View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_198 (Length: 248)

Name: NF6868A_low_198
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_198
NF6868A_low_198
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (1-235)||(22081108-22081342)
chr8 (7-156)||(44562928-44563077)
chr8 (28-235)||(31490013-31490220)
chr8 (25-235)||(19286210-19286420)
chr8 (33-156)||(19659304-19659427)
chr8 (25-235)||(19687843-19688053)
chr8 (7-156)||(9354449-9354598)
chr8 (25-233)||(16283196-16283404)
chr8 (28-235)||(19674183-19674390)
chr8 (28-235)||(28362218-28362425)
chr8 (25-235)||(16277299-16277509)
chr8 (28-235)||(19208623-19208830)
chr8 (25-235)||(2137519-2137729)
chr8 (25-235)||(27609165-27609375)
chr8 (25-235)||(14557372-14557582)
chr8 (25-235)||(18710331-18710541)
chr8 (73-235)||(19518451-19518613)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (1-235)||(15391609-15391844)
chr4 (5-235)||(14235806-14236036)
chr4 (7-230)||(1900025-1900248)
chr4 (7-230)||(15285208-15285431)
chr4 (7-230)||(15227638-15227861)
chr4 (25-235)||(27163618-27163828)
chr4 (28-235)||(5005630-5005837)
chr4 (28-235)||(30753502-30753709)
chr4 (28-235)||(33674114-33674321)
chr4 (25-235)||(21969461-21969671)
chr4 (28-235)||(39850383-39850590)
chr4 (25-235)||(54833150-54833360)
chr4 (25-235)||(14664778-14664988)
chr4 (25-235)||(24592612-24592822)
chr4 (73-235)||(31126867-31127029)
chr4 (7-156)||(24460885-24461034)
chr4 (73-235)||(14098301-14098463)
chr4 (25-235)||(17013760-17013970)
chr4 (73-235)||(18800971-18801133)
chr4 (28-235)||(6569613-6569820)
chr4 (25-235)||(14763605-14763815)
chr4 (73-235)||(19373021-19373183)
chr4 (25-113)||(24112547-24112635)
chr4 (25-113)||(34189258-34189346)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-235)||(21312-21546)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (8-235)||(27392734-27392961)
chr2 (7-230)||(19456690-19456913)
chr2 (7-230)||(21703433-21703656)
chr2 (25-235)||(32049539-32049749)
chr2 (25-233)||(27434734-27434942)
chr2 (7-156)||(31891597-31891746)
chr2 (28-235)||(21677475-21677682)
chr2 (7-156)||(27118511-27118660)
chr2 (28-235)||(261058-261265)
chr2 (28-235)||(11635482-11635689)
chr2 (28-235)||(11641671-11641878)
chr2 (28-235)||(12586542-12586749)
chr2 (25-235)||(34279190-34279400)
chr2 (7-156)||(3784477-3784626)
chr2 (7-156)||(34156834-34156983)
chr2 (28-235)||(13936837-13937044)
chr2 (73-235)||(12716943-12717105)
chr2 (7-156)||(16163422-16163571)
chr2 (35-156)||(34303600-34303721)
chr2 (28-235)||(27803433-27803640)
chr2 (28-235)||(37925234-37925441)
chr2 (28-235)||(40233240-40233447)
chr2 (73-235)||(16829676-16829838)
chr2 (73-235)||(16891643-16891805)
chr2 (25-235)||(28881955-28882165)
chr2 (25-233)||(23128856-23129064)
chr2 (28-235)||(9350287-9350494)
chr2 (28-235)||(27776948-27777155)
chr2 (28-235)||(27816715-27816922)
chr2 (28-235)||(31876022-31876229)
chr2 (28-235)||(34861421-34861628)
chr2 (28-235)||(37686202-37686409)
chr2 (28-235)||(37701467-37701674)
chr2 (25-235)||(12655283-12655493)
chr2 (25-235)||(34286095-34286305)
chr2 (25-235)||(34291155-34291365)
chr2 (73-235)||(39889803-39889965)
chr2 (25-235)||(20837659-20837869)
chr2 (28-113)||(39052121-39052206)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (7-230)||(16208308-16208531)
chr1 (8-230)||(20460857-20461079)
chr1 (7-156)||(20340615-20340764)
chr1 (26-235)||(41793610-41793819)
chr1 (28-235)||(10962414-10962621)
chr1 (28-235)||(28584725-28584932)
chr1 (73-235)||(51637962-51638124)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (7-230)||(18530108-18530331)
chr3 (7-230)||(16626827-16627049)
chr3 (25-235)||(7996268-7996478)
chr3 (25-235)||(10642776-10642986)
chr3 (28-235)||(28116302-28116509)
chr3 (28-235)||(47023159-47023366)
chr3 (25-235)||(4721337-4721547)
chr3 (25-235)||(7072918-7073128)
chr3 (25-233)||(15893048-15893256)
chr3 (28-235)||(51781717-51781924)
chr3 (25-235)||(4796995-4797205)
chr3 (25-235)||(8295681-8295891)
chr3 (25-235)||(35880472-35880682)
chr3 (7-156)||(17994105-17994254)
chr3 (28-224)||(51796817-51797013)
chr3 (28-235)||(5013418-5013625)
chr3 (28-235)||(11110706-11110913)
chr3 (28-235)||(18224897-18225104)
chr3 (28-235)||(20577207-20577414)
chr3 (28-235)||(29665330-29665537)
chr3 (28-235)||(36997434-36997641)
chr3 (73-235)||(5466691-5466853)
chr3 (25-235)||(15741424-15741634)
chr3 (73-235)||(17985346-17985508)
chr3 (35-156)||(4625732-4625853)
chr3 (79-235)||(18330380-18330536)
chr3 (25-235)||(8301606-8301816)
chr3 (28-235)||(48465621-48465828)
chr3 (34-156)||(5713012-5713134)
chr3 (34-156)||(5723922-5724044)
chr3 (34-156)||(5757433-5757555)
chr3 (34-156)||(5768324-5768446)
chr3 (25-235)||(6192022-6192232)
chr3 (25-235)||(8211447-8211657)
chr3 (73-235)||(22871264-22871426)
chr3 (73-235)||(22886323-22886485)
chr3 (22-235)||(5596705-5596918)
chr3 (7-156)||(5652175-5652324)
chr3 (73-235)||(6542864-6543026)
chr3 (25-235)||(10395842-10396052)
chr3 (73-235)||(18242433-18242595)
chr3 (25-235)||(20065752-20065962)
chr3 (73-235)||(29149145-29149307)
chr3 (148-235)||(18050968-18051055)
chr3 (25-235)||(18277394-18277604)
chr3 (25-235)||(18292695-18292905)
chr3 (25-235)||(18307996-18308206)
chr3 (25-113)||(4893041-4893129)
chr3 (25-113)||(32438985-32439073)
chr3 (73-235)||(4347074-4347236)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (7-230)||(16450164-16450387)
chr7 (7-230)||(16041077-16041300)
chr7 (25-235)||(5127738-5127948)
chr7 (8-233)||(16503550-16503775)
chr7 (8-233)||(16518586-16518811)
chr7 (28-235)||(3445040-3445247)
chr7 (28-235)||(5147530-5147737)
chr7 (28-235)||(45387089-45387296)
chr7 (28-235)||(11441306-11441513)
chr7 (7-156)||(31088630-31088779)
chr7 (7-156)||(45733288-45733437)
chr7 (28-235)||(26435003-26435210)
chr7 (25-235)||(2154319-2154529)
chr7 (25-235)||(4145310-4145520)
chr7 (28-235)||(9618397-9618604)
chr7 (28-235)||(16736650-16736857)
chr7 (28-235)||(16751704-16751911)
chr7 (28-235)||(17523278-17523485)
chr7 (28-235)||(17529730-17529937)
chr7 (28-235)||(26485934-26486141)
chr7 (25-235)||(11424963-11425173)
chr7 (28-235)||(24592731-24592938)
chr7 (28-235)||(26275284-26275491)
chr7 (28-235)||(26320059-26320266)
chr7 (28-235)||(26538063-26538270)
chr7 (25-235)||(10917052-10917262)
chr7 (73-235)||(31124657-31124819)
chr7 (25-235)||(5159268-5159478)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (8-230)||(20162-20384)
scaffold0124 (25-235)||(30198-30408)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (7-233)||(23891962-23892188)
chr5 (7-233)||(25198788-25199014)
chr5 (28-235)||(8665676-8665883)
chr5 (7-175)||(22888287-22888455)
chr5 (28-235)||(30168223-30168430)
chr5 (28-235)||(18500949-18501156)
chr5 (28-235)||(31431182-31431389)
chr5 (28-235)||(37771200-37771407)
chr5 (28-235)||(43078003-43078210)
chr5 (73-235)||(18375658-18375820)
chr5 (7-156)||(13184825-13184974)
chr5 (7-156)||(13440671-13440820)
chr5 (7-156)||(33877083-33877232)
chr5 (28-235)||(30151772-30151979)
chr5 (25-235)||(11549108-11549318)
chr5 (25-235)||(22999312-22999522)
chr5 (25-235)||(23718186-23718396)
chr5 (25-235)||(23752648-23752858)
chr5 (73-235)||(24681191-24681353)
chr5 (73-235)||(24723718-24723880)
chr5 (73-235)||(33516110-33516272)
chr5 (25-235)||(33777241-33777451)
chr5 (7-156)||(11325630-11325779)
chr5 (145-233)||(24951866-24951954)
chr5 (148-235)||(24688478-24688565)
chr5 (28-235)||(37754722-37754929)
chr5 (28-235)||(40473753-40473960)
chr5 (25-235)||(9548741-9548951)
chr5 (28-235)||(3789280-3789487)
chr5 (28-235)||(5637664-5637871)
chr5 (28-235)||(9317205-9317412)
chr5 (28-235)||(12131909-12132116)
chr5 (28-235)||(26480146-26480353)
chr5 (28-235)||(31826620-31826827)
chr5 (25-235)||(15658958-15659168)
chr5 (8-110)||(24969903-24970005)
chr5 (25-235)||(30934390-30934600)
chr5 (73-235)||(37671738-37671900)
chr5 (25-113)||(33292404-33292492)
chr5 (28-235)||(41674463-41674670)
chr5 (73-235)||(28648980-28649142)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (7-230)||(20160454-20160674)
chr6 (7-230)||(22172157-22172377)
chr6 (9-192)||(22477501-22477684)
chr6 (25-235)||(26918122-26918332)
chr6 (7-156)||(28162481-28162630)
chr6 (28-235)||(3695805-3696012)
chr6 (25-235)||(26999815-27000025)
chr6 (7-156)||(8892533-8892682)
chr6 (7-156)||(13522296-13522445)
chr6 (7-156)||(33374479-33374628)
chr6 (28-235)||(34463608-34463815)
chr6 (25-235)||(13299195-13299405)
chr6 (25-235)||(26988743-26988953)
chr6 (73-235)||(30558308-30558470)
chr6 (22-235)||(29501148-29501361)
chr6 (7-156)||(8903768-8903917)
chr6 (28-235)||(16673869-16674076)
chr6 (25-235)||(4525031-4525241)
chr6 (25-235)||(15424561-15424771)
chr6 (25-235)||(16749596-16749806)
chr6 (25-235)||(24304862-24305072)
chr6 (25-235)||(24863459-24863669)
chr6 (25-235)||(29549220-29549430)
chr6 (28-235)||(29572755-29572962)
chr6 (73-235)||(27007454-27007616)
chr6 (73-235)||(4757503-4757665)
chr6 (73-235)||(4772739-4772901)
chr6 (73-235)||(26777919-26778081)
chr6 (25-62)||(22935121-22935158)
chr6 (25-62)||(23857566-23857603)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (7-156)||(2938-3087)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (25-233)||(40370-40578)
scaffold0089 (25-233)||(29510-29718)
scaffold0089 (25-110)||(47286-47371)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (73-235)||(15279-15441)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (25-235)||(431-641)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (25-235)||(27037-27247)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (28-235)||(26506-26713)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (25-235)||(7977-8187)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (28-235)||(7543-7750)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (28-181)||(37-190)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (34-235)||(5734-5936)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22081108 - 22081342
Alignment:
Q  1 gccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22081108 gccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaag 22081207  T
Q  101 gatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081208 gatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccat 22081307  T
Q  201 ccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081308 ccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccat 22081342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44563077 - 44562928
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| |   |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  44563077 ggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggat 44562981  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44562980 gctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 44562928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 31490013 - 31490220
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | |    
T  31490013 gcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggt 31490112  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  31490113 atgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 31490212  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  31490213 gtgtccat 31490220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19286420 - 19286210
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  19286420 tgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 19286321  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19286320 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 19286221  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  19286220 gtggtgtccat 19286210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Original strand, 19659304 - 19659427
Alignment:
Q  33 ggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatac 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||    
T  19659304 ggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 19659400  T
Q  130 ggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19659401 gacggaggtagctgagcagcattgatg 19659427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19688053 - 19687843
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||  ||   ||      
T  19688053 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatg 19687954  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  19687953 ggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 19687854  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  19687853 gtggtgtccat 19687843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9354598 - 9354449
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9354598 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 9354502  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9354501 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 9354449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16283404 - 16283196
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |     |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||   ||      
T  16283404 tgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 16283305  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | |||| |||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16283304 ggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 16283205  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  16283204 gtggtgtcc 16283196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19674390 - 19674183
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  19674390 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 19674291  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  19674290 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtg 19674191  T
Q  228 atgtccat 235  Q
    ||||||||    
T  19674190 atgtccat 19674183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 28362218 - 28362425
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  28362218 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 28362317  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  28362318 atgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 28362417  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  28362418 gtgtccat 28362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16277509 - 16277299
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  16277509 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 16277410  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16277409 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 16277310  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  16277309 gtggtgtccat 16277299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 19208623 - 19208830
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  19208623 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 19208722  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  19208723 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 19208822  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  19208823 gtgtccat 19208830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 2137519 - 2137729
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  2137519 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 2137618  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2137619 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 2137718  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  2137719 gtggtgtccat 2137729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 27609165 - 27609375
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||   ||  ||      
T  27609165 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatg 27609264  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27609265 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttctt 27609364  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  27609365 gtggtgtccat 27609375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14557582 - 14557372
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||  ||      
T  14557582 tgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatg 14557483  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14557482 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 14557383  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  14557382 gtggtgtccat 14557372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18710541 - 18710331
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  18710541 tgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 18710442  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  |||| || ||||| || |||||||||||    
T  18710441 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttctt 18710342  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  18710341 gtggtgtccat 18710331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 19518451 - 19518613
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  |    
T  19518451 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtca 19518550  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  19518551 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 19518613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15391609 - 15391844
Alignment:
Q  1 gccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15391609 gccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaag 15391708  T
Q  101 gatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggc-aacagtagcaatggattgactggttccggcagatgcca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15391709 gatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagatacca 15391808  T
Q  200 tccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15391809 tccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccat 15391844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 14235806 - 14236036
Alignment:
Q  5 gcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatg 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||  | | | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14235806 gcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatg 14235905  T
Q  105 ctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccct 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235906 ctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccct 14236005  T
Q  205 acttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14236006 acttctgtctctttcttcttatgatgaccat 14236036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1900248 - 1900025
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1900248 ggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 1900152  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    ||||||||||| ||   ||  | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1900151 gctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccc 1900052  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1900051 tacttctgtttctttcttcttatgatg 1900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 15285208 - 15285431
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15285208 ggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgct 15285307  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    |||||||||||   ||  | |||   ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||| |||    
T  15285308 gagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatac 15285407  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  15285408 ttctgtttctttcttcttatgatg 15285431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15227861 - 15227638
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15227861 ggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggat 15227765  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  15227764 gctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccc 15227665  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15227664 tacttctgtttctttcttcttatgatg 15227638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 27163618 - 27163828
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  27163618 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 27163717  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  27163718 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttctt 27163817  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  27163818 gtggtgtccat 27163828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5005837 - 5005630
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  5005837 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 5005738  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  5005737 atgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5005638  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  5005637 gtgtccat 5005630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30753709 - 30753502
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  30753709 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 30753610  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||   |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  30753609 atgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtg 30753510  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  30753509 gtgtccat 30753502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 33674114 - 33674321
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  33674114 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 33674213  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  33674214 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 33674313  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  33674314 gtgtccat 33674321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21969671 - 21969461
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  21969671 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 21969572  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21969571 ggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttctt 21969472  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  21969471 gtggtgtccat 21969461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39850590 - 39850383
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  39850590 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 39850491  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  39850490 atgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtg 39850391  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  39850390 gtgtccat 39850383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54833360 - 54833150
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  54833360 tgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 54833261  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  54833260 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 54833161  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  54833160 gtggtgtccat 54833150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14664988 - 14664778
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |    ||      
T  14664988 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatg 14664889  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14664888 ggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 14664789  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  14664788 gtggtgtccat 14664778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 24592612 - 24592822
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  24592612 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 24592711  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24592712 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttctt 24592811  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  24592812 gtggtgtccat 24592822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127029
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 31127029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 24460885 - 24461034
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24460885 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 24460981  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24460982 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 24461034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098301
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 14098301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17013970 - 17013760
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  17013970 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 17013871  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || |  ||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  17013870 ggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 17013771  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  17013770 gtggtgtccat 17013760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801133
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | | ||||| || ||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccat 18801133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6569820 - 6569613
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  6569820 gcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 6569721  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  6569720 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 6569621  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  6569620 gtgtccat 6569613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 14763605 - 14763815
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  14763605 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 14763704  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14763705 ggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 14763804  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  14763805 gtggtgtccat 14763815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19373183 - 19373021
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  19373183 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 19373084  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  19373083 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 19373021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24112635 - 24112547
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24112635 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 24112547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 34189258 - 34189346
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34189258 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 34189346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21546 - 21312
Alignment:
Q  1 gccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaag 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21546 gccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaag 21447  T
Q  101 gatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21446 gatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccat 21347  T
Q  201 ccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21346 ccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccat 21312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27392961 - 27392734
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27392961 gctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctg 27392862  T
Q  108 agagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctact 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27392861 agagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctact 27392762  T
Q  208 tctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392761 tctgtctctttcttcttatgatgaccat 27392734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 19456690 - 19456913
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19456690 ggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgct 19456789  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    || ||||||||   ||  | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  19456790 gaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctac 19456889  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  19456890 ttctgtttctttcttcttatgatg 19456913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 21703433 - 21703656
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21703433 ggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 21703529  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    ||||||||||| ||   ||  | |||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21703530 gctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccc 21703629  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21703630 tacttctgtttctttcttcttatgatg 21703656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32049749 - 32049539
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  32049749 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 32049650  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  32049649 ggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttctt 32049550  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  32049549 gtggtgtccat 32049539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 27434734 - 27434942
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |     || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||   ||      
T  27434734 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 27434833  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | |||| |||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  27434834 ggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 27434933  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  27434934 gtggtgtcc 27434942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 31891597 - 31891746
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  31891597 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggat 31891693  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31891694 gctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 31891746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 21677475 - 21677682
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  21677475 gcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 21677574  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | |||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  21677575 atggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 21677674  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  21677675 gtgtccat 21677682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27118660 - 27118511
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27118660 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 27118564  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   | | | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27118563 gctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 27118511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 261058 - 261265
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  261058 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 261157  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  261158 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 261257  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  261258 gtgtccat 261265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 11635482 - 11635689
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  11635482 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 11635581  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||    
T  11635582 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtg 11635681  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  11635682 gtgtccat 11635689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 11641671 - 11641878
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  11641671 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 11641770  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||    
T  11641771 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtg 11641870  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  11641871 gtgtccat 11641878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12586749 - 12586542
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||    
T  12586749 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatggat 12586650  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  12586649 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 12586550  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  12586549 gtgtccat 12586542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34279400 - 34279190
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  34279400 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 34279301  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  34279300 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 34279201  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  34279200 gtggtgtccat 34279190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3784626 - 3784477
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3784626 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 3784530  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3784529 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 3784477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34156983 - 34156834
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34156983 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 34156887  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34156886 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 34156834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 13936837 - 13937044
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  13936837 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 13936936  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  13936937 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 13937036  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  13937037 gtgtccat 13937044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717105
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 12717105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16163571 - 16163422
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16163571 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 16163475  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16163474 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 16163422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303721
Alignment:
Q  35 cattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacgg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   ||||     
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacga 34303696  T
Q  132 cggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  34303697 cggaggtagctgagcagcattgatg 34303721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27803640 - 27803433
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  27803640 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 27803541  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  27803540 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 27803441  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  27803440 gtgtccat 27803433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37925441 - 37925234
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  37925441 gcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 37925342  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  37925341 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37925242  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  37925241 gtgtccat 37925234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40233447 - 40233240
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  40233447 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 40233348  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  40233347 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 40233248  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  40233247 gtgtccat 40233240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 16829676 - 16829838
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16829775  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  16829776 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 16829838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16891805 - 16891643
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16891706  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  16891705 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 16891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28882165 - 28881955
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  28882165 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 28882066  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  28882065 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttctt 28881966  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  28881965 gtggtgtccat 28881955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 23128856 - 23129064
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  23128856 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 23128955  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  23128956 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 23129055  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  23129056 gtggtgtcc 23129064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 9350287 - 9350494
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  9350287 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 9350386  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  9350387 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 9350486  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  9350487 gtgtccat 9350494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27777155 - 27776948
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  27777155 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 27777056  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  27777055 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 27776956  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  27776955 gtgtccat 27776948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27816922 - 27816715
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  27816922 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 27816823  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||  || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  27816822 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 27816723  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  27816722 gtgtccat 27816715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31876229 - 31876022
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  31876229 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 31876130  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  31876129 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 31876030  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  31876029 gtgtccat 31876022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34861628 - 34861421
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  34861628 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 34861529  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  34861528 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 34861429  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  34861428 gtgtccat 34861421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 37686202 - 37686409
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  37686202 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 37686301  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  37686302 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37686401  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  37686402 gtgtccat 37686409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 37701467 - 37701674
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  37701467 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 37701566  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  37701567 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37701666  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  37701667 gtgtccat 37701674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12655493 - 12655283
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  12655493 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 12655394  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||  |||| |||||||| || |||||||||||    
T  12655393 ggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttctt 12655294  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  12655293 gtggtgtccat 12655283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34286305 - 34286095
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||      
T  34286305 tgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatg 34286206  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||| || |||  | ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  34286205 ggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 34286106  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  34286105 gtggtgtccat 34286095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34291365 - 34291155
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||      
T  34291365 tgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatg 34291266  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||| || |||  | ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  34291265 ggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 34291166  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  34291165 gtggtgtccat 34291155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889803
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 39889803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20837869 - 20837659
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  20837869 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 20837770  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||| | |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||  |||| |||||||| || |||||||||||    
T  20837769 ggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttctt 20837670  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  20837669 gtggtgtccat 20837659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 39052121 - 39052206
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39052121 gcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 39052206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 16208308 - 16208531
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16208308 ggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgct 16208407  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  16208408 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctac 16208507  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16208508 ttctgtttctttcttcttatgatg 16208531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460857
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctg 107  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  108 agagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctact 207  Q
    ||||||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 20460880  T
Q  208 tctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  20460879 tctatttctttcttcttatgatg 20460857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 20340615 - 20340764
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  20340615 ggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 20340711  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20340712 gctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 20340764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 41793610 - 41793819
Alignment:
Q  26 gagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactg 125  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| ||  |    
T  41793610 gagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgg 41793709  T
Q  126 atacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctta 225  Q
     || | |||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| |||| || ||||| || |||||||||||     
T  41793710 gtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttg 41793809  T
Q  226 tgatgtccat 235  Q
    || |||||||    
T  41793810 tggtgtccat 41793819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10962621 - 10962414
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  10962621 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 10962522  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10962521 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 10962422  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  10962421 gtgtccat 10962414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28584932 - 28584725
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||| | |    
T  28584932 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggt 28584833  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| | || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  28584832 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 28584733  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  28584732 gtgtccat 28584725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637962
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 51637962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18530331 - 18530108
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| || |||||||||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18530331 ggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgct 18530232  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    |||||||||||   ||| | ||||  ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18530231 gagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctac 18530132  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  18530131 ttctgtttctttcttcttatgatg 18530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 16626827 - 16627049
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||  | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  16626827 ggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgct 16626926  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    ||||||||||    ||| | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16626927 gagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctac 16627026  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  16627027 ttctgtttc-ttcttcttatgatg 16627049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7996478 - 7996268
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  7996478 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 7996379  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7996378 ggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 7996279  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  7996278 gtggtgtccat 7996268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10642986 - 10642776
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  10642986 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 10642887  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10642886 ggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 10642787  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  10642786 gtggtgtccat 10642776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 28116302 - 28116509
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  28116302 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 28116401  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  28116402 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 28116501  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  28116502 gtgtccat 28116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47023366 - 47023159
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  47023366 gcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 47023267  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  47023266 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 47023167  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  47023166 gtgtccat 47023159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4721547 - 4721337
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||  |||  ||      
T  4721547 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatg 4721448  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  4721447 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 4721348  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  4721347 gtggtgtccat 4721337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7073128 - 7072918
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  7073128 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 7073029  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7073028 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 7072929  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  7072928 gtggtgtccat 7072918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 15893048 - 15893256
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |     || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||  ||   ||      
T  15893048 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 15893147  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | |||| |||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  15893148 ggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 15893247  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  15893248 gtggtgtcc 15893256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51781924 - 51781717
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  51781924 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 51781825  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  51781824 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 51781725  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  51781724 gtgtccat 51781717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 4796995 - 4797205
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  4796995 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 4797094  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  4797095 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 4797194  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  4797195 gtggtgtccat 4797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8295891 - 8295681
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  8295891 tgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 8295792  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8295791 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 8295692  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  8295691 gtggtgtccat 8295681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35880682 - 35880472
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  35880682 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 35880583  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  35880582 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 35880483  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  35880482 gtggtgtccat 35880472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 17994105 - 17994254
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17994105 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 17994201  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17994202 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 17994254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51797013 - 51796817
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  51797013 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 51796914  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  51796913 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 51796817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5013625 - 5013418
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  5013625 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 5013526  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  5013525 atgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5013426  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  5013425 gtgtccat 5013418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 11110706 - 11110913
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  11110706 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 11110805  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  11110806 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtg 11110905  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  11110906 gtgtccat 11110913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18225104 - 18224897
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | |    
T  18225104 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggt 18225005  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  18225004 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18224905  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  18224904 gtgtccat 18224897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 20577207 - 20577414
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  20577207 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 20577306  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  20577307 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 20577406  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  20577407 gtgtccat 20577414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 29665330 - 29665537
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  29665330 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 29665429  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  29665430 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 29665529  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  29665530 gtgtccat 29665537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 36997434 - 36997641
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  36997434 gcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 36997533  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  36997534 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 36997633  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  36997634 gtgtccat 36997641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466691
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 5466691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 15741424 - 15741634
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  15741424 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 15741523  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  15741524 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 15741623  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  15741624 gtggtgtccat 15741634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985508
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 17985508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625732
Alignment:
Q  35 cattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacgg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   ||||     
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacga 4625757  T
Q  132 cggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  4625756 cggaggtagctgagcagcattgatg 4625732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18330536 - 18330380
Alignment:
Q  79 tgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggatt 178  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  18330536 tgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggatt 18330437  T
Q  179 gactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||| || ||| || ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  18330436 gaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18330380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 8301606 - 8301816
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |     || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   || |    
T  8301606 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata-t 8301704  T
Q  125 ga-tacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttct 223  Q
    || |||| |||||| |  || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| || |||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||    
T  8301705 gagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttct 8301804  T
Q  224 tatgatgtccat 235  Q
    | || |||||||    
T  8301805 tgtggtgtccat 8301816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48465828 - 48465621
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  48465828 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 48465729  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  48465728 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtg 48465629  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  48465628 gtgtccat 48465621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5713134 - 5713012
Alignment:
Q  34 gcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcg 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   |||| ||    
T  5713134 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 5713035  T
Q  134 gaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  5713034 gaggtagctgagcagcattgatg 5713012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5724044 - 5723922
Alignment:
Q  34 gcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcg 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   |||| ||    
T  5724044 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 5723945  T
Q  134 gaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  5723944 gaggtagctgagcagcattgatg 5723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 5757433 - 5757555
Alignment:
Q  34 gcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcg 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   |||| ||    
T  5757433 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 5757532  T
Q  134 gaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  5757533 gaggtagctgagcagcattgatg 5757555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 156
Target Start/End: Original strand, 5768324 - 5768446
Alignment:
Q  34 gcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcg 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||   |||| ||    
T  5768324 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 5768423  T
Q  134 gaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  5768424 gaggtagctgagcagcattgatg 5768446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6192232 - 6192022
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  6192232 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 6192133  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||  | ||  |||||| |||||| || |||||||||||    
T  6192132 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttctt 6192033  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  6192032 gtggtgtccat 6192022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8211657 - 8211447
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||   ||      
T  8211657 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatg 8211558  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8211557 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 8211458  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  8211457 gtggtgtccat 8211447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871426
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 22871426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886485
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 22886485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 5596705 - 5596918
Alignment:
Q  22 tgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |    
T  5596705 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 5596804  T
Q  122 actgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttctt 221  Q
    |  | |||| |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||    
T  5596805 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctt 5596904  T
Q  222 cttatgatgtccat 235  Q
    ||| || |||||||    
T  5596905 cttgtggtgtccat 5596918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5652324 - 5652175
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcg---gatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   || ||    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5652324 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---attgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 5652228  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5652227 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 5652175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 6542864 - 6543026
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  6542864 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 6542963  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  6542964 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 6543026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10396052 - 10395842
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |||| ||      
T  10396052 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatg 10395953  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10395952 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 10395853  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  10395852 gtggtgtccat 10395842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242433
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18242433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20065962 - 20065752
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  20065962 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 20065863  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || |||||||| || |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20065862 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttctt 20065763  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     ||||||||||    
T  20065762 gtgatgtccat 20065752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 29149145 - 29149307
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||  | || | |||||| |  || || |||||||| || |||| |||||| |    
T  29149145 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagcca 29149244  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  29149245 tggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 29149307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18051055 - 18050968
Alignment:
Q  148 gcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  18051055 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18050968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 18277394 - 18277604
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  18277394 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 18277493  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18277494 ggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 18277593  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  18277594 gtggtgtccat 18277604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 18292695 - 18292905
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  18292695 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 18292794  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18292795 ggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 18292894  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  18292895 gtggtgtccat 18292905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 18307996 - 18308206
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  18307996 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 18308095  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18308096 ggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 18308195  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  18308196 gtggtgtccat 18308206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4893129 - 4893041
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4893129 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 4893041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32439073 - 32438985
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32439073 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 32438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 4347074 - 4347236
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||  |  | || | |||||| |  || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  4347074 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagcca 4347173  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  4347174 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4347236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 16450164 - 16450387
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||| ||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16450164 ggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggat 16450260  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    |||||||||| |||  |||| | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  16450261 gctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccc 16450360  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16450361 tacttttgtttctttcttcttatgatg 16450387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16041300 - 16041077
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16041300 ggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgct 16041201  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    |||||||| ||   ||  | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  16041200 gagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctac 16041101  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16041100 ttctgtttctttcttcttatgatg 16041077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5127948 - 5127738
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  5127948 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 5127849  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  5127848 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 5127749  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  5127748 gtggtgtccat 5127738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 16503550 - 16503775
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctg 107  Q
    ||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16503550 gctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctg 16503649  T
Q  108 agagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctact 207  Q
    ||||||  ||   ||  | || | |||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  16503650 agagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctact 16503749  T
Q  208 tctgtctctttcttcttatgatgtcc 233  Q
    || || ||||||||||| || |||||    
T  16503750 tccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16503775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 16518586 - 16518811
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctg 107  Q
    ||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16518586 gctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctg 16518685  T
Q  108 agagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctact 207  Q
    ||||||  ||   ||  | || | |||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  16518686 agagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctact 16518785  T
Q  208 tctgtctctttcttcttatgatgtcc 233  Q
    || || ||||||||||| || |||||    
T  16518786 tccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16518811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3445247 - 3445040
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |    
T  3445247 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggt 3445148  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  3445147 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 3445048  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  3445047 gtgtccat 3445040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 5147530 - 5147737
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||    
T  5147530 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggat 5147629  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  5147630 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5147729  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  5147730 gtgtccat 5147737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45387296 - 45387089
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  45387296 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 45387197  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  45387196 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 45387097  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  45387096 gtgtccat 45387089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11441513 - 11441306
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  11441513 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 11441414  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  11441413 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 11441314  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  11441313 gtgtccat 11441306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 31088630 - 31088779
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31088630 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 31088726  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31088727 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 31088779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45733437 - 45733288
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  45733437 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 45733341  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45733340 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 45733288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26435210 - 26435003
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  26435210 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 26435111  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||| |||| || |||||||| || ||||| |||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26435110 atgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 26435011  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26435010 gtgtccat 26435003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2154529 - 2154319
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  2154529 tgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 2154430  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2154429 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 2154330  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  2154329 gtggtgtccat 2154319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 4145310 - 4145520
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||      
T  4145310 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 4145409  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4145410 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttctt 4145509  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  4145510 gtggtgtccat 4145520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9618604 - 9618397
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  9618604 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 9618505  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  9618504 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 9618405  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  9618404 gtgtccat 9618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 16736650 - 16736857
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  16736650 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 16736749  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||  |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16736750 atgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 16736849  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  16736850 gtgtccat 16736857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 16751704 - 16751911
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  16751704 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 16751803  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||  |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16751804 atgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 16751903  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  16751904 gtgtccat 16751911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17523485 - 17523278
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  17523485 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 17523386  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||  |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17523385 atgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 17523286  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  17523285 gtgtccat 17523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 17529730 - 17529937
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  17529730 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 17529829  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||  |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17529830 atgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 17529929  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  17529930 gtgtccat 17529937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 26485934 - 26486141
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  26485934 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 26486033  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26486034 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 26486133  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26486134 gtgtccat 26486141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 11424963 - 11425173
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  11424963 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 11425062  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11425063 ggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 11425162  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  11425163 gtggtgtccat 11425173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 24592731 - 24592938
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  24592731 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 24592830  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  24592831 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 24592930  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  24592931 gtgtccat 24592938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 26275284 - 26275491
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  26275284 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 26275383  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26275384 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 26275483  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26275484 gtgtccat 26275491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 26320059 - 26320266
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  26320059 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 26320158  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26320159 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 26320258  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26320259 gtgtccat 26320266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 26538063 - 26538270
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  26538063 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 26538162  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  26538163 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtg 26538262  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26538263 gtgtccat 26538270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 10917052 - 10917262
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||  ||      
T  10917052 tgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatg 10917151  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | || ||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  10917152 ggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 10917251  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  10917252 gtggtgtccat 10917262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124657
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 31124657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5159478 - 5159268
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    ||      
T  5159478 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataag 5159379  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || | ||||| || | |  ||| || || || || |||||||||||    
T  5159378 ggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttctt 5159279  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     ||||||||||    
T  5159278 gtgatgtccat 5159268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20384 - 20162
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatg 104  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  20384 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatg 20288  T
Q  105 ctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccct 204  Q
    |||||||||| ||   ||  | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  20287 ctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccct 20188  T
Q  205 acttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20187 acttctgtttctttcttcttatgatg 20162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30408 - 30198
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||   ||      
T  30408 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatg 30309  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  30308 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttctt 30209  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  30208 gtggtgtccat 30198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23892188 - 23891962
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23892188 ggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggat 23892092  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    ||||||||||  ||   ||  | |||| |||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  23892091 gctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccc 23891992  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatgtcc 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23891991 tacttctgtttctttcttcttatgatgtcc 23891962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25199014 - 25198788
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||| ||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25199014 ggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggat 25198918  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccc 203  Q
    ||||||||||  ||   ||  | |||| |||||| || || | |||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  25198917 gctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccc 25198818  T
Q  204 tacttctgtctctttcttcttatgatgtcc 233  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25198817 tacttctgtttccttcttcttatgatgtcc 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 8665676 - 8665883
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  8665676 gcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggt 8665775  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | |||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  8665776 atggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 8665875  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  8665876 gtgtccat 8665883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22888455 - 22888287
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22888455 ggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 22888359  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatgg 175  Q
    ||||||||||| ||   ||  | |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22888358 gctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30168430 - 30168223
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | |    
T  30168430 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggt 30168331  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  30168330 atgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 30168231  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  30168230 gtgtccat 30168223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 18500949 - 18501156
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  18500949 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 18501048  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  18501049 atgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 18501148  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  18501149 gtgtccat 18501156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31431389 - 31431182
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  31431389 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 31431290  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  31431289 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 31431190  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  31431189 gtgtccat 31431182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 37771200 - 37771407
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  |||    
T  37771200 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggat 37771299  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    ||| |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  37771300 acgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37771399  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  37771400 gtgtccat 37771407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43078210 - 43078003
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  43078210 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 43078111  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    ||| |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||| || ||| |  ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  43078110 acgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 43078011  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  43078010 gtgtccat 43078003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375820
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 18375820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 13184825 - 13184974
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13184825 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 13184921  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13184922 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 13184974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 13440671 - 13440820
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13440671 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 13440767  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13440768 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 13440820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33877232 - 33877083
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33877232 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 33877136  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33877135 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 33877083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30151979 - 30151772
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  30151979 gcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 30151880  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  30151879 atgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 30151780  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  30151779 gtgtccat 30151772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11549318 - 11549108
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||  ||      
T  11549318 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatg 11549219  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11549218 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 11549119  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  11549118 gtggtgtccat 11549108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 22999312 - 22999522
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  22999312 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 22999411  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22999412 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttctt 22999511  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  22999512 gtggtgtccat 22999522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 23718186 - 23718396
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  23718186 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 23718285  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  23718286 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 23718385  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  23718386 gtggtgtccat 23718396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 23752648 - 23752858
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  23752648 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 23752747  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  23752748 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 23752847  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  23752848 gtggtgtccat 23752858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681191
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24681191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723718
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24723718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516110
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 33516110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33777451 - 33777241
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  33777451 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 33777352  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  33777351 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 33777252  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  33777251 gtggtgtccat 33777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11325779 - 11325630
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||    |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11325779 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtccca---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 11325683  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11325682 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 11325630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24951954 - 24951866
Alignment:
Q  145 gcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtcc 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  24951954 gcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 24951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Original strand, 24688478 - 24688565
Alignment:
Q  148 gcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  24688478 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 24688565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37754929 - 37754722
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  |||    
T  37754929 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggat 37754830  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  37754829 atgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37754730  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  37754729 gtgtccat 37754722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 40473753 - 40473960
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||   | |    
T  40473753 gcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtgtgggt 40473852  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  40473853 atgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 40473952  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  40473953 gtgtccat 40473960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 9548741 - 9548951
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||      
T  9548741 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatg 9548840  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || | |||||| || |||||||| || |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  9548841 ggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 9548940  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  9548941 gtggtgtccat 9548951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3789487 - 3789280
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  | |    
T  3789487 gcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 3789388  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  3789387 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 3789288  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  3789287 gtgtccat 3789280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5637871 - 5637664
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  5637871 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 5637772  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  5637771 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5637672  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  5637671 gtgtccat 5637664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9317412 - 9317205
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  9317412 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 9317313  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  9317312 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 9317213  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  9317212 gtgtccat 9317205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12132116 - 12131909
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  12132116 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 12132017  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  12132016 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 12131917  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  12131916 gtgtccat 12131909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26480353 - 26480146
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  26480353 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 26480254  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26480253 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtg 26480154  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26480153 gtgtccat 26480146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 31826620 - 31826827
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  31826620 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 31826719  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  31826720 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 31826819  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  31826820 gtgtccat 31826827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 15658958 - 15659168
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  15658958 tgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 15659057  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    |||| | |||||| |  ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15659058 gatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 15659157  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  15659158 gtggtgtccat 15659168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24970005 - 24969903
Alignment:
Q  8 gctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctg 107  Q
    ||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24970005 gctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctg 24969906  T
Q  108 aga 110  Q
    |||    
T  24969905 aga 24969903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30934600 - 30934390
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||  ||      
T  30934600 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatg 30934501  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||  |||||||| | || ||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  30934500 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 30934401  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  30934400 gtggtgtccat 30934390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 37671738 - 37671900
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  37671738 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37671837  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  37671838 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 37671900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33292492 - 33292404
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 113  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33292492 tgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 33292404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41674670 - 41674463
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |   | || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||  |||  ||  | |    
T  41674670 gcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggt 41674571  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  || || | |||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  41674570 atgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 41674471  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  41674470 gtgtccat 41674463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28649142 - 28648980
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| | |||||| |  ||||||||||| |    
T  28649142 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagcca 28649043  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | | ||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  28649042 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 28648980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20160674 - 20160454
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |    
T  20160674 ggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgtt 20160575  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    ||||||| ||     || | || || |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||   | ||| || ||||||||||    
T  20160574 gagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctac 20160478  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  20160477 ttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 22172157 - 22172377
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |    
T  22172157 ggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgtt 22172256  T
Q  107 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctac 206  Q
    ||||||| ||     || | || || |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||   | ||| || ||||||||||    
T  22172257 gagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctac 22172353  T
Q  207 ttctgtctctttcttcttatgatg 230  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  22172354 ttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 22477501 - 22477684
Alignment:
Q  9 ctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgc 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22477501 ctgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgc 22477597  T
Q  106 tgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggca 192  Q
    |||||||| |||   ||| | |||| | ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22477598 tgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgactagttccggca 22477684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26918332 - 26918122
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  26918332 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 26918233  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  26918232 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 26918133  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  26918132 gtggtgtccat 26918122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28162630 - 28162481
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  28162630 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggat 28162534  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  28162533 gctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcattgatg 28162481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3696012 - 3695805
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  3696012 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 3695913  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  3695912 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 3695813  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  3695812 gtgtccat 3695805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27000025 - 26999815
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  27000025 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 26999926  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  26999925 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 26999826  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  26999825 gtggtgtccat 26999815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 8892533 - 8892682
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8892533 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggat 8892629  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8892630 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 8892682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 13522296 - 13522445
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13522296 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 13522392  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13522393 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 13522445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 33374479 - 33374628
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33374479 ggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 33374575  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33374576 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 33374628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 34463608 - 34463815
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | |    
T  34463608 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggt 34463707  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  34463708 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 34463807  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  34463808 gtgtccat 34463815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 13299195 - 13299405
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  13299195 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 13299294  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  13299295 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 13299394  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  13299395 gtggtgtccat 13299405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26988953 - 26988743
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  26988953 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 26988854  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  26988853 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 26988754  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  26988753 gtggtgtccat 26988743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558470
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    ||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccat 30558470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29501361 - 29501148
Alignment:
Q  22 tgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgt 121  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |    
T  29501361 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 29501262  T
Q  122 actgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttctt 221  Q
    |  | |||| |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||    
T  29501261 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctt 29501162  T
Q  222 cttatgatgtccat 235  Q
    ||| || |||||||    
T  29501161 cttgtggtgtccat 29501148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 8903768 - 8903917
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   | |||||| ||||| |||||||| |||||  |||    
T  8903768 ggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagat 8903864  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||   |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8903865 gctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 8903917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16674076 - 16673869
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||  |||    
T  16674076 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggat 16673977  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  16673976 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtg 16673877  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  16673876 gtgtccat 16673869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4525241 - 4525031
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||      
T  4525241 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 4525142  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4525141 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 4525042  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  4525041 gtggtgtccat 4525031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 15424561 - 15424771
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  15424561 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 15424660  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  15424661 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 15424760  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  15424761 gtggtgtccat 15424771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16749806 - 16749596
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  16749806 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 16749707  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||  |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16749706 ggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 16749607  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  16749606 gtggtgtccat 16749596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 24304862 - 24305072
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||  ||      
T  24304862 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatg 24304961  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  24304962 ggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 24305061  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  24305062 gtggtgtccat 24305072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24863669 - 24863459
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||| | | | || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  24863669 tgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 24863570  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  24863569 ggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 24863470  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  24863469 gtggtgtccat 24863459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29549430 - 29549220
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||      
T  29549430 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatg 29549331  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  29549330 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29549231  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     ||||||||||    
T  29549230 gtgatgtccat 29549220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29572962 - 29572755
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  29572962 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 29572863  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  29572862 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 29572763  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  29572762 gtgtccat 29572755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27007616 - 27007454
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  27007616 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 27007517  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  27007516 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 27007454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4757665 - 4757503
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||| |    
T  4757665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagcca 4757566  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  4757565 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4757503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4772901 - 4772739
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||  | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| |    
T  4772901 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4772802  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || |||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  4772801 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 4772739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778081
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | || | |||||| |  || || | |||||| || ||||||||||| |    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||| | || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 26778081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 22935121 - 22935158
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccgg 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935121 tgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccgg 22935158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 23857566 - 23857603
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccgg 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857566 tgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccgg 23857603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 2938 - 3087
Alignment:
Q  7 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggat 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2938 ggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggat 3034  T
Q  104 gctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatg 156  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3035 gctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 3087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 40370 - 40578
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |     || ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  40370 tgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 40469  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  40470 ggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 40569  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  40570 gtggtgtcc 40578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29718 - 29510
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |     || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   |||     
T  29718 tgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacg 29619  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | ||||  ||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29618 ggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 29519  T
Q  225 atgatgtcc 233  Q
     || |||||    
T  29518 gtggtgtcc 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 47286 - 47371
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgaga 110  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47286 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15441
Alignment:
Q  73 tactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | || | |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  173 tggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgtccat 235  Q
    | ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccat 15441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 431 - 641
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
T  431 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 530  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| |  ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  531 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 630  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  631 gtggtgtccat 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27247 - 27037
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | | | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||   ||      
T  27247 tgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatg 27148  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  || || |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  27147 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 27048  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  27047 gtggtgtccat 27037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 26506 - 26713
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  26506 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 26605  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  26606 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 26705  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  26706 gtgtccat 26713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 7977
Alignment:
Q  25 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 124  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||      
T  8187 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 8088  T
Q  125 gatacggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttctt 224  Q
    | || | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||| || ||| || ||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8087 ggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttctt 7988  T
Q  225 atgatgtccat 235  Q
     || |||||||    
T  7987 gtggtgtccat 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 7543 - 7750
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  | |    
T  7543 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 7642  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatg 227  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  7643 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 7742  T
Q  228 atgtccat 235  Q
     |||||||    
T  7743 gtgtccat 7750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 37 - 190
Alignment:
Q  28 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||     || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||  |||    
T  37 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggat 136  T
Q  128 acggcggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtagcaatggattgac 181  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  137 atgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgac 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5936 - 5734
Alignment:
Q  34 gcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaat-ggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggc 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   | || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | || | |    
T  5936 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgac 5837  T
Q  133 ggaggtaactgagcagcattgatgggggcaacagtag-caatggattgactggttccggcagatgccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgt 231  Q
    ||||| |  ||||  |||||||| || |||||||||| || | ||||||| || ||| || ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  5836 ggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgt 5738  T
Q  232 ccat 235  Q
    ||||    
T  5737 ccat 5734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University