View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_20 (Length: 438)

Name: NF6868A_low_20
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_20
NF6868A_low_20
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (6-426)||(26143491-26143911)
chr6 (6-426)||(25580345-25580765)
chr6 (6-426)||(25483682-25484102)
chr6 (6-426)||(25539166-25539586)
chr6 (6-423)||(26056548-26056965)
chr6 (6-423)||(26656591-26657008)
chr6 (6-423)||(26762562-26762979)
chr6 (6-423)||(26076518-26076935)
chr6 (6-423)||(26884696-26885113)
chr6 (6-402)||(26862227-26862623)
chr6 (6-404)||(26647124-26647522)
chr6 (6-404)||(26753092-26753490)
chr6 (6-399)||(27337234-27337627)
chr6 (6-399)||(27397974-27398367)
chr6 (6-409)||(27530440-27530843)
chr6 (6-301)||(25511640-25511935)
chr6 (6-423)||(25492458-25492875)
chr6 (6-404)||(27215097-27215495)
chr6 (6-409)||(27717638-27718041)
chr6 (6-409)||(27610259-27610662)
chr6 (6-409)||(28786878-28787281)
chr6 (6-409)||(28792999-28793402)
chr6 (6-409)||(28781741-28782144)
chr6 (6-409)||(31285199-31285602)
chr6 (6-409)||(26623911-26624314)
chr6 (6-409)||(26729888-26730291)
chr6 (6-409)||(27592160-27592563)
chr6 (6-409)||(27603843-27604246)
chr6 (6-409)||(27697725-27698128)
chr6 (6-393)||(26803102-26803489)
chr6 (6-393)||(27676759-27677146)
chr6 (6-393)||(27679606-27679993)
chr6 (6-393)||(27426751-27427138)
chr6 (49-393)||(27705586-27705930)
chr6 (6-404)||(26824464-26824862)
chr6 (347-423)||(25511564-25511640)
chr6 (206-289)||(28140295-28140378)
chr6 (212-288)||(26937790-26937866)
chr6 (199-281)||(28097775-28097857)
chr6 (6-136)||(28326391-28326521)
chr6 (6-136)||(28504027-28504157)
chr6 (235-300)||(26849461-26849526)
chr6 (198-268)||(26724349-26724419)
chr6 (199-281)||(26950511-26950593)
chr6 (6-60)||(29477204-29477258)
chr6 (235-300)||(26975700-26975765)
chr6 (6-83)||(28182084-28182161)
chr6 (29-82)||(28490718-28490771)
chr6 (29-82)||(29803128-29803181)
chr6 (218-306)||(28243538-28243626)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (6-423)||(28126814-28127231)
chr1 (6-423)||(28163515-28163931)
chr1 (52-409)||(267525-267882)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (6-409)||(18698535-18698938)
chr4 (6-393)||(18730639-18731026)
chr4 (6-409)||(18678695-18679098)
chr4 (6-393)||(18654612-18654999)
chr4 (6-393)||(18723220-18723607)
chr4 (6-393)||(18074417-18074804)
chr4 (6-129)||(5090089-5090212)
chr4 (198-306)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (6-409)||(3851-4254)
scaffold0277 (6-409)||(12814-13217)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (6-409)||(8127-8530)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (6-409)||(2678-3081)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (6-409)||(29272977-29273380)
chr8 (7-74)||(35984274-35984341)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (6-393)||(60225-60612)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (199-298)||(3280410-3280509)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (199-298)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (6-136)||(57433-57563)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (218-306)||(43700-43788)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26143911 - 26143491
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143911 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 26143812  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26143811 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattc 26143712  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26143711 tctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaa 26143612  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26143611 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatt 26143512  T
Q  406 taagaaaacatgattgatatt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  26143511 taaaaaaacatgattgatatt 26143491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25580765 - 25580345
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580765 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 25580666  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| || ||||| ||    
T  25580665 tgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaactattattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatc 25580566  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580565 tctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 25580466  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25580465 aaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtt 25580366  T
Q  406 taagaaaacatgattgatatt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25580365 taaaaaaacatgattgatatt 25580345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25484102 - 25483682
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25484102 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgat 25484003  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25484002 tggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcatcttt-tggagatgtttcaggttattatgacttgaatt 25483904  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483903 ctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaagaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 25483804  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25483803 aaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgt 25483704  T
Q  405 ttaagaaaacatgattgatatt 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  25483703 ttaaaaaatcatgattgatatt 25483682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25539586 - 25539166
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25539586 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgat 25539487  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||| || || ||||||| |  |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25539486 tgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattc 25539387  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539386 tctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaacaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 25539287  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  25539286 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagcaatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacata 25539187  T
Q  406 taagaaaacatgattgatatt 426  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25539186 taaaaaaacatgattgatatt 25539166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26056965 - 26056548
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26056965 accaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataat 26056866  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || ||||||||    
T  26056865 tggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattc 26056766  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26056765 tctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaa 26056666  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  26056665 aaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtt 26056566  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26056565 taaaaaaacatgattgat 26056548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26657008 - 26656591
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26657008 accaatcaagtcctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgat 26656909  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  26656908 tggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattc 26656809  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656808 tctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 26656709  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||     
T  26656708 aaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatg 26656609  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26656608 taaaaaaacacgattgat 26656591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26762979 - 26762562
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26762979 accaatcaagtcctcctgccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgat 26762880  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  26762879 tggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattc 26762780  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762779 tctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 26762680  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||     
T  26762679 aaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatg 26762580  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26762579 taaaaaaacacgattgat 26762562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26076935 - 26076518
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26076935 accaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataat 26076836  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || ||||||||    
T  26076835 tggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattc 26076736  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26076735 tctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaa 26076636  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  26076635 aaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtt 26076536  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26076535 taaaaaaacatgattgat 26076518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26885113 - 26884696
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  26885113 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccattttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgag 26885014  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  26885013 tggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattc 26884914  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26884913 tccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaacataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 26884814  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||| |||||||||| | ||| | || | |||  |||| |||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26884813 aaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatg 26884714  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  26884713 taaaacaacacgattgat 26884696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26862623 - 26862227
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |     
T  26862623 accaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataag 26862524  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  26862523 tggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattc 26862424  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26862423 tctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccat 26862324  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctac 402  Q
    |||||||||||||| | ||| | || |||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26862323 aaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 26862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26647522 - 26647124
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26647522 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 26647423  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||| || || ||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  26647422 tggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattc 26647323  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26647322 tctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccat 26647223  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    |||||||||||||  ||||| | || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26647222 aaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacat 26647124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26753490 - 26753092
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26753490 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 26753391  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||| || || ||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  26753390 tggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattc 26753291  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26753290 tctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccat 26753191  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    |||||||||||||  ||||| | || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26753190 aaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacat 26753092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 399
Target Start/End: Original strand, 27337234 - 27337627
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  27337234 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgat 27337333  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||    
T  27337334 tggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattc 27337433  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  27337434 tctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccat 27337533  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggc 399  Q
    ||||||||||||||  |||| | || |||||  |||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27337534 aaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27337627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 399
Target Start/End: Original strand, 27397974 - 27398367
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  27397974 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgat 27398073  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| || ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||  |||||||    
T  27398074 tggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattc 27398173  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  27398174 tctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccat 27398273  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggc 399  Q
    ||||||||||||||  |||| | || |||||  |||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27398274 aaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27398367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27530440 - 27530843
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27530440 accaatcaagtcctccagccaaggcctctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgat 27530539  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||    | | ||||||    
T  27530540 tggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattc 27530639  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
     |||| ||||| |  ||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27530640 actctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccat 27530739  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||    |  |||||| ||  |||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  27530740 aaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgccctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacatc 27530839  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  27530840 taag 27530843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25511935 - 25511640
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25511935 accagtcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataat 25511836  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| || |  ||  ||||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||  || ||| || ||||||||    
T  25511835 tggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattc 25511736  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25511735 tctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaatagaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 25492458 - 25492875
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  || |||||    
T  25492458 accaatcaagtccttcagccaaatcctctagctgctccagtctgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgat 25492557  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttca-gtttattatgacttgaatt 204  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||  ||  ||| ||||  || |  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||  || |||||||    
T  25492558 tgcaattccctcactaacacttcttaacttaatgtctaatctaaccattttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttg-gagttgaatt 25492656  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||     ||||||||||  | |||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25492657 ctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtacca 25492756  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  || |||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25492757 taaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaagcaatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacat 25492856  T
Q  405 ttaagaaaacatgattgat 423  Q
     |||  ||||| |||||||    
T  25492857 gtaatgaaacacgattgat 25492875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27215495 - 27215097
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||  || ||  |    
T  27215495 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctt 27215396  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||| | | |||||  | |||||| || |||||||  |||||   | ||||||||    
T  27215395 tgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccgttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattc 27215296  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||| | ||||  |  |||||| ||   | |||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27215295 tctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaatgaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccat 27215196  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27215195 gaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacat 27215097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27717638 - 27718041
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||       
T  27717638 accaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatata 27717737  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||   | |||||||    
T  27717738 aggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaatt 27717836  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27717837 ctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtacca 27717936  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  27717937 taaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27718036  T
Q  405 ttaag 409  Q
     ||||    
T  27718037 gtaag 27718041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27610259 - 27610662
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||       
T  27610259 accaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatata 27610358  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||   | |||||||    
T  27610359 aggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaatt 27610457  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27610458 ctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtacca 27610557  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||| ||||||||| || || | | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  27610558 taaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27610657  T
Q  405 ttaag 409  Q
     ||||    
T  27610658 gtaag 27610662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28787281 - 28786878
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||       
T  28787281 accaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatata 28787182  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || |||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||    
T  28787181 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattc 28787082  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28787081 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 28786982  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||     
T  28786981 aaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 28786882  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  28786881 taag 28786878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28793402 - 28792999
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||       
T  28793402 accaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatata 28793303  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || |||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||   |  |||| ||    
T  28793302 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactc 28793203  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28793202 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 28793103  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||     
T  28793102 aaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 28793003  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  28793002 taag 28792999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28782144 - 28781741
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||       
T  28782144 accaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatata 28782045  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| || || || | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||    
T  28782044 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtgcttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattc 28781945  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28781944 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaattaagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 28781845  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||||||||||||| | |||  |||  ||| | || |   |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  28781844 aaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 28781745  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  28781744 taag 28781741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31285602 - 31285199
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || || | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31285602 accaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgattcatattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 31285503  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||   | ||||  || |||| | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||    
T  31285502 tggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattgttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattc 31285403  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  31285402 tctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaataaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccat 31285303  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| | ||| | |  | ||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  || ||||||||||| ||||| ||||     
T  31285302 aaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagcaatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatg 31285203  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  31285202 taag 31285199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26624314 - 26623911
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||   |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26624314 accaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 26624215  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||   | ||||  |  |||| | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||    
T  26624214 tgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattc 26624115  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  26624114 tctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccat 26624015  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    | | ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| || ||||     
T  26624014 acattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatg 26623915  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  26623914 taag 26623911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26730291 - 26729888
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||   |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26730291 accaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 26730192  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||||   | ||||  |  |||| | |||||||| |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||    
T  26730191 tgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattc 26730092  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  26730091 tctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccat 26729992  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    | | ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| || ||||     
T  26729991 acattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatg 26729892  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  26729891 taag 26729888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27592160 - 27592563
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  |    
T  27592160 accaatcaagtcctccagccaaagcatctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttatttt 27592259  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaa-tttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     | |||||| || ||||||  ||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| |    
T  27592260 aggaattccttcgctaacacttcctaactta-atttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaact 27592358  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  27592359 ctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatccca 27592458  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  27592459 taaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacat 27592558  T
Q  405 ttaag 409  Q
    |||||    
T  27592559 ttaag 27592563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27603843 - 27604246
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |   || |||||||| ||       
T  27603843 accaatcaggttctcctgccaaagcctgtagttgccccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatg 27603942  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  ||||||    
T  27603943 agaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaatt 27604041  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27604042 ctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtacca 27604141  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||  |||||||||||| || ||| ||||| || |||| ||| || ||||| ||||    
T  27604142 taaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagagatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacat 27604241  T
Q  405 ttaag 409  Q
     ||||    
T  27604242 gtaag 27604246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 27697725 - 27698128
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27697725 accaatcgagtcctccagccaaagcctgtagctgatccagtttgtcaacatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgat 27697824  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||| ||||||||||   |||| |||   | | ||  |  |||| | |||||||| |  || |||||||||| ||  ||||| | |  |||||||    
T  27697825 tggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttgttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattc 27697924  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
      ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||     
T  27697925 attctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaaccaaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaa 27698024  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || |||||||   ||||||||  || || | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  27698025 aaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaattgatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 27698124  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  27698125 taag 27698128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26803489 - 26803102
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||    
T  26803489 accaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataat 26803390  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||| ||||||| |||||   |||||||    ||||||  |  |||| ||| ||| || |  || |||||||||||||  ||||| |||  |||||||    
T  26803389 tggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattc 26803290  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  26803289 tctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccat 26803190  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||| || || ||| || || || |||||||||||    
T  26803189 aaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggta 26803102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Original strand, 27676759 - 27677146
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||  |    
T  27676759 accaatcgagtcttccagccaaagcctctagctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttatttt 27676858  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaa-tttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     | |||||| || ||||||  ||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || | |||||||| |||||  |||||   |  |||| |    
T  27676859 aggaattccttcgctaacacttcctaactta-atttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaact 27676957  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  27676958 ctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatccca 27677057  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| || |  ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  27677058 taaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27679993 - 27679606
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  27679993 accaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgcttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgac 27679894  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||   | |||      |||| |||||||||| |  || ||||||| |||||  ||||| |||  |||||||    
T  27679893 tggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttgtttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattc 27679794  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||    
T  27679793 tctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaacaaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccat 27679694  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    ||| ||| |||||  ||||| |||| || || ||||  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  27679693 aaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Original strand, 27426751 - 27427138
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||    
T  27426751 accaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgat 27426850  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||    
T  27426851 tgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaatt 27426949  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    ||||||||| |  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | |||    
T  27426950 ctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatccca 27427049  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  27427050 taaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27427138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 393
Target Start/End: Original strand, 27705586 - 27705930
Alignment:
Q  49 gtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattta 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || ||| ||||||| |||||   |||||||    ||| ||  |    
T  27705586 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatcca 27705685  T
Q  149 actgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcag 248  Q
      |||| ||| ||| || |  || |||||||||||||  | ||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  27705686 gttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcag 27705785  T
Q  249 caacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaag 348  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  |||||    
T  27705786 caacaaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaag 27705885  T
Q  349 aagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    |||  |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  27705886 aagtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27705930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26824862 - 26824464
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||||   |||||| || || |||||    
T  26824862 accaatcaaatcctccagccaaagcatctagttgctccagtttgtcaatgtcatcgagaatcagaagaactttctttctgcgtagtctatcttttatgat 26824763  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    |  ||| || | ||||||| |||||||||||   |    |  || |||| |||||||||| |  || ||||||| || ||    ||  | |  |||||||    
T  26824762 ttgaataccttgactaacacctcctaacttaatttcttctccaattgtttttaaaaggagttgctcttggagattttccaagccatgcttagctgaattc 26824663  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| || || | ||||||||| |    |||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |    
T  26824662 tctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctccaataccgt 26824563  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||  | || ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26824562 aaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttggcaacat 26824464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511564
Alignment:
Q  347 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaagaaaacatgattgat 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgat 25511564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26937866 - 26937790
Alignment:
Q  212 acattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacc 288  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26937866 acattatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 281
Target Start/End: Original strand, 28097775 - 28097857
Alignment:
Q  199 tgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 281  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28097775 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28326521 - 28326391
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||     || |||| ||| |||||    
T  28326521 accaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgat 28326422  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaactta 136  Q
    || || ||| ||| | |||||||||||||||    
T  28326421 tggaactccatcattgacatctcctaactta 28326391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28504157 - 28504027
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||     || |||| ||| |||||    
T  28504157 accaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcgagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgat 28504058  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaactta 136  Q
    || || ||| ||| | |||||||||||||||    
T  28504057 tggaactccatcattgacatctcctaactta 28504027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  235 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 300  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26724419 - 26724349
Alignment:
Q  198 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgct 268  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26724419 ttgaattttctctcacattgtgaaggaaacacaacccttcaaattgatcagcaatcaaatcataaactgct 26724349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26950593 - 26950511
Alignment:
Q  199 tgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 281  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  26950593 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatttgcattcaaattgattagcaatcaagttataaactgcttgagcaagtgttg 26950511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 29477204 - 29477258
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatc 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  29477204 accaatcaagtcctccagccaaagcctccatttgctctagtctgtccacatcatc 29477258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26975765 - 26975700
Alignment:
Q  235 ttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 300  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  26975765 ttcaaattgattagcaatcaaattataaactgcttgagcaagtgttgtcttacccattcccccagt 26975700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28182161 - 28182084
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttc 83  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |  |||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28182161 accaatcaattcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatctagaatcaatagaaccttctttc 28182084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 28490718 - 28490771
Alignment:
Q  29 gcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttt 82  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28490718 gcctctaattgctccaaattgtcaacatcatctagaagcaaaagaatcttcttt 28490771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 29803128 - 29803181
Alignment:
Q  29 gcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttt 82  Q
    |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29803128 gcctctaattgctccaaattgtcaacatcatctagaagcaaaagaatcttcttt 29803181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28243626 - 28243538
Alignment:
Q  218 tgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 306  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28243626 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28243538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 28126814 - 28127231
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  || |||||    
T  28126814 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgat 28126913  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||  ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||   || ||||| ||    
T  28126914 tgcaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaactgttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatc 28127013  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||  |  ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28127014 tctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccat 28127113  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||| || | ||  |||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  28127114 aaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatg 28127213  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    |||||||||| |||||||    
T  28127214 taagaaaacacgattgat 28127231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 423
Target Start/End: Original strand, 28163515 - 28163931
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||  || |||||    
T  28163515 accaatcgagtcctccagccaaagcctccagctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgat 28163614  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||  || | || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  ||     || ||||||||    
T  28163615 tgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaactgtt-tcaaaaagagctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattc 28163713  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||  |  ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28163714 tctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcat 28163813  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||| || | | || ||||| |||||||| ||||| || ||||     
T  28163814 aaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaagcaatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatg 28163913  T
Q  406 taagaaaacatgattgat 423  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  28163914 taaaaaaacacgattgat 28163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Original strand, 267525 - 267882
Alignment:
Q  52 aacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaact 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||   | ||||  |  |    
T  267525 aacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagtt 267624  T
Q  152 gttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagttta-ttatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagca 250  Q
    ||| |||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  267625 gtttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagct-gaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagca 267723  T
Q  251 acaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaa 350  Q
    | ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| || || |||||||    
T  267724 ataaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaa 267823  T
Q  351 gcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatttaag 409  Q
    ||||||||||||||| || | | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  267824 gcaatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatgtaag 267882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 18698535 - 18698938
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||       
T  18698535 accaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatata 18698634  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |   | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||    
T  18698635 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattc 18698734  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18698735 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccat 18698834  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||     
T  18698835 aaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagcgctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 18698934  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  18698935 taag 18698938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Original strand, 18730639 - 18731026
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||       
T  18730639 accaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatata 18730738  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |   | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||    
T  18730739 gggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattc 18730838  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18730839 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccat 18730938  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    ||||||||| |||||||||  || | | ||| || || ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18730939 aaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18731026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 18678695 - 18679098
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  || || ||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||       
T  18678695 accaatcacgtcctccggccaaagcatgcagttgttccaaattgtgcacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatata 18678794  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |  || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||    
T  18678795 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattc 18678894  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  18678895 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccat 18678994  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||| |  |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||     
T  18678995 aaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 18679094  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  18679095 taag 18679098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Original strand, 18654612 - 18654999
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||       
T  18654612 accaatcacgtcctccagccaaagcatgcagtggttccaaattgtccacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatata 18654711  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||   |||| |  || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  ||||||     
T  18654712 aggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattt 18654811  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18654812 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaatacaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccat 18654911  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    ||||||||| |||||||||  || | ||||| || || ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18654912 aaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Original strand, 18723220 - 18723607
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  || || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| ||       
T  18723220 accaatcaggtcctccagccaaagcatgcagttgtttcaaattgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatata 18723319  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | ||||| |||||||||| ||||||| |||   |||| |  || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||   |  |||||||    
T  18723320 aggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattc 18723419  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| || || | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18723420 tctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccat 18723519  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    ||||||||| |||||||||  || | | ||| || || ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18723520 aaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18074804 - 18074417
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||    
T  18074804 accaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgat 18074705  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||    
T  18074704 tgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaatt 18074606  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    ||||||||| |  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | |||    
T  18074605 ctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatccca 18074506  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18074505 taaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 18074417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 129
Target Start/End: Original strand, 5090089 - 5090212
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||| ||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||| |||| ||| |||||    
T  5090089 accaatcaggttctccggccaaaacctgtagttgtttcagtttgtcaatatcatcgagaatcaaaagaactttctttctttgtagccttttctttatgat 5090188  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcc 129  Q
    || |||||||||||| | ||||||    
T  5090189 tggaattccctcactgatatctcc 5090212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 306
Target Start/End: Original strand, 5090284 - 5090392
Alignment:
Q  198 ttgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcc 297  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  | ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5090284 ttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcctcc 5090383  T
Q  298 agtaccata 306  Q
    ||| |||||    
T  5090384 agtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 3851 - 4254
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |   || |||||||| ||       
T  3851 accaatcaggttctcctgccaaagcctgtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatg 3950  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| || || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  ||||||    
T  3951 agaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaatt 4049  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4050 ctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtacca 4149  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||| || |  ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  4150 taaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 4249  T
Q  405 ttaag 409  Q
     ||||    
T  4250 gtaag 4254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 12814 - 13217
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||       
T  12814 accaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatata 12913  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | ||||||||||||||||  ||||||||||   |||  || || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||    
T  12914 aggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattc 13013  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13014 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 13113  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |  ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  13114 aaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 13213  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  13214 taag 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8530 - 8127
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||| ||       
T  8530 accaatcaggtcctcctgccaaagcatgtagttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatata 8431  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
     | ||||||||||||||||  ||||||||||   |||  || || |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   |  |||||||    
T  8430 aggaattccctcactaacacttcctaacttagttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattc 8331  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8330 tctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccat 8231  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |  ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  8230 aaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 8131  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  8130 taag 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 2678 - 3081
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||       
T  2678 accaatcaggtcctccagccaaagcatgtagttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatata 2777  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaattt-aactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
     | |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||| || || |||| |||||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||   |  ||||||    
T  2778 aggaattccctcactaacacctccaaacttaat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaatt 2876  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2877 ctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtacca 2976  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacat 404  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||  |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  2977 taaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacat 3076  T
Q  405 ttaag 409  Q
     ||||    
T  3077 gtaag 3081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 29272977 - 29273380
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||| || ||    
T  29272977 accaatcatgtcctccagccaaagcatgtagttgcttcaaattatcaacatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataat 29273076  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaattc 205  Q
    || ||| |||||||||||||   ||||||||   | ||||  |  |||| |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||| | |  |||||||    
T  29273077 tggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatccagttgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattc 29273176  T
Q  206 tctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccat 305  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  29273177 tctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaaaaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccat 29273276  T
Q  306 aaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggtatttggctacatt 405  Q
    ||| ||| |||||  ||| | |||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  29273277 aaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaagaagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatg 29273376  T
Q  406 taag 409  Q
    ||||    
T  29273377 taag 29273380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35984341 - 35984274
Alignment:
Q  7 ccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaa 74  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35984341 ccaatcaaaccctccaaccaaggcctctagctgttctattttgtcaacatcatctagaatcaaaagaa 35984274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 60612 - 60225
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||    
T  60612 accaatcaactcctccagccaaagcattcagttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgat 60513  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactgttcttaaaaggag-atcttcctggagatgtttcagtttattatgacttgaatt 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||| || || |||  || ||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||   |  ||||||    
T  60512 tgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatct-cctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaatt 60414  T
Q  205 ctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtacca 304  Q
    ||||||||| |  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | |||    
T  60413 ctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatccca 60314  T
Q  305 taaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccttgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaacccaacagggta 393  Q
    |||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  ||||  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  60313 taaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 60225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3280509 - 3280410
Alignment:
Q  199 tgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 298  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  3280509 tgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16691717 - 16691618
Alignment:
Q  199 tgaattctctctgacattatgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 298  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||||    
T  16691717 tgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 57433 - 57563
Alignment:
Q  6 accaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| | || ||||||||| |||||||| | || ||||||||     || |||| ||| |||||    
T  57433 accaatcaagtcctccagccaaaacctgtaattgcttcagctcgtgaacatcatcgagaatcaacaaaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgat 57532  T
Q  106 tgaaattccctcactaacatctcctaactta 136  Q
    || |||||||||  | |||||| ||||||||    
T  57533 tggaattccctcgttgacatctactaactta 57563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43788 - 43700
Alignment:
Q  218 tgaagaaaacataccctttcaaattgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 306  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  43788 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University