
Q  304 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21696342 aatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaatactgtggattgatgttgcattatcgagtc 21696253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 6775492 - 6775700
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6775492 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 6775591  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||    
T  6775592 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcatt 6775690  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  6775691 atcgagtcct 6775700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5236884
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 5237108  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  5237107 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 5237009  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  5237008 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 5236910  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  5236909 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 5236884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662714
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 24662490  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24662491 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 24662589  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  24662590 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 24662688  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  24662689 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 24662714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24547910
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 24548083  T
Q  221 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  24548082 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 24547984  T
Q  321 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24547983 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 24547910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 22908745 - 22908952
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |    
T  22908745 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttg--t 22908842  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22908843 atgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcat 22908941  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  22908942 tatcgagtcct 22908952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 24930375 - 24930582
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  24930375 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 24930474  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24930475 gggacatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcatt 24930574  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  24930575 atcgagtc 24930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224630
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 224529  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  224530 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 224628  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  224629 ct 224630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 700843 - 701043
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  700843 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 700942  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  700943 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 701041  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  701042 ct 701043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738253
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 738152  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  738153 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 738251  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  738252 ct 738253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 861948 - 862148
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 862047  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  862048 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 862146  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  862147 ct 862148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Original strand, 24107848 - 24108050
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||     
T  24107848 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtac 24107947  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  24107948 gggcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgg--tgttgtcgcatta 24108044  T
Q  387 tcgagt 392  Q
    ||||||    
T  24108045 tcgagt 24108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 13663905 - 13664104
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  13663905 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 13664003  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664004 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 13664102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 13723180 - 13723379
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  13723180 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 13723278  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723279 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 13723377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 393
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730931
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgt 17730711  T
Q  175 aaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatg 272  Q
    ||  |||  ||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||  ||||    
T  17730712 aagaaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatg 17730811  T
Q  273 agttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga 372  Q
    | ||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||     
T  17730812 atttgattgtgtatggacatgttttcttgttaatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtgg-gaaaattgtggg 17730910  T
Q  373 ttgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     || |||||||||||||||||    
T  17730911 gtgatgtcgcattatcgagtc 17730931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684343
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 43684567  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  43684566 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 43684468  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  43684467 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 43684369  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  43684368 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 43684343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 272435 - 272670
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  272435 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 272532  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272533 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 272629  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  272630 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 272670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 643414 - 643179
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  643414 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 643317  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  643316 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 643220  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  643219 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 643179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 829220 - 828985
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  829220 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 829123  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  829122 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 829026  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  829025 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 828985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 391
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195202
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || | ||| | |||     
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgg 16195100  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16195101 gcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 16195199  T
Q  389 gag 391  Q
    |||    
T  16195200 gag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107775
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 24107728  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107729 aggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 24107775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270429
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    |||||||       |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  270587 tgttgat-------aatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaa 270495  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270494 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645491
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    ||||||       ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  645333 tgttga-------taatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgagatgaa 645425  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  645426 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 393
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831226
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    ||||||       ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  831068 tgttga-------taatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaa 831160  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  831161 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 831226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836562
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 28836605  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836604 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 28836562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663823
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaa 13663734  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||| |  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13663735 tgtgagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13663823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 22089729 - 22089910
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22089729 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22089825  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22089826 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 22089910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042424
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  113 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | | || |||||| |||| | ||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatgaa--atgcttgaattggtgaaactatatgtgata 16042318  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16042319 gttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatg 16042418  T
Q  308 caaatg 313  Q
    ||||||    
T  16042419 caaatg 16042424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611377
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 18611393  T
Q  206 atagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  18611392 atagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722358
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtg 13722273  T
Q  176 aagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722274 agaaatgcttgaattagtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 15320345 - 15320526
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15320345 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15320441  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15320442 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 15320526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 15500714 - 15500895
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15500714 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15500810  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15500811 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 15500895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532341
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 159  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttc 38532586  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtg 257  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  38532585 tcttacttataatgtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtg 38532486  T
Q  258 atggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 348  Q
    ||  |||||         ||||| | ||  ||| |||||   ||| ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38532485 ataatgaatcttatttgaactataacttgattgtgtatggatatgatttcttgataatataattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcct 38532386  T
Q  349 atatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||| |||  |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  38532385 ttatattgtggtagaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 38532341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908673
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22908631  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22908632 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatggtgaatg 22908673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28836490 - 28836353
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  28836490 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 28836393  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28836392 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataat 28836353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 24930259  T
Q  180 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930260 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24930302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28543826 - 28543628
Alignment:
Q  193 gaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 292  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| |||    
T  28543826 gaaactatatggaataattaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgaacat 28543729  T
Q  293 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28543728 gttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatgtggaagttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagt 28543629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 16040621 - 16040748
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  16040621 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 16040720  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatg 313  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16040721 tggacatgttttcttgagaatgcaaatg 16040748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Original strand, 16675624 - 16675791
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  16675624 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 16675722  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16675723 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16675791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 229 - 393
Target Start/End: Original strand, 21853199 - 21853361
Alignment:
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 328  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21853199 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 21853297  T
Q  329 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21853298 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgctgtcgcattatcgagtc 21853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37605783 - 37605685
Alignment:
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37605783 ttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 393
Target Start/End: Original strand, 21845794 - 21845956
Alignment:
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 328  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||    
T  21845794 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgttgataatca 21845892  T
Q  329 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21845893 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 21845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Original strand, 6775326 - 6775420
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6775326 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 6775420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  174 taaagaatacttg-aatggtgaaact 198  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 13722433 - 13722506
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722433 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 13722581 - 13722654
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722581 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 13722729 - 13722802
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722729 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 13722877 - 13722950
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722877 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 13723025 - 13723098
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13723025 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13723098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040549
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatg 16040530  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16040531 tgatagttgatgttgaatg 16040549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Original strand, 18768135 - 18768233
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  18768135 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgataaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 18768233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 393
Target Start/End: Original strand, 16203739 - 16203804
Alignment:
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16203739 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 39448198 - 39448271
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39448198 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 39448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 17151399 - 17151445
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151399 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18618187 - 18618138
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18618187 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 21199547 - 21199608
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21199547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 21199608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 31195658 - 31195719
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31195658 tttcttgataatgcaaatgttgcggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 31195719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 231
Target Start/End: Original strand, 17151521 - 17151561
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151521 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 17151561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224348
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 224348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700761
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 700761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737971
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 737971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861866
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 17151288 - 17151335
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17151288 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18618062 - 18618028
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618062 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  46 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 143  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  144 tgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23148682 - 23148624
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23148682 cttgataatgcaaatgttgttgaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 23148624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 21192120 - 21192181
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  21192120 tttcttgataatacaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 21192181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Original strand, 22737250 - 22737349
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  22737250 tttcttggtaatgcatttgtggtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatatggtggtgaaaattgttgaggtgatgtcacattatcgagtc 22737349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 37654901 - 37654952
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37654901 tggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 37654952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23836008 - 23835950
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  23836008 cttgataatgcaattgttgaggaaatgatcaatatatttggaagttttcctttatattg 23835950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21392874
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaatggtgaaactatatgtgat 21393067  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 21392967  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21392966 caaatgttgtggagataatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtac 21392874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652877
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  110 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatacgtga 21652683  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21652684 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgaacatgttttcttgataat 21652783  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21652784 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 21652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20710823
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 20711017  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20711016 ataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataa 20710918  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20710917 tgcgaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 20710823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258286
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 28258472  T
Q  216 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28258471 ttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatg 28258373  T
Q  314 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28258372 ttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtac 28258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 78 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16534999
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 277  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16535213 aaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttg 16535114  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
     |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16535113 attgtatatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgtt 16535015  T
Q  378 gtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16535014 gtcgcattatcaagtc 16534999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510676
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacatt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatgattgaatagcatt 23510846  T
Q  228 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 327  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||| || ||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23510845 gttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgatttaattgcatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatc 23510749  T
Q  328 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23510748 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 23510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184681
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||     
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 24184492  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  24184493 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgata 24184592  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24184593 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtc 24184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4863961
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 4864147  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4864146 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataa 4864047  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4864046 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagt 4863961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11582774 - 11582565
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11582774 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 11582675  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582674 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 11582575  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  11582574 atcgagtcct 11582565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 395
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884770
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatat-ga 22884552  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagt 275  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatt 22884651  T
Q  276 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 375  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  22884652 tatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattg 22884750  T
Q  376 ttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22884751 ttgtcgcattatcgagtcct 22884770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404273
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 19404490  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  19404489 aatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgattt 19404390  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19404389 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgt 19404290  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||    
T  19404289 tgtcgcattatcgagtc 19404273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649523
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    ||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21649755 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaat 21649656  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  21649655 gatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtgg 21649556  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21649555 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 21649523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 1169923 - 1170129
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1169923 aatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtat 1170022  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1170023 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgtta 1170122  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  1170123 tcgagtc 1170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 83 - 393
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338334
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttat 278  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||      
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatttga 11338220  T
Q  279 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 378  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11338221 ttatgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatgga-attgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatg 11338319  T
Q  379 tcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||    
T  11338320 tcgcattatcgagtc 11338334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169848
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 1169800  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1169801 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11341597 - 11341327
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11341597 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 11341498  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11341497 acattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggaga 11341399  T
Q  323 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11341398 taatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattattgagtcct 11341327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 1221112 - 1221318
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  1221112 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 1221209  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  1221210 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcatt 1221308  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  1221309 atcgagtcct 1221318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 22367865 - 22368071
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  22367865 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 22367962  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  22367963 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 22368061  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  22368062 atcgagtcct 22368071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7424575 - 7424368
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7424575 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 7424476  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  7424475 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 7424378  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  7424377 atcgagtcct 7424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 17473150 - 17473359
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  17473150 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 17473249  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17473250 taagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 17473349  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  17473350 atcgagtcct 17473359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453641
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  106 gtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| ||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23453836  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 300  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||    
T  23453835 tgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttctt 23453736  T
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23453735 gataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtcct 23453641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465146
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  106 gtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata 201  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| ||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23465341  T
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 300  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||    
T  23465340 tgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttctt 23465241  T
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23465240 gataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtcct 23465146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234993
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 21234769  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21234770 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 21234868  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  21234869 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 21234967  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  21234968 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 21234993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 21074870 - 21075076
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21074870 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21074967  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  21074968 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21075066  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  21075067 atcgagtcct 21075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 110364 - 110571
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  110364 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 110463  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  110464 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 110562  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  110563 tcgagtcct 110571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 4201347 - 4201553
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  4201347 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 4201446  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4201447 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcatta 4201544  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  4201545 tcgagtcct 4201553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 9731984 - 9732252
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9731984 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 9732082  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  9732083 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 9732181  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9732182 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 9732252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 11044
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  11246 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 11149  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  11148 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 11051  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  11050 atcgagt 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23513693 - 23513487
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| || ||    
T  23513693 tggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgatctatttgtgtgtg 23513594  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23513593 ggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggatataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattat 23513495  T
Q  388 cgagtcct 395  Q
    ||||||||    
T  23513494 cgagtcct 23513487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731975
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 9731960  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  9731961 agttgatgttgaatg 9731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615305
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgttgtttttccctattacttgg 20615527  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  20615526 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgatacatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 20615428  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  20615427 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 20615329  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20615328 t-gattgttgtcgcattatcgagtc 20615305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17473075
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 17473021  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17473022 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 395
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192585
Alignment:
Q  199 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttc 25192489  T
Q  299 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25192490 ttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagtcct 25192585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 392
Target Start/End: Original strand, 29192004 - 29192203
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||     
T  29192004 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgg 29192101  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  29192102 gcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatc 29192199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 10779560 - 10779766
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||     
T  10779560 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgatttattt--gtg 10779657  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  10779658 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 10779756  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  10779757 atcgagtcct 10779766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25425580 - 25425313
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |  | || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25425580 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 25425481  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25425480 acattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggaga 25425385  T
Q  323 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25425384 taatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 25425313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 43445142 - 43445341
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  43445142 aactatatgtgatagttgatgttgaatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatga-ttatttgtgtatgggcatg 43445240  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43445241 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 43445339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 18779374 - 18779582
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18779374 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgt 18779473  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  18779474 atggacatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattggttgtcgtcatatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcat 18779571  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  18779572 tatcgagtcct 18779582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779489
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 10779443  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779444 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 10779489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051677
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta-tcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| ||| |||||| |||| || |  |  | |||||| |    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgttgttttttcctattacttgg 37051899  T
Q  170 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  37051898 aatatga-gaatgcttggaatggtgaaactatatgatatagctgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatac 37051800  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  37051799 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 37051701  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  37051700 t-gattgttgtcgcattatcgagtc 37051677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11318
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 11363  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 11318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191929
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 29191884  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191885 gaacgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 29191929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 27185095 - 27185301
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  27185095 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgta 27185194  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27185195 tagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgt-gattgttgtcgcatt 27185293  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  27185294 atcgagtc 27185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 21933512 - 21933747
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  21933512 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 21933609  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21933610 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 21933706  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21933707 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 21933747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 21939682 - 21939917
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  21939682 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 21939779  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21939780 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 21939876  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21939877 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 21939917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35581180 - 35580945
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  35581180 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 35581083  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35581082 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35580986  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35580985 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 35580945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 37010516 - 37010751
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37010516 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 37010613  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37010614 tgtgatgacgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 37010710  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37010711 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 37010751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582846
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 11582857  T
Q  212 gatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||    
T  11582856 gatgttgaatg 11582846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19498752 - 19498491
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaata-cttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  | || || ||||||||||||||||||  ||||||||||      |    
T  19498752 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattatctggaatggtgaaactatatgatatagttgatg------g 19498659  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19498658 acattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggaga 19498563  T
Q  323 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19498562 tgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 19498491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23327825 - 23327644
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||||||     
T  23327825 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtggacatgttttcttgataatgc- 23327729  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23327728 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 23327644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24595373 - 24595192
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  24595373 ttgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 24595277  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24595276 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 24595192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110292
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 110244  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110245 aggaatgcttgaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatga 110292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 25901707 - 25901911
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  25901707 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgt 25901806  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  25901807 gggcatgttttcttagtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 25901904  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  25901905 tcgagtc 25901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Original strand, 35792544 - 35792719
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35792544 tgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 35792643  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35792644 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 35792719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1221040
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220990 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1221040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201274
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201224 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 4201274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 388
Target Start/End: Original strand, 11212986 - 11213183
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  |     
T  11212986 tggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattgtgtgcgg 11213085  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11213086 gcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgtgatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgt-gattg-tgtcgcattatc 11213183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27185023
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 27185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513767
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagt 23513779  T
Q  211 tgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||    
T  23513778 tgatgttgaatg 23513767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779301
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgta 18779254  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18779255 aggaatggttgaatggtgaaactatatgtggaagttgatgttgaatg 18779301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425589
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagg 25425633  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425632 aatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25425589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24474654 - 24474367
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||   ||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  24474654 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 24474556  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24474555 atgaatgaatgat----------atgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 24474466  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24474465 tagttgttgttgaataacattgttgat-------aatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 24474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367793
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 22367746  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367747 aggaatgtttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341605
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 11341651  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341650 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901635
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatat 25901587  T
Q  175 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901588 ga-gaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424648
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 7424648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 229 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27008867 - 27008705
Alignment:
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 328  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27008867 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtatatgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtggtggagataatca 27008769  T
Q  329 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27008768 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 27008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19498855 - 19498764
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498855 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 260
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792456
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | |      
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatgat- 35792373  T
Q  179 aatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35792374 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7727369 - 7727296
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7727369 tttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7727296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3672780 - 3672685
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || | |||||||||||||||    
T  3672780 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatacttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgatgtgatatcgcattatcgagtc 3672685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23492794 - 23492722
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23492794 tttcttgataatg-aaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  113 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 32967547 - 32967608
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32967547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 32967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Original strand, 37189501 - 37189561
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37189501 ttcttgatgatgcaaatgttgtggaaatgatcaatatatttggaggttgtcctttatattg 37189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 260
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445060
Alignment:
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 43445060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24471049 - 24470996
Alignment:
Q  339 atgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24471049 atgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24470996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 431221 - 431149
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||||||    
T  431221 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttgtattgttgtgaaaatt 431149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28888709 - 28888649
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28888709 ttcttgataatgcaaatgtagtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 28888649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 5452007 - 5452130
Alignment:
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 225  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  5452007 gatatgatatttatcatgtgatgttgtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatacaaggtagttgatgttgaatgata 5452106  T
Q  226 ttgttgattattgataatcatgtt 249  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  5452107 ctgttgattattgatgattatgtt 5452130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Original strand, 5452190 - 5452285
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  5452190 cttggtaatgcaattgttctggagatgatcaatatgtttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 5452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21615804 - 21615735
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  21615804 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 21615735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 24226842 - 24226911
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  24226842 cttgataatgcaattgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtcgtgaaaatt 24226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3672900 - 3672849
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3672900 tggtgaaactatatgatttagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 3672849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19861025 - 19860967
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861025 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19860967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897419
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| |||     
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaatggtgaaactaaatgtaataa 32897603  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgta 32897503  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32897502 aatgttgtggagatgatcaataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 32897419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431322
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18431511  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18431510 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 18431411  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18431410 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 400
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646302
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgat 25646116  T
Q  215 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25646117 gttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgt 25646216  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25646217 tgtggagataatcaataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtac 25646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569281
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  116 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttg 18569463  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18569462 atgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 18569363  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18569362 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcct 18569281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984671
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 19984496  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19984497 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 19984596  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  19984597 tggaaatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgaattatctagtc 19984671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35017151
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagtt 35016967  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35016968 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 35017067  T
Q  311 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017068 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcct 35017151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18775907
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 18776093  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18776092 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgata 18775995  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18775994 atgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18775907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105254
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaat 16105441  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 16105341  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16105340 gcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtc 16105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18088181
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18087946 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtga 18088045  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18088046 tggtgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgag 18088144  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18088145 gttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcct 18088181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Original strand, 18004234 - 18004448
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18004234 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 18004333  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18004334 tggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcatt 18004433  T
Q  386 atcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| ||||    
T  18004434 atcgagtccttgtac 18004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23151956
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23152120  T
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 328  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||    
T  23152119 ttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattcaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaaca 23152020  T
Q  329 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23152019 gtataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattatcgagtc 23151956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 129 - 395
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1659181
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 1659014  T
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 327  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1659015 ttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatc 1659113  T
Q  328 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1659114 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtcct 1659181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976264
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    |||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23976495 ttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 23976397  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23976396 gctgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagg 23976300  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23976299 ttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtcct 23976264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22430944
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgat 22431123  T
Q  215 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22431122 gtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaaatg 22431023  T
Q  314 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22431022 atgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 394
Target Start/End: Original strand, 15736440 - 15736650
Alignment:
Q  184 ttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 283  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15736440 ttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtg 15736539  T
Q  284 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 383  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  15736540 tatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgca 15736639  T
Q  384 ttatcgagtcc 394  Q
    |||||||||||    
T  15736640 ttatcgagtcc 15736650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745763
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttga 25745620  T
Q  214 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25745621 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 25745720  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 355  Q
    | |||| | || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25745721 gatgtgtagatgaacaatataattgggtgttgtcctatttatt 25745763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 27655348 - 27655554
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  27655348 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 27655445  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  27655446 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 27655544  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  27655545 atcgagtcct 27655554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 16827138 - 16827345
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16827138 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 16827237  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16827238 gggcatgttttcttgataatacaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 16827336  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  16827337 tcgagtcct 16827345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4989797 - 4989592
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  4989797 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgatttattt--gtgt 4989700  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||    
T  4989699 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcatta 4989601  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  4989600 tcgagtcct 4989592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16230546 - 16230278
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230546 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 16230448  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  16230447 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 16230349  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16230348 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16230278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 16230570  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  16230569 agttgatgttgaatg 16230555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 33315844 - 33316049
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  33315844 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 33315941  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  33315942 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 33316040  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  33316041 tcgagtcct 33316049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 205 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31627322 - 31627134
Alignment:
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||    
T  31627322 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgatttgtttgtgtatggacatgttttcttgata 31627223  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31627222 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 31627134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25174455 - 25174253
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  25174455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 25174358  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  25174357 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 25174260  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  25174259 atcgagt 25174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651419
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 1651246  T
Q  221 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1651247 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatataattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 1651345  T
Q  321 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1651346 gatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 1651419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397622
Alignment:
Q  36 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 132  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  133 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 232  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||  |  ||||| ||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18397882 gatgat-atcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggggaagctacatgagatagtgaatgttgaatgacattgttga 18397784  T
Q  233 ttattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaata 331  Q
     ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18397783 gtattgatgatcatattgatgtggtgatgatgagtattatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaatgttgtggggataatcaata 18397684  T
Q  332 taattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18397683 taattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtc 18397622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11215026 - 11214836
Alignment:
Q  202 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||    
T  11215026 tgtgatagttgttgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttctt 11214927  T
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11214926 gataatgcaa-tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatagagt 11214836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824847
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18824835  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  18824836 gatgttgaatga 18824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084882
Alignment:
Q  31 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 130  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  131 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtt 230  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaagggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgtt 16084940  T
Q  231 gattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16084939 gattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatttaattgtgtatg 16084882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239058
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||| || || ||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgatctatttgtgtgtgggc 16239163  T
Q  291 atgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16239162 atgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcg 16239064  T
Q  390 agtcct 395  Q
    ||||||    
T  16239063 agtcct 16239058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174527
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 25174572  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174571 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25174527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989869
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 4989881  T
Q  212 gatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||    
T  4989880 gatgttgaatga 4989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10487809 - 10487574
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10487809 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 10487712  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10487711 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 10487615  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10487614 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 10487574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377753
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16377518 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 16377615  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16377616 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 16377712  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16377713 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 16377753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 16384842 - 16385077
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16384842 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 16384939  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16384940 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 16385036  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16385037 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 16385077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 394
Target Start/End: Original strand, 13622374 - 13622583
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  13622374 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgta 13622473  T
Q  286 tgagcatgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||    
T  13622474 tggacatgtttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggttgcat 13622573  T
Q  385 tatcgagtcc 394  Q
    ||||||||||    
T  13622574 tatcgagtcc 13622583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 14627871 - 14628078
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  || ||| |||    
T  14627871 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattgtgta 14627970  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  14627971 tgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatt 14628068  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  14628069 atcgagtcct 14628078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15861642 - 15861425
Alignment:
Q  177 agaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg--acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatg 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15861642 agaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatataacattgttgattgttgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatg 15861543  T
Q  273 agttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga 372  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  15861542 atttatttgtgtgtgagcatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-ga 15861446  T
Q  373 ttgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15861445 ttgttgtcgcattatcgagtc 15861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655287
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 27655246  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655247 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840702
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 18840654  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840655 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18840702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016260
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggg 13016007  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt- 227  Q
                      ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||     
T  13016008 ------------------atgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttgagtgacattt 13016089  T
Q  228 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 327  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  13016090 gttgatt-ttgagaatcatgttgacatgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggaggtaatc 13016187  T
Q  328 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13016188 aatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtac 13016260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Original strand, 18825023 - 18825225
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18825023 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 18825122  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18825123 gggcatg-tttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaataatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcatta 18825219  T
Q  387 tcgagt 392  Q
    ||||||    
T  18825220 tcgagt 18825225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Original strand, 18843083 - 18843286
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18843083 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 18843182  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||    
T  18843183 gagcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacattataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgtcgtcgcatta 18843280  T
Q  387 tcgagt 392  Q
    ||||||    
T  18843281 tcgagt 18843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 217
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315767
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 33315727  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 217  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33315728 gaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004154
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 161  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004102 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736362
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagtt 15736359  T
Q  212 gat 214  Q
    |||    
T  15736360 gat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622302
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 13622259  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622260 atgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 13622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824951
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18824940  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18824941 atgttgaatga 18824951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840806
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18840795  T
Q  213 atgttgaatga 223  Q
    |||||||||||    
T  18840796 atgttgaatga 18840806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18129129 - 18128981
Alignment:
Q  244 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||    
T  18129129 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgtt 18129030  T
Q  344 gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18129029 gtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18128981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1554741 - 1554536
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  1554741 aatggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 1554642  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  1554641 tggacatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcatt 1554544  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  1554543 atcgagtc 1554536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827065
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 16827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Original strand, 17343578 - 17343753
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17343578 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa-tgttg 17343674  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17343675 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcct 17343753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 16557301 - 16557482
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16557301 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16557397  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16557398 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcct 16557482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 16650531 - 16650712
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16650531 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16650627  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16650628 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcct 16650712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582151
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 18582169  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18582168 gatagttgatgttgaatg 18582151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26088713 - 26088532
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||     
T  26088713 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgctttcttggtaatgc- 26088615  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26088614 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgttgcattatcgagtc 26088532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 29870760 - 29870942
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  29870760 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 29870856  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29870857 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 29870942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368827
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 25368626  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatacta--tgagttat---ttg--cgt--atgagcatg 293  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||  |||||| |||||  ||  ||| ||||   |||  |||  |||  | ||    
T  25368627 aggtagtttatgttgaatgatattgttgattattaatgatcatgttgatgaagtgatgatgaatcttatttgaattatgacttgatcgtgcatggacgtg 25368726  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  25368727 atttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtggagtgatgtcgcattatcgagt 25368826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196250
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||  |||| |||||||||||||||   ||| ||||| | |||||||||| ||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  173 gtaaagaatacttgaa--tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat--- 266  Q
    ||||  ||| ||||||  |||| ||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |       
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaataatattgttgattattgataatcatgttgatgatgtgattcttatttga 28196123  T
Q  267 actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaat 366  Q
    | ||| | ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  28196124 attataacttgattgtgtatggacatgatttcttgataatgcaattggtgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaat 28196223  T
Q  367 tgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28196224 tgtggagtgttgtcgcattatcgagtc 28196250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627791
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagaaa 14627757  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627758 tgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23994032 - 23993858
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23994032 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 23993934  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23993933 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 23993858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22866864
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaag 22867067  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtta 277  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||             || |||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| | ||     
T  22867066 aatgtttgaatgatgaaactatatgagatagtaaatgttga-------------tttttgataatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatcatttg 22866980  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
     ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  22866979 attgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatttatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgat 22866880  T
Q  378 gtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| |||||    
T  22866879 ttcgcattattgagtc 22866864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 22226926 - 22227110
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||   |||||| |||| |||||||    
T  22226926 ttgatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgatttatttgtgtgtggatatgtttccttggtaatgca 22227025  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22227026 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtcct 22227110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19609310 - 19609192
Alignment:
Q  275 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 374  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  19609310 ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaatt 19609213  T
Q  375 gttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19609212 gttgtcgcattatcgagtcct 19609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609350
Alignment:
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 19609350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16084215 - 16084112
Alignment:
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16084215 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcg 16084116  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  16084115 agtc 16084112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088782
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  161 cttacttagaat 172  Q
    ||||||| ||||    
T  26088793 cttacttggaat 26088782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Original strand, 21776791 - 21776870
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776791 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15739043 - 15738945
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  15739043 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtaaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 15738945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  143 atgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1554866 - 1554817
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1554866 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741146
Alignment:
Q  335 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18741146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 16889122 - 16889183
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16889122 tttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 16889183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33323605 - 33323532
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33323605 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 33323532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 35137326 - 35137399
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  35137326 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 35137399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22846923 - 22846867
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat 354  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  22846923 cttgataattcaattgttgtggagataatcaatatatttggaagttatcctttatat 22846867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44863934
Alignment:
Q  12 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaatggtgaaagtatatgtgatagtt 44864118  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44864117 gatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 44864018  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864017 tgctgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 44863934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288461
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccatatgtgat 47288654  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 47288554  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47288553 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 47288461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369580
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 369767  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  369766 tagttgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 369667  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369666 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 369580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12545190
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatttgata 12544998  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||     
T  12544999 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgg 12545098  T
Q  309 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12545099 aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 12545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867552
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  112 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaattcttgaatgatgaaactatatgtgatag 13867361  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13867461  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13867462 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13867552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453728
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggaaaattatatgtaata 45453542  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45453543 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 45453642  T
Q  309 aaatgttgtggaaataatcaatataatt-ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453643 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 45453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 393
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823881
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  130 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 15823713  T
Q  230 tgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtga----atactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15823714 tgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaatatatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataa 15823813  T
Q  326 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15823814 tcaatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtc 15823881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071743
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26071496 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga- 26071594  T
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26071595 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctata 26071694  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26071695 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 400
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095530
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26095283 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga- 26095381  T
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26095382 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctata 26095481  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26095482 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753575
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 12753761  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  12753760 tagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtggagatgagtactataatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataat 12753661  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12753660 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgtggtg-aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 12753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125520
Alignment:
Q  20 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  120 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttg 125694  T
Q  219 aatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtg 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  125693 aatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaatcgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaaggatgtg 125594  T
Q  319 gaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  125593 gagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 125520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11285904
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11286147 tatgttatcttacttagaatataaggaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 11286048  T
Q  252 --tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtccta 349  Q
      ||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||     
T  11286047 tgtgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttctcctt 11285948  T
Q  350 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11285947 tatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 11285904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3893789
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaagtggtgaaactatatgt 3893975  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||| || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3893974 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgata 3893877  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||| |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3893876 atgtaaatgttgtggagatgaacaatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3893789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112767
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaactatatgt 112579  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  112580 gatagttgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgata 112679  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | ||||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112680 aagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142313
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgt 142510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  142509 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgat 142410  T
Q  304 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  142409 aatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981378
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18981144 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtga 18981243  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18981244 tggtgaatactatgatttatttgtatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgag 18981342  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18981343 ttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 18981378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051356
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 36051525  T
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  36051524 attgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttacttaataatgc-aatg-tgtggagata 36051427  T
Q  325 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051426 atcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 36051356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 63 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757271
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  13757503 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 13757405  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13757404 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 13757307  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757306 ttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 13757271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249584
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatg 12249362  T
Q  174 taaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactat 271  Q
    |||  ||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12249363 taagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctat 12249462  T
Q  272 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 371  Q
    || ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  12249463 gatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtga 12249562  T
Q  372 attgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12249563 attgatgtcgcattatcgagtc 12249584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 393
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938240
Alignment:
Q  123 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1938070  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1938071 gacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaattatgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggag 1938170  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1938171 atgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaat--tgaattgttgtcgcattatcgagtc 1938240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7291753 - 7291540
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7291753 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 7291654  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  7291653 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 7291555  T
Q  386 atcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| ||||    
T  7291554 atcgagtccttgtac 7291540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851163
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Original strand, 15952360 - 15952563
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  15952360 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 15952457  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15952458 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 15952556  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  15952557 atcgagt 15952563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15443030
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 15442806  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15442807 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 15442905  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  15442906 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 15443004  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  15443005 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 15443030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 32495819 - 32496025
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  32495819 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 32495918  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  32495919 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 32496017  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  32496018 atcgagtc 32496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058741
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagca 3058842  T
Q  292 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 391  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3058841 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 3058743  T
Q  392 tc 393  Q
    ||    
T  3058742 tc 3058741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 189 - 394
Target Start/End: Original strand, 13038373 - 13038576
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  13038373 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 13038472  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  13038473 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataatcgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatt 13038570  T
Q  389 gagtcc 394  Q
    ||||||    
T  13038571 gagtcc 13038576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 11582109 - 11582311
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  11582109 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 11582208  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11582209 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatc 11582306  T
Q  389 gagtc 393  Q
    |||||    
T  11582307 gagtc 11582311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2027457 - 2027250
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  2027457 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 2027358  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||    
T  2027357 tgggcgtgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcatt 2027258  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  2027257 atcgagtc 2027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16417364 - 16417162
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||     
T  16417364 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtg 16417267  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  16417266 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 16417169  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  16417168 atcgagt 16417162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571563
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 16571344  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||  |||||  ||||| ||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 16571444  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 374  Q
      ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16571445 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggatt 16571544  T
Q  375 gttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  16571545 gatgtctcattatcgagtc 16571563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594099
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 16594318  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||  |||||  ||||| ||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 16594218  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 374  Q
      ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16594217 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggatt 16594118  T
Q  375 gttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  16594117 gatgtctcattatcgagtc 16594099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252491
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 14252476  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  14252477 agttgatgttgaatg 14252491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16210676 - 16210472
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||     
T  16210676 tggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtgtgg 16210577  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16210576 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatc 16210479  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  16210478 gagtcct 16210472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 393
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263593
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 30263371  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30263372 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 30263470  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30263471 tatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattg 30263568  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  30263569 agaattgttgtcgcattatcgagtc 30263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 13912378 - 13912582
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13912378 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 13912477  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  13912478 gggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 13912575  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  13912576 tcgagtc 13912582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 27102783 - 27103018
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27102783 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27102880  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27102881 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27102977  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27102978 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 27103018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 27110131 - 27110366
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27110131 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27110228  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27110229 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27110325  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27110326 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 27110366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27175543 - 27175308
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27175543 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27175446  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27175445 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27175349  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27175348 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 27175308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 38784875 - 38785110
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38784875 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 38784972  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38784973 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 38785069  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38785070 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 38785110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39048042
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 39047983  T
Q  215 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39047984 gttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 39048042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 2191960 - 2192168
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  2191960 gaatagtgaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttatttttgta 2192059  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2192060 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgctgtcgcatt 2192158  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  2192159 atcgagtcct 2192168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 16480200 - 16480407
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  || |||  ||    
T  16480200 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattgtata 16480299  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  16480300 tgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatt 16480397  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  16480398 atcgagtcct 16480407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417436
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 16417481  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417480 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 16417436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7821851 - 7821616
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  7821851 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatg 7821754  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7821753 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 7821657  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7821656 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 7821616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7829162 - 7828927
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  7829162 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatg 7829065  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7829064 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 7828968  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7828967 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 7828927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273436
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 13273636  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||  |||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||    
T  13273635 agttagttgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgttgttgttgtgataatgaatcttgtttgaattatgaattgattgtgtatggacatg 13273536  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||    
T  13273535 atttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaagttgtgaagtaatgtcgcattatcgagtc 13273436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15926261 - 15926059
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  |    
T  15926261 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--g 15926165  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  15926164 ggcatgttt-cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattat 15926067  T
Q  388 cgagtcct 395  Q
    ||||||||    
T  15926066 cgagtcct 15926059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11515020 - 11514816
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  11515020 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgt 11514921  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  11514920 gggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 11514823  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  11514822 tcgagtc 11514816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 26010455 - 26010662
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || ||     
T  26010455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctttgatgtaactgtgtg 26010554  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  26010555 tggacatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 26010652  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  26010653 atcgagtcct 26010662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 208 - 395
Target Start/End: Original strand, 15525769 - 15525956
Alignment:
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15525769 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattatgtgaatgatgaatactatgatctatttgtgtgtgtgcatgttttcttgataat 15525868  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15525869 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtcct 15525956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495747
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtg 32495730  T
Q  206 atagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  32495731 atagttgatgttgaatg 32495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952280
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 15952243  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952244 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912305
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912255 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 13912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291825
Alignment:
Q  83 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 7291867  T
Q  181 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291866 tgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 7291825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629464
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  108 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| || | ||||||||||     
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaactatatga 15629663  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | |  |||||         | || || ||  ||| |||||  ||||     
T  15629662 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttaagttaatgaatcttatttgaattaagaattgattgtgtatggacatga 15629563  T
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  15629562 tttcttgataatacaattgttgtggaaatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgacgtcgcattatcgagtc 15629464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 15761634 - 15761839
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  15761634 aatggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 15761733  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  15761734 tggacatgttttcttgataatgcaaatgatgaggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcatt 15761831  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  15761832 atcgagtc 15761839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515198
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 11515246  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515245 aggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Original strand, 42057458 - 42057632
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42057458 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 42057556  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42057557 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 42057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049272
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaat 49049041  T
Q  173 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 266  Q
    ||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||        
T  49049042 gtaagaaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgttaatta-tgatgatcatgttgatgatgtgatgatgaatctta 49049140  T
Q  267 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 361  Q
         | ||||| ||  ||| ||||   |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  49049141 tttgaaatatgacttgattgtgtatagacatgatttcttgataatgcaattgtggtggagatgatcaacatatttgaaagttgtcctttatattgtggtg 49049240  T
Q  362 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  49049241 gaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 49049272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027529
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgt-aagaaatgttgagttggtgaaactatatgtga 2027545  T
Q  207 tagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  2027544 tagttgatgttgaatg 2027529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285510
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatg 7285460  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285461 taaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 7285510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 395
Target Start/End: Original strand, 18255090 - 18255294
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 290  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |  ||||||  | || ||    
T  18255090 tgaaactataagtgataattgaagttgaatgtctttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactataatctatttgtatgtgggc 18255189  T
Q  291 atgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18255190 atgttttgcttgataatgtaa-tgttgtggggataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcg 18255288  T
Q  390 agtcct 395  Q
    ||||||    
T  18255289 agtcct 18255294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13571701 - 13571525
Alignment:
Q  216 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  13571701 ttgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgt 13571603  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13571602 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcttatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 264
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862187
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||| || ||||  | ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 10862125  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgatta-ttgataatcatgttaatg-tgtgatggtga 264  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  10862126 a-atagttgatgttgaatgatattgttgattatttgatgattatgttgatgatgtgatggtga 10862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2436456 - 2436316
Alignment:
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436456 tgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtgtggacatttttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 2436358  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2436357 ttgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 2436316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 393
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293747
Alignment:
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293608 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctata 25293706  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25293707 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25293747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10988479 - 10988304
Alignment:
Q  218 gaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10988479 gaatgatattattgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttc-cttggtaatgcaa-tgttg 10988382  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10988381 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcct 10988304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191884
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 159  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| || | || | |      
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgttttccc 2191783  T
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2191784 tattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 2191882  T
Q  259 tg 260  Q
    ||    
T  2191883 tg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 16480034 - 16480120
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480034 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11515138 - 11515092
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515138 agaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Original strand, 15761509 - 15761558
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15761509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 9058007 - 9058076
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  9058007 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 9058076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 392
Target Start/End: Original strand, 10862231 - 10862326
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt-gtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  10862231 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatgtatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtgaggtgatgtcgcattatcgagt 10862326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Original strand, 15913817 - 15913874
Alignment:
Q  299 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  15913817 ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 15913874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  108 atgaatgaa 116  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13376461 - 13376423
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13376461 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatata 13376423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 400
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256384
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 256199  T
Q  216 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  256200 ttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg-aaatgt 256298  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  256299 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 385
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262975
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 262805  T
Q  216 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  262806 ttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgt 262904  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262905 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 262975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124761
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 124552  T
Q  186 gaatgg-tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  124553 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattgggt 124652  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  124653 gtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacat 124750  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  124751 tatcgagtcct 124761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Original strand, 75855 - 76162
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||  |||  ||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 75953  T
Q  186 gaatgg-tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||    
T  75954 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattgagt 76053  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  76054 gtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 76151  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  76152 tatcgagtcct 76162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 193508 - 193304
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || ||     
T  193508 tggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgg 193409  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  193408 gcatgttttcttgttaatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 193311  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  193310 gagtcct 193304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71921
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  111 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatagt 71738  T
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71739 tcatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 71838  T
Q  311 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  71839 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 71921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 400
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6837
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 6651  T
Q  216 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  6652 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgatttaattgtgtataggcatgttttcttgataatgcaaatga 6751  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6752 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtac 6837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26200
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 26007  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  26008 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatctgtgtatagacatgttttcttgataat 26107  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26108 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70873
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 70684  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  70685 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgatttcttgataattcaaa 70784  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  70785 tgttgtggagatgattaatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 70873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93527
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 180  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaa 93602  T
Q  181 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 254  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  93601 tgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgt 93527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148311
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaatggtgaaactatatatgat 6148123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcttgttttcttgataatg 6148223  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148224 taaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 6148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 400
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183489
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgatgaaactatatgtgata 16183292  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16183293 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgacaatg 16183392  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat----attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16183393 caaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 16183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113602
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 50113414  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 50113514  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50113515 caaatgttgtggaggtaatcaatataat----tgttgtcctatatattgaggtg-aaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 50113602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145740
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgcttggatgatgaaactatatgtgatagtt 22145560  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22145561 gatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaatggtgtaggggcatgttttcttgataatgcaaa 22145660  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22145661 -gttgtggagataatcaatataattgggtg-tgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtc 22145740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816201
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 13816412  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | ||| ||    
T  13816411 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattgtgt 13816312  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13816311 gtgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcat 13816212  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  13816211 tatcgagtcct 13816201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099397
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 17099593  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  |||  ||||  |||||||||||||||    
T  17099592 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttataatttgattgtttatggacatgttttcttgata 17099493  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  17099492 atgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtac 17099397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572241
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 19572031  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| ||    
T  19572032 gaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattgtgt 19572130  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19572131 gtggccatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacat 19572230  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  19572231 tatcgagtcct 19572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 318695 - 319081
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg- 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 318893  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  318894 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatgatttaatcgtgtatgggcatgttttcttgata 318993  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  318994 atgcaaatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 319081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122377
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||     
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 35122566  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  35122565 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgata 35122466  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35122465 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtc 35122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 395
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860616
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 15860406  T
Q  186 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||    
T  15860407 gaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattgtgt 15860506  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15860507 gtggacatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 15860605  T
Q  385 tatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||    
T  15860606 tatcgagtcct 15860616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630538
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |  |  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgatatt-atcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgat 8630723  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8630722 aattgacgttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgtcttcttgataatg 8630623  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8630622 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 8630538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469931
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtga 15469749  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  15469750 tagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatg-ttccttgataat 15469848  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15469849 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattattgtcgcattatcgagt 15469931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899989
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  110 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 206  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggaatggtgaaaccatatgaga 53899803  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  53899804 taaatgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtatatggacatgttttcttgataat 53899902  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53899903 gcaaatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 53899989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11199040
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  109 tgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgag 11198851  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  11198852 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 11198951  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11198952 atgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcaagtc 11199040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 356
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786314
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa-agaatac 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  184 ttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgc 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||     
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgt 47786240  T
Q  283 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47786241 gtatggacatgctttcttgataatgaaaatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattg 47786314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351312
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  115 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 12351132  T
Q  214 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  12351133 tgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgcggacatgttttcttgataatgcaaat 12351232  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12351233 gatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgaattatcgagtc 12351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491202
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  23491430 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaa 23491331  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    || |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  23491330 tgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtg 23491231  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23491230 gagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 23491202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297188
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14297377  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14297376 ataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgata 14297277  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14297276 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14297188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14302815
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14303004  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14303003 ataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgata 14302904  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14302903 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14302815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057531
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgta 25057757  T
Q  176 aagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 273  Q
    ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatga 25057657  T
Q  274 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggat 373  Q
     ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  25057656 tttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gat 25057558  T
Q  374 tgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25057557 tgttgtcgcattatcgagtccttgtac 25057531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294119
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 14294336  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgattt 14294236  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14294235 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattga 14294136  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||    
T  14294135 tgtcgcattatcgagtc 14294119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062504
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatg 11062283  T
Q  174 taaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactat 271  Q
    |||  ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  |||    
T  11062284 taagaaatgcttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttat 11062383  T
Q  272 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 371  Q
    || ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11062384 gatttgattgtgtatggacatgtttt-ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgg 11062482  T
Q  372 attgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  11062483 attgatgtcgcattattgagtc 11062504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299746
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 14299963  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 14299863  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14299862 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattga 14299763  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||    
T  14299762 tgtcgcattatcgagtc 14299746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938421
Alignment:
Q  81 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaag 40938637  T
Q  179 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtta 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||  |||||  ||||| ||     
T  40938636 aatgcttgaatggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgtggtgataatgaatcttatgatttg 40938537  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
     ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |    
T  40938536 attgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggt 40938437  T
Q  378 gtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||    
T  40938436 gtcgcattatcgagtc 40938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 390
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562944
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  113 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatag 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtag 12562761  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtacggacatgttttcttgataatgc 12562861  T
Q  309 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcga 390  Q
    || ||||||||| || ||||||||| |||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12562862 aattgttgtggagatgatcaatatatttggaatttttcctctatattgtggtgaaaatttgtgaagtgttgtcgcattatcga 12562944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16819802 - 16819598
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  16819802 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgt 16819705  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  16819704 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 16819607  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  16819606 tcgagtcct 16819598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33340740 - 33340534
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |    
T  33340740 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaa 33340641  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  33340640 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 33340542  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  33340541 atcgagtc 33340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 125 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18909647 - 18909379
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18909647 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 18909549  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18909548 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgtggatgttttcttgataatgc-aatgttgtggag 18909452  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18909451 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 18909379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945317
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  112 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgat 19945503  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 19945403  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945402 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19945317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574731
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15574904  T
Q  221 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15574903 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 15574805  T
Q  321 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15574804 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 15574731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 17957533 - 17957802
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17957533 ttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 17957631  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17957632 gtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggac 17957731  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957732 atgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 17957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 393
Target Start/End: Original strand, 51159742 - 51159945
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||     
T  51159742 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtgtatgg 51159841  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51159842 acatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattggtgtcgcattatc 51159940  T
Q  389 gagtc 393  Q
    |||||    
T  51159941 gagtc 51159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 53769618 - 53769350
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53769618 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 53769520  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  53769519 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 53769421  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53769420 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 53769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22273939 - 22273737
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  22273939 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 22273842  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  22273841 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 22273744  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  22273743 atcgagt 22273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613750
Alignment:
Q  122 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 220  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15613923  T
Q  221 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15613922 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 15613824  T
Q  321 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
     || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15613823 gatgattaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 15613750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909656
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 18909671  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  18909670 agttgatgttgaatg 18909656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769627
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 53769642  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  53769641 agttgatgttgaatg 53769627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 8269673 - 8269869
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||    
T  8269673 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgt 8269770  T
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8269771 tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcc 8269868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 8276784 - 8276980
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||    
T  8276784 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgt 8276881  T
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8276882 tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcc 8276979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048751
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggg 2048854  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2048853 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 2048755  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  2048754 agtc 2048751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230751
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||      
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattgtgaatgga 19230854  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19230853 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 19230755  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  19230754 agtc 19230751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Original strand, 2450590 - 2450791
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  2450590 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgatttattt--gtg 2450686  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  2450687 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 2450784  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  2450785 atcgagt 2450791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 49231102 - 49230902
Alignment:
Q  195 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  49231102 aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 49231003  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49231002 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 49230904  T
Q  394 ct 395  Q
    ||    
T  49230903 ct 49230902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274011
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22274056  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274055 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7852705 - 7852499
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||    
T  7852705 gaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattgtgta 7852606  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  7852605 tggacatgttttcttgataatgtaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 7852507  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  7852506 atcgagtc 7852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 1468885 - 1469120
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1468885 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 1468982  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1468983 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 1469079  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1469080 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 1469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450518
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaag 2450473  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450474 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2450518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837733
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13837741  T
Q  208 agttgatg 215  Q
    ||||||||    
T  13837740 agttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 16745433 - 16745638
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  16745433 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgac-ttgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgttt 16745531  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16745532 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gatggttgtcgcatta 16745629  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  16745630 tcgagtcct 16745638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 393
Target Start/End: Original strand, 17913527 - 17913717
Alignment:
Q  201 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||    
T  17913527 atgtgatagttgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttctt 17913626  T
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17913627 gataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgt-gattg-tgtcgcattatctagtc 17913717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16259938 - 16259732
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||     
T  16259938 gaatggtgaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtg 16259839  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16259838 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 16259740  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  16259739 atcgagtc 16259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44228354 - 44228116
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44228354 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatg 44228257  T
Q  254 tg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 352  Q
    || ||||| ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44228256 tgatgatgatgaatgctatgatttaatcgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatat 44228158  T
Q  353 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44228157 attgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 44228116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957520
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatg 17957474  T
Q  174 taaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957475 taaggaatgcttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27839573 - 27839395
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  27839573 tgaatgataatgttgattgttgatgatcatgttaatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgat 27839475  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27839474 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 27839395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Original strand, 14522580 - 14522775
Alignment:
Q  199 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||| |||||||||    
T  14522580 atatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgggcatgtttt 14522679  T
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14522680 cttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 14522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30152205 - 30152024
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30152205 ttgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30152109  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30152108 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 30152024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231180
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaa 49231227  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49231226 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgattatgaatga 49231180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819882
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 16819920  T
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819919 ggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937333
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || | |    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgtaagaaatgctagta 17937393  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 247  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937392 ttggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 17937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852777
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 204  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 7852795  T
Q  205 gatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7852794 gatagttgatgttgaatg 7852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159669
Alignment:
Q  30 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 127  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  128 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatga 51159669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138157
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 17138356  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat--------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 294  Q
     | |||||| |||| || || |||  |||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||        | ||||| ||| ||| ||| |  ||||     
T  17138355 aggtagttgttgttaaacgatatttatgatgattgatgatcatgttgatgatgtgatgatgaatcttattgaattatgatttaattgtgtaaggacatga 17138256  T
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  17138255 tgtcttgataattcaattgttgtggagatgatcaatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtc 17138157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30205274 - 30205137
Alignment:
Q  262 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30205274 tgaatactatgaattaattgtgtatgtgcatgttttcttgataaagcaaa-gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtccaatatattcaggtg 30205176  T
Q  362 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30205175 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 30205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 111  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  112 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 12265775 - 12265959
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||  ||||||| |||| |||||||    
T  12265775 ttgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttatttgtctgtggacatgtttccttggtaatgca 12265874  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12265875 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 12265959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 393
Target Start/End: Original strand, 17523691 - 17523877
Alignment:
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  17523691 gatagttaatgttgaatgacattattgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtagtatgaattaattgtgtatggacatgatttcttgata 17523788  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17523789 atgcacatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtc 17523877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5227585 - 5227406
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| |||||||  |   | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5227585 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatacatt---tgaattgtatatgagcatgttttcttgataatgca 5227489  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5227488 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5227406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 395
Target Start/End: Original strand, 15939725 - 15939929
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 290  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||  | || ||    
T  15939725 tgaaactataagtgataattgaagttgaatgactttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactatgatctatttgtatgtgggc 15939824  T
Q  291 atgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  15939825 atgttttgcttgataattcaa-tgttatggggataatcaatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattg 15939923  T
Q  390 agtcct 395  Q
    ||||||    
T  15939924 agtcct 15939929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10737386 - 10737247
Alignment:
Q  253 gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 352  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10737386 gtgtcatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatacaattgggtgttgtcctatat 10737287  T
Q  353 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10737286 attgtggagaaaattgt-tattgttgtcgcattatcgagtc 10737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 395
Target Start/End: Original strand, 14846034 - 14846130
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14846034 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 14846130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340812
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 33340850  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33340849 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 33340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45859884 - 45859709
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45859884 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 45859786  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45859785 gtgaagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 45859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 55315252 - 55315085
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  55315252 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 55315154  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55315153 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 55315085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031364
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||| |    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatggg 12031348  T
Q  290 catgttttcttgataa 305  Q
    | ||||||||||||||    
T  12031349 cgtgttttcttgataa 12031364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935286
Alignment:
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aa 16935264  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatata 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16935265 tgttgtggagataatcaatata 16935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 297 - 395
Target Start/End: Original strand, 8305693 - 8305789
Alignment:
Q  297 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8305693 tcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 8305789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260014
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||||||| ||||| |||     ||||| |||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16260162 atgaatgagtgattatat-----atgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtg 16260069  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16260068 atagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 395
Target Start/End: Original strand, 18905171 - 18905266
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18905171 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgt-gattgttttcgcattattgagtcct 18905266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39654925 - 39654757
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||||| ||| |||| | |||| |||||   |||||||||||||    
T  39654925 gtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaat 39654826  T
Q  173 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    || |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39654825 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgttgattattgat 39654757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41269098 - 41268931
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaa-tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||  || || || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  41269098 attgttgattgttgataatcaagttgtctgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggtatgttctcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 41269000  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  41268999 aatcaatataattgggtgttgtcctatgtattgagttg-agattgagaaatgttgtcgcattatcgagtc 41268931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 393
Target Start/End: Original strand, 13976964 - 13977101
Alignment:
Q  256 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 354  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13976964 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatata 13977062  T
Q  355 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13977063 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 393
Target Start/End: Original strand, 13956132 - 13956269
Alignment:
Q  256 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 354  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13956132 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaaaataattgggtgttgtcctatatata 13956230  T
Q  355 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13956231 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Original strand, 14843815 - 14843919
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 291  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||    
T  14843815 tgaaactatatgtgatagtgggtgttgaatgatattgttgattggtgataatcaagttattatgtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtgtgggca 14843914  T
Q  292 tgttt 296  Q
    |||||    
T  14843915 tgttt 14843919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12951835 - 12951743
Alignment:
Q  301 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  12951835 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgagatgatgtcgcattatcgagtc 12951743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15874953 - 15874893
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15874953 ttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 15874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Original strand, 9303753 - 9303802
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9303753 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Original strand, 11330382 - 11330442
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11330382 ttcttgataatgcaaatgtggtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 11330442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522538
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaa 14522538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15516521 - 15516426
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||    
T  15516521 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattttgagttgatgtcgcattatcaagtc 15516426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 11883518 - 11883580
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  11883518 aatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgttgattatcgatgattatgtt 11883580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggagtat-gagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15516671 - 15516590
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15516671 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgctgttgaatgatattgttgattattgat 15516590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 38812367 - 38812436
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38812367 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 38812436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 12490105 - 12490177
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  12490105 tttcttgataatgaaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 12490177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39654695 - 39654607
Alignment:
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  39654695 atgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 39654607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14287828 - 14287785
Alignment:
Q  350 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14287828 tatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtc 14287785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 273
Target Start/End: Original strand, 18897982 - 18898045
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18897982 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatga 18898045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 393
Target Start/End: Original strand, 11883645 - 11883735
Alignment:
Q  303 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||   || |||||||||||||||||    
T  11883645 taatgctaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtggaaagtgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 11883735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11813586 - 11813554
Alignment:
Q  363 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813586 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 11813554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 33370118 - 33370169
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33370118 tggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 33370169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 14060614 - 14060675
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  14060614 tttcttgataatgcaaatattgtggggatgatcaatatagtttgaagttgtcctttatattg 14060675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Original strand, 55442145 - 55442218
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattgg-atgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  55442145 ttcttaataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 55442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 393
Target Start/End: Original strand, 47786311 - 47786339
Alignment:
Q  365 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786311 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 47786339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 37 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6232
Alignment:
Q  37 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 136  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  137 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6396  T
Q  237 tgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataatt 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6395 tgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataatt 6296  T
Q  337 ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6295 gggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2317
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgataaaactatatgtgat 2123  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 2223  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2224 gcaaatgatgtggagataatcaatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13217
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13024  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgacaatg 13124  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13125 caaatgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 161
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttact-agaatgtaatgaatgttgaaatggtgaaactatatgtgat 203  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36892185
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 205  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 36891991  T
Q  206 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36891992 atagtcgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataa 36892090  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36892091 tgaaaatgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 36892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273577
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22273753  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22273752 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgtgcatgttttcttgataatgcgaatgatg 22273653  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273652 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22282810
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22282986  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22282985 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagcaaatgatg 22282886  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||| | || |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22282885 tggagatgaacaatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449698
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||| |     
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaccatagga 4449510  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  4449511 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtgtatggacatgttttcttgata 4449609  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4449610 atgcaaatgttgcgaaaatgatcaatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 4449698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942335
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttg 8942518  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8942517 atgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaa- 8942419  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8942418 tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 8942335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 395
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637632
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttg 12637452  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  12637453 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aat 12637549  T
Q  313 gttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12637550 gttgtggagataatcaatataatggtggtgttatcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 12637632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878134
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  116 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggt-gaaactatatgtgatagttg 212  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttg 6878315  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6878314 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 6878215  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6878214 ggatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgtggtcgcattatcgagtc 6878134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8886832
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8887001  T
Q  224 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8887000 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 8886901  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8886900 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttatcgcattatcgagtc 8886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862179
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatga 22862348  T
Q  224 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22862347 aattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 22862248  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22862247 aaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22862179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25600858 - 25600652
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||    
T  25600858 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtat 25600759  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25600758 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcatta 25600659  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  25600658 tcgagtc 25600652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260274
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
T  27260492 tatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtt--------------------- 27260415  T
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
     |||||||| |||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27260414 -gtgtgatgatgaatactatgaattgattgtatatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatggtcaatataattgggagttgtcctata 27260316  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260315 tattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 27260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726742
Alignment:
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 224  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12726910 attgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagata 12726812  T
Q  325 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12726811 atcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 12726742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20013811
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| | | |  | |||||| |||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgtttttccc-tattacttggaa 20014033  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatacta 270  Q
    | | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20014032 tatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatacta 20013934  T
Q  271 tgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 370  Q
    ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||     
T  20013933 tgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt- 20013836  T
Q  371 gattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20013835 gattgttgtcgcattatcgagtcct 20013811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 393
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581402
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  187 aat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 284  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||   |||||  ||||| ||  ||  ||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgttgtgagaatgaatcttatgatttgattatgt 22581293  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22581294 atggacatgttttcttgataatgcaaacgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcat 22581393  T
Q  385 tatcgagtc 393  Q
    |||||||||    
T  22581394 tatcgagtc 22581402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907906
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 14907682  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14907683 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 14907781  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  14907782 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 14907880  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  14907881 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 14907906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23818868
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 23819092  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  23819091 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 23818993  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  23818992 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 23818894  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  23818893 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 23818868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34823093 - 34822887
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  34823093 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 34822994  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  34822993 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 34822896  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  34822895 tcgagtcct 34822887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 21275788 - 21275994
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21275788 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21275885  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||    
T  21275886 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21275984  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  21275985 atcgagtcct 21275994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 3800375 - 3800580
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  3800375 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 3800472  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  3800473 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 3800571  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  3800572 tcgagtcct 3800580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Original strand, 5889559 - 5889764
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  5889559 aatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 5889656  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  5889657 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 5889755  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  5889756 tcgagtcct 5889764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24967195 - 24966987
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| | |||    
T  24967195 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgatttattcgtgta 24967096  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24967095 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcatt 24966996  T
Q  386 atcgagtcc 394  Q
    |||||||||    
T  24966995 atcgagtcc 24966987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275716
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21275701  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  21275702 agttgatgttgaatg 21275716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Original strand, 19888041 - 19888243
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  19888041 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 19888138  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  19888139 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 19888236  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  19888237 atcgagt 19888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21140771 - 21140569
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21140771 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21140674  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  21140673 tgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21140576  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  21140575 atcgagt 21140569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643214
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 12643199  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  12643200 agttgatgttgaatg 12643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Original strand, 25877210 - 25877399
Alignment:
Q  185 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |    
T  25877210 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattgtg 25877309  T
Q  284 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 374  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877310 tatggccatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 25877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 12643223 - 12643491
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12643223 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 12643321  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  12643322 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 12643420  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12643421 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 12643491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 392
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644442
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| |||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgaatgggca 43644342  T
Q  292 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 391  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43644343 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 43644441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572860
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtga 258  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  24572626 cttacttagaatgtgaggaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgttgtga 24572725  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    |  |||||  | ||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |    
T  24572726 taatgaatcttgtgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtg 24572825  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  24572826 gtgaaaattgtgaagtgttatcgcattatcgagtc 24572860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 461631 - 461427
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  461631 tggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 461532  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  461531 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 461434  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  461433 gagtcct 461427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7320450 - 7320179
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7320450 ttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 7320351  T
Q  223 acattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7320350 acattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattttgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggag 7320251  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7320250 attatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 7320179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Original strand, 24827831 - 24828034
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||     
T  24827831 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt- 24827929  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  24827930 -gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcatt 24828027  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  24828028 atcgagt 24828034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179555
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 42179540  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  42179541 agttgatgttgaatg 42179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887969
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 19887924  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887925 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 19887969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 11232484 - 11232719
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11232484 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 11232581  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11232582 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 11232678  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11232679 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 11232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900207
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16900262  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16900261 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16900207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993598
Alignment:
Q  89 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16993653  T
Q  188 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16993652 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16993598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 22514331 - 22514566
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22514331 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 22514428  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22514429 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 22514525  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22514526 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 22514566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 20628662 - 20628863
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  20628662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg---atgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 20628758  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  20628759 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatc 20628856  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  20628857 gagtcct 20628863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140843
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 21140888  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140887 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 21140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972732
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  108 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatat 202  Q
    ||||| |||||    | |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatgt--tggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaatgcttaaatggtaaaactatgt 28972922  T
Q  203 gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 301  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||     
T  28972921 gaggtgtttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatg-tttctta 28972823  T
Q  302 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28972822 gtaatgcaaatg-tgtggagatgatcaatatatatggatgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtc 28972732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Original strand, 28776932 - 28777167
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28776932 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 28777029  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28777030 tgtgatgatgaattctatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 28777126  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28777127 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 28777167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800195
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800136 tacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654296
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgg 261  Q
    ||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||  | |||||||     
T  9654073 tacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga-------taatcatgttgttatgtgatga 9654165  T
Q  262 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||||| || |    
T  9654166 tgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgttaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgctctatatattgtggag 9654265  T
Q  362 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9654266 aaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9654296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 393
Target Start/End: Original strand, 22691175 - 22691419
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcat 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22691175 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcat 22691274  T
Q  247 gttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 345  Q
    |   || || |||||  || || ||||| ||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  22691275 g---atttgatgatgacgagtagtatgatttgattgtgtatagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgt 22691371  T
Q  346 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22691372 cctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtc 22691419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 393
Target Start/End: Original strand, 22695822 - 22696066
Alignment:
Q  148 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcat 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22695822 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcat 22695921  T
Q  247 gttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 345  Q
    |   || || |||||  || || ||||| ||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  22695922 g---atttgatgatgacgagtagtatgatttgattgtgtatagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgt 22696018  T
Q  346 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22696019 cctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtc 22696066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23773407 - 23773226
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  23773407 ttgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 23773311  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23773310 aatgttgtcgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 23773226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 24686954 - 24687135
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||     
T  24686954 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgta--ggcatgttttcttgataatgc- 24687050  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24687051 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 24687135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15632269 - 15632088
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15632269 tgatgttgaatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 15632170  T
Q  311 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15632169 ttgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15632088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211866
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 25211889  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaact 198  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  25211888 aggaatgcttgaatggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270035
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  113 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 203  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823165
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 34823211  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823210 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727126
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 12727172  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727171 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 290 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 269981 - 269878
Alignment:
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  269981 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcg 269882  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  269881 agtc 269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 393
Target Start/End: Original strand, 17397894 - 17398061
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  17397894 attgttgattgttgataatcaagttgtttctgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgttgagat 17397992  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17397993 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 17398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 22787108 - 22787351
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    | |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  22787108 gccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgt 22787205  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
     |||||||||  || |||  || ||||||| |||||||| | |||| ||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||| | || |||| |||||    
T  22787206 gtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttgaaattgtaaaaccatatg 22787305  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  22787306 aggtagttgatgttgaatgatattgtggattattgatgatcatgtt 22787351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 721257 - 721162
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  721257 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgtagtgatgtcgcattatcgagtc 721162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 721407 - 721317
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  721407 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgtt 721317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 23822894 - 23822967
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23822894 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 23824838 - 23824911
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23824838 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 23831973 - 23832046
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23831973 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 393
Target Start/End: Original strand, 22787408 - 22787506
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22787408 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagtcgtcctctatattgtggtgaagactgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 22787506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 19670515 - 19670576
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19670515 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22693133 - 22693040
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22693133 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22697780 - 22697687
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22697780 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Original strand, 24088566 - 24088683
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24088566 ttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatg 24088665  T
Q  223 acattgttgattattgat 240  Q
    | ||||||||||||||||    
T  24088666 atattgttgattattgat 24088683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Original strand, 24088752 - 24088810
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24088752 cttggtaatgcaattgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctttatattg 24088810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 4663 - 4735
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4663 tttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692979
Alignment:
Q  346 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcct 22692979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697626
Alignment:
Q  346 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcct 22697626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 24295958 - 24296031
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24295958 tttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 24296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 3800257 - 3800302
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800257 agaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19658739 - 19658678
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| |||||||| |||||||    
T  19658739 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaacatatctggaagttgtcctttatattg 19658678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12727118 - 12727020
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12727118 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaatg 12727021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 394
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138280
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttactaa-aatgtaatgaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 138094  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  138095 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataat 138194  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 394  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138195 ac-aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaagtg-aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 138280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87127
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 87318  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||  |||    
T  87317 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgatttatttgtgtatggacatgttttcttg--aat 87220  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  87219 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 87127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10357
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  113 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 209  Q
     ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatgattgaatggtaaaactatgtgaggtag 10542  T
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  ||||  ||  ||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatatggtgataatgaatcttatgctttgattgtgtatggatatgttttcttgataatgc 10442  T
Q  309 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10441 aaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 10357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77069
Alignment:
Q  345 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 77069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32660
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 32484  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32485 tgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 32584  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32585 tggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34147 - 34037
Alignment:
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34147 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 34049  T
Q  389 gagtcctcgtac 400  Q
    ||||||| ||||    
T  34048 gagtccttgtac 34037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40184
Alignment:
Q  18 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 117  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  118 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 40360  T
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40359 tgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 40260  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40259 tggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Original strand, 38594 - 38807
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38594 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 38693  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  38694 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 38792  T
Q  386 atcgagtcctcgtac 400  Q
    |||||||||| ||||    
T  38793 atcgagtccttgtac 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38522
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T
Q  172 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38472 tgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7485
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7727 tatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 7628  T
Q  252 tgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 350  Q
    ||| |||||| |||||  ||||| ||  ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||    
T  7627 tgtggtgatgatgaatcttatgatttgattgtgcatggacatgttttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatataattgggagtggtcctat 7528  T
Q  351 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7527 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 95 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8125
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  |||||| ||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttgaattggtg 8325  T
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  8324 aaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatg 8225  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8224 ttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3318
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  115 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 3497  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3496 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 3399  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3398 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 5926
Alignment:
Q  15 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  115 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 6105  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6104 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 6007  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6006 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 5926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1336
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1418 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1057
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  1262 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 1163  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1162 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 1064  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  1063 tcgagtc 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 393
Target Start/End: Original strand, 7781 - 8123
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtta 250  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7881 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttg 7980  T
Q  251 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 350  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  7981 atgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtccttt 8080  T
Q  351 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8081 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 393
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13512
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 151  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  152 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtta 250  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13270 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttg 13369  T
Q  251 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 350  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  13370 atgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtccttt 13469  T
Q  351 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13470 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20084
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 20253  T
Q  224 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20252 cattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 20153  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20152 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18000
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18169  T
Q  224 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18168 cattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 18069  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18068 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3352
Alignment:
Q  53 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 152  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 251  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3592 tatgatatcttact-ataatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttga 3494  T
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||  ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  3493 tgtgtgatgaggaatgctatgaattgattgtgtatggacatattttcttgataatgcaaatgttgtggatatgatcaatataattgggagttgtcctata 3394  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3393 tattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtc 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21351
Alignment:
Q  27 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 126  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  127 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21597 ggatatgatg--------------------ctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21517 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 21418  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21417 caatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtc 21351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Original strand, 129466 - 129668
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||| || |||||| ||||||| |||||| || || | ||  ||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  129466 tgaaactatatgtgatagttgaggaatgaaggaccttattgattgttgataaccatgttgatatgcggtgacgaatactatgattttaattgtgtatggg 129565  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  129566 catgttttgttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 129664  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  129665 agtc 129668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 12891
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 13078  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13077 taattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataa 12978  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12977 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 12891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 46819
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 47003  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  47002 gttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatg 46903  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46902 caaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60267
Alignment:
Q  10 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  110 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 60451  T
Q  209 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  60450 gttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatg 60351  T
Q  308 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60350 caaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 60267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44513
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 44678  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||    
T  44677 tagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataa 44578  T
Q  306 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 370  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44577 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtg 44513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 38903
Alignment:
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 39085  T
Q  213 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  39084 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaaa 38985  T
Q  312 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38984 tgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 38903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78242
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-g 78460  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 277  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgattta 78360  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  78359 tttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtt 78260  T
Q  378 gtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||    
T  78259 gtcgcattatcgagtcct 78242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39178
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 39195  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  39194 tagttgatgttgaatga 39178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 74 - 320
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20692
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 173  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatg 20545  T
Q  174 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 273  Q
    |||  || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20546 taagaaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataa 20645  T
Q  274 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20646 tttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaagtgttgtgga 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 395
Target Start/End: Original strand, 20686 - 20715
Alignment:
Q  366 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20686 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 20715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52743
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 52557  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  52558 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataat 52657  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52658 gcgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 52743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56695
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 56509  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  56510 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataat 56609  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  56610 gcgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 56695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 390
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13660
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagtt 13481  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 310  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||| |||||||||||||||||    
T  13482 gatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgggtgtggacatattttcttgataatgcaa 13581  T
Q  311 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 390  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13582 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcga 13660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16311 - 16133
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16311 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 16213  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16212 gtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 16133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 236874
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 237063  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||| ||||||||||    
T  237062 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatattttcttgat 236963  T
Q  304 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  236962 aatgcaaaagatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 271020 - 270813
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactat-gagttatttgcgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |  ||| ||| ||    
T  271020 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatggttttaattgtgt 270921  T
Q  285 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 384  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  270920 atgggcatgttttcttgataatgcaaatgatatggagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcat 270822  T
Q  385 tatcgagtc 393  Q
    |||||||||    
T  270821 tatcgagtc 270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 390
Target Start/End: Original strand, 505 - 861
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 214  Q
    ||||||||||||                  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  604 atgattgtattg------------------agatgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaac 685  T
Q  215 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgatttcttgataatgcaaatgt 785  T
Q  315 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 390  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 86 - 385
Target Start/End: Original strand, 5770 - 6069
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggttt 5869  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 283  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| ||| |    
T  5870 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattgtg 5969  T
Q  284 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 383  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5970 tgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgca 6067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28575
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||     
T  28780 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgg 28681  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28680 gcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 28582  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  28581 gagtcct 28575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28857
Alignment:
Q  13 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 112  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  113 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagtt 28906  T
Q  212 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28905 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 78 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27714
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |  |    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatat-ga 27930  T
Q  178 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagt 275  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | |||| |||||||||||||||| |    
T  27929 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgatt 27831  T
Q  276 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 375  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  27830 taattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattg 27732  T
Q  376 ttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27731 ttgtcgcattatcgagtc 27714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 395
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14734
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 206  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtga 14547  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||||||||    
T  14548 tagttgatgaggagtgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatg-tttcttgataat 14646  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14647 gc-aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtcct 14734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28261
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  28394 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 28295  T
Q  288 agcatgt-tttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
      ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  28294 gacatgtattgcttgataatgcaaatgatgtgga 28261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40257
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  40390 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 40291  T
Q  288 agcatgt-tttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
      ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  40290 gacatgtattgcttgataatgcaaatgatgtgga 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28472
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  28545 aatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40541 - 40468
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  40541 aatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 23801 - 23862
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23801 tttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 23862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 125 - 400
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15338
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15064 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15162  T
Q  222 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15163 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggag 15259  T
Q  322 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15260 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15055
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15040  T
Q  208 agttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  15041 agttgatgttgaatg 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54330
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||| ||    
T  54553 cttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg-------ttgataatcatgttaatgtgtaat 54463  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54462 gatgaatactatgatttaattatgaatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgg 54363  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54362 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 109344 - 109552
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  109344 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 109443  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  109444 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 109542  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  109543 atcgagtcct 109552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 135  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 393
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11394
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 259  Q
    |||||||   |||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  11162 cttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaat 11261  T
Q  260 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 359  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  11262 gttgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtcttgtcctatatattgtgg 11361  T
Q  360 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11362 agaaaattgt-gatttttgtcgcattatcgagtc 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 177 - 395
Target Start/End: Original strand, 18831 - 19049
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  18831 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgattt 18930  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18931 atttgtgcatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggacatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgt 19030  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19031 tgtcgcattatcgagtcct 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18767
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt-acttagaatgtaaagaatacttgaatgg-tgaaactatat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaactatat 18708  T
Q  203 -gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18709 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32541 - 32275
Alignment:
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32541 atatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 32442  T
Q  227 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32441 tgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgtacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 32342  T
Q  327 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32341 caatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 32275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14364
Alignment:
Q  153 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgtta 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgtta 14514  T
Q  251 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14513 atgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatagacatgatttcttgataatgcaaatattgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctat 14414  T
Q  351 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14413 atattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtac 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 187 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 95219 - 95006
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  95219 aatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaactgtgtat 95120  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95119 gggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 95020  T
Q  387 tcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||| ||||    
T  95019 tcgagtccttgtac 95006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95294
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 95347  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 393
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66907
Alignment:
Q  229 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 328  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 66843  T
Q  329 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  66844 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 66907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 248741 - 249008
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatga 248839  T
Q  224 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  248840 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcagatgatgtgggaat 248939  T
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  248940 gaacaatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgt-gatttttgttgcattatcgagtc 249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3124
Alignment:
Q  57 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  157 ctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3025 ctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtg 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Original strand, 155618 - 155821
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  155618 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 155715  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  155716 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 155814  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  155815 atcgagt 155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155546
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaag 155501  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155502 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 155546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Original strand, 732 - 913
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  732 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 828  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  829 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35163 - 35024
Alignment:
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35163 tgtgatgatgaaaactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35065  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35064 ttgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 35024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17797
Alignment:
Q  9 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 108  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  109 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 17683  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 17783  T
Q  307 gcaaatgttgtgga 320  Q
    ||||||| ||||||    
T  17784 gcaaatgatgtgga 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24216
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 206  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 24101  T
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 305  Q
    || ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  24102 taattgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataa 24201  T
Q  306 tgcaaatgttgtgga 320  Q
    |||||||| ||||||    
T  24202 tgcaaatgatgtgga 24216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Original strand, 2723 - 3044
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttaga 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |     
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggg 2822  T
Q  171 atgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    || | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2823 atatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatac 2921  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||    
T  2922 tatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattg 3017  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  3018 tgaattgttgtcgcattatcgagtcct 3044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 393
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23168
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtga 23033  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    |  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23034 taatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataaagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtg 23133  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23134 gtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 23168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 145438 - 145223
Alignment:
Q  177 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  145438 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattt 145339  T
Q  277 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 376  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  145338 atttatgtatgggcatgttttcttaataatgcatatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgt 145240  T
Q  377 tgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||||||    
T  145239 tgtcgcattatcgagtc 145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145502
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  108 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatat-g 203  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||| ||||||||||||| |    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatattg 145559  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145558 tgatagttgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 147685 - 147482
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||| | ||      
T  147685 ggtgaaactatatgtgattgttgatgttgaaggatcttattgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaaattgtgaattg 147586  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147585 gcatgttttcttgataatgcatatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 147487  T
Q  389 gagtc 393  Q
    |||||    
T  147486 gagtc 147482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  85 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 90147 - 90352
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||     
T  90147 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtg 90246  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||    
T  90247 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgga---ttgtcgcatt 90342  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  90343 atcgagtcct 90352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 187 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 129281 - 129076
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  129281 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgatttattt--gtgt 129184  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||  |||||||||||||||    
T  129183 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcatta 129085  T
Q  387 tcgagtcct 395  Q
    |||||||||    
T  129084 tcgagtcct 129076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129353
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  107 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 129370  T
Q  207 tagttgatgttgaatga 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  129369 tagttgatgttgaatga 129353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90075
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 185  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 90037  T
Q  186 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  90038 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 90075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 78471 - 78410
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  78471 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 78410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4531
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggc 4635  T
Q  291 atgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4634 atgttttcttgataatgcta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcga 4536  T
Q  391 gtcct 395  Q
    |||||    
T  4535 gtcct 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 17545 - 17340
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  17545 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 17446  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  17445 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattg-ggattgttgtcgcatta 17347  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  17346 tcgagtc 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17618
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 175  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgta 17665  T
Q  176 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17664 aggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2593
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  2395 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaaatgtgtat 2494  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2495 ggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2319
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 160  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  161 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 218  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 395
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27982
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||    
T  27781 tgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggca 27880  T
Q  292 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 391  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27881 tgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgag 27978  T
Q  392 tcct 395  Q
    ||||    
T  27979 tcct 27982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 154
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| || |    | |||||| |||| |   |    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgg-g 369  T
Q  179 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 277  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgattta 269  T
Q  278 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 377  Q
     ||  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  268 attatgtatggacatattttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgtt 170  T
Q  378 gtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||    
T  169 gtcgcattatcgagtc 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25592
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 25816  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  25815 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 25717  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |    
T  25716 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatgg 25618  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  25617 t-gattgttgtcgcattatcgagtcct 25592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21337
Alignment:
Q  74 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgtttttccctattacttgg 21561  T
Q  170 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 268  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21560 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 21462  T
Q  269 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |    
T  21461 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatgg 21363  T
Q  369 tggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  21362 t-gattgttatcgcattatcgagtcct 21337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145621
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  107 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaaactatatg 145807  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 303  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  145806 agatagtggatg-tgaatgacattgttgattattgatgatcatgt-----tgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgat 145713  T
Q  304 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||    
T  145712 aatgctaatgttgtggagatgatcaatatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatcgtgaattgatgtcgcattatcaagtc 145621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 5874
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||     
T  6076 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtg 5979  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  5978 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 5881  T
Q  386 atcgagt 392  Q
    |||||||    
T  5880 atcgagt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 393
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217218
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga-gttatttgcgtatgag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattttaattgtgtatggg 217115  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  217116 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattat-gattgttgtcgcattatcg 217214  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  217215 agtc 217218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6148
Alignment:
Q  78 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 177  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 6193  T
Q  178 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1874
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || ||     
T  2078 tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgg 1979  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1978 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 1881  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  1880 gagtcct 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 153  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 395
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6619
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  6415 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 6514  T
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6515 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatc 6612  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  6613 gagtcct 6619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 207 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8771
Alignment:
Q  207 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8957 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatggacatgttttcttgataat 8858  T
Q  307 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8857 gcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 395
Target Start/End: Original strand, 2958 - 3162
Alignment:
Q  191 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || || |    
T  2958 gtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgatctatttgtgtgtggg 3057  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3058 catgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcg 3156  T
Q  390 agtcct 395  Q
    ||||||    
T  3157 agtcct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2882
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 2839  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2840 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 245
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || | ||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggtat 347  T
Q  293 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346 gttttcttgataatgtta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 248  T
Q  393 cct 395  Q
    |||    
T  247 cct 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43275
Alignment:
Q  16 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 115  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  116 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaatcatatgtgatagttgatg 43249  T
Q  216 ttgaatgacattgttgattattgata 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  43250 tttaatgacattgttgattattgata 43275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113883
Alignment:
Q  17 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  117 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatg 215  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatg 113849  T
Q  216 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113850 ttgaatgacattgttgataattgataatcatgtt 113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108343
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  108 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 204  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| || | |||||||||      
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaagtgataaaactatataa 108542  T
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 294  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||  |||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||     
T  108541 ggtagttgatgttgaagaacattgttgattattaatgatcatgatgatgtggtgataatgaatcttatttgaattatgatttgattgtgtatggacatga 108442  T
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  108441 tttcttaataatgcaattgttctggagatgatcaatatatttagaaattgtcctttatattgtggtggaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 108343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6619
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6441 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactttgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttgataatgcaa-tgtt 6539  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6540 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtcct 6619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 106297 - 106370
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  106297 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41605 - 41399
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |||||| ||| ||| | |    
T  41605 aatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattgtgaa 41506  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  41505 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagattaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 41407  T
Q  386 atcgagtc 393  Q
    ||||||||    
T  41406 atcgagtc 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41677
Alignment:
Q  162 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 41677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 82 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 164
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 246  T
Q  180 atacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  245 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 1
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  86 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38213 - 37978
Alignment:
Q  155 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 253  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38213 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 38116  T
Q  254 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 353  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38115 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 38019  T
Q  354 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38018 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcct 37978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40487 - 40291
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  40487 ggtgaaactatatgtgatagttga------atgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgag 40394  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40393 catgttttcttgataatgcaaatgttgtgtagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 40295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  97 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 205 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 69646 - 69456
Alignment:
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  69646 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 69547  T
Q  305 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  69546 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcct 69456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30957 - 30768
Alignment:
Q  205 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 303  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  30957 gatagttaatattgaatgacattgttgattattgatgatcttgttcatgtggtgataatgaatgttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgat 30858  T
Q  304 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30857 aatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23898
Alignment:
Q  29 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  129 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 227  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacatt 23931  T
Q  228 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23930 gttgattattgataatcatgttaatgtatgatg 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6575
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||     
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T
Q  173 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 266  Q
    ||||  ||| |||||| || | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||        
T  6806 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataaggaatctta 6707  T
Q  267 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 361  Q
         | ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6706 attgaattatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataattcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtg 6607  T
Q  362 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6606 aaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1666
Alignment:
Q  63 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 162  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  163 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1607 tacttataatgtaaggaatggttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2095
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| ||||    
T  1889 aatggtgaaaccatatgagataattgttgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtat 1988  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtcgagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 2088  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    | |||||    
T  2089 tagagtc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  52 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30223 - 30042
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30223 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30127  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30126 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcct 30042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 29942
Alignment:
Q  147 aatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30127 aatgtgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatc 30028  T
Q  245 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaat 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30027 atgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgattttatgataatgcaaatgttgtggagatgatcaat 29942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27336 - 27260
Alignment:
Q  324 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctcgtac 400  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27336 aatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 754
Alignment:
Q  11 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  111 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 207  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgagat 787  T
Q  208 agttgatgttgaatgacattgttgattattgat 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 agttaatgttgaatgacattgttgattattgat 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2937
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  108 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 203  Q
    |||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||  |||| ||||  | ||| |||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtttgaaatggtaaaactatatg 2737  T
Q  204 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatg 293  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||         | ||| | ||  ||| |||||   |||    
T  2738 aggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatttgaaatataaattgattgtgtatggaaatg 2837  T
Q  294 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
     ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  2838 atttcttgataataaaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 2937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 935
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 978  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15191
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaagga 15234  T
Q  180 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 880 - 771
Alignment:
Q  283 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  880 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 782  T
Q  383 attatcgagtc 393  Q
    |||||||||||    
T  781 attatcgagtc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 15027
Alignment:
Q  283 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15136 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 15038  T
Q  383 attatcgagtc 393  Q
    |||||||||||    
T  15037 attatcgagtc 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  108 atgaatgaat 117  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 393
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6805
Alignment:
Q  160 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 258  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtga 6670  T
Q  259 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 358  Q
    |  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6671 taatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcatgataatgcaaattttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgtg 6770  T
Q  359 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6771 gtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5676
Alignment:
Q  14 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  114 gaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 174  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  5614 gaatgactatatgttggatgtgatg-ttatcatggaatgttgtatgtgctcttacttagaatgt 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 106867 - 106690
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  106867 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 106769  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  106768 tggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtcct 106690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 395
Target Start/End: Original strand, 17353 - 17560
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 285  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || ||     
T  17353 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctgtgatgtaactgtgtg 17452  T
Q  286 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 385  Q
    |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  17453 tagacatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatcattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 17550  T
Q  386 atcgagtcct 395  Q
    ||||||||||    
T  17551 atcgagtcct 17560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7673
Alignment:
Q  192 tgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | ||| || |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  7875 tgaaactatatgtgatagttgatgagtggaagaccttattgattgttgataatcatgttgttgtgtggtgatgaatactatgattttaattgtgtatggg 7776  T
Q  290 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7775 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaactatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgtattatcg 7677  T
Q  390 agtc 393  Q
    ||||    
T  7676 agtc 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  86 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 210 - 393
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11504
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  11322 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtatgtgggcatgtttccttgataatgca 11421  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11422 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 393
Target Start/End: Original strand, 4862 - 5067
Alignment:
Q  190 ggtgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat--ttgcgtat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |  ||| ||||    
T  4862 ggtgaaactatatgtgatagttgatgagtggaagaccttattgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgatttttaattgtgtat 4961  T
Q  287 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||     
T  4962 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattg 5060  T
Q  387 tcgagtc 393  Q
    |||||||    
T  5061 tcgagtc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  95 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 51897 - 51728
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 316  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  51897 tgaatgatattgttgattgttgataaccaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 51799  T
Q  317 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 387  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  51798 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattat 51728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4823
Alignment:
Q  245 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 344  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  4970 atgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgcgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttg 4871  T
Q  345 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4870 tcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgtgttatcgagt 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2114
Alignment:
Q  76 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 172  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||     
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T
Q  173 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 266  Q
    ||||  ||| |||||| || | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||   ||||        
T  2342 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgttgtgataaagaatctta 2243  T
Q  267 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 361  Q
         | ||| | ||  ||| |||||   ||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  2242 attaaaatataaattgattgtgtatggaaatgatttcttaataataaaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtg 2143  T
Q  362 aaaattgtggattgttgtcgcattatcga 390  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2142 aaaattgtgaattgatgtcgcattatcga 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 59016 - 58899
Alignment:
Q  268 ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59016 ctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgatcaatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaatt 58917  T
Q  368 gtggattgttgtcgcatt 385  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58916 gtggattgttgtcgcatt 58899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59561
Alignment:
Q  134 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||     
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgttgg 59576  T
Q  233 ttattgataatcatg 247  Q
    ||||| || ||||||    
T  59575 ttattaatgatcatg 59561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 59422 - 59375
Alignment:
Q  225 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatg 272  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  59422 attgatgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1672
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34466 - 34334
Alignment:
Q  189 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  34466 tggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 34367  T
Q  288 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 320  Q
      ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34366 gacatgttttcttgataatacaaatgatgtgga 34334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1262
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 315  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1078 tgaatgataatgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 1176  T
Q  316 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag-gtga-----aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1177 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtcct 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5700
Alignment:
Q  210 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 309  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  5867 ttgattttgtatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5771  T
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 380  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5770 aatgttgttgagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtc 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 395
Target Start/End: Original strand, 9291 - 9396
Alignment:
Q  289 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9291 gcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatc 9389  T
Q  389 gagtcct 395  Q
    |||||||    
T  9390 gagtcct 9396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15073 - 14988
Alignment:
Q  310 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 14988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20600 - 20391
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcg 283  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||         | ||||| ||  | | |    
T  20600 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaatcttatttgaattatgacttgatcgtg 20501  T
Q  284 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 383  Q
    ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  20500 tatggacgtgatttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgca 20401  T
Q  384 ttatcgagtc 393  Q
    ||||||||||    
T  20400 ttatcgagtc 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27429 - 27220
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcg 283  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||         | ||||| ||  | | |    
T  27429 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaatcttatttgaattatgacttgatcgtg 27330  T
Q  284 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 383  Q
    ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  27329 tatggacgtgatttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgca 27230  T
Q  384 ttatcgagtc 393  Q
    ||||||||||    
T  27229 ttatcgagtc 27220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4218
Alignment:
Q  266 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 365  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4092 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 4191  T
Q  366 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4192 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Original strand, 48932 - 49058
Alignment:
Q  266 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 365  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  48932 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 49031  T
Q  366 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49032 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 49058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 279 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4648 - 4534
Alignment:
Q  279 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 378  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648 ttgcgtatggacatattttattgatgatgcaaatgttgtggagatgatcaaaataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttg 4549  T
Q  379 tcgcattatcgagtc 393  Q
    || ||||||||||||    
T  4548 tcacattatcgagtc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  8 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  108 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 142  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53203 - 53141
Alignment:
Q  187 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53203 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgatgatcatgtt 53141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 53328 - 53279
Alignment:
Q  211 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53328 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 393
Target Start/End: Original strand, 197482 - 197572
Alignment:
Q  302 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  197482 ataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 197572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  82 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4469
Alignment:
Q  252 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 351  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4603 tgtgtgatgataaatactgtgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 4505  T
Q  352 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 388  Q
    |||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  4504 tattga-gtcgagattgagaattgttgtcgcattatc 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4801
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4728 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 7041 - 7114
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7041 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7290
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  7387 ttcttgataatgtaattgttgtagaggtgatcaatatatttggatgttgtcctttatattgttgtggaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtc 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 71655 - 71728
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  71655 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaggtgtcctttatattgttgtgaaaattg 71728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3739
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3667 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 484 - 429
Alignment:
Q  194 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 249  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  484 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgtt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6116
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 393  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  6021 cttgataatgaaattgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 992
Alignment:
Q  357 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1030 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4759
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4820 tttcttgagaatgcagatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 117977 - 118049
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  117977 tttcttaataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Original strand, 23663 - 23786
Alignment:
Q  125 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 222  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| | |  |||| ||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23663 ttggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaataattgaagtggtgaaactatctgatgtagttgatgttgaatg 23762  T
Q  223 acattgttgattattgataatcat 246  Q
    | |||| ||||||||||| |||||    
T  23763 atattgatgattattgatgatcat 23786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12936
Alignment:
Q  295 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12986 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgt 12936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 78206 - 78265
Alignment:
Q  296 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  78206 ttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaggctgtcctttatatt 78265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Original strand, 6400 - 6450
Alignment:
Q  186 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 236  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  6400 gaatggtgaaactatatgacatagttaatgttgaatgatattgatgattat 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34261 - 34203
Alignment:
Q  298 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 356  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34261 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 34203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2761 - 2696
Alignment:
Q  217 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttg 281  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2761 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University