View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_177 (Length: 250)

Name: NF6868A_low_177
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_177
NF6868A_low_177
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (14-235)||(37290451-37290672)
chr5 (14-235)||(22135878-22136099)
chr5 (14-235)||(22331842-22332063)
chr5 (14-235)||(34567704-34567925)
chr5 (14-235)||(16357712-16357933)
chr5 (14-235)||(27519616-27519837)
chr5 (14-235)||(27611564-27611785)
chr5 (14-235)||(27684355-27684576)
chr5 (14-235)||(40709990-40710211)
chr5 (13-235)||(41772052-41772274)
chr5 (14-235)||(14998694-14998915)
chr5 (14-235)||(19771170-19771391)
chr5 (14-235)||(27667445-27667666)
chr5 (14-235)||(29475028-29475249)
chr5 (14-235)||(23441420-23441641)
chr5 (14-235)||(23574939-23575160)
chr5 (14-235)||(18777006-18777227)
chr5 (14-183)||(20800659-20800828)
chr5 (17-235)||(23472438-23472655)
chr5 (50-235)||(21562964-21563149)
chr5 (14-235)||(25427643-25427864)
chr5 (17-235)||(20467056-20467274)
chr5 (20-235)||(26737688-26737903)
chr5 (17-235)||(21338255-21338473)
chr5 (105-235)||(21882159-21882289)
chr5 (14-225)||(28893897-28894108)
chr5 (14-225)||(28915368-28915579)
chr5 (14-225)||(28922723-28922934)
chr5 (14-225)||(28930636-28930847)
chr5 (14-225)||(20822655-20822866)
chr5 (14-235)||(17268289-17268510)
chr5 (14-225)||(22463153-22463364)
chr5 (14-225)||(22503881-22504092)
chr5 (29-235)||(24619265-24619471)
chr5 (29-235)||(24715496-24715702)
chr5 (29-235)||(24748524-24748730)
chr5 (50-235)||(21872042-21872226)
chr5 (50-235)||(21876322-21876506)
chr5 (14-235)||(14885946-14886167)
chr5 (14-235)||(21936143-21936364)
chr5 (23-235)||(23079053-23079265)
chr5 (17-235)||(21679736-21679954)
chr5 (14-235)||(20343474-20343695)
chr5 (14-235)||(22234875-22235096)
chr5 (50-235)||(25849267-25849452)
chr5 (14-235)||(24797352-24797573)
chr5 (50-219)||(37542372-37542541)
chr5 (36-235)||(24582402-24582601)
chr5 (50-235)||(21408348-21408533)
chr5 (14-235)||(27012276-27012497)
chr5 (106-222)||(21497147-21497263)
chr5 (92-193)||(822-923)
chr5 (14-147)||(20777193-20777326)
chr5 (176-235)||(21830878-21830937)
chr5 (152-225)||(20774961-20775034)
chr5 (14-113)||(23504558-23504657)
chr5 (203-235)||(23517736-23517768)
chr5 (49-117)||(21624140-21624208)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (14-235)||(1542002-1542223)
chr6 (14-235)||(25113694-25113915)
chr6 (14-235)||(2873721-2873942)
chr6 (14-235)||(29590838-29591059)
chr6 (17-235)||(28262118-28262336)
chr6 (17-235)||(28340867-28341085)
chr6 (13-235)||(27188578-27188800)
chr6 (13-235)||(27260440-27260662)
chr6 (14-235)||(27564739-27564960)
chr6 (14-234)||(24312086-24312306)
chr6 (14-234)||(22435012-22435232)
chr6 (14-234)||(22443410-22443630)
chr6 (14-235)||(16962363-16962584)
chr6 (14-235)||(19865829-19866050)
chr6 (14-235)||(22761373-22761594)
chr6 (13-235)||(5838136-5838358)
chr6 (14-235)||(16926556-16926779)
chr6 (30-235)||(20636235-20636440)
chr6 (14-235)||(25608779-25609000)
chr6 (17-224)||(18196654-18196861)
chr6 (14-235)||(21472743-21472964)
chr6 (14-235)||(21563050-21563271)
chr6 (14-235)||(23079611-23079832)
chr6 (14-235)||(21568909-21569130)
chr6 (14-235)||(28281731-28281952)
chr6 (16-235)||(15897236-15897454)
chr6 (14-225)||(15460488-15460699)
chr6 (14-120)||(16621998-16622104)
chr6 (116-235)||(16625737-16625856)
chr6 (20-235)||(18406868-18407083)
chr6 (50-235)||(19488226-19488411)
chr6 (14-213)||(18795854-18796053)
chr6 (14-235)||(19454562-19454783)
chr6 (14-235)||(5296124-5296345)
chr6 (14-225)||(24365564-24365775)
chr6 (17-235)||(34644507-34644725)
chr6 (17-235)||(18966216-18966431)
chr6 (14-114)||(21754481-21754581)
chr6 (14-225)||(14378835-14379046)
chr6 (14-225)||(14380385-14380596)
chr6 (14-235)||(16381291-16381512)
chr6 (23-235)||(10467776-10467988)
chr6 (23-235)||(19436144-19436356)
chr6 (17-235)||(19880440-19880658)
chr6 (14-235)||(14624275-14624496)
chr6 (50-235)||(16648923-16649108)
chr6 (105-225)||(8761942-8762062)
chr6 (14-235)||(23997390-23997611)
chr6 (14-118)||(1647732-1647836)
chr6 (36-235)||(18449652-18449851)
chr6 (14-127)||(16099259-16099372)
chr6 (174-231)||(22077768-22077825)
chr6 (14-63)||(25764146-25764195)
chr6 (14-117)||(35275004-35275107)
chr6 (14-235)||(16234170-16234391)
chr6 (14-127)||(18574439-18574552)
chr6 (14-235)||(18836826-18837047)
chr6 (14-118)||(21928464-21928568)
chr6 (14-117)||(14129729-14129832)
chr6 (15-113)||(23026635-23026733)
chr6 (49-118)||(19986375-19986444)
chr6 (179-235)||(18572795-18572851)
chr6 (170-235)||(1647888-1647953)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (14-235)||(44460-44681)
scaffold0028 (14-235)||(9783-10004)
scaffold0028 (14-235)||(16245-16466)
scaffold0028 (17-235)||(49293-49511)
scaffold0028 (14-114)||(105349-105449)
scaffold0028 (179-235)||(105514-105570)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (14-235)||(13253587-13253808)
chr3 (14-235)||(48426344-48426565)
chr3 (14-235)||(16636670-16636891)
chr3 (14-235)||(20061066-20061287)
chr3 (14-235)||(43163994-43164215)
chr3 (14-235)||(15588404-15588625)
chr3 (14-235)||(5423942-5424163)
chr3 (14-235)||(15340166-15340387)
chr3 (14-235)||(15401529-15401750)
chr3 (14-235)||(15723946-15724167)
chr3 (14-235)||(10006497-10006718)
chr3 (14-235)||(10907107-10907328)
chr3 (13-235)||(53384029-53384251)
chr3 (16-235)||(15347259-15347478)
chr3 (13-235)||(6601633-6601855)
chr3 (14-235)||(14125606-14125827)
chr3 (14-235)||(16411294-16411515)
chr3 (14-235)||(16805959-16806180)
chr3 (14-234)||(14875511-14875731)
chr3 (14-225)||(16693071-16693282)
chr3 (14-235)||(12499145-12499366)
chr3 (14-235)||(15062615-15062836)
chr3 (14-235)||(16491193-16491414)
chr3 (14-235)||(14579954-14580175)
chr3 (14-178)||(3686897-3687061)
chr3 (14-235)||(17490747-17490968)
chr3 (17-235)||(15260527-15260745)
chr3 (42-235)||(14574830-14575023)
chr3 (14-235)||(12359528-12359749)
chr3 (14-235)||(16827204-16827425)
chr3 (14-235)||(31939810-31940031)
chr3 (13-114)||(5109622-5109723)
chr3 (13-234)||(15228557-15228778)
chr3 (13-234)||(15234425-15234646)
chr3 (14-235)||(16379929-16380150)
chr3 (14-235)||(44778154-44778375)
chr3 (14-235)||(13942931-13943152)
chr3 (14-235)||(41178429-41178650)
chr3 (14-235)||(17187281-17187502)
chr3 (14-235)||(31694187-31694408)
chr3 (23-235)||(11960179-11960391)
chr3 (14-225)||(10419046-10419257)
chr3 (14-225)||(16835511-16835722)
chr3 (50-235)||(12179245-12179430)
chr3 (17-235)||(13971124-13971342)
chr3 (36-225)||(13319525-13319714)
chr3 (23-235)||(16337522-16337734)
chr3 (14-225)||(16328661-16328872)
chr3 (14-235)||(28755225-28755446)
chr3 (14-235)||(30138713-30138934)
chr3 (14-235)||(30148264-30148485)
chr3 (14-235)||(47124851-47125072)
chr3 (14-235)||(8273411-8273632)
chr3 (14-235)||(13966356-13966577)
chr3 (14-235)||(18133347-18133568)
chr3 (17-235)||(14087580-14087798)
chr3 (109-235)||(17493537-17493663)
chr3 (50-235)||(15014804-15014989)
chr3 (14-127)||(16258159-16258272)
chr3 (174-235)||(16755757-16755818)
chr3 (14-235)||(25767225-25767446)
chr3 (14-235)||(6151865-6152086)
chr3 (14-235)||(16741715-16741936)
chr3 (49-235)||(18750851-18751037)
chr3 (14-235)||(15611010-15611231)
chr3 (13-117)||(55514729-55514833)
chr3 (68-118)||(15096030-15096080)
chr3 (13-59)||(16755712-16755758)
chr3 (50-127)||(12793156-12793233)
chr3 (14-127)||(17194109-17194222)
chr3 (179-235)||(16258051-16258107)
chr3 (176-235)||(4679345-4679404)
chr3 (13-115)||(6711423-6711525)
chr3 (179-235)||(12793048-12793104)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (14-235)||(16923798-16924019)
chr2 (14-235)||(16983061-16983282)
chr2 (14-235)||(24263279-24263500)
chr2 (14-235)||(10869759-10869980)
chr2 (14-235)||(16926269-16926490)
chr2 (14-235)||(16999909-17000130)
chr2 (14-235)||(21144354-21144575)
chr2 (14-235)||(27218925-27219146)
chr2 (14-235)||(41607698-41607919)
chr2 (14-235)||(44384882-44385103)
chr2 (14-235)||(24710943-24711164)
chr2 (14-235)||(27372178-27372399)
chr2 (14-235)||(22324169-22324390)
chr2 (14-235)||(24876062-24876283)
chr2 (14-235)||(21324579-21324800)
chr2 (53-235)||(17064626-17064808)
chr2 (14-235)||(24676398-24676619)
chr2 (14-228)||(24706795-24707009)
chr2 (14-235)||(23107043-23107264)
chr2 (50-235)||(23111645-23111830)
chr2 (14-235)||(23099331-23099552)
chr2 (14-235)||(23277685-23277906)
chr2 (14-235)||(12575262-12575483)
chr2 (17-120)||(23072887-23072990)
chr2 (14-235)||(27788650-27788870)
chr2 (14-235)||(1064660-1064881)
chr2 (14-235)||(24949499-24949720)
chr2 (23-235)||(45533254-45533466)
chr2 (14-225)||(23294854-23295065)
chr2 (14-225)||(19651363-19651574)
chr2 (14-228)||(27209485-27209699)
chr2 (14-235)||(12639546-12639767)
chr2 (14-235)||(20829168-20829389)
chr2 (14-235)||(31831567-31831788)
chr2 (14-166)||(25264032-25264184)
chr2 (14-235)||(24830501-24830722)
chr2 (23-216)||(30011506-30011699)
chr2 (23-235)||(30210240-30210451)
chr2 (14-127)||(22279122-22279235)
chr2 (173-235)||(23067300-23067362)
chr2 (14-118)||(25129635-25129739)
chr2 (14-118)||(22760882-22760986)
chr2 (14-117)||(24568981-24569084)
chr2 (179-224)||(22279025-22279070)
chr2 (182-235)||(24569149-24569202)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-235)||(8248-8469)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (14-235)||(8675-8896)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (14-235)||(44790133-44790354)
chr7 (14-235)||(8199895-8200116)
chr7 (14-235)||(11235995-11236216)
chr7 (14-235)||(14333663-14333884)
chr7 (14-235)||(12688767-12688989)
chr7 (14-235)||(8708872-8709093)
chr7 (14-235)||(15159839-15160060)
chr7 (14-235)||(16100-16321)
chr7 (14-235)||(10872262-10872483)
chr7 (14-235)||(13687331-13687552)
chr7 (14-235)||(14955821-14956042)
chr7 (14-235)||(18179009-18179230)
chr7 (14-235)||(18550540-18550761)
chr7 (14-235)||(11551884-11552105)
chr7 (14-235)||(9597324-9597545)
chr7 (14-235)||(23202395-23202616)
chr7 (14-235)||(23508522-23508743)
chr7 (14-235)||(14212941-14213162)
chr7 (14-235)||(15147667-15147888)
chr7 (14-235)||(320819-321040)
chr7 (20-235)||(11771029-11771244)
chr7 (20-235)||(14040962-14041177)
chr7 (20-235)||(14350992-14351207)
chr7 (17-235)||(15204886-15205104)
chr7 (14-235)||(11387188-11387409)
chr7 (50-235)||(15101399-15101584)
chr7 (23-235)||(12205569-12205781)
chr7 (14-235)||(19148479-19148700)
chr7 (14-235)||(20747878-20748099)
chr7 (14-235)||(16071055-16071276)
chr7 (50-235)||(15341699-15341884)
chr7 (14-235)||(18052713-18052934)
chr7 (14-235)||(23504630-23504851)
chr7 (50-235)||(13022625-13022810)
chr7 (14-235)||(14285136-14285357)
chr7 (53-235)||(205-388)
chr7 (14-213)||(14263004-14263203)
chr7 (29-235)||(16949247-16949453)
chr7 (14-235)||(7825167-7825388)
chr7 (14-235)||(13666805-13667026)
chr7 (14-235)||(27106556-27106777)
chr7 (14-235)||(27171548-27171769)
chr7 (23-235)||(12457908-12458120)
chr7 (17-235)||(19613943-19614161)
chr7 (50-235)||(11305059-11305244)
chr7 (50-235)||(26117401-26117586)
chr7 (14-198)||(13967428-13967612)
chr7 (14-235)||(4441195-4441416)
chr7 (21-225)||(39935-40139)
chr7 (50-235)||(49153569-49153754)
chr7 (17-135)||(15625892-15626010)
chr7 (13-115)||(15717684-15717786)
chr7 (14-118)||(17925035-17925139)
chr7 (170-235)||(15625821-15625886)
chr7 (29-114)||(23642831-23642916)
chr7 (49-117)||(14937732-14937800)
chr7 (49-117)||(15365325-15365393)
chr7 (179-222)||(13354429-13354472)
chr7 (182-235)||(13456014-13456067)
chr7 (14-118)||(21673316-21673420)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (14-235)||(23957025-23957246)
chr4 (14-235)||(29037917-29038138)
chr4 (14-235)||(8052136-8052357)
chr4 (14-235)||(8387690-8387911)
chr4 (14-235)||(12477878-12478099)
chr4 (14-235)||(19777306-19777527)
chr4 (14-235)||(14302491-14302712)
chr4 (14-235)||(18298483-18298704)
chr4 (14-235)||(40474318-40474539)
chr4 (14-235)||(27712614-27712835)
chr4 (14-235)||(12524954-12525175)
chr4 (14-227)||(14681853-14682066)
chr4 (14-235)||(16353958-16354179)
chr4 (14-235)||(18614337-18614558)
chr4 (17-235)||(18225962-18226180)
chr4 (14-235)||(15146398-15146619)
chr4 (14-235)||(14160748-14160969)
chr4 (13-235)||(8707198-8707419)
chr4 (17-236)||(14695390-14695609)
chr4 (14-235)||(15071637-15071858)
chr4 (14-235)||(15002137-15002358)
chr4 (17-235)||(14849882-14850100)
chr4 (14-228)||(16148996-16149210)
chr4 (14-228)||(16153142-16153356)
chr4 (49-235)||(15320414-15320600)
chr4 (50-235)||(15247202-15247387)
chr4 (14-235)||(51605565-51605786)
chr4 (14-235)||(1648050-1648271)
chr4 (14-235)||(27901664-27901885)
chr4 (14-235)||(3263567-3263788)
chr4 (14-235)||(15357893-15358114)
chr4 (14-235)||(29452310-29452531)
chr4 (14-235)||(33224201-33224422)
chr4 (50-235)||(11206040-11206225)
chr4 (64-235)||(15413849-15414020)
chr4 (13-127)||(9292221-9292335)
chr4 (29-225)||(44660654-44660850)
chr4 (14-78)||(56566304-56566368)
chr4 (14-235)||(15291931-15292152)
chr4 (21-127)||(18548839-18548945)
chr4 (14-235)||(14998594-14998814)
chr4 (105-225)||(20892270-20892390)
chr4 (15-118)||(12341639-12341742)
chr4 (179-235)||(9292113-9292169)
chr4 (179-235)||(13248923-13248979)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (14-235)||(16349441-16349662)
chr1 (14-235)||(21831596-21831817)
chr1 (14-235)||(33389874-33390095)
chr1 (14-235)||(17043860-17044081)
chr1 (14-235)||(51332338-51332559)
chr1 (14-235)||(21838243-21838465)
chr1 (14-235)||(19107661-19107882)
chr1 (13-235)||(41352506-41352728)
chr1 (17-235)||(21025466-21025684)
chr1 (14-235)||(21234576-21234797)
chr1 (14-210)||(24793462-24793658)
chr1 (14-235)||(430961-431182)
chr1 (14-235)||(21750233-21750454)
chr1 (17-235)||(22361092-22361310)
chr1 (20-235)||(22110315-22110530)
chr1 (20-235)||(22114164-22114379)
chr1 (78-235)||(16373823-16373980)
chr1 (14-235)||(21744397-21744618)
chr1 (23-235)||(24098457-24098669)
chr1 (14-225)||(20834745-20834956)
chr1 (29-235)||(23197106-23197312)
chr1 (14-235)||(19661982-19662203)
chr1 (14-235)||(19855598-19855819)
chr1 (14-235)||(21952202-21952423)
chr1 (50-235)||(19759754-19759939)
chr1 (14-235)||(20938908-20939129)
chr1 (14-225)||(20855605-20855816)
chr1 (14-235)||(20830237-20830458)
chr1 (143-235)||(16077630-16077722)
chr1 (23-235)||(20295705-20295917)
chr1 (17-235)||(20060800-20061018)
chr1 (14-219)||(31538842-31539047)
chr1 (14-235)||(37678373-37678594)
chr1 (24-83)||(16377587-16377646)
chr1 (14-117)||(22134402-22134505)
chr1 (14-127)||(41216702-41216815)
chr1 (20-81)||(50619235-50619296)
chr1 (14-117)||(20915012-20915115)
chr1 (179-235)||(22134567-22134623)
chr1 (179-235)||(20914894-20914950)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (14-235)||(19114034-19114255)
chr8 (14-235)||(20017479-20017700)
chr8 (14-235)||(17673239-17673460)
chr8 (14-235)||(18857921-18858142)
chr8 (14-235)||(32601488-32601709)
chr8 (14-235)||(22041203-22041424)
chr8 (14-235)||(22119390-22119611)
chr8 (14-235)||(22128174-22128395)
chr8 (13-235)||(19483279-19483501)
chr8 (14-235)||(30312360-30312581)
chr8 (14-235)||(21165754-21165975)
chr8 (14-235)||(15534727-15534948)
chr8 (14-229)||(22132257-22132472)
chr8 (14-235)||(19979311-19979532)
chr8 (14-235)||(21043789-21044010)
chr8 (17-235)||(21393084-21393302)
chr8 (17-235)||(21787578-21787796)
chr8 (18-235)||(20395352-20395569)
chr8 (14-235)||(21252288-21252509)
chr8 (14-235)||(23651385-23651606)
chr8 (17-233)||(22247652-22247868)
chr8 (13-235)||(20389443-20389665)
chr8 (14-235)||(21920952-21921173)
chr8 (14-152)||(16407333-16407471)
chr8 (23-235)||(20984772-20984984)
chr8 (14-225)||(20974872-20975083)
chr8 (14-225)||(21324485-21324696)
chr8 (14-235)||(23656271-23656492)
chr8 (14-235)||(31570058-31570279)
chr8 (23-235)||(29302651-29302863)
chr8 (14-235)||(20009137-20009357)
chr8 (14-235)||(22372275-22372496)
chr8 (14-235)||(21841761-21841982)
chr8 (23-225)||(31415696-31415898)
chr8 (23-235)||(22052207-22052419)
chr8 (17-235)||(23886368-23886586)
chr8 (14-235)||(6605002-6605223)
chr8 (110-235)||(19852755-19852880)
chr8 (110-235)||(19858791-19858916)
chr8 (78-235)||(22376734-22376891)
chr8 (78-235)||(22382909-22383066)
chr8 (50-235)||(14566486-14566671)
chr8 (50-225)||(12306112-12306287)
chr8 (50-225)||(16270476-16270651)
chr8 (50-235)||(16876347-16876532)
chr8 (14-235)||(22435647-22435868)
chr8 (14-191)||(27355924-27356101)
chr8 (14-127)||(20651549-20651662)
chr8 (49-225)||(21849588-21849764)
chr8 (14-117)||(23156256-23156359)
chr8 (21-225)||(19869047-19869251)
chr8 (14-118)||(22316652-22316756)
chr8 (14-222)||(23901544-23901752)
chr8 (179-225)||(23156393-23156439)
chr8 (173-234)||(22623411-22623472)
chr8 (143-235)||(1267582-1267674)
chr8 (14-114)||(19860900-19861000)
chr8 (179-225)||(20651714-20651760)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (14-235)||(8706-8927)
scaffold0080 (14-147)||(49487-49620)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (14-235)||(108587-108808)
scaffold0029 (17-235)||(113868-114086)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (14-235)||(19911-20132)
scaffold0081 (14-235)||(35335-35556)
scaffold0081 (14-235)||(50741-50962)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (14-235)||(277606-277827)
scaffold0005 (14-235)||(261617-261838)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (14-235)||(79270-79491)
scaffold0022 (20-83)||(55230-55293)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-235)||(4129-4350)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (14-235)||(1727-1948)
scaffold0044 (14-235)||(15467-15688)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (14-235)||(66714-66935)
scaffold0042 (14-235)||(38596-38817)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (14-235)||(28144-28365)
scaffold0023 (23-224)||(60073-60274)
scaffold0023 (136-235)||(3354-3453)
scaffold0023 (172-235)||(131415-131478)
scaffold0023 (50-127)||(54753-54830)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (14-229)||(57332-57547)
scaffold0017 (14-235)||(18843-19064)
scaffold0017 (14-235)||(196263-196475)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (14-235)||(7323-7544)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (14-235)||(29347-29568)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (14-235)||(12768-12993)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (13-235)||(3503-3725)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (14-223)||(23849-24058)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-235)||(32349-32570)
scaffold0109 (14-235)||(9905-10126)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (14-235)||(3181-3402)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (14-235)||(19117-19338)
scaffold0114 (14-225)||(21206-21417)
scaffold0114 (14-213)||(45848-46047)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (13-235)||(16963-17185)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (37-235)||(39688-39886)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (14-235)||(7358-7579)
scaffold0358 (170-235)||(3541-3606)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (14-235)||(13987-14208)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (14-235)||(30254-30475)
scaffold0026 (25-235)||(29366-29576)
scaffold0026 (23-186)||(50168-50331)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (13-235)||(31528-31750)
scaffold0180 (14-225)||(12303-12514)
scaffold0180 (13-120)||(34526-34633)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (13-235)||(102542-102764)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (14-235)||(75-296)
scaffold0319 (14-235)||(2578-2799)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (14-235)||(13367-13588)
scaffold0120 (17-235)||(7329-7547)
scaffold0120 (50-235)||(364-549)
scaffold0120 (14-117)||(23603-23706)
scaffold0120 (179-235)||(23485-23541)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (28-235)||(10278-10485)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (13-235)||(25720-25941)
scaffold0243 (49-127)||(899-977)
scaffold0243 (179-235)||(791-847)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (14-235)||(7429-7650)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (14-235)||(7107-7328)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (14-235)||(7681-7902)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (13-235)||(2745-2967)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (13-235)||(202243-202465)
scaffold0004 (14-225)||(324023-324234)
scaffold0004 (17-235)||(118535-118753)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (13-235)||(7862-8084)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (17-235)||(16186-16404)
scaffold0040 (17-225)||(112267-112475)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (50-235)||(2297-2482)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (24-235)||(22971-23182)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (17-235)||(5180-5398)
scaffold0270 (17-235)||(12310-12528)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (23-235)||(16762-16974)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (17-235)||(6670-6888)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (17-235)||(13777-13995)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (17-235)||(38727-38945)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (14-235)||(5085-5306)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (14-235)||(15421-15642)
scaffold0266 (14-225)||(8637-8848)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (14-235)||(5739-5960)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (14-235)||(6530-6751)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (14-210)||(8435-8631)
scaffold0647 (78-235)||(2217-2374)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (13-235)||(23854-24069)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (17-228)||(3230-3441)
scaffold0010 (14-235)||(46175-46396)
scaffold0010 (14-235)||(41109-41330)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (25-235)||(2202-2412)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (17-235)||(17994-18212)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (13-235)||(11102-11324)
scaffold0309 (14-81)||(16103-16170)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-235)||(177037-177259)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (14-235)||(1630-1851)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (14-235)||(47810-48031)
scaffold0053 (14-235)||(56623-56844)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (50-235)||(4058-4243)
scaffold0035 (50-235)||(42919-43104)
scaffold0035 (21-127)||(11979-12085)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (23-235)||(287-499)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-235)||(310-522)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (23-235)||(1178-1390)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-235)||(4421-4639)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (17-235)||(25312-25530)
scaffold0011 (14-235)||(149879-150099)
scaffold0011 (14-235)||(194480-194701)
scaffold0011 (14-117)||(181351-181454)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (14-235)||(18658-18879)
scaffold0244 (14-235)||(25553-25774)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-235)||(48413-48634)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (14-235)||(55676-55897)
scaffold0076 (14-235)||(41567-41788)
scaffold0076 (17-235)||(32456-32674)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (14-235)||(27934-28154)
scaffold0067 (14-225)||(59990-60201)
scaffold0067 (14-225)||(50956-51167)
scaffold0067 (14-225)||(66378-66589)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (14-235)||(108939-109160)
scaffold0031 (125-235)||(62918-63028)
scaffold0031 (13-120)||(55766-55873)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (78-235)||(218257-218414)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-235)||(44092-44304)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (23-225)||(6930-7132)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (30-235)||(11578-11783)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (14-235)||(39866-40087)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (14-235)||(41007-41228)
scaffold0102 (14-115)||(47189-47289)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (50-235)||(5901-6088)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (14-222)||(34792-35000)
scaffold0139 (105-222)||(28539-28656)
scaffold0139 (175-235)||(95-155)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (17-235)||(15260-15479)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (17-235)||(846-1064)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (14-224)||(13075-13285)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (137-235)||(26283-26381)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-235)||(39535-39756)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (14-231)||(3489-3706)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (14-235)||(2131-2352)
scaffold0222 (35-225)||(8379-8569)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (50-235)||(32720-32905)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (14-235)||(80608-80829)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (14-235)||(3729-3950)
scaffold0034 (50-235)||(68679-68864)
scaffold0034 (14-225)||(12684-12895)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (14-234)||(3048-3268)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (14-234)||(30061-30281)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (23-235)||(9593-9805)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (13-120)||(476-583)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (14-225)||(6014-6225)
scaffold0367 (30-117)||(1-88)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (14-225)||(42236-42447)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (14-225)||(15489-15700)
scaffold0089 (125-235)||(10746-10856)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (14-225)||(20439-20650)
scaffold0058 (23-193)||(57976-58146)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (17-235)||(115684-115902)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (105-235)||(89312-89442)
scaffold0001 (105-235)||(89990-90120)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (14-235)||(1192-1413)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (50-235)||(27833-28018)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (23-225)||(1619-1821)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (17-235)||(13860-14078)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (50-224)||(6070-6244)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (14-96)||(1-83)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (14-235)||(2897-3118)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (14-235)||(6522-6743)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (14-147)||(2978-3111)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (14-235)||(749-970)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (14-235)||(464-684)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (14-235)||(13509-13730)
scaffold0124 (14-223)||(6584-6793)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-235)||(50651-50872)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (23-222)||(284-483)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (14-229)||(10233-10448)
scaffold0235 (14-229)||(20447-20662)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (29-236)||(35421-35628)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (14-235)||(2651-2872)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (14-235)||(24703-24924)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (14-235)||(14217-14438)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (14-235)||(100338-100559)
scaffold0020 (188-235)||(181508-181555)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (14-225)||(28252-28463)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (81-235)||(9859-10013)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (56-225)||(2148-2317)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (14-235)||(20158-20379)
scaffold0090 (14-235)||(24320-24541)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (50-235)||(249922-250107)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (14-166)||(24-176)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (131-235)||(24776-24880)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (23-235)||(23523-23735)
scaffold0104 (50-235)||(20703-20888)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (14-225)||(643-854)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (14-213)||(10665-10864)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (14-225)||(5112-5323)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (61-224)||(24699-24862)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (29-235)||(10848-11054)
scaffold0298 (29-235)||(14618-14824)
scaffold0298 (14-166)||(21361-21513)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (14-235)||(16340-16561)
scaffold0077 (14-117)||(25658-25761)
scaffold0077 (14-235)||(27042-27263)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (86-235)||(96473-96622)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (14-235)||(25135-25356)
scaffold0008 (14-235)||(133265-133486)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (95-235)||(14157-14296)
scaffold0261 (95-235)||(22336-22475)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (15-235)||(72498-72718)
scaffold0021 (14-117)||(6638-6741)
scaffold0021 (14-117)||(15858-15961)
scaffold0021 (14-117)||(25389-25492)
scaffold0021 (14-235)||(32189-32410)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (14-117)||(2728-2831)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (14-235)||(6483-6704)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (23-235)||(32104-32316)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (97-225)||(4311-4439)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (29-235)||(8574-8780)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (17-235)||(6464-6682)
scaffold0117 (62-235)||(248-421)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (170-235)||(5340-5405)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (17-198)||(343-524)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (69-225)||(64-220)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-117)||(19474-19577)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (36-127)||(92834-92925)
scaffold0007 (23-235)||(85304-85516)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (17-127)||(7669-7779)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (14-235)||(10603-10824)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (50-127)||(879-956)
scaffold0369 (179-235)||(771-827)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (50-147)||(6160-6257)
scaffold0149 (50-147)||(10591-10688)
scaffold0149 (173-235)||(6265-6327)
scaffold0149 (173-235)||(10696-10758)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (14-127)||(11486-11599)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (14-90)||(13590-13666)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (15-83)||(34675-34743)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (14-58)||(1552-1596)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (14-58)||(8469-8513)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (14-117)||(3971-4074)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (158-225)||(12052-12119)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (177-235)||(1-59)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (23-117)||(1627-1721)
scaffold0509 (23-117)||(8055-8149)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (186-235)||(1005-1054)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (14-118)||(15484-15588)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (50-129)||(1-80)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (179-225)||(8491-8537)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (68-118)||(8897-8947)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (14-99)||(1578-1663)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 37290451 - 37290672
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290451 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 37290550  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290551 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 37290650  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37290651 attgcatatgtccgctatgatg 37290672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22136099 - 22135878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22136099 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22136000  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135999 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22135900  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22135899 attgcatatgtccgctatgatg 22135878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22331842 - 22332063
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22331842 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22331941  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331942 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22332041  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22332042 attgcatatgtccgctatgatg 22332063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34567925 - 34567704
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34567925 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 34567826  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567825 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 34567726  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  34567725 attgcatatgtccgccatgatg 34567704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16357933 - 16357712
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16357933 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggagttgaatatga 16357834  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357833 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16357734  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16357733 attgcatatgtccgccatgatg 16357712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27519837 - 27519616
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27519837 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27519738  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519737 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27519638  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27519637 attgcatatgtccgccatgatg 27519616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27611785 - 27611564
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27611785 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27611686  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611685 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27611586  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27611585 attgcatatgtccgccatgatg 27611564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27684355 - 27684576
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27684355 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27684454  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684455 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27684554  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27684555 attgcatatgtccgctatgatg 27684576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40710211 - 40709990
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40710211 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 40710112  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710111 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 40710012  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  40710011 attgcatatgtccgccatgatg 40709990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41772274 - 41772052
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41772274 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatg 41772175  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772174 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 41772075  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  41772074 cattgcatatgtccgccatgatg 41772052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14998694 - 14998915
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  14998694 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 14998793  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998794 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14998893  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14998894 attgcatatgtccgctatgatg 14998915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19771391 - 19771170
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19771391 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 19771292  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19771291 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagac 19771192  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  19771191 attgcatatgtccgccatgatg 19771170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27667445 - 27667666
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27667445 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27667544  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667545 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27667644  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27667645 attgcatatgtccgccatgatg 27667666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29475028 - 29475249
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29475028 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29475127  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475128 gacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29475227  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29475228 attgcatatgtccgctatgatg 29475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23441641 - 23441420
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23441641 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatga 23441542  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441541 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 23441442  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23441441 attgcatatgtccgctatgatg 23441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23575160 - 23574939
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  23575160 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcaatcagaaagaattgaatatga 23575061  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23575060 ggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggc 23574961  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23574960 attgcatatgtccgctatgatg 23574939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18777227 - 18777006
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18777227 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18777128  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18777127 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 18777028  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  18777027 attgcatatgtctgctttgatg 18777006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20800828 - 20800659
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20800828 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 20800729  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaa 183  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  20800728 ggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaa 20800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23472655 - 23472438
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  23472655 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataa-agtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 23472557  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23472556 agcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 23472457  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23472456 gcatatgtccgctatgatg 23472438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 21562964 - 21563149
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| || |    
T  21562964 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatg 21563063  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21563064 attttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatg 21563149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25427864 - 25427643
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25427864 ttgaagatatggagactttacttttatggttccagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatga 25427765  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25427764 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 25427665  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  25427664 cttgcatatgtctgctatgatg 25427643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 20467056 - 20467274
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  20467056 aagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagac 20467155  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  |    
T  20467156 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactct 20467255  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||||    
T  20467256 acatatgtccgctatgatg 20467274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 26737688 - 26737903
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||| ||||||||||||||     
T  26737688 atatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagg 26737787  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| || |||||||| || || || ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26737788 gaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 26737887  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  26737888 tatgtccgctatgatg 26737903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21338255 - 21338473
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |    
T  21338255 aagatatagagacattacttgtattgttcgagatttgaagtgttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 21338354  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| |  ||||| |||||| |||| || || || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |    
T  21338355 agcgaatgtggcttgaattgctgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgct 21338454  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  21338455 gcatatgtcagctatgatg 21338473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21882289 - 21882159
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21882289 tgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgag 21882190  T
Q  205 taggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21882189 taggaagacattgaatatgtccgctatgatg 21882159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 28893897 - 28894108
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  28893897 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28893996  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28893997 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28894096  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  28894097 attgcacatgtc 28894108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 28915368 - 28915579
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  28915368 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28915467  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28915468 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28915567  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  28915568 attgcacatgtc 28915579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 28922723 - 28922934
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  28922723 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28922822  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28922823 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28922922  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  28922923 attgcacatgtc 28922934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 28930636 - 28930847
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  28930636 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 28930735  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28930736 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 28930835  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  28930836 attgcacatgtc 28930847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20822866 - 20822655
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  20822866 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20822767  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20822766 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20822667  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  20822666 attgcacatgtc 20822655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17268289 - 17268510
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  17268289 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagacggaattgaatatga 17268388  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| ||  |||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  17268389 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 17268488  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  17268489 actgcatatgtctgctatgatg 17268510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22463364 - 22463153
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  22463364 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 22463265  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22463264 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 22463165  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     ||||| |||||    
T  22463164 gttgcacatgtc 22463153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22504092 - 22503881
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  22504092 ttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 22503993  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  22503992 ggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaac 22503893  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||    
T  22503892 attgcatatgtc 22503881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24619265 - 24619471
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||     
T  24619265 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24619364  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  24619365 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24619464  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24619465 tatgatg 24619471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24715496 - 24715702
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||     
T  24715496 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24715595  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  24715596 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24715695  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24715696 tatgatg 24715702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 24748524 - 24748730
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||     
T  24748524 cattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 24748623  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  24748624 tagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 24748723  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  24748724 tatgatg 24748730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 21872042 - 21872226
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| |    
T  21872042 tttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaag-aattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatg 21872140  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21872141 attttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 21876322 - 21876506
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| |    
T  21876322 tttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaag-aattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatg 21876420  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21876421 attttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14885946 - 14886167
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  14885946 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 14886045  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14886046 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 14886145  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  14886146 gttgcacatgtctgctttgatg 14886167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21936143 - 21936364
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  21936143 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 21936242  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21936243 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 21936342  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  21936343 tttgcatatgtctgctttgatg 21936364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 23079053 - 23079265
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||||||| | |    
T  23079053 tggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagagga 23079152  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23079153 gatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatat 23079252  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  23079253 gtctgctttgatg 23079265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21679736 - 21679954
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  21679736 aagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 21679835  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21679836 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 21679935  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  21679936 acacatgtcggccatgatg 21679954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20343695 - 20343474
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  20343695 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 20343596  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | || ||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  20343595 ggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaac 20343496  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  20343495 tttgcacatgtctgctttgatg 20343474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22234875 - 22235096
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||| |||  || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  22234875 ttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 22234974  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  |||||||||| || || ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22234975 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 22235074  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  22235075 gttgcatatgtctgctttgatg 22235096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25849452 - 25849267
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||  |||| ||||| |    
T  25849452 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatg 25849353  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  25849352 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 25849267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 24797352 - 24797573
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  24797352 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 24797451  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  24797452 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagac 24797551  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  24797552 tttgcacatgtctgctttgatg 24797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 37542372 - 37542541
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| || ||||||||||  |    
T  37542372 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttg 37542471  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| || |||||    
T  37542472 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactttgca 37542541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24582601 - 24582402
Alignment:
Q  36 tgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaatt 135  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| | ||||     
T  24582601 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaata 24582502  T
Q  136 gttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  24582501 tcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 24582402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21408533 - 21408348
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||| || || |||||  || | |||||||||||||  || ||||| |||||| | |||||||| |    
T  21408533 tttgacgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggcagcataggtggcttgaattgctaaaggattatg 21408434  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | || || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  21408433 aattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatg 21408348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27012497 - 27012276
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  27012497 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagttcgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27012398  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27012397 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27012298  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  27012297 tttgcatatgtctgctttgatg 27012276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21497263 - 21497147
Alignment:
Q  106 gaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 205  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || |||||| |||| || || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  21497263 gaatatgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagc 21497164  T
Q  206 aggaagacattgcatat 222  Q
    |||||||| || |||||    
T  21497163 aggaagacgttacatat 21497147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 193
Target Start/End: Original strand, 822 - 923
Alignment:
Q  92 gatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttg 191  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  822 gatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttg 921  T
Q  192 ca 193  Q
    ||    
T  922 ca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20777326 - 20777193
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  20777326 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20777227  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggatta 147  Q
    ||||| | |||||||| || || || ||||||||    
T  20777226 ggcagaggagatggcttgagttattaaaggatta 20777193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21830937
Alignment:
Q  176 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatg 21830937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20775034 - 20774961
Alignment:
Q  152 tttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    ||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20775034 tttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 20774961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23504657 - 23504558
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  23504657 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatga 23504558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517736
Alignment:
Q  203 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 23517736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21624208 - 21624140
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  21624208 gtttgaagtttttagcgaccacaagagtttaaagtacttgtttgatcaaaaggaactcaacatgaggca 21624140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 1542002 - 1542223
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1542002 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 1542101  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1542102 ggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagac 1542201  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1542202 attgcatatgtccgctatgatg 1542223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25113915 - 25113694
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25113915 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 25113816  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113815 ggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 25113716  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25113715 attgcatatgtccgctatgatg 25113694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 2873721 - 2873942
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2873721 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 2873820  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873821 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 2873920  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2873921 attgcatatgtccgctatgatg 2873942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29590838 - 29591059
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29590838 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29590937  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590938 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29591037  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29591038 attgcatatgtccgccatgatg 29591059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 28262118 - 28262336
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28262118 aagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 28262217  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262218 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 28262317  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  28262318 gcatatgtctgccatgatg 28262336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 28340867 - 28341085
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28340867 aagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 28340966  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340967 agcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 28341066  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  28341067 gcatatgtctgccatgatg 28341085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27188800 - 27188578
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27188800 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 27188701  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188700 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 27188601  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  27188600 cgttgcatatgtccgccatgatg 27188578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 27260440 - 27260662
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27260440 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 27260539  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260540 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 27260639  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  27260640 cgttgcatatgtccgccatgatg 27260662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27564739 - 27564960
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27564739 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27564838  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27564839 ggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 27564938  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27564939 attgcatatgtccgctttgatg 27564960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 24312086 - 24312306
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24312086 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24312185  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24312186 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagac 24312285  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24312286 attgcatatgtccgccatgat 24312306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22435232 - 22435012
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| |||||||||    
T  22435232 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 22435133  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435132 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22435033  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22435032 gttgcatatgtccgctatgat 22435012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22443630 - 22443410
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| |||||||||    
T  22443630 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 22443531  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443530 ggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22443431  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22443430 gttgcatatgtccgctatgat 22443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16962363 - 16962584
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16962363 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 16962462  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  16962463 ggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtc 16962562  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  16962563 attgcacatgtccgctatgatg 16962584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19866050 - 19865829
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19866050 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttcaggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 19865951  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19865950 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaac 19865851  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  19865850 gttgcatatgtctgctatgatg 19865829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22761373 - 22761594
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22761373 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatga 22761472  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22761473 ggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 22761572  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| || ||||||    
T  22761573 cttgcatatgtctgccatgatg 22761594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 5838136 - 5838358
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  5838136 gttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaatatg 5838235  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||| | || |||||||||| | | ||||| || || || |  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5838236 agacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 5838335  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  5838336 ctttgcatatgtccgctatgatg 5838358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16926556 - 16926779
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcga-ggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16926556 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatgtg 16926655  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattg-ttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaag 211  Q
    ||| |||| |||||||| |||||| |  |||||||| || ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16926656 agggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaag 16926755  T
Q  212 acattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  16926756 tcattgcacatgtccgctatgatg 16926779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636440
Alignment:
Q  30 attacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggct 129  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  130 agaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgct 229  Q
     |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgct 20636434  T
Q  230 atgatg 235  Q
    ||||||    
T  20636435 atgatg 20636440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 25608779 - 25609000
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  25608779 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgttcgattagaaggaattgaatatga 25608878  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||  || ||||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25608879 gacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagac 25608978  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  25608979 tttgcatatgtctgctatgatg 25609000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 18196654 - 18196861
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  18196654 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 18196753  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18196754 agcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagacttt 18196853  T
Q  217 gcatatgt 224  Q
     |||||||    
T  18196854 acatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21472964 - 21472743
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  | || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||    
T  21472964 ttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcataagagattgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatga 21472865  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21472864 ggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 21472765  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  21472764 gttgcacatgtctgctatgatg 21472743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21563050 - 21563271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21563050 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 21563149  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21563150 gacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 21563249  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  21563250 gttgcacatgtcggctatgatg 21563271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23079832 - 23079611
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  23079832 ttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgttttatcataaggaattgaatatga 23079733  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
      ||||| || |||||  |||||||||||||||| || ||| |||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23079732 aacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 23079633  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  23079632 gttgcatatgtctgctatgatg 23079611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21568909 - 21569130
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21568909 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 21569008  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21569009 gacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 21569108  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  21569109 gttgcacatgtcggctatgatg 21569130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 28281731 - 28281952
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28281731 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 28281830  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  28281831 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagac 28281930  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  28281931 actccatatgtctgctatgatg 28281952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15897454 - 15897236
Alignment:
Q  16 gaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgagg 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  15897454 gaagatttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgaga 15897356  T
Q  116 cagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||      
T  15897355 caacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactc 15897256  T
Q  216 tgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  15897255 tacatatgtccgcgatgatg 15897236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15460699 - 15460488
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  15460699 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 15460600  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15460599 ggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 15460500  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  15460499 attgcacatgtc 15460488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 16621998 - 16622104
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16621998 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16622097  T
Q  114 ggcagcg 120  Q
    | |||||    
T  16622098 gacagcg 16622104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 16625737 - 16625856
Alignment:
Q  116 cagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625737 cagcgaagatgactcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 16625836  T
Q  216 tgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  16625837 tgcatatgtccgccatgatg 16625856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 18406868 - 18407083
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  18406868 atatggagacgttacttgtatggttcgagatttgatgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaatggaacatgagacagc 18406967  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||    
T  18406968 gaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgca 18407067  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| |||||||||    
T  18407068 tatgtctgctatgatg 18407083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 19488226 - 19488411
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||| ||||||||||||| || || ||||| | |||||||||||| || |    
T  19488226 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttctttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatg 19488325  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19488326 attttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatg 19488411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18796053 - 18795854
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||  |||| ||||    
T  18796053 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaaatattcatttgatcaaaaggagttgaacatga 18795954  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18795953 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 18795854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19454783 - 19454562
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||    
T  19454783 ttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatga 19454684  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19454683 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 19454584  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  19454583 attgcatatgtctgctttgatg 19454562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5296124 - 5296345
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  5296124 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 5296223  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  5296224 ggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagac 5296323  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  5296324 gttgcacatgtctgctatgatg 5296345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24365775 - 24365564
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24365775 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttgtttgaccagaaggaactgaacatga 24365676  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  24365675 ggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaac 24365576  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     ||||| |||||    
T  24365575 cttgcacatgtc 24365564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 34644507 - 34644725
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||| ||||| |    
T  34644507 aagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagac 34644606  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34644607 agaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 34644706  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  34644707 acacatgtcggccatgatg 34644725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 18966216 - 18966431
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18966216 aagatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggc 18966315  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||  | | |||||||||||| |||||   |||||| || |||||||| ||  |    
T  18966316 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactct 18966412  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| |||||||||    
T  18966413 acatatgtctgctatgatg 18966431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21754581 - 21754481
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21754581 ttgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaactgaatatga 21754482  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  21754481 g 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 14378835 - 14379046
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  14378835 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 14378934  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14378935 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 14379034  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  14379035 gctgcatatgtc 14379046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 14380385 - 14380596
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  14380385 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 14380484  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14380485 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 14380584  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  14380585 gctgcatatgtc 14380596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16381291 - 16381512
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16381291 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16381390  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16381391 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16381490  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  16381491 tttgcatatgtctgctttgatg 16381512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 10467776 - 10467988
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| | |    
T  10467776 tggaggcattatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagga 10467875  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| |||| ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  10467876 gatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatat 10467975  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  10467976 gtctgctttgatg 10467988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19436356 - 19436144
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || ||  ||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||| || | |    
T  19436356 tggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcggtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatgaggtagagga 19436257  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
     |||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19436256 tatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatat 19436157  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  19436156 gtctgctttgatg 19436144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19880658 - 19880440
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||| ||||| |    
T  19880658 aagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttatttgaccagaaggagttgaacatgagac 19880559  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19880558 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgtt 19880459  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||||| || ||||||    
T  19880458 gcacatgtcggccatgatg 19880440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14624275 - 14624496
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  14624275 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14624374  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | ||||| | ||| |||   |||| |||  | || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14624375 ggcagaggagatggttggaataccttaaggacttcgattttcagttgagttatcatcccgaaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 14624474  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| || ||| |||||    
T  14624475 tttgcatatttctgctttgatg 14624496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 16648923 - 16649108
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| | ||||   | |||||||  |    
T  16648923 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttg 16649022  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16649023 attttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 16649108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 8761942 - 8762062
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8761942 tgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgag 8762041  T
Q  205 taggaagacattgcatatgtc 225  Q
    |||||| ||  ||||||||||    
T  8762042 taggaaaacgctgcatatgtc 8762062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23997611 - 23997390
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  23997611 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 23997512  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | | |||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23997511 ggcagaggagatggttggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 23997412  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  23997411 tttgcatatgtctgctttgatg 23997390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 1647732 - 1647836
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  1647732 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 1647831  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  1647832 ggcag 1647836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18449851 - 18449652
Alignment:
Q  36 tgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaatt 135  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| ||| | ||||||||| || | || ||||| |||||    
T  18449851 tgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggtagtgaaggtggcttgaatt 18449752  T
Q  136 gttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | ||||||||  | || || ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  18449751 gctaaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatg 18449652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16099372 - 16099259
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16099372 ttgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16099273  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  16099272 ggcagagaagatgg 16099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 22077768 - 22077825
Alignment:
Q  174 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22077768 gtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctat 22077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 25764146 - 25764195
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25764146 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttag 25764195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 35275004 - 35275107
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||    
T  35275004 ttgaagatttggagtcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 35275103  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  35275104 ggca 35275107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16234391 - 16234170
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16234391 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16234292  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| ||||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||    
T  16234291 ggcaaagaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagac 16234192  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  16234191 tttgcatatgtctgctttgatg 16234170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18574552 - 18574439
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  18574552 ttgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 18574453  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  18574452 ggcagaggagatgg 18574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18836826 - 18837047
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || | ||  |||||||||    
T  18836826 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatga 18836925  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18836926 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 18837025  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  18837026 tttgcatatgtctgctttgatg 18837047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21928568 - 21928464
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  21928568 ttgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatga 21928469  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  21928468 ggcag 21928464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14129832 - 14129729
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| | |||| | |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  14129832 ttgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14129733  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  14129732 ggca 14129729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Original strand, 23026635 - 23026733
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||| |||  | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  23026635 tgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23026733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 118
Target Start/End: Original strand, 19986375 - 19986444
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcag 118  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19986375 gtttgaagtattcagtgaccacaagagtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcag 19986444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18572851 - 18572795
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  18572851 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctttgatg 18572795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 1647888 - 1647953
Alignment:
Q  170 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  1647888 ccaggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatgtgtctgctttgatg 1647953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44681 - 44460
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44681 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44582  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44581 ggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagac 44482  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44481 attgcatatgtccgctatgatg 44460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10004 - 9783
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10004 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatga 9905  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9904 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 9805  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9804 attgcatatgtccgctatgatg 9783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16466 - 16245
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16466 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16367  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16366 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagac 16267  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  16266 attgcatatgtcttctatgatg 16245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 49293 - 49511
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  49293 aagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 49392  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49393 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 49492  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  49493 acacatgtcggccatgatg 49511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 105349 - 105449
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  105349 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatga 105448  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  105449 g 105449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Original strand, 105514 - 105570
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  105514 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 105570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13253808 - 13253587
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13253808 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 13253709  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253708 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 13253609  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  13253608 attgcatatgtccgccatgatg 13253587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48426565 - 48426344
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48426565 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 48426466  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426465 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 48426366  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  48426365 attgcatatgtccgccatgatg 48426344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16636891 - 16636670
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16636891 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16636792  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636791 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16636692  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16636691 attgcatatgtccgccatgatg 16636670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20061066 - 20061287
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20061066 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 20061165  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061166 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 20061265  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  20061266 attgcatatgtccgccatgatg 20061287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43164215 - 43163994
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43164215 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 43164116  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164115 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 43164016  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  43164015 attgcatatgtccgccatgatg 43163994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15588404 - 15588625
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15588404 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 15588503  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588504 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15588603  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15588604 attgcatatgtccgccatgatg 15588625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5423942 - 5424163
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5423942 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 5424041  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424042 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 5424141  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  5424142 attgcatatgtccgccatgatg 5424163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15340387 - 15340166
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15340387 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15340288  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15340287 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagac 15340188  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15340187 attgcatatgtccgctatgatg 15340166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15401529 - 15401750
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15401529 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15401628  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15401629 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15401728  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15401729 attgcatatgtccgctatgatg 15401750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15723946 - 15724167
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15723946 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 15724045  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15724046 gacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 15724145  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15724146 attgcatatgtccgctatgatg 15724167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10006718 - 10006497
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10006718 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10006619  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006618 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10006519  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10006518 attgcatatgtccgccatgatg 10006497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10907328 - 10907107
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10907328 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttttcgatcagaaggaattgaatatga 10907229  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907228 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10907129  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10907128 attgcatatgtccgccatgatg 10907107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 53384029 - 53384251
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53384029 gttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 53384128  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53384129 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaaga 53384228  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  53384229 cattgcatatgtccgccatgatg 53384251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 15347259 - 15347478
Alignment:
Q  16 gaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15347259 gaagatatggagacattacttgtttggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagg 15347358  T
Q  116 cagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15347359 cagcgaagatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaat 15347458  T
Q  216 tgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15347459 tgcatatgtccgccatgatg 15347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6601855 - 6601633
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6601855 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatg 6601756  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601755 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 6601656  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  6601655 cattgcatatgtccgccatgatg 6601633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14125606 - 14125827
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14125606 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 14125705  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14125706 ggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 14125805  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14125806 attgcatatgtccgctatgatg 14125827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16411294 - 16411515
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  16411294 ttgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatta 16411393  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16411394 ggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 16411493  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16411494 attgcatatgtccgctatgatg 16411515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16805959 - 16806180
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16805959 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 16806058  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16806059 ggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 16806158  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16806159 attgcatatgtccgctttgatg 16806180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 14875511 - 14875731
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14875511 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaatgaattgaatatga 14875610  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14875611 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 14875710  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  14875711 attgcatatgtccactatgat 14875731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16693282 - 16693071
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||    
T  16693282 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaaggaattgaatatga 16693183  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16693182 gacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagac 16693083  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||    
T  16693082 attgcatatgtc 16693071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12499366 - 12499145
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12499366 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 12499267  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  12499266 gtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagac 12499167  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12499166 attgcatatgtccgctatgatg 12499145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062615
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagac 15062637  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15062636 attgcatatgtccgctatgatg 15062615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16491193 - 16491414
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16491193 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 16491292  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||  ||  | || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16491293 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagac 16491392  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  16491393 cttgcatatgtctgctatgatg 16491414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14579954 - 14580175
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14579954 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 14580053  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14580054 gacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaa 14580153  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || || |||||||||||||||    
T  14580154 tttacacatgtccgctatgatg 14580175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3687061 - 3686897
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3687061 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 3686962  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaa 178  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  3686961 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaa 3686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17490968 - 17490747
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17490968 ttgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 17490869  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17490868 ggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 17490769  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  17490768 cttgcatatgtctgctatgatg 17490747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15260745 - 15260527
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |    
T  15260745 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaagtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 15260646  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15260645 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacttt 15260546  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15260545 gcatatgtccgctatgatg 15260527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14575023 - 14574830
Alignment:
Q  42 gttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaa 141  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||    
T  14575023 gttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaa 14574924  T
Q  142 ggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14574923 ggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 14574830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 12359528 - 12359749
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  12359528 ttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagtatttagtaatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 12359627  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12359628 ggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagac 12359727  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  12359728 gttgcatatgtctgctttgatg 12359749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16827204 - 16827425
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||    
T  16827204 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagagttgaatatga 16827303  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16827304 ggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagac 16827403  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  16827404 gttgcacatgtctgctatgatg 16827425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31940031 - 31939810
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  31940031 ttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 31939932  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31939931 ggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaac 31939832  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      |||||||||| ||| |||||    
T  31939831 gctgcatatgtctgctttgatg 31939810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 5109622 - 5109723
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5109622 gttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatg 5109721  T
Q  113 ag 114  Q
    ||    
T  5109722 ag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15228778 - 15228557
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||| ||||||||    
T  15228778 gttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatg 15228679  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||| |||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15228678 aggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaaga 15228579  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgat 234  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  15228578 ctttgcatatgtcagctatgat 15228557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15234646 - 15234425
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||| ||||||||    
T  15234646 gttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatg 15234547  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||| |||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15234546 aggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaaga 15234447  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgat 234  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  15234446 ctttgcatatgtcagctatgat 15234425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16379929 - 16380150
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16379929 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 16380028  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16380029 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 16380128  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  16380129 actgcatatgtctgctatgatg 16380150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44778375 - 44778154
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  44778375 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 44778276  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  44778275 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 44778176  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  44778175 actgcatatgtctgctatgatg 44778154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13943152 - 13942931
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13943152 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatacttgtttgatcagaaggaattgaatatga 13943053  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  13943052 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagac 13942953  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  13942952 actgcatatgtctgctatgatg 13942931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41178650 - 41178429
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  41178650 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 41178551  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  41178550 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 41178451  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  41178450 actccatatgtctgctatgatg 41178429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17187502 - 17187281
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  |||| ||||    
T  17187502 ttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatga 17187403  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||| ||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17187402 ggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggc 17187303  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  17187302 attgcatatgtcggctatgatg 17187281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 31694187 - 31694408
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  31694187 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 31694286  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31694287 ggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaac 31694386  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      |||||||||| ||| |||||    
T  31694387 gctgcatatgtctgctttgatg 31694408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 11960179 - 11960391
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  11960179 tggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 11960278  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||| | ||||| |  |||||||||| || ||||| ||||||||| | ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11960279 gattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacattgcatat 11960378  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  11960379 gtctgctttgatg 11960391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 10419046 - 10419257
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||    
T  10419046 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccagaaagaattgaacatga 10419145  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10419146 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 10419245  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    |||||| |||||    
T  10419246 attgcacatgtc 10419257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 16835511 - 16835722
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16835511 ttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 16835610  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16835611 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagac 16835710  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     ||||| |||||    
T  16835711 tttgcacatgtc 16835722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12179430 - 12179245
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  12179430 tttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatg 12179331  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  12179330 attttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatg 12179245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 13971124 - 13971342
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  13971124 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 13971223  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13971224 agaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgtt 13971323  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  13971324 acacatgtcggccatgatg 13971342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 225
Target Start/End: Original strand, 13319525 - 13319714
Alignment:
Q  36 tgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaatt 135  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||  |    
T  13319525 tgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaggtatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagct 13319624  T
Q  136 gttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13319625 gttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtc 13319714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 16337522 - 16337734
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  16337522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 16337621  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16337622 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatat 16337721  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  16337722 gtctgctttgatg 16337734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 16328661 - 16328872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  16328661 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgataataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatga 16328760  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16328761 ggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaac 16328860  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||| ||||||||    
T  16328861 attacatatgtc 16328872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28755446 - 28755225
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  28755446 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatga 28755347  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28755346 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaac 28755247  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  28755246 gttgcacatgtctgctttgatg 28755225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30138934 - 30138713
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  30138934 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30138835  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30138834 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30138735  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  30138734 tttgcatatgtctgctttgatg 30138713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30148485 - 30148264
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  30148485 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30148386  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30148385 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30148286  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  30148285 tttgcatatgtctgctttgatg 30148264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47125072 - 47124851
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  47125072 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 47124973  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  47124972 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 47124873  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  47124872 gttgcacatgtctgctttgatg 47124851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 8273411 - 8273632
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8273411 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 8273510  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8273511 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 8273610  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  8273611 tttgcatatgtctgctttgatg 8273632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 13966356 - 13966577
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||| ||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  13966356 ttgacgatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 13966455  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13966456 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 13966555  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  13966556 tttgcatatgtctgctttgatg 13966577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18133347 - 18133568
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| | ||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  18133347 ttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 18133446  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | || ||| ||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||| | || |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  18133447 ggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaac 18133546  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  18133547 gttgcatatgtctgctttgatg 18133568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14087798 - 14087580
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||  |||| |||||||    
T  14087798 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatctgattagaaggagttgaacatgaggc 14087699  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14087698 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacatt 14087599  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  14087598 acacatgtcggccatgatg 14087580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17493663 - 17493537
Alignment:
Q  109 tatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagg 208  Q
    |||||||||| | |||||| || |  ||||||||||||| || |||||||||| |||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  17493663 tatgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggagg 17493564  T
Q  209 aagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17493563 aagacgttgcatatgtctgctatgatg 17493537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 15014804 - 15014989
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || ||  |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| |    
T  15014804 tttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatg 15014903  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||  | ||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  15014904 atttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatg 15014989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16258272 - 16258159
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16258272 ttgaagatctggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16258173  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  16258172 ggcagaggagatgg 16258159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755818
Alignment:
Q  174 gtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatg 16755818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25767446 - 25767225
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  25767446 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25767347  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | |||||| | ||||   | ||||||| ||| |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25767346 gacaaagaagatggtttgaatatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 25767247  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  25767246 tttgcatatgtctgctttgatg 25767225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 6151865 - 6152086
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||  |||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| |    
T  6151865 ttgaagattcggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataa 6151964  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6151965 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 6152064  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  6152065 tttgcatatgtctgctttgatg 6152086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16741715 - 16741936
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16741715 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16741814  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16741815 ggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16741914  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  16741915 tttgcatatgtctgctttgatg 16741936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18751037 - 18750851
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattac 148  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | || ||| | || |   | ||||||| |    
T  18751037 gtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttc 18750938  T
Q  149 gactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     | |||   |||| |||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  18750937 aattttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 18750851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15611231 - 15611010
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  15611231 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 15611132  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | ||||| |  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  15611131 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagat 15611032  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  15611031 tttgcatatgtctgctttgatg 15611010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 55514729 - 55514833
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| |  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  55514729 gttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaatatg 55514828  T
Q  113 aggca 117  Q
    |||||    
T  55514829 aggca 55514833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15096080 - 15096030
Alignment:
Q  68 cacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcag 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15096080 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaatatgaggcag 15096030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 16755712 - 16755758
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgt 59  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16755712 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgt 16755758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12793233 - 12793156
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| ||||||| | ||||||    
T  12793233 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacgaggcagaggagatgg 12793156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17194222 - 17194109
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| || ||  |||||||||    
T  17194222 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatga 17194123  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  17194122 ggcagagaagatgg 17194109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16258107 - 16258051
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16258107 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 16258051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4679404 - 4679345
Alignment:
Q  176 aaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4679404 aaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatg 4679345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 6711423 - 6711525
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | ||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||    
T  6711423 gttgaagatttggagccattatctgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagattgaagtacttgtttgaccagaaagagttgaatatg 6711522  T
Q  113 agg 115  Q
    |||    
T  6711523 agg 6711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12793104 - 12793048
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  12793104 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagtaagattttgcatatgtctgctttgatg 12793048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16924019 - 16923798
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16924019 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16923920  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923919 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16923820  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16923819 attgcatatgtccgccatgatg 16923798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16983282 - 16983061
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16983282 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16983183  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983182 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16983083  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16983082 attgcatatgtccgccatgatg 16983061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24263500 - 24263279
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24263500 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24263401  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24263400 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24263301  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24263300 attgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10869980 - 10869759
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10869980 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10869881  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869880 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10869781  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10869780 attgcatatgtccgccatgatg 10869759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16926490 - 16926269
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16926490 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16926391  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926390 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16926291  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16926290 attgcatatgtccgccatgatg 16926269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17000130 - 16999909
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17000130 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 17000031  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000030 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16999931  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16999930 attgcatatgtccgccatgatg 16999909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21144354 - 21144575
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21144354 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 21144453  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144454 gacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21144553  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21144554 attgcatatgtccgctatgatg 21144575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27219146 - 27218925
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27219146 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27219047  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219046 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27218947  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27218946 attgcatatgtccgccatgatg 27218925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 41607698 - 41607919
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41607698 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 41607797  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607798 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 41607897  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41607898 attgcatatgtccgctatgatg 41607919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44384882 - 44385103
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44384882 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44384981  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384982 ggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 44385081  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  44385082 attgcatatgtccgccatgatg 44385103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24711164 - 24710943
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24711164 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24711065  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711064 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24710965  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  24710964 attgcatatgtccgccatgatg 24710943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27372399 - 27372178
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27372399 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 27372300  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372299 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 27372200  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27372199 attgcatatgtccgccatgatg 27372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22324169 - 22324390
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22324169 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22324268  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324269 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 22324368  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  22324369 attgcatatgtccgccatgatg 22324390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 24876062 - 24876283
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24876062 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttgaggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 24876161  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876162 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24876261  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24876262 attgcatatgtccgctatgatg 24876283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21324579 - 21324800
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21324579 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 21324678  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21324679 ggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagac 21324778  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  21324779 tttgcatatgtccgctatgatg 21324800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17064808 - 17064626
Alignment:
Q  53 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgact 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17064808 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgact 17064709  T
Q  153 ttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17064708 ttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatg 17064626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24676619 - 24676398
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  24676619 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttcgatcagaaagagttgaatatga 24676520  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676519 ggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24676420  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24676419 attgcatatgtccgctatgatg 24676398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 24706795 - 24707009
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  24706795 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagacagaattgaatatga 24706894  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24706895 ggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagac 24706994  T
Q  214 attgcatatgtccgc 228  Q
    |||||||||||||||    
T  24706995 attgcatatgtccgc 24707009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23107043 - 23107264
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  23107043 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctattcgatcagaaggaattgaatatga 23107142  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| || ||||  ||||  ||  | ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23107143 ggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagac 23107242  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  23107243 cttgcatatgtctgctatgatg 23107264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23111830 - 23111645
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |    
T  23111830 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatg 23111731  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||| ||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23111730 attttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 23111645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23099331 - 23099552
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  23099331 ttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatatttgtttgattaaaaggaattgaatatga 23099430  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | || ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23099431 gacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 23099530  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  23099531 gttgcacatgtcggctatgatg 23099552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23277906 - 23277685
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  23277906 ttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagttatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 23277807  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23277806 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 23277707  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  23277706 gttgcacatgtctgctatgatg 23277685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12575483 - 12575262
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  12575483 ttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 12575384  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  12575383 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagac 12575284  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  12575283 actgcatatgtctgctatgatg 12575262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23072990 - 23072887
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23072990 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagac 23072891  T
Q  117 agcg 120  Q
    ||||    
T  23072890 agcg 23072887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27788870 - 27788650
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  27788870 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 27788771  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27788770 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 27788671  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  27788670 act-catatgtctgctatgatg 27788650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1064881 - 1064660
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  1064881 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 1064782  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  1064781 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 1064682  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  1064681 gttgcacatgtctgctttgatg 1064660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24949720 - 24949499
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  24949720 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 24949621  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24949620 ggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 24949521  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  24949520 gttgcacatgtctgctttgatg 24949499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45533466 - 45533254
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||||||||||| |    
T  45533466 tggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttatttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 45533367  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| | |||||| | |||||||| || || || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||    
T  45533366 ggtggtttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatat 45533267  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  45533266 gtctgctatgatg 45533254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23295065 - 23294854
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  23295065 ttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 23294966  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||    
T  23294965 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagac 23294866  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     |||||||||||    
T  23294865 gttgcatatgtc 23294854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 19651363 - 19651574
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  19651363 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 19651462  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||| || || || ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19651463 ggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaac 19651562  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  19651563 gctgcatatgtc 19651574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 27209485 - 27209699
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  27209485 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 27209584  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27209585 ggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagac 27209684  T
Q  214 attgcatatgtccgc 228  Q
    |||||| ||||||||    
T  27209685 attgcacatgtccgc 27209699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 12639546 - 12639767
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  12639546 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 12639645  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12639646 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagac 12639745  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  12639746 tttgcatatgtctgctttgatg 12639767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20829389 - 20829168
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  20829389 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 20829290  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| |||| ||  |||| ||||  || ||||| ||||||||| | || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20829289 ggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 20829190  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  20829189 gttgcacatgtctgctttgatg 20829168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31831788 - 31831567
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  31831788 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 31831689  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  31831688 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 31831589  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || || ||||| ||| |||||    
T  31831588 tttacacatgtctgctttgatg 31831567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25264184 - 25264032
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  25264184 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 25264085  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattac 166  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||||    
T  25264084 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaattac 25264032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 24830501 - 24830722
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  24830501 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 24830600  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | |  || || |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  24830601 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatctcggaaaggctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagac 24830700  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  24830701 tttgcatatgtctgctttgatg 24830722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 30011506 - 30011699
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |  ||||| || | |||||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  30011506 tggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaattttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 30011605  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | ||||| |||||| | |||||||| || || || || |||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  30011606 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacatt 30011699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 30210240 - 30210451
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||| |||||| || |    
T  30210240 tggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggcatcgaa 30210339  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| |||||| | |||||||| || || || ||||||||| | || ||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  30210340 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaaca-tacatat 30210438  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  30210439 gtctgctatgatg 30210451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22279235 - 22279122
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||    
T  22279235 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatga 22279136  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  22279135 ggcagagaagatgg 22279122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23067362 - 23067300
Alignment:
Q  173 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23067362 ggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatg 23067300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25129739 - 25129635
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||||    
T  25129739 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatga 25129640  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  25129639 ggcag 25129635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 22760882 - 22760986
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||    
T  22760882 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 22760981  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  22760982 ggcag 22760986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 24568981 - 24569084
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  ||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||||    
T  24568981 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtattaagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaaaagatgaatatga 24569080  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  24569081 ggca 24569084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22279070 - 22279025
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22279070 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgt 22279025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Original strand, 24569149 - 24569202
Alignment:
Q  182 aatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  24569149 aatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 24569202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8469 - 8248
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8469 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8370  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8369 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8270  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8269 attgcatatgtccgctatgatg 8248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8896 - 8675
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8896 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattgaatatga 8797  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8697  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8696 attgcatatgtccgctatgatg 8675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 44790133 - 44790354
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44790133 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 44790232  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790233 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 44790332  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  44790333 attgcatatgtccgccatgatg 44790354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8200116 - 8199895
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8200116 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8200017  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200016 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8199917  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  8199916 attgcatatgtccgccatgatg 8199895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11235995 - 11236216
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11235995 ttgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 11236094  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236095 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 11236194  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11236195 attgcatatgtccgctatgatg 11236216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14333884 - 14333663
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14333884 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 14333785  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333784 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14333685  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  14333684 attgcatatgtccgccatgatg 14333663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12688989 - 12688767
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12688989 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcaatcagaaggaattgaatatga 12688890  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaagga-ttacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688889 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 12688790  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12688789 cattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8709093 - 8708872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8709093 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8708994  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708993 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8708894  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  8708893 gttgcatatgtccgccatgatg 8708872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15159839 - 15160060
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15159839 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttattcgatcagaaggaattgaatatga 15159938  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159939 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15160038  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15160039 attgcatatgtccgccatgatg 15160060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16100 - 16321
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  16100 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaacagtttgaagtatttgtttgatcagaagaaattgaatatga 16199  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16200 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 16299  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16300 attgcatatgtccgctttgatg 16321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10872483 - 10872262
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10872483 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10872384  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872383 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10872284  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10872283 attgcatatgtccgccatgatg 10872262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13687552 - 13687331
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13687552 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 13687453  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13687452 gacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagac 13687353  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  13687352 attgcatatgtccgccatgatg 13687331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14956042 - 14955821
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14956042 ttgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 14955943  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955942 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14955843  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14955842 attgcatatgtccgctatgatg 14955821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18179230 - 18179009
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  18179230 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgttctatcagaaggaattgaacatga 18179131  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179130 ggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18179031  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18179030 attgcatatgtccgccatgatg 18179009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18550540 - 18550761
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18550540 ttgaagataaggagacattacttgtatgattcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18550639  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18550640 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18550739  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  18550740 gttgcatatgtccgccatgatg 18550761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11551884 - 11552105
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11551884 ttgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 11551983  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11551984 ggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagac 11552083  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11552084 attgcatatgtccgctatgatg 11552105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9597545 - 9597324
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  9597545 ttgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaggtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 9597446  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9597445 ggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagac 9597346  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9597345 attgcatatgtccgctttgatg 9597324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23202395 - 23202616
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23202395 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 23202494  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23202495 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagac 23202594  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  23202595 attgcatatgtccgccatgatg 23202616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23508522 - 23508743
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23508522 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 23508621  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23508622 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagac 23508721  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  23508722 attgcatatgtccgccatgatg 23508743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14213162 - 14212941
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14213162 ttgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaaaatga 14213063  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14213062 ggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagac 14212963  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14212962 attgcatatgtccgctttgatg 14212941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15147667 - 15147888
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15147667 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 15147766  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||| |||| || |  || ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147767 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 15147866  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  15147867 tttgcatatgtctgctatgatg 15147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 320819 - 321040
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  320819 ttgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 320918  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||| | |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  320919 ggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagac 321018  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  321019 tttgcatatgtccgctatgatg 321040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 11771029 - 11771244
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| || |    
T  11771029 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctatttgatcagaaggaattgaatatgagacaac 11771128  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  11771129 gaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgca 11771228  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  11771229 tatgtccgctatgatg 11771244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14041177 - 14040962
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14041177 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 14041078  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |  |   |  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14041077 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgca 14040978  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| |||||||||||    
T  14040977 tatgcccgctatgatg 14040962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14351207 - 14350992
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14351207 atatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 14351108  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || |  |   |  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14351107 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgca 14351008  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| |||||||||||    
T  14351007 tatgcccgctatgatg 14350992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15205104 - 15204886
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |    
T  15205104 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 15205005  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15205004 aacgaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacttt 15204905  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| |||||||||    
T  15204904 acatatgtctgctatgatg 15204886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 11387188 - 11387409
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  11387188 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 11387287  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  11387288 ggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagac 11387387  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  11387388 gttgcacatgtcggctatgatg 11387409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 15101399 - 15101584
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15101399 tttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatg 15101498  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15101499 attttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 15101584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 12205569 - 12205781
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||| |    
T  12205569 tggagaccttatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgta 12205668  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| |||||||||||||| || || ||| |||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12205669 ggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 12205768  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
     || |||||||||    
T  12205769 atcagctatgatg 12205781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19148700 - 19148479
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  19148700 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 19148601  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19148600 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 19148501  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  19148500 gttgcacatgtctgctatgatg 19148479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20748099 - 20747878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  20748099 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 20748000  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20747999 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 20747900  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  20747899 gttgcacatgtctgctatgatg 20747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16071055 - 16071276
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||| || ||  |||||||||    
T  16071055 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgatcaaaaagagttgaatatga 16071154  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16071155 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagac 16071254  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  16071255 attgcacatgtctgctatgatg 16071276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15341884 - 15341699
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||      
T  15341884 tttgaggtgttcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatt 15341785  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  15341784 attttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatg 15341699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18052713 - 18052934
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  18052713 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 18052812  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  18052813 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagac 18052912  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  18052913 actccatatgtctgctatgatg 18052934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 23504630 - 23504851
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  23504630 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattaaacatga 23504729  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  23504730 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagac 23504829  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      |||||||||| |||||||||    
T  23504830 gctgcatatgtctgctatgatg 23504851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13022810 - 13022625
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  13022810 tttgatgtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatg 13022711  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  13022710 attttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatg 13022625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14285136 - 14285357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||  || || ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  14285136 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagtattcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 14285235  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14285236 ggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagac 14285335  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  14285336 actgcatatgtctgctatgatg 14285357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 205 - 388
Alignment:
Q  53 gaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgact 152  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  205 gaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgatt 304  T
Q  153 ttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgc-agatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  305 ttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcatatgtctgctttgatg 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 14263004 - 14263203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||| |||| ||| | || ||  |||||||||    
T  14263004 ttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgtaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatga 14263103  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14263104 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 14263203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 16949247 - 16949453
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||     
T  16949247 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggt 16949346  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16949347 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgc 16949446  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    | |||||    
T  16949447 tctgatg 16949453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7825388 - 7825167
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  7825388 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 7825289  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7825288 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 7825189  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  7825188 tttgcatatgtctgctttgatg 7825167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13667026 - 13666805
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  13667026 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 13666927  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||  ||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||    
T  13666926 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaac 13666827  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  13666826 gttgcatatgtctgctttgatg 13666805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27106556 - 27106777
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  27106556 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27106655  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27106656 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27106755  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  27106756 tttgcatatgtctgctttgatg 27106777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27171769 - 27171548
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  27171769 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27171670  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27171669 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27171570  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  27171569 tttgcatatgtctgctttgatg 27171548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12458120 - 12457908
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  | |    
T  12458120 tggaggcattatttgtacggttccagatttaaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaagga 12458021  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  12458020 gatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatat 12457921  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  12457920 gtctgctttgatg 12457908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19614161 - 19613943
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  19614161 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 19614062  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19614061 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 19613962  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  19613961 acacatgtcggccatgatg 19613943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 11305059 - 11305244
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  |    
T  11305059 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttg 11305158  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  11305159 attttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 11305244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 26117401 - 26117586
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||  |||||||||| |    
T  26117401 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatg 26117500  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||| |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  26117501 attttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 26117586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 13967428 - 13967612
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  13967428 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagatgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 13967527  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 198  Q
    ||||| | || ||| |||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  13967528 ggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgc 13967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4441416 - 4441195
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  4441416 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 4441317  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |||   | |||||| ||||||     | ||||| |||||||   |||| |||  |||| || || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4441316 ggccaagaagatggttagaatatcctacggatttcgactttcagttgagttatcaccccgggaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagac 4441217  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| ||| || |||||    
T  4441216 tttgcatatatcctctttgatg 4441195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 39935 - 40139
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  39935 tatggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcg 40034  T
Q  121 cagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | ||||| || ||||| || || ||||   ||| |||  | ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  40035 gagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 40134  T
Q  221 atgtc 225  Q
    |||||    
T  40135 atgtc 40139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 49153754 - 49153569
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| ||  |||| ||||  |    
T  49153754 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttg 49153655  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  49153654 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 49153569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15626010 - 15625892
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  15626010 aagatttggagacattatttatatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggc 15625911  T
Q  117 agcgcagatggctagaatt 135  Q
    || | || ||||| |||||    
T  15625910 agggaaggtggcttgaatt 15625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 15717684 - 15717786
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |    
T  15717684 gttgaagatttggaggcactacttgtatggttctaagtttgaagtgttcgatgaccacaagagtttgaagtacttgttcgatcagaaggagttgaataag 15717783  T
Q  113 agg 115  Q
    |||    
T  15717784 agg 15717786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17925139 - 17925035
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| | |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  17925139 ttgaagatttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 17925040  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  17925039 ggcag 17925035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15625886 - 15625821
Alignment:
Q  170 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  15625886 ccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatg 15625821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23642916 - 23642831
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgag 114  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||    
T  23642916 cattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtatttgtttgactagaaggagttgaatatgag 23642831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14937800 - 14937732
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  14937800 gtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggca 14937732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15365393 - 15365325
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  15365393 gtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggca 15365325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13354472 - 13354429
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13354472 gctaatgttgttgccgatgccttgagtaggaagacgtggcatat 13354429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13456067 - 13456014
Alignment:
Q  182 aatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13456067 aatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatg 13456014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 21673316 - 21673420
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||  ||||| |||| | |||| | ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  |||||||||    
T  21673316 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagttttaagtgttcagtgactacaagagtttgaagtacttgtttgataagaaagagttgaatatga 21673415  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  21673416 ggcag 21673420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23957246 - 23957025
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23957246 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 23957147  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957146 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 23957047  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23957046 attgcatatgtccgctatgatg 23957025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29037917 - 29038138
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29037917 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 29038016  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038017 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 29038116  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29038117 attgcatatgtccgccatgatg 29038138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 8052136 - 8052357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8052136 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8052235  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052236 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8052335  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  8052336 attgcatatgtccgccatgatg 8052357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8387911 - 8387690
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8387911 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 8387812  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387811 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8387712  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  8387711 attgcatatgtccgccatgatg 8387690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12478099 - 12477878
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12478099 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 12478000  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477999 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12477900  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  12477899 attgcatatgtccgccatgatg 12477878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 19777306 - 19777527
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19777306 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 19777405  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777406 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19777505  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  19777506 attgcatatgtccgccatgatg 19777527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14302491 - 14302712
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14302491 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 14302590  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14302591 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagat 14302690  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14302691 attgcatatgtccgctatgatg 14302712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18298704 - 18298483
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18298704 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18298605  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298604 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 18298505  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18298504 attgcatatgtccgccatgatg 18298483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40474539 - 40474318
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40474539 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 40474440  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40474439 ggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagac 40474340  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40474339 attgcatatgtccgctatgatg 40474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27712835 - 27712614
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27712835 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 27712736  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27712735 ggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagac 27712636  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  27712635 attgcatatgtccgccatgatg 27712614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12525175 - 12524954
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12525175 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 12525076  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12525075 ggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12524976  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  12524975 attgcatatgttcgctatgatg 12524954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14682066 - 14681853
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14682066 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 14681967  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681966 ggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T
Q  214 attgcatatgtccg 227  Q
    ||||||||||||||    
T  14681866 attgcatatgtccg 14681853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16353958 - 16354179
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16353958 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 16354057  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354058 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16354157  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16354158 attgcatatgtccgctatgatg 16354179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18614337 - 18614558
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18614337 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18614436  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  18614437 gacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagac 18614536  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18614537 attgcatatgtccgctttgatg 18614558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 18225962 - 18226180
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  18225962 aagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcaaaaggaattaaatatgaggc 18226061  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18226062 agcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacatt 18226161  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  18226162 gcatatgtcagctttgatg 18226180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15146398 - 15146619
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15146398 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15146497  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15146498 ggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagac 15146597  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  15146598 gttgcatatgtccgctatgatg 15146619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14160969 - 14160748
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  14160969 ttgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaacatga 14160870  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||  |||||||||  || ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  14160869 ggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagac 14160770  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  14160769 cttgcatatgtccgctatgatg 14160748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8707419 - 8707198
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  8707419 gttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatg 8707320  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8707319 ag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 8707221  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  8707220 cgttgcatatgtctgctatgatg 8707198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14695609 - 14695390
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |    
T  14695609 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagac 14695510  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  14695509 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagtt 14695410  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14695409 gcatatgtccgctatgatgt 14695390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15071858 - 15071637
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||    
T  15071858 ttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttttttgaccaaaaggaattgaatatga 15071759  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15071758 ggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagac 15071659  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  15071658 gttgcacatgtctgctatgatg 15071637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15002137 - 15002358
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| ||  |||||||||    
T  15002137 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatga 15002236  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15002237 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 15002336  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  15002337 gttgcacatgtcggctatgatg 15002358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 14849882 - 14850100
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||| |    
T  14849882 aagatatggagacattatttgtacgattctagatttgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagac 14849981  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| |||||  |||| || || || ||||| || |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14849982 agcgaaggtggcttgaatttgtgaaagactatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgtt 14850081  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14850082 gcatatgtccgctgtgatg 14850100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16149210 - 16148996
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  16149210 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 16149111  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16149110 ggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagac 16149011  T
Q  214 attgcatatgtccgc 228  Q
    |||||||||||||||    
T  16149010 attgcatatgtccgc 16148996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16153356 - 16153142
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  16153356 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 16153257  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16153256 ggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagac 16153157  T
Q  214 attgcatatgtccgc 228  Q
    |||||||||||||||    
T  16153156 attgcatatgtccgc 16153142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15320600 - 15320414
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattac 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||     
T  15320600 gtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattat 15320501  T
Q  149 gactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  15320500 gattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatg 15320414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15247387 - 15247202
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  15247387 tttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatg 15247288  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  15247287 actttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 15247202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 51605565 - 51605786
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  51605565 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 51605664  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  51605665 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 51605764  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  51605765 actccatatgtctgctatgatg 51605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 1648050 - 1648271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| ||||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  1648050 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagtatttagtgaccacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggagctgaacatga 1648149  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||| ||||  ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1648150 ggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagac 1648249  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||| || ||||||    
T  1648250 attgcacatgtcggccatgatg 1648271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27901885 - 27901664
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  27901885 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatatgtttgaacaaaaagaattgaacatga 27901786  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27901785 ggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 27901686  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||| || ||||||    
T  27901685 attgcacatgtcggccatgatg 27901664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 3263567 - 3263788
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  3263567 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 3263666  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3263667 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 3263766  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  3263767 tttgcacatgtctgctttgatg 3263788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15357893 - 15358114
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  15357893 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 15357992  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||  |||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15357993 ggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 15358092  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  15358093 gttgcatatgtctgctatgatg 15358114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29452310 - 29452531
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  29452310 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 29452409  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29452410 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 29452509  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  29452510 gttgcacatgtctgctttgatg 29452531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33224422 - 33224201
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  33224422 ttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 33224323  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  33224322 ggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 33224223  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||| ||| |||||    
T  33224222 attacatatgtctgctttgatg 33224201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 11206040 - 11206225
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||||| |    
T  11206040 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatg 11206139  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  11206140 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 11206225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414020
Alignment:
Q  64 tgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaat 163  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | || ||| | || ||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||    
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  164 tacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatg 15414020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9292335 - 9292221
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  9292335 gttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatg 9292236  T
Q  113 aggcagcgcagatgg 127  Q
    |||||| | ||||||    
T  9292235 aggcagagaagatgg 9292221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 44660654 - 44660850
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | || |||     
T  44660654 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggt 44660753  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    |||| ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||    
T  44660754 tagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtc 44660850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 56566304 - 56566368
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 78  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56566304 ttgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagttt 56566368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 15291931 - 15292152
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  15291931 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 15292030  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15292031 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 15292130  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  15292131 tttgcatatgtctgctttgatg 15292152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 18548839 - 18548945
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  18548839 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgagacagcg 18548938  T
Q  121 cagatgg 127  Q
     ||||||    
T  18548939 gagatgg 18548945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14998814 - 14998594
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  14998814 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 14998716  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14998715 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 14998616  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  14998615 tttgcatatgtctgctttgatg 14998594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20892390 - 20892270
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20892390 tgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 20892291  T
Q  205 taggaagacattgcatatgtc 225  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  20892290 caggaaaacattgcatatgtc 20892270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 12341639 - 12341742
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgag 114  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  12341639 tgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgag 12341738  T
Q  115 gcag 118  Q
    ||||    
T  12341739 gcag 12341742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9292169 - 9292113
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  9292169 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 9292113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248923
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 13248923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16349441 - 16349662
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16349441 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 16349540  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16349541 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 16349640  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16349641 attgcatatgtccgccatgatg 16349662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21831817 - 21831596
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21831817 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 21831718  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831717 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21831618  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21831617 attgcatatgtccgctatgatg 21831596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 33389874 - 33390095
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33389874 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 33389973  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389974 ggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 33390073  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33390074 attgcatatgtccgctatgatg 33390095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17043860 - 17044081
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17043860 ttgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttggatcagaaggaattgaatatga 17043959  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043960 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17044060 attgcatatgtccgctttgatg 17044081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 51332338 - 51332559
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51332338 ttgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 51332437  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51332438 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagac 51332537  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51332538 attgcatatgtccgctatgatg 51332559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21838465 - 21838243
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatca-caagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21838465 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 21838366  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838365 agacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 21838266  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21838265 cattgcatatgtccgccatgatg 21838243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19107882 - 19107661
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19107882 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattgaatatga 19107783  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107782 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19107683  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19107682 attgtatatgtccgctatgatg 19107661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 41352506 - 41352728
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41352506 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 41352605  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41352606 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 41352705  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  41352706 cattgcatatgtccgccatgatg 41352728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21025684 - 21025466
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21025684 aagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggc 21025585  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025584 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 21025485  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21025484 gcatatgtccgctatgatg 21025466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21234576 - 21234797
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  21234576 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatattagttcgatcaaaaggaattgaatatga 21234675  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21234676 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 21234775  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  21234776 gttgcatatgtccgctttgatg 21234797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 24793462 - 24793658
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24793462 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatga 24793561  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793562 gacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaa 24793658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 430961 - 431182
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  430961 ttgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 431060  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  431061 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 431160  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  431161 cttgcatatgtctgctatgatg 431182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21750454 - 21750233
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21750454 ttgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 21750355  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||| | || || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21750354 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21750255  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  21750254 attgcatatgtcggccatgatg 21750233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 22361092 - 22361310
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22361092 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaagtaattgaatatgaggc 22361191  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||| || || ||||  || |  ||  |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22361192 agcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacctt 22361291  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| || |||||||||    
T  22361292 gcatatatctgctatgatg 22361310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22110530 - 22110315
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||| |||||  |||  || ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22110530 atatggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22110431  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22110430 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22110331  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22110330 tatgtcctctatgatg 22110315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22114379 - 22114164
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagc 119  Q
    |||||||||||||| |||||  |||  || ||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22114379 atatggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagc 22114280  T
Q  120 gcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgca 219  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22114279 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgca 22114180  T
Q  220 tatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22114179 tatgtcctctatgatg 22114164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16373980 - 16373823
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaa 177  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | ||||||||    
T  16373980 tgaagcatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaa 16373881  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16373880 agctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatg 16373823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21744397 - 21744618
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || | ||||| || ||| |||||||||    
T  21744397 ttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgattgatcaaaaagaattgaatatga 21744496  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21744497 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagac 21744596  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  21744597 gttgcacatgtctgctatgatg 21744618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 24098457 - 24098669
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  24098457 tggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 24098556  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24098557 gatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatat 24098656  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  24098657 gtctgctttgatg 24098669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 20834745 - 20834956
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  20834745 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaggaattgaacatga 20834844  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20834845 ggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 20834944  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  20834945 gctgcatatgtc 20834956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 23197106 - 23197312
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||     
T  23197106 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggt 23197205  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23197206 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgc 23197305  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    |||||||    
T  23197306 tatgatg 23197312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 19661982 - 19662203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || || || || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||    
T  19661982 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattgaacatga 19662081  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19662082 ggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 19662181  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  19662182 attgcatatgtctgctttgatg 19662203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19855819 - 19855598
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||||||| | || ||||    
T  19855819 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattaaacatga 19855720  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19855719 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 19855620  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  19855619 attgcatatgtctgctttgatg 19855598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21952423 - 21952202
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  21952423 ttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatga 21952324  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21952323 ggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 21952224  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  21952223 attgcatatgtctgctttgatg 21952202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 19759754 - 19759939
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  19759754 tttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattatg 19759853  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  19759854 attttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 19759939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20938908 - 20939129
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  20938908 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggtattcagtgattacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 20939007  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  20939008 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaat 20939107  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  20939108 gttgcatatgtctgctttgatg 20939129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 20855605 - 20855816
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || ||| |||| ||||    
T  20855605 ttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttgaccaaaaagaattgaacatga 20855704  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20855705 ggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagac 20855804  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     ||||| |||||    
T  20855805 gttgcacatgtc 20855816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20830237 - 20830458
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  20830237 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 20830336  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20830337 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 20830436  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  20830437 tttgcatatgtctgctttgatg 20830458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077722
Alignment:
Q  143 gattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatg 16077722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20295917 - 20295705
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||| | |    
T  20295917 tggagacattatttgtacggttccagatctgaggtgttcaatgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaa 20295818  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20295817 gatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacat 20295718  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  20295717 gtctgctttgatg 20295705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 20060800 - 20061018
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| || || || ||| |||| |||||||    
T  20060800 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggc 20060899  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | ||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20060900 agaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgtt 20060999  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  20061000 acacatgtcggccatgatg 20061018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 31538842 - 31539047
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||    
T  31538842 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaggaactgaacatga 31538941  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  31538942 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 31539041  T
Q  214 attgca 219  Q
     |||||    
T  31539042 gttgca 31539047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37678594 - 37678373
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||    
T  37678594 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccaaaaagaactgaacatga 37678495  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  37678494 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaac 37678395  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  37678394 gttgcacatgtctgctttgatg 37678373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16377646 - 16377587
Alignment:
Q  24 ggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16377646 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttaagtgatcacaagagtttgaagt 16377587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 22134402 - 22134505
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  22134402 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22134501  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  22134502 ggca 22134505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 41216702 - 41216815
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||| |||| | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  41216702 ttgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41216801  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  41216802 ggcagagaagatgg 41216815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 50619235 - 50619296
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  50619235 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtctgaa 50619296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20915115 - 20915012
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  20915115 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 20915016  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  20915015 ggca 20915012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Original strand, 22134567 - 22134623
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  22134567 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 22134623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20914950 - 20914894
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  20914950 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 20914894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19114255 - 19114034
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19114255 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 19114156  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19114155 ggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 19114056  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  19114055 attgcatatgtccgccatgatg 19114034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20017479 - 20017700
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20017479 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 20017578  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017579 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 20017678  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  20017679 attgcatatgtccgccatgatg 20017700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 17673239 - 17673460
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17673239 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 17673338  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673339 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 17673438  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  17673439 attgcatatgtccgccatgatg 17673460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18858142 - 18857921
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18858142 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 18858043  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18858042 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagac 18857943  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  18857942 tttgcatatgtccgctatgatg 18857921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32601709 - 32601488
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  32601709 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 32601610  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32601609 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 32601510  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  32601509 attgcatatgtccgctttgatg 32601488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22041424 - 22041203
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22041424 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttggaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22041325  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22041324 ggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagac 22041225  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22041224 attgcatatgtccgctttgatg 22041203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22119390 - 22119611
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22119390 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22119489  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22119490 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagac 22119589  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22119590 gttgcatatgtccgctatgatg 22119611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 22128174 - 22128395
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22128174 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 22128273  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22128274 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagac 22128373  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  22128374 gttgcatatgtccgctatgatg 22128395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 19483279 - 19483501
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19483279 gttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatg 19483378  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483379 aggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 19483478  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  19483479 cattgcatatgtccgccatgatg 19483501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 30312360 - 30312581
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30312360 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 30312459  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30312460 ggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 30312559  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  30312560 attgcatatgtccgctttgatg 30312581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21165754 - 21165975
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||    
T  21165754 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgatcaaaaagagttgaatatga 21165853  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165854 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 21165953  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21165954 attgcatatgtccgctttgatg 21165975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15534948 - 15534727
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15534948 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15534849  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15534848 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagac 15534749  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  15534748 attgcacatgtccgctttgatg 15534727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 22132257 - 22132472
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22132257 ttgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatga 22132356  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  22132357 ggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagac 22132456  T
Q  214 attgcatatgtccgct 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  22132457 attgcatatgtccgct 22132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19979532 - 19979311
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19979532 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgttcgatcagaaagaattgaatatga 19979433  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19979432 ggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagac 19979333  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19979332 attgcatatgtccgctatgatg 19979311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21044010 - 21043789
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21044010 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 21043911  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21043910 ggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagac 21043811  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  21043810 cttgcatatgtctgctatgatg 21043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21393084 - 21393302
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21393084 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 21393183  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  21393184 agcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagacctt 21393283  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  21393284 gcatatgtctgctatgatg 21393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 21787578 - 21787796
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21787578 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggc 21787677  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  21787678 agcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagacctt 21787777  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  21787778 gcatatgtctgctatgatg 21787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 20395352 - 20395569
Alignment:
Q  18 agatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20395352 agatttggagacgttatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggca 20395451  T
Q  118 gcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattg 217  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||     
T  20395452 gcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacttta 20395551  T
Q  218 catatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20395552 catatgtcagttatgatg 20395569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21252509 - 21252288
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21252509 ttgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcaatcagaaggaattgaatatga 21252410  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21252409 ggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21252310  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  21252309 cttgcatatgtctgctatgatg 21252288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23651606 - 23651385
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23651606 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgttcgatctgaaggaattgaatatga 23651507  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||  | || ||||| || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23651506 ggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagac 23651407  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  23651406 tttgcatatgtctgctatgatg 23651385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 22247652 - 22247868
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |    
T  22247652 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagac 22247751  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22247752 agcgaaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 22247851  T
Q  217 gcatatgtccgctatga 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  22247852 gcatatgtccgctatga 22247868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20389665 - 20389443
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||    
T  20389665 gttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaatatg 20389566  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20389565 aggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaaga 20389466  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  20389465 cgttgcatatgtctgctatgatg 20389443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 21920952 - 21921173
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||    
T  21920952 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgctcgatcagaaggaattgaacatga 21921051  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||| | ||  |||| || ||||  ||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21921052 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 21921151  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || || ||||| || ||||||    
T  21921152 ttttcacatgtctgccatgatg 21921173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 16407333 - 16407471
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16407333 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatga 16407432  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgact 152  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  16407433 ggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgact 16407471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 20984772 - 20984984
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||| || || || ||| |||||||||||||| | |    
T  20984772 tggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaa 20984871  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20984872 gatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacat 20984971  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  20984972 gtctgctatgatg 20984984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 20974872 - 20975083
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||    
T  20974872 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatga 20974971  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  20974972 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 20975071  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  20975072 gctgcatatgtc 20975083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 21324485 - 21324696
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  21324485 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 21324584  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21324585 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 21324684  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     |||||| ||||    
T  21324685 gttgcatgtgtc 21324696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23656492 - 23656271
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  23656492 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaaaagcttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 23656393  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23656392 ggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 23656293  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  23656292 gttgcatatgtctgctatgatg 23656271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 31570058 - 31570279
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  31570058 ttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgtttgaccagaaggaattgaatatga 31570157  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  31570158 ggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagac 31570257  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  31570258 acttcatatgtctgctatgatg 31570279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 29302651 - 29302863
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| | |    
T  29302651 tggaggcattatttgtacggttccagattcgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagga 29302750  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  29302751 gatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgcatat 29302850  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  29302851 gtctgctttgatg 29302863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 20009137 - 20009357
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  ||||  | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||| | || ||||    
T  20009137 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattaaacatga 20009236  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20009237 ggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 20009335  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  20009336 gttgcacatgtctgctatgatg 20009357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22372496 - 22372275
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || || || ||  || |||||||||    
T  22372496 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatctatttgaccaaaaataattgaatatga 22372397  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22372396 ggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagac 22372297  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  22372296 gttgcacatgtctgctatgatg 22372275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21841982 - 21841761
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||    
T  21841982 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 21841883  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||||||||||| || ||  ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21841882 ggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 21841783  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||  | ||||| |||||||||    
T  21841782 gttaaacatgtctgctatgatg 21841761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 31415696 - 31415898
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  31415696 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 31415795  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  31415796 gatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcatat 31415895  T
Q  223 gtc 225  Q
    |||    
T  31415896 gtc 31415898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22052419 - 22052207
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||| |||  || ||||| || || || ||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| ||| | |    
T  22052419 tggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacaggagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagagga 22052320  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22052319 gatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatat 22052220  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  22052219 gtctgctatgatg 22052207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23886586 - 23886368
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||  ||||||| || |||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |    
T  23886586 aagatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagac 23886487  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || |||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  23886486 aacgaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 23886387  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || |||||||| ||||||    
T  23886386 acacatgtccgccatgatg 23886368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6605223 - 6605002
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  6605223 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 6605124  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| |||| ||  |||| ||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  6605123 ggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 6605024  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  6605023 tttgcacatgtctgctttgatg 6605002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852755
Alignment:
Q  110 atgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 209  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19852781  T
Q  210 agacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19852780 agacgttgcacatgtctgctatgatg 19852755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858791
Alignment:
Q  110 atgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagga 209  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19858817  T
Q  210 agacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19858816 agacgttgcacatgtctgctatgatg 19858791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Original strand, 22376734 - 22376891
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaa 177  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | | | ||||    
T  22376734 tgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaa 22376833  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22376834 agctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatg 22376891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Original strand, 22382909 - 22383066
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaa 177  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | | | ||||    
T  22382909 tgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaa 22383008  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22383009 agctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgatg 22383066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14566671 - 14566486
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  |    
T  14566671 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttg 14566572  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  14566571 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 14566486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12306287 - 12306112
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| || | ||  | |||||||| |    
T  12306287 tttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactaaaggattatg 12306188  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||    
T  12306187 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgtc 12306112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Original strand, 16270476 - 16270651
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||  | |||||||| |    
T  16270476 tttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatg 16270575  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    | ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16270576 attttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcacatgtc 16270651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 16876347 - 16876532
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| | ||||   | |||||||  |    
T  16876347 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttg 16876446  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  16876447 attttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 16876532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22435868 - 22435647
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  22435868 ttgaagatttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatga 22435769  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | || ||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22435768 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaac 22435669  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  22435668 tttgcatatgtctgctttgatg 22435647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27356101 - 27355924
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||    
T  27356101 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgaccagaaggaactaaacatga 27356002  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttg 191  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||    
T  27356001 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 20651549 - 20651662
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  20651549 ttgaagatttggaggcattacctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatga 20651648  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  20651649 ggcagagaagatgg 20651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Original strand, 21849588 - 21849764
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattac 148  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| | || |   | ||||| | |    
T  21849588 gtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggttggagtatcttaaggacttc 21849687  T
Q  149 gactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  21849688 gattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtc 21849764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 23156256 - 23156359
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  23156256 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23156355  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  23156356 ggca 23156359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19869251 - 19869047
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  19869251 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaatgagttgaatatgagacagcg 19869152  T
Q  121 cagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 220  Q
     |||||| | || || || ||||| || || ||||   ||| |||  | ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||| | |||||     
T  19869151 gagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcac 19869052  T
Q  221 atgtc 225  Q
    |||||    
T  19869051 atgtc 19869047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22316756 - 22316652
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| | || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  22316756 ttgaagatttggaggcattatctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22316657  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  22316656 ggcag 22316652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23901752 - 23901544
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  23901752 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23901653  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||  | |||||| ||||||   | ||||| | |||||||   |||| |||  | || || || |||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  23901652 gacaaagaagatggttagaatatcttaaggacttcgactttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgacgacgccttgagtaagaagac 23901553  T
Q  214 attgcatat 222  Q
     ||||||||    
T  23901552 tttgcatat 23901544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 23156393 - 23156439
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23156393 gctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagactttgcatatgtc 23156439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Original strand, 22623411 - 22623472
Alignment:
Q  173 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22623411 ggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgat 22623472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267582
Alignment:
Q  143 gattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | |  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatg 1267582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19861000 - 19860900
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  19861000 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 19860901  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  19860900 g 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 20651714 - 20651760
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20651714 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtc 20651760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8927 - 8706
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8927 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgattagaaggaattgaatatga 8828  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8827 gacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 8728  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8727 attgcatatgtccgctatgatg 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49620 - 49487
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  49620 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagatggaattgaatatga 49521  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggatta 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  49520 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagatta 49487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 108587 - 108808
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  108587 ttgaagatagggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatga 108686  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108687 ggcagcgtagatgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 108786  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  108787 attgcatatgtctgctatgatg 108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 114086 - 113868
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  114086 aagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgtttgatcagaaggagttgaacatgaggc 113987  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  113986 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 113887  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  113886 acacatgtcggccatgatg 113868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20132 - 19911
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20132 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatga 20033  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20032 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 19933  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19932 attgcatatgtccgctatgatg 19911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35556 - 35335
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  35556 ttgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattgaatatga 35457  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35456 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagac 35357  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35356 attgcatatgtccgctatgatg 35335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50962 - 50741
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  50962 ttgaagatatggagaaattacttgtatgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgtttgattagaaggaattgcatatga 50863  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50862 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 50763  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  50762 tttgcacatgtccgctatgatg 50741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 277606 - 277827
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  277606 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaagaattgaatatga 277705  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  277706 ggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 277805  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  277806 attgcatatgtccgctatgatg 277827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 261838 - 261617
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || || || || |||||| |||| ||||    
T  261838 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtacttatttgaccaaaaggaattgaacatga 261739  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || || | |||||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  261738 ggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagac 261639  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  261638 actgcatatgtctgctatgatg 261617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 79270 - 79491
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  79270 ttgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 79369  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79370 ggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagac 79469  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  79470 attgcatatgtccgccatgatg 79491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 55293 - 55230
Alignment:
Q  20 atatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55293 atatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaagt 55230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4350
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  4129 ttgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcaatcagaaagaattgaatatga 4228  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4229 ggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 4328  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  4329 attgaatatgtccgctttgatg 4350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1948 - 1727
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  1948 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 1849  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1848 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagac 1749  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  1748 attgcatatgtccgctttgatg 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15688 - 15467
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  15688 ttgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatga 15589  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15588 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagac 15489  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15488 attgcatatgtccgctttgatg 15467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 66935 - 66714
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  66935 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatta 66836  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  66835 gacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaagac 66736  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  66735 attgcatatgtccgctttgatg 66714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 38596 - 38817
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38596 ttgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 38695  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38696 ggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagac 38795  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  38796 attgcatatgtccgctttgatg 38817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 28144 - 28365
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  28144 ttgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatga 28243  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28244 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagac 28343  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28344 attgcatatgtccgctatgatg 28365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 60274 - 60073
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| |||||  ||||| |||| || ||||| || || |||| ||| || ||| | |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||  |    
T  60274 tggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagtggtcataaaagtataaagtatttatttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaa 60175  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | |||||||||||| | |||||||| || || || ||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||    
T  60174 ggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatat 60075  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  60074 gt 60073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Original strand, 3354 - 3453
Alignment:
Q  136 gttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  3354 gttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatg 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 131478 - 131415
Alignment:
Q  172 aggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  131478 aggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatg 131415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Original strand, 54753 - 54830
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  54753 tttgaggtgttcattgaccataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgaagatgg 54830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 57547 - 57332
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  57547 ttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagttcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaaatatga 57448  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  57447 gacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagac 57348  T
Q  214 attgcatatgtccgct 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  57347 attgcatatgtccgct 57332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 18843 - 19064
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  18843 ttgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttcaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaagaattgaatatga 18942  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18943 ggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaatac 19042  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  19043 attgcatatgtccactttgatg 19064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 196263 - 196475
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  196263 ttgaagatatggagacattacttgtatggt---------gaggtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatga 196353  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  196354 ggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  196454 attgcatatgtccgctttgatg 196475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7544 - 7323
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  7544 ttgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatga 7445  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7444 ggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagac 7345  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  7344 attgcatatgtcctctatgatg 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 29347 - 29568
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  29347 ttgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatga 29446  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29447 ggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 29546  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  29547 gttgcatatgtccgctatgatg 29568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 12768 - 12993
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12768 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 12867  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||| || |  |||| || || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12868 ggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T
Q  214 attgcatat----gtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||    |||||||||||||    
T  12968 attgcatatatatgtccgctatgatg 12993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3725 - 3503
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3725 gttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatg 3626  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3625 aggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaaga 3526  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  3525 cgttgcatatgtccgctatgatg 3503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 23849 - 24058
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23849 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatga 23948  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || |||||  |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23949 ggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T
Q  214 attgcatatg 223  Q
    ||||||||||    
T  24049 attgcatatg 24058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 32349 - 32570
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32349 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 32448  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  32449 ggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagac 32548  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||| || |||||    
T  32549 gttgcatatgtccactttgatg 32570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10126 - 9905
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  10126 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 10027  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10026 gacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagac 9927  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9926 attgcatatgtccgctttgatg 9905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 3181 - 3402
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  3181 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatga 3280  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  3281 gacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagac 3380  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  3381 attgcatatgtccgctttgatg 3402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 19117 - 19338
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19117 ttgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgttcgatcagaaggaattgaatatga 19216  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19217 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 19316  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  19317 cttgcatatgtctgctatgatg 19338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21206
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || |||| |||||| || |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  21417 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 21318  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21317 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 21218  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  21217 cttacatatgtc 21206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46047 - 45848
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  46047 ttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaacatttatttgatcagaaggaattgaacatga 45948  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  45947 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 45848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17185 - 16963
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17185 gttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 17086  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||  ||  | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17085 agacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaaga 16986  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  16985 cattgcatatgtcggccatgatg 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39886 - 39688
Alignment:
Q  37 gtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattg 136  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39886 gtatggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattg 39787  T
Q  137 ttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39786 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatg 39688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7579 - 7358
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7579 ttgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaagaattgaatatga 7480  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7479 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7380  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  7379 cttgcatatgtctgctatgatg 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3606
Alignment:
Q  170 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3541 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatg 3606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 13987 - 14208
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13987 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatga 14086  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14087 ggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 14186  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      |||||||||| |||||||||    
T  14187 catgcatatgtctgctatgatg 14208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30475 - 30254
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30475 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 30376  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30375 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagac 30276  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  30275 attgcatatgtctgctatgatg 30254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29366
Alignment:
Q  25 gagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcaga 124  Q
    ||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||| | |||    
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  125 tggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 29377  T
Q  225 ccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||    
T  29376 ctgctatgatg 29366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50331 - 50168
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||| | |    
T  50331 tggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaa 50232  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgt 186  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  50231 gatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 31528 - 31750
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31528 gttgaaaatatggaaacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttagatcagaaggaattgaatatg 31627  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31628 agccagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaga 31727  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  31728 cgttgcatatgtccgctatgatg 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 12303 - 12514
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||||||  |||| ||||    
T  12303 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgattagaaggagttgaacatga 12402  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12403 ggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 12502  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  12503 gctgcatatgtc 12514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 34526 - 34633
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  34526 gttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatg 34625  T
Q  113 aggcagcg 120  Q
    ||||||||    
T  34626 aggcagcg 34633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 102764 - 102542
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  102764 gttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 102665  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  102664 agacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaaga 102565  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||| |||| ||||||    
T  102564 ctttgcatatgcccgccatgatg 102542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 75
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  296 ttgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 197  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  196 ggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 97  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  96 cttgcatatgtctgctatgatg 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2578
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2799 ttgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 2700  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||  || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2699 ggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 2600  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  2599 cttgcatatgtctgctatgatg 2578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13588 - 13367
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  13588 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatga 13489  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 13389  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||| ||| || ||||||    
T  13388 tttgcataagtctgccatgatg 13367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7329
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  7547 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggc 7448  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||  |||||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  7447 agcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagacttt 7348  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7347 gcatatgtccgctatgatg 7329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 364 - 549
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| |    
T  364 tttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatg 463  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  464 attttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatg 549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23706 - 23603
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| || || |||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  23706 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23607  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  23606 ggca 23603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23541 - 23485
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23541 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 23485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10278
Alignment:
Q  28 acattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  128 ctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccg 227  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctg 10286  T
Q  228 ctatgatg 235  Q
    ||||||||    
T  10285 ctatgatg 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25720 - 25941
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||     
T  25720 gttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgtttgattagagggaattgaatatt 25819  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| || ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25820 aggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaaga 25918  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  25919 cattgcatatgtcggccatgatg 25941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 977 - 899
Alignment:
Q  49 gtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  977 gtttgaagagttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgcttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 847 - 791
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  847 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 7429 - 7650
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  7429 ttgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 7528  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||| | || || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7529 ggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7628  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  7629 attgcatatgtcggccatgatg 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7328
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7107 ttgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaaggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 7206  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    || |||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||  ||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7207 ggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagac 7306  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||| |||| |||||||||    
T  7307 cttgcatttgtctgctatgatg 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7902 - 7681
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  7902 ttgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttgagctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgttcgatcaaaaggaattgaatatga 7803  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||  ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7802 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 7703  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  7702 cttgcatatgtctgctatgatg 7681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2967 - 2745
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2967 gttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatg 2868  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||| |||| || ||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||  ||  | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2867 aggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaaga 2768  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | || |||||||| |||||||||    
T  2767 ctttacatatgtctgctatgatg 2745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 202243 - 202465
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||  | || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  202243 gttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagattttaggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatg 202342  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  202343 aggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 202442  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  202443 cattgcatatgtcagctatgatg 202465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 324234 - 324023
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||  | || ||||    
T  324234 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtctcaaatatttatttgatcagaaggagttaaacatga 324135  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  324134 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 324035  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     ||||| |||||    
T  324034 gttgcacatgtc 324023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 118753 - 118535
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||    ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  118753 aagatttggagacattatttgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 118654  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  118653 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 118554  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||| |||||||    
T  118553 acatatgtccgttatgatg 118535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 7862 - 8084
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  7862 gttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcgaggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgtttgatcaaaaggaattgaatatg 7961  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||| || || || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7962 aggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaa 8061  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  8062 cattgcatatgtcggccatgatg 8084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16404 - 16186
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  16404 aagatttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagac 16305  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||| |  |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16304 agcgaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacttt 16205  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  16204 gcatatgtctgctatgatg 16186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 112267 - 112475
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  112267 aagataaggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggc 112366  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| |  ||||| |||||| |||| || || || ||||  ||||  ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  112367 agcgtaagtggcttgaattgctgaacgactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacatt 112466  T
Q  217 gcatatgtc 225  Q
    |||||||||    
T  112467 gcatatgtc 112475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 2297 - 2482
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2297 tttgaagtgtttagtgatcccaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatg 2396  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2397 attttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 22971 - 23182
Alignment:
Q  24 ggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcag 123  Q
    |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22971 ggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 23070  T
Q  124 atggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 223  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||    
T  23071 gtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatg 23170  T
Q  224 tccgctatgatg 235  Q
    ||  ||||||||    
T  23171 tctcctatgatg 23182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5398 - 5180
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  5398 aagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 5299  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5298 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 5199  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  5198 gcatatgtccactatgatg 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12528 - 12310
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  12528 aagatatggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 12429  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12428 agcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 12329  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  12328 gcatatgtccactatgatg 12310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 16762 - 16974
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| || || |    
T  16762 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaacgaa 16861  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||    
T  16862 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatat 16961  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||    
T  16962 gtccgctatgatg 16974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 6670 - 6888
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  6670 aagatttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 6769  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |  | || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |    
T  6770 aaggaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactct 6869  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6870 acatatgtccgctatgatg 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13995 - 13777
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |    
T  13995 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagac 13896  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  13895 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaacttt 13796  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  13795 gcatatgtccgccatgatg 13777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 38727 - 38945
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  38727 aagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgagac 38826  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  38827 atcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagacctt 38926  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  38927 ggatatgtctgctatgatg 38945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5306 - 5085
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  5306 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaggaattgaatatga 5207  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5206 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagac 5107  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| || || |||||||||    
T  5106 gttgcacatttctgctatgatg 5085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15642 - 15421
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||| |||||||||    
T  15642 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatga 15543  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  15542 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagag 15443  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  15442 gttgcatatgtctgctatgatg 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 8637 - 8848
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  8637 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatga 8736  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8737 ggcacagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 8836  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     |||||||||||    
T  8837 tttgcatatgtc 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5960 - 5739
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | || ||| |||||||||    
T  5960 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgataaaaaagaattgaatatga 5861  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5860 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagac 5761  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  5760 gttgcacatgtctgctatgatg 5739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6751 - 6530
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  6751 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgataatacgagtttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatga 6652  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || ||||| |||||| | || |||||  ||||||  || |  ||  |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6651 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagac 6552  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  6551 tttgcatatgtccgctatgatg 6530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 8435 - 8631
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8435 ttgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaacatga 8534  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 210  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||| ||| || || ||||  ||||  ||  |  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8535 gacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2374 - 2217
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaa 177  Q
    |||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||  |||||||  | ||||||||    
T  2374 tgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaa 2275  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  2274 agctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatg 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 23854 - 24069
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  23854 gttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttattagatcaaaaggaattgaatatg 23953  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  23954 aggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaaga 24046  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  24047 cgttgcatatgtctgctatgatg 24069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3230
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |    
T  3441 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagac 3342  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3341 agcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 3242  T
Q  217 gcatatgtccgc 228  Q
    ||||||||||||    
T  3241 gcatatgtccgc 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 46175 - 46396
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  46175 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 46274  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  46275 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaac 46374  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  46375 gttgcatatgtctgctttgatg 46396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 41109 - 41330
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  41109 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 41208  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  41209 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaac 41308  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| ||| |||||    
T  41309 gttgcacatgtctgctttgatg 41330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2412 - 2202
Alignment:
Q  25 gagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcaga 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  2412 gagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtagg 2313  T
Q  125 tggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||  ||  | | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2312 tggcttgaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgt 2213  T
Q  225 ccgctatgatg 235  Q
    | || ||||||    
T  2212 cggccatgatg 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 17994 - 18212
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||  | ||||| |  ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  17994 aagatatggagacattatttgtaaggttctagattaaaagtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagac 18093  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18094 aacgaaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgtt 18193  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18194 gcatatgtccgctatgatg 18212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11324 - 11102
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || ||  ||||||||    
T  11324 gttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatg 11225  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    |||||| |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11224 aggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 11125  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||| |||||||||    
T  11124 cgttgcacatgtctgctatgatg 11102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16170 - 16103
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16170 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 177037 - 177259
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  177037 gttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaagaaattgaatatg 177136  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  177137 aggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaaga 177236  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | || |||||||| |||||||||    
T  177237 cgttacatatgtctgctatgatg 177259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 1630 - 1851
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  1630 ttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagcctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 1729  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1730 ggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagac 1829  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| |||||  ||||||||    
T  1830 gttgcacatgtctactatgatg 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 47810 - 48031
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||    
T  47810 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 47909  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47910 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagac 48009  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  48010 gttgcacatgtctgctatgatg 48031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 56623 - 56844
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||||| | |||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  56623 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaatgatcaaaagagtctaaagtatttatttgatcagaaggaattgaacatga 56722  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  56723 ggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagac 56822  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
      |||| ||||| |||||||||    
T  56823 gctgcacatgtctgctatgatg 56844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4243 - 4058
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  4243 tttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatg 4144  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4143 attttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctgctatgatg 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 42919 - 43104
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||| |    
T  42919 tttgaagtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagacagcgaaggtggctagaattgctaaaagattatg 43018  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  43019 actttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatg 43104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 11979 - 12085
Alignment:
Q  21 tatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcg 120  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  11979 tatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcg 12078  T
Q  121 cagatgg 127  Q
     ||||||    
T  12079 gagatgg 12085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 287
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    |||||| |||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||||||| | |    
T  499 tggagatattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaattttgaaatatttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaa 400  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  399 gatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatat 300  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  299 gtctgctatgatg 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 522 - 310
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  522 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 423  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  422 gatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatat 323  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  322 gtctgctatgatg 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1390 - 1178
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | |    
T  1390 tggagacattatttgtacggttccaggtttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 1291  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
     |||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  1290 aatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacat 1191  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    |||  ||||||||    
T  1190 gtctactatgatg 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4421
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||| |    
T  4639 aagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagac 4540  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |  | | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
T  4539 agcaaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagacttt 4440  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| |||||||||    
T  4439 acatatgtctgctatgatg 4421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 25312 - 25530
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| ||| |||||||||| |    
T  25312 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagac 25411  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  25412 aacgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgtt 25511  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25512 gcatatgtccgctatgatg 25530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 150099 - 149879
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||  ||||  | ||||| || ||| | |||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  150099 ttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagtattttgggatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 150000  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  149999 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 149901  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||||| ||| |||||    
T  149900 attgaatatgtctgctttgatg 149879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 194480 - 194701
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||| | || ||  |||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  194480 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagtattcggtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 194579  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  194580 ggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagac 194679  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  194680 gttgcatatgtctgctttgatg 194701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 181454 - 181351
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  181454 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 181355  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  181354 ggca 181351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18879 - 18658
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  18879 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatttattcgatctgaaagaattgaatatga 18780  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  18779 ggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagac 18680  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||| || || || |||||||||    
T  18679 atttcacatctctgctatgatg 18658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25774
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  25553 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatga 25652  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | || |   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || ||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  25653 ggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagac 25752  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  25753 attgcatatgtctgctttgatg 25774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48634 - 48413
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  48634 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgagatatttgtttgatcaaaaagaattgaatatga 48535  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    |  || | |||||||| || ||| | |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48534 gctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 48435  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  48434 gttgcatatgtctgctatgatg 48413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 55676 - 55897
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  55676 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcataagagtatgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 55775  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55776 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 55875  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  55876 attgcatatgtctgctttgatg 55897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41788 - 41567
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  41788 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41689  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41688 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 41589  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  41588 tttgcatatgtctgctttgatg 41567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 32456 - 32674
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  32456 aagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatgaggc 32555  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32556 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 32655  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  32656 acacatgtcggccatgatg 32674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28154 - 27934
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  28154 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 28055  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | ||||||    
T  28054 ggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagca-gaagac 27956  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||| ||||||| |||||||||    
T  27955 gttggatatgtctgctatgatg 27934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 59990 - 60201
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  59990 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 60089  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||    
T  60090 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagac 60189  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  60190 cttacatatgtc 60201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 50956 - 51167
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  50956 ttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatga 51055  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||    
T  51056 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagac 51155  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  51156 cttacatatgtc 51167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 66378 - 66589
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  66378 ttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaattgaatatga 66477  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||    
T  66478 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagac 66577  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  66578 cttacatatgtc 66589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 109160 - 108939
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||| |||||||||    
T  109160 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgattagaaagaattgaatatga 109061  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  109060 ggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagac 108961  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  108960 gttgcacatgtctgctatgatg 108939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 62918 - 63028
Alignment:
Q  125 tggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  62918 tggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgt 63017  T
Q  225 ccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||    
T  63018 ccgctatgatg 63028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 55766 - 55873
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  55766 gttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttattcgatcagaaagaattgaatatg 55865  T
Q  113 aggcagcg 120  Q
    ||||||||    
T  55866 aggcagcg 55873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Original strand, 218257 - 218414
Alignment:
Q  78 tgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaa 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | ||||||||    
T  218257 tgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaa 218356  T
Q  178 agctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  218357 agctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatg 218414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44304 - 44092
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  44304 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 44205  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44204 gatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcatat 44105  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  44104 gtctgctttgatg 44092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 6930 - 7132
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  6930 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagcttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 7029  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7030 gatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 7129  T
Q  223 gtc 225  Q
    |||    
T  7130 gtc 7132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 11578 - 11783
Alignment:
Q  30 attacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggct 129  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||    
T  11578 attatttgtatggttcgagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggct 11677  T
Q  130 agaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgct 229  Q
     || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11678 tgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgct 11777  T
Q  230 atgatg 235  Q
    ||||||    
T  11778 atgatg 11783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40087 - 39866
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||||| || | ||| |||||| | || ||||| || ||||  ||||  ||  | || | |||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagac 39888  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  39887 cttgcatatgtctgctatgatg 39866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41228 - 41007
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  41228 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatga 41129  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | |||||||| || ||| | |||||||| || ||||||||  ||||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41128 gacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 41029  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  41028 gttgcacatgtctgctatgatg 41007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 47189 - 47289
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  47189 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtt-gaagtatttgtttgatcagaaatagttgaatatga 47287  T
Q  114 gg 115  Q
    ||    
T  47288 gg 47289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 5901 - 6088
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |    
T  5901 tttgaggtgtttagcgataacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatg 6000  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgt--tgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  6001 attttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 6088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35000 - 34792
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  35000 ttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 34901  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34900 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 34801  T
Q  214 attgcatat 222  Q
    | |||||||    
T  34800 actgcatat 34792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28656 - 28539
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  28656 tgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgag 28557  T
Q  205 taggaagacattgcatat 222  Q
     ||||||||| |||||||    
T  28556 caggaagacactgcatat 28539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 95 - 155
Alignment:
Q  175 taaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatg 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 15260 - 15479
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaaga-gtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgagg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| |  ||||| || | || |||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||     
T  15260 aagatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgaga 15359  T
Q  116 cagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 215  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15360 cagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgt 15459  T
Q  216 tgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15460 tgcatatgtccactatgatg 15479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 846 - 1064
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||  |||||| | ||||||||||    
T  846 aagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaagtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggc 945  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||  ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  946 agcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacatt 1045  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  1046 gcatatgtcggccatgatg 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 13075 - 13285
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  13075 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgatcagaaggagttgaacatga 13174  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13175 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 13274  T
Q  214 attgcatatgt 224  Q
      |||||||||    
T  13275 gctgcatatgt 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26283
Alignment:
Q  137 ttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 26283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 39535 - 39756
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  39535 gttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgagatatttatttgatcaaaaggaattgaatatg 39634  T
Q  113 aggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 212  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| || || |||  ||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  39635 aggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-tttatttttaattatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaaga 39733  T
Q  213 cattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  39734 cgttgcatatgtctgctatgatg 39756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3706 - 3489
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||   | |||  |||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  3706 ttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaatatctgagatatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 3607  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||| | |||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3606 ggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 3507  T
Q  214 attgcatatgtccgctat 231  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  3506 gttgcacatgtctgctat 3489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 2131 - 2352
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  2131 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 2230  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | |||||| ||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2231 gacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaac 2330  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||||||  ||||||||    
T  2331 gttgcatatgtctactatgatg 2352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8569 - 8379
Alignment:
Q  35 ttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaat 134  Q
    |||||| |||| || ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| | ||      
T  8569 ttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagc 8470  T
Q  135 tgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8469 tgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgtc 8379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32905 - 32720
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  32905 tttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatg 32806  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32805 attttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatg 32720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 80608 - 80829
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| |||| || ||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  80608 ttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtatgaaatatttatttgaccagaaggaattgaacatga 80707  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  80708 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagac 80807  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||| |||||||||    
T  80808 actacatatgtctgctatgatg 80829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3950
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||  ||  |||| || || ||||||||||| ||| | || ||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  3729 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgaccagaaagaattgaacatga 3828  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3829 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagac 3928  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  3929 gttgcatatgtctgctttgatg 3950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 68864 - 68679
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || ||||| |    
T  68864 tttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaattatttgtttgatcataaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatg 68765  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  68764 attttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatg 68679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 12684 - 12895
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  12684 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 12783  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12784 ggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagac 12883  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||    
T  12884 attgcatatgtc 12895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 3048 - 3268
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||||    
T  3048 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatga 3147  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  3148 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagac 3247  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
     ||||| ||||| ||| ||||    
T  3248 gttgcacatgtctgctttgat 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 30061 - 30281
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||||    
T  30061 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatatttgtctgatcaaaaggaattgaacatga 30160  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  30161 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagac 30260  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgat 234  Q
     ||||| ||||| ||| ||||    
T  30261 gttgcacatgtctgctttgat 30281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 9593 - 9805
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||  | || ||||| || ||| |||||||||||||||| |    
T  9593 tggagacattatttctacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtacctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgta 9692  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  9693 ggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcattt 9792  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  9793 gtcagctatgatg 9805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 476
Alignment:
Q  13 gttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  583 gttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatg 484  T
Q  113 aggcagcg 120  Q
    ||||||||    
T  483 aggcagcg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6225
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||| | || || ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  6014 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 6113  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  6114 ggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaat 6213  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     |||||||||||    
T  6214 gttgcatatgtc 6225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  30 attacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42447 - 42236
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| |||||||  | || ||||    
T  42447 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgtttttagtgatcataagagtcttaaatatttatttgattagaaggagtttaacatga 42348  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42347 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaac 42248  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
      ||||||||||    
T  42247 gctgcatatgtc 42236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 15489 - 15700
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  15489 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatga 15588  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | || ||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15589 ggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagac 15688  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     |||||||||||    
T  15689 tttgcatatgtc 15700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10856 - 10746
Alignment:
Q  125 tggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||    
T  10856 tggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgt 10757  T
Q  225 ccgctatgatg 235  Q
    | |||||||||    
T  10756 cagctatgatg 10746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20650 - 20439
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||| |||||| | |||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  20650 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcataagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 20551  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20550 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 20451  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||    
T  20450 attgcatatgtc 20439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 57976 - 58146
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    |||||||||||  ||||| |||  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  57976 tggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaa 58075  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgca 193  Q
    | ||||| |||||| | |||||||| || || || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  58076 ggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 115684 - 115902
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |    
T  115684 aagatttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagac 115783  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
      || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  115784 cacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 115883  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||||    
T  115884 acatatgtccgctatgatg 115902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 89312 - 89442
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  89312 tgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgag 89411  T
Q  205 taggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  89412 caggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 89442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 89990 - 90120
Alignment:
Q  105 tgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 204  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  89990 tgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgag 90089  T
Q  205 taggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  90090 caggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 90120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1413 - 1192
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||    
T  1413 ttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatttgtttgaccagaaagaattgaacatga 1314  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1313 ggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagac 1214  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||| ||||| || ||||||    
T  1213 attgcacatgtcggccatgatg 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28018 - 27833
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || || |||||| |||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||||| || |    
T  28018 tttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatg 27919  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  27918 attttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatg 27833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 1619 - 1821
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  1619 tggagacattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 1718  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| || | ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1719 gatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 1818  T
Q  223 gtc 225  Q
    |||    
T  1819 gtc 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 13860 - 14078
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |    
T  13860 aagatttggagacattatttgtatggctctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagac 13959  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  13960 aacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactct 14059  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14060 acatatgtccgctatgatg 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6070
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| || || ||| | |||||||| |    
T  6244 tttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaactatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatg 6145  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    | ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  6144 attttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgt 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 83 - 1
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgcggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3118 - 2897
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||  || |||| ||||    
T  3118 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacatga 3019  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |  |||||||| ||| | |||||||||||  |||| |||||||     
T  3018 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagat 2919  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  2918 gttgcatatgtctgctatgatg 2897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6743 - 6522
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||| |||| ||||    
T  6743 ttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaacatga 6644  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||  | || || ||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6643 ggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagac 6544  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | | |||||||  |||||||||    
T  6543 acttcatatgtatgctatgatg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2978
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  3111 ttgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttgaggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgttcgataagaaggagttgaatataa 3012  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggatta 147  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||    
T  3011 ggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagatta 2978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 749 - 970
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||| | || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||    
T  749 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcaaaaagaattgaatatga 848  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||| |  | | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  849 ggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagac 948  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| | ||| |||||||||    
T  949 gttgcacaagtctgctatgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 464 - 684
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||  |||| || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  464 ttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgaccataaaagtttaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 563  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  564 ggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattacca-tcgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagac 662  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  663 gttgcatatgtctgctatgatg 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13730 - 13509
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  13730 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 13631  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13630 ggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagac 13531  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||| ||||    
T  13530 gttgcacatgtctgctacgatg 13509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 6584 - 6793
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  6584 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6683  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | ||||| |  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6684 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 6783  T
Q  214 attgcatatg 223  Q
     |||||||||    
T  6784 tttgcatatg 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 50651 - 50872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| | || ||  |||||||||    
T  50651 ttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtattcagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgataaaaaagagttgaatatga 50750  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  50751 ggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaac 50850  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  50851 gttgcacatgtctgctatgatg 50872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 483 - 284
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    |||||| |||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  483 tggagagattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagga 384  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  383 ggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatat 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10233 - 10448
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||| |||| ||||    
T  10233 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatga 10332  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10333 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaac 10432  T
Q  214 attgcatatgtccgct 229  Q
      ||||||||||||||    
T  10433 gctgcatatgtccgct 10448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 20447 - 20662
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||| |||| ||||    
T  20447 ttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatattaatttgatcagaaggaattgaacatga 20546  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20547 ggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaac 20646  T
Q  214 attgcatatgtccgct 229  Q
      ||||||||||||||    
T  20647 gctgcatatgtccgct 20662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35628 - 35421
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||  |||| |||| | || | ||||||     
T  35628 cattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctaaaatattttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggt 35529  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  35528 tagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctgc 35429  T
Q  229 tatgatgt 236  Q
    ||||||||    
T  35428 tatgatgt 35421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 2651 - 2872
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  2651 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2750  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  2751 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 2850  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  2851 tttgcatatgtctgctttgatg 2872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24924 - 24703
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  24924 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 24825  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24824 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 24725  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  24724 tttgcatatgtctgctttgatg 24703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14217
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  14438 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14339  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14338 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 14239  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  14238 tttgcatatgtctgctttgatg 14217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 100338 - 100559
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| |||| || ||||| || || ||||||||  | || ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  100338 ttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcattaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggagttgaatatga 100437  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  | |||||||| ||| | ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  100438 ggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagac 100537  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  100538 attgcatatgtctgctttgatg 100559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181508
Alignment:
Q  188 gttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatg 181508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28463 - 28252
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||    
T  28463 ttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaattatttatttgaccagaaggaacttaacatga 28364  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |  ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||    
T  28363 ggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaac 28264  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
    ||||||||||||    
T  28263 attgcatatgtc 28252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Original strand, 9859 - 10013
Alignment:
Q  81 agtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagc 180  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||| |||    
T  9859 agtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagc 9958  T
Q  181 taatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||||||||  || |||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  9959 caatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2317
Alignment:
Q  56 gtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttg 155  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || |||     
T  2148 gtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttta 2247  T
Q  156 gtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    ||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  2248 gtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtc 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20379 - 20158
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |  | || ||||    
T  20379 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatga 20280  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  20279 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagac 20180  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || || ||||| |||||||||    
T  20179 gttacacatgtcggctatgatg 20158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24320
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |  | || ||||    
T  24541 ttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcagaagcagttaaacatga 24442  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24441 ggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagac 24342  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || || ||||| |||||||||    
T  24341 gttacacatgtcggctatgatg 24320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 250107 - 249922
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||  || |||||||||| |    
T  250107 tttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatg 250008  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  250007 attttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatg 249922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 24
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  176 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaaggaattgaatatga 77  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattac 166  Q
    ||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  76 ggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattac 24  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24880 - 24776
Alignment:
Q  131 gaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgcta 230  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||     
T  24880 gaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctt 24781  T
Q  231 tgatg 235  Q
    |||||    
T  24780 tgatg 24776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23735 - 23523
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  23735 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 23636  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||| | ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23635 ggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatat 23536  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  23535 gtctgctttgatg 23523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20888 - 20703
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacg 149  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||| | ||  ||||||| ||||| |    
T  20888 tttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatg 20789  T
Q  150 actttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  20788 attttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatg 20703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 854 - 643
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||  ||||||||    
T  854 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagcgttcagtgatcacaagagtctaaaatatttatttgaccagaaggaatggaatatga 755  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    | ||| | ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  754 gacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagac 655  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  654 cttacatatgtc 643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 10665 - 10864
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  10665 ttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 10764  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10765 ggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 5112 - 5323
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||| | || |||||||||    
T  5112 ttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtatttatttgaccagaggtaattgaatatga 5211  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| | |  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5212 ggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagac 5311  T
Q  214 attgcatatgtc 225  Q
     || ||||||||    
T  5312 cttacatatgtc 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 224
Target Start/End: Original strand, 24699 - 24862
Alignment:
Q  61 tagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttg 160  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||| ||||||| |||| |||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  161 aattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgt 224  Q
    |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgt 24862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 10848 - 11054
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    |||||||||||  | || || ||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| ||  |||| ||||||||| | ||||||     
T  10848 cattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggt 10947  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  10948 tagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgc 11047  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    || ||||    
T  11048 tacgatg 11054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 14618 - 14824
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    |||||||||||  | || || ||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||| || |||  ||| ||  |||| ||||||||| | ||||||     
T  14618 cattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatatttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggt 14717  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    ||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  14718 tagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgc 14817  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    || ||||    
T  14818 taagatg 14824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21513 - 21361
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  21513 ttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcagaaagaattgaacatga 21414  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattac 166  Q
    ||||| | |||||| ||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21413 ggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattac 21361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 16340 - 16561
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  16340 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16439  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16440 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 16539  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  16540 tttgcatatgtctgctttgatg 16561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 25658 - 25761
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  25658 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25757  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  25758 ggca 25761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 27042 - 27263
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  27042 ttgaagatttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27141  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | ||||| |  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27142 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagac 27241  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  27242 tttgcatatgtctgctttgatg 27263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 96622 - 96473
Alignment:
Q  86 ttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatg 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||    
T  96622 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 96523  T
Q  186 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  96522 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatg 96473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25356 - 25135
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  25356 ttgaagatttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25257  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25256 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 25157  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  25156 tttgcatatgtctgctttgatg 25135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 133265 - 133486
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| || ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  133265 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 133364  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | |  || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  133365 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttaacatctcgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 133464  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  133465 tttgcatatgtctgctttgatg 133486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 14157 - 14296
Alignment:
Q  95 cagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcag 194  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| |||||||    
T  14157 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 14255  T
Q  195 atgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14256 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatg 14296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 22336 - 22475
Alignment:
Q  95 cagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcag 194  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| |||||||    
T  22336 cagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcca-gtaaagacaatgtggttgcag 22434  T
Q  195 atgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  22435 atgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatg 22475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 72718 - 72498
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgag 114  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  72718 tgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgag 72619  T
Q  115 gcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaca 214  Q
    |||| | |||||| | ||||   | ||||| |  || |||   |||| |||  |||| || || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||     
T  72618 gcagagaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgatttatcaccccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagact 72519  T
Q  215 ttgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  72518 ttgcatatgtctgctttgatg 72498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6741 - 6638
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||     
T  6741 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatttgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgc 6642  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  6641 ggca 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15961 - 15858
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| |||  | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  15961 ttgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatga 15862  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  15861 ggca 15858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25492 - 25389
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| |||  | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  25492 ttgaagatttggaggcattacatgtatggttttaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatga 25393  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  25392 ggca 25389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 32189 - 32410
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  32189 ttgaagatttggaagcattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatga 32288  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | || ||| | ||||   | ||| ||| ||| |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  32289 ggcaaagaaggtggttggaatatcttaagcatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 32388  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  32389 tttgcatatgtctgctttgatg 32410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 2728 - 2831
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  2728 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2827  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  2828 ggca 2831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6704 - 6483
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  6704 ttgaaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6605  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||| | |||||| | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  6604 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtc 6505  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  6504 tttgcatatgtctgctttgatg 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 32104 - 32316
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||||||| |||| |||||| || | |    
T  32104 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaa 32203  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    ||||| ||||  || |||||||||| || ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  32204 gatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatat 32303  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| ||| |||||    
T  32304 gtctgctttgatg 32316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4439
Alignment:
Q  97 gaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagat 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggat 4410  T
Q  197 gccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4411 gcgttgagcaggaagaccttacatatgtc 4439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8780 - 8574
Alignment:
Q  29 cattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggc 128  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||  | | ||||     
T  8780 cattatttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaatatggt 8681  T
Q  129 tagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgc 228  Q
    | ||||   | |||||||  || |||   |||| |||  ||||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8680 tggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgc 8581  T
Q  229 tatgatg 235  Q
    | |||||    
T  8580 tttgatg 8574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 6464 - 6682
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||| ||||| |    
T  6464 aagatttggaggcactacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttatttgaacagaaggagttgaacatgagac 6563  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacatt 216  Q
    || | |||||| | ||  | ||||||||||| || ||||| ||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6564 agaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagacgtt 6663  T
Q  217 gcatatgtccgctatgatg 235  Q
     || ||||| || ||||||    
T  6664 acacatgtcggccatgatg 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 235
Target Start/End: Original strand, 248 - 421
Alignment:
Q  62 agtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttga 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||  | |||||| | ||||   | ||||| |  || |||   ||||    
T  248 agtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatggttggaatatctcaaggactttgattttcagttga 347  T
Q  162 attacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     |||  | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  348 gttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtccgctttgatg 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5405 - 5340
Alignment:
Q  170 ccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5405 ccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatg 5340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 343
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||    
T  524 aagatttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggc 425  T
Q  117 agcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 198  Q
    |||| || ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||    
T  424 agcgaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 64 - 220
Alignment:
Q  69 acaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacga 168  Q
    |||| |||||||  ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  64 acaaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaatacca 163  T
Q  169 cccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  164 tccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtc 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19577 - 19474
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  19577 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatga 19478  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  19477 ggca 19474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 92925 - 92834
Alignment:
Q  36 tgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||    
T  92925 tgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 92834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 85304 - 85516
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 122  Q
    ||||| |||||  ||||| |||| || |||||  |||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||| || |    
T  85304 tggaggcattatctgtatggttctagatttgaattgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggcaacgaa 85403  T
Q  123 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 222  Q
    | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||||||| | || |||||  |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  85404 ggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatat 85503  T
Q  223 gtccgctatgatg 235  Q
    ||| |||||||||    
T  85504 gtctgctatgatg 85516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 7669 - 7779
Alignment:
Q  17 aagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggc 116  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||| ||    
T  7669 aagatatgaagacattaactgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagc 7768  T
Q  117 agcgcagatgg 127  Q
    || | ||||||    
T  7769 agagaagatgg 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10824 - 10603
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||| ||| ||||| ||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  10824 ttgaggatttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 10725  T
Q  114 ggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 213  Q
    ||||  | |||||| | ||||   | || ||||  || |||   |||| |||  ||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10724 ggcatagaagatggttggaatatcttaatgattttgattttcagttgagttatcaccctaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagac 10625  T
Q  214 attgcatatgtccgctatgatg 235  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  10624 tttgcatatgtctgctttgatg 10603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 956 - 879
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  956 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 771
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  827 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatg 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 6160 - 6257
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggatta 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  6160 tttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggatta 6257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 10591 - 10688
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggatta 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  10591 tttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggatta 10688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 6265 - 6327
Alignment:
Q  173 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6265 ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 10696 - 10758
Alignment:
Q  173 ggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10696 ggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatg 10758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 11486 - 11599
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||    
T  11486 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatga 11585  T
Q  114 ggcagcgcagatgg 127  Q
    ||||| | ||||||    
T  11586 ggcagaggagatgg 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 13590 - 13666
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtt 90  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13590 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtt 13666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 34743 - 34675
Alignment:
Q  15 tgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagt 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34743 tgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagt 34675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1596
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1552 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 8469 - 8513
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8469 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4074 - 3971
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||||    
T  4074 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatga 3975  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  3974 ggca 3971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 12052
Alignment:
Q  158 ttgaattacgacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtc 12052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 235
Target Start/End: Original strand, 1 - 59
Alignment:
Q  177 aagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 59  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1721 - 1627
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    ||||||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||||||    
T  1721 tggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 8055
Alignment:
Q  23 tggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggca 117  Q
    ||||||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||||||    
T  8149 tggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatatttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggca 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 1005
Alignment:
Q  186 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 235  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1054 ttgtagcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatg 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15588 - 15484
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||  ||||||| |    
T  15588 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatta 15489  T
Q  114 ggcag 118  Q
    |||||    
T  15488 ggcag 15484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 80 - 1
Alignment:
Q  50 tttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgcagatggct 129  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  80 tttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8537 - 8491
Alignment:
Q  179 gctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  8537 gctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgtc 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 8897 - 8947
Alignment:
Q  68 cacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcag 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  8897 cacaagagtttgaagtacttgttcgatcaaaaggcgttgaatatgaggcag 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 1578 - 1663
Alignment:
Q  14 ttgaagatatggagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaa 99  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  1578 ttgaagattttgagacattatttgtatggttctaagtttgaaatgttcagtgaccacaagagtttaaagtacttgtttgataagaa 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University