View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6867A_low_344 (Length: 240)

Name: NF6867A_low_344
Description: NF6867A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6867A_low_344
NF6867A_low_344
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (12-223)||(123375-123584)
scaffold0029 (180-222)||(77391-77433)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (12-223)||(9582899-9583108)
chr7 (12-223)||(14551104-14551314)
chr7 (12-223)||(16119849-16120058)
chr7 (12-219)||(23515073-23515278)
chr7 (12-223)||(8717871-8718080)
chr7 (12-223)||(13673862-13674071)
chr7 (12-223)||(18593352-18593561)
chr7 (12-223)||(18618123-18618332)
chr7 (13-223)||(4312564-4312772)
chr7 (13-223)||(538755-538964)
chr7 (13-223)||(12567020-12567229)
chr7 (14-223)||(12548805-12549012)
chr7 (60-223)||(8780936-8781101)
chr7 (60-222)||(48801777-48801939)
chr7 (13-221)||(9003958-9004165)
chr7 (13-223)||(20108375-20108584)
chr7 (68-223)||(13657926-13658081)
chr7 (64-223)||(11921307-11921463)
chr7 (16-223)||(9264939-9265145)
chr7 (160-223)||(16465616-16465679)
chr7 (64-223)||(16532150-16532311)
chr7 (64-223)||(16633351-16633512)
chr7 (167-223)||(825783-825839)
chr7 (167-223)||(4461242-4461298)
chr7 (167-223)||(14221718-14221774)
chr7 (167-223)||(15916776-15916832)
chr7 (167-223)||(18287761-18287817)
chr7 (167-223)||(27291496-27291552)
chr7 (160-223)||(15206584-15206647)
chr7 (165-223)||(5397273-5397331)
chr7 (174-223)||(15065935-15065984)
chr7 (170-223)||(9194544-9194597)
chr7 (167-219)||(6713072-6713124)
chr7 (181-222)||(4791383-4791424)
chr7 (167-222)||(15348532-15348587)
chr7 (167-207)||(15522517-15522557)
chr7 (180-222)||(15940731-15940773)
chr7 (64-93)||(16465743-16465772)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (12-223)||(15699561-15699770)
chr6 (12-223)||(22165549-22165758)
chr6 (12-223)||(22243818-22244027)
chr6 (12-223)||(22061503-22061712)
chr6 (13-223)||(24855245-24855453)
chr6 (63-223)||(22767116-22767276)
chr6 (12-223)||(20170248-20170458)
chr6 (60-223)||(18448185-18448349)
chr6 (13-223)||(23023093-23023302)
chr6 (13-223)||(25625691-25625899)
chr6 (60-223)||(2181105-2181269)
chr6 (60-223)||(18854063-18854226)
chr6 (13-219)||(20107784-20107989)
chr6 (13-223)||(21560554-21560762)
chr6 (60-223)||(29595741-29595904)
chr6 (13-223)||(25631269-25631477)
chr6 (60-223)||(30671807-30671971)
chr6 (66-223)||(25963299-25963457)
chr6 (66-223)||(25967946-25968104)
chr6 (160-223)||(18184874-18184937)
chr6 (166-223)||(35270971-35271028)
chr6 (160-223)||(18731868-18731931)
chr6 (160-223)||(20218981-20219044)
chr6 (160-223)||(22113006-22113069)
chr6 (167-223)||(11204004-11204060)
chr6 (60-143)||(19585622-19585705)
chr6 (167-219)||(23517835-23517887)
chr6 (167-223)||(29686601-29686657)
chr6 (12-112)||(20016339-20016438)
chr6 (13-49)||(29686449-29686485)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (12-223)||(11496614-11496823)
chr4 (12-223)||(13822919-13823128)
chr4 (12-223)||(42709731-42709940)
chr4 (12-223)||(15254354-15254563)
chr4 (14-223)||(10630758-10630965)
chr4 (13-223)||(3354646-3354855)
chr4 (14-223)||(18291945-18292153)
chr4 (60-223)||(18081459-18081624)
chr4 (60-223)||(56580539-56580704)
chr4 (14-223)||(17484910-17485118)
chr4 (14-223)||(38426745-38426938)
chr4 (13-223)||(45234232-45234441)
chr4 (160-223)||(14653998-14654061)
chr4 (167-221)||(15865647-15865701)
chr4 (167-223)||(10650547-10650603)
chr4 (167-223)||(15260109-15260165)
chr4 (167-223)||(16682913-16682969)
chr4 (172-223)||(15409534-15409585)
chr4 (167-223)||(9488878-9488934)
chr4 (163-223)||(8092427-8092487)
chr4 (174-222)||(17296250-17296298)
chr4 (60-93)||(8092559-8092592)
chr4 (178-222)||(14233257-14233301)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (12-223)||(10602472-10602681)
chr3 (12-223)||(13504881-13505090)
chr3 (12-223)||(11947413-11947622)
chr3 (12-223)||(16448760-16448969)
chr3 (12-223)||(7600361-7600570)
chr3 (16-223)||(15556942-15557147)
chr3 (12-223)||(16373565-16373774)
chr3 (12-223)||(9360971-9361180)
chr3 (12-223)||(12187076-12187285)
chr3 (12-223)||(37942384-37942593)
chr3 (14-222)||(12193491-12193697)
chr3 (12-219)||(6814874-6815079)
chr3 (12-223)||(10147017-10147226)
chr3 (63-223)||(15645056-15645216)
chr3 (12-223)||(10160173-10160382)
chr3 (63-222)||(13187418-13187577)
chr3 (60-222)||(3245589-3245751)
chr3 (13-223)||(10546936-10547148)
chr3 (60-223)||(4382796-4382961)
chr3 (60-223)||(13001425-13001590)
chr3 (13-223)||(13097711-13097919)
chr3 (14-223)||(2721305-2721511)
chr3 (13-223)||(20156515-20156722)
chr3 (13-223)||(13690608-13690816)
chr3 (60-223)||(1992848-1993011)
chr3 (60-223)||(14348588-14348752)
chr3 (13-223)||(11398215-11398424)
chr3 (60-223)||(12160207-12160372)
chr3 (16-223)||(22637702-22637908)
chr3 (60-223)||(3279235-3279399)
chr3 (167-223)||(27356728-27356784)
chr3 (62-215)||(17045749-17045902)
chr3 (62-215)||(17047909-17048062)
chr3 (166-223)||(13601220-13601277)
chr3 (63-223)||(17387884-17388045)
chr3 (167-223)||(3339226-3339282)
chr3 (167-223)||(12776534-12776590)
chr3 (167-223)||(13136210-13136266)
chr3 (167-223)||(20584262-20584318)
chr3 (172-223)||(15946773-15946824)
chr3 (165-223)||(14445768-14445826)
chr3 (167-223)||(15619283-15619339)
chr3 (179-223)||(13195458-13195502)
chr3 (12-106)||(16655804-16655897)
chr3 (168-223)||(8686387-8686442)
chr3 (160-223)||(20225754-20225817)
chr3 (179-223)||(13068313-13068357)
chr3 (192-223)||(2005499-2005530)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (12-223)||(22665068-22665277)
chr2 (12-223)||(22044660-22044869)
chr2 (12-223)||(25357517-25357726)
chr2 (12-223)||(117549-117758)
chr2 (12-223)||(16775657-16775866)
chr2 (65-223)||(17590464-17590622)
chr2 (13-223)||(11615-11823)
chr2 (12-223)||(24795285-24795494)
chr2 (12-223)||(27627586-27627796)
chr2 (13-223)||(25144757-25144966)
chr2 (14-223)||(5500265-5500473)
chr2 (60-223)||(25804267-25804430)
chr2 (61-223)||(23798922-23799084)
chr2 (60-223)||(23643995-23644160)
chr2 (64-218)||(25370890-25371044)
chr2 (69-223)||(24178193-24178348)
chr2 (167-223)||(23159385-23159441)
chr2 (167-223)||(23570642-23570698)
chr2 (167-223)||(27631655-27631711)
chr2 (167-223)||(27768816-27768872)
chr2 (172-223)||(24171510-24171561)
chr2 (13-143)||(24502168-24502297)
chr2 (160-223)||(24506802-24506865)
chr2 (167-223)||(23257570-23257625)
chr2 (167-219)||(24321328-24321380)
chr2 (160-223)||(25337651-25337714)
chr2 (179-222)||(19805618-19805661)
chr2 (179-222)||(29955870-29955913)
chr2 (180-222)||(17334606-17334648)
chr2 (162-204)||(23648123-23648165)
chr2 (174-222)||(21512567-21512615)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (12-223)||(27046880-27047089)
chr1 (12-223)||(17094601-17094810)
chr1 (12-223)||(21798662-21798872)
chr1 (12-223)||(20237462-20237671)
chr1 (60-219)||(8653168-8653327)
chr1 (60-223)||(52938621-52938785)
chr1 (135-223)||(14070632-14070720)
chr1 (61-223)||(19364082-19364244)
chr1 (60-223)||(3989989-3990154)
chr1 (165-219)||(19875648-19875702)
chr1 (160-223)||(21784472-21784535)
chr1 (160-223)||(4027832-4027895)
chr1 (167-220)||(16382578-16382631)
chr1 (160-223)||(8947515-8947578)
chr1 (180-222)||(18478234-18478276)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (12-223)||(20595831-20596040)
chr5 (12-223)||(20602117-20602326)
chr5 (12-223)||(20608408-20608617)
chr5 (12-223)||(15735540-15735749)
chr5 (12-223)||(23748057-23748266)
chr5 (12-198)||(23710701-23710886)
chr5 (13-223)||(24940540-24940749)
chr5 (63-223)||(18072955-18073115)
chr5 (12-223)||(24953174-24953383)
chr5 (14-205)||(20622170-20622359)
chr5 (63-223)||(20790714-20790874)
chr5 (13-223)||(23600636-23600845)
chr5 (13-223)||(24219752-24219961)
chr5 (13-219)||(20444843-20445048)
chr5 (60-223)||(21387441-21387605)
chr5 (167-223)||(22317513-22317569)
chr5 (167-223)||(25006808-25006864)
chr5 (167-223)||(30759655-30759711)
chr5 (160-223)||(18484212-18484275)
chr5 (173-223)||(25116171-25116221)
chr5 (179-223)||(25175261-25175305)
chr5 (167-223)||(26847803-26847859)
chr5 (17-223)||(20916456-20916660)
chr5 (13-93)||(22948518-22948596)
chr5 (179-219)||(22855735-22855775)
chr5 (179-222)||(27270564-27270607)
chr5 (61-139)||(20575555-20575633)
chr5 (174-222)||(17412736-17412784)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (12-223)||(15684-15893)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (12-223)||(21382099-21382309)
chr8 (12-223)||(21098794-21099003)
chr8 (12-223)||(21104115-21104324)
chr8 (12-223)||(23911447-23911655)
chr8 (12-223)||(8314473-8314683)
chr8 (12-223)||(8322846-8323056)
chr8 (13-223)||(21843524-21843733)
chr8 (60-223)||(21939996-21940161)
chr8 (13-223)||(20038981-20039189)
chr8 (68-223)||(17620806-17620961)
chr8 (64-223)||(16418620-16418781)
chr8 (60-223)||(24034065-24034230)
chr8 (14-223)||(23454945-23455154)
chr8 (112-223)||(20712537-20712649)
chr8 (167-223)||(11346953-11347009)
chr8 (167-223)||(19767684-19767740)
chr8 (167-223)||(22370102-22370158)
chr8 (172-223)||(20002279-20002330)
chr8 (60-223)||(21538599-21538765)
chr8 (179-223)||(21831188-21831232)
chr8 (179-223)||(22033555-22033599)
chr8 (179-223)||(22099655-22099699)
chr8 (167-223)||(22102552-22102608)
chr8 (160-212)||(14352181-14352233)
chr8 (179-223)||(22817762-22817806)
chr8 (180-222)||(19902174-19902216)
chr8 (174-222)||(18572977-18573025)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (63-223)||(1093-1253)
scaffold0404 (150-223)||(3451-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (12-223)||(615-825)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (13-223)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (60-223)||(11101-11264)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (16-223)||(2852-3058)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (13-223)||(220-428)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (14-223)||(14662-14869)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (65-223)||(164403-164562)
scaffold0011 (160-222)||(172254-172316)
scaffold0011 (160-223)||(161995-162058)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (60-223)||(876-1041)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (60-223)||(2287-2451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (60-223)||(120998-121162)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (13-223)||(7941-8149)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (105-223)||(10206-10325)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (16-223)||(482-687)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (76-223)||(8720-8869)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (64-223)||(97726-97887)
scaffold0032 (178-218)||(25658-25697)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (68-223)||(35104-35251)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (64-223)||(1157-1318)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (62-221)||(12450-12609)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (64-223)||(58628-58789)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (62-221)||(232789-232948)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (60-223)||(510-673)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (122-223)||(38508-38610)
scaffold0096 (60-93)||(38625-38658)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (160-223)||(5232-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (160-223)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (160-223)||(50506-50569)
scaffold0035 (180-222)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (165-223)||(912-970)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (167-223)||(2762-2818)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (172-223)||(12743-12794)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (160-223)||(13002-13065)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (160-219)||(22159-22218)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (160-223)||(22756-22818)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (167-223)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (167-223)||(54849-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (160-223)||(1839-1902)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (160-223)||(37743-37806)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (167-222)||(1193-1248)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (183-223)||(18223-18263)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (160-223)||(45228-45291)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (165-219)||(37868-37922)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (173-223)||(72572-72622)
scaffold0037 (173-223)||(84762-84812)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (13-49)||(2859-2895)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (167-207)||(83174-83214)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (178-218)||(9138-9177)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (180-220)||(3251-3291)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 123375 - 123584
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123375 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 123472  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123473 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 123572  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  123573 gggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 9582899 - 9583108
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582899 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 9582996  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582997 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 9583096  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  9583097 gggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 14551104 - 14551314
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551104 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaa-ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 14551202  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551203 tgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 14551302  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  14551303 gggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16120058 - 16119849
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120058 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 16119961  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119960 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 16119861  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  16119860 gggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 23515073 - 23515278
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515073 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 23515170  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515171 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 23515270  T
Q  212 gggagttt 219  Q
    ||||||||    
T  23515271 gggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 8717871 - 8718080
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8717871 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaagccct 8717968  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717969 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 8718068  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  8718069 gggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 13673862 - 13674071
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673862 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 13673959  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13673960 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 13674059  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  13674060 gggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18593561 - 18593352
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18593561 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--ttccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaagccct 18593464  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18593463 tgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 18593364  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  18593363 gggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 18618123 - 18618332
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18618123 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--ttccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaagccct 18618220  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18618221 tgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 18618320  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  18618321 gggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagccttt 4312661  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312662 gaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4312761  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  4312762 ggagtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || ||||    
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaaccct 538867  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538866 tcaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 538767  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  538766 gggagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagccctt 12567117  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | || || || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12567118 gaggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgg 12567217  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  12567218 gggagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttg 12548915  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||  | | ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12548914 aggagacatgta-tttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgg 12548816  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  12548815 ggagtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8781101 - 8780936
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||    
T  8781101 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtt 8781002  T
Q  158 ggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781001 tatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48801939 - 48801777
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   |    
T  48801939 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtt 48801843  T
Q  157 tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48801842 tattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||          | ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--tcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagccttt 9004055  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9004056 gaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgg 9004155  T
Q  212 gggagtttga 221  Q
    ||||||||||    
T  9004156 gggagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagccttt 20108472  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||    ||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20108473 gaggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgg 20108572  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20108573 gggagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Original strand, 13657926 - 13658081
Alignment:
Q  68 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| |    
T  13657926 aatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgaggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctacca 13658025  T
Q  168 tgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13658026 tgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11921463 - 11921307
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgc 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||    
T  11921463 aagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgc 11921368  T
Q  163 tactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921367 taccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  16 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgag 9265048  T
Q  116 gagacatgtgcttta-attgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||  | |||  ||||||||||||| || ||    || |  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265047 gagacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 9264948  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  9264947 agtttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465616
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 16532150 - 16532311
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   ||    
T  16532150 aagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatg 16532249  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16532250 ctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16633512 - 16633351
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   ||    
T  16633512 aagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatg 16633413  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16633412 ctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  170 tttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4791424 - 4791383
Alignment:
Q  181 tgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791424 tgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16465772 - 16465743
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465772 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 15699561 - 15699770
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699561 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 15699658  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699659 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 15699758  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  15699759 gggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22165758 - 22165549
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165758 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 22165661  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165660 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 22165561  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22165560 gggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 22243818 - 22244027
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243818 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 22243915  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243916 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 22244015  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22244016 gggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22061712 - 22061503
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061712 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 22061615  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22061614 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 22061515  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22061514 gggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccct 24855356  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24855355 tgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 24855257  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  24855256 gggagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22767276 - 22767116
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22767276 caagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatg 22767178  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22767177 ttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 20170248 - 20170458
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20170248 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 20170345  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ctgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20170346 ttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat 20170444  T
Q  210 gggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||    
T  20170445 gggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 18448185 - 18448349
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || ||     
T  18448185 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttt 18448284  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448285 gtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagccctt 23023190  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023191 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 23023290  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  23023291 gggagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagccctt 25625788  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
     ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25625789 aaggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggg 25625888  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  25625889 ggagtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 2181105 - 2181269
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg- 158  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||      
T  2181105 ttacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttt 2181204  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181205 gtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 18854063 - 18854226
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||      
T  18854063 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacatgtgtattaattaaattgtcatatgataatattgttta 18854162  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18854163 tgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagccttt 20107892  T
Q  113 gaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||||||| || | || || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107891 gaggagacataagttttcaattgaattgtcatatgtt-tatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 20107793  T
Q  211 ggggagttt 219  Q
    |||||||||    
T  20107792 ggggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaagga--ttacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagccttt 21560665  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21560664 gaggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 21560565  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  21560564 ggagtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 29595741 - 29595904
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||      
T  29595741 ttacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggggagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttattta 29595840  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29595841 tgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgagggagtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagccttt 25631380  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac--tgttggt-gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 209  Q
    || |||| ||  | |||||||||||||||||   ||||||   ||||  | ||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25631379 gaagagatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgt 25631283  T
Q  210 gggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||    
T  25631282 gggggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30671971 - 30671807
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |||     ||||||||||||||||| || ||   || | |     
T  30671971 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgctt 30671872  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671871 atgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Original strand, 25963299 - 25963457
Alignment:
Q  66 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgcta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  |||||    
T  25963299 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgcta 25963398  T
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963399 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Original strand, 25967946 - 25968104
Alignment:
Q  66 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgcta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  |||||    
T  25967946 gaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgcta 25968045  T
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25968046 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  166 tatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19585705 - 19585622
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcat 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  19585705 ttacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagccttttaggagacatgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20016438 - 20016339
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |          || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20016438 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatag--aataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaagccc 20016341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686485
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttg 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttg 29686485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11496823 - 11496614
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496823 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 11496726  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496725 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 11496626  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  11496625 gggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 13822919 - 13823128
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822919 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 13823016  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823017 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 13823116  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  13823117 gggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagccct 42709843  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709842 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 42709743  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  42709742 gggagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 15254354 - 15254563
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15254354 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaaccct 15254451  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254452 taaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 15254551  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  15254552 gggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttg 10630855  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630856 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 10630954  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  10630955 ggagtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagccctt 3354743  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3354744 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgg 3354843  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  3354844 gggagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttg 18292042  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18292043 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggg 18292142  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  18292143 ggagtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18081624 - 18081459
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||     
T  18081624 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttc 18081525  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081524 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56580704 - 56580539
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||     
T  56580704 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattt 56580605  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580604 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataagga--ttataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctg 17485021  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485020 aggagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 17484921  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  17484920 ggagtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttg 38426842  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426843 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 38426928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagccttt 45234344  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||   ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45234343 gaggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgg 45234244  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  45234243 gggagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  172 tatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  163 tactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8092592 - 8092559
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092592 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Original strand, 14233257 - 14233301
Alignment:
Q  178 atttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  14233257 atttgcttgaggacaagcaatggttcaagtataggggagtttgat 14233301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10602681 - 10602472
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602681 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 10602584  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602583 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 10602484  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  10602483 gggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13505090 - 13504881
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505090 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 13504993  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504992 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 13504893  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  13504892 gggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 11947413 - 11947622
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947413 tcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 11947510  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11947511 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgg 11947610  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  11947611 gggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16448969 - 16448760
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16448969 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaagccct 16448872  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16448871 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16448772  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  16448771 gggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 7600361 - 7600570
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600361 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 7600458  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7600459 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 7600558  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  7600559 gggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15557147 - 15556942
Alignment:
Q  16 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557147 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--tttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 15557050  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557049 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 15556950  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  15556949 gtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16373774 - 16373565
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16373774 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 16373677  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16373676 ttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 16373578  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  16373577 ggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9361180 - 9360971
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9361180 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaagccct 9361083  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9361082 tgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 9360983  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  9360982 gggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12187285 - 12187076
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12187285 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 12187188  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12187187 ttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 12187089  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  12187088 ggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 37942384 - 37942593
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37942384 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 37942481  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37942482 ttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 37942580  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  37942581 ggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 12193600  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12193599 gaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggg 12193501  T
Q  213 ggagtttgat 222  Q
    ||||||||||    
T  12193500 ggagtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 6814874 - 6815079
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6814874 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttatgccc 6814971  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6814972 ttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 6815070  T
Q  211 ggggagttt 219  Q
     ||||||||    
T  6815071 agggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 10147017 - 10147226
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10147017 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 10147114  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10147115 ttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtatg 10147213  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  10147214 ggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 15645056 - 15645216
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtg 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  15645056 caagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatg 15645154  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15645155 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10160382 - 10160173
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10160382 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagccc 10160285  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10160284 ttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 10160186  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  10160185 ggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13187577 - 13187418
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  13187577 caagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatg 13187479  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13187478 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3245751 - 3245589
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||      
T  3245751 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttta 3245652  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245651 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 4382796 - 4382961
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||     
T  4382796 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttc 4382895  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382896 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13001590 - 13001425
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||     
T  13001590 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttt 13001491  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001490 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaagga--ttacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagccttt 13097808  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13097809 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggg 13097908  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  13097909 ggagtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttg 2721402  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2721403 aggagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-ggg 2721501  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  2721502 gagtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||          |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagt--ttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagccttt 20156625  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || || |||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20156624 gaggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaa-gattcaagtgtgg 20156527  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20156526 gggagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaagga--ttacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagccttt 13690705  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  13690706 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggg 13690805  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  13690806 ggagtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 1992848 - 1993011
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||      
T  1992848 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttta 1992947  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  1992948 tgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagagagtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14348752 - 14348588
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| || ||   || | |     
T  14348752 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgctt 14348653  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348652 atgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagccttt 11398312  T
Q  113 gaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    || |||||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11398313 gaagagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgg 11398412  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  11398413 gggagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12160372 - 12160207
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||     
T  12160372 ttacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttgaggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattt 12160273  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160272 tatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  16 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgag 22637799  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||| |||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22637800 gaggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtagggg 22637899  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  22637900 agtttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 3279235 - 3279399
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatata-actgttg 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||||||||   | ||||||| ||||||||| || ||   | ||||     
T  3279235 ttacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgaggagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgttt 3279334  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     || | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3279335 atgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 17045749 - 17045902
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggt 160  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  |    
T  17045749 acaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttat 17045847  T
Q  161 gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045848 gctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 17047909 - 17048062
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggt 160  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  |    
T  17047909 acaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttat 17048007  T
Q  161 gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048008 gctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  166 tatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 17387884 - 17388045
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||  |||||    ||||   ||    
T  17387884 caagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgaggagatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatg 17387983  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387984 ctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  172 tatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13195502 - 13195458
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195502 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 16655804 - 16655897
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655804 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtag--aataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  168 tgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 13068313 - 13068357
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068313 tttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  192 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 22665068 - 22665277
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665068 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 22665165  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665166 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 22665265  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22665266 gggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22044869 - 22044660
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044869 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 22044772  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22044771 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 22044672  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22044671 gggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 25357517 - 25357726
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357517 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 25357614  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25357615 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 25357714  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  25357715 gggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 117549 - 117758
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117549 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 117646  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  117647 tgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagtgtgg 117746  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  117747 gggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 16775657 - 16775866
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775657 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 16775754  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16775755 tgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16775854  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  16775855 gggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Original strand, 17590464 - 17590622
Alignment:
Q  65 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgcta 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17590464 agaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgcta 17590563  T
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17590564 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 11726  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11725 gaggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggg 11626  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  11625 ggagtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24795494 - 24795285
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795494 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 24795397  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24795396 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 24795297  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  24795296 gggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 27627586 - 27627796
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  27627586 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaagccc 27627683  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27627684 ttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 27627783  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  27627784 ggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagccctt 25144869  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144868 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 25144769  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  25144768 gggagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggt--ttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttg 5500376  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500375 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 5500276  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  5500275 ggagtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25804430 - 25804267
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| |    
T  25804430 ttacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgaggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttg 25804331  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804330 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23799084 - 23798922
Alignment:
Q  61 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |    
T  23799084 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttat 23798985  T
Q  161 gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23798984 gctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 23643995 - 23644160
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||     
T  23643995 ttacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgaggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattt 23644094  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644095 tatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25371044 - 25370890
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttggt- 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  |||||  |     
T  25371044 aagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttatt 25370948  T
Q  161 gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 218  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370947 gttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  69 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  168 tgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  172 tatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502297
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcattt 24502265  T
Q  113 gaggagacatgtg-ctttaattgaattgtcat 143  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502266 gaggagacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19805661 - 19805618
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805661 tttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Original strand, 29955870 - 29955913
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955870 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattca 204  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 27046880 - 27047089
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046880 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 27046977  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046978 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 27047077  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  27047078 gggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17094810 - 17094601
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094810 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaga--tttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 17094713  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094712 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 17094613  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  17094612 gggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21798872 - 21798662
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798872 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaa--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 21798775  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21798774 tgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 21798675  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  21798674 ggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 20237462 - 20237671
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20237462 tcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaagccct 20237559  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237560 tgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 20237659  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20237660 gggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Original strand, 8653168 - 8653327
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac--tgtt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||   ||||    
T  8653168 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtt 8653264  T
Q  158 ggt-gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653265 tattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52938785 - 52938621
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    ||||      
T  52938785 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgtttt 52938686  T
Q  160 -tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938685 atgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  135 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Original strand, 19364082 - 19364244
Alignment:
Q  61 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |    
T  19364082 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttat 19364181  T
Q  161 gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364182 gctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 3989989 - 3990154
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||     
T  3989989 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttgacgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttt 3990088  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3990089 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20596040 - 20595831
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596040 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 20595943  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595942 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 20595843  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20595842 gggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20602326 - 20602117
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602326 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 20602229  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602228 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 20602129  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20602128 gggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20608617 - 20608408
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608617 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 20608520  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608519 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 20608420  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  20608419 gggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 15735540 - 15735749
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15735540 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaagccct 15735637  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735638 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 15735737  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  15735738 gggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 23748057 - 23748266
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748057 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 23748154  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23748155 tgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 23748254  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  23748255 gggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23710886 - 23710701
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710886 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtt--aaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 23710789  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23710788 tgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccct 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagccct 24940637  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24940638 tgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 24940737  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  24940738 gggagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 18072955 - 18073115
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  18072955 caagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatg 18073053  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18073054 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24953383 - 24953174
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24953383 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 24953286  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24953285 ttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 24953187  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  24953186 ggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 20622267  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20622268 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20790874 - 20790714
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  20790874 caagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatg 20790776  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20790775 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagccctt 23600748  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600747 gaggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 23600648  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||    
T  23600647 gggaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagccctt 24219849  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24219850 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgg 24219949  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  24219950 gggagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagccctt 20444951  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20444950 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgg 20444851  T
Q  212 gggagttt 219  Q
    ||||||||    
T  20444850 gggagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 21387441 - 21387605
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    |||      
T  21387441 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgt 21387540  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387541 gtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  173 atgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25175305 - 25175261
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175305 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  17 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgagg 20916563  T
Q  117 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  20916562 agacatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggag 20916463  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  20916462 tttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Original strand, 22855735 - 22855775
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855735 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Original strand, 27270564 - 27270607
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270564 tttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 20575555 - 20575633
Alignment:
Q  61 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  20575555 tacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattg 20575633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 15684 - 15893
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15684 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagccct 15781  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15782 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 15881  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  15882 gggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 21382099 - 21382309
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382099 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 21382196  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21382197 tgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 21382296  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  21382297 ggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21099003 - 21098794
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||          | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099003 tcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaa--tgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 21098906  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098905 tgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 21098806  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  21098805 gggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21104324 - 21104115
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||          | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104324 tcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaa--tgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 21104227  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104226 tgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 21104127  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  21104126 gggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 23911447 - 23911655
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||          |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23911447 tcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaagccct 23911543  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23911544 tgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 23911643  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  23911644 gggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 8314473 - 8314683
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314473 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 8314570  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8314571 tgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 8314670  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  8314671 ggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8323056 - 8322846
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8323056 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaaga--tttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccc 8322959  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8322958 ttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 8322859  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
     ||||||||||||    
T  8322858 agggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagccctt 21843636  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843635 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 21843536  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  21843535 gggagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21940161 - 21939996
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||     
T  21940161 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattt 21940062  T
Q  159 g-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940061 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaagga--ttacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagccttt 20039092  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    || |||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039091 gaagagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20038992  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  20038991 ggagtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Original strand, 17620806 - 17620961
Alignment:
Q  68 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| |    
T  17620806 aatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctacca 17620905  T
Q  168 tgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17620906 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggggagtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16418781 - 16418620
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   ||    
T  16418781 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatg 16418682  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418681 ctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 24034065 - 24034230
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgata-taactgtt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |  || |  |  ||    
T  24034065 ttacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatattaatctcgttt 24034164  T
Q  158 ggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034165 attgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaaga--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttg 23455042  T
Q  114 aggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gg 211  Q
    |||||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23455043 aggagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23455142  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  23455143 gggagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  172 tatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 21538599 - 21538765
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtt 157  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  ||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||    
T  21538599 ttacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtt 21538698  T
Q  158 gg-tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538699 ttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 21831188 - 21831232
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831188 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22033599 - 22033555
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033599 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22099699 - 22099655
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099699 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14352233 - 14352181
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352233 tgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 22817762 - 22817806
Alignment:
Q  179 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817762 tttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1253
Alignment:
Q  63 caagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgc 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  1093 caagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgc 1192  T
Q  163 tactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1193 tactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3524
Alignment:
Q  150 taactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 825 - 615
Alignment:
Q  12 tcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccc 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  825 tcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaa--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaatccc 728  T
Q  111 ttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  727 ttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtg 628  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  627 ggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagccctt 251982  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  251981 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgg 251882  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  251881 gggagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 11101 - 11264
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||      
T  11101 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttta 11200  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11201 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  16 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggt--ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaag 2961  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  2960 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtggg 2861  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  2860 agtttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagccctt 317  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  318 gaggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 417  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  418 ggagtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  14 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtt--tcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttg 14772  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14771 aggagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 14672  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  14671 gagtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  65 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  164 actatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 876 - 1041
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-tt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||    
T  876 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatt 975  T
Q  158 ggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  976 tatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2451 - 2287
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||      
T  2451 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgtttt 2352  T
Q  160 -tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2351 atgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 120998 - 121162
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg- 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | | |  | | ||      
T  120998 ttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattatttt 121097  T
Q  159 gtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121098 gtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaagga--ttacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagccttt 8038  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 212  Q
    || |||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8039 gaagagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggg 8138  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  8139 ggagtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  105 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  204 aagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  16 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgnnnnnnnnnnttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||          |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaaga--ttacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgag 579  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  580 gagacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 679  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  680 gtttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  76 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgttta 173  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  174 tgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 97887 - 97726
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   ||    
T  97887 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatg 97788  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97787 ctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Original strand, 25658 - 25697
Alignment:
Q  178 atttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25658 atttgcttgaggacaagcaaagctt-aagtgtgggggagtt 25697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35251 - 35104
Alignment:
Q  68 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  |||||| |    
T  35251 aatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagccttaaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctacca 35160  T
Q  168 tgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35159 tgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 1157 - 1318
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   ||    
T  1157 aagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttgaggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatg 1256  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1257 ctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12609
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 12546  T
Q  160 t-gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 58789 - 58628
Alignment:
Q  64 aagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   ||    
T  58789 aagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatg 58690  T
Q  162 ctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58689 ctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 232852  T
Q  160 t-gctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232851 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 673 - 510
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||      
T  673 ttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgtttta 574  T
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  573 tgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  122 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  221 atg 223  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38658 - 38625
Alignment:
Q  60 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38658 ttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5295
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  172 tatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13065 - 13002
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13065 tgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagtttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgcc-tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Original strand, 18223 - 18263
Alignment:
Q  183 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18223 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 37868 - 37922
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37868 ctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  173 atgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  173 atgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2895
Alignment:
Q  13 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttg 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttg 2895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  167 atgtttatgccatttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9177 - 9138
Alignment:
Q  178 atttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9177 atttgcttgaggacaagcaaaggtt-aagtgtgggggagtt 9138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 220
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  180 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 220  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University