View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6868A_low_295 (Length: 229)

Name: NF6868A_low_295
Description: NF6868A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6868A_low_295
NF6868A_low_295
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (3-229)||(34056793-34057019)
chr5 (3-229)||(21670712-21670938)
chr5 (3-229)||(19468832-19469058)
chr5 (3-228)||(17452488-17452713)
chr5 (3-229)||(6980665-6980891)
chr5 (3-229)||(27048012-27048238)
chr5 (3-229)||(13529087-13529313)
chr5 (3-229)||(14034902-14035128)
chr5 (3-229)||(14452787-14453013)
chr5 (3-229)||(14563828-14564054)
chr5 (3-229)||(20556607-20556833)
chr5 (3-229)||(22680976-22681202)
chr5 (3-229)||(23301137-23301363)
chr5 (3-229)||(24571932-24572158)
chr5 (3-229)||(24822651-24822877)
chr5 (3-229)||(24942365-24942591)
chr5 (3-229)||(27465022-27465248)
chr5 (3-229)||(34776756-34776982)
chr5 (3-229)||(39496662-39496888)
chr5 (3-229)||(1117077-1117303)
chr5 (3-229)||(9340815-9341041)
chr5 (3-229)||(15999071-15999297)
chr5 (3-229)||(17723778-17724004)
chr5 (3-229)||(22151376-22151602)
chr5 (3-229)||(23366796-23367022)
chr5 (3-229)||(23701640-23701866)
chr5 (3-229)||(24812773-24812999)
chr5 (3-229)||(30233201-30233427)
chr5 (3-229)||(35220363-35220589)
chr5 (3-229)||(36692558-36692784)
chr5 (3-229)||(37735742-37735968)
chr5 (3-229)||(42047640-42047866)
chr5 (3-229)||(15744829-15745055)
chr5 (3-229)||(17611922-17612148)
chr5 (3-229)||(31353394-31353620)
chr5 (3-229)||(39357356-39357582)
chr5 (3-229)||(5296317-5296543)
chr5 (3-229)||(23483977-23484203)
chr5 (3-229)||(27617947-27618173)
chr5 (3-229)||(31838340-31838566)
chr5 (3-229)||(40395222-40395448)
chr5 (3-229)||(20784905-20785131)
chr5 (3-229)||(36588292-36588518)
chr5 (3-229)||(23400771-23400997)
chr5 (3-151)||(5604796-5604944)
chr5 (3-78)||(21203721-21203796)
chr5 (1-130)||(24416833-24416962)
chr5 (1-130)||(30450246-30450375)
chr5 (14-148)||(15326397-15326531)
chr5 (14-148)||(18712238-18712372)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (3-229)||(13266395-13266621)
chr3 (7-229)||(9000530-9000752)
chr3 (3-229)||(11210831-11211057)
chr3 (3-228)||(17900826-17901051)
chr3 (3-229)||(1788608-1788835)
chr3 (3-229)||(4429052-4429278)
chr3 (3-229)||(15655778-15656004)
chr3 (3-229)||(1059454-1059680)
chr3 (3-229)||(4749593-4749819)
chr3 (3-229)||(5584370-5584596)
chr3 (3-229)||(5870433-5870659)
chr3 (3-229)||(7799358-7799584)
chr3 (3-229)||(8780537-8780763)
chr3 (3-229)||(12242296-12242522)
chr3 (3-229)||(19784296-19784522)
chr3 (3-229)||(24388255-24388481)
chr3 (3-229)||(29938291-29938517)
chr3 (3-229)||(29987445-29987671)
chr3 (3-229)||(41689523-41689749)
chr3 (3-229)||(508907-509133)
chr3 (3-229)||(6214798-6215024)
chr3 (3-229)||(9986624-9986850)
chr3 (3-229)||(11277122-11277348)
chr3 (3-229)||(12290926-12291152)
chr3 (3-229)||(13145008-13145234)
chr3 (3-229)||(14471495-14471721)
chr3 (3-229)||(16395784-16396010)
chr3 (3-229)||(20677934-20678160)
chr3 (3-229)||(29465942-29466168)
chr3 (3-229)||(38200526-38200752)
chr3 (3-229)||(39377958-39378184)
chr3 (3-229)||(5198975-5199201)
chr3 (3-229)||(5541758-5541984)
chr3 (3-229)||(9385320-9385546)
chr3 (3-229)||(10631560-10631786)
chr3 (3-229)||(13127565-13127791)
chr3 (3-229)||(15839096-15839322)
chr3 (3-229)||(24665744-24665970)
chr3 (3-229)||(28318975-28319201)
chr3 (3-229)||(37872335-37872561)
chr3 (3-229)||(37880853-37881079)
chr3 (3-229)||(5516547-5516773)
chr3 (3-229)||(13377404-13377630)
chr3 (3-229)||(13387998-13388224)
chr3 (3-229)||(23763168-23763394)
chr3 (3-229)||(6495081-6495307)
chr3 (3-229)||(18126458-18126684)
chr3 (3-229)||(17999527-17999753)
chr3 (4-229)||(16439075-16439299)
chr3 (3-229)||(14970515-14970741)
chr3 (3-229)||(17249499-17249723)
chr3 (3-229)||(18703282-18703508)
chr3 (40-229)||(11186246-11186435)
chr3 (7-229)||(20765986-20766207)
chr3 (3-151)||(48982899-48983047)
chr3 (3-46)||(17013241-17013284)
chr3 (3-32)||(11186430-11186459)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (3-229)||(26872796-26873022)
chr2 (3-229)||(28726074-28726300)
chr2 (3-229)||(39174851-39175077)
chr2 (3-229)||(10272816-10273042)
chr2 (3-229)||(22746102-22746328)
chr2 (3-229)||(24332506-24332732)
chr2 (3-229)||(29250050-29250276)
chr2 (3-228)||(22777082-22777307)
chr2 (3-229)||(9767520-9767746)
chr2 (3-229)||(9902330-9902556)
chr2 (3-229)||(11399929-11400155)
chr2 (3-229)||(19307176-19307402)
chr2 (3-229)||(21125699-21125925)
chr2 (3-229)||(21166704-21166930)
chr2 (3-229)||(27227268-27227494)
chr2 (3-229)||(34794974-34795200)
chr2 (3-229)||(35258834-35259060)
chr2 (3-229)||(35269459-35269685)
chr2 (3-229)||(40246438-40246664)
chr2 (3-229)||(43088527-43088753)
chr2 (3-229)||(22938414-22938640)
chr2 (3-229)||(43351232-43351458)
chr2 (3-229)||(4215725-4215951)
chr2 (3-229)||(28705966-28706192)
chr2 (3-223)||(24721161-24721381)
chr2 (3-229)||(24809131-24809357)
chr2 (3-106)||(24419783-24419886)
chr2 (3-151)||(1795181-1795329)
chr2 (192-229)||(24419891-24419928)
chr2 (99-133)||(10835151-10835185)
chr2 (68-213)||(26705578-26705723)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (3-229)||(16742547-16742773)
chr8 (3-229)||(19230653-19230879)
chr8 (3-229)||(19424200-19424426)
chr8 (3-229)||(36083796-36084022)
chr8 (3-229)||(44486989-44487215)
chr8 (3-229)||(3353407-3353633)
chr8 (3-229)||(6156941-6157167)
chr8 (3-229)||(9346973-9347199)
chr8 (3-229)||(13693342-13693568)
chr8 (3-229)||(19134555-19134781)
chr8 (3-229)||(25678760-25678986)
chr8 (3-229)||(29082266-29082492)
chr8 (3-229)||(36298801-36299027)
chr8 (3-229)||(247683-247909)
chr8 (3-229)||(810803-811029)
chr8 (3-229)||(21294174-21294400)
chr8 (3-229)||(30319477-30319703)
chr8 (3-229)||(32082468-32082694)
chr8 (3-229)||(15785482-15785708)
chr8 (3-229)||(19934985-19935211)
chr8 (8-229)||(22668933-22669154)
chr8 (7-229)||(17293364-17293586)
chr8 (3-229)||(22465915-22466141)
chr8 (3-229)||(24650772-24650997)
chr8 (3-228)||(20376593-20376809)
chr8 (8-229)||(16400618-16400839)
chr8 (3-223)||(18159915-18160135)
chr8 (14-148)||(45494835-45494969)
chr8 (1-130)||(20748624-20748753)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (3-229)||(15201544-15201770)
chr4 (3-229)||(16311000-16311226)
chr4 (3-229)||(14840798-14841024)
chr4 (3-229)||(10745339-10745565)
chr4 (3-229)||(10959108-10959334)
chr4 (3-229)||(36024179-36024405)
chr4 (3-229)||(49513424-49513650)
chr4 (3-229)||(55749993-55750219)
chr4 (3-229)||(10296559-10296785)
chr4 (3-229)||(16261753-16261979)
chr4 (3-229)||(24646219-24646445)
chr4 (3-229)||(27171955-27172181)
chr4 (3-229)||(27662500-27662726)
chr4 (3-229)||(456450-456676)
chr4 (3-229)||(4992536-4992762)
chr4 (3-229)||(5018025-5018251)
chr4 (3-229)||(17923986-17924212)
chr4 (3-229)||(19949136-19949362)
chr4 (3-229)||(27819672-27819898)
chr4 (3-229)||(30931234-30931460)
chr4 (3-229)||(14907790-14908016)
chr4 (3-229)||(18757231-18757457)
chr4 (3-229)||(40461486-40461712)
chr4 (3-229)||(16849879-16850105)
chr4 (3-229)||(22002305-22002531)
chr4 (87-229)||(15467148-15467290)
chr4 (3-118)||(39530924-39531039)
chr4 (4-84)||(14008592-14008672)
chr4 (1-130)||(26816494-26816623)
chr4 (1-130)||(54695430-54695559)
chr4 (14-148)||(14936543-14936677)
chr4 (3-123)||(11534406-11534526)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (3-229)||(18829057-18829283)
chr6 (3-229)||(20034672-20034898)
chr6 (3-229)||(25793542-25793768)
chr6 (3-229)||(4636754-4636980)
chr6 (3-229)||(9117239-9117465)
chr6 (3-229)||(12721583-12721809)
chr6 (3-229)||(26031248-26031474)
chr6 (3-229)||(27347573-27347799)
chr6 (3-229)||(27408313-27408539)
chr6 (3-229)||(32305793-32306019)
chr6 (3-229)||(3667254-3667480)
chr6 (3-229)||(11255335-11255561)
chr6 (3-229)||(12860759-12860985)
chr6 (3-229)||(13919074-13919300)
chr6 (3-229)||(16954836-16955062)
chr6 (3-229)||(26039444-26039670)
chr6 (3-229)||(26870630-26870856)
chr6 (3-229)||(32966693-32966919)
chr6 (3-229)||(34811910-34812136)
chr6 (3-229)||(25681728-25681954)
chr6 (3-229)||(27378620-27378846)
chr6 (3-229)||(27469003-27469229)
chr6 (3-229)||(27499532-27499758)
chr6 (7-229)||(22381862-22382084)
chr6 (3-229)||(16882000-16882226)
chr6 (3-213)||(19956630-19956840)
chr6 (3-229)||(14058114-14058339)
chr6 (3-229)||(14064243-14064468)
chr6 (3-163)||(17613259-17613419)
chr6 (3-229)||(19445692-19445918)
chr6 (3-171)||(22810771-22810939)
chr6 (99-229)||(1656606-1656736)
chr6 (108-229)||(18920359-18920480)
chr6 (90-229)||(17053277-17053416)
chr6 (124-216)||(14367089-14367181)
chr6 (105-187)||(14169919-14170001)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (3-229)||(7684967-7685193)
chr1 (3-229)||(3177417-3177643)
chr1 (3-229)||(51650656-51650882)
chr1 (3-229)||(5644487-5644713)
chr1 (3-229)||(5839020-5839246)
chr1 (3-229)||(7513090-7513316)
chr1 (3-229)||(7694253-7694479)
chr1 (3-229)||(12617935-12618161)
chr1 (3-229)||(12736344-12736570)
chr1 (3-229)||(21869479-21869705)
chr1 (3-229)||(35642820-35643046)
chr1 (3-229)||(36241213-36241439)
chr1 (3-229)||(38100901-38101127)
chr1 (3-229)||(47612715-47612941)
chr1 (7-229)||(21210510-21210732)
chr1 (3-229)||(4173118-4173344)
chr1 (3-229)||(19164434-19164660)
chr1 (3-217)||(21129081-21129295)
chr1 (3-229)||(22127306-22127532)
chr1 (3-229)||(17715712-17715938)
chr1 (50-229)||(20871952-20872131)
chr1 (3-208)||(23978343-23978548)
chr1 (140-229)||(22446506-22446594)
chr1 (140-229)||(22451740-22451828)
chr1 (3-46)||(22650725-22650768)
chr1 (56-136)||(14277687-14277767)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (3-229)||(37632-37858)
scaffold0047 (6-229)||(4255-4478)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (3-229)||(18434379-18434605)
chr7 (3-229)||(4217864-4218090)
chr7 (3-229)||(9165420-9165646)
chr7 (3-229)||(1993412-1993638)
chr7 (3-229)||(15882644-15882870)
chr7 (3-229)||(17954935-17955161)
chr7 (3-229)||(26394915-26395141)
chr7 (3-229)||(40046925-40047151)
chr7 (3-229)||(42871704-42871930)
chr7 (3-229)||(172746-172972)
chr7 (3-229)||(8006887-8007113)
chr7 (3-229)||(9091090-9091316)
chr7 (3-229)||(11011043-11011269)
chr7 (3-229)||(20985113-20985339)
chr7 (3-229)||(24739957-24740183)
chr7 (3-229)||(461807-462033)
chr7 (3-229)||(2710434-2710660)
chr7 (3-229)||(6872051-6872277)
chr7 (3-229)||(9439119-9439345)
chr7 (7-229)||(20998244-20998466)
chr7 (3-229)||(26658156-26658382)
chr7 (3-229)||(22094997-22095223)
chr7 (3-227)||(13662324-13662548)
chr7 (3-229)||(8623219-8623446)
chr7 (4-229)||(13125778-13126003)
chr7 (3-225)||(16314291-16314513)
chr7 (3-228)||(14141759-14141984)
chr7 (3-229)||(4416815-4417041)
chr7 (3-228)||(10652695-10652922)
chr7 (3-229)||(16157922-16158148)
chr7 (3-50)||(25206050-25206097)
chr7 (1-133)||(15179739-15179871)
chr7 (177-227)||(4824767-4824817)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (3-229)||(36990-37216)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-229)||(47715-47941)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (3-229)||(12980-13206)
[»] scaffold0382 (3 HSPs)
scaffold0382 (3-229)||(6063-6289)
scaffold0382 (3-229)||(758-984)
scaffold0382 (87-229)||(11405-11547)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (3-229)||(21641-21867)
scaffold0185 (178-229)||(14913-14964)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (3-229)||(41732-41958)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (3-229)||(47921-48147)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (3-229)||(9738-9964)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (3-229)||(2215-2441)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (3-229)||(4446-4672)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (3-229)||(29560-29786)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (3-229)||(5439-5665)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (3-229)||(3989-4215)
scaffold0004 (7-229)||(6545-6767)
scaffold0004 (3-169)||(11206-11372)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-229)||(45260-45488)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (7-203)||(117073-117269)
scaffold0035 (7-203)||(108572-108768)
[»] scaffold0497 (2 HSPs)
scaffold0497 (3-198)||(103-298)
scaffold0497 (192-229)||(1609-1646)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (3-229)||(6606-6832)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (3-227)||(10738-10962)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (11-229)||(10295-10513)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (3-229)||(4282-4508)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (3-229)||(12548-12774)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (3-217)||(26308-26521)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (3-229)||(1021-1247)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (3-229)||(74161-74387)
scaffold0037 (147-229)||(86351-86433)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (3-229)||(1075-1301)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-227)||(43258-43482)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (3-229)||(7944-8169)
[»] scaffold1578 (1 HSPs)
scaffold1578 (35-229)||(1119-1315)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (3-166)||(22742-22905)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (4-229)||(4279-4504)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (3-212)||(10705-10914)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (74-229)||(129487-129642)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (3-145)||(3204-3346)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (3-223)||(33960-34177)
scaffold0001 (3-223)||(39267-39484)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (116-229)||(21228-21341)
scaffold0161 (3-112)||(14616-14725)
scaffold0161 (3-112)||(19289-19398)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (26-211)||(5589-5787)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-130)||(99944-100073)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (1-130)||(6897-7026)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (3-56)||(30175-30228)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (158-229)||(160521-160592)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-67)||(30531-30597)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-67)||(84215-84281)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 34056793 - 34057019
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34056793 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 34056892  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  34056893 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaat 34056992  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34056993 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 34057019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 21670712 - 21670938
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  21670712 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 21670811  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21670812 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 21670911  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21670912 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 21670938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19468832 - 19469058
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19468832 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 19468931  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19468932 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 19469031  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19469032 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 19469058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17452713 - 17452488
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17452713 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 17452614  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  17452613 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcgggttacttttatcctatgcagttaatcttgacataatattatatcaaat 17452514  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17452513 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 17452488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6980665 - 6980891
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6980665 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 6980764  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  6980765 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatatcaaat 6980864  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6980865 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 6980891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27048238 - 27048012
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27048238 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaagactacagtcaacaagaag 27048139  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27048138 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27048039  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27048038 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27048012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13529313 - 13529087
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  13529313 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggggaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 13529214  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13529213 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13529114  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13529113 ggatgtcaatagtgcatttcttaatgg 13529087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14034902 - 14035128
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  14034902 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 14035001  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14035002 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 14035101  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14035102 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 14035128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14453013 - 14452787
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  14453013 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 14452914  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14452913 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 14452814  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14452813 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 14452787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14564054 - 14563828
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  14564054 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 14563955  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14563954 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 14563855  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14563854 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 14563828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 20556607 - 20556833
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20556607 attggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 20556706  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20556707 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagtaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 20556806  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20556807 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 20556833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22680976 - 22681202
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22680976 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22681075  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22681076 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22681175  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22681176 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 22681202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 23301137 - 23301363
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  23301137 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 23301236  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23301237 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23301336  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23301337 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 23301363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24571932 - 24572158
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24571932 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24572031  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24572032 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24572131  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24572132 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24572158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24822877 - 24822651
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24822877 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24822778  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24822777 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24822678  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24822677 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24822651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24942591 - 24942365
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24942591 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 24942492  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24942491 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24942392  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24942391 ggatgtcaaaagtgtttttcttaatgg 24942365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 27465022 - 27465248
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27465022 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27465121  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27465122 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27465221  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27465222 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27465248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 34776756 - 34776982
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  34776756 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 34776855  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  34776856 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 34776955  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34776956 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 34776982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39496888 - 39496662
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  39496888 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 39496789  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  39496788 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 39496689  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39496688 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 39496662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1117303 - 1117077
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  1117303 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 1117204  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  1117203 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaattaatcatggcataatactatatcaaat 1117104  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1117103 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 1117077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9340815 - 9341041
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9340815 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9340914  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9340915 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9341014  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9341015 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 9341041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15999297 - 15999071
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15999297 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 15999198  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15999197 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 15999098  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15999097 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 15999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 17723778 - 17724004
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  17723778 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 17723877  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  17723878 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatatcaaat 17723977  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17723978 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 17724004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22151376 - 22151602
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22151376 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22151475  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22151476 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22151575  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22151576 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 22151602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 23366796 - 23367022
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  23366796 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 23366895  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23366896 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23366995  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23366996 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 23367022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 23701640 - 23701866
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  23701640 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 23701739  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23701740 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23701839  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23701840 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 23701866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24812773 - 24812999
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24812773 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24812872  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24812873 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24812972  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24812973 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 24812999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30233427 - 30233201
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  30233427 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 30233328  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  30233327 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 30233228  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30233227 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 30233201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 35220363 - 35220589
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  35220363 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 35220462  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  35220463 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 35220562  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35220563 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 35220589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 36692558 - 36692784
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||     
T  36692558 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaat 36692657  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36692658 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36692757  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36692758 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 36692784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37735968 - 37735742
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  37735968 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 37735869  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37735868 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 37735769  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37735768 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 37735742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 42047640 - 42047866
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  42047640 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 42047739  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  42047740 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 42047839  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42047840 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 42047866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 15744829 - 15745055
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15744829 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 15744928  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15744929 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaaaattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 15745028  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15745029 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 15745055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 17611922 - 17612148
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  17611922 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 17612021  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17612022 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 17612121  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17612122 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 17612148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 31353394 - 31353620
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  31353394 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 31353493  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  31353494 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 31353593  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31353594 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 31353620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 39357356 - 39357582
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  39357356 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 39357455  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  39357456 gcattgattacactgaaacatttgttccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 39357555  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39357556 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatgg 39357582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5296543 - 5296317
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5296543 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5296444  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  5296443 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 5296344  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5296343 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 5296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23484203 - 23483977
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  23484203 attggtacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgtggcacaaggttacagtcaacaagaag 23484104  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23484103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23484004  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23484003 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 23483977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27618173 - 27617947
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27618173 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27618074  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27618073 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcgtacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27617974  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27617973 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 27617947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 31838340 - 31838566
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  31838340 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 31838439  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  || || |||||||||||    
T  31838440 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggaataatattatatcaaat 31838539  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31838540 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 31838566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 40395222 - 40395448
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  40395222 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 40395321  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  40395322 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 40395421  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| || ||||  |||||||||||    
T  40395422 ggatgttaaaagtgtctttcttaatgg 40395448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 20784905 - 20785131
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||    
T  20784905 attggaacaaaatgggtattcagaaagaagctgaatgaagaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaagaagaag 20785004  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  20785005 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatagtatatcaaat 20785104  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20785105 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 20785131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36588518 - 36588292
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||    
T  36588518 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaacgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacaatcaacaagaag 36588419  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36588418 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36588319  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36588318 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 36588292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 23400771 - 23400997
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23400771 attggaacaaaatggatattcagaaacaagctaaatgaacaaggagaaataaccataaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 23400870  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23400871 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaaaaaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23400970  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23400971 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 23400997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 5604796 - 5604944
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  5604796 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 5604895  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 151  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  5604896 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 5604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Original strand, 21203721 - 21203796
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttg 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21203721 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtaaagtagtcagaaacaaagctagacttgttg 21203796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 24416833 - 24416962
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  24416833 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagtcatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 24416932  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  24416933 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 24416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30450375 - 30450246
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  30450375 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 30450276  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  30450275 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 30450246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15326531 - 15326397
Alignment:
Q  14 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 113  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  15326531 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtgactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 15326432  T
Q  114 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 148  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  15326431 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 15326397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 18712238 - 18712372
Alignment:
Q  14 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 113  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  18712238 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtgactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 18712337  T
Q  114 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 148  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  18712338 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 18712372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 13266395 - 13266621
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13266395 attggaacaaaatgtgtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctaaacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 13266494  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13266495 gcattgattacactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcggttaatcatgacataatattatatcaaat 13266594  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13266595 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 13266621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 9000530 - 9000752
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  9000530 gaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcat 9000629  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  9000630 tgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggat 9000729  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9000730 gtcaagagtgcttttcttaatgg 9000752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 11210831 - 11211057
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11210831 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaggctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 11210930  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  || || |||||||||||    
T  11210931 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggtataatattatatcaaat 11211030  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11211031 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 17900826 - 17901051
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17900826 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 17900925  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17900926 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 17901025  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17901026 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 17901051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 1788608 - 1788835
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaacca-gaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1788608 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaa 1788707  T
Q  102 ggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaa 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  1788708 gacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaa 1788807  T
Q  202 tggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1788808 tggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 1788835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4429278 - 4429052
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4429278 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagttagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 4429179  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4429178 gcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 4429079  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4429078 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 4429052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 15655778 - 15656004
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15655778 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 15655877  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15655878 gtattaattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 15655977  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15655978 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 15656004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1059680 - 1059454
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  1059680 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 1059581  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1059580 gcattgattacactgagatatttgctgcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 1059481  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1059480 ggatatcaagagtgcttttcttaatgg 1059454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4749819 - 4749593
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4749819 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 4749720  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4749719 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 4749620  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4749619 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 4749593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 5584370 - 5584596
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5584370 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5584469  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5584470 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5584569  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5584570 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 5584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 5870433 - 5870659
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5870433 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5870532  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5870533 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5870632  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5870633 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 5870659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 7799358 - 7799584
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7799358 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaagagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 7799457  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  7799458 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagactggaagcaatcaggttacttctatcatatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 7799557  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7799558 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 7799584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8780763 - 8780537
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  8780763 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 8780664  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  8780663 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 8780564  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8780563 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 8780537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12242296 - 12242522
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12242296 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 12242395  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12242396 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12242495  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12242496 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 12242522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19784522 - 19784296
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  19784522 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 19784423  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19784422 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 19784323  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19784322 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 19784296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24388255 - 24388481
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24388255 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24388354  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24388355 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24388454  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24388455 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24388481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 29938291 - 29938517
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29938291 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 29938390  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | || |||||||||||    
T  29938391 gcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatatcaaat 29938490  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29938491 ggatgtgaagagcgcttttcttaatgg 29938517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 29987445 - 29987671
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29987445 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 29987544  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | || |||||||||||    
T  29987545 gcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatatcaaat 29987644  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29987645 ggatgtgaagagcgcttttcttaatgg 29987671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41689749 - 41689523
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  41689749 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 41689650  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  41689649 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 41689550  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41689549 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 41689523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 508907 - 509133
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  508907 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 509006  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  509007 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 509106  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  509107 ggatatcaaaagtgcttttcttaatgg 509133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6214798 - 6215024
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6214798 attggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 6214897  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6214898 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 6214997  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6214998 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 6215024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9986624 - 9986850
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9986624 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9986723  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9986724 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9986823  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9986824 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 9986850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 11277122 - 11277348
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  11277122 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 11277221  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  11277222 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 11277321  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11277322 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 11277348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12290926 - 12291152
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12290926 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 12291025  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12291026 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12291125  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12291126 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 12291152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13145234 - 13145008
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13145234 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 13145135  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13145134 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagtttggaagcaattaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 13145035  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13145034 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 13145008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14471721 - 14471495
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  14471721 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 14471622  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14471621 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 14471522  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14471521 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 14471495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 16395784 - 16396010
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16395784 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 16395883  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16395884 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 16395983  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16395984 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatgg 16396010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 20677934 - 20678160
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  20677934 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 20678033  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20678034 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 20678133  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20678134 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 20678160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 29465942 - 29466168
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  29465942 attggaacaaaatgagtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 29466041  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29466042 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatgacataatattatatcaaat 29466141  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29466142 ggatgtcaaaagtgtttttcttaatgg 29466168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38200752 - 38200526
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  38200752 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 38200653  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  38200652 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 38200553  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38200552 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 38200526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39378184 - 39377958
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  39378184 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 39378085  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  39378084 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 39377985  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39377984 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 39377958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5199201 - 5198975
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||| |||||| ||||    
T  5199201 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaatccagacttcttgcacaaggttacaatcaacaagaag 5199102  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  5199101 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcgaat 5199002  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5199001 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 5198975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 5541758 - 5541984
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5541758 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 5541857  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5541858 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5541957  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5541958 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 5541984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9385320 - 9385546
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||    
T  9385320 attggaacaaaatgggttttcagaaacaagctgagtgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaacaaaaag 9385419  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  9385420 gcattgattacactgaaacatttgcttcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaattaatcatggcataatattatattaaat 9385519  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9385520 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 9385546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 10631560 - 10631786
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |    
T  10631560 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagagataaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagagg 10631659  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  10631660 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 10631759  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10631760 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 10631786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13127791 - 13127565
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13127791 attggaacaaaatgggtattcagaaagaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 13127692  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13127691 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13127592  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13127591 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 13127565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15839322 - 15839096
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15839322 attggaacaaaatgggtattcggaaacaagttgaatgaacaaggtcaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 15839223  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15839222 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaataaggttacttctatcctatgcagttaatcatgtcataatattatatcaaat 15839123  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  15839122 ggatgtcaagagtacatttcttaatgg 15839096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24665970 - 24665744
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24665970 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24665871  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||| || |||||||||||    
T  24665870 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcattgcataatattatatcaaat 24665771  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24665770 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24665744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 28318975 - 28319201
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  28318975 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 28319074  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  28319075 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 28319174  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28319175 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 28319201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37872561 - 37872335
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  37872561 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 37872462  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37872461 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 37872362  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  37872361 ggatgtcaaaaatgcctttcttaatgg 37872335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37881079 - 37880853
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  37881079 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 37880980  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37880979 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 37880880  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  37880879 ggatgtcaaaaatgcctttcttaatgg 37880853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5516773 - 5516547
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5516773 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5516674  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5516673 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagcttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5516574  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5516573 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 5516547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 13377404 - 13377630
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13377404 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaatgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 13377503  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13377504 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13377603  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13377604 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 13377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 13387998 - 13388224
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13387998 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaatgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 13388097  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13388098 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13388197  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13388198 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 13388224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23763394 - 23763168
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  23763394 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccaaacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 23763295  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23763294 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 23763195  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23763194 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 23763168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6495081 - 6495307
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6495081 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagatgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 6495180  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6495181 gcattgattatactgaaacatttgctccagtggcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 6495280  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6495281 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 6495307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 18126458 - 18126684
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18126458 attggaacaaaatgggtgttcagaaacaagttgaatgaacaaggtgatgtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaagattacagtcaacaagaag 18126557  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  18126558 acattgactacactgaaacatttactccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgtagttaatcacaacatactattatatcaaat 18126657  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18126658 ggatgtcaagaatgcatttcttaatgg 18126684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17999753 - 17999527
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||    
T  17999753 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagccaacaagaag 17999654  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| || || |||||||||||    
T  17999653 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcatgttacttctatcctatgcagtcaatcatgatataatattatatcaaat 17999554  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  17999553 ggatgttaagagtgcatttcttaatgg 17999527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 16439075 - 16439299
Alignment:
Q  4 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  16439075 ttggaacaaaatggatattcagaaacaagttgaatgaacaaggacaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaagg 16439174  T
Q  104 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||  || || || |||||||||    
T  16439175 cattggttacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggaataatattgtatcaaatg 16439274  T
Q  204 gatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  16439275 gatgtcaa-agtgcttttcttaatgg 16439299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14970741 - 14970515
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||    
T  14970741 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaagtgaagtagtcataaacaaagctagacttgttacacaaggttacagtcagcaagaag 14970642  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  14970641 gcattaattatactgaaacattttctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatatgaagttaatcataacataatattatatcaaat 14970542  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970541 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 14970515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 17249499 - 17249723
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  17249499 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaagt-gaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacggtcaacaagaag 17249597  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17249598 gcattaattacactaaaa-atttgctccagttgcaagattcgaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcatggcattattttatatcaaat 17249696  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||    
T  17249697 ggatgtcaagagtgcatatcttaatgg 17249723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 18703282 - 18703508
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||||||||| | |||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  18703282 attgaaacaaagtgggtgttcagaaacaagcttaatgaacagggagaagtagttagaaacaaaaccagacatgttgctcaaggatatagtcaacaagaag 18703381  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  18703382 gcattgattacactgaaacatttactccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacattatattatatcaaat 18703481  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18703482 ggatgttaagagtgcatttctcaatgg 18703508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11186435 - 11186246
Alignment:
Q  40 aacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatg 139  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || || || |    
T  11186435 aacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcattgactacattgaaacatttgtttcaatttcaag 11186336  T
Q  140 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11186335 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcataacataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttctcaatgg 11186246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 20765986 - 20766207
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||||| |||| |  |  ||||||||||| ||  | ||    
T  20765986 gaacaaaatgggtatttagaaacaagctcaatgaactaggagaagtagtcagaaacaa-gcaagacttattgctccgggttacagtcaacaagagagtat 20766084  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20766085 gtattacattgaaacatttgcttcagttgcaagattggaggcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggat 20766184  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  20766185 gttaagagtgcatttcttaatgg 20766207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 48982899 - 48983047
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  48982899 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 48982998  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 151  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  48982999 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 48983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 17013284 - 17013241
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17013284 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaagg 17013241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 11186459 - 11186430
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaag 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11186459 attggaacaaaatgggtattcagaaacaag 11186430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26873022 - 26872796
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  26873022 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcataaggatacagtcaacaagaag 26872923  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26872922 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 26872823  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26872822 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 26872796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 28726074 - 28726300
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28726074 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 28726173  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  28726174 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatgacataatattatatcaaat 28726273  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28726274 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 28726300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 39174851 - 39175077
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  39174851 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 39174950  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  39174951 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatatcaaat 39175050  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39175051 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 39175077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10273042 - 10272816
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  10273042 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 10272943  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10272942 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 10272843  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10272842 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 10272816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22746102 - 22746328
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  22746102 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacagggatacagtcaacaagaag 22746201  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22746202 gcattgattacactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagctatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 22746301  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22746302 ggatgtcaagagtgcttttcgtaatgg 22746328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24332506 - 24332732
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24332506 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaggaag 24332605  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24332606 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24332705  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24332706 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 24332732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29250276 - 29250050
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  29250276 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 29250177  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  29250176 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 29250077  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29250076 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 29250050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22777307 - 22777082
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22777307 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 22777208  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | || |||||||||||    
T  22777207 gcattgactacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatatcaaat 22777108  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    
T  22777107 ggatgtcaagagcgcctttcttaatg 22777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9767520 - 9767746
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9767520 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9767619  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9767620 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9767719  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9767720 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 9767746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9902330 - 9902556
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9902330 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9902429  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9902430 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9902529  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9902530 ggatgtcaaaagtgtttttcttaatgg 9902556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 11399929 - 11400155
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  11399929 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 11400028  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  11400029 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 11400128  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11400129 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 11400155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19307176 - 19307402
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  19307176 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 19307275  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19307276 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 19307375  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19307376 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 19307402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 21125699 - 21125925
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  21125699 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 21125798  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21125799 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 21125898  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21125899 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 21125925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 21166704 - 21166930
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21166704 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 21166803  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21166804 gcattgattacactaaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 21166903  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21166904 ggatgtcaaaagtgattttcttaatgg 21166930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27227494 - 27227268
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27227494 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27227395  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27227394 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27227295  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27227294 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 27227268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 34794974 - 34795200
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  34794974 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 34795073  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  34795074 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 34795173  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34795174 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 34795200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35259060 - 35258834
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  35259060 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 35258961  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  35258960 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 35258861  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35258860 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 35258834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35269685 - 35269459
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  35269685 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 35269586  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  35269585 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 35269486  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35269485 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 35269459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40246664 - 40246438
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  40246664 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 40246565  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  40246564 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 40246465  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40246464 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 40246438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43088753 - 43088527
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  43088753 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 43088654  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  43088653 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 43088554  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43088553 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 43088527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22938414 - 22938640
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22938414 attggaacaaaatgggtattcagaaacaaactgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22938513  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22938514 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22938613  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22938614 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 22938640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43351458 - 43351232
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  43351458 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 43351359  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  43351358 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 43351259  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43351258 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 43351232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4215951 - 4215725
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4215951 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 4215852  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  4215851 gcattggttacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcagat 4215752  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4215751 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 4215725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 28705966 - 28706192
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  28705966 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtgaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacaatcaacaagaag 28706065  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  28706066 gcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcataatattatatcaaat 28706165  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28706166 ggatgtcaagagtgcatttattaatgg 28706192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24721381 - 24721161
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24721381 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagcaagacttgttgctcaaggttacagtcaacaggaag 24721282  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  24721281 gcattgactatactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagtaaatcatggcataatattatatcaaat 24721182  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttct 223  Q
    |||||| |||| ||| |||||    
T  24721181 ggatgtaaagattgcatttct 24721161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 24809131 - 24809357
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  24809131 attggaacaaaattggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 24809230  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||  || || |||||| ||||    
T  24809231 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattagaagcaatcaagttatttctgtcctatgcagttaatcatggtataatattatattaaat 24809330  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24809331 ggatgtctagagtgcatttcttaatgg 24809357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 24419783 - 24419886
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24419783 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 24419882  T
Q  103 gcat 106  Q
    ||||    
T  24419883 gcat 24419886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 1795181 - 1795329
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  1795181 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 1795280  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 151  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  1795281 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 1795329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 24419891 - 24419928
Alignment:
Q  192 ttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24419891 ttatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24419928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Original strand, 10835151 - 10835185
Alignment:
Q  99 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagt 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10835151 gaaggcattgactacactgaaacatttgctccagt 10835185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26705723 - 26705578
Alignment:
Q  68 tagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcc 167  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||| |  |||||  |||| |||| ||| ||||||||| | |      
T  26705723 tagacttgtagctcaaggctacagtcaacaggaatgtatagattacactaaaacctttgcacatgttgctagatttgaagaaattaggttacttatgtta 26705624  T
Q  168 tatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaaga 213  Q
    ||||  ||||||||||| || |   |||||||||||||||| ||||    
T  26705623 tatgatgttaatcatgatatcactctatatcaaatggatgttaaga 26705578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16742773 - 16742547
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16742773 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 16742674  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16742673 gcattgattacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 16742574  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16742573 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 16742547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19230879 - 19230653
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  19230879 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 19230780  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  19230779 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataacattatatcaaat 19230680  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19230679 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 19230653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19424426 - 19424200
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  19424426 attggatcaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcgacaagaag 19424327  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19424326 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 19424227  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19424226 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 19424200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36084022 - 36083796
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  36084022 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 36083923  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36083922 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36083823  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36083822 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 36083796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44487215 - 44486989
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  44487215 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 44487116  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  44487115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 44487016  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44487015 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 44486989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 3353407 - 3353633
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  3353407 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 3353506  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  3353507 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 3353606  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3353607 ggatgtcaaaagtgattttcttaatgg 3353633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6157167 - 6156941
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6157167 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 6157068  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6157067 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 6156968  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6156967 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 6156941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9347199 - 9346973
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9347199 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9347100  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9347099 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9347000  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9346999 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 9346973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 13693342 - 13693568
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13693342 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 13693441  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13693442 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13693541  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13693542 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 13693568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19134781 - 19134555
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  19134781 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 19134682  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  19134681 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 19134582  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  19134581 ggatgtaaaaagtgcttttcttaatgg 19134555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 25678760 - 25678986
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  25678760 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 25678859  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25678860 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 25678959  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25678960 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 25678986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29082492 - 29082266
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  29082492 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 29082393  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  29082392 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 29082293  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29082292 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 29082266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36299027 - 36298801
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  36299027 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 36298928  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36298927 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36298828  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36298827 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 36298801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 247909 - 247683
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||    
T  247909 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgatcaaggctacagtcaacaagaag 247810  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  247809 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 247710  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  247709 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 247683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 811029 - 810803
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||    
T  811029 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgatcaaggctacagtcaacaagaag 810930  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  810929 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 810830  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  810829 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 810803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21294400 - 21294174
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21294400 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 21294301  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  21294300 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttgatcatggcataatattatatcaaat 21294201  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21294200 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 21294174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 30319477 - 30319703
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  30319477 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagagataaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 30319576  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  30319577 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatattaaat 30319676  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30319677 ggatgtcaaaagtgattttcttaatgg 30319703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 32082468 - 32082694
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  32082468 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 32082567  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  32082568 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 32082667  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  32082668 ggatgtcgaaagtgcctttcttaatgg 32082694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 15785482 - 15785708
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15785482 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagcagaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 15785581  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15785582 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 15785681  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15785682 ggatgtcaaaagtgcccttcttaatgg 15785708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19935211 - 19934985
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||     
T  19935211 attggaacaaaatgagtatttagaaagaagttgaatgataaaggtgaagtaaccaaaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaat 19935112  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19935111 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 19935012  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19935011 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 19934985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22669154 - 22668933
Alignment:
Q  8 aacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcatt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||    
T  22669154 aacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccaaacttgttacacaaggttatagtcaacaagaaggcatt 22669055  T
Q  108 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  22669054 gattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagaaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggatg 22668955  T
Q  208 tcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  22668954 tcaatagtgaatttcttaatgg 22668933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 17293364 - 17293586
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  17293364 gaacaaaataggtattcaaaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagaattgttgaacaaggttacagtcaacaagaaggcat 17293463  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17293464 tgactacactgaaacatttgctccagtcgcaagattggaagcaattaggttacttctatcttatgcagtaaatcatgacataatattatatcaaatggat 17293563  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  17293564 gtcaagagtgcatttcttaatgg 17293586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 22465915 - 22466141
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||    
T  22465915 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagctcaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacaatcaacaagaag 22466014  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  22466015 gtattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcttatgcagtaaatcatggcataatattatatcaaat 22466114  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22466115 ggatgtaaagagtgcatttctcaatgg 22466141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24650997 - 24650772
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24650997 attggaacaaaatgggt-ttcataaataagttgaataaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacatgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 24650899  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||| ||| || |||||||||||    
T  24650898 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatatgcagtttataatggcataatattatatcaaat 24650799  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  24650798 ggatatcaagggtgcatttcttaatgg 24650772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 20376593 - 20376809
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20376593 attggaacaaaatgggtattcataaacaagttggatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 20376692  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  | || |||||||||||    
T  20376693 acattga---------aacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagcttacttctatcctatgcagttaatcatgaagtaatattatatcaaat 20376783  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20376784 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatg 20376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16400839 - 16400618
Alignment:
Q  8 aacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcatt 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| || || |||    
T  16400839 aacaaaatgggtatttaggaacaagcttaatgaacaaggagaggttgttagaaacaaagctagacttattgaacaaggatacattcaacaagagggtatt 16400740  T
Q  108 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatg 207  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  16400739 gactatactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagaaatcaggttacatctatcctatgcagttaatcatgacattatattatatcaaatgaagg 16400640  T
Q  208 tcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  16400639 ttaagagtgcatttctcaatgg 16400618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18160135 - 18159915
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || | || ||||||||| |||||||| ||  |||  ||||| ||||| ||      
T  18160135 attggaacaagatgggtattaagaaacaagttcaatgatctaggtgaagttatcataaacaaagcaagacttgtagctgaaggttacaggcaacaagagt 18160036  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| ||    
T  18160035 gtattgattatactgggacatttgctccaattgcaagactagaagcaataaggttacttctatcatatgcagttaatcatggcataactttatatcagat 18159936  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttct 223  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  18159935 ggatgttaagagtgcctttct 18159915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45494969 - 45494835
Alignment:
Q  14 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 113  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  45494969 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtaactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 45494870  T
Q  114 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 148  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  45494869 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 45494835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 20748624 - 20748753
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||| | || |  ||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  20748624 tcattggaacaagatgagtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttataagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 20748723  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  20748724 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 20748753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 15201544 - 15201770
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15201544 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 15201643  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15201644 gcattgattacactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 15201743  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15201744 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 15201770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16311226 - 16311000
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16311226 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 16311127  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16311126 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 16311027  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16311026 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 16311000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14840798 - 14841024
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14840798 attggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 14840897  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14840898 gcattgatgacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 14840997  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14840998 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 14841024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 10745339 - 10745565
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  10745339 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 10745438  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10745439 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 10745538  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10745539 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 10745565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 10959108 - 10959334
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  10959108 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 10959207  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10959208 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 10959307  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10959308 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 10959334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36024405 - 36024179
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  36024405 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 36024306  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36024305 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36024206  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36024205 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 36024179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49513650 - 49513424
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  49513650 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 49513551  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  49513550 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 49513451  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49513450 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 49513424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 55749993 - 55750219
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  55749993 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 55750092  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  55750093 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 55750192  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  55750193 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 55750219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10296785 - 10296559
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  10296785 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 10296686  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10296685 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 10296586  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10296585 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 10296559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16261979 - 16261753
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16261979 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 16261880  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16261879 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 16261780  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16261779 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 16261753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24646445 - 24646219
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24646445 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24646346  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24646345 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24646246  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24646245 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 24646219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27172181 - 27171955
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27172181 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27172082  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27172081 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27171982  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27171981 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 27171955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27662726 - 27662500
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27662726 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27662627  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27662626 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27662527  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27662526 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 27662500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 456676 - 456450
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  456676 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccggaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 456577  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  456576 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 456477  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  456476 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 456450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 4992536 - 4992762
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4992536 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 4992635  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4992636 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctttcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 4992735  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4992736 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 4992762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5018251 - 5018025
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5018251 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5018152  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5018151 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcatgttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5018052  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5018051 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 5018025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17924212 - 17923986
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  17924212 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 17924113  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17924112 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 17924013  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17924012 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 17923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19949136 - 19949362
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  19949136 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 19949235  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||| || |||||||||||    
T  19949236 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatagcataatattatatcaaat 19949335  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19949336 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 19949362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 27819672 - 27819898
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27819672 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 27819771  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  27819772 gcattgattacaccgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctattctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 27819871  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27819872 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27819898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 30931234 - 30931460
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  30931234 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 30931333  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  30931334 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 30931433  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30931434 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 30931460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14907790 - 14908016
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14907790 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatccagtcaacaagaag 14907889  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  14907890 gcattaactacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtttatcataacataatattatatcaaat 14907989  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  14907990 agatgtcaagagtgcatttcttaatgg 14908016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 18757231 - 18757457
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  18757231 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 18757330  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18757331 gcattgattatactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 18757430  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18757431 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 18757457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 40461486 - 40461712
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  40461486 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 40461585  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  40461586 gcattgattacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 40461685  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  40461686 ggatgtaaaaagtgcttttcttaatgg 40461712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16850105 - 16849879
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  16850105 attggaacaaaatggatattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacattcaacaagaag 16850006  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16850005 gcattgattacacagaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaat 16849906  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16849905 ggatgtcaagagtgcatttctcaatgg 16849879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22002531 - 22002305
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22002531 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22002432  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22002431 gcattaattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaaacaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22002332  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22002331 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 22002305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 15467148 - 15467290
Alignment:
Q  87 tacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgaca 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15467148 tacagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaatattggaagaaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggca 15467247  T
Q  187 tgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15467248 taatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 15467290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 39530924 - 39531039
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| || ||||    
T  39530924 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagttagacttgttgcacaaggttataatcagcaagaag 39531023  T
Q  103 gcattgattacactga 118  Q
    ||||||||||||||||    
T  39531024 gcattgattacactga 39531039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14008672 - 14008592
Alignment:
Q  4 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaag 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14008672 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgctcaag 14008592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 26816494 - 26816623
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  26816494 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 26816593  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  26816594 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 26816623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 54695559 - 54695430
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  54695559 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 54695460  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  54695459 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 54695430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 14936543 - 14936677
Alignment:
Q  14 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 113  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  14936543 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtaactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 14936642  T
Q  114 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 148  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  14936643 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 14936677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11534526 - 11534406
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||| |||    
T  11534526 attggaacaaaaggggtgttcataaacaaactcaatgagcaaggtgaggtgataagaaacaaagctagacttgcagcacaaggctacaatcaccagcaag 11534427  T
Q  103 gcattgattacactgaaacat 123  Q
    | ||||| || | ||||||||    
T  11534426 gtattgactatattgaaacat 11534406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 18829057 - 18829283
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  18829057 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 18829156  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18829157 gcattgattacactgaaacttttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 18829256  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18829257 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 18829283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 20034672 - 20034898
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  20034672 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagttaacaagaag 20034771  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20034772 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 20034871  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20034872 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 20034898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25793768 - 25793542
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  25793768 attggaacaaaatgggtattcataaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggatacagtcaacaagaag 25793669  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25793668 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 25793569  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25793568 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 25793542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4636980 - 4636754
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4636980 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 4636881  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4636880 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 4636781  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4636780 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 4636754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9117239 - 9117465
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9117239 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 9117338  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  9117339 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 9117438  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9117439 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 9117465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12721583 - 12721809
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12721583 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 12721682  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12721683 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12721782  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12721783 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 12721809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26031474 - 26031248
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  26031474 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 26031375  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26031374 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 26031275  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26031274 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 26031248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27347799 - 27347573
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27347799 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27347700  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27347699 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27347600  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27347599 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27347573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27408539 - 27408313
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27408539 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 27408440  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  27408439 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 27408340  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27408339 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27408313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 32305793 - 32306019
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  32305793 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 32305892  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  32305893 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 32305992  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32305993 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 32306019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3667480 - 3667254
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  3667480 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 3667381  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  3667380 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 3667281  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3667280 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 3667254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 11255335 - 11255561
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  11255335 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 11255434  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||| || |||||||||||    
T  11255435 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaagtaatcatggcataatattatatcaaat 11255534  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11255535 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 11255561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12860985 - 12860759
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12860985 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 12860886  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12860885 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12860786  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12860785 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 12860759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13919300 - 13919074
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  13919300 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 13919201  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13919200 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 13919101  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13919100 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 13919074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16955062 - 16954836
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16955062 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 16954963  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  16954962 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 16954863  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16954862 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 16954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26039670 - 26039444
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  26039670 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 26039571  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26039570 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 26039471  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26039470 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 26039444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26870856 - 26870630
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  26870856 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 26870757  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26870756 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 26870657  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26870656 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatgg 26870630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 32966693 - 32966919
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  32966693 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggatacagtcaacaagaag 32966792  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  32966793 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagactggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 32966892  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32966893 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 32966919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 34811910 - 34812136
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  34811910 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 34812009  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  34812010 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 34812109  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34812110 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 34812136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 25681728 - 25681954
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25681728 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaacgagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 25681827  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||   | || |||||||||||    
T  25681828 gcattgactacactgaagcatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcccatgcagttaatcatggtttaatattatatcaaat 25681927  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  25681928 ggatgtcaagagcgcctttcttaatgg 25681954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27378846 - 27378620
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27378846 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 27378747  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  27378746 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 27378647  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  27378646 ggatgtcaaaagtggttttattaatgg 27378620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27469229 - 27469003
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27469229 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 27469130  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  27469129 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 27469030  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  27469029 ggatgtcaaaagtggttttattaatgg 27469003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27499758 - 27499532
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  27499758 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 27499659  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||| || || ||||||||    
T  27499658 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaaccatggcataatattgtatcaaat 27499559  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27499558 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 27499532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22382084 - 22381862
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22382084 gaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaatccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcat 22381985  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||| |||    
T  22381984 taattacactgaaacaattgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatagat 22381885  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  22381884 gtcaagagtgcatttcttaatgg 22381862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16882226 - 16882000
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  16882226 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagttcaatgaacaaggtgaagtaacaagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 16882127  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||    
T  16882126 gcataaactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtcaatcatgacataatattatatcaaat 16882027  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  16882026 ggatatcaagagtgcatttattaatgg 16882000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 19956630 - 19956840
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19956630 attggaacaaaacgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggggaagtaaccagaaaaaaagtcagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 19956729  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || || |||||| ||||    
T  19956730 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcataaaataatattatattaaat 19956829  T
Q  203 ggatgtcaaga 213  Q
    |||||||||||    
T  19956830 ggatgtcaaga 19956840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14058114 - 14058339
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14058114 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaggaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatatagtcaacaagaag 14058213  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||  || ||  ||||||||||    
T  14058214 gcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttcta-cctatgcaatcaatcatggaataataatatatcaaat 14058312  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14058313 agatgttaagagtgcttttcttaatgg 14058339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14064243 - 14064468
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14064243 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaggaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatatagtcaacaagaag 14064342  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||  || ||  ||||||||||    
T  14064343 gcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttcta-cctatgcaatcaatcatggaataataatatatcaaat 14064441  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14064442 agatgttaagagtgcttttcttaatgg 14064468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 17613259 - 17613419
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17613259 attggaataaaatgggtattcaaaaacaagttgaacgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 17613358  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttct 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17613359 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttct 17613419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19445918 - 19445692
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||| || | ||||  ||||||||||| ||||    
T  19445918 attggaacaaaatgggtattaataatcaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaaactagacttatttctcaaggttacagtcaacaagaag 19445819  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  19445818 gcattgattatactgaaacatttcctccatttgcaagattggaagcagtcaggttacttctatcctgtgcagtaaatcatggcattatattatatcaaat 19445719  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19445718 ggatgtaaagagtgcatttctaaatgg 19445692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22810939 - 22810771
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||  |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  22810939 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacagggtgaagtagtcagaaacaaagctatacttgttgaacaaggttacagtcaacaagaag 22810840  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatg 171  Q
    | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22810839 gtattgagtacattgaaaaatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatg 22810771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1656736 - 1656606
Alignment:
Q  99 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  1656736 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatc 1656637  T
Q  199 aaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1656636 aaatggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 1656606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 18920359 - 18920480
Alignment:
Q  108 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatg 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18920359 gattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaatggatg 18920458  T
Q  208 tcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18920459 tcaatagtgcttttcttaatgg 18920480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17053416 - 17053277
Alignment:
Q  90 agtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatga 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| || |    
T  17053416 agtcaacaagaaggcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggtttcttctttcctatgctattaatcatgatatca 17053317  T
Q  190 tgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
       ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17053316 ccctatatcaaatggacgtcaagagtgcatttcttaatgg 17053277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14367181 - 14367089
Alignment:
Q  124 ttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtg 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14367181 ttgctccacttgcaagattggaagcaatcagattacttctatcctatgcggtaaatcatgccataatattatatcaaatggatgtaaagagtg 14367089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Original strand, 14169919 - 14170001
Alignment:
Q  105 attgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacat 187  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  14169919 attgattacactaatacatttgctccagttgcaagaccgaaaacaataaggttacttctatcttatgcagttaatcatgacat 14170001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7685193 - 7684967
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  7685193 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 7685094  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  7685093 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 7684994  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7684993 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 7684967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3177643 - 3177417
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  3177643 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 3177544  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  3177543 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 3177444  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3177443 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 3177417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 51650656 - 51650882
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  51650656 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 51650755  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  51650756 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 51650855  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51650856 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 51650882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 5644487 - 5644713
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5644487 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaagcctacagtcaacaagaag 5644586  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5644587 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5644686  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5644687 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 5644713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5839246 - 5839020
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  5839246 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 5839147  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5839146 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 5839047  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5839046 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 5839020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7513316 - 7513090
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  7513316 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 7513217  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  7513216 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatatcaaat 7513117  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7513116 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 7513090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 7694253 - 7694479
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  7694253 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaactagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 7694352  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  7694353 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 7694452  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7694453 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 7694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12617935 - 12618161
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12617935 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 12618034  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12618035 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12618134  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12618135 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 12618161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12736570 - 12736344
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  12736570 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 12736471  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  12736470 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 12736371  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12736370 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 12736344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21869705 - 21869479
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  21869705 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 21869606  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21869605 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 21869506  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21869505 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatgg 21869479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 35642820 - 35643046
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  35642820 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 35642919  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  35642920 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 35643019  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35643020 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 35643046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 36241213 - 36241439
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  36241213 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 36241312  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36241313 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 36241412  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36241413 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 36241439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38101127 - 38100901
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  38101127 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 38101028  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  38101027 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 38100928  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38100927 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 38100901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 47612715 - 47612941
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  47612715 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 47612814  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  47612815 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 47612914  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47612915 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 47612941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 21210510 - 21210732
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  21210510 gaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcat 21210609  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  21210610 tgattacactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctttcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggat 21210709  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21210710 gtcaagagtgcttttcttaatgg 21210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4173344 - 4173118
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||    
T  4173344 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagccaacaagaag 4173245  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4173244 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 4173145  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4173144 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 4173118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 19164434 - 19164660
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  19164434 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 19164533  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19164534 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 19164633  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19164634 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 19164660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 21129081 - 21129295
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  21129081 attggaacaaaatgggtattcagaaataagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacattcaacaagaag 21129180  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21129181 gcattgattacacagaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 21129280  T
Q  203 ggatgtcaagagtgc 217  Q
    |||||||||||||||    
T  21129281 ggatgtcaagagtgc 21129295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22127532 - 22127306
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  22127532 attggaacaaaatgggtattcataaacaagttgaatgaacaagatgaagtaattagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 22127433  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22127432 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 22127333  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22127332 ggatgttaagagtgcattttttaatgg 22127306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17715938 - 17715712
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||    
T  17715938 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtagtaagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaaaaagaag 17715839  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  17715838 gcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatgctatacagtaaatcatggcataatattatatcaaat 17715739  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17715738 ggatgtaaagagtgcatttctcaatgg 17715712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 20871952 - 20872131
Alignment:
Q  50 ggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagca 149  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20871952 ggtaactagaaagaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagca 20872051  T
Q  150 atcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20872052 atcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 20872131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Original strand, 23978343 - 23978548
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  23978343 attggaacaaaatgggtggtcaggaacaagcttaatgaacaaggagaagttgttagaaacaaagaacgacttgttgcacaaggatatagtcaacaagagg 23978442  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||| || |||||||||||    
T  23978443 gtattgattacactgaaatatttactcaaattgcaagattataagcaatcaggttacttctatcctatgcagttatttaagacattatattatatcaaat 23978542  T
Q  203 ggatgt 208  Q
    ||||||    
T  23978543 ggatgt 23978548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 22446506 - 22446594
Alignment:
Q  140 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22446506 attggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaat-atggcaaaatattatatcaaatggatgtcaagagtgtatttcttaatgg 22446594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 22451740 - 22451828
Alignment:
Q  140 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22451740 attggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaat-atggcaaaatattatatcaaatggatgtcaagagtgtatttcttaatgg 22451828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22650768 - 22650725
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650768 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 22650725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14277767 - 14277687
Alignment:
Q  56 cagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgc 136  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||  |||| |||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  14277767 cagaaataaagctagattagtagcacaaggctacaatcaacaagaaggtattgactatgatgaaacatttgctccagttgc 14277687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 37632 - 37858
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37632 attggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 37731  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37732 gcattgatgacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 37831  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37832 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 37858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4478 - 4255
Alignment:
Q  6 ggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggca 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||    
T  4478 ggaacaaaatgggtattcaggaacaagttgaatgaacaatgtgaagtagttagaaacaaagctagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaagaca 4379  T
Q  106 ttgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatgga 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || || ||||||  ||| ||    
T  4378 ttgattatattgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagtacatcctgatataatattatatataattga 4279  T
Q  206 tgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||    
T  4278 tgtaaagagcgcatttctcaatgg 4255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18434605 - 18434379
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  18434605 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 18434506  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  18434505 gcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaattatggcataatattatatcaaat 18434406  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18434405 ggatgtcaagagtgctttccttaatgg 18434379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4218090 - 4217864
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4218090 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 4217991  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4217990 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 4217891  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4217890 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 4217864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9165646 - 9165420
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  9165646 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 9165547  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9165546 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9165447  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9165446 ggatgtcaaaagtgctttttttaatgg 9165420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1993638 - 1993412
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  1993638 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 1993539  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1993538 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 1993439  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1993438 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 1993412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 15882644 - 15882870
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  15882644 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 15882743  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15882744 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 15882843  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15882844 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 15882870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 17954935 - 17955161
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  17954935 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 17955034  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17955035 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcgattaatcatggcataatattatatcaaat 17955134  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17955135 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 17955161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 26394915 - 26395141
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  26394915 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 26395014  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26395015 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 26395114  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26395115 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 26395141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 40046925 - 40047151
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  40046925 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 40047024  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  40047025 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 40047124  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40047125 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 40047151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42871930 - 42871704
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  42871930 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 42871831  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  42871830 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 42871731  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42871730 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 42871704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 172972 - 172746
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  172972 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 172873  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  172872 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 172773  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  172772 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 172746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 8006887 - 8007113
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  8006887 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 8006986  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  8006987 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 8007086  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8007087 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 8007113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9091316 - 9091090
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9091316 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9091217  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  9091216 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 9091117  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9091116 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 9091090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11011269 - 11011043
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  11011269 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 11011170  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  11011169 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 11011070  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11011069 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 11011043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20985339 - 20985113
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  20985339 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 20985240  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  20985239 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 20985140  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20985139 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 20985113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24740183 - 24739957
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  24740183 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaactagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 24740084  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  24740083 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 24739984  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24739983 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 24739957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 461807 - 462033
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  461807 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 461906  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  461907 gcattgattacactgaaacatttgcttcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 462006  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  462007 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 462033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 2710434 - 2710660
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  2710434 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 2710533  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  2710534 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaaacaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 2710633  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2710634 ggatgtcaaaagtgcatttcttaatgg 2710660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6872051 - 6872277
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6872051 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaag 6872150  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6872151 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 6872250  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  6872251 ggatgttaaaagtgcttttcttaatgg 6872277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9439345 - 9439119
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  9439345 attggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccataaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 9439246  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||    
T  9439245 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaat 9439146  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9439145 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 9439119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 20998244 - 20998466
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20998244 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaaggcat 20998343  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20998344 tgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaatggat 20998443  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  20998444 gtcaaaagtgcttttcttaatgg 20998466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 26658156 - 26658382
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  26658156 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 26658255  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26658256 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 26658355  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26658356 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatgg 26658382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22095223 - 22094997
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22095223 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22095124  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22095123 gcattgattacactgaaacatttgctatagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22095024  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22095023 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 22094997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13662548 - 13662324
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  13662548 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaacaagaag 13662449  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  13662448 gcattgactacactgaaacatttgctcctgttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataaaattatatcaaat 13662349  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13662348 ggatgtcaagagtgcttttcttaat 13662324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8623446 - 8623219
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagactt-gttgcacaagaatacagtcaacaggaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  8623446 attggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagactttgttgctcaaggctacagtcaacaagaa 8623347  T
Q  102 ggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  8623346 ggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaa 8623247  T
Q  202 tggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8623246 tggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 8623219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 13125778 - 13126003
Alignment:
Q  4 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13125778 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaagg 13125877  T
Q  104 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatg 203  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  13125878 cattgactacactgaaaaatttgctccagttacaagattggaagcaatcaggttacttctatcctaagcaattaatcatggcataatattatatcaaatg 13125977  T
Q  204 gatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  13125978 gatgtcaagagtgcatttcttaatgg 13126003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 16314291 - 16314513
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||    
T  16314291 attggaacaaaatgggtattcataaacaaattgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcataatgttacagttaacaagaag 16314390  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  16314391 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgtagttaatcacggcataatattatatcaaat 16314490  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttctta 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16314491 ggatgtcaagagtgcatttctta 16314513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14141984 - 14141759
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| ||||    
T  14141984 attgtaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgaacaaggttatagtcaacaagaag 14141885  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || || |||||||||||    
T  14141884 gcatagactacactaaaacatttgctctagttgcaagattggtagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggaataatattatatcaaat 14141785  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14141784 ggatgtcaagagtgtatttcttaatg 14141759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 4416815 - 4417041
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| || | ||||  ||||  ||||| ||||    
T  4416815 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctcaatgaaaagggagaagtaatcagaaagaaagccagacttattactcaagggtacaaccaacaagaag 4416914  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |  |||||||||||    
T  4416915 gcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaattaggttacttctttcctatgcagtaaatcatgatatcaccttatatcaaat 4417014  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4417015 ggatgtcaagagtgcatttctcaatgg 4417041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10652922 - 10652695
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||     
T  10652922 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaattaattagaaacaaagttagacttgttgcataaggttacagtcaacaagaac 10652823  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctcca--gttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||  |   ||   |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||    
T  10652822 gcattgactacactgaaacatttgctacactgaaacaaagttggaaacaatcaagttacttctatcctatgtagttaatcgtaacataatattatatcaa 10652723  T
Q  201 atggatgtcaagagtgcttttcttaatg 228  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  10652722 atagatgttaaaagtgcatttcttaatg 10652695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 16157922 - 16158148
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| || || |    
T  16157922 attggaacaaaatgggtgttcaggaacaaacttaatgaacaaggtgaaaatgtcagaaacaaagctagacttgttgtataaggatatagtcagcaagagg 16158021  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| || |||||||||||    
T  16158022 gcataaattatacttaaacattttctccagttgcaagattataagcaatcaggttacttctatcctattcattttatcatggcattatattatatcaaat 16158121  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  16158122 agatgtcaagagtgcatttctcaatgg 16158148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Original strand, 25206050 - 25206097
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagag 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206050 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagag 25206097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15179739 - 15179871
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  15179739 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 15179838  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctccagt 133  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15179839 aggtattgattacgatgaaacctttgctccagt 15179871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4824817 - 4824767
Alignment:
Q  177 aatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaat 227  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4824817 aatcatggcataatattatatcaaatggatgtgaagagtgcatttcttaat 4824767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37216 - 36990
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  37216 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 37117  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37116 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 37017  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37016 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 47715 - 47941
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  47715 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 47814  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  47815 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 47914  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47915 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgg 47941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13206 - 12980
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  13206 attggaacaaaatgggtattcagaaataagctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttccacaaggttacagtcaacaagaag 13107  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  13106 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 13007  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13006 ggatgtcaagagttctttttttaatgg 12980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6063 - 6289
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6063 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 6162  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6163 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 6262  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6263 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 6289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 758 - 984
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  758 attggaacagaatgggtattcagaaacaacctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaagtttacagtcaacaagaag 857  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||  || |||||||| || |  ||||| |||||    
T  858 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctttcttttgcagtaaatcatgatatcaccttataccaaat 957  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  958 ggatgtcaagagtgcttttctcaatgg 984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 11405 - 11547
Alignment:
Q  87 tacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgaca 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||  || |||||||| |    
T  11405 tacagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctttcttttgcagtaaatcatgata 11504  T
Q  187 tgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11505 tcaccttataccaaatggatgtcaagagtgcttttctcaatgg 11547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21867 - 21641
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  21867 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaagaaggtgaagtaaccagaaacaaagacagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 21768  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21767 gcatcgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 21668  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21667 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 21641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14964 - 14913
Alignment:
Q  178 atcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14964 atcatggcataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 41732 - 41958
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  41732 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 41831  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  41832 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 41931  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41932 ggatgtcaaaagtgcctttcttaatgg 41958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 47921 - 48147
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || |    
T  47921 attggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgagcaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttattgcacaaggatacagtcaacaagagg 48020  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  48021 gcattgactaccctgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgttgtcaatcatgacataatattatatcaaat 48120  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  48121 ggatgtgaagagtgcatttcttaatgg 48147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 9738 - 9964
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  9738 attggaacaaaatgggtattcagaaataagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggctacagtcaacaagaag 9837  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    |||||||||||    
T  9838 gcattgattacactgaaacatttgctaaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcatataattatatcaaat 9937  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9938 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 9964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 2215 - 2441
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2215 attggaacaaaatttgtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 2314  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  2315 gcattgactacactgaaatatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatatgaaat 2414  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2415 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 4446 - 4672
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  4446 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctcaatgaaaagggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaagggtacagtcaacaagaag 4545  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || |||||||||||    
T  4546 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagctaatcatggcataatattatatcaaat 4645  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4646 ggatgtcaagagtgcatttctttatgg 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 29560 - 29786
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  29560 attggaacaaaatgggtattcagaaaaaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagtaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 29659  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  29660 gcattgactacagtgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatattaaat 29759  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29760 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 5439 - 5665
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  5439 attggaataaaatgggtattcagaaacaaattgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagatttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 5538  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  5539 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctctgcagttaatcataacataatattatatcaaat 5638  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5639 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 5665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4215 - 3989
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  4215 attggaagaaaatgggtattcataaacaagttgagtgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaacaagaag 4116  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4115 acaatgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatatcaaat 4016  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4015 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 3989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 6545 - 6767
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | | | ||||    
T  6545 gaacaaaatgagtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaagttacagtcaataagtatgcat 6644  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggat 206  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  6645 tgactacactaaaacatttgctccagttgtaagattgcaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggat 6744  T
Q  207 gtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6745 gtcaaaagtgcatttctcaatgg 6767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11372 - 11206
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  11372 attggaagaaaatgggtattcataaacaagttgagtgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaacaagaag 11273  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatccta 169  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272 acaatgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatccta 11206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45488 - 45260
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||    
T  45488 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtgagaaacaaagctatacttgttgcacaaggttacaatcaacaaga 45389  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaa 200  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  45388 aggcattgactacagtaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtaggtaatcataacataatattatatcaa 45289  T
Q  201 atggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45288 atggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 45260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 117073 - 117269
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  117073 gaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccaaaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcat 117172  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  117173 tgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaatg 117269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 108572 - 108768
Alignment:
Q  7 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  108572 gaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccaaaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcat 108671  T
Q  107 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  108672 tgattacactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaatg 108768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 103 - 298
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  103 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcgcaaggttatagtcaacaagaag 202  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatc 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  203 acattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctttgcagttaatcatggcataatattatatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1646
Alignment:
Q  192 ttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1609 ttatatgaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 1646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 6606 - 6832
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6606 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaagcaaagctatacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 6705  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  6706 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagtttacttctatcttatccagttaatcatggcataatattatatcaaat 6805  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6806 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 6832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10962 - 10738
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  10962 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtctgaaacaaagcaagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 10863  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  10862 gcattgattatactgaaacatttgctccagttacatgattggaagcaatcagattacttctatcctatgctgtaaatcatggcataatattatatcaaat 10763  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  10762 ggatgtcaagagtgcatttcttaat 10738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 10295 - 10513
Alignment:
Q  11 aaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgat 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||     
T  10295 aaaataggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagagttgttgcacaaggttacactcaacaagaaggcattgac 10394  T
Q  111 tacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  10395 tacactgaaacatttgctcctgttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggatgtca 10494  T
Q  211 agagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  10495 agagtgcatttcttaatgg 10513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4508 - 4282
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  4508 attggaacaaaatgggtgttcagaaacaagttgagtgaacaaggtgaagtaatcagagacaaatctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 4409  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  4408 acattgattacactgaaagatttgctccaattgcaagatttgaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcattatattatatgaaat 4309  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4308 ggatgtcaagagtgcatttcttaatgg 4282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12774 - 12548
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  12774 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccataaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 12675  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| || ||||||||||     
T  12674 gcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaataaatcatggcataatattatatcaaac 12575  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12574 cgatgtcaagagtgcatttctgaatgg 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26521 - 26308
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26521 attggaacaaa-tgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaacccagacttgttgcacaaggctacagtcaacaagaag 26423  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||    
T  26422 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatagcataatattatatcaaat 26323  T
Q  203 ggatgtcaagagtgc 217  Q
    |||||||||||||||    
T  26322 ggatgtcaagagtgc 26308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1247
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  1021 attggatcaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaattagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaacaagaag 1120  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1121 gcattaattacactgaaacatttgctctagttgcaagattgaaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 1220  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||    
T  1221 ggatgtcaagagtgaatttcttaatgg 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 74387 - 74161
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  74387 attggaacgaaatgggtattcagaaacaagcttaatgaacaaggagaagtagtcagaaacatagctagacttgttgctgaaggatacagtcaacaagaag 74288  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||     
T  74287 gcattgattatactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaattaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcattatattatatcaaac 74188  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  74187 ggatgtaaagagtgcatttctcaatgg 74161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 86433 - 86351
Alignment:
Q  147 gcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  86433 gcaattaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcattatattatatcaaacggatgtaaagagtgcatttctcaatgg 86351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1301
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  1075 attggaacaaaattggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaag 1174  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||  || || |||||| ||||    
T  1175 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattagaagcaatcaagttatttctgtcctatgcagttaatcatggtataatattatattaaat 1274  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1275 ggatgtctagagtgcatttcttaatgg 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43482 - 43258
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  43482 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagttgaatgaacaacgtgaagtagtcagaaagaaagctagacttgttgcacaaggttacagttaacaagaag 43383  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  43382 gcattgactacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatacagttaatcatggcataatattatatcaaat 43283  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaat 227  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||    
T  43282 gaatgtcaagagtgcattttttaat 43258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 7944 - 8169
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||| ||||    
T  7944 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcataaacaaagctagacatattgcacaaggttgcagtcaacaagaag 8043  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  8044 gcattgactacactg-aacatttactcaagttgcatgattggaagcaatcaggttacttttatcctttgcagttaatcatggcataatattatatcaaat 8142  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8143 ggatgtcaatagtgcttttctaaatgg 8169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1578 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1578
Description:

Target: scaffold1578; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1315 - 1119
Alignment:
Q  35 gaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagtt 134  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1315 gaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgattacacttaaacatttgctccagtt 1216  T
Q  135 gcatgattggaagcaatcagg--ttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1215 gcaagattggaagcaatcaggttttacttctatcctatgcagttaatcataacataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttctaaatgg 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22905 - 22742
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22905 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacatagccagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 22806  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805 gcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatc 22742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4279
Alignment:
Q  4 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |    |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  4504 ttggaacaaaatgagtatttagaaacaagctgaatgacaaaggtgaagctgtcagaaacaaaactagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaagg 4405  T
Q  104 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  4404 cattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaataaatcatggcattatattatatcaaatg 4305  T
Q  204 gatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  4304 gatgtaaatagtgcatttctcaatgg 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10914 - 10705
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||     
T  10914 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagttagaaacaaaactagatttgttgcacaaggttacaatcaacaaaaat 10815  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||    
T  10814 gcattgattatactgaaaaatttgctctagttgcaagattgaaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatagcataatattatatcaaat 10715  T
Q  203 ggatgtcaag 212  Q
    ||||||||||    
T  10714 ggatgtcaag 10705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 129487 - 129642
Alignment:
Q  74 tgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtg 173  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  129487 tgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgactacaccgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctataca 129586  T
Q  174 gttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  129587 gttaatcatggcataatattatatcaaattgatgtcaagagtgcatttcttaatgg 129642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3346 - 3204
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3346 attggaacaaagagggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 3247  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattgga 145  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3246 acattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattgga 3204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 33960 - 34177
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||   |||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||||| |  ||||    
T  33960 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgtacaagaagttgt---cagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggttatagtcatctagaag 34056  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||| || | |||||||||    
T  34057 gcactgattatacataaacatttgttccagttgcacgattggaagaaatcaagttacttctatcctatgcactaaatcatgacattatatcatatcaaat 34156  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttct 223  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  34157 ggctgttaagagtgcatttct 34177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 39267 - 39484
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||   |||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||||| |  ||||    
T  39267 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgtacaagaagttgt---cagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggttatagtcatctagaag 39363  T
Q  103 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaat 202  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||| || | |||||||||    
T  39364 gcactgattatacataaacatttgttccagttgcacgattggaagaaatcaagttacttctatcctatgcactaaatcatgacattatatcatatcaaat 39463  T
Q  203 ggatgtcaagagtgcttttct 223  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  39464 ggctgttaagagtgcatttct 39484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 21228 - 21341
Alignment:
Q  116 tgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  21228 tgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcatatgcagtaaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaatagt 21327  T
Q  216 gcttttcttaatgg 229  Q
    || ||||| |||||    
T  21328 gcatttctaaatgg 21341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 14616 - 14725
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||    
T  14616 attggaacaaaatgggtatttagaaataagctgaatgaacaaggtaaagtagtaaaaaacaaagcaagacttgttgcccaaggttacagttaacatgaag 14715  T
Q  103 gcattgatta 112  Q
    ||||||||||    
T  14716 gcattgatta 14725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 19289 - 19398
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||    
T  19289 attggaacaaaatgggtatttagaaataagctgaatgaacaaggtaaagtagtaaaaaacaaagcaagacttgttgcccaaggttacagttaacatgaag 19388  T
Q  103 gcattgatta 112  Q
    ||||||||||    
T  19389 gcattgatta 19398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5787
Alignment:
Q  26 aaacaagct-gaatgaacaagga-gaggtaaccagaaac--aaagctagacttgttgcacaagaata-cagt-caacaggaaggcattga-ttacact-g 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  5589 aaacaagctagaatgaacaaggaagaagtaaccagaaactaaaagctagacttgttgcacaaggttaacagttcaacaagaaggcattgaattacactag 5688  T
Q  118 aaacatttg-ctccag--ttgcatgattggaagcaatcaggttacttc-tatcct-atgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaa 211  Q
    ||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  5689 aaacatttgtctctaagtttgcaagattggaagcaatcaggttacttcttatcctaatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaa 5787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 100073 - 99944
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  100073 tcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 99974  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  99973 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 99944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 6897 - 7026
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacagga 100  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| |||||| ||    
T  6897 tcattggaacaagatggatatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaaga 6996  T
Q  101 aggcattgattacactgaaacatttgctcc 130  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  6997 aggtattgattacgatgaaacctttgctcc 7026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 30175 - 30228
Alignment:
Q  3 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaacc 56  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  30175 attggaaccaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaacc 30228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Original strand, 160521 - 160592
Alignment:
Q  158 acttctatcctatgtggttaatcatgacatgatgttatatcaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgg 229  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  160521 acttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtaaaaagtgcatttcttaatgg 160592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 30531 - 30597
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 67  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  30531 tcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggaaaggttgtcagaaacaaagc 30597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 84281 - 84215
Alignment:
Q  1 tcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 67  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  84281 tcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggaaaggttgtcagaaacaaagc 84215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University